Rafael Silva Duarte

Bolsista de Produtividade em Pesquisa do CNPq - Nível 2

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  • Última atualização do currículo em 18/06/2018


possui graduação em Medicina pela Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ) em 2013, e também Bacharelado em Microbiologia e Imunologia (1997), mestrado em Ciências (Microbiologia) (2000) e doutorado em Ciências (Microbiologia) (2004) pela UFRJ. Atualmente é Professor Associado da Universidade Federal do Rio de Janeiro no departamento de Microbiologia Médica, atuando no laboratório de Micobactérias. O pesquisador apresenta ampla experiência na área de Microbiologia Médica, com atividade atual voltada para Micobacteriologia e Infectologia, atuando, junto com os profissionais do laboratório, principalmente nos seguintes temas: (i) Caracterização de marcadores bioepidemiológicos de micobactérias de importância médica, veterinária e ambiental; (ii) Avaliação fenotípica e genotípica da susceptibilidade de micobactérias a antimicrobianos de uso terapêutico e saneantes aplicados nos diferentes níveis de desinfecção; (iii) Caracterização da produção de micobacteriocinas em micobactérias; (iv) Caracterização da fisiologia do processo de latência/dormência em micobactérias; (v) Epidemiologia molecular de bactérias de interesse médico e taxonomia bacteriana;; (vi) Caracterização fenotípica e genotípica de cocos gram-positivos de importância médica e veterinária. As colaborações e orientações são bem-vindas para os profissionais e estudantes de diferentes níveis. Aos interessados, entrar em contato através do e-mail: rsduarte@ufrj.br. MD and Ph.D. in Microbiology and Immunology, at Institute of Microbiology, Federal University of Rio de Janeiro, Associate Professor of the Medical Microbiology Department, Chairman of the Mycobacteria Laboratory, and coordinator of the Microbiology and Immunology section of the Medical Course at the same institution. The researcher presents wide background in the following themes: (i) Characterization of bioepidemiological markers of medical, veterinary and environmental mycobacteria, (ii) Disinfectant and drug susceptibility of mycobacteria, (iii) Mycobacteriocin production, (iv) Physiology of latency in mycobacteria, (v) Molecular epidemiology of bacteria, and taxonomy (vi) Phenotypic and genotypic characterization of Gram-positive cocci from medical and veterinary sources. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Rafael Silva Duarte
Nome em citações bibliográficas
DUARTE, R. S.;Duarte, Rafael Silva;Duarte, Rafael Da Silva;DUARTE, RAFAEL S.;Duarte, R.D.S.;Duarte, R. D. S.;DUARTE, RAFAEL;DUARTE, R.S.;DUARTE, RAFAEL S

Endereço


Endereço Profissional
Universidade Federal do Rio de Janeiro, Instituto de Microbiologia Prof. Paulo de Góes, Departamento de Microbiologia Médica.
Av. Carlos Chagas Filho, 373 - CCS - BL-I, Lab. 011 - Cidade Universitária - Ilha do Fundão
Cidade Universitária
21941902 - Rio de Janeiro, RJ - Brasil
Telefone: (21) 25608344
Ramal: 134
URL da Homepage: http://www.microbiologia.ufrj.br


Formação acadêmica/titulação


2000 - 2004
Doutorado em Ciências (Microbiologia).
Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.
Título: Diversidade Fenotípica e Genotípica de Amostras de Streptococcus agalactiae Isoladas de Seres Humanos e Animais no Brasil, Ano de obtenção: 2004.
Orientador: Lúcia Martins Teixeira.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
Palavras-chave: Streptococcus agalactiae; Caracterização fenotípica; Susceptibilidade a antimicrobianos; Detecção de fatores de virulência; RAPD-PCR; Pulsed-field gel electrophoresis (PFGE).
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia / Subárea: Epidemiologia Molecular.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia / Subárea: Genética Microbiana.
Setores de atividade: Saúde Humana.
1998 - 2000
Mestrado em Ciências (Microbiologia).
Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.
Título: Caracterização Fenotípica e Genotípica de Amostras de Streptococcus porcinus Isoladas de Espécimens Clínicos de Origem Humana,Ano de Obtenção: 2000.
Orientador: Lúcia Martins Teixeira.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
Palavras-chave: Streptococcus porcinus; Caracterização fenotípica; Susceptibilidade a antimicrobianos; SDS-PAGE; RAPD-PCR; Pulsed-field gel electrophoresis (PFGE).
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia / Subárea: Epidemiologia Molecular.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia / Subárea: Taxonomia de Microrganismos.
Setores de atividade: Saúde Humana.
2003 - 2013
Graduação em Medicina.
Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.
1994 - 1997
Graduação em Bacharelado Em Microbiologia e Imunologia.
Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.
Título: Caracterização Fenotípica e Genotípica de Amostras de Streptococcus porcinus Isoladas de Espécimens Clínicos de Origem Humana.
Orientador: Lúcia Martins Teixeira.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.




Formação Complementar


2007 - 2007
- VII Curso Internacional de Epidemiologia Molecul. (Carga horária: 40h).
Fundação Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, Brasil.
2007 - 2007
Curso de Curta Duração.
University of California at Berkeley, UCB, Estados Unidos.
2007 - 2007
Curso de Curta Duração.
University of California, Berkeley, UCB, Estados Unidos.
2005 - 2005
Extensão universitária em Fundamentos e Métodos de Biologia Molecular. (Carga horária: 15h).
Instituto de biofísica Carlos Chagas Filho, IBCCF, Brasil.
1999 - 1999
Gerência e Análise de Dados Epidemiológicos. (Carga horária: 90h).
Escola Nacional de Saúde Pública - FIOCRUZ, ENSP, Brasil.
1998 - 1998
Molecular Systematics and Evolution of Microorgani. (Carga horária: 45h).
Fundação Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, Brasil.


Atuação Profissional



Universidade do Estado do Rio de Janeiro, UERJ, Brasil.
Vínculo institucional

2006 - 2007
Vínculo: Professor Substituto, Enquadramento Funcional: Contrato temporário, Carga horária: 10


Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.
Vínculo institucional

2007 - Atual
Vínculo: Professor Adjunto, Enquadramento Funcional: Professor Adjunto, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

01/2007 - Atual
Pesquisa e desenvolvimento , Reitoria, Centro de Ciências da Saúde.

01/2007 - Atual
Pesquisa e desenvolvimento , Reitoria, Centro de Ciências da Saúde.

01/2007 - Atual
Pesquisa e desenvolvimento , Reitoria, Centro de Ciências da Saúde.


Centro Universitário Augusto Motta, UNISUAM, Brasil.
Vínculo institucional

2006 - 2006
Vínculo: Professor Adjunto, Enquadramento Funcional: Professor Adjunto, Carga horária: 36



Linhas de pesquisa


1.
Avaliação da Susceptibilidade de Micobactérias a Antimicrobianos e Saneantes
2.
Epidemiologia Molecular de Micobactérias
3.
Caracterização de Marcadores Bioepidemiológicos de Micobactérias


Projetos de pesquisa


2014 - Atual
Disseminação de resistência aos antimicrobianos associados a bactérias de interesse médico no Rio de Janeiro: uma abordagem sobre aspectos epidemiológicos e moleculares envolvendo microbiota humana, meio ambiente, alimentos e animais
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2012 - 2014
Caracterização Fenotípica e Genotípica de Micobactérias Não Associadas a Tuberculose: Avaliação da resistência a antimicrobianos, epidemiologia molecular e mecanismos de sobrevida sob condições adversas
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (1) .
Integrantes: Rafael Silva Duarte - Coordenador.Financiador(es): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ - Bolsa.
2010 - 2015
Disinfectant-resistant mycobacteria / NIH/NIAID grant # 1R01AI089718-01A1
Descrição: NIH/NIAID grant # 1R01AI089718-01A1.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (1) .
Integrantes: Rafael Silva Duarte - Integrante / M. JACKSON - Coordenador.
2010 - 2012
Caracterização Fenotípica e Genotípica de Cepas de Mycobacterium fortuitum Isoladas de Espécimes Respiratórios e Feridas Cirúrgicas no Estado do Rio de Janeiro
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) .
Integrantes: Rafael Silva Duarte - Coordenador.Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
2010 - 2011
Caracterização Fenotípica e Genotípica de Cepas de Mycobacterium fortuitum Isoladas de Espécimes Respiratórios e Feridas Cirúrgicas no Estado do Rio de Janeiro
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) .
Integrantes: Rafael Silva Duarte - Coordenador.Financiador(es): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ - Auxílio financeiro.
2008 - 2010
FAPERJ ? APOIO ÀS INSTITUIÇÕES DE PESQUISA DO RIO DE JANEIRO / Epidemiologia molecular de patógenos emergentes em instituições hospitalares da cidade do Rio de Janeiro.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2008 - 2010
FAPERJ / Programa ?Apoio a Grupos Emergentes de Pesquisa no Estado do Rio de Janeiro ? 2008
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2008 - 2010
FAPERJ - PENSA RIO / Patógenos Bacterianos Emergentes Isolados de Infecções Hospitalares em Instituições de Saúde da Cidade do Rio de Janeiro
Descrição: Coordenação da Profa. Kátia Regina Netto dos Santos.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) .
Integrantes: Rafael Silva Duarte - Integrante / Kátia Regina Netto dos Santos - Coordenador.
Número de produções C, T & A: 3 / Número de orientações: 1
2008 - 2009
CNPq Universal / Caracterização Fenotípica e Genotípica de Micobactérias de Crescimento Rápido Relacionadas à Epidemia de Infecções de Sítio Cirúrgico no Estado do Rio de Janeiro
Descrição: Identificação fenotípica e genotípica Susceptibilidade a antimicrobianos Epidemiologia Molecular.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) .
Integrantes: Rafael Silva Duarte - Coordenador.
Número de produções C, T & A: 3 / Número de orientações: 1


Revisor de periódico


2008 - Atual
Periódico: Brazilian Journal of Veterinary Research and Animal Science
2009 - 9999
Periódico: American Journal of Infection Control
2008 - Atual
Periódico: HU Revista (Juiz de Fora)


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia / Subárea: Bacteriologia Médica Humana e Veterinária/Especialidade: Micobacteriologia.
2.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia / Subárea: Epidemiologia Molecular.
3.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia / Subárea: Bacteriologia Médica Humana e Veterinária.
4.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Imunologia.


Idiomas


Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Espanhol
Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.
Francês
Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.


Prêmios e títulos


2008
Menção Honrosa, XIV Semana de Microbiologia e Imunologia, UFRJ - RJ.
2008
Melhores Trabalhos, Resumos do XI Congresso Brasileiro de Controle de Infecção e Epidemiologia Hospitalar, RJ.
2008
Melhores Trabalhos, Resumos do XI Congresso Brasileiro de Controle de Infecção e Epidemiologia Hospitalar, RJ.
2005
Dignidade Acadêmica Magna Cum Laude, Reitoria da Universidade Federal do Rio de Janeiro.
2002
2o. Melhor Poster na I Jornada de Pós-Graduação, Instituto de Microbiologia Prof. Paulo de Góes / UFRJ.
1997
Menção Honrosa, XIX Jornada de Iniciação Científica da Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ)..
1996
Menção Honrosa, XVIII Jornada de Iniciação Científica da UFRJ.
1996
Menção Honrosa, XVIII Jornada de Iniciação Científica da UFRJ.
1994
Bolsa Jovem Pesquisador, Divisão de Atividades Extracurriculares da SR-1, Reitoria da UFRJ..
1994
Prêmio de Incentivo à Ciência, II Jornada de Iniciação Científica do Instituto de Microbiologia Prof. Paulo de Góes.


Produções



Produção bibliográfica
Artigos completos publicados em periódicos

1.
RIBEIRO, GIOVANNI MONTEIRO2017RIBEIRO, GIOVANNI MONTEIRO ; MATSUMOTO, C. K. ; REAL, FERNANDO ; TEIXEIRA, DANIELA ; DUARTE, R. S. ; MORTARA, RENATO ARRUDA ; Leão, Sylvia Cardoso ; DE SOUZA CARVALHO-WODARZ, CRISTIANE . Increased survival and proliferation of the epidemic strain Mycobacterium abscessus subsp. massiliense CRM0019 in alveolar epithelial cells. BMC MICROBIOLOGY, v. 17, p. 195, 2017.

2.
CONCEIÇÃO, EMILYN COSTA2017CONCEIÇÃO, EMILYN COSTA ; RASTOGI, NALIN ; COUVIN, DAVID ; LOPES, MARIA LUÍZA ; FURLANETO, ISMARI PERINI ; GOMES, HARRISON MAGDINIER ; VASCONCELLOS, SIDRA EZÍDIO GONÇALVES ; SUFFYS, PHILIP NOEL ; SCHNEIDER, MARIA PAULA CRUZ ; DE SOUSA, MAÍSA SILVA ; SOLA, CHRISTOPHE ; DE PAULA SOUZA E GUIMARÃES, RICARDO JOSÉ ; Duarte, Rafael Silva ; BATISTA LIMA, KARLA VALÉRIA . Genetic diversity of Mycobacterium tuberculosis from Pará, Brazil, reveals a higher frequency of ancestral strains than previously reported in South America. INFECTION GENETICS AND EVOLUTION, v. 56, p. 62-74, 2017.

3.
EVERALL, IZZY2017EVERALL, IZZY ; NOGUEIRA, CHRISTIANE LOURENÇO ; BRYANT, JOSEPHINE M ; SÁNCHEZ-BUSÓ, LEONOR ; Chimara, Erica ; Duarte, Rafael Da Silva ; RAMOS, JESUS PAIS ; LIMA, KARLA VALÉRIA BATISTA ; LOPES, MARIA LUÍZA ; PALACI, MOISES ; KIPNIS, ANDRE ; MONEGO, FERNANDA ; FLOTO, R. ANDRES ; PARKHILL, JULIAN ; Leão, Sylvia Cardoso ; HARRIS, SIMON R . Genomic epidemiology of a national outbreak of post-surgical Mycobacterium abscessus wound infections in Brazil. Microbial Genomics, v. 3, p. 1-10, 2017.

4.
BURGESS, WINONA2017BURGESS, WINONA ; MARGOLIS, ALYSSA ; GIBBS, SARA ; Duarte, Rafael Silva ; JACKSON, MARY . Disinfectant Susceptibility Profiling of Glutaraldehyde-Resistant Nontuberculous Mycobacteria. INFECTION CONTROL AND HOSPITAL EPIDEMIOLOGY, v. 38, p. 784-791, 2017.

5.
GOMES, KAREN MACHADO2017GOMES, KAREN MACHADO ; Duarte, Rafael Silva ; DE FREIRE BASTOS, MARIA DO CARMO . Lantibiotics produced by Actinobacteria and their potential applications (a review). MICROBIOLOGY-SGM, v. 163, p. 109-121, 2017.

6.
CONCEIÇÃO, EMILYN COSTA2017CONCEIÇÃO, EMILYN COSTA ; LIMA, KARLA VALÉRIA BATISTA ; GOMES, HARRISON MAGDINIER ; Duarte, Rafael Silva . Molecular epidemiology of tuberculosis in Brazil: a translational research perspective*. REVISTA PAN-AMAZÔNICA DE SAÚDE (ONLINE), v. 8, p. 11-13, 2017.

7.
SANTOS, DEBORA RIBEIRO DE SOUZA2016SANTOS, DEBORA RIBEIRO DE SOUZA ; LOURENÇO, M. C. S. ; COELHO, FÁBRICE SANTANA ; MELLO, FERNANDA CARVALHO QUEIROZ ; DUARTE, R. S. . Resistance profile of strains of Mycobacterium fortuitum isolated from clinical specimens. Jornal Brasileiro de Pneumologia (Online), v. 42, p. 299-301, 2016.

8.
NEVES, MARCELO S.2016NEVES, MARCELO S. ; DA SILVA, MARLEI GOMES ; Côrtes, Patrícia Barbur ; Duarte, Rafael Silva ; VENTURA, GRASIELLA M. ; DE SOUZA, HEITOR S. . Response:. GASTROINTESTINAL ENDOSCOPY, v. 84, p. 1078, 2016.

9.
CONDE, MARCUS B.2016CONDE, MARCUS B. ; MELLO, FERNANDA C. Q. ; Duarte, Rafael Silva ; CAVALCANTE, SOLANGE C. ; ROLLA, VALERIA ; DALCOLMO, MARGARETH ; LOREDO, CARLA ; DUROVNI, BETINA ; ARMSTRONG, DEREK T. ; EFRON, ANNE ; BARNES, GRACE L. ; MARZINKE, MARK A. ; SAVIC, RADOJKA M. ; DOOLEY, KELLY E. ; COHN, SILVIA ; MOULTON, LAWRENCE H. ; CHAISSON, RICHARD E. ; DORMAN, SUSAN E. . A Phase 2 Randomized Trial of a Rifapentine plus Moxifloxacin-Based Regimen for Treatment of Pulmonary Tuberculosis. PLoS One, v. 11, p. e0154778, 2016.

10.
CAIERÃO, JULIANA2016CAIERÃO, JULIANA ; PAIVA, JOSÉ AUGUSTO CARDOSO DIAS ; SAMPAIO, JORGE LUIZ MELLO ; Silva, Marlei Gomes da ; SANTOS, DÉBORA RIBEIRO DE SOUZA ; COELHO, FABRICE SANTANA ; FONSECA, LEILA DE SOUZA ; Duarte, Rafael Silva ; ARMSTRONG, DEREK T. ; REGUA-MANGIA, ADRIANA HAMOND . Multilocus enzyme electrophoresis analysis of rapidly-growing mycobacteria: an alternative tool for identification and typing. INTERNATIONAL JOURNAL OF INFECTIOUS DISEASES, v. 42, p. 11-16, 2016.

11.
MACHADO, RACHEL R.P.2015MACHADO, RACHEL R.P. ; DUTRA, RAFAEL C. ; RAPOSO, NÁDIA R.B. ; LESCHE, BERNHARD ; GOMES, MARLEI S. ; DUARTE, RAFAEL S. ; SOARES, GERALDO LUIZ G. ; KAPLAN, MARIA AUXILIADORA C. . Interferometry as a tool for evaluating effects of antimicrobial doses on Mycobacterium bovis growth. TUBERCULOSIS, v. 95, p. 829-838, 2015.

12.
NEVES, MARCELO S.2015NEVES, MARCELO S. ; DA SILVA, MARLEI GOMES ; VENTURA, GRASIELLA M. ; Côrtes, Patrícia Barbur ; Duarte, Rafael Silva ; DE SOUZA, HEITOR S. . Effectiveness of current disinfection procedures against biofilm on contaminated GI endoscopes. GASTROINTESTINAL ENDOSCOPY, v. 83, p. 944-953, 2015.

13.
MACHADO, R.R.P.2015MACHADO, R.R.P. ; DUTRA, R.C. ; PITTELLA, F. ; RAPOSO, N.R.B. ; LESCHE, B. ; DUARTE, R.S. ; SOARES, G.L.G. ; KAPLAN, M.A.C. . Screening antimycobacterial activity of Baccharis dracunculifolia, Centella asiatica, Lantana camara and Pterodon emarginatus. Rev. Bras. Pl. Med., v. 17, p. 891-899, 2015.

14.
PAULA UZAM, CAMILLA PEREIRA DE2015PAULA UZAM, CAMILLA PEREIRA DE ; BRIANESI, URZE ADOMAITIS ; ROMAGNOLI, CAMILA ; GOMES, KAREN MACHADO ; Duarte, Rafael Silva ; Chimara, Erica ; OLIVEIRA, JULIO CEZAR FRANCO DE ; VALLIM, MARCELO AFFONSO ; PASCON, RENATA CASTIGLIONI ; Viana-Niero, Cristina . MALDI-TOF MS Assessment to Identify Environmental Mycobacteria. ADVANCES IN MICROBIOLOGY, v. 05, p. 620-629, 2015.

15.
TETTELIN, HERVÉ2014TETTELIN, HERVÉ ; DAVIDSON, REBECCA M. ; AGRAWAL, SONIA ; AITKEN, MOIRA L. ; SHALLOM, SHAMIRA ; HASAN, NABEEH A. ; STRONG, MICHAEL ; NOGUEIRA DE MOURA, VINICIUS CALADO ; DE GROOTE, MARY ANN ; DUARTE, RAFAEL S. ; HINE, ERIN ; PARANKUSH, SUSHMA ; SU, QI ; DAUGHERTY, SEAN C. ; FRASER, CLAIRE M. ; BROWN-ELLIOTT, BARBARA A. ; WALLACE, RICHARD J. ; HOLLAND, STEVEN M. ; SAMPAIO, ELIZABETH P. ; OLIVIER, KENNETH N. ; JACKSON, MARY ; ZELAZNY, ADRIAN M. . High-level Relatedness among subsp. Strains from Widely Separated Outbreaks. Emerging Infectious Diseases (Print), v. 20, p. 364-371, 2014.

16.
MACHADO, G. E.2014MACHADO, G. E. ; Matsumoto, C. K. ; Chimara, E. ; Duarte, R. D. S. ; DE FREITAS, D. ; PALACI, M. ; HADAD, D. J. ; LIMA, K. V. B. ; LOPES, M. L. ; RAMOS, J. P. ; CAMPOS, C. E. ; CALDAS, P. C. ; HEYM, B. ; Leao, S. C. . Multilocus Sequence Typing Scheme versus Pulsed-Field Gel Electrophoresis for Typing Mycobacterium abscessus Isolates. Journal of Clinical Microbiology (Print), v. 52, p. 2881-2891, 2014.

17.
NUNES, L. D. S.2014NUNES, L. D. S. ; BAETHGEN, L. F. ; RIBEIRO, M. O. ; CARDOSO, C. M. ; DE PARIS, F. ; DE DAVID, S. M. M. ; da Silva, M. G. ; DUARTE, R. S. ; BARTH, A. L. . Outbreaks due to Mycobacterium abscessus subsp. bolletii in Southern Brazil: Persistence of a single clone from 2007 to 2010. Journal of Medical Microbiology, v. 99, p. 9-99, 2014.

18.
CANDIDO, P. H. C.2014CANDIDO, P. H. C. ; NUNES, L. D. S. ; MARQUES, E. A. ; FOLESCU, T. W. ; Coelho, F. S. ; de Moura, V. C. N. ; da Silva, M. G. ; Gomes, K. M. ; LOURENÇO, M. C. S. ; AGUIAR, F. S. ; CHITOLINA, F. ; ARMSTRONG, D. T. ; LEAO, S. C. ; NEVES, F. P. G. ; Mello, F. C. d. Q. ; DUARTE, R. S. . Multidrug-Resistant Nontuberculous Mycobacteria Isolated from Cystic Fibrosis Patients. Journal of Clinical Microbiology (Print), v. 52, p. 2990-2997, 2014.

19.
LOBATO, L. S.2014LOBATO, L. S. ; ROSA, P. S. ; FERREIRA, J. D. S. ; NEUMANN, A. D. S. ; SILVA, M. G. D. ; NASCIMENTO, D. C. D. ; SOARES, C. T. ; PEDRINI, S. C. B. ; OLIVEIRA, D. S. L. D. ; MONTEIRO, C. P. ; PEREIRA, G. M. B. ; RIBEIRO-ALVES, M. ; HACKER, M. A. ; MORAES, M. O. ; PESSOLANI, M. C. V. ; DUARTE, R. S. ; LARA, F. A. . Statins increase rifampin mycobactericidal effect. Antimicrobial Agents and Chemotherapy (Online), v. 21, p. 1826, 2014.

20.
Duarte, Rafael Silva2014Duarte, Rafael Silva; MARTINS, ISA HARO ; MENDES, CRISTIANE PEREIRA ; SILVA COSTA, MARIA ANTÔNIA ; MENDES, DANIELA DE SOUZA ; ROMANO, VALÉRIA FERREIRA ; GOMES, SÉRGIO COELHO ; REIS, ALESSANDRA ; NEVES, REGINA DIAS . Proposta interdisciplinar de apoio à cessação do tabagismo em uma unidade de saúde da Estratégia Saúde da Família: relato de experiência. Revista Brasileira de Medicina de Familia e Comunidade, v. 9, p. 384-390, 2014.

21.
FURLANETTO, L. V.2014FURLANETTO, L. V. ; CONTE JUNIOR, C. A. ; FIGUEIREDO, E. E. ; DUARTE, R. S. ; LILENBAUN, W. ; SILVA, J. T. ; PASCHOALIN, V.M.F. . HPLC Protocol for Identification of Mycobacterium spp. from Clinical Samples of Human and Veterinary. Journal of Microbiology Research, v. 4, p. 193-200, 2014.

22.
MATSUMOTO, C. K.2013MATSUMOTO, C. K. ; Matsumoto, Cristianne Kayoko ; Chimara, Erica ; RAMOS, JESUS PAIS ; CAMPOS, CARLOS EDUARDO DIAS ; CALDAS, PAULO CESAR DE SOUZA ; Lima, Karla Valeria Batista ; DUARTE, R. S. ; Lopes, Maria Luiza ; Leão, Sylvia Cardoso . Rapid tests for the detection of the Mycobacterium abscessus subsp. bolletii strain responsible for an epidemic of surgical-site infections in Brazil. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz (Impresso), v. 107, p. 969-970, 2013.

23.
MACHADO, R. R. P.2013MACHADO, R. R. P. ; MARQUES, A. ; JUNIOR, W. ; COIMBRA, E. ; DUARTE, R. S. ; SOARES, G. ; KAPLAN, M. A. C. . Evaluation of in vitro antileishmanial and antimycobacterial activities of Stiffia chrysantha (Mikan) extracts. Revista Fitos (Farmanguinhos/FIOCRUZ), v. 7, p. 252-258, 2013.

24.
LIMA, ANDREA SANTOS2013LIMA, ANDREA SANTOS ; Duarte, Rafael Silva ; MONTENEGRO, LILIAN MARIA LAPA ; SCHINDLER, HAIANA CHARIFKER . Rapid detection and differentiation of mycobacterial species using a multiplex PCR system. Revista da Sociedade Brasileira de Medicina Tropical (Impresso), v. 46, p. 447-452, 2013.

25.
LIMA, ANDREA SANTOS2013LIMA, ANDREA SANTOS ; NEVES, MARIA MADILEUZA CARNEIRO ; GOMES, KAREN MACHADO ; GUARINES, KLARISSA MIRANDA ; LUNA, CARLOS FEITOSA ; Duarte, Rafael Silva ; MONTENEGRO, LÍLIAN MARIA LAPA ; SCHINDLER, HAIANA CHARIFKER . First case report of infection by Mycobacterium wolinskyi after mammoplasty in Brazil. Infectious Disease Reports, v. 5, p. 40-42, 2013.

26.
DAVIDSON, REBECCA M.2013DAVIDSON, REBECCA M. ; HASAN, NABEEH A. ; DE MOURA, VINICIUS CALADO NOGUEIRA ; Duarte, Rafael Silva ; JACKSON, MARY ; STRONG, MICHAEL . Phylogenomics of Brazilian epidemic isolates of Mycobacterium abscessus subsp. bolletii reveals relationships of global outbreak strains. Infection, Genetics and Evolution (Print), v. 20, p. 292-297, 2013.

27.
DAVIDSON, R. M.2013DAVIDSON, R. M. ; REYNOLDS, P. R. ; FARIAS-HESSON, E. ; DUARTE, R. S. ; JACKSON, M. ; STRONG, M. . Genome Sequence of an Epidemic Isolate of Mycobacterium abscessus subsp. bolletii from Rio de Janeiro, Brazil. Genome Announcements, v. 1, p. e00617-13-e00617-13, 2013.

28.
FERREIRA, THAÍS GONÇALVES2013FERREIRA, THAÍS GONÇALVES ; BARBOSA, THAÍS FLECHER ; TEIXEIRA, FELIPE LOPES ; FERREIRA, ELIANE DE OLIVEIRA ; Duarte, Rafael Silva ; DOMINGUES, REGINA MARIA CAVALCANTI PILOTTO ; DE PAULA, GERALDO RENATO . Effect of hospital disinfectants on spores of clinical Brazilian Clostridium difficile strains. Anaerobe (London. Print), v. 22, p. 121-122, 2013.

29.
DE LUCA REBELLO, RAQUEL COSTA2013DE LUCA REBELLO, RAQUEL COSTA ; MACHADO GOMES, KAREN ; Duarte, Rafael Silva ; TAVORA COELHO DA COSTA RACHID, CAIO ; ROSADO, ALEXANDRE SOARES ; REGUA-MANGIA, ADRIANA HAMOND . Diversity of Mercury Resistant Escherichia coli Strains Isolated from Aquatic Systems in Rio de Janeiro, Brazil. International Journal of Biodiversity, v. 2013, p. 1-8, 2013.

30.
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POLYCARPO, C. R.1997POLYCARPO, C. R. ; LEITÃO, E. A. ; DUARTE, R. S. ; VILLASBÔAS, M. H. S. ; BARRETO- BERGTER, E. . Partial characterization of polysaccharides from Fusarium solani.. Revista Brasileira de Microbiologia, Rio de Janeiro, v. 28, p. 268-270, 1997.

Capítulos de livros publicados
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TEIXEIRA, L. M. ; DUARTE, R. S. ; TRABULSI, L. R. . Streptococcus agalactiae. In: Luiz Rachid Trabulsi; Flávio Alterthum. (Org.). Microbiologia. 5aed.Rio de Janeiro: Atheneu, 2008, v. , p. 195-1999.

2.
TEIXEIRA, L. M. ; DUARTE, R. S. ; TRABULSI, L. R. . Streptococcus agalactiae. In: Trabulsi, L.R., Alterthum, F., Martinez, M.B., Campos, L.C., Gompertz, O.F. & Rácz, M.L.. (Org.). Microbiologia. 4aed.São Paulo: Atheneu, 2004, v. , p. 195-198.

3.
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Textos em jornais de notícias/revistas
1.
DUARTE, R. S.; ALVIANO, D. S. ; ALVIANO, C. S. ; FORMIGA, L. C. D. . Graduação em Microbiologia e Imunologia. SBM notícias, Rio de Janeiro, , v. 22, p. 4 - 6, 12 out. 1998.

Trabalhos completos publicados em anais de congressos
1.
DUARTE, R. S.; FACKLAM, R. R. ; TEIXEIRA, L. M. . Phenotypic and genotypic characterization of Streptococcus porcinus strains isolated from human clinical specimens. In: XIV Lancefield International Symposium on Streptococci and Streptococcal Diseases, 1999, Auckland-Nova Zelândia. XIV Lancefield International Symposium on Streptococci and Streptococcal Diseases, 1999. p. 2.4.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
Duarte, Rafael Silva. Risk factors associated with surgical site infection caused by Mycobacterium massiliense in abdominal videolaparoscopie. In: 22nd European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, 2012, LONDON. 22nd European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, 2012.

2.
CARVALHO, A. C. S. ; CONTE JUNIOR, C. A. ; Duarte, Rafael Silva ; SILVA, J. T. ; PASCHOALIN, V.M.F. . Detection of enteric bacterial pathogens, Listeria monocytogenes and opportunist mycobacterial species in mussel (Perna perna) by PCR and restriction enzyme analysis. In: 16th World Congress of Food Science and Technology, 2012, FOZ DO IGUAÇU. 16th World Congress of Food Science and Technology, 2012.

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4.
MOURA, V. C. N. ; SILVA, M. G. ; GOMES, K. M. ; COELHO, F. S. ; MELO, F. C. Q. ; Lourenço, Maria Cristina Silva ; Duarte, Rafael Silva . Phenotypic and molecular characterization of quinolone resistance in rapidly growing mycobacteria with focus on Mycobacterium massiliense BRA100 clone. In: Conference of American Thoracic Society, 2011, Denver. Conference of American Thoracic Society, 2011.

5.
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19.
Sampaio, J.L.M. ; Viana-Niero, C. ; DUARTE, R. S. ; Siciliano, R.F. ; Strabelli, T.M.V. ; Castelli, J.B ; Kipnis, A. ; Neves, Z.C. ; Lima, K.V.B. ; Lopes, M.L. ; LEAO, S. C. . Review of outbreaks caused by traditional and newly described rapidly growing mycobacteria in Brazil. In: 28th Annual Congress of the European Society of Mycobacteriology, 2007, Atenas. Congress of the European Society of Mycobacteriology, 2007.

20.
DUARTE, R. S.; REGUA-MANGIA, A. H. ; Sampaio, J.L.M. ; LEAO, S. C. ; Silva, M.G. ; ESPARIA, C. M. ; SERRADAS, L. R. ; Marques, E. A. ; Viana-Niero, C. ; Fonseca, L.S. . Caracterização isoenzimática de micobactérias de crescimento rápido (MCR) relacionadas ao surto de infecções cirúrgicas no Brasil. In: XXIV Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2007, Brasília. Anais do XXIV Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2007.

21.
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24.
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25.
DUARTE, R. S.; Mendonça-Souza C.R.V. ; BARROS, R. R. ; Bellei, B.C. ; Brito, M.A.V.P. ; CASTRO, A. D. ; SAMPAIO, J. ; FACKLAM, R. R. ; TEIXEIRA, L. M. . Distribuição de genes de resistência a tetraciclina em diferentes espécies de Streptococcus. In: XXII Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2003, Florianópolis. Resumos do XXII Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2003.

26.
DUARTE, R. S.; NEVES, F. P. G. ; Kronemberger, G. ; TEIXEIRA, L. M. ; Merquior, V.L.C. . Emergência de amostras de Enterococcus móveis portadoras do gene vanA em um hospital universitário do Rio de Janeiro. In: XXII Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2003, Florianópolis. Resumos do XXII Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2003.

27.
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29.
DUARTE, R. S.; Miranda, O.P. ; Brito, M.A.V.P. ; Bellei, B.C. ; TEIXEIRA, L. M. . Phenotypic and genotypic characterization of Streptococcus agalactiae strains isolated from bovines in Brazil. In: I Jornada da Pós-Graduação do Instituto de Microbiologia Prof. Paulo de Góes ? CCS ? UFRJ, 2002, Rio de Janeiro-RJ. Anais da I Jornada da Pós-Graduação do Instituto de Microbiologia Prof. Paulo de Góes ? CCS ? UFRJ, 2002.

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DUARTE, R. S.; FACKLAM, R. R. ; TEIXEIRA, L. M. . Caracterização de amostras de Streptococcus porcinus isoladas de espécimens clínicos de origem humana. In: XIX Congresso Brasileiro de Microbiologia, 1997, Rio de Janeiro-RJ. Anais do XIX Congresso Brasileiro de Microbiologia, 1997.

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POLYCARPO, C. R. ; DUARTE, R. S. ; WAIT, R. ; Barreto-Bergter, E. . Structural Characterization of neutral glycosphingolipids from Fusarium species by FAB/MS collisional activation and linked scanning. In: VI Congress of glycoconjugates, 1997. Glycoconjugaete Journal, 1997. v. 14. p. S108-S109.

35.
POLYCARPO, C. R. ; LEITÃO, E. A. ; DUARTE, R. S. ; Barreto-Bergter, E. . Studies on the polysaccharide of Fusarium solani.. In: XXVIa Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 1997, Caxambú-MG. Resumos da XXVIa Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 1997.

36.
MYAZAKI, N. H. T. ; SILVEIRA, M. S. ; DUARTE, R. S. ; SIQUEIRA, P. L. A. ; CARVALHO, B. T. F. ; NOLETO, A. L. S. ; FONSECA, M. E. ; FIGUEIREDO, A. M. S. . Inibição da produção de enterotoxinas após indução do gene mecA em Staphylococcus aureus. In: IV Jornada Nacional de Iniciação Científica e 49a Reunião Anual da SBPC, 1997, Belo Horizonte-MG. Anais da IV Jornada Nacional de Iniciação Científica e 49a Reunião Anual da SBPC, 1997.

37.
RAMOS, R. L. ; ORMONDE, L. R. ; DUARTE, R. S. ; SIQUEIRA, P. L. A. ; FIGUEIREDO, A. M. S. . Detecção do gene ile s? no clone epidêmico de Staphylococcus aureus resistentes à meticilina predominantes no Brasil (clone III::B:A). In: IV Jornada Nacional de Iniciação Científica e 49a Reunião Anual da SBPC, 1997, Belo Horizonte-MG. Anais da IV Jornada Nacional de Iniciação Científica e 49a Reunião Anual da SBPC, 1997.

38.
DUARTE, R. S.; FACKLAM, R. R. ; TEIXEIRA, L. M. . Caracterização de amostras de Streptococcus porcinus isoladas de espécimens clínicos de origem humana. In: XIX Jornada de Iniciação Científica da UFRJ, 1997, Rio de Janeiro-RJ. Anais da XIX Jornada de Iniciação Científica da UFRJ, 1997.

39.
RAMOS, R. L. ; ORMONDE, L. R. ; DUARTE, R. S. ; SIQUEIRA, P. L. A. ; FIGUEIREDO, A. M. S. . Detecção do gene ile s'no clone epidêmico de Staphylococcus aureus resistentes à meticilina predominantes no Brasil (clone III::B:A). In: XVIII Jornada de Iniciação Científica da UFRJ, 1996, Rio de Janeiro-RJ. Resumos da XVIII Jornada de Iniciação Científica da UFRJ, 1996.

40.
MYAZAKI, N. H. T. ; SILVEIRA, M. S. ; DUARTE, R. S. ; SIQUEIRA, P. L. A. ; CARVALHO, B. T. F. ; NOLETO, A. L. S. ; FONSECA, M. E. ; FIGUEIREDO, A. M. S. . Inibição da produção de enterotoxinas após indução do gene mecA em Staphylococcus aureus. In: XVIII Jornada de Iniciação Científica da UFRJ, 1996, Rio de Janeiro-RJ. Resumos da XVIII Jornada de Iniciação Científica da UFRJ, 1996.

41.
POLYCARPO, C. R. ; DUARTE, R. S. ; PINTO, M. R. ; VILLASBÔAS, M. H. S. ; Barreto-Bergter, E. . Caracterização de glicoesfingolipídios de espécies de Fusarium. In: V Encontro Nacional de Microbiologia Ambiental e I Encontro Nordestino de Microbiologia Ambiental, 1996, Fortaleza-CE. Resumos do V Encontro Nacional de Microbiologia Ambiental e I Encontro Nordestino de Microbiologia Ambiental, 1996.

42.
POLYCARPO, C. R. ; DUARTE, R. S. ; LEITÃO, E. A. ; Barreto-Bergter, E. . Polissacarídeos de Fusarium solani. In: XVIII Jornada Interna de Iniciação Científica da UFRJ, 1996, Rio de Janeiro-RJ. Anais da XVIII Jornada Interna de Iniciação Científica da UFRJ, 1996.

43.
DUARTE, R. S.; Barreto-Bergter, E. . Glicoesfingolipídios de Fusarium solani. In: XVII Jornada Interna de Iniciação Científica da UFRJ, 1995, Rio de Janeiro-RJ. Resumos da XVII Jornada Interna de Iniciação Científica da UFRJ, 1995.

44.
DUARTE, R. S.; Barreto-Bergter, E. . Monohexosylceramidas de fungos da espécie Fusarium solani. In: XVIII Congresso Brasileiro de Microbiologia, 1995, Santos-SP. Anais do XVIII Congresso Brasileiro de Microbiologia, 1995.

45.
DUARTE, R. S.; Barreto-Bergter, E. . Glycosphingolipids of the fungus Fusarium solani. In: XXIV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 1995, Caxambú-MG. Anais da XXIV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 1995.

46.
DUARTE, R. S.; Barreto-Bergter, E. . Glicolipídios de Fusarium solani: Isolamento e detecção por cromatografia em camada fina (TLC). In: II Jornada de Iniciação Científica, 1994, Rio de Janeiro-RJ. Anais da II Jornada de Iniciação Científica do Instituto de Microbiologia Prof. Paulo de Góes - CCS - UFRJ, 1994.

Artigos aceitos para publicação
1.
MACHADO, R. R. P. ; DUTRA, R. C. ; SILVA, F. P. ; RAPOSO, N. R. B. ; LESCHE, B. ; DUARTE, R. S. ; SOARES, G. L. ; KAPLAN, M. A. C. . Screening antimycobacterial activity of Baccharis dracunculifolia, Centella asiatica, Lantana camara and Pterodon emarginatus. Revista Brasileira de Plantas Medicinais, 2015.

Outras produções bibliográficas
1.
DUARTE, R.S.. WHITEBOOK. Rio de Janeiro: PEBMED, 2017 (Multimídia).

2.
DUARTE, R. S.; Cavalcanti, M.G. ; Peralta, J.M. ; Oelemann, W.M.R. . Bacteriologia, Micologia e Parasitologia Clínicas. Um Texto Ilustrado em Cores. Rio de Janeiro-RJ: Guanabara Koogan, 2002. (Tradução/Livro).

3.
DUARTE, R. S.; Oelemann, W.M.R. ; Peralta, J.M. . Imunologia. Rio de Janeiro-RJ: Guanabara Koogan, 2001. (Tradução/Livro).

Demais trabalhos
1.
DUARTE, R. S.. Diversidade fenotípica e genotípica de amostras de Streptococcus agalactiae isoladas de seres humanos e animais no Brasil. 2004 (Tese de Doutorado) .

2.
DUARTE, R. S.. Caracterização fenotípica e genotípica de amostras de Streptococcus porcinus isoladas de espécimens clínicos de origem humana.. 2000 (Tese de Mestrado) .

3.
DUARTE, R. S.. Caracterização fenotípica e genotípica de amostras de Streptococcus porcinus isoladas de espécimens clínicos de origem humana.. 1997 (Monografia) .



Bancas



Participação em bancas de trabalhos de conclusão
Mestrado
1.
Duarte, Rafael Silva. Participação em banca de Raquel Fernandes de Barros Nóboa. Avaliação da transmissibilidade e virulência de diferentes famílias do Mycobacterium tuberculosis em pacientes com tuberculose e seus contatos intradomiciliares. 2008. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação em Clínica Médica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

2.
Duarte, Rafael Silva. Participação em banca de Leonardo Silva Araújo. Genotipagem por RFLP e DRE-PCR no estudo da diversidade genética de cepas de Micobacterium tuberculosis isoladas de pacientes institucionalizados. 2008. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação em Clínica Médica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

3.
Duarte, Rafael Silva. Participação em banca de Rodrigo Mendes Paletta. ?Estudo da virulência de cepas de Mycobacterium tuberculosis de contatos intradomiciliares com tuberculose pulmonar. 2008. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação em Clínica Médica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

4.
Duarte, Rafael Silva. Participação em banca de Cristina Félix. Contaminação de cultura para micobactéria e seus fatores associados. 2008. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação em Clínica Médica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

5.
Duarte, Rafael Silva. Participação em banca de Giseli da Silva da Costa. Avaliação de técnicas moleculares alternativas para a diferenciação das espécies do complexo Streptococcus bovis / Streptococcus equinus. 2008. Dissertação (Mestrado em Pós-Graduação em Ciências (Microbiologia)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

6.
Duarte, Rafael Silva. Participação em banca de Olinda Cabral da Silva Santos. ?Caracterização de bactérias produtoras de substâncias antimicrobianas isoladas de esponjas marinhas. 2008. Dissertação (Mestrado em Pós-Graduação em Ciências (Microbiologia)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

7.
Duarte, Rafael Silva. Participação em banca de Andre Nogueira Olendzki. Avaliação da acurácia do sistema MicroScan Walkaway na identificação e detecção da resistência à oxacilina em amostras de Staphylococcus coagulase-negativos. 2008. Dissertação (Mestrado em Pós-Graduação em Ciências (Microbiologia)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

8.
Duarte, Rafael Silva. Participação em banca de Camilla Dellatorre Teixeira. Estudo de amostras de Enterococcus spp. isoladas de pacientes atendidos em quatro hospitais do município de Niterói: Caracterização fenotípica e genotípica. 2007. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação em Patologia) - Universidade Federal Fluminense.

9.
Duarte, Rafael Silva. Participação em banca de Tatiane Mendes Varela Ramos. ?Infecção experimental de camundongos C3H/HeJ com L. interrogans sorovar Copenhageni ? Susceptibilidade e resposta imune protetora. 2007.

Teses de doutorado
1.
Duarte, Rafael Silva. Participação em banca de Eliezer Menezes Pereira. Staphylococcus lugdunensis: aspectos fenotípicos, moleculares e de virulência em amostras clínicas isoladas de diferentes hospitais do Rio de Janeiro. 2008. Tese (Doutorado em Pós-Graduação em Ciências (Microbiologia)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

2.
Duarte, Rafael Silva. Participação em banca de Elis Regina Dalla Costa. Caracterização das mutações envolvidas na resistência a isoniazida em isolados de Mycobacterium tuberculosis do Brasil, Argentina e Peru. 2008. Tese (Doutorado em Programa de Pós-Graduação em Clínica Médica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

3.
Duarte, Rafael Silva. Participação em banca de Rossana Coimbra Brito. ?Resistência aos fármacos anti-tuberculose de cepas de Mycobacterium tuberculosis isoladas de pacientes atendidos em seis hospitais da região metropolitana do Estado do Rio de Janeiro ? RJ. 2008. Tese (Doutorado em Programa de Pós-Graduação em Clínica Médica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

4.
Duarte, Rafael Silva. Participação em banca de Simone Gonçalves Senna. Análise molecular de amostras clínicas e ambientais de micobactérias não associadas á tuberculose. 2008. Tese (Doutorado em Pós-Graduação em Ciências (Microbiologia)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

5.
Duarte, Rafael Silva. Participação em banca de Flávio Rodrigues Ferreira Alves. Perfil da comunidade bacteriana de infecções endodônticas de diferentes regiões geográficas e nos diferentes terços do sistema de canais radiculares. 2008. Tese (Doutorado em Pós-Graduação em Ciências (Microbiologia)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

6.
Duarte, Rafael Silva. Participação em banca de Juliana Arruda de Matos. Incidência de fatores de risco para colonização por Acinetobacter spp. em uma unidade de terapia intensiva de hospital universitário no Rio de Janeiro. 2008. Tese (Doutorado em Pós-Graduação em Doenças Infecciosas e Parasitária) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

7.
Duarte, Rafael Silva. Participação em banca de Tatiana de Castro Abreu Pinto. Transferência conjugativa de genes de resistência a tetraciclina, eritromicina e clindamicina em cepas de Streptococcus agalactiae de origens humana e bovina. 2007. Tese (Doutorado em Pós-Graduação em Ciências (Microbiologia)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Trabalhos de conclusão de curso de graduação
1.
Duarte, Rafael Silva. Participação em banca de Maria Esther de Magalhães Machado Tonus.Avaliação da Técnica de Redução do Sal de Tetrazol XII para a Determinação da Viabilidade do BCG Moreau ? RJ em Amostras de Vacina. 2008.

2.
Duarte, Rafael Silva. Participação em banca de Ariane Guimarães Barcellos.Staphylococcus coagulase-negativos como agentes de bacteriemias relacionadas a cateter venoso central: caracterização de espécies, produção de biofilme e diversidade genômica. 2008. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas: Microbiologia e Imunologia) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

3.
Duarte, Rafael Silva. Participação em banca de Lais Bessa dos Santos.Glicolipídios das cepas Pasteur e Moreau de Mycobacterium (M.) bovis BCG: caracterização e aplicação no sorodiagnóstico da tuberculose humana. 2008. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas: Microbiologia e Imunologia) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

4.
DUARTE, R. S.. Participação em banca de Tatiana Pinto de Abreu.Caracterização molecular de Streptococcus pneumoniae dos sorotipos 9N e 9V isolados no Brasil. 2005. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

5.
CASTRO, A. D.; FRACALANZZA, S. E. L.; BARROS, R. R.; DUARTE, R. S.. Participação em banca de Bruna Campos Bellei.Distribuição dos genes de resistência a antimicrobianos e de virulência entre estreptococos do grupo B isolados de seres humanos e de bovinos. 2004. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Microbiologia e Imunologia) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

6.
Duarte, Rafael Silva. Participação em banca de Bruna Campos Bellei.Avaliação de técnicas baseadas na reação em cadeia da polimerase para a diferenciação e caracterização de Streptococcus -hemolíticosAvaliação de técnicas baseadas na reação em cadeia da polimerase para a diferenciação e caracterização de Streptococcus -hemolíticos. 2004. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Microbiologia e Imunologia) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

7.
DUARTE, R. S.; Rosado, AS; Soares, S.. Participação em banca de Rafael Fogel.Caracterização taxonômica de estirpes de Paenibacillus isoladas de rizosfera de milho e sorgo plantados em solo de cerrado, Sete Lagoas - MG. 2002. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Microbiologia e Imunologia) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

8.
DUARTE, R. S.. Participação em banca de Otávio Padula de Miranda.Caracterização fenotípica e genotípica de amostras de Streptococcus agalactiae isoladas de bovinos no Brasil. 2001. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Microbiologia e Imunologia) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.




Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
Congresso 2011 da American Thoracic Society. Congresso 2011 da American Thoracic Society. 2011. (Congresso).

2.
Conhecendo a UFRJ 2011. Bacharelado em Ciências Biológicas: Microbiologia e Imunologia. 2011. (Congresso).

3.
II Workshop da Rede TB.Multirresistência a biocidas e antimicrobianos em micobactérias de crescimento rápido. 2011. (Outra).

4.
I Jornada de Vigilância em Saúde do Instituto Fernandes Figueira, FIOCRUZ. Infecções por microbactérias atípicas. 2011. (Congresso).

5.
I Jornada Norte de Prevenção e Controle de IRAS e Reprocessamento de Artigos da Escola Normal Superior da UEA.Surtos de infecções por micobactérias de crescimento rápido no Brasil. 2011. (Outra).

6.
Semana de Recepção de Calouros do curso de Microbiologia e Imunologia do IMPPG, UFRJ.Tuberculose: antigo problema com novos desafios. 2011. (Seminário).

7.
Ciclo de Seminários da Sociedade Brasileira de Controle de Contaminação com o tema ?Microbiologia: Aspectos da Contaminação Microbiana e a Validação da Limpeza e Sanitização.Surtos de infecções por micobactérias de crescimento rápido no Brasil. 2010. (Seminário).

8.
Ciclo de Seminários em Ciências do Programa de Pós-Graduação em Ciências Aplicadas a Produtos para Saúde, Faculdade de Farmácia da UFF.Surto de infecções pós-cirúrgicas por microbactérias de crescimento rápido: Processamento inadequado ou resistência a desinfetantes?. 2010. (Seminário).

9.
Curso de Processamento de Materiais Cirúrgicos Complexos (Módulo II) promovido pela GEAPIO CME. Micobactérias de Crescimento Rápido: resultados e análises frente à aos saneantes comercializados no mercado nacional. 2010. (Congresso).

10.
II Congresso de Infectologia do estado do Rio de Janeiro. Reprocessamento seguro? com o tema ?Surto de infecção por micobactérias de crescimento rápido. Processamento inadequado ou resistência a desinfetante?. 2010. (Congresso).

11.
I Simpósio de Epidemiologia Molecular em Doenças Infecciosas e Parasitárias Emergentes, na FIOCRUZ.?Outbreaks of postsurgical infections by rapidly growing mycobacteria: inefficient cleaning or disinfectant resistance?. 2010. (Simpósio).

12.
IV Encontro Nacional de Tuberculose / I Fórum da Parceria Brasileira contra a Tuberculose.Biocidas e Micobactérias. 2010. (Encontro).

13.
IV Encontro Nacional de Tuberculose / I Fórum da Parceria Brasileira contra a Tuberculose..Diagnóstico laboratorial e vigilância epidemiológica de MNT. 2010. (Outra).

14.
Semana de Recepção de Calouros do curso de Microbiologia e Imunologia do IMPPG, UFRJ.Tuberculose: antigo problema com novos desafios. 2010. (Outra).

15.
XV Encontro Científico do Instituto Biomédico / IV Jornada Científica de Biomedicina da UFF / III Workshop de Microbiologia Aplicada.Diagnóstico e epidemiologia molecular de agentes infecciosos. 2010. (Outra).

16.
XVI Semana de Microbiologia e Imunologia, realizada no IMPPG, UFRJ.Surtos de infecções por micobactérias de crescimento rápido no Brasil. 2010. (Seminário).

17.
3rd Stop TB Partners Forum.3rd Stop TB Partners Forum. 2009. (Outra).

18.
Atualização em Microbacteriose? no Hospital das Clínicas de Teresópolis Costantino Ottaviano.Infecções por microbactérias de crescimento rápido: Surtos e tolerância a desinfetantes. 2009. (Outra).

19.
Fórum do Grupo de Trabalho sobre Micobacterioses.Novos Desafios no Tratamento das Micobacterioses ? Recidivas, Esquemas Terapêuticos e Perspectivas. 2009. (Outra).

20.
III Simpósio de Doenças Infecciosas.Surto de infecções por microbactérias de crescimento rápido: novos patógenos iatrogênicos?. 2009. (Simpósio).

21.
III Simpósio de Esterilização e Centro Cirúrgico realizado no Centro de Estudos Hospital Naval Marcílio Dias.Surto de infecções pós-cirúrgicas por microbactérias de crescimento rápido: processamento inadequado ou resistência a desinfetantes?. 2009. (Simpósio).

22.
Semana de Recepção de Calouros do curso de Microbiologia e Imunologia do IMPPG, UFRJ.Tuberculose: antigo problema com novos desafios. 2009. (Outra).

23.
Seminário de Imunologia do programa de Pós-graduação do Instituto Oswaldo Cruz / FIOCRUZ.Infecções por microbactérias de crescimento rápido em videocirurgia e cirurgia estética. 2009. (Seminário).

24.
XLV Congresso da Sociedade Brasileira de Medicina Tropical. : O que não usar?? na Mesa Redonda com o tema ?Epidemia Brasileira de Microbactérias de Crescimento Rápido. 2009. (Congresso).

25.
XXV Congresso Brasileiro de Microbiologia / XIII Simpósio Brasileiro de Microbactérias. Biocidas e Microbactérias. 2009. (Congresso).

26.
Fórum de Micobacteriose.Medidas de Prevenção por Micobactérias em Procedimentos Cirúrgicos. 2008. (Outra).

27.
III Encontro Nacional de Tuberculose.Surto de Infecções de Sítio Cirúrgico por MCR no estado do Rio de Janeiro (2006 a 2007). 2008. (Outra).

28.
Prevenção e Controle de Infecção Hospitalar em Videocirurgias no Hospital Pedro Ernesto, UERJ.Retrospectiva e Diagnóstico de Infecção em Videocirurgias. 2008. (Simpósio).

29.
Reunião Científica da Sociedade Brasileira de Endoscopia Digestiva.Limpeza e Desinfecção na Endoscopia Digestiva. 2008. (Outra).

30.
Seminário de Tese e Pesquisa realizado pela Unidade de Pesquisa em Tuberculose (UPT) - Hospital Universitário Clementino Fraga Filho / UFRJ.Surto de infecções de sítio cirúrgico por micobactérias de crescimeto rápido no Estado do Rio de Janeiro (2006-2007). 2008. (Seminário).

31.
XI Congresso Brasileiro de Controle de Infecção e Epidemiologia Hospitalar. Aspectos Microbiológicos dos Surtos de Micobactérias de Crescimento Rápido. 2008. (Congresso).

32.
III Jornada de Farmácia do Centro Universitário Augusto Motta.Infecções por micobactérias em videolaparoscopia e cirurgia estética. 2007. (Outra).

33.
Infecções por micobactérias em videolaparoscopia e cirurgia estética na Escola de Enfermagem Alfredo Pinto da Universidade do Rio de Janeiro (UNIRIO).Infecções por micobactérias em videolaparoscopia e cirurgia estética. 2007. (Outra).

34.
Infecções Relacionadas à Assistência á Saúde. 2007. (Seminário).

35.
Programa de Pós-graduação em Vigilância Sanitária do Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde.Infecções por microbactérias em videolaparoscopia e cirurgia estética. 2007. (Outra).

36.
Semana de Recepção de Calouros do curso de Microbiologia e Imunologia do IMPPG, UFRJ.Tuberculose: antigo problema com novos desafios. 2007. (Seminário).

37.
Seminário ENSP.Tuberculose: antigo problema com novos desafios. 2007. (Seminário).

38.
XI Encontro de Profissionais de Controle de Infecção do RJ. 2007. (Seminário).

39.
Curso de Mestrado em Microbiologia Médica Humana da Faculdade de Ciências Médicas da UERJ,.Caracterização de amostras de Streptococcus agalactiae isoladas no Sudeste Brasileiro. 2006. (Seminário).

40.
I Jornada de Farmácia da UNISUAM.Resistência a antibióticos. 2006. (Seminário).

41.
Programa de Pós-graduação em Microbiologia Médica Humana da Faculdade de Ciências Médicas da UERJ.?Virulência bacteriana ? Cocos Gram-positivos?. 2006. (Oficina).

42.
?Bacteriologia Médica IV (IMM 719)? do curso de Pós-Graduação do IMPPG/UFRJ.?Métodos de Tipagem de Microrganismos ? Técnicas moleculares envolvendo ácidos nucléicos?. 2005. (Oficina).

43.
?Bacteriologia Médica IV (IMM 719)? do curso de Pós-Graduação do IMPPG/UFRJ.?Perfis Eletroforéticos ? Análise visual e automatizada?,. 2005. (Outra).

44.
Curso de Atualização em Técnicas Moleculares Aplicadas ao Estudo da Diversidade de Microrganismos.Perfis Eletroforéticos: Aspectos Teóricos da Análise Visual e Automatizada. 2003. (Oficina).

45.
VIII Semana de Microbiologia e Imunologia, UFRJ.Interação Parasito-Hospedeiro. 2002. (Outra).

46.
Curso de Atualização em Técnicas Moleculares Aplicadas ao Estudo da Diversidade de Microrganismos.Perfis Eletroforéticos: Aspectos Teóricos da Análise Visual e Automatizada. 2001. (Oficina).

47.
XXI Congresso Brasileiro de Microbiologia. Técnicas envolvendo a análise de ácidos nucléicos: sistemas de restrição e hibridização. 2001. (Congresso).

48.
XXI Congresso Brasileiro de Microbiologia. Técnicas envolvendo a análise de proteínas: sistemas de revelação. 2001. (Congresso).

49.
Curso de Atualização em Técnicas Moleculares Aplicadas ao Estudo da Diversidade de Microrganismos.Perfis Eletroforéticos: Análise Visual e Automatizada. 2000. (Oficina).

50.
Reunião Científica do Hospital Adventista Silvestre.Avanços no Diagnóstico Laboratorial de Infecções por Cocos Gram-positivos. 2000. (Encontro).



Orientações



Orientações e supervisões em andamento
Dissertação de mestrado
1.
Alessandra Mageste Fernandes. Detecção de micobactérias em gelo filtrado para consumo humano: avaliação de sobrevida e influência de aspectos físico-químicos e microbiológicos. Início: 2018. Dissertação (Mestrado profissional em Microbiologia e Imunologia) - Instituto de Microbiologia Prof. Paulo de Góes, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. (Orientador).

2.
Gabriel Rezende Pereira. Adesão de microrganismos patogênicos em próteses mamárias. Início: 2017. Dissertação (Mestrado em Microbiologia e Parasitologia Aplicadas) - Universidade Federal Fluminense, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. (Coorientador).

Tese de doutorado
1.
Henry Marcel Zalona. Caracterização de bacteriocinas por amostras do gênero Alcaligenes. Início: 2018. Tese (Doutorado em Microbiologia e Imunologia) - Instituto de Microbiologia Prof. Paulo de Góes. (Orientador).

2.
Maria Carolina Del Valle Sisco Zerpa. Comparação de genomas de micobactérias não patogênicas e patogênicas, utilizando como modelos Bacilo Calmette Guérin (BCG). Início: 2016. Tese (Doutorado em Microbiologia e Imunologia) - Instituto de Microbiologia Prof. Paulo de Góes, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. (Orientador).


Orientações e supervisões concluídas
Dissertação de mestrado
1.
Henry Marcel Zalona Fernandes. Detecção de micobactérias em água de consumo humano: avaliação de métodos de isolamento, sobrevida e influência de aspectos físico-químicos e microbiológicos. 2017. Dissertação (Mestrado em Microbiologia e Imunologia) - Instituto de Microbiologia Prof. Paulo de Góes, . Orientador: Rafael Silva Duarte.

2.
Monicke Santos Cunha do Nascimento. Análise do tempo de conversão bacteriológica na tuberculose pulmonar ativa em unidade de saúde do município do Rio de Janeiro no período de 2004 a 2012. 2016. Dissertação (Mestrado em Clínica Médica) - Hospital Universitário Clementino Fraga Filho, . Coorientador: Rafael Silva Duarte.

3.
Cássio Luiz Coutinho Almeida da Silva. Caracterização de defeitos na granulopoiese em camundongos deficientes em perforina. 2014. Dissertação (Mestrado em Microbiologia e Imunologia) - Instituto de Microbiologia Prof. Paulo de Góes, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rafael Silva Duarte.

4.
Pedro Henrique Campanini Cândido. Caracterização de micobactérias isoladas do trato respiratório de pacientes com fibrose cística em um centro de referência no estado do Rio de Janeiro. 2014. Dissertação (Mestrado em Clínica Médica) - Hospital Universitário Clementino Fraga Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rafael Silva Duarte.

5.
Débora Ribeiro de Souza. Caracterização fenotípica e genotípica de cepas de Mycobacterium fortuitum isoladas de espécimes clínicos de origem humana. 2013. Dissertação (Mestrado em Clínica Médica) - Hospital Universitário Clementino Fraga Filho, . Orientador: Rafael Silva Duarte.

6.
Tatiana Cristina Pereira Dutra. Caracterização de glicolipídios fenólicos de Mycobacterium abscessus subsp. bolletii. 2013. Dissertação (Mestrado em Microbiologia e Imunologia) - Instituto de Microbiologia Prof. Paulo de Góes, . Coorientador: Rafael Silva Duarte.

7.
Caroline Reis de Barros. Caracterização de micobactérias em solo da Antártida e mecanismos de sobrevivência. 2013. Dissertação (Mestrado em Microbiologia e Imunologia) - Instituto de Microbiologia Prof. Paulo de Góes, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rafael Silva Duarte.

8.
Tiago Fausto França da Costa e Sá. Estudo sobre a ocorrência de Escherichia coli O157:H7 em vegetais pela técnica neutrongráfica. 2013. Dissertação (Mestrado em Engenharia Nuclear) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Coorientador: Rafael Silva Duarte.

9.
Guilherme da Silva Lourenço. Formação de biofilmes por Streptococcus spp. 2012. Dissertação (Mestrado em Microbiologia) - Universidade do Estado do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rafael Silva Duarte.

10.
Cristina Rodrigues Félix. Prevalência de contaminação da cultura de escarro para micobactérias e fatores associados em um local com elevada incidência de tuberculose. 2012. Dissertação (Mestrado em Clínica Médica) - Hospital Universitário Clementino Fraga Filho, . Coorientador: Rafael Silva Duarte.

11.
Karla Gripp Couto de Mello. Características clínico-epidemiológicas das infecções pulmonares por micobactérias não tuberculosas em Unidade de Saúde de Referência Nacional. 2012. Dissertação (Mestrado em Clínica Médica) - Hospital Universitário Clementino Fraga Filho, . Coorientador: Rafael Silva Duarte.

12.
Karen Machado Gomes. Detecção de bactérias patogênicas em leite bovino pela técnica de eletroforese em gel com gradiente de desnaturantes. 2011. Dissertação (Mestrado em Microbiologia e Imunologia) - Instituto de Microbiologia Prof. Paulo de Góes, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rafael Silva Duarte.

13.
Aline Silva Soares Souto. Avaliação da suscetibilidade de Mycobacterium massiliense isolados de surto de hospitais do Rio de janeiro frente a três diferentes tipos de desinfetantes. 2011. Dissertação (Mestrado em Vigilância Sanitária) - Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rafael Silva Duarte.

14.
Marcus Vinícius Lima Rockembach. Avaliação de testes laboratoriais para a determinação da susceptibilidade de Mycobacterium tuberculosis ao fármaco pirazinamida. 2011. Dissertação (Mestrado em Clínica Médica) - Hospital Universitário Clementino Fraga Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rafael Silva Duarte.

15.
Nádia Suely de Oliveira Lorena. ?Avaliação da susceptibilidade de Mycobacterium massiliense a desinfetantes de uso hospitalar?.. 2011. Dissertação (Mestrado em Ciências Médicas) - Universidade do Estado do Rio de Janeiro, . Coorientador: Rafael Silva Duarte.

16.
Bruna Peres Sabagh. Estudo Comparativo entre o enriquecimento ADC e o Soro Fetal Bovino com glicose adicionado aos meios de cultura empregados no ensaio de Avaliação da Atividade Micobactericida de desinfetantes.. 2011. Dissertação (Mestrado em Vigilância Sanitária) - Fundação Oswaldo Cruz, . Orientador: Rafael Silva Duarte.

17.
Lívia Barroso Cardoso. Caracterização de estirpes de micobactérias de crescimento rápido quanto à formação de biofilme, susceptibilidade a antimicrobianos e expressão de proteínas totais. 2011. Dissertação (Mestrado em Microbiologia e Imunologia) - Instituto de Microbiologia Prof. Paulo de Góes, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Coorientador: Rafael Silva Duarte.

18.
Vinícius Calado Nogueira de Moura. Caracterização da resistência a quinolonas em Mycobacterium abscessus subsp. bolletii e outras micobactérias de crescimento rápido relacionadas. 2011. Dissertação (Mestrado em Microbiologia) - Universidade do Estado do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rafael Silva Duarte.

19.
Rachel dos Santos de Sena de Vasconcelos. Avaliação da Resistência a Estreptomicina em Mycobacterium tuberculosis: Métodos Fenotípicos de Detecção e Caracterização Genotípica. 2009. Dissertação (Mestrado em Microbiologia e Imunologia) - Instituto de Microbiologia Prof. Paulo de Góes, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Coorientador: Rafael Silva Duarte.

Tese de doutorado
1.
Emilyn Costa Conceição. Caracterização da história molecular evolutiva de Mycobacterium tuberculosis da família EAI no estado do Pará, Brasil. 2017. Tese (Doutorado em Microbiologia e Imunologia) - Instituto de Microbiologia Prof. Paulo de Góes, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Rafael Silva Duarte.

2.
Marcelo Soares Neves. Eficiência do processamento de endoscópios expostos a alta carga bacteriana e formação de biofilme, e revisão sistemática. 2015. Tese (Doutorado em Clínica Médica) - Hospital Universitário Clementino Fraga Filho, . Coorientador: Rafael Silva Duarte.

3.
Karen Machado Gomes. Caracterização de peptídeos antimicrobianos produzidos por micobactérias de crescimento rápido. 2015. Tese (Doutorado em Microbiologia e Imunologia) - Instituto de Microbiologia Prof. Paulo de Góes, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rafael Silva Duarte.

4.
Rachel Rocha Pinheiro Machado. Investigação de atividade antimicrobiana a partir de produtos vegetais e avaliação do método interferométrico em testes de susceptibilidade com Mycobacterium bovis... 2015. Tese (Doutorado em Biotecnologia Vegetal) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, . Coorientador: Rafael Silva Duarte.

5.
Juliana Figueiredo da Costa Lima. Avaliação da técnica Nested PCR em único tubo (STNPCR) com detecção colorimétrica para diagnóstico de Tuberculose pulmonar e extrapulmonar. 2014. Tese (Doutorado em Clínica Médica) - Hospital Universitário Clementino Fraga Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Coorientador: Rafael Silva Duarte.

6.
Andrea Santos Lima. Prevalência de infecções por micobactérias não tuberculosas em pacientes do estado de Pernambuco. 2014. Tese (Doutorado em Saúde Pública) - Centro de Pesquisas Aggeu Magalhães /, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Coorientador: Rafael Silva Duarte.

7.
Anna Grazia Marsico. Resistência a pirazinamida em Mycobacterium tuberculosis: Métodos fenotípicos e genotípicos de detecção. 2012. Tese (Doutorado em Clínica Médica) - Hospital Universitário Clementino Fraga Filho, . Coorientador: Rafael Silva Duarte.

8.
Ana Carolina da Silva Carvalho. Avaliação da associação de Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis com a doença de Crohn em uma população do Rio de Janeiro. 2010. Tese (Doutorado em Doença Infecto-Parasitárias) - Hospital Universitário Clementino Fraga Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rafael Silva Duarte.

9.
Ana Carolina da Silva Carvalho. Detecção e isolamento de Mycobacterium avium subespécie paratuberculosis em diferentes espécimes clínicos de pacientes com e sem Doença de Crohn. 2006. Tese (Doutorado em Doença Infecto-Parasitárias) - Hospital Universitário Clementino Fraga Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Coorientador: Rafael Silva Duarte.

Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização
1.
Silvio Renan Pinheiro Victor de Araújo. Novas estratégias para detecção molecular de multirresistência a antimicrobianos em Mycobacterium tuberculosis. 2016. Monografia. (Aperfeiçoamento/Especialização em Biomedicina) - Universidade Castelo Branco. Orientador: Rafael Silva Duarte.

2.
Helga Delgado Monteiro. Nova estratégia para detecção do operon ica em Staphylococcus aureus resistentes a meticilina utilizando oligonucleotídeos iniciadores espécie-específicos. 2014. Monografia. (Aperfeiçoamento/Especialização em Biomedicina) - Universidade Federal do Estado do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rafael Silva Duarte.

Trabalho de conclusão de curso de graduação
1.
Patrícia Barbur Côrtes. Caracterização da susceptibilidade a desinfetantes de micobactérias de crescimento rápido isoladas de surtos de infecções de sítio cirúrgico. 2011. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Microbiologia e Imunologia) - Instituto de Microbiologia Prof. Paulo de Góes, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rafael Silva Duarte.

2.
Vinícius Calado Nogueira de Moura. Caracterização Genotípica da Resistência a Quinolonas em Micobactérias de Crescimento Rápido (MCR) Relacionadas a Surtos de Infecções de Sítio Cirúrgico no Brasil. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em biomedicina) - Universidade Federal Fluminense, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rafael Silva Duarte.

3.
Karen Machado Gomes. Isolamento e Identificação de Micobactérias Ambientais em Solo de Zona Rural. 2008. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciências biológicas) - Universidade Federal Fluminense, Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ. Orientador: Rafael Silva Duarte.

4.
Carolini Alvez Matarazzo. Identificação de Micobactérias Atípicas Isoladas de Amostras Fecais de Bovinos Suspeitos de Paratuberculose no Estado do Rio de Janeiro. 2008. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciências biológicas) - Universidade Federal Fluminense. Orientador: Rafael Silva Duarte.

5.
Tatiana de Campos Rodrigues. Segregação de Espécies do Complexo Mycobacterium avium-intracellulare em Ágar Vermelho Congo. 2007. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Microbiologia e Imunologia) - Instituto de Microbiologia Prof. Paulo de Góes, Universidade Federal do Rio de Janeiro. Orientador: Rafael Silva Duarte.

6.
Jaqueline Carvalho Gonçalves. Novas Aplicabilidades da Talidomida. 2006. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Farmácia) - Centro Universitário Augusto Motta. Orientador: Rafael Silva Duarte.

7.
Vanessa Monteiro Bussoli. Análise Microbiológica de Produto Final em uma Indústria de Cosméticos. 2006. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Farmácia) - Centro Universitário Augusto Motta. Orientador: Rafael Silva Duarte.

8.
Bruna Campos Bellei. Distribuição dos genes de resistência a antimicrobianos e de virulência entre estreptococos do grupo B isolados de seres humanos e de bovinos. 2004. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Bacharelado Em Microbiologia e Imunologia) - Universidade Federal do Rio de Janeiro. Orientador: Rafael Silva Duarte.

9.
Otávio Padula de Miranda. Caracterização fenotípica e genotípica de amostras de Streptococcus agalactiae isoladas de bovinos no Brasil. 2002. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Bacharelado Em Microbiologia e Imunologia) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rafael Silva Duarte.

Iniciação científica
1.
Daniel Torrelio Pereira. Infecções Cutâneas por Micobactérias Não Associadas à Tuberculose: Revisão Sistemática. 2016. Iniciação Científica. (Graduando em Medicina) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rafael Silva Duarte.

2.
Rodrigo Correia Dutra. Produção de Biofilmes por Micobacterias. 2014. Iniciação Científica. (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade de Nova Iguaçu, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rafael Silva Duarte.

3.
Larissa Moraes de Vasconcelos. Produção de Enzimas Extracelulares por Micobactérias. 2014. Iniciação Científica. (Graduando em Farmácia) - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rafael Silva Duarte.

4.
Tamíris de Oliveira Leite. Susceptibilidade de Micobactérias a Saneantes. 2013. Iniciação Científica. (Graduando em Ciências Biológicas: Microbiologia e Imunologia) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rafael Silva Duarte.

5.
Bruno Rios Vilaça. Caracterização da susceptibilidade a antimicrobianos de micobactérias de crescimento rápido associadas à epidemia de infecção de sítio cirúrgico no estado do Rio de Janeiro (2006 ? 2007). 2009. Iniciação Científica. (Graduando em Medicina) - Instituto de Microbiologia Prof. Paulo de Góes, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rafael Silva Duarte.

6.
Patrícia Barbur Côrtes. Treinamento Científico em seu estágio no Laboratório de Micobactérias do IMPPG/UFRJ. 2009. Iniciação Científica. (Graduando em Microbiologia e Imunologia) - Instituto de Microbiologia Prof. Paulo de Góes, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Rafael Silva Duarte.

7.
Vinícius Calado Nogueira de Moura. Treinamento Científico em seu estágio no Laboratório de Micobactérias do IMPPG/UFRJ. 2009. Iniciação Científica. (Graduando em Biomedicina) - Fundação Euclides da Cunha de Apoio Institucional a UFF, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rafael Silva Duarte.

8.
Vinícius Calado Nogueira de Moura. Vinícius Calado Nogueira de Moura. 2009. Iniciação Científica. (Graduando em Microbiologia e Imunologia) - Instituto de Microbiologia Prof. Paulo de Góes, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rafael Silva Duarte.

9.
Pedro Henrique Campanini Cândido. curso de Especialização em Tópicos em Bacteriologia Médica. 2009. Iniciação Científica. (Graduando em CEBAC) - Instituto de Microbiologia Prof. Paulo de Góes. Orientador: Rafael Silva Duarte.

10.
Claúdia Thompson Lemer Ribeiro. curso de Especialização em Tópicos em Bacteriologia Médica. 2009. Iniciação Científica. (Graduando em CEBAC) - Instituto de Microbiologia Prof. Paulo de Góes. Orientador: Rafael Silva Duarte.

11.
Marcus Vinícius Lima Rockembach. curso de Especialização em Ensino de Ciências e Biologia. 2009. Iniciação Científica. (Graduando em Bioquímica Médica) - Instituto de Bioquímica. Orientador: Rafael Silva Duarte.

12.
Patrícia Barbur Côrtes. Caracterização de glicolipídeos de micobactérias de crescimento rápido isoladas de surtos no Brasil. 2008. Iniciação Científica. (Graduando em Microbiologia e Imunologia) - Instituto de Microbiologia Prof. Paulo de Góes, Universidade Federal do Rio de Janeiro. Orientador: Rafael Silva Duarte.

13.
Rafaela Lora Grando. Caracterização fenotípica de micobactérias atípicas envolvidas em surtos de infecções superficiais após procedimentos invasivos no Brasil. 2008. Iniciação Científica. (Graduando em Microbiologia e Imunologia) - Instituto de Microbiologia Prof. Paulo de Góes, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rafael Silva Duarte.

14.
José Augusto Cardoso Dias Paiva. Caracterização Isoenzimática de Micobactérias de Crescimento Rápido Isoladas de Surtos de Infecções Cutâneas após Procedimentos Invasivos no Brasil. 2008. Iniciação Científica. (Graduando em Microbiologia e Imunologia) - Instituto de Microbiologia Prof. Paulo de Góes. Orientador: Rafael Silva Duarte.

15.
Denise de Oliveira Coutinho. Avaliação do polimorfismo imunogenético de pacientes com tuberculose ativa. 2007. Iniciação Científica. (Graduando em Microbiologia e Imunologia) - Instituto de Microbiologia Prof. Paulo de Góes. Orientador: Rafael Silva Duarte.

16.
Adriane de Lacerda Nery. Prevenção de Febre Reumática em Crianças da Vila Cruzeiro. 2006. Iniciação Científica. (Graduando em Farmácia) - Centro Universitário Augusto Motta. Orientador: Rafael Silva Duarte.

17.
Ciro Martins Vieira Correa. Prevenção de Febre Reumática em Crianças da Vila Cruzeiro. 2006. Iniciação Científica. (Graduando em Farmácia) - Centro Universitário Augusto Motta. Orientador: Rafael Silva Duarte.

18.
Sérgio Eufrazio Benedito. Prevenção de Febre Reumática em Crianças da Vila Cruzeiro. 2006. Iniciação Científica. (Graduando em Enfermagem) - Centro Universitário Augusto Motta, Centro Universitário Augusto Motta. Orientador: Rafael Silva Duarte.

19.
Gisele Roberto de Souza. Prevenção de Febre Reumática em Crianças da Vila Cruzeiro. 2006. Iniciação Científica. (Graduando em Farmácia) - Centro Universitário Augusto Motta. Orientador: Rafael Silva Duarte.

20.
Bruna Campos Bellei. Caracterização fenotípica e genotípica de amostras de Streptococcus agalactiae isoladas de bovinos e seres humanos no Brasil. 2003. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado Em Microbiologia e Imunologia) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rafael Silva Duarte.



Educação e Popularização de C & T



Artigos
Artigos completos publicados em periódicos
1.
SOUTO, A. S. S.2012SOUTO, A. S. S. ; SABAGH, B. P. ; ABREU, A. O. ; SILVA, S. A. ; PEREIRA, D. C. R. ; NEVES, M. C. ; PINHEIRO, R. R. ; DUARTE, R. S. ; MIYAZAKI, N. H. T. ; VILLAS BOAS, M. H. S. . Tolerance of Mycobacterium abscessus subsp. bolletii to high level disinfectants. Revista do Instituto Adolfo Lutz (Impresso), v. 71, p. 362-371, 2012.

2.
TETTELIN, HERVÉ2014TETTELIN, HERVÉ ; DAVIDSON, REBECCA M. ; AGRAWAL, SONIA ; AITKEN, MOIRA L. ; SHALLOM, SHAMIRA ; HASAN, NABEEH A. ; STRONG, MICHAEL ; NOGUEIRA DE MOURA, VINICIUS CALADO ; DE GROOTE, MARY ANN ; DUARTE, RAFAEL S. ; HINE, ERIN ; PARANKUSH, SUSHMA ; SU, QI ; DAUGHERTY, SEAN C. ; FRASER, CLAIRE M. ; BROWN-ELLIOTT, BARBARA A. ; WALLACE, RICHARD J. ; HOLLAND, STEVEN M. ; SAMPAIO, ELIZABETH P. ; OLIVIER, KENNETH N. ; JACKSON, MARY ; ZELAZNY, ADRIAN M. . High-level Relatedness among subsp. Strains from Widely Separated Outbreaks. Emerging Infectious Diseases (Print), v. 20, p. 364-371, 2014.




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