Currículo do Sistema de Currículos Lattes (João Eduardo Ferreira)

João Eduardo Ferreira
Bolsista de Produtividade em Pesquisa do CNPq - Nível 2

Graduação Bacharelado em Física - Opção Física-Computacional pela Universidade de São Paulo (1988); mestrado (1991) e doutorado (1996) em Fisica-Computacional pela Universidade de São Paulo; graduação em Pedagogia pela Universidade Federal de São Carlos (1989). Atualmente é professor livre docente junto ao departamento de Ciência da Computação do Instituto de Matemática e Estatística da Universidade de São Paulo. Tem experiência na área de Ciência da Computação, com ênfase em Arquitetura de Sistemas de Computação, atuando principalmente nos seguintes temas: integração de dados; modelagem e implementação de processos e banco de dados; workflows científicos; processos de negócio; data warehouse; transações assíncronas.
(Texto informado pelo autor)

Última atualização do currículo em 06/01/2010
Endereço para acessar este CV:
http://lattes.cnpq.br/0131770792108992

Dados pessoais

Nome	João Eduardo Ferreira
Nome em citações bibliográficas	FERREIRA, J. E.
Sexo	Masculino

Endereço profissional

Universidade de São Paulo, Instituto de Matemática e Estatística, Departamento de Ciência da Computação.
Rua do Matão 1010
Butanta
05508-900 - Sao Paulo, SP - Brasil
Telefone: (11) 30916134 Ramal: 6134 Fax: (11) 30916135
URL da Homepage: http://www.ime.usp.br

Formação acadêmica/Titulação

1992 - 1996

Doutorado em Fisica-Computacional .
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: Compartilhamento de Objetos Compostos entre Base de Dados Orientadas a Objetos, Ano de Obtenção: 1996.
Orientador: Caetano Traina Junior.
Palavras-chave: compartilhamento de dados; distribuição de objetos; banco de dados; dados heterogêneos.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Sistemas de Computação / Especialidade: Arquitetura de Sistemas de Computação.
Setores de atividade: Atividades de Banco de Dados.

1989 - 1991

Mestrado em Fisica-Computacional .
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: Estudo da Distribuição de Base de Dados Orientada a Objetos, Ano de Obtenção: 1991.
Orientador:

Caetano Traina Junior.
Palavras-chave: Base de Dados distribuídas; objetos; objetos complexos; compartilhamento de dados.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Sistemas de Computação / Especialidade: Arquitetura de Sistemas de Computação.
Setores de atividade: Atividades de Banco de Dados.

1984 - 1989

Graduação em Pedagogia .
Universidade Federal de São Carlos, UFSCAR, Brasil.

1983 - 1988

Graduação em Bacharelado em Física - Opção Física-Computacional .
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.

Atuação profissional

Universidade de São Paulo, USP, Brasil.

Vínculo institucional

2008 - Atual

Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Livre docente, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Vínculo institucional

1999 - 2008

Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Assistente MS-3, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Vínculo institucional

1987 - 1989

Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: tecnico nivel superior, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

12/2007 - Atual	Atividades de Participação em Projeto, Instituto de Matemática e Estatística, .
	Projetos de pesquisa Análise e Classificação de Comportamentos de Doadores de Sangue em Banco de Dados Multidimensionais

09/2006 - Atual	Atividades de Participação em Projeto, Instituto de Matemática e Estatística, .
	Projetos de pesquisa Retrovirus Epidemiology Donor Study - REDS

4/2001 - Atual	Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Matemática e Estatística, Departamento de Ciência da Computação.
	Cargo ou função Membro titular (MS-3) do conselho departamental.

4/2000 - Atual	Extensão universitária , Instituto de Matemática e Estatística, Departamento de Ciência da Computação.
	Atividade de extensão realizada BIOINFO -USP núcleo de bioinformática.

4/2000 - Atual	Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Matemática e Estatística, Departamento de Ciência da Computação.
	Cargo ou função Membro do Conselho do Núcleo de Pesquisa em Bioinformática-USP, BIOINFO: http://www.bioinfo.usp.br/.

08/1999 - Atual

Atividades de Participação em Projeto, Instituto de Matemática e Estatística, .

Projetos de pesquisa
Processamento de Requisições em Larga Escala Utilizando o Conceito de Plano de Navegação
Banco de dados de produtos e serviços para pessoas portadoras de deficiência
Indexing and Data Mining in Multimedia Databases-ImiMD
Aproximação Genômica e Pós-Genômica ao Estudo das Malárias Humanas de Plasmodium vivax e Plasmodium falciparum na Amazônia Brasileira.-ClinMalDB
Cooperation for Analysis of Gene Expression-CAGE
Otimização de acesso a disco para grandes volumes de dados.
Desenvolvimento de ambiente informatizado para análise determinística de dados epidemiológicos e de resistência genotípica do HIV-1.
Data Warehouse para análise de dados do banco de sangue do Hospital Israelita Albert Einstein

3/1999 - Atual	Pesquisa e desenvolvimento , Instituto de Matemática e Estatística, Departamento de Ciência da Computação.
	Linhas de pesquisa Banco de dados para extração de conhecimento Integração de Sistemas de Informação

3/1999 - Atual	Ensino, Bacharelado em Ciência da Computação, Nível: Graduação.
	Disciplinas ministradas Introdução à Computação Sistemas de Banco de Dados Laboratório de Banco de Dados

3/1999 - Atual	Ensino, Ciências da Computação, Nível: Pós-Graduação.
	Disciplinas ministradas Controle de Concorrência e Distribuição de Dados Introdução aos Sistemas de Banco de Dados

4/2001 - 7/2001	Estágios , Instituto de Matemática e Estatística, Departamento de Ciência da Computação.
	Estágio realizado atividades de pesquisa com o Prof. Calton Pu, College of Computing at Georgia Tech, Atlanta(http://www.cc.gatech.edu/~calton/).

2/2000 - 6/2001	Outras atividades técnico-científicas , Instituto de Matemática e Estatística, Departamento de Ciência da Computação.
	Atividade realizada mebro do comite de programa do Simpósio Brasileiro de Banco de Dados. edição 2000 e2001.

9/2000 - 12/2000	Estágios , Instituto de Matemática e Estatística, Departamento de Ciência da Computação.
	Estágio realizado atividades de pesquisa com o Prof. Shamkant Navathe, College of Computing at Georgia Tech, Atlanta(http://www.cc.gatech.edu/~sham/).

12/1987 - 3/1989	Pesquisa e desenvolvimento , Instituto de Física de São Carlos, Coordenadoria de Divulgação Científica e Cultural.
	Linhas de pesquisa Banco de dados

Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.

Vínculo institucional

1990 - 1999

Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Assistente MS-2 e MS-3, Carga horária: 40

Outras informações

Professor Assistente efetivo do quadro UNESP

Vínculo institucional

1989 - 1990

Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Assistente MS-1, Carga horária: 40

Atividades

4/1990 - 2/1999	Pesquisa e desenvolvimento , Instituto de Geociências e Ciências Exatas de Rio Claro, Departamento de Estatística, Matemática Aplicada e Computacional.
	Linhas de pesquisa modelagem de banco de dados

4/1990 - 2/1999	Ensino, Bacharelado em Ciências da Computação, Nível: Graduação.
	Disciplinas ministradas Compiladores Sistemas Orientados a Objetos Estrutura de Dados II Programação Orientada a Objetos Linguagens Formais e Autômatos Estágio Supervisionado e Trabalho de Graduação Linguagens de Programação

12/1997 - 1/1999	Extensão universitária , Instituto de Geociências e Ciências Exatas de Rio Claro, Departamento de Estatística, Matemática Aplicada e Computacional.
	Atividade de extensão realizada Consultor Técnico da Secretaria da Fazenda do Governo do Estado de São Paulo, no Programa de Modernização da Arrecadação Tributária (PROMOCAT), projeto financiado pelo BID-PNUD..

3/1996 - 11/1998	Outras atividades técnico-científicas , Instituto de Geociências e Ciências Exatas de Rio Claro, Departamento de Estatística, Matemática Aplicada e Computacional.
	Atividade realizada Avaliador do Conselho Estadual de Educação do Governo do Estado de São Paulo para implantação e avaliação de cursos universitários..

8/1996 - 7/1998	Outras atividades técnico-científicas , Instituto de Geociências e Ciências Exatas de Rio Claro, Departamento de Estatística, Matemática Aplicada e Computacional.
	Atividade realizada Orientaçào iniciação científica CNPq processo - 800383/92-3.

3/1995 - 6/1998	Outras atividades técnico-científicas , Instituto de Geociências e Ciências Exatas de Rio Claro, Departamento de Estatística, Matemática Aplicada e Computacional.
	Atividade realizada mebro da comissão de avaliadores do Simpósio Brasileiro de Banco de Dados.

6/1996 - 11/1997	Extensão universitária , Instituto de Geociências e Ciências Exatas de Rio Claro, Departamento de Estatística, Matemática Aplicada e Computacional.
	Atividade de extensão realizada Projeto UNIMED- Construão de Sistemas Modulares para Gestào de Serviços Médicos.

9/1993 - 8/1995	Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Geociências e Ciências Exatas de Rio Claro, Departamento de Estatística, Matemática Aplicada e Computacional.
	Cargo ou função Coordenador de Curso de Graduação portaria IGCE 061/93.

9/1993 - 8/1995	Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Geociências e Ciências Exatas de Rio Claro, Departamento de Estatística, Matemática Aplicada e Computacional.
	Cargo ou função Membro titular da Comissão de Ensino segundo portaria IGCE no. 074/93.

3/1993 - 9/1993	Outras atividades técnico-científicas , Instituto de Geociências e Ciências Exatas de Rio Claro, Departamento de Estatística, Matemática Aplicada e Computacional.
	Atividade realizada Desenvolvedor do Projeto: "Construção do Protótipo para Sistemas de Gerenciamento de Pessoas" no contexto dos Sistemas de Administração Central da USP..

8/1989 - 3/1990	Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Ciências de Bauru, Departamento de Computação.
	Cargo ou função membro de conselho de departamento.

4/1989 - 3/1990	Pesquisa e desenvolvimento , Faculdade de Ciências de Bauru, Departamento de Computação.
	Linhas de pesquisa banco de dados

4/1989 - 3/1990	Ensino, Bacharelado em Ciências da Computação, Nível: Graduação.
	Disciplinas ministradas Introduçào à Computação Inteligência Artificial Banco de Dados Gerência e Recuperação da Informação

Linhas de Pesquisa

1.	Banco de dados

Banco de dados para extração de conhecimento

Objetivos: Banco de dados para extração de conhecimento.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação / Especialidade: Banco de Dados.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação / Especialidade: Sistemas de Informação.
Setores de atividade: Desenvolvimento de Programas (Software) e Prestação de Serviços em Informática.
Palavras-chave: análise de dados; banco de dados; banco de dados analíticos.

Integração de Sistemas de Informação

Objetivos: Integracao de Sistemas de Informacao.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação / Especialidade: Banco de Dados.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação / Especialidade: Engenharia de Software.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação / Especialidade: Sistemas de Informação.
Setores de atividade: Desenvolvimento de Programas (Software) e Prestação de Serviços em Informática.
Palavras-chave: banco de dados heterogêneos; Base de Dados distribuídas; base de dados heterogêneas; scientific workflows.

4.	banco de dados
	Objetivos: banco de dados. Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação / Especialidade: Banco de Dados. Setores de atividade: Desenvolvimento de Programas (Software) e Prestação de Serviços em Informática. Palavras-chave: modularização de base de dados; modelo de dados analíticos.

5.	modelagem de banco de dados
	Objetivos: modelagem de banco de dados. Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação / Especialidade: Banco de Dados. Setores de atividade: Desenvolvimento de Programas (Software) e Prestação de Serviços em Informática. Palavras-chave: Base de Dados distribuídas; bases de dados analíticas.

Projetos de Pesquisa

2007 - 2011

Retrovirus Epidemiology Donor Study - REDS

Descrição: Há 15 anos os National Institute of Health nos Estados Unidos financia um grupo de seis bancos de sangue nos EUA denominado REDS (Retrovirus Epidemiology Donor Study) que desenvolvem pesquisas relacionadas à segurança transfusional. Em 2005, uma concorrência para que outros países submetessem projetos de pesquisa para fazerem parte desta rede. Com base no mérito do trabalho, foram escolhidos o Brasil e a China para participarem desta nova etapa, que se chama REDS Internacional O projeto terá duração de 4 anos e serão aplicados cerca de US 3 milhões na proposta brasileira. Três hemocentro brasileiros (Fundação Pró-Sangue/ Hemocentro de São Paulo, Hemominas, e HEMOPE) submeteram um proposta juntamente com o Blood Systems Research Institute (BSRI) em São Francisco. Este projeto também terá a participação do Departamento de Ciência da Computação do IME/USP e do Depto. de Medicina Preventiva e Social da UFMG. O projeto será liderado pela Dra Ester C Sabino da Fundação Pró-Sangue e terá a participação dos seguintes pesquisadores do Brasil: Anna Barbara F. Carneiro-Proietti- Fundação Hemominas Divaldo Sampaio - HEMOPE Thelma Gonzalez - Fundação Pró-Sangue Hemocentro de São Paulo Fernando A Proietti - Depto. de Medicina Preventiva e Social da Universidade Federal de Minas Gerais João Eduardo Ferreira - Departamento de Ciência da Computação do Instituto de Matemática e Estatística da Universidade de São Paulo. O principal objetivo do estudo é obter informações que possam reverter na melhoria da segurança transfusional. O projeto prevê o desenvolvimento de um banco de dados que auxilie os hemocentros a analisar os dados guardados por seu sistema operacional. Serão desenvolvidos 3 projetos de pesquisa: a) Risco residual de transmissão de HIV b) Estudo epidemiológico epidemiológico relacionado à validade das perguntas usadas na triagem de doadores. c) Historia Natural da doença de Chagas, com História natural da doença de Chagas, com.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação ( 1) / Especialização ( 1) / Mestrado acadêmico ( 2) / Doutorado ( 1) .
Integrantes: João Eduardo Ferreira - Coordenador.
Financiador(es): National Institutes of Health - Auxílio financeiro..

2007 - 2009

Análise e Classificação de Comportamentos de Doadores de Sangue em Banco de Dados Multidimensionais

Descrição: Um dos desafios para aplicações E-Science é a análise em larga escala de séries temporais, originárias de grandes bancos de dados multidimensionais. Este projeto propõe a integração de algoritmos de visualização e classificação não-supervisionada de séries temporais armazenadas em banco de dados multidimensionais. Essa integração será validada com a utilização de um banco de dados real de doadores de sangue de três grandes hemocentros do Brasil, de modo a melhor caracterizar o comportamento desses doadores tendo em vista a melhoria da segurança transfusional. .
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico ( 2) .
Integrantes: Roberto Marcondes Cesar Junior - Integrante / Ester C. Sabino - Integrante / Nina Sumiko Tomita Hirata - Integrante / João Eduardo Ferreira - Coordenador.
Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro..

2006 - 2009

Processamento de Requisições em Larga Escala Utilizando o Conceito de Plano de Navegação

Descrição: Processamento de requisição é uma aplicação importante no gerenciamento de processos de negócio. Dois dos principais desafios para projeto e implementação de sistemas de processamento de requisi-ções são: (1) inter-operação e integração de sistemas de informação autônomos e heterogêneos; (2) evolução flexível e composição de elementos de software que implementam o workflow de processa-mento de requisições. Nesse projeto de pesquisa propomos o conceito de Plano de Navegação como solução para vários desafios de processamento de requisições. A hipótese principal de nossa pesquisa é que os três estágios de processamento de requisições podem ser separados, implementados, integrados e executados através de interfaces que apóiam tanto a integração de sistemas autônomos e heterogêneos como também a evolução flexível de workflows. Os três estágios são: primeiro, um cli-ente (usuário ou outro programa) gera uma requisição, isto é, um pedido de informação, materiais ou serviços; segundo, a requisição é validada através de uma série de passos de negócio. Isso é impor-tante desde que as requisições validadas possam ser finalizadas apenas quando elas satisfaçam as exigências especificadas nos passos de negócio; terceiro, a requisição validada é submetida aos pro-cessos de execução apropriados para atender às exigências especificadas. A representação e execu-ção de passos de negocio em ambientes de workflows tem gerado vários desafios. Um deles é: Qual é a melhor fundamentação formal e linguagem para controlar padrões de workflow? Algumas das lin-guagens workflow advogam abordagem de Redes de Petri ou Álgebra de Processos, como fundamen-tação formal. Entretanto, a implementação de padrões de workflow descritas por Álgebra de Proces-sos ainda é um problema em aberto. Nessa pesquisa, Álgebra de Processos tem sido usada para representar uma descrição semi-formal da linguagem de definição de Plano de Navegação (NPDL). Seis atividades são propostas nesse projeto de pesquisa para aprofu.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico ( 3) Doutorado ( 3) .
Integrantes: João Eduardo Ferreira - Coordenador.
Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.Número de orientações: 3.

2002 - 2006

Desenvolvimento de ambiente informatizado para análise determinística de dados epidemiológicos e de resistência genotípica do HIV-1.

Descrição: Este projeto pretende implementar um banco de dados através da integração de bancos do Programa de DST-AIDS já existentes (SICLOM, SISCEL e RENAGENO) de modo a viabilizar os elementos analíticos para cruzamento de informações vinculadas aos aspectos clínicos, epidemiológicos e de genotipagem dos pacientes com HIV positivo. Pretende-se também adequar ferramentas de bioinformática que permitam analisar sequências do HIV, gerando laudos de genotipagem e subtipagem..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Especialização ( 2) / Mestrado acadêmico ( 2) Doutorado ( 1) .
Integrantes: João Eduardo Ferreira - Coordenador.
Financiador(es): Ministério da Saúde - Auxílio financeiro.Número de orientações: 2.

2002 - 2004

Data Warehouse para análise de dados do banco de sangue do Hospital Israelita Albert Einstein

Descrição: Data Warehouse para análise de dados do banco de sangue do Hospital Israelita Albert Einstein..
Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento.
Alunos envolvidos: Especialização ( 2) / Mestrado acadêmico ( 2) .
Integrantes: João Eduardo Ferreira - Coordenador.
Financiador(es): Instituto Israelita de Ensino e Pesquisa Albert Einstein - Auxílio financeiro.Número de orientações: 2.

2001 - 2006

Aproximação Genômica e Pós-Genômica ao Estudo das Malárias Humanas de Plasmodium vivax e Plasmodium falciparum na Amazônia Brasileira.-ClinMalDB

Descrição: A finalização do genoma de P. falciparum, bem como avanços significativos no genoma de P. vivax foram anunciados recentemente na revista Nature [415:702-709 (2002)]. Este projeto propõe o uso de abordagens genômicas e pós-genômicas em três áreas principais de pesquisa em malária: fatores de virulência, genética de populações e quimioterapia. Além disso, através da integração com o Núcleo de Bioinformática da USP, propomos a criação de um banco de dados de seqüências e imagens de microarrays (MalDB) para explorar de modo completo toda essa nova informação biológica..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação ( 1) / Mestrado acadêmico ( 1) / Doutorado ( 1) .
Integrantes: Hernando A del Portillo, - Coordenador / João Eduardo Ferreira - Integrante.
Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.Número de orientações: 1.

2001 - 2003	Banco de dados de produtos e serviços para pessoas portadoras de deficiência
	Descrição: Banco de dados de produtos e serviços para pessoas portadoras de deficiência, junto ao CECAE-USP. Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. Integrantes: João Eduardo Ferreira - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro..

2000 - 2004	Otimização de acesso a disco para grandes volumes de dados.
	Descrição: otimização de técnicas de acesso a disco baseado em dois conceitos de projeto físico de bancos de dados: indexação e cache.. Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. Integrantes: João Eduardo Ferreira - Coordenador. Financiador(es): SUN Systems - Auxílio financeiro..

2000 - 2003

Indexing and Data Mining in Multimedia Databases-ImiMD

Descrição: Indexação de resultados de classificadores em grandes volumes de dados..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico ( 1) .
Integrantes: Caetano Traina Junior - Coordenador / João Eduardo Ferreira - Integrante.
Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.Número de orientações: 1.

1999 - 2003

Cooperation for Analysis of Gene Expression-CAGE

Descrição: Cooperação entre professores dos departamentos de Bioquímica e Ciência da Computação da USP para o desenvolvimento de tecnologia para a análise de expressão gênica em diversos contextos biológicos. O projeto contempla a montagem de um laboratório de microarrays na Bioquímica e um laboratório de bioinformática na Computação, que permitam o desenvolvimento de todo processo de análise de expressão gênica por microarrays, desde a preparação bioquímica dos experimentos e aquisição dos dados, até a análise quantitativa desses dados. .
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico ( 2) .
Integrantes: Hugo H Armelin - Coordenador / João Eduardo Ferreira - Integrante.
Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.Número de orientações: 2.

Revisor de periódico

2006 - Atual	Periódico: Journal of the Brazilian Computer Society (0104-6500)
2006 - Atual	Periódico: INFOCOMP. Journal of Computer Science (1807-4545)
2005 - Atual	Periódico: Revista de Informática Teórica e Aplicada (0103-4308)
2005 - Atual	Periódico: Genetics and molecular research

Áreas de atuação

1.	Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Sistemas de Computação / Especialidade: Arquitetura de Sistemas de Computação.
2.	Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação / Especialidade: Banco de Dados.
3.	Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação.

Idiomas

Inglês	Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.
Português	Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Espanhol	Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente, Escreve Razoavelmente.

Prêmios e títulos

2009	Prêmio de Incentivo em Ciência e Tecnologia para o SUS com o trabalho: HIVSetSubtype, Software for subtype classification of HIV-1, SUS-Ministério da Saúde.
2007	Prêmio de Incentivo em Ciência e Tecnologia para o SUS com o trabalho: Sistema Cooperativo para Estudos do HIV/AIDS no Brasil., Ministério da Saúde.
2007	Professor homenageado dos formandos do BCC - 2007, USP - São Paulo, IME-USP.
2004	2 º colocado do concurso modalidade Monografias do VII Prêmio CONIP 2004 de Excelência em Informática Aplicada aos Serviços Públicos., VII Prêmio CONIP 2004 - Órgão: SUCESU-SP e IDETI..
2003	Prêmio jovens talentos 2003 - Coordenador da equipe, IBM - http://www.ibm.com/news/br/2003/03/18-03-2003.html.
2001	Melhor Site Transacional de Serviços Públicos - Posto Fiscal Eletrônico Secretaria da Fazenda do Estado de São Paulo, CONIP - 2001.
1996	Paraninfo dos Formandos de 1996 - BCC Unesp Rio Claro, UNESP- Rio Claro.
1995	Professor homenageado dos formandos do BCC - 1995, UNESP - Rio Claro.
1994	Professor homenageado dos formandos do BCC de 1994, UNESP - Rio Claro.

Produção em C,T & A

Produção bibliográfica

Artigos completos publicados em periódicos

CARNEIRO-PROIETTI, A. B. ; SABINO, E. C. ; Sampaio, Divaldo ; Proietti, Fernando A. ; GONCALVES, T. T. ; OLIVEIRA, C. D. L. ; FERREIRA, J. E. ; Liu, Jing ; Schreiber, George B. ; Murphy, Edward L. ; BUSCH, M. P. . Demographic profile of blood donors at three major Brazilian blood centers: results from the International REDS-II study, 2007 to 2008. Transfusion (Arlington, Va.), v. 1, p. 1537-2995, 2009.

2.	CANTAO, M. ; FERREIRA, J. E. ; LEMOS, E. G. M. . Optimal Clones Identifier for Genomic Shotgun Libraries: OC Identifier Tool. Genetics and Molecular Research, v. 6, p. 743-755, 2007.

3.	ITALIANO, I. ; FERREIRA, J. E. . Synchronization Options for Data Warehouse Designs. Computer (Long Beach), v. 39, p. 53-57, 2006.

4.	ARAÚJO, L. V. ; SOARES, M. A. ; TANURI, A. ; OLIVEIRA, S. M. ; CHEQUER, P. ; SABINO, E. C. ; FERREIRA, J. E. . DBCollHIV: A Database System for Collaborative HIV analysis in Brazil. Genetics and Molecular Research, v. 5, p. 203-215, 2006.

5.	BARRETO, C. C. ; ARAÚJO, L. V. ; FERREIRA, J. E. ; SABINO, E. C. . Trends in Antiretroviral Drug Resistance and Clade Distributions Among HIV. Journal of Acquired Immune Deficiency Syndromes, v. 41, n. 3, p. 338-342, 2006.

MERINO, E. F. ; FERNANDEZ-BECERRA, C. ; DURHAM, A. M. ; FERREIRA, J. E. ; TUMILASCI, V. F. ; DARC-NEVES, J. ; DADARIO, A. ; SILVA-NUNES, M. ; FERREIRA, M. U. ; WICKRAMARACHCHI, T. A. ; PORTILLO, H. A. . Multi-character population study of the vir subtelomeric multigene superfamily of Plasmodium vivax, a major human malaria parasite. Molecular and Biochemical Parasitology, v. 149, p. 10-16, 2006.

ALBRECHT, L. ; MERINO, E. F. ; HOFFMANN, E. H. E. ; FERREIRA, M. U. ; FERREIRA, R. G. M. ; OSAKABE, A. L. ; MARTHA, R. C. D. ; RAMHARTER, M. ; DURHAM, A. M. ; FERREIRA, J. E. ; PORTILLO, H. A. . Extense variant gene family repertoire overlap in Western Amazon Plasmodium falciparum isolates. Molecular and Biochemical Parasitology, v. 150, p. 157-165, 2006.

8.	BARRERA, J. ; CESAR JUNIOR, R. M. ; FERREIRA, J. E. ; GUBITOSO, M. D. . An environment for knowledge discovery in biology. Computers in Biology and Medicine, Washington, DC ,USA, July 2004, v. 34, n. 5, p. 371-459, 2004.

9.	OIKAWA, M. K. ; BROINIZI, M. E. ; DERMAGOS, A. ; ARMELIN, H. A. ; FERREIRA, J. E. . Genflow: generic flow for integration, management and analysis. Genetics and Molecular Research, http://www.scielo.br/, v. 27, n. 4, p. 691-697, 2004.

10.	FERREIRA, J. E. ; TRAINA JUNIOR, C. . Reaproveitamento de interfaces de acesso a dados. In DBMS Tools and Strategies, Sao Paulo, v. 1, n. 4, p. 54-60, 1997.

Livros publicados/organizados ou edições

1.	MATTOSO, M. L. Q. (Org.) ; FERREIRA, J. E. (Org.) ; BRAGANHOLO, V. P. (Org.) . e-Science Workshop. 1. ed. Sociedade Brasileira de Computação, 2007. v. 1. 82 p.

2.	FERREIRA, J. E. ; FINGER, M. . Controle de Concorrência e distribuição de dados: a teoria clássica, suas limitações e extensões modernas. São Paulo: Escola Brasileira de Computação 2000, 2001. 177 p.

Capítulos de livros publicados

1.	BRAGHETTO, K. R. ; FERREIRA, J. E. ; PU, C. . NPTool: Towards Scalability and Reliability of Business Process Management (preprint). In: Springer-Verlag. (Org.). Communications in Computer and Information Science. : , 2009, v. , p. -.

2.	FERREIRA, J. E. ; TAKAI, O. K. . Understanding database modeling. In: NCBI bookshelf. (Org.). Bioinformatics Tropical Disease Research: A Pratical Approach. : NCBI, 2008, v. , p. -.

Textos em jornais de notícias/revistas

1.	FERREIRA, J. E. . E-Science e workflows científicos: uma nova onda ou de fato um novo desafio ?. Computação Brasil, Porto Alegre RS, p. 3 - 3, 01 jan. 2007.

2.	FERREIRA, J. E. ; TRAINA JUNIOR, C. . Multimédia: mythus - CD e som estéreo. Folha de São Paulo - Caderno de Informática. Folha de São Paulo, São Paulo, p. 6 - 8, 20 jul. 1994.

Trabalhos completos publicados em anais de congressos

WU, Q. ; PU, C. ; FERREIRA, J. E. . A Partial Persistent Data Structure to Support Consistent Shared Access in Collaborative Editing Applications (accepted-ICDE2010)). In: 26th IEEE International Conference on Data Engineering ICDE, 2010, Long BEACH. IEEE International Conference on Data Engineering. Long Beach : ICDE, 2010.

2.	CANTAO, M. ; ARAÚJO, L. V. ; LEMOS, E. G. M. ; FERREIRA, J. E. . Algebraic approach to optimal clone selection applied in metagenomic projects (accepted ISB 2010). In: International Symposium on Biocomputing,, 2010, Calicut-Kerela. International Symposium on Biocomputing,, 2010.

3.	ARAÚJO, L. V. ; Sanabani S.S. ; SABINO, E. C. ; FERREIRA, J. E. . HIVSetSubtype: Software for subtype classification of HIV-1 sequences. In: Annual ACM Symposium on Applied Computing- SAC-ACM, 2009, Honolulu. 24rd Annual ACM Symposium on Applied Computing- SAC-ACM, 2009. v. 2. p. 811-815.

Chui, M. ; MALKOWSKI, S. ; BROINIZI, M. E. ; FERREIRA, J. E. ; PU, C. . Implementing Rigorous Web Services with Process Algebra Navigation Plan for Web Services. In: Annual ACM Symposium on Applied Computing- SAC-ACM, 2009, Honolulu, Hawaii. 24rd Annual ACM Symposium on Applied Computing- SAC-ACM, 2009. v. 2. p. 625-631.

OIKAWA, M. K. ; SILVA, P. P. S. B. ; MERINO, E. F. ; FERNANDEZ-BECERRA, C. ; WUNDERLICH, G. ; BARRERA, J. ; DELPORTILLO, H. A. ; FERREIRA, J. E. . ClinMaldb: a clinical field-research oriented relational database to study human malaria. In: IADIS International Conference e-Health 2009, 2009, Algarve. IADIS International Conference e-Health 2009, 2009. v. 1. p. 1-9.

CANTAO, M. ; ARAÚJO, L. V. ; LEMOS, E. G. M. ; FERREIRA, J. E. . Optimal Clone Identifier based on Dynamic Rules and Process Algebra. In: International Conference on Bioinformatics, Computational Biology, Genomics and Chemoinformatics, 2009, Florida. International Conference on Bioinformatics, Computational Biology, Genomics and Chemoinformatics, 2009, 2009. p. 13-16.

7.	DUARTE G. L. ; DOMINGUES, H. ; Kon, F ; FERREIRA, J. E. . Heterogeneidade como solução para bancos de dados móveis em um sistema de saúde. In: Workshop de Informática Médica, 2009, Bento Gonçalvez. XXIX Congresso da Sociedade Brasileira de Computação, 2009. p. 2025-2034.

8.	DOMINGUES, H. ; Kon, F ; FERREIRA, J. E. . Replicação assíncrona em bancos de dados evolutivos. In: Simpósio Brasileiro de Banco de Dados, 2009, Fortaleza. XXIV Simpósio Brasileiro de Banco de Dados, 2009.

OIKAWA, M. K. ; FERREIRA, J. E. ; MALKOWSKI, S. ; PU, C. . Towards Algorithmic Generation of Business Processes: From Business Step Dependencies to Process Algebra Expressions.. In: Business Process Management Conference, 2009, ULM. Business Process Management Conference 2009. Germany : LNCC, 2009. v. 1. p. 80-96.

10.	BROINIZI, M. E. ; FERREIRA, J. E. ; Goldman A. . Using Annotations in the Naked Objects framework to explore data requirements. In: 23rd Annual ACM Symposium on Applied Computing - SAC-ACM, 2008, Fortaleza. 23rd Annual ACM Symposium on Applied Computing, 2008. v. 1. p. 630-638.

11.	ARAÚJO, L. V. ; SABINO, E. C. ; FERREIRA, J. E. . HIV drug resistance analysis tool based on process algebra. In: 23rd Annual ACM Symposium on Applied Computing- SAC-ACM, 2008, Fortaleza. 23rd Annual ACM Symposium on Applied Computing, 2008. v. 2. p. 1358-1364.

12.

NARDI, A. ; NASCIMENTO, D. R. B. ; PONTES, M. R. ; SEIXAS, T. T. ; GRACAS, F. A. F. ; FERREIRA, J. E. . Um Padrão Canônico para Controle de Paralelização em Aplicações de e-Science. In: Simposio Brasileiro de Banco de Dados, 2008, Campinas. Simposio Brasileiro de Banco de Dados, 2008. v. 1. p. 268-279.

13.

DOMINGUES, H. ; CORREIA, R. ; Kon, F ; KON, R. ; FERREIRA, J. E. . Análise e Modelagem Conceitual de um Sistema de Prontuário Eletrônico para Centros de Saúde. In: VIII Workshop de Informática Médica. In: VIII Workshop de Informática Médica (WIM´2008), 2008, Belém. VIII Workshop de Informática Médica (WIM´2008), 2008. v. 1. p. 31-40.

14.

ZULIANI, D. ; OIKAWA, M. K. ; MALKOWSKI, S. ; PEREZ-ALCAZAR, J. J. ; FERREIRA, J. E. . The RiverFish Approach to Business Process Modeling: Linking Business Steps to Control-Flow Patterns. In: The 4th International Conference on Collaborative Computing, 2008, Florida, USA. The 4th International Conference on Collaborative Computing, 2008. v. 1. p. 45-56.

15.	BRAGHETTO, K. R. ; FERREIRA, J. E. ; PU, C. . Business Processes Management using Process Algebra and Relational Database Model. In: International Conference on e-Business, 2008, Porto, Portugal. International Conference on e-Business, 2008. v. 1. p. 323-333.

16.	BRAGHETTO, K. R. ; FERREIRA, J. E. ; PU, C. . Using Control-Flow Patterns for Specifying Business Processes in Cooperative Environments. In: The 22nd Annual ACM Symposium on Applied Computing, 2007, Seoul. The 22nd Annual ACM Symposium on Applied Computing, 2007. v. 2. p. 1234-1241.

17.	NETTO, F. S. ; GOUVEA, M. A. ; FERREIRA, J. E. . Normative Attributes in Business Process Management Performance. In: 18th Annual Conference of the POMS, 2007, Dallas. 18th Annual Conference of the POMS, 2007. v. 1. p. 20-30.

18.

NETTO, F. S. ; FERREIRA, J. E. ; GOUVEA, M. A. . The use of Multidimensional Scaling as Applied to the BPM Performance in Brazilian e-Government Administration. In: Database and Expert Systems Applications - DEXA, 2007, Alemanha. Eletronic Government Conference Workshop. Austria : Trauner Druck, 2007. v. 1. p. 229-240.

19.	NARDI, A. ; FERREIRA, J. E. . Padrões para Controle de Fluxo e sua Execução em Grade. In: E-Science Workshop, 2007, Fortaleza. E-Science Workshop - SBBD-SBES 2007. Porto Alegre : Sociedade Brasileira de Computação, 2007. v. 1. p. 20-28.

20.

NETTO, F. S. ; GOUVEA, M. A. ; FERREIRA, J. E. . Avaliação de Desempenho de BPM na Administração Pública Brasileira com o Uso de Análise Multivariada. In: XXX ENANPAD - Encontro Nacional da ANPAD - Brasil, 2006, Sao Paulo. XXX ENANPAD - Encontro Nacional da ANPAD - Brasil. São Paulo : ANPAD, 2006. v. 1. p. 231-240.

21.

GOUVEA, M. A. ; NETTO, F. S. ; FERREIRA, J. E. . Evaluation of BPM in the context of a National Support Program for the State Exchequer. In: 17th Annual World Conference on Production and Operations Management, POM´S, 2006, Boston. 17th Annual World Conference on Production and Operations Management, POM´S. Boston : In: OM in the New World Uncertainties, 17th Annual POMS Conference, 2006,, 2006. v. 1. p. 107-118.

22.

FERREIRA, J. E. ; TAKAI, O. K. ; BRAGHETTO, K. R. ; PU, C. . Large Scale Order Processing through Navigation Plan Concept. In: IEEE International Conference on Services Computing (SCC 2006), 2006, Chicago. IEEE International Conference on Services Computing 2006. Chicago : IEEE Computer Society. v. 1. p. 297-300.

23.

FERREIRA, J. E. ; TAKAI, O. K. ; PU, C. . Integration of Business Processes with Autonomous Information Systems: A Case Study in Government Services. In: 7th International IEEE Conference on E-Commerce Technology 2005, 2005, Munich. 7th International IEEE Conference on E-Commerce Technology 2005. Munique : IEEE, 2005. p. 471-478.

24.

GONCALVES, B. M. T. ; ITALIANO, I. ; FERREIRA, J. E. . Data updating between the operational and analytical database through dw-log algorithm. In: Ninth International Database Apllications & Engineering Symposium - IDEAS2005, 2005, Montreal - Canada. Ninth International Database Apllications & Engineering Symposium - IDEAS2005. Montreal - Canada : International Database Apllications & Engineering Symposium, 2005. p. 77-83.

25.

FERREIRA, J. E. ; TAKAI, O. K. ; PU, C. . Integration of Collaborative Information System in Internet Applications using RiverFish Architecture. In: International Conference on Collaborative Computing: Networking, Applications and Work sharing, 2005, 2005, San Jose. The First International Conference on Collaborative Computing: Networking, Applications and Work sharing. San Jose : In Annais The First International Conference on Collaborative Computing: Networkin, 2005. v. 1. p. 19-27.

26.

FERREIRA, J. E. ; ZULIANI, D. ; NETTO, F. S. . The unified interface for the government business registration through unified model. In: 1st. International Conference on Information Systems and Technology Management. Local: FEA/USP, 2004, São Paulo. In. CONTECSI, 1., 2004, São Paulo. Anais, São Paulo:TECSI, jun. 2004. p. 14. (CD-ROM).. São Paulo : In. CONTECSI, 1., 2004, São Paulo. Anais, São Paulo:TECSI, jun. 2004. p. 14. (CD-ROM)., 2004. p. 14-23.

27.	NETTO, F. S. ; ZULIANI, D. ; FERREIRA, J. E. . O Processo Unificado de Cadastramento de Empresas: um estudo de caso. In: CONIP-2004 SUCESU-SP e IDETI, 2004, São Paulo. CONIP 2004- Serviços de Excelência em Informática Aplicada aos Serviços Públicos. Sao Paulo : SUCESU-SP e IDETI, 2004. p. 1-10.

28.	ITALIANO, I. ; FERREIRA, J. E. . A Hybrid model for data synchronism in data warehouse projects. In: IDEAS2003, 2003, Hong Kong. Seventh International Database Engineering and Applications Symposium - IDEAS2003. Hong Kong, SAR : Proceedings IEEE - IDEAS 2003, 2003. v. 1. p. 12-22.

29.

GIL, M. ; FERREIRA, J. E. ; GONCALVES, B. M. T. ; GONZALES, C. J. ; MEDINA, A. G. . O uso de Banco de Dados na disponibilização Digital de Informações para Portadores de Deficiências. In: Fórum de Informática Aplicada a Pessoas Portadoras de Necessidades Especiais, 2003, Itajaí. II Fórum de Informática Aplicada a Pessoas Portadoras de Necessidades Especiais, 2003. v. 1. p. 143-152.

30.

ARMELIN, H. H. ; BARRERA, J. ; FERREIRA, J. E. ; GUBITOSO, M. D. . A simulator for gene expression networks In: SPIE Microarrays: Optical Technologies and Informatics. In: SPIE Microarrays: Optical Technologies and informatics, 2001, San Jose. SPIE Microarrays: Optical Technologies and Informatics. San Jose : SPIE, 2001. v. 1. p. 245-254.

31.	FERREIRA, J. E. ; BUSICHIA, G. . Database modularization design for the construction of flexible information systems. In: IDEAS99, 1999, Montreal. Proceedings IEEE - IDEAS99. Montreal : IDEAS, 1999. p. 415-422.

32.	FERREIRA, J. E. ; BUSICHIA, G. . Sharing of heterogeneous databases. In: ADBIS'99 (Advances in Databases and Information Systems), 1999, Eslovênia. Proceedings for the ACM -ADBIS'99 (Advances in Databases and Information Systems. Eslovênia : ADBIS-99, 1999. p. 145-154.

33.	BUSICHIA, G. ; FERREIRA, J. E. . Compartilhamento de módulos heterogêneos de dados através de objetos integradores.. In: Simpósio Brasileiro de Banco de Dados, 1999, Florianópolis. XIII Simpósio Brasileiro de Banco de Dados. Florianópolis : SBBD-99, 1999. v. 1. p. 320-329.

34.

FERREIRA, J. E. ; TRAINA JUNIOR, C. ; BIAJIZ, M. . Use of a semantically grained database system for distribution and control within design environments. In: Third Internacional Euro-Par Conference, 1997, Passau. In Lectures Notes in Computer Science, 1300. Passau : Euro-Par, 1997. v. 1. p. 1130-1135.

35.	FERREIRA, J. E. ; TRAINA JUNIOR, C. . Usando templates orientados a objetos para acesso a base de dados relacionais. In: 6o. Congresso Nacional de Desenvolvimento de Sistemas e Orientacao a Objetos, 1997, Sao Paulo. Developers & Object Forum. Sao Paulo : Mantel, 1997. v. 1. p. 276-285.

36.	FERREIRA, J. E. ; TRAINA JUNIOR, C. . Controle de compartilhamento e acesso em GBDOO baseado em composição de objetos. In: Simpósio Brasileiro de Banco de Dados, 1996, São Carlos. XI Simpósio Brasileiro de Banco de Dados. São Carlos : SBBD, 1996. v. 1. p. 143-157.

37.	FERREIRA, J. E. ; TRAINA JUNIOR, C. . Adding conceptual constructs to support distribution in an object oriented model. In: Simpósio Brasileiro de Banco de Dados, 1994, São Carlos. IX Simpósio Brasileiro de Banco de Dados. São Carlos : SBBD, 1994. v. 1. p. 216-229.

38.

FERREIRA, J. E. ; TRAINA JUNIOR, C. . Distribution Aspects In Databases for Project Suppot Environmrnts. In: XII International Conference of the Chilean Computer Science Society, 1992, Santiago do Chile. XII International Conference of the Chilean Computer Science Society. Santiago do Chile : Computer Science Society, 1992. v. 1. p. 345-360.

Resumos expandidos publicados em anais de congressos

ARAÚJO, L. V. ; TANURI, A. ; SABINO, E. C. ; DIAZ, R. S. ; BRINDEIRO, R. M. ; FERREIRA, J. E. . Bioinformatic tools for HIV-1 sequences analyses developed for the Brazilian STD/AIDS programme network for genotype testing. In: XV International AIDS Conference, 2004, BangKok, Thailand 11-16 July 2. In anais XV International AIDS Conference , BangKok, Thailand 11-16 July 2004. BangKok, Thailand 11-16 July 2 : In anais XV International AIDS Conference, 2004. p. 14-15.

GONCALVES, B. M. T. ; SABINO, E. C. ; ARAÚJO, L. V. ; FERREIRA, J. E. . Data Warehouse Development for the Brazilian STD/AIDS Programme.. In: In anais XV International AIDS Conference, 2004, BangKok, Thailand 11-16 July 2. In anais XV International AIDS Conference. BangKok, Thailand 11-16 July 2 : XV International AIDS Conference, 2004. p. 15-18.

3.	OIKAWA, M. K. ; FERREIRA, J. E. . Heterogeneous database integration to support data mining. In: The International Conference on Bioinformatics 2002, 2002, Bangkok, Thailand. Incob 2002. bangkok, Thailand : Incob 2002, 2002. v. 1. p. 88-94.

4.	ARAÚJO, L. V. ; FERREIRA, J. E. . Cache semântico para computação sem fio baseado na abstração de composição de dados. In: I Workshop SIDAM, 2000, São Paulo. I Workshop SIDAM, 2000.

5.	SOUZA, M. C. ; FERREIRA, J. E. . Integração assíncrona de instâncias de base de dados em esquemas homogêneos. In: I Workshop SIDAM, 2000, São Paulo. I Workshop SIDAM, 2000.

Resumos publicados em anais de congressos

1.	BRAGHETTO, K. R. ; FERREIRA, J. E. ; PU, C. . Using Process Algebra to Control the Execution of Business Processes. In: 23rd Annual ACM Symposium on Applied Computing, 2008, Fortaleza. 23rd Annual ACM Symposium on Applied Computing, 2008. v. 1. p. 128-129.

2.	CORREIA, R. ; Kon, F ; FERREIRA, J. E. . Um Sistema de Software Livre para Gerenciamento de Centros de Saúde. In: Anais do III Simpósio de Iniciação Científica e Pós-Graduação do IME-USP, 2008, Sao Paulo. Anais do III Simpósio de Iniciação Científica e Pós-Graduação do IME-USP, 2008. v. 1.

Apresentações de Trabalho

1.	OIKAWA, M. K. ; FERREIRA, J. E. ; MALKOWSKI, S. ; PU, C. . Towards Algorithmic Generation of Business Processes: From Business Step Dependencies to Process Algebra Expressions.. 2009. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

2.	DOMINGUES, H. ; Kon, F ; FERREIRA, J. E. . Banco de dados evolutivos e metodos ageis. 2008. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

3.	FERREIRA, J. E. . The RiverFish Approach to Business Process Modeling: Linking Business Steps to Control-Flow Patterns. 2008. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

4.	FERREIRA, J. E. . The use of Multidimensional Scaling as Applied to the BPM Performance in Brazilian e-Government Administration. 2007. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

5.	FERREIRA, J. E. . Using Control-Flow Patterns for Specifying Business Processes in Cooperative Environments. 2007. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

6.	FERREIRA, J. E. . Integration of Business Processes with Autonomous Information Systems: A Case Study. 2005. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

7.	FERREIRA, J. E. . Data Updating Between the Operational and Analytical Databases Through DW-Log Algorithm. 2005. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

8.	FERREIRA, J. E. . Mini-curso SBBD 2004: Naked Objects. 2004. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

9.	FERREIRA, J. E. . Database modularization design for the construction of flexible information systems. 1999. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

10.	FERREIRA, J. E. . Sharing of heterogeneous databases. 1999. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

11.	FERREIRA, J. E. . Use of a semantically grained database system for distribution and control within design environments. 1997. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

12.	FERREIRA, J. E. . Controle de compartilhamento e acesso em GBDOO baseado em composição de objetos. 1996. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

13.	FERREIRA, J. E. . Adding conceptual constructs to support distribution in an object oriented model. 1994. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

Demais tipos de produção bibliográfica

1.	FERREIRA, J. E. ; TAKAI, O. K. . PROJETO E MODELAGEM DE BANCO DE DADOS - revisão técnica. Rio de Janeiro: Editora Campus/Elsevier, 2006. (Tradução/Livro).

2.	TAKAI, O. K. ; FERREIRA, J. E. . Naked Objects, 2004. (Tradução/Livro).

Produção técnica

Softwares sem registro de patente

1.	FERREIRA, J. E. ; OIKAWA, M. K. ; DURHAM, A. M. ; PORTILLO,, H. A. . ClinMalDB. 2006.

2.	FERREIRA, J. E. ; ARAÚJO, L. V. ; SABINO, E. C. ; ULIANA, R. ; DADARIO, A. . DBCollHIV. 2005.

3.	FERREIRA, J. E. . Posto Fiscal Eletrônico. 2001.

4.	FERREIRA, J. E. ; TRAINA JUNIOR, C. . Sistema MASTER-UNIMED. 1997.

5.	FERREIRA, J. E. ; TRAINA JUNIOR, C. . Autorizador de Serviços Médicos para o Complexo UNIMED. 1997.

Trabalhos técnicos

1.	ITALIANO, I. ; FERREIRA, J. E. ; TAKAI, O. K. . Aspectos Conceituais em Data Warehouse. 2001.

2.	BARRERA, J. ; FERREIRA, J. E. ; GUBITOSO, M. D. ; CESAR JUNIOR, R. M. . An Integrated environment for Storage and Analysis of Genetic. 2001.

3.	FERREIRA, J. E. ; NETTO, F. S. ; ZULIANI, D. . Arquitetura do Sistema de Informação para os Serviços Eletrônicos da Secretaria da Fazenda do Estado de São Paulo. 2000.

4.	FERREIRA, J. E. ; TRAINA JUNIOR, C. . Relatório Final do Projeto Master-UNIMED. 1997.

Demais trabalhos

1.	FERREIRA, J. E. . Desenvolvimento de um Software Modular para Análise de Expressão Gênica. 2004 (Projeto PIPE-FAPESP).

2.	FERREIRA, J. E. . Arquitetura de Sistemas de Informação para fiscalização tributária. 1999 (Consultor da Secretaria da Fazenda do Estado de São Paulo).

Bancas

Participação em bancas examinadoras

Dissertações

1.	CAMOLESI JR, L.; SILVA, F. S. C.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Guilherme Tozo de Carvalho. Aplicacao de praticas ageis na construcao de data warehouse evolutivo. 2009. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

CAMPOS, E. G. L.; REVERBEL, F. R.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Maritza Maura de Carvalho. Análise de viabilidade e estudo comparativo de aboradagens de gerenciamento de qualidade de dados. 2009. Dissertação (Mestrado em Engenharia de Computação) - Instituto de Pesquisas Tecnológicas do Estado de São Paulo.

3.	ALMEIDA JUNIOR, J. R.; HIRATA JUNIOR, R.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Grace Anne Pontes Borges. Fluxo de dados em redes de Petri coloridas e em grafos orientados a atores. 2008. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

4.	PEREZ-ALCAZAR, J. J.; RUIZ, D. D. A.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Pedro Losco Takecian. ACP e LOTOS: um estudo comparativo baseado em conceitos de BPEL e padroes de controle de fluxo. 2008. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

RUIZ, D. D. A.; SOUZA, O. N.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Karina dos Santos Machado. Um Workflow Científico para a Modelagem do Processo de Desenvolvimento de Fármacos Assistido por Computador Utilizando Receptor Flexível. 2007. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul.

RUIZ, D. D. A.; SOUZA, O. N.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Leandro Paulo Bogoni. Um método evolutivo para Aplicação de Programas de Métricas em Processos de Desenvolvimento de Software. 2007. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul.

7.	HIRATA, N. S. T.; TRAINA JUNIOR, C.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Philipe Dalla Bernardina. PCA-tree: uma proposta para indexação multidimensional. 2007. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística.

8.	HIRATA, N. S. T.; CAMOLESI JR, L.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Gustavo Bianchi Maia. Ferramenta para integração de modelos multidimensionais e softwares de visualização de séries temporais. 2007. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística.

9.	CAMOLESI JR, L.; ALVES, R. F.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Luciano Matarazzo Regno. Implantação de Sistemas CRM: Metodologia e Sistema de Apoio Orientados a Interação. 2006. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Metodista de Piracicaba.

10.	CALONEGO JR., N.; COELHO, R. C.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Carlos Eduardo Della Coletta. Realidade Virtual Aplicada à Visualização de Informações Web. 2006. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Metodista de Piracicaba.

11.	ANIDO, R. O.; MELLO FILHO, R. D. B. P.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Elton Gustavo Fanelli. Tecnicas de Otimização do Mergesort Externo num Ambiente de Banco de Dados. 2006. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas.

12.

CAMPOS, E. G. L.; BARROS, L. N.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Julio Cesar Mila. O uso de ontologias para apoiar a representação de regras e processos de negocio em sistemas de computação. 2006. Dissertação (Mestrado em Engenharia de Computação) - Instituto de Pesquisas Tecnológicas do Estado de São Paulo.

13.	VIEIRA, M. T. P.; BIAJIZ, M.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Luciene Cristina Pizzi. Mineração Multi-Relacional: O algoritmo GFP-Growth. 2006. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Federal de São Carlos.

14.	FINGER, M.; MEDEIROS, C. M. B.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Kelly Rosa Braguetto. Padrões de fluxos de processos em banco de dados relacionais. 2006. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

15.	SETZER, V. W.; MEDEIROS, C. M. B.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Yen Chin Shen. Por que usar banco de dados orientados a objetos ?. 2006. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

16.

REVERBEL, F. R.; CAMPOS, E. G. L.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Ricardo da Silva Carvalheiro. Integração de estruturas de endereçamento para automatizar o georreferenciamento de cadastros. 2006. Dissertação (Mestrado em Engenharia de Computação) - Instituto de Pesquisas Tecnológicas do Estado de São Paulo.

17.	CAMPOS, E. G. L.; PEREZ-ALCAZAR, J. J.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Devanir Zuliani. Diretrizes para Projeto Conceitual de Workflow. 2006. Dissertação (Mestrado em Engenharia de Software) - Instituto de Pesquisas Tecnológicas do Estado de São Paulo.

18.	LAENDER, A. H. F.; Goldman A.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Marcos Eduardo Bolelli Broinizi. Validação ágil e precisa de projetos conceituais de banco de dados. 2006. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística.

19.	TRAINA JUNIOR, C.; HIRATA, N. S. T.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Andre Rodrigo Sanches. Redução de dimensionalidade em séries temporais. 2006. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística.

20.	COSTA, L. F.; CARRER, H.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Pablo Rodrigo Sanches. Sistema de gerenciamento e análise de dados por bioinformática. 2006. Dissertação (Mestrado em Física) - Universidade de São Paulo.

21.	FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Claudia Alves de Souza Mello. Metadados para Apoio a Recuperação de Componentes de Software baseada em Agrupamento por Rede Neural. 2005. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Federal de São Carlos.

22.

CAMPOS, E. G. L.; REZENDE, M. N.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Carlo Borsoi Moura. Desenvolvimento de uma ontologia para o compartilahmento do conhecimento corporativo. 2005. Dissertação (Mestrado em Engenharia de Computação) - Instituto de Pesquisas Tecnológicas do Estado de São Paulo.

23.

CAMPOS, E. G. L.; SETZER, V. W.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Sergio Linares Filho. Analise de requisitos de software baseada em modelagem conceitual de dados e protótipos. 2005. Dissertação (Mestrado em Engenharia de Computação) - Instituto de Pesquisas Tecnológicas do Estado de São Paulo.

24.	FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Sálvio Padlipskas. Ajuste de consultas a banco de dados utilizando padrões. 2005. Dissertação (Mestrado em Engenharia de Computação) - Instituto de Pesquisas Tecnológicas do Estado de São Paulo.

25.	FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Alan Borsato. Metodos de prevalência de objetos. 2004. Dissertação (Mestrado em Engenharia de Sistemas e Computação) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

26.	FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Bei Yi. Banco de Dados. 2004. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas.

27.	FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Clovis K. Hanashiro. Armazenamento de Documentos XML Text-Centric e Data-Centric em Sistemas Relacionais e Objeto-Relacionais. 2004. Dissertação (Mestrado em Engenharia Eletrica) - Escola Politécnica da Universidade de São Paulo.

28.	FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Humberto Luiz Razente. Análise Visual em Processos de Redução de Dimensionalidade para Mineração em Sistemas de Bases de Dados. 2004. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo.

29.	FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Francisco Aparecido Rodrigues. Técnicas de Orientação ao Objeto para Computação Científica Paralela. 2004. Dissertação (Mestrado em Ciências Físicas Aplicadas) - Instituto de Física e Química de São Carlos.

30.	FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Marco Eugênio Madeira Di Beneditto. Analise de Padrões em banco de dados. 2004. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

31.	FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Gustavo T. Okida. Otimização de consultas por conteúdo em bancos de dados heterogêneos. 2004. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

32.	FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Marcio Katsumi Oikawa. Integracao para dados e aplicacoes em biologia molecular computacional. 2003. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

33.	FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Mauricio Serrano. Um Sistema de Recomendação para Mídias Baseado em Conteúdo Nebuloso. 2003. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Federal de São Carlos.

34.	KOFUJI, S. T.; NETTO, M. L.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Elcio Yukio Nanba. Escalonamento de tarefas em clusters de servidores SMP heterogeneos para aplicação de biologia molecular. 2003. Dissertação (Mestrado em Engenharia Elétrica) - Universidade de São Paulo.

35.	FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Marcelo Camacho Souza. Componente de controle transacional para integracao assincrona de bases de dados. 2003. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

36.	FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Márcio K. Oikawa. Integração para dados e aplicações em biologia molecular computacional. 2003. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

37.	FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Isabel Cristina Italiano. Um Modelo hibrido para atualizacao de dados em projetos de data warehouse. 2002. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

38.	FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Luciano Vieira de Araujo. CCICLO: Componente para cruzamento e integração de objetos classificados. 2002. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

39.	FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Bianka M. M. Teixeira Goncalves. Alternativas para propagacao das atualizacoes de um banco de dados operacional para um data warehouse. 2002. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

40.	FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Valmir Ferreira Marques. Análise dos Dados da base de dados do Programa de Melhoramento Genético da Raça Nelore. 2002. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo.

41.	FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Myrthes Cavalcante de Aguiar. Arquiteturas de Componentização de Servidores como Integradoras de Bancos de Dados Distribuídos. 2002. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

42.	FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Carlos Henrique Maia Braga. Metamodelo para controle de estratégias assíncronas de replicação de dados. 2001. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

43.	FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Francisco Sobreira Netto. Elementos propulsores e inibidores do uso de soluções informatizadas na modernização da prestação de serviços públicos na administração brasileira. 2001. Dissertação (Mestrado em Administração) - Centro Universitário de Franca.

44.	FURTADO, M. DE O.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Mabelly de Oliveira Furtado. Tratamento de Regras ativas em Banco de Dados. 2000. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

45.

MANTOVANI, L. A. T.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Leonardo A. T. Mantovani. Uma Alternativa para Simplificação do Sincronismo de dados entre os Ambientes Operacionais e Analíticos. 2000. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo.

46.	FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Gisele Busichia. Construção de Sistemas Modulares com Integração pelo Gerenciador de Dados. 1999. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo.

47.	FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Larissa P. S. Gomes. Método para Projeto de Aplicativos centrados em BDOO utilizando Abstração de Generalização. 1999. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo.

Teses de doutorado

1.	FORTES, R. P. M.; SALGADO, A. C. B.; TOLEDO, M. B. F.; PIMENTEL, M. G. C.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Cassio Vinicius Serafim Prazeres. Servicos Web Semanticos: da modelagem 'a composicao. 2009. Tese (Doutorado em Ciência da Computação (São Carlos)) - Universidade de São Paulo.

DIGIAMPIETRI, L. A.; REVERBEL, F. R.; NAVAUX, P. O. A.; RUIZ, D. D. A.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Alexandre Ricardo Nardi. Uma arquitetura de baixo acoplamento para excucao de padroes de controle de fluxo em grades. 2009. Tese (Doutorado em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo.

3.	FINGER, M.; DIGIAMPIETRI, L. A.; MATTOSO, M. L. Q.; RUIZ, D. D. A.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Marcio Katsumi Oikawa. Geracao de expressoes algebricas para processos de negocio usando reducoes de digrafos serie-paralelo. 2008 - Universidade de São Paulo.

4.	SETUBAL, J. C.; TOLEDO, M. B. F.; MATTOSO, M. L. Q.; TORRES, R. S.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Luciano Antonio Digiampietri. Gerenciamento de Workflows Científicos em Bioinformática. 2007. Tese (Doutorado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas.

5.	ALMEIDA JUNIOR, J. R.; SOUZA, S. N. A.; TRAINA JUNIOR, C.; CORREA, P. L. P.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Sidney da Silva Viana. Uma linguagem de gerência de regras como extensão da linguagem SQL3. 2007. Tese (Doutorado em Engenharia Elétrica) - Universidade de São Paulo.

ALMEIDA JUNIOR, J. R.; SATO, L. M.; BECERRA, J. L. R.; PENTEADO, R. A. D.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Isabel Cristina Italiano. Um modelo para manutenção de esquema e de dados em data warehouse implementados em plataformas móvies. 2007. Tese (Doutorado em Engenharia Elétrica) - Universidade de São Paulo.

SATO, L. M.; TRAVIESO, G.; CUCCHIERI, A.; SANTANA, R. H. C.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Eloiza Helena Sonoda. OOPS - Object-Oriented Parallel Ssytem. Um Framework de classes para a programação cientifica paralela. 2006. Tese (Doutorado em Fisica-Computacional) - Universidade de São Paulo.

GOUVEA, M. A.; DINIZ, E. H.; SOUZA, C. A.; PLANTULLO, V. L.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Francisco Sobreira Netto. Medição de desempenho do gerenciamento de processos de negócio - BPM no PNAFE: uma proposta de modelo. 2006. Tese (Doutorado em Fac de Economia, Administração e Contabilidadade) - Universidade de São Paulo.

9.	MATTOSO, M. L. Q.; HEUSER, C. A.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Luiz Antonio Vivacqua C. Meyer. Gerenciamento de paralelismo em workflows científicos. 2006. Tese (Doutorado em Engenharia de Sistemas e Computação) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

10.	TRAINA JUNIOR, C.; HEUSER, C. A.; AMO, S. A.; REZENDE, S. O.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Maria Camila Nardini Barioni. Operação de consulta por similaridade em grandes bases de dados complexos. 2006. Tese (Doutorado em Ciência da Computação (São Carlos)) - Universidade de São Paulo.

11.	ZUFFO, J. A.; SANTOS, C. A. S.; NETTO, M. L.; KOFUJI, S. T.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Reinaldo Lourenso. Segmentação de objetos complexos em um sistema de banco de dados objeto relacional baseado em Grids. 2005. Tese (Doutorado em Engenharia Elétrica) - Universidade de São Paulo.

12.	FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Eugênio Akihiro Nassu. Consultas sobre "Aqui" em Sistemas de Bancos de Dados em Ambientes de Computação Nômade. 2003. Tese (Doutorado em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo.

Qualificações de doutorado

1.	MEDEIROS, C. M. B.; FORTES, R. P. M.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Mônica Ribeiro Porto Ferreira. Optimizing similarity queries in metric spaces meeting users expectations. 2009. Exame de qualificação (Doutorando em Ciência da Computação (São Carlos)) - Universidade de São Paulo.

2.	FINGER, M.; BARROS, L. N.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Marcio Katsumi Oikawa. Geração semi-automática de expressões algébricas para workflows científicos. 2007. Exame de qualificação (Doutorando em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística.

3.	FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Fabio Passeti. Indentificação de marcadores genéticos. 2006. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

4.	FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Ana Carolina Quirino Simões. Análise e armazenamento de dados em microarray. 2006. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

5.	FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Bruno Augusto Nassif Travençolo. Reconhecimento de formas em Bioinformática. 2006. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

PIMENTEL, M. G. C.; FORTES, R. P. M.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Renata Maria Porto. Gerenciamento de serviços em ambientes ubíquos: uso de semântica no controle de informações compartilhadas. 2006. Exame de qualificação (Doutorando em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo.

7.	ALMEIDA JUNIOR, J. R.; BECERRA, J. L. R.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Isabel Cristina Italiano. Implementação de data warehouse para ambientes móveis. 2006. Exame de qualificação (Doutorando em Engenharia Elétrica) - Universidade de São Paulo.

8.	MEDEIROS, C. M. B.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Luciano Digiampietri. Sistemas de workflow para bioinformatica. 2005. Exame de qualificação (Doutorando em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas.

9.	GOUVEA, M. A.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Francisco Sobreira Neto. Sistema de Medição de Desempenho para Gerenciamento de Processos de Negócio. 2005. Exame de qualificação (Doutorando em Fac de Economia, Administração e Contabilidadade) - Universidade de São Paulo.

Participação em bancas de comissões julgadoras

Concurso público

1.	AMO, S. A.; SANTOS, M. P.; FERREIRA, J. E.. Membro titular da banca de contratação. 2009. Universidade Federal de Uberlândia.

2.	MASIERO, P. C.; BARROS, L. N.; FERREIRA, J. E.. Membro titular da comissao julgadora do concurso publico Sistema Informacao e Banco de Dados EACH-USP. 2008. Universidade de São Paulo.

3.	CORREA, P. L. P.; TRAINA JUNIOR, C.; FERREIRA, J. E.. Membro titular da comissao julgadora do concurso publico Banco de Dados e Engenharia Software. 2008. Universidade de São Paulo.

4.	FERREIRA, J. E.. Membro titular da comissão do processo seletivo para preenchimento de uma função professor assistente na disciplina Banco de Dados. 2007. Universidade de São Paulo.

5.	FERREIRA, J. E.. Membro titular da comissão do processo seletivo para preenchimento de uma função professor assistente das disciplinas Sistemas de Informação e Banco de Dados. 2006. Universidade de São Paulo - Zona Leste.

6.	FERREIRA, J. E.. Membro titular da banca para contratação de um docente na categoria Professor Doutor, na área de Ciência da Computação Especialidade II: Banco de Dados. 2005. Universidade de São Paulo.

7.	FERREIRA, J. E.. Membro titular da banca para provimento de um cargo de Professor Assistente . 2005. Universidade Estadual Paulista - Júlio de Mesquita Filho.

8.	FERREIRA, J. E.. Membro titular da Banca Examinadora do Concurso Publico de Porvas e Titulos para preenchimento de uma função professor assistente na disciplina Sistemas orientados a objetos. 2005. Universidade Estadual Paulista.

9.	FERREIRA, J. E.. Membro titular da banca para provimento de um cargo de Professor Assistente UNESP Rio Claro. 2004. UNESP/RIO CLARO - Centro de Estudos de Insetos Sociais.

10.	FERREIRA, J. E.. Membro titular da banca para provimento de um cargo de Professor Assistente UNESP Rio Claro. Disciplina: Teoria da Computação. 2004. UNESP/RIO CLARO - Centro de Estudos de Insetos Sociais.

11.	FERREIRA, J. E.. Membro titular da banca para contratação de um docente na categoria Professor Doutor, na área de Ciência da Computação Especialidade: Banco de Dados nas disciplinas MC-526 e MO-410. 2004. Universidade Estadual de Campinas.

12.	FERREIRA, J. E.. Membro titular da banca para efetivação de Prof. Assistente - UNESP Rio Claro- Banco de dados. 2003. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

13.	FERREIRA, J. E.. Membro titular da banca para efetivação de Prof. Assistente - UNESP Rio Claro - Compiladores. 2003. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

14.	FERREIRA, J. E.. Membro titular da Banca para o cargo de Prof. Adjunto - Departamento da Computação. 2001. Universidade Federal de São Carlos.

15.	FERREIRA, J. E.. Membro titular da banca examinadora de concurso público de títulos e provas para provimento de um cargo efetivo - disciplina Teoria da Computação. 2000. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Avaliação de cursos

1.	GUILHERME, I. R.; FERREIRA, J. E.. Relatório Circunstanciado sobre curso de graduação em tecnologia em informática-CEE 478/2006. 2006. Conselho Estadual de Educação.

2.	LIESENBERG, H.; FERREIRA, J. E.. Relatório circunstanciado para efeito de autorização de funcionamento do curso de Engenharia de Informática no IMES de Assis-GP 0106/95. 1995. Centro Estadual de Educação Tecnológica Paula Souza.

Eventos

Participação em eventos

1.	Business Process Management.Towards Algorithmic Generation of Business Processes: From Business Step Dependencies to Process Algebra Expressions. 2009. (Congresso).

2.	The 4th International Conference on Collaborative Computing.The RiverFish Approach to Business Process Modeling: Linking Business Steps to Control-Flow Patterns. 2008. (Congresso).

3.	Simposio Brasileiro de Banco de Dados.Banco de dados evolutivos e metodos ageis. 2008. (Congresso).

4.	Congresso de Tecnologias para Gestão de Dados e Metadados do Cone Sul.Gerenciamento de Processos de Negócio Usando Álgebra de Processos. 2007. (Congresso).

5.	Symposium on Apllied Computing.Using Control-Flow Patterns for Specifying Business Processes in Cooperative Environments. 2007. (Congresso).

6.	Database and Expert Systems Applications - DEXA.The use of Multidimensional Scaling as Applied to the BPM Performance in Brazilian e-Government Administration. 2007. (Congresso).

7.	Intelligent Systems for Molecular Biology. 2006. (Congresso).

8.	Simpósio Brasileiro de Banco de Dados. 2006. (Congresso).

9.	7th International IEEE Conference on E-Commerce Technology.Integration of Business Processes with Autonomous Information Systems: A Case Study in Government Services. 2005. (Congresso).

10.	Simpósio Brasileiro de Banco de Dados. 2005. (Congresso).

11.	IDEAS-2005.International Database Engineering and Applications Symposium. 2005. (Congresso).

12.	1o. International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computacional Biology.A Database System for Collaborative HIV analysis in Brazil. 2005. (Congresso).

13.	International IEEE Conference om E-Commerce Techonology.Integration of Business Processes with Autonomous Information Systems: A Case Study in Government Services. 2005. (Congresso).

14.	1st. International Conference on Information Systems and Technology Management. Local: FEA/USP.The unified interface for the government business registration through unified model. 2004. (Congresso).

15.	SBBD 2004.Mini-curso SBBD 2004: Naked Objects. 2004. (Congresso).

16.	CONIP-2004 SUCESU-SP e IDETI.O Processo Unificado de Cadastramento de Empresas: um estudo de caso. 2004. (Congresso).

17.	Simpósio Brasileiro de Banco de Dados.Simpósio Brasileiro de Banco de Dados. 2004. (Congresso).

18.	III Latin American Course on Bioinformatics for Tropical Disease Research - OMS.Workshop: Introduction to Bioinformatics Databases. 2004. (Oficina).

19.	1st International Conference on Bioinformatics and Computational Biology.Genflow: generic flow for integration, management and analysis. 2003. (Congresso).

20.	II Latin American Course on Bioinformatics for Tropical Disease Research.Introduction for Bioinformatic Databases - OMS. 2003. (Oficina).

21.	ENITEC.I Encontro de Informação e Tecnologia - ENITEC. 2003. (Encontro).

22.	Encontro de Informática da Unesp.Estratégias de Distribuição e Replicação de Dados em Sistemas Corporativos. 2003. (Encontro).

23.	CN DST e Aids.Projeto de Construção de Data Warehouse e Desenvolvimento de Ferramentas para Bioinformática. 2003. (Outra).

24.	Microarray Patterns.Microarray database patterns. 2000. (Encontro).

25.	Escola Brasileira de Computação 2000.Controle de Concorrência e distribuição de dados: a teoria clássica, suas limitações e extensões modernas. 2000. (Outra).

26.	Simpósio Brasileiro de Banco de Dados.Compartilhamento de módulos heterogêneos de dados através de objetos integradores. 1999. (Congresso).

27.	IDEAS99.Database modularization design for the construction of flexible information systems. 1999. (Congresso).

28.	ADBIS'99 (Advances in Databases and Information Systems).Sharing of heterogeneous databases. 1999. (Congresso).

29.	Third Internacional Euro-Par Conference.Use of a semantically grained database system for distribution and control within design environments. 1997. (Congresso).

30.	6o. Congresso Nacional de Desenvolvimento de Sistemas e Orientacao a Objetos.Usando templates orientados a objetos para acesso a basse de dados relacionais. 1997. (Congresso).

31.	Simpósio Brasileiro de Banco de Dados.Controle de compartilhamento e acesso em GBDOO baseado em composição de objetos. 1996. (Congresso).

32.	Simpósio Brasileiro de Banco de Dados.Adding conceptual constructs to support distribution in an object oriented model. 1994. (Congresso).

Organização de eventos

1.	FERREIRA, J. E. . Comitê de Programa Sixteenth Conference on Information and Knowledge Management. 2007. (Congresso).

2.	FERREIRA, J. E. . Comitê de Programa e-Science Workshop. 2007. (Congresso).

3.	FERREIRA, J. E. . Xmeeting - Comitê Editorial. 2006. (Congresso).

4.	FERREIRA, J. E. . Xmeeting - Comitê Editorial. 2005. (Congresso).

5.	FERREIRA, J. E. . SBBD - Comitê de Programa. 2005. (Congresso).

6.	FERREIRA, J. E. . ICOBICOBI - comitê organizador. 2004. (Congresso).

7.	FERREIRA, J. E. . SBBD - Comitê de Programa. 2004. (Congresso).

8.	FERREIRA, J. E. . ICOBICOBI - comitê organizador. 2003. (Congresso).

9.	FERREIRA, J. E. . SBBD - Comitê de Programa. 2001. (Congresso).

10.	FERREIRA, J. E. . SBBD - Comitê de Programa. 2000. (Congresso).

11.	FERREIRA, J. E. . SBBD - Comitê Organizador. 1996. (Congresso).

12.	FERREIRA, J. E. . SBBD - Comitê Organizador. 1994. (Congresso).

Orientações

Orientações em andamento

Dissertação de mestrado

1.	Gustavo Luiz Duarte. Controle de transações no ambiente de computação móvel. Início: 2008. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. (Orientador).

2.	Tiago Mota Jorge. Vinculação de registros usando indexação de dados. Início: 2007. Dissertação (Mestrado em Pós graduação Computação) - Instituto de Matemática e Estatística. (Orientador).

3.	Elisa Pereira Kameda. Redução de dimensionalidade em modelos de bancos de dados multidimensionais. Início: 2007. Dissertação (Mestrado em Pós graduação Computação) - Instituto de Matemática e Estatística. (Orientador).

4.	Mauricio Chui Rodrigues. Serviços Web e a NPDL. Início: 2007. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística. (Orientador).

5.	Ronie Uliana. Evolução de banco de dados em Ruby on Rails. Início: 2007. Dissertação (Mestrado em Engenharia de Computação) - Instituto de Pesquisas Tecnológicas do Estado de São Paulo. (Co-orientador).

Tese de doutorado

1.	Pedro Losco Takecian. Controle de transações para processos transformações e limpeza de dados. Início: 2009. Tese (Doutorado em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo, NIH-USA Fundacao Pro-Sangue. (Orientador).

2.	Fernanda Nascimento. Procedência de dados em segurança transfusional. Início: 2007. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Co-orientador).

3.	Helves Domingues. Evolução de Banco de Dados em Métodos Ágeis. Início: 2007. Tese (Doutorado em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. (Co-orientador).

4.	Kelly Rosa Braghetto. Identificação Não-Supervisionada de Padrões de Fluxos em Workflow Científicos. Início: 2006. Tese (Doutorado em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. (Orientador).

Supervisões e orientações concluídas

Dissertação de mestrado

1.	Guilherme Tozo de Carvalho. Aplicação de práticas ágeis na construção de data warehouse evolutivo. 2009. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Orientador: João Eduardo Ferreira.

2.	Pedro Losco Takecian. ACP e LOTOS: um estudo comparativo baseado em conceitos de BPEL e padrões de controle de fluxo. 2008. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, National Institutes of Health. Orientador: João Eduardo Ferreira.

3.	Grace Anne Pontes Borges. Fluxo de dados em redes de Petri coloridas e em grafos orientados a atores. 2008. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Orientador: João Eduardo Ferreira.

4.	Gustavo Bianchi Maia. Ferramenta para integração de banco de dados multidimensionais e softwares de visualização de séries temporais. 2007. Dissertação (Mestrado em Pós graduação Computação) - Instituto de Matemática e Estatística, . Orientador: João Eduardo Ferreira.

RICARDO DA SILVA CARVALHEIRO. Integração de estruturas de endereçamento para viabilizar a automatização do georreferenciamento de cadastros: Um estudo de caso. 2006. Dissertação (Mestrado em Engenharia de Computação) - Instituto de Pesquisas Tecnológicas do Estado de São Paulo, . Orientador: João Eduardo Ferreira.

6.	Kelly Rosa Braghetto. CONTROLE DE PADRÕES DE FLUXOS DE PROCESSOS EM BANCOS DE DADOS RELACIONAIS. 2006. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: João Eduardo Ferreira.

7.	Devanir Zuliani. Projeto Conceitual de Workflow. 2006. Dissertação (Mestrado em Engenharia de Software) - Instituto de Pesquisas Tecnológicas do Estado de São Paulo, . Orientador: João Eduardo Ferreira.

8.	Marcos Eduardo Bolelli Broinizi. Validacao Agil e Precisa de Projetos Conceituais de Banco de Dados. 2006. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: João Eduardo Ferreira.

9.	Julio Cesar Mila. Utilização de ontologias na especificacao de processos e regras de negocio. 2005. Dissertação (Mestrado em Engenharia de Computação) - Instituto de Pesquisas Tecnológicas do Estado de São Paulo, . Orientador: João Eduardo Ferreira.

10.	Gustavo Tadao Okida. Índices para consultas por conteúdo em bancos de dados heterogêneos. 2004. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Orientador: João Eduardo Ferreira.

11.	Marcio Katsumi Oikawa. Integracao para dados e aplicacoes em biologia molecular computacional. 2003. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: João Eduardo Ferreira.

12.	Marcelo Camacho de Souza. Componente de controle transacional para integracao assincrona de bases de dados. 2003. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Orientador: João Eduardo Ferreira.

13.	Elcio Yukio Nanba. Escalonamento de tarefas em clusters de servidores SMP heterogeneos para aplicacoes de biologia molecular. 2003. Dissertação (Mestrado em Engenharia Elétrica) - Universidade de São Paulo, . Co-Orientador: João Eduardo Ferreira.

14.	Isabel Italiano. Um Modelo hibrido para atualizacao de dados em projetos de data warehouse. 2002. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Orientador: João Eduardo Ferreira.

15.	Bianka M. M. Teixeira Goncalves. Alternativas para propagacao das atualizacoes de um banco de dados operacional para um data warehouse. 2002. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Orientador: João Eduardo Ferreira.

16.	Luciano Vieira de Araujo. CCICLO: Componente para cruzamento e integracao de objetos classificados. 2002. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Orientador: João Eduardo Ferreira.

17.

LEONARDO AUGUSTO TANIGUTI MANTOVANI. Uma alternativa para Simplificação de Sincronismo de Dados Temporais entre Ambientes Operacionais e Analíticos. 2001. 98 f. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo, . Orientador: João Eduardo Ferreira.

18.	CARLOS HENRIQUE MAIA BRAGA. Meta Modelo para Controle Corporativo de Estratégia de Replicação de Dados. 2001. 112 f. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Orientador: João Eduardo Ferreira.

19.

Gisele Busichia. Construção de Sistemas Modulares com Integração pelo Gerenciador de Dados. 1999. 110 f. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: João Eduardo Ferreira.

Tese de doutorado

1.	Alexandre Ricardo Nardi. Uma arquitetura de baixo acoplamento para execução de padrões de controle de fluxo em grades. 2009. Tese (Doutorado em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo, . Orientador: João Eduardo Ferreira.

2.	Maurício Egidio Cantão. Abordagem algébrica para seleção de clones ótimos em projetos genomas e metagenomas. 2009. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Co-Orientador: João Eduardo Ferreira.

3.	Márcio Katsumi Oikawa. Geração de expressões algébricas para processos de negócio usando reduções de digrafos série-paralelo. 2008. Tese (Doutorado em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo, NIH-USA Fundacao Pro-Sangue. Orientador: João Eduardo Ferreira.

4.	Luciano Vieira de Araújo. Sistema colaborativo para armazenamento e análise de dados de HIV. 2008. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, NIH-USA Fundacao Pro-Sangue. Orientador: João Eduardo Ferreira.

5.	Francisco Sobreira Netto. Medição de desempenho do gerenciamento de processos de negócio -BPM no PNAFE: uma proposta de modelo. 2006. Tese (Doutorado em Administração) - Universidade de São Paulo, . Co-Orientador: João Eduardo Ferreira.

Iniciação Científica

1.	Mauricio Chui Rodrigues. Encapsulando a NavigationPlanTool como Serviços Web. 2007. Iniciação Científica. (Graduando em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: João Eduardo Ferreira.

2.	Marcos Eduardo Bolelli Broinzi. Genflow: um ambiente para integração de dados e processos em aplicações de bioinformática. 2003. Iniciação Científica - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: João Eduardo Ferreira.

Leonardo A. T. Montavani. Modelagem de dados multidimensionais. 1998. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado em Ciências da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: João Eduardo Ferreira.

4.	André Luis Munhos Matos. Controle de transações assíncronas. 1997. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado em Ciências da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: João Eduardo Ferreira.

5.	Marcelo Camargo. Banco de dados orientados a objetos. 1995. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado em Ciências da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: João Eduardo Ferreira.

6.	Patricia Maura Angelini. Integração de dados. 1994. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado em Ciências da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: João Eduardo Ferreira.

7.	Fernanda Juliana Teixeira. Banco de dados distribuídos. 1993. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado em Ciências da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho. Orientador: João Eduardo Ferreira.

Outras informações relevantes

- Membro da Comissão de Avaliadores do Simpósio Brasileiro de Banco de Dados respectivamente nos anos de 1995 a 2010.
- Avaliador externo de trabalhos dos congressos SCC, ICWS e BPM nos anos de 2008 e 2009..

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