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SciELO - artigos em texto completo

Glaucia Mendes Souza
Bolsista de Produtividade em Pesquisa do CNPq - Nível 2

A Dra. Glaucia Souza é Bacharel pelo Instituto de Biociências da USP (1988), Doutora em Bioquimica pelo Instituto de Quimica da USP (1993), pós-doutora em genética molecular pelo La Jolla Cancer Research Foundation (1994) e pós-doutora em genética molecular pelo Baylor College of Medicine (1996). Contratada no Instituto de Química da USP em 1998 atualmente ela é professora associada e lider do Laboratório de Transdução de Sinal. A Dra. Glaucia Souza é coordenadora de várias iniciativas em genômica de cana-de-açúcar. Em 2000 ela se juntou a um grupo de 200 pesquisadores para o sequenciamento e anotação de ESTs da cana (Projeto SUCEST) como parte do Programa Genoma da FAPESP. Em 2003 ela assumiu a coordenação do SUCEST e iniciou o Projeto SUCEST-FUN (http://sucest-fun.org) composto por uma rede de pesquisadores dedicados à análise funcional dos genes da cana e à identificação de genes associados à características agronômicas de interesse. As atividades do seu grupo se focam na análise do Transcriptoma, geração de plantas transgênicas e estudos relacionados à investigação de redes regulatórias e de sinalização. Genes associados ao teor de sacarose, biomassa, tolerância à seca, deficiência em fosfato, herbivoria, interação com bactérias endofíticas, mudanças climáticas, açúcares e hormônios foram identificados. Em 2007 a iniciativa SUCEST-FUN progrediu para a formação de uma rede de pesquisa associada a programas de melhoramento da cana no país. O grupo pretende usar ferramentas biotecnológicas para aumentar o teor de sacarose, alterar a qualidade e quantidade da fibra, desenvolver plantas resistentes à seca, identificar promotores e marcadores moleculares. A Dra. Souza está desenvolvendo o banco de dados SUCEST-FUN e ferramentas de bioinformática para a integração de dados moleculares e agronômicos da cana. Desde 2003 ela desenvolve pesquisa em colaboração com o setor privado para alterar o metabolismo energético da cana-de-açúcar e o seu potencial na produção de biocombustíveis. Em 2008 a Dra. Souza foi apontada Coordenadora da Divisão de BIOMASSA do Programa de Bioenergia da FAPESP (BIOEN) e Coordenadora de Área (Biologia II) da FAPESP. Ela orienta pelos programas de Pós-graduação em Bioquímica, Bioinformática e pelo Programa de Pós-graduação Internacional da USP em Biologia Celular e Molecular (Biologia Vegetal).
(Texto informado pelo autor)

Última atualização do currículo em 16/07/2009
Endereço para acessar este CV:
http://lattes.cnpq.br/9035886932770957
Dados pessoais
NomeGlaucia Mendes Souza
Nome em citações bibliográficasSOUZA, G. M.;Souza, Glaucia M
SexoFeminino
Endereço profissionalUniversidade de São Paulo.
Av. Prof. Lineu Prestes 748
Butantan
05508-900 - Sao Paulo, SP - Brasil
Telefone: (011) 38183815 Ramal: 216 Fax: (011) 38155579
URL da Homepage: http://sucest-fun.org

Formação acadêmica/Titulação
2004Livre-docência.
Instituto de Quimica da USP.
Título: , Ano de obtenção: 2004.
1997 - 1998Pós-Doutorado .
Instituto de Quimica da USP.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
1996 - 1997Pós-Doutorado .
Baylor College of Medicine.
Bolsista do(a): Baylor College of Medicine, , .
1994 - 1995Pós-Doutorado .
Burnham Institute - La Jolla Cancer Research Foundation.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.
1989 - 1993Doutorado em Bioquimica .
Instituto de Quimica da USP.
Título: Estudo dos mecanismos envolvidos no controle por cAMP da expressão do gene para uma molécula de adesão em Dictyostelium discoideum, Ano de Obtenção: 1993.
Orientador: Aline Maria da Silva.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
Palavras-chave: Dictyostelium; Expressao Genica; Camp; Adesao Celular.
1984 - 1988Graduação em Bacharelado .
Instituto de Biociências - USP.

Formação complementar
2005 - 2005Proteção Radiológica. (Carga horária: 40h).
Instituto de Quimica da USP.

Atuação profissional
Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
Vínculo institucional
2008 - Atual Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Coordenador de Área, Carga horária: 8
Outras informações Coordenador de Área (Biologia II)
Instituto de Quimica da USP, IQ-USP, Brasil.
Vínculo institucional
1998 - Atual Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professora Associada, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Atividades
05/2008 - AtualConselhos, Comissões e Consultoria, FAPESP, .
Cargo ou função
Membro da Coordenação de Área (Biologia II).
2008 - AtualAtividades de Participação em Projeto, Instituto de Quimica, .
Projetos de pesquisa
Redes Regulatórias e de Sinalização da Cana-de-açúcar
08/2007 - AtualConselhos, Comissões e Consultoria, International Society of Cane Technologists, .
Cargo ou função
Membro do Comitê de Biologia.
03/2006 - AtualEnsino, Química, Nível: Graduação.
Disciplinas ministradas
QBQ2454 - Bioquímica
11/2004 - AtualConselhos, Comissões e Consultoria, Central de Álcool Lucélia, .
Cargo ou função
Consultora.
09/2004 - AtualConselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Quimica, .
Cargo ou função
Presidente da Comissão Interna de Biossegurança.
08/2004 - AtualConselhos, Comissões e Consultoria, Central de Álcool Lucélia, .
Cargo ou função
Consultora.
08/2004 - AtualConselhos, Comissões e Consultoria, COPERSUCAR, .
Cargo ou função
Consultora.
07/2004 - AtualPesquisa e desenvolvimento , Instituto de Quimica, .
Linhas de pesquisa
Transcriptoma da Cana-de-açúcar (SUCEST-FUN)
07/2004 - AtualAtividades de Participação em Projeto, Instituto de Quimica, .
Projetos de pesquisa
SUCEST-FUN: Transcriptoma da Cana-de-açúcar
10/2003 - AtualConselhos, Comissões e Consultoria, FAPESP, .
Cargo ou função
Coordenadora Geral do Projeto SUCEST.
10/2003 - AtualConselhos, Comissões e Consultoria, FAPESP, .
Cargo ou função
Coordenadora da Aliança FAPESP/Cropdesign.
10/2003 - AtualAtividades de Participação em Projeto, Instituto de Quimica, .
Projetos de pesquisa
Aliança FAPESP/Cropdesign
09/2003 - AtualConselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Quimica, .
Cargo ou função
Membro titular da Comissão de Distribuição Didática.
08/2003 - AtualConselhos, Comissões e Consultoria, Embrapa, .
Cargo ou função
consultora.
05/2002 - AtualConselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Quimica, .
Cargo ou função
Membro suplente da Comissão de Pós-graduação do Curso interunidades de pós-graduação em Bioinformatica.
12/2001 - AtualConselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Quimica, .
Cargo ou função
Membro titular da Comissão de Radioproteção.
06/2001 - AtualConselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Quimica, .
Cargo ou função
Membro titular do Conselho do Departamento de Bioquímica.
08/2000 - AtualAtividades de Participação em Projeto, Instituto de Quimica, .
Projetos de pesquisa
SUCAST - Transdução de sinal da cana-de-açúcar
07/2000 - AtualPesquisa e desenvolvimento , Instituto de Quimica, .
Linhas de pesquisa
Transdução de Sinal da Cana-de-açúcar (SUCAST)
02/2000 - AtualOutras atividades técnico-científicas , Instituto de Quimica, .
Atividade realizada
Co-coordenadora do Laboratório de microarrays do CAGE (Cooperação para Analise dos Genes e sua Expressão).
02/1998 - AtualPesquisa e desenvolvimento , Instituto de Quimica, .
Linhas de pesquisa
Transdução de sinal da transição crescimento/desenvolvimento
03/2008 - 07/2008Ensino, Fisioterapia, Nível: Graduação.
Disciplinas ministradas
QBQ104 - Bioquímica e Biologia Molecular
03/2008 - 07/2008Ensino, Química, Nível: Graduação.
Disciplinas ministradas
QBQ2456 - Biologia Molecular
03/2007 - 07/2007Ensino, Educação Física, Nível: Graduação.
Disciplinas ministradas
QBQ102 - Bioquímica e Biologia Molecular
03/2007 - 07/2007Ensino, Fisioterapia, Nível: Graduação.
Disciplinas ministradas
QBQ104 - Bioquímica e Biologia Molecular
08/2006 - 12/2006Ensino, Química, Nível: Graduação.
Disciplinas ministradas
QBQ2456 - Biologia Molecular
05/2006 - 05/2006Ensino, Bioquimica, Nível: Pós-Graduação.
Disciplinas ministradas
Tópicos Avançados em Neurociências
08/2005 - 12/2005Ensino, Química, Nível: Graduação.
Disciplinas ministradas
QBQ2456 - Biologia Molecular
08/2005 - 12/2005Ensino, Química, Nível: Graduação.
Disciplinas ministradas
QBQ2456 - Biologia Molecular
10/2005 - 10/2005Extensão universitária , Centro de Extensão Universitária, .
Atividade de extensão realizada
Aula no Curso de Especialização em Química.
02/2005 - 07/2005Ensino, Bioquimica, Nível: Graduação.
Disciplinas ministradas
QBQ216 - Bioquímica
01/1999 - 01/2005Atividades de Participação em Projeto, Instituto de Quimica, .
Projetos de pesquisa
Cooperation for Analysis of Gene Expression
08/2004 - 12/2004Ensino, Biologia Molecular, Nível: Graduação.
Disciplinas ministradas
QBQ2456 - Biologia Molecular
08/2004 - 12/2004Ensino, Bioquimica, Nível: Graduação.
Disciplinas ministradas
QBQ316 - Bioquímica Experimental
08/2003 - 11/2003Ensino, QBQ5728 - Análise Funcional de Genômas, Nível: Pós-Graduação.
Disciplinas ministradas
QBQ5728 - Análise Funcional de Genomas
02/2003 - 07/2003Ensino, Bioquimica, Nível: Graduação.
Disciplinas ministradas
QBQ101 - Bioquímica para Enfermagem
09/2002 - 12/2002Ensino, Bioquimica, Nível: Pós-Graduação.
Disciplinas ministradas
QBQ5728 - Análise Funcional de Genômas
02/2002 - 07/2002Ensino, Bioquimica, Nível: Graduação.
Disciplinas ministradas
QBQ101 - Bioquimica para Enfermagem
09/2001 - 12/2001Ensino, Bioquimica, Nível: Pós-Graduação.
Disciplinas ministradas
QBQ5728 - Analise Funcional de Genomas
02/2001 - 07/2001Ensino, Bioquimica, Nível: Graduação.
Disciplinas ministradas
QBQ101 - Bioquimica para Enfermagem
05/2000 - 07/2001Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Quimica, .
Cargo ou função
Membro da comissão ad hoc do Departamento para criação da homepage do Instituto e do Departamento.
06/1999 - 06/2001Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Quimica, .
Cargo ou função
Membro suplente do Conselho do Departamento de Bioquímica.
09/1998 - 08/2000Atividades de Participação em Projeto, Instituto de Quimica, .
Projetos de pesquisa
Estudo das vias de Transdução de Sinal que controlam a transição crescimento/desenvolvimento em Dictyostelium discoideum
02/2000 - 07/2000Ensino, Bioquimica, Nível: Graduação.
Disciplinas ministradas
QBQ101 - Bioquimica para Enfermagem
02/2000 - 07/2000Ensino, Bioquimica, Nível: Graduação.
Disciplinas ministradas
QBQ102 - Enfermagem para a Educação Fisica
08/1999 - 12/1999Ensino, Bioquimica, Nível: Graduação.
Disciplinas ministradas
QBQ219 - Bioquimica para Nutrição
02/1999 - 07/1999Ensino, Bioquimica, Nível: Graduação.
Disciplinas ministradas
QBQ204 - Bioquimica para a Odontologia
02/1999 - 07/1999Ensino, Bioquimica, Nível: Graduação.
Disciplinas ministradas
QBQ101 - Bioquimica para a Enfermagem
03/1999 - 05/1999Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Quimica, .
Cargo ou função
Membro titular da comissão para propor a realocação de técnicos de nível básico.
08/1998 - 12/1998Ensino, Bioquimica, Nível: Graduação.
Disciplinas ministradas
QBQ219 - Bioquimica para a Biologia
02/1998 - 07/1998Ensino, Bioquimica, Nível: Graduação.
Disciplinas ministradas
QBQ101 - Bioquimica para a Enfermagem
Baylor College of Medicine, BCM, Estados Unidos.
Vínculo institucional
2000 - 2000 Vínculo: Professor Visitante, Enquadramento Funcional: Visiting Scholar, Carga horária: 40
Atividades
10/2000 - 10/2000Pesquisa e desenvolvimento , Department of Biochemistry, .
Linhas de pesquisa
Transdução de Sinal da Transição Crescimento/Desenvolvimento
Baylor College of Medicine, BCM, Estados Unidos.
Vínculo institucional
1999 - 1999 Vínculo: Professor Visitante, Enquadramento Funcional: Visiting Scholar, Carga horária: 40
Baylor College of Medicine, BCM, Estados Unidos.
Vínculo institucional
1998 - 1998 Vínculo: Professor Visitante, Enquadramento Funcional: Visiting Scholar, Carga horária: 40

Linhas de Pesquisa
1. Transdução de sinal da transição crescimento/desenvolvimento
Objetivos: Uma característica comum a todos os seres vivos é a sua capacidade de empregar mecanismos de sobrevivência em resposta a estresses ambientais. O mais comum estresse encontrado é o estresse nutricional. Nós determinamos que vários aspectos da resposta à carência nutricional são coordenados pela proteína quinase YakA em Dictyostelium. Este microorganismo de solo responde à carência alimentar entrando em um programa de desenvolvimento onde as amebas adotam um modo de vida multicelular e se diferenciam em esporos para sobreviverem às condições desfavoráveis. As respostas observadas nas primeiras horas que se seguem à detecção da exaustão do suprimento alimentar incluem a parada do crescimento, a indução da síntese de cAMP, a ativação da Proteína Quinase dependente de cAMP (PKA) e a migração das células através de gradientes de cAMP secretado que guiam a formação dos organismos multicelulares. Nossos estudos indicam um papel para a YakA e a PKA em Dictyostelium também na inibição do crescimento que se segue ao estresse oxidativo e nitrosoativo. Compostos como H2O2 e óxido nítrico induzem a síntese de cAMP e a ativação da PKA. Com a intenção de identificarmos as vias reguladas pela YakA isolamos supressores dos fenótipos associados a esta quinase. Os fenótipos analisados incluiram o padrão de desenvolvimento em resposta à carência nutricional e a hiper-sensibilidade a óxido nítrico e água oxigenada observada para o mutante nulo yakA. Os supressores em estudo codificam para as proteínas PufA, KeaA e a própria PKA-C. O presente projeto se destina à caracterização do perfil de expressão gênica dos mutantes para estes genes utilizando microarrays de cDNA, a identificação de proteínas que interagem com estes pela purificação de complexos e identificação destes por espectrometria de massa (TAP-tag/MS) e a análise do papel de keaA na resposta a estresses..
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.
Setores de atividade: Produtos e Processos Biotecnológicos Vinculados À Saúde Humana Ou dos Animais.
Palavras-chave: Ciclo Celular; Desenvolvimento; Dictyostelium; Expressao Genica; microarrays de DNA; AMP cíclico.
2. Transdução de Sinal da Cana-de-açúcar (SUCAST)
Objetivos: O projeto SUCAST (Sugarcane Signal Transduction) foi iniciado em 2000 com o objetivo de identificar, catalogar e caracterizar os ESTs da cana-de-açúcar que estão envolvidos em vias de transdução de sinal, bem como a organização de todas estas informações em um banco de dados que facilite futuras análises funcionais. As etapas do projeto SUCAST compreendem, de forma sucinta, a prospecção de dados, a anotação e a caracterização estrutural e funcional de componentes de transdução de sinais em cana-de-açúcar utilizando-se ferramentas de bioinformática e a análise de expressão gênica através da tecnologia de microarranjos de cDNA. Os dados são armazenados em um banco sequências, domínios, categorias funcionais e dados de expressão (http://sucest-fun.org). Entre os alvos do projeto temos a determinação do padrão de expressão dos genes de transdução de sinal e fatores de transcrição nos diversos tecidos da cana, a caracterização estrutural e funcional do Quinoma da Cana-de-Açúcar (receptores, proteínas quinase e genes-R com domínio pkinase), a análise da resposta a fitohormônios (ABA e MeJ), a análise da resposta a estresses bióticos e abióticos, e a identificação de genes associados ao teor de sacarose..
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.
Setores de atividade: Produtos e Processos Biotecnológicos Vinculados À Agricultura.
Palavras-chave: Expressao Genica; genomica; microarrays de DNA; plantas; Transducao de Sinal; transgénicos.
3. Transcriptoma da Cana-de-açúcar (SUCEST-FUN)
Objetivos: O Projeto SUCEST-FUN (http://sucest-fun.org) reune quatro Universidades (USP, UNICAMP, UNESP e UFRJ) e duas empresas (CTC e Centralcool) num esforço por mim coordenado para o estudo funcional do genoma e transcriptoma da cana-de-açúcar. A cana-de-açúcar é de grande importância econômica para o Brasil estando entre os seus principais produtos de exportação. A produção de açúcar e álcool se beneficiaria largamente de variedades com maior teor de sacarose e resistentes a estresses. O estabelecimento de tais variedades utilizando-se técnicas de melhoramento genético tradicionais é demorado e complicado pela grande complexidade do genoma da cana e poderia ser acelerado se genes alvos para o melhoramento fossem identificados. O projeto SUCEST (http://sucest.lbi.ic.unicamp.br/public/) permitiu a identificação de cerca de 238 mil ESTs (Expressed Sequence Tags) da cana. Estas sequências correspondem a aproximadamente 43 mil SAS (Sugarcane Assembled Sequences). Acredita-se que mais de 90% do genoma expresso da cana tenha sido etiquetado (30 mil genes). A verificação do padrão de expressão destes genes é um passo importante para que se possa inferir sua função nos diferentes tecidos e estágios de desenvolvimento da planta, e para que estas informações possam ser utilizadas em programas de melhoramento. O transcriptoma da cana está sendo estudado com o auxílio de microarrays de cDNA. ESTs foram selecionados por estarem associados a processos envolvidos no crescimento, desenvolvimento e adaptação a variações ambientais. Através do projeto SUCAST (Sugarcane Signal Transduction) nós catalogamos mais de 3600 possíveis genes de cana-de-açúcar envolvidos na sinalização destas vias. Outras categorias de destaque nos chips incluem Fatores de Transcrição (cerca de 500 SAS), patogênese (242), resposta a estresses (557) e metabolismo de carboidratos. O projeto ainda se dedica a clonagem de promotores, produção de plantas transgênicas e geração de ferramentas para a biotecnologia da ca.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.
Setores de atividade: Produtos e Processos Biotecnológicos Vinculados À Agricultura.
Palavras-chave: cana-de-açúcar; data mining; Expressao Genica; genomica; microarrays de DNA; plantas.
4. Transdução de Sinal da Transição Crescimento/Desenvolvimento

Projetos de Pesquisa
2008 - AtualRedes Regulatórias e de Sinalização da Cana-de-açúcar
Descrição: Este projeto foca estudos de regulação gênica e visa a geração de ferramentas que permitam abordagens da Biologia Sistêmica em cana-de-açúcar e a identificação de redes regulatórias. Como ponto de partida escolhemos caracterizar dois tratos agronômicos de interesse desta cultura: o teor de sacarose e a resposta à seca. Pretendemos estudar categorias gênicas com conhecido papel regulatório (Fatores de Transcrição, Proteínas Quinases e Fosfatases), aprofundar estudos do Transcriptoma, produzir plantas transgênicas para genes de interesse e desenvolver ferramentas de bioinformática e bancos de dados integrando os vários níveis de informação. Identificaremos os alvos de TFs utilizando a técnica de ChIP-HTS e clonando promotores. Os resultados terão consequëncias diretas múltiplas nos programas de melhoramento que frequentemente selecionam mudanças nos CREs e TFs na busca de genótipos mais adaptados ao ambiente e com maior performance agronômica. As Proteínas Quinases atuam em cascatas de sinalização de respostas a estímulos ambientais e nossos dados apontam para um papel predominante das PKs na regulação do teor de sacarose e resposta à seca. Para identificar novos genes associados a brix e seca caracterizaremos o transcriptoma de genótipos e cultivares contrastantes para estes tratos utilizando chips de oligonucleotídeos. Genes de interesse serão então avaliados quanto à sua função pela geração e análise de plantas transgênicas. Para integrar o grande conjunto de dados públicos e gerados pelo projeto uma infra-estrutura computacional robusta será desenvolvida. O banco de dados SUCEST-FUN integrará dados do SUCEST, promotores, CREs, dados de expressão e a caracterização agronômica, fisiológica e bioquímica de cultivares da cana. Em paralelo também desenvolveremos o banco de dado GRASSIUS para o estabelecimento das redes regulatórias de cana, arroz, milho e sorgo..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação ( 1) / Mestrado acadêmico ( 1) / Doutorado ( 5) .
Integrantes: Glaucia Mendes Souza - Coordenador.
.
2004 - AtualSUCEST-FUN: Transcriptoma da Cana-de-açúcar
Descrição: O Projeto SUCEST-FUN (http://sucest-fun.org) reune quatro Universidades (USP, UNICAMP, UNESP e UFRJ) e duas empresas (COPERSUCAR e Centralcool) num esforço por mim coordenado para o estudo funcional do genoma e transcriptoma da cana-de-açúcar. A cana-de-açúcar é de grande importância econômica para o Brasil estando entre os seus principais produtos de exportação. A produção de açúcar e álcool se beneficiaria largamente de variedades com maior teor de sacarose e resistentes a estresses. O estabelecimento de tais variedades utilizando-se técnicas de melhoramento genético tradicionais é demorado e complicado pela grande complexidade do genoma da cana e poderia ser acelerado se genes alvos para o melhoramento fossem identificados. O projeto SUCEST (http://sucest.lbi.ic.unicamp.br/public/) permitiu a identificação de cerca de 238 mil ESTs (Expressed Sequence Tags) da cana. Estas sequências correspondem a aproximadamente 43 mil SAS (Sugarcane Assembled Sequences). Acredita-se que mais de 90% do genoma expresso da cana tenha sido etiquetado (30 mil genes). A verificação do padrão de expressão destes genes é um passo importante para que se possa inferir sua função nos diferentes tecidos e estágios de desenvolvimento da planta, e para que estas informações possam ser utilizadas em programas de melhoramento. O transcriptoma da cana será estudado com o auxílio de microarrays de cDNA. ESTs foram selecionados por estarem associados a processos envolvidos no crescimento, desenvolvimento e adaptação a variações ambientais. Através do projeto SUCAST (Sugarcane Signal Transduction) nós catalogamos mais de 3600 possíveis genes de cana-de-açúcar envolvidos na sinalização destas vias. Destes, cerca de 1000 estão sendo analisados através dos microarrays de cDNA, uma tecnologia já estabelecida pelo grupo (Papini-Terzi et al., 2005). Outras categorias de destaque nos chips incluem Fatores de Transcrição (cerca de 500 SAS), patogênese (242), resposta a estresses (557) e metabolismo de .
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Doutorado ( 1) .
Integrantes: Flavia Riso Rocha - Integrante / Ricardo Zorzetto Nicoliello Vêncio - Integrante / Juliana de Maria Felix - Integrante / Renato Vicentini - Integrante / Cristiane de Rocha Souza - Integrante / Eugenio César Ulian - Integrante / Sonia Marli Zingaretti di Mauro - Integrante / Marcelo Menossi - Integrante / Marcio de Castro Silva-Filho - Integrante / Adriana Silva Hemerly - Integrante / Marcelo Dornelas - Integrante / Antonio Figueira - Integrante / Glaucia Mendes Souza - Coordenador.
Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Cooperativa de Produtores de Cana-de-Açúcar, Açúcar e Álcool de São Paulo - Auxílio financeiro / Central de Álcool Lucélia - Auxílio financeiro / Instituto Uniemp - Bolsa.
Número de produções C, T & A: 5.
2001 - AtualAliança FAPESP/Cropdesign
Descrição: Em 2001 a FAPESP firmou um acordo com a Empresa Cropdesign (Ghent, Bélgica) para a avaliação da função dos genes da cana-de-açúcar em arroz utilizando a plataforma TraitMill do qual sou coordenadora. O TraitMill é uma plataforma robotizada que processa, identifica, clona e insere genes em arroz e milho, além de analisar fenotipicamente as plantas e grãos. A Cropdesign tem a capacidade de modular a expressão de centenas de genes e avaliar o seu efeito em plantas de uma maneira automatizada. Este sistema high-throughput foi utilizado para analisarmos o efeito de 1039 genes da cana por super-expressão ou supressão no arroz. Leads identificados pela Cropdesign podem nos indicar um possível papel para estes genes no aumento de produtividade, tamanho dos grãos e tolerância a estresses abióticos..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Integrantes: Glaucia Mendes Souza - Coordenador.
Financiador(es): Instituto de Quimica da USP - Cooperação / Cropdesign - Cooperação.
Número de produções C, T & A: 1.
2000 - AtualSUCAST - Transdução de sinal da cana-de-açúcar
Descrição: O projeto SUCAST (Sugarcane Signal Transduction) foi iniciado em 2000 com o objetivo de identificar, catalogar e caracterizar os ESTs da cana-de-açúcar que estão envolvidos em vias de transdução de sinal, bem como a organização de todas estas informações em um banco de dados que facilite futuras análises funcionais (Souza et al, 2001). As etapas do projeto SUCAST compreendem, de forma sucinta, a prospecção de dados, a anotação e a caracterização estrutural e funcional de componentes de transdução de sinais em cana-de-açúcar utilizando-se ferramentas de bioinformática e a análise de expressão gênica através da tecnologia de microarranjos de cDNA. Os dados são armazenados em um banco sequências, domínios, categorias funcionais e dados de expressão (http://sucestfun.cbmeg.unicamp.br/sucestfun/sucast/index.shtml). Entre os alvos do projeto temos a determinação do padrão de expressão dos genes de transdução de sinal e fatores de transcrição nos diversos tecidos da cana (Papini-Terzi et al., 2005), a caracterização estrutural e funcional do Quinoma da Cana-de-Açúcar (receptores, proteínas quinase e genes-R com domínio pkinase) e a análise da resposta a fitohormônios (ABA e MeJ)..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação ( 1) / Doutorado ( 1) .
Integrantes: Ana Carolina Quirino Simoes - Integrante / Milton Yutaka Nishiyama-Junior - Integrante / Aline Maria da Silva - Integrante / Katia Cristina Oliveira - Integrante / Rosangela Campanha - Integrante / Mara Lucia Zucheran Silvestri - Integrante / Flavia Stal Papini-Terzi - Integrante / Flavia Riso Rocha - Integrante / Ricardo Zorzetto Nicoliello Vêncio - Integrante / Juliana de Maria Felix - Integrante / Renato Vicentini - Integrante / Cristiane de Rocha Souza - Integrante / Eugenio César Ulian - Integrante / Carlos Alberto de Bragança Pereira - Integrante / Marcelo Menossi - Integrante / Marcio de Castro Silva-Filho - Integrante / Adriana Silva Hemerly - Integrante / Glaucia Mendes Souza - Coordenador.
Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Número de produções C, T & A: 15 / Número de orientações: 1.
1999 - 2005Cooperation for Analysis of Gene Expression
Descrição: Entire genomes and whole sets of ESTs of scientific and economically important micro-organisms, relevant model organisms and humans are rapidly becoming available. To take advantage of these enormous sets of genomic and EST sequences, several academic and industrial laboratories are developing technologies to analyze gene expression, at RNA level, on a genome wide basis, using DNA microarrays, which are also called DNA chips. These techniques are potentially useful to generate hundreds of data points for expression of tens of thousands of genes, whose impact in biological research and biotechnology might be revolutionary. Analyses of such huge amounts of data pose complex and unsolved problems of data storage, data mining and design of non-linear gene state predictors. Altogether, these tasks require the coordinated collaboration of, by one side, computer scientists and mathematicians and, by the other, molecular biologists and biochemists. To this end, interdisciplinary teams of scientists are been organized in the countries that are presently leading the international genome research. In the State of São Paulo, FAPESP has timely launched a genome program that was initiated by sequencing the genome of Xylella fastidiosa and is presently being extended to genomes of other micro-organisms and ESTs of human cancer cells and plant cells of sugar cane. This FAPESP initiative has established sufficient conditions to locally start competitive projects of functional genomics using the technology of DNA microarrays. Cooperation for Analysis of Gene Expression", CAGE, is an informal organization, funded by FAPESP, to concert interdisciplinary collaboration between molecular biologists of the Instituto de Química (IQ-USP) and computer scientists and mathematicians of the Instituto de Matemática e Estatística (IME-USP), to study gene expression using the DNA microarray technology. The laboratory of DNA-microarrays, in the Instituto de Química, is equi.
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação ( 3) / Doutorado ( 2) .
Integrantes: Aline Maria da Silva - Integrante / Luciana Mantzourani - Integrante / Hugo Aguirre Harmelin - Coordenador / Glaucia Mendes Souza - Integrante.
Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Número de produções C, T & A: 11 / Número de orientações: 5.
Estudo das vias de Transdução de Sinal que controlam a transição crescimento/desenvolvimento em Dictyostelium discoideum
Situação: Desativado; Natureza: Outra.
Integrantes: Glaucia Mendes Souza - Coordenador.
.

Membro de corpo editorial
2006 - Atual Periódico: International Journal of Plant Genomics

Revisor de periódico
2007 - Atual Periódico: Proceedings International Society Cane Technologists
2008 - Atual Periódico: Tropical Plant Biology
2003 - Atual Periódico: Genetics and Molecular Biology

Áreas de atuação
1. Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Vegetal.
2. Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular / Especialidade: Biotecnologia.
3. Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.
4. Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.

Idiomas
Inglês Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Espanhol Fala Bem, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.
Francês Fala Bem, Lê Razoavelmente, Escreve Bem.
Português Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Inglês Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Espanhol Fala Bem, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.
Francês Fala Bem, Lê Razoavelmente, Escreve Bem.
Português Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Espanhol Fala Bem, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.
Francês Fala Bem, Lê Razoavelmente, Escreve Bem.
Português Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Inglês Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Espanhol Fala Bem, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.
Francês Fala Bem, Lê Razoavelmente, Escreve Bem.
Português Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Inglês Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Prêmios e títulos
2007NPG Award, Nature Publishing Group.
1997THE V.C. JOSHI MEMORIAL AWARD, BAYLOR COLLEGE OF MEDICINE/.


Produção em C,T & A
Produção bibliográfica
Artigos completos publicados em periódicos
1. Gray J ; Bevan M ; Brutnell T ; Buell CR ; Cone K ; HAKE, S. ; JACKSON, D. ; KELLOGG, E. ; MCCOUCH, S. ; MOCKLER, T. ; MOOSE, S. ; PETERSON, T. ; ROKSHAR, D. ; SOUZA, G. M. ; SPRINGER, N. ; STEIN, N. ; TIMMERMANS, M. ; WANG, G. ; Grotewold E . A recommendation for naming transcription factor proteins in the grasses. Plant Physiology (Bethesda), v. 149, p. 4-6, 2009.
2. Papini-Terzi, Flavia S ; Rocha, Flavia R ; Vencio, Ricardo ZN ; Felix, Juliana M ; Branco, Diana S ; Waclawovsky, Alessandro J ; Del Bem, Luiz EV ; Lembke, Carolina G ; Costa, Maximiller DL ; Nishiyama, Milton Y ; Vicentini, Renato ; Vincentz, Michel GA ; Ulian, Eugenio C ; Menossi, Marcelo ; SOUZA, G. M. . Sugarcane genes associated with sucrose content. BMC Genomics, v. 10, p. 120, 2009.
3. MENOSSI, M. ; SILVA-FILHO, M. C. ; VINCENTZ, M. ; Van Sluys M-A ; SOUZA, G. M. . Sugarcane Functional Genomics: gene discovery for agronomic trait development. International Journal of Plant Genomics, v. 2008, p. 458732, 2008.
4. Souza AP ; GASPAR, A. ; Silva, E.A. ; ULIAN, E. C. ; Waclawovsky AJ ; Nishiyama-Junior, M. Y. ; VICENTINI, R. ; MENOSSI, M. ; SOUZA, G. M. ; Buckeridge M . Elevated CO2 induces increases in photosynthesis, biomass, productivity and modifies gene expression in sugarcane. Plant, Cell and Environment, v. 31, p. 1116-1127, 2008.
5. Yilmaz A ; Nishiyama-Junior, M. Y. ; Garcia-Fuentes B ; SOUZA, G. M. ; Janies D ; Gray J ; Grotewold E . GRASSIUS: A Platform for Comparative Regulatory Genomics Across the Grasses. Plant Physiology (Bethesda), v. 10.110, p. 10.1104/pp.108., 2008.
6. Papini-Terzi F. S. ; FELIX, J. M. ; ROCHA, F. R. ; Waclawovsky AJ ; ULIAN, E. C. ; Chabregas S ; Falco MC ; Nishiyama-Junior, M. Y. ; VENCIO, R. Z. N. ; VICENTINI, R. ; MENOSSI, M. ; SOUZA, G. M. . The SUCEST-FUN project: identifying genes that regulate sucrose content in sugarcane. Sugar Cane International, v. 26, p. 25-29, 2008.
7.   ROCHA, F. R. ; Papini-Terzi F. S. ; Nishiyama-Junior, M. Y. ; VENCIO, R. Z. N. ; VICENTINI, R. ; DUARTE, R. ; VINAGRE, F. ; Medeiros, A ; di MAURO, S. M. Z. ; ULIAN, E. C. ; HEMERLY, A. S. ; FIGUEIRA, A. ; SILVA-FILHO, M. C. ; MENOSSI, M. ; SOUZA, G. M. . Signal transduction-related responses to phytohormones and environmental challenges in sugarcane. BMC Genomics, v. 8, p. 71, 2007.
8. ANDRIOLIY, L. P. ; SOUZA, G. M. ; da SILVA, A. M. . Staurosporine induces tyrosine phosphorylation in Dictyostelium discoideum proteins. Cell Biochemistry and Function, v. 24, p. 1-7, 2006.
9.   Papini-Terzi F. S. ; ROCHA, F. R. ; VENCIO, R. Z. N. ; FELIX, J. M. ; VICENTINI, R. ; ULIAN, E. C. ; MENOSSI, M. ; SOUZA, G. M. . Transcription Profiling of Signal Transduction-related Genes in Sugarcane Tissues. DNA Research, v. 12, p. 27-38, 2005.
10. RIBEIRO, F. P. ; FURLANETO, C. J. ; RIBEIRO, W. B. ; SOUZA, G. M. ; CASSATELA, M. ; CAMPA, A. . mRNA expression and release of interleukin-8 induced by serum amyloid A in neutrophils and monocytes.. Mediators Inflamm., v. 12, p. 173-178, 2003.
11.   VETTORE, A. ; da SILVA, F. R. ; KEMPER, E. ; SOUZA, G. M. . Analysis and functional annotation of an expressed sequence tag collection for the tropical crop sugarcane. Genome Research, EUA, v. 13, n. 00, p. 2725-2735, 2003.
12. HATANAKA, E. ; FURLANETO, C. J. ; RIBEIRO, F. P. ; SOUZA, G. M. ; CAMPA, A. . Serum amyloid A-induced mRNA expression and release of tumor necrosis factor-alpha (TNF-a) in human neutrophils. Immulology Letters, v. 91, p. 33-37, 2003.
13. SOUZA, G. M. ; TAMINATO, A. ; BAGATTINI, R. ; CHEN, G. ; KUSPA, A. . A role for YakA, cAMP and PKA in the regulation of stress responses of Dictyostelium discoideum cells. Molecular Biology of the Cell, v. 13, p. 2266-2275, 2002.
14. SOUZA, G. M. ; FURLANETO, C. J. ; RIBEIRO, F. P. ; TANAKA, E. ; CASSATELA, M. . Apolipoproteins A-I and A-II downregulate neutrophil functions. Lipids, v. 37, p. 925-928, 2002.
15. SOUZA, G. M. ; Simoes, A. C. Q. ; OLIVEIRA, K. C. ; FIORINI, L. C. ; Garay, H. M. ; Gomes, F. S. ; Nishiyama-Junior, M. Y. ; da SILVA, A. M. . The sugarcane signal transduction (SUCAST) catalogue: prospecting signal transduction in sugarcane.. Genetics and Molecular Biology, v. 24, p. 25-34, 2001.
16. SOUZA, G. M. ; SILVA ; M, A. ; KUSPA, A. . Starvation Promotes Dictyostelium Development By Relieving Pufa Inhibition Of Pka Translation Through The Yaka Kinase Pathway. Development, v. 126, p. 3263-3274, 1999.
17.   SOUZA, G. M. ; LU, S. ; KUSPA, A. . Yaka, A Protein Kinase Required For The Transition From Growth To Development In Dictyostelium. Development, v. 125, p. 2291-2302, 1998.
18. SOUZA, G. M. ; MEHTA, D. P. ; LAMMERTZ, M. ; RODRIGUEZ-PARIS ; WU, R. ; CARDELLI, J. A. ; FREEZE, H. H. . Dictyostelium Lysosomal Proteins With Different Sugar Modifications Sort To Functionally Distinct Compartments. Journal Cell Science, v. 110, p. 2239-2248, 1997.
19. SOUZA, G. M. ; HIRAI, J. ; FREEZE, H. H. . Identification Of Two Novel Dictyostelium Discoideum Cysteine Proteinases That Carry N-Acetylglucosamine-1-P Modification.. Journal of Biological Chemistry, v. 270, p. 28938-28945, 1995.
20. SOUZA, G. M. ; KLEIN, C. ; MAIA, J. C. C. ; SILVA ; M, A. . Calcium Uptake And Gp80 Mrna Destabilization Follows Camp Receptor Down-Regulation In Dictyostelium Discoideum. Cell Signaling, v. 6, p. 883-895, 1994.
21. JULIANI, M. H. ; SOUZA, G. M. ; C, K. . Camp Stimulation Of Dictyostelium Discoideum Destabilizes The Mrna For 117 Antigen. J. BIOL. CHEM., v. 265, n. 16, p. 9077-9082, 1990.
Capítulos de livros publicados
1. HOARAU, J. Y. ; SOUZA, G. M. ; D'HONT, A. ; MENOSSI, M. ; PINTO, L. R. ; SOUZA, A. P. ; GRIVET, L. ; MENCK, C. F. M. ; ULIAN, E. C. ; VINCENTZ, M. . Sugarcane, a tropical crop with a highly complex genome. In: J. F. Morot-Gaudry, P. Lea and J. F. Briat. (Org.). Functional Plant Genomics. : Science Publishers, 2007, v. , p. -.
2. D'HONT, A. ; SOUZA, G. M. ; MENOSSI, M. ; VINCENTZ, M. ; Van Sluys M-A ; Glaszmann JC ; ULIAN, E. C. . An outstanding tropical polyploid and a major source of sucrose and bio-energy.. In: Paul Moore; Ray Ming. (Org.). Genomics of Tropical Crop Plants. : , 2007, v. , p. -.
Textos em jornais de notícias/revistas
1. SOUZA, G. M. . Máquina coloca país na fronteira da genômica. O Estado de São Paulo, 06 jul. 2008.
2. SOUZA, G. M. . Pesquisa de Etanol vai receber R$ 73 milhões. O Estado de São Paulo, 04 jul. 2008.
3. SOUZA, G. M. . Visão Estratégica: a Ciência da Bioenergia. Revista Opiniões, 01 jul. 2008.
4. SOUZA, G. M. . Science in Action. BBC News, 03 abr. 2008.
5. SOUZA, G. M. . Pesquisa vai identificar genes da sacarose da cana. Terra - Notícias - Ciência e Meio Ambiente, 17 jan. 2005.
6. SOUZA, G. M. . Segredos da doçura. Pesquisa FAPESP, São Paulo, p. 78 - 79, 01 dez. 2004.
7. SOUZA, G. M. . Ciência procura genes da super cana. Informativo Uniemp, São Paulo, p. 17 - 17, 01 nov. 2004.
8. SOUZA, G. M. . Inovação Tecnológica para identificar genes da riqueza em açúcar. CA Notícias, Lucélia, p. 1 - 1, 01 ago. 2004.
9. SOUZA, G. M. . Pesquisadores da USP e Unicamp ministram palestra sobre o projeto genoma da cana-de-açúcar na Central. O Independente, p. 7, 28 maio 2004.
10. SOUZA, G. M. ; da SILVA, A. M. . Desvendando as vias de transdução de sinal da cana-de-açúcar. Revista Biotecnologia, p. xx - xx, 01 jun. 2002.
11. SOUZA, G. M. . Os genes do Macintosh. Macmania, São Paulo, p. 24 - 26.
12. SOUZA, G. M. . Revolução no canavial: Novas usinas, variedades mais produtivas e pesquisa genética são as soluções para aumentar a oferta de álcool. Revista FAPESP, São Paulo.
13. SOUZA, A. P. ; SOUZA, G. M. . Genética doce: Mapa funcional de genes da cana-de-açúcar vai ajudar a formar variedades mais produtivas. Pesquisa FAPESP.
14. SOUZA, G. M. . Vias para avançar como líder do etanol. FAPESP lança programa para impulsionar pesquisa em bioenergia. Revista Pesquisa FAPESP.
15. SOUZA, G. M. . Boosting Brazilian Bioenergy. Nature, p. 134.
Trabalhos completos publicados em anais de congressos
1. Papini-Terzi F. S. ; FELIX, J. M. ; ROCHA, F. R. ; Waclawovsky AJ ; ULIAN, E. C. ; Chabregas S ; Falco MC ; Nishiyama-Junior, M. Y. ; VENCIO, R. Z. N. ; VICENTINI, R. ; MENOSSI, M. ; SOUZA, G. M. . The SUCEST-FUN Project: identifying genes that regulate sucrose content in sugarcane plants. In: XXVI International Society of Sugarcane Technologists Congress, 2007, Durban. Proc. Int. Soc. Sugar Cane Technol., 2007. v. 26.
Artigos aceitos para publicação
1. LAM, E. ; SHINE JR, J. ; da SILVA, J. ; LAWTON, M. ; BONOS, S. ; CALVINO, M. ; CARRER, H. ; SILVA-FILHO, M. C. ; GLYNN, N. ; HELSEL, Z. ; MA, J. ; RICHARD JR, E. ; SOUZA, G. M. ; MING, R. . Improving sugarcane for biofuel: engineering for an even. Global Change Biology Bioenergy, 2009.
2. FELIX, J. M. ; Papini-Terzi F. S. ; ROCHA, F. R. ; VENCIO, R. Z. N. ; VICENTINI, R. ; Nishiyama-Junior, M. Y. ; ULIAN, E. C. ; SOUZA, G. M. ; MENOSSI, M. . Expression profile of signal transduction components in a sugarcane population segregating for sugar content. Tropical Plant Biology, 2009.
Produção técnica
Processos ou técnicas
1. SOUZA, G. M. ; Papini-Terzi F. S. ; ROCHA, F. R. ; Waclawovsky AJ . Sequências de nucleotídeos que promovem a expressão de genes. 2008.
2.   SOUZA, G. M. ; ROCHA, F. R. ; Papini-Terzi F. S. ; MENOSSI, M. ; VENCIO, R. Z. N. ; FELIX, J. M. ; Buckeridge M ; Souza AP ; ULIAN, E. C. . Genes associated to sucrose content. 2006.
3. SOUZA, G. M. ; Papini-Terzi F. S. ; ROCHA, F. R. ; Waclawovsky AJ ; VENCIO, R. Z. N. ; Marques JM ; FELIX, J. M. ; MENOSSI, M. ; Buckeridge M ; SOUZA, A. P. ; ULIAN, E. C. . Sugarcane with increased sugar levels. 2006.
4. SOUZA, G. M. . plants having modified growth and a method for doing the same. 2004.
Demais trabalhos
1. SOUZA, G. M. . Workshop Genoma da Cana-de-açúcar. 2004 (Organização de Workshop).
2. SOUZA, G. M. . Workshop da Cana. 2003 (Organização de Workshop).

Bancas
Participação em bancas examinadoras
Dissertações
1. SOUZA, G. M.. Participação em banca de Leandro Marcio Moreira. Análise comparativa entre genomas dos fitopatógenos Xylella fastidiosa e Xanthomonas axonopodis pv. citri. 2002. Dissertação (Mestrado em Bioquimica) - Instituto de Quimica da USP.
2. SOUZA, G. M.. Participação em banca de Claudia Beck Eichler. Isolamento de mutantes dominante-negativos para PKA derivados de células adrenocorticais Y-1: efeitos de ACTH. 1998. Dissertação (Mestrado em Bioquimica) - Instituto de Quimica da USP.
Teses de doutorado
1. SOUZA, G. M.. Participação em banca de Diana Noronha Nunes. Caracterização de novos genes humanos envolvidos no processo de regulação da expressão de genes homeóticos. 2004. Tese (Doutorado em Bioquimica) - Instituto de Quimica da USP.
2. SOUZA, G. M.. Participação em banca de Karina Fabiana Ribichich. Análise de sequências expressas durante a fase de esporulação do fungo aquático Blastocadiella emersonii. 2004. Tese (Doutorado em Bioquimica) - Instituto de Quimica da USP.
3. SOUZA, G. M.. Participação em banca de Raquel Bagattini. Estudo da função de keaA no controle do crescimento, desenvolvimento e resposta a estresses em Dictyostelium. 2004. Tese (Doutorado em Bioquimica) - Instituto de Quimica da USP.
4. SOUZA, G. M.. Participação em banca de Adriana Regina de Oliveira Freitas. Caracterização das vias de sinalização desencadeadas pelas interações PrPc-p66 e PrPc-laminina e sua relevância nos processos de morte celular programada e consolidação da memória. 2002 - Instituto de Quimica da USP.
5. SOUZA, G. M.. Participação em banca de José Ribamar dos Santos Ferreira Júnior. Comunicação entre mitocôndria e núcleo controla a transcrição do gene Gal1 de Saccharomyces cerevisiae. 2001. Tese (Doutorado em Bioquimica) - Instituto de Quimica da USP.
6. SOUZA, G. M.. Participação em banca de Ana Paula Lepique. O gene c-myc e o controle do ciclo celular por ACTH em células adrenocorticais de camundongo da linhagem Y-1. 2000 - Instituto de Quimica da USP.
7. SOUZA, G. M.. Participação em banca de Márcia Aparecida Sperança. Biologia da relação patógeno-hospedeiro. 1999. Tese (Doutorado em Parasitologia) - Instituto de Ciências Biomédicas.
8. SOUZA, G. M.. Participação em banca de Márinez Almeida de Faria. Caracterização de uma forma epimastigota intracelular no ciclo do Trypanosoma cruzi, clone CL-14. 1999. Tese (Doutorado em Bioquimica) - Instituto de Quimica da USP.

Eventos
Participação em eventos
1. XXXVII Annual Meeting of SBBq and XI Conference of the Pan American Association for Biochemistry and Molecular Biology.Plant Biotechnology. 2008. (Congresso).
2. Pan American Congress of the American Society of Plant Biology.Designing the Sugarcane Energy Crop. 2008. (Congresso).
3. Workshop FAPESP Bioenergia.O Programa FAPESP de Bioenergia (BIOEN). 2008. (Simpósio).
4. Worshop BIOEN em Genômica de Cana-de-açúcar.The SUCEST-FUN Project: Gene Discovery for the Improvement of Sugarcane. 2008. (Simpósio).
5. Workshop BIOEN on Cellulosic Ethanol.The SUCEST-FUN Project: using genomic tools for the improvement of biomass in sugarcane. 2008. (Simpósio).
6. Workshop sobre Bioenergia FAPESP-BBSRC.A pesquisa em Biomassa do Programa Bioenergia FAPESP (BIOEN). 2008. (Encontro).
7. Plant Metabolic Engineering Gordon Research Conference.Genomic tools for the metabolic engineering of sugars in sugarcane. 2007. (Congresso).
8. XXVI Congress International Society of Sugar Cane Technologists.The SUCEST-FUN Project: identifying genes that regulate sucrose content in sugarcane. 2007. (Congresso).
9. XXXVI Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology.KeaA, a Dictyostelium kelch domain protein that regulates the response to stress and development. 2007. (Congresso).
10. 53o Congresso Brasileiro de Genética.Perspectivas da Genômica em Agropecuária. 2007. (Congresso).
11. Conferências da Division of Biological Sciences at UCSD.Sugarcane Functional Genomics: the identification of signaling genes associated to sugar yield, drought and stress responses. 2007. (Seminário).
12. Photosynthetic Organisms: Biotechnology, Environment and Bioenergy.O Transcriptoma da Cana-de-açúcar. 2007. (Seminário).
13. Plant & Animal Genome Conference XV Conference.International Consortium for Sugarcane Biotechnologists. 2007. (Simpósio).
14. I Simpósio Brasileiro de Genética Molecular de Plantas.II. 2007. (Simpósio).
15. V Tripatite Workshop on Biotechnology and Bionergy.Biomass Production. 2007. (Simpósio).
16. Workshop sobre melhoramento genético e biotecnologia.Prospecção de genes de interesse para o melhoramento visando a tolerância ao estresse hídrico. 2007. (Encontro).
17. Plant & Animal Genome Conference XIV Conference.International Consortium for Sugarcane Biotechnologists. 2006. (Congresso).
18. Dicty2006. International Dictyostelium Conference.KeaA, a Dictyostelium kelch-domain protein that regulates the response to stress and development. 2006. (Congresso).
19. Intl. Consortium for Sugarcane Biotech. (ICSB).Transcription profiling of signal transduction-related genes in sugarcane tissues. 2005. (Congresso).
20. 50 Congresso Brasileiro de Genética.Expression profile analysis of sugarcane receptors, protein kinases and R-genes. 2005. (Congresso).
21. International Consortium for Sugarcane Biotechnology.The SUCAST Project: sugarcane signal transduction analysed. 2005. (Congresso).
22. Plant & Animal Genome XIII Conference.International Consortium for Sugarcane Bioqtechnologists. 2005. (Congresso).
23. XXXIV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular.Transcription Profiling of Signal Transduction-Related Genes in Sugarcane. 2005. (Congresso).
24. Plant & Animal XII Conference.Trancription profiles of sugarcane signaling components in different tissues and stress conditions. 2004. (Congresso).
25. Plant & Animal XII Conference.The sugarcane kinome. 2004. (Congresso).
26. II Congresso do Instituto de Química.Transcriptoma da Cana-de-açúcar. 2004. (Seminário).
27. Workshop Genoma da Cana-de-açúcar.O Transcriptoma da Cana-de-açúcar. 2004. (Encontro).
28. XIX International Congress of Genetics.The SUCAST catalogue: a collection of signal transduction ESTs identified in the grass sugarcane. 2003. (Congresso).
29. XIX International Congress of Genetics.Identification of YakA suppressor genes involved in Dictyostelium stress responses. 2003. (Congresso).
30. International Dictyostelium 2003 Conference.Dictyostelium stress responses and the YakA pathway. 2003. (Congresso).
31. 49o Congresso Nacional de Genética.The sugarcane kinome. 2003. (Congresso).
32. 49o Congresso Nacional de Genética.Expression patterns of sugarcane signal transduction components revealed by microarrays and in silico analysis. 2003. (Congresso).
33. 49o Congresso Nacional de Genética.YakA suppressor genes and the Dictyostelium stress responses. 2003. (Congresso).
34. Ciclo de Seminários.SUCAST: uma catálogo de transdução de sinal da cana-de-açúcar. 2003. (Seminário).
35. VI Congresso do Departamento de Bioquímica.SUCAST A transdução de sinal na cana-de-açúcar. 2003. (Seminário).
36. Ciclo de Seminários.Desvendando as vias de transdução de sinal da cana-de-açúcar. 2003. (Seminário).
37. Workshop da Cana-de-açúcar.SUCAST Chips A transdução de sinal da cana-de-açúcar analisada por microarrays de cDNA. 2003. (Encontro).
38. XXXI Reuniao anual da Sociedade Brasileira de Bioquimica e Biologia Molecular.Identification and characterization of sugarcane transcription factors. 2002. (Congresso).
39. XXXI Reunião anula da Sociedade Brasileira de Bioquimica e Biologia Molecular.Circadian clock components in the sugarcana genome. 2002. (Congresso).
40. International Dictyostelium 2002 Conference.Regulation of Dictyostelium stress responses by YakA, PKA and KeaA. 2002. (Congresso).
41. XXXI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular.Analysis of the genetic networks that govern stress responses in Dictyostelium by molecular genetics and microarray analysis. 2002. (Congresso).
42. International Dictyostelium Conference.A role for YakA, cAMP and PKA in the nitrosoative/oxidative stress response of Dictyostelium discoideum cells. 2001. (Congresso).
43. .Apolipoprotein AII has an antiinflammatory effect. 5th World Congress on Inflammation. 2001. (Congresso).
44. XXX Annual Meeting of the Brazilian Society of Biochemistry and Molecular Biology.Identification and characterization of KeaA, a gene implicated in the regulation of development and stress responses of Dictyostelium cells.. 2001. (Congresso).
45. XXX Annual Meeting of the Brazilian Society of Biochemistry and Molecular Biology.Effect of serum amyloid A on neutrophyl expression TNF-alpha, IL-1 beta and IL-8.. 2001. (Congresso).
46. The Brazilian International Genome Conference.Signal transduction components of the sugarcane genome. 2001. (Congresso).
47. Seminários da Sociedade de Pesquisas em Biologia Celular.Transdução de sinal do crescimento e desenvolvimento: genética molecular e microarrays. 2001. (Seminário).
48. 47o Congresso Nacional de Genética.SUCAST: decifrando a transdução de sinais em plantas. 2001. (Seminário).
49. Tecnologias e Novas Tendências em Bioquímica e Biologia Molecular.Data-mining de genomas. 2001. (Seminário).
50. Seminários da Sociedade de Pesquisas em Biologia Celular do Departamento de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia.Transdução de Sinal do Crescimento e Desenvolvimento: Genética Molecular e Microarrays de DNA. 2001. (Seminário).
51. XXIX Annual Meeting of the Brazilian Society of Biochemistry and Molecular Biology.A role for YakA and PKA in the oxidative stress response of Dictyostelium discoideum cells. 2000. (Congresso).
52. International Dictyostelium 1999 Conference.Identification of pathways regulated by yakA that control growth, development and stress responses in Dictyostelium cells. 1999. (Congresso).
53. .Transdução de sinal da transição crescimento/desenvolvimento em Dictyostelium discoideum. 1999. (Seminário).
54. Internation Dictyostelium Conference.Identification of pathways regulated by yakA that control growth, development and stress responses in Dictyostelium cells. 1999. (Seminário).
55. International Dictyostelium Conferece.A suppressor of yakA that implicates translational control in the synthesis of PKA-C at the initiation of development. 1998. (Seminário).
56. XXVII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular.Signal transduction of the growth to development transition in Dictyostelium discoideum. 1998. (Seminário).
57. International Dictyostelium 1996 Conference.Dictyostelium lysosomal proteins with different sugar modifications sort to functionally distinct endosome-lysosome compartments. 1996. (Congresso).
58. Gordon Research Conference on Proteolytic Enzymes and their Inhibitors.Dictyostelium lysosomal proteins with different sugar modifications sort to functionally distinct endosome-lysosome compartments. 1996. (Congresso).
59. 6th International Congress on Cell Biology.Dictyostelium lysosomal proteins with different sugar modifications sort to functionally distinct endosome-lysosome compartments. 1996. (Congresso).
60. International Dictyostelium 1995 Conference.Detection of GlcNAc-1-P, Fuc, Man-6-P and Man-6-S containing glycoproteins on Dictyostelium discoideum secretions, lysosomal membranes, and at the cell surface. 1995. (Congresso).
61. International Dictyostelium 1994 Conference.Over-expression of an unusual cysteine proteinase modified by phosphoglycosylation in Dictyostelium.. 1994. (Congresso).
62. International Dictyostelium 1994 Conference.Calcium uptake and gp80 mRNA destabilization follows cAMP receptor down regulation in Dictyostelium discoideum. 1994. (Congresso).
Organização de eventos
1. SOUZA, G. M. . The Sugarcane Transcriptome Symposium. 2005. (Congresso).

Orientações
Orientações em andamento
Dissertação de mestrado
1. Rodrigo Fandino. Clonagem de promotores de cana-de-açúcar e análise do transcriptoma de variedades segregantes para teor de sacarose. Início: 2008. Dissertação (Mestrado em Bioquímica) - Instituto de Química - USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. (Orientador).
Tese de doutorado
1. Paloma Mieko Sato. ANALISE FUNCIONAL DE PROTEINAS QUINASES DA CANA-DE-ACUCAR RELACIONADAS AO TEOR DE SACAROSE.. Início: 2008. Tese (Doutorado em Bioquimica) - Instituto de Quimica da USP, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Orientador).
2. Maximiller Dal-Bianco Lamas Costa. Identificação de redes regulatórias induzidas por seca em cana-de-açúcar. Início: 2007. Tese (Doutorado em Bioquimica) - Instituto de Quimica da USP, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. (Orientador).
3. Carolina Gimiliani Lembke. Utilização de microarranjos de cDNA na identificação de genes regulados por estresse hídrico em cana-de açúcar. Início: 2006. Tese (Doutorado em Bioquímica) - Instituto de Química - USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. (Orientador).
4. Fabio Fernandes da Rocha Vicente. Redes regulatórias da cana-de-açúcar. Início: 2006. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Instituto de Matemática e Estatística. (Orientador).
5. Luciana Mantzouranis. Análise do transcriptoma regulado pela quinase YakA em Dictyostelium. Início: 2004. Tese (Doutorado em Bioquimica) - Instituto de Quimica da USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. (Orientador).
Supervisão de pós-doutorado
1. Carlos Takeshi Hotta. Início: 2007. Instituto de Quimica da USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo.
2. Alessandro Jaquiel Waclawovsky. Início: 2006. Instituto de Quimica da USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo.
Iniciação científica
1. Leila Regina Kazokas. Análise do padrão de expressão gênica de mutantes de Dictyostelium discoideum submetidos a estresses nutricional, oxidativo e nitrosoativo. Início: 2006. Iniciação científica (Graduando em Química) - Instituto de Quimica da USP. (Orientador).
Supervisões e orientações concluídas
Tese de doutorado
1. Flávia Riso Rocha. Identificação e análise funcional de genes relacionados à transdução de sinais na cana-de-açúcar. 2006. Tese (Doutorado em Bioquímica) - Instituto de Química - USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Glaucia Mendes Souza.
2. Raquel Bagattini. Estudo da função de keaA no controle do crescimento, desenvolvimento e resposta a estresses em Dictyostelium. 2005. Tese (Doutorado em Bioquimica) - Instituto de Quimica da USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Glaucia Mendes Souza.
Supervisão de pós-doutorado
1. Josélia Marques. 2006. Instituto de Quimica da USP, Instituto Uniemp. Glaucia Mendes Souza.
2. Paulo Schlogl. 2005. Instituto de Quimica da USP, Instituto Uniemp. Glaucia Mendes Souza.
Trabalho de conclusão de curso de graduação
1. Fernando Toshio Ogata. Obtenção de mutantes nulos do gene keaA e análise da função de seus domínios. 2005. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciências Biológicas - Modalidade Médica) - Universidade Federal de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Glaucia Mendes Souza.
Iniciação Científica
1. Talita Marcília de Oliveira Silva. Clonagem de promotores tecido-específicos de cana-de-açúcar. 2006. Iniciação Científica. (Graduando em Química) - Instituto de Quimica da USP. Orientador: Glaucia Mendes Souza.
2. Bruno Sato. Clonagem de promotores da cana-de-açúcar. 2006. Iniciação Científica. (Graduando em Química) - Instituto de Quimica da USP. Orientador: Glaucia Mendes Souza.
3. Leonardo André Hage Fabri. Validação de dados de expressão em Dictyostelium. 2006. Iniciação Científica. (Graduando em Química) - Instituto de Quimica da USP. Orientador: Glaucia Mendes Souza.
4. Carolina Gimiliani Lembke. Utilização de microarranjos de cDNA na identificação de genes regulados por estresse hídrico em cana-de açúcar. 2006. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado) - Instituto de Biociências - USP, Instituto Uniemp. Orientador: Glaucia Mendes Souza.
5. Mauricio Barlera Alves. Identificação de proteínas que interagem com a proteína keaA de Dictyostelium discoideum. 2006. Iniciação Científica. (Graduando em Bioquimica) - Instituto de Quimica da USP. Orientador: Glaucia Mendes Souza.
6. Rodrigo Fandino. Produção e análise de plantas transgênicas da cana-de-açúcar. 2004. Iniciação Científica - Instituto de Química da Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Glaucia Mendes Souza.
7. Rodrigo de Oliveira Mascarenhas. Analise do padrão de expressão dos genes supressores da yakA e do seu papel no controle da resposta a estresses. 2003. Iniciação Científica - Instituto de Biociências - USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Glaucia Mendes Souza.
8. Luciana Mantzouranis. Produção de microarrays de cDNA para validação de dados de expressão. 2003. Iniciação Científica - Instituto de Quimica da USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Glaucia Mendes Souza.
9. Katia Cristina Pereira Oliveira. Analise do padrão de expressão de fatores de transcrição da cana-de-açúcar. 2003. Iniciação Científica - Instituto de Química da Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Glaucia Mendes Souza.
10. Katrin Chaves da Costa. Caracterização de supressores da YakA. 2001. Iniciação Científica - Instituto de Química da Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Glaucia Mendes Souza.
11. Weslei Bueno Ribeiro. Estudo do papel de papA no controle do crescimento e desenvolvimento de Dictyostelium discoideum. 2001. Iniciação Científica - Faculdade de Ciências Farmacêuticas da Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Glaucia Mendes Souza.
12. Renata Gorjão. Clonagem, recapitulação e identificação de supressores de mutagênese insercional da YakA. 2000. Iniciação Científica. (Graduando em Farmácia) - Faculdade de Ciências Farmacûticas - USP. Orientador: Glaucia Mendes Souza.
13. Alexandre Taminato. Isolamento de supressores do mutante yakA de dictyostelium discoideum. 1999. Iniciação Científica - Faculdade de Ciências Farmacêuticas da Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Glaucia Mendes Souza.
14. Marcos Navarro. Análise do padrão de expressão de supressores da YakA. 1999. Iniciação Científica. (Graduando em Ciências Moleculares) - Universidade de São Paulo. Orientador: Glaucia Mendes Souza.
15. Rodrigo Romanhole. Clonagem, recapitulação e identificação de supressores multi-cópia da YakA. 1999. Iniciação Científica. (Graduando em Farmácia) - Faculdade de Ciências Farmacêuticas da Universidade de São Paulo. Orientador: Glaucia Mendes Souza.
Orientações de outra natureza
1. Thiago Gomes Capistano. Validação de dados de expressão e clonagem de promotores. 2006. Orientação de outra natureza. (Bioquimica) - Instituto de Quimica da USP. Orientador: Glaucia Mendes Souza.

Outras informações relevantes 
Convênios e acordos firmados:

1. Aliança FAPESP/Cropdesign. Aliança de Cooperação entre a FAPESP e a empresa Cropdesign (Bélgica). Início: 23/08/01 (em andamento). Coordenadora: Glaucia Mendes Souza (desde 20/02/04).

2. Convênio de Cooperação entre a Cooperativa de Produtores de Cana, açúcar e álcool do Estado de São Paulo - COPERSUCAR, o Instituto Uniemp e a Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - FAPESP. Início: 01/07/04 (em andamento). Coordenadora: Glaucia Mendes Souza. 

3. Convênio de Cooperação entre a Central de Álcool Lucélia LTDA. - Centralcool, o Instituto Uniemp e a Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - FAPESP. Início: 01/07/04 (em andamento). Coordenadora: Glaucia Mendes Souza.

4. Convênio de Cooperação entre a Central de Álcool Lucélia LTDA., a Universidade de São Paulo e o Instituto Uniemp. Início 12/11/04 (em andamento). Coordenadora: Glaucia Mendes Souza.  
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