Marcelo Mendes Brandao

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  • Última atualização do currículo em 12/02/2019


Formado em Ciências Biológicas pela Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho (1996), mestrado em Farmacologia pela Universidade Estadual de Campinas (1999) e doutorado em Clínica Médica pela Universidade Estadual de Campinas (2003). Pós doutorado em Biologia Molecular (2005) no Laboratório de Biologia Molecular do Hemocentro da UNICAMP, Pós doutorado em Bioinformática, Biologia Computacional e evolução (2007- 2011) no Laboratório de Biologia Molecular de plantas no Departamento de Genética da ESALQ. Foi pesquisador convidado no Departamento de Ciências da Vida na Universidade de Alberta em Edmonton, AB, Canadá (2012-2013), responsável pelas análises de Biologia Computacional e estatísticas dos transcriptomas de pragas de floresta de interesse econômico estudados pelo projeto BEGAB, ?Budworm Eco-Genomics: Applications & Biotechnology" (http://www.sprucebudworm.ca/). Atualmente, é pesquisador do Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG) da UNICAMP e responsável pelo Laboratório de Biologia Integrativa e Sistêmica (https://labis.bioinfoguy.net/), tendo como principais linhas de pesquisa Análise e identificação de genes diferencialmente expressos por técnicas de sequenciamento de nova geração, anotação de transcriptomas de sistemas não modelo, relações evolutivas entre famílias protéicas. As áreas de pesquisa citadas acima tem como organismos de estudo Lepdópteras consideradas praga para a agricultura brasiliera, leveduras e bactérias fermentadoras com interesse na produção de bioprodutos de primeira ou segunda geração. Atua também na área de BioTI sendo responsável pela administração dos sistemas de computação de alto desempenho Thunder e Bioinfo, para uso em análise de Bioinformática aplicada à Agricultura e Bioenergia. Tem auxiliado outros grupos de pesquisa na montagem de sistemas de computação para análise de dados biológicos e gerenciamento de grande volume de dados. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Marcelo Mendes Brandao
Nome em citações bibliográficas
BRANDAO, M. M.;Brandao, Marcelo M;Brandão, M M;Marcelo Mendes Brandão;Brandão, M. M.;BRANDÃO, MARCELO MENDES;BRANDÃO, MARCELO M.;BRANDÃO, M.M.

Endereço


Endereço Profissional
Universidade Estadual de Campinas, Reitoria, Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética.
Avenida Cândido Rondon 400
Cidade Universitária
13083875 - Campinas, SP - Brasil
Telefone: (19) 35211198
URL da Homepage: http://www.bioinfoguy.net/labis


Formação acadêmica/titulação


1999 - 2003
Doutorado em Clínica Médica.
Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.
Título: Aplicação da pinça óptica para estudo da deformabilidade das hemácias, Ano de obtenção: 2003.
Orientador: Sara Teresinha Olalla Saad.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
Palavras-chave: Pinça Óptica; Reologia; esferocitose; Hemoglobina; Elasticidade; Doadores.
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Biofísica Celular.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Morfologia / Subárea: Citologia e Biologia Celular.
1997 - 1999
Mestrado em Farmacologia.
Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.
Título: Estudo da interação entre o óxido nítrico e RAS em linhagens leucêmicas mielóides,Ano de Obtenção: 1999.
Orientador: Sara Terezinha Olalla Saad.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
Palavras-chave: LMA; Leucemia; iNOS; Óxido nítrico.
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética.
1993 - 1996
Graduação em Bacharelado Em Ciências Biológicas.
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.


Pós-doutorado


2009 - 2014
Pós-Doutorado.
Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz", ESALQ - USP, Brasil.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Evolução.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética.
2007 - 2009
Pós-Doutorado.
Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz", ESALQ - USP, Brasil.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Biologia computacional.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.
2003 - 2005
Pós-Doutorado.
Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.


Formação Complementar


2009 - 2009
Advanced methods for phylogenetic analysis of mole. (Carga horária: 52h).
European Molecular Biology Organization, EMBO/EMBL, Alemanha.
1998 - 1998
17. Bioinformática do Projeto Genoma FAPESP. (Carga horária: 16h).
Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.
1998 - 1998
18. Como os leucócitos chegam aos tecidos? Estudos. (Carga horária: 8h).
Federação das Sociedades de Biologia Experimental, FeSBE, Brasil.
1996 - 1996
16. Grandes hidrelétricas e os problemas do impact. (Carga horária: 8h).
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.
1996 - 1996
14. Biologia Molecular na investigação da paternid. (Carga horária: 4h).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
1996 - 1996
13. Interface entre genética clássica e molecular. (Carga horária: 8h).
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.
1996 - 1996
15. Metodologia cientifica. (Carga horária: 40h).
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.
1995 - 1995
Extensão universitária em 9. Iniciação à aqüicultura. (Carga horária: 40h).
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.
1995 - 1995
12. Conhecimentos básicos de hemoglobinopatias. (Carga horária: 20h).
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.
1995 - 1995
11. Noções gerais sobre animais peçonhetos. (Carga horária: 8h).
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.
1995 - 1995
10. Tópicos de oceanografia. (Carga horária: 8h).
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.
1994 - 1994
Extensão universitária em 8. Iniciação à biologia marinha. (Carga horária: 40h).
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.
1994 - 1994
5. Geologia marinha. (Carga horária: 8h).
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.
1994 - 1994
6. Peixes de caverna. (Carga horária: 1994h).
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.
1994 - 1994
4. Extração e identificação de fitonematódeos de s. (Carga horária: 8h).
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.
1993 - 1993
1. Microscopia óptica, estereoscópica e manutenção. (Carga horária: 8h).
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.
1993 - 1993
2. Biodiversidade. (Carga horária: 8h).
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.
1993 - 1993
3. Introdução à ornitologia de campo. (Carga horária: 8h).
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.


Atuação Profissional



Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.
Vínculo institucional

2014 - Atual
Vínculo: , Enquadramento Funcional: Pesquisador C, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações
Pesquisador responsável pelo Laboratório de Bioinformática, Biologia integrativa e sistêmica.

Vínculo institucional

2007 - 2008
Vínculo: Pesquisador Colaborador, Enquadramento Funcional: Pós-doutoramento, Carga horária: 0, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações
Pesquisador Colaborador voluntário

Vínculo institucional

1997 - 2003
Vínculo: Outro, Enquadramento Funcional: Aluno de pós graduação, Carga horária: 0

Atividades

06/2014 - Atual
Pesquisa e desenvolvimento , Reitoria, Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética.

11/2005 - 10/2007
Pesquisa e desenvolvimento , Hemocentro, Laboratório de Biologia Molecular e Celular.

03/1997 - 10/2005
Pesquisa e desenvolvimento , Hemocentro, Laboratorio de Biologia Computacional.

1/2003 - 6/2003
Estágios , Faculdade de Ciências Médicas da UNICAMP, Departamento de Clínica Médica da FCM/UNICAMP.

Estágio realizado
Programa de estágio em docencia (PED) Disciplina "Medicina Interna / Introdução às Disciplinas em Clínica Médica I".
1/2002 - 6/2002
Estágios , Faculdade de Ciências Médicas da UNICAMP, Departamento de Clínica Médica da FCM/UNICAMP.

Estágio realizado
Programa de estágio em docencia (PED) Disciplina "Introdução à prática científica".

Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz", ESALQ - USP, Brasil.
Vínculo institucional

2007 - 2014
Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Pós-doutoramento, Regime: Dedicação exclusiva.


Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.
Vínculo institucional

2007 - 2007
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Substituto, Carga horária: 24
Outras informações
Responsável pelas disciplinas de Biologia Molecular e Evolução do curso de Ciências Biológicas do Campus Experimental de São Vicente

Vínculo institucional

1994 - 1994
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Iniciação científica

Atividades

1/1994 - 10/1994
Estágios , Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, Departamento de Física.

Estágio realizado
Comparação das estruturas tridimensionais das aldolases humana e de Drosophila.

Universidade de Alberta, UofA, Canadá.
Vínculo institucional

2012 - 2013
Vínculo: Pesquisador Visitante, Enquadramento Funcional: Pesquisador Visitante


Université Laval, ULAVAL, Canadá.
Vínculo institucional

2014 - 2014
Vínculo: Pesquisador Visitante, Enquadramento Funcional: Pesquisador Visitante



Linhas de pesquisa


1.
Clonagem e caracterização de novos genes realcionados às proteínas do citoesqueleto

Objetivo: Clonar novos genes, analisar domínios proteícos funcionais e imunolocalização de proteínas do citoesqueleto em células hematopoeticas, e celulas do sistema nervoso.
Palavras-chave: Biologia molecular; Domínios Protéicos; Sitio ativo; Função Protéica.
2.
Modelagem estrutural de proteínas

Objetivo: Análise de sítos ativos e identificação de regiões em comum entre famílias protéicas.
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Biologia estrutural.
Palavras-chave: Biologia estrutural; Biologica computacional; Bioinformática; Domínios Protéicos; Filogenia.
3.
Interações evolutivas de famílias protéicas

Objetivo: Caracterizar as interrelações evolutivas entre famílias protéicas, especialmente, proteínas de membrana de hemácias, bactérias de solo e proteínas com duplo direcionamento.
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Quantitativa.
Palavras-chave: Bioinformática; Biologica computacional; Filogenômica; Função Protéica; Biologia de sistemas.
4.
Transcriptomica de intestino de insetos

Objetivo: Conhecer o conjunto de enzimas digestivas transcritas pelos intestinos dos insetos em busca de alvos de interesse em biotecnologia.
Palavras-chave: Biologia de sistemas; Biologia Integrativa; Bioinformática; Evolução; Big Data.
5.
Desenvolvimento de novas ferrmentas de análise de dados de NGS

Objetivo: Desenvolver plataformas de análises de dados biológicos provenientes de sistemas de sequenciamento massivos (nova geração) para uso otimizado em sistemas de computação de alto desempenho..
Palavras-chave: Bioinformática; Biologica computacional; Biologia de sistemas; Programação em PERL; Programação em R; Programação em BASH.
6.
Genomica e Transcriptômica comparativa entre leveduras e bactérias fermentadoras para produção de bioprodutos de segunda geração

Objetivo: Identificar genes e/ou vias bioquímicas de interesse para produção de bioprodutos de segunda geração de fermentação.
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Biologia computacional.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.
Palavras-chave: Transcriptomica; Genômica; Bioinformática; Biologica computacional; Big Data.
7.
Análise evolutiva de famílias protéicas relacionadas a membrana celular

Objetivo: Propor uma filogenia para as famílias de protéinas relacionadas à estrutura e funcionalidade da membrana celular.
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Biologia computacional.
Palavras-chave: Bioinformática; Filogenômica; Biologica computacional; Biologia molecular; Evolução; Biologia estrutural.


Projetos de pesquisa


2011 - 2016
Biologia de sistemas aplicada à agricultura: análise de transcriptomas e interactomas
Descrição: O conhecimento básico de expressão gênica e das redes de interações proteína-proteína são fundamentais para uma melhor compreensão dos mecanismos envolvidos nas relações entre insetos e plantas. Assim, este projeto propõe duas linhas de pesquisa que demandam alta capacidade de aplicação de técnicas de Biologia Computacional. A primeira trata da análise de transcriptomas, tanto para estudos com micro arranjos de DNA quanto para sequenciamento de fragmentos de cDNA por técnicas de alto rendimento. A outra linha de pesquisa trata da proposição de interações proteicas e gênicas de sistemas biológicos (Interactoma), no caso deste projeto, utilizando os dados contidos nos bancos de dados de interações proteína-proteína próprios ? AtPIN ? e publicamente disponíveis e, ainda, dados oriundos de análises dos transcritos previamente citados. Os objetivos principais do projeto são articular estas duas linhas de pesquisa de modo a produzir um corpo sólido de informações e, utilizando dados de co-expressão, identificar quais vias metabólicas são ativadas em insetos, resistentes ou não a inibidores de proteases, que apresentam uma possível barreira aos compostos de defesa de plantas de interesse econômico. Paralelamente, usando a rede de interações de proteínas de Arabidopsis thaliana concatenada pelo AtPIN, identificar as sub-redes de interações (Cliques) que formam os complexos proteicos essenciais e identificar proteínas candidatas a participarem da via de síntese da tiamina em Arabidopsis..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (3) Doutorado: (2) .

Integrantes: Marcelo Mendes Brandao - Coordenador.
Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
2009 - 2011
Identificação de complexos protéicos essenciais em uma rede de interações proteína-proteína
Descrição: Nos últimos anos, os avanços tecnológicos tornaram possível o mapeamento sistemático das interações proteína-proteína por métodos experimentais e in silico, embora, muitas destas metodologias revelem apenas as interações entre pares, e o conjunto destes pares pode ser representado como um grafo matemático. Duas características marcantes dos grafos estão presentes nas redes de interação protéicas; a redundância de substituição e a presença de regiões com alto índice de interações, chamados hubs ou ilhas. Vários autores correlacionam as proteínas presentes nestas ilhas com sua importância para a manutenção do funcionamento do sistema, assim, os hubs protéicos são muito mais importantes para a sobrevivência de uma célula do que proteínas não participantes destes. Para se compreender a intrincada maquinaria celular é necessário identificar as possíveis interações entre proteínas, uma vez que, estas trabalham em conjunto regulando e sendo regulada por outras interações para execução plena de suas funções. Assim, as cadeias de interações protéicas funcionam como uma rede lógica, uma conexão dinâmica na qual a atividade de um processo é afetada por uma alteração nas condições externas ou pela atividade de outro processo..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.

Integrantes: Marcelo Mendes Brandao - Coordenador / Marcio de Castro Silva Filho - Integrante.
2007 - 2009
Análise evolutiva de proteínas com duplo direcionamento em Arabidopsis thaliana e Oryza sativa.
Descrição: Células eucarióticas são caracterizadas por um complexo sistema de endomembranas que definem subcompartimentos ou organelas. Embora, a multi-compartimentalização dos diversos processos biossintéticos tenha proporcionado diferentes papéis para as organelas, observa-se a ocorrência de sobreposições funcionais, ou seja, um mesmo processo bioquímico/fisiológico pode ocorrer em mais de um local. Esta sobreposição funcional foi tratada ao longo da evolução basicamente sob duas estratégias: duplicação gênica seguida da aquisição de seqüências de direcionamento específicas e o duplo direcionamento de proteínas codificadas por um único gene. Diferentes mecanismos regulatórios são responsáveis pela dupla localização das proteínas, incluindo regulação transcricional (múltiplos transcritos ou processamento alternativo do mRNA), mecanismos traducionais. Ainda que, várias destas estratégias de duplo direcionamento sejam vistas como distintas, pode se postular que elas surgiram a partir de processos evolutivos similares envolvendo a aquisição de domínios separados para o direcionamento específico. Finalmente, uma das teorias relacionadas à evolução de genes duplicados sugere que uma cópia pode adquirir uma nova função, sendo preservada pela seleção natural, sendo a outra cópia retendo a função original. Este processo é conhecido como neo-funcionalização e, sua ocorrência pode permitir a presença de níveis diferenciados de regulação gênica. A seleção positiva pode apresentar um papel importante na retenção de genes duplicados Assim, uma das possibilidades a serem exploradas neste trabalho é avaliar os níveis de expressão gênica entre os membros das famílias multigênicas que apresentem um parálogo cujo produto seja destinado às mitocôndrias e cloroplastos. Os objetivos específicos deste trabalho são: Identificar o possível, ou possíveis grupos de origem das proteínas, conhecidas como duplo alvo, herdadas pelas espécies vegetais Arabidopisis thaliana e Oryza sativa por processo de en.
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.

Integrantes: Marcelo Mendes Brandao - Coordenador / Marcio de Castro Silva Filho - Integrante.
Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.
Número de produções C, T & A: 2


Membro de corpo editorial


2014 - Atual
Periódico: BMC Genomics
2012 - Atual
Periódico: REVISTA ELETRÔNICA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DO IESB


Revisor de periódico


2005 - Atual
Periódico: Bioinformatics (Oxford)
2005 - 2006
Periódico: Biota Neotropica
2007 - Atual
Periódico: Briefings in Bioinformatics
2011 - Atual
Periódico: Genetics and Molecular Biology (Impresso)


Revisor de projeto de fomento


2017 - Atual
Agência de fomento: Fundação de Apoio à Pesquisa do Distrito Federal
2015 - 2017
Agência de fomento: Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Biologia computacional.
2.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.
3.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Filogenômica.
4.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Evolução.
5.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética.


Idiomas


Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Português
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.


Prêmios e títulos


2011
SBBq AWARD Best work, SBBq.
2009
Best Bioinformatics tools and Databases, Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology (AB3C).
2002
Young investigator award, Fondazione Italiana Ricerca Sul Cancro.
2001
Prêmio Oswaldo Melone, Sociedade Brasileira de Hematologia.
2001
Young investigator travel grant, European Haematololgy Association.


Produções



Produção bibliográfica
Citações

Web of Science
Total de trabalhos:24
Total de citações:311
Fator H:8
Brandão, Marcelo M  Data: 12/09/2017

SCOPUS
Total de trabalhos:21
Total de citações:300
brandao marcelo m; Brandão, Marcelo Mendes  Data: 12/09/2017

Outras
Total de trabalhos:35
Total de citações:499
brandao mm[author]  Data: 12/09/2017

Artigos completos publicados em periódicos

1.
HORTA, MARIA AUGUSTA CRIVELENTE2018HORTA, MARIA AUGUSTA CRIVELENTE ; FILHO, JAIRE ALVES FERREIRA ; MURAD, NATÁLIA FARAJ ; DE OLIVEIRA SANTOS, EIDY ; DOS SANTOS, CLELTON APARECIDO ; MENDES, JULIANO SALES ; BRANDÃO, MARCELO MENDES ; AZZONI, SINDELIA FREITAS ; DE SOUZA, ANETE PEREIRA . Network of proteins, enzymes and genes linked to biomass degradation shared by Trichoderma species. Scientific Reports, v. 8, p. 1341, 2018.

2.
SILVA-BRANDÃO, KARINA LUCAS2018SILVA-BRANDÃO, KARINA LUCAS ; PERUCHI, ALINE ; SERAPHIM, NOEMY ; MURAD, NATÁLIA FARAJ ; CARVALHO, RENATO ASSIS ; FARIAS, JULIANO RICARDO ; OMOTO, CELSO ; CÔNSOLI, FERNANDO LUIS ; FIGUEIRA, ANTONIO ; BRANDÃO, MARCELO MENDES . Loci under selection and markers associated with host plant and host-related strains shape the genetic structure of Brazilian populations of Spodoptera frugiperda (Lepidoptera, Noctuidae). PLoS One, v. 13, p. e0197378, 2018.

3.
BAJAY, STEPHANIE K.2018BAJAY, STEPHANIE K. ; CRUZ, MARIANA V. ; DA SILVA, CARLA C. ; MURAD, NATÁLIA F. ; BRANDÃO, MARCELO M. ; DE SOUZA, ANETE P. . Extremophiles as a Model of a Natural Ecosystem: Transcriptional Coordination of Genes Reveals Distinct Selective Responses of Plants Under Climate Change Scenarios. Frontiers in Plant Science, v. 9, p. 1376, 2018.

4.
SPERLING, JANET L.2017SPERLING, JANET L. ; SILVA-BRANDÃO, K.L. ; BRANDÃO, M.M. ; LLOYD, V.K. ; DANG, S. ; DAVIS, C.S. ; SPERLING, F.A.H. ; MAGOR, K.E. . Comparison of bacterial 16S rRNA variable regions for microbiome surveys of ticks. Ticks and Tick-Borne Diseases, p. 453-461, 2017.

5.
SILVA-BRANDÃO, KARINA LUCAS2017 SILVA-BRANDÃO, KARINA LUCAS ; HORIKOSHI, RENATO JUN ; BERNARDI, DANIEL ; OMOTO, CELSO ; FIGUEIRA, ANTONIO ; BRANDÃO, MARCELO MENDES . Transcript expression plasticity as a response to alternative larval host plants in the speciation process of corn and rice strains of Spodoptera frugiperda. BMC GENOMICS, v. 18, p. 792, 2017.

6.
SOUZA, T. P.2016SOUZA, T. P. ; DIAS, R. O. ; CASTELHANO, E. C. ; Brandão, M. M. ; MOURA, D. S. ; SILVA FILHO, M. C. . Comparative analysis of expression profiling of the trypsin and chymotrypsin genes from Lepidoptera species with different levels of sensitivity to soybean peptidase inhibitors. Comparative Biochemistry and Physiology. Part B: Biochemistry & Molecular Biology (Print), v. 196-197, p. 67-73, 2016.

7.
DIAS, RENATA O.2015 DIAS, RENATA O. ; VIA, ALLEGRA ; BRANDÃO, MARCELO M. ; TRAMONTANO, ANNA ; SILVA-FILHO, MARCIO C. . Digestive peptidase evolution in holometabolous insects led to a divergent group of enzymes in Lepidoptera. Insect Biochemistry and Molecular Biology, v. 58, p. 1-11, 2015.

8.
SILVA-BRANDÃO, KARINA LUCAS2015SILVA-BRANDÃO, KARINA LUCAS ; SILVA, OSCAR ARNALDO BATISTA NETO E ; BRANDÃO, MARCELO MENDES ; OMOTO, CELSO ; SPERLING, FELIX A. H. . Genotyping-by-sequencing approach indicates geographic distance as the main factor affecting genetic structure and gene flow in Brazilian populations of Grapholita molesta (Lepidoptera, Tortricidae). EVOLUTIONARY APPLICATIONS, p. n/a-n/a, 2015.

9.
Brandão, M M2015 Brandão, M M; SPOLADORE, L. ; FARIA, L. C. B. ; ROCHA, A. S. L. ; SILVA FILHO, M. C. ; PALAZZO JR, R. . Ancient DNA sequence revealed by error-correcting codes. Scientific Reports, v. 5, p. 12051, 2015.

10.
SANTINI, LUCIANE2015SANTINI, LUCIANE ; MUNHOZ, CARLA FREITAS ; BONFIM JR., MAURO FERREIRA ; INOMOTO, MARIO MASSAYUKI ; BRANDÃO, MARCELO MENDES ; VIEIRA, MARIA LUCIA CARNEIRO . Host transcriptional profiling at early and later stages of the compatible interaction between Phaseolus vulgaris and Meloidogyne incognita.. Phytopathology, v. x, p. 001, 2015.

11.
PICCIN-SANTOS, VIVIANE2014PICCIN-SANTOS, VIVIANE ; BRANDÃO, MARCELO MENDES ; BITTENCOURT-OLIVEIRA, MARIA DO CARMO . Phylogenetic study of and (Cyanobacteria) using PC-IGS and 16S-23S ITS as markers: investigation of horizontal gene transfer. Journal of Phycology, v. 50, p. 736-743, 2014.

12.
Mascari, MG2012Mascari, MG ; DUARTE, V. S. ; Brandão, M M ; DELALIBERA JUNIOR, I. . Natural occurrence of Zoophthora radicans (Entomophthorales: Entomophthoraceae) on Thaumastocoris peregrinus (Heteroptera: Thaumastocoridae), an invasive pest recently found in Brazil. Journal of Invertebrate Pathology (Print), v. 110, p. 401-404, 2012.

13.
LAZARINI, MARIANA2012LAZARINI, MARIANA ; TRAINA, FABIOLA ; MACHADO-NETO, JOÃO A. ; BARCELLOS, KARIN S.A. ; MOREIRA, YURI B. ; BRANDÃO, MARCELO M. ; VERJOVSKI-ALMEIDA, SERGIO ; RIDLEY, ANNE J. ; SAAD, SARA T. OLALLA . ARHGAP21 is a RhoGAP for RhoA and RhoC with a role in proliferation and migration of prostate adenocarcinoma cells. Biochimica et Biophysica Acta. Molecular Basis of Disease, v. ip, p. S09254439120026, 2012.

14.
Fontes, A2011Fontes, A ; Castro, M L Barjas ; Brandão, M M ; Fernandes, H P ; Thomaz, A A ; Huruta, R R ; Pozzo, L Y ; Barbosa, L C ; Costa, F F ; Saad, S T O ; Cesar, C L . Mechanical and electrical properties of red blood cells using optical tweezers. Journal of Optics, v. 13, p. 044012, 2011.

15.
De-la-Pena, C.2010De-la-Pena, C. ; Badri, D. V. ; Lei, Z. ; Watson, B. S. ; BRANDAO, M. M. ; Silva-Filho, M. C. ; Sumner, L. W. ; Vivanco, J. M. . Root secretion of defense-related proteins is development-dependent and correlated with flowering time. The Journal of Biological Chemistry (Print), v. 285, p. 30654-30665, 2010.

16.
BRANDAO, M. M.2010BRANDAO, M. M.; Silva-Filho, M. C. . Evolutionary History of Arabidopsis thaliana Aminoacyl-tRNA Synthetase Dual-Targeted Proteins. Molecular Biology and Evolution, v. 28, p. 79-85, 2010.

17.
BRANDAO, M. M.;Brandao, Marcelo M;Brandão, M M;Marcelo Mendes Brandão;Brandão, M. M.;BRANDÃO, MARCELO MENDES;BRANDÃO, MARCELO M.;BRANDÃO, M.M.2009BRANDAO, M. M.; CASTRO, Maria de Lourdes Rios Barjas ; FONTES, Adriana ; CÉSAR, Carlos Lenz ; COSTA, Fernando Ferreira ; SAAD, Sara Terezinha Ollala . Impaired red cell Deformability in iron deficient subjects. Clinical Hemorheology and Microcirculation, v. 43, p. 219-223, 2009.

18.
Brandao, Marcelo M2009 Brandao, Marcelo M; Dantas, Luiza L ; Silva-Filho, Marcio C . AtPIN: Arabidopsis thaliana Protein Interaction Network. BMC Bioinformatics, v. 10, p. 454, 2009.

19.
BRANDAO, M. M.;Brandao, Marcelo M;Brandão, M M;Marcelo Mendes Brandão;Brandão, M. M.;BRANDÃO, MARCELO MENDES;BRANDÃO, MARCELO M.;BRANDÃO, M.M.2006BRANDAO, M. M.; BRANDÃO, Karina Lucas da Silva ; COSTA, Fernando Ferreira ; SAAD, Sara Terezinha Ollala . RHOGAP domain-containing proteins phylogeny. Genomics, Proteomics & Bioinformatics, China, v. 4, n.3-4, p. 182-188, 2006.

20.
FONTES, Adriana2005FONTES, Adriana ; CASTRO, Maria de Lourdes Rios Barjas ; BRANDAO, M. M. ; SAAD, Sara Terezinha Ollala ; BARBOSA, Luiz Carlos ; CÉSAR, Carlos Lenz . Mechanical properties of stored red blood cells using optical tweezers. Proceedings of SPIE, the International Society for Optical Engineering, v. 5930, p. 1-6, 2005.

21.
BRANDAO, M. M.;Brandao, Marcelo M;Brandão, M M;Marcelo Mendes Brandão;Brandão, M. M.;BRANDÃO, MARCELO MENDES;BRANDÃO, MARCELO M.;BRANDÃO, M.M.2003BRANDAO, M. M.; FONTES, Adriana ; CASTRO, Maria de Lourdes Rios Barjas ; CÉSAR, Carlos Lenz ; COSTA, Fernando Ferreira ; SAAD, Sara Terezinha Ollala . Optical tweezers for measuring red blood cell elasticity: application to the study of drug response in sickle cell disease. European Journal of Haematology, v. 70, n.4, p. 207-211, 2003.

22.
BRANDAO, M. M.;Brandao, Marcelo M;Brandão, M M;Marcelo Mendes Brandão;Brandão, M. M.;BRANDÃO, MARCELO MENDES;BRANDÃO, MARCELO M.;BRANDÃO, M.M.2003BRANDAO, M. M.; SAAD, Sara Terezinha Ollala ; CÉSAR, Carlos Lenz ; FONTES, Adriana ; COSTA, Fernando Ferreira ; CASTRO, Maria de Lourdes Rios Barjas . Elastic properties of stored red blood cells from sickle trait donor units. Vox Sanguinis (Basel. 1956), v. 85, n.3, p. 213-215, 2003.

23.
CASTRO, Maria de Lourdes Rios Barjas2002BRANDAO, M. M.; CASTRO, Maria de Lourdes Rios Barjas ; FONTES, Adriana ; CÉSAR, Carlos Lenz ; COSTA, Fernando Ferreira ; SAAD, Sara Terezinha Ollala . Elastic properties of irradiated RBCs measured by optical tweezers. Transfusion (online), v. 42, n.9, p. 1196-1199, 2002.

24.
BRANDAO, M. M.;Brandao, Marcelo M;Brandão, M M;Marcelo Mendes Brandão;Brandão, M. M.;BRANDÃO, MARCELO MENDES;BRANDÃO, MARCELO M.;BRANDÃO, M.M.2001BRANDAO, M. M.; SOARES, Elizabeth ; SAAD, Sara Terezinha Ollala . Expression of inducible nitric oxide synthase is increased in acute myeloid leukaemia. Acta Haematologica, v. 106, n.3, p. 95-99, 2001.

Textos em jornais de notícias/revistas
1.
BRANDAO, M. M.; ARRUDA, L. H. ; MOURA, D. S. ; SILVA FILHO, M. C. ; Silva, F. H. ; Júnior, W.M. ; Neshich, IP ; NESHICH, Goran . Manobra de Escape. Revista Cultivar, Pelotas, RS, p. 06 - 07, 01 jul. 2011.

Resumos expandidos publicados em anais de congressos
1.
Brandão, M M; BELIVEAU, C. ; BOYLE, B. ; DOUCET, D. ; WEN, F. ; LUMLEY, L. ; SPERLING, F. A. H. ; JURETIC, N. ; DEWAR, K. ; LEVESQUE, R. C. ; CUSSON, M. . The spruce budworm transcriptome and its use in identifying the molecular and endocrine correlates of early instar diapause. In: 2016 International Congress of Entomology, 2016, Orlando. Presentations of the XXV ICE, 2016.

2.
SILVA-BRANDÃO, KARINA LUCAS ; Brandão, M. M. ; HORIKOSHI, R. ; BERNARDI, D. ; OMOTO, CELSO ; FIGUEIRA, A. . Gene expression plasticity response to alternative host plants in the speciation process of Spodoptera frugiperda strains. In: 2016 International Congress of Entomology, 2016, Orlando. Presentations of the XXV ICE, 2016.

3.
BRANDAO, M. M.; BRANDÃO, Karina Lucas da Silva ; COSTA, Fernando Ferreira ; SAAD, Sara Terezinha Ollala . RHOGAP DOMAIN-CONTAINING PROTEINS PHYLOGENY - AN BAYESIAN APPROACH. In: 14th Annual International conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB 2006), 2006, Fortaleza. ISMB 2006, 2006.

4.
BRANDAO, M. M.; FALCÃO, Paula Regina Kuser ; NESHICH, Goran . STRUCTURAL PARAMETERS TO FILTER CRUCIAL CATALYTIC SITE AMINOACIDS FROM FRUCTOSE 1,6-BISPHOSPHATE ALDOLASE. In: 14th Annual International conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB 2006), 2006, Fortaleza. ISMB 2006, 2006.

5.
BRANDAO, M. M.; BRANDÃO, Karina Lucas da Silva ; COSTA, Fernando Ferreira ; SAAD, Sara Terezinha Ollala . RHOGAP DOMAIN-CONTAINING PROTEINS PHYLOGENY ? AN BAYESIAN APPROACH. In: 14th annual international conference on Intelligent systems for molecular biology, 2006, Fortaleza. ISMB2006, 2006.

6.
BRANDAO, M. M.; FALCÃO, Paula Regina Kuser ; NESHICH, Goran . STRUCTURAL PARAMETERS TO FILTER CRUCIAL CATALYTIC SITE AMINOACIDS FROM FRUCTOSE 1,6-BISPHOSPHATE ALDOLASE.. In: 14th annual international conference on Intelligent systems for molecular biology, 2006, Fortaleza. ISMB2006, 2006.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
BAJAY, S. K. ; SILVA, C. C. ; MURAD, N. F. ; Brandão, M. M. ; SOUZA, A. P. . GENE CO-EXPRESSION NETWORK REVEALS DISTINCT SELECTIVE RESPONSES BETWEEN EQUATORIAL AND SUBTROPICAL MANGROVE REGIONS IN A SCENARIO OF GLOBAL CLIMATE CHANGE. In: GENÉTICA 2017 - Brazilian-International Congress of Genetics, 2017, Águas de Lindóia. Genetica 2017 Abstracts book. Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2017.

2.
FILHO, M. A. ; DIAS, R. O. ; Brandão, M. M. ; SAAD, SARA T. OLALLA . SCREENING OF GENETIC VARIANTS IN FAMILIAL CASES OF MYELOID NEOPLASMS BY EXOME SEQUENCING. In: Congresso Brasileiro de Hematologia, Hemoterapia e Terapia Celular, 2016, Florianópolis. Revista Brasileira de Hematologia e Hemoterapia. Rio de Janeiro: Associação Brasileira de Hematologia, Hemoterapia e Terapia Celular, 2016. v. 38. p. 547.

3.
MURAD, N. F. ; SILVA-BRANDÃO, KARINA LUCAS ; Brandão, M. M. . Gene regulatory networks applied to transcriptome data to detect differences in adaptation to herbivory of two Spodoptera frugiperda strains focusing on peptidases. In: 2016 International Congress of Entomology, 2016, Orlando. Presentations of the XXV ICE, 2016.

4.
BAJAY, S. K. ; CRUZ, M. V. ; MANTELLO, C. C. ; Brandão, M. M. ; SOUZA, A. P. . De novo assembly and characterization of the transcriptome of Rhizophora mangle, an extremophilic species.. In: International Plant Molecular Biology Congress, 2015, Foz do Iguaçú. Abstracts from the International Plant Molecular Biology Congress, 2015.

5.
Brandão, M. M.. DeNSAs - The de novo sequence annotation system. In: X-meeting 2016, 2015, São Paulo. X-meeting abstracts, 2015.

6.
SILVA-BRANDÃO, KARINA LUCAS ; BRANDÃO, MARCELO MENDES ; HORIKOSHI, R. ; BERNARDI, D. ; OMOTO, CELSO ; FIGUEIRA, A. . Comparative gene expression profile in Spodoptera frugiperda (Lepidoptera, Noctuidae) host races feeding on preferential and alternative host plants. In: Annual meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution, 2015, Vienna. Abstract book of hte 2015 annual meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution, 2015. p. 906.

7.
Brandão, M. M.; FARIA, L. C. B. ; ROCHA, A. S. L. ; SILVA FILHO, M. C. ; PALAZZO JR, R. . Ancient DNA sequence can be revealed by error-Correcting codes. In: third International Society for Computational Biology Latin America X-Meeting on Bioinformatics with BSB and SoiBio, 2014, Belo Horizonte. Abstracts from the third International Society for Computational Biology Latin America X-Meeting on Bioinformatics with BSB and SoiBio, 2014.

8.
Brandão, M M; ARRUDA, L. H. ; MOURA, D. S. ; NESHICH, Goran ; Neshich, IP ; SILVA FILHO, M. C. . ?Structural and Phylogenetic Analysis of Spodoptera frugiperda Chymotrypsins Involved on Insect Chemical Protective Barrier Against Plant Proteinase Inhibitors (PIs). In: Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Biologia Molecular e Bioquímica, 2011, Foz do Iguaçu. SBBq - Program of the XL Annual Meeting, 2011.

9.
BRANDAO, M. M.; DIAS, R. O. ; SILVA FILHO, M. C. . Transcriptomic profile of the Spodoptera frugiperda midgut. In: 7th International Conference of th Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology - X-Meeting, 2011, Florianópolis. 7th x-meeting, 2011.

10.
BRANDAO, M. M.; SILVA FILHO, M. C. . Horizontal gene transfer evidences on a dual target protein, the tRNA synthetase family. In: ISMB, 2008, Toronto. Proceeding of the 16th Annual International Conference Intelligent Systems for Molecular Biology, 2008.

11.
BARCELLINI, V. C. ; BRANDÃO, Karina Lucas da Silva ; BRANDAO, M. M. . From Bacteria to Butterfly: A neighbor joining inference of Horizontal gene transfer.. In: 3rd International Conference of the AB3C, 2007, São Paulo. Proceeding of the 3rd X-Meeting. Campinas, 2007.

12.
Silva, F.F. ; SAAD, Sara Terezinha Ollala ; BRANDÃO, Karina Lucas da Silva ; BRANDAO, M. M. . Molecular evolution on MASK and Formins proteins. In: 3rd International Conference of the AB3C, 2007, São Paulo. Proceeding of the 3rd X-Meeting. Campinas, 2007.

13.
BRANDAO, M. M.; CASTRO, Maria de Lourdes Rios Barjas ; COSTA, Fernando Ferreira ; CÉSAR, Carlos Lenz ; SAAD, Sara Terezinha Ollala . IMPAIRED RED CELL ELASTICITY IN IRON DEFICIENT SUBJECTS. In: Congresso Brasileiro de Hematologia e Hemoterapia, 2007, São Paulo. Anais do Congresso Brasileiro de Hematologia e Hemoterapia, 2007.

14.
BRANDAO, M. M.; BRANDÃO, Karina Lucas da Silva ; COSTA, Fernando Ferreira ; SAAD, Sara Terezinha Ollala . Phylogenetic analysis, a tool to enlighten protein interaction: an approach to the human RhoGAP domain-containing proteins studies. In: 1st International conference of the AB3C, 2005, Caxambú / MG. X-meeting - 1st international conference of the AB3C, 2005.

15.
CAMPOS, Paula de Melo ; TRAINA, Fabíola ; DUARTE, Adriana da Silva Santos ; BENITES, Bruno D ; BRANDAO, M. M. ; COSTA, Fernando Ferreira ; SAAD, Sara Terezinha Ollala . Expressão de FLIP-Long (FLIPL) e FLIP-Short (FLIPS) em células de medula óssea de pacientes com mielodisplasia: correlação com subgrupos de acordo com as classificações FAB e WHO. In: Congresso Brasileiro de Hematologia e hemoteraipa, 2005, Rio de Janeiro. Anais do Hemo 2005, 2005.

16.
BRANDAO, M. M.; BRANDÃO, Karina Lucas da Silva ; COSTA, Fernando Ferreira ; SAAD, Sara Terezinha Ollala . Phylogenetic analysis, a tool to enlighten protein interaction: an approach to the human RhoGAP domain-containing proteins studies. In: X-meeting, 2005. X-Meeting, 2005.

17.
BRANDAO, M. M.; FONTES, Adriana ; CÉSAR, Carlos Lenz ; COSTA, Fernando Ferreira ; SAAD, Sara Terezinha Ollala . Deformabilidade de células AS estocadas medida por pinça óptica. In: 3. 25º Congresso brasileiro de Hematologia e Hemoterapia, 2002, Salvador. 25º Congresso de Hematologia / Hemoterapia, 2002.

18.
BRANDAO, M. M.; FONTES, Adriana ; CÉSAR, Carlos Lenz ; COSTA, Fernando Ferreira ; CASTRO, Maria de Lourdes Rios Barjas ; SAAD, Sara Terezinha Ollala . Redução da deformabilidade de células com anemia ferropriva, medida por pinça óptica. In: 25º Congresso brasileiro de Hematologia e Hemoterapia, 2002, Salvador. Anais do 25° Congresso brasileiro de Hematologia e Hemoterapia, 2002.

19.
BRANDAO, M. M.; FONTES, Adriana ; CÉSAR, Carlos Lenz ; COSTA, Fernando Ferreira ; SAAD, Sara Terezinha Ollala . Deformabilidade de células AS estocadas medida por pinça óptica. In: 25º Congresso brasileiro de Hematologia e Hemoterapia, 2002, Salvador. Anais do 25º Congresso brasileiro de Hematologia e Hemoterapia, 2002.

20.
BRANDAO, M. M.; CÉSAR, Carlos Lenz ; COSTA, Fernando Ferreira ; SAAD, Sara Terezinha Ollala . Impaired elasticity of red blood cells with different membrane protein defects measured by optical tweezers technique. In: 6TH ANNUAL MEETING OF THE EUROPEAN HAEMATOLOGY ASSOCIATION, 2001, Frankfurt. The Hematology Journal. Londres: Nature Publish Group, 2001. v. 1. p. 178-178.

21.
BRANDAO, M. M.; CASTRO, Maria de Lourdes Rios Barjas ; SAAD, Sara Terezinha Ollala ; COSTA, Fernando Ferreira ; CÉSAR, Carlos Lenz ; FONTES, Adriana . Deformability of stored as red blood cell units measured by optical tweezers.. In: ANNUAL MEETING OF THE AMERICAN SOCIETY OF HEMATOLOGY, 2001, Orlando, Fl. Blood. Washington: Wb Saunders, 2001. v. 98. p. 103B-103B.

22.
BRANDAO, M. M.; CASTRO, Maria de Lourdes Rios Barjas ; CÉSAR, Carlos Lenz ; FONTES, Adriana ; COSTA, Fernando Ferreira ; SAAD, Sara Terezinha Ollala . Reduction of erythrocyte deformability in iron deficiency measured by optical tweezers.. In: ANNUAL MEETING OF THE AMERICAN SOCIETY OF HEMATOLOGY, 2001, Orlando, Fl. Blood. Washington: WB Saunders, 2001. v. 98. p. 494a-494a.

23.
BRANDAO, M. M.; FONTES, Adriana ; CÉSAR, Carlos Lenz ; COSTA, Fernando Ferreira ; CASTRO, Maria de Lourdes Rios Barjas ; SAAD, Sara Terezinha Ollala . Reduced elasticity of irradiated red blood cell units stored for 21 days, measured by optical tweezers.. In: Annual meeting of the American Society of Hematology, 2000, San Diego. Blood, 2000. v. 96. p. 660a-660a.

24.
BRANDAO, M. M.; SOARES, Elizabeth ; SAAD, Sara Terezinha Ollala . Expression of inducible nitric oxide synthase (inos) is increased in acute myeloid leukaemia. In: 4TH ANNUAL MEETING OF THE EUROPEAN HAEMATOLOGY ASSOCIATION, 1999, Barcelona. Haematologica. Pavia Itália: The Ferrata Storti Foundation, 1999. v. 84. p. 145-145.

25.
BRANDAO, M. M.; SAAD, Sara Terezinha Ollala ; COSTA, Fernando Ferreira ; CÉSAR, Carlos Lenz ; CASTRO, Maria de Lourdes Rios Barjas . Differences in mechanical properties of Hbs Cells measured by optical tweezers technique. In: 41TH ANNUAL MEETING OF THE AMERICAN SOCIETY OF HEMATOLOGY, 1999, New Orleans. BLOOD. New york: W.B. Saunders, 1999. v. 94. p. 191a-191a.

26.
BRANDAO, M. M.; SAAD, Sara Terezinha Ollala . Relação da expressão de RAS e formação de NO em linhagens leucêmicas. In: FESBE, 1998, Caxambú. FESBE 98, 1998.

27.
BRANDAO, M. M.; ARNI, R. K. . Comparação das estruturas tridimensionais homólogas entre aldolases de Drosophila melanogaster e Homo sapiens. In: XII Colóquio de Incentivo à Pesquisa, 1995, São José do Rio Preto. do XII Colóquio de Incentivo à Pesquisa da UNESP, 1995.

Apresentações de Trabalho
1.
BRANDÃO, MARCELO M.. Análise de metadados para identificação funcional em transcriptomas de novo. 2018. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

2.
Brandão, M. M.. Biotecnologia e sustentabilidade. 2018. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

3.
Brandão, M. M.. Big data em transcriptômica. 2018. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

4.
QUEIROZ, M. C. V. ; HORTA, MARIA AUGUSTA CRIVELENTE ; Brandão, M. M. ; SATO, M. E. . Análise de transcriptoma de linhagens de Phytoseiulus macropilis (Acari: Phytoseiidae) resistente e suscetível a piretroides'. 2018. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

5.
Brandão, M. M.. Transcriptômica e Big Data, amigos inseparáveis. 2017. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

6.
Brandão, M. M.. Mining the Big data. 2016. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

7.
BRANDAO, M. M.. Agricultural insect pests studies in the next generation sequencing era: Sequence annotation and peptidase database. 2015. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

8.
Brandão, M. M.. Mathematics of Life. 2015. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

9.
Brandão, M. M.; FARIA, L. C. B. ; ROCHA, A. S. L. ; SILVA FILHO, M. C. ; PALAZZO JR, R. . DNA sequences do have a mathematical structure!. 2014. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

10.
Brandão, M. M.. Transcriptômica e Big Data no estudo de insetos praga. 2014. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

11.
ARRUDA, L. H. ; BRANDAO, M. M. ; NESHICH, Goran ; MOURA, D. S. ; SILVA FILHO, M. C. . Characterization of Structural Interactions among Spodoptera frugiperda Serine Proteinases and Plant Proteinase Inhibitors.. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

12.
BRANDAO, M. M.; Dantas, LL de Barros ; SILVA FILHO, M. C. . ATPIN: ARABIDOPSIS THALIANA PROTEIN INTERACTION NETWORK. 2009. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).


Produção técnica
Programas de computador sem registro
1.
BRANDAO, M. M.; SILVA FILHO, M. C. . BIOlogical Scripts for PHylogenetic Analyses. 2010.

2.
BRANDAO, M. M.; SILVA FILHO, M. C. . Arabidopsis thaliana protein interaction network. 2009.

3.
BRANDAO, M. M.; SAAD, Sara Terezinha Ollala . Ssitema de gerenciamento de Conferencia - Semana da Pesquisa. 2008.

4.
BRANDAO, M. M.. Atualização do sistema DataPesq - Camara de pesquisa da FCM UNICAMP. 2006.

5.
BRANDAO, M. M.. Web site do hemocentro da Unicamp. 2002.

6.
BRANDAO, M. M.; SAAD, Sara Terezinha Ollala . Web site de Auxílio ao módulo Célula. 2001.

Entrevistas, mesas redondas, programas e comentários na mídia
1.
Brandão, M. M.; MARGARIDO, G. ; KUROSHU, R. . Aplicações e Desafios da Bioinformática. 2017. (Programa de rádio ou TV/Mesa redonda).

2.
Brandão, M. M.; ALVES FILHO, M. . Matemática da Vida. 2015. (Programa de rádio ou TV/Entrevista).

Redes sociais, websites e blogs
1.
Brandão, M. M.. The Bioinfo Guy. 2016; Tema: Divulgação da área de Bioinformática e Biologia Computacional. (Rede social).

2.
Brandão, M M. The Bioinfo Guy. 2014; Tema: Divulgação de sistemas de pesquisa e análise utilizando ferramentas de biologia computacional. (Site).


Demais tipos de produção técnica
1.
BRANDAO, M. M.. Filogenia. 2009. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

2.
BRANDAO, M. M.. Introdução A Bioinformática e a Filogenia Molecular. 2009. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

3.
BRANDAO, M. M.. Ecologia Molecular. 2007. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

4.
BRANDAO, M. M.. Alterações nas propriedades mecânicas de hemácias: Hemácias estocadas, com alteração de membranas e anemias. 2003. (Curso de curta duração ministrado/Outra).



Bancas



Participação em bancas de trabalhos de conclusão
Mestrado
1.
DIAS, S. M. G.; BRANDÃO, M.M.; MASCHIETTO, M.. Participação em banca de Fábio Malta de Sá Patroni. Identificação dos Genes Regulados pelas diferentes isoformas de HIF-3Alfa: Desenvolvimento de ferramenta para análise de Dados Tumorais. 2019. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

2.
Brandão, M M; FIGUEIRA, A.. Participação em banca de Paulo Massanari Tokimatu Filho. Estudo da evolução da fitopatogenicidade em Moniliophthora perniciosa através de análises de genômica comparativa de seus biótipos. 2018. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

3.
OLIVEIRA, J. V. C.; BRANDÃO, M.M.; GROSS, J.. Participação em banca de Mirta Natalia Coutouné. Genomica Comparativa de cepas de Saccharomyces cerevisiae produtoras de etanol. 2018. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

4.
Brandão, M. M.; Saad, S T O; CARDENAS, R. G. C. C. L.. Participação em banca de Moisés Alves Ferreira Filho. Rastreamento de variantes genéticas em neoplasias mieloides por sequenciamento completo do exoma. 2016. Dissertação (Mestrado em Fisiopatologia Médica) - Universidade Estadual de Campinas.

5.
PEREIRA, G.A. G.; BRANDAO, M. M.; YAMAGISHI, M. E. B.. Participação em banca de Osvaldo Reis Junior. Identificação e padrões de expressão de transcritos derivados de RNA-seq: caracterização molecular do fungo Moniliophtora perniciosa, causador da vassoura de bruxa do cacauero. 2014. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

6.
SANTOS, R. V.; BRANDAO, M. M.; Kobarg, J. Participação em banca de Lucas Eduardo Costa Canesin. Identificação e caracterização de lncRNAs e genes codificantes linhagem-específicos em Andropogoneae: Padroes comuns de genes emergentes. 2014. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

7.
VIEIRA, M. L. C.; BRANDAO, M. M.; VITORELLO, C. B. M.. Participação em banca de Anselmo Azevedo dos Santos. Exploração de uma biblioteca genômica de Passiflora edulis f. flavicarpa por sequenciamento de BAC-ends. 2013. Dissertação (Mestrado em Genética e Melhoramento de Plantas) - Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz".

8.
BRANDAO, M. M.; TEXEIRA, M. M.; PAPES, F.. Participação em banca de Raphael de Souza Mattos. análise de microtranscriptoma em variedades de cana-de-açúcar (Saccharum spp.) submetida a estresse hídrico. 2011. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

9.
BRANDAO, M. M.; FALCÃO, Paula Regina Kuser; YAMAGISHI, M. E. B.. Participação em banca de Isabel Pereira Caminha. Estudos estruturais das enzimas envolvidas com o mecanismo de produção de ácidos orgânicos da bactéria Gluconacetobacter diazotrophicus utilizando métodos computacionais. 2011. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

10.
BRANDAO, M. M.; YAMAGISHI, M. E. B.; SANTOS, R. V.. Participação em banca de Isabel Pereira Caminha. Estudos estruturais das enzimas envolvidas com a produção de ácidos orgânicos da bactéria G. diazotrophicus por métodos computacionais. 2010. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

11.
BRANDAO, M. M.; TEXEIRA, M. M.; VINCENTZ, M. G. A.. Participação em banca de Raphael de Souza Matos. análise de microtranscriptoma e variedades de cana (Saccharum spp) submetidas a estresse hídrico. 2010. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

12.
BRANDAO, M. M.; Matioli, S. R.; SANTOS, R. V.. Participação em banca de Felipe Fedel Silva. Identificação e filogenia de genes relacionados a fotossíntese na Cana de açúcar. 2010. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

13.
BRANDAO, M. M.; FALCÃO, Paula Regina Kuser; YAMAGISHI, M. E. B.. Participação em banca de Isabel Pereira Caminha. Estudos estruturais das enzimas envolvidas com o mecanismo de produção de ácidos orgânicos da bactéria Gluconacetobacter diazotrophicus utilizando métodos computacionais. 2010. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Teses de doutorado
1.
BRANDAO, M. M.; FUJITA, A.; Carvalho, B S; YAMAGISHI, M. E. B.; CARVALHO, R. A.. Participação em banca de Natália Faraj Murad. Redes de regulação gênica para a identificação de adaptações de duas raças de Spodoptera frugiperda a diferentes dietas. 2018. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

2.
Brandão, M. M.; ANDREOTE, F. D.; TAKETANI, R. G.. Participação em banca de Daiane Rodrigues Barbosa Belgini. Estudos de interações e função microbiana em reservatórios de petróleo brasileiros. 2018. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

3.
DAMASIO, A. R. L.; MALAVAZI, I.; SEGATO, F.; PERSINOTI, G. F.; Brandão, M. M.. Participação em banca de Mariane Paludetti Zubieta. aspergillus nidulans como modelo para manipulação de genes envolvidos no processo de unfolded protein response. 2018. Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

4.
MONDEGO, J. M. C.; TAKITA, M. A.; Brandão, M. M.. Participação em banca de Nicholas Vinicius Silva. Caracterização genômica e desempnho agronômico de Erianthus arundinaceus: Uma planta com potencial para bioenergia. 2018. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

5.
PALAZZO JR, R.; CAMARA, C. E.; ANDRADE, A. A.; Brandão, M M; BENGTSON, M. H.. Participação em banca de Mario Enrique Duarte Gonzalez. Modelagem da síntese de proteínas e sua estrutura organizacional atraves de códigos corretores de erro. 2017. Tese (Doutorado em Engenharia Elétrica) - Universidade Estadual de Campinas.

6.
FUENTES, A. S. C.; FREIRE, C. C. M.; ALVARENGA, R. O.; BRAGA, M. R. B.; Brandão, M. M.. Participação em banca de Darlan Gonçalves Nakayama. Estudos transcriptômicos do inseto Migdolus fryanus, a broca do rizoma da cana-de-açúcar. 2017. Tese (Doutorado em Genética e Evolução) - Universidade Federal de São Carlos.

7.
SILVA FILHO, M. C.; Brandão, M M; CONSOLI, F. L.; MICHEL, A. P.. Participação em banca de Júlio César Fatoretto. Caracterização Molecular da Lagarta do cartucho (Spodoptera frugiperda) resistente a proteína VIP3Aa20 em milho. 2017. Tese (Doutorado em INTERNACIONAL BIOLOGIA) - Universidade de São Paulo.

8.
Brandão, M M; FRANCO, T. T.; BASSO, T. O.; LENCZAK, J. L.; CAVALETT, O.. Participação em banca de Michelle da cunha Abreu Xavier. Produção de Lipídios a partir do Hidrolisado Hemicelulósico do Bagaço de Cana e Engenharia Metabólia da Levedura Lipomyces starkeyi. 2016. Tese (Doutorado em Engenharia Química) - Universidade Estadual de Campinas.

9.
Brandão, M M; MOURA, D. S.; Silva-Filho, M. C.; Silva, F. H.. Participação em banca de Larissa Spoladore. Componentes genéticos que afetam a via de direcionamento do proteínas organelares em Arabidopsis thaliana. 2016. Tese (Doutorado em Biologia Celular e Molecular) - Universidade de São Paulo.

10.
SOUZA, A. P.; Brandão, M M; MARGARIDO, G. R. A.; RIBEIRO, R. V.; MALUF, M. P.. Participação em banca de André Ricardo Oliveira Conson. Mapeamento Genético-molecular e análise de QTLs associados ao crescimento em Hevea brasiliensis utilizando marcadores microssatélites e SNPs. 2016. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

11.
Brandão, M. M.; LEMKE, N.; MARUYAMA, S. R. C.; FERREIRA, C. P.; MAGRO, A. J.. Participação em banca de Esther Camilo dos Reis. Predição de Fenótipos de E. coli através de redes biológicas e aprendizado de máquina. 2015. Tese (Doutorado em Ciencias Biologicas (Genetica)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

12.
SOUZA, G. M.; Brandão, M. M.; DIGIAMPIETRI, L. A.; ARAUJO, L. V.; PACHON, D. M. R.. Participação em banca de Milton Yutaka Nishiyama Junior. Desenvolvimento da plataforma CaneRegNet para anotação funcional e análises do transcriptoma de cana de açúcar. 2015. Tese (Doutorado em Interunidades em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

13.
VIEIRA, M. L. C.; BRANDAO, M. M.; Inomoto, M M; Camargo, L E A; Grossi-de-Sá, M F. Participação em banca de Luciane Santini. Análise, via RNA-seq, do transcriptoma do feijoeiro e identificação de genes expressos em resposta à infecção pelo nematoide das galhas. 2014. Tese (Doutorado em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas)) - Universidade de São Paulo.

14.
BRANDAO, M. M.; PEREIRA, G.A. G.; Mazzafera, P.; YAMAGISHI, M. E. B.; Marraccini, P.. Participação em banca de Ramon de Oliveira Vidal. Avaliação in silico do transcriptoma do café: identificação de SNPs e inferência de mecanismos de regulação da expressão gênica. 2010. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Qualificações de Doutorado
1.
FRANCO, T. T.; DAMASIO, A. R. L.; Brandão, M. M.. Participação em banca de Fernando Cesar Barbosa. Otimização da produção de celo-oligossacarídeos a partir da hidrólise enzimática da palha da cana-de-açúcar via expressão heteróloga de enzimas celulolíticas e oxidativas. 2018. Exame de qualificação (Doutorando em Interunidades em Bioenergia) - Universidade Estadual de Campinas.

2.
Brandão, M. M.; RIBEIRO, R. V.; VIEIRA, S. A.. Participação em banca de Mariana Vargas Cruz. (Pré Banca) Adaptações locais de uma espécie de mangue Neotropical reveladas por Ecofisiologia e Transcriptômica Comparativa e Scans Genômicos para Seleção Natural. 2017. Exame de qualificação (Doutorando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

3.
SANTOS, R. V.; Brandão, M. M.; PERSINOTI, G. F.. Participação em banca de Lucas Miguel de carvalho. Desenvolvimento de métodos de análise e integração de dados de ômicas aplicados à construção de leveduras insdustriais para produção de bioetanol de segunda geração. 2017. Exame de qualificação (Doutorando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

4.
Brandão, M. M.; MATIOLLI, C. C.; VALENTE, G. T.. Participação em banca de Lucas Eduardo Costa Canesin. Evolução da transcrição pervasiva em populações de Arabidopsis thaliana. 2015. Exame de qualificação (Doutorando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

5.
BRANDAO, M. M.. Participação em banca de Ártemis Socorro do Nascimento Rodrigues. Caracterização Molecular do fenótipo RhD fraco na população brasileira. 2004. Exame de qualificação (Doutorando em Clínica Médica) - Universidade Estadual de Campinas.

Qualificações de Mestrado
1.
BRANDAO, M. M.; JOSE, J.; SANTOS, L. V.. Participação em banca de Mirta Natália Coutouné. Genômica comparativa de Leveduras Industriais para produção de Etanol. 2018. Exame de qualificação (Mestrando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

2.
Brandão, M. M.; DAMASIO, A. R. L.; MURAKAMI, L. M. Z.. Participação em banca de Deborah Aires Almeira. Análise transcricional de Trichoderma harzianum CBMAI-0179 durante a degradação de celulose e glicose. 2018. Exame de qualificação (Mestrando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

3.
Brandão, M. M.; KITAJIMA, J. P. F. W.; PERSINOTI, G. F.. Participação em banca de Márcio Luiz Magrini. Identificação de vias metabólicas indutoras de crescimento vegetal em bactérias isoladas do microbioma da cana-de-açũcar. 2018. Exame de qualificação (Mestrando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

4.
BRANDÃO, M.M.; LABORDA, P. R.; MARGARIDO, G. R. A.. Participação em banca de Thamiris Gatti Deo. Estudo genéticos-moleculares em Panicum maximum: mapeamento genético com marcadores SNPs baseados em genotipagem por sequenciamento. 2018. Exame de qualificação (Mestrando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

5.
Brandão, M M; AZEREDO-SPIN, A. M. L.; FREITAS, A. V. L.. Participação em banca de Rogério Martins Gonçalves. Diversidade Genética e estrutura populacional da praga Helicoverpa armigera recentemente introduzida na América do Suil. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

6.
Brandão, M M; MARTINEZ, C. E. A.; DESTEFANO, S. A. L.. Participação em banca de Isadora Vitti Vieira Borge. Aplicação de multilocus sequence analysis (MLSA) para identificação de espécies de Chromobacterium spp.. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

7.
Brandão, M M; SOUZA, A. P.; CANCADO, G. M. A.. Participação em banca de Camila Fornezari. Caracterização genético-molecular em Panicum maximum: Identificação de marcadores moleculares SNPs e mapeamento genético. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

8.
Brandão, M. M.; VINCENTZ, M. G. A.; MALUF, M. P.. Participação em banca de Stephanie Karenina Bajay. Análise do transcriptoma de Rhizophora mangle: adaptações de árvores extremófilas em um cenário de mudanças climáticas. 2015. Exame de qualificação (Mestrando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

9.
YAMAGISHI, M. E. B.; Brandão, M. M.; MARGARIDO, G. R. A.. Participação em banca de Rodrigo Marcondes Quintas dos Santos. Desenvolvimento de método para haplotipagem de genes a partir de dados de RNA-SEQ de nova geração e aplicação em cana-de-açúcar. 2015. Exame de qualificação (Mestrando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

10.
SANTOS, R. V.; Brandão, M M; REIS, L. L. B.. Participação em banca de Camila Fornezari. Caracterização genético-molecular em Panicum maximum: identificação de marcadores moleculares SNPs e mapeamento genético da espécie. 2015. Exame de qualificação (Mestrando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

11.
Brandão, M M; Carvalho, B S; SECOLIN, R.. Participação em banca de Moisés Alves Ferreira Filho. Rastreamento de Variantes genéticas em neoplasias mielóides por sequenciamento completo do exoma. 2015. Exame de qualificação (Mestrando em Fisiopatologia Médica) - Universidade Estadual de Campinas.

12.
Brandão, M M; BLOTTA, M. H. S.; FERTRIN, K. Y.. Participação em banca de Bidossessi Wilfried Hounkpe. Avaliação da expressão da PAD4 e de genes induzidos pelo heme livre em pacientes com anemia falciforme. 2015.

13.
SANTOS, R. V.; BRANDAO, M. M.; Neto, A Z. Participação em banca de Felipe Alonso Martins. Aplicação de ferramentas de Biologia de Sistemasem levedura industrial para produção de bioetanol de segunda geração. 2014. Exame de qualificação (Mestrando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

14.
Silva, F R; BRANDAO, M. M.; Carvalho, B S. Participação em banca de Luís Augusto Eijy Nagai. Identificação de genes relacionados à qualidade da carne de bovinos das raças Angus e Nelore por análise de expressão diferencial. 2014. Exame de qualificação (Mestrando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

15.
BRANDAO, M. M.; PEREIRA, G.A. G.; SANTOS, R. V.. Participação em banca de Osvaldo Reis Junior. Identificação e padrões de expressão de transcritos derivados de RNA-seq: caracterização molecular do fungo Moniliophtora perniciosa, causador da vassoura de bruxa do cacaueiro. 2013. Exame de qualificação (Mestrando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

16.
BRANDAO, M. M.; YAMAGISHI, M. E. B.; HERAI, R. H.. Participação em banca de Natália Faraj Murad. Natália. 2012. Exame de qualificação (Mestrando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Trabalhos de conclusão de curso de graduação
1.
BRANDAO, M. M.; Moraes, S; Toledo, M.D.. Participação em banca de Felipe Fedel Silva.Evolução molecular das famílias proteícas MASK e FORMINA. 2007. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Pontifícia Universidade Católica de São Paulo.



Participação em bancas de comissões julgadoras
Outras participações
1.
BRANDAO, M. M.. Membro suplente da Comissão Examinadora de qualificação para obtenção de título de Doutorado da aluna Ártemis Socorro do Nascimento Rodrigues. 2004. Universidade Estadual de Campinas.



Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
IV Workshop de Biotecnologia.Big Data em transcritptoma. 2018. (Simpósio).

2.
X-meeting 2018. IT. 2018. (Congresso).

3.
X-meeting 2017. BioIT and Bioinformatics. 2017. (Congresso).

4.
2016 International Congress of Entomology. Gene expression plasticity response to alternative host plants in the speciation process of Spodoptera frugiperda strains. 2016. (Congresso).

5.
2016 International Congress of Entomology. Gene regulatory networks applied to transcriptome data to detect differences in adaptation to herbivory of two Spodoptera frugiperda strains focusing on peptidases. 2016. (Congresso).

6.
2016 International Congress of Entomology. The spruce budworm transcriptome and its use in identifying the molecular and endocrine correlates of early instar diapause. 2016. (Congresso).

7.
Congresso Brasileiro de Hematologia, Hemoterapia e Terapia Celular. SCREENING OF GENETIC VARIANTS IN FAMILIAL CASES OF MYELOID NEOPLASMS BY EXOME SEQUENCING. 2016. (Congresso).

8.
X-Meeting + BSB 2015. DeNSAS - De Novo Sequence Annotation System. 2015. (Congresso).

9.
third International Society for Computational Biology Latin America X-Meeting on Bioinformatics with BSB and SoiBio. DNA sequences do have a mathematical structure! Ancient DNA sequence can be revealed by error-Correcting codes. 2014. (Congresso).

10.
IV Encuentro de Lepdoptera Neotropicales.The proteinase flare: How Spodoptera frugiperda dodges from plant herbivore protective barrier. 2012. (Encontro).

11.
7th International Conference of th Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology - X-Meeting. Transcriptomic profile of the Spodoptera frugiperda midgut. 2011. (Congresso).

12.
Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Biologia Molecular e Bioquímica. Structural and Phylogenetic Analysis of Spodoptera frugiperda Chymotrypsins Involved on Insect Chemical Protective Barrier Against Plant Proteinase Inhibitors (PIs). 2011. (Congresso).

13.
1st International Workshop on Bioinformatics.The dual-targeted proteins evolutionary pathways. 2010. (Encontro).

14.
2ª Jornada Acadêmica.Uma breve história da Bioinformática. 2010. (Simpósio).

15.
26º Encontro sobre temas de genética e melhoramento. 2009. (Encontro).

16.
5th International Conference of the AB3C. ATPIN: ARABIDOPSIS THALIANA PROTEIN INTERACTION NETWORK. 2009. (Congresso).

17.
ISMB. Horizontal gene transfer evidences on a dual target protein, the tRNA synthetase family.. 2008. (Congresso).

18.
XIV Seminário de Iniciação Científica.Informática e comunicação em pesquisa. 2008. (Seminário).

19.
X-meeting. 2008. (Congresso).

20.
3rd International conference of the AB3C. Molecular evolution on MASK and Formins proteins. 2007. (Congresso).

21.
Congresso Brasileiro de Hematologia e Hemoterapia. Impaired. 2007. (Congresso).

22.
Semana de Biologia marinha e gerenciamento costeiro.Biologia Computacional para Biólogos. 2007. (Simpósio).

23.
14th annual international conference on Intelligent systems for molecular biology. ISMB2006. 2006. (Congresso).

24.
Encontro dos usuários de PCR em tempo real. 2006. (Encontro).

25.
Genômica e Biologia Estrutural para aplicações Biotecnológicas e Médicas.Genômica e Biologia Estrutural para aplicações Biotecnológicas e Médicas. 2006. (Simpósio).

26.
IV Semana da Informática Biomédica.Bioinformática: Da Predição à Realidade. 2006. (Encontro).

27.
Semana da Biologia da UNESP de Rio Claro.A necessidade da Bioinformática para biólogos experimentais e a necessidade de biólogos experimentais para a bioinformática. 2006. (Encontro).

28.
X-meeting. X-Meeting, 1° Conferencia internacional da Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional. 2005. (Congresso).

29.
Fórum permanente de conhecimento e tecnologia da informação. 2004. (Encontro).

30.
25º Congresso brasileiro de Hematologia e Hemoterapia. Deformabilidade de células AS estocadas medida por pinça óptica. 2002. (Congresso).

31.
6TH ANNUAL MEETING OF THE EUROPEAN HAEMATOLOGY ASSOCIATION. Impaired elasticity of red blood cells with different membrane protein defects measured by optical tweezers technique. 2001. (Congresso).

32.
ANNUAL MEETING OF THE AMERICAN SOCIETY OF HEMATOLOGY. Reduction of erythrocyte deformability in iron deficiency measured by optical tweezers. 2001. (Congresso).

33.
41TH ANNUAL MEETING OF THE AMERICAN SOCIETY OF HEMATOLOGY. Differences in mechanical properties of Hbs Cells measured by optical tweezers technique. 1999. (Congresso).

34.
4TH ANNUAL MEETING OF THE EUROPEAN HAEMATOLOGY ASSOCIATION. Expression of inducible nitric oxide synthase (inos) is increased in acute myeloid leukaemia. 1999. (Congresso).

35.
FESBE. Relação da expressão de RAS e formação de NO em linhagens leucêmicas. 1998. (Congresso).

36.
XII Colóquio de Incentivo à Pesquisa.Comparação das estruturas tridimensionais homólogas entre aldolases de Drosophila melanogaster e Homo sapiens. 1995. (Encontro).


Organização de eventos, congressos, exposições e feiras
1.
Franco, G R ; DURHAM, A. M. ; LEMKE, N. ; PASSETTI, F. ; Brandão, M. M. ; BITAR, M. ; SCHERER, N. ; GRYNBERG, P. . X-meeting. 2016. (Congresso).

2.
Brandão, M. M.. 2° Workshop Interno do CBMEG. 2016. (Outro).

3.
Brandão, M M; Franco, G R ; DURHAM, A. M. ; LEMKE, N. ; GRYNBERG, P. ; PASSETTI, F. ; BITAR, M. ; SCHERER, N. . X-meeting. 2015. (Congresso).

4.
VITORELLO, C. B. M. ; PINHEIRO, J. B. ; VIEIRA, M. L. C. ; BANDEL, G. ; Varani, A. M. ; BRANDAO, M. M. . 28º Encontro Sobre temas em Genética e Melhoramento. 2011. (Outro).

5.
BRANDAO, M. M.. 3ºinternational conference of the AB3C. 2007. (Congresso).



Orientações



Orientações e supervisões em andamento
Tese de doutorado
1.
Natália Faraj Murad. ?REDES DE REGULAÇÃO GÊNICA PARA IDENTIFICAR ADAPTAÇÕES À HERBIVORIA EM DUAS RAÇAS DE Spodoptera frugiperda?. Início: 2015. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Orientador).


Orientações e supervisões concluídas
Dissertação de mestrado
1.
Stephanie Karenina Bajay. Análise do transcriptoma de Rhizophora mangle: adaptações de árvores extremófilas em um cenário de mudanças climáticas. 2017. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Coorientador: Marcelo Mendes Brandao.

Tese de doutorado
1.
Natalia Faraj Murad. Redes de Regulação gênica para identificação de adaptações de duas raças de Spodoptera frugiperda a diferentes dietas. 2018. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Marcelo Mendes Brandao.

Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização
1.
Felipe Fedel Silva. Análise filogenética de proteínas MASK e forminas humanas. 2007. Monografia. (Aperfeiçoamento/Especialização em Ciências Biológicas) - Pontifícia Universidade Católica de São Paulo. Orientador: Marcelo Mendes Brandao.

Trabalho de conclusão de curso de graduação
1.
Felipe Fedel Silva. Evolução molecular das famílias protéicas MASK e FORMINA. 2007. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciências Biológicas) - Pontifícia Universidade Católica de São Paulo. Orientador: Marcelo Mendes Brandao.

Iniciação científica
1.
Bruno Gazeta Felix Rosa. Evolução das serino peptidases dentro da ordem Lepidoptera. 2017. Iniciação Científica. (Graduando em Ensino Médio) - Escola Estadual ADONIRAM BARBOSA, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Marcelo Mendes Brandao.

2.
Franciélle Muniz Duarte. EVOLUÇÃO DAS SERINO PEPTIDASES DENTRO DA ORDEM DAS LEPDOPTERAS. 2017. Iniciação Científica. (Graduando em Ensino Médio) - Escola Estadual São Judas Tadeu, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Marcelo Mendes Brandao.

3.
Lucas Gabriel Poloni. Análise por Biologia Computacional do conteúdo de miRNAs e seus alvos em ​Spodoptera frugiperda. 2017. Iniciação Científica. (Graduando em Ensino Médio) - Escola Estadual Dom João Nery, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Marcelo Mendes Brandao.

4.
Victor Carrozza Barcellini. Correlação entre eventos de transferência horizontal de genes e a filogenia de papilionidae. 2007. Iniciação Científica. (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista. Orientador: Marcelo Mendes Brandao.



Educação e Popularização de C & T



Apresentações de Trabalho
1.
BRANDAO, M. M.. Agricultural insect pests studies in the next generation sequencing era: Sequence annotation and peptidase database. 2015. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).


Entrevistas, mesas redondas, programas e comentários na mídia
1.
Brandão, M. M.; MARGARIDO, G. ; KUROSHU, R. . Aplicações e Desafios da Bioinformática. 2017. (Programa de rádio ou TV/Mesa redonda).


Redes sociais, websites e blogs
1.
Brandão, M M. The Bioinfo Guy. 2014; Tema: Divulgação de sistemas de pesquisa e análise utilizando ferramentas de biologia computacional. (Site).



Outras informações relevantes


Responsável pelo grupo de pesquisa em Bioinformática do Laboratório de Biologia Molecular de Plantas da ESALQ / USP



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