Rubens Mendes Lopes

Bolsista de Produtividade em Pesquisa do CNPq - Nível 1D

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  • Última atualização do currículo em 06/08/2018


Possui graduação em Ciências Biológicas pela Universidade de São Paulo (1985), mestrado em Ecologia pela Universidade de São Paulo (1989) e doutorado em Zoologia pela Universidade Federal do Paraná (1997). Atualmente é professor doutor do Instituto Oceanográfico da Universidade de São Paulo, onde é credenciado como orientador em nível de mestrado e doutorado. Atua na área de Oceanografia Biológica, com ênfase em Ecologia do Plâncton Marinho, desenvolvendo estudos nos seguintes temas: variabilidade espacial e temporal do zooplâncton; interações tróficas no sistema pelágico; produção secundária planctônica; comportamento do zooplâncton. Participa de programas de monitoramento, avaliação e gestão ambiental, particularmente nos setores de energia e aquaviário. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Rubens Mendes Lopes
Nome em citações bibliográficas
LOPES R. M.;LOPES, R.;Lopes, R. M.;Lopes, Rubens M.;LOPES, R;LOPES, R M;LOPES, RUBENS MENDES;LOPES, RUBENS M

Endereço


Endereço Profissional
Universidade de São Paulo, Instituto Oceanográfico, Departamento de Oceanografia Biológica.
Praça do Oceanográfico, 191 - sala 100
Butantã
05508120 - São Paulo, SP - Brasil
Telefone: (11) 30916556
Fax: (11) 30916607
URL da Homepage: laps.io.usp.br


Formação acadêmica/titulação


1993 - 1997
Doutorado em Zoologia.
Universidade Federal do Paraná, UFPR, Brasil.
Título: ZOOPLÂNCTON DA BAÍA DE PARANAGUÁ: DISTRIBUIÇÃO ESPACIAL, VARIAÇÃO TEMPORAL E INTERAÇÕES TRÓFICAS., Ano de obtenção: 1997.
Orientador: FREDERICO PEREIRA BRANDINI.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
Palavras-chave: ZOOPLÂNCTON; COPEPODA; COSTA SUL-SUDESTE; ESTUÁRIOS; COMPORTAMENTO ALIMENTAR; VARIAÇÃO TEMPORAL.
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Oceanografia / Subárea: Oceanografia Biológica / Especialidade: Interação entre os Organismos Marinhos e os Parâmetros Ambientais.
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Oceanografia / Subárea: Oceanografia Biológica / Especialidade: Ecologia do Plâncton Marinho.
Setores de atividade: Pesca, Aqüicultura e Maricultura; Produtos e Serviços Voltados Para A Defesa e Proteção do Meio Ambiente, Incluindo O Desenvolvimento Sustentado.
1986 - 1989
Mestrado em Ecologia.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: ZOOPLÂNCTON DO ESTUÁRIO DO RIO GUARAÚ (PERUÍBE, SÃO PAULO): COMPOSIÇÃO, DISTRIBUIÇÃO ESPACIAL E VARIAÇÃO SAZONAL NO PERÍODO DE OUTUBRO/86 A OUTUBRO/87.,Ano de Obtenção: 1989.
Orientador: TAGEA KRISTINA SIMON BJöRNBERG.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
Palavras-chave: ZOOPLÂNCTON; ESTUÁRIOS; DISTRIBUIÇÃO ESPACIAL; VARIAÇÃO TEMPORAL; COPEPODA; COSTA SUL-SUDESTE.
Grande área: Ciências Biológicas
Setores de atividade: Pesca, Aqüicultura e Maricultura; Produtos e Serviços Voltados Para A Defesa e Proteção do Meio Ambiente, Incluindo O Desenvolvimento Sustentado.
1982 - 1985
Graduação em Ciências Biológicas.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.




Formação Complementar


1993 - 1993
Estágio Em Ciências Marinhas. (Carga horária: 480h).
University Of Connecticut, UCONN, Estados Unidos.


Atuação Profissional



Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Vínculo institucional

2017 - Atual
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Associado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Vínculo institucional

2002 - Atual
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Doutor, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

06/2018 - Atual
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, .

Cargo ou função
Representante do DOB na Comissão de Pesquisa - Suplente.
09/2016 - Atual
Ensino, Oceanografia Biológica, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
IOC-5723 ? Avanços em Ecologia do Pelagial Marinho
07/2016 - Atual
Ensino, Oceanografia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
IOB-0135/Sistema Pelágico
9/2002 - Atual
Pesquisa e desenvolvimento , Instituto Oceanográfico, Departamento de Oceanografia Biológica.

05/2015 - 05/2017
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, .

Cargo ou função
Comissão de Assessoramento Científico da Biblioteca "Prof. Dr. Gelso Vazzoler" - Suplente.
02/2016 - 01/2017
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, .

Cargo ou função
Comissão de Bolsas da Pós-Graduação - Suplente.
02/2015 - 01/2017
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, Departamento de Oceanografia Biológica.

Cargo ou função
Representante dos Professores Doutores no Conselho Departamental - Titular.
01/2016 - 06/2016
Ensino, Oceanografia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
IOB-0156/Microbiologia Marinha
01/2016 - 06/2016
Ensino, Oceanografia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
2100104/Trabalho de Graduação I
06/2015 - 05/2016
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, .

Cargo ou função
Representante da categoria de Professor Doutor junto à Congregação - Titular.
04/2015 - 03/2016
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, Departamento de Oceanografia Biológica.

Cargo ou função
Comissão encarregada pela realização do Exame de Seleção no Programa de Oceanografia Biológica - Suplente.
01/2016 - 02/2016
Ensino, Oceanografia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
IOB-146/Produção Secundária do Zooplâncton Marinho
02/2015 - 01/2016
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, .

Cargo ou função
Comissão de Bolsas da Pós-Graduação - Suplente.
2014 - 2016
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, .

Cargo ou função
Comissão Gestora dos Laboratórios das Bases de Pesquisa - Presidente.
07/2015 - 12/2015
Ensino, Oceanografia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
2100105/Trabalho de Graduação II
07/2015 - 12/2015
Ensino, Oceanografia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
IOB-0135/Sistema Pelágico
07/2015 - 12/2015
Ensino, Oceanografia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
IOB-122/Oceanografia - O Ambiente Marinho
01/2015 - 06/2015
Ensino, Oceanografia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
IOB-0156/Microbiologia Marinha
01/2015 - 06/2015
Ensino, Oceanografia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
2100104/Trabalho de Graduação I
11/2013 - 05/2015
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, .

Cargo ou função
Comissão de Regimento da Biblioteca "Prof. Dr. Gelso Vazzoler - Suplente.
02/2014 - 03/2015
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, .

Cargo ou função
Comissão de Bolsas da Pós-Graduação - Suplente.
07/2014 - 12/2014
Ensino, Oceanografia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
IOB-135/Sistema Pelágico
07/2014 - 12/2014
Ensino, Oceanografia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
IOB-156 / Microbiologia Marinha
07/2014 - 12/2014
Ensino, Oceanografia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
IOB-122/Oceanografia - O Ambiente Marinho
06/2014 - 08/2014
Ensino, Oceanografia Biológica, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
IOC-5723 ? Avanços em Ecologia do Pelagial Marinho
04/2012 - 04/2014
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, .

Cargo ou função
Comissão de Pós-Graduação - Suplente.
02/2013 - 03/2014
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, .

Cargo ou função
Comissão de Bolsas de Pós-Graduação - Suplente.
07/2013 - 12/2013
Ensino, Oceanografia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
2100105/Trabalho de Graduação II
01/2013 - 12/2013
Ensino, Oceanografia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
IOB-142 / Invertebrados Marinhos I
01/2013 - 06/2013
Ensino, Oceanografia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
2100104/Trabalho de Graduação I
2007 - 2013
Ensino, Oceanografia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
IOB-122/Oceanografia - O Ambiente Marinho
2005 - 2013
Ensino, Oceanografia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
IOB-135/Sistema Pelágico
03/2012 - 05/2012
Ensino, Oceanografia Biológica, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
IOC-5723 ? Avanços em Ecologia do Pelagial Marinho
04/2010 - 03/2012
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, .

Cargo ou função
Comissão de Pós-Graduação - Suplente.
04/2004 - 03/2012
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, .

Cargo ou função
Comissão de Pós-Graduação do Instituto Oceanográfico da USP - Suplente.
2006 - 2012
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, .

Cargo ou função
Titular da Comissão encarregada do processo seletivo para a pós-graduação (mestrado e doutorado) no programa de Oceanografia Biológica, IOUSP.
02/2011 - 12/2011
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, .

Cargo ou função
Comissão de Divulgação da Pós-Graduação - Membro.
01/2011 - 06/2011
Ensino, Oceanografia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
2100105/Trabalho de Graduação II
04/2010 - 03/2011
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, .

Cargo ou função
Comissão de Informática - Membro.
02/2010 - 01/2011
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, Departamento de Oceanografia Biológica.

Cargo ou função
Comissão encarregada pela realização de Exame de Seleção no Programa de Oceanografia Biológica - Presidente.
02/2009 - 01/2011
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, .

Cargo ou função
Membro do Conselho do Departamento de Oceanografia Biológica do IOUSP - Titular.
2010 - 2011
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, .

Cargo ou função
Comissão de Acompanhamento dos Alunos Ingressantes em 2010 - Membro.
07/2010 - 12/2010
Ensino, Oceanografia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
IOB-146/Produção Secundária do Zooplâncton Marinho
07/2010 - 12/2010
Ensino, Oceanografia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
2100105/Trabalho de Graduação II
09/2010 - 11/2010
Ensino, Oceanografia Biológica, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
IOB-5751 ? Avanços em Ecologia do Pelagial Marinho
10/2002 - 09/2010
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, Departamento de Oceanografia Biológica.

Cargo ou função
Representante dos Professores Doutores na Comissão de Graduação (Curso de Graduação em Oceanografia) - suplente.
01/2010 - 06/2010
Ensino, Oceanografia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
2100104/Trabalho de Graduação I
03/2010 - 05/2010
Ensino, Oceanografia Biológica, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
IOB-5751 ? Avanços em Ecologia do Pelagial Marinho
11/2007 - 03/2010
Conselhos, Comissões e Consultoria, FUNDESPA, .

Cargo ou função
Conselho Curador da Fundação de Estudos e Pesquisas Aquáticas ? FUNDESPA - Membro.
04/2007 - 03/2010
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, .

Cargo ou função
Comissão de Pós-Graduação - Suplente.
07/2009 - 12/2009
Ensino, Oceanografia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
2100105/Trabalho de Graduação II
06/2009 - 08/2009
Ensino, Oceanografia Biológica, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
IOB-5751 ? Avanços em Ecologia do Pelagial Marinho
01/2009 - 06/2009
Ensino, Oceanografia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
2100104/Trabalho de Graduação
06/2006 - 05/2009
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, .

Cargo ou função
Comissão de Pesquisa - Titular.
05/2008 - 04/2009
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, .

Cargo ou função
Comissão Interna de Avaliação de Desempenho dos Servidores Técnico-Administrativos - Titular.
05/2008 - 04/2009
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, .

Cargo ou função
Conselho da ADUSP, como representante do IOUSP - Suplente.
02/2008 - 01/2009
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, Departamento de Oceanografia Biológica.

Cargo ou função
Comissão encarregada pela realização de Exame de Seleção para ingresso no Curso de Pós-graduação - Membro.
2006 - 2009
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, .

Cargo ou função
Titular da Comissão encarregada da realização de Examoes de Proficiência em Inglês, Curso de Pós-Graduação, IOUSP.
01/2008 - 12/2008
Ensino, Oceanografia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
IOB-146/Produção Secundária do Zooplâncton Marinho
11/2005 - 10/2008
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, .

Cargo ou função
Comissão de Graduação - titular.
06/2008 - 09/2008
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, .

Cargo ou função
Comissão Interna do Programa de Acesso à Carreira, dirigido aos Servidores Técnico-Administrativos - Titular.
03/2005 - 02/2008
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, Departamento de Oceanografia Biológica.

Cargo ou função
Comissão de Bolsas.
02/2007 - 01/2008
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, .

Cargo ou função
Comissão Coordenadora do PAE - Titular.
02/2007 - 01/2008
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, Departamento de Oceanografia Biológica.

Cargo ou função
Comissão encarregada pela realização de Exame de Seleção para ingresso no Curso de Pós-graduação - Suplente.
02/2007 - 01/2008
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, Departamento de Oceanografia Biológica.

Cargo ou função
Comissão encarregada pela realização do Exame de Proficiência em Inglês - Suplente.
02/2007 - 01/2008
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, Departamento de Oceanografia Biológica.

Cargo ou função
Comissão encarregada pela realização do Exame de Proficiência em Inglês - Suplente.
02/2007 - 01/2008
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, Departamento de Oceanografia Biológica.

Cargo ou função
Comissão encarregada pela realização de Exame de Seleção - Titular.
2007 - 2008
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, .

Cargo ou função
Comissão para tratar da implantação da Base de Apoio a Pesquisa do Instituto Oceanográfico no Guarujá - SP - Titular.
2003 - 2008
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, Departamento de Oceanografia Biológica.

Cargo ou função
Representante dos Professores Doutores na Congregação do IOUSP (titular).
2003 - 2008
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, .

Cargo ou função
Comissão de Graduação do Instituto Oceanográfico da USP - Suplente.
07/2007 - 12/2007
Ensino, Oceanografia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
2100105/Trabalho de Graduação II
09/2007 - 11/2007
Ensino, Oceanografia Biológica, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
IOB-5742 - Produção Secundária Planctônica
03/2005 - 10/2007
Conselhos, Comissões e Consultoria, FUNDESPA, .

Cargo ou função
Conselho Curador da Fundação de Estudos e Pesquisas Aquáticas ? FUNDESPA - Membro.
01/2007 - 06/2007
Ensino, Oceanografia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
2100104/Trabalho de Graduação I
06/2005 - 05/2007
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, .

Cargo ou função
Representantes dos Professores Doutores junto à Congregação - Titular.
04/2004 - 03/2007
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, .

Cargo ou função
Comissão de Pós-Graduação do Instituto Oceanográfico da USP - Suplente.
02/2006 - 01/2007
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, .

Cargo ou função
Comissão do Exame de Proficiência em Inglês do IOUSP - Suplente.
02/2006 - 01/2007
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, Departamento de Oceanografia Biológica.

Cargo ou função
Comissão encarregada pela realização de Exame de Seleção para ingresso no Curso de Pós-graduação - Membro.
02/2005 - 01/2007
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, Departamento de Oceanografia Biológica.

Cargo ou função
Conselho do Departamento de Oceanografia Biológica do IOUSP - Suplente.
07/2006 - 12/2006
Ensino, Oceanografia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
2100104/Trabalho de Graduação I
01/2006 - 06/2006
Ensino, Oceanografia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
2100104/Trabalho de Graduação I
06/2005 - 05/2006
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, .

Cargo ou função
ite o nome do cargo ou função a ser incluido e pressione a tecla ENTER.
02/2005 - 01/2006
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, .

Cargo ou função
Comissão Coordenadora do PAE, no âmbito do IOUSP - Titular.
02/2005 - 01/2006
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, Departamento de Oceanografia Biológica.

Cargo ou função
Comissão do Exame de Proficiência em Inglês, Oceanografia Biológica do IOUSP - Suplente.
02/2005 - 01/2006
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, .

Cargo ou função
Comissão Coordenadora do PAE, no âmbito do IOUSP - Titular.
2003 - 2006
Ensino, Oceanografia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
IOB-136/Fundamentos de Ecologia Aquática
2003 - 2006
Ensino, Oceanografia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
IOB-132/Produtores Primários Marinhos
6/2005 - 8/2005
Ensino, Oceanografia (Oceanografia Biológica), Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
IOB-5742 - Produção Secundária Planctônica
09/1996 - 07/2005
Conselhos, Comissões e Consultoria, World Association of Copepodologist, .

Cargo ou função
Membro do Conselho Executivo da World Association of Copepodologists; webmaster do site da associação (http://www.copepoda.uconn.edu) e moderador da ?Copepoda List?, que congrega cerca de 400 pesquisadores de todos os continentes.
06/2003 - 05/2005
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, .

Cargo ou função
Representantes dos Professores Doutores junto à Congregação - Titular.
9/2003 - 4/2005
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, Departamento de Oceanografia Biológica.

Cargo ou função
Representante do Instituto Oceanográfico no Conselho Deliberativo do Centro de Biologia Marinha da USP - Titular.
02/2003 - 02/2005
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, Departamento de Oceanografia Biológica.

Cargo ou função
Conselho do Departamento de Oceanografia Biológica - Suplente.
02/2004 - 01/2005
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, .

Cargo ou função
Comissão para realização de Exames de Proficiência em Inglês, Oceanografia Biológica do IOUSP - Suplente.
2003 - 2005
Conselhos, Comissões e Consultoria, Fundação de Apoio a Universidade de São Paulo - FUSP, .

Cargo ou função
Consultor da Fundação de Apoio à Universidade de São Paulo, coordenador executivo do projeto 1266 ? Programa de Monitoramento Ambiental do Ecossistema Estuarino na Área de Influência da Refinaria Landulpho Alves (PROMARLAM ? Fase 2).
03/2004 - 05/2004
Ensino, Oceanografia (Oceanografia Biológica), Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
IOB-5742 - Produção Secundária Planctônica
2003 - 2004
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, .

Cargo ou função
Comissão organizadora da participação do IOUSP no programa "A Universidade e as Profissões - Membro.
2002 - 2004
Extensão universitária , Instituto Oceanográfico, Departamento de Oceanografia Biológica.

Atividade de extensão realizada
Membro titular do Grupo de Trabalho sobre Água de Lastro - Agência Nacional de Vigilância Sanitária (ANVISA).
2002 - 2004
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto Oceanográfico, Departamento de Oceanografia Biológica.

Cargo ou função
Representante dos Professores Doutores na Comissão de Graduação do IOUSP (suplente).
2002 - 2004
Conselhos, Comissões e Consultoria, FUNDESPA, .

Cargo ou função
Consultor da Fundação de Estudos e Pesquisas Aquáticas ? FUNDESPA em projeto de monitoramento ambiental no Canal de São Sebastião (Projeto TEBAR/PETROBRÁS) e em estudos sobre água de lastro de navios, em parceria com a ANVISA ? Agência Nacional de Vi.

Universidade Estadual de Santa Cruz, UESC, Brasil.
Vínculo institucional

1999 - 2002
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor adjunto, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

7/2000 - 9/2002
Direção e administração, Reitoria, Assessoria de Avaliação Institucional.

Cargo ou função
Membro de comissão permanente.
5/2000 - 9/2002
Direção e administração, Pró Reitoria de Pesquisa e Pós Graduação, Comitê de Pesquisa.

Cargo ou função
Membro de comissão permanente.
3/2000 - 9/2002
Direção e administração, Departamento de Ciências Biológicas, Laboratório de Oceanografia Biológica.

Cargo ou função
Diretor de Unidade.
3/2000 - 9/2002
Ensino, Ciências Biológicas, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Introdução à Oceanografia
Plâncton Marinho
2/2000 - 9/2002
Ensino, Especialização Em Oceanografia, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Plâncton
9/1999 - 9/2002
Direção e administração, Departamento de Ciências Biológicas, Comissão de Oceanografia.

Cargo ou função
Membro de comissão permanente.
9/1999 - 9/2002
Pesquisa e desenvolvimento , Pró Reitoria de Pesquisa e Pós Graduação, Departamento de Ciências Biológicas.


Universidade Federal do Paraná, UFPR, Brasil.
Vínculo institucional

1998 - 1999
Vínculo: Bolsista recém-doutor, Enquadramento Funcional: Professor colaborador, Carga horária: 40
Outras informações
Responsável pelo Laboratório de Zooplâncton do Centro de Estudos do Mar.

Vínculo institucional

1992 - 1997
Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Professor colaborador, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações
Responsável pelo Laboratório de Zooplâncton do Centro de Estudos do Mar.

Atividades

1/1998 - 8/1999
Ensino, Zoologia, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Ecologia de Ecossistemas Pelágicos
Plâncton Marinho
3/1993 - 8/1999
Serviços técnicos especializados , Reitoria, Centro de Estudos do Mar.

Serviço realizado
Consultor Técnico em Ecologia de Reservatórios.
8/1992 - 8/1999
Pesquisa e desenvolvimento , Reitoria, Centro de Estudos do Mar.

8/1992 - 8/1999
Ensino, Ciências Biológicas, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Zooplâncton
8/1992 - 8/1999
Treinamentos ministrados , Reitoria, Centro de Estudos do Mar.

Treinamentos ministrados
Treinamento de alunos de iniciação científica
Treinamento de alunos da Antioch University, EUA (várias visitas técnicas anuais)
Treinamento de alunos de pós-graduação (identificação do plâncton marinho; métodos em ecologia marinha)
7/1992 - 8/1999
Direção e administração, Reitoria, Centro de Estudos do Mar.

Cargo ou função
Chefe de laboratório.
1/1997 - 12/1998
Extensão universitária , Reitoria, Centro de Estudos do Mar.

Atividade de extensão realizada
Assessoria na área de Ciências Ambientais.

Fundação de Estudos e Pesquisas Aquáticas, FUNDESPA, Brasil.
Vínculo institucional

1991 - 1992
Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Pesquisador associado, Carga horária: 40

Atividades

10/1991 - 8/1992
Pesquisa e desenvolvimento , Fundação de Estudos e Pesquisas Aquáticas, .

10/1991 - 8/1992
Serviços técnicos especializados , Fundação de Estudos e Pesquisas Aquáticas, .

Serviço realizado
Embarques oceanográficos e análises laboratoriais.
10/1991 - 8/1992
Extensão universitária , Fundação de Estudos e Pesquisas Aquáticas, .

Atividade de extensão realizada
Apoio técnico à PETROBRAS.

Universidade Estadual de Londrina, UEL, Brasil.
Vínculo institucional

1989 - 1991
Vínculo: Servidor público ou celetista, Enquadramento Funcional: Assessor Técnico, Carga horária: 40
Outras informações
Responsável pela área de Zooplâncton do Projeto de Diagnóstico Ambiental do Rio Tibagi (PR)

Atividades

9/1989 - 9/1991
Pesquisa e desenvolvimento , Centro de Ciências Biológicas, Departamento de Biologia Animal e Vegetal.



Linhas de pesquisa


1.
Ecologia do Plâncton Marinho
2.
Zooplâncton de Águas Continentais
3.
Oceanografia Biológica
4.
Ecologia do Plâncton Marinho
5.
Ecologia de Águas Continentais
6.
Zooplâncton
7.
Ecologia do Plâncton Marinho
8.
Oceanografia Biológica
9.
Ecologia do Plâncton Marinho


Projetos de pesquisa


2016 - Atual
Pesquisa e implementação de tecnologias de detecção e monitoramento do coral-sol e prevenção da bioincrustação.

Projeto certificado pela empresa Petróleo Brasileiro - Rio de Janeiro - Matriz em 08/12/2017.
Descrição: O coral-sol, Tubastraea spp, é um organismo exótico originário do oceano Pacifico Central, comumente transportado por vetores antrópicos como navios e plataformas de petróleo. O objetivo geral do projeto é estudar e implementar tecnologias para avaliar a dispersão espacial e monitorar a ocorrência de larvas do coral-sol ao longo do tempo. Os objetivos específicos são: - Implementar instrumentação operada a partir de plataforma móvel para o diagnóstico da ocorrência e distribuição de larvas do coral-sol, baseada em técnicas de aquisição de imagens in situ; - Implementar instrumentação instalada em posição fixa, para monitoramento remoto da dispersão larval do coral-sol por meio de sistema de imageamento e aquisição de dados ambientais; - Desenvolver software de visão computacional para a análise automática das imagens de plâncton e larvas de coral sol.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (3) .
Integrantes: Rubens Mendes Lopes - Coordenador.
2016 - Atual
Estudo do Efeito do Ultrassom nas Bioincrustações sobre Substratos Artificiais em Ambientes Aquáticos
Descrição: Esse projeto trata do estudo do efeito do ultrassom nas bioincrustações que se formam em substratos artificiais em ambientes aquáticos, visando fornecer subsídios para o desenvolvimento de equipamentos de prevenção e controle. O foco do estudo será em dois grupos taxonômicos de interesse para pesquisas sobre bioincrustação: (i) o coral-sol (Tubastraea spp.), gênero de coral exótico não hermatípico originário do Pacífico, encontrado sobre plataformas e outras estruturas no sudeste e nordeste do Brasil; e (ii) cirripédios (cracas), que são os organismos incrustantes mais comuns e persistentes em cascos de embarcações e plataformas marinhas. Serão conduzidos ensaios de campo para avaliar a influência do uso do ultrassom sobre os níveis de incrustação dos grupos taxonômicos citados, utilizando-se placas de substrato para avaliar as influências da frequência de operação, da pressão acústica, da potência média aplicada e da distância da fonte de ultrassom aos pontos monitorados ao longo da superfície do substrato. Essas avaliações serão realizadas através do mapeamento do campo acústico e, das imagens das placas, obtidas periodicamente. Para os experimentos em campo serão montados equipamentos para geração de ondas de ultrassom que atendam às condições do ambiente, alimentados eletricamente por baterias. Adicionalmente, experimentos de laboratório avaliarão as relações de causa e efeito entre o tratamento com ultrassom sob diferentes condições, incluindo cavitação acústica, e as respostas biológicas relacionadas ao assentamento larval em substratos não colonizados e à mortalidade de indivíduos previamente incrustados. A distribuição de pressão acústica no interior do tanque experimental será medida com um hidrofone calibrado. A pressão acústica no volume de controle será monitorada durante os experimentos com hidrofones a serem construídos no projeto. Em ensaios preliminares realizados na base do IO em Ubatuba foi possível determinar uma configuração básica dos experimentos usando um volume de controle de aproximadamente 50 ml. Nos ensaios de assentamento e mortalidade serão feitas imagens periódicas através de imagens usando uma câmera. Para avaliar a influência da aplicação do ultrassom no assentamento das larvas está previsto o uso de duas câmeras de alta taxa de amostragem que serão montadas de forma ortogonal entre si para a visualização de um volume conhecido, a ser posicionado sobre o centro da placa-teste contendo o transdutor na base do tanque, emitindo ultrassom sobre o volume de controle. Imagens focalizadas e de alta resolução serão obtidas neste volume, para o registro do deslocamento tridimensional das larvas em reação ao tratamento com o ultrassom, de acordo com o campo acústico mapeado, e na ausência deste. As larvas serão obtidas a partir da desova de comunidades incrustantes naturais ou de populações adultas mantidas em laboratório pelo tempo de duração dos experimentos...
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) .
Integrantes: Rubens Mendes Lopes - Integrante / Nilson Noris Franceschetti - Integrante / Marco Aurélio Brizzotti Andrade - Integrante / JULIO CEZAR ADAMOWSKI - Coordenador.
2014 - Atual
Estudo de camadas finas de plâncton em um ecossistema costeiro utilizando métodos autônomos de detecção e análise comportamental.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2014 - Atual
Novas tecnologias observacionais em oceanografia biológica aplicadas ao estudo de atividades comportamentais do zooplâncton em camadas finas;
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2014 - Atual
Detecção de Camadas Finas por Veículo Autônomo Submersível em um Ecossistema Costeiro - ECOAUV
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2013 - Atual
Detecção do plâncton no oceano superficial por tecnologia de sensores de alta resolução;
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2013 - Atual
Netuno ? Rede de Pesquisa, Desenvolvimento e Inovação em Computação, Instrumentação, Automação e Robótica Subaquáticas
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2013 - Atual
BIODIVERSITY AND MOLECULAR PHYLOGENY OF MARINE MICROBIAL EUKARYOTES;
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2012 - Atual
Desenvolvimento de sistemas de monitoramento da água de lastro com avaliação de forçantes hidrodinâmicas, operacionais e biológicas
Descrição: O objetivo deste projeto é avaliar processos relevantes para a determinação da qualidade da água de lastro de navios. Serão estudados os seguintes aspectos: Avaliação do impacto do enchimento, esvaziamento e movimentação da água dos tanques de lastro durante as operações de desembarque, embarque e navegação, incluindo o efeito da mistura ou estratificação da água de lastro sobre organismos e parâmetros físico-químicos e sedimentos; Análise da mortalidade, persistência e potencial invasivo de espécies aquáticas nos tanques sob diferentes condições simuladas e validadas em laboratório; Influência de aspectos operacionais e da arquitetura de navios sobre os parâmetros citados anteriormente; Aprimoramento de um protótipo de sistema remoto georreferenciado de coleta de dados em múltiplos tanques, com foco em parâmetros físico-químicos, bem como na posição geográfica da coleta da água de lastro; e Análise crítica das diretrizes internacionais da IMO sobre o monitoramento de embarcações..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2009 - 2014
Sistemas Automáticos de Monitoramento Biológico e Ambiental - SAMBA
Descrição: O objetivo geral deste projeto é desenvolver e avaliar a eficiência de sistemas automáticos e semi-automáticos de análise da qualidade da água de lastro de navios. Serão contemplados instrumentos para a análise de nutrientes dissolvidos e de organismos planctônicos, estes últimos por meio de técnicas ópticas. Os sistemas a serem desenvolvidos e testados serão também utilizáveis para o monitoramento ambiental marinho em geral, a partir de adequações específicas para cada aplicação. Os objetivos específicos são os seguintes: ? Projetar, desenvolver e validar instrumentação óptica dedicada à varredura de água em alto fluxo de vazão, simulando a descarga de água de lastro, para a detecção, contagem e identificação de organismos planctônicos viáveis e não viáveis; ? Projetar um protótipo de instrumentação dedicada ao monitoramento da concentração de organismos em água de lastro em escala adequada à instalação em navios comerciais; ? Projetar, desenvolver, construir e testar um protótipo de instrumento que permita o monitoramento contínuo de elementos nutrientes da água do mar (fosfato, silicato, nitrito e amônia) acoplado a registrador eletrônico temporal (datalogger); ? Formar um banco de imagens de organismos planctônicos, utilizando técnicas variadas de aquisição, para avaliação de programas de classificação; ? Testar diferentes corantes vitais para a marcação e detecção de organismos planctônicos, viáveis e não viáveis, através de imagens estáticas; ? Comparar o desempenho dos instrumentos e softwares utilizados; ? Apresentar recomendações de caráter gerencial visando a implementação das melhores técnicas para o monitoramento da qualidade da água de lastro, no que se refere aos padrões D-2 da Convenção Internacional da IMO (Organização Marítima Internacional)..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) .
Integrantes: Rubens Mendes Lopes - Coordenador / MATUSZEWSKI, DAMIAN J. - Integrante / BALDASSO, LUIS F. - Integrante.
2009 - 2010
HABITATS - Avaliação da Heterogeneidade Ambiental da Bacia de Campos
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
2009 - 2010
SANTA RITA - Diagnóstico da Comunidade do Zooplâncton com ênfase ao Camarão em fase planctônica na área do empreendimento a ser implantado no Largo de Santa Rita, Estuário de Santos
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
2008 - 2011
Monitoramento de Alta Resolução de Florações de Algas Tóxicas - MARFLAT
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
2007 - 2011
Florações de Algas Tóxicas: Estudo dos Controles por Toxicidade, Interferência, Valor Nutricional e Grazing - FLOATING
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
2005 - 2014
ANTARES
Descrição: ANTARES é uma rede sul-americana criada em 2003 com o apoio do IOCCG (International Ocean-Colour Coordinating Group), do POGO (Partnership for the Observation of the Global Oceans) e com financiamento inicial de um projeto pelo IAI (Inter American Institute for Global Change Research). O objetivo principal da rede ANTARES é o estudo de mudanças de longo período nos ecossistemas costeiros em torno da América do Sul, para distinguir aqueles devidos à variabilidade natural daqueles devidos a perturbações externas (efeitos antrópicos). Para alcançar este objetivo se propõe padronizar e aperfeiçoar uma série de medições realizadas em estações de séries temporais existentes. isto permitirá a criação de uma base de dados consistente em escala continental que poderá servir para o desenvolvimento e validação de algoritmos usados na obtenção de informações oceanográficas por satélites, tais como, a temperatura da superfície do mar e a concentração de clorofila a. Esta base de dados integrada com dados in situ da zona costeira que rodeia a América do Sul não será somente utilizada pelos pesquisadores da rede empenhados em alcançar seus objetivos científicos, mas também, pelo público em geral com propósitos educacionais e de gerenciamento ambiental. Espera-se que esta iniciativa contribua para o desenvolvimento social e econômico das áreas envolvidas..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (1) .
Integrantes: Rubens Mendes Lopes - Integrante / Salvador Airton Gaeta - Integrante / M Kampel - Coordenador.
Número de produções C, T & A: 3 / Número de orientações: 4
2005 - 2010
Produtividade, Sustentabilidade e Utilização do Ecossistema do Banco de Abrolhos (PRO-ABROLHOS)
Descrição: O Banco de Abrolhos abrange alguns dos mais importantes ecossistemas marinhos do Brasil, apresentando a maior biodiversidade do Atlântico Sul e abrigando diversas espécies de animais ameaçados de extinção. Tais ecossistemas exercem profunda influência na dinâmica econômica e social da costa leste brasileira. O Banco dos Abrolhos foi recentemente classificado como "Área de Extrema Importância Biológica" pelo Ministério do Meio Ambiente. A manutenção dessa biodiversidade depende da interação entre processos oceanográficos com três escalas espaciais diferentes: de plataforma continental, de talude e regiões oceânicas, e de estuários. Fenômenos climáticos, associados a mudanças globais, adicionam complexidade a esses processos. O objetivo geral da proposta é a investigação do funcionamento e manutenção do ecossistema marinho sobre o Banco de Abrolhos, visando o entendimento de possíveis variações bem como o gerenciamento racional de seus recursos biológicos. A meta principal é a aquisição de informações sobre a estrutura e o funcionamento dos ecossistemas do Banco de Abrolhos e áreas adjacentes, gerando subsídios para a gestão sustentável de seus recursos naturais. Tal abordagem enfatizará a conservação da diversidade biológica dessa importante região em seus três níveis: diversidade genética, específica e ecossistêmica. A metodologia inclui cruzeiros oceanográficos de diversos tipos, com navio oceanográfico e embarcações menores, sensoriamento remoto da superfície do mar e modelagem numérica. Ao término do projeto serão disponibilizadas ferramentas para o aprimoramento da discussão sobre limites de exploração de recursos e o estabelecimento de zonas de amortecimento ambiental das unidades de conservação da área. O projeto está em fase final, de redação de artigos científicos.
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Doutorado: (2) .
Integrantes: Rubens Mendes Lopes - Coordenador.Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
2005 - 2008
Influencia do Valo Grande nas condições hidrográficas e o na comunidade planctônica da região norte do sistema estuarino-lagunar de Cananéia-Iguape
Descrição: O Sistema Estuarino-Lagunar de Cananéia-Iguape, localizado a 25ºS no estado de São Paulo, é um ecossistema altamente complexo apresentando duas conexões principais com o oceano, ao sul - Barra de Cananéia - e ao norte - Barra de Icapara -, sendo que nesta última localiza-se o maior aporte de água doce do sistema, o canal artificial do Valo Grande. Os aportes de água doce provenientes deste canal influenciam significativamente a dinâmica da região e transportam materiais que interferem no metabolismo e processos físicos do sistema (material em suspensão - assoreamento; metais pesados - bioacumulação). Apesar da problemática que representa, existem poucos estudos na região norte. No presente estudo pretende-se quantificar os aportes derivados do Valo Grande para o interior do sistema, determinando a influência quanto aos nutrientes, material em suspensão, comunidade fitoplanctônica e bacterioplanctônica, produtividade primária e secundária, partículas exopoliméricas transparentes, metais pesados. Assim como quantificar o transporte de propriedades entre o sistema e o oceano adjacente..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (2) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) .
Integrantes: Rubens Mendes Lopes - Integrante / Daniela Rimoldi Cunha - Integrante / Newton Aquino - Integrante / Sônia Maria Flores Gianesella - Coordenador / Juan Alba - Integrante / Flávia Marisa P Saldanha Correa - Integrante.Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
2005 - 2006
RECOS - Recursos Costeiros
Descrição: O projeto avaliou a variação espacial e sazonal da estrutura da comunidade planctônica na superfície ao longo do gradiente de salinidade em dois transectos amostrais. O primeiro abrange áreas controle, com condições ambientais bem preservadas, e o segundo sob impacto direto da poluição antropogênica no eixo leste-oeste da Baía de Paranaguá propriamente dita, oriunda de atividades portuárias e despejo urbano..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
2004 - 2008
A influência do complexo estuarino da Baixada Santista sobre o ecossistema de plataforma continental adjacente (ECOSAN): Utilização de um sistema de digitalização e reconhecimento de imagens para o estudo da abundância e produção secundária do zooplâncton
Descrição: O projeto ECOSAN envolve um estudo oceanográfico integrado, de forma multi- e interdisciplinar, sobre a influência continental remota e local na plataforma continental adjacente à Baixada Santista. O Sistema Estuarino de Santos representa um dos mais significativos exemplos brasileiros de degradação ambiental. Informações sobre os processos que regem o sistema e os efeitos que causam sobre a biota são imprescindíveis para o entendimento da estrutura e a dinâmica do ecossistema da região centro-sul paulista como um todo. O objetivo geral do projeto é avaliar a influência dos aportes continentais do complexo estuarino da Baixada Santista sobre a plataforma continental interna, compreendida entre Itanhaém e São Sebastião. O objetivo específico referente à área de atuação do pesquisador é conhecer a estrutura da comunidade zooplânctônica (composição, abundância), sua distribuição, condição nutricional e produção secundária, correlacionando estas informações com os dados a serem obtidos no projeto sobre estoques pesqueiros regionais. A amostragem dos organismos será feita durante dois cruzeiros oceanográficos, utilizando rede Multinet MPS (Hydrobios) em 20 estações. A região estuarina será estudada em amostragens mensais com redes bongô ou cônico-cilíndricas. Serão feitas as identificações e as medidas de biomassa dos táxons zooplanctônicos por meio de digitalização utilizando o equipamento ZOOSCAN, dotado de software de reconhecimento de imagens baseado em redes neurais. O software permite o cálculo da biomassa zooplanctônica a partir das configurações morfométricas, previamente calibradas a partir de um ?training set?. Os resultados serão apresentados sob a forma de mapas de distribuição das espécies e grupos taxonômicos. A condição nutricional de espécies dominantes de copépodes será estudada a partir de estimativas da razão RNA/DNA nos tecidos totais..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) .
Integrantes: Rubens Mendes Lopes - Coordenador / Mario Katsuragawa - Integrante / June F Dias - Integrante / Newton Aquino - Integrante / Adriana R M Crété - Integrante / Ana Maria Pires Setubal Vanin - Integrante.
Número de produções C, T & A: 4 / Número de orientações: 2
2004 - 2006
Monitoramento dos Sistemas Hídricos do Terminal Aquaviário de São Sebastião, Estações de Guaratuba e Rio Pardo, e do Canal de São Sebastião (TEBAR)
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
2003 - 2006
Informe nacional sobre espécies exóticas invasoras, subprojeto: Organismos que afetam o ambiente marinho
Descrição: A utilização direta ou indireta dos biomas costeiros e oceânicos para o desenvolvimento de atividades econômicas tem provocado importantes mudanças ambientais na estrutura e no funcionamento dos ecossistemas marinhos. Segundo a Organização das Nações Unidas, entre os diversos impactos antropogênicos sobre os oceanos, a introdução de espécies exóticas é considerada um dos mais preocupantes atualmente. Como a opção de erradicação das espécies invasoras é virtualmente inexistente, todos os esforços devem ser empreendidos para a implementação de mecanismos de prevenção de novas introduções e de controle dos organismos introduzidos. O presente trabalho representa uma contribuição para subsidiar tais ações no que se refere aos ecossistemas marinhos brasileiros. Este subprojeto, que faz parte de um projeto do PROBIO/MMA para a produção de um Informe Nacional sobre espécies exóticas invasoras, prevê a execução de um levantamento minucioso e extensivo de informações sobre organismos marinhos introduzidos na costa brasileira. Trata-se de uma tarefa complexa em função da amplitude das variáveis (riqueza específica, densidade, biomassa, etc) e dos processos (ciclo de vida, comportamento alimentar, padrões de dispersão e distribuição geográfica, etc) a serem abordados. Os oceanos possuem alta diversidade específica, associada à complexidade filogenética dos grandes grupos taxonômicos que neles ocorrem. Além disto, devido à sua extensão latitudinal (4°N-33°S) e à heterogeneidade dos processos geomorfológicos que levaram à sua configuração recente, a costa brasileira é particularmente rica em biomas costeiros (manguezais, marismas, recifes de coral, costões rochosos, praias arenosas, etc) e oceânicos (áreas de convergência e divergência, giros oceânicos, etc). Ambos os aspectos devem ser considerados detalhadamente na produção deste Informe..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) .
Integrantes: Rubens Mendes Lopes - Coordenador / Irma Rivera - Integrante / Flavio Costa Fernandes - Integrante / June F Dias - Integrante / José Eduardo Martinelli Filho - Integrante / Daniela Rimoldi Cunha - Integrante / Andrea Junqueira - Integrante / Marcos Tavares - Integrante / Eurico Cabral de Oliveira - Integrante / Maria Célia Villac - Integrante / Patricia Cunningham - Integrante.Financiador(es): Instituto de Estudos do Mar Almirante Paulo Moreira - Cooperação / Ministério do Meio Ambiente e da Amazonia Legal - Auxílio financeiro / Universidade de Taubaté - Cooperação / Universidade Federal do Rio de Janeiro - Cooperação.
Número de produções C, T & A: 10
2003 - 2005
Síntese de Informações Ambientais sobre os Ecossistemas Aquáticos da Baía de Todos os Santos (BA), com Ênfase na Área da Refinaria Landulpho Alves (RLAM) - SIRLAM
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
2003 - 2005
Produção Secundária do Zooplâncton na Plataforma Continental Sudeste do Brasil
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
2002 - 2008
Dinâmica do Ecossistema de Plataforma da Região Oeste do Atlântico Sul (DEPROAS)
Descrição: O projeto abrange um importante setor pesqueiro da plataforma continental brasileira, caracterizado por capturas anuais em torno de 265-290 mil toneladas. Acredita-se que as intrusões da ACAS, uma massa de água fria e rica em nutrientes, sejam parcialmente responsáveis pelos estoques elevados de peixes pelágicos e demersais, assim como pela variabilidade interanual destes estoques. A relação entre o aporte de nutrientes via ACAS e a produção pesqueira é controlada por processos complexos na teia alimentar pelágica, associados à transferência de uma fração da energia fixada pela atividade fotossintética algal para os níveis tróficos superiores da teia alimentar - incluindo os predadores pelágicos exploráveis comercialmente - através da atividade metabólica dos protistas e metazoários do zooplâncton. Propomos o estudo da composição, abundância, biomassa e taxas de produção do fitoplâncton e do zooplâncton metazoário na PCSE. Além disto, será avaliado o impacto da atividade alimentar do micro- e mesozooplâncton sobre a variabilidade do estoque algal no ecossistema pelágico da região. Examinaremos também as interações tróficas na teia alimentar microbiana e entre a alça microbiana e o zooplâncton metazoário. Estes processos serão investigados em dois períodos do ano com características climatológicas e hidrográficas constrastantes: os períodos de máxima (verão) e mínima (inverno) freqüência de intrusão da ACAS na área de estudo. As amostragens e experimentos serão desenvolvidos durante os chamados cruzeiros de mesoescala do projeto DEPROAS, que prevêm coletas em vários transectos perpendiculares à costa, desde águas ao largo do talude continental até águas costeiras da plataforma interna. Esta estratégia amostral representa uma excelente oportunidade para caracterizar a estrutura e a função das associações planctônicas, assim como as interações na teia alimentar pelágica, ao longo de gradientes espaciais e em duas situações sazonais distintas..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (3) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) .
Integrantes: Rubens Mendes Lopes - Integrante / Salvador Airton Gaeta - Coordenador / Mario Katsuragawa - Integrante / June F Dias - Integrante / Adriana Crete - Integrante.Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Número de produções C, T & A: 4
2002 - 2007
Água de Lastro: Análise de Risco, Plano de Manejo Ambiental e Monitoramento de Espécies Exóticas no Porto de Paranaguá, Paraná (ALARME)
Descrição: O transporte de microrganismos, plantas e animais através de água de lastro de navios representa um vetor significativo de invasão de espécies exóticas e nocivas. Este fenômeno tem atingido proporções alarmantes à medida que os navios tornaram-se mais numerosos, velozes e com maior volume de casco e carga, necessitando de maior lastreamento. Lagos, rios, estuários e regiões costeiras de todo o mundo têm sido profundamente impactados por esta forma de distúrbio ecológico, especialmente desde a década de 1970. Após sua instalação, as espécies invasoras podem causar modificações complexas em diferentes compartimentos do ecossistema, alterando as relações tróficas da cadeia alimentar, competindo com espécies nativas por espaço, ou introduzindo substâncias tóxicas ou novas doenças, que afetam os organismos residentes e as populações humanas. Desta forma, as invasões biológicas têm consequências negativas de alta relevância para a saúde pública, a cultura e a economia das regiões afetadas. Este projeto tem como meta principal contribuir para o estabelecimento de mecanismos de vigilância ecológica e epidemiológica da água de lastro em portos brasileiros. Para tanto, propomos um estudo da água de lastro de navios atracados no Porto de Paranaguá, um dos mais importantes do país e predominantemente importador de água de lastro. Será analisada a ocorrência e a abundância de microalgas e zooplâncton, determinando a origem e as características biológicas dos organismos estudados, quanto à toxicidade e efeitos nocivos ao ambiente e à saúde humana. Entre os resultados esperados deste projeto destacamos: 1) a elaboração de um Plano de Manejo Ambiental e Inspeção Permanente da água de lastro no Porto de Paranaguá, aplicável a outros portos brasileiros; 2) documentação de eventuais invasões de organismos exóticos ou nocivos através da água de lastro; 3) Artigos a serem submetidos à publicação em revistas internacionais; 4) Produção de material de divulgação sobre bioinvasões..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) .
Integrantes: Rubens Mendes Lopes - Integrante / Luciano Felício Fernandes - Coordenador / José Eduardo Martinelli Filho - Integrante / Daniela Rimoldi Cunha - Integrante / Luis Proença - Integrante.Financiador(es): Fundo Nacional do Meio Ambiente - Auxílio financeiro / Universidade do Vale do Itajaí - Cooperação / Universidade Federal do Paraná - Cooperação.
Número de produções C, T & A: 4
2002 - 2006
Produtividade pelágica na plataforma continental sudeste do Brasil e sua relação com as intrusões da Água Central do Atlântico Sul
Descrição: A presente proposta é um componente do projeto DEPROAS (Dinâmica do Ecossistema de Plataforma da Região Oeste do Atlântico Sul), desenvolvido sob a coordenação do IOUSP com o objetivo geral de estudar os mecanismos físicos que controlam a intrusão sazonal da Água Central do Atlântico Sul (ACAS) sobre a Plataforma Continental Sudeste (PCSE) entre Cabo de São Tomé e Ilha de São Sebastião e o impacto destes mecanismos físicos sobre os processos biológicos do ecossistema da região. A relação entre o aporte de nutrientes via ACAS e a produção pesqueira é controlada por processos complexos na teia alimentar pelágica, associados à transferência de uma fração da energia fixada pela atividade fotossintética algal para os níveis tróficos superiores da teia alimentar ? incluindo os predadores pelágicos exploráveis comercialmente ? através da atividade metabólica dos protistas e metazoários do zooplâncton. Apesar da importância trófica destes organismos, pouca atenção tem sido dada à caracterização dos estoques e processos metabólicos do zooplâncton na plataforma continental brasileira. O objetivo central do projeto é analisar a variabilidade espacial (horizontal e vertical) da densidade, biomassa e produção secundária do zooplâncton e suas relações com a produtividade primária, a distribuição do fitoplâncton e do ictioplâncton, em dois cenários sazonais (verão e inverno) visando compreender a influência da intrusão da ACAS sobre os processos ecológicos no ambiente pelágico da PCSE. Os objetivos específicos do projeto são: - Correlacionar os padrões de produtividade zooplanctônica com os mecanismos de intrusão e retração da ACAS sobre a plataforma continental e - Realizar o mapeamento das áreas de maior atividade biológica na PCSE nos períodos de verão e inverno no que diz respeito à biomassa e produtividade do zooplâncton, focalizando suas interações com a distribuição de presas (fitoplâncton) e de predadores pelágicos (zooplâncton carnívoro, incluindo larvas de peixes..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) .
Integrantes: Rubens Mendes Lopes - Coordenador / Salvador Airton Gaeta - Integrante / Hans G Dam - Integrante / Sylvia Maria Susini Ribeiro - Integrante / George Mc Manus - Integrante / Mario Katsuragawa - Integrante / Adriana Crete - Integrante / Eliane Gonzalez Rodrigues - Integrante.Financiador(es): Instituto de Estudos do Mar Almirante Paulo Moreira - Cooperação / University Of Connecticut - Cooperação / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Número de produções C, T & A: 12
2001 - 2002
Estudo Exploratório da Presença de Organismos Patogênicos na Água de Lastro de Navios Atracados em Portos Brasileiros
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
1998 - 2000
The Role of Small Copepods on Food Web Structure in Antartic and Subantartic Waters - MAR 35/98
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
1996 - 2002
Southern Ocean GLOBEC: Role of Copepods in Krill Biology? (O papel dos copépodes pequenos na estrutura da teia alimentar em águas antárticas e subantárticas).
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.


Projetos de extensão


2003 - 2005
Programa de monitoramento ambiental do ecossistema estuarino na área de influência da Refinaria Landulpho Alves
Descrição: Este projeto, elaborado por solicitação da PETROBRAS através da Coordenação de Higiene e Meio Ambiente da Refinaria Landulpho Alves - RLAM e do Centro de Pesquisas e Desenvolvimento Leopoldo A. Miguez de Mello - CENPES, contempla atividades de pesquisa referentes ao monitoramento ambiental do ecossistema estuarino da área de influência da RLAM na Baía de Todos os Santos, Estado da Bahia. Os resultados deste Programa de Monitoramento Ambiental fornecerão elementos técnicos e científicos de acompanhamento dos eventuais impactos do empreendimento e deverão ainda subsidiar a tomada de decisões quanto à gestão ambiental da Refinaria. O trabalho envolve cerca de 15 laboratórios do IOUSP, com parcerias na UFSCar e no CEM-UFPR, tendo como objetivo geral avaliar os efeitos resultantes das atividades de refino da indústria de petróleo sobre o ecossistema estuarino da Baía de Todos os Santos por meio do acompanhamento das possíveis alterações ambientais produzidas pelo lançamento do efluente da ETDI da refinaria, na qualidade da água e do sedimento, assim como nas comunidades biológicas, além de monitorar as concentrações de contaminantes nas ilhas vizinhas à refinaria, atingidas pelo vazamento da fábrica de asfalto em 1992..
Situação: Concluído; Natureza: Extensão.
Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (2) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) .
Integrantes: Rubens Mendes Lopes - Coordenador.Financiador(es): Petróleo Brasileiro - Rio de Janeiro - Matriz - Auxílio financeiro / Universidade Federal de São Carlos - Cooperação / Universidade Federal do Paraná - Cooperação.


Projetos de desenvolvimento


2009 - 2011
Sistemas automáticos de monitoramento biológico e ambiental - SAMBA
Descrição: O objetivo geral deste projeto é desenvolver e avaliar a eficiência de sistemas automáticos e semi-automáticos de análise da qualidade da água de lastro de navios. Serão contemplados instrumentos para a análise de nutrientes dissolvidos e de organismos planctônicos, estes últimos por meio de técnicas ópticas. Os sistemas a serem desenvolvidos e testados serão também utilizáveis para o monitoramento ambiental marinho em geral, a partir de adequações específicas para cada aplicação..
Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) .
Integrantes: Rubens Mendes Lopes - Coordenador / J. Rudi Strickler - Integrante.Financiador(es): Centro de Pesquisa e Desenvolvimento Leopoldo Américo Miguêz de Mello - Cooperação.


Outros Projetos


2005 - 2012
An Ocean Biogeographic Information System for South American (OBISSA)
Descrição: The project will develop a South American node for the Ocean Biogeographic Information System (OBIS). OBIS South America (OBISSA) is envisioned to have three regional nodes, one for the tropical and sub-tropical Atlantic Ocean, one for the tropical and temperate Pacific, and one for the sub-temperate Atlantic and Pacific. These nodes will provide biogeographic information on marine species in the coastal and offshore waters of the regions via the OBIS Portal. The marine biogeographic information collected by each region will come from diverse data sources that describe both the distribution of species as well as the environmental conditions of the region. The biogeographic information that will be available on the nodes will range from the distribution and in some cases movements of species of invertebrates, marine mammals, birds and fishes in the coastal system and over the continental shelf to benthic invertebrates in tropical near shore and intertidal waters. The OBISSA nodes will be fully interoperable with the OBIS network and thus will conform to all its standards and protocols. Queries and transfer of taxonomic information will be executed using DiGIR software and environmental information will be stored, merged with taxonomic information, visualized, and exported using the EASy environmental information system, which has been specifically designed for marine applications. EASy will provide a much more powerful mapping service than is currently available on the OBIS Portal. The project will be a collaboration among marine biologists and technicians from the University of Concepcion, Chile, the University of Sao Paulo and Centro de Referencia em Informacao Ambiental, Brazil, the Ecological Research Station at Port Madryn, Argentina and System Science Applications, Redondo Beach, California. All participants are well known experts in the their field..
Situação: Em andamento; Natureza: Outra.
Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) .
Integrantes: Rubens Mendes Lopes - Coordenador.Financiador(es): Alfred P Sloan Foundation - Auxílio financeiro.


Membro de corpo editorial


2011 - Atual
Periódico: Continental Shelf Research


Revisor de periódico


2004 - Atual
Periódico: Brazilian Journal of Oceanography
2004 - 2004
Periódico: Acta Amazonica (0044-5967)
2004 - Atual
Periódico: Brazilian Journal of Biology (1519-6984)
2004 - 2004
Periódico: Nauplius
2003 - 2008
Periódico: Brazilian Archives of Biology and Technology (1516-8913)
2005 - 2005
Periódico: Boletim do Instituto de Pesca (0046-9939)
2005 - 2005
Periódico: Revista Brasileira de Zoologia (0101-8175)
2005 - Atual
Periódico: Journal of Plankton Research (0142-7873)
2006 - 2006
Periódico: Journal of Experimental Marine Biology and Ecology (0022-0981)
2006 - 2006
Periódico: Zootaxa (Online) (1175-5334)
2006 - 2006
Periódico: Hydrobiologia (The Hague)
2006 - 2006
Periódico: Revista de Biologia Marina y Oceanografia
2000 - 2000
Periódico: Revista Brasileira de Oceanografia (1413-7739)
2000 - Atual
Periódico: Marine Ecology. Progress Series (0171-8630)
1998 - 1998
Periódico: Revista Arquivos de Biologia e Tecnologia
1997 - 1997
Periódico: Revista Unimar. Edição Jurídica (0102-0307)
1995 - 1995
Periódico: Nauplius (0104-6497)
1995 - 1995
Periódico: Revista de Trabalhos Oceanográficos da UFPE
2009 - Atual
Periódico: Deep-Sea Research. Part 1. Oceanographic Research Papers
2009 - Atual
Periódico: Limnology and Oceanography, Methods
2015 - Atual
Periódico: Limnology and Oceanography
2015 - Atual
Periódico: Estuarine, Coastal and Shelf Science (Print)


Revisor de projeto de fomento


2014 - Atual
Agência de fomento: Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
2009 - Atual
Agência de fomento: Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo
2002 - Atual
Agência de fomento: Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Oceanografia / Subárea: Oceanografia Biológica/Especialidade: Ecologia do Plâncton Marinho.
2.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Oceanografia / Subárea: Oceanografia Biológica/Especialidade: Interação entre os Organismos Marinhos e os Parâmetros Ambientais.


Idiomas


Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Espanhol
Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.


Produções



Produção bibliográfica
Citações

Web of Science
Total de trabalhos:67
Total de citações:544
Fator H:13
LOPES R, LOPES RM  Data: 30/08/2017

SCOPUS
Total de trabalhos:36
Total de citações:334
Lopes, Rubens Mendes  Data: 24/11/2014

Outras
Total de trabalhos:111
Total de citações:1823
LOPES RM; LOPES R  Data: 30/08/2017

Artigos completos publicados em periódicos

1.
FREIRE, LUCIANO O.2018FREIRE, LUCIANO O. ; OLIVEIRA, LUCAS M. ; VALE, RODRIGO T.S. ; MEDEIROS, MAIÁ ; DIANA, RODRIGO E.Y. ; Lopes, Rubens M. ; PELLINI, EDUARDO L. ; DE BARROS, ETTORE A. . Development of an AUV control architecture based on systems engineering concepts. OCEAN ENGINEERING, v. 151, p. 157-169, 2018.

2.
ANGELINI, RONALDO2018ANGELINI, RONALDO ; CONTENTE, RIGUEL F. ; ROSSI-WONGTSCHOWSKI, CARMEM L.D.B. ; SOARES, LUCY S.H. ; SCHAEFFER-NOVELLI, YARA ; Lopes, Rubens M. ; MANCINI, PATRÍCIA L. ; COLL, MARTA ; AMARAL, ANTONIA C.Z. . Ecosystem modeling as a framework to convert a multi-disciplinary research approach into a useful model for the Araçá Bay (Brazil). OCEAN & COASTAL MANAGEMENT, v. 1, p. 1-10, 2018.

3.
VINCENT, FLORA J.2018VINCENT, FLORA J. ; COLIN, SÉBASTIEN ; ROMAC, SARAH ; SCALCO, ELEONORA ; BITTNER, LUCIE ; GARCIA, YONARA ; Lopes, Rubens M. ; DOLAN, JOHN R. ; ZINGONE, ADRIANA ; DE VARGAS, COLOMBAN ; BOWLER, CHRIS . The epibiotic life of the cosmopolitan diatom Fragilariopsis doliolus on heterotrophic ciliates in the open ocean. ISME Journal, v. 12, p. 1094-1108, 2018.

4.
GÓMEZ, FERNANDO2017GÓMEZ, FERNANDO ; QIU, DAJUN ; LOPES, RUBENS MENDES ; LIN, SENJIE . Morphological and molecular characterization of the toxic dinoflagellate Ostreopsis cf. ovata (Dinophyta) from Brazil (South Atlantic Ocean). REVISTA DE BIOLOGIA TROPICAL, v. 65, p. 1022-1032, 2017.

5.
GÓMEZ, FERNANDO2017GÓMEZ, FERNANDO ; WANG, LU ; HERNÁNDEZ-BECERRIL, DAVID U. ; LISUNOVA, YULIYA O. ; Lopes, Rubens M. ; LIN, SENJIE . Molecular phylogeny suggests transfer of Hemidiscus into Actinocyclus (Coscinodiscales, Coscinodiscophyceae). DIATOM RESEARCH, v. 32, p. 21-28, 2017.

6.
LOPES, R M2016LOPES, R M; MARCOLIN, C. R. ; BRANDINI, F. P. . Influence of oceanic fronts on mesozooplankton abundance and grazing during spring in the Southwestern Atlantic. Marine and Freshwater Research, v. 67, p. 626-635, 2016.

7.
COSTA, E. G.2016COSTA, E. G. ; LOPES R. M. ; SINGER, JULIO M. . Sample size for estimating the mean concentration of organisms in ballast water. Journal of Environmental Management, v. 180, p. 433-438, 2016.

8.
SERAFIM-JÚNIOR, M.2016SERAFIM-JÚNIOR, M. ; LANSAC-TÔHA, F. A. ; Lopes, R. M. ; PERBICHE-NEVES, G. . Continuity effects on rotifers and microcrustaceans caused by the construction of a downstream reservoir in a cascade series (Iguaçu River, Brazil). Brazilian Journal of Biology (Online), v. 76, p. 279-291, 2016.

9.
GÓMEZ, FERNANDO2016GÓMEZ, FERNANDO ; SIMÃO, TAIZ L.L. ; UTZ, LAURA R.P. ; Lopes, Rubens M. . The nature of the diatom Leptocylindrus mediterraneus (Bacillariophyceae), host of the enigmatic symbiosis with the stramenopile Solenicola setigera. Phycologia (Oxford), v. 55, p. 265-273, 2016.

10.
GÓMEZ, FERNANDO2016GÓMEZ, FERNANDO ; QIU, DAJUN ; OTERO-MORALES, ERNESTO ; LOPES, RUBENS M ; LIN, SENJIE . Circumtropical distribution of the epiphytic dinoflagellate (Dinophyceae): Morphology and molecular phylogeny from Puerto Rico and Brazil. Phycological Research (Print), v. 64, p. 194-199, 2016.

11.
MARTINELLI FILHO, José Eduardo2016MARTINELLI FILHO, José Eduardo ; LOPES, RUBENS MENDES ; RIVERA, IRMA NELLY GUTIERREZ ; COLWELL, RITA ROSSI . Are natural reservoirs important for cholera surveillance? The case of an outbreak in a Brazilian estuary. Letters in Applied Microbiology, v. 63, p. 183-188, 2016.

12.
GÓMEZ, FERNANDO2016GÓMEZ, FERNANDO ; QIU, DAJUN ; DODGE, JOHN D. ; Lopes, Rubens M. ; LIN, SENJIE . Morphological and molecular characterization of revealed the polyphyletic nature of the order Ptychodiscales (Dinophyceae). JOURNAL OF PHYCOLOGY, v. 52, p. 793-805, 2016.

13.
MELO JÚNIOR, MAURO2016MELO JÚNIOR, MAURO ; MARCOLIN, CATARINA R. ; Miyashita, Leonardo K. ; Lopes, Rubens M. . Temporal changes in pelagic copepod assemblages off Ubatuba, Brazil. Marine Ecology (Berlin), v. 37, p. 877-890, 2016.

14.
COSTA, ELIARDO G.2015COSTA, ELIARDO G. ; Lopes, Rubens M. ; SINGER, JULIO M. . Implications of heterogeneous distributions of organisms on ballast water sampling. Marine Pollution Bulletin., v. 91, p. 280-287, 2015.

15.
CHIMETTO TONON, LUCIANE A.2015CHIMETTO TONON, LUCIANE A. ; SILVA, BRUNO SERGIO DE O. ; MOREIRA, ANA PAULA B. ; VALLE, CECILIA ; ALVES, NELSON ; CAVALCANTI, GISELLE ; GARCIA, GIZELE ; Lopes, Rubens M. ; FRANCINI-FILHO, RONALDO B. ; DE MOURA, RODRIGO L. ; THOMPSON, CRISTIANE C. ; THOMPSON, FABIANO L. . Diversity and ecological structure of vibrios in benthic and pelagic habitats along a latitudinal gradient in the Southwest Atlantic Ocean. PeerJ, v. 3, p. e741, 2015.

16.
MARCOLIN, C. R.2015MARCOLIN, C. R. ; GAETA, S. ; Lopes, R. M. . Seasonal and interannual variability of zooplankton vertical distribution and biomass size spectra off Ubatuba, Brazil. Journal of Plankton Research, v. 37, p. 1-12, 2015.

17.
MATUSZEWSKI, DAMIAN J.2015MATUSZEWSKI, DAMIAN J. ; CESAR-JR, ROBERTO M. ; STRICKLER, J. R. ; BALDASSO, LUIS F. ; LOPES, R M . Visual rhythm for particle analysis in sample-in-flow systems: application for continuous plankton monitoring. Limnology and Oceanography, Methods, v. 13, p. 1-10, 2015.

18.
GÓMEZ, FERNANDO2015GÓMEZ, FERNANDO ; QIU, DAJUN ; Lopes, Rubens M. ; LIN, SENJIE . Fukuyoa paulensis gen. et sp. nov., a New Genus for the Globular Species of the Dinoflagellate Gambierdiscus (Dinophyceae). Plos One, v. 10, p. e0119676, 2015.

19.
GÓMEZ, FERNANDO2015GÓMEZ, FERNANDO ; LOPES R. M. . New records of the distinctive benthic dinoflagellate genus Cabra (Dinophyceae). CICIMAR Oceanides, v. 30, p. 63-70, 2015.

20.
MARCOLIN, CATARINA R.2015MARCOLIN, CATARINA R. ; Lopes, Rubens M. ; JACKSON, GEORGE A. . Estimating zooplankton vertical distribution from combined LOPC and ZooScan observations on the Brazilian Coast. Marine Biology, v. 162, p. 2171-2186, 2015.

21.
CULVERHOUSE, PHILIP F.2014CULVERHOUSE, PHILIP F. ; MACLEOD, NORMAN ; WILLIAMS, ROBERT ; BENFIELD, MARK C. ; Lopes, Rubens M. ; PICHERAL, MARC . An empirical assessment of the consistency of taxonomic identifications. Marine Biology Research (Online), v. 10, p. 73-84, 2014.

22.
RIVERA, IRMA N. G.2013RIVERA, IRMA N. G. ; SOUZA, KEILI M. C. ; SOUZA, CLAUDIANA P. ; Lopes, Rubens M. . Free-Living and Plankton-Associated Vibrios: Assessment in Ballast Water, Harbor Areas, and Coastal Ecosystems in Brazil. Frontiers in Microbiology (Online), v. 3, p. 1-8, 2013.

23.
ROCHA, ROSANA M.2013ROCHA, ROSANA M. ; VIEIRA, LEANDRO M. ; MIGOTTO, ALVARO E. ; AMARAL, ANTONIA CECÍLIA Z. ; VENTURA, CARLOS RENATO R. ; SEREJO, CRISTIANA S. ; PITOMBO, FÁBIO B. ; SANTOS, KÁTIA CHRISTOL ; SIMONE, LUIZ R.L. ; TAVARES, Marcos ; Lopes, Rubens M. ; PINHEIRO, ULISSES ; MARQUES, ANTONIO CARLOS . The need of more rigorous assessments of marine species introductions: A counter example from the Brazilian coast. Marine Pollution Bulletin., v. 67, p. 241-243, 2013.

24.
DE MOURA, RODRIGO LEÃO2013DE MOURA, RODRIGO LEÃO ; SECCHIN, NÉLIO AUGUSTO ; AMADO-FILHO, GILBERTO MENEZES ; FRANCINI-FILHO, RONALDO BASTOS ; FREITAS, MATHEUS OLIVEIRA ; MINTE-VERA, CAROLINA VIVIANA ; TEIXEIRA, JOÃO BATISTA ; THOMPSON, FABIANO LOPES ; DUTRA, GUILHERME FRAGA ; SUMIDA, PAULO YUKIO GOMES ; GUTH, ARTHUR ZIGLIATTI ; LOPES, RUBENS MENDES ; BASTOS, ALEX CARDOSO . Spatial patterns of benthic megahabitats and conservation planning in the Abrolhos Bank. Continental Shelf Research, v. 70, p. 109-117, 2013.

25.
SILVA, N. J.2013SILVA, N. J. ; TANG, K. W. ; Lopes, R. M. . Effects of microalgal exudates and intact cells on subtropical marine zooplankton. Journal of Plankton Research, v. 35, p. 855-865, 2013.

26.
DE MELO JÚNIOR, MAURO2013DE MELO JÚNIOR, MAURO ; Miyashita, Leonardo K. ; SILVA, NAIRA J. ; Gaeta, Salvador A. ; Lopes, Rubens M. . Reproductive traits of Euterpina acutifrons in a coastal area of Southeastern Brazil. Marine Ecology (Berlin), v. 34, p. n/a-n/a, 2013.

27.
Lopes, Rubens M.2013Lopes, Rubens M.; CASTRO, BELMIRO M. . Oceanography, ecology and management of Abrolhos Bank. Continental Shelf Research, v. 70, p. 1-2, 2013.

28.
MARCOLIN, CATARINA DA ROCHA2013MARCOLIN, CATARINA DA ROCHA ; SCHULTES, SABINE ; JACKSON, GEORGE A. ; Lopes, Rubens M. . Plankton and seston size spectra estimated by the LOPC and ZooScan in the Abrolhos Bank ecosystem (SE Atlantic). Continental Shelf Research, v. 70, p. 74-87, 2013.

29.
KOETTKER, ANDRÉA GREEN2013KOETTKER, ANDRÉA GREEN ; Lopes, Rubens M. . Meroplankton spatial structure and variability on Abrolhos bank and adjacent areas, with emphasis on brachyuran larvae. Continental Shelf Research, v. 70, p. 97-108, 2013.

30.
KOETTKER, A.2012KOETTKER, A. ; SUMIDA, P. Y. ; LOPES R. M. ; FREIRE, A. S. . Illustrated key for the identification of the known zoeal stages of brachyuran crabs (Crustacea: Decapoda) from tropical and subtropical Brazil. Zootaxa (Auckland. Print), v. 3204, p. 1-19, 2012.

31.
Amaral, G.R.S.2012Amaral, G.R.S. ; Silva, B.S.O. ; Santos, E.O. ; Dias, G.M. ; Lopes, R. M. ; Edwards, R.A. ; Thompson, C.C. ; Thompson, F.L. . Genome Sequence of the Bacterioplanktonic, Mixotrophic Vibrio campbellii Strain PEL22A, Isolated in the Abrolhos Bank. Journal of Bacteriology (Print), v. 194, p. 2759-2760, 2012.

32.
BRANDINI, F. P.2012BRANDINI, F. P. ; MIYASHITA, L. K. ; MARTINELLI-FILHO, J. E. ; FERNANDES, L. F. ; LOPES R. M. . Comparison of zooplankton community structure between impacted and non-impacted areas of Paranaguá Bay Estuarine Complex, south Brazil. Journal of Natural History, v. 46, p. 1557-1571, 2012.

33.
MIYASHITA, L. K.2011MIYASHITA, L. K. ; GAETA, S. A. ; Lopes, R. M. . Life cycle and reproductive traits of marine podonids (Cladocera, Onychopoda) in a coastal subtropical area. Journal of Plankton Research, v. 33, p. 779-792, 2011.

34.
Miyashita, Leonardo K.2011Miyashita, Leonardo K. ; Lopes, Rubens M. . Larvacean (Chordata, Tunicata) abundance and inferred secondary production off southeastern Brazil. Estuarine, Coastal and Shelf Science (Print), v. 92, p. 367-375, 2011.

35.
Miyashita, Leonardo K.2010Miyashita, Leonardo K. ; Pompeu, Mayza ; Gaeta, Salvador A. ; Lopes, Rubens M. . Seasonal contrasts in abundance and reproductive parameters of Penilia avirostris (Cladocera, Ctenopoda) in a coastal subtropical area. Marine Biology (Berlin), v. 157, p. 2511-2519, 2010.

36.
MARTINELLI FILHO, José Eduardo2010MARTINELLI FILHO, José Eduardo ; LOPES R. M. ; RIVERA, I. ; Colwell, R. R. . Vibrio cholerae O1 detection in estuarine and coastal zooplankton. Journal of Plankton Research, v. 33, p. 51-62, 2010.

37.
MIYASHITA, L. K.2009MIYASHITA, L. K. ; MELO JUNIOR, M. ; LOPES R. M. . Estuarine and oceanic influences on copepod abundance and production of a subtropical coastal area. Journal of Plankton Research, v. 31, p. 815-826, 2009.

38.
SCHULTES, S.2009 LOPES R. M.; SCHULTES, S. ; Laser Optical Plankton Counter and Zooscan intercomparison in tropical and subtropical marine ecosystems. Limnology and Oceanography, Methods, v. 7, p. 771-784, 2009.

39.
MARTINELLI FILHO, José Eduardo2009MARTINELLI FILHO, José Eduardo ; Melo-Júnior, M ; Cunha, DR ; LOPES R. M. . Rare sexual anomalies in Temora stylifera (Dana, 1849) (Copepoda: Calanoida). Brazilian Journal of Biology (Impresso), v. 69, p. 455-456, 2009.

40.
MANUS, G. M.2007MANUS, G. M. ; COSTAS, Barbara ; DAM, H. G. ; LOPES R. M. ; GAETA, S. A. ; SUSINI, S. M. ; ROSETTA, C. . Microzooplankton grazing of phytoplankton in a tropical upwelling system. Hydrobiologia (The Hague. Print), v. 575, p. 69-81, 2007.

41.
ATIENZA, D.2007ATIENZA, D. ; CALBET A ; SAIZ, E. ; LOPES R. M. . Ecological success of the cladoceran Penilia avirostris. Marine Biology (Berlin), v. 151, p. 1385-1396, 2007.

42.
LOPES R. M.;LOPES, R.;Lopes, R. M.;Lopes, Rubens M.;LOPES, R;LOPES, R M;LOPES, RUBENS MENDES;LOPES, RUBENS M2007LOPES R. M.; DAM, H. G. ; AQUINO, Newton ; MONTEIRO-RIBAS, W. ; RULL, L. . Massive egg production by a salp symbiont, the poecilostomatoid copepod Sapphirina angusta Dana, 1849. Journal of Experimental Marine Biology and Ecology, v. 348, p. 145-153, 2007.

43.
LOPES R. M.;LOPES, R.;Lopes, R. M.;Lopes, Rubens M.;LOPES, R;LOPES, R M;LOPES, RUBENS MENDES;LOPES, RUBENS M2007LOPES R. M.. Marine zooplankton studies in Brazil: a brief evaluation and perspectives. Anais da Academia Brasileira de Ciências (Impresso), v. 79, p. 369-379, 2007.

44.
LOPES R. M.;LOPES, R.;Lopes, R. M.;Lopes, Rubens M.;LOPES, R;LOPES, R M;LOPES, RUBENS MENDES;LOPES, RUBENS M2006LOPES R. M.; KATSURAGAWA, Mario ; MONTÚ, M. A. ; MUELBERT, José H ; DIAS, June F ; GORRI, C. ; BRANDINI, F. P. . Influencia de los procesos físicos en la distribución del zooplancton e ictioplancton: una revisión de los estudios realizados en la costa sur de Brasil. Scientia Marina, in press, v. 70, n.2, p. 189-202, 2006.

45.
Medeiros, G.F.2006LOPES R. M.; Medeiros, G.F. ; Medeiros, L.S. ; Henriques, D.M.F. ; LIma e Carlos, M.T. ; FAUSTINO, G. V. B. S. . Current distribution of the exotic copepod Pseudodiaptomus trihamatus Wright, 1937 along the northeastern coast of Brazil. Brazilian Journal of Oceanography (Impresso), v. 54, p. 241-245, 2006.

46.
MARONE, E.2005LOPES R. M.; MARONE, E. ; MACHADO, E. C. ; SILVA, E. T. . Land-ocean fluxes in the Paranaguá Bay estuarine system, southern Brazil. Brazilian Journal of Oceanography (Impresso), no prelo, v. 53, p. 169-181, 2005.

47.
OHTSUKA, Susumu2004OHTSUKA, Susumu ; HORIGUCHI, T ; LOPES R. M. ; CHOI, K H ; IWASAKI, K . Plankton introduction via ship ballast water: A review.. Bulletin of Plankton Society of Japan, v. 51, n.2, p. 101-118, 2004.

48.
DAM, H. G.2003 DAM, H. G. ; LOPES R. M. . Omnivory in the copepod Temora longicornis: feeding, egg production and hatching rates. Journal of Experimental Marine Biology and Ecology, v. 292, p. 119-137, 2003.

49.
DUBISCHAR, C.2002LOPES R. M.; DUBISCHAR, C. ; BATHMANN, U. V. . High summer abundances of small pelagic copepods at the Antarctic Polar Frontâ implications for ecosystem dynamics. Deep-Sea Research. Part 2. Tropical Studies in Oceanography, v. 49, p. 3871-3887, 2002.

50.
BRANDINI, F. P.2000BRANDINI, F. P. ; BOLTOVSKOY, D. ; PIOLA, A. ; KOCMUR, S. ; ROTTGERS, R. ; ABREU, P. C. ; LOPES R. M. . Multiannual trends in fronts and distribution of nutrients and chlorophyll in the Southwestern Atlantic (30º - 62ºS).. Deep-Sea Research. Part 1. Oceanographic Research Papers, Inglaterra, v. 47, n.6, p. 1015-1033, 2000.

51.
MARONE, E.2000MARONE, E. ; MACHADO, E. C. ; LOPES R. M. ; SILVA, E. T. . Paranagua Bay Bay estuarine complex, Parana State. LOICZ Reports & Studies, Texel, The Netherlands, v. 15, p. 26-32, 2000.

52.
SARTORI, L. P.2000SARTORI, L. P. ; LOPES R. M. . Seasonal variability of pelagic copepod assemblages on the inner continental shelf off Paraná, Brazil. Nauplius, v. 8, n.1, p. 79-88, 2000.

53.
KNOPPERS, B.1999KNOPPERS, B. ; MARONE, E. ; MEYERHOFER, M. ; LOPES R. M. ; LEIPE, T. ; DUTZ, J. . Compartments of the pelagic system and material exchange at the Abrolhos coral reefs, Brazil.. Archive of Fishery and Marine Research, Jena, v. 47, p. 285-306, 1999.

54.
LOPES R. M.;LOPES, R.;Lopes, R. M.;Lopes, Rubens M.;LOPES, R;LOPES, R M;LOPES, RUBENS MENDES;LOPES, RUBENS M1999LOPES R. M.; BRANDINI, F. P. ; GAETA, S. A. . Distributional patterns of epipelagic copepods off Rio de Janeiro State, Southeastern Brazil.. Hydrobiologia (The Hague. Print), Dordrecht, v. 411, p. 161-174, 1999.

55.
LOPES R. M.;LOPES, R.;Lopes, R. M.;Lopes, Rubens M.;LOPES, R;LOPES, R M;LOPES, RUBENS MENDES;LOPES, RUBENS M1998LOPES R. M.; VALE, R. ; BRANDINI, F. P. . Composição, abundância e distribuição espacial do zooplâncton no complexo estuarino de Paranaguá durante o inverno de 1993 e o verão de 1994. Brazilian Journal of Oceanography (Impresso), São Paulo, v. 46, p. 195-211, 1998.

56.
LOPES R. M.;LOPES, R.;Lopes, R. M.;Lopes, Rubens M.;LOPES, R;LOPES, R M;LOPES, RUBENS MENDES;LOPES, RUBENS M1996LOPES R. M.. Hydrography and zooplankton community: a comparative study among estuaries of the Juréia-Itatins Ecological Station (Southeastern Brazil).. Nerítica (Pontal do Sul), Curitiba, v. 10, p. 27-40, 1996.

57.
TURNER, J. T.1995TURNER, J. T. ; BATHMANN, U. V. ; BJORNBERG, T. K. S. ; BRANDINI, F. P. ; LOPES R. M. . Advanced course on marine zooplankton ecology: a summary.. Nerítica (Pontal do Sul), Curitiba, v. 9, p. 93-103, 1995.

58.
GAETA, S. A.1995GAETA, S. A. ; TEIXEIRA, C. ; ABE, D. S. ; LOPES R. M. ; SUSINI, S. M. . Size fractionation of primary production and phytoplankton biomass on the inshore waters of the Ubatuba region, Brazil.. Revista Brasileira de Oceanografia, São Paulo, v. 46, p. 195-211, 1995.

59.
POR, F. D.1994POR, F. D. ; LOPES R. M. . The streams of the Atlantic rainforest in Brazil.. Proceedings of the International Association of Theoretical and Applied Limnology, v. 25, p. 1871-1875, 1994.

60.
BJORNBERG, T. K. S.1994BJORNBERG, T. K. S. ; LOPES R. M. ; BJORNBERG, M. H. G. C. . Chave para a identificação de náuplios de copépodos planctônicos marinhos do Atlântico Sul-Ocidental.. Nauplius, v. 2, p. 1-16, 1994.

61.
LOPES R. M.;LOPES, R.;Lopes, R. M.;Lopes, Rubens M.;LOPES, R;LOPES, R M;LOPES, RUBENS MENDES;LOPES, RUBENS M1994LOPES R. M.; SILVEIRA, M. . Symbiosis between a pelagic flatworm and a dinoflagellate from a tropical area: structural observations.. Hydrobiologia (The Hague. Print), Dordrecht, v. 287, p. 277-284, 1994.

62.
LOPES R. M.;LOPES, R.;Lopes, R. M.;Lopes, Rubens M.;LOPES, R;LOPES, R M;LOPES, RUBENS MENDES;LOPES, RUBENS M1994 LOPES R. M.. Zooplankton distribution in the Guaraú River estuary (South-eastern Brazil).. Estuarine, Coastal and Shelf Science (Print), v. 39, p. 287-302, 1994.

63.
LOPES R. M.;LOPES, R.;Lopes, R. M.;Lopes, Rubens M.;LOPES, R;LOPES, R M;LOPES, RUBENS MENDES;LOPES, RUBENS M1993LOPES R. M.. Zooplankton spatial and seasonal distribution in the Tibagi River (Paraná State, Brazil). Semina (Londrina), Londrina, v. 14, n.2, p. 95-102, 1993.

64.
GAETA, S. A.1990GAETA, S. A. ; ABE, D. S. ; SUSINI, S. M. ; LOPES R. M. ; METZLER, P. M. . Produtividade primária, plâncton e covariáveis ambientais no Canal de São Sebastião durante o outono.. Revista Brasileira de Biologia, v. 50, p. 963-974, 1990.

65.
GUIX, J. C.1989GUIX, J. C. ; LOPES R. M. . Occurence of Hyla geographica and Bufo crucifer tadpoles in brackish water environments in the Juréia area.. Amphibia-Reptilia, Leiden, v. 10, p. 185-192, 1989.

66.
LOPES R. M.;LOPES, R.;Lopes, R. M.;Lopes, Rubens M.;LOPES, R;LOPES, R M;LOPES, RUBENS MENDES;LOPES, RUBENS M1986LOPES R. M.; ALMEIDA PRADO-POR, M. S. ; POR, F. D. . Zooplankton seasonality in the Rio Verde Estuary.. Revue D' Hydrobiologie Tropicale, v. 19, n.3-4, p. 207-214, 1986.

Livros publicados/organizados ou edições
1.
LOPES R. M.. Informe sobre as espécies exóticas invasoras marinhas no Brasil. Brasilia: Ministério do Meio Ambiente - Secretaria de Biodiversidade e Florestas, 2009. 439p .

2.
LOPES R. M.; REID, J. W. ; ROCHA, Carlos Eduardo Falavigna da . Copepoda: Developments in Ecology, Biology and Systematics. Dordrecht: Kluwer Academic Publishers, 2001. v. 1. 576p .

3.
BRANDINI, F. P. ; LOPES R. M. ; GUTSEIT, K. S. ; SPACH, H. L. ; SASSI, R. . Planctonologia na plataforma continental do Brasil - Diagnose e revisão bibliográfica.. Rio de Janeiro: FEMAR, 1997. 196p .

Capítulos de livros publicados
1.
Bonecker, Ana Cristina Teixeira ; de Araújo, Adriana Valente ; de Oliveira Dias, Cristina ; de Castro, Márcia Salustiano ; de Carvalho, Pedro Freitas ; LOPES, RUBENS MENDES ; Bonecker, Sérgio Luiz Costa . COMUNIDADES ZOOPLANCTÔNICAS E ICTIOPLANCTÔNICAS: VARIAÇÕES VERTICAIS E NICTEMERAIS AO LONGO DE OITO DIAS * *Bonecker, A.C.T., Araújo, A.V., Dias, C.O., Castro, M.S., Carvalho, P.F., Lopes, R.M., Bonecker, S.L.C. 2017. Comunidades zooplanctônicas e ic(...). Ambiente Pelágico. 1ed.: Elsevier, 2017, v. , p. 247-281.

2.
Bonecker, Sérgio Luiz Costa ; de Araújo, Adriana Valente ; de Carvalho, Pedro Freitas ; de Oliveira Dias, Cristina ; Fernandes, Luiz Fernando Loureiro ; Aguilar, Tulia Isabel Martinez ; LOPES, RUBENS MENDES . ESTRUTURA ESPACIAL E TEMPORAL DA COMUNIDADE ZOOPLANCTÔNICA * *Bonecker, S.L.C., Araújo, A.V., Carvalho, P.F., Dias, C.O., Fernandes, L.F.L., Aguilar, T.I.M., Lopes, R.M. 2017. Estrutura espacial e temporal da comunidade zooplanctônica. In: Falcão, A.(...). Ambiente Pelágico. 1ed.: Elsevier, 2017, v. , p. 171-206.

3.
LOPES R. M.; DIAS, June F ; GAETA, S. A. . Ambiente Pelágico. In: Vanessa Hatje; Jailson B. de Andrade. (Org.). Baia de Todos os Santos: Aspectos Oceanograficos. Salvador: EDUFBA, 2009, v. , p. 121-156.

4.
JUNQUEIRA, Andrea ; JULIO, L. M. ; FERREIRA-SILVA, M. A. G. ; CAMPOS, S. H. C. ; FERNANDES, F. C. ; LOPES R. M. . Bioinvasão no ambiente marinho. In: Rosana M Rocha; Walter A P Boeger. (Org.). Estado da arte e perspectivas para a zoologia no Brasil. Curitiba: Editora UFPR, 2009, v. , p. 271-284.

5.
LOPES R. M.; CUNHA, Daniela Rimoldi ; SANTOS, K.C. . Estatísticas sobre as espécies exóticas marinhas registradas na zona costeira brasileira. In: Lopes, R.M.. (Org.). Informe sobre as espécies exóticas invasoras marinhas no Brasil. Brasília: MMA/SBF, 2009, v. , p. 31-35.

6.
VILLAC, M. C. ; LOPES R. M. ; RIVERA, I. ; BASSANELLO, R. T. ; CUNHA, D. R. ; MARTINELLI FILHO, J. E. ; SANTOS, D. B. . Plâncton. Informe sobre as Espécies Exóticas Invasoras Marinhas no Brasil. 2ed.Brasília: Ministério do Meio Ambiente, 2009, v. , p. 39-104.

7.
LOPES R. M.; VILLAC, M. C. ; SCHAEFFER-NOVELLI, Y. . Introdução. Informe sobre espécies exóticas invasoras marinhas no Brasil. 2ed.Brasília: Ministério do Meio Ambiente, 2009, v. , p. 11-15.

8.
Ferreira, Carlos Eduardo Leite ; de Oliveira Ribeiro Junqueira, Andrea ; VILLAC, Maria Célia ; LOPES, RUBENS MENDES . Marine Bioinvasions in the Brazilian Coast: Brief Report on History of Events, Vectors, Ecology, Impacts and Management of Non-indigenous Species. Ecological Studies. 1ed.: Springer Berlin Heidelberg, 2009, v. , p. 459-477.

9.
LOPES, R M; VILLA, M. C. . Método. Método. 2ed.Brasília: MMA/SBF, 2009, v. , p. 19-28.

10.
Lana, C. ; Arai, M. ; LOPES R. M. . Significado paleoambiental de blooms de ovos de copépodes do albiano inferior a médio das bacias de Campos e Santos (Sudeste brasileiro). Paleontologia ? Cenários da Vida. Rio de Janeiro: Interciência, 2007, v. , p. 489-495.

11.
LOPES R. M.; MONTÚ, M. A. ; GORRI, C. ; MUXAGATA, E. ; MIYASHITA, L. K. ; OLIVEIRA, Lilian Prescinotti de . Diagnóstico do conhecimento atual sobre o zooplâncton marinho na região entre o Cabo de São Tomé (RJ) e o Chuí (RS). In: Carmen L.D.B. Rossi-Wongtschowski; Lauro Madureira. (Org.). O ambiente oceanográfico de plataforma continental e do talude na região sudeste-sul do Brasil.. São Paulo: EDUSP (no prelo), 2006, v. único, p. 265-358.

12.
LOPES R. M.; LANSAC-TÔHA, F. A. ; OLIVEIRA, I. ; KUTNER, M. B. . O plâncton dos estuários da Estação Ecológica Juréia-Itatins. In: Marques, O.A.V; Duleba, W.. (Org.). Estação Ecológica Juréia-Itatins. Ambiente, flora e fauna. Ribeirão Preto: Holos Editora, 2004, v. , p. 58-67.

13.
LOPES R. M.. Bioinvasões aquáticas por organismos zooplanctônicos: uma breve revisão.. In: J.S.V. Silva; R.C.C.L. Souza. (Org.). Água de Lastro e Bioinvasão.. Rio de Janeiro: Interciência, 2004, v. , p. 113-131.

14.
LANA, P. C. ; MARONE, E. ; LOPES R. M. ; MACHADO, E. C. . The subtropical estuarine complex of Paranaguá Bay, Brazil. In: Ulrich Seeliger; Bjorn Kjerfve. (Org.). Coastal Marine Ecosystems of Latin America. Berlin Heidelberg: Springer Verlag, 2001, v. , p. 131-145.

15.
MARONE, E. ; MACHADO, E. C. ; LOPES R. M. ; SILVA, E. T. . Paranaguá Bay estuarine complex, Paraná State. In: Dupra, V.; Smith, S.V.; Marshall Crossland, J.I.; Crossland, C.J.. (Org.). Estuarine systems of the South American region: carbon, nitrogen and phosphorus fluxes. Texel: LOICZ, 2000, v. 15, p. 26-32.

16.
LOPES R. M.; LANSAC-TÔHA, F. A. ; VALE, R. ; SERAFIM JR, M. . Comunidade zooplanctônica do Reservatório de Segredo.. In: Angelo A Agostinho; Luiz C Gomes. (Org.). Reservatório de Segredo: Bases ecológicas para o manejo.. Maringá: EDUEM, 1997, v. , p. 39-60.

Textos em jornais de notícias/revistas
1.
MELO JUNIOR, M. ; LOPES R. M. . Pequenos personagens, descrições notáveis. Ciência Hoje, Rio de Janeiro, p. 60 - 61, 15 set. 2008.

2.
MELO JUNIOR, M. ; LOPES R. M. . Minúsculos, mas zelosos. Ciência Hoje, Rio de Janeiro, , v. 248, p. 60 - 61, 01 maio 2008.

Trabalhos completos publicados em anais de congressos
1.
HIRATA, NINA S.T. ; FERNANDEZ, MARIELA ATAUSINCHI ; LOPES R. M. . Plankton image classification based on multiple segmentations.. In: 2nd Workshop on Computer Vision for Analysis of Underwater Imagery, 2016, Cancun, México. INTERNATIONAL CONFERENCE ON PATTERN RECOGNITION, 2016.

2.
FERNANDEZ, MARIELA ATAUSINCHI ; Lopes, Rubens M. ; HIRATA, NINA S.T. . Image Segmentation Assessment from the Perspective of a Higher Level Task. In: 2015 28th SIBGRAPI Conference on Graphics, Patterns and Images (SIBGRAPI), 2015, Salvador. 2015 28th SIBGRAPI Conference on Graphics, Patterns and Images, 2015. p. 111-118.

3.
MATUSZEWSKI, DAMIAN J. ; Lopes, Rubens M. . Plankton Detection and Tracking Using Frequency Filtering. In: 2013 Symposium on Computer and Automation for Offshore Shipbuilding (NAVCOMP), 2013, Rio Grande. 2013 Symposium on Computing and Automation for Offshore Shipbuilding, 2013. p. 75-80.

4.
MATUSZEWSKI, DAMIAN J. ; LOPES, R M ; CESAR-JR, ROBERTO M. . Visual Rhythm-based method for continuous plankton monitoring. In: ESCIENCE, 2013 IEEE 9th International Conference on eScience (eScience), 2013. ESCIENCE, 2013 IEEE 9th International Conference on eScience (eScience), 2013. p. 204-211.

5.
MATUSZEWSKI, DAMIAN J. ; MARTINS, C. IURY O. ; CESAR-JR, ROBERTO M. ; STRICKLER, J. RUDI ; Lopes, Rubens M. . Visual rhythm-based plankton detection method for ballast water quality assessment. In: 2012 19th IEEE International Conference on Image Processing (ICIP 2012), 2012, Orlando. 2012 19th IEEE International Conference on Image Processing, 2012. p. 1009-1012.

6.
Sieracki, M. E. ; Benfield, M. ; Hanson, A. ; Davis, C. ; Pilskaln, C.H. ; Checkley, D. ; Sosik, H.M. ; Ashjian, C. ; Culverhouse, P. ; Cowen, R. ; Lopes, R. M. ; Balch, W. ; Irigoien, X. . Optical plankton imaging and analysis systems for ocean observation. In: OceanObs?09, 2010, Venice. Proceedings of OceanObs?09: Sustained Ocean Observations and Information for Society, ESA Publication WPP-306. Paris: European Space Agency, 2010. v. 2.

7.
Reid, P.C. BATHMANN, U. Batten, S.D. Brainard, R.E. Burkill, P.H. Carlotti, F. Chiba, S. Conversi, A. Dickson, R.R. Dooley, H. Edwards, M. Flinkman, J. Fukuchi, M. Goes, J. Goni, G. Greene, C.H. Hare, J.A. Hays, G.C. Head, E. Hood, R.R. Hosie, G. Hunt, B.P.V. John, A.W.G. Jonas, T.D. Jossi, J.W. , et al.Karlson, B. Kim, K. Kirby, R.R. Kitchener, J. Kobayashi, D. Lakkis, S. Llope, M. Lopes, R. M. MacDiarmid, A. McQuatters-Gollop, A. Malone, T. Matondkar, P. MUXAGATA, E. Pershing, E. Richardson, A.J. Robertson, D. Robinson, K. Sartimbul, A. Stenseth, N.C. Sugisaki, H. Stevens, D. Van den Berghe, E. Verheye, H. Vezzulli, L. Ward, P. ; A global continuous plankton recorder programme. In: OceanObs'09, 2010, Venice. Proceedings of OceanObs?09: Sustained Ocean Observations and Information for Society, ESA Publication WPP-306. Paris: European Space Agency, 2010. v. 2.

8.
MIELLI, MURILO Z. ; BALDASSO, LUIS F. ; Lopes, Rubens M. ; CARREN'O, MARCELO N. ; PAVANELLO, M. ; CLAEYS, C. ; MARTINO, J. . Microfluidic Systems in PDMS for Study of Foraging Abilities of Marine Microorganisms. In: 25th Symposium on Microelectronics Technology and Devices, 2010, Sao Paulo. ECS. v. 31. p. 449-455.

9.
Karlson, B. ; Lopes, R. M. ; Berdalet, E. ; Chavez, F. ; Claus, S. ; Daly, K. ; GAETA, S. A. ; Gallienne, C. ; Piera, J. ; Polat, S. ; Ross, O.N. ; Shams El Din, N. ; Valdes, L. . Observational approaches to community structure, from microbes to zooplankton. In: Workshop on Ocean Biology Observatories, 2009, Venice. Group Reports, Workshop on Ocean Biology Observatories. Newark: SCOR, 2009.

10.
LOPES R. M.; POR, F. D. . Tipos fluviais da área de Juréia-Itatins e Baixo Ribeira (São Paulo). In: Simpósio de Ecossistemas da Costa Sul e Sudeste do Brasil, 1990, Águas de Lindóia, SP. Publicação ACIESP. São Paulo: ACIESP, 1990. v. 71. p. 85-94.

Resumos expandidos publicados em anais de congressos
1.
SILVEIRA, F. L. ; LOPES R. M. . Censo da Vida Marinha e a perspectiva de sua Síntese em 2010: quais serão os grandes novos desafios?. In: II Congresso Brasileiro de Biologia Marinha, 2009, Armação dos Buzios, RJ. Associação Brasileira de Biologia Marinha, 2009. v. 1. p. 44-46.

2.
MARTINELLI FILHO, José Eduardo ; MIYASHITA, L. K. ; LOPES R. M. ; BRANDINI, F. P. . Variações na comunidade zooplanctônica em 2 transectos no Complexo Estuarino de Paranaguá (Paraná). In: III Congresso Brasileiro de Oceanografia, 2008, Fortaleza. III Congresso Brasileiro de Oceanografia - CD de Resumos, 2008.

3.
MELO JUNIOR, M. ; SILVA, N. J. ; LOPES R. M. . Produção de ovos e crescimento de quatro copépodes pelágicos nas proximidades da Ilha Anchieta (SP, Brasil). In: III Congresso Brasileiro de Oceanografia, 2008, Fortaleza. III Congresso Brasileiro de Oceanografia - CD de Resumos, 2008.

4.
SILVA, N. J. ; MELO JUNIOR, M. ; LOPES R. M. . Determinação de copépodes planctônicos mortos na plataforma continental interna de Ubatuba (SP). In: III Congresso Brasileiro de Oceanografia, 2008, Fortaleza. III Congresso Brasileiro de Oceanografia - CD de Resumos, 2008.

5.
MARTINELLI FILHO, José Eduardo ; LOPES R. M. . Distribuição de Vibrio cholerae associado ao zooplâncton marinho no complexo estuarino de Santos-Bertioga e plataforma adjacente. In: III Congresso Brasileiro de Oceanografia, 2008, Fortaleza. III Congresso Brasileiro de Oceanografia - CD de Resumos, 2008.

6.
SILVEIRA, Fábio Lang da ; LOPES R. M. . Serviço de Informação Internacional sobre Biodiversidade em Ambiente Marinho, Ocean Biogeographic Information System (OBIS), como iniciativa com participação da América do Sul e do Brasil dentro do Census of Marine Life. In: I Congresso Brasileiro de Biologia Marinha, 2006, Niterói. Livro do evento, 2006.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
GOÇALO, C. G. ; AQUINO, N. A. ; KERBER, C. E. ; NAGATA, R. M. ; LOPES, R M . Swimming behavior of Cobia larvae (Rachycentron canadum) facing prey and predator. In: 38th Annual Larval Fish Conference, 2014, Québec. 38th Annual Larval Fish Conference, 2014.

2.
LOPES, R M; BALDASSO, L. F. ; MEDEIROS, M. G. ; TICLIA, L. . Caracterização do zooplâncton na Baía do Araçá e Canal de São Sebastião - SP por técnica de aquisição de imagem in situ. In: II Workshop FAPESP - BIOTA Araçá, 2014, São Paulo. II Workshop FAPESP - BIOTA Araçá, 2014.

3.
LOPES, R M. Variabilidade Espaço-Temporal da Diversidade e Estrutura Trófica do Ambiente Pelágico na Plataforma Continental. In: Kick-Off-Workshop INCT AmbTropic GT 2.2, 2013, RECIFE - PE. Kick-Off-Workshop INCT AmbTropic GT 2.2, 2013.

4.
GHIGLIENO, F. ; BALDASSO, L. F. ; GOÇALO, C. G. ; AQUINO, Newton ; LOPES, R M . Ergonomic digital holography for oceanographic applications. In: 3rd EOS Topical Meeting on Blue Photonics - Optics in the Sea (Blue Photonics 3), 2013, Netherlands. 3rd EOS Topical Meeting on Blue Photonics - Optics in the Sea (Blue Photonics 3), 2013.

5.
MACHADO, L. M. ; MATTIELLO, I. ; LOPES, R M ; CARRENO, M. N. P. . Microfluidic biochip for phytoplankton cell counting. In: Symposium on Presented at the Microelectronics Technology and Devices (SBMicro), 2013. Symposium on Presented at the Microelectronics Technology and Devices (SBMicro), 2013. p. 1-4.

6.
GOÇALO, C. G. ; LOPES, R M . Comportamento natatório de larvas de peixes marinhos (Epinephelus marginatus) observado em câmera lenta. In: XXXI Encontro Anual de Etologia, 2013, São Paulo. XXXI Encontro Anual de Etologia, 2013.

7.
LOPES R. M.. Invasive marine species in Brazil: assessment and management perspectives. In: Brasil - Texas A&M University: Science and Education Internationalization, 2012, Porto de Galinhas, Brazil. Brasil - Texas A&M University: Science and Education Internationalization, 2012.

8.
MARCOLIN, CATARINA R. ; SCHULTES, S. ; LOPES R. M. . Plankton size spectra in tropical and subtropical Brazil. In: Brasil - Texas A&M University: Science and Education Internationalization, 2012, Porto de Galinhas, Brazil. Brasil - Texas A&M University: Science and Education Internationalization, 2012.

9.
KOETTKER, ANDRÉA GREEN ; GOÇALO, C. G. ; BRANDAO, M. C. ; LOPES, R M . High-speed video observations of brachyuran larvae behavior. In: 10th International Larval Biology Symposium, 2012, BERKELEY. 10th International Larval Biology Symposium, 2012.

10.
KOETTKER, ANDRÉA GREEN ; LOPES, R M . Meroplankton spatial structure and variability on Abrolhos Bank and adjacent areas (Northeast Brazil), with emphasis on brachyuran larvae. In: 10th International Larval Biology Symposium, 2012. 10th International Larval Biology Symposium, 2012.

11.
MARCOLIN, CATARINA R. ; LOPES R. M. . Zooplankton biomass size spectra off Rio de Janeiro (Brazil) estimated by LOPC and Zooscan observations. In: 5th International Zooplankton Production Symposium, 2011, Pucón, Chile. 5th International Zooplankton Production Symposium, 2011.

12.
BALDASSO, L. F. ; STRICKLER, J. RUDI ; LOPES R. M. . Behavioral responses of Temora turbinata (Copepoda, Calanoida) exposed to phytoplankton thin layers. In: 5th International Zooplankton Production Symposium, 2011, Pucón, Chile. 5th International Zooplankton Production Symposium, 2011.

13.
SILVA, NAIRA J. ; LOPES, R M . Occurrence of copepod carcasses on the inner shelf off Ubatuba (Southeastern Brazil). In: 5th International Zooplankton Production Symposium, 2011, Pucón, Chile. 5th International Zooplankton Production Symposium, 2011.

14.
SARTORI, L. P. ; LOPES, R M . Zooplankton size spectra obtained by LOPC from Abrolhos Bank. In: 5th International Zooplankton Production Symposium, 2011, Pucón, Chile. Zooplankton size spectra obtained by LOPC from Abrolhos Bank., 2011.

15.
KOETTKER, ANDRÉA GREEN ; LOPES R. M. . Meroplankton assessment on the Abrolhos Bank, Brazil: Observations on major larval groups. In: 5th International Zooplankton Production Symposium, 2011, Pucón, Chile. 5th International Zooplankton Production Symposium, 2011.

16.
Silva, T.A. ; LOPES R. M. . Resposta temporal da comunidade zooplanctônica frente às variações ambientais em uma estação fixa ao largo de Ubatuba (SP, Brasil). In: 19o Simpósio Internacional de Iniciação Científica da USP, 2011, São Paulo. 19o Simpósio Internacional de Iniciação Científica da USP, 2011.

17.
SILVEIRA, F. L. ; LOPES, R M . OBIS como legado do Censo da Vida Marinha para os países membros da Comissão Oceanográfica Intergovernamental (COI) da UNESCO: participação do Brasil (IODE/WSAOBIS). In: III Congresso Brasileiro de Biologia Marinha, 2011, NATAL. III Congresso Brasileiro de Biologia Marinha, 2011.

18.
BARRERA-ALBA, J. J. ; NOGUEIRA, S. ; AQUINO, N. A. ; GOÇALO, C. G. ; ALVES, J. L. ; TOCCI, B. R. C. ; TOLENTINO, H. M. M. ; PREVIERO-NOGUEIRA, F. ; LANNES, D. M. ; STAVALE, T. N. ; MOSER, G. A. O. ; LOPES R. M. . Uso da tecnologia FlowCAM para monitoramento de alta frequência do microfitoplâncton em uma maricultura de bivalves na praia da Cocanha (Caraguatatuba, SP). In: V Simpósio Brasileiro de Oceanografia, 2011, Santos, SP. V Simpósio Brasileiro de Oceanografia, 2011.

19.
SILVEIRA, F. L. ; LOPES R. M. . OBIS como legado do Censo da Vida Marinha para os países membros da Comissão Oceanográfica Intergovernamental (COI) da UNESCO: participação do Brasil (IODE/WSAOBIS). In: III Congresso Brasileiro de Biologia Marinha, 2011, NATAL. III Congresso Brasileiro de Biologia Marinha, 2011.

20.
MOSER, G. A. O. ; VASCONCELOS, F. P. ; RICHARD, E. C. ; PREVIERO-NOGUEIRA, F. ; TOLENTINO, H. M. M. ; STAVALE, T. N. ; LANNES, D. M. ; LOPES R. M. . Ocorrência de cistos de dinoflagelados nos sedimentos da praia da Cocanha (Caraguatatuba-SP). In: V Simpósio Brasileiro de Oceanografia, 2011, SANTOS. V Simpósio Brasileiro de Oceanografia, 2011.

21.
KOETTKER, ANDRÉA GREEN ; SUMIDA, PAULO YUKIO GOMES ; LOPES R. M. . Illustrated key for the identification of the known zolal stage of Brachyura. In: 9th Larval Biology Symposium, 2010, Wellington. 9th Larval Biology Symposium, 2010. p. 83-84.

22.
Silva, T.A. ; LOPES R. M. . Relação entre zooplâncton e algas nocivas no litoral norte: variabilidade espaço-temporal, co-ocorrência e forçantes ambientais. In: 18o Simpósio Internacional de Iniciação Científica da USP, 2010, São Paulo. 18o Simpósio Internacional de Iniciação Científica da USP, 2010.

23.
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100.
ABRAHÃO, R. L. B. E. ; LOPES R. M. . Distribuição, biomassa e atividade metabólica do zooplâncton no ecossistema pelágico do Atlântico Sudoeste. In: III Evento de Iniciação Científica, 1995, Curitiba. Resumos. Curitiba: UFPR, 1995.

101.
BJORNBERG, T. K. S. ; LOPES R. M. ; BJORNBERG, M. H. G. C. . Identificação de náuplios de copépodos planctônicos marinhos do Atlântico Sudoeste. In: VI Congresso Latinoamericano de Ciências do Mar, 1995, Mar del Plata. Resumos, 1995.

102.
LOPES R. M.; ABRAHÃO, R. L. B. E. ; NETTO, J. D.B. ; BRANDINI, F. P. ; GAETA, S. A. . Densidade, biomassa e metabolismo do zooplâncton em regiões oceânicas do Atlântico Sudoeste. In: VI COngresso Latinoamericano de Ciências do Mar, 1995, Mar del Plata. Resumos, 1995.

103.
LOPES R. M.; VALE, R. ; NETTO, J. D.B. . Zooplâncton da Baía de Paranaguá (SE Brasil): composição, densidade e atividade alimentar. In: VI Congresso Latinoamericano de Ciências do Mar, 1995, Mar del Plata. Resumos, 1995.

104.
ABRAHÃO, R. L. B. E. ; VALE, R. ; LOPES R. M. . Zooplâncton da Baía de Paranaguá: estrutura e dinâmica da comunidade, com ênfase em interações tróficas. In: II Evento de Iniciação Científica, 1994, Curitiba. Resumos. Curitiba: UFPR, 1994.

105.
LOPES R. M.. Composition and distribution of copepods (Crustacea: Copepoda) in the epipelagial off eastern Rio de Janeiro coast (Brazil). In: 5th International Conference on Copepoda, 1993, Baltimore, USA. Abstracts. Baltimore: University of Maryland, 1993.

106.
LOPES R. M.; YABE, M. J. S. . Análise de parâmetros limnológicos da Bacia do Rio Tibagi (PR). In: IV Congresso Brasileiro de Limnologia, 1992, Manaus. Resumos, 1992.

107.
LOPES R. M.; SILVEIRA, M. . Aspectos ultra-estruturais da associação de endosimbiose em Convoluta sp. (Turbellaria: Acoela). In: XIII Colóquio da Sociedade Brasileira de Microscopia Eletrônica, 1991, Caxambu. Resumos, 1991.

108.
LOPES R. M.. Aspectos da fauna e flora da bacia do Rio Tibagi. In: 3º Encontro Nacional de Estudos Sobre o Meio Ambiente, 1991, Londrina. Resumos. Londrina: UEL, 1991.

109.
LOPES R. M.. Distribuição do Zooplâncton do Rio Guaraú (Juréia, São Paulo). In: XV Congresso Brasileiro de Zoologia, 1988, Curitiba. Resumos, 1988.

110.
LOPES R. M.. Análise Multidimensional da Distribuição do Zooplâncton do Estuário do Rio Guaraú (Peruíbe, São Paulo). In: II Congresso Brasileiro de Limnologia, 1988, Cuiabá. Resumos, 1988.

111.
LOPES R. M.. Distribuição Espacial do Zooplâncton dos Estuários da Estação Ecológica da Juréia (Peruíbe/Iguape, São Paulo). In: III Encontro Brasileiro de Plâncton, 1988, Caiobá. Resumos. Curitiba: UFPR, 1988.

112.
GAETA, S. A. ; ABE, D. S. ; SUSINI RIBEIRO, S. M. ; METZLER, P. M. ; SALDANHA, F. M. P. ; LOPES R. M. ; MORAES, M. C. P. . Produtividade primária, clorofila e nutrientes no Canal de São Sebastião - Estação fixa 23o50'S e 45o25'W (CEBIMAR), primavera de 1987. In: VII Mini-Simpósio de Biologia Ma, 1988, São Sebastião. VII Mini-Simpósio de Biologia Marinha, 1988. p. 21-21.

113.
GAETA, S. A. ; SUSINI, S. M. ; LOPES R. M. ; MORAES, M. C. P. ; METZLER, P. M. ; ABE, D. S. ; SALDANHA, F. M. P. . Plâncton e Produtividade Primária no Canal de São Sebastião (SP): Levantamento Preliminar durante o Inverno de 1987. In: VI Mini-Simpósio de Biologia Marinha, CEBIMar (USP), 1987, São Sebastião. Resumos, 1987.

114.
LOPES R. M.. Tipos Fluviais na Baixada do Ribeira. In: 1° Encontro dos Alunos de Pós-Graduação do Instituto de Biociências (USP), 1986, São Paulo. Resumos, 1986.


Produção técnica
Assessoria e consultoria
1.
Lopes, R. M.; Culverhouse, P. ; Benfield, M. . Membro titular do SCOR Working Group on Automatic Visual Plankton Identification. 2007.

2.
LOPES R. M.. Diagnóstico ambiental marinho da área de influência da Refinaria Landulpho Alves Mataripe. 2000.

Trabalhos técnicos
1.
LOPES R. M.. Programa de monitoramento ambiental do ecossistema estuarino na área de influência da Refinaria Landulpho Alves (Editor).. 2004.

2.
LOPES R. M.. Programa de monitoramento ambiental do ecossistema estuarino na área de influência da Refinaria Landulpho Alves (Editor).. 2003.

3.
LOPES R. M.; FERNANDES, F. C. ; RIVERA, I. ; MENNUCCI, Daniel Lins ; FERREIRA, Catia Pedroso ; SCHNEIDER, Marestela Huppes . Estudo Exploratório para Identificação e Caracterização de Espécies Patogênicas em Água de Lastro em Portos Selecionados no Brasil. 2002.

4.
LOPES R. M.. Análise Rápida do Plâncton: uma ferramenta para a identificação da origem ambiental da água de lastro. 2002.

5.
LOPES R. M.. Small Pelagic Copepods. 2001.

6.
LOPES R. M.; RIVERA, I. ; FERNANDES, F. C. . Estudo exploratório da presença de organismos patogênicos na água de lastro de navios atracados em portos brasileiros. 2001.

7.
LOPES R. M.; FERNANDES, L. F. ; RIVERA, I. . Água de Lastro: Análise de Risco e Monitoramento de Espécies Exóticas e Nocivas no Porto de Paranaguá, Paraná. 2001.

8.
LOPES R. M.; Rivera, I. N. G. ; FERNANDES, F. C. . Membro do Grupo de Trabalho sobre Água de Lastro da Agência Nacional de Vigilância Sanitária (ANVISA-Ministério da Saúde). 2001.

9.
LOPES R. M.. Ecologia do zooplâncton em ambientes estuarinos e costeiros do litoral sul da Bahia. 2000.

10.
LOPES R. M.. Diagnóstico Ambiental do Complexo Estuarino de Camamu. 2000.

11.
LOPES R. M.. Produtividade pelágica na plataforma continental sudeste do Brasil e sua relação com as intrusões da Água Central do Atlântico Sul. 2000.

12.
LOPES R. M.; BATHMANN, U. V. . Southern Ocean GLOBEC: Role of small copepods in krill biology. 2000.

13.
LOPES R. M.. Bifurcação do ramo sul da Corrente Sul Equatorial: implicações para o plâncton e a produtividade primária na plataforma continental do sul da Bahia. 2000.

14.
LOPES R. M.; SUSINI RIBEIRO, S. M. . Interações tróficas entre o fito- e o zooplâncton em um estuário tropical. 2000.

15.
LOPES R. M.. Plano estratégico de desenvolvimento da área de oceanografia na Universidade Estadual de Santa Cruz. 2000.

16.
LOPES R. M.. O papel dos copépodes pequenos na estrutura da teia alimentar em águas antárticas e subantárticas. 1999.


Demais tipos de produção técnica
1.
MEYERHOEFFER, M. ; MARONE, E. ; CAMARGO, R. ; LEIPE, T. ; KNOPPERS, B. ; LOPES R. M. ; DUTZ, J. . Transport mechanisms of biogeneous material, heavy metals and organic pollutants in east Brazilian waters - small scale investigations. 1996. (Relatório de pesquisa).

2.
LOPES R. M.; BRANDINI, F. P. . Advanced course on marine zooplankton ecology. 1995. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

Demais trabalhos
1.
WEIGAND JR, R. ; LOPES R. M. . Reserva Extrativista Marinha de Itacaré (BA): Relatório Final do Diagnóstico Participativo. 2001 (Relatório Técnico) .



Bancas



Participação em bancas de trabalhos de conclusão
Mestrado
1.
Lopes, R. M.; BARRERA-ALBA, J. J.; RIBEIRO, S. M. M. S.. Participação em banca de Yonara Garcia Borges Felipe. Motilidade da associação entre uma diatomácea cêntrica e um ciliado peritríquio e suas possíveis consequências ecológicas.. 2018. Dissertação (Mestrado em Oceanografia (Oceanografia Biológica)) - Universidade de São Paulo.

2.
HIRATA, NINA S.T.; LOPES R. M.; PAPA, J. P.. Participação em banca de Mariela Atausinchi. Classificação de imagens de plâncton usando múltiplas segmentações.. 2017. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo.

3.
HIRATA JR., R.; KOGLER JUNIOR, J. E.; LOPES R. M.. Participação em banca de Jefferson Serafin Ascaneo. Processamento de imagens de holografia digital para o estudo de organisos planctônicos. 2017. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo.

4.
OLIVEIRA, O. M. P.; LOPES R. M.; MORANDINI, A. C.. Participação em banca de Paula Keshia Rosa Silva. Diversidade e distribuição do zooplâncton gelatinoso sobre a plataforma continental e talude da Bacia de Campo (SE Brasil). 2017. Dissertação (Mestrado em Evolução e Diversidade) - Universidade Federal do ABC.

5.
LOPES R. M.; BARROS, E. A.; BARRERA-ALBA, J. J.. Participação em banca de MAIÁ GOMES MEDEIROS. Desenvolvimento de uma instrumentação de captura de imagens in situ para estudo da distribuição vertical do plâncton.. 2017. Dissertação (Mestrado em Oceanografia (Oceanografia Biológica)) - Universidade de São Paulo.

6.
LOPES R. M.; BRANDINI, F. P.; ROCHA, O.. Participação em banca de Luis Fabiano Baldasso. Deslocamento seletivo induzido do zooplâncton marinho em resposta a percepção espectral da luz visível. 2016. Dissertação (Mestrado em Oceanografia (Oceanografia Biológica)) - Universidade de São Paulo.

7.
LOPES R. M.; CORREA, Flávia Marisa P Saldanha; BARRERA-ALBA, J. J.. Participação em banca de Izadora De La Volpe Mattiello. Avaliação de corantes para a detecção da viabilidade do fitoplâncton marinho. 2015. Dissertação (Mestrado em Oceanografia (Oceanografia Biológica)) - Universidade de São Paulo.

8.
CESAR-JR, ROBERTO M.; HIRATA, NINA S.T.; LOPES R. M.. Participação em banca de Damian Janusz Matuszewski. Visão computacional para o monitoramento contínuo de plâncton.. 2014. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo.

9.
SINGER, JULIO M.; LEE HO, L.; LOPES R. M.. Participação em banca de Eliardo Guimarães da Costa. Aspectos estatísticos da amostragem da água de lastro. 2013. Dissertação (Mestrado em Estatística) - Universidade de São Paulo.

10.
LOPES R. M.; MORANDINI, A. C.; FERNANDES, L. F.. Participação em banca de Tulia Isabel Martinez Aguilar. Distribuição espacial e sazonal de grupos do microzooplâncton na Bacia de Campos em cinco massas de água, da superfície ao batipelagial. 2013. Dissertação (Mestrado em Oceanografia (Oceanografia Biológica)) - Universidade de São Paulo.

11.
LOPES R. M.; SOUSA, E. C. P. M.; FIGUEIREDO, G. M.. Participação em banca de Naira Juliana da Silva. Influência de dinoflagelados potencialmente nocivos sobre o zooplâncton de uma região costeira subtropical: uma abordagem experimental. 2013. Dissertação (Mestrado em Oceanografia (Oceanografia Biológica)) - Universidade de São Paulo.

12.
RIVERA, I. N. G.; VICENTE, E. J.; LOPES R. M.. Participação em banca de Flávio Augusto Cardozo. Avaliação da atividade quitinolítica por bactérias do gênero Aeromonas isoladas do ecossistema marinho. 2012. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.

13.
KATSURAGAWA, Mario; LOPES R. M.; BONECKER, A. C. T.. Participação em banca de Camilla Nunes Garbini. Distribuição e abundância de larvas e Pleuronectiformes na região entre o Cabo de Sào Tomé (RJ) e a Ilha de São Sebastião (SP). 2012. Dissertação (Mestrado em Oceanografia (Oceanografia Biológica)) - Universidade de São Paulo.

14.
FLORES, A. A. V.; LOPES R. M.; MENNA-BARRETO, L. S.. Participação em banca de Paula Kasten. Ritmicidade da emissão de propágulos em Chthamalus bisinuatus (Pilsbry, 1916): componentes endógenas e exógenas. 2011. Dissertação (Mestrado em Biologia Comparada) - Universidade de São Paulo.

15.
SILVEIRA, F. L.; GUSMAO, L. C. F. R.; LOPES R. M.. Participação em banca de Julia Silva Beneti. A anênoma-do-mar Diadumene Stephenson, 1920: um cnidário com potencial invasor na Baía de Paranaguá, PR, Brasil. 2011. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Zoologia)) - Universidade de São Paulo.

16.
LOPES R. M.; BONECKER, S. L. C.; LOUREIRO FERNANDES, L. F.. Participação em banca de Leonardo Kenji Miyashita. Dinâmica populacional de Appendicularia e Cladocera na plataforma interna de Ubatuba (SP): um estudo sazonal e multianual. 2010. Dissertação (Mestrado em Oceanografia (Oceanografia Biológica)) - Universidade de São Paulo.

17.
LOPES R. M.; KATSURAGAWA, Mario; Sant'anna, EE. Participação em banca de Daniela Rimoldi Cunha. Estudo comparativo dos copépodes Temora stylifera e T. turbinata na Plataforma Continental Sudeste do Brasil no verão e inverno de 2002. 2009. Dissertação (Mestrado em Oceanografia (Oceanografia Biológica)) - Universidade de São Paulo.

18.
LOPES R. M.. Participação em banca de André Marafon de Almeida. Distribuição espaço-temporal de crustáceos decápodes planctônicos na Baía da Babitonga, SC, Brasil. 2009. Dissertação (Mestrado em Zoologia) - Universidade Federal do Paraná.

19.
LOPES R. M.; BONECKER, S. L. C.; OLIVEIRA, O. M. P.. Participação em banca de Lílian Prescinoti de Oliveira. Análise comparativa da distribuição das Famílias Salpidae e Doliolidae em relação ao zooplâncton total na Plataforma Continental Sudeste do Brasil por meio de técnicas semi-automáticas de identificação e contagem. 2009. Dissertação (Mestrado em Oceanografia (Oceanografia Biológica)) - Universidade de São Paulo.

20.
LOPES R. M.; VALENTIN, Jean Louis; THOMPSON, FABIANO LOPES. Participação em banca de José Eduardo Martinelli Filho. A associação entre o zooplâncton e Vibrio cholerae no complexo estuarino de Santos - Bertioga e plataforma adjacente.. 2007. Dissertação (Mestrado em Oceanografia (Oceanografia Biológica)) - Universidade de São Paulo.

21.
STAMPAR, S. N.; SILVEIRA, Fábio Lang da; MORANDINI, A. C.; SARAIVA, E. S. B.; LOPES R. M.. Participação em banca de Sergio Nascimento Stampar. Disponibilidade e privação do alimento como reguladores da reprodução assexuada em cifístomas de Nausithoe aurea Silveira & Morandini, 1997 (Cnidária, Scyphozoa, Coronatae). 2006. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Zoologia)) - Universidade de São Paulo.

22.
Sant'anna, EE; Attayde, JL; LOPES R. M.. Participação em banca de Laura Ribas de Almeida. Avaliação espaço-temporal do zooplâncton da laguna estuarina de Guaraíras (RN, Brasil). 2006. Dissertação (Mestrado em Ecologia) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

23.
LOPES R. M.; ROCHA, O.; GAETA, S. A.. Participação em banca de Adriana Rachel de Moraes Crété. Distribuição e produção estimada do copépode Calanoides carinatus (Kroyer, 1849) na Plataforma Continental Sudeste Brasileira.. 2006. Dissertação (Mestrado em Oceanografia (Oceanografia Biológica)) - Universidade de São Paulo.

24.
PURCELL, C. A.; VALENTIN, Jean Louis; RODRIGUES, Eliane Gonzalez; GIANESELLA, Sônia Maria Flores; LOPES R. M.. Participação em banca de Caroline Anne Purcell. Biomassa e produção primária fracionadas (pico-, nano- e microfitoplâncton), e a contribuição relativa do compartimento heterotrófico à biomassa microplanctônica na ressurgêngia de Cabo Frio (RJ). 2005. Dissertação (Mestrado em Oceanografia (Oceanografia Biológica)) - Universidade de São Paulo.

25.
TRONOLONE, V. B.; ROCHA, Carlos Eduardo Falavigna da; SILVEIRA, Fábio Lang da; PEREIRA, Denise Navas; LOPES R. M.. Participação em banca de Valquiria Baddini Tronolone. Hidromedusas como indicadoras de massas de água. 2005. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Zoologia)) - Universidade de São Paulo.

26.
MEDEIROS, D. S.; LOPES R. M.. Participação em banca de Douglas Siqueira de Medeiros. Avaliação de risco da introdução de espécies marinhas exóticas por meio de água de lastro no Terminal Portuário de Ponta Ubu (ES). 2004. Dissertação (Mestrado em Tecnologia Ambiental) - Instituto de Pesquisas Tecnológicas do Estado de São Paulo.

27.
ABREU, P. C.; LOPES R. M.; ODEBRECHT, Clarisse. Participação em banca de Giuliano Robertson Hickenbick. Predação de bactérias pelo protozooplâncton em um gradiente de salinidade e seu efeito no balanço de massa bacteriano.. 2002. Dissertação (Mestrado em Oceanografia Biológica) - Universidade Federal do Rio Grande.

28.
LOPES R. M.; MACHADO, E. C.; FERNANDES, L. F.. Participação em banca de Luciana Pinto Sartori. Distribuição espacial e variação sazonal dos copépodes pelágicos na plataforma continental interna do Paraná. 2000. Dissertação (Mestrado em Zoologia) - Universidade Federal do Paraná.

29.
LOPES R. M.; MACHADO, E. C.; ABSHER, Theresinha Monteiro. Participação em banca de Ricardo Lins de Barros Essenfelder Abrahão. Variação diária do zooplâncton no Canal da Galheta, Baía de Paranaguá, Brasil. 1999. Dissertação (Mestrado em Zoologia) - Universidade Federal do Paraná.

30.
LOPES R. M.; MONTÚ, M. A.; ABSHER, Theresinha Monteiro. Participação em banca de Rosinei do Vale. Variabilidade temporal nas taxas de produção de ovos de Acartia tonsa (Copepoda: Calanoida) na Baía de Paranaguá, Paraná. 1999. Dissertação (Mestrado em Zoologia) - Universidade Federal do Paraná.

31.
LOPES R. M.; BARTHEM, Ronaldo Borges; NAHUM, Victoria Judith Isaac; HIGUCHI, Horacio; SCHORIES, Dirk. Participação em banca de Ariadne da Costa Peres. A comunidade zooplanctônica em um canal de maré, no estuário do rio Caeté, município de Bragança, Pará, Brasil. 1999. Dissertação (Mestrado em Zoologia) - Universidade Federal do Pará.

32.
BJORNBERG, T. K. S.; LOPES R. M.; ROCHA, Carlos Eduardo Falavigna da. Participação em banca de Crisiane Lages de la Rocha. Variação temporal da comunidade zooplanctônica e produção anual do Copepoda Acartia lilljeborgi na enseada da Praia do Segredo (São Sebastião - S.P.). 1998. Dissertação (Mestrado em Ecologia) - Universidade de São Paulo.

33.
LANA, P. C.; LOPES R. M.; BEMVENUTI, Carlos Emílio. Participação em banca de Luciano Lorenzi. Composição e distribuição da macrofauna bêntica em gamboas da Baía de Paranaguá (Paraná, Brasil). 1998. Dissertação (Mestrado em Zoologia) - Universidade Federal do Paraná.

34.
LANSAC-TÔHA, F. A.; THOMAZ, Sidinei Magela; LOPES R. M.. Participação em banca de Juraci Rejaine Catenassi Campos. Variações espaço-temporais da comunidade de microcrustáceos da lagoa do Guaraná e rio Baía, na planície de inundação do alto rio Paraná-MS. 1998. Dissertação (Mestrado em Ecologia de Ambientes Aquáticos Continentais) - Universidade Estadual de Maringá.

Teses de doutorado
1.
LOPES R. M.; CERQUEIRA, V. R.; KATSURAGAWA, Mario; WHITTON, R. G. M.; FIGUEIREDO, G. M.. Participação em banca de Cássia Gôngora Goçalo. Análise do comporrtamento natatório de larvas de peixes marinhos com técnicas de imageamento de alta frequência. 2016. Tese (Doutorado em Oceanografia (Oceanografia Biológica)) - Universidade de São Paulo.

2.
LOPES R. M.; FLORES, A. A. V.; TAVARES, M. D. S.; CALAZANS, D. K.; FERNANDES, L. D. A.. Participação em banca de Andréa Green Koettker. Composição e distribuição das larvas de invertebrados bênticos do Banco de Abrolhos e região adjacente, com ênfase em larvas de caranguejos branquiúros. 2014. Tese (Doutorado em Oceanografia (Oceanografia Biológica)) - Universidade de São Paulo.

3.
LOPES R. M.; KATSURAGAWA, Mario; LEITAO, S. N.; GUSMAO, L. F. M.; SUZUKI, B. K.. Participação em banca de José Eduardo Martinelli Filho. Variação temporal e crescimento do zooplâncton no litoral norte de São Paulo, com ênfase em estágios imaturos de copépodes. 2013. Tese (Doutorado em Oceanografia (Oceanografia Biológica)) - Universidade de São Paulo.

4.
LOPES R. M.; SUMIDA, P. Y.; GUSMAO, L. F. M.; GASALLA, M. A.; BARRERA-ALBA, J. J.. Participação em banca de Catarina da Rocha Marcolin. Espectro de tamanho e biomassa do plâncton e de partículas no Atlântico Sudoeste: Estudos de caso em áreas tropicais e subtropicais. 2013. Tese (Doutorado em Oceanografia (Oceanografia Biológica)) - Universidade de São Paulo.

5.
BRINATI, H. L.; CONTI, M. B.; LOPES R. M.; SZAJNBOK, M.; PROCOPIAK, L. K.. Participação em banca de Newton Narciso Pereira. Alternativas de tratamento da água de lastro em portos exportadores de minério de ferro. 2012. Tese (Doutorado em Engenharia Naval e Oceânica) - Universidade de São Paulo.

6.
MARQUES, ANTONIO CARLOS; MIGOTTO, A. E.; ROCHA, R. M.; LOPES R. M.; MORANDINI, A. C.. Participação em banca de JULIANA BARDI. Comunidades de hidrozoários (Cnidaria) estuarinos do sudeste e sul do Brasil. 2011. Tese (Doutorado em Zoologia - IB/USP) - Universidade de São Paulo.

7.
THOMPSON, FABIANO LOPES; SILVEIRA, W. D.; MATTE, G. R.; LOPES R. M.; KRUGER, R. H.. Participação em banca de Luciane Alessandra Chimetto Tonon. Taxonomia de procariontes isolados de cnidários de São Sebastião, SP, Brasil. 2010. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

8.
Thompson, F.L.; LOPES R. M.; VICENTE, E. J.; MAYER, M. P. A.; RIVERA, I. N. G.. Participação em banca de Caroline Viana Markman. Caracterização de Vibrio cholerae, V. parahaemolyticus e V. vulnificus, em amostras da região costeira do Estado de São Paulo, de regiões portuárias brasileiras e de tanques de lastro de navios. 2009. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Microbiologia)) - Universidade de São Paulo.

9.
RIVERA, I. N. G.; VICENTE, E. J.; AZEVEDO, J. L.; LOPES R. M.; BARRETO, C. C.. Participação em banca de Claudiana Paula de Souza Sales. Diversidade de bactérias quitinolíticas isoladas em amostras de água do mar e plâncton, coletadas na região costeira do Estado de São Paulo. 2009. Tese (Doutorado em Interunidades em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.

10.
LOPES R. M.; SCHWAMBORN, R.; ESKINAZI-SANT'ANNA, E. M.; BRANDINI, F. P.; ROCHA, O.. Participação em banca de MAURO DE MELLO JUNIOR. Produção secundária e aspectos reprodutivos de copépodes pelágicos ao largo de Ubatuba (SP, Brasil). 2009. Tese (Doutorado em Oceanografia Biológica) - Universidade de São Paulo.

11.
VALENTIN, Jean Louis; BONECKER, S.; LOPES R. M.; JUNQUEIRA, Andrea; FIGUEIREDO, G.. Participação em banca de Suzane da Silva Barros da Fonseca. Cladóceros (Crustacea: Branchiopoda) na Baía de Guanabara (RJ, Brasil): distribuição, aspectos reprodutivos e sucesso de eclosão. 2007. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Zoologia)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

12.
RIVERA, I.; FERNANDES, F. C.; LOPES R. M.; MAYER, M. P. A.; CASTRO, A. F. P.. Participação em banca de Keili Maria Cardoso de Souza. Qualidade microbiológica da água de lastro de navios, água e bivalves da região portuária brasileira, com ênfase na detecção, pesquisa de fatores associados à virulência e epidemiologia molecular de Vibrio cholerae O1. 2007. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Microbiologia)) - Universidade de São Paulo.

13.
JABLONSKY, S.; LOPES R. M.. Participação em banca de Alexandre de Carvalho Leal Neto. Identificando similaridades: uma aplicação para a avaliação de riscos de água de lastro. 2007. Tese (Doutorado em Planejamento Energético) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

14.
ROCHA, Carlos Eduardo Falavigna da; LOPES R. M.; KIHARA, Terue; BRANDIMARTE, A. L.; ANAYA, M.. Participação em banca de Luciana Paes de Andrade. Distribuição espacial e estrutura da comunidade de crustáceos de águas intersticiais de um igarapé amazônico e um riacho da mata atlântica. 2007. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Zoologia)) - Universidade de São Paulo.

15.
VALENTIN, Jean Louis; LOPES R. M.. Participação em banca de Claudio Leandro Gomes. O mesozooplâncton da Baía de Guanabara: distribuição temporal dos principais grupos e produção de duas espécies de Copepoda dominantes. 2007. Tese (Doutorado em Ecologia) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

16.
GORRI, C.; BERSANO FILHO, J. G.; LOPES R. M.; BEMVENUT, C. E.; ODEBRECHT, Clarisse; CALAZANS, D.; MUELBERT, José H. Participação em banca de Charles Gorri. Composição, abundância e variação sazonal de copépodes capturados na zona de arrebentação da Praia do Cassino-RS, Brasil (32º11'S, 52º05'W) com ênfase no aspecto reprodutivo e alimentar do Calanoida Parvocalanus crassirostris (Dahl, 1894). 2006. Tese (Doutorado em Oceanografia Biológica) - Universidade Federal do Rio Grande.

17.
CONTADOR, C. R. B.; OLIVEIRA FILHO, E.; BERCHEZ, F.A.S.; PLASTINO, E. M.; CUNHA, S. R.; LOPES R. M.. Participação em banca de Cristian Rúben Bulboa Contador. Bases bio-tecnológicas para o cultivo de Chondracanthus chamissoi, uma alga vermelha de importância econômica da costa chilena. 2006. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Botânica)) - Universidade de São Paulo.

18.
PELLIZZARI, F. M.; OLIVEIRA, Eurico Cabral de; PLASTINO, E. M.; CHOW HO, F. F.; LOPES R. M.; REIS, R. P.. Participação em banca de Franciane Maria Pellizzari. Desenvolvimento das bases biológicas e de técnicas para o cultivo de algas verdes de talo monostromático (Chlorophyta) no litoral do Paraná, sul do Brasil. 2005. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Botânica)) - Universidade de São Paulo.

19.
SILVEIRA, Fábio Lang da; LOPES R. M.; BJORNBERG, T. K. S.; MIGOTTO, Álvaro Esteves; PEREIRA, Denise Navas. Participação em banca de André Carrara Morandini. Estrutura populacional de Chrysaora lactea e Lychnorhiza lucerna (Cnidaria, Scyphozoa) em amostras de plâncton, com a redescrição das espécies.. 2003. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Zoologia)) - Universidade de São Paulo.

20.
PAIVA FILHO, Alfredo Martins; LOPES R. M.; KATSURAGAWA, Mario; SOARES, Lucy Satiko Hashimoto; GOITEIN, Roberto. Participação em banca de Eduardo Masami Kitahara. Distribuição horizontal, crescimento e mortalidade das larvas de Gobionellus oceanicus, Achirus linneatus e Scartella cristata do complexo estuarino-lagunar de Cananéia, SP, e aspectos relacionados aos seus recrutamentos. 2000. Tese (Doutorado em Oceanografia (Oceanografia Biológica)) - Universidade de São Paulo.

21.
BRANDINI, F. P.; LOPES R. M.; SPACH, Henry Louis; VALENTIN, Jean Louis; BOLTOVSKOY, D.. Participação em banca de Luciano Felício Fernandes. Taxonomia, distribuição e biomassa dos tintínidos (Protozoa - Ciliophora - Subordem Tintinnina), e microplâncton associado, entre o Rio de Janeiro e a Península Antártica. 1998. Tese (Doutorado em Zoologia) - Universidade Federal do Paraná.

Qualificações de Mestrado
1.
HIRATA, NINA S.T.; MIRANDA, P. A. V.; LOPES R. M.. Participação em banca de Mariela Atausinchi Fernandez. Metodologia para a classificação de imagens de plâncton obtidas por um Sistema de Monitoramento Contínuo. 2015. Exame de qualificação (Mestrando em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo.

2.
ROBERTO, H. J.; LOPES R. M.; Jackowski, Marcel P.. Participação em banca de Jefferson Serafim Ascaneo. Um estudo de algoritmos de reconstrução, focalização e segmentação de imagens de holografia digital para o aprimoramento da classificação de organismos planctônicos.. 2014. Exame de qualificação (Mestrando em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo.

3.
LOPES R. M.. Participação em banca de Damian Janusz Matuszewski. Visão computacional para o monitoramento contínuo de plâncton. 2013. Exame de qualificação (Mestrando em Estatística) - Universidade de São Paulo.

Monografias de cursos de aperfeiçoamento/especialização
1.
LOPES R. M.; SUSINI RIBEIRO, S. M.; ROCHA, G. R. A.. Participação em banca de Crissy Dantas Dias. Biologia e Ecologia do Zooplâncton - Textos. 2001. Monografia (Aperfeiçoamento/Especialização em Especialização Em Oceanografia) - Universidade Estadual de Santa Cruz.

Trabalhos de conclusão de curso de graduação
1.
LOPES R. M.. Participação em banca de Aurore Bénidelune Lambert.Estudo do efeito do ultrassom nas bioincrustações em substratos artificiais em ambientes aquáticos. 2015. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia Naval) - Universidade de São Paulo.

2.
LOPES R. M.. Participação em banca de Marcia Akari Yoshida.Análise de trajetórias de natação como ferramenta de avaliação de comportamento natatório em Daphnia similis. 2015. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Oceanografia) - Universidade de São Paulo.

3.
LOPES R. M.. Participação em banca de Elisa Van Sluys Menck.Diagnóstico e monitoramento de lixo marinho submerso no Arquipélago dos Alcatrazes. 2015. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Oceanografia) - Universidade de São Paulo.

4.
LOPES R. M.. Participação em banca de Gabriel Ruske de Freitas.Produção primária marinha do Saco do Mamanguá (RJ) em relação aos parâmetros ambientais: a contribuição do picofitoplâncton. 2014. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Oceanografia) - Universidade de São Paulo.

5.
LOPES R. M.. Participação em banca de Alessandra Colombo Simões Gomes.Determinação da velocidade de afundamento de microalgas marinhas utilizando métodos ópticos inovadores. 2013. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Oceanografia) - Universidade de São Paulo.

6.
LOPES R. M.. Participação em banca de Thalles Augusto Abreu Araújo.Relação entre ondas de Rossby e variações na concentração de clorofila no Atlântico Sul. 2013. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Oceanografia) - Universidade de São Paulo.

7.
LOPES R. M.. Participação em banca de Silvia de Almeida Gonsales.Descrição e caracterização morfológica das fases larval e de transformação de Cynoscion microlepidotus (Sciaenidae: Teleostei). 2012. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Oceanografia) - Universidade de São Paulo.

8.
LOPES R. M.. Participação em banca de Eduardo Giuseppe Rigoglio.Estudo da similaridade ambiental entre áreas portuárias que mantém movimentação de embarcações dirigidas ao Porto de Santos (SP) e observações sobre suas espécies invasoras potenciais. 2011. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Oceanografia) - Universidade de São Paulo.

9.
LOPES R. M.. Participação em banca de Luis Fabiano Baldasso.Explorando camadas finas: Respostas natatórias de Temora turbinata (Copepoda, Calanoida) a agregados de microalgas tóxicas e não tóxicas. 2011. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Oceanografia) - Universidade de São Paulo.

10.
LOPES R. M.. Participação em banca de Naira Juliana da Silva.Influência do dinoflagelado potencialmente nocivo Prorocentrum minimum (Pavillard) Schiller 1933 na alimentação e reprodução do copépode planctônico marinho Acartia lilljeborgi (Giesbrecht, 1889.. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Oceanografia) - Universidade de São Paulo.

11.
LOPES R. M.. Participação em banca de Thais Bucci Francisco.Avaliação quali-quantitativa da comunidade fitoplanctônica na região da plataforma continental de Santos. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Oceanografia) - Universidade de São Paulo.

12.
LOPES R. M.; LEMOS, D.; GASALLA, M. A.. Participação em banca de André Liewton de Moura Germano.Avaliação de risco da introdução de espécies aquáticas por água de lastro no porto de Santos (SP) utilizando um método integrativo. 2007. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Oceanografia) - Universidade de São Paulo.

13.
LOPES R. M.; ROCHA, Carlos Eduardo Falavigna da. Participação em banca de Leonardo Kenji Miyashita.Produção secundária de copépodes pelágicos na plataforma interna de Santos. 2007. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Oceanografia) - Universidade de São Paulo.

14.
LOPES R. M.. Participação em banca de Leonardo Kenji Miyashita.Composição, biomassa e produção dos copépodes pelágicos na plataforma interna de Santos. 2007. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Oceanografia) - Universidade de São Paulo.

15.
LOPES R. M.; RODRIGUES, Misael Domingues; GABRIELLI, Mario Artur. Participação em banca de Valéria Aparecida Bello.Distribuição vertical diária do zooplâncton em uma estação fixa no Canal de São Sebastião (Estado de São Paulo). 1990. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual de Londrina.



Participação em bancas de comissões julgadoras
Concurso público
1.
VALENTIN, Jean Louis; BRANDINI, F. P.; LOPES R. M.; MUELBERT, José H. Banca Examinadora do Concurso Público para admissão de Professor Adjunto no Depto de Biologia Marinha - Instituto de Biologia. 2005. Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Outras participações
1.
LOPES R. M.. Membro titular da Comissão Examinadora da etapa única de qualificação da aluna Janete D. da Silva. 1998. Universidade Federal do Paraná.



Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
2nd Meeting of the SCOR Working Group on Automatic Visual Plankton Identification.Use of the Laser Optical Plankton Counter and the Zooscan to determine zooplankton community structure. 2008. (Oficina).

2.
III Congresso Brasileiro de Oceanografia. Variações na comunidade zooplanctônica em 2 transectos no Complexo Estuarino de Paranaguá. 2008. (Congresso).

3.
15o. Simpósio Internacional de Iniciação Científica da USP.Diferenças na composição, densidade e biomassa de copépodes pelágicos entre as malhas de 64 e 300 um. 2007. (Simpósio).

4.
1st Meeting of the SCOR Working Group on Automatic Visual Plankton Identification.SCOR WG 130. 2007. (Oficina).

5.
II Semana Temática de Oceanografia."Antártica no Polarstern" e "Proabrolhos" - exposições fotográficas. 2007. (Encontro).

6.
IV International Zooplankton Production Symposium.Coupling of Calanoides carinatus production with SACW intrusions off the Southeastern Brazilian shelf. 2007. (Simpósio).

7.
Plankton Symposium IV e I Congresso Brasileiro de Plâncton.Plankton Symposium IV e I Congresso Brasileiro de Plâncton. Copepod production on the inner shelf off Santos (Southeastern Brazil). 2007. (Congresso).

8.
14o. Simpósio Internacional de Iniciação Científica da USP.Taxa de Produção dos Copépodes Pelágicos na Plataforma Interna ao Largo de Santos. 2006. (Simpósio).

9.
20a. Reunião Ordinária da CONABIO - Comissão Nacional da Biodiversidade.Avaliação de Cenários de Risco para a Introdução de Espécies Exóticas Marinhas no Brasil - Perspectivas para 2010. 2006. (Outra).

10.
Ecology Seminar Series..Biology of sapphirinid copepods with emphasis on life cycle estrategies and egg production. 2006. (Seminário).

11.
I Congresso Brasileiro de Biologia Marinha. A world record in egg production by a egg-carrying copepod. 2006. (Congresso).

12.
III Simpósio Brasileiro de Oceanografia.Biomassa de copépodes pelágicos na plataforma adjacente à Baixada Santista (São Paulo, Brasil). 2006. (Simpósio).

13.
IV Seminário Brasileiro Sobre Água de Lastro.Informe Nacional Sobre Espécies Exóticas Invasoras, Ambiente Marinho: Síntese dos Resultados. 2006. (Seminário).

14.
Seminar- Fugro Pelagos International Office.The PRO-ABROLHOS project: a comprehensive study of the Abrolhos Reefs ecosystem. 2006. (Seminário).

15.
II Congresso Brasileiro de Oceanografia. Informe nacional sobre espécies exóticas invasoras no ambiente marinho: principais resultados. 2005. (Congresso).

16.
Informe Nacional sobre Espécies Exóticas e Invasoras no Ambiente Marinho. II Congresso Brasileiro de Oceanografia. 2005. (Congresso).

17.
I Semana de Biologia da UFBA.Bioinvasão por àgua de Lastro. 2005. (Outra).

18.
OBIS Managers Committee Meeting.OBIS Activities in South America. 2005. (Encontro).

19.
Projeto RUMO 2005.Profissão Oceanografia. 2005. (Encontro).

20.
ZooImage - a GLOBEC / SPACC workshop on Image analysis to count and identify zooplankton. 2005. (Oficina).

21.
3rd Brazilian Crustacean Congress & The Crustacean Society Meeting. Characterization of copepod assemblages in ballast water tanks of vessels operating in Brazilian ports. 2004. (Congresso).

22.
III Seminário Brasileiro sobre Água de Lastro.Informe sobre as Espécies Exóticas Invasoras no Brasil (PROBIO/MMA), subprojeto: Organismos que Afetam o Ambiente Marinho. 2004. (Seminário).

23.
III Seminário Brasileiro sobre Água de Lastro.Análise Rápida do Plâncton (ARP): Uma Ferramenta para identificar a Origem Ambiental da Água de Lastro. 2004. (Seminário).

24.
II Simpósio Brasileiro de Oceanografia.Alta produção de ovos por Sapphirina angusta Dana, 1849 ao largo de Cabo Frio (RJ). 2004. (Simpósio).

25.
Água de Lastro: Impactos sobre o Ecossistema e a Saúde Pública.Ciclo de Seminários do Departamento de Oceanografia Biológica - IOUSP. 2003. (Seminário).

26.
ASLO 2003 Aquatic Sciences Meeting. Planktonic trophic cascades in the Southern Brazilian Bight. 2003. (Congresso).

27.
Comparação multianual da composição e abundância do zooplâncton do sistema estuarino da Baía de Paranaguá.11º. Simpósio Internacional de Iniciação Científica da USP. 2003. (Simpósio).

28.
Influence of physical processes on zooplankton and ichthyoplankton distribution: a review of studies in the southern Brazilian shelf.Third International Zooplankton Production Symposium. 2003. (Simpósio).

29.
Projeto Água de Lastro.Semana do Meio Ambiente, Centro Universitário Monte Serrat (UNIMONTE). 2003. (Outra).

30.
Água de Lastro de Navios: Uma Ameaça à Biodiversidade em Ecossistemas Aquáticos.XVII Simpósio de Biologia Marinha. 2002. (Simpósio).

31.
Caracterização da Água de Lastro para Identificação de sua Origem e Verificação da Troca Oceânica.II Seminário Brasileiro Sobre Água de Lastro. 2002. (Seminário).

32.
Comunidades Planctônicas no Porto de Paranaguá, Paraná: Taxonomia e Biogeografia de Espécies Nocivas e Invasoras.II Seminário Brasileiro sobre Água de Lastro. 2002. (Seminário).

33.
Micro-crustáceos em Água de Lastro de Navios: Implicações para a Biodiversidade e Saúde Pública. II Congresso Brasileiro Sobre Crustáceos. 2002. (Congresso).


Organização de eventos, congressos, exposições e feiras
1.
LOPES R. M.; STRICKLER, J. R. . Curso Internacional: Scaling the effects of climate change on marine zooplankton. 2009. (Outro).

2.
LOPES R. M.. 2nd SCOR WG 130 Meeting. 2008. (Outro).

3.
SARAIVA, E. S. B. ; GOMES, V. ; LOPES R. M. ; SUMIDA, P. Y. ; POLITO, P. ; COSTA, K. ; CUNNINGHAM, Patricia . III Simpósio Brasileiro de Oceanografia. 2006. (Congresso).

4.
LOPES R. M.. I Simpósio Brasileiro sobre Espécies Exóticas Invasoras. 2005. (Congresso).

5.
Campos, E. ; LOPES R. M. ; Wainer, I. . II Simpósio Brasileiro de Oceanografia. 2004. (Congresso).

6.
LOPES R. M.; DAM, H. G. ; MANUS, G. M. ; TANG, K. . Curso: "Experimental approaches in marine zooplankton ecology: Concepts and strategies towards global change research". 2004. (Outro).

7.
LOPES R. M.. 7th International Conference on Copepoda. 1999. (Congresso).



Orientações



Orientações e supervisões em andamento
Dissertação de mestrado
1.
Cláudia Guimarães. Avaliação do efeito do ultrasson sobre larvas meroplanctônicas em fase de assentamento. Início: 2017. Dissertação (Mestrado em Oceanografia (Oceanografia Biológica)) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Orientador).

2.
Carolina Fonseca Maciel. Análise da influência de substância de referência na natação de microcrustáceos zooplanctônicos marinhos e dulcículas: um enfoque comportamental. Início: 2016. Dissertação (Mestrado em Oceanografia (Oceanografia Biológica)) - Universidade de São Paulo. (Orientador).

Tese de doutorado
1.
Gelaysi Moreno Vega. Aplicação de técnicas holográficas ao estudo de camadas finas do plâncton. Início: 2018. Tese (Doutorado em OCEANOGRAFIA) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Orientador).

2.
Luciana Rocha Frazão. Avaliação de aspectos fisiológicos do fitoplâncton exposto a compostos emergentes (PPCPs): desenvolvimento de método e aplicação em Análise de Risco Ecológico (ARE). Início: 2018. Tese (Doutorado em OCEANOGRAFIA) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Orientador).

3.
Silvana Simone Batista Penninck. Relações entre camadas finas de fitoplâncton e condições ambientais no ecossistema costeiro de Ubatuba. Início: 2017. Tese (Doutorado em OCEANOGRAFIA) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Orientador).

Supervisão de pós-doutorado
1.
Adrian John Bunker. Início: 2017. Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior.

2.
Damián Mizrahi. Início: 2017. Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior.


Orientações e supervisões concluídas
Dissertação de mestrado
1.
Alessandra Colombo Simões Gomes. Desenvolvimento e utilização de um novo sistema submersível de imageamento e visão computacional para o estudo da dinâmica de partículas na Enseada do Flamengo, Ubatuba/SP.. 2018. Dissertação (Mestrado em Oceanografia (Oceanografia Biológica)) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rubens Mendes Lopes.

2.
Yonara Garcia Borges Felipe. Motilidade da associação entre uma diatomácea cêntrica e um ciliado peritríquio e suas possíveis consequências ecológicas.. 2018. Dissertação (Mestrado em Oceanografia (Oceanografia Biológica)) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rubens Mendes Lopes.

3.
Maiá Gomes Medeiros. Desenvolvimento de uma instrumentação de captura de imagens in situ para estudo da distribuição vertical do plâncton. 2017. Dissertação (Mestrado em OCEANOGRAFIA) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Rubens Mendes Lopes.

4.
Luis Fabiano Baldasso. Deslocamento seletivo induzido do zooplâncton marinho em resposta a percepção espectral da luz visível. 2016. Dissertação (Mestrado em Oceanografia (Oceanografia Biológica)) - Universidade de São Paulo, . Orientador: Rubens Mendes Lopes.

5.
Izadora De La Volpe Mattiello. Avaliação de corantes para a detecção da viabilidade do fitoplâncton marinho. 2014. Dissertação (Mestrado em OCEANOGRAFIA) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Rubens Mendes Lopes.

6.
Naira Juliana da Silva. Influência de dinoflagelados potencialmente nocivos sobre o zooplâncton de uma região costeira subtropical: uma abordagem experimental. 2013. Dissertação (Mestrado em Oceanografia (Oceanografia Biológica)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Rubens Mendes Lopes.

7.
Tulia Isabel Martinez Aguilar. Distribuição espacial e sazonal de grupos do microzooplâncton na Bacia de Campos em cinco massas de água, da superfície ao batipelagial. 2013. Dissertação (Mestrado em Oceanografia (Oceanografia Biológica)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Rubens Mendes Lopes.

8.
Leonardo Kenji Miyashita. Produção secundária de Cladocera e Apendicullaria no litoral norte de São Paulo. 2010. Dissertação (Mestrado em Oceanografia (Oceanografia Biológica)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Rubens Mendes Lopes.

9.
Viviane Gonzaga dos Santos. Distribuição espaço-temporal do zooplâncton no estuário do rio Maraú, Baía de Camamu - BA. 2009. Dissertação (Mestrado em Sistemas Aquáticos Tropicais) - Universidade Estadual de Santa Cruz, . Coorientador: Rubens Mendes Lopes.

10.
Camila Rodrigues Cabral. Análise da estrutura e transporte do zooplâncton no estuário no rio Caravelas (Bahia-Brasil) através do uso do zooscan. 2009. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, . Coorientador: Rubens Mendes Lopes.

11.
Daniela Rimoldi Cunha. Estudo comparativo dos copépodes Temora stylifera e T. turbinata na plataforma continental sudeste do Brasil no verão e inverno de 2002. 2008. Dissertação (Mestrado em Oceanografia (Oceanografia Biológica)) - Universidade de São Paulo, . Orientador: Rubens Mendes Lopes.

12.
José Eduardo Martinelli Filho. Caracterização microbiológica e ecológica da associação entre microcrustáceos planctônicos e Vibrio cholerae na região de Santos e plataforma adjacente. 2007. 0 f. Dissertação (Mestrado em Oceanografia (Oceanografia Biológica)) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rubens Mendes Lopes.

13.
Lilian Prescinoti de Oliveira. Distribuição espaço-temporal de espécies das Famílias Salpidae e Doliolidae na região de Cabo Frio (RJ), nos períodos de verão e inverno de 2002. 2007. Dissertação (Mestrado em Oceanografia (Oceanografia Biológica)) - Universidade de São Paulo, . Orientador: Rubens Mendes Lopes.

14.
Adriana Rachel de Moraes Crété. Distribuição e produção estimada do copépode Calanoides carinatus (Kroyer, 1849) na Plataforma Continental Sudeste Brasileira. 2006. 0 f. Dissertação (Mestrado em Oceanografia (Oceanografia Biológica)) - Universidade de São Paulo, . Orientador: Rubens Mendes Lopes.

15.
Luciana Pinto Sartori. Distribuição espacial e variação sazonal dos copépodes pelágicos na plataforma continental interna do Paraná. 2000. 0 f. Dissertação (Mestrado em Zoologia) - Universidade Federal do Paraná, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Rubens Mendes Lopes.

16.
Ricardo Lins de Barros Essenfelder Abrahão. Variação diária do zooplâncton no Canal da Galheta, Baía de Paranaguá, Brasil.. 1999. 0 f. Dissertação (Mestrado em Zoologia) - Universidade Federal do Paraná, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rubens Mendes Lopes.

17.
Rosinei do Vale. Taxas de produção de ovos pelo copépode estuarino Acartia tonsa na Baía de Paranaguá.. 1998. 0 f. Dissertação (Mestrado em Zoologia) - Universidade Federal do Paraná, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rubens Mendes Lopes.

Tese de doutorado
1.
Cássia Gongora Goçalo. Análise do comportamento natatório de larvas de peixes marinhos com técnicas de imageamento de alta frequência. 2015. Tese (Doutorado em Oceanografia Biológica) - Universidade de São Paulo, . Orientador: Rubens Mendes Lopes.

2.
Andrea Green Koettker. Composição e distribuição das larvas de invertebrados bênticos do Banco dos Abrolhos e região adjacente, com ênfase em larvas de caranguejos branquiúros. 2013. Tese (Doutorado em Oceanografia (Oceanografia Biológica)) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rubens Mendes Lopes.

3.
Catarina Marcolin. Plankton and particle biomass size spectra on the Southwest Atlantic: Case studies in tropical and subtropical areas. 2013. Tese (Doutorado em Oceanografia Biológica) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rubens Mendes Lopes.

4.
José Eduardo Martinelli Filho. Taxas de crescimento e produção secundária de estágios imaturos de copépodes. 2013. Tese (Doutorado em Oceanografia (Oceanografia Biológica)) - Universidade de São Paulo, . Orientador: Rubens Mendes Lopes.

5.
Mauro de Melo Junior. Produção secundária e aspectos reprodutivos de copépodes pelágicos ao largo de Ubatuba (SP, Brasil). 2009. Tese (Doutorado em Oceanografia (Oceanografia Biológica)) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Rubens Mendes Lopes.

6.
Dacha Atienza Ariznavarreta. Growth and feeding of marine cladocera. 2004. Tese (Doutorado em Oceanografia) - Instituto de Ciencias do Mar/Barcelona, . Coorientador: Rubens Mendes Lopes.

Supervisão de pós-doutorado
1.
Cássia Gôngora Goçalo. 2017. Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Rubens Mendes Lopes.

2.
Fernando Gómez Perez. Biodiversidade e filogenia molecular de micróbios eucariontes marinhos. 2016. Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Rubens Mendes Lopes.

3.
Rafaella Brasil Bastos. 2016. Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Rubens Mendes Lopes.

4.
Filippo Giovanni Ghiglieno. Pesquisa aplicada em holografia para análise de imagens do plâncton. 2014. Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Rubens Mendes Lopes.

5.
Eduardo Masami Kitahara. 2009. Universidade de São Paulo, . Rubens Mendes Lopes.

6.
Sabine Gerda Kunigundes Schultes. 2008. Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Rubens Mendes Lopes.

Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização
1.
Crissy Dantas Dias. Biologia e Ecologia do Zooplâncton - Textos. 2001. 0 f. Monografia. (Aperfeiçoamento/Especialização em Especialização Em Oceanografia) - Universidade Estadual de Santa Cruz. Orientador: Rubens Mendes Lopes.

2.
Valéria Aparecida Bello. Distribuição vertical diária do zooplâncton em uma estação fixa do Canal de São Sebastião (Estado de São Paulo) durante a primavera. 1991. Monografia. (Aperfeiçoamento/Especialização em biologia animal e vegetal) - Universidade Estadual de Londrina. Orientador: Rubens Mendes Lopes.

Trabalho de conclusão de curso de graduação
1.
Philippe Augusto Alves Guieiro. Diel and seasonal variation in gut pigment content of copepods in Paranagua Bay, Brazil. 2016. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Oceanografia) - Universidade de São Paulo. Orientador: Rubens Mendes Lopes.

2.
Bruno Ogata. Assessment of a new software for semi-automatic analysis of digital images of zooplankton.. 2016. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho. Orientador: Rubens Mendes Lopes.

3.
Marcia Akari Yoshida. Análise de trajetórias de natação como ferramenta de avaliação de comportamento natatório em Daphnia similis. 2015. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Oceanografia) - Universidade de São Paulo. Orientador: Rubens Mendes Lopes.

4.
Aurore Bénidelune Lambert. Estudo do efeito do ultrassom nas bioincrustações em substratos artificiais em ambientes aquáticos. 2015. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Abi - Engenharia) - Universidade de São Paulo. Orientador: Rubens Mendes Lopes.

5.
Alessandra Colombo Simões Gomes. Determinação da velocidade de afundamento de microalgas marinhas utilizando métodos ópticos inovadores. 2013. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Oceanografia) - Universidade de São Paulo. Orientador: Rubens Mendes Lopes.

6.
Luis Fabiano Baldasso. Explorando camadas finas: Respostas natatórias de Temora turbinata (Copepoda, Calanoida) a agregados de microalgas tóxicas e não tóxicas. 2010. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Oceanografia) - Universidade de São Paulo. Orientador: Rubens Mendes Lopes.

7.
Tathiane Alves da Silva. Resposta temporal da comunidade zooplanctônica às variações ambientais em uma estação fixa ao largo de Ubatuba (SP, Brasil). 2010. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Oceanografia) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rubens Mendes Lopes.

8.
Naira Juliana da Silva. Influência do fitoplâncton potencialmente nocivo Prorocentrum minimum (Pavillard) Schiller 1933 na alimentação e reprodução do copépode planctônico marinho Acartia lilljeborgi (Giesbrecht, 1889). 2009. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Oceanografia) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Rubens Mendes Lopes.

9.
Leonardo Kenji Miyashita. Distribuição e produção do zooplâncton no ecossistema costeiro ao largo de Santos. 2007. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Oceanografia) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Rubens Mendes Lopes.

10.
Eduardo Giuseppe Rigoglio. Estudo da similaridade ambiental entre áreas portuárias que mantêm movimentação de embarcações dirigidas ao Porto de Santos (SP) e observações sobre suas espécies invasoras potenciais. 2007. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Oceanografia) - Universidade de São Paulo. Orientador: Rubens Mendes Lopes.

11.
André Liewton de Moura Germano. Avaliação de risco da introdução de espécies aquáticas por água de lastro no Porto de Santos (SP) utilizando um método integrativo. 2006. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Oceanografia) - Universidade de São Paulo. Orientador: Rubens Mendes Lopes.

12.
Crissy Dantas Dias. Biologia e ecologia do zooplâncton marinho: textos. 2001. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual de Santa Cruz. Orientador: Rubens Mendes Lopes.

13.
Valéria Aparecida Bello. Distribuição vertical diária do zooplâncton em uma estação fixa do Canal de São Sebastião (Estado de São Paulo) durante a primavera. 1991. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Biologia Animal e Vegetal) - Universidade Estadual de Londrina. Orientador: Rubens Mendes Lopes.

Iniciação científica
1.
Tathiane Alves da Silva. Relação entre zooplâncton e algas nocivas no litoral norte de São Paulo: variabilidade espaço-temporal, co-ocorrência e forçantes ambientais" e ?Comunidade zooplanctônica e sua resposta temporal frente às variações ambientais ao largo de Ubatuba (SP, Brasil). 2011. Iniciação Científica. (Graduando em Oceanografia) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rubens Mendes Lopes.

2.
Naira Juliana da Silva. "Proporção de copépodes planctônicos vivos e mortos na plataforma interna adjacente à Ilha Anchieta (Ubatuba, SP)" e "Proporção de copépodes planctônicos vivos e mortos na região de Ubatuba, São Paulo". 2008. Iniciação Científica. (Graduando em Oceanografia) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rubens Mendes Lopes.

3.
Leonardo Kenji Miyashita. Produção secundária na plataforma continental ao largo de Santos (SP): utilização de um sistema inovador de processamento de amostras de zooplâncton. 2007. Iniciação Científica. (Graduando em Oceanografia) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rubens Mendes Lopes.

4.
Ananda Marson Silva. Ecologia do zooplâncton em ambientes estuarinos e costeiros do litoral sul da Bahia. 2001. Iniciação Científica. (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual de Santa Cruz. Orientador: Rubens Mendes Lopes.

5.
Thais Bonfim de Santana. Ecologia do zooplâncton em ambientes estuarinos e costeiros do litoral sul da Bahia. 2001. Iniciação Científica. (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual de Santa Cruz, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rubens Mendes Lopes.

6.
Jaqueline D. B. Netto. xxxxxxxxxxxxxxx. 1997. Iniciação Científica. (Graduando em Oceanografia) - Universidade Federal do Paraná, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rubens Mendes Lopes.

7.
Rosinei do Vale. Zooplâncton do ecossistema estuarino da Baía de Paranaguá: Estrutura e dinâmica da comunidade, com ênfase em interações trófic. 1994. Iniciação Científica. (Graduando em Abi - Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Paraná. Orientador: Rubens Mendes Lopes.

8.
Ricardo Lins Barros E. Abrahão. Zooplâncton do ecossistema estuarino da Baía de Paranaguá: Estrutura e dinâmica da comunidade, com ênfase em interações tróficas. 1993. Iniciação Científica. (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Paraná. Orientador: Rubens Mendes Lopes.

9.
Angélica Maria Kazue Uejima. Zooplâncton do Canal de São Sebastião (SP). 1991. Iniciação Científica. (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual de Londrina. Orientador: Rubens Mendes Lopes.

10.
Joseane Balan da Silva. Composição e distribuição do zooplâncton do Rio Tibagi. 1991. Iniciação Científica. (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual de Londrina. Orientador: Rubens Mendes Lopes.

11.
Cleber Ibraim Salimon. Composição e distribuição do zooplâncton do Rio Tibagi. 1990. Iniciação Científica. (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual de Londrina. Orientador: Rubens Mendes Lopes.

Orientações de outra natureza
1.
Cláudia Guimarães. Avaliação do efeito do ultrasson sobre larvas meroplanctônicas em fase de assentamento. 2015. Orientação de outra natureza - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rubens Mendes Lopes.



Inovação



Projetos de pesquisa



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