Vinicius Carqueijo Mesel

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  • Última atualização do currículo em 11/07/2018


Tem experiência em análise de dados e aplicação de algoritmos de machine learning com ênfase em Bioinformática. Cursa Engenharia da Computação na Faculdade de Informática e Administração Paulista (FIAP - SP). (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Vinicius Carqueijo Mesel
Nome em citações bibliográficas
MESEL, V. C.;MESEL, VINÍCIUS;MESEL, VINÍCIUS C


Formação acadêmica/titulação


2017
Graduação em andamento em Engenharia de Computação.
Faculdade de Informática e Administração Paulista, FIAP, Brasil.
2014 - 2016
Ensino Médio (2º grau).
Salesiano Santa Teresinha, SST, Brasil.
2006 - 2013
Ensino Fundamental (1º grau).
Salesiano Santa Teresinha, SST, Brasil.




Formação Complementar


2017 - 2017
Curso de verão de Bioinformática. (Carga horária: 40h).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
2017 - 2017
Introdução ao Cálculo de Probabilidades. (Carga horária: 60h).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
2006 - 2014
Inglês. (Carga horária: 800h).
Cultura Inglesa - São Paulo, CULTURA INGLESA, Brasil.


Atuação Profissional



Instituto Butantan, IBU, Brasil.
Vínculo institucional

2017 - Atual
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Iniciação Científica, Carga horária: 16
Outras informações
Trabalhando no pipeline de preparação do experimento de phage display. O pipeline contém as seguintes etapas: corte do tamanha das sequências dos transcritos, remoção de restriction sites, colocação de adaptadores nas pontas das sequências e análise de machine learning dos epítopos detectados no experimento.

Vínculo institucional

2016 - 2016
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Iniciação Científica, Carga horária: 8, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações
Participante do projeto de Doutorado do Aluno Lucas F. Silva: "Identificação de RNAs longos não codificadores de proteína ativados por andrógeno com potencial de regulação da arquitetura cromossômica e da composição epigenética local"

Atividades

07/2016 - Atual
Outras atividades técnico-científicas , Laboratório Especial de Zoonóses e Endemias Parasitárias, Laboratório Especial de Zoonóses e Endemias Parasitárias.

Atividade realizada
Iniciação Científica.


Projetos de pesquisa


2017 - Atual
Criação de uma biblioteca de sequências para o experimento de phage display que será usado para testes de novos epítopos vacinais contra o parasita S. mansoni.
Descrição: Será criado um pipeline para geração de fragmentos de sequências de cDNAs de Schistosoma mansoni de tamanho e composição de bases adequados para a construção de uma biblioteca de phage-display, permitindo a busca não enviesada de novos candidatos a alvos vacinais contra a esquistossomose. A biblioteca de fragmentos de cDNA será obtida por síntese química por encomenda na empresa Agilent, e os cDNAs serão sintetizados segundo o arquivo de fragmentos de sequências obtido pelo pipeline desenvolvido pelo aluno. Estas sequências serão utilizadas na descoberta dos epítopos reconhecidos durante o processo de resposta imunológica de auto-cura de macacos rhesus..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) .
Integrantes: Vinicius Carqueijo Mesel - Integrante / Sergio Verjovski-Almeida - Coordenador.
2016 - 2017
Machine-Learning pipeline to predict relevant RNA motifs that allow the physical association between lincRNAs and androgen receptor
Descrição: A large amount of evidence suggests that long intergenic noncoding RNAs (lincRNAs) regulate genes in their genomic neighborhoods by recruiting specific proteins like transcription factors and histone modifying enzymes. In this work we used a high-throughput RNA immunoprecipitation and sequencing (RIP-seq) approach in LNCaP (Androgen-Sensitive Human Prostate Adenocarcinoma) cells under androgen hormonal stimulation to identify the androgen receptor (AR)-bound RNA sequences combined with machine learning and statistical methods (SVM, Random Forest and Deep Neural Networks) for pattern discovery that putatively permit the interaction between lincRNAs and AR.
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) .
Integrantes: Vinicius Carqueijo Mesel - Integrante / Sergio Verjovski-Almeida - Coordenador / Lucas S Ferreira - Integrante.
Número de produções C, T & A: 5


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Probabilidade e Estatística / Subárea: Bioinformática.
2.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Probabilidade e Estatística / Subárea: Ciência da Computação.


Idiomas


Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Espanhol
Compreende Pouco, Fala Razoavelmente, Lê Pouco, Escreve Pouco.
Hebraico
Compreende Pouco, Fala Pouco, Lê Pouco, Escreve Pouco.


Prêmios e títulos


2016
Resumo escolhido para publicação na Revista InCiência, Colégio Dante Allighieri.
2016
Prêmio de Melhor Resumo como Apresentador Convidado, Colégio Dante Alighieri.


Produções



Produção bibliográfica
Artigos completos publicados em periódicos

1.
VASCONCELOS, ELTON J R2018VASCONCELOS, ELTON J R ; MESEL, VINÍCIUS C ; DASILVA, LUCAS F ; PIRES, DAVID S ; LAVEZZO, GUILHERME M ; PEREIRA, ADRIANA S A ; AMARAL, MURILO S ; VERJOVSKI-ALMEIDA, SERGIO . Atlas of Schistosoma mansoni long non-coding RNAs and their expression correlation to protein-coding genes. Database-The Journal of Biological Databases and Curation, v. 2018, p. bay068, 2018.

2.
DASILVA, LUCAS F.2018DASILVA, LUCAS F. ; BECKEDORFF, FELIPE C. ; AYUPE, ANA C. ; AMARAL, MURILO S. ; MESEL, VINÍCIUS ; VIDEIRA, ALEXANDRE ; REIS, EDUARDO M. ; SETUBAL, JOÃO C. ; VERJOVSKI-ALMEIDA, SERGIO . Chromatin Landscape Distinguishes the Genomic Loci of Hundreds of Androgen-Receptor-Associated LincRNAs From the Loci of Non-associated LincRNAs. Frontiers in Genetics, v. 9, p. 1, 2018.

Apresentações de Trabalho
1.
MESEL, V. C.. GeoMath - Matemática Analítica em Python. 2016. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

2.
MESEL, V. C.; VERJOVSKI-ALMEIDA, S. ; FERREIRA, L. S. . Utilização de Algoritmos de aprendizado de maquina para predição de motivos de ligação entre Receptor de Andrógeno e DNA. 2016. (Apresentação de Trabalho/Congresso).



Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
Butantan: Incentivo a Jovens Cientistas e a uma Ciência Jovem.Sequências peptídicas de Schistosoma mansoni para screening não enviesado em macaco rhesus de possíveis candidatos vacinais. 2018. (Simpósio).

2.
18ª Reunião Científica Anual do Instituto Butantan. Machine-Learning pipeline to predict relevant RNA motifs that allow the physical association between lincRNAs and androgen receptor. 2016. (Congresso).

3.
Congresso do Departamento de Bioquímica. Aprendizagem de máquina para a procura de motivos nas sequências de RNA que permitem a associação entre lincRNAs e Receptor de Andrógeno. 2016. (Congresso).

4.
VIII Simpósio de Ciência do Colégio Dante Alighieri.Aprendizagem de máquina para a procura de motivos nas sequências de RNA que permitem a associação entre lincRNAs e Receptor de Andrógeno. 2016. (Simpósio).




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