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Univ Federal do Rio de Janeiro |
Rodrigo Weber dos Santos possui graduação em Engenharia Eletrica Eletronica pela Universidade Federal do Rio de Janeiro (1996), mestrado em Engenharia de Sistemas e Computação pela Universidade Federal do Rio de Janeiro (1998) e doutorado em Matemática pela Universidade Federal do Rio de Janeiro (2002). Atualmente é professor adjunto da Universidade Federal de Juiz de Fora. Tem experiência na área Multidisciplinar de Modelagem Matemática e Computacional, com ênfase em Modelagem de Sistemas Biológicos, atuando principalmente nos seguintes temas: modelagem do coração, eletrofisiologia cardíaca, simulação numérica, equações diferenciais parciais e computação de alto desempenho.
Última
atualização do currículo em 27/08/2011
Endereço para acessar este CV: http://lattes.cnpq.br/6653435398940498 |
Dados pessoais
| Nome | Rodrigo Weber dos Santos |
| Nome em citações bibliográficas | SANTOS, Rodrigo Weber dos;Santos, Rodrigo Weber dos;dos Santos, Rodrigo Weber;dos Santos, R. W.;Weber dos Santos, R.;Weber dos Santos, Rodrigo;Santos, R. W. dos |
| Sexo | Masculino |
| Endereço profissional | Universidade Federal de Juiz de Fora, Instituto de Ciências Exatas, Departamento de Ciência da Computação. Campus Universitário de Martelos Martelos 36036-330 - Juiz de Fora, MG - Brasil Telefone: (32) 32293311 URL da Homepage: http://www.mestradomodelagem.ufjf.br |
Formação acadêmica/Titulação
| 2002 - 2004 | Pós-Doutorado
. Physikalisch-Technische Bundesanstalt, P.T.B., Alemanha. Bolsista do(a): Bundesministerium Für Bildung Und Forschung . Grande área: Ciências Biológicas / Área: Fisiologia / Subárea: Fisiologia de Órgãos e Sistemas / Especialidade: Fisiologia Cardiovascular. Grande área: Engenharias / Área: Engenharia Biomédica / Subárea: Bioengenharia / Especialidade: Modelagem de Sistemas Biológicos. Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Sistemas de Computação / Especialidade: Computação Paralela. |
| 1997 - 1998 | Mestrado em Engenharia de Sistemas e Computação
.
Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil. Título: Software de Comunicação para Sistemas de Memória Compartilhada Distribuída, Ano de Obtenção: 1998. Orientador: Claudio Luis de Amorim. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior ,CAPES ,Brasil . Palavras-chave: Software DSM; Computação de alto desempenho; Redes de computadores; Software de comunicação; Computação paralela. Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Sistemas de Computação / Especialidade: Arquitetura de Sistemas de Computação. Setores de atividade: Desenvolvimento de Programas (Software). |
| 1991 - 1996 | Graduação em Engenharia Eletrica Eletronica
.
Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil. Título: Implementação de um Sistema de Validação em Tempo Real no Processador Digital de Sinais ADSP21020. Orientador: Jose Manuel de Seixas. Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico ,CNPq ,Brasil . |
Atuação profissional
| Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil. |
| Vínculo institucional |
| 2009 - Atual | Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Colaborador |
| Atividades |
| 2009 - Atual | Atividades de Participação em Projeto, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fisiologia e Biofísica. |
|
Projetos de pesquisa Estratégias Experimentais Inovadoras Na Busca De Alvos Moleculares Para O Tratamento De Cardiopatias Severas |
| Universidade Federal de Juiz de Fora, UFJF, Brasil. |
| Vínculo institucional |
| 2004 - Atual | Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Adjunto, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva. |
| Atividades |
| 2009 - Atual | Atividades de Participação em Projeto, Instituto de Ciências Exatas, Departamento de Ciência da Computação. |
|
Projetos de pesquisa Ferramentas Computacionais Aplicadas a Modelos Complexos da Fisiologia de Células Cardíacas |
| 03/2008 - Atual | Atividades de Participação em Projeto, Instituto de Ciências Exatas, Departamento de Ciência da Computação. |
|
Projetos de pesquisa Uma Ferramenta para o Cálculo Contínuo da Fração de Ejeção Cardíaca em UTI |
| 2008 - Atual | Atividades de Participação em Projeto, Instituto de Ciências Exatas, Departamento de Ciência da Computação. |
|
Projetos de pesquisa Métodos Numéricos e Computacionais Aplicados à Modelagem da Eletrofisiologia Cardíaca |
| 08/2007 - Atual | Ensino, Ciencia da Computacao, Nível: Graduação. |
| Disciplinas ministradas Arquitetura de Computadores |
| 08/2007 - Atual | Atividades de Participação em Projeto, Instituto de Ciências Exatas, Departamento de Ciência da Computação. |
|
Projetos de pesquisa Modelagem Matemática e Simulação de Reservatórios de Petróleo |
| 07/2007 - Atual | Ensino, Multidisciplinar Em Modelagem Computacional, Nível: Pós-Graduação. |
| Disciplinas ministradas Computação Paralela |
| 11/2006 - Atual | Atividades de Participação em Projeto, Instituto de Ciências Exatas, Departamento de Ciência da Computação. |
|
Projetos de pesquisa Modelagem computacional das alterações eletrofisiológicas em miocárdio ventricular de ratos durante a doença de chagas |
| 06/2006 - Atual | Conselhos, Comissões e Consultoria, Reitoria, . |
|
Cargo ou função
Membro do Comitê Assessor ao Conselho Setorial de Pós-Graduação e Pesquisa. Área: Ciências Exatas e Engenharias. |
| 2/2006 - Atual | Direção e administração, Instituto de Ciências Exatas, Departamento de Ciência da Computação. |
| Cargo ou função Vice-Coordenação do Mestrado Multidisciplinar em Modelagem Computacional. |
| 11/2004 - Atual | Atividades de Participação em Projeto, Instituto de Ciências Exatas, Departamento de Ciência da Computação. |
|
Projetos de pesquisa PARAFISIO. Computação Paralela, Metalinguagem XML e Servidor Web: Soluções para a neurofisiologia e a eletro-fisiologia cardíaca computacionais. Métodos computacionais para a modelagem da eletrofisiologia cardíaca |
| 7/2004 - Atual | Pesquisa e desenvolvimento , Instituto de Ciências Exatas, Departamento de Ciência da Computação. |
|
Linhas de pesquisa Modelos computacionais da eletrofisiologia cardíaca Computação paralela |
| 3/2007 - 07/2007 | Ensino, Ciencia da Computacao, Nível: Graduação. |
| Disciplinas ministradas Arquitetura de Computadores |
| 03/2007 - 06/2007 | Ensino, Multidisciplinar Em Modelagem Computacional, Nível: Pós-Graduação. |
| Disciplinas ministradas Introdução à Modelagem Matemática |
| 09/2006 - 12/2006 | Ensino, Ciencia da Computacao, Nível: Graduação. |
| Disciplinas ministradas Tópicos em Sistemas Distribuídos Arquitetura de Computadores |
| 09/2006 - 11/2006 | Ensino, Multidisciplinar Em Modelagem Computacional, Nível: Pós-Graduação. |
| Disciplinas ministradas Eletrofisiologia Computacional |
| 03/2006 - 09/2006 | Ensino, Ciencia da Computacao, Nível: Graduação. |
| Disciplinas ministradas Redes de Computadores Seminários em Computação Dsitribuída |
| 06/2006 - 08/2006 | Ensino, Multidisciplinar Em Modelagem Computacional, Nível: Pós-Graduação. |
| Disciplinas ministradas Computação Distribuída |
| 8/2005 - 2/2006 | Ensino, Ciencia da Computacao, Nível: Graduação. |
| Disciplinas ministradas Arquitetura de Computadores Redes de Computadores Tópicos especiais em redes de computadores |
| 3/2005 - 8/2005 | Ensino, Ciencia da Computacao, Nível: Graduação. |
| Disciplinas ministradas Arquitetura de computadores Laboratório de organizaçao de computadores Tópicos especiais em redes - Linux Clusters |
| 8/2004 - 12/2004 | Ensino, Ciencia da Computacao, Nível: Graduação. |
| Disciplinas ministradas Redes de Computadores Sistemas Operacionais Seminários em Computação - Introdução à computação gráfica |
| Physikalisch-Technische Bundesanstalt, P.T.B., Alemanha. |
| Vínculo institucional |
| 2002 - 2004 | Vínculo: Bolsista Pos-doutorado, Enquadramento Funcional: Pesquisador, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva. |
| Atividades |
| 9/2002 - 6/2004 | Atividades de Participação em Projeto, Medizinphysik, Biosignale. |
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Projetos de pesquisa Modelagem numérica da eletrofisiologia cardíaca: Magnetocardiografia aplicada à Miocardite viral. Áreas e palavras-chave: Biomagnetismo; Eletrofisiologia cardíaca; Engenharia Biomédica; Doenças do Miocardium; Computação Paralela; Métodos Numéricos |
| Associação Instituto Nacional de Matemática Pura e Aplicada, IMPA, Brasil. |
| Vínculo institucional |
| 2001 - 2002 | Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Assitente de pesquisa, Carga horária: 20 |
| Atividades |
| 7/2001 - 7/2002 | Pesquisa e desenvolvimento , Impa, Laboratório de Dinâmica dos Fluidos. |
|
Linhas de pesquisa Modelagem de Magnetocardiografia e suas aplicações. Áreas e palavras-chave: Modelagem do coração; Biomagnetismo; Equações diferenciais parciais; Arritmia cardíaca; Computação paralela |
| 7/2001 - 7/2002 | Atividades de Participação em Projeto, Impa, Laboratório de Dinâmica dos Fluidos. |
|
Projetos de pesquisa Melhoria de Recuperação de Petróleo em Escoamento Trifásico Uni e Bidimensional. Áreas e palavras-chave: Equações diferenciais parciais; Métodos numéricos; Escoamento de fluidos multifásicos; Meios porosos |
| European Organization for Nuclear Research, CERN, Suiça. |
| Vínculo institucional |
| 1995 - 1996 | Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Pesquisador, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva. |
| Atividades |
| 8/1995 - 7/1996 | Pesquisa e desenvolvimento , Atlas Detector, Second Level Trigger Laboratory. |
|
Linhas de pesquisa O sistema de trigger de segundo nível para o detetor ATLAS. Áreas e palavras-chave: Processamento de sinais digitais; Redes neuronais; Computação paralela; Física de partículas |
| Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil. |
| Vínculo institucional |
| 1999 - 2002 | Vínculo: Bolsista doutorado, Enquadramento Funcional: Assistente de pesquisa, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva. |
| Outras informações | Departamento de matemática aplicada, Instituto de Matemática |
| Vínculo institucional |
| 1997 - 1998 | Vínculo: Bolsista mestrado, Enquadramento Funcional: Assistente de pesquisa, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva. |
| Outras informações | Laboratório de Computação Paralela - COPPE / Programa de Engenharia de Sistemas e Computação |
| Vínculo institucional |
| 1993 - 1995 | Vínculo: Bolsista iniciação científica, Enquadramento Funcional: Asistente de pesquisa, Carga horária: 20 |
| Outras informações | Departamento de Eletrônica, Escola de Engenharia |
| Vínculo institucional |
| 1991 - 1992 | Vínculo: Bolsista iniciação científica, Enquadramento Funcional: Assistente de pesquisa, Carga horária: 20 |
| Outras informações | Departamento de matemática aplicada, Instituto de Matemática |
| Atividades |
| 1/1999 - 9/2002 | Pesquisa e desenvolvimento , Instituto de Matemática, Departamento de Matemática Aplicada. |
|
Linhas de pesquisa Modelagem matemática da eletrofisiologia cardíaca. Áreas e palavras-chave: Equações diferenciais parciais; Métodos numéricos; Eletrofisiologia cardíaca; Computação paralela |
| 7/2000 - 7/2001 | Atividades de Participação em Projeto, Instituto de Matemática, Departamento de Matemática Aplicada. |
|
Projetos de pesquisa Métodos iterativos eficientes para múltiplos lados direitos. Áreas e palavras-chave: Álgebra linear; Equações diferenciais parciais; Métodos numéricos; Simulação de reservatórios de petróleo |
| 1/1997 - 12/1998 | Pesquisa e desenvolvimento , Coppe, Programa de Engenharia de Sistemas e Computação. |
|
Linhas de pesquisa Software de Comunicação para Sistemas de Memória Compartilhada Distribuída. Áreas e palavras-chave: Computação paralela; Redes de computadores; Software DSM |
| 1/1997 - 12/1998 | Atividades de Participação em Projeto, Coppe, Programa de Engenharia de Sistemas e Computação. |
|
Projetos de pesquisa O computador paralelo NCP2. Áreas e palavras-chave: Harware Digital; Lógica programável; Software DSM; Computação paralela |
| 7/1991 - 12/1992 | Pesquisa e desenvolvimento , Instituto de Matemática, Departamento de Matemática Aplicada. |
|
Linhas de pesquisa Estimativa de parâmetros para a equação de difusão. Áreas e palavras-chave: Matemática aplicada; Equações diferenciais parciais; Problema inverso; Métodos numéricos |
Linhas de Pesquisa
| 1. | Modelos computacionais da eletrofisiologia cardíaca |
| 2. | Computação paralela |
| 3. | Estimativa de parâmetros para a equação de difusão. Áreas e palavras-chave: Matemática aplicada; Equações diferenciais parciais; Problema inverso; Métodos numéricos |
| 4. | Implementação do Sistema Neuronal de Segundo Nível de Trigger em Processadores de Sinais Digitais. Áreas e palavras-chave: Processamento de sinais digitais; Redes neuronais; Eletrônica; Física de partículas |
| 5. | Software de Comunicação para Sistemas de Memória Compartilhada Distribuída. Áreas e palavras-chave: Computação paralela; Redes de computadores; Software DSM |
| 6. | Modelagem matemática da eletrofisiologia cardíaca. Áreas e palavras-chave: Equações diferenciais parciais; Métodos numéricos; Eletrofisiologia cardíaca; Computação paralela |
| 7. | Modelagem de Magnetocardiografia e suas aplicações. Áreas e palavras-chave: Modelagem do coração; Biomagnetismo; Equações diferenciais parciais; Arritmia cardíaca; Computação paralela |
| 8. | O sistema de trigger de segundo nível para o detetor ATLAS. Áreas e palavras-chave: Processamento de sinais digitais; Redes neuronais; Computação paralela; Física de partículas |
| 9. | Modelagem computacional de Miocardite viral e Magnetocardiografia. Áreas e palavras-chave: Biomagnetismo; Eletrofisiologia cardíaca; Engenharia Biomédica; Doenças do Miocardium; Computação Paralela; Métodos Numéricos; Equações diferenciais parciais |
Projetos de Pesquisa
| 2009 - Atual | Ferramentas Computacionais Aplicadas a Modelos Complexos da Fisiologia de Células Cardíacas |
| Descrição: O Laboratório de Fisiologia Computacional e de Alto Desempenho (FISIOCOMP) do Departamento de Ciência da Computação da Universidade Federal de Juiz de Fora (UFJF) tem desenvolvido pesquisa de ponta na área de simulação computacional da eletrofisiologia cardíaca. Apesar do pequeno número de pesquisadores e das grandes dificuldades inerentes a esta área multidisciplinar o grupo tem contribuído significativamente para o desenvolvimento da área, como indicam as diversas publicações nacionais e internacionais dos pesquisadores. O objetivo deste projeto multidisciplinar é fortalecer este grupo através da aceleração da capacitação do mesmo em novas tecnologias computacionais e da aquisição de novos equipamentos que permitam o desenvolvimento de um ambiente computacional para: aumentar a produtividade do grupo; e incentivar o uso desta tecnologia de simulação computacional no Brasil, dentre os diversos centros de pesquisa que trabalham nas áreas correlatas, visando o aprimoramento e a aceleração dos diversos processos envolvidos no desenvolvimento de novos medicamentos e equipamentos médicos destinados ao tratamento/diagnóstico de enfermidades que acometem grande parte da população brasileira, como as doenças cardio-vasculares. Para alcançar estes objetivos, o grupo juntará esforços para desenvolver um novo modelo computacional que integra os aspectos da eletrofisiologia, contração celular e metabolismo energético. Este modelo possibilitará de forma inédita o estudo de situações de grande interesse, como é o caso da isquemia cardíaca. Além disto, diversas ferramentas computacionais serão desenvolvidas visando a criação e validação deste novo modelo.
. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação ( 3) / Mestrado acadêmico ( 3) . Integrantes: Rodrigo Weber dos Santos - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais - Auxílio financeiro.. |
| 2009 - Atual | Estratégias Experimentais Inovadoras Na Busca De Alvos Moleculares Para O Tratamento De Cardiopatias Severas |
| Descrição: PRONEX FAPEMIG
Estratégias Experimentais e Computacionais Inovadoras serão utilizdas na busca de alvos moleculares para o tratamento de cardiopatias. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Jorge Luiz Pesquero - Coordenador / Rodrigo Weber dos Santos - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais - Auxílio financeiro.. |
| 2008 - 2009 | Uma Ferramenta para o Cálculo Contínuo da Fração de Ejeção Cardíaca em UTI |
| Descrição: A medida denominada fração de ejeção do coração é um importante parâmetro para a caracterização do funcionamento cardíaco. Atualmente, em pacientes de unidade de terapia intensiva, esta caracterização é realizada através de exames periódicos de ultrasonografia computadorizada. Esse procedimento, além de custoso, tem se mostrado ineficiente, devido as variações bruscas no comportamento do coração.
No momento, do nosso conhecimento, não existe um método alternativo para a medição contínua deste importante marcador fisiológico. Uma ferramenta que tem ganhado espaço no cenário de diagnósticos não-invasivos é a Tomografia por Impedância Elétrica. Neste projeto, propomos um software que tem como finalidade o cálculo contínuo da fração de ejeção com base em medidas de impedância elétrica.. Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico ( 1) . Integrantes: Barra, Luis Paulo - Integrante / Rodrigo Weber dos Santos - Coordenador. Financiador(es): Secretaria de Estado de Ciência Tecnologia e Ensino Superior de MG - Auxílio financeiro.. |
| 2008 - Atual | Métodos Numéricos e Computacionais Aplicados à Modelagem da Eletrofisiologia Cardíaca |
| Descrição: Este projeto multidisciplinar envolve o desenvolvimento de modelos computacionais e matemáticos que descrevem a eletrofisiologia de células cardíacas. Os modelos a serem desenvolvidos tem como objetivo reproduzir, in silico, as alterações fisiológicas associadas à doença de Chagas no coração. Esses modelos computacionais visam o aprimoramento da compreensão desta doença e a aceleração dos diversos processos envolvidos no desenvolvimento de novos medicamentos e equipamentos médicos destinados ao tratamento/diagnóstico da doença de Chagas. Para o desenvolvimento dos modelos computacionais técnicas avançadas de matemática aplicada e de computação paralela serão empregadas. Os métodos e modelos desenvolvidos neste projeto serão disponibilizados em um Portal Web. A disponibilização de uma interface amigável via Web para os modelos computacionais, assim como a melhoria do desempenho dos simuladores, facilitará e incentivará o uso da técnica de modelagem computacional por outros centros de pesquisa das áreas correlatas. Entendemos que a realização desse projeto está na fronteira do conhecimento científico da área e é um passo significativo na consolidação de uma tecnologia que hoje é detida por grupos internacionais e contribuirá para dar soluções locais para problemas que afetam particularmente comunidades com o nosso perfil geográfico e econômico.
. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação ( 2) / Mestrado acadêmico ( 1) . Integrantes: Rodrigo Weber dos Santos - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais - Auxílio financeiro.. |
| 2007 - Atual | Modelagem Matemática e Simulação de Reservatórios de Petróleo |
| Descrição: O processo de ajuste histórico para a Simulação de Reservatórios e o benefício decorrente de uma maior automação deste processo é extremamente importante para o planejamento e pesquisa em prospecção de petróleo.
Trabalhos recentes desenvolveram programas computacionais de ajuste automático de histórico baseado no método de Gauss-Newton, regularizado por TSVD (decomposição em valores singulares truncada). Os resultados obtidos até o momento são encorajadores. O objetivo deste projeto é dar continuidade a este estudo.
Este trabalho compreende diversas etapas. Inicialmente será desenvolvido um simulador de reservatório bifásico bidimensional incompressível. Neste simulador serão implementados opções de cálculo de derivadas. Este simulador servirá de base para o desenvolvimento de um código computacional paralelo eficiente para o ajuste automático de histórico baseado na técnica TSVD (decomposição em valores singulares truncada).. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico ( 2) . Integrantes: Flavio Dickstein - Coordenador / Paulo Goldfeld - Integrante / Rodrigo Weber dos Santos - Integrante. Financiador(es): Agência Nacional do Petróleo - Auxílio financeiro.. |
| 2006 - 2008 | Modelagem computacional das alterações eletrofisiológicas em miocárdio ventricular de ratos durante a doença de chagas |
| Descrição: O objetivo deste projeto é a construção de modelos computacionais que capturem as alterações eletrofisiológicas observadas em experimentos com miocárdio ventricular de ratos chagásicos. Especificamente, serão desenvolvidos modelos adimensionais para a célula do miocárdio ventricular e modelos bidimensionais para a propagação elétrica na parede ventricular esquerda de ratos. Os modelos celulares serão baseado em dados experimentais que caracterizam o potencial de ação, a dinâmica da concentração intracelular de Cálcio e diversas correntes iônicas, como as correntes de potássio IK, as correntes de sódio INa e as correntes de Cálcio, ICaL. Dados de experimentos realizados com corações isolados serão usados para desenvolver modelos da parede ventricular esquerda de ratos infectados.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação ( 2) / Especialização ( 0) / Mestrado acadêmico ( 1) / Mestrado profissionalizante ( 0) / Doutorado ( 0) . Integrantes: Jader dos Santos Cruz - Integrante / Rodrigo Weber dos Santos - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais - Auxílio financeiro.. |
| 2004 - 2007 | PARAFISIO. Computação Paralela, Metalinguagem XML e Servidor Web: Soluções para a neurofisiologia e a eletro-fisiologia cardíaca computacionais. |
| Descrição: Este projeto tem como objetivo o emprego de tecnologias inovadoras para promover o desenvolvimento da área de neurofisiologia e a eletro-fisiologia cardíaca computacionais no Brasil. Técnicas de computação paralela de alto desempenho e a tecnologia de metalinguagem XML serão empregadas para acelerar e aumentar a produtividade do pequeno grupo de pesquisa deste projeto. Um potal Web baseado em técnicas para servidor Web permitirá a divulgação e utilização desta tecnologia de simulação computacional no Brasil, entre os diversos centros de pesquisa que trabalham nas áreas correlatas, visando o aprimoramento e a aceleração dos processos envolvidos no desenvolvimento de novos medicamentos e equipamentos médicos destinados ao tratamento/diagnóstico de enfermidades que acometem grande parte da população brasileira, como a doença de chagas, as arritmias cardíacas e a epilepsia.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação ( 3) / Especialização ( 0) / Mestrado acadêmico ( 0) / Mestrado profissionalizante ( 0) / Doutorado ( 0) . Integrantes: Ciro de Barros Barbosa - Integrante / Antônio-Carlos Guimarães de Almeida - Integrante / Fernando Otaviano Campos - Integrante / Leandro Neumann Ciuffo - Integrante / Rafael Sachetto Oliveira - Integrante / Hewerson Zansávio Teixeira - Integrante / Ronan Mendonça Amorim - Integrante / Rodrigo Weber dos Santos - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.. |
| 2004 - 2007 | Métodos computacionais para a modelagem da eletrofisiologia cardíaca |
| Descrição: O objetivo deste projeto é propor e implementar algoritmos numéricos eficientes para estudar a propagação de ondas elétricas no coração. Este é um problema relevante por várias razões. Em primeiro lugar, pelas aplicações práticas deste estudo. Estes modelos têm sido extensivamente utilizados na área farmacêutica como plataforma de desenvolvimento e teste de novas drogas e na área médica para o aperfeiçoamento de diagnósticos não-invasivos. Do ponto de vista numérico, há enormes desafios para que se possa obter algoritmos capazes de tratar certas situações realistas de interesse.
Um dos membros da equipe desenvolveu e implementou um simulador em elementos finitos tridimensional para arquiteturas paralelas, que resolve simultaneamente a propagação elétrica no coração e no torso humano. Seu desempenho é extremamente satisfatório quando comparado aos simuladores usualmente citados na literatura especializada. No entanto, ainda há um longo caminho até que se possa ter um algoritmo capaz de simular a eletrofisiologia de um coração humano. Pretendemos aperfeiçoar este pacote computacional desenvolvendo:
(i) precondicionadores eficientes para a resolução (via gradientes conjugados) dos sistemas lineares envolvidos. Em particular, métodos de decomposição de domínios para explorar o potencial de arquiteturas paralelas e métodos multigrid algébricos.
(iii) esquemas eficientes para o acoplamento coração-torso. Como a natureza da propagação é bastante distinta nos dois meios, técnicas numéricas distintas para tratá-los são aconselháveis. Iremos implementar um esquema de elementos de contorno na região do torso.
A arquitetura e a implementação dos algoritmos serão desenvolvidas no cluster computacional do laboratório de pesquisa do DCC. Esperamos ao final deste período ter uma ferramenta capaz de simular um espectro maior de situações realistas, ficando assim na fronteira do estado da arte nesta área.
. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação ( 0) / Especialização ( 0) / Mestrado acadêmico ( 0) / Mestrado profissionalizante ( 0) / Doutorado ( 0) . Integrantes: Flavio Dickstein - Coordenador / Rubens de Oliveira - Integrante / Paulo Goldfeld - Integrante / Rodrigo Weber dos Santos - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.. |
| 2002 - 2007 | Modelagem numérica da eletrofisiologia cardíaca: Magnetocardiografia aplicada à Miocardite viral. Áreas e palavras-chave: Biomagnetismo; Eletrofisiologia cardíaca; Engenharia Biomédica; Doenças do Miocardium; Computação Paralela; Métodos Numéricos |
| Descrição: Objetivo: Caracterização não invasiva do status da doença de miocardite através de
Magnetocardiografia e modelagem computacional, visando a redução do número
de procedimentos invasivos (biopsia) realizados para o controle da dosagem do
medicamento utilizado (Interferon).
Metodos numéricos: Modelagem da atividade elétrica e magnética do coração através sistemas de eq. diferenciais parciais não lineares.
Solução numérica através de elementos finitos, métodos de splitting, métodos de multigrid e computação paralela.
Desenvolvimento e validação dos modelos: Diferentes parâmetros do modelo são usados
para a reprodução das características eletrofisiológicas da patologia de miocardite. Os parâmetros se baseiam em experimentos animais ou procedimentos histológicos
realizados com biopsias do endocardio humano. Alguns modelos são validados através
de experimentos animais tipo perfusão Langendorff.
Aplicacao dos resultados numéricos: Diferentes etapas da doença de miocardite
devem ser reproduzidos pelos modelos numéricos. A solução para-frente dos modelos
deve reproduzir a evolução espaço-temporal do campo magnético produzido pela
atividade elétrica cadíaca. O campo magnético dos pacientes
é medido através do método de Magnetocardigrafia. A comparação dos dados clínicos
com os resultados numéricos dos diferentes modelos de miocardite deve auxiliar
na tomada de decisão relacionada à dosagem do medicamento Interferon e desta forma
reduzir o número de procedimentos invasivos (biopsia) aos quais os pacientes devem se submeter.
. Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. Alunos envolvidos: Graduação ( 0) / Especialização ( 0) / Mestrado acadêmico ( 0) / Mestrado profissionalizante ( 0) / Doutorado ( 0) . Integrantes: S. Bauer - Integrante / Hans Koch - Coordenador / Rodrigo Weber dos Santos - Integrante. Financiador(es): Freie Universität Berlin - Cooperação / Shering Ag - Auxílio financeiro / Deutscher Akademischer Austauschdienst - Cooperação.. |
| 2001 - 2002 | Melhoria de Recuperação de Petróleo em Escoamento Trifásico Uni e Bidimensional. Áreas e palavras-chave: Equações diferenciais parciais; Métodos numéricos; Escoamento de fluidos multifásicos; Meios porosos |
| Descrição: Desenvolvimento de software para modelagem de escoamento
de fluidos multifásicos em meios porosos, incluindo a modelagem
de "foamy oil". Projeto CT-PETRO (464744/2001-6). Colaboração IMPA e Petrobrás. Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. Alunos envolvidos: Graduação ( 0) / Especialização ( 0) / Mestrado acadêmico ( 0) / Mestrado profissionalizante ( 0) / Doutorado ( 0) . Integrantes: Dan Marchesin - Coordenador / Rodrigo Weber dos Santos - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.. |
| 2000 - 2001 | Métodos iterativos eficientes para múltiplos lados direitos. Áreas e palavras-chave: Álgebra linear; Equações diferenciais parciais; Métodos numéricos; Simulação de reservatórios de petróleo |
| Descrição: Projeto CTPETRO de colaboração entre o IM-UFRJ e o grupo de Simulação de Reservatórios do Cenpes/Petrobrás. Implementação de um esquema iterativo de resolução de sistemas lineares com múltiplos lados direitos. No caso em que o conjunto de m vetores n-dimensionais de lados direitos forma (aproximadamente) um subespaço de dimensão k. Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. Alunos envolvidos: Graduação ( 0) / Especialização ( 0) / Mestrado acadêmico ( 0) / Mestrado profissionalizante ( 0) / Doutorado ( 0) . Integrantes: Flavio Dickstein - Coordenador / Jose Roberto P Rodrigues - Integrante / Luiz Mariano Paes de Carvalho Filho - Integrante / Rodrigo Weber dos Santos - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.. |
| 1997 - 1998 | O computador paralelo NCP2. Áreas e palavras-chave: Harware Digital; Lógica programável; Software DSM; Computação paralela |
| Descrição: Projeto e desenvolvimento de hardware e software de protocolos programáveis (CP) para suporte a Software DSM. Um CP consiste de placa PCI com processador Intel 960/66MHz, 32 M bytes de memória RAM, 8 Mbits de memória SRAM, lógica de snoop em fpga, relógio global em fpga e DMA. A placa CP provê suporte de hardware para se implementar, de forma eficiente, o modelo de programação de memória compartilhada numa rede de estações de trabalho, transformando essa rede virtualmente num computador paralelo de alto desempenho (1 protótipo montado com 8 nós). . Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. Alunos envolvidos: Graduação ( 0) / Especialização ( 0) / Mestrado acadêmico ( 0) / Mestrado profissionalizante ( 0) / Doutorado ( 0) . Integrantes: Claudio Luis de Amorim - Coordenador / Ricardo Bianchini - Integrante / Malena O Hor-Meyll - Integrante / Lauro Whately - Integrante / Marcelo de Maria - Integrante / Rodrigo Weber dos Santos - Integrante. Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.. |
Revisor de periódico
| 2005 - 2005 | Periódico: BioMedical Engineering Online |
| 2008 - Atual | Periódico: SIAM Journal on Scientific Computing |
| 2007 - 2007 | Periódico: Computers in Biology and Medicine |
| 2008 - Atual | Periódico: Future Generation Computer Systems |
Áreas de atuação
| 1. | Grande área: Engenharias / Área: Engenharia Biomédica / Subárea: Bioengenharia /
Especialidade: Modelagem de Sistemas Biológicos. |
| 2. | Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Sistemas de Computação. |
| 3. | Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Matemática / Subárea: Matemática Aplicada /
Especialidade: Métodos Numéricos Para Resolução de Equações Diferenciais. |
| 4. | Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Sistemas de Computação /
Especialidade: Computação Paralela. |
| 5. | Grande área: Engenharias / Área: Engenharia Biomédica / Subárea: Bioengenharia /
Especialidade: Processamento de Sinais Biológicos. |
| 6. | Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Sistemas de Computação /
Especialidade: Arquitetura de Sistemas de Computação. |
Idiomas
| Português | Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem. |
| Inglês | Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem. |
| Espanhol | Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Pouco. |
| Alemão | Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco. |
| Francês | Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco. |
| Italiano | Compreende Razoavelmente, Fala Pouco, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco. |
Prêmios e títulos
| 2007 | PRÊMIO INTERNACIONAL - NEC AWARDS- Melhor artigo de aplicação de computação de alto desempenho: "Multi-level Parallelism in the Computational Modeling of the Heart" na conf. SBAC-PAD-2007 da IEEE, NEC-Computers e Sociedade Brasileira de Computação. |
| 2007 | PRÊMIO NACIONAL - 3o Lugar na 2nd Marathon of Parallel Programming. SBAC-PAD-2007. Equipe: Rafael Sachetto Oliveira e Carolina Ribeiro Xavier. Treinador (Coach): Rodrigo Weber dos Santos, SBC Sociedade Brasileira de Computação. |
| 2004 | PRÊMIO INTERNACIONAL - Prêmio Helmholtz de publicacao científica. Trabalho, Helmholtz Foundation. |
| 1992 | PRÊMIO NACIONAL - Primeiro Lugar no concurso nacional de Iniciação Científica em Matematica Aplicada e Computacional, Beatriz Neves. Trabalho:, SBMAC - Sociedade Brasileira de Matemática Aplicada e Computacional. |
Produção em C,T & A
| Produção bibliográfica |
| Citações | |||||||||||||||||||
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| Artigos completos publicados em periódicos |
| 1. |  Rocha, Bernardo M. ; Kickinger, Ferdinand ; Prassl, Anton J. ; Haase, Gundolf ; Vigmond, Edward J. ; Santos, Rodrigo Weber dos ; Zaglmayr, Sabine ; Plank, Gernot . A Macro Finite-Element Formulation for Cardiac Electrophysiology Simulations Using Hybrid Unstructured Grids. IEEE Transactions on Biomedical Engineering (Print) , v. 58, p. 1055-1065, 2011. |
| 2. | Rocha, B. M. ; Campos, F. O. ; AMORIM, R. M. ; PLANK, G. ; Santos, R. W. dos ; Liebmann, M. ; Haase, G. . Accelerating cardiac excitation spread simulations using graphics processing units. Concurrency and Computation, v. 23, p. 708-720, 2011. |
| 3. | CAMPOS, R. S. ; LOBOSCO, M. ; SANTOS, Rodrigo Weber dos . Adaptive Time Step for Cardiac Myocyte Models. Procedia Computer Science, v. 4, p. 1092-1100, 2011. |
| 4. | PIGOZZO, A. B. ; Macedo, G. C. ; SANTOS, Rodrigo Weber dos ; LOBOSCO, M. . Implementation of a Computational Model of the Innate Immune System. Lecture Notes in Computer Science, v. 6825, p. 95-107, 2011. |
| 5. | PIGOZZO, A. B. ; LOBOSCO, M. ; SANTOS, Rodrigo Weber dos . Parallel Implementation of a Computational Model of the Human Immune System. Lecture Notes in Computer Science, v. 6586, p. 217-224, 2011. |
| 6. | Campos, Ricardo Silva ; Amorim, Ronan Mendonca ; Costa, Caroline Mendonça ; Lino de Oliveira, Bernardo ; BARBOSA, Ciro de Barros ; Sundnes, Joakim ; Weber dos Santos, Rodrigo . Approaching cardiac modeling challenges to computer science with CellML-based web tools. Future Generation Computer Systems, v. 26, p. 462-470, 2010. |
| 7. | Cannataro, Mario ; Romberg, Mathilde ; Sundnes, Joakim ; Weber dos Santos, Rodrigo . Special section: Biomedical and bioinformatics challenges to computer science. Future Generation Computer Systems, v. 26, p. 421-423, 2010. |
| 8. | SANTOS, E. P. ; Dickstein, F. ; Goldfeld, P. ; SANTOS, Rodrigo Weber dos ; Xavier, Carolina Ribeiro ; XAVIER, C. R. . Automatic History Matching in Petroleum Reservoirs Using the TSVD Method. Lecture Notes in Computer Science, v. 6017, p. 475-487, 2010. |
| 9. | XAVIER, C. R. ; Xavier, Carolina Ribeiro ; SANTOS, E. P. ; AMORIM, R. M. ; Lobosco, M. ; Dickstein, F. ; SANTOS, Rodrigo Weber dos ; Goldfeld, P. . Performance Evaluation of a Reservoir Simulator on a Multi-core Cluster. Lecture Notes in Computer Science, v. 6019, p. 395-408, 2010. |
| 10. | PAULA, T.H. ; LOBOSCO, M. ; SANTOS, Rodrigo Weber dos . A Web-Based Tool for the Automatic Segmentation of Cardiac MRI. IFMBE Proceedings, v. 29, p. 667-670, 2010. |
| 11. | CAMPOS, R. S. ; XAVIER, M. P. ; LOBOSCO, M. ; SANTOS, Rodrigo Weber dos . Performance Evaluation of a Grid-based Heart Simulator. IFMBE Proceedings, v. 29, p. 663-666, 2010. |
| 12. | Rocha, Bernardo ; CAMPOS, Fernando Otaviano ; Plank, Gernot ; Weber dos Santos, Rodrigo ; Liebmann, Manfred ; Haase, Gundolf . Simulations of the Electrical Activity in the Heart with Graphic Processing Units. Lecture Notes in Computer Science, v. 6067, p. 439-448, 2010. |
| 13. | CAMPOS, Fernando Otaviano ; Wiener, Thomas ; Prassl, Anton J. ; Ahammer, Helmut ; PLANK, G. ; Weber dos Santos, R. ; SANCHEZ-QUINTANA, D. ; HOFER, Ernst . A 2D-Computer Model of Atrial Tissue Based on Histographs Describes the Electro-Anatomical Impact of Microstructure on Endocardiac Potentials and Electric Near Fields. Conference Proceedings (IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. Conf.), v. 1, p. 2541-2544, 2010. |
| 14. | Costa, Caroline Mendonça ; Weber dos Santos, R. . Limitations of the homogenized cardiac Monodomain model for the case of low gap junctional coupling. Conference Proceedings (IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. Conf.), v. 1, p. 228-231, 2010. |
| 15. | Amorim, Ronan Mendonca ; Rocha, Bernardo M. ; CAMPOS, Fernando Otaviano ; dos Santos, Rodrigo Weber . Automatic code generation for solvers of cardiac cellular membrane dynamics in GPUs. Conference Proceedings (IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. Conf.), v. 1, p. 2666-2669, 2010. |
| 16. | OLIVEIRA, Bernardo Lino de ; Sundnes, J. ; Weber dos Santos, R. . The development of a new computational model for the electromechanics of the human ventricular myocyte. Conference Proceedings (IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. Conf.), v. 1, p. 3820-3823, 2010. |
| 17. | Cannataro, M. ; Weber dos Santos, Rodrigo ; Sundnes, J. . Biomedical and bioinformatics challenges to computer science. Procedia Computer Science, v. 1, p. 931-933, 2010. |
| 18. | Cannataro, M. ; Weber dos Santos, R. ; Sundnes, J. . Bioinformatics Challenges to Computer Science: Bioinformatics Tools and Biomedical Modeling. Lecture Notes in Computer Science, v. 5544, p. 807-809, 2009. |
| 19. | Peters, Franciane, C. ; Barra, Luis Paulo ; Weber dos Santos, R. . Determination of Cardiac Ejection Fraction by Electrical Impedance Tomography - Numerical Experiments and Viability Analysis. Lecture Notes in Computer Science, v. 5544, p. 819-828, 2009. |
| 20. | SANTOS, Elisa Portes dos ; XAVIER, Carol Ribeiro ; GOLDFELD, P. ; DICKSTEIN, Flavio ; Weber dos Santos, R. . Comparing Genetic Algorithms and Newton-Like Methods for the Solution of the History Matching Problem. Lecture Notes in Computer Science, v. 5544, p. 377-386, 2009. |
| 21. | MATOS, Ely Edison da Silva ; CAMPOS, F. C. A. ; BRAGA, R. M. ; Weber dos Santos, R. ; Palazzi, Daniele . CelOWS: A Service Oriented Architecture to Define, Query and Reuse Biological Models. Lecture Notes in Computer Science, v. 5544, p. 73-83, 2009. |
| 22. | Weber dos Santos, R. ; Nygren, A. ; Otaviano Campos, F. ; Koch, H. ; Giles, W. R. . Experimental and theoretical ventricular electrograms and their relation to electrophysiological gradients in the adult rat heart. American Journal of Physiology. Heart and Circulatory Physiology, v. 297, p. H1521-H1534, 2009. |
| 23. | Xavier, Carolina Ribeiro ; OLIVEIRA, Rafael Sachetto ; da Fonseca Vieira, Vinicius ; dos Santos, Rodrigo Weber ; Meira, Wagner . Multi-Level Parallelism for the Cardiac Bidomain Equations. International Journal of Parallel Programming, v. 37, p. 572-592, 2009. |
| 24. | Rocha, Bernardo ; Lino de Oliveira, Bernardo ; dos Santos, R. W. ; Toledo, Elson ; Barra, Luis Paulo ; Sundnes, J. . A Two Dimensional Model of Coupled Electromechanics in Cardiac Tissue. IFMBE Proceedings, v. 25, p. 2081-2084, 2009. |
| 25. | CAMPOS, Fernando Otaviano ; CAMPOS, R. S. ; dos Santos, R. W. . Evaluation of Numerical Methods and Computational Techniques for Solving Cardiac Cell Models. IFMBE Proceedings, v. 25, p. 2287-2290, 2009. |
| 26. | CAMPOS, Fernando Otaviano ; Costa, C.M. ; dos Santos, R. W. ; NYGREN, Anders ; CLARK, R.B. ; GILES, Wayne . Modeling the Action Potential in Mouse Sinoatrial Node Myocytes. IFMBE Proceedings, v. 25, p. 2211-2214, 2009. |
| 27. |  VIGMOND, e J ; SANTOS, Rodrigo Weber dos ; PRASSL, A.J. ; DEO, M. ; PLANK, G. . Solvers for the Cardiac Bidomain Equations. Progress in Biophysics and Molecular Biology, v. 96, p. 3-18, 2008. |
| 28. | Costa, C.M. ; CAMPOS, R. S. ; CAMPOS, Fernando Otaviano ; SANTOS, Rodrigo Weber dos . Web Applications Supporting the Development of Models of Chagas Disease for Left Ventricular Myocytes of Adult Rats. Lecture Notes in Computer Science, v. 5103, p. 120-129, 2008. |
| 29. | TEIXEIRA, G. M. ; Pommeranzembaum, I.R. ; OLIVEIRA, Bernardo Lino de ; LOBOSCO, M. ; SANTOS, Rodrigo Weber dos . Automatic Segmentation of Cardiac MRI Using Snakes and Genetic Algorithms. Lecture Notes in Computer Science, v. 5103, p. 168-177, 2008. |
| 30. | Cannataro, M. ; Romberg, M. ; Sundnes, J. ; SANTOS, Rodrigo Weber dos . Bioinformatics Challenges to Computer Science. Lecture Notes in Computer Science, v. 5103, p. 160-165, 2008. |
| 31. | Garny, Alan ; Nickerson, David P. ; Cooper, Jonathan ; SANTOS, Rodrigo Weber dos ; Miller, Andrew K. ; McKeever, Steve ; Nielsen, Poul M.F. ; Hunter, Peter J. . CellML and associated tools and techniques. Philosophical Transactions. Royal Society. Mathematical, Physical and Engineering Sciences, v. 366, p. 3017-3043, 2008. |
| 32. | MARTINS, Daves ; CAMPOS, Fernando Otaviano ; CIUFFO, Leandro Neumann ; OLIVEIRA, Rafael Sachetto ; AMORIM, Ronan Mendonça ; VIEIRA, Vinícius da Fonseca ; EBECKEN, Nelson F F ; BARBOSA, Ciro de Barros ; SANTOS, Rodrigo Weber dos . A Computational Framework for Cardiac Modeling Based on Distributed Computing and Web Applications. Lecture Notes in Computer Science, v. 4395, p. 544-555, 2007. |
| 33. | Plank, Gernot ; Liebmann, M. ; dos Santos, R. W. ; Vigmond, Edward J. ; Haase, Gundolf . Algebraic Multigrid Preconditioner for the Cardiac Bidomain Model. IEEE Transactions on Biomedical Engineering, v. 54, p. 585-596, 2007. |
| 34. | CAMPOS, Fernando Otaviano ; OLIVEIRA, Rafael Sachetto ; SANTOS, Rodrigo Weber dos . Performance Comparison of Parallel Geometric and Algebraic Multigrid Preconditioners for the Bidomain Equations. Lecture Notes in Computer Science, Berlin-Heidelberg, v. 3991, p. 76-83, 2006. |
| 35. | dos Santos, Rodrigo Weber ; OTAVIANO CAMPOS, FERNANDO ; NEUMANN CIUFFO, LEANDRO ; NYGREN, Anders ; GILES, Wayne ; KOCH, Hans . ATX-II Effects on the Apparent Location of M Cells in a Computational Model of a Human Left Ventricular Wedge. Journal of Cardiovascular Electrophysiology, New York, v. 17, n. Suppl 1, p. S86-S95, 2006. |
| 36. | BARBOSA, Ciro de Barros ; SANTOS, Rodrigo Weber dos ; AMORIM, Ronan Mendonça ; CIUFFO, Leandro Neumann ; MANFROI, Fayrus M ; OLIVEIRA, Rafael Sachetto ; CAMPOS, Fernando Otaviano . A Transformation Tool for ODE based models. Lecture Notes in Computer Science, Berlin-Heidelberg, v. 3991, p. 69-75, 2006. |
| 37. | dos Santos, R. W. ; KOCH, Hans . Interpreting Biomagnetic Fields of Planar Wave Fronts in Cardiac Muscle. Biophysical Journal, New York, v. 88, n. 5, p. 3731-3733, 2005. |
| 38. | dos Santos, Rodrigo Weber ; PLANK, G. ; BAUER, S. ; Vigmond, E.J. . Parallel Multigrid Preconditioner for the Cardiac Bidomain Model. IEEE Transactions on Biomedical Engineering, USA, v. 51, n. 11, p. 1960-1968, 2004. |
| 39. | SANTOS, Rodrigo Weber dos ; PLANK, G. ; BAUER, S. ; VIGMOND, e J . Preconditioning techniques for the bidomain equations. Lecture Notes in Computational Science and Engineering, New York, v. 40, p. 571-580, 2004. |
| 40. | SANTOS, Rodrigo Weber dos ; KOSCH, Olaf ; STEINHOFF, Uwe ; BAUER, S. ; TRAHMS, Lutz ; KOCH, Hans . MCG to ECG source differences: Measurements and a two-dimensional computer model study*1. Journal of Electrocardiology, USA, v. 37, n. 4, p. 123-127, 2004. |
| 41. | SANTOS, Rodrigo Weber dos ; STEINHOFF, Uwe ; HOFER, Ernst ; SANCHEZ-QUINTANA, D. ; KOCH, Hans . Modelling the electrical propagation in cardiac tissue using detailed histological data. Biomedizinische Technik. Supplement (Berlin), v. 48, n. 1, p. 476-478, 2003. |
| 42. | SANTOS, Rodrigo Weber dos ; MARCHESIN, Dan ; GUNDELACH, Beata ; VALERIO, Juliana . Magnetocardiographic Location of Rotating Spiral Electrochemical Waves. Matemática Contemporânea, v. 22, n. 1, p. 97-112, 2003. |
| 43. | SANTOS, Rodrigo Weber dos ; DICKSTEIN, Flavio . On the influence of a volume conductor on the orientation of currents in a thin cardiac tissue. Lecture Notes in Computer Science, New York, v. 2674, p. 111-121, 2003. |
| 44. | SANTOS, Rodrigo Weber dos ; DICKSTEIN, Flavio ; MARCHESIN, Dan . Transversal versus longitudinal current propagation on a cardiac tissue and its relation to MCG. Biomedizinische Technik. Supplement (Berlin), v. 47, n. 1, p. 249-252, 2002. |
| 45. | CARVALHO FILHO, Luiz Mariano Paes de ; DICKSTEIN, Flavio ; RODRIGUES, Jose Roberto P ; SANTOS, Rodrigo Weber dos . Um Esquema GMRES Precondicionado para Simulação de Reservatórios. TEMA. Tendências em Matemática Aplicada e Computacional, v. 3, n. 2, p. 63-72, 2002. |
| 46. | LIMA, Eduardo Andrade ; SANTOS, Rodrigo Weber dos ; MONTEIRO, Elisabeth Costa ; BARBOSA, Carlos Roberto Hall ; MARCHESIN, Dan . Location of Reentry Currents in Isolated Rabbit Cardiac Tissues through Inverse Magnetocardiography. Biomedizinische Technik. Supplement (Berlin), v. 46, n. 2, p. 63-65, 2001. |
| 47. | SANTOS, Rodrigo Weber dos ; BIANCHINI, Ricardo ; AMORIM, Claudio Luis de . A survey of messaging software issues and systems for Myrinet-based clusters. Parallel And Distributed Computing Practices, Nova Science Pub., New York, v. 2, n. 2, p. 225-234, 2000. |
| Livros publicados/organizados ou edições |
| 1. | Meira Junior, Wagner (Org.) ; Cavalheiro, Gerson Geraldo H. (Org.) ; Dantas, Mario (Org.) ; SANTOS, Rodrigo Weber dos (Org.) ; Martins, Carlos Augusto da Paiva Silva (Org.) . 18th Symposium on Computer Architecture and High Performance Computing. Proceedings of the Workshops. High Perfomance Computing in the Life Sciences. 1. ed. Brasilia: Sociedade Brasileira de Computação, 2006. v. 1. 359 p. |
| Capítulos de livros publicados |
| 1. | TEIXEIRA, G. M. ; CAMPOS, R. S. ; Weber dos Santos, R. ; LOBOSCO, M. . The Cardiac Electrophysiology Simulator on Grid. In: Mayo, R. ; Hoeger, H. ; Castro, H. ; Ciuffo, L. ; Barbera, R. ; Dutra, I. ; Gavillet, P. ; Marechal, B.. (Org.). Serie Ponencias. Madri: CIEMAT, 2009, v. 1, p. 179-186. |
| 2. | BAER, Markus ; BAUER, S. ; MODEL, R. ; SANTOS, Rodrigo Weber dos . Modelling measurement processes in complex systems with partial differential equations: from heat conduction to the heart. In: Ciarlini, Patrizia; IAC/CNR, Roma, Italy; Filipe, Eduarda; Instituto Portugues da Qualidade, Caparica, Portugal; Forbes, Alistair B.; National Physical Laboratory, Teddington, UK; Pavese, Franco; Instituto di Metrologia;. (Org.). Advanced Mathematical & Computational Tools in Metrology VII. Singapore: World Scientific Publishing Co., 2006, v. , p. 1-12. |
| 3. | SANTOS, Rodrigo Weber dos ; BIANCHINI, Ricardo ; AMORIM, Claudio Luis de . A survey of messaging software issues and systems for Myrinet-based clusters.
In:
R. Buyya; C. Szyperski;.
(Org.). Cluster Computing. New York:
Nova Science Publishers,
2001, v. , p. 133-146. |
| Textos em jornais de notícias/revistas |
| 1. | SANTOS, Rodrigo Weber dos . Estimativa de parâmetros para a equação de difusão. Iniciação científica em revista, Rio de Janeiro, v. 3, 07 jul. 1992. |
| Trabalhos completos publicados em anais de congressos |
| 1. | Pigozzo, A. ; LOBOSCO, M. ; dos Santos, R. W. . Parallel implementation of a computational model of the HIS using OpenMP and MPI. In: 1st Workshop on Applications for Multi and Many Core Architectures, 2010, Petrópolis. 22nd International Symposium on Computer Architecture and High Performance Computing Workshops, 2010. p. 67-72. |
| 2. | Mauss, V.W. ; Correa, M.R. ; dos Santos, R. W. ; Barra, Luis Paulo . Transporte de massa na interface entre meios porosos com características distintas. In: IX Encontro regional de Matemática Aplicada e Computacion, 2010, Rio Grande, RS. Anais do IV Simpósio de Modelagem Computacional do Sul, 2010. p. 338-343. |
| 3. | XAVIER, M. P. ; CAMPOS, R. S. ; Lobosco, M. ; dos Santos, Rodrigo Weber . Porte de um Simulador da Eletrofisiologia do Coração para um Ambiente de Grade Computacional. In: WSCAD-WIC, 2010, Petrópolis. Anais do WSCAD-SSC, 2010. |
| 4. | DICKSTEIN, Flavio ; GOLDFELD, P. ; Pfeiffer, G.T. ; SANTOS, Elisa Portes dos ; Weber dos Santos, Rodrigo ; Gomez,S.G. . A Study of the Impact of 4D-Seismic Data on TSVD-Based Schemes for History Matching. In: 2010 LACPEC - SPE Latin American and Caribbean Petroleum Engineering Conference "Latin America's Energy Challenge: Sustainable and Responsible Economic Development", 2010, Lima, Peru.
2010 LACPEC - SPE Latin American and Caribbean Petroleum Engineering Conference "Latin America's Energy Challenge: Sustainable and Responsible Economic Development". New York :
SPE, 2010. p. 1400-1411. |
| 5. | Campos, Ricardo Silva ; Weber dos Santos, Rodrigo . Esquema adaptativo para a resolução numérica de modelos da eletrofisiologia cardíaca. In: IV MCSUL / IX ERMAC, 2010, Rio Grande, RS. Anais do IV MCSUL / IX ERMAC, 2010. p. 1-10. |
| 6. | TEIXEIRA, G. M. ; Santos, R. W. dos ; Correa, M.R. . COMPARANDO DIFERENTES IMPLEMENTAÇÕES DO MÉTODO KURGANOV-TADMOR E DO ESQUEMA UPWIND PARA A SOLUÇÃO DO ESCOAMENTO BIFÁSICO EM MEIOS POROSOS. In: MECOM 2010 - CILAMCE 2010, 2010, Buenos Aires. Mecánica Computacional Vol XXIX. Buenos Aires : Mecanica Computacional, 2010. p. 8793-8895. |
| 7. | AMORIM, Ronan Mendonça ; Haase, G. ; Liebmann, Manfred ; Weber dos Santos, R. . Comparing CUDA and OpenGL implementations for a Jacobi iteration. In: International Conference on High Performance Computing & Simulation, HPCS '09, 2009, Leipzig.
Proceedings of IEEE, HPCS 2009. New York :
IEEE, 2009. v. 1. p. 22-32. |
| 8. | Cannataro, M. ; Guzzi, P.H. ; LOBOSCO, M. ; Weber dos Santos, R. . GridSnake: a Grid-based Implementation of the Snake Segmentation Algorithm. In: 22nd IEEE International Symposium on Computer-Based Medical Systems (CBMS-2009), 2009, Albuquerque. Proceedings of IEEE, CBMS-2009. New York : IEEE, 2009. v. 1. p. 1-10. |
| 9. | Xavier, Carolina Ribeiro ; SANTOS, Elisa Portes dos ; GOLDFELD, P. ; DICKSTEIN, Flavio ; Weber dos Santos, R. . Comparação de Métodos de Otimização para o Problema de Ajuste de Histórico. In: XII Encontro de Modelagem Computacional, 2009, Rio de Janeiro. XII Encontro de Modelagem Computacional, 2009. p. 1-10. |
| 10. | Xavier, Micael Peters ; CAMPOS, R. S. ; LOBOSCO, M. ; Weber dos Santos, R. . Porte de um Simulador da Eletrofisiologia do Coração para um Ambiente de Grade Computacional. In: XII Encontro de Modelagem Computacional, 2009, Rio de Janeiro. XII Encontro de Modelagem Computacional, 2009. v. 1. p. 10-20. |
| 11. | Xavier, Carolina Ribeiro ; SANTOS, Elisa Portes dos ; LOBOSCO, M. ; GOLDFELD, P. ; DICKSTEIN, Flavio ; Weber dos Santos, R. . ANÁLISE DE DESEMPENHO DE UM SIMULADOR DE RESERVATÓRIOS EM UM AMBIENTE PARALELO MULTIPROCESSADO. In: CILAMCE, 2009, Buzios. 30th edition of the Iberian-Latin-American Congress on Computational Methods in Engineering, 2009. v. 1. p. 1-10. |
| 12. | CAMPOS, R. S. ; Xavier, Micael Peters ; TEIXEIRA, G. M. ; LOBOSCO, M. ; Weber dos Santos, R. . Porting a Cardiac Simulator to a Grid Environment. In: 2nd EELA-2 Conference, 2009, Choroni. Proceedings of the 2nd EELA-2 Conference, 2009. v. 1. p. 1-10. |
| 13. | MATOS, Ely Edison da Silva ; CAMPOS, F. C. A. ; BRAGA, R. M. ; SANTOS, Rodrigo Weber dos . Composição de modelos para a fisiologia: uma proposta de infraestrutura de e-science baseada em ontologias. In: SBC - SEMISH, 2008, Belém. Anais do SBC- SEMISH. Brasília : SBC, 2008. v. 1. p. 1-15. |
| 14. | Peters, Franciane, C. ; LOBOSCO, M. ; Barra, Luis Paulo ; SANTOS, Rodrigo Weber dos . Implementação Paralela da Função Objetivo Associada ao Problema da Tomografia por Impedância Elétrica. In: 11 Encontro de Modelagem Computacional, 2008, Volta Redonda- RJ. 11 Encontro de Modelagem Computacional, 2008. v. 1. p. 1-10. |
| 15. | AMORIM, Ronan Mendonça ; SANTOS, Rodrigo Weber dos . Solução das Equações do Monodomínio em Unidades de Processamento Gráfico. In: 11 Encontro de Modelagem Computacional, 2008, Volta Redonda- RJ. 11 Encontro de Modelagem Computacional, 2008. v. 1. p. 1-10. |
| 16. | TEIXEIRA, G. M. ; LOBOSCO, M. ; SANTOS, Rodrigo Weber dos . Análise da Escalabilidade de um Simulador Cardíaco. In: IX Simpósio em Sistemas Computacionais, 2008, Campo Grande. IX Simpósio em Sistemas Computacionais, 2008. v. 1. p. 1-4. |
| 17. | Barra, Luis Paulo ; Peters, Franciane, C. ; SANTOS, Rodrigo Weber dos . EXPERIMENTOS NUMÉRICOS PARA ANÁLISE DA VIABILIDADE DA DETERMINAÇÃO DA FRAÇÃO DE EJEÇÃO CARDÍACA ATRAVÉS DA TOMOGRAFIA POR IMPEDÂNCIA ELÉTRICA. In: CILAMCE, 2008, Maceio. XXIX CILAMCE 2008, 2008. |
| 18. | dos Santos, R. W. ; Rocha, Bernardo ; Toledo, Elson ; Barra, Luis Paulo . UMA ESTRATÉGIA COMPUTACIONAL PARA A MODELAGEM ELETRO-MECÂNICA DO CORAÇÃO. In: CILAMCE, 2008, Maceio. XXIX CILAMCE 2008, 2008. |
| 19. | MATOS, Ely Edison da Silva ; CAMPOS, F. C. A. ; BRAGA, R. M. ; Weber dos Santos, R. . Composição de modelos em eletrofisiologia cardíaca. In: Congresso Brasileiro de Informática na Saúde - CBIS'2008, 2008, Campos do Jordão. Anais CBIS'2008. São Paulo : SBC, 2008. v. 1. p. 1-8. |
| 20. | XAVIER, Carol Ribeiro ; OLIVEIRA, Rafael Sachetto ; VIEIRA, Vinícius da Fonseca ; SANTOS, Rodrigo Weber dos ; Meira Junior, Wagner . Multi-level Parallelism in the Computational Modeling of the Heart. In: SBAC-PAD 2007: 19th International Symposium on Computer Architecture and High Performance Computing, 2007, Gramado. Proceedings of IEEE, SBAC-PAD 2007: 19th International Symposium on Computer Architecture and High Performance Computing, 2007. v. 1. p. 1-8. |
| 21. | Pommeranzembaum, I.R. ; OLIVEIRA, Bernardo Lino de ; LOBOSCO, M. ; SANTOS, Rodrigo Weber dos . Paralelização do Processamento de Imagens Médicas do Coração em Máquinas Multiprocessadas. In: Workshop em Sistemas Computacionais de Alto Desempenho, 2007, Gramado-RS. Anais do Concurso dos Trabalhos de Iniciação Científica do VIII Workshop em Sistemas Computacionais de Alto Desempenho. Brasília-DF : SBC - Soc. Bras. de Computação, 2007. v. 2. p. 1-5. |
| 22. | XAVIER, Carol Ribeiro ; SANTOS, Rodrigo Weber dos . Paralelização de um Simulador Cardíaco explorando a Independência de Tarefas. In: X Encontro de Modelagem Computacional. In: X Encontro de Modelagem Computacional, 2007, Nova Friburgo-RJ. Anais do X Encontro de Modelagem Computacional, 2007. v. 1. p. 1-8. |
| 23. | LEGARRETA, R. ; BAUER, S. ; SANTOS, Rodrigo Weber dos ; KOCH, Hans ; BAER, Markus . Spatial Properties and Effects of Ajmaline for Epicardial Propagation on Isolated Rabbit Hearts: Measurements and a Computer Study. In: Computers in Cardiology 2007, 2007, Durham-USA. Proceedings Computers in Cardiology 2007. Berlin : Computers in Cardiology, 2007. p. 117-121. |
| 24. | MARTINS, Daves ; CAMPOS, Fernando Otaviano ; CIUFFO, Leandro Neumann ; OLIVEIRA, Rafael Sachetto ; AMORIM, Ronan Mendonça ; BARBOSA, Ciro de Barros ; EBECKEN, Nelson F F ; SANTOS, Rodrigo Weber dos . A Computational Framework for Cardiac Modeling and Web Applications. In: Vecpar 2006 Seventh International Meeting on High Performance Computing for computational science, 2006, Rio de Janeiro. Vecpar 2006 Seventh International Meeting on High Performance Computing for Computational Science. Rio de Janeiro : COPPETEC, 2006. p. 1-14. |
| 25. | BAUER, S. ; ROEDER, G ; ENGEL, H ; SANTOS, Rodrigo Weber dos ; KOCH, Hans ; BAER, Markus . Normal heart beat, alternans and fibrillation in simulations of a model for the rabbit ventricles. In: IEEE Conference and meeting of the European Study Group on Cardiovascular Oscillations 2006, 2006, Jena. Proceedings of the European Study Group on Cardiovascular Oscillations ESGCO 2006. Jena : ESGCO, 2006. p. 123-126. |
| 26. | Maximo, Andre ; Marroquim, Ricardo ; Esperança, Claudio ; SANTOS, Rodrigo Weber dos ; BENTES, C. ; Farias, Ricardo . High-Performance Volume Rendering for 3D Heart Visualization. In: High Performance Computing in the Life Sciences, 2006, Ouro Preto. 18th Symposium on Computer Architecture and High Performance Computing. Proceedings of the Workshops. High Perfomance Computing in the Life Sciences. Brasilia : Sociedade Brasileira de Computação, 2006. v. 1. p. 1-6. |
| 27. | Barra, Luis Paulo ; SANTOS, Rodrigo Weber dos ; Peters, Franciane, C. ; SANTOS, Elisa Portes dos ; Barbosa, Helio J. C. . Parallel Computational Experiments in Electrical Impedance Tomography. In: High Performance Computing in the Life Sciences, 2006, Ouro Preto. 18th Symposium on Computer Architecture and High Performance Computing. Proceedings of the Workshops. High Perfomance Computing in the Life Sciences. Brasilia : Sociedade Brasileira de Computação, 2006. v. 1. p. 7-13. |
| 28. | XAVIER, Carol Ribeiro ; VIEIRA, Vinícius da Fonseca ; MARTINS, Daves Marcio Silva ; SANTOS, Rodrigo Weber dos . Comparing Two Parallel Genetic Algorithms for the Inverse Problem Associated to the Cardiac Bidomain Equations. In: High Performance Computing in the Life Sciences, 2006, Ouro Preto. 18th Symposium on Computer Architecture and High Performance Computing. Proceedings of the Workshops. High Perfomance Computing in the Life Sciences. Brasilia : Sociedade Brasileira de Computação, 2006. v. 1. p. 29-34. |
| 29. | VIEIRA, Vinícius da Fonseca ; SANTOS, Rodrigo Weber dos . Escalonamento de processos sequenciais e paralelos em um cluster dedicado a simulações biológicas. In: VI Workshop em Sistemas Computacionais de Alto Desempenho, 2006, Ouro Preto. VI Workshop em Sistemas Computacionais de Alto Desempenho. Brasilia : Sociedade Brasileira de Computação, 2006. v. 1. p. 191-194. |
| 30. | MARTINS, Daves Marcio Silva ; XAVIER, Carol Ribeiro ; SANTOS, Elisa Portes dos ; VIEIRA, Vinícius da Fonseca ; OLIVEIRA, Rafael Sachetto ; SANTOS, Rodrigo Weber dos . Estimating Conductivity Distribution of Transmural Wedges of the Ventricle Using Parallel Genetic Algorithms. In: Computers in Cardiology 2006, 2006, Valencia, Espanha. Computers in Cardiology. New York : Computers in Cardiology, 2006. v. 33. p. 49-52. |
| 31. | Oliveira, Marcelino Campos ; OLIVEIRA, Rubens de ; SANTOS, Rodrigo Weber dos . Combinação de Elementos Híbridos de Contorno e Elementos Finitos em Problemas de Potencial da Eletrofisiologia Cardíaca Computacional. In: IX Encontro de Modelagem Computacional, 2006, Belo Horizonte. IX Encontro de Modelagem Computacional. Belo Horizonte, 2006. v. 1. p. 1-9. |
| 32. | OLIVEIRA, Bernardo Lino de ; SANTOS, Rodrigo Weber dos . Segmentação do endocárdio em imagens de ressonância magnética utilizando Snakes. In: XVII SIBGRAPI 2006, The Brazilian Symposium on Computer Graphics and Image Processing Workshop of Undergraduate Works, 2006, Manaus. XVII SIBGRAPI 2006, The Brazilian Symposium on Computer Graphics and Image Processing. Brasília : Sociedade Brasileira de Computação, 2006. v. 1. p. 1-6. |
| 33. | BAUER, S. ; SANTOS, Rodrigo Weber dos ; SCHMAL, Thaiz Ruberti ; NAGEL, e ; BAER, Markus ; KOCH, Hans . QRS Width and QT Time Alteration Due to Geometry Change in Modelled Human Cardiac Magnetograms. In: Computers in Cardiology 2005, 2005, Lyon. Proceedings of IEEE Computers in Cardiology. New York : IEEE, 2005. v. 32. p. 639-642. |
| 34. | OLIVEIRA, Daniele Carvalho ; CIUFFO, Leandro Neumann ; OLIVEIRA, Bernardo Lino de ; SANTOS, Rodrigo Weber dos . Visualização da estrutura lamina-fibra do tecido cardíaco obtida por imagens de ressonância magnética. In: SIBGRAPI 2005 The Brazilian Symposium on Computer Graphics and Image Processing Workshop of Undergraduate Work, 2005, Natal. SIBGRAPI 2005. Natal : National Library, Brasil, 2005. p. 1-5. |
| 35. | PINTO, Raquel ; WHATELY, Lauro ; MARIA, Marcelo de ; SANTOS, Rodrigo Weber dos ; BIANCHINI, Ricardo ; AMORIM, Claudio Luis de . Evaluating the dynamic diffing technique. In: 12th Symposium on Computer Architecture and High Performance Computing (SBAC-PAD 2000), 2000, Aguas de São Pedro/SP. 12th Simposium on Computer Architecture and High Performance Computing, 2000. p. 209-216. |
| 36. | SANTOS, Rodrigo Weber dos ; BIANCHINI, Ricardo ; AMORIM, Claudio Luis de . High performance networking for software DSMs. In: X Simpósio Brasileiro de Arquitetura de Computadores, Processamento de Alto Desempenho (SBAC-PAD), 1998, Buzios/RJ. Anais do X Simpósio Brasileiro de Arquitetura de Computadores, Processamento de Alto Desempenho, 1998. p. 107-117. |
| 37. | AMORIM, Claudio Luis de ; BIANCHINI, Ricardo ; HOR-MEYLL, Malena O ; MARIA, Marcelo de ; PINTO, Raquel ; SANTOS, Rodrigo Weber dos ; WHATELY, Lauro . The NCP2 distributed shared memory system - project status. In: IX Simpósio Brasileiro de Arquitetura de Computadores, Processamento de Alto desempenho (SBAC-PAD), 1997, Campos do Jordão/SP. Anais do IX Simpósio Brasileiro de Arquitetura de Computadores, Processamento de Alto Desempenho, 1997. p. 573-576. |
| 38. | SANTOS, Rodrigo Weber dos ; HOR-MEYLL, Malena O ; MARIA, Marcelo de ; PINTO, Raquel ; WHATELY, Lauro ; BIANCHINI, Ricardo ; AMORIM, Claudio Luis de . Implementação e avaliação do controlador de protocolos do NCP2. In: IX Simpósio Brasileiro de Arquitetura de Computadores, Processamento de Alto desempenho (SBAC-PAD), 1997, Campos do Jordão/SP. Anais do IX Simpósio Brasileiro de Arquitetura de Computadores, Processamento de Alto Desempenho, 1997. p. 93-106. |
| 39. | MAENNER, R. ; NOFFZ, K. H. ; LAY, R. ; SILVA FILHO, M. Vaz da ; SANTOS, Rodrigo Weber dos ; BESNARD, Federico H A G D . HIPA-PC High-Speed Image Processing on DSP and FPGA-based Accelerators for Standard PCs. In: 4th German-Brazilian Workshop on Information Technology, 1997, Porto Alegre/RS. 4th German-Brazilian Workshop on Information Technology, 1997. p. 119-124. |
| 40. | BLAIR, R ; KASTRUP, B ; SEIXAS, José Manoel de ; SANTOS, Rodrigo Weber dos . Options for the ATLAS Level-2 Trigger. In: Computing in High Energy Physics 1997, 1997, Berlin. Computing in High Energy Physics 97, 1997. p. 284-286. |
| 41. | SEIXAS, José Manoel de ; KASTRUP, B ; CALOBA, L. P. ; SANTOS, Rodrigo Weber dos . Neural feature extraction for calorimeters in a distributed processing environment. In: Second Workshop on Electronics for the LHC Experiment, 1996, Balatonfured. Second Workshop on Electronics for the LHC Experiment, 1996. p. 267-271. |
| 42. | SANTOS, Rodrigo Weber dos ; BESNARD, Federico H A G D ; SEIXAS, José Manoel de . The Atlas ROB Pre-Processor Hardware Implementation Based On A Digital Signal Processor. In: Second Workshop on Electronics for the LHC Experiment, 1996, Balatonfured. Second Workshop on Electronics for the LHC Experiment, 1996. p. 23-27. |
| 43. | BLAIR, R ; DAWSON, J W ; SCHLERETH, J. L. ; ABOLINS, Maris ; OWEN, Daniel ; POPE, Bernard G. ; SANTOS, Rodrigo Weber dos . The ATLAS level 2 trigger supervisor. In: Second Workshop on Electronics for the LHC Experiment, 1996, Balatonfured. Second Workshop on Electronics for the LHC Experiment, 1996. p. 191-193. |
| 44. | SEIXAS, José Manoel de ; SANTOS, Rodrigo Weber dos ; CALOBA, L. P. . Implementing a neural classifier on a fast Digital Signal Processor. In: Congresso da Sociedade Brasileira de Telecomunicações, 1995, Águas de Lindóia/SP. Congresso da Sociedade Brasileira de Telecomunicações 1995, 1995. p. 375-378. |
| 45. | SEIXAS, José Manoel de ; SANTOS, Rodrigo Weber dos ; CALOBA, L. P. . Implementing a neural second level trigger system on Digital Signal Processor technology: The global decision problem. In: First International Workshop on Electronics for LHC, 1995, Lisboa. First International Workshop on Electronics for LHC, 1995. p. 324-327. |
| 46. | SEIXAS, José Manoel de ; CALOBA, L. P. ; SANTOS, Rodrigo Weber dos ; KASTRUP, B ; PEREIRA, F S . Reducing input space dimension for real time data analysis in high-event rate environments. In: International Conference on Artificial Neural Networks 95, 1995, Paris. International Conference on Artificial Neural Networks 95. p. 203-208. |
| 47. | SEIXAS, José Manoel de ; SANTOS, Rodrigo Weber dos ; CALOBA, L. P. . Implementing a neural second level trigger system on a fast DSP. In: Fourth International Workshop on Software Engineering and Artificial Intelligence for High Energy and Nuclear Physics, 1995, Pisa. Fourth International Workshop on Software Engineering and Artificial Intelligence for High Energy and Nuclear Physics, 1995. p. 551-556. |
| Resumos expandidos publicados em anais de congressos |
| 1. | SANTOS, Rodrigo Weber dos ; Barra, Luis Paulo ; Toledo, Elson ; Rocha, Bernardo . Finite-Element based Scheme of Cardiac Electromechanics. In: 1o Encontro Nacional de Engenharia Biomecanica, 2007, Petropolis. 1o Encontro Nacional de Engenharia Biomecanica, 2007. v. 1. p. 1-2. |
| 2. | BAUER, S. ; SANTOS, Rodrigo Weber dos ; STEINHOFF, Uwe ; WIEKHORST, F. ; ACKERMANN, R. ; TRAHMS, Lutz ; BAER, Markus ; KOCH, Hans . Bidomain Modelling of Electrical Activity of the Mouse Heart Supports the Design of a Specialized Magnetocardiographic Design. In: ICMP 2005 14th International Conference of Medical Physics, 2005, Nuremberg. Biomedizinische Technik. BMT 2005. Berlin : Fachverlag Schiele & Schoen. v. 50. p. 171-172. |
| 3. | BAUER, S. ; SANTOS, Rodrigo Weber dos ; PLANK, G. ; VIGMOND, e J . MCG Simulation of a 3D ventricular tissue.. In: 39th Annual Congress of the German Society for Biomedical Engineering, 2004, Illmenau, Alemanha. Biomedizinische Technik. BMT 2004, 2004. v. 49. p. 702-703. |
| Resumos publicados em anais de congressos |
| 1. | Barra, Luis Paulo ; SANTOS, Rodrigo Weber dos ; Peters, Franciane, C. ; PADILHA, M. . EIT for Calculating Ventricular Ejection Fraction: Numerical Experiments. In: 7th BIOMAT International Symposium on Mathematical and Computational Biology, 2007, Buzios. 7th BIOMAT International Symposium on Mathematical and Computational Biology. Rio de Janeiro : BIOMAT, 2007. |
| 2. | Costa, C.M. ; CAMPOS, Fernando Otaviano ; SANTOS, Rodrigo Weber dos . Towards the Modeling of Chagas' Disease for Left Ventricular Myocytes of Adult Rats. In: 7th BIOMAT International Symposium on Mathematical and Computational Biology, 2007, Buzios. 7th BIOMAT International Symposium on Mathematical and Computational Biology, 2007. |
| 3. | BAUER, S. ; STEINHOFF, Uwe ; SANTOS, Rodrigo Weber dos ; DHEIN, S. ; SCHMAL, Thaiz Ruberti ; NAGEL, e ; BAER, Markus ; KOCH, Hans . Whole heart modelling: From validation to the reconstruction of the human MCG. In: 31st Annual Meeting of the International Society for Computerized Electrocardiography, 2006, Niagara-on-the-Lake, Canada. Proceedings of the 31st Annual Conference of the International Society for Computerized Electrocardiology (2006). p. 65-65. |
| 4. | MARTINS, Daves Marcio Silva ; XAVIER, Carol Ribeiro ; SANTOS, Elisa Portes dos ; SANTOS, Rodrigo Weber dos . TWO-LEVEL PARALLELISM EXPLOITED IN THE SOLUTION OF THE INVERSE PROBLEM ASSOCIATED TO CARDIAC ELECTROPHYSIOLOGY. In: 2nd LNCC Meeting on Computational Modelling, 2006, Petropolis-RJ. 2nd LNCC Meeting on Computational Modelling, 2006. p. 21-21. |
| 5. | SANTOS, Rodrigo Weber dos ; CAMPOS, Fernando Otaviano ; CIUFFO, Leandro Neumann ; KOCH, Hans ; GILES, Wayne . ATX-II Effects on the Apparent Location of M Cells in a Computational Human Left Ventricular Wedge . In: Mechanisms for Maintaining Intracellular Na+ and Ca2+ Homeostasis in the Mammalian Heart: Implications of Ischemia and Left Ventricular Dysfunction, 2005, San Diego, USA. Mechanisms for Maintaining Intracellular Na+ and Ca2+ Homeostasis in the Mammalian Heart: Implications of Ischemia and Left Ventricular Dysfunction, 2005. |
| 6. | SANTOS, Rodrigo Weber dos ; KOSCH, Olaf ; STEINHOFF, Uwe ; KOCH, Hans . MCG to ECG source differences: a 2d computer model study. In: 29th Annual Conference of the International Society for Computerized Electrocardiology, 2004, Miami. 29th Annual Conference of the International Society for Computerized Electrocardiology, 2004. p. 27-27. |
| 7. | SANTOS, Rodrigo Weber dos ; PLANK, G. ; BAUER, S. ; VIGMOND, e J . Preconditioning technique for the bidomain equation. In: 15th International Conference on Domain Decomposition Methods, 2003, Berlin. 15th International Conference on Domain Decomposition Methods, 2003. p. 65-66. |
| 8. | SANTOS, Rodrigo Weber dos ; MARCHESIN, Dan ; GUNDELACH, Beata ; SILVA, M. A. C. da ; VALERIO, Juliana . Magnetocardiographic localization of spiral electrochemical waves. In: VII Workshop on Partial Differential Equations, 2001, Rio de Janeiro, Brasil. VII Workshop on Partial Differential Equations, 2001. |
| 9. | SANTOS, Rodrigo Weber dos . Um Problema Inverso em MagnetoCardiografia. In: XXIV CONGRESSO NACIONAL DE MATEMÁTICA APLICADA E COMPUTACIONAL - CNMAC, 2001, Belo Horizonte, Brasil. XXIV CONGRESSO NACIONAL DE MATEMÁTICA APLICADA E COMPUTACIONAL - CNMAC, 2001. |
| 10. | CARVALHO FILHO, Luiz Mariano Paes de ; DICKSTEIN, Flavio ; RODRIGUES, Jose Roberto P ; SANTOS, Rodrigo Weber dos . Precondicionador Combinativo para Problemas de Simulação de Reservatórios . In: XXIV CONGRESSO NACIONAL DE MATEMÁTICA APLICADA E COMPUTACIONAL - CNMAC, 2001, Belo Horizonte. XXIV CONGRESSO NACIONAL DE MATEMÁTICA APLICADA E COMPUTACIONAL - CNMAC, 2001. v. 1. p. 173-173. |
| Apresentações de Trabalho |
| 1. | Weber dos Santos, Rodrigo . Palestrante Convidado- SB-Meeting, Systems BiologyMeeting. 2010. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra). |
| 2. | Weber dos Santos, Rodrigo . Palestrante Convidado- III Semana da Matemática Computacional -Duas aplicações de modelagem matemática e computacional: Meios Porosos e Eletroficiologia Cardíaca. 2010. (Apresentação de Trabalho/Seminário). |
| 3. | Weber dos Santos, Rodrigo . Palestrante Convidado- Bidomain Workshop. 2009. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra). |
| 4. | Santos, Rodrigo Weber dos . Palestrante Convidado - KFU GRAZ - SFB Colloquium - "Advanced Computer Techniques for the Cardiac Bidomain Equations". 2008. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra). |
| 5. | Weber dos Santos, Rodrigo . Palestrante Convidado - CARP Workshop "New parallelization techniques for the Bidomain equations". 2008. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra). |
| 6. | Weber dos Santos, R. . Palestrante Convidado- UFLA Semana da Computação "Informática na Saúde". 2008. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra). |
| 7. | SANTOS, Rodrigo Weber dos . Palestrante Convidado - BELIEF-EELA Conference "Computational Physiology: Powered by E-Science; Heading to E-Health". 2007. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra). |
| 8. | Santos, Rodrigo Weber dos . Palestrante Convidado - Seminário do Programa de Doutorado em Bioinformática - UFMG - "Modelagem Computacional do Coração". 2007. (Apresentação de Trabalho/Seminário). |
| 9. | SANTOS, Rodrigo Weber dos . Palestrante Convidado -Oxford University- Seminar -"Cardiac Modeling: Applications and Computational Techniques". 2006. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra). |
| 10. | Santos, Rodrigo Weber dos . Palestrante Convidado - UFMG - Programas de bioquimica e imunologia; fisiologia e biofisica - "Introdução a modelagem da eletrofisiologia cardíaca". 2006. (Apresentação de Trabalho/Seminário). |
| 11. | Santos, Rodrigo Weber dos . Palestrante Convidado - Workshop de Visualização de Alto Desempenho - UFMG -. 2006. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra). |
| 12. | SANTOS, Rodrigo Weber dos . Palestrante Convidado - Institute for Theoretical Physics - TU Berlin - "Steps towards the modeling of heart inflammations". 2005. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra). |
| 13. | SANTOS, Rodrigo Weber dos . Palestrate Convidado - University of California San Diego - "ATX-II Effects on the Apparent Location of M Cells in a Computational Human Left Ventricular Wedge". 2005. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra). |
| 14. | SANTOS, Rodrigo Weber dos . Palestrante Convidado - Sessão Plenária - ISCE04 - "MCG to ECG Source Differences: A 2D Computer Model Study". 2004. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra). |
| 15. | SANTOS, Rodrigo Weber dos . Pastrante Convidado - University of Graz - OPTIMIZATION and CONTROL SEMINAR. 2004. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra). |
| 16. | SANTOS, Rodrigo Weber dos . Palestrante Convidado - Medical School - University of Graz - "Modeling Cardiac Myocarditis". 2004. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra). |
| Produção técnica |
| Softwares sem registro de patente |
| 1. | DICKSTEIN, Flavio ; SANTOS, Rodrigo Weber dos ; RODRIGUES, Jose Roberto P ; CARVALHO FILHO, Luiz Mariano Paes de . Rotinas para problemas de simulacão de reservatórios. 2001. |
| Produtos tecnológicos |
| 1. | AMORIM, Claudio Luis de ; BIANCHINI, Ricardo ; MARIA, Marcelo de ; WHATELY, Lauro ; PINTO, Raquel ; SANTOS, Rodrigo Weber dos ; HOR-MEYLL, Malena O . Computador Paralelo NCP2. 1998. |
Bancas
| Participação em bancas examinadoras |
| Dissertações |
| 1. | Barra, Luis Paulo; Toledo, Elson; dos Santos, R. W.; Ribeiro, C; Malta, S.M.C.; Toledo, R.C.P.L.. Participação em banca de Victor Wegner Maus. Modelagem computacional aplicada ao transporte de contaminantes em águas subterrâneas. 2011. Dissertação (Mestrado em Modelagem Computacional) - Universidade Federal de Juiz de Fora. |
| 2. | dos Santos, R. W.; Toledo, Elson; Burgarelli Duczmal, Denise. Participação em banca de Caroline Mendonça Costa. Modelagem da microestrutura de tecidos cardíacos. 2011. Dissertação (Mestrado em Modelagem Computacional) - Universidade Federal de Juiz de Fora. |
| 3. | Lobosco, M.; dos Santos, R. W.; Macedo, G.C.; Vianna, Gizelle; Borges, C.C.H.. Participação em banca de Alexandre Bittencourt Pigozzo. Implementação Computacional de um modelo matemático do sistema imune inato. 2011. Dissertação (Mestrado em Modelagem Computacional) - Universidade Federal de Juiz de Fora. |
| 4. | Barra, Luis Paulo; dos Santos, R. W.; Telles, J.C.F.. Participação em banca de Franciane Conceição Peters. Estratégia para a solução numérica do problema inverso da identificação de inclusões em domínio condutor. 2010. Dissertação (Mestrado em Modelagem Computacional) - Universidade Federal de Juiz de Fora. |
| 5. | dos Santos, R. W.; Barra, Luis Paulo; Toledo, Elson; Las Casas, E.B.; Sundnes, J.. Participação em banca de Bernardo Lino de Oliveira. Modelagem quantitativa da eletromecânica do tecido cardíaco humano. 2010. Dissertação (Mestrado em Modelagem Computacional) - Universidade Federal de Juiz de Fora. |
| 6. | Meira Junior, Wagner; Weber dos Santos, R.; Dantas de Oliveira, Socrates; Burgarelli Duczmal, Denise. Participação em banca de Ronan Mendonça Amorim. Solução das Equações do Bidomínio em Unidades de Processamento Gráfico. 2009. Dissertação (Mestrado em Modelagem Computacional) - Universidade Federal de Juiz de Fora. |
| 7. | Weber dos Santos, R.; DICKSTEIN, Flavio; GOLDFELD, P.; Romeu, R.K.; Correa, M.R.. Participação em banca de Elisa Portes dos Santos. Ajuste Automático de Histórico em Reservatórios de Petróleo Utilizando o Método TSVD. 2009. Dissertação (Mestrado em Modelagem Computacional) - Universidade Federal de Juiz de Fora. |
| 8. | Weber dos Santos, R.; DICKSTEIN, Flavio; GOLDFELD, P.; Garcia, E.L.M.; LOBOSCO, M.. Participação em banca de Carolina Ribeiro Xavier. Comparação de métodos de otimização para o problema de ajuste de histórico em ambientes paralelos. 2009. Dissertação (Mestrado em Modelagem Computacional) - Universidade Federal de Juiz de Fora. |
| 9. | Weber dos Santos, R.; BARBOSA, Ciro de Barros; Travassos, G.H.; Barros, M.O.; Villela, P.R.C.. Participação em banca de Igor de Oliveira Knop. Modelagem e Simulação de Sistemas Dinâmicos: uma ferramenta baseada em dinâmica de sistemas aplicada a gerenciamento de processo de software. 2009. Dissertação (Mestrado em Modelagem Computacional) - Universidade Federal de Juiz de Fora. |
| 10. | Toledo, Elson; Barra, Luis Paulo; SANTOS, Rodrigo Weber dos; LOULA, A. F. D.; GUERREIRO, J. N. C.. Participação em banca de Bernardo Martins Rocha. Um Modelo de Acoplamento Eletro-Mecânico do Tecido Cardíaco através do Método dos Elementos Finitos. 2008. Dissertação (Mestrado em Modelagem Computacional) - Universidade Federal de Juiz de Fora. |
| 11. | CAMPOS, F. C. A.; SANTOS, Rodrigo Weber dos; SANTOS, N.; BRAGA, R. M.. Participação em banca de Ely Edson da Silva Matos. CELOWS: UM FRAMEWORK BASEADO EM ONTOLOGIAS COM SERVIÇOS WEB SEMÂNTICOS PARA MODELAGEM CONCEITUAL EM BIOLOGIA SISTÊMICA. 2008. Dissertação (Mestrado em Modelagem Computacional) - Universidade Federal de Juiz de Fora. |
| 12. | EBECKEN, Nelson F F; SANTOS, Rodrigo Weber dos; GUIMARAES, A. C. F.; LIMA, B. S. L. P.. Participação em banca de Daves Marcio Silva Martins. ALGORITMOS GENÉTICOS DISTRIBUÍDOS APLICADOS AO PROBLEMA INVERSO DE ELETROFISIOLOGIA CARDÍACA. 2008. Dissertação (Mestrado em Engenharia Civil) - Universidade Federal do Rio de Janeiro. |
| 13. | SANTOS, Rodrigo Weber dos; CRUZ, Jader dos Santos; CAMPOS FILHO, F. F.; Barra, Luis Paulo; OLIVEIRA, Rubens de. Participação em banca de Fernando Otaviano Campos. Modelagem computacional da eletrofisiologia cardíaca: o desenvolvimento de um novo modelo para células de camundongos e a avaliação de novos esquemas numéricos. 2008. Dissertação (Mestrado em Modelagem Computacional) - Universidade Federal de Juiz de Fora. |
| 14. | SANTOS, Rodrigo Weber dos; Vianna, Gizelle; Almeida, Renan; Mendonça, José Paulo; Barbosa, Helio J. C.. Participação em banca de Rafael Sachetto Oliveira. AJUSTE AUTOMÁTICO DE MODELOS CELULARES APOIADO POR ALGORITMOS GENÉTICOS. 2008. Dissertação (Mestrado em Modelagem Computacional) - Universidade Federal de Juiz de Fora. |
| 15. | PITANGUEIRA, R. L. S.; BARROS, F. B.; SANTOS, Rodrigo Weber dos. Participação em banca de Samuel Silva Penna. Pós-processador para modelos bidimensionais do método dos elementos finitos. 2007. Dissertação (Mestrado em Engenharia de Estruturas) - Universidade Federal de Minas Gerais. |
| 16. | PITANGUEIRA, R. L. S.; BARROS, F. B.; SANTOS, Rodrigo Weber dos; BARBOSA, F. S.. Participação em banca de Luciana Sampaio Câmara. Um Serviço Web para o Método dos Elementos Finitos. 2007. Dissertação (Mestrado em Engenharia de Estruturas) - Universidade Federal de Minas Gerais. |
| 17. | SANTOS, Rodrigo Weber dos; ALMEIDA, Antônio-carlos Guimarães de; KOHN, André Fabio. Participação em banca de Paulliani Gonçalves Vivas. Efeito da Hipóxia e da Palitoxina sobre a atividade epileptiforme não sináptica no hipocampo. 2005. Dissertação (Mestrado em FISICA E QUIMICA DE MATERIAIS) - Universidade Federal de São João Del-Rei. |
| Teses de doutorado |
| 1. | Santoro, Marcelo; SANTOS, Rodrigo Weber dos; Barrera, J.; Azevedo, Walter; Franco, Glaura. Participação em banca de Raquel Melo Minardi. Classificação Estrutural de Proteínas com Base em Mapas de Contatos. 2008. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais. |
| 2. | SANTOS, Rodrigo Weber dos; KOHN, André Fabio; ALMEIDA, Antônio-carlos Guimarães de; INFANTOSI, Antonio Fernando Catelli. Participação em banca de Hewerson Zansávio Teixeira. Modelagem Matemática do smecanismos de eletrodifusão e recuperação dos gradientes iônicos durante o fenômeno de depressão alastrante. 2005. Tese (Doutorado em Engenharia Biomédica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro. |
| Trabalhos de Conclusão de Curso de graduação |
| 1. | SANTOS, Rodrigo Weber dos; OLIVEIRA, Rubens de; BARBOSA, Ciro de Barros. Participação em banca de Rafael Sachetto Oliveira. Computação de Alto Desempenho Apoiando o Desenvolvimento de Novas Técnicas de Diagnóstico para Doenças do Coração.. 2006. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciencia da Computacao) - Universidade Federal de Juiz de Fora. |
| 2. | SANTOS, Rodrigo Weber dos; JABOUR, Eugênia; RIBEIRO, Marcos Henrique Fonseca. Participação em banca de Leonardo Kemps Bittencourt da Silva. Redes de Sensores: Adicionando Segurança aos códigos Móveis. 2006. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciencia da Computacao) - Universidade Federal de Juiz de Fora. |
| 3. | SANTOS, Rodrigo Weber dos; MATOS, Ely Edison da Silva; OLIVEIRA, Rubens de. Participação em banca de Giuliano Freitas de Paula Petrilo. Metodologia para Gerência de Redes com o Protocolo SNMP. 2006. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciencia da Computacao) - Universidade Federal de Juiz de Fora. |
| 4. | SANTOS, Rodrigo Weber dos; RIBEIRO, Marcos Henrique Fonseca; JABOUR NETO, Filippe Coury. Participação em banca de Bernardo Martins Rocha. Uma metaheurística GRASP paralela para o problema de empacotamento de conjuntos. 2006. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciencia da Computacao) - Universidade Federal de Juiz de Fora. |
| 5. | SANTOS, Rodrigo Weber dos; BARBOSA, Ciro de Barros; RIBEIRO, Marcos Henrique Fonseca. Participação em banca de Vinícius da Fonseca Vieira. Escalonamento de processos sequenciais e paralelos em um cluster dedicado a simulações biológicas. 2006. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciencia da Computacao) - Universidade Federal de Juiz de Fora. |
| Participação em bancas de comissões julgadoras |
| Concurso público |
| 1. | dos Santos, R. W.; XAVIER, C. R.; Vieira, L.F.M.. Presidente de Banca do Concurso Público para Professor Adjunto do Dept. de Ciência da Computação da UFJF. 2010. Universidade Federal de Juiz de Fora. |
| 2. | CAMPOS FILHO, F. F.; Alves, J. L. D.; Weber dos Santos, R.. Presidente de Banca do Concurso Público para Professor Adjunto do Dept. de Ciência da Computação da UFJF. 2009. Universidade Federal de Juiz de Fora- UFJF. |
| 3. | dos Santos, R. W.; GOLDFELD, P.; Oliveira, A.R.L.. Presidente de Banca do Concurso Público para Professor Adjunto do Dept. de Ciência da Computação da UFJF. 2009. Universidade Federal de Juiz de Fora. |
| 4. | SANTOS, Rodrigo Weber dos; BENTES, C.; Castro, M.C.S.. Presidente da Banca do Concurso Público para Professor Adjunto do Dept. de Ciência da Computação da UFJF. 2006. Universidade Federal de Juiz de Fora. |
Eventos
| Organização de eventos |
| 1. | Cannataro, M. ; Weber dos Santos, Rodrigo ; Sundnes, J. . Workshop Biomedical and Bioinformatics Challenges to Computer Science - ICCS 2010 (The International Conference on Computational Science). 2010. (Congresso). |
| 2. | Weber dos Santos, R. . Symposium Mathematical Modeling of Biological Phenomena - X-meeting 2010 (International Conference on Bioinformatics and Computational Biology). 2010. (Congresso). |
| 3. | Weber dos Santos, Rodrigo . Workshop on Computational Modeling of the Heart. 2010. (Congresso). |
| 4. | Weber dos Santos, R. ; Cannataro, M. ; Sundnes, J. . Workshop Bioinformatics Challenges to Computer Science - ICCS 2009 (The International Conference on Computational Science). 2009. (Congresso). |
| 5. | Weber dos Santos, Rodrigo . Workshop em Modelagem Computacional de Reservatórios de Petróleo. 2009. (Congresso). |
| 6. | Cannataro, M. ; Romberg, M. ; Sundnes, J. ; SANTOS, Rodrigo Weber dos . Workshop Bioinformatics Challenges to Computer Science - ICCS 2008 (The International Conference on Computational Science). 2008. (Congresso). |
| 7. | SANTOS, Rodrigo Weber dos . High Performance Computing in the Life Sciences- HPCLife. 2006. (Congresso). |
Orientações
| Orientações em andamento |
| Dissertação de mestrado |
| 1. | Ricardo Silva Campos. Métodos computacionais para a modelagem da eletrofisiologia cardíaca. Início: 2009. Dissertação (Mestrado em Modelagem Computacional) - Universidade Federal de Juiz de Fora. (Orientador). |
| 2. | Gustavo Miranda Teixeira. Métodos numéricos para problemas direto e inverso de modelagem computacional do escoamento de fluidos em meios porosos. Início: 2009. Dissertação (Mestrado em Modelagem Computacional) - Universidade Federal de Juiz de Fora, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Orientador). |
| Iniciação científica |
| 1. | CAMILO PINTO RODRIGUES. PROCESSAMENTO DE IMAGENS DE RESSONÂNCIA MAGNÉTICA CARDÍACA. Início: 2010. Iniciação científica (Graduando em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Juiz de Fora- UFJF, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. (Orientador). |
| 2. | GUSTAVO MONTES NOVAES. MÉTODOS COMPUTACIONAIS PARA A MODELAGEM DA ELETROFISIOLOGIA CARDÍACA. Início: 2010. Iniciação científica (Graduando em Engenharia Computacional) - Universidade Federal de Juiz de Fora- UFJF, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. (Orientador). |
| 3. | ADRIELE ALVARENGA SECUNDINO. FERRAMENTAS COMPUTACIONAIS APLICADAS A MODELOS COMPLEXOS DA FISIOLOGIA DE CÉLULAS CARDÍACAS. Início: 2010. Iniciação científica (Graduando em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Juiz de Fora- UFJF, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais. (Orientador). |
| 4. | JOHNNY MOREIRA GOMES. FERRAMENTAS COMPUTACIONAIS APLICADAS A MODELOS COMPLEXOS DA FISIOLOGIA DE CÉLULAS CARDÍACAS. Início: 2010. Iniciação científica (Graduando em Engenharia Computacional) - Universidade Federal de Juiz de Fora- UFJF, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais. (Orientador). |
| 5. | ERIC ALEXANDER MELCHIADES TEIXEIRA. PROCESSAMENTO DE IMAGENS DE RESSONÂNCIA MAGNÉTICA CARDÍACA. Início: 2010. Iniciação científica (Graduando em Engenharia Computacional) - Universidade Federal de Juiz de Fora- UFJF, Universidade Federal de Juiz de Fora- UFJF. (Orientador). |
| 6. | RICARDO BARBOSA KLOSS. MÉTODOS COMPUTACIONAIS PARA A MODELAGEM DA ELETROFISIOLOGIA CARDÍACA. Início: 2010. Iniciação científica (Graduando em Engenharia Computacional) - Universidade Federal de Juiz de Fora- UFJF, Universidade Federal de Juiz de Fora- UFJF. (Orientador). |
| Supervisões e orientações concluídas |
| Dissertação de mestrado |
| 1. |  Caroline Mendonça Costa. Modelagem da microestrutura de tecidos cardíacos.
2011.
Dissertação (Mestrado em Modelagem Computacional) - Universidade Federal de Juiz de Fora, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais. Orientador: Rodrigo Weber dos Santos. |
| 2. | Bernardo Lino de Oliveira. Modelagem quantitativa da eletromecânica do tecido cardíaco humano. 2011. Dissertação (Mestrado em Modelagem Computacional) - Universidade Federal de Juiz de Fora, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Rodrigo Weber dos Santos. |
| 3. | Alexandre Bittencourt Pigozzo. Implementação Computacional de um modelo matemático do sistema imune inato. 2011. Dissertação (Mestrado em Modelagem Computacional) - Universidade Federal de Juiz de Fora, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Co-Orientador: Rodrigo Weber dos Santos. |
| 4. | Elisa Portes dos Santos. Ajuste Automático de Histórico em Reservatórios de Petróleo Utilizando o Método TSVD. 2009. Dissertação (Mestrado em Modelagem Computacional) - Universidade Federal de Juiz de Fora, Agência Nacional de Petróleo. Orientador: Rodrigo Weber dos Santos. |
| 5. | Carolina Ribeiro Xavier. COMPARACÃO DE MÉTODOS DE OTIMIZAÇÃO PARA O PROBLEMA DE AJUSTE DE HISTÓRICO EM AMBIENTES PARALELOS. 2009. Dissertação (Mestrado em Multidisciplinar Em Modelagem Computacional) - Universidade Federal de Juiz de Fora, Agência Nacional de Petróleo. Orientador: Rodrigo Weber dos Santos. |
| 6. | Ronan Mendonça Amorim. Solução das Equações do Bidomínio em Unidades de Processamento Gráfico.
2009.
Dissertação (Mestrado em Multidisciplinar Em Modelagem Computacional) - Universidade Federal de Juiz de Fora, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais. Orientador: Rodrigo Weber dos Santos. |
| 7. | Daves Marcio Silva Martins. ALGORITMOS GENÉTICOS DISTRIBUÍDOS APLICADOS AO PROBLEMA INVERSO DE ELETROFISIOLOGIA CARDÍACA. 2008. 0 f. Dissertação (Mestrado em COPPEInterdisciplinar Computação de AltoDesempenho) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, . Co-Orientador: Rodrigo Weber dos Santos. |
| 8. | Fernando Otaviano Campos. Modelagem computacional da eletrofisiologia cardíaca: o desenvolvimento de um novo modelo para células de camundongos e a avaliação de novos esquemas numéricos.
2008. 0 f.
Dissertação (Mestrado em Multidisciplinar Em Modelagem Computacional) - Universidade Federal de Juiz de Fora, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais. Orientador: Rodrigo Weber dos Santos. |
| 9. | Rafael Sachetto Oliveira. AJUSTE AUTOMÁTICO DE MODELOS CELULARES APOIADO POR ALGORITMOS GENÉTICOS.
2008. 0 f.
Dissertação (Mestrado em Multidisciplinar Em Modelagem Computacional) - Universidade Federal de Juiz de Fora, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Rodrigo Weber dos Santos. |
| 10. | Bernardo Martins Rocha. Um Modelo de Acoplamento Eletro-Mecânico do Tecido Cardíaco através do Método dos Elementos Finitos. 2008. Dissertação (Mestrado em Multidisciplinar Em Modelagem Computacional) - Universidade Federal de Juiz de Fora, Universidade Federal de Juiz de Fora- UFJF. Co-Orientador: Rodrigo Weber dos Santos. |
| Trabalho de conclusão de curso de graduação |
| 1. | Caroline Mendonça Costa. Modelagem Computacional da Doença de Chagas. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciencia da Computacao) - Universidade Federal de Juiz de Fora, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais. Orientador: Rodrigo Weber dos Santos. |
| 2. | Ricardo Silva Campos. A utilização de uma grade computacional para um problema inverso da eletrofisiologia cardíaca. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciencia da Computacao) - Universidade Federal de Juiz de Fora, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais. Orientador: Rodrigo Weber dos Santos. |
| 3. | Gustavo Miranda Teixeira. Análise de desempenho de um simulador da eletrofisiologia cardíaca. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciencia da Computacao) - Universidade Federal de Juiz de Fora, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rodrigo Weber dos Santos. |
| 4. | Guilherme Pereira de Souza. Introdução à Modelagem Matemática de Balanço Hídrico. 2008. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciencia da Computacao) - Universidade Federal de Juiz de Fora. Orientador: Rodrigo Weber dos Santos. |
| 5. | Carolina Ribeiro Xavier. Implementações distribuídas de algoritmos genéticos para o problema da estimativa de parâmetros das equações do bidomínio.. 2007. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciencia da Computacao) - Universidade Federal de Juiz de Fora. Orientador: Rodrigo Weber dos Santos. |
| 6. | Elisa Portes dos Santos. Comparação de dois métodos de otimização para o problema de estimativa de parâmetros das equações do monomínio.. 2007. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciencia da Computacao) - Universidade Federal de Juiz de Fora. Orientador: Rodrigo Weber dos Santos. |
| 7. | Luis Gustavo Mendes Simões. I/O paralelo utilizando o sistema de arquivos PVFS e a interface de passagem de mensagem MPI.. 2007. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciencia da Computacao) - Universidade Federal de Juiz de Fora. Orientador: Rodrigo Weber dos Santos. |
| 8. | Ronan Mendonça Amorim. Ferramenta de transformações de Equações diferencias ordinárias descritas em XML e sua aplicação em modelagem cardíaca. 2007. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciencia da Computacao) - Universidade Federal de Juiz de Fora. Orientador: Rodrigo Weber dos Santos. |
| 9. | Thiago Torres Ferreira. Comparação de desempenho em diferentes implementações MPI em um cluster Linux. 2007. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciencia da Computacao) - Universidade Federal de Juiz de Fora. Orientador: Rodrigo Weber dos Santos. |
| 10. | Marcelino Campos Oliveira Silva. Combinação de Elementos Híbridos de Contorno com Elementos Finitos para Problemas de Potencial da Eletrofisiologia Cardíaca Computacional. 2007. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciencia da Computacao) - Universidade Federal de Juiz de Fora. Orientador: Rodrigo Weber dos Santos. |
| 11. | Rafael Sachetto Oliveira. Computação de Alto Desempenho Apoiando o Desenvolvimento de Novas Técnicas de Diagnóstico para Doenças do Coração.. 2006. 52 f. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciencia da Computacao) - Universidade Federal de Juiz de Fora, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rodrigo Weber dos Santos. |
| 12. | Vinícius da Fonseca Vieira. Técnicas de escolonamento para clusters e grids. 2006. 0 f. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciencia da Computacao) - Universidade Federal de Juiz de Fora. Orientador: Rodrigo Weber dos Santos. |
| 13. | Fernando Otaviano Campos. Um estudo sobre a modelagem da eletrofisiologia cardíaca. 2005. 50 f. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciencia da Computacao) - Universidade Federal de Juiz de Fora. Orientador: Rodrigo Weber dos Santos. |
| Iniciação Científica |
| 1. | Guilherme G. Montebrune de Souza. Métodos matemáticos para a modelagem da eletrofisiologia cardíaca. 2008. Iniciação Científica. (Graduando em Ciencia da Computacao) - Universidade Federal de Juiz de Fora, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rodrigo Weber dos Santos. |
| 2. | Carolina Mendonça Costa. Desenvolvimento de Modelos Computacionais para a Doença de Chagas em Miócitos Ratos. 2007. Iniciação Científica. (Graduando em Ciencia da Computacao) - Universidade Federal de Juiz de Fora, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais. Orientador: Rodrigo Weber dos Santos. |
| 3. | Rafael Ribeiro de Carvalho. Métodos matemáticos para a modelagem da eletrofisiologia cardíaca. 2007. Iniciação Científica. (Graduando em Ciencia da Computacao) - Universidade Federal de Juiz de Fora, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rodrigo Weber dos Santos. |
| 4. | Ricardo Silva Campos. Técnicas Computacionais para modelagem do coração. 2007. Iniciação Científica. (Graduando em Ciencia da Computacao) - Universidade Federal de Juiz de Fora, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais. Orientador: Rodrigo Weber dos Santos. |
| 5. | Gustavo Miranda Teixeira. Processamento de Imagens de Ressonância Magnética do Coração. 2007. Iniciação Científica. (Graduando em Ciencia da Computacao) - Universidade Federal de Juiz de Fora, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rodrigo Weber dos Santos. |
| 6. | Rafael Sachetto Oliveira. Interfaces gráficas para simuladores cardíacos e neuronais. 2006. 52 f. Iniciação Científica. (Graduando em Ciencia da Computacao) - Universidade Federal de Juiz de Fora, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rodrigo Weber dos Santos. |
| 7. | Héberte Fernandes de Moraes. Métodos numéricos e gráficos aplicados a modelagem do coração. 2006. 0 f. Iniciação Científica. (Graduando em Ciencia da Computacao) - Universidade Federal de Juiz de Fora, Universidade Federal de Juiz de Fora. Orientador: Rodrigo Weber dos Santos. |
| 8. | Elisa Portes dos Santos. Algoritmos Genéticos aplicados ao problema inverso da eletrofisilogia cardíaca. 2006. 0 f. Iniciação Científica. (Graduando em Ciencia da Computacao) - Universidade Federal de Juiz de Fora, Universidade Federal de Juiz de Fora. Orientador: Rodrigo Weber dos Santos. |
| 9. | Carol Ribeiro Xavier. Implementações distribuídas de algoritmos genéticos para o problema de estimativa de parâmetros das equações do Bidomínio. 2006. 0 f. Iniciação Científica. (Graduando em Ciencia da Computacao) - Universidade Federal de Juiz de Fora, Universidade Federal de Juiz de Fora- UFJF. Orientador: Rodrigo Weber dos Santos. |
| 10. | Bernardo Lino de Oliveira. Processamento de Imagens de Ressonância Magnética Cardíaca. 2006. Iniciação Científica. (Graduando em Ciencia da Computacao) - Universidade Federal de Juiz de Fora, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rodrigo Weber dos Santos. |
| 11. | Marcelino Campos Oliveira Silva. Métodos matemáticos para a modelagem da eletrofisiologia cardíaca. 2006. Iniciação Científica. (Graduando em Ciencia da Computacao) - Universidade Federal de Juiz de Fora, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rodrigo Weber dos Santos. |
| 12. | Daniele Carvalho Oliveira. Métodos numéricos e gráficos aplicados a modelagem do coração. 2005. 12 f. Iniciação Científica. (Graduando em Ciencia da Computacao) - Universidade Federal de Juiz de Fora, Universidade Federal de Juiz de Fora. Orientador: Rodrigo Weber dos Santos. |
| 13. | Ronan Mendonça Amorim. Metalinguagens XML e CellML aplicadas à modelagem eletrofisiológica. 2005. 0 f. Iniciação Científica. (Graduando em Ciencia da Computacao) - Universidade Federal de Juiz de Fora, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rodrigo Weber dos Santos. |
| 14. | Bernardo Lino de Oliveira. Computação gráfica e processamento de imagens aplicados a ressonância magnética. 2005. 0 f. Iniciação Científica. (Graduando em Ciencia da Computacao) - Universidade Federal de Juiz de Fora, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rodrigo Weber dos Santos. |
| Orientações de outra natureza |
| 1. | Fernando Otaviano Campos. Algoritmos paralelos e interfaces gráficas para a eletro-fisiologia cardíaca computacional. 2006. 44 f. Orientação de outra natureza - Universidade Federal de Juiz de Fora, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rodrigo Weber dos Santos. |
| 2. | Leandro Neumann Ciuffo. Servidor Web para a neurofisiologia e a eletro-fisiologia cardíaca computacionais. 2006. 47 f. Orientação de outra natureza - Universidade Federal de Juiz de Fora. Orientador: Rodrigo Weber dos Santos. |
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