Denise Rejane de Carvalho e Silva

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  • Última atualização do currículo em 04/06/2010


Possui graduação em Ciências Biológicas (1995) e doutorado em Bioquímica e Imunologia (2000) ambos pela Universidade Federal de Minas Gerais, e pos-doutorado em Genetica na Australian National University (2002). Desde 2004, trabalha no Wellcome Trust Sanger Institute, inicialmente como pesquisadora na area de Evolucao Humana e mais recentemente (2007-atual) como cientista no grupo HAVANA (Human And Vertebrate Analysis aNd Annotation). Atua nas áreas de Genética e Genomica, com ênfase nos seguintes temas: cromosomos sexuais X e Y, DNA mitocondrial humano, microsatellites, SNPs, populacoes da America do Sul (brasileiros e amerindios), populacoes do sul da Asia (indianos, butaneses e nepaleses), bioinformatica e anotacao de genomas humano, murino e porcino para os projetos CCDS e EUCOMM. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Denise Rejane de Carvalho e Silva
Nome em citações bibliográficas
Carvalho-Silva, D. R..;Carvalho-Silva, D

Endereço


Endereço Profissional
The Wellcome Trust Sanger Institute.
Genome Campus-Morgan building N309
CB10 1SA - Hinxton, - Inglaterra
Telefone: (01223) 834244
Ramal: 8777
URL da Homepage: http://www.sanger.ac.uk/HGP/havana/


Formação acadêmica/titulação


1996 - 2000
Doutorado em Bioquímica e Imunologia.
Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.
Título: Estudos filogeográficos e moleculares do cromossomo Y em populações humanas do Brasil, Ano de obtenção: 2000.
Orientador: Sergio Danilo Junho Pena.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior.
Palavras-chave: Biologia Molecular; Evolução Molecular; Genética de Populações; Povoamento do Brasil; cromossomo Y humano; Fluxo gênico direcional.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular / Especialidade: Evolução Molecular.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular / Especialidade: Genética de Populações.
Setores de atividade: Educação.
1991 - 1995
Graduação em Ciências Biológicas.
Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.
Título: Efeito das raízes de soja nos perfis protéico e polissacarídeo de estirpes de Bradyrhizobium japonicum que variam quanto à capacidade competitiva..
Orientador: Maria Rita Scotti Marques Muzzi Leitão.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico.


Pós-doutorado


2000 - 2002
Pós-Doutorado.
Australian National University.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genômica Comparativa de Marsupiais.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Bioinformatica.


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Humana e Médica/Especialidade: Genética Humana.
2.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular/Especialidade: Evolução Molecular.
3.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética de Populações.
4.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Animal/Especialidade: Estudo comparativo de genomas em marsupiais.
5.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Bioinformatica.
6.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Bioinformatica/Especialidade: Anotacao de genomas em vertebrados.


Idiomas


Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Espanhol
Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.


Produções



Produção bibliográfica
Artigos completos publicados em periódicos

1.
Balaresque, Patricia2009Balaresque, Patricia ; Parkin, Emma J. ; Roewer, Lutz ; Carvalho-Silva, Denise R. ; Mitchell, R. John ; Oorschot, Roland A. H. ; Henke, Jürgen ; Stoneking, Mark ; Nasidze, Ivan ; Wetton, Jon ; Knijff, Peter ; Tyler-Smith, Chris ; Jobling, Mark A. . Genomic complexity of the Y-STR DYS19: inversions, deletions and founder lineages carrying duplications. International Journal of Legal Medicine, v. 123, p. 15-23, 2009.

2.
Balaresque, Patricia2008Balaresque, Patricia ; Bowden, Georgina R. ; Parkin, Emma J. ; Omran, Ghada A. ; Heyer, Evelyne ; Quintana-Murci, Lluis ; Roewer, Lutz ; Stoneking, Mark ; Nasidze, Ivan ; Carvalho-Silva, Denise R. ; Tyler-Smith, Chris ; de Knijff, Peter ; Jobling, Mark A. . Dynamic nature of the proximal AZFc region of the human Y chromosome: multiple independent deletion and duplication events revealed by microsatellite analysis . Human Mutation, v. 29, p. 1171-1180, 2008.

3.
Thangaraj, Kumarasamy2008Thangaraj, Kumarasamy Chaubey, Gyaneshwer Kivisild, Toomas Selvi Rani, Deepa Singh, Vijay Kumar Ismail, Thanseem Carvalho-Silva, Denise Metspalu, Mait Bhaskar, L.V.K.S. Reddy, Alla G. Chandra, Sarat Pande, Veena Prathap Naidu, B. Adarsh, Niharika Verma, Abhilasha Jyothi, Inaganti Amara Mallick, Chandana Basu Shrivastava, Nidhi Devasena, Ragala Kumari, Babita Singh, Amit Kumar Dwivedi, Shailendra Kumar Dhar Singh, Shefali Rao, Geeta Gupta, Pranav , et al.Sonvane, Vartika Kumari, Kavita Basha, Afsar Bhargavi, K.R. Lalremruata, Albert Gupta, Arvind Kumar Kaur, Gurukamal Reddy, K.K. Rao, A.Papa Villems, Richard Tyler-Smith, Chris Singh, Lalji ; Maternal Footprints of Southeast Asians in North India, v. 66, p. 1-9, 2008.

4.
Carvalho-Silva, D. R..;Carvalho-Silva, D2006Carvalho-Silva, D. R..; Tarazona-Santos, Eduardo ; Rocha, Jorge ; Pena, Sérgio D. J. ; Santos, Fabrício R. . Y Chromosome Diversity in Brazilians: Switching Perspectives from Slow to Fast Evolving Markers. Genetica (The Hague), v. 126, p. 251-260, 2006.

5.
CARVALHO-SILVA, D. R.2006CARVALHO-SILVA, D. R.; ZERJAL, T. ; TYLER-SMITH, C. . Ancient Indian roots?. Journal of Biosciences, v. 31, p. 1-2, 2006.

6.
Gutala, Ramana2006 Gutala, Ramana ; Carvalho-Silva, Denise R. ; Jin, Li ; Yngvadottir, Bryndis ; Avadhanula, Vasanthi ; Nanne, Khaja ; Singh, Lalji ; Chakraborty, Ranajit ; Tyler-Smith, Chris . A shared Y-chromosomal heritage between Muslims and Hindus in India. Human Genetics, v. 120, p. 543-551, 2006.

7.
Jobling, M. A.2006Jobling, M. A. ; Lo, I. C. C. ; Turner, D. J. ; Bowden, G. R. ; Lee, A. C. ; Xue, Y. ; Carvalho-Silva, D. ; Hurles, M. E. ; Adams, S. M. ; Chang, Y. M. ; Kraaijenbrink, T. ; Henke, J. ; Guanti, G. ; McKeown, B. ; van Oorschot, R. A.H. ; Mitchell, R. J. ; de Knijff, P. ; TYLER-SMITH, C. ; Parkin, E. J. . Structural variation on the short arm of the human Y chromosome: recurrent multigene deletions encompassing Amelogenin Y. Human Molecular Genetics, v. 16, p. 307-316, 2006.

8.
RUIZ-NARVÁEZ, Edward A2005RUIZ-NARVÁEZ, Edward A ; SANTOS, F. R. ; Carvalho-Silva, D. R.. ; AZOFEIFA, Jorge ; BARRANTES, Ramiro ; PENA, S. D. J. . Genetic variation of the Y-chromosome in Chibcha-speaking Amerindians of Costa Rica and Panama. Human Biology, Detroit, v. 77, p. 71-91, 2005.

9.
Waters, Paul D.2005Waters, Paul D. ; Delbridge, Margaret L. ; Deakin, Janine E. ; El-Mogharbel, Nisrine ; Kirby, Patrick J. ; Carvalho-Silva, Denise R. ; Graves, Jennifer A. Marshall . Autosomal location of genes from the conserved mammalian X in the platypus (Ornithorhynchus anatinus): implications for mammalian sex chromosome evolution. Chromosome Research, v. 13, p. 401-410, 2005.

10.
Carvalho-Silva, Denise R.2004Carvalho-Silva, Denise R.; O Neill, Rachel J. W. ; Brown, Judith D. ; Huynh, Kim ; Waters, Paul D. ; Pask, Andrew J. ; Delbridge, Margaret L. ; Graves, Jennifer A. Marshall . Molecular characterization and evolution of X and Y-borne ATRX homologues in American marsupials. Chromosome Research, Holanda, v. 12, p. 795-804, 2004.

11.
Mohyuddin, A2004Mohyuddin, A ; CARVALHO-SILVA, D. R. . Genetic instability in EBV-transformed lymphoblastoid cell lines. Biochimica et Biophysica Acta. G, General Subjects, v. 1670, p. 81-83, 2004.

12.
SANTUCCIU, C.2003SANTUCCIU, C. ; Gr& ; Carvalho-Silva, D.R. ; Graves, J.A.M. . Isolation of chromosomal regions controlling intersex development in a marsupial. Cytogenetic and Genome Research, Suíça, v. 101, p. 224-228, 2003.

13.
CARVALHOSILVA, D2001 CARVALHOSILVA, D; SANTOS, F ; ROCHA, J ; PENA, S . The Phylogeography of Brazilian Y-Chromosome Lineages. American Journal of Human Genetics, Estados Unidos, v. 68, p. 281-286, 2001.

14.
TARAZONASANTOS, E2001 TARAZONASANTOS, E ; CARVALHOSILVA, D ; PETTENER, D ; LUISELLI, D ; DESTEFANO, G ; LABARGA, C ; RICKARDS, O ; TYLERSMITH, C ; PENA, S ; SANTOS, F . Genetic Differentiation in South Amerindians Is Related to Environmental and Cultural Diversity: Evidence from the Y Chromosome. American Journal of Human Genetics, Estados Unidos, v. 68, p. 1485-1496, 2001.

15.
TARAZONA-SANTOS, E. M.2001TARAZONA-SANTOS, E. M. ; Carvalho-Silva, D. R.. ; PETTENER, D. ; LUISELLI, D. ; DE STEFANO, G. F. ; LABARGA, C. M. ; RICKARDS, O. ; TYLER-SMITH, C. ; PENA, S. D. J. ; SANTOS, F. R. . Reply to Rothhammer and Moraga . American Journal of Medical Genetics, Estados Unidos, v. 69, p. 904-906, 2001.

16.
Carvalho-Silva, D2000Carvalho-Silva, D. Molecular characterization and population study of an X chromosome homolog of the Y-linked microsatellite DYS391. Gene (Amsterdam), Amsterdã, Holanda, v. 247, p. 233-240, 2000.

17.
Carvalho-Silva, Denise R.1999 Carvalho-Silva, Denise R.; Santos, Fabrício R. ; Hutz, Mara H. ; Salzano, Francisco M. ; Pena, Sérgio D.J. . Divergent Human Y-Chromosome Microsatellite Evolution Rates. Journal of Molecular Evolution, New York, E.U.A., v. 49, p. 204-214, 1999.

18.
Carvalho-Silva, D. R..;Carvalho-Silva, D1998Carvalho-Silva, D. R..; VARGAS, M. A. T. ; SCOTTI, M.R.M.M.L. . Alterações nos perfis protéicos (SDS-PAGE) de estirpes competitivas de Bradyrhizobium sp. na fase de pré-infecção da soja.. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, Brasil, v. 33, p. 1375-1388, 1998.

19.
SCOTTI, M. R. M. M. L.1997SCOTTI, M. R. M. M. L. ; Carvalho-Silva, D. R.. ; VARGAS, M. A. T. ; NEVES, M. C. ; DOBEREINER, J. . Changes in electrophoretic profiles of lipopolysaccharides from competitive strais of Bradyrhizobium sp. induced by soybean roots. Journal of Applied Microbiology, v. 83, p. 552-560, 1997.

20.
PENA, S. D. J.1997PENA, S. D. J. ; Carvalho-Silva, D. R.. ; SANTOS, F. R. . Utilização de Polimorfismos do Cromossomo Y no Estudo do Povoamento das Américas.. Revista Universidade de Sao Paulo, São Paulo, v. 34, p. 44-57, 1997.

Capítulos de livros publicados
1.
Yngvadottir, Bryndis ; CARVALHO-SILVA, D. R. . Reconstructing Human History Using Autosomal, Y-Chromosomal and Mitochondrial Markers. Encyclopedia of Life Sciences. : , 2008, v. , p. -.

2.
SANTOS, F. R. ; Carvalho-Silva, D. R.. ; PENA, S. D. J. . PCR-Based Dna Profiling Of Human Y Chromosomes. In: Jorg T. Epplen; Thomas Lubjuhn. (Org.). DNA profiling and DNA fingerprinting. 1ed.Basel, Suiça: Birkhäuser Verlag AG, 1999, v. , p. 133-152.

Textos em jornais de notícias/revistas
1.
PENA, S. D. J. ; Carvalho-Silva, D. R.. ; Alves-Silva J ; Prado VF ; SANTOS, F. R. . Retrato Molecular do Brasil. Ciência Hoje, p. 16 - 25, 15 abr. 2000.

2.
PENA, S. D. J. ; Carvalho-Silva, D. R.. ; Alves-Silva J ; Prado VF ; SANTOS, F. R. . Os genes de Cabral. Público, Portugal, 21 mar. 2000.

3.
PENA, S. D. J. ; Carvalho-Silva, D. R.. ; Alves-Silva J ; Prado VF ; SANTOS, F. R. . Aquarela do Brasil. Revista Época, 30 dez. 1900.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
Carvalho-Silva, D. R..; SANTOS, F. R. ; PENA, S. D. J. . The multi-ethnic peopling of Brazil: history told by Y-chromosome polymorphisms. In: THE THIRD BIENNIAL EUROCONFERENCE OF THE EUROPEAN HUMAN GENOME DIVERSITY, 1999, Cambridge, UK. Human Diversity in Europe and Beyond: Retrospect and Prospect, 1999. p. 7-7.

2.
Tarazona-Santos E ; Carvalho-Silva, D. R.. ; PETTENER, D. ; LUISELLI, D. ; PENA, S. D. J. ; SANTOS, F. R. . Y chromosome variability in Andean Populations and historical inferences. In: 45o Congresso Nacional de Genética, 1999, Gramado, RS. Genetics and Molecular Biology, suplemento, 1999. v. 22. p. 574-574.

3.
Carvalho-Silva, D. R..; PENA, S. D. J. . Identification, mapping and population studies of a novel microsatellite on the human X chromosome containing sequence homologous to DYS391. In: 44o Congresso Nacional de Genética, 1998, Águas de Lindóia. Sociedade Brasileira de Genética SBG (suplemento), 1998. v. 21. p. 312-312.

4.
Carvalho-Silva, D. R..; SANTOS, F. R. ; PENA, S. D. J. . Evolution of Y-linked tetranucleotide loci in Amerindians. In: XXVII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular SBBq, 1998, Caxambu, MG. Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular SBBq, 1998. p. 17-17.

5.
Carvalho-Silva, D. R..; SANTOS, F. R. ; PENA, S. D. J. . Y chromosome haplotype diversity in Brazilian Caucasians. In: XXVII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e biologia Molecular SBBq, 1998, Caxambu, MG. XXVII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular SBBq, 1998. p. 13-13.

6.
SCOTTI, M. R. M. M. L. ; Carvalho-Silva, D. R.. ; 2 ; DOBEREINER, J. . Changes induced by soybean roots in the lipopolysaccharides of Bradyrhizobium japonicum strains that differ in competitiveness. In: VII Congresso Argentino de Microbiologia, 1995, Buenos Aires. VII Congresso Argentino de Microbiologia, 1995.

7.
Carvalho-Silva, D. R..; 2 ; DOBEREINER, J. ; SCOTTI, M. R. M. M. L. . Proteic and lipopolysaccharide changes in Bradyrhizobium japonicum strains induced by soybean roots. In: XLVI Congresso Nacional de Botânica, 1995, Ribeirão Preto. XLVI Congresso Nacional de Botânica, 1995.




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