André Atanasio Maranhão Almeida

bacharel em Ciência da Computação pela Universidade Federal de Alagoas (2003) e mestre em Ciência da Computação pela Universidade Estadual de Campinas (2007). Atualmente é aluno de doutorado da Universidade Estadual de Campinas. Tem experiência na área de Ciência da Computação, com ênfase em Bioinformática e Biologia Molecular Computacional.
(Texto informado pelo autor)

Última atualização do currículo em 23/10/2009
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Dados pessoais
NomeAndré Atanasio Maranhão Almeida
Nome em citações bibliográficasALMEIDA, André A M; André A M Almeida
SexoMasculino
Endereço profissionalUniversidade Estadual de Campinas, Instituto de Computação.
Avenida Albert Einstein, 1251
Cidade Universitária
13084-851 - Campinas, SP - Brasil
URL da Homepage: http://www.ic.unicamp.br/~atanasio

Formação acadêmica/Titulação
2007            Doutorado em andamento em Ciência da Computação .
Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.
Título: Novas abordagens para o problema do alinhamento múltiplo de seqüências, Orientador: Zanoni Dias.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, , .
Palavras-chave: Biologia Computacional; Bioinformática; Alinhamento múltiplo de seqüências.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Biologia Computacional.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Bioinformática.
2004 - 2007Mestrado em Ciência da Computação .
Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.
Título: Comparação algébrica de genomas: o caso da distância de reversão, Ano de Obtenção: 2007.
Orientador: João Meidanis.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, , .
Palavras-chave: Biologia Computacional; Rearranjo de genomas; Distância de reversão.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Teoria da Computação / Especialidade: Biologia Computacional.
2000 - 2003Graduação em Ciência da Computação .
Universidade Federal de Alagoas, UFAL, Brasil.
Título: Aplicação de Algoritmos de Agrupamento a Dados Biológicos.
Orientador: Eliana Silva de Almeida, Alejandro C. Frery.
1996 - 1999Curso técnico/profissionalizante em Informática .
Centro Federal de Educação Tecnológica de Alagoas.

Formação complementar
2002 - 2003Curso Básico de Inglês. (Carga horária: 120h).
Casa de Cultura Britânica.

Atuação profissional
Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.
Vínculo institucional
2004 - Atual Vínculo: Aluno de pós-graduação, Enquadramento Funcional: Aluno de pós-graduação, Carga horária: 20
Atividades
03/2008 - 12/2008Outras atividades técnico-científicas , Instituto de Computação, .
Atividade realizada
Monitor da disciplina Paradigmas de Programação (MC336).
8/2004 - 12/2004Outras atividades técnico-científicas , Instituto de Computação, .
Atividade realizada
Monitor de Banco de Dados (MC536).
Scylla Informática, Brasil.
Vínculo institucional
2005 - 2007 Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Analista de Sistemas, Carga horária: 40
Outras informações Desenvolvimento de sistemas com foco na área de bioinformática.
Atividades
3/2005 - 7/2007Serviços técnicos especializados , Scylla Bioinformática, .
Serviço realizado
Desenvolvimento de sistemas.
Universidade Federal de Alagoas, UFAL, Brasil.
Vínculo institucional
2000 - 2003 Vínculo: Outro, Enquadramento Funcional: Outro (aluno da graduação), Carga horária: 40
Outras informações Aluno do curso de graduação em Ciência da Computação
Atividades
5/2003 - 12/2003Outras atividades técnico-científicas , Centro de Ciências Exatas e Naturais, Departamento de Tecnologia da Informação.
Atividade realizada
Monitor da disciplina de Inteligência Artificial I.
8/2002 - 12/2003Atividades de Participação em Projeto, Centro de Ciências Exatas e Naturais, Departamento de Tecnologia da Informação.
Projetos de pesquisa
Projeto de desenvolvimento de sistemas evolucionários para tratamento de problemas de alta complexidade: Desenvolvimento e uso de algoritmos genéticos para alinhamento de DNA
5/2002 - 1/2003Outras atividades técnico-científicas , Centro de Ciências Exatas e Naturais, Departamento de Tecnologia da Informação.
Atividade realizada
Monitor da disciplina de Programação II.
11/2000 - 7/2002Atividades de Participação em Projeto, Centro de Ciências Exatas e Naturais, Departamento de Tecnologia da Informação.
Projetos de pesquisa
AMBAP: Um Ambiente de Apoio ao Aprendizado de Programação
5/2001 - 1/2002Outras atividades técnico-científicas , Centro de Ciências Exatas e Naturais, Departamento de Tecnologia da Informação.
Atividade realizada
Monitoria da disciplina de Programação I.
6/2000 - 2/2001Estágios , Reitoria, Pró Reitoria de Pós Graduação e Pesquisa.
Estágio realizado
Suporte na área de informática a Pró-reitoria de Pós-graduação e Pesquisa.
Clínica Santa Juliana, CSJ, Brasil.
Vínculo institucional
2000 - 2002 Vínculo: Outro, Enquadramento Funcional: Outro (Auxiliar de serviços de informática), Carga horária: 12
Atividades
11/2000 - 11/2002Serviços técnicos especializados , Hospital Geral, Administração.
Serviço realizado
Trabalhei com criação e manutenção de sites (ASP, PHP, Access), desenvolvimento de software (Delphi, Access), editoração eletrônica (Adobe PageMaker e Corel Draw).
Centro Federal de Educação Tecnológica de Alagoas, CEFET-AL, Brasil.
Vínculo institucional
1996 - 1999 Vínculo: Outro, Enquadramento Funcional: Outro (aluno de curso técnico), Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações Aluno do curso técnico em Informática
Atividades
3/1999 - 12/1999Estágios , Gerência de Tecnologia da Informação, Desenvolvimento de Software.
Estágio realizado
Estudos no que diz respeito a desenvolvimento de aplicações em 3 camadas e desenvolvimento de aplicação web. Implementação de um software para auxiliar o gerenciamento do almoxarifado da instituição..
7/1997 - 12/1997Estágios , Coordenadoria de Informática, Laboratórios de Informática.
Estágio realizado
Monitoria nos laboratórios do curso de informática.

Projetos de Pesquisa
2002 - 2003Projeto de desenvolvimento de sistemas evolucionários para tratamento de problemas de alta complexidade: Desenvolvimento e uso de algoritmos genéticos para alinhamento de DNA
Descrição: Tem o objetivo maior de capacitação em bioinformática, onde foram feitos estudos de conceitos e algoritmos. Além de ser dado início ao desenvolvimento de um Sistema Tutor. Outro objetivo era a análise dos softwares de alinhamento disponíveis e a implementação de um algoritmo de alinhamento usando algoritmos genéticos..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação ( 4) / Especialização ( 0) / Mestrado acadêmico ( 0) / Mestrado profissionalizante ( 0) / Doutorado ( 0) .
Integrantes: Eliana Silva de Almeida - Coordenador / Evandro de Barros Costa - Integrante / Elthon Allex da Silva Oliveira - Integrante / Leandro Melo de Sales - Integrante / Glauber Vinícius Ventura de Melo Ferreira - Integrante / André Atanasio Maranhão Almeida - Integrante.
Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Alagoas - Auxílio financeiro..
2000 - 2002AMBAP: Um Ambiente de Apoio ao Aprendizado de Programação
Descrição: Desenvolvimento de um ambiente integrado para o auxílio ao ensino introdutório de fundamentos da Computação que tem como objetivo dar suporte às disciplinas de Teoria da Computação, Arquitetura de computadores e Programação. O ambiente integra ferramentas de autoria de pseudo-código e micro-programação, com compilação e execução inspecionada pelo aluno, representação gráfica e mapa de memória, além de simulações com máquinas abstratas, como a de Turing. Além disso, apresenta-se também um cenário de interação do aluno com as ferramentas que compõem o ambiente..
Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento.
Alunos envolvidos: Graduação ( 4) / Especialização ( 0) / Mestrado acadêmico ( 0) / Mestrado profissionalizante ( 0) / Doutorado ( 0) .
Integrantes: Klebson dos Santos Silva - Integrante / Rodrigo de Barros Paes - Integrante / Eliana Silva de Almeida - Coordenador / Evandro de Barros Costa - Integrante / Julian Diego Herrera Braga - Integrante / André Atanasio Maranhão Almeida - Integrante.

Número de produções C, T & A: 3.

Áreas de atuação
1. Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Bioinformática.
2. Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Biologia Computacional.

Idiomas
Inglês Compreende Razoavelmente, Fala Pouco, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.
Espanhol Compreende Razoavelmente, Fala Pouco, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.

Prêmios e títulos
2001Menção Honrosa no 6º Congresso de Iniciação Científica da ASSER, Centro Universitário Central Paulista.


Produção em C,T & A
Produção bibliográfica
Trabalhos completos publicados em anais de congressos
1.   ALMEIDA, Eliana Silva de ; COSTA, Evandro de Barros ; ALMEIDA, André A M ; SILVA, K. S. ; PAES, R. B. ; BRAGA, J. D. H. . AMBAP: Um Ambiente de Apoio ao Aprendizado de Programação. In: XXII Congresso da Sociedade Brasileira de Computação, 2002, Florianópolis. Anais do XXII Congresso da Sociedade Brasileira de Computação, 2002. v. 4. p. 79-88.
Resumos publicados em anais de congressos
1. F. SILVA ; M. SOUZA ; André A M Almeida ; DIAS, Z. . A method to evaluate assemblers that make use of short and long transcript reads simultaneously. In: 5th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2009, Angra dos Reis - RJ. X-Meeting Eletronic Abstracts Book 2009, 2009.
2. ALMEIDA, André A M ; GALVES, Miguel ; DIAS, Z. . An algorithm for identifying multiple polymorphisms correlations. In: 3rd Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computacional Biology, 2007, São Paulo. 3rd Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computacional Biology, 2007.
3. BRASILEIRO FILHO, V P ; ALMEIDA, Eliana Silva de ; ALMEIDA, André A M . Partitional Clustering applied to Bioinformatics: Case study in the analysis os types of HPV. In: 1st International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2005, Caxambu. 1st International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2005.
4. ALMEIDA, André A M ; SILVA, K. S. ; PAES, R. B. ; ALMEIDA, Eliana Silva de . AMBAP: Um Ambiente de Aprendizado de Programação. In: 6º Congresso de Iniciação Científica da ASSER, 2001, São Carlos. 6º Congresso de Iniciação Científica - ASSER - UNICENP, 2001. v. único. p. 91-91.
Apresentações de Trabalho
1. ALMEIDA, André A M . Tecnologias para o desenvolvimento de aplicações web. 2003. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
Produção técnica
Softwares sem registro de patente
1.   ALMEIDA, André A M ; FERREIRA, Glauber Vinícius Ventura de Melo ; ANDRADE, A B ; OLIVEIRA, B J S ; LIMA, I S ; TONHOLO, J . Sistema de Gerenciamento do PIBIC na Web. 2002.
2.   ALMEIDA, André A M ; SILVA, K. S. . ProImage. 2001.
3.   ALMEIDA, André A M ; ALMEIDA, Eliana Silva de ; COSTA, Evandro de Barros ; BRAGA, J. D. H. ; SILVA, K. S. ; PAES, R. B. ; SILVA FILHO, Luiz Josué da . AMBAP. 2001.
Trabalhos técnicos
1. ALMEIDA, André A M ; GALVES, Miguel ; DIAS, Z. . Um algoritmo para identificação de correlações múltiplas de polimorfismos. 2006.

Eventos
Organização de eventos
1. ALMEIDA, André A M ; ALMEIDA, Eliana Silva de ; COSTA, Evandro de Barros ; ALMEIDA, Hyggo Oliveira de ; ORGAMBIDE, Alejandro Cesar Frery ; RAMOS FILHO, Heitor Soares ; SANTOS, Robério José Rogério dos ; GUSMÃO, Sóstenes de ; FERREIRA, Glauber Vinícius Ventura de Melo ; CAVALCANTE FILHO, Emerson Loureiro ; SALES, Leandro Melo de ; LEITE, Talita Perciano Costa ; FERREIRA, Cristiane Maria S ; RIBEIRO, Márcio de Medeiros ; OLIVEIRA, Elthon Allex da Silva ; BUBLITZ, Frederico Moreira ; LOPES, Bruno ; AZEVEDO, Wallace Franco Nogueira de . Congresso Alagoano de Tecnologia da Informação. 2003. (Congresso).
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