Junior Barrera

  • Endereço para acessar este CV: http://lattes.cnpq.br/0362417828475021
  • Última atualização do currículo em 10/10/2018


possui graduação em Engenharia Elétrica pela Escola Politécnica da Universidade de São Paulo (1983); mestrado em Computação Aplicada pelo Instituto Nacional de Pesquisas Espaciais (1987); doutorado em Engenharia Elétrica pela Escola Politécnica da Universidade de São Paulo (1992) - parte da pesquisa realizada na École National des Mines de Paris; livre docência pelo Instituto de Matemática e Estatística da USP (1998); titularidade em Ciência da Computação pelo Instituto de Matemática e Estatística da USP (2005) e pela Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto (2008). Atualmente, é professor titular do Departamento de Ciência da Computação do IME-USP. Tem experiência na área de Ciência da Computação, com ênfase em Matemática da Computação, tendo realizado desenvolvimentos teóricos nos seguintes temas: morfologia matemática, aprendizado de operadores morfológicos, modelagem e identificação de sistemas dinâmicos de reticulado. Ainda, tem realizado aplicações dessas técnicas em processamento e análise de imagens, vídeo digital, análise de expressão gênica, modelagem de sistemas biológicos e esportes coletivos de invasão. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Junior Barrera
Nome em citações bibliográficas
BARRERA, Junior;BARRERA, JUNIOR;Júnior Barrera;Barrera, Júnior

Endereço


Endereço Profissional
Universidade de São Paulo, Instituto de Matemática e Estatística.
Rua do Matão
Butantã
05508090 - São Paulo, SP - Brasil
Telefone: (11) 30916135
Fax: (11) 30916134
URL da Homepage: www.esience.ime.usp.br


Formação acadêmica/titulação


1988 - 1992
Doutorado em Engenharia Elétrica Sistemas.
Escola Politécnica da Universidade de São Paulo, POLI/USP, Brasil.
com período sanduíche em Ecole Nationale Supérieure des Mines de Paris (Orientador: Jean Serra).
Título: Uma abordagem unificada para os problemas de visão computacional: a morfologia matemática, Ano de obtenção: 1992.
Orientador: Gerald Jean Francis Banon.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
Palavras-chave: Decomposição de operadores de reticulado; Morfologia matemática.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
1984 - 1987
Mestrado em Computação Aplicada.
Instituto Nacional de Pesquisas Espaciais, INPE, Brasil.
Título: Uma abordagem unificada para os problemas de Processamento Digital de Imagens: a Morfologia Matemática,Ano de Obtenção: 1987.
Orientador: Nelson D'àvila Mascarenhas.
Coorientador: Dr. Gerald Jean Francis Banon.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
Palavras-chave: Processamento digital de imagens; Morfologia matemática.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
1981 interrompida
Graduação interrompida em 1983 em Filosofia.
Faculdade de Filosofia, Letras e Ciencias Humanas, FFLCH, Brasil.
Ano de interrupção: 1983
1978 - 1983
Graduação em Engenharia Elétrica.
Escola Politécnica da Universidade de São Paulo, POLI/USP, Brasil.
Título: Controle Automático - Projeto e simulação de um controlador para um reator nuclear.
Orientador: Roberto de Moura Sales.


Livre-docência


1998
Livre-docência.
Instituto de Matemática e Estatística Usp, IME / USP, Brasil.
Título: Morfologia matemática: teoria, sistemas e aplicações, Ano de obtenção: 1998.
Palavras-chave: Morfologia matemática.


Formação Complementar


1992 - 2005
Professor Titular em Ciência da Computação.
Instituto de Matemática e Estatística da USP, IME-USP, Brasil.


Atuação Profissional



Instituto de Matemática e Estatística da USP, IME-USP, Brasil.
Vínculo institucional

2016 - Atual
Vínculo: , Enquadramento Funcional:


Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Vínculo institucional

2011 - Atual
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor titular, Regime: Dedicação exclusiva.

Vínculo institucional

2008 - 2011
Vínculo: , Enquadramento Funcional: Professor Titular do DFM/FFCLRP, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Vínculo institucional

2005 - 2008
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Titular do DCC/IME-USP, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Vínculo institucional

1998 - 2005
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Associado do DCC/IME-USP, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Vínculo institucional

1992 - 1998
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: professor doutor do DCC/IME-USP, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

01/2012 - Atual
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Matemática e Estatística, .

Cargo ou função
Membro do conselho do departamento de ciência da computação.
3/2003 - Atual
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Matemática e Estatística, Departamento de Ciência da Computação.

Cargo ou função
Membro da Congregação do IME-USP.
2/2002 - Atual
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Matemática e Estatística, .

Cargo ou função
Membro da Comissão de Pós-Graduação do Programa de Doutorado em Bioinformática da USP.
06/1992 - Atual
Pesquisa e desenvolvimento , Instituto de Matemática e Estatística, .

05/1992 - Atual
Pesquisa e desenvolvimento , Instituto de Matemática e Estatística, .

1/1992 - Atual
Ensino, Ciências da Computação, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Processamento Digital de Imagens: Teoria e Aplicações
Bases da Morfologia Matemática para Análise de Imagens
Aprendizado Computacional: Teoria, Algoritmos e Aplicações
1/1992 - Atual
Ensino, Ciência da Computação, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Introdução a Computação
Estrutura de Dados
Algebra Booleana
Processamento de Imagens
Morfologia Matematica
Computação Grafica
Aprendizado Computacional
01/2012 - 01/2014
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Matemática e Estatística, .

Cargo ou função
2012-2013: membro da CAS de Ciência da Computação da USP.
07/2005 - 09/2008
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Matemática e Estatística, .

Cargo ou função
Presidente da Comissão de Pesquisa do IME-USP.
6/2003 - 6/2005
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Matemática e Estatística, Departamento de Ciência da Computação.

Cargo ou função
Membro da Comissão de Pesquisa do IME-USP.
11/2000 - 11/2004
Direção e administração, Instituto de Matemática e Estatística, .

Cargo ou função
Coordenador Científico do Núcleo de Pesquisa em Bioinformática da USP.
7/2003 - 7/2004
Extensão universitária , Instituto de Matemática e Estatística, Departamento de Ciência da Computação.

Atividade de extensão realizada
Mini-curso: Microarrays. II Latin-American Course on Bioinformatics for Tropical Disease Research..
5/2002 - 5/2004
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Matemática e Estatística, Departamento de Ciência da Computação.

Cargo ou função
Vice-presidente da Comissão de Pós-Graduação do Programa de Doutorado em Bioinformática da USP.
6/2000 - 6/2003
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Matemática e Estatística, Departamento de Ciência da Computação.

Cargo ou função
Membro da Comissão de Pesquisa do IME-USP.
4/2001 - 4/2003
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Matemática e Estatística, Departamento de Ciência da Computação.

Cargo ou função
Membro do Conselho do Depto. de Ciência da Computação.
2/2000 - 8/2002
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Matemática e Estatística, Departamento de Ciência da Computação.

Cargo ou função
Presidente da Comissão de Pesquisa do IME-USP.
8/1998 - 8/2001
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Matemática e Estatística, Departamento de Ciência da Computação.

Cargo ou função
Representante do DCC na Comissão de Cultura e Extensão (suplente).
4/1994 - 4/1999
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Matemática e Estatística, Departamento de Ciência da Computação.

Cargo ou função
Representante do DCC na Comissão de Iniciação Científica (suplente).
9/1995 - 9/1997
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Matemática e Estatística, Departamento de Ciência da Computação.

Cargo ou função
Vice-coordenador da Comissão de Informática do IME-USP.
1/1996 - 1/1996
Extensão universitária , Instituto de Matemática e Estatística, Departamento de Ciência da Computação.

Atividade de extensão realizada
Mini-curso: Automatic Programming of Morphological Machines. Brazilian Workshop on Mathematical Morphology.
3/1993 - 3/1995
Direção e administração, Instituto de Matemática e Estatística, .

Cargo ou função
Vice Diretor do Centro de Ensino de Computação do IME-USP.
1/1995 - 1/1995
Extensão universitária , Instituto de Matemática e Estatística, Departamento de Ciência da Computação.

Atividade de extensão realizada
Mini-curso: Morfologia Matemática. Parte prática. Workshop de Morfologia Matemática..
1/1994 - 1/1994
Extensão universitária , Instituto de Matemática e Estatística, Departamento de Ciência da Computação.

Atividade de extensão realizada
Mini-curso: Bases da Morfologia Matemática para Análise de Imagens Binárias. IX Escola de Computação - UFPE..
1/1993 - 1/1993
Extensão universitária , Instituto de Matemática e Estatística, Departamento de Ciência da Computação.

Atividade de extensão realizada
Mini-curso: Processamento Digital de Imagens. Parte prática. EBAI..
1/1992 - 1/1992
Extensão universitária , Instituto de Matemática e Estatística, Departamento de Ciência da Computação.

Atividade de extensão realizada
Mini-curso: Overview of Mathematical Morphology. SIBGRAPI..

Instituto Nacional de Pesquisas Espaciais, INPE, Brasil.
Vínculo institucional

1985 - 1992
Vínculo: Servidor público ou celetista, Enquadramento Funcional: pesquisador assistente, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

01/1985 - 06/1992
Pesquisa e desenvolvimento , Divisão de Processamento de Imagens, .

1/1991 - 1/1992
Extensão universitária , Divisão de Processamento de Imagens, .

Atividade de extensão realizada
Mini-curso: Introduction to Digital Image Processing. Curso Internacional de Sensoriamento Remoto..
1/1991 - 1/1992
Extensão universitária , Divisão de Processamento de Imagens, .

Atividade de extensão realizada
Mini-curso: Introduction to Digital Image Processing. Curso Internacional de Sensoriamento Remoto..
12/1988 - 12/1989
Estágios , Ëcole des Mines de Paris, .

Estágio realizado
Doutorado Sanduíche na Ëcole des Mines de Paris, orientado pelo Dr. Jean Serra, na área de Morfologia Matemática..

Instituto Butantan, IBU, Brasil.
Vínculo institucional

2013 - Atual
Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Pesquisador colaborador

Atividades

01/2013 - Atual
Pesquisa e desenvolvimento , CeTICS - Centro de Toxinas, Imuno-Resposta e Sinalização Celular, .


Universidade Federal do Rio Grande do Norte, UFRN, Brasil.
Vínculo institucional

2016 - Atual
Vínculo: Professor PosGrad BIOINFO, Enquadramento Funcional: Professor Convidado



Linhas de pesquisa


1.
Aplicações da Morfologia Matemática em Análise de Imagens

Objetivo: Aplicar os sistemas computacionais desenvolvidos e as técnicas de Morfologia Matemática estudadas na solução de problemas reais de análise de imagens..
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Setores de atividade: Aeronáutica e Espaço; Agricultura, Pecuária, Silvicultura, Exploração Florestal.
Palavras-chave: Análise de imagens; Morfologia Matematica.
2.
Desenvolvmento de sistemas computacionais para análise de imagens

Objetivo: Desenhar e implementar sistemas computacionais para análise de imagens por Morfologia Matemática..
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Setores de atividade: Aeronáutica e Espaço; Agricultura, Pecuária, Silvicultura, Exploração Florestal.
Palavras-chave: Análise de imagens; Segmentacao de Imagens; Sistemas de Processamento de Imagens.
3.
Pesquisa teórica em Morfologia Matemática

Objetivo: Estudar famílias de operadores morfológicos e suas decomposições em termos de operadores elementares da Morfologia Matemática (erosão, dilatação, anti-erosão, anti-dilatação)..
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Setores de atividade: Aeronáutica e Espaço; Agricultura, Pecuária, Silvicultura, Exploração Florestal.
Palavras-chave: complete lattice; Decomposição de operador; Morfologia Matematica.
4.
Pesquisa teórica em representação de operadores morfológicos
5.
Projeto e desenvolvimento de ambientes computacionais para morfologia matematica
6.
Aplicação dos ambientes computacionais desenvolvidos em problemas reais de análise de imagens
7.
Pesquisa teórica sobre o projeto de operadores morfológicos por aprendizado computacional
8.
Aplicação das técnicas de projeto de operadores a problemas reais de processamento de imagens
9.
Pesquisa teorica em otimização pelo modelo U-curve
10.
Aplicações do modelo U-curve a problemas reais de otimização
11.
Modelagem de redes de expressão gênica pelo modelo PGN
12.
Inferência de redes de expressão gênica
13.
inferência de vias de sinalização celulares
14.
Modelagem, simulação e análise de sistemas multia-agentes formado por dois times competindo
15.
Modelagem, identificação e simulação de vias de sinalização celular


Projetos de pesquisa


2016 - Atual
torage, Modeling and Analysis of Dynamical Systems for e-Science Applications.

Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) João Eduardo Ferreira em 01/08/2018.
Descrição: The astonishing fast rate of technology evolution has given rise to a new era of scientific knowledge discovery. This new age of science, known as e-Science, is described as the new great computational and multidisciplinary team science requiring novel methodologies for data storage, modeling and analysis. In particular, the development of transactional and analytical software systems for e-Science applications when viewed from a dynamic systems perspective, presents a number of new computational challenges. Among them are the scientific knowledge discovery processes, which involve frequent changes of requirements for data storage, modeling and analysis. The need to address scientific dynamic systems in order to cope with complex applications of e-Science has woken up the scientific community for the development of robust and evolutionary software systems to meet these new challenges. Dynamical system is the classical mathematical formalism to represent phenomena that evolute with time, which are of great interest in science. In this project, our main goal is to develop computational models and methodologies to support e-Science applications viewed as dynamic systems. Our fundamental research covers three key research areas, namely storage, modeling, and analysis of dynamic systems. These research areas are significant and relevant to the FAPESP e-Science Program since many of the present e-Science challenges are related to the proper treatment of dynamic systems. Hence, we plan to develop and apply computational methodologies that will ease the development of e-Science applications, thereby contributing to the improvement of worldwide scientific knowledge, while respecting legal and ethical restrictions in data management...
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2016 - Atual
INCT da Internet do Futuro para Cidades Inteligentes
Descrição: bjetivo: Desenvolvimento de modelos, técnicas, métodos e sistemas de software visando à melhoria da vida da população urbana por meio da utilização da tecnologia da informação e da comunicação. Essa pesquisa envolve técnicas avançadas de Computação em Nuvem, Internet das Coisas, Computação de Alto Desempenho, Engenharia de Software, Big Data e Aprendizado de Máquina...
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2014 - Atual
Biologia Sistêmica do Câncer

Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Sandro José de Souza em 10/02/2016.
Descrição: Rede de pesquisa, extensão e ensino financiada pela Capes. Para maiores detalhes, ver http://neuro.ufrn.br/bsc. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2013 - Atual
CeTICS - Centro de Toxinas, Imuno-Resposta e Sinalização Celulkar

Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Hugo Aguirre Armelin em 09/02/2014.
Descrição: No Instituto Butantan toxinologia e regulação da resposta imune são, tradicionalmente, áreas conexas de pesquisa científica e desenvolvimento biotecnológico, através das quais o Instituto, historicamente, construiu sua reputação internacional de excelência. Na cultura do Instituto, venenos são misturas complexas de toxinas, selecionadas ao longo da evolução para sinergicamente exercerem efeitos biológicos sistêmicos, através de mecanismos bioquímicos, moleculares e celulares altamente específicos. Portanto, a análise química de venenos tem boas chances de levar à descoberta de novas moléculas de toxinas com potencial terapêutico. Essas premissas foram seguidas com sucesso por pesquisadores do Centro de Toxinologia Aplicada (CAT CEPID-FAPESP), projeto iniciado há 10 anos, que isolaram, caracterizaram quimicamente e patentearam diversas toxinas de natureza proteica, que se tornaram pontos de partida para desenvolvimento de inovação farmacêutica em parceria com indústrias locais. A ênfase em proteínas e peptídeos levou o CAT CEPID a instalar laboratórios no estado da arte para transcriptômica, proteômica, biologia molecular do DNA recombinante e síntese de peptídeos. Mais recentemente, estudos dos mecanismos de ação, bioquímicas, moleculares e celulares, dessas promissoras moléculas foram iniciados com o objetivo de estabelecer provas de conceito. Assim, o CAT estabeleceu, no Instituto Butantan, as condições iniciais para a criação de um centro de toxinas e resposta imune fundamentado nas abordagens atuais da biologia sistêmica. Por conseguinte, 10 pesquisadores, entre os mais competitivos do Instituto Butantan, propõem a criação do novo Centro de Toxinas, Resposta-imune e Sinalização Celular, com aspirações a centro de excelência de classe mundial, aproveitando a histórica reputação internacional do Butantan e o sucesso recente do CAT CEPID. O Plano de pesquisa do Centro Integra subprojetos voltados para a pesquisa científica com subprojetos de vocação para a inovação tecnológica. Um grande grupo de cientistas seniores do Instituto Butantan, de outras instituições brasileiras e de renomadas instituições estrangeiras serão colaboradores do Centro proposto. (AU).
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (1) .
Integrantes: Junior Barrera - Integrante / Hugo Aguirre Armelin - Coordenador.
2012 - Atual
NAP ESCIENCE
Descrição: Análise e nodelagem de fenômenos naturais mensuráveis por técnicas matemático computacionais..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2009 - 2010
Modelagem do ciclo celular
Descrição: Este projeto visa construir modelos quantitativos que permitam prever fenõmenos relacionados com o ciclo celular..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2005 - 2010
Modelagem por redes (grafos) e técnicas de reconhecimento de padrões: estrutura, dinâmica e aplicações
Descrição: Dentre os desafios enfrentados atualmente pela pesquisa em reconhecimento de padrões, cabe ressaltar três linhas fundamentais: (a) problemas em que elementos devem ser descritos estruturalmente através de uma rede indicando conexões entre tais elementos; (b) problemas envolvendo a evolução da informação ao longo de alguma variável independente (e.g. tempo, no caso de sequências de vídeo); (c) problemas envolvendo ambos aspectos, i.e. uma rede de elementos cuja dinâmica evolui ao longo de alguma variável independente. O presente projeto temático, unindo os grupos de visão do IME-USP e IFSC-USP, além de pesquisadores colaboradores de outras instituições, prevê o estudo, desenvolvimento e aplicação de técnicas de reconhecimento de padrões com esses três ítens formando o tema de integração da pesquisa. Além da área de reconhecimento de padrões, o projeto inclui técnicas e problemas de visão computacional, processamento de imagens e de sinais e bioinformática, todas sendo áreas de trabalho dos pesquisadores proponentes..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2004 - Atual
Biomedical Research Informatics for Global Health Training Program - BRIGHT
Descrição: Projeto conjunto com o IME-USP, MIT e Harvard Medical School, no qual aplicaremos técnicas de análise de imagens por nós desenvolvidas para resolução de problemas em expressão gênica e bioinformática..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) .
Integrantes: Junior Barrera - Coordenador / Lucila Ohno Machado - Integrante / Richard Maas - Integrante / Eduardo Massad - Integrante.
2002 - 2007
Aproximação Genômica e Pós-Genômica ao Estudo da Malária Humana na Amazônia Brasileira
Descrição: Análise de dados de biologia molecular, particularmente de expressão gênica, para entender mecanismos biológicos presentes no parasita da malária..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) .
Integrantes: Junior Barrera - Coordenador / Hernando A del Portillo Obando - Integrante.
2002 - 2004
Identificação de Genes que Regulam Fenótipos de Interesse em Agropecuária através da Análise Computacional de Seqüências de Expressão
Descrição: Análise de dados de biologia molecular, particularmente de expressão gênica, para pesquisar melhorias vegetais e animais..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) .
Integrantes: Junior Barrera - Coordenador.
2002 - 2004
Cursos / Organização Mundial da Saúde
Descrição: Organização de cursos de Bioinformática de curta duração para alunos latino-americanos..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) .
Integrantes: Junior Barrera - Coordenador / Hernando A del Portillo Obando - Integrante.
2000 - 2005
Cooperation for Gene Analysis Expression
Descrição: Desenvolver técnicas de análise de expressão gênica e aplica-las ao entendimento de Problemas biológicos, como o controle do ciclo celular..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) .
Integrantes: Junior Barrera - Coordenador / Hugo Aguirre Armelin - Integrante.


Membro de corpo editorial


2007 - Atual
Periódico: EURASIP Journal on System Biology and Bioinformatics
2001 - 2006
Periódico: Pattern Recognition
2000 - 2002
Periódico: Image Analysis and Stereology
1999 - 2004
Periódico: Journal of Electronic Imaging - SPIE


Membro de comitê de assessoramento


1992 - Atual
Agência de fomento: Fundação de Amparo à Pesquisa do Espírito Santo
1992 - Atual
Agência de fomento: Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
1992 - Atual
Agência de fomento: Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior


Revisor de periódico


1998 - Atual
Periódico: SIAM Review
1998 - Atual
Periódico: Nature Genetics
1991 - Atual
Periódico: SIAM Journal on Applied Mathematics
1998 - Atual
Periódico: PAMI-IEEE
1998 - Atual
Periódico: Journal of Mathematical Image and Vision
1998 - Atual
Periódico: Signal Processing
1998 - Atual
Periódico: Pattern Recognition Letters
1998 - Atual
Periódico: Computer Vision and Image Understanding
1998 - Atual
Periódico: Real-Time Imaging
1998 - Atual
Periódico: Optical Engineering
1998 - Atual
Periódico: Journal of Computational Biology
1998 - Atual
Periódico: Bioinformatics (Oxford)
1998 - Atual
Periódico: Journal of Electronic Imaging (Online)
1998 - Atual
Periódico: Image Analysis and Stereology
1998 - Atual
Periódico: BMC Bioinformatics


Revisor de projeto de fomento


1992 - Atual
Agência de fomento: Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
1992 - Atual
Agência de fomento: Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
1992 - Atual
Agência de fomento: Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo
1992 - Atual
Agência de fomento: Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Matemática da Computação.
2.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação/Especialidade: Processamento Gráfico (Graphics).
3.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação/Especialidade: Sistemas de Informação.
4.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.
5.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Quantitativa.


Idiomas


Português
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Espanhol
Compreende Bem, Fala Pouco, Lê Bem, Escreve Pouco.
Francês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.


Prêmios e títulos


2008
Professor Titular da Faculdade de Filosofia Ciências e Letras da USP de Ribeirão Preto, Departamento de Física e Matemática da FFCLRP.
2007
Presidente da Assoicação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, .
2005
Professor Titular do Instituto de Matemática e Estatística da USP, Depto de Ciência da Computação do IME-USP.
2004
Melhor apresentação no CAMDA 2004, Critical Assessment of Microarray Data Analysis / Duke University.
2004
Membro do Comitê Assessor Externo da EMBRAPA Informática Agropecuária, CNPTIA - EMBRAPA.
2004
Vice-presidente da AB3C, Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional.
2002
Participação de duas bancas de doutorado na Universidade de Amsterdam, Universidade de Amsterdam, Holanda.
1996
Orientador da dissertação primeira colocada em concurso da SBC, Sociedade Brasileira de Computação.
1992
Uma das três melhores teses de doutorado da USP em Ciências Exatas em 1992, Universidade de São Paulo.
1983
Segundo colocado em concurso de trabalhos de iniciação científica da SBC, Sociedade Brasileira de Computação.


Produções



Produção bibliográfica
Artigos completos publicados em periódicos

1.
ATASHPAZ-GARGARI, ESMAEIL2018ATASHPAZ-GARGARI, ESMAEIL ; Reis, Marcelo S. ; BRAGA-NETO, ULISSES M. ; BARRERA, JUNIOR ; DOUGHERTY, EDWARD R. . A fast Branch-and-Bound algorithm for U-curve feature selection. PATTERN RECOGNITION, v. 73, p. 172-188, 2018.

2.
MARCONDES, DIEGO2018MARCONDES, DIEGO ; SIMONIS, ADILSON ; BARRERA, JUNIOR . Feature Selection based on the Local Lift Dependence Scale. Entropy, v. 20, p. 97, 2018.

3.
LAMAS, LEONARDO2018LAMAS, LEONARDO ; DREZNER, RENE ; OTRANTO, GUILHERME ; BARRERA, JUNIOR ; DENG, YONG . Analytic method for evaluating players’ decisions in team sports: Applications to the soccer goalkeeper. PLoS One, v. 13, p. e0191431, 2018.

4.
Reis, Marcelo S.2018Reis, Marcelo S. ; Estrela, G. ; FERREIRA, C. E. ; BARRERA, Junior . Optimal Boolean lattice-based algorithms for the U-curve optimization problem. INFORMATION SCIENCES, v. 471, p. 97-114, 2018.

5.
REIS, MARCELO2017REIS, MARCELO ; Estrela, G. ; FERREIRA, C. E. ; BARRERA, Junior . featsel: A framework for benchmarking of feature selection algorithms and cost functions. SoftwareX, v. 6, p. 193-197, 2017.

6.
BARRERA2016BARRERA ; FONSECA, ANDRÉ ; GUBITOSO, MARCO ; REIS, MARCELO ; de Souza SJ ; BARRERA, Junior . A New Approach for Identification of Cancer-related Pathways using Protein Networks and Genomic Data. Cancer Informatics, v. 14, p. 139-149, 2016.

7.
CUBAS, CARLOS FERNANDO MONTOYA2015CUBAS, CARLOS FERNANDO MONTOYA ; MARTINS-JR, DAVID CORREA ; SANTOS, CARLOS SILVA ; BARRERA, JUNIOR . Linear grouping of predictor instances to infer gene networks. Network Modeling Analysis in Health Informatics and Bioinformatics, v. 4, p. 34, 2015.

8.
Santana, F.2015Santana, F. ; ROSTAISER, E. ; SHERZER, E. ; UGRINOWITSCH, C. ; BARRERA, Junior ; LAMAS, L. . Space protection dynamics validation in basketball and innovative teams' evaluation.. Motriz : Revista de Educação Física (Online), v. 21, p. 34-44, 2015.

9.
LAMAS, L.2014LAMAS, L. ; BARRERA, Junior ; Otranto, G. ; UGRINOWITSCH, C. . Invasion team sports: strategy and match modelling. International Journal of Performance Analysis in Sport, v. 14, p. 307-329, 2014.

10.
Lopes, Fabrício M.2014Lopes, Fabrício M. ; MARTINS JR, David Corrêa ; BARRERA, Junior ; Cesar, Roberto M. . A feature selection technique for inference of graphs from their known topological properties: Revealing scale-free gene regulatory networks. Information Sciences, v. 272, p. 1-15, 2014.

11.
TREPODE, NESTOR W.2013TREPODE, NESTOR W. ; DE FARIAS, CLÉVER R.G. ; BARRERA, JUNIOR . A pattern-oriented specification of gene network inference processes. Computers in Biology and Medicine, v. 43, p. 1415-1427, 2013.

12.
LIMA, L. A.2012LIMA, L. A. ; Lima, Leandro de A. ; BARRERA, Junior ; RIS, M. ; BRENTANI, M. M. ; BRENTANI, H. . Computing a Predictor Set Influence Zone through a Multi-Layer Genetic Network to Explore the Role of Estrogen in Breast Cancer. Advances in Breast Cancer Research, v. 01, p. 21-29, 2012.

13.
LAMAS, L.2012LAMAS, L. ; BARRERA, Junior ; Otranto, G. ; UGRINOWITSCH, C. . Elementos estruturais de um modelo formal dos esportes coletivos de invasão.. Revista Brasileira de Educacao Fisica e Esporte, v. 26, p. 765-778, 2012.

14.
NAJMAN, LAURENT2012NAJMAN, LAURENT ; BARRERA, JUNIOR ; SAGAR, B. S. DAYA ; MARAGOS, PETROS ; SCHONFELD, DAN . Introduction to the Issue on Filtering and Segmentation With Mathematical Morphology. IEEE Journal of Selected Topics in Signal Processing, v. 6, p. 737-738, 2012.

15.
DANTAS, D. O.2011DANTAS, D. O. ; BARRERA, Junior . Automatic generation of wrapper code for vídeo processing functions. Learning and Nonlinear Models, v. 9, p. 130-137, 2011.

16.
RIS, Marcelo2010RIS, Marcelo ; BARRERA, Junior ; MARTINS JR, D C . U-curve: A branch-and-bound optimization algorithm for U-shaped cost functions on Boolean lattices applied to the feature selection problem. Pattern Recognition, v. 43, p. 557-568, 2010.

17.
DELLAMONICA, D.2007DELLAMONICA, D. ; SILVA, P J S ; Humes Jr ; HIRATA, N. S. T. ; BARRERA, Junior . An Exact Algorithm for Optimal MAE Stack Filter Design. IEEE Transactions on Image Processing, v. 16, p. 453-462, 2007.

18.
TREPODE, N. W.2007TREPODE, N. W. ; ARMELIN, H. A. ; BITTNER, M ; BARRERA, Junior ; GUBITOSO, M. D. ; HASHIMOTO, R.F. . A Robust Structural PGN Model for Control of Cell-Cycle Progression Stabilized by Negative Feedbacks. EURASIP Journal on Bioinformatics and Systems Biology (Online), v. 2007, p. 73109-73120, 2007.

19.
BARRERA, Junior;BARRERA, JUNIOR;Júnior Barrera;Barrera, Júnior2007BARRERA, Junior; CESAR JR, Roberto Marcondes ; Humes Jr ; MARTINS JR, David Corrêa ; PATRAO, D. F. C. ; SILVA, Paulo J S ; Bretani, H. . A feature selection approach for identification of signature genes from SAGE data. BMC Bioinformatics, v. 8, p. 1, 2007.

20.
Stransky, B.2007Stransky, B. ; MACHADO, Lucila Ohno ; BARRERA, Junior ; Souza, S. J. . MODELING CANCER: INTEGRATION OF OMICS INFORMATION IN DYNAMIC SYSTEMS. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, v. 5, p. 977-986, 2007.

21.
MARTINS JR, D C2006MARTINS JR, D C ; CESAR JR, Roberto M ; BARRERA, Junior . W-operator window design by minimization of mean conditional entropy. Pattern Analysis and Applications, v. 9, p. 139-153, 2006.

22.
SILVA, Paulo J S2005SILVA, Paulo J S ; HASHIMOTO, Ronaldo F ; KIM, Seungchan ; BARRERA, Junior ; BRANDÃO, Leônidas O ; SUH, Edward ; DOUGHERTY, Edward R . Feature selection algorithms to find strong genes. Pattern Recognition Letters, v. 26, p. 1444-1453, 2005.

23.
HIRATA, N. S. T.2005HIRATA, N. S. T. ; BARRERA, Junior . A Unifying View for Stack Filter Design Based on Graph Search Methods. Pattern Recognition, v. 38, p. 2088-2098, 2005.

24.
BRUN, Marcel2004BRUN, Marcel ; HIRATA JR, Roberto ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R . Nonlinear filter design using envelopes. Journal Of Mathematical Image And Vision, Estados Unidos, v. 21, n.1, p. 81-97, 2004.

25.
BARRERA, Junior;BARRERA, JUNIOR;Júnior Barrera;Barrera, Júnior2004BARRERA, Junior; TORRES, Martha . A parallel algorithm for finding small sets of genes that are enough to distinguish two biological states. Genetics and Molecular Biology, Brasil, v. 27, n.4, p. 686-690, 2004.

26.
COSTA, Luciano da Fontoura2004COSTA, Luciano da Fontoura ; CESAR JR, Roberto Marcondes ; BARRERA, JUNIOR . Editorial - Special section on Bioinformatics. Genetics and Molecular Biology (Impresso), v. 27, p. 604-604, 2004.

27.
BARRERA, Junior;BARRERA, JUNIOR;Júnior Barrera;Barrera, Júnior2004BARRERA, Junior; CESAR JUNIOR, R. M. ; FERREIRA, J. E. ; GUBITOSO, M. D. . An environment for knowledge discovery in Biology. Computers in Medicine and Biology, v. 34, p. 427-447, 2004.

28.
HASHIMOTO, R. F.2003HASHIMOTO, R. F. ; BARRERA, Junior . A greedy algorithm for decomposing convex structuring elements. Journal of Mathematical Imaging and Vision, v. 8, p. 269-289, 2003.

29.
BRUN, Marcel2003BRUN, Marcel ; DOUGHERTY, Edward R ; HIRATA JR, R. ; BARRERA, Junior . Design of optimal binary filters under joint multiresolution-envelope constraint.. Pattern recognition letters, v. 24, p. 937-945, 2003.

30.
HASHIMOTO, R. F.2002HASHIMOTO, R. F. ; BARRERA, Junior . A note on Park and Chin algorithm. IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence, v. 24, n.1, p. 139-144, 2002.

31.
DOUGHERTY, Edward R2002DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior ; BRUN, Marcel ; KIM, S ; CESAR JR, Roberto Marcondes ; CHEN, Y. ; BITNER, M. ; TRENT, J. . Inference from clustering with application to gene expression microarrays. Journal of Computational Biology, Estados Unidos, v. 9, n.1, p. 105-126, 2002.

32.
KIM, S2002KIM, S ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R ; CHEN, Y. ; BITNER, M. ; TRENT, J. . Strong feature sets from small samples. Journal of Computational Biology, v. 9, n.1, p. 127-146, 2002.

33.
HIRATA JR, R.2002HIRATA JR, R. ; BRUN, Marcel ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R . Multiresolution design of aperture operators. Journal of Mathematical Image and Vision, v. 19, p. 199-222, 2002.

34.
HIRATA JR, R.2002HIRATA JR, R. ; BARRERA, Junior ; HASHIMOTO, Ronaldo F ; DANTAS, D. O. ; ESTEVES, G. P. . Segmentation of microarray images by mathematical morphology. Real time imaging, Estados Unidos, v. 8, p. 491-505, 2002.

35.
DOUGHERTY, Edward R2002DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior . Pattern recognition theory in nonlinear signal processing. Journal of Mathematical Imaging and Vision, v. 16, p. 181-197, 2002.

36.
DOUGHERTY, Edward R2001 DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior ; MOZELLEL, Gerard ; BRUN, Marcel . Multiresolution Analysis for Optimal Binary Filters. Journal Of Mathematical Image And Vision, v. 14, n.1, p. 53-72, 2001.

37.
BARRERA, Junior;BARRERA, JUNIOR;Júnior Barrera;Barrera, Júnior2001BARRERA, Junior; HASHIMOTO, R. F. . From the sup-decomposition to sequential decompositions. Journal of Mathematical Imaging And Vision, v. 15, n.3, p. 197-216, 2001.

38.
BARRERA, Junior;BARRERA, JUNIOR;Júnior Barrera;Barrera, Júnior2001BARRERA, Junior; HASHIMOTO, R. F. . Sub-compact and inf-compact representations of W-operators. Fundamenta Informaticae, v. 45, n.4, p. 283-294, 2001.

39.
TOMITA, N. S.2000TOMITA, N. S. ; DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior . Iterative Design of Morphological Binary Image Operators. Optical Engineering (Bellingham), v. 39, n.12, p. 3106-3123, 2000.

40.
HASHIMOTO, Ronaldo F2000HASHIMOTO, Ronaldo F ; BARRERA, Junior ; FERREIRA, C. E. . A combinatorial optimization technique for the sequential decomposition of erosions and dilations. Journal Of Mathematical Image And Vision, v. 14, n.1, p. 17-33, 2000.

41.
BARRERA, Junior;BARRERA, JUNIOR;Júnior Barrera;Barrera, Júnior2000BARRERA, Junior; DOUGHERTY, Edward R ; BRUN, Marcel . Hybrid human-machine binary morphological operator design. Signal Processing, v. 80, p. 1469-1487, 2000.

42.
TOMITA, N. S. T.2000TOMITA, N. S. T. ; DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior . A switching algorithm for design of optimal increasing binary filters over large windows. Pattern Recognition, v. 33, n.6, p. 1059-1081, 2000.

43.
BARRERA, Junior;BARRERA, JUNIOR;Júnior Barrera;Barrera, Júnior2000 BARRERA, Junior; DOUGHERTY, Edward R ; HIRATA JR, R. . Aperture filters. Signal Processing, v. 80, n.4, p. 697-721, 2000.

44.
BARRERA, Junior;BARRERA, JUNIOR;Júnior Barrera;Barrera, Júnior2000BARRERA, Junior; TERADA, R. ; HIRATA JR, R. ; TOMITA, N. S. T. . Automatic programming of morphological machines by PAC learning. Fundamenta Informaticae, v. 41, p. 229-258, 2000.

45.
KAMAT, V.2000KAMAT, V. ; DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior . Multiresolution Bayesian design of binary filters. Electronic Imaging, v. 9, n.3, p. 283-295, 2000.

46.
BARRERA, Junior;BARRERA, JUNIOR;Júnior Barrera;Barrera, Júnior1998BARRERA, Junior; BANON, G. J. F. ; LOTUFO, R. A. . MMach: a mathematical morphology toolbox for the Khoros system. Photo Electronic Imaging, v. 6, n.1, p. 54-67, 1998.

47.
BARRERA, Junior;BARRERA, JUNIOR;Júnior Barrera;Barrera, Júnior1997BARRERA, Junior; DOUGHERTY, Edward R ; TOMITA, N. S. T. . Design of optimal morphological operators from prior filters. Acta Steriologica, v. 16, n.3, p. 193-200, 1997.

48.
DOUGHERTY, Edward R1997DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior . Bayesian design of optimal morphological operators based on prior distributions for conditional probabilities. Acta Steriologica, v. 16, n.3, p. 167-174, 1997.

49.
BARRERA, Junior;BARRERA, JUNIOR;Júnior Barrera;Barrera, Júnior1997 BARRERA, Junior; DOUGHERTY, Edward R ; TOMITA, N. S. T. . Automatic programming of binary morphological machines by design of statistically optimal operators in the context of computational learning theory. Photo Electronic Imaging, v. 6, n.1, p. 54-67, 1997.

50.
BARRERA, Junior;BARRERA, JUNIOR;Júnior Barrera;Barrera, Júnior1996BARRERA, Junior; SALAS, G. P. . Set operations on collections of closed intervals and their applications to the automatic programming of morphological machines. Photo Electronic Imaging, v. 1, p. 335-352, 1996.

51.
BANON, G. J. F.1993 BANON, G. J. F. ; BARRERA, Junior . Decomposition of mappings between complete lattices by Mathematical Morphology. Signal Processing, v. 30, p. 299-327, 1993.

52.
BANON, G. J. F.1991 BANON, G. J. F. ; BARRERA, Junior . Minimal representation for translation invariant set mappings by Mathematical Morphology. SIAM Journal on Applied Mathematics, v. 51, n.6, p. 1782-1798, 1991.

53.
BANON, G. J. F.1989BANON, G. J. F. ; BARRERA, Junior . Morphological filtering for stripping correction of SPOT images. Photogrametria, v. 43, p. 195-205, 1989.

Livros publicados/organizados ou edições
1.
BANON, G. J. F. (Org.) ; BARRERA, Junior (Org.) ; BRAGA NETO, U. M. (Org.) . Mathematical Morphology and its applications to Signal and Image Processing. 1. ed. São José dos Campos: INPE, 2007. v. 200. 475p .

2.
COSTA, Luciano da Fontoura (Org.) ; CESAR JR, Roberto Marcondes (Org.) ; BARRERA, Junior (Org.) . Genetics and Molecular Biology. Special Section on Bioinformatics.. Brazilian Society for Genetics, 2004.

3.
COSTA, Luciano da Fontoura (Org.) ; BARRERA, Junior (Org.) ; KOSLOW, Steven (Org.) ; CESAR JR, Roberto M (Org.) . Real-Time Imaging. Special Issue on Image Processing for Molecular Biology. Elsevier, 2004.

4.
BARRERA, Junior; ASTOLA, Jaakko (Org.) . Journal of Electronic Imaging. Special Issue on Nonlinear Image Processing. SPIE, 1997.

5.
BANON, G. J. F. ; BARRERA, Junior . Bases da Morfologia Matemática para Análise de Imagens. Recife: Escola de Computacao, 1994. v. 1. 250p .

Capítulos de livros publicados
1.
Reis, Marcelo S. ; Noël, Vincent ; Dias, Matheus H. ; Albuquerque, Layra L. ; Guimarães, Amanda S. ; Wu, Lulu ; BARRERA, JUNIOR ; Armelin, Hugo A. . An Interdisciplinary Approach for Designing Kinetic Models of the Ras/MAPK Signaling Pathway. In: Paul Huang; Aik Choon Tan. (Org.). Methods in Molecular Biology. 1ed.New York: Springer New York, 2017, v. 1636, p. 455-474.

2.
DURHAM, A. ; SETUBAL, J. C. ; BARRERA, Junior . Interdisciplinaridade em ação na pesquisa e pós-graduação em bioinformática. In: Arlindo Philippi Jr Valdir Fernandes. (Org.). Práticas da Interdisciplinaridade no Ensino e Pesquisa. 1ed.Barueri: Manole, 2015, v. , p. 619-642.

3.
LAMAS, L. ; BARRERA, Junior ; Santana, F. ; UGRINOWITSCH, C. . Team sports modeling: building a framework for quantitative approaches.. In: Juarez Vieira do Nascimento; Valmor Ramos; Fernando Tavares. (Org.). Jogos Desportivos: Formação e Investigação. 1ed.Florianópolis: EUDESC, 2013, v. 2013, p. 439-462.

4.
BARRERA, Junior; BANON, G. J. F. ; DOUGHERTY, Edward R . Automatic design of morphological operators. In: Michel Bilodeau, Fernand Meyer, Michel Schimitt. (Org.). Space, Structure and Randomness. : Springer, 2007, v. 1, p. -.

5.
BARRERA, Junior; CESAR JUNIOR, R. M. ; MARTINS JR, David Corrêa ; VÊNCIO, R Z ; MERINO, E F ; YAMAMOTO, M M ; LEONARDI, Florência G ; PEREIRA, C A B ; Obano, H. P. . Constructing probabilistic genetic networks of Plasmodium falciparum from dynamical expression signals of the intraerythrocytic development cycle. In: In: J Shoemaker et al. (Org.).. (Org.). Methods of Microarray Data Analysis. : Springer Verlag, 2006, v. 5, p. -.

6.
HIRATA JR, Roberto ; BARRERA, Junior ; BRUN, Marcel ; DOUGHERTY, E R . Aperture filtures: theory, application and multi-resolution analysis.. In: Stephen Marshall; Giovanni L. Sicuranza.. (Org.). ADVANCES ON NONLINEAR SIGNAL AND IMAGE PROCESSING.. 1ed.: Hindawi Publishing Corporation, 2005, v. 6, p. 15-45.

7.
BARRERA, Junior; TERADA, R. ; HIRATA JR, R. ; HIRATA, N. S. T. . Automatic Programming of Morphological Machines. In: Henk Heijmans; John Goutsias. (Org.). Mathematical Morphology. : , 2000, v. , p. 229-258.

8.
DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior . Logical Image operators. In: Edward R. Dougherty; Jaakko A. Astola. (Org.). Nonlinear filters for image processing. : SPIE, 1999, v. , p. 1-58.

9.
DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior . Computational Gray-Scale Operators. In: Edward R. Dougherty; Jaakko A. Astola. (Org.). Non linear filters for image processing. : IEEE-SPIE, 1999, v. , p. 61-96.

Textos em jornais de notícias/revistas
1.
BARRERA, Junior. O ingresso de estudantes na USP: um problema estratégico para o desenvolvimento nacional. Jornal da USP, USP - São Paulo, p. 2 - 2, 01 fev. 2016.

2.
BARRERA, Junior. A mathematical morphology toolbox for Matlab. Electronic Imaging, SPIE/IS & T. International Technical Working Group Newsletter, , v. 8, 01 jan. 1998.

3.
DIAS, L. A. V. ; C NETO, G. ; BARRERA, Junior ; SOUZA, R. C. M. . Imagens e computadores: uma nova fronteira. Ciência Hoje, , v. 7 - 37, p. 35 - 44.

4.
BARRERA, Junior. Equívoco na Definição das faixas etárias na base. Cidade do Futebol, Cidade do Futebol.

5.
BARRERA, Junior. Um modelo de inteligência do jogador de futebol. Cidade do Futebol.

Trabalhos completos publicados em anais de congressos
1.
LAMAS, L. ; Otranto, G. ; BARRERA, Junior . Computational system for strategy design and match simulation in team sports.. In: 10th International Symposium on Computer Science in Spor, 2015, Berlin. Advances in Intelligent Systems and Computing series. Berlin: Springer, 2015. p. xx-xx.

2.
LAMAS, L. ; Santana, F. ; Otranto, G. ; BARRERA, Junior . Inference of team sports strategies based on a library of states: application to basketball. In: In KDDD 2014 - Workshop on Large Scale Sports Analytics, 2014, New York. Workshop on Large Scale Sports Analytics, 2014. v. 1. p. 1-8.

3.
Montoya Cubas, C. F. ; MARTINS JR, David C ; Santos, C. S. ; BARRERA, Junior . Gene network Inference through linear grouping of variables. In: Conference on Bioinformatics and Bioengineering, 2014, Boca Raton. IEEE Conference on Bioinformatics and Bioengineering, 2014. p. 243.

4.
REIS, M. S. ; BARRERA, Junior . Solving problems in mathematical morphology through reduction to the U-curve problem. In: ISMM - Mathematical Morphology and its applications to Signal and Image Processing, 2013, Uppsala, Sweden. 11th International Symposium, ISMM 2013. v. 11. p. 49-60.

5.
CASTRO, J. E. S. ; HASHIMOTO, Ronaldo F ; BARRERA, Junior . Analytical Solutions for Minkowski Addition Equation. In: ISMM 2013 - Mathematical Morphology and its applications to Signal and Image Processing, 2013, Uppsala, Sweden. 11th International Symposium, ISMM 2013, 2013. v. 11. p. 61-72.

6.
MIRANDA, G. ; SOARES, E. ; BARRERA, Junior ; Felipe, J. C. . Method to Support Diagnosis of Cervical Intraepithelial Neoplasia (CIN) Based on Structural Analysis of Histological Images.. In: 25th IEEE International Symposium on Computer-Based Medical Systems, 2012, 2012, Roma. Proceedings of the 25th IEEE International Symposium on Computer-Based Medical Systems, 2012, 2012. v. 1.

7.
MIRANDA, G. ; BARRERA, Junior ; SOARES, E. ; Felipe, J. C. . Method for Computational Analysis of histopathological images to Support the Diagnosis of Cervical Cancer.. In: SIBGRAPI, 2012, Ouro Preto. Workshop of Theses and Dissertations (SIBGRAPI 2012), 2012, Ouro Preto, MG. Anais WTD, 2012. v. 1.

8.
LOPES, Fabrício M. ; MARTINS JR, David ; BARRERA, Junior ; CESAR JR, Roberto M . SFFS-MR: a floating search strategy for GRNs inference. In: 5th IAPR International Conference on Pattern Recognition in Bioinformatics (PRIB, 2010, Nijmegen, The Netherlands. 5th IAPR International Conference on Pattern Recognition in Bioinformatics (PRIB), 2010, Nijmegen. Lecture Notes in Computer Science.. Berlin / Heidelberg: Springer-Verlag, 2010. v. 6282. p. 407-418.

9.
HIRATA, N. S. T. ; HIRATA JR, Roberto ; BARRERA, Junior . Basis Computation Algorithm. In: International Symposium on Mathematical Morphology, 2007, Rio de Janeiro. Basis Computation Algorithms. São José dos Campos: INPE, 2007. p. 15-26.

10.
BARRERA, Junior; HASHIMOTO, R F . Binary Decision Diagrams as a New Paradigm for Morphological Machines. In: International Symposium on Mathematical Morphology, 2005, Paris. proceedings of the 7th International Symposium on Mathematical Morphology. Paris, 2005. p. 3-12.

11.
VAQUERO, Daniel André ; BARRERA, Junior ; HIRATA JR, R. . A maximum likelyhood approach for multi-resolution W-operator design. In: SIBGRAPI, 2005, Natal. SIBGRAPI, 2005.

12.
MARTINS JR, David Corrêa ; CESAR JR, Roberto Marcondes ; BARRERA, Junior . Automatic window design for gray-scale image processing based on entropy minimization.. In: CIARP, 2005, Havana. CIARP, 2005, 2005.

13.
RIS, Marcelo ; BARRERA, Junior ; Bretani, H. . U-curve search for biological state characterization and genetic network design.. In: GENSIPS, IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics,, 2005, New Port. GENSIPS, IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics,, 2005.

14.
TREPODE, Nestor W ; ARMELIN, H. A. ; BITNER, M. ; BARRERA, Junior ; GUBITOSO, M. D. ; HASHIMOTO, R. F. . Modeling cell cycle regulation by discrete dynamical systems.. In: GENSIPS, IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics, 2005, New Port. GENSIPS, IEEE International Workshop on Genomic Signal Processing and Statistics, 2005.

15.
MARTINS JR, David Corrêa ; CESAR JR, Roberto Marcondes ; BARRERA, Junior . W-operator window design by maximization of training data information. In: Brazilian Simposium on Computer Graphics and Image Processing, 2004, Curitiba, 2004. p. 162-169.

16.
BARRERA, Junior; CESAR JR, Roberto Marcondes ; MERINO, E F ; PEREIRA, C A B ; VÊNCIO, R Z ; LEONARDI, F G ; YAMAMOTO, M M ; PORTILLO, H A . A new annotation tool for malaria based on inference of probabilistic genetic networks. In: Critical Assessment of Microarray Data Analysis (CAMDA 2004), 2004, Durham, 2004. p. 36-40.

17.
BARRERA, Junior; CESAR JR, Roberto M ; DANTAS, Daniel de O ; MARTINS JR, David C ; TREPODE, Nestor W . From microarray images to biological knowledge. In: Simpósio Brasileiro em Matemática e Biologia Computacional, 2003, Rio de Janeiro. Simpósio Brasileiro em Matemática e Biologia Computacional - E-papers, 2003.

18.
TORRES, Martha ; BARRERA, Junior ; GOLDMAN, A. . Parallel algorithm for enumerating combinations. In: International Conference on Parallel Processing (ICPP'03), 2003. Proceedings the 2003 international conference on parallel processing, 2003. v. 1. p. 581-588.

19.
HIRATA, N. S. T. ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R ; TERADA, R. . The incremental splitting of intervals algorithm for the design of binary image operators. In: international Symposium of Mathematical Morphology, 2002, Sydney. ISMM 2002, 2002. p. 219-227.

20.
BARRERA, Junior; MARTIN, P. A. ; DOUGHERTY, Edward R ; GUBITOSO, M. D. . Identification of input-free finite lattice dynamical systems under envelope constraints. In: International Symposium on Mathematical Morphology, 2002, Sydney. ISMM 2002, 2002. p. 337-345.

21.
TORRES, Martha ; BARRERA, Junior ; HIRATA, N. S. T. . A high performance algorithm for Boolean function minimization: the partioned incremental splitting of intervals (PISI). In: SPIE 2002, 2002, San Jose. SPIE 2002, 2002. v. 4667. p. 386-395.

22.
BRUN, Marcel ; BALAGURUNATHAN, Y. ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, E.R. . Clustering granulometric features. In: SPIE 2002, 2002. Image Processing: Algorithms and Systems, 2002. v. 4667. p. 36-42.

23.
BALAGURUNATHAN, Y. ; HASHIMOTO, R.F. ; KIM, S. ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, E.R. . Granulometric classifiers from small samples. In: SPIE 2002, 2002. Image Processing: Algorithms and Systems, 2002. v. 4667. p. 100-108.

24.
DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior ; BRUN, Marcel ; KIM, S ; CESAR JUNIOR, R. M. ; CHEN, Y. ; BITNER, M. ; TRENT, J. . Time series inference from clustering. In: SPIE Microarrays: Optical Technologies and Informatics, 2001, San Jose. SPIE Microarrays: Optical Technologies and Informatics. San Jose: SPIE, 2001. v. 4266. p. 222-227.

25.
KIM, S ; DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior ; CHEN, Y. ; BITNER, M. ; TRENT, J. . Finding Robust Linear Expression-Based Classifiers. In: SPIE Microarrays: Optical Technologies and Informatics, 2001, San Jose. SPIE Microarrays: Optical Technologies and informatics. San Jose: SPIE, 2001. v. 4266. p. 207-212.

26.
ARMELIN, H. A. ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R ; GUBITOSO, M. D. ; FERREIRA, J. E. ; HIRATA, N. S. T. ; NEVES, E. J. . A simulator for gene expression networks. In: SPIE Microarrays: Optical Technologies and Informatics, 2001, San Jose. SPIE Microarrays: Optical Technologies and informatics. San Jose: SPIE, 2001. v. 4266. p. 248-259.

27.
HIRATA JR, R. ; BARRERA, Junior ; HASHIMOTO, Ronaldo F ; DANTAS, D. O. . Microarray gridding by mathematical morphology. In: SIBGRAPI, 2001, Florianópolis. SIBGRAPI. p. 112-119.

28.
BRUN, Marcel ; HIRATA JR, R. ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R . Hybrid human-machine non-linear filter design using envelopes. In: SIBGRAPI, 2001, Florianópolis. SIBGRAPI, 2001. p. 106-111.

29.
HIRATA JR, R. ; BRUN, Marcel ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R . Image restoration by multiresolution aperture filters. In: NonLinear Image Processing and Pattern Analysis XII, 2001, San Jose. NonLinear Image Processing and Pattern Analysis XII, 2001. v. 4304. p. 256-264.

30.
BRUN, Marcel ; BARRERA, Junior ; HIRATA, N. S. T. ; TREPODE, N. W. ; DANTAS, D. O. ; TERADA, R. . Multiresolution classification trees in OCR design. In: SIBGRAPI, 2001, Florianopolis. SIBGRAPI 2001, 2001. p. 59-66.

31.
DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior ; GUBITOSO, M. D. ; HIRATA, N. S. T. . Dynamical systems with morphological transitions. In: NSIP, 2001, Baltmor. Non Linear Signal Processing, 2001.

32.
BARRERA, Junior; DOUGHERTY, Edward R ; GUBITOSO, M. D. ; HIRATA, N. S. T. . Modeling temporal morphological systems via lattice dynamical systems. In: Non Linear Image Processing and Pattern Analysis XII - SPIE, 2001, San Jose. Non linear image processing and pattern analysis XII, 2001. v. 4304. p. 265-276.

33.
DOUGHERTY, E R ; BARRERA, Junior . Nonlinear filtering and pattern recognition: are they the same?. In: Nonlinear Image Processing and Pattern Analysis XII, 2001. Proceedings of SPIE. v. 4304. p. 1-6.

34.
BARRERA, Junior; BRUN, Marcel ; TERADA, R. . Boosting OCR classifier by optimal edge noise filtering. In: International Simposium on Mathematical Morphology, 2000, Palo Alto. Mathematical Morphology and Its Applications to Image and Signal Processing. p. 371-380.

35.
HIRATA JR, R. ; DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior . Some applications of aperture filters. In: International Simposium on Mathematical Morphology, 2000, Palo Alto. Mathematical Morphology and its applications to Image and Signal Processing, 2000. p. 119-128.

36.
DOUGHERTY, Edward R ; KIM, S ; MOZELLE, G. ; BARRERA, Junior ; BRUN, Marcel . Multiresolution filter design. In: Conference of the International Society for Optical Engineering, 2000, San Jose. Non Linear Image Processing, 2000. v. 3961. p. 12-21.

37.
KAMAT, V. ; DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior . Bayesian Multiresolution filter design. In: SPIE Nonlinear Image processing, 2000, San Jose. SPIE Nonlinear Image Processing, 2000. v. 3961. p. 22-33.

38.
BARRERA, Junior; DOUGHERTY, Edward R . Design of Statistically Optimal Morphological Operators. In: European Signal Processing Conference, 2000, Tampera. European Signal Processing Conference, 2000.

39.
HIRATA JR, R. ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R . Design of Gray-Scale Nonlinear filters via multiresolution apertures. In: European Signal Processing Conference, 2000, Tampere. European Signal Processing Conference.

40.
HIRATA, N. S. T. ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R . Bayesian Switching algorithm for the optimal increasing binary filter. In: European Signal Processing Conference, 2000, Tampere. European Signal Processing Conference, 2000. v. IV. p. 1889-1892.

41.
HIRATA, N. S. T. ; BARRERA, Junior ; TERADA, R. . Text segmentation by automatically designed morphological operators. In: Brazilian Simposium on Computer Graphics and Image Processing, 2000, Gramado. Brazilian Simposium on Computer Graphics and Image Processing, 2000. p. 284-291.

42.
HIRATA JR, R. ; FLORES, F. C. ; BARRERA, Junior ; LOTUFO, R. A. ; MEYER, F. . Color Image Gradients for Morphological Segmentation. In: Brazilian Simposium on Computer Graphics and Image Processing, 2000, Gramado. Brazilian Simposium on Computer Graphics and Image Processing, 2000. p. 316-323.

43.
BARRERA, Junior; FLORES, F. C. ; HIRATA JR, R. ; LOTUFO, R. A. ; MEYER, F. . Morphological operators for segmentation of color images. In: Brazilian Simposium on Computer Graphics and Image Processing, 2000, Gramado. Brazilian Simposium on Computer Graphics and Image Processing, 2000. p. 300-307.

44.
HASHIMOTO, R F ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, E R . From the sup-decomposition to a sequential decomposition. In: International Simposium on Mathematical Morphology, 2000, Palo Alto. Mathematical Morphology and Its Applications to Image and Signal Processing, 2000. p. 13-22.

45.
MADEIRA, H. M. ; BARRERA, Junior . Incremental evaluation of BDD-represented set operaators. In: Brazilian Simposium on Computer Graphics and Image Processing, 2000, Gramado. Brazilian Simposium on Computer Graphics and Image Processing, 2000. p. 308-315.

46.
BARRERA, Junior; DOUGHERTY, Edward R ; BRUN, Marcel . Hybrid human-machine binary morphological operator design. In: Conference of the International Society for Optical Engineering, 1999, San Jose. Nonlinear Image Processing, 1999. v. 3646. p. 162-173.

47.
BARRERA, Junior; TOMITA, N. S. T. ; DOUGHERTY, Edward R . Efficient switching algorithm for designing binary filters. In: Conference of the International Society for Optical Engineering, 1999, San Jose. Nonlinear Image processing, 1999. v. 3646. p. 185-196.

48.
BARRERA, Junior; DOUGHERTY, Edward R ; HIRATA JR, R. . Optimal range-domain window filters. In: Conference of the International Society for Mathematical Morphology, 1999, San Jose. Nonlinear Image Processing, 1999. v. 3646.

49.
BARRERA, Junior. Design of morphological set operators by statistical optimization. In: IEEE-EURASIP Workshop on Nonlinear Signal and Image Processing, 1999, Antalia. Nonlinear Signal and Image Processing (NSIP '99), 1999. p. 185-189.

50.
DOUGHERTY, Edward R ; BITNER, M. ; CHEN, Y. ; KIM, S ; SILVAKUMAR, K. ; BARRERA, Junior ; MELTZER, P. ; TRENT, J. . Nonlinear filters in genomic control. In: IEEE-EURASIP Workshop in Nonlinear Signal and Image Processing, 1999, Antalia. Nonlinear Signal and Image Processing (NSIP '99), 1999. p. 10-15.

51.
HIRATA JR, R. ; BARRERA, Junior ; FLORES, F. C. ; LOTUFO, R. A. . Automatic dessign of morphological operators for motion segmentation. In: Brazilian Symposium on Computer Graphics, Image Processing and Vision, 1999, Campinas. Computer Graphics, Image Processing and Vision, 1999. p. 283-292.

52.
TOMITA, N. S. T. ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R . Design of Statistically Optimal Stack Filters. In: Brazilian Symposium on Computer Graphics and Image Processing, 1999, Campinas. SIBGRAPI, 1999. p. 265-274.

53.
MADEIRA, H. M. ; BARRERA, Junior ; HIRATA JR, R. ; TOMITA, N. S. T. . A new paradigma for architectures of morphological machines: binary decision diagrams. In: Brazilian Symposium on Computer Graphics and Image Processing, 1999, Campinas. SIBGRAPI, 1999. p. 293-301.

54.
BARRERA, Junior; HASHIMOTO, Ronaldo F . A simple algorithm for decomposing convex structuring elements. In: Brazilian Symposium on Computer Graphics and Image Processing, 1999, Campinas. SIBGRAPI, 1999. p. 293-301.

55.
BARRERA, Junior; DOUGHERTY, Edward R . Representation of gray-scale windowed operators. In: International Simposium on Mathematical Morphology, 1998, Amsterdam. Mathematical Morphology and its applications to Image and Signal Processing, 1998. p. 19-26.

56.
DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior . Prior information in the design of optimal binary filters. In: International Simposium on Mathematical Morphology, 1998, Amsterdam. Mathematical Morphology and its applications to Image and Signal Processing, 1998. p. 259-266.

57.
BARRERA, Junior; FERREIRA, C. E. ; HASHIMOTO, Ronaldo F . Finding optimal sequential decomposition of erosions and dilations. In: International Simposium on Mathematical Morphology, 1998, Amsterdam. Mathematical Morphology and its applications to Image and Signal Processing. p. 299-306.

58.
DOUGHERTY, Edward R ; GREGORYAN, A. M. ; BARRERA, Junior ; TOMITA, N. S. T. . Binary filter design optimization, prior information and robustness. In: Conference of the International Society for Optical Engineering, 1998, Orlando. Mathematical Modeling and Estimation Techniques in Computer Vision, 1998. v. 3457. p. 230-241.

59.
TOMITA, N. S. T. ; DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior . Design of large window binary filters via iteration. In: Conference of the International Society for Optical Engineering, 1998, Boston. Intelligent Robots and Computer Vision, 1998. v. 3422. p. 173-182.

60.
BARRERA, Junior; TERADA, R. ; LOTUFO, R. A. ; HIRATA JR, R. ; TOMITA, N. S. T. . An OCR based on Mathematical Morphology. In: Conference of the International Society for Optical Engineering, 1998, San Jose. Non Linear Image Processing, 1998. v. 3304. p. 19720.

61.
BARRERA, Junior; BRUN, Marcel . Translation invariant transformations of discrete random sets. In: Brazilian Symposium on Computer Graphics and Image Processing, 1998, Rio de Janeiro. SUBGRAPI, 1998. p. 450-455.

62.
BARRERA, Junior; HIRATA JR, R. . Fast algorithms to compute the elementary operators of Maathematical Morphology. In: BrazilianSymposium on Computer Graphics and Image Processing, 1997, Campos do Jordão. SIBGRAPI, 1997. p. 163-170.

63.
BARRERA, Junior; ZAMPIROLLI, F. A. ; LOTUFO, R. A. . Morphological operators characterized by neighbourhood graphs. In: Brazilian Symposium on Computer Graphics and Image Processing, 1997, Campos do Jordão. SIBGRAPI, 1997. p. 179-186.

64.
HIRATA JR, R. ; BARRERA, Junior ; LOTUFO, R. A. . A tutorial on image segmentation via mathematical morphology with Khoros. In: Khoros workshop, 1997, Albuquerquue. Khoros '97 Proceedings. p. 192-206.

65.
DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior . Optimal filters from prior filters. In: Conference of the International Society for Mathematical Morphology, 1997, San Jose. Nonlinear Image Processing, 1997. v. 3026. p. 2-7.

66.
BARRERA, Junior; SALAS, G. P. . Set operations on collections of closed intervals and their applications to the automatic programming of MMach's. In: International Simposium on Mathematical Morphology, 1996, Atlanta. Mathematical Morphology and its applications to Image and Signal Processing, 1996. p. 377-384.

67.
BARRERA, Junior; TERADA, R. ; SILVA, F. S. C. ; TOMITA, N. S. T. . Automatic programming of MMach's for OCR. In: International Simposium on Mathematical Morphology, 1996, Atlanta. Mathematical Morphology and its applications to Image and Signal Processing, 1996. p. 385-392.

68.
DOUGHERTY, Edward R ; BARRERA, Junior . Morphological paradigma for loss function-based design of morphological filters. In: Conference of the Society for Optical Engineering, 1996, Orlando. Visual Information Processing, 1996. v. 2753. p. 3-10.

69.
TOMITA, N. S. T. ; BARRERA, Junior . Programação automática de máquinas morfológicas binárias baseada em aprendizagem PAC. In: XXIII SEMISH, 1996, Recife. XXIII SEMISH, 1996. p. 517-525.

70.
BARRERA, Junior; TOMITA, N. S. T. ; SILVA, F. S. C. ; TERADA, R. . Automatic programming of binary morphological machines by PAC learning. In: Conference of the International Society fr Optical Engineering, 1995, San Diego. Neural, Morphological and Stochastic Methods in Image and Signal Processing, 1995. v. 2568. p. 233-244.

71.
SILVA, F. S. C. ; BARRERA, Junior . Automating the generation of proceduress to analyse binary images. In: Simpósio Brasileiro de Computação Gráfica e Processamento de imagens, 1995, Curitiba. SIBGRAPI, 1995.

72.
BANON, G. J. F. ; BARRERA, Junior . Set operator decomposition and conditionally translation invariant elementary operators. In: International Simposium on Mathematical Morphology, 1994, Fontainebleau. Mathematical Morphology and its applications to Image and Signal Processing, 1994. p. 5-12.

73.
BARRERA, Junior; SILVA, F. S. C. ; BANON, G. J. F. . Automatic programming of binary morphological machines. In: Conference of the International Society for Optical Engineering, 1994, San Diego. Image Algebra and Morphological Image Processing, 1994. v. 2300. p. 229-240.

74.
BARRERA, Junior; BANON, G. J. F. ; LOTUFO, R. A. . A Mathematical Morphology toolbox for the Khoros system. In: Conference of the International Society for mathematical Morphology, 1994, San Diego. Image algebra and mathematical Morphology, 1994. v. 2300. p. 241-252.

75.
BARRERA, Junior. A decomposition theorem in Mathematical Morphology. In: International Simposium on Mathematical Morphology, 1993, Barcelona. Mathematical Morphology and its applications to Image and Signal Processing, 1993. p. 234-237.

76.
BARRERA, Junior; BANON, G. J. F. . Expressiveness of the morphological language. In: Conference of the International Society for Optical Engineering, 1992, San Diego. Image Algebra and Morphological Image processing, 1992. v. 1769. p. 264-275.

77.
BARRERA, Junior. Estudo da proliferação celular por análise de imagens. In: Simpósio Brassileiro de Computação Gráfica e Processamento de Imagens, 1991, Sãao Paulo. SIBGRAPI '91, 1991. p. 201-212.

78.
BANON, G. J. F. ; BARRERA, Junior . Morphological filtering for stripping correction of SPOT images. In: Simpósio Brasileiro de Computação Gráfica e Processamento de Imagens, 1988, Itaipava. SIBGRAPI, 1988. p. 132-143.

79.
II, F. A. M. ; DIAS, L. A. V. ; DÁLGE, J. C. ; BARRERA, Junior . Mudança automática no traçado de contornos por ocasião de redução de escala utilizando a Morfologia matemática. In: Simpósio Brasileiro de Sensoriamento Remto, 1988, Natal. Simpósio Brasileiro de Sensoriamento Remoto, 1988.

80.
ROSIM, S. ; MARCONDES, S. P. ; MONTEIRO, A. M. ; DUTRA, L. V. ; BARRERA, Junior . ANIMA: analisador de imagens aplicado a sensoriamento remoto. In: Simpósio Brasileiro de Sensoriamento Remoto, 1988, Natal. Simpósio Brasileiro de Sensoriamento Remoto, 1988.

81.
BARRERA, Junior; MASCARENHAS, N. D. ; BANON, G. J. F. . Aplicações da Morfologia Matemática. In: SEMISH, 1987, Salvador. SEMISH, 1987. p. 72-87.

82.
SANTELLANO, J. ; BARRERA, Junior . Sistemas de Processamento de Imagens. In: Simpósio Brasileiro do Microfilme, 1986, São Paulo. Simpósio Brasileiro do Microfilme, 1986.

83.
BARRERA, Junior; DUTRA, L V ; MASCARENHAS, N D A ; MONTEIRA, A M V ; ROSIM, S . Anima: sistema de análise morfológica de imagens microscópicas. In: I Congresso Brasileiro de Informática em Saúde, 1986, Campinas, 1986.

84.
GUICHOU, C. ; BARRERA, Junior . Um instrumento de análise de imagens: por computadora morfologia matemática. In: SEMISH, 1985, Porto Alegre. SEMISH, 1985.

Resumos expandidos publicados em anais de congressos
1.
NOEL, V. ; REIS, M. S. ; Dias, M.H.S ; Nakano, F. ; BARRERA, Junior ; ARMELIN, H A . Design and analysis of dynamical models of biochemical reaction networks.. In: Symmetry and Dynamics in Biology: From experimental analysis to mathematical modeling, 2015, São Paulo., 2015, São Paulo. Proceedings of SDB 2015,, 2015.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
NOEL, V. ; REIS, MARCELO ; Dias, M.H.S ; Wu, L. ; G. S., Amanda ; REVERBEL, D. F. ; BARRERA, Junior ; ARMELIN, H. A. . A web-based framework for designing kinetic models of molecular signaling networks. In: COMBINE 2016, 2016, 2016, Newcastle upon Tyne. COMBINE 2016 abstracts.

2.
REIS, MARCELO ; Dias, M.H.S ; NOEL, V. ; FONSECA, C. S. ; ALBUQUERQUE, L. L. ; Nakano, F. ; BARRERA, Junior ; ARMELIN, H A . Mathematical modeling of the K-Ras switch in the K-Ras-driven mouse Y1 adrenocortical tumor cells provides insights into molecular mechanisms of FGF2-induced cell cycle arrest.. In: 17th International Conference on Systems Biology (ICSB 2016), 2016, 2016, Barcelona. Proceedings of the 17th International Conference on Systems Biology, 2016.

3.
REIS, M. S. ; DIAS, M. ; Nakano, F. ; BARRERA, Junior ; ARMELIN, H A . Mathematical Modeling of RAs/MAPK signalling network kinetics provides insights into mechanisms of FGF2-induced cell cycle arrest in the K-K-ras-driven mouse Y1 adrenocortical timor cells. In: RECOMB 2014, 2014, Pittsburgh. Book of Abstracts. p. 126-126.

4.
REIS, M. S. ; NISHYAMA, M. Y. ; SILVA, D. F. ; JUNQUEIRA-DE-AZEVEDO, I. L. M. ; DA-CUNHA, J. P. C. ; BARRERA, Junior ; IWAI, L. K. ; SERRANO, S. ; ARMELIN, H A . CeTICSdb: a plataform for interdisciplinary research that allows quantitative and qualitative-omics analyses and mathematical modelling of signalling networks. In: RECOMB 2014, 2014, Pittsburgh. Book of Abstracts, 2014. p. 128-128.

5.
REIS, M. S. ; NOEL, V. ; DIAS, M. H. S. ; ALBUQUERQUE, L. L. ; Nakano, F. ; BARRERA, Junior ; ARMELIN, H. A. . Mathematical modelling of the cross talk between Ras/MAPK and P13K/Akt signalling pathways in the K-Ras-driven mouse Y1 adrenocortical tumor cells provides insights into de mechanism of FGF2-driven cell cycle arrest.. In: The 15th international conference on System Biology (ICSB 2014), 2014, Melbourne. Proceedings of the ICSB 2014, 2014.

6.
REIS, M. S. ; BARRERA, Junior . Estimation of Probabilistic Gene Networks using the UCS feature selection algorithm. In: X-meeting, 2010, Ouro preto. Proceddings of the 6th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology. p. SBN15-SBN15.

7.
Reis, Marcelo ; BARRERA, Junior . Assessment of prediction methods for the estimation of Probabilistic Gene Networks. In: X-meeting, 2009, Angra dos Reis. International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2009. p. 68-68.

8.
MARTINS JR, D C ; CESAR JR, R M ; BARRERA, Junior . Genetic network architecture identification by conditional entropy analysis. In: 1o International Conference on Bioinformatics and Computational Biology, 2003, Ribeirão Preto, 2003.

9.
TREPODE, N W ; ARMELIN, H A ; BITTNER, M ; BARRERA, Junior ; GUBITOSO, M D . An approach for studying genetic networks: discreted dynamical system simulation. A case study: the cell cycle. In: 1º International Conference on Bioinformatics and Computational Biology, 2003, Ribeirão Preto, 2003.

10.
TORRES, M ; BARRERA, Junior . A parallel algorithm to find small sets of genes that are enough to distinguish two biological states. In: International Conference on Bioinformatics and Computational Biology, 2003, Ribeirão Preto. Icobicobi 2003, 2003.

11.
TORRES, M ; BARRERA, Junior . A parallel algorithm for agglomerative hierarchical clustering using complete link. In: International Conference on Bioinformatics and Computational Biology, 2003, Ribeirão Preto, 2003.

12.
SILVA, P J S ; HASHIMOTO, R F ; KIM, S ; BARRERA, Junior ; BRANDÃO, L O ; SUH, E ; DOUGHERTY, E R . Feature Selection Algorithms to Find Strong Genes. In: International Conference on Bioinformatics and Computational Biology, 2003, Ribeirão Preto, 2003.

13.
CAREZZATO, C J ; BARRERA, Junior ; SOUZA, S J ; COSTA, L F . Classification of genomic regions by chaos game representation images and fractal dimension. In: International Conference on Bioinformatics and Computational Biology, 2003, Ribeirão Preto.

14.
SOUZA, J e S ; SAKABE, N J ; BARRERA, Junior ; SOUZA, S J . A large-scale study of SNPs in regulatory elements of alternative splicing and their possible relation to human diseases. In: International Conference on Bioinformatics and Computational Biology, 2003, Ribeirão Preto. Icobicobi 2003, 2003.

15.
COSTA, L F ; FABBRI, R ; BARRERA, Junior . Simple Microarray Gridding by a Minimization Procedure on Image Projections. In: International Conference on Bioinformatics and Computational Biology, 2003, Ribeirão Preto, 2003.

16.
BARRERA, Junior; CESAR JR, R M ; FERREIRA, J E ; GUBITOSO, M D . An environment for knowlegde discovery in bioinformatics applications. In: International Conference on Bioinformatics and Computational Biology, 2003, Ribeirão Preto, 2003.

17.
PINTO, C. C. D. A. ; RBILOTTA, C. C. ; BARRERA, Junior . Implementation of a morphological machine for classificatiion of human cromossomes. In: World Congress on Medical Physics and Biomedical Engineering, 1994, Rio de Janeiro. Word Congress on Medical Physics and Biomedical Engineering, 1994.

18.
MASCARENHAS, N. D. ; BARRERA, Junior . Experiência do INPE em Processamento de Imagens Médicas. In: Simpósio Brasileiro de Processamento de Imagens em Medicina, 1991, São Paulo. Simpósio Brasileiro de Processamento de Imagens em Medicina, 1991.

19.
BARRERA, Junior; VINCENT, L. ; RAPHAELA, M. ; MEYER, F. . Étude de la proliferation cellulaire par analise morphologique dímage. In: Cercle Français de Miscroscopie Quantitative, 1989, Paris. Cercle Français de Microscopie Quantitative, 1989.

20.
DUTRA, L. V. ; ROSIM, S. ; MONTEIRO, A. M. ; BARRERA, Junior ; MASCARENHAS, N. D. . An image analysis system: ANIMA. In: International Electronic Imagery & Cnference, 1987, USA. International Electronic Imagery & Conference, 1987.

21.
MASCARENHAS, N. D. ; BARRERA, Junior ; DUTRA, L. V. ; MONTEIRO, A. M. ; ROSIM, S. . Microscopia Computadorizada. In: SEMISH, 1986, Recife. SEMISH, 1986. p. 613-615.

22.
GUICHOU, C. ; BARRERA, Junior . Morfologia em tom de cinza. In: Simpósio Brasileiro de Inteligência Artificial, 1985, São José dos Campos. Simpósio Brasileiro de Inteligência Artificial, 1985.

23.
BARRERA, Junior. Simulação Digital de Redes Neurais. In: SEMISH, 1983, Campinas. SEMISH, 1983. p. 551-555.

24.
BARRERA, Junior; KOHN, A. F. . Simulação de redes neurais usando computador digital. In: Reunião Anual da SBPC, 1983, Campinas. Reunião Anual da SBPC, 1983.

Artigos aceitos para publicação
1.
ATASHPAZ-GARGARI, E. ; REIS, MARCELO ; BRAGA NETO, U. M. ; BARRERA, JUNIOR ; DOUGHERTY, E.R. . A fast branch-and-bound algorithm for U-curve feature selection. PATTERN RECOGNITION, 2017.

Outras produções bibliográficas
1.
BANON, G. J. F. ; BARRERA, Junior . Set mapping decomposition by Mathematical Morphology. Sao Jose dos Campos: INPE, 1999 (Relatorio tecnico).

2.
BARRERA, Junior. Morfologia Matematica: teoria, sistemas e aplicacoes. Sao Paulo: IME-USP, 1998 (Sistematizacao de atividades para livre doscencia).

3.
BARRERA, Junior. Uma abordagem unificada para os problemas de visao computacional: a Morfologia Matematica. Sao Jose dos campos: INPE, 1992 (Tese de doutorado).

4.
BANON, G. J. F. ; BARRERA, Junior . Study of a pair of dual minimal representations for translation invariant set mappings by mathematical morphology. Sao Jose dos Campos: INPE, 1990 (Relatorio tecnico).

5.
SERRA, J. ; BARRERA, Junior . Elements of functional analysis in mathematical morphology. Fontainebleau: CMM-ENSMP, 1989 (Relatorio tecnico).

6.
BARRERA, Junior; VINCENT, L. ; MEYER, F. ; RAPHAELA, M. . Etude de la proliferation cellulaire par analyse morphologique d images. Fontainebleau: CMM-ENSMP, 1989 (Relatorio tecnico).

7.
BARRERA, Junior. Uma abordagem unificada para os problemas de processamento digital de imagens: a morfologia matematica. Sao Jose dos Campos: INPE, 1987 (Dissertacao de mestrado).

8.
BARRERA, Junior. Processamento Digital de Imagens. Sao Jose dos Campos: INPE, 1985 (Relatorio tecnico).


Produção técnica
Programas de computador sem registro
1.
Otranto, G. ; Gomes, T. R. ; GUBITOSO, M. D. ; BARRERA, Junior . Strategy Soccer. 2007.

2.
BARRERA, Junior; LOTUFO, R. A. . SDC morphology toolbox. 1999.

3.
BARRERA, Junior; LOTUFO, R. A. . MMach: a mathematical morphology toolbox for the khoros system. 1997.

4.
BARRERA, Junior; DUTRA, L. V. ; MONTEIRO, A. M. ; ROSIM, S. ; MASCARENHAS, N. D. . ANIMA: analisador de imagens. 1987.

Processos ou técnicas
1.
BRUN, Marcel ; BARRERA, Junior ; KIM, Seungchang ; DOUGHERTY, Edward R . Evaluating Data Clustering Procedures. Patente USP/Texas A&M. 2003.

2.
SILVA, Paulo J S ; BARRERA, Junior ; DOUGHERTY, Edward R . Generating Feature Sets Using Linear Programming. Patente: USP/Texas A&M. 2002.


Demais tipos de produção técnica
1.
BARRERA, Junior; CESAR JR, Roberto M . Análise de Expressão Gênica. 2007. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

2.
BARRERA, Junior; CESAR JR, R M ; SILVA, Paulo J S . Microarrays. 2003. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

3.
BARRERA, Junior; JEULIN, D. ; BANON, G. J. F. . Automatic Programming of Morphological Machines. 1996. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

4.
BARRERA, Junior; LOTUFO, R. A. . Morfologia Matemática - Parte Prática. 1995. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

5.
BANON, G. J. F. ; BARRERA, Junior . Bases da Morfologia Matemática para Análise de Imagens Binárias. 1994. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

6.
BARRERA, Junior; LOTUFO, R. A. . Processamento Digital de Imagens. 1993. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

7.
BARRERA, Junior. Introduction to Digital Image Processing. 1992. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

8.
BARRERA, Junior. Digital Image Processing. 1992. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

9.
SERRA, J. ; BANON, G. J. F. ; BARRERA, Junior . Overview of Mathematical Morphology. 1992. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

10.
BARRERA, Junior. Introduction to Digital Image Processing. 1991. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

11.
BARRERA, Junior. Digital Filters. 1991. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

Demais trabalhos
1.
BARRERA, Junior. Organizador do Primeiro Icobicobi, International Conference on Bioinformatics and Computational Biology, Ribeirão Preto. 2003 (Organização de encontros, simpósios e congressos) .

2.
BARRERA, Junior. Organizador de workshop em Morfologia Matemática para a conferênica da SIAM. 2002 (Organização de encontros, simpósios e congressos) .

3.
BARRERA, Junior. Organizador do curso internacional de Bioinformática, patrocinado pela OMS.. 2002 (Organização de encontros, simpósios e congressos) .

4.
BARRERA, Junior. Revisor de trabalhos para o ISMM (International Symposium on Mathematical Morphology and its Applications to Image and Signal Processing). 2002 (Revisor de trabalhos para conferências) .

5.
BARRERA, Junior. Revisor de trabalhos para o Nonlinear Image Processing and Pattern Analysis / IS&T/SPIE´s 13th Annual Symposium on Electronic Imaging: Science and Technology. 2001 (Revisor de trabalhos para conferências) .

6.
BARRERA, Junior. Revisor de trabalhos para o IEEE Workshop on Scale-Space and Morphology in Computer Vision. 2001 (Revisor de trabalhos para conferências) .

7.
BARRERA, Junior. Revisor de trabalhos para a conferência International Joint Conference IBERAMIA-SBIA, I Workshop on Artificial Intelligence and Computer Vision. 2000 (Revisor de trabalhos para conferências) .

8.
BARRERA, Junior. Revisor de trabalhos para o ISMM (International Symposium on Mathematical Morphology and its Applications to Image and Signal Processing). 2000 (Revisor de trabalhos para conferências) .

9.
BARRERA, Junior. Organizador do Workshop de Morfologia Matemática no SIBGRAPI. 1999 (Organização de encontros, simpósios e congressos) .

10.
BARRERA, Junior. Organizador do Workshop de Morfologia Matemática no SIBGRAPI. 1998 (Organização de encontros, simpósios e congressos) .

11.
BARRERA, Junior. Revisor de trabalhos para o simpósio Mathematical Modeling and Estimation Techniques in Computer Vision. SPIE´s International Symposium on Optical Science, Engineering and Instrumentation. 1998 (Revisor de trabalhos para conferências) .

12.
BARRERA, Junior. Membro da Comissão Organizadora do Brazilian Workshop on Mathematical Morphology. 1997 (Organização de encontros, simpósios e congressos) .

13.
BARRERA, Junior. Revisor de trabalhos para o simpósio Statistical and Scholastic Methods for Image Processing II. SPIE´s International Symposium on Optical Science, Engineering and Instrumentation. 1997 (Revisor de trabalhos para conferências) .

14.
BARRERA, Junior. Membro da Comissão Organizadora do Brazilian Workshop on Mathematical Morphology. 1996 (Organização de encontros, simpósios e congressos) .

15.
BARRERA, Junior. Revisor de trabalhos para o II Workshop on Cybernetic Vision, São Carlos Institute of Physics, University of São Paulo. 1996 (Revisor de trabalhos para conferências) .

16.
BARRERA, Junior. Membro da Comissão Organizadora do Brazilian Workshop on Mathematical Morphology. 1995 (Organização de encontros, simpósios e congressos) .

17.
BARRERA, Junior. Revisor de trabalhos para o VIII Simpósio Brasileiro de Computação Gráfica e Processamento de Imagens, SIBGRAPI 95, Universidade Federal de São Carlos. 1995 (Revisor de trabalhos para conferências) .

18.
BARRERA, Junior. Revisor de trabalhos para o VII Simpósio Brasileiro de Computação Gráfica e Processamento de Imagens, SIBGRAPI 94. 1994 (Revisor de trabalhos para conferências) .

19.
BARRERA, Junior. Membro da Comissão Organizadora do SIBGRAPI 92. 1992 (Organização de encontros, simpósios e congressos) .

20.
BARRERA, Junior. Revisor de trabalhos para o simpósio Statistical and Stochastic Methods for Image Processing. SPIE´s International Symposium on Optical Science, Engineering and Instrumentation. 1991 (Revisor de trabalhos para conferências) .



Bancas



Participação em bancas de trabalhos de conclusão
Mestrado
1.
BARRERA, Junior. Participação em banca de Lílian Nogueira de Faria. Reconstrução 3D de imagens tomográficas de Raios-X de arcos coronais em ambiente paralelo. 2003. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Federal de São Carlos.

2.
BARRERA, Junior. Participação em banca de Archias Alves de Almeida Filho. Maximização de entropia em lingüística computacional para a língua portuguesa. 2003. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística Usp.

3.
BARRERA, Junior. Participação em banca de Marcio Katsumi Oikawa. Integração para dados e aplicações em biologia molecular computacional. 2003. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística Usp.

4.
BARRERA, Junior. Participação em banca de Gustavo Henrique Esteves. Validação de procedimentos para medida de expressão gênica a partir de imagens de cDNA Microarray. 2002. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Centro de Tratamento e Pesquisa do Hospital do Câncer.

5.
BARRERA, Junior. Participação em banca de Teófilo Emídio de Campos. Técnicas de seleção de características com aplicações em reconhecimento de faces. 2001. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística Usp.

6.
BARRERA, Junior. Participação em banca de Vital Cruvinel Ferreira. Restauração de imagens tomográficas de ciência dos solos por métodos iterativos. 2000. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Federal de São Carlos.

7.
BARRERA, Junior. Participação em banca de Luiz Eduardo da Silva. Algoritmo de fotomosaico para imagens coloridas por morfologia matemática. 1999. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas.

8.
BARRERA, Junior. Participação em banca de Luciano Silva. Algoritmos geométricos discretos: complexidade e aplicações. 1998. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística Usp.

9.
BARRERA, Junior. Participação em banca de Aluir Porfírio Dal Poz. Correlação estrutural aplicada à extração automática de apoio de campo em imagens digitais. 1996. Dissertação (Mestrado em Engenharia Civil) - Escola Politécnica da Usp.

10.
BARRERA, Junior. Participação em banca de Nina Sumiko Tomita Hirata. Programação automática de máquinas morfológicas binárias baseada em Aprendizado PAC. 1996. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística Usp.

11.
BARRERA, Junior. Participação em banca de Guillermo Pablo Salas. Operações sobre coleções de intervalos e suas aplicações à programação automática de máquinas morfológicas. 1996. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística Usp.

12.
BARRERA, Junior. Participação em banca de Jussara Carneiro da Cunha. Inspeção de placas de circuito impresso utilizando morfologia matemática. 1995. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Instituto Alberto Luiz Coimbra de Pós-Graduação e Pesquisa de Engenharia.

13.
BARRERA, Junior. Participação em banca de Ulisses de Mendonça Braga Neto. Reconstrução Volumétrica e Análise de Imagens Tridimensionais por Morfologia Matemática. 1994. Dissertação (Mestrado em Engenharia Elétrica) - Universidade Estadual de Campinas.

14.
BARRERA, Junior. Participação em banca de Tania Mezzadri Centeno. Limiarização de impressões digitais a partir da morfologia matemática. 1994. Dissertação (Mestrado em Computação) - Universidade Tecnológica Federal do Paraná.

15.
BARRERA, Junior. Participação em banca de Marcos Cordeiro d'Ornellas. Algoritmos rápidos para o processamento morfológico de imagens binárias. 1992. Dissertação (Mestrado em Engenharia Eletrônica e Computação) - Instituto Tecnológico de Aeronáutica.

Teses de doutorado
1.
BARRERA, Junior. Participação em banca de Murillo Rodrigo Petrucelli Homem. Reconstrução tridimensional de imagens com o uso de deconvolução a partir de seções bidimensionais obtidas em microscopia óptica. 2003. Tese (Doutorado em Física) - Instituto de Física São Carlos Usp.

2.
BARRERA, Junior. Participação em banca de Márcio Magini. O estudo de mapas equivariantes sob a ação do grupo octaédrico: um sistema dinâmico para a evolução do código genético. 2002. Tese (Doutorado em Física) - Instituto de Física São Carlos.

3.
BARRERA, Junior. Participação em banca de Marcos Cordeiro d'Ornellas. Algorithmic patterns for morphological image processing. 2001. Tese (Doutorado em Ciência da Computação) - Universiteit van Amsterdam.

4.
BARRERA, Junior. Participação em banca de Hieu T. Nguyen. Segmentation of video into spatio-temporal objects. 2001. Tese (Doutorado em Ciência da Computação) - Universiteit van Amsterdam.

5.
BARRERA, Junior. Participação em banca de Ronaldo Fumio Hashimoto. Mudança de estrutura de representação de operadores em morfologia matemática. 2000. Tese (Doutorado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística Usp.

6.
BARRERA, Junior. Participação em banca de João Ricardo de Freitas Oliveira. O uso de algoritmos genéticos na decomposição morfológica de operadores invariantes em translação aplicados em imagens digitais. 1998. Tese (Doutorado em Computação Aplicada) - Instituto Nacional de Pesquisas Espaciais.

7.
BARRERA, Junior. Participação em banca de Roseli de Deus Lopes. Técnicas de processamento de imagens tridimensionais baseadas em regiões adaptativas. 1998. Tese (Doutorado em Engenharia Elétrica) - Escola Politécnica da Usp.

8.
BARRERA, Junior. Participação em banca de Roberto Marcondes Cesar Junior. Análise multi-escala de formas bidimensionais. 1997. Tese (Doutorado em Física) - Instituto de Física São Carlos.

9.
BARRERA, Junior. Participação em banca de Jun Okamoto Junior. Planejamento da aquisição de vistas de um objeto para fusão sensorial e obtenção de seu modelo tridimensional. 1994. Tese (Doutorado em Engenharia Mecatrônica) - Escola Politécnica da Usp.

10.
BARRERA, Junior. Participação em banca de Alejandro César Frery Orgambide. Algumas ferramentas estatísticas na síntese, processamento e análise de imagens de radar de abertura sintética. 1993. Tese (Doutorado em Computação Aplicada) - Instituto Nacional de Pesquisas Espaciais.



Participação em bancas de comissões julgadoras
Professor titular
1.
BARRERA, Junior. Membro de comissão julgadora de concurso para contratação de professor-doutor (Sérgio Ricardo Nozawa). 2003. Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto Usp.

Concurso público
1.
BARRERA, Junior. Membro de comissão julgadora de concurso para contratação de professor assistente. 2004. Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto Usp.

2.
BARRERA, Junior. Membro da comissão julgadora do concurso de ingresso na carreira do Prof. Ronaldo Fumio Hashimoto. 2003. Instituto de Matemática e Estatística Usp.

3.
BARRERA, Junior. Membro de comissão julgadora de concurso para contratação de professor assistente (Profa. Cristina Gomes Fernandes). 2000. Instituto de Matemática e Estatística Usp.

4.
BARRERA, Junior. Membro de comissão julgadora de concurso para contratação de professor assistente (José Augusto Ramos Soares). 2000. Instituto de Matemática e Estatística Usp.

5.
BARRERA, Junior. Membro de comissão julgadora de concurso para contratação de professor assistente (José Coelho Pina Junior). 2000. Instituto de Matemática e Estatística Usp.

6.
BARRERA, Junior. Membro de comissão julgadora de concurso para contratação de professor assitente (Kunio Okuda). 2000. Instituto de Matemática e Estatística Usp.

7.
BARRERA, Junior. Membro de comissão julgadora de concurso para contratação de professor-doutor (Cláudia Monteiro Peixoto). 2000. Instituto de Matemática e Estatística Usp.

8.
BARRERA, Junior. Membro de comissão julgadora de concurso para contratação de professor-doutor (Elisabeti Kira). 2000. Instituto de Matemática e Estatística Usp.

9.
BARRERA, Junior. Membro de comissão julgadora de concurso para contratação de professor-doutor (Adilson Simonis). 2000. Instituto de Matemática e Estatística Usp.

10.
BARRERA, Junior. Membro de comissão julgadora de concurso para contratação de professor assistente (Aurélio Ribeiro Leite de Oliveira). 2000. Instituto de Matemática e Estatística Usp.

11.
BARRERA, Junior. Membro da comissão julgadora de concurso para contratação de professor assistente (Nelson Mugayar Kuhl). 2000. Instituto de Matemática e Estatística Usp.

12.
BARRERA, Junior. Membro de comissão julgadora de concurso para contratação de professor assistente (Antonio Elias Fabris). 2000. Instituto de Matemática e Estatística Usp.

13.
BARRERA, Junior. Membro de comissão julgadora de concurso para contratação de professor assistente (Luis Carlos de Castro Santos). 2000. Instituto de Matemática e Estatística Usp.

14.
BARRERA, Junior. Membro de comissão julgadora de concurso para contratação de professor assistente (Joyce da Silva Bevilacqua). 2000. Instituto de Matemática e Estatística Usp.

15.
BARRERA, Junior. Membro de comissão julgadora de concurso para contratação de professor assistente (Alexandre Megiorin Roma). 2000. Instituto de Matemática e Estatística Usp.

16.
BARRERA, Junior. Membro de comissão julgadora de concurso para contratação de professor-doutor no Depto. de Engenharia de Computação e Sistemas Digitais. 1999. Escola Politécnica da Usp.

Livre docência
1.
BARRERA, Junior. Membro da comissão julgadora do concurso de livre-docência do Prof. Roberto Marcondes Cesar Jr.. 2003. Instituto de Matemática e Estatística Usp.

2.
BARRERA, Junior. Membro da comissão julgadora do concurso de livre-docência do Prof. Julio Michael Stern. 2002. Instituto de Matemática e Estatística Usp.

3.
BARRERA, Junior. Membro da comissão julgadora do concurso de livre-docência do Prof. Sérgio Shiguemi Furuie. 2002. Escola Politécnica da Usp.

4.
BARRERA, Junior. Membro da comissão julgadora do concurso de livre-docência do Prof. Antonio Elias Fabris. 2002. Instituto de Matemática e Estatística Usp.



Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
Latin America eScience Workshop 2013. 2013. (Seminário).

2.
Workshop do projeto de Modelagem do Ciclo Celular.Modeling and inference of genes network. 2009. (Seminário).

3.
Workshop on Gene Regulation and Noise.Design of PGNs for malaria parasite and cell cycle control. 2008. (Seminário).

4.
Seminários da EMBRAPA Informática.Design of PGNs for malaria parasite and cell cycle control. 2007. (Seminário).

5.
Seminários de Bioinformática na Université Claude Bernard, Lyon I.Cell cycle control modeling. 2007. (Seminário).

6.
Seminários do Barcelona Centre for International Health.Anotating malare genes by genetic network estimation. 2007. (Seminário).

7.
51 Congresso Brasileiro de Genética. Design of PGNs for malaria parasite and cell cycle control system. 2005. (Congresso).

8.
Seminários de Computação Gráfica do IMPA.Futebol: inteligência do jogo. 2005. (Seminário).

9.
Critical Assesment of Microarray Data Analysis - CAMDA 2004. A New Annotation Tool For Malaria Based On Inference Of Probabilistic Genetic Networks. 2004. (Congresso).

10.
Seminários do Tgen Institute.A new anotation tool for malaria based on inference of PGN. 2004. (Seminário).

11.
II Latin American Course on Bioinformatics for Tropical Disease Research. Data mining and dynamical modeling in Biology: a semiotic view. 2003. (Congresso).

12.
Programa de Seminários em Biologia Computacional - USP/ Ínformática Médica.Dos sinais de Microarrays à descoberta de conhecimento biológico. 2003. (Encontro).

13.
Encontro França-Brasil de Bioinformática.An integrated environment for analysis of genetic data. 2002. (Encontro).

14.
II Simpósio Brasileiro de Biologia Matemática e computacional. From Microarray images to biological knowledge. 2002. (Congresso).

15.
IMPA 50 anos - Seção Especial de Computação Gráfica. Automatic programming of morphological machines by PAC learning. 2002. (Congresso).

16.
Meeting of the American Mathematical Society.Modeling of genetic networks form microarray data. 2002. (Seminário).

17.
Seminários de Parasitologia do ICB-USP.Análise de dados de microarray. 2002. (Seminário).

18.
Seminários do curso de pós-graduação do Programa de Fisiopatologia Experimental da MED-USP.Bioinformática. 2002. (Seminário).

19.
VI Brazilian School of Probability - Session Probability in Genetics.Microarray data analysis. 2002. (Outra).

20.
Pesquisa científica e internet" - 14o Reunião Anual do Instituto Biológico.Descoberta de conhecimento em biologia molecular através da bioinformática. 2001. (Seminário).

21.
Série de Seminários do Instituto de Computação da UNICAMP.Um ambiente integrado para a análise de dados de genética. 2001. (Seminário).

22.
VI Encontro Regional de Matemática Aplicada e Computacional.Design of morphological operators by computational learning. 2001. (Encontro).

23.
SBMAC. Automatic Programing of morphological machines. 2000. (Congresso).

24.
Seminários do Departamento de Informática da Universidade de Amsterdam.Genomic Signal Processing. 2000. (Seminário).

25.
Seminários do departamento de informática da universidade de Groningen.Genomic Signal Processing. 2000. (Seminário).

26.
Seminários do Grupo de Morfologia Matemática do CWI.Automatic programming of morphological machines. 2000. (Seminário).

27.
SIAM Annual Conference. Model-Based Design of Optimal Morphological Filters. 2000. (Congresso).

28.
22o Colóquio Brasileiro de Matemática - IMPA.Design of aperture filters for motion tracking and segmentation. 1999. (Encontro).

29.
Centre de Morphologie mathématique.Design of aperture filters. 1999. (Seminário).

30.
Centre de Morphologie Mathématique.Non linear filters in genomic control. 1999. (Encontro).

31.
Centre de Morphologie Mathématique.Hybrid human-machine design of morphological operators. 1999. (Encontro).

32.
Centre de Morphologie Mathematique em Fontainebleau.The switching algorithm for designing increasing operators. 1999. (Seminário).

33.
Ciclo de Seminários do Serviço de Informática do Instituto do Coração.Nonlinear filters in genomic control. 1999. (Seminário).

34.
Departamento de Informática da Universitée d'Orsé.Non linear filters for genomic control. 1999. (Seminário).

35.
Departamento de Informática da Universitée d'Orsé.Design of morphological operators by generalized PAC learning. 1999. (Outra).

36.
IEEE-EURASIP Workshop on Nonlinear Signal and Image Processing (NSIP'99).Non linear filters in genomic control. 1999. (Encontro).

37.
Seminários do Departamento de Bioquímica da USP.Non linear filters in genomic control. 1999. (Seminário).

38.
Signal Processing Laboratory.Non linear filters in genomic control. 1999. (Seminário).

39.
Encontro da Academia Brasileira de Ciências.Programação Automática de Máquinas Morfológicas por PAC Learning. 1998. (Encontro).

40.
Nonlineaar Filters at Electronic Imaging - SPIE. Automatic algorithm design in the context of Morphological Machines. 1997. (Congresso).

41.
Centre de Morphologie Mathematuque em Fontainebleau.Parallelisation des operateurs morphologiques. 1995. (Seminário).

42.
Curso de Palestras do DCC-UNICAMP.Programação Automática de Máquinas Morfológicas. 1995. (Outra).

43.
Palestra conidada do Centre de Morphologie Mathematique em Fontainebleau.Programmation automatique des systems morphologiques par apprentissage. 1995. (Seminário).

44.
Palestra convidada no INRIA de Sophia-Antipolis.Palestra convidada: Morphological Representation of Translation Invariant Set Operators. 1994. (Seminário).

45.
Congresso da EletroPaulo. Uma caixa de ferramentas de Morfologia Matemática para o Sistema KHOROS. 1993. (Congresso).

46.
I Simpósio de Processamento de Imagens em Medicina.Palestra convidada: Experiência do INPE em processamento de imagens médicas. 1991. (Simpósio).


Organização de eventos, congressos, exposições e feiras
1.
Falcão, P. K. ; BARRERA, Junior . X-meeting. 2007. (Congresso).

2.
BARRERA, Junior; CP/IME-USP . III SImpósio de Iniciação Científica e Pós-Graduação do IME-USP. 2007. (Congresso).

3.
BARRERA, Junior; HIRATA JR, Roberto . International Symposium on Mathematical Morphology. 2007. (Congresso).

4.
BARRERA, Junior; CP/IME-USP . II Simpósio de Iniciação Científica e Pós-Graduação do IME-USP. 2006. (Congresso).

5.
BARRERA, Junior; CP/IME-USP . I simpósio de Iniciação Científica e Pós-Graduação do IME-USP. 2005. (Congresso).

6.
BARRERA, Junior; Goldman, G. ; COSTA, Luciano Fontoura ; CESAR JR, Roberto M . Icobicobi - International Conference on Bioinformatics and Computational Biology. 2003. (Congresso).

7.
BARRERA, Junior; OBANDO, Hernando A Del Portillo . I Latin American Course on Bioinformatics for Tropical Disease Research. 2002. (Congresso).

8.
BARRERA, Junior. Mathematical Morphology. 2001. (Congresso).



Orientações



Orientações e supervisões em andamento
Tese de doutorado
1.
André Fonseca. Métodos de Bioinformática em Câncer. Início: 2018. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte. (Coorientador).

2.
André Mello. Identificação de Vias de Sinalização de Proteínas. Início: 2018. Tese (Doutorado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística da USP, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Orientador).


Orientações e supervisões concluídas
Dissertação de mestrado
1.
Luiz Paulo Medina de Lima. Identificação de Sistemas Dinâmicos em dados de estoque imobiliário. 2018. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computaçao) - Instituto de Matemática e Estatística da USP, . Orientador: Junior Barrera.

2.
Paulo Roberto Branco Lins.. Desenvolvimento de uma abordagem quantitativa para o estudo de recorrências de módulos topológicos em redes biológicas. 2018. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, . Orientador: Junior Barrera.

3.
Amanda Sayuri Guimaraes. Um algoritmo para simplificar sistemas de equações diferenciais que descrevem a cinética de reações químicas. 2016. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computaçao) - Instituto de Matemática e Estatística da USP, . Orientador: Junior Barrera.

4.
Lulu Wu. Um método para modificar vias de sinalização molecular por meio de análise de banco de dados de interatomas. 2015. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Junior Barrera.

5.
Ubiratan Augusto Lima. Análise de uma Rede Genética Probabilística que representa o controle do ciclo celular. 2012. Dissertação (Mestrado em Mestrado em Bioinformática) - Instituto de Matemática e Estatística da USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Junior Barrera.

6.
Leandro Lima. Identificação de redes de expressão gênica no contexto de malária. 2009. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística da USP, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Junior Barrera.

7.
Daniel André Vaqueri. Projeto multi-resolução de operadores morfológicos a partir de exemplos. 2006. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Junior Barrera.

8.
Daniel O. Dantas. Uma técnica automática para medida de sinal de imagens de cDNA. 2004. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Orientador: Junior Barrera.

9.
Caetano Giminez Carezato. Análise de classificadores de seqüências projetados por aprendizado computacional supervisionado e não supervisionado. 2004. 0 f. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Junior Barrera.

10.
Gustavo P. Esteves. Validação de medidas de expressão gênica em imagens de microarray. 2004. Dissertação - Instituto Ludwig de Pesquisa sobre o Câncer, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Coorientador: Junior Barrera.

11.
Nestor Walter Trepode. Identificação de sistemas dinâmicos finitos: aplicações para a modelagem de redes genéticas. 2002. 0 f. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Orientador: Junior Barrera.

12.
David Martins Jr. Redução de dimensionalidade baseada na entropia condicional média. 2002. 0 f. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Coorientador: Junior Barrera.

13.
Franklin Cesar Flores. Segmentação de vídeo digital por morfologia matemática. 2000. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Junior Barrera.

14.
Francisco A Zampirolli. Desenvolvimento de um sistema de analise morfologica de imagens baseado em grafos de vizinhanca. 1997. 0 f. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Junior Barrera.

15.
Roberto Hirata Jr. Segmentacao de imagens por tecnicas da morfologia matematica. 1997. 0 f. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Junior Barrera.

16.
Nina S T Tomita. Programacao automatica de maquinas morfologicas binarias baseada em aprendizado PAC. 1996. 0 f. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Junior Barrera.

17.
Guillermo P Salas. Operacoes sobre colecoes de intervalos e suas aplicacoes a programacao automatica de maquinas morfologicas. 1996. 0 f. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Junior Barrera.

Tese de doutorado
1.
Joel Edu Sanches Castro. Model Selection for Learning Boolean Hypothesis. 2018. Tese (Doutorado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística da USP, . Coorientador: Junior Barrera.

2.
Guilherme Fernades Otranto. A formal model for strategic planning in cooperative and competitive environments case study: design and implementation of a basketball simulator. 2017. Tese (Doutorado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística da USP, . Orientador: Junior Barrera.

3.
Marcelo da Silva Reis. Minimização de funções decomponíveis em curvas em U definidas sobre cadeias de posets - algoritmos e aplicações. 2012. Tese (Doutorado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística da USP, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Junior Barrera.

4.
Leonardo Lamas Leandro Ribeiro. Modelagem estratégico-tática em esportes coletivos de invasão: aplicação ao basquetebol. 2012. Tese (Doutorado em Educação Física) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Coorientador: Junior Barrera.

5.
Daniel de Oliveira Dantas. Segmentação e reconhecimento de gestos em tempo real com câmeras e aceleração gráfica. 2010. Tese (Doutorado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística Usp, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Junior Barrera.

6.
David Corrêa Martins Jr. Identificação de redes de expressão gênica em malária. 2008. 0 f. Tese (Doutorado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística Usp, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Coorientador: Junior Barrera.

7.
Marcelo Ris. Representação de sistemas biológicos a partir de sistemas dinâmicos: controle da transcrição a partir do estrógeno. 2008. Tese (Doutorado em Doutorado em Bioinformática) - Departamento de Ciência da Computação Bioinfo Usp, . Orientador: Junior Barrera.

8.
Nestor Walter Trepode. Modelagem do controle gênico do ciclo celular por redes genéticas probabilísticas. 2007. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Instituto de Matemática e Estatística da USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Junior Barrera.

9.
Marcel Brun. Projetos de operadores morfológicos multi-escala por otimização estatística. 2002. 0 f. Tese (Doutorado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Junior Barrera.

10.
Roberto Hirata Jr. Projeto de operadores morfológicos para imagens e sinais: abordagem de reticulados finitos. 2001. Tese - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Junior Barrera.

11.
Ronaldo Fumio Hashimoto. Mudança de estrutura de representação de operadores em morfologia matemática. 2000. Tese - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Junior Barrera.

12.
Nina S. T. Hirata. Projeto automático de operadores explorando conhecimento a priori. 2000. Tese (Doutorado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Junior Barrera.

Supervisão de pós-doutorado
1.
Marcelo da Siva Reis. 2013. Instituto de Matemática e Estatística da USP, . Junior Barrera.

2.
Beatriz Stransky. Modelagem multi-resolução de tecidos. 2009. Instituto de Matemática e Estatística da USP, Fundação de Apoio à Pesquisa do Estado da Paraíba. Junior Barrera.

3.
Nestor Walter Trepode. 2008. Faculdade de Flosofia Ciências e Letras da USP de Ribeirão Preto, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Junior Barrera.

4.
Martha Ximena Torres Delgado. 2001. Instituto de Matemática e Estatística Usp, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Junior Barrera.

Trabalho de conclusão de curso de graduação
1.
Guilherme Otranto e Thomaz Rodrigues Gomes. Projeto e desenvolvimento de um simulador para jogos de futebol. 2008. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em CIência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística Usp, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Junior Barrera.



Outras informações relevantes


A atuação profissional de Junior Barrera envolve atividades de pesquisa básica em matemática, desenvolvimento de software, aplicações de técnicas desenvolvidas a problemas de análise de imagens e genética, e funções administrativas. A sua principal contribuição científica foi o desenvolvimento de técnicas formais para o projeto de operadores de reticulado a partir de exemplos, o que inclui contribuições em decomposição algébrica, estimação estatística e otimização combinatória. Ele foi co-projetista de dois softwares de muito uso na comunidade internacional de processamento de imagens: as toolboxes de morfologia matemática mmach e mmorph, respectivamente, para asplataformas Khoros e Matlab. Desde de 1999 tem concentrado suas atividades de pesquisa na área de Bioinformática, principalmente na análise de expressão fênica. Dessas atividades decorreram a liderança na fundação da AB#C, da qual veio a ser vice-presidente e presidente, e do Programa de Doutorado em Bioinformática da USP, do qual, em duas oportunidades, foi vice coordenador.  Ele foi editor associado das revistas Pattern Recognition, Electronic Image e EURASIP journal on Bioinformatics and System Biology. Teve inúmeras funções administrativas na USP, por exemplo, foi chefe dos Departamentos de Ciência da Computação do IME-USP e do Departamento de Física e Matemática da FFCLRP..  Atualmente, ele é um dos pesquisadores principais do projeto CEPID-FAPESP, denominado CENTER FOR RESEARCH ON TOXINS, IMMUNE-RESPONSE AND CELL SIGNALING. .



Página gerada pelo Sistema Currículo Lattes em 15/12/2018 às 3:18:51