Jorge Chahine

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  • Última atualização do currículo em 28/01/2014


Possui graduação em Física pela Universidade de São Paulo(1977), mestrado em Física pela Universidade de São Paulo(1984), doutorado em Física pela Universidade de São Paulo(1990) e pós-doutorado pela University of California System(1999). Atualmente é Professor Adjunto da Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Revisor de periódico da Applied Mathematics and Computation e Revisor de periódico da Journal of Chemical Information and Modeling (Online). Tem experiência na área de Física, com ênfase em Física da Matéria Condensada. Atuando principalmente nos seguintes temas:Enovelamento de Proteínas, Simulação Computacional. (Texto gerado automaticamente pela aplicação CVLattes)


Identificação


Nome
Jorge Chahine
Nome em citações bibliográficas
CHAHINE, J.

Endereço


Endereço Profissional
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, Departamento de Física.
Rua Cristovão Colombo, 2265
Jardim Nazareth
15054000 - Sao Jose do Rio Preto, SP - Brasil
Telefone: (17) 32212240
Ramal: 2461
Fax: (17) 32212247
URL da Homepage: http://www.ibilce.unesp.br


Formação acadêmica/titulação


2007
Livre-docência.
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.
Título: Simulações computacionais de em modelos de proteínas: Mecanismos de enovelamento e dimerização e estudo do papel da difusão no enovelamento., Ano de obtenção: 2007.
Palavras-chave: Enovelamento de Proteínas; Simulação Computacional.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Física da Matéria Condensada / Especialidade: Equação de Estado, Equilíbrio de Fases e Transições de Fase.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Biofísica Molecular.
1997 - 1999
Pós-Doutorado.
University of California System, UC System, Estados Unidos.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Física da Matéria Condensada / Especialidade: Equação de Estado, Equilíbrio de Fases e Transições de Fase.
1986 - 1990
Doutorado em Física.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: Método de Monte Carlo com evolução no espaço de parâmetros, Ano de obtenção: 1990.
Orientador: José Roberto Drugowich de Felicio.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
Palavras-chave: Sistemas de Spin; Transição de Fase; Simulações Monte Carlo; Grupo de Renormalização; Expoentes Criticos.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Física da Matéria Condensada / Especialidade: Equação de Estado, Equilíbrio de Fases e Transições de Fase.
Setores de atividade: Educação; Energia.
1978 - 1984
Mestrado em Física.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: Teoremas de baixa energia no espalhamento compton,Ano de Obtenção: 1984.
Orientador: Silvestre Ragusa.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
Palavras-chave: Espalhamanto Compton; Teoremas de Baixa Energia; Polarizabilidade de Nucleons.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Física Geral / Especialidade: Física Clássica e Física Quântica; Mecânica e Campos.
Setores de atividade: Energia.
1974 - 1977
Graduação em Física.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.


Atuação Profissional



University of California System, UC System, Estados Unidos.
Vínculo institucional

2006 - 2006
Vínculo: , Enquadramento Funcional:


Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.
Vínculo institucional

1985 - Atual
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Adjunto, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

10/2013 - Atual
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, .

Cargo ou função
Membro Titular do Conselho do Departamento de Física.
10/2009 - Atual
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, .

Cargo ou função
Membro do Conselho de Curso do Curso de Graduação de Engenharia de Alimentos.
01/2006 - Atual
Pesquisa e desenvolvimento , Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, .

5/1985 - Atual
Pesquisa e desenvolvimento , Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, Departamento de Física.

09/2013 - 01/2014
Ensino, Física, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Mecânica Clássica I - 90 horas
06/2012 - 10/2013
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, .

Cargo ou função
Membro da Congregação.
10/2011 - 10/2013
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, .

Cargo ou função
Membro Titular do Conselho do Departamento de Física.
03/2013 - 09/2013
Ensino, Física, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Métodos Computacionais II - 60 horas
Mecânica Clássica II - 60 horas
08/2012 - 12/2012
Ensino, Física Biológica, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Mecânica Clássica - 90 horas
Mecânica Estatística - 45 horas
02/2012 - 06/2012
Ensino, Bacharelado Em Física Biológica, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Métodos Computacionais II - 60 horas
02/2012 - 06/2012
Ensino, Engenharia de Alimentos, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Física Geral I - 60 horas
08/2011 - 12/2011
Ensino, Bacharelado Em Física Biológica, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Mecânica Clássica - 90 horas
Mecânica Estatística - 45 horas
02/2011 - 07/2011
Ensino, Bacharelado Em Física Biológica, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Métodos Computacionais II - 60 horas
02/2011 - 07/2011
Ensino, Engenharia de Alimentos, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Física Geral I - 60 horas
08/2010 - 12/2010
Ensino, Bacharelado Em Física Biológica, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Mecânica Clássica - 90 horas
Mecânica Estatística - 45 horas
02/2010 - 07/2010
Ensino, Engenharia de Alimentos, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Física Geral I - 60 horas
02/2010 - 07/2010
Ensino, Bacharelado Em Física Biológica, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Métodos Computacionais II - 60 horas
06/2008 - 06/2010
Direção e administração, Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, .

Cargo ou função
Vice-Chefe de Departamento.
08/2009 - 12/2009
Ensino, Bacharelado Em Física Biológica, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Mecânica Estatística - 45 horas
Mecânica Clássica - 90 horas
03/2009 - 07/2009
Ensino, Bacharelado Em Física Biológica, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Complementos de Mecânica Clássica - 60 horas (Optativa)
Métodos Computacionais II - 60 horas
08/2008 - 12/2008
Ensino, Bacharelado Em Física Biológica, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Mecânica Clássica - 90 horas
Mecânica Estatística - 45 horas
03/2008 - 08/2008
Ensino, Biofísica Molecular, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Física Estatística - 90 horas
03/2008 - 07/2008
Ensino, Bacharelado Em Física Biológica, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Métodos Computacionais II - 60 horas
10/2007 - 06/2008
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, .

Cargo ou função
Membro do Conselho do Departamento de Física.
08/2007 - 12/2007
Ensino, Bacharelado Em Física Biológica, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Mecânica Clássica - 90 horas - 2o. semestre
Mecânica Estatística - 45 horas - 2o. semestre
03/2007 - 08/2007
Ensino, Bacharelado Em Física Biológica, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Complementos de Mecânica Clássica - 60 horas - 1o. semestre
Métodos Computacionais II - 60 horas - 1o. semestre
6/2002 - 06/2007
Direção e administração, Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, Departamento de Física.

Cargo ou função
Coordenador de curso de pós-graduação.
10/2006 - 02/2007
Extensão universitária , Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, .

Atividade de extensão realizada
Coordenação do Curso de Extensão Universitária "Curso de Verão em Biofísica Molecular".
3/2006 - 12/2006
Ensino, Bacharelado Em Física Biológica, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Mecânica Clássica - 30 horas - 2o. semestre
Mecânica Estatística - 45 horas - 1o. semestre
Mecânica Estatística - 45 horas - 2o. semestre
Métodos Computacionais II - 60 horas - 2o. semestre
2/2006 - 3/2006
Extensão universitária , Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, Departamento de Física.

Atividade de extensão realizada
Coordenação do Curso de Extensão: Curso de Verão em Biofísica Molecular.
3/2005 - 12/2005
Ensino, Bacharelado Em Física Biológica, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Mecânica Clássica - 90 horas - 1o. semestre
3/2005 - 12/2005
Ensino, Bacharelado Em Física Biológica, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Mecânica Clássica - 90 horas - 2o. semestre
10/2003 - 09/2005
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, .

Cargo ou função
Membro da Comissão Permanente de Ensino.
02/2005 - 02/2005
Extensão universitária , Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, .

Atividade de extensão realizada
MiniCurso ministrado no Curso de Extensão Universitária: Curso de Verão em Biofísica Molecular.
3/2004 - 12/2004
Ensino, Química Ambiental, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Física II
3/2004 - 12/2004
Ensino, Engenharia de Alimentos, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Mecânica Geral
08/2002 - 08/2004
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, .

Cargo ou função
Membro do Conselho do Programa de Pós-Graduação em Biofísica Molecular.
01/2004 - 02/2004
Extensão universitária , Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, .

Atividade de extensão realizada
Coordenação do Curso de Extensão Universitária: Curso de Verão em Biofísica Molecular.
8/2003 - 12/2003
Ensino, Bacharelado Em Física Biológica, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Física I
2/2003 - 12/2003
Ensino, Engenharia de Alimentos, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Mecânica Geral
3/2002 - 12/2003
Ensino, Engenharia de Alimentos, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Mecânica Geral
Física Geral e Experimental I
01/2003 - 02/2003
Extensão universitária , Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, .

Atividade de extensão realizada
Palestra proferida no Curso de Extensão Universitária: Curso de Verão em Biofísica Molecular.
12/2000 - 12/2002
Direção e administração, Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, Departamento de Física.

Cargo ou função
Vice-Coordenador de Curso de Pós--Graduação.
06/2002 - 06/2002
Extensão universitária , Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, .

Atividade de extensão realizada
Curso de Física Biológica ministrado no evento "Venha nos Conhecer".
5/1985 - 12/2001
Ensino, Licenciatura Em Matemática, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Física Geral e Experimental I
Mecânica Geral
Física Geral II
Física Geral III
Biofísica
Física
1/2000 - 12/2000
Ensino, Biofísica Molecular, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Estudos Computacionais em Biopolimeros
4/1994 - 4/1996
Direção e administração, Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, Departamento de Física.

Cargo ou função
Vice-Chefe de Departamento.
10/1989 - 10/1991
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, .

Cargo ou função
Membro do Conselho de Curso de Graduação de Computação.
08/1989 - 08/1990
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, .

Cargo ou função
Membro da Comissão Local de Informática.


Linhas de pesquisa


1.
Transição de Fase em Sistemas de Spin
2.
Estudo de Formação de Micelas via Modelagem Computacional
3.
Técnicas de Histogramas em Estudo Computacional de Polieletrólitos em Solução
4.
Enovelamento de Proteínas
5.
Predição de Estruturas via Redes Neurais
6.
Auxílio financeiro do PRODOC/CAPES (R$ 12.000,00) para Implantação da linha de pesquisa "Técnicas de Biologia Molecular" -


Projetos de pesquisa


2005 - 2008
Clonagem, Expressão e Purificação de Proteínas Recombinantes

Descrição: O Objetivo consiste em implantar a linha de pesquisa que envolve técnicas de biologia molecular visando caracterizar proteínas com dicroismo circular..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.

Integrantes: Jorge Chahine - Coordenador / Marcia Perez dos Santos Cabrera - Integrante / Raquel Kelly Bortoleto - Integrante.
Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.
2002 - 2004
Implantação de Linhas de Pesquisas no Programa de Pós-Graduação em Biofísica Molecular

Descrição: O Projeto visa obter recusrsos financeiros e bolsa para Absorção Temporária de Jovens Doutores para exercerem atividades de pesquisa..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.

Integrantes: Jorge Chahine - Coordenador / Aline Thais Bruni - Integrante.
Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.
1994 - 1995
Simulação pelo Método de Monte Carlo de Microemulsões e Micelas Iônicas em Solução Eletrolítica

Descrição: Estudar a formação de micelas e microemulsões em meio aquoso através de simulações computacionais..
Situação: Desativado; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) .

Integrantes: Jorge Chahine - Coordenador / Alexandre Lopes Veneziano - Integrante.
Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.
1993 - 1994
Uso do Grupo de Renormalização com Técnica de Monte Carlo

Descrição: Estudos da transições de fases no modelo de Ashkin-Teller com três Spins por sitio..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.

Integrantes: Jorge Chahine - Coordenador / José Roberto Drugovich de Felício - Integrante / Nestor Caticha - Integrante.
Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.


Outros Projetos


2006 - 2006
Enovelamento de Proteínas

Descrição: Realizar simulações computacionais para descrever processos envolvendo enovelamento proteíco..
Situação: Concluído; Natureza: Outra.

Integrantes: Jorge Chahine - Coordenador / Vitor Barbanti Pereira Leite - Integrante / José Nelson Onuchic - Integrante.
Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.
1996 - 1998
Estudos dos Mecanismos de Folding de Proteínas

Descrição: Realizar simulação computacional para descrever processos de enovelamento proteíco..
Situação: Concluído; Natureza: Outra.

Integrantes: Jorge Chahine - Coordenador / José Nelson Onuchic - Integrante.
Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.


Revisor de periódico


2008 - 2008
Periódico: Chemical Engineering Science
2007 - 2007
Periódico: Química Nova (Online)
2009 - 2009
Periódico: PLoS Computational Biology
2011 - Atual
Periódico: Applied Mathematics and Computation
2013 - Atual
Periódico: Journal of Chemical Information and Modeling (Online)


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Física da Matéria Condensada/Especialidade: Equação de Estado, Equilíbrio de Fases e Transições de Fase.
2.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Biofísica Molecular.


Idiomas


Inglês
Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.
Espanhol
Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente, Escreve Razoavelmente.


Produções



Produção bibliográfica
Citações

SCOPUS

Artigos completos publicados em periódicos

1.
CONTESSOTO, V.G.2013CONTESSOTO, V.G. ; CHAHINE, J. ; LIMA, D.T. ; OLIVEIRA, R.J. ; Bruni, A.T. ; LEITE, V.B.P. . Analyzing the effect of homogeneous frustration in protein folding. Proteins (Print), v. 81, p. 1727-1737, 2013.

2.
WANG, J.2012WANG, J. ; OLIVEIRA, R. J. ; CHU, X. ; WHITFORD, P. C. ; CHAHINE, J. ; HAN, W. ; WANG, E. ; ONUCHIC, J. N. ; LEITE, V. B. P. . Topography of funneled landscapes determines the thermodynamics and kinetics of protein folding. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, v. 109, p. 15763-15768, 2012.

3.
Oliveira, Ronaldo J.2010Oliveira, Ronaldo J. ; Whitford, Paul C. ; Wang, Jin ; Onuchic, José N. ; Leite, Vitor  ; CHAHINE, J. . The Origin of Nonmonotonic Complex Behavior and the Effects of Nonnative Interactions on the Diffusive Properties of Protein Folding. Biophysical Journal (Print), v. 99, p. 600-608, 2010.

4.
Oliveira, Ronaldo J.2010Oliveira, Ronaldo J. ; Whitford, Paul C. ; Leite, Vitor B.P. ; Wang, Jin ; CHAHINE, J. . Coordinate and time-dependent diffusion dynamics in protein folding. Methods (San Diego, Calif., Print), v. 52, p. 91-98, 2010.

5.
CHAHINE, J.2008CHAHINE, J. ; SCOTT, Luis Paulo Barbour ; RUGGIERO, José Roberto . Use of Genetic Algorithms and Solvation Potential to Study Peptides Structure. Applied Mathematics and Computation, v. 195, p. 515-522, 2008.

6.
CHAHINE, J.2008CHAHINE, J. ; SCOTT, Luis Paulo Barbour ; RUGGIERO, José Roberto . Using Genetic Algorithm to Design Protein Sequence. Applied Mathematics and Computation, v. 200, p. 1-9, 2008.

7.
SCOTT, Luis Paulo Barbour2008SCOTT, Luis Paulo Barbour ; CHAHINE, J. ; RUGGIERO, José Roberto . Predicting peptides structure with solvation potential and rotamer library dependent of the backbone. Applied Mathematics and Computation, v. 199, p. 155-161, 2008.

8.
CHAHINE, J.2007 CHAHINE, J. ; OLIVEIRA, R J ; LEITE, Vitor Barbanti Pereira ; WANG, J. . Configuration-dependent diffusion can shift the kinetic transition state and barrier height of protein folding. PNAS. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, v. 104, p. 14646-14651, 2007.

9.
SCOTT, Luis Paulo Barbour2007SCOTT, Luis Paulo Barbour ; CHAHINE, J. ; RUGGIERO, José Roberto . Aplicação de Redes MLP na Predição de Estrutura Secundária de Proteínas-PREDCASA.. Biomatemática (UNICAMP), v. 17, p. 87-100, 2007.

10.
OLIVEIRA, Leandro C2006 OLIVEIRA, Leandro C ; SILVA, Ricardo Hildebrand Theodoro da ; LEITE, Vitor Barbanti Pereira ; CHAHINE, J. . Frustation and hydrophobicity interplay in protein folding and protein evolution. Chinese Journal of Chemical Physics, v. 125, p. 084904-1-084904-7, 2006.

11.
CHAHINE, J.2005 CHAHINE, J. ; CHEUNG, Margaret S . Computational Studies of the Reversible Domain Swapping of p13suc1. Biophysical Journal, v. 89, p. 2693-2700, 2005.

12.
FELICIO, J R Drugowich de2003FELICIO, J R Drugowich de ; CHAHINE, J. ; CATICHA, N . A Monte Carlo Study of the Anisotropic N=3 Ahkin-Teller Model. Physica. A (Print), Amsterdam, v. 321, n.3-4, p. 529-542, 2003.

13.
CHAHINE, J.2002CHAHINE, J. ; NYMEYER, H. ; LEITE, Vitor Barbanti Pereira ; SOCCI, N. D. ; ONUCHIC, J. N. . Specific and Nonspecific Collapse in Protein Folding Funnels. Physical Review Letters (Print), v. 88, n.16, p. 101-1-101-4, 2002.

14.
ONUCHIC, J. N.2000 ONUCHIC, J. N. ; NYMEYER, H. ; GARCIA, A. E. ; CHAHINE, J. ; SOCCI, N. . The energy landscape theory of protein folding: insights into fonding mechanisms and scenarios. Advances in Protein Chemistry, Estados Unidos, v. 43, p. 87-152, 2000.

15.
CHAHINE, J.2000CHAHINE, J. ; RUGGIERO NETO, J. ; FOSSEY, M. A. ; SANTOS, C. C. M. . Coil it Extended Coil Transition in Polygalacturonic Acid: Conductometric Titration An Monte Carlo Simulations. The Journal Of Physical Chemistry B, Estados Unidos, v. 104, n.51, p. 1217-1218, 2000.

16.
NYMEYER, H.1999NYMEYER, H. ; CHAHINE, J. ; ONUCHIC, J. N. . Energy vs. native fold: determinants of the folding transition state structure. Biophysical Journal, Estados Unidos, v. 76, n.1, p. A176-A176, 1999.

17.
CHAHINE, J.1998CHAHINE, J. ; NYMEYER, H. ; ONUCHIC, J. N. . A Landscape Analysis of Friction Effect in Protein Folding. Biophysical Journal, Estados Unidos, v. 74, n.2, p. A167-A167, 1998.

18.
CHAHINE, J.1997CHAHINE, J. ; SOCCI, N. D. . How Fast in the Collapse of Proteins During Folding ?. American Chemical Society, Division of Colloid and Surface Chemistry, Estados Unidos, v. 214, p. 237-237, 1997.

19.
CHAHINE, J.1994CHAHINE, J. ; GUIMARÃES, M. A. ; CAVICHIOLLI, F. R. . Temperature dependence of conformational properties of short polyelectrolytes from simulations at a single temperature. Journal of Physical Chemistry, Estados Unidos, v. 98, n.39, p. 9845-9849, 1994.

20.
CHAHINE, J.1991CHAHINE, J. ; CATICHA, N ; FELICIO, J R Drugowich de . Numerical Determination of the Order of Phase Transitions in Ising Systems with Multispin Interactions. Physical Review. B. Solid State. (Cessou em 1978. Cont. 1098-0121 Physical Review. B, Condensed Matter and Materials Physics), Estados Unidos, v. 43, n.1, p. 1173-1175, 1991.

21.
CHAHINE, J.1989CHAHINE, J. ; FELICIO, J R Drugowich de ; CATICHA, N . Non-Universal Exponents and Marginal Operators via Monte Carlo Renormalization Group. Journal of Physics. A, Mathematical and General (Print) (Cessou em 2006. Cont. ISSN 1751-8113 Journal of Physics. A, Mathematical and Theoretical (Pri, Estados Unidos, v. 22, n.10, p. 1639-1645, 1989.

22.
CHAHINE, J.1989CHAHINE, J. ; FELICIO, J R Drugowich de ; CATICHA, N . Using the Ferrenberg-Swendsen Monte Carlo Method for Nonuniversal Exponents. Physics Letters A, Estados Unidos, v. 139, n.8, p. 360-362, 1989.

23.
CHAHINE, J.1989 CHAHINE, J. ; CATICHA, N ; FELICIO, J R Drugowich de . Monte Carlo Renormalization Group with Evolution in the Space of Parameters. Physical Review. A, Estados Unidos, v. 40, n.12, p. 7431-7433, 1989.

Resumos expandidos publicados em anais de congressos
1.
SCOTT, Luis Paulo Barbour ; CHAHINE, J. ; RUGGIERO, José Roberto . Prediction of Pepetides Structure Using Genetic Algorithms and Rotamer Library. In: 15th Annual Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB) 2007, 2007, Viena. 15th Annual Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB), 2007.

2.
CHAHINE, J. ; FERREIRA, Fausto Roberto . Application of Neural Ntwork Multi Layer Perceptron for the Prediction of Secondary Structures of Proteins. In: 4th Congress of Pharmaceutical Sciences, 2003, Ribeirão Preto-SP. Revista Brasileira de Ciências Farmacêuticas, 2003. v. 39. p. 192-192.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
CHAHINE, J. ; MELO, D. C. ; SCOTT, Luis Paulo Barbour . Algumas Técnicas Computacionais para Estudar Modelos de Estruturas Proteicas. In: XXXVI Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 2013, Águas de Lindóia. ENFMC, 2013. v. XXXVI. p. ---.

2.
CONTESSOTO, V. G. ; LIMA, D. T. ; Oliveira, Ronaldo J. ; CHAHINE, J. ; LEITE, Vitor Barbanti Pereira . Study of the addition effect of frustration in the protein folding process using a structure-based model. In: Annual Meeting of SBBq, 2012, Foz do Iguaçu. SBBq, 2012. v. XLI. p. ---.

3.
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CHAHINE, J. ; CAVICHIOLLI, F. R. . Nova Forma de Simulação Monte Carlo de Polieletrólitos exibindo Transição Induzida pela Temperatura. In: IV Congresso de Iniciação Científica, 1992, Araçatuba-SP. Congresso de Iniciação Científica. São Paulo: UNESP, 1992. v. IV.

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CHAHINE, J. ; COLOMBO, Marcio Francisco ; RUGGIERO, José Roberto ; SCOTT, Luis Paulo Barbour ; MENDES, O. L. . Desenvolvimento de Software para Simulação e Animação em Física. In: 17o. Colóquio de Incentivo à Pesquisa, 1990, São José do Rio Preto-SP. Colóquio de Incentivo à Pesquisa. São Paulo: UNESP, 1990. v. 17. p. 87-87.

66.
CHAHINE, J. ; RUGGIERO, José Roberto ; SCOTT, Luis Paulo Barbour ; MENDES, O. L. ; BRANCO, A. F. F. . Simulação e Visualização de um Polímero. In: II Congresso de Iniciação Científica, 1990, Botucatu-SP. Congresso de Iniciação Científica. São Paulo: UNESP, 1990. v. II. p. 26-26.

67.
CHAHINE, J. ; FELICIO, J R Drugowich de ; CATICHA, N . Non-Universal Exponents and Marginal Operators via Monte Carlo Renormalization Group. In: STATPHYS 17, 1989, Rio de Janeiro-RJ. STATPHYS. Amsterdam, Netherlands: Elsevier Science Publishers, 1989. v. 17.

Resumos publicados em anais de congressos (artigos)
1.
CHAHINE, J.2003CHAHINE, J. ; FERREIRA, Fausto Roberto . Application of Neural Network Multi Layer Perceptron for the Prediction of Secondary Structures of Proteins. Revista Brasileira de Ciências Farmacêuticas, São Paulo, v. 39, n.2, p. 192-192, 2003.

Apresentações de Trabalho
1.
CHAHINE, J. ; De Felício, J.R.D. ; Caticha, N. . Simulação Computacional em Modelos de Spin e de Proteínas. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

2.
CHAHINE, J. ; MELO, D. C. . Dinâmica Molecular do Eumine Mastoparano em Misturas de TFE. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

3.
CHAHINE, J. ; MELO, D. C. ; SCOTT, Luis Paulo Barbour . Algumas Técnicas Computacionais para estudar Modelos de Estruturas Protéicas. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

4.
CHAHINE, J. . Física Computacional. 2012. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

5.
CHAHINE, J. . Técnicas Computacionais para Estudar o Enovelamento Proteíco. 2012. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

6.
CHAHINE, J. . Configurational Dependent Diffusion and Protein Folding Kinetics. 2011. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

7.
OLIVEIRA, R J ; CHAHINE, J. ; LEITE, Vitor Barbanti Pereira ; WANG, J. . Coordinate and Time Dependent Diffusion Dynamics in Protein Folding. 2011. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

8.
CHAHINE, J. . Using a Lattice Model to Study the Role of Diffusion in Protein Folding. 2011. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

9.
OLIVEIRA, R J ; LEITE, Vitor Barbanti Pereira ; CHAHINE, J. . Exploring the Origin of Non-Monotic Complex behavior and Effects of Non-Native Interaction on the Diffusion of Protein Folding. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

10.
CHAHINE, J. . Enovelamento de Proteínas. 2010. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

11.
OLIVEIRA, R J ; Whitford, Paul C. ; CHAHINE, J. ; Wang, Jin ; ONUCHIC, J. N. ; LEITE, Vitor Barbanti Pereira . Exploring the origin of non-monotonic complex behavior and effects of non-native interactions on the diffusion of protein folding. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).


Produção técnica
Trabalhos técnicos
1.
CHAHINE, J. . Parecer Técnico Científico de trabalhos da àrea de exatas. 2012.

2.
CHAHINE, J. . Parecer emitido sobre Resumo expandido de trabalho na área de exatas. 2009.


Demais tipos de produção técnica
1.
CHAHINE, J. . "Theory, Modeling, Simulation in Biophysics". 2011. (Coordenação de Sessão do Encontro de Física 2011 Integração da Física na América latina).

2.
CHAHINE, J. . Principios de Simulação Computacional - II Semana da Física Biológica. 2005. (Curso de curta duração ministrado/Outra).



Bancas



Participação em bancas de trabalhos de conclusão
Mestrado
1.
CARVALHO, S. J.; CALIRI, Antonio; CHAHINE, J.. Participação em banca de Rafael Musa Lyrio do Valle. Estudo Conformacional de Polianfóteros fracos utilizando Simulações de Monte Carlo. 2012. Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

2.
CHAHINE, J.. Participação em banca de Ana Carolina Rios Coelho. Estimação de Parâmetros em Modelos de Eliminação Enzimática de Substratos no Fígado. Um Estudo Via Otimização Global. 2009. Dissertação (Mestrado em Modelagem Computacional) - Universidade do Estado do Rio de Janeiro.

3.
DRIGO FILHO, Elso; CHAHINE, J.; BARRANCO, A. V.. Participação em banca de Karina Heloisa Paulino. Poços Quânticos e Transferência de Elétrons. 2009. Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

4.
CHAHINE, J.; RUGGIERO, José Roberto; Araújo, Alexandre Suman. Participação em banca de Denise Cavalcante de Melo. Estruturação do Eumenine Mastoparano por Dinâmica Molecular em misturas de TFE água. 2007. Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

5.
CHAHINE, J.; SILVA, Marco Antonio Alves da; LEITE, Vitor Barbanti Pereira. Participação em banca de André Luiz Martins. Predição de Estruturas de Proteínas Utilizando o Algoritmo da Rede Elástica. 2005. Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

6.
CHAHINE, J.; DRIGO FILHO, Elso; SILVA, Roosevelt Alves da. Participação em banca de Fausto Roberto Ferreira. O Uso de Redes Neurais Artificais MLP na Predição de Estruturas Secundárias de Proteínas. 2004. Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

7.
CHAHINE, J.; CALIRI, Antonio; SILVA, Marco Antonio Alves da. Participação em banca de Lessandra Eler. O Uso do Método de crescimento de cadeias no estudo do enovelamento de proteínas. 2003. Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Teses de doutorado
1.
ALVES, Nelson Augusto; DRIGO FILHO, Elso; CHAHINE, J.; Dias LG; Mendes TCR. Participação em banca de Leandro Gutierrez Rizzi. Algoritmos de Monte Carlo generalizados e criticalidade no modelo de Ising dipolar e em proteínas descritas por um modelo mínimo. 2013. Tese (Doutorado em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto (USP).

2.
Freitas LCG; Coutinho KR; Caracelli I; CHAHINE, J.; Cardoso CL. Participação em banca de Guedmiller Souza de Oliveira. Análise da interação molecular porteína-Herbicida através de simulação computacional: Aplicação no desenvolvimento de Nanobiossensores. 2013. Tese (Doutorado em Programa de Pós Graduação em Química-UFSCar) - Universidade Federal de São Carlos.

3.
DRIGO FILHO, Elso; WEBER, G.; CHAHINE, J.; Goldman C; Dutra AS. Participação em banca de Natália Favaro Ribeiro. Modelos de Redes Unidimensionais Aplicados ao Estudo Termodinâmico do DNA. 2013. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

4.
RUGGIERO, José Roberto; WEBER, G.; CALIRI, Antonio; LEONEL, E. D.; CHAHINE, J.. Participação em banca de Gabriel Gouvea Slade. Modelos Mecânicos para o Estudo da Dinâmica do DNA. 2013. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

5.
ITO, A. S.; SKAF, M. S.; Coutinho KR; AMARAL, M. S.; CHAHINE, J.. Participação em banca de Sérgio Leandro Espindola Preza. Localização e dinâmica de sondas fluorescentes em modelos de membranas: estudos por dinâmica molecular e anisotropia de fluorescência resolvida no tempo.. 2013. Tese (Doutorado em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto (USP).

6.
Hornos, J.E.M.; Armelin, H.A.; CHAHINE, J.; Fontanari, J.F.; Briones, M.R.S.. Participação em banca de Guilherme da Costa Pereira Innocentini. Uma generalização do modelo de spins e bóson para a transcrição de genes sob múltiplo controle. 2012. Tese (Doutorado em Ciências Física Básica) - Instituto de Física de São Carlos - USP.

7.
CHAHINE, J.; CARVALHO, S. J.; Fossey, M. A.; OLIVEIRA, Leandro C; Oliveira, Ronaldo J.. Participação em banca de André Luiz Martins. Uso de Modelos de Rede no Estudo de Enovelamento de Proteínas. 2012. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

8.
CHAHINE, J.; Araújo, Alexandre Suman; OLIVEIRA, Leandro C; RUGGIERO, José Roberto; CARVALHO, S. J.. Participação em banca de Diego Oliveira Nolasco da Silva. Estudos por Dinâmica Molecular do Peptídeo Polybia-MPI via Replica Exchange. 2010. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

9.
ALVES, Nelson Augusto; OLIVEIRA, M. J.; CHAHINE, J.; SILVA, Luis Fernando Barroso da; RUGGIERO, José Roberto. Participação em banca de Rafael Bertolini Frigori. Simulações Microcanônicas de Proteínas. 2010. Tese (Doutorado em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto (USP).

10.
RUGGIERO NETO, J.; VRIES, R.; SILVA, Luis Fernando Barroso da; CALIRI, Antonio; CHAHINE, J.. Participação em banca de José Ésio Bessa Ramos Junior. Condensação-psi do DNA: um estudo teórico e experimental. 2009. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

11.
DRIGO FILHO, Elso; CHAHINE, J.; RUGGIERO NETO, João. Participação em banca de Ricardo Alexandre dos Santos Silva. Modelo Vibro-rotacional para a molécula de DNA. 2008. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

12.
AZEVEDO JR, Walter Filgueira de; OLIVEIRA, Paulo Sergio Lopes de; FALCÃO, Paula Regina Kuser; RUGGIERO, José Roberto; CHAHINE, J.. Participação em banca de Nelson José de Freitas. Bioinformática Estrutural aplicada ao Estudo de Proteínas Alvo do Genôma do Mycobacterium tuberculosis. 2005. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

13.
CALIRI, Antonio; SILVA, Marco Antonio Alves da; COLOMBO, Marcio Francisco; CHAHINE, J.; ARAUJO, Antonio Francisco. Participação em banca de Luiz Faustino de Oliveira Rocha. Mecanismo de folding de macromoléculas: estudo sobre o papel das especificidades topológicas e químicas das interações intramoleculares em cadeias poliméricas lineares. 2005. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

14.
CALIRI, Antonio; ALVES, Nelson Augusto; BORISSEVITCH, Iouri; CHAHINE, J.; COLOMBO, Marcio Francisco. Participação em banca de Maria Eulália Pinto Tarrago. Potencial Estéreo-Hidrofóbico e Propriedades Topológicas no Enovelamento Proteínas. 2003. Tese (Doutorado em Física Aplicada) - Universidade de São Paulo.

15.
CHAHINE, J.; GARRET, Richard Charles; PASCUTTI, Pedro Geraldo; SILVA, Luis Fernando Barroso da; LEITE, Vitor Barbanti Pereira. Participação em banca de Luis Paulo Barbour Scott. Investigação da Utilização de Algoritmos Genéticos e Redes Neurais Artificiais na Predição de Estruturas Protéicas. 2003. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

16.
CHAHINE, J.; CALIRI, Antonio. Participação em banca de Rooservelt Alves da Silva. Modelos de rede no enovelamento de proteínas. 2002. Tese (Doutorado em Física Aplicada) - Universidade de São Paulo.

17.
CHAHINE, J.; CALIRI, Antonio. Participação em banca de Cláudia dos Santos Simões. Estudo de enovelamento de proteínas. 2001. Tese (Doutorado em Física Aplicada) - Universidade de São Paulo.

18.
CHAHINE, J.; SILVA, Marco Antonio da. Participação em banca de Osvaldo Eduardo Aiélio. Monte Carlo fora do equilíbrio. 2000. Tese (Doutorado em Física Aplicada) - Universidade de São Paulo.

Qualificações de Doutorado
1.
CHAHINE, J.; Maia, L.P.; Garratt, R.C.. Participação em banca de Guilherme da Costa Pereira Innocentini. Efeitos do ruído de entrada em um chaveamento bioquímico simples. 2012. Exame de qualificação (Doutorando em Física Aplicada) - Instituto de Física de São Carlos - USP.

2.
RUGGIERO, José Roberto; CHAHINE, J.; Araújo, Alexandre Suman. Participação em banca de Fernando César Lopes Filho. Simulações por Dinâmica Molecular fine-e coarse-grained das interações intermoleculares entre peptídeos antimicrobianos da família Mastoparano e membranas modelo. 2012. Exame de qualificação (Doutorando em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

3.
DRIGO FILHO, Elso; Ricotta, R.M.; CHAHINE, J.. Participação em banca de Natália Favaro Ribeiro. Modelos de Redes Unidimensionais Aplicados ao Estudo Termodinâmico do DNA. 2012. Exame de qualificação (Doutorando em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

4.
RUGGIERO, José Roberto; CHAHINE, J.; Fossey, M. A.. Participação em banca de Gabriel Gouvea Slade. Estudo da dinâmica do DNA usando modelos mecânicos: modos localizados de vibração em cadeias homogêneas e cadeias reais. 2012. Exame de qualificação (Doutorando em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

5.
DRIGO FILHO, Elso; CHAHINE, J.; CORNELIO, M. L.. Participação em banca de Gisele Bosso de Freitas. Equações Estocásticas: reação-difusão e crescimento. 2012. Exame de qualificação (Doutorando em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

6.
NAPOLITANO, R. J.; CHAHINE, J.; MARCO, R.. Participação em banca de Guilherme Nery Prata. Limites Fundamentais na Supressão de Flutuações Moleculares. 2011. Exame de qualificação (Doutorando em Física Aplicada) - Universidade de São Paulo.

7.
CHAHINE, J.; CARVALHO, S. J.; Araújo, Alexandre Suman. Participação em banca de André Luiz Martins. Algoritmo de Crescimento de Estruturas Proteícas. 2011. Exame de qualificação (Doutorando em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

8.
CHAHINE, J.; RUGGIERO, José Roberto; CARVALHO, S. J.. Participação em banca de Diego Oliveira Nolasco da Silva. Estudos estruturais por dinâmica molecular do peptídeo polybia-MPI via réplica exchange. 2010. Exame de qualificação (Doutorando em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

9.
RUGGIERO NETO, João; CHAHINE, J.; DRIGO FILHO, Elso. Participação em banca de José Ésio Bessa Ramos Júnior. Flexible Polymer-Induced DNA Condensation: Deviations from the Scaling Regime for Flexible Polymer Solutiobs. 2008. Exame de qualificação (Doutorando em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

10.
DRIGO FILHO, Elso; CHAHINE, J.; LEITE, Vitor Barbanti Pereira. Participação em banca de Ricardo Alexandre dos Santos Silva. Modelo Vibro-Rotacional para a Molécula de DNA. 2007. Exame de qualificação (Doutorando em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

11.
CHAHINE, J.; FADEL, V.. Participação em banca de Márcio Vinicius Bertacini Dias. Estudo Estrutural de Enzimas Alvo de Mycobacterium Tuberculosis. 2006. Exame de qualificação (Doutorando em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

12.
CHAHINE, J.; COLOMBO, Marcio Francisco; RUGGIERO, José Roberto. Participação em banca de Alexandre César Dourado Neves. Efeito de volume excluso no enovelmaneot de proteínas. 2003. Exame de qualificação (Doutorando em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

13.
CHAHINE, J.; DRIGO FILHO, Elso; AGOSTINHO NETO, Augusto. Participação em banca de Glaucia Rosangela Peglow Borges. Equação de Fokker-Plack, supersimetria e enovelamento de proteínas. 2003. Exame de qualificação (Doutorando em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

14.
CHAHINE, J.; RUGGIERO NETO, João; RANGEL, Maria Do Socorro Nogueira. Participação em banca de Luiz Paulo Barbour Scott. Redes neurais e algoritmos genéticos na pedição de estrutura secundária. 2003. Exame de qualificação (Doutorando em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Qualificações de Mestrado
1.
LEITE, Vitor Barbanti Pereira; CHAHINE, J.; DRIGO FILHO, Elso. Participação em banca de Débora Tavares de Lima. Caracterização termodinâmica do enovelamento de proteínas usando modelos baseado em estrutura. 2012. Exame de qualificação (Mestrando em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

2.
LEITE, Vitor Barbanti Pereira; CHAHINE, J.; Araújo, Alexandre Suman. Participação em banca de Antonio Bento de Oliveira Junior. Visualização do Funil de Enovelamento de Proteínas. 2012. Exame de qualificação (Mestrando em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

3.
CARVALHO, S. J.; RUGGIERO NETO, João; CHAHINE, J.. Participação em banca de Vinicius Martins de Oliveira. Estudo por Simulação Computacional da Interação entre Polieletrólitos Fracos e Macroíons Esféricos. 2012. Exame de qualificação (Mestrando em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Trabalhos de conclusão de curso de graduação
1.
Araújo, Alexandre Suman; RUGGIERO NETO, João; CHAHINE, J.. Participação em banca de Ingrid Bernardes Santana Martins.Desenvolvimento de Ferramentas para Construção Automática de Modelos de Membranas Biológicas Mistas Destinadas a Simulações de Dinâmica Molecular. 2013. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

2.
LEITE, Vitor Barbanti Pereira; CHAHINE, J.; OLIVEIRA, Leandro C. Participação em banca de Rafael Gombrade.Utilização do Modelo baseado em Estrutura Aplicado em Proteína Relacionada à Atividades Cancerígena. 2013. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

3.
CHAHINE, J.; LEITE, Vitor Barbanti Pereira; CARVALHO, S. J.. Participação em banca de Driely Oliveira.Estudo do Coeficiente de Difusão no Enovelamento de Proteínas Utilizando Dinâmica Estocástica. 2012. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

4.
CHAHINE, J.; LEITE, Vitor Barbanti Pereira; SILVA, Ricardo Hildebrand Theodoro da. Participação em banca de Rafaela Magalhãea Tavares.Cálculo do Coeficiente de Difusão no Enovelamento de Proteínas por Análise Bayesiana. 2012. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

5.
LEITE, Vitor Barbanti Pereira; CHAHINE, J.; Carareto, C.M.A.. Participação em banca de Tiago Tambonis.Análise Estatística Baseada em Métrica Aplicada em Expressão Diferencial de Genes a Partir de RNA-Seq.. 2012. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

6.
LEITE, Vitor Barbanti Pereira; CHAHINE, J.; SILVA, Ricardo Hildebrand Theodoro da. Participação em banca de Laís Ozelin de Lima Pimentel.Efeitos de Valores Phi e Hidrofobicidade na Variabilidade Sequencial de Proteínas. 2012. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

7.
CORNELIO, M. L.; CHAHINE, J.; ABREGO, J. R. B.. Participação em banca de Guilherme Giovanini.Estudo da Fotoisomerização 11-Cis/All-Trans Retinal de Rodopsina por Métodos de Química Quântica Computacional. 2011. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

8.
RUGGIERO, José Roberto; CHAHINE, J.; CARVALHO, S. J.. Participação em banca de Carolina Penhavel de Souza.Estudo Conformacional por Dinãmica Molecular do Peptídeo Anoplin com Micela de SDS 4em Solução Aquosa. 2011. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

9.
DRIGO FILHO, Elso; Araújo, Alexandre Suman; CHAHINE, J.. Participação em banca de Matheus Antonio da Silveira.Sistemas Quânticos e o Método Variacional. 2011. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

10.
LEITE, Vitor Barbanti Pereira; CHAHINE, J.; CARVALHO, S. J.. Participação em banca de André Schraider Maizel.Papel da Hidrofobicidade na Variabilidade Sequencial de Proteínas. 2011. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

11.
DRIGO FILHO, Elso; CHAHINE, J.; CARVALHO, S. J.. Participação em banca de Denise Caldas.Equação de Fokker-Planck e Equação de Schrodinger. 2010. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

12.
AGOSTINHO NETO, Augusto; CHAHINE, J.; SANTOS, L. F.. Participação em banca de Vinícius Augusto Paccola.Fônons em um Cristal Unidimensional. 2010. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

13.
CARVALHO, S. J.; CHAHINE, J.; RUGGIERO NETO, João. Participação em banca de Vinícius Martins de Oliveira.Estudo por Simulação Computacional da Interação entre Peptídeos Catiônicos e Membranas Modelo. 2010. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

14.
CORNELIO, M. L.; CHAHINE, J.; SOUZA, F. P.. Participação em banca de Rodolfo Molina Antoniassi.Estudo por Química Quântica Computacional do Composto Quercetina. 2010. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

15.
LEITE, Vitor Barbanti Pereira; CHAHINE, J.; RUGGIERO, José Roberto. Participação em banca de Antonio Bento de Oliveira Junior.Modelo Computacional Minimalista em Enovelamento de Proteínas - Visualização do Funil de Enovelamento de Proteína. 2010. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

16.
CHAHINE, J.; DRIGO FILHO, Elso; CARVALHO, S. J.. Participação em banca de Renata da Fonseca Moraes Batista.Equação de Fokker-Planck e o Enovelamento de Proteínas. 2010. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

17.
RUGGIERO, José Roberto; CHAHINE, J.; Araújo, Alexandre Suman. Participação em banca de Diogo Lino de Souza.Estudo da Estabilidade do Peptídeo AMP-AF-NH2 sob Troca da Glicina 9 por uma Serina e Influência do Tratamento das Interações de Longo Alcance na Estrutura Secundária do Peptídeo Mutado. 2010. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

18.
LEITE, Vitor Barbanti Pereira; RUGGIERO, José Roberto; CHAHINE, J.. Participação em banca de Débora Tavares de Lima.Estudo de Proteínas de Rápido Enovelamento com Modelos Baseados em Estrutura. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

19.
LEITE, Vitor Barbanti Pereira; CHAHINE, J.; RUGGIERO, José Roberto. Participação em banca de Juliana Sartori Pinto.Estudo de Modos Normais de Proteínas através do Método de Normal Mode Analysis (NMA). 2009. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

20.
LEITE, Vitor Barbanti Pereira; CHAHINE, J.; RUGGIERO, José Roberto. Participação em banca de Vinicius de Godoi Contessoto.Estudos de Proteínas de Rápido Enovelamento com Modelos Baseados em Estruturas. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

21.
CORNELIO, M. L.; CHAHINE, J.; FOSSEY, M. A.. Participação em banca de Patricia Suemy Kumagai.Estudo do Ulfolding e Refolding térmico da mioglobina por meio da espectroscopia infravermelha de correlação 2D variável-variável e de correlação 2D sample-sample. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

22.
RUGGIERO, José Roberto; RUGGIERO NETO, João; CHAHINE, J.. Participação em banca de Eric Allison Philot.Estudo Conformacional do Cepacian. 2008. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

23.
DRIGO FILHO, Elso; CASTRO, G. R. P. B.; CHAHINE, J.. Participação em banca de Marcelo Tozo de Araújo.Equação de Fokker-Planck Associada a de Schrondinger. 2008. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

24.
LEITE, Vitor Barbanti Pereira; RUGGIERO NETO, João; CHAHINE, J.. Participação em banca de Marcelo Boareto do Amaral.Predição de Classes de Enzimas por meio de Agrupamento Superparamagnético. 2008. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

25.
BONINI-DOMINGOS, C. R.; CHAHINE, J.; FOSSEY, M. A.. Participação em banca de Angélica Nakagawa Lima.Bioinformática Estrutural Aplicada ao estudo de Hemoglobinas. 2007. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Outros tipos
1.
AZEVEDO JR, Walter Filgueira de; CHAHINE, J.. Participação em banca de Ana Helena Casé. Modelagem molecular da quinase dependente da ciclina 1 complexada com inibidores. 2005. Outra participação, Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

2.
AZEVEDO JR, Walter Filgueira de; CANDURI, Fernanda; CHAHINE, J.. Participação em banca de Renato Tadeu Gaspar. Modelagem molecular da quinase dependente de ciclina 5 complex da roscovitina. 2003. Outra participação, Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

3.
CHAHINE, J.; LEITE, Vitor Barbanti Pereira. Participação em banca de Lessandra Eller. Métodos de crescimento de cadeias no estudo de modelos de rede em proteínas. 2003. Outra participação, Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

4.
CHAHINE, J.; RUGGIERO, José Roberto; LEITE, Vitor Barbanti Pereira. Participação em banca de Carlos Emídio Sampaio Nogueira. Estudo estrutural por dinâmica molecular do exopolissacarídeo da Burkhoderia Cepacia: Cepacian. 2003. Outra participação, Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

5.
RUGGIERO, José Roberto; AGOSTINHO NETO, Augusto; CHAHINE, J.. Participação em banca de Ricardo Alexandre dos Santos Silva. O efeito da solvatação na conformação de cadeias ácidas poligalacturônicas (PGA). 2003. Outra participação, Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

6.
DRIGO FILHO, Elso; RUGGIERO, José Roberto; CHAHINE, J.. Participação em banca de Angelo Pulici. Tunelamento quântico em potencial bi-estável. 2002. Outra participação, Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

7.
RUGGIERO, José Roberto; CHAHINE, J.; AZEVEDO JR, Walter Filgueira de. Participação em banca de Sabrina Thais Broggio. Análise Conformacional de Peptídeos usando o Recozimento Simulado Generalizado (GSA). 2002. Outra participação, Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.



Participação em bancas de comissões julgadoras
Concurso público
1.
CHAHINE, J.; ABREGO, J. R. B.; LEITE, Vitor Barbanti Pereira. Comissão Julgadora do Concruso Público para Contratação Emergencial de 01 Professor Susbtituto. 2013. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

2.
CHAHINE, J.; YOSHIDA, M.; LIBERO, W.. Banca Examinadora do Concurso Público de Títulos e Provas Professor Assistente - Física Matemática. 2011. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

3.
CHAHINE, J.; YOSHIDA, M.; JACOMETTI, J. A.. Membro da Banca Examinadora do Concurso Público de Provas e Títulos para contratação de Professor Assistente. 2010. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

4.
CHAHINE, J.. Membro da Comissão Julgadora do Concurso Público para contratação de 01 Professor Substituto. 2009. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Outras participações
1.
CARVALHO, S. J.; DRIGO FILHO, Elso; CHAHINE, J.. Comissão Examinadora do Exame de Qualificação de mestrado de de Rafael Musa Lyriro do Valle. 2011. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

2.
CORNELIO, M. L.; CHAHINE, J.; FOSSEY, M. A.. Comissão Examinadora do Exame de Qualificação de Mestrado de Luciane Sussuchi da Silva. 2010. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

3.
CORNELIO, M. L.; RUGGIERO, José Roberto; CHAHINE, J.. Comissão Examinadora do Exame de Qualificação de mestrado de Daniel Inoue Koga. 2010. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

4.
RUGGIERO NETO, J.; FOSSEY, M. A.; CHAHINE, J.. Comissão Examinadora do Exame de qualificação de mestrado de Laiana Cristina da Costa. 2010. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

5.
CORNELIO, M. L.; CHAHINE, J.; FOSSEY, M. A.. Comissão Examinadora do Exame de Qualificação de Mestrado de Eduardo Rogério Gonçalves, junto ao Programa de Pós-Graduação Biofísica Molecular. 2009. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

6.
DRIGO FILHO, Elso; CHAHINE, J.; RUGGIERO, José Roberto. Comissão Examinadora do Exame Geral de Qualificação de Mestrado de Franciele Polotto junto ao Programa de Pós-Graduação em Biofísica Molecular. 2009. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

7.
RUGGIERO, José Roberto; CHAHINE, J.; FEITOSA, E.. Comissão Examinadora do Exame de Qualificação de mestrado de Tamara Rodrigues Valder. 2009. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.



Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
XXXVI Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. Algumas Técnicas Computacionais para estudar Modelos de Estruturas Protéicas. 2013. (Congresso).

2.
II Escola Brasileira de Modelagem Molecular (EBMM 2013).Dinâmica Molecular do Eumine Mastoparano em Misturas de TFE. 2013. (Simpósio).

3.
Sistemas Complexos: Aleatoriedade, Emergência e Universalidade.Simulação Computacional em Modelos de Spin e de Proteínas. 2013. (Simpósio).

4.
Workshop da Biblioteca pDynamo usada em Simulações Computacionais e 5a. Edição do Simpósio "Molecular Simulation". 2013. (Simpósio).

5.
Dia da Graduação ano 2013 O Projeto Político Pedagógico. 2013. (Outra).

6.
Palestra "Saúde Masculina: Prevenção do Câncer de Próstata". 2013. (Outra).

7.
Workshop in Protein Folding: Integrating Theory, Simulation and Experiment. Conformational Studies of Mastoparan Peptides by Molecular Dynamics. 2012. (Congresso).

8.
XXXV Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. 2012. (Congresso).

9.
Gordon Research Conference on Protein Folding Dynamics he. Kinetics and thermodynamics of protein folding: when does a little frustation help?. 2012. (Congresso).

10.
I Semana da Física.Física Computacional. 2012. (Outra).

11.
V Semana da Física.Exemplos de Usos de Técnicas Computacionais para estudar o Enovelamento Proteíco. 2012. (Outra).

12.
Encontro de Física 2011. Protein Structure Prediction and Chain Growth Algorithm on the Cubo-Octahedral Lattice. 2011. (Congresso).

13.
Simpósio Interdisciplinar Física + Bioinformática 2011.Estudos Computacionais de Esfingomielinase: Modelagem e Dinâmica.. 2011. (Simpósio).

14.
X Encontro da SBPMat.Using a Lattice Model to Study the Role of Diffusion in Protein Folding. 2011. (Encontro).

15.
I Escola Brasileira de Modelagem Molecular.Configurational Dependent Diffusion and Protein Folding Kinetics. 2011. (Outra).

16.
VIII Semana da Física Biológica. 2011. (Outra).

17.
Gordon Research Conference on Protein Folding Dynamics (GRS). Exploring the Origin of Non-Monotonic Complex Behavior and Effects of Non-Native Interactions on the Diffusion of Protein Folding. 2010. (Congresso).

18.
Gordon Research Conference on Protein Folding Dynamics. Exploring the origin non-monotonic complex behavior and effects of non-native interactions on the diffusion of protein folding. 2010. (Congresso).

19.
XXXIII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. Conformational Analysis of Isolated and Association Protonectin and Protonectin (1-6) Peptides in Water/TFE Mixtures. 2010. (Congresso).

20.
V Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos.Enovelamento de proteínas. 2010. (Outra).

21.
XXXII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. Chain Growth Algorithm on the Cubo-Octahedral Lattice. 2009. (Congresso).

22.
XXXI Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. Principal Component Analysis - Pca - Of Protein-Ligand Complexes To Test The Influence Of Moving Over The Enzymatic Activity. 2008. (Congresso).

23.
XXX Encontro de Física da Matéria Condensada. Cálculo do Tempo de Enovelamento de Proteínas na Rede. 2007. (Congresso).

24.
Gordon Conference. Frustation and Hydrofobicity interplay in protein folding and protein evolution. 2006. (Congresso).

25.
XXXVII Latin American School of Physics. Prediction of Protein Strucuture Using Genetic Algorithms and Rotamer Library. 2006. (Congresso).

26.
Gordon Research Conference on Protein Folding Dynamics. Protein Folding. 2004. (Congresso).

27.
2nd International Workshop on Spectroscopy for Biology. Topological Aspects of optimally Designed proteins. 2004. (Congresso).

28.
VI Simpósio de Iniciação Científica e IV Seminário de Ensino de Pesquisa.Algoritmos de Otimização em Sistemas Biológicos. 2004. (Simpósio).

29.
Curso de Extensão: Curso de Verão em Biofísica Molecular.A Era Genômica: Conquistas e Desafios. 2004. (Outra).

30.
Conferência da Pós-Graduação. Desafios da Pós-Graduação na UNESP. 2003. (Congresso).

31.
Grupo de Física Biológica.Enovelamento de Proteínas - Técnicas de Simulação. 2003. (Seminário).

32.
Simpósio de Homenagem ao Prof. Silvestre Ragusa.Espalhamento Compton de Hadrons. 2003. (Simpósio).

33.
Simpósio sobre Pós-Graduação e Pesquisa: A Nova Agenda. 2003. (Simpósio).

34.
Curso de Extensão: Curso de Verão em Biofísica Molecular.Modelos para Estudo do Enovelamento de Proteínas. 2003. (Outra).

35.
XV Semana da Matemática.Mesa Redonda: Perspectivas em Programas de Pós-Graduação para Egressos dos Cursos de Matemática. 2003. (Outra).

36.
XVIII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada.Uso da Técnica de Histogramas no Estudo de Polieletrólitos. 1995. (Encontro).

37.
17o. Colóquio de Incentivo à Pesquisa.Desenvolvimento de Software para Simulação e Animação em Física. 1990. (Encontro).

38.
13o. Colóquio de Incentivo à Pesquisa.História das Partículas Elementares. 1986. (Outra).


Organização de eventos, congressos, exposições e feiras
1.
CHAHINE, J. . Coordenação da Sessão Assorted Topics in Statistical Mechanics, bo XXXVI ENFMC. 2013. (Congresso).

2.
CHAHINE, J. . Coordenação da Sessão "Applications of New Material in Biophysics" no XXXVI Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. 2013. (Congresso).

3.
CHAHINE, J. . II Encontro de Pós-Graduação do IBILCE - IIEPGI. 2007. (Outro).



Orientações



Orientações e supervisões em andamento
Dissertação de mestrado
1.
Driely Oliveira Santos. Cálculo do coeficiente de difusão no enovelamento de Proteínas. Início: 2012. Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Orientador).

Tese de doutorado
1.
Luciane Sussuchi. Simulações Computacionais em Sistemas Proteína Ligante. Início: 2010. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Orientador).

2.
Franciele Polotto. Equação de Fokker - Planck e Enovelamento de Proteínas. Início: 2010. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. (Co-orientador).


Orientações e supervisões concluídas
Dissertação de mestrado
1.
Denise Caldas Campos. Solução da Equação de Fokker-Planck para o Potencial do Oscilador Harmônico Duplo. 2012. Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Co-Orientador: Jorge Chahine.

2.
Denise Cavalcante de Melo. Estruturação do Eumenine Mastoparano por Dinâmica Molecular em misturas de TFE água. 2007. Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Jorge Chahine.

3.
Fernando César Lopes Filho. Estudo por Dinâmica Molecular da Estabilidade de Dímeros do Peptídeo EMP-AF em Água e Mistura TFE-Água. 2007. Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Co-Orientador: Jorge Chahine.

4.
André Luiz Martins. Predição de Estruturas de Proteínas utilizando o Algoritmo da Rede Elástica. 2005. 0 f. Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Jorge Chahine.

5.
Fausto Roberto Ferreira. O Uso de Redes Neurais Artificais MLP na Predição de Estruturas Secundárias de Proteínas. 2004. 0 f. Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Jorge Chahine.

6.
Lessandra Eler. O Uso do Método de crescimento de cadeias no estudo do enovelamento de proteínas. 2003. 0 f. Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Jorge Chahine.

7.
Ricardo Hildebrand Theodoro da Silva. Comportamento Termodinâmico e a Cinética de Mutações de Proteínas Otimamente Desenhadas em Modelos de Rede. 2002. 0 f. Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Co-Orientador: Jorge Chahine.

Tese de doutorado
1.
André Luiz Martins. Uso de Modelos de Rede no Estudo de Enovelamento de Proteínas. 2012. 0 f. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Jorge Chahine.

2.
Ronaldo Junio de Oliveira. Estudo do Coeficiente de Difusão no Enovelamento de Proteínas. 2011. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Co-Orientador: Jorge Chahine.

3.
Diego Oliveira Nolasco da Silva. Estudos estruturais por Dinâmica Molecular do Peptídeo Polybia-MPI via Replica Exchange. 2010. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Jorge Chahine.

4.
Luis Paulo Barbour Scott. Investigação da Utilização de Algoritmos Genéticos e Redes Neurais Artificiais na Predição de Estruturas Protéicas. 2003. 0 f. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Jorge Chahine.

Trabalho de conclusão de curso de graduação
1.
Rafaela Magalhães Tavares. Cálculo do Coeficiente de Difusão no Enovelamento de Proteínas por Análise Bayesiana. 2012. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Bacharelado em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Universidade Estadual Paulista - BAEE. Orientador: Jorge Chahine.

2.
Driely Oliveira Santos. Estudo do Coeficiente de Difusão no Enovelamento de Proteínas Utilizando Dinâmica Estocástica. 2012. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Bacharelado em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Universidade Estadual Paulista - BAEE. Orientador: Jorge Chahine.

3.
Renata da Fonseca Moraes Batista. Equação de Fokker-Planck e o Enovelamento de Proteínas. 2010. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho. Orientador: Jorge Chahine.

4.
Mauro Tatibana. Implementação de Softwares Gráficos em Duas e Três Dimensões. 1994. 0 f. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Bacharelado Em Ciências da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho. Orientador: Jorge Chahine.

5.
Cristina Sakaji. Implementação de Softwares Gráficos em Duas e Três Dimensões. 1994. 0 f. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Bacharelado Em Ciências da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho. Orientador: Jorge Chahine.

Iniciação científica
1.
Renata Batista Fonseca. Equação de Fokker-Planck e Enovelamento de Proteínas. 2010. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, unesp. Orientador: Jorge Chahine.

2.
Mavi Maria Polo. Implementação de um Software Gráfico para homogeneização de vários programas. 1996. 0 f. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado Em Ciências da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Jorge Chahine.

3.
Marco Antonio Guimaraes. Nova Forma de Simulação Monte Carlo de Polieletrólitos Exibindo Transição Induzida pela Temperatura. 1992. 0 f. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado Em Ciências da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Jorge Chahine.

4.
Fernando Ribeiro Cavichiolli. Nova Forma de Simulação Monte Carlo e Polieletrólitos Exibindo Transição Induzida por Interação Hidrofóbica. 1992. 0 f. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado Em Ciências da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Jorge Chahine.

5.
Oswaldo dos Santos Gazola. Medida da Radiação Solar Direta, Difusa e Total Através da Construção de um Radiômetro. 1982. 0 f. Iniciação Científica. (Graduando em Licenciatura Em Matemática) - Centro Universitário da Fundação Educacional de Barretos, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Jorge Chahine.

Orientações de outra natureza
1.
Vinicius Martins de Oliveira. Disciplina "Métodos Computacionais II". 2012. Orientação de outra natureza. (Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho. Orientador: Jorge Chahine.

2.
Driley Oliveira Santos. Estudo do Coeficiente de Difusão no Enovelamento de Proteínas Utilizando Dinâmica Estocástica. 2012. Orientação de outra natureza. (Bacharelado em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Universidade Estadual Paulista - BAEE. Orientador: Jorge Chahine.

3.
Rafaela Magalhães Tavares. Cálculo do Coeficiente de Difusão no Enovelamento de Proteínas por Análise Beyesiana. 2012. Orientação de outra natureza. (Bacharelado em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Universidade Estadual Paulista - BAEE. Orientador: Jorge Chahine.

4.
Driely Oliveira Santos. Estudos sobre Introdução à Dinâmica Molecular. 2011. Orientação de outra natureza. (Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Universidade Estadual Paulista - BAEE. Orientador: Jorge Chahine.

5.
Rafaela Magalhães Tavares. Estudos sobre Introdução à Dinâmica Molecular. 2011. Orientação de outra natureza. (Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Universidade Estadual Paulista - BAEE. Orientador: Jorge Chahine.

6.
Marcelo Tozo de Araujo. Disciplina Mecânica Estaística. 2011. Orientação de outra natureza. (Bacharelado em Física Biológica) - Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto. Orientador: Jorge Chahine.

7.
Antonio Bento de Oliveira Junior. Disciplina Mecânica Clássica. 2011. Orientação de outra natureza. (Bacharelado em Física Biológica) - Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto. Orientador: Jorge Chahine.

8.
Luciane Sussuchi. Disciplina Mecânica Estatística. 2010. Orientação de outra natureza. (Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho. Orientador: Jorge Chahine.

9.
Carolina Penhavel de Souza. Estudo Conformacional por Dinâmica Molecular de Peptídeos Antimicrobianos. 2010. Orientação de outra natureza. (Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Pró-Reitoria de Extensão / Universidade Estadual Paulista. Orientador: Jorge Chahine.

10.
Carolina Penhavel de Souza. Uso de Modelos de Rede para Estudo do Enovelamento de Proteínas. 2009. Orientação de outra natureza. (Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Pró-Reitoria de Extensão / Universidade Estadual Paulista. Orientador: Jorge Chahine.

11.
Gisele Baldissera. Disciplina Mecânica Estatística. 2008. Orientação de outra natureza. (Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho. Orientador: Jorge Chahine.

12.
Ronaldo Junio de Oliveira. Disciplina Mecânica Clássica. 2008. Orientação de outra natureza. (Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho. Orientador: Jorge Chahine.

13.
Leandro Cristante de Oliveira. Mecânica Estatística. 2006. Orientação de outra natureza. (Bacharelado Em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho. Orientador: Jorge Chahine.



Outras informações relevantes


BOLSAS E AUXÌLIOS RECEBIDOS

1 - Bolsa CAPES para Estágio pós-doutoral no exterior de 02/01/2006  a  01/03/2006 ,  processo BEX2760/05-3, valor US$ 4.130,00
2 - Auxilio FUNDUNESP para organização da "Primeira Semana da Pós-Graduação do Programa de Biofísica Molecular",  de 03 a 05/06/2004, processo 00347/04-DFP.  Valor: R$ 1.100,00
3 - Auxílio para participação em Congresso no exterior, projeto CAPES -  Prodoc, coordenado por Prof. Jorge Chahine. Valor: US$ 925,00
4 - Auxílio CAPES para despesas de publicação de artigo científico no exterior, em 11/2005, valor de R$ 980,12
5 - Bolsa FAPESP para Estágio pós-doutoral no Exterior de 12/19/1996 a 11/10/1998, na Universidade da Califórnia,  processo 96/05399-1
6 - Bolsa de mestrado FAPESP obtida para o aluno de mestrado Alexandre Lopes Veneziano em 03/1994, processo 93/04004-5
7 - Bolsa de doutorado FAPESP obtida para o aluno de doutorado Luis Paulo Barbour Scott em 09/2000, Processo 00/05473-4



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