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Univ Federal do Rio de Janeiro

Paulo Mascarello Bisch
Bolsista de Produtividade em Pesquisa do CNPq - Nível 1B

possui Bacharelado em Fisica pela Universidade Federal do Rio Grande do Sul (1971), Mestrado em Física pelo Centro Brasileiro de Pesquisas Físicas (1974) e Doutorado em Ciências (Física) pela Universite Libre de Bruxelles, Bélgica (1980). Atualmente é Professor Titular do Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho da Universidade Federal do Rio de Janeiro. Tem experiência nas áreas de Física, Físico-Química e Biofísica, com ênfase em Biofísica Molecular, Celular e de Sistema, atuando principalmente nos seguintes temas: sistemas biológicos, biologia estrutural, microscopia de força atômica, modelagem molecular, bioinformática, genômica e proteômica.
(Texto informado pelo autor)

Última atualização do currículo em 26/12/2011
Endereço para acessar este CV:
http://lattes.cnpq.br/5928043800446342
Dados pessoais
NomePaulo Mascarello Bisch
Nome em citações bibliográficasBISCH, P. M.;Bisch, Paulo M.;Bisch, Paulo M;Bisch, Paulo Mascarello;BISCH, P
SexoMasculino
Endereço profissionalUniversidade Federal do Rio de Janeiro, Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho.
UFRJ/IBCCF
Ilha do Fundão
21949-900 - Rio de Janeiro, RJ - Brasil
Telefone: (21) 25626575 Fax: (21) 22808193

Formação acadêmica/Titulação
1980 - 1981Pós-Doutorado .
Universitat Ulm.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Biofísica Molecular.
1975 - 1980Doutorado em Doutorado Em Ciências Física .
Université Libre de Bruxelles, ULB, Bélgica.
Título: On the Electrohydrodynamics of Fluid Interfaces : Stability and Surface Waves, Ano de Obtenção: 1980.
Orientador: Albert Sanfeld.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física.
1972 - 1974Mestrado em Mestrado Em Física .
Centro Brasileiro de Pesquisas Físicas, CBPF, Brasil.
Título: Estudo da Resposta Magnética em Sistemas Metálicos; Efeitos da Correlação Coulombiana e de Potenciais de Impurezas, Ano de Obtenção: 1974.
Orientador: Affonso Gomes.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Física da Matéria Condensada.
1967 - 1971Graduação em Bacharelado Em Fisica .
Universidade Federal do Rio Grande do Sul, UFRGS, Brasil.

Atuação profissional
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Vínculo institucional
1993 - 1993 Vínculo: Professor Visitante, Enquadramento Funcional: Professor titular, Regime: Dedicação exclusiva.
Atividades
3/1993 - 6/1993Pesquisa e desenvolvimento , Instituto de Física, Departamento de Física Experimental.
Linhas de pesquisa
Modelagem e Dinâmica de Biomoléculas
3/1993 - 6/1993Ensino, Física, Nível: Pós-Graduação.
Disciplinas ministradas
Biofísica
Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.
Vínculo institucional
1993 - Atual Vínculo: Servidor público ou celetista, Enquadramento Funcional: Professor titular, Regime: Dedicação exclusiva.
Atividades
3/1994 - AtualEnsino, Nível: Graduação.
Disciplinas ministradas
Métodos Matemátios em Biologia
Fundamentos de Biofísica
3/1994 - AtualEnsino, Ciências Biológicas (Biofísica), Nível: Pós-Graduação.
Disciplinas ministradas
Matemática I
Físico-Química I
Métodos de Física Molecular e Espectroscopia
11/1993 - AtualDireção e administração, Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho, Laboratorio de Física Biológica.
Cargo ou função
Chefe de Laboratorio.
11/1993 - AtualPesquisa e desenvolvimento , Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho, Laboratorio de Física Biológica.
Linhas de pesquisa
Métodos Físicos aplicados a Biociencias
5/1995 - 6/2000Direção e administração, Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho, Programa de Bifisica Celular e de Sistemas.
Cargo ou função
Coordenador de Programa.
Centro Brasileiro de Pesquisas Físicas, CBPF, Brasil.
Vínculo institucional
1988 - 1993 Vínculo: Servidor público ou celetista, Enquadramento Funcional: Pesquisador Titular, Carga horária: 0
Vínculo institucional
1983 - 1988 Vínculo: Servidor público ou celetista, Enquadramento Funcional: Pesquisador Associado
Vínculo institucional
1980 - 1983 Vínculo: Bolsista recém-doutor, Enquadramento Funcional: BOLSA ESPECIAL DE PESQUISA
Atividades
3/1983 - 11/1993Ensino, Pós-Graduação em Física, Nível: Pós-Graduação.
Disciplinas ministradas
Termodinâmica de Não-Equilíbrio
Biofísica
Mecânica Estatística
8/1982 - 11/1993Pesquisa e desenvolvimento , Departamento de Materia Condensada e Espectroscopia, Grupo de Biofísica.
Linhas de pesquisa
TERMODINAMICA E MEC. ESTATISTICA DE INTERFACES E FILMES
7/1988 - 6/1989Direção e administração, Departamento de Materia Condensada e Espectroscopia, .
Cargo ou função
Chefe de Departamento.
6/1986 - 10/1988Direção e administração, Coordenação de Formação Científica, .
Cargo ou função
Coordenador de Programa.

Linhas de Pesquisa
1. TERMODINAMICA E MEC. ESTATISTICA DE INTERFACES E FILMES
2. Métodos Físicos aplicados a Biociencias
3. Modelagem e Dinâmica de Biomoléculas

Áreas de atuação
1. Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica.
2. Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Biofísica Molecular / Especialidade: Modelagem e Dinamica de Biomoléculas.
3. Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Biofísica Celular / Especialidade: Microscopia de Força Atômica de Superfícies Celulares.
4. Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Física Estatística e Termodinamica de Não-Equilíbrio.
5. Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Química / Subárea: Físico-Química de Interfaces Líquidas.
6. Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Biofísica de Processos e Sistemas.

Idiomas
Alemão Compreende Razoavelmente, Fala Pouco, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.
Inglês Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Espanhol Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.
Francês Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Italiano Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.


Produção em C,T & A
Produção bibliográfica
Artigos completos publicados em periódicos
1. Lery, Letícia M. S. ; Hemerly, Adriana S. ; Nogueira, Eduardo M. ; von Krüger, Wanda M. A. ; Bisch, Paulo M. . Quantitative Proteomic Analysis of the Interaction Between the Endophytic Plant-Growth-Promoting Bacterium and Sugarcane. Molecular Plant-Microbe Interactions, v. 24, p. 562-576, 2011.
2. Batista, Paulo Ricardo ; de Souza Costa, Mauricio Garcia ; Pascutti, Pedro Geraldo ; Bisch, Paulo Mascarello ; de Souza, Wanderley . High temperatures enhance cooperative motions between CBM and catalytic domains of a thermostable cellulase: mechanism insights from essential dynamics. PCCP. Physical Chemistry Chemical Physics (Print), v. 13, p. 13709, 2011.
3. Andrade, I. S. ; Vianez, J. L. ; GOULART, C. L. ; Homble, F. ; Ruysschaert, J.-M. ; von KRUGER, W. M. A. ; BISCH, P. M. ; DE SOUZA, W. ; MOHANA-BORGES, R. ; Motta, M. C. M. . Characterization of a porin channel in the endosymbiont of the trypanosomatid protozoan Crithidia deanei. Microbiology (Reading. Print), v. 157, p. 2818-2830, 2011.
4. Parente, Thiago E.M. ; Rebelo, Mauro F. ; da-Silva, Manuela L. ; Woodin, Bruce R. ; Goldstone, Jared V. ; Bisch, Paulo M. ; Paumgartten, Francisco J.R. ; Stegeman, John J. . Structural features of cytochrome P450 1A associated with the absence of EROD activity in liver of the loricariid catfish Pterygoplichthys sp.. Gene (Amsterdam), v. 489, p. 111-118, 2011.
5. Diniz, M. M. P. ; GOULART, C. L. ; Barbosa, L. C. ; Farache, J. ; LERY, L. M. S. ; Pacheco, A. B. F. ; BISCH, P. M. ; von Kruger, W. M. d. A. . Fine-Tuning Control of phoBR Expression in Vibrio cholerae by Binding of PhoB to Multiple Pho Boxes. Journal of Bacteriology (Print), v. 193, p. 6929-6938, 2011.
6. Batista, Paulo R. ; Pandey, Gaurav ; Pascutti, Pedro G. ; Bisch, Paulo M. ; Perahia, David ; Robert, Charles H. . Free Energy Profiles along Consensus Normal Modes Provide Insight into HIV-1 Protease Flap Opening. Journal of Chemical Theory and Computation, v. 7, p. 2348-2352, 2011.
7. Batista, Paulo Ricardo ; Robert, Charles Herbert ; Maréchal, Jean-Didier ; Hamida-Rebaï, Meriam Ben ; Pascutti, Pedro Geraldo ; Bisch, Paulo Mascarello ; Perahia, David . Consensus modes, a robust description of protein collective motions from multiple-minima normal mode analysis application to the HIV-1 protease. PCCP. Physical Chemistry Chemical Physics (Print), v. 12, p. 2850-2859, 2010.
8. Rocha, Gustavo Miranda ; Teixeira, Dirceu Esdras ; Miranda, Kildare ; WEISSMÜLLER, GILBERTO ; Bisch, Paulo Mascarello ; de Souza, Wanderley . Structural Changes of the Paraflagellar Rod during Flagellar Beating in Trypanosoma cruzi. Plos One, v. 5, p. e11407, 2010.
9. GOULART, C. L. ; dos Santos, G. G. ; Barbosa, L. C. ; LERY, L. M. S. ; BISCH, P. M. ; von KRUGER, W. M. A. . A ToxR-dependent role for the putative phosphoporin VCA1008 in bile salt resistance in Vibrio cholerae El Tor N16961. Microbiology (Reading. Print), v. 156, p. 3011-3020, 2010.
10. Rocha, Gustavo Miranda ; Miranda, Kildare ; WEISSMÜLLER, GILBERTO ; Bisch, Paulo Mascarello ; de Souza, Wanderley . Visualization of the flagellar surface of protists by atomic force microscopy. Micron (Oxford. 1993), v. 41, p. 939-944, 2010.
11. Lery, Letícia MS ; Bitar, Mainá ; Costa, Mauricio GS ; Rössle, Shaila CS ; Bisch, Paulo M . Unraveling the molecular mechanisms of nitrogenase conformational protection against oxygen in diazotrophic bacteria. BMC Genomics, v. 11, p. S7, 2010.
12. Costa, Mauricio GS ; Batista, Paulo R ; Shida, Cláudio S ; Robert, Charles H ; Bisch, Paulo M ; Pascutti, Pedro G . How does heparin prevent the pH inactivation of cathepsin B? Allosteric mechanism elucidated by docking and molecular dynamics. BMC Genomics, v. 11, p. S5, 2010.
13. Bertalan, Marcelo ; Albano, Rodolpho ; de Pádua, Vânia ; Rouws, Luc ; Rojas, Cristian ; Hemerly, Adriana ; Teixeira, Kátia ; Schwab, Stefan ; Araujo, Jean ; Oliveira, André ; França, Leonardo ; Magalhães, Viviane ; Alquéres, Sylvia ; Cardoso, Alexander ; Almeida, Wellington ; Loureiro, Marcio ; Nogueira, Eduardo ; Cidade, Daniela ; Oliveira, Denise ; Simão, Tatiana ; Macedo, Jacyara ; Valadão, Ana ; Dreschsel, Marcela ; Freitas, Flávia ; Vidal, Marcia ; Guedes, Helma ; Rodrigues, Elisete ; Meneses, Carlos ; Brioso, Paulo ; Pozzer, Luciana ; Figueiredo, Daniel ; Montano, Helena ; Junior, Jadier ; de Souza Filho, Gonçalo ; Martin Quintana Flores, Victor ; Ferreira, Beatriz ; Branco, Alan ; Gonzalez, Paula ; Guillobel, Heloisa ; Lemos, Melissa ; Bisch, Paulo M . Complete genome sequence of the sugarcane nitrogen-fixing endophyte Gluconacetobacter diazotrophicus Pal5. BMC Genomics, v. 10, p. 450, 2009.
14. Goulart, Carolina L. ; Lery, Letà cia M.S. ; Diniz, Michelle M.P. ; Vianez-Junior, Joà o L. ; Neves-Ferreira, Ana Gisele C. ; Perales, Jonas ; Bisch, Paulo M ; von Krà ger, Wanda M.A. . Molecular analysis of VCA1008: a putative phosphoporin of. FEMS Microbiology Letters, v. 298, p. 241-248, 2009.
15. Rocha, Gustavo Miranda ; Miranda, Kildare ; WEISSMÜLLER, GILBERTO ; Bisch, Paulo Mascarello ; de Souza, Wanderley . Ultrastructure ofTrypanosoma cruzi revisited by atomic force microscopy. Microscopy Research and Technique (Print), v. 71, p. 133-139, 2008.
16.   Lery, Leticia M. S. ; Coelho, Ana ; von?Kruger, Wanda M. A. ; Gonçalves, Mayla S. M. ; Santos, Marise F. ; Valente, Richard H. ; Santos, Eidy O. ; Rocha, Surza L. G. ; Perales, Jonas ; Domont, Gilberto B. ; Teixeira, Katia R. S. ; BERTALAN, M. ; FERREIRA, P. C. G. ; BISCH, P. M. . Protein expression profile ofGluconacetobacter diazotrophicus PAL5, a sugarcane endophytic plant growth-promoting bacterium. Proteomics, v. 8, p. 1631-1644, 2008.
17.   Lopes, Francisco J. P. ; Vieira, Fernando M. C. ; Holloway, David M. ; Bisch, Paulo M. ; Spirov, Alexander V. ; Ohler, Uwe . Spatial Bistability Generates hunchback Expression Sharpness in the Drosophila Embryo. PLoS Computational Biology, v. 4, p. e1000184, 2008.
18. LERY, L ; VONKRUGER, W ; VIANA, F ; TEIXEIRA, K ; BISCH, P . A comparative proteomic analysis of Gluconacetobacter diazotrophicus PAL5 at exponential and stationary phases of cultures in the presence of high and low levels of inorganic nitrogen compound. Biochimica et Biophysica Acta. Proteins and Proteomics, v. 1784, p. 1578-1589, 2008.
19. WEISSMÜLLER, GILBERTO ; YURTSEVER, AYHAN ; COSTA, LILIAN T. ; PACHECO, ANA B. F. ; Bisch, Paulo M. ; HECKL, WOLFGANG M. ; STARK, ROBERT W. . TORSIONAL RESONANCE MODE ATOMIC FORCE MICROSCOPY OF A PROTEIN DNA COMPLEX. NANO, v. 03, p. 443, 2008.
20. CRUZEIRO-SILVA, C. ; GOMES-NETO, F. ; TINOCO, L. W. ; CILLI, E. M. ; BARROS, P. V. ; LAPIDO-LOUREIRO, P. A. ; BISCH, P. M. ; ALMEIDA, F. C. ; VALENTE, A. P. . Structural biology of membrane-acting peptides: Conformational plasticity of anticoccidial peptide PW2 probed by solution NMR. Biochimica et Biophysica Acta. Biomembranes, v. 1768, p. 3182-3192, 2007.
21. SALLES, D. ; CABRAL, R. E. ; PIZZATTI, L. ; BISCH, P. M. ; PAIXÃO, J. C. ; ALMEIDA, C. E. ; SEUÁNEZ, H. N. ; CABRAL-NETO, J. B. . Changes in protein expression due to deleterious mutations in the FA/BRCA pathway. Biochemical and Biophysical Research Communications, v. 364, p. 755-760, 2007.
22. CARNEIRO, F. A. ; LAPIDO-LOUREIRO, P. A. ; CORDO, S. M. ; STAUFFER, F. ; WEISSMULLER, G. ; BIANCONI, M. L. ; JULIANO, M. A. ; JULIANO, L. ; BISCH, P. M. ; POIAN, A. T. D. . Probing the interaction between vesicular stomatitis virus and phosphatidylserine. European Biophysics Journal, v. 35, n. 2, p. 145-154, 2006.
23.   von KRUGER, W. M. A. ; LERY, L. M. S. ; SOARES, M. R. ; MANTA, F. S. N. ; SILVA, C. M. B. E. ; NEVES-FERREIRA, A. G. C. ; PERALES, J. ; BISCH, P. M. . The phosphate starvation response in Vibrio cholerae O1 and phoB mutant under proteomic analysis: disclosing functions involved in adaptation, survival, and virulence. Proteomics, v. 6, p. 1495-1511, 2006.
24. MORET, M. A. ; PASCUTTI, P. G. ; BISCH, P. M. ; MUNDIM, M. S. P. ; MUNDIM, K. C. . Classical and quantum conformational analysis using generalized genetic algorithm. Physica. A, v. 363, p. 260-268, 2006.
25. Larentis AL ; Almeida RV ; ROSSLE, S. C. ; CARDOSO, A. M. ; ALMEIDA, W. I. ; BISCH, P. M. ; ALVES, T. L. M. ; MARTINS, O. B. . Expression and homology modelling of 2 '-aminobiphenyl-2,3-diol-1,2-dioxygenase from Pseudomonas stutzeri carbazole degradation pathway. Cell Biochemistry and Biophysics, v. 44, p. 530-538, 2006.
26. PIZZATTI, L. ; SA, L. A. ; SOUZA, J. M. ; BISCH, P. M. ; ABDELHAY, E. . Altered protein profile in chronic myeloid leukemia chronic phase identified by a comparative proteomic study. BBA. Proteins and Proteomics, v. 1764, p. 929-942, 2006.
27. Almeida RV ; ALQUERES, SMC ; Larentis AL ; ROSSLE, S. C. ; CARDOSO, A. M. ; ALMEIDA, W. I. ; BISCH, P. M. ; ALVES, T. L. M. ; MARTINS, O. B. . Cloning, expression, partial characterization and structural modeling of a novel esterase from Pyrococcus furiosus. Enzyme and Microbial Technology, v. 39, p. 1128-1136, 2006.
28. Larentis AL ; Almeida RV ; CARDOSO, A. M. ; ALMEIDA, W. I. ; ROSSLE, S. C. ; BISCH, P. M. ; MARTINS, O. B. ; ALVES, T. L. M. . Homology modeling of the oxygenase component of carbazole 1,9a-dioxygenase (CarAa) involved in petroleum denitrogenation pathway of Pseudomonas sp. Brazilian Archives of Biology and Technology, v. 49, p. 53-61, 2006.
29. CAVALCANTI, M. C. ; TARGINO, R. ; BAIAO, F. ; ROSSLE, S. C. ; PIRES, P. F. ; BISCH, P. M. ; CAMPOS, M. L. M. ; MATTOSO, M. . Managing structural genomic workflows using Web services. Data & Knowledge Engineering, v. 53, n. 1, p. 45-74, 2005.
30. SILVA, R. ; FERNANDES, M. ; ROSSLE, S. C. ; BISCH, P. M. ; RONDINELLI, E. ; URMENYI, T. P. . Gene characterization and predicted protein structure of the mitochondrial chaperonin HSP10 of Trypanosoma cruzi. Gene (Amsterdam), v. 349, p. 135-142, 2005.
31. LOPES, F. J. ; ALONSO, C. E. V. ; BISCH, P. M. ; VIEIRA, F. M. C. . A kinetic mechanism for Drosophila bicoid cooperative binding. Journal of Theoretical Biology, v. 235, n. 2, p. 185-198, 2005.
32. LORENZO, A. C. ; BISCH, P. M. . Analyzing different parameters of steered molecular dynamics for small membrane interacting molecules. Journal of Molecular Graphics and Modelling, v. 24, n. 1, p. 59-71, 2005.
33. MEYER, L. A. V. C. ; ROSSLE, S. C. ; BISCH, P. M. ; MATTOSO, M. . Parallelism in bioinformatics workflows. Lecture Notes in Computer Science, v. 3402, p. 583-597, 2005.
34. MORET, M. A. ; BISCH, P. M. ; NOGUEIRA JR, E. ; PASCUTTI, P. G. . Stochastic strategy to analyze protein folding. Physica. A, v. 353, p. 353-364, 2005.
35. L. T. Costa ; KERKMANN, M. ; HARTMANN, G. ; ENDRES, S. ; BISCH, P. M. ; HECKL, W. M. ; THALHAMMER, S. . Structural studies of oligonucleotides containing G-quadruplex motifs using AFM. Biochemical and Biophysical Research Communications, SAN DIEGO, CA 92101-4495 USA, v. 313, n. 4, p. 1065-1072, 2004.
36. SOARES, M. R. ; BISCH, P. M. ; CARVALHO, A. C. C. ; VALENTE, A. P. ; ALMEIDA, F. . Correlation between conformation and antibody binding: NMR structure of cross-reactive peptides from T. cruzi, human and L-braziliensis. FEBS Letters, AMSTERDAM, NETHERLANDS, v. 560, n. 1-3, p. 134-140, 2004.
37. L. T. Costa ; PINTO, J. R. ; MORAES, M. B. ; da Souza G:G:B: ; SORENSON, M. M. ; BISCH, P. M. ; WEISSMULLER, G. . Chemical treatment of mica for atomic force microscopy can affect biological sample conformation. Biophysical Chemistry, AMSTERDAM, NETHERLANDS, v. 109, n. 1, p. 63-71, 2004.
38. COELHO, A. ; SANTOS, E. D. O. ; FARIA, M. L. D. H. ; de CARVALHO, D. P. ; SOARES, M. R. ; von KRUGER, W. M. A. ; BISCH, P. M. . A proteome reference map for Vibrio cholerae El Tor. Proteomics, WEINHEIM, GERMANY, v. 4, n. 5, p. 1491-1504, 2004.
39.   KUHNER, F. ; L. T. Costa ; BISCH, P. M. ; THALHAMMER, S. ; HECKL, W. M. ; GAUB, H. E. . LexA-DNA Bond Strength by Single Molecule Force Spectroscopy. Biophysical Journal, USA, v. 87, p. 2683-2690, 2004.
40. LORENZO, A. C. ; PASCUTTI, P. G. ; BISCH, P. M. . Nonspecific Interaction Forces at Water-Membrane Interface by Forced Molecular Dynamics Simulation. Journal of Computational Chemistry, EEUU, v. 24, n. 03, p. 328-339, 2003.
41.   DARDENNE, L. E. ; WERNECK, A. S. ; OLIVEIRA NETO, M. ; BISCH, P. M. . Electrostatic Properties in the Catalytic Site of Papain: A Possible Regulatory Mechanism for the Reactivity of the Ion Pair. Proteins, New York, v. 52, n. 2, p. 236-254, 2003.
42. CIDADE, G. A. G. ; L. T. Costa ; WEISSMULLER, G. ; SILVA NETO, A. ; ROBERTY, N. ; MORAES, M. B. ; PRAZERES, G. M. P. ; HILL, C. E. M. ; RIBEIRO, S. J. M. ; BISCH, P. M. . Atomic Force Microscopy as a Tool for Biomedical and Biotechnological Studies. Artificial Organs, v. 27, n. 5, p. 447-451, 2003.
43. PRAZERES, G. M. P. ; BATISTA, E. D. J. O. ; SOUZA, W. ; BISCH, P. M. ; WEISSMULLER, G. . Interaction between chondroitin-6-sulfate and Entamoeba histolytica as revealed by force spectroscopy. Experimental Parasitology, SAN DIEGO, CA 92101-4495 USA, v. 104, n. 1-2, p. 40-46, 2003.
44. MORET, M. ; BISCH, P. M. ; MUNDIN, K. C. ; PASCUTTI, P. G. . New Stochastic Strategy to Analyze Helix Folding. Biophysical Journal, EEUU, v. 82, p. 1123-1132, 2002.
45. ROSSLE, S. C. ; BISCH, P. M. ; LONE, Y. ; ABASTADO, J. ; KOURILSKY, P. ; BELLIO, M. . Mutational analysis and molecular modeling of the binding of Staphylococus aureus enterotoxin C2 to a Murine T cell receptor Vbeta10 chain. European Journal of Immunology, Alemanha, v. 32, n. 8, p. 2172-2178, 2002.
46. CAFFARENA, E. R. ; GRIGERA, J. R. ; BISCH, P. M. . Stochastic Molecular Dynamics Simulations of Peanut Lectin PNA Complex with T-antigen Disaccharide. Journal of Molecular Graphics & Modelling, v. 21, p. 227-240, 2002.
47. MORET, M. A. ; PASCUTTI, P. G. ; MUNDIN, K. C. ; BISCH, P. M. ; NOGUEIRA JR, E. . Multifractality, Levinthal paradox, and energy hypersurface. Physical Review E - Statistical Physics, Plasmas, Fluids and Related Interdisciplinary Topics, v. 63, n. 02090-R, p. 01-04, 2001.
48. DARDENNE, L. E. ; WERNECK, A. S. ; OLIVEIRA NETO, M. ; BISCH, P. M. . Reassociation of fragments using multicentered multipolar expansions: peptide junction treatments to investigate electrostatic properties of proteins. Journal of Computational Chemistry, EEUU, v. 22, n. 07, p. 689-701, 2001.
49. SOUZA, E. R. ; ANTENEODO, C. B. ; GALLEZ, D. ; BISCH, P. M. . Long-Scale Evolution of Thin Liquid Films Bounded by a Viscous Phase with Diffusing Charged Surfactants. Journal of Colloid and Interface Science, New York, v. 244, n. 2, p. 303-312, 2001.
50. L.T.C. França ; SCHMIDT, J. ; MICHELS, A. ; HOROWITZ, F. ; GRIENEISEN, H. ; KIST, T. ; BISCH, P. M. . Using spin coating to deposit DNA over flat surfaces for AFM imaging. Acta Microscópica, v. 10, p. 79-82, 2001.
51. WEISSMULLER, G. ; GARCIA-ABREU, J. ; BISCH, P. M. ; NETO, V. M. ; CAVALCANTE, L. A. . Glial cells with differential neurite growth-modulating properties probed by atomic force microscopy. NEUROSCIENCE RESEARCH, v. 38, n. 2, p. 217-220, 2000.
52. CAFFARENA, E. R. ; BISCH, P. M. . Hydration of T-antigen Gal beta(1-3)GalNAc and the isomer Gal beta(1-3)GlcNAc by molecular dynamics simulations. JOURNAL OF MOLECULAR GRAPHICS & MODELLING, v. 18, n. 2, p. 119-125, 2000.
53. ANTENEODO, C. ; SOUZA, E. R. ; GALLEZ, D. ; BISCH, P. M. . Convection cells in thin electrolytic films. Physica. A, v. 283, n. 1-2, p. 243-249, 2000.
54. FARINA, M. ; SCHEMMEL, A. ; WEISSMULLER, G. ; CRUZ, R. ; BISCH, P. M. . Atomic Force Microscopy Study of Tooth Surfaces. Journal Of Structural Biology, v. 125, p. 39-49, 1999.
55. PASCUTTI, P. G. ; MUNDIM, K. C. ; ITO, A. S. ; BISCH, P. M. . Polarization Effects on Peptide Confromations at Water-Membrane Interface by Molecular Dynamics Simulation. Journal of Computational Chemistry, v. 20, n. 9, p. 971-982, 1999.
56. PASCUTTI, P. G. ; ELJAIK, L. J. ; BISCH, P. M. ; MUNDIM, K. C. ; ITO, A. S. . Molecualr dynamics simulation of alfa-melanocyte stimulating hormone in water-membrane model interface. European Biophysics Journal, v. 28, n. 6, p. 499-509, 1999.
57. MORET, M. A. ; PASCUTTI, P. G. ; BISCH, P. M. ; MUNDIN, K. C. . Stochastic Molecular Optimization Using Generalized Simulated Annealing. Journal of Computational Chemistry, v. 19, n. 6, p. 647-657, 1998.
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82. PRÉVOST, M. ; BISCH, P. M. ; SANFELD, A. . Stability Of Low Tension Interfaces And Propagation Of Longitudinal Waves: Role Of The Electrica Double Layer. Journal of Colloid and Interface Science, v. 88, n. 2, p. 353-371, 1982.
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88. HENNENBERG, M. ; BISCH, P. M. ; VIGNESADLER, M. ; SANFELD, A. . Mass-Transfer, Marangoni Effect, and Instability of Interfacial Longitudinal Waves: Diffusional Exchanges and Adsorption-Desorption Processes. Journal of Colloid and Interface Science, v. 74, n. 2, p. 495-508, 1980.
89. BISCH, P. M. ; VANLAMSWEERDEGALLEZ, D. ; SANFELD, A. . Hydrodynamic Stability Of Monolayes At Fluid-Fluid Interfaces I: Ion Interactions. Journal of Colloid and Interface Science, v. 71, n. 3, p. 501-512, 1979.
90. HENNENBERG, M. ; BISCH, P. M. ; VIGNESADLER, M. ; SANFELD, A. . Mass-Transfer, Marangoni Effect, and Instability of Interfacial Longitudinal Waves: Diffusional Exchange. Journal of Colloid and Interface Science, v. 69, n. 1, p. 128-137, 1979.
91. VANLAMSWEERDEGALLEZ, D. ; BISCH, P. M. ; SANFELD, A. . Hydrodynamic Stability Of Monolayes At Fluid-Fluid Interfaces II: Dipole Interactions. Journal of Colloid and Interface Science, v. 71, n. 3, p. 513-521, 1979.
92. VANLAMSWEERDEGALLEZ, D. ; BISCH, P. M. ; SANFELD, A. . Deformational Instability of Biomembranes Induced by Chemical Reactions and Electrical Interactions. Bioelectrochemistry and Bioenergetics, v. 5, n. 2, p. 401-410, 1978.
93. BISCH, P. M. ; TROPER, A. ; GOMES, A. A. . Effect Of Localized Perturbations On The Spin Polarization: Two Band Model.. Physical Review B - Solid State, v. 13, n. 9, p. 3902-3911, 1976.
Capítulos de livros publicados
1. WEISSMULLER, G. ; CIDADE, G. A. G. ; BISCH, P. M. . Microscopia de Força Atômica: Nanoscopia, Nanomanipulação e Nanocaracterização de Biomateriais. In: Ed. Cientifico Marcelo M. Morales. (Org.). Terapias Avançadas. 1a ed. São Paulo: Atheneu, 2007, v. unico, p. 307-321.
2. HERMANN, P. S. P. ; MATTOSO, L. H. C. ; FILHO, R. B. ; FROMMER, J. ; CIDADE, G. A. G. ; BISCH, P. M. ; WEISSMULLER, G. . Microscopias de Varredura por Sonda e Aspectos Práticos e suas Aplicações na Nanociência e Nanotecnologia. In: Duran, N.; Mattoso, L.H.C.; Morais, P.C.. (Org.). Nanotecnologia: Introdução, preparação e caracterização de novos materiais e exemplos de aplicação. 1a ed. São Paulo: Artliber Editora Ltda., 2006, v. 1, p. 110-139.
3. BISCH, P. M. . Genômica Funcional : Proteômica. In: Luís Mir. (Org.). Genômica. 1 ed. São Paulo: Editora Atheneu, 2004, v. 1, p. 139-162.
Resumos expandidos publicados em anais de congressos
1. WEISSMULLER, G. ; MORAES, M. B. ; PRAZERES, G. M. P. ; TEIXEIRA, L. S. P. ; L. T. Costa ; BATISTA, E. D. J. O. ; CARNEIRO, F. A. ; ISHIMARU, D. ; REZENDE, G. ; BISCH, P. M. . Multiple Applications of Atomic Force Microscope in Biology. In: Second Latin American Symposium on Scanning Probe Microscopy, 2003, Búzios, RJ. Acta Microscopica. México : CIASEM, 2003. v. 12. p. 29-33.
Resumos publicados em anais de congressos
1. LERY, L. M. S. ; CARVALHO, A. L. O. ; BISCH, P. M. ; ZINGAI, R. . PEPTIDOMICS ANALYSIS OF THE NITROGEN-FIXING BACTERIUM GLUCONACETOBACTER DIAZOTROPHICUS. In: XXXVI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquimica e Biologia Molecular, 2007, Salvador, BA. Anais da XXXVI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquimica e Biologia Molecular,, 2007.
2. LERY, L. M. S. ; GOULART, C. L. ; BISCH, P. M. ; von KRUGER, W. M. A. . PROTEOMIC ANALYSIS REVEALS INORGANIC PHOSPHATE-INDEPENDENT FUNCTIONS FOR THE PHOB/PHOR SYSTEM OF VIBRIO CHOLERAE 01. In: Vibrio2007 Conference, 2007, Paris, France. Proceedings of Vibrio2007 Conference, 2007.
3. LERY, L. M. S. ; TEIXEIRA, K. R. S. ; von KRUGER, W. M. A. ; BISCH, P. M. . Comparative proteomic analysis of Gluconacetobacter diazotrophicus PAL5 under nitrogen fixing and non fixing conditions. In: XVI Reunião Anual de usuários do LNLS, 2006, Campinas - SP. Resumos da XVI RAU, 2006.
4. von KRUGER, W. M. A. ; LERY, L. M. S. ; SOARES, M. R. ; MANTA, F. S. N. ; SILVA, C. M. B. E. ; NEVES-FERREIRA, A. G. C. ; PERALES, J. ; BISCH, P. M. . A Proteomic Analysis Of The Phosphate Stimulon In Vibrio Cholerae O1 Reveals Functions Involved In Adaptation, Survival And Pathogenesis. In: Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular SBBq, 2005, Águas de Linóia - SP. Anais da Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular SBBq, 2005.
5. LERY, L. M. S. ; TEIXEIRA, K. R. S. ; von KRUGER, W. M. A. ; BISCH, P. M. . Comparative proteomic analysis of Gluconacetobacter diazotrophicus PAL5 under nitrogen fixing and non fixing conditions. In: Congresso Brasileiro de Espectrometria de Massas BRMass, 2005. Anais do Congresso Brasileiro de Espectrometria de Massas BRMass.
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37. ROSSLE, S. C. ; BELLIO, M. ; BISCH, P. M. . Estudo por modelagem molecular da interação entre o receptor de célula T Cw3/1.1 e o superantígeno. In: XIV Reunião Anual da Federação de Sociedades de Biologia Experimental, 1999, Caxambú - MG. XIV Reunião Anual da Federação de Sociedades de Biologia Experimental, 1999. p. 320.
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Orientações
Orientações em andamento
Dissertação de mestrado
1. Leandro de Oliveira Santos. Estudos de bioinformática da distribuição filo-geográfica do gênero Vibrio. Início: 2010. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Biofísica)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Orientador).
2. Maira Arruda Cardoso. Estudo do padrão de expressão do gene hunchback durante o desenvolvimento embrionário da Drosophila melanogaster através de técnicas de imunohistoquímica e modelagem teórica. Início: 2010. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Biofísica)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Orientador).
Tese de doutorado
1. Daniel Moreira da Costa Leite. Caracterização da Interação do Fator Transcricional PhoB com o DNA e suas Implicações em Vibrio cholerae. Início: 2011. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biofísica)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro. (Orientador).
2. Pedro Victor Renault de Barros. Estudos de Modelagem Molecular da Rhodesaína, Uma Cisteíno-Protease do Trypanosoma brucei. Início: 2011. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biofísica)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro. (Orientador).
3. Mauricio Garcia de Souza Costa. Estudo estrutural da flexibilidade de enzimas direcionado a aplicações biomédicas e biotecnológicas. Início: 2009. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biofísica)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. (Orientador).
4. João Lídio da Silva Gonçalves Vianez Júnior. Modelagem comparativa em genômica funcional e estrutural de Vibrio cholerae,. Início: 2008. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biofísica)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Orientador).
Supervisões e orientações concluídas
Dissertação de mestrado
1. Daniel Moreira da Costa Leite. Estudos In Silico das vias Metabólicas de Produção de Ácido Indol-3-Acético em Bactérias com Enfoque em Gluconacetobacter Diazotrophicus. 2011. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Biofísica)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Paulo Mascarello Bisch.
2. Patrícia Machado de Barros. Gerência da Execução de Workflows Científicos de Bioinformática em Ambientes Distribuídos. 2009. Dissertação (Mestrado em Engenharia de Sistemas e Computação) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, . Co-Orientador: Paulo Mascarello Bisch.
3. Leticia Miranda Lery Santos. Análise proteômica da bactéria Gluconaecetobacter diazotrophicus: estabelecimento de um banco proteômico, expressão diferencial e implicações na anotação do genoma. 2007. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Biofísica)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, . Orientador: Paulo Mascarello Bisch.
4. Shaila Cintia Sykora Rossle. Estudo da Interação do Receptor de Célula T Cw3/1.1 com o Superantígeno SEC2 por Técnicas de Modelagem Molecular: Construção de Modelos por Homologia. 2000. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Biofísica)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Paulo Mascarello Bisch.
5. Monica da Luz Carvalho. Estimativa das Afinidades de Ligação de Inibidoires de Enzimas por Técnicas Modelagem Molecular: Aplicações para Inibidores de Cisteíno Proteases. 1999. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Biofísica)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Paulo Mascarello Bisch.
6. Gilza Maria Piedade Prazeres. Caracterização Físico-Química e Estrutural dos Componentes Lipídicos e Proteicos da Membrana Plasmática das Células do Cristalino. 1997. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Biofísica)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Paulo Mascarello Bisch.
7. Katya Maria Oliveira de Sousa. Formação de Estruturas Dissipativas Em Células de Diálise: Um Modelo de Auto-Organização. 1997. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Biofísica)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Paulo Mascarello Bisch.
8. FRANCISCO JOSE PEREIRA LOPES. Aplicacao da Formulacao Local da Termodinamica Ao Estudo dos Processos de Sedimentacao Em Solucoes. 1996. Dissertação (Mestrado em Física) - Centro Brasileiro de Pesquisas Físicas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Paulo Mascarello Bisch.
9. Gilberto Weissmuller. Propriedades Termodinâmicas e Cinéticas do Transporte Ativo em Biomembranas: Efeitos de Cooperatividade. 1989. 0 f. Dissertação (Mestrado em Mestrado Em Física) - Centro Brasileiro de Pesquisas Físicas, . Orientador: Paulo Mascarello Bisch.
10. Fernado da Silva Rodrigues. Teoria Estatistica dos Efeitos de Superficie Na Estruturacao da Agua: Estudo das Forcas de Hidratacao Em Filmes Aquosos.. 1986. Dissertação (Mestrado em Física) - Centro Brasileiro de Pesquisas Físicas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Paulo Mascarello Bisch.
Tese de doutorado
1. Manuela Leal da Silva. Modelagem molecular de proteínas da bactéria endofítica Gluconacetobacter diazotrophicus: Análise em larga escala e de proteínas potencialmente envolvidas na associação planta-bactéria. 2011. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biofísica)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Paulo Mascarello Bisch.
2. Carolina Lage Goulart. Porina VCA1008 de Vibrio Cholerae O1: Regulação da Expressão Gênica e Caracterização Funcional. 2011. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biofísica)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Co-Orientador: Paulo Mascarello Bisch.
3. Simone Queiroga de Brito. Análise Fenotípica e Molecular de um Mutante de Motilidade de Vibrio Cholerae.. 2010. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biofísica)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Co-Orientador: Paulo Mascarello Bisch.
4. Leticia Miranda Lery Santos. Análise proteomica da interação endofítica entre Gluconacetobacter diazotrophicus e seus hospedeiros. 2010. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biofísica)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesq. do Estado do Rio de Janeiro. Orientador: Paulo Mascarello Bisch.
5. Paulo Ricardo Batista. Estudo da flexibilidade da Protease do HIV-1 por Modelagem e Dinâmica, Análise de modos normais e dos modos consensus. 2009. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biofísica)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Co-Orientador: Paulo Mascarello Bisch.
6. MICHELLE DINIZ MENEZES PASSOS. Regulação da Expressão e Funcionalidade do Promotor phoBR de Vibrio cholerae.. 2009. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biofísica)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, . Co-Orientador: Paulo Mascarello Bisch.
7. Pedro Alexandre de Araújo Gomes Lapido Loureiro. Utilização de métodos computacionais no estudo de membrana lipídicas. 2007. Tese (Doutorado em Doutorado em Ciência Biológicas (Biofísica)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, . Co-Orientador: Paulo Mascarello Bisch.
8. Shaila Cintia Sykora Rössle. Desenvolvimento de um Sistema Computacional para Modelagem Comparativa em Genômica Estrutural: Análise de Seqüências do Genoma da Gluconacetobacter diazotrophicus.. 2004. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biofísica)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Paulo Mascarello Bisch.
9. Lílian Terezinha Costa França. Microscopia de força atômica: Imagens e espectroscopia de força de biomoléculas. 2004. Tese (Doutorado em Biologia Celular e Molecular) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul, . Co-Orientador: Paulo Mascarello Bisch.
10. Gilza Maria Piedade Prazeres. Microscopia de Força Atômica Aplicada ao Estudo de Interações Moleculares de Interesse Biológico. 2003. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biofísica)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Paulo Mascarello Bisch.
11. Monica da Luz Carvalho. Análises Termodinâmicas e Estruturais da Ligação de Inibidoires a Enzimas por Técnicas de Dinâmica Molecular: Uma aplicação para Cisteíno Proteases de T. Cruzi. 2003. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biofísica)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Paulo Mascarello Bisch.
12. Marcia Regina Soares da Silva. Determinação de Estrutura por Ressonância Magnética Nuclear de Petitídeos Derivados de Porteínas P-Ribossomais do T. cruzi, Humana e de L. braziliensis. 2002. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biofísica)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Paulo Mascarello Bisch.
13. Katya Maria Oliveira de Sousa. Determinação da Estrutura do Peptídeo Melanotrópico alfa MSH por Ressonância Magnética Nuclear. 2002. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biofísica)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Paulo Mascarello Bisch.
14. Francisco José Pereira Lopes. Análise da Formação de Padrôes no Desenvolvimento da Drosophila melanogaster através de Modelos de Redes Complexas. 2002. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biofísica)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Paulo Mascarello Bisch.
15. Alicia Claudia Lorenzo de Rovere. Dinâmica Molecular Forçada Aplicada ao Estudo de Interações Não-Específicas de Biomoléculas com Membranas Biológicas. 2001. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biofísica)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Paulo Mascarello Bisch.
16. Laurent Emmanuel Dardenne. Propriedades Eletrostáticas do Sítio Ativo de Cisteíno Proteínase da Família da Papaína. 2000. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biofísica)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Paulo Mascarello Bisch.
17. Marcelo A. Moret S. Gonçalves. Estudo Conformacional de Proteínas usando Métodos Estocásticos Generalizados. 2000. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biofísica)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Paulo Mascarello Bisch.
18. Geraldo Antônio Gerrera Cidade. Desenvolvimento de Metodologias de Aquisição e Processamento de Imagens Biológicas obtidas em Microscopia de Força Atômica (AFM). 2000. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biofísica)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, . Orientador: Paulo Mascarello Bisch.
19. Elias Ramos de Souza. Estudo da Adesão de Células e Vesículas através da Teoria Eletro-Hidrodinâmica. 1999. 0 f. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biofísica)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Paulo Mascarello Bisch.
20. Marta Maria Cassiano. Dinâmica de Biomoléculas Em Água: Simulações Com Representação Explícita do Solvente. 1998. Tese (Doutorado em Física) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Paulo Mascarello Bisch.
21. PEDRO GERALDO PASCUTTI. Dinamica Molecular de Peptideos Na Interface Membrana/Agua. 1996. Tese (Doutorado em Física) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Co-Orientador: Paulo Mascarello Bisch.
22. Celia Beatriz Anteneodo. Estudos Físico-Químicos da Ação de Anestésicos em Biomembranas Através de Técnicas Espectrocópicas e Calorimétricas. 1993. 0 f. Tese (Doutorado em Pós-Graduação em Física) - Centro Brasileiro de Pesquisas Físicas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Paulo Mascarello Bisch.
23. Fernando de Magalhães Coutinho Vieira. Estudo de Modêlos Não-Lineares para o Transporte Ativo em Biomembranas. 1993. 0 f. Tese (Doutorado em Pós-Graduação em Física) - Centro Brasileiro de Pesquisas Físicas, . Orientador: Paulo Mascarello Bisch.
24. CELIA CORTEZ-MAGHELLY. Estudo da Influência da Força Iônica e das Cargas Superficiais sobre a Estabilidade Mecânica da Membrana de Eritrócitois. 1992. 0 f. Tese (Doutorado em Pós-Graduação em Física) - Centro Brasileiro de Pesquisas Físicas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Paulo Mascarello Bisch.
25. Nice Maria Americano da Costa Pinto. Dinâmica e Estabilidade de Filmes Lipídicos: Análise Linear e Não-Linear. 1989. 0 f. Tese (Doutorado em Pós-Graduação em Física) - Centro Brasileiro de Pesquisas Físicas, . Orientador: Paulo Mascarello Bisch.
Supervisão de pós-doutorado
1. Francisco Jose Pereira Lopes. 2008. Universidade Federal do Rio de Janeiro, Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesq. do Estado do Rio de Janeiro. Paulo Mascarello Bisch.
2. Fabiana Avila Carneiro. 2006. Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Paulo Mascarello Bisch.
3. Luciana Pizzatti Barboza. 2005. Universidade Federal do Rio de Janeiro, Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesq. do Estado do Rio de Janeiro. Paulo Mascarello Bisch.
4. Marcia Regina Soares da Silva. 2004. Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Paulo Mascarello Bisch.
5. Claudio Saburo Shida. 2004. Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Paulo Mascarello Bisch.
6. Ernesto Raúl Caffarena. 2000. Universidade Federal do Rio de Janeiro, Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesq. do Estado do Rio de Janeiro. Paulo Mascarello Bisch.
7. Ernesto Raúl Caffarena. 1999. Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Paulo Mascarello Bisch.
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