Rede de Colaboração
Diretório de grupos de pesquisa

Georgios Joannis Pappas Júnior
Bolsista de Produtividade em Pesquisa do CNPq - Nível 2

possui graduação em Ciências Biológicas pela Universidade de Brasília (1990), graduação em Economia pelo Centro Universitário de Brasília (1991), mestrado em Ciências Biológicas (Biologia Molecular) pela Universidade de Brasília (1993) e doutorado em Biophysics and Computational Biology - University of Illinois (2001). Atualmente é pesquisador da EMBRAPA Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) e professor da Universidade Católica de Brasília. Tem experiência na área de Bioinformática, com ênfase em análise genômica, atuando principalmente nos seguintes temas: desenvolvimento de software para genômica, bioinformática estrutural, além de participar de diversas iniciativas genômicas no país de espécies como o eucalipto, banana e arroz.
(Texto informado pelo autor)

Última atualização do currículo em 01/02/2012
Endereço para acessar este CV:
http://lattes.cnpq.br/6434812322607721
Dados pessoais
NomeGeorgios Joannis Pappas Júnior
Nome em citações bibliográficasPAPPAS Jr, G. J.;Pappas, Georgios J;Pappas, Georgios;Pappas Jr, G.J.;Pappas, G. J.;Pappas Jr, G.;PAPPAS, G;Pappas Jr., G.J.
SexoMasculino
Endereço profissionalUniversidade Católica de Brasília, Pró-Reitoria de Pós-Graduação e Pesquisa, Pos Graduacao Em Ciencias Genomicas e Biotecnologia.
SGAN 916 Módulo
Asa norte
70790-160 - Brasilia, DF - Brasil
Telefone: (61) 34484741 Fax: (61) 3474797
URL da Homepage: http://bioinformatica.cenargen.embrapa.br/

Formação acadêmica/Titulação
1993 - 2001Doutorado em Biophysics and Computational Biology .
University of Illinois - System, UILLINOIS, Estados Unidos.
Título: Theoretical and computational aspects of protein structure prediction from the amino acid sequence, Ano de Obtenção: 2001.
Orientador: Shankar Subramaniam.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico ,CNPq ,Brasil .
Palavras-chave: Protein Secondary Structure Prediction; Protein Structure; Bioinformatics.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Biofísica Molecular.
Setores de atividade: Produtos e Processos Biotecnológicos.
1990 - 1993Mestrado em Ciências Biológicas (Biologia Molecular) .
Universidade de Brasília, UNB, Brasil.
Título: Purificacao e caracterizacao bioquimica de prossomas de Trypanosoma cruzi, Ano de Obtenção: 1993.
Orientador: Cezar Martins de Sa.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior .
1985 - 1991Graduação em Economia .
Centro Universitário de Brasília, UniCEUB, Brasil.
1985 - 1990Graduação em Ciencias Biologicas .
Universidade de Brasília, UNB, Brasil.

Atuação profissional
Centro nacional de recursos genéticos e biotecnologia - CENARGEN, Brasil.
Vínculo institucional
2006 - Atual Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Pesquisador A, Carga horária: 40
Atividades
12/2006 - AtualPesquisa e desenvolvimento , CENARGEN, .
Linhas de pesquisa
Bioinformática e genômica
2009 - 2011Atividades de Participação em Projeto, CENARGEN, .
Projetos de pesquisa
Desenvolvimento de ferramentas de bioinformática para detecção de SNPs e variantes estruturais a partir do resequenciamento genômico de variedades de arroz tolerantes à seca
Universidade Católica de Brasília, UCB-DF, Brasil.
Vínculo institucional
2000 - Atual Vínculo: Dedicacao exclusiva, Enquadramento Funcional: Professor, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Atividades
10/2001 - AtualPesquisa e desenvolvimento , Pró-Reitoria de Pós-Graduação e Pesquisa, .
Linhas de pesquisa
Bioinformática e genômica
Predição de estrutura de proteínas
3/2001 - AtualAtividades de Participação em Projeto, Pró-Reitoria de Pós-Graduação e Pesquisa, Pos Graduacao Em Ciencias Genomicas e Biotecnologia.
Projetos de pesquisa
Rede de pesquisa em Bioinformática do Centro-Oeste
02/2001 - AtualEnsino, Biologia, Nível: Graduação.
Disciplinas ministradas
Informática na Biologia
02/2000 - AtualEnsino, Ciências Genômicas e Biotecnologia, Nível: Pós-Graduação.
Disciplinas ministradas
Bioinformática
Laboratório de Bioinformática
Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária, EMBRAPA, Brasil.
Vínculo institucional
1999 - 2000 Vínculo: consultor, Enquadramento Funcional: consultor, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações Consultoria em Bioinformática
Atividades
2008 - 2011Atividades de Participação em Projeto, Centro nacional de recursos genéticos e biotecnologia - CENARGEN, .
Projetos de pesquisa
Descoberta de micro RNAs e análise de regulação da expressão gênica em Eucalyptus sp
06/1999 - 09/2000Pesquisa e desenvolvimento , Centro nacional de recursos genéticos e biotecnologia - CENARGEN, .
Linhas de pesquisa
Estudo da estrutura tri-dimensional de proteínas
Bioinformática e genômica

Linhas de Pesquisa
1. Estudo da estrutura tri-dimensional de proteínas
2. Bioinformática e genômica
3. Bioinformática e genômica
4. Predição de estrutura de proteínas
5. Bioinformática e genômica

Projetos de Pesquisa
2009 - 2011Desenvolvimento de ferramentas de bioinformática para detecção de SNPs e variantes estruturais a partir do resequenciamento genômico de variedades de arroz tolerantes à seca
Descrição: Este projeto visa desenvolver ferramentas analíticas de bioinformática para identificar e selecionar variações de seqüência de DNA a partir de dados de ressequenciamento de genomas de oito variedades de arroz (Oryza sativa) de sequeiro (subespécie japonica tropical). Os objetivos são: * Organizar, alinhar e comparar os dados de ressequenciamento do genoma de oito variedades de arroz com variabilidade genética para tolerância à seca (Chorinho, Puteca, BRS Primavera, IAC 165, Catetão, Azucena, Moroberekan e Ligeiro); * Identificar e desenvolver marcadores SNPs (Single Nucleotide Polymorphism) e SVs (Structural Variants) pelo alinhamento dos genomas re-sequenciados de arroz; * Gerar, armazenar e disponibilizar informações em banco de dados de forma sistemática para apoiar programas de melhoramento genético vegetal visando controle de tolerância à seca, seja do organismo modelo selecionado ou de gramíneas de grande importância econômica, como o sorgo, milho, aveia, cevada e trigo. .
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Doutorado ( 1) .
Integrantes: Roberto C Togawa - Integrante / Marcos do Carmo Mota Costa - Integrante / Márcio Elias Ferreira - Integrante / Bonfim da Silva, Orzenil - Integrante / Georgios Joannis Pappas Júnior - Coordenador.
Financiador(es): Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Auxílio financeiro..
2008 - 2011Descoberta de micro RNAs e análise de regulação da expressão gênica em Eucalyptus sp
Descrição: O foco central deste projeto é fazer uma contribuição para o conhecimento de elementos regulatórios descrevendo os primeiros miRNAs para o gênero Eucalyptus e para o entendimento da formação da madeira do ponto de vista da regulação da expressão gênica envolvida neste processo. Para a realização do projeto, será adotada uma das novas metodologias de seqüenciamento de nova geração ou ultra high throughput , como Illumina, capazes de gerar dados da ordem de giga bases de seqüências curtas (até 35 bases) em uma única corrida, com custos acessíveis. O tamanho reduzido das seqüências geradas é absolutamente compatível com o tamanho dos miRNAs que são foco de interesse do projeto cerca de 21 nucleotídeos. Propõe-se, além da geração das primeiras seqüências de micro RNAs do gênero e da caracterização quanto a potenciais genes alvo de regulação, traçar perfis de expressão de micro RNAs em Eucalyptus. Para tanto, pretende-se utilizar material genético de duas espécies de Eucalyptus que possuam características contrastantes de composição química da madeira, como E. grandis e E. globulus, que possui maior conteúdo de celulose. Utilizando amostras de pequenos RNAs de folha e câmbio de árvores destas duas espécies pretende-se traçar perfis de expressão de micro RNAs tecido e espécie-específicos com o objetivo de potencialmente assinalar pontos de regulação relevantes para a formação da madeira, no primeiro caso, e para a composição química da madeira, no último..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Doutorado ( 1) .
Integrantes: Marília C. R. Pappas - Integrante / Dario Grattapaglia - Integrante / Alessandra M. M. Reis - Integrante / Pasquali, Giancarlo - Integrante / Georgios Joannis Pappas Júnior - Coordenador.
Financiador(es): Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Auxílio financeiro.
Número de produções C, T & A: 1.
2001 - AtualRede de pesquisa em Bioinformática do Centro-Oeste
Descrição: Rede de pesquisa em Bioinrofmática do Centro-Oeste (BIOFOCO) http://www.biofoco.org.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação ( 9) / Especialização ( 0) / Mestrado acadêmico ( 2) / Mestrado profissionalizante ( 0) / Doutorado ( 0) .
Integrantes: Maria Emília Machado Telles Walter - Integrante / Natália Martins - Integrante / Marcos Mota Costa - Integrante / Georgios Joannis Pappas Júnior - Coordenador.
Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Número de produções C, T & A: 3.

Revisor de periódico
2008 - Atual Periódico: Tree Genetics and Genomics

Áreas de atuação
1. Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: BIOINFORMÁTICA.
2. Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Vegetal.
3. Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: BIOTECNOLOGIA.

Idiomas
Inglês Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Grego Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Pouco.


Produção em C,T & A
Produção bibliográfica
Artigos completos publicados em periódicos
1. Ienne, Susan ; Pappas, Georgios ; Benabdellah, Karim ; González, Antonio ; Zingales, Bianca . Horizontal Gene Transfer Confers Fermentative Metabolism in the Respiratory-Deficient Plant Trypanosomatid Phytomonas Serpens. Infection, Genetics and Evolution (Print), v. 12, p. :10.1016/j.meeg, 2012.
2. Grattapaglia, Dario ; Silva-Junior, Orzenil B ; Kirst, Matias ; de Lima, Bruno ; Faria, Danielle A ; Pappas, Georgios J . High-throughput SNP genotyping in the highly heterozygous genome of Eucalyptus: assay success, polymorphism and transferability across species. BMC Plant Biology (Online), v. 11, p. 65, 2011.
3. MARTINS, C. ; REIS-CUNHA, J.L. ; SILVA, M.N. ; Pereira, E.G. ; Pappas Jr., G.J. ; Bartholomeu, D.C. ; ZINGALES, B. . Identification of genes encoding hypothetical proteins in open-reading frame expressed sequence tags from mammalian stages of Trypanosoma cruzi. Genetics and Molecular Research, v. 10, p. 1589-1630, 2011.
4. Faria, D. A. ; Mamani, E. M. C. ; Pappas, M. R. ; Pappas, G. J. ; Grattapaglia, D. . A Selected Set of EST-Derived Microsatellites, Polymorphic and Transferable across 6 Species of Eucalyptus. Journal of Heredity, p. esq024, 2010.
5. Hippolyte, Isabelle ; Bakry, Frederic ; Seguin, Marc ; Gardes, Laetitia ; Rivallan, Ronan ; Risterucci, Ange-Marie ; Jenny, Christophe ; Perrier, Xavier ; Carreel, Francoise ; Argout, Xavier ; Piffanelli, Pietro ; Khan, Imtiaz ; Miller, Robert NG ; Pappas, Georgios J ; Mbeguie-a-mbeguie, Didier ; Matsumoto, Takashi ; De Bernardinis, Veronique ; Huttner, Eric ; Kilian, Andrzej ; Baurens, Franc-Christophe ; D'hont, Angelique ; Cote, Francois ; Courtois, Brigitte ; Glaszmann, Jean-Christophe . A saturated SSR/DArT linkage map of Musa acuminata addressing genome rearrangements among bananas. BMC Plant Biology (Online), v. 10, p. 65, 2010.
6. Castro, Alinne Pereira ; Araújo, Samuel Dias ; Reis, Alessandra M. M. ; Moura, Rodrigo L. ; Francini-Filho, Ronaldo B. ; Pappas, Georgios ; Rodrigues, Thiago Bruce ; Thompson, Fabiano L. ; Krüger, Ricardo H. . Bacterial Community Associated with Healthy and Diseased Reef Coral Mussismilia hispida from Eastern Brazil. Microbial Ecology, v. 59, p. 658-667, 2010.
7. Miller, Robert NG ; Passos, Marco AN ; Menezes, Natalia NP ; Souza, Manoel T ; do Carmo Costa, Marcos M ; Rennó Azevedo, Vânia C ; Amorim, Edson P ; Pappas, Georgios J ; Ciampi, Ana Y . Characterization of novel microsatellite markers in Musa acuminata subsp. burmannicoides, var. Calcutta 4. BMC Research Notes, v. 3, p. 148, 2010.
8. Reis, A.M.M. ; Araújo Jr, S.D. ; MOURA, R.L. ; Francini-Filho, R.B. ; Pappas Jr, G. ; Coelho, A.M.A. ; Krüger, R.H. ; Thompson, F.L. . Bacterial diversity associated with the Brazilian endemic reef coral. Journal of Applied Microbiology, v. 106, p. 1378-1387, 2009.
9. QUIRINO, B ; PAPPAS, G ; TAGLIAFERRO, A ; COLLEVATTI, R ; NETO, E ; DASILVA, M ; BUSTAMANTE, M ; KRUGER, R . Molecular phylogenetic diversity of bacteria associated with soil of the savanna-like Cerrado vegetation. Microbiological Research, v. 164, p. 59-70, 2009.
10.   MILLER, R. ; BERTIOLI, D. ; Baurens, F. ; SANTOS, C. ; ALVES, P. ; MARTINS, N. ; TOGAWA, R. C. ; SOUZA JUNIOR, M. ; PAPPAS Jr, G. J. . Analysis of non-TIR NBS-LRR resistance gene analogs in Musa acuminata Colla: Isolation, RFLP marker development, and physical mapping. BMC Plant Biology (Online), v. 8, p. 15, 2008.
11. LESCOT, M. ; PIFFANELLI, P. ; CIAMPI, A. ; RUIZ, M. ; BLANC, G. ; LEEBENS-MACK, J. ; SILVA, F. ; SANTOS, C. ; DHONT, A. ; PAPPAS Jr, G. J. ; SOUZA JUNIOR, M. ; MILLER, R. ; GLASZMANN, J.C. ; TOWN, C. D. . Insights into the Musa genome: syntenic relationships to rice and between Musa species. BMC Genomics, v. 9, p. 58, 2008.
12. Gomes, C.P.C. ; NAGATA, T. ; Jesus Jr, W.C. ; Borges Neto, C.R. ; PAPPAS Jr, G. J. ; Martin, D.P. . Genetic variation and recombination of RdRp and HSP 70h genes of Citrus tristeza virus isolates from orange trees showing symptoms of citrus sudden death disease. Virology, v. 5, p. 9, 2008.
13. Castro, A.P. ; QUIRINO, B. F. ; PAPPAS Jr, G. J. ; Kurokawa, A.S. ; Neto, E.L. ; Krüger, R.H. . Diversity of Soil Fungal Communities of Cerrado and its Closely Surrounding Agriculture Fields. Archives of Microbiology, v. 000, p. 000, 2008.
14.   Novaes, Evandro ; Drost, Derek R ; Farmerie, William G ; Pappas, Georgios J ; Grattapaglia, Dario ; Sederoff, Ronald R ; Kirst, Matias . High-throughput gene and SNP discovery in Eucalyptus grandis, an uncharacterized genome. BMC Genomics, v. 9, p. 312, 2008.
15. Bruskiewich, Richard ; Senger, Martin ; Davenport, Guy ; Ruiz, Manuel ; Rouard, Mathieu ; Hazekamp, Tom ; Takeya, Masaru ; Doi, Koji ; Satoh, Kouji ; Costa, Marcos ; Simon, Reinhard ; Balaji, Jayashree ; Akintunde, Akinnola ; Mauleon, Ramil ; Wanchana, Samart ; Shah, Trushar ; Anacleto, Mylah ; Portugal, Arllet ; Ulat, Victor Jun ; Thongjuea, Supat ; Braak, Kyle ; Ritter, Sebastian ; Dereeper, Alexis ; Skofic, Milko ; Rojas, Edwin ; Martins, Natalia ; Pappas, Georgios ; Alamban, Ryan ; Almodiel, Roque ; Barboza, Lord Hendrix ; Detras, Jeffrey ; Manansala, Kevin ; Mendoza, Michael Jonathan ; Morales, Jeffrey ; Peralta, Barry ; Valerio, Rowena ; Zhang, Yi ; Gregorio, Sergio ; Hermocilla, Joseph ; Echavez, Michael . The Generation Challenge Programme Platform: Semantic Standards and Workbench for Crop Science, v. 2008, p. 1-7, 2008.
16. Midorikawa, G.E.O. ; Pinheiro, M.R.R. ; Vidigal, B.S. ; Arruda, M.C. ; Costa, F.F. ; Pappas Jr, G.J. ; Ribeiro, S.G. ; Freire, F. ; Miller, R.N.G. . Characterization of Aspergillus flavus strains from Brazilian Brazil nuts and cashew by RAPD and ribosomal DNA analysis. Letters in Applied Microbiology, v. 47, p. 12-18, 2008.
17.   PAPPAS Jr, G. J. ; BENABDELLAH, K. ; ZINGALES, B. ; GONZALEZ, A. . Expressed sequence tags from the plant trypanosomatid Phytomonas serpens. Molecular and Biochemical Parasitology, v. 142, n. 2, p. 149-157, 2005.
18. PAPPAS Jr, G. J. ; SUBRAMANIAM, S. . Analysis of the Effects of Multiple Sequence Alignments in Protein Secondary Structure Prediction. Lecture Notes in Computer Science, v. 3594, n. Agosto, p. 128-140, 2005.
19. HIGA, R. H. ; MONTAGNER, A J ; TOGAWA, R. C. ; KUSER, P R ; YAMAGISHI, M e B ; MANCINI, A L ; PAPPAS Jr, G. J. ; MIURA, R T ; HORITA, L G ; NESHICH, G. . ConSSeq: a web-based application for analysis of amino acid conservation based on HSSP database and within context of structure. Bioinformatics (Oxford), v. 20, n. 12, p. 1983-1985, 2004.
20. NESHICH, G. ; TOGAWA, R. C. ; PAPPAS Jr, G. J. . STING Millennium: a web-based suite of programs for comprehensive and simultaneous analysis of protein structure and sequence. Nucleic Acids Research, v. 31, p. 3386-3392, 2003.
21. BERTIOLI, D. ; LEAL-BERTIOLI, S. C. M. ; LION, M. B. ; SANTOS, V. L. ; PAPPAS Jr, G. J. ; CANNON, S. B. ; GUIMARAES, P. M. . A large scale analysis of resistance gene homologues in Arachis. Molecular Genetics and Genomics, Heidelberg, v. 270, n. 1, p. 34-45, 2003.
22. COSTA, M. M. ; TOGAWA, R. C. ; MIRANDA, R. P. ; PAPPAS Jr, G. J. . Distributed Blast using grid service technology. Revista Tecnologia da Informação, Brasilia-DF, v. 3, n. 2, p. 127-129, 2003.
Capítulos de livros publicados
1. Miller, R.N.G. ; PASSOS, M. A. N. ; EMEDIATO, F. L. ; de CAMARGO TEIXEIRA, C. ; PAPPAS Jr, G. J. . CANDIDATE RESISTANCE GENE DISCOVERY: RESISTANCE GENE ANALOG CHARACTERISATION AND DIFFERENTIAL GENE EXPRESSION ANALYSIS IN MUSA-MYCOSPHAERELLA HOST-PATHOGEN INTERACTIONS. In: I. Van den Bergh, M. Smith, R. Swennen, C. Hermanto. (Org.). International ISHS-ProMusa Symposium on Global Perspectives on Asian Challenges. Leuven: ISHS, 2011, v. 897, p. 179-185.
2. EMEDIATO, F. L. ; NUNES, F. A. C. ; de CAMARGO TEIXEIRA, C. ; PASSOS, M. A. N. ; BERTIOLI, D. ; PAPPAS Jr, G. J. ; Miller, R.N.G. . Characterization of Resistance Gene Analogs in Musa acuminata acuminata Cultivars Contrasting in Resistance to Biotic Stresses. In: Q. Y. Shu. (Org.). Induced Plant Mutations in the Genomics Era. Roma: Food and Agriculture Organization of the United Nations (FAO), 2009, v. , p. -.
3. PAPPAS Jr, G. J. . Genômica Florestal: Genes, genomas e Bioinformática. In: Borem, A.. (Org.). Biotecnologia Florestal. 1 ed. : Suprema Grafica e Editora, 2007, v. , p. 253-269.
4. PAPPAS Jr, G. J. ; SUBRAMANIAM, S. . An Evaluation Of Protein Secondary Structure Prediction Algorithms. In: Daniel Marshak. (Org.). Techniques in protein chemistry VIII. 1 ed. San Diego - USA: Academic Press, 1997, v. , p. 783-794.
Textos em jornais de notícias/revistas
1. Pappas, Georgios . A era dos tecnobiólogos. Revista Galileu, 01 out. 2010.
2. PAPPAS Jr, G. J. . Rede de pesquisa e desenvolvimento em bioinformática do centro-oeste. ComCiência: Revista Eletrônica de Jornalismo Científico, Brasil, 05 ago. 2003.
Trabalhos completos publicados em anais de congressos
1. RIBEIRO, E. O. ; WALTER, M. E. ; COSTA, M. M. ; Pappas Jr, G.J. . A Peer-to-Peer system for executing bioinformatics applications: a case study of distributed and scalable information management over massive volumes of data. In: XXVIII Congresso da Sociedade Brasileira de Computação - SEMISH, 2008, Belém-PA. Anais do XXVIII Congresso da Sociedade Brasileira de Computação, 2008. p. 16-30.
2. LIBERMAN, F. ; PAPPAS Jr, G. J. . Análise dos fatores determinantes para a qualidade da anotação genômica automática. Um estudo de caso para a Chlamydia trachomatis. In: XXVI Congresso da Sociedade Brasileira de Computação, 2006, Campo Grande-MS. Anais do XXVI Congresso da Sociedade Brasileira de Computação, 2006.
Resumos expandidos publicados em anais de congressos
1. Pappas, Marília ; Reis, Alessandra ; Farinell, Laurent ; Pasquali, Giancarlo ; Pappas, Georgios ; Grattapaglia, Dario . Interspecific discovery and expression profiling of Eucalyptus micro RNAs by deep sequencing. In: IUFRO Tree Biotechnology Conference 2011: From Genomes to Integration and Delivery, 2011, Porto Seguro. IUFRO Tree Biotechnology Conference 2011: From Genomes to Integration and Delivery, 2011.
2. Grattapaglia, Dario ; de Alencar, Sergio ; Pappas, Georgios . Genome-wide genotyping and SNP discovery by ultra-deep Restriction-Associated DNA (RAD) tag sequencing of pooled samples of E. grandis and E. globulus. In: IUFRO Tree Biotechnology Conference 2011: From Genomes to Integration and Delivery, 2011, Porto Seguro, BA. IUFRO Tree Biotechnology Conference 2011: From Genomes to Integration and Delivery, 2011.
3. Petroli, César ; Sansaloni, Carolina ; Carling, Jason ; Mamani, Eva M C ; Steane, Dorothy A ; Myburg, Alexander A ; Vaillancourt, René E ; Kilian, Andrzej ; Pappas, Georgios J ; Bonfim da Silva, Orzenil ; Grattapaglia, Dario . Genomic characterization, high-density mapping and anchoring of DArT markers to the reference genome of Eucalyptus. In: IUFRO Tree Biotechnology Conference 2011: From Genomes to Integration and Delivery, 2011, Porto Seguro, BA. IUFRO Tree Biotechnology Conference 2011: From Genomes to Integration and Delivery, 2011.
4. Silva-Junior, Orzenil B ; Rosado, Tatiana B ; Laviola, Bruno G ; Pappas, Marilia R ; Pappas, Georgios J ; Grattapaglia, Dario . Genome-wide SNP discovery from a pooled sample of accessions of the biofuel plant Jatropha curcas based on whole-transcriptome Illumina resequencing. In: IUFRO Tree Biotechnology Conference 2011: From Genomes to Integration and Delivery, 2011, Porto Seguro, BA. IUFRO Tree Biotechnology Conference 2011: From Genomes to Integration and Delivery, 2011.
5. Faria, Danielle ; Mamani, Eva ; Sena, Juliana ; Alves, Alexandre ; Falcao, Clarissa ; Lourenço, Rodrigo ; Pappas, Georgios ; Grattapaglia, Dario . A new set of 182 microsatellites for Eucalyptus: characterization and mapping in a four-species consensus linkage map. In: IUFRO Tree Biotechnology Conference 2011: From Genomes to Integration and Delivery, 2011, Porto Seguo, BA. IUFRO Tree Biotechnology Conference 2011: From Genomes to Integration and Delivery, 2011.
6. Alencar, Sérgio ; Silva-Junior, Orzenil ; Togawa, Roberto ; Costa, Marcos ; Revers, Luís ; Pappas, Georgios . SNP discovery in apple cultivars using next generation sequencing. In: IUFRO Tree Biotechnology Conference 2011: From Genomes to Integration and Delivery, 2011, Porto Seguo, BA. IUFRO Tree Biotechnology Conference 2011: From Genomes to Integration and Delivery, 2011.
7. Lima, Bruno ; Silva-Junior, Orzenil B ; Faria, Danielle A ; Mamani, Eva MC ; Pappas, Georgios J ; Grattapaglia, Dario . Assessment of SNPs for linkage mapping in Eucalyptus: construction of a consensus SNP/microsatellite map from two unrelated pedigrees. In: IUFRO Tree Biotechnology Conference 2011: From Genomes to Integration and Delivery, 2011, Porto Seguo, BA. IUFRO Tree Biotechnology Conference 2011: From Genomes to Integration and Delivery, 2011.
8. Sansaloni, Carolina ; Petroli, César ; Pappas, Georgios ; Da Silva, Orzenil ; Grattapaglia, Dario . How many genes might underlie QTLs for growth and wood quality traits in Eucalyptus?. In: IUFRO Tree Biotechnology Conference 2011: From Genomes to Integration and Delivery, 2011, Porto Seguo, BA. IUFRO Tree Biotechnology Conference 2011: From Genomes to Integration and Delivery, 2011.
9. MILLER, R. ; CIAMPI, A. ; ALVES, P. ; BERTIOLI, D. ; PAPPAS Jr, G. J. ; SILVA, F. ; MARTINS, N. ; SOUZA JUNIOR, M. ; PIFFANELLI, P. . Identification of resistance gene analogs in Musa acuminata cv Calcutta 4, amplified via PCR with degenerate oligonucleotide primers. In: V Simpósio Brasileiro sobre bananicultura, 2003, Paracatu-MG. Anais do V Simpósio Brasileiro sobre bananicultura. Cruz das Almas-BA : Gráfica e editora Nova Civilização Ltda., 2003.
Resumos publicados em anais de congressos
1. MILLER, R. ; CIAMPI, A. ; HORBERG, H. ; BERTIOLI, D. ; PAPPAS Jr, G. J. ; SILVA, F. ; MARTINS, N. ; COLEVATTI, R. ; PIFFANELLI, P. ; SOUZA JUNIOR, M. . STRATEGIES FOR IDENTIFICATION OF GENES OF AGRICULTURAL IMPORTANCE IN MUSA ACUMINATA 'CALCUTTA 4'. In: Seventh International Congress of Plant Molecular Biology, 2003, Barcelona. Proceedings Seventh International Congress of Plant Molecular Biology, 2003.
2. COSTA, M. C. M. ; TOGAWA, R. C. ; MIRANDA, R. P. ; PAPPAS Jr, G. J. . Distributed blast using grid service technology. In: Second Brazilian Workshop on Bioinformatics, 2003, Macaé-RJ. Proceedings of the second Brazilian Workshop on Bioinformatics, 2003.
Apresentações de Trabalho
1. PAPPAS Jr, G. J. . Eucalyptus research in the post-genome era. 2011. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
2. PAPPAS Jr, G. J. ; Brommonschenkel, S.H. ; Pappas, M.C.R. ; Faria, D.A. ; Sá, S.V. ; Kaiser, O. ; Grattapaglia, D. . Individual And Pooled Eucalyptus BAC Clone Sequencing And Assembly By High Throughput Pyrosequencing. 2008. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
3. PAPPAS Jr, G. J. . Analysis Of Resistance Gene Analogs In Musa acuminata Subsp. Burmannicoides, var. calcutta 4. 2006. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
4. PAPPAS Jr, G. J. . IUFRO Tree Biotechnology 2005, 2005. (Congresso) Sample sequencing of 3 megabases of shotgun DNA of Eucalyptus grandis: genome structure, repetitive elements and genes. 2005. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
Produção técnica
Softwares sem registro de patente
1. PAPPAS Jr, G. J. ; COSTA, M. C. M. ; MIRANDA, R. P. . Sistema Genoma. 2004.

Bancas
Participação em bancas examinadoras
Dissertações
1. Santana, J.M.; Pappas Jr, G.J.. Participação em banca de Paula Beatriz Santiago. Análise proteômica revela que a saliva de Dipetalogaster maxima é rica em lipocalinas e possui apirase da família 5 nucleotidase. 2011. Dissertação (Mestrado em Ciencias Medicas) - Universidade de Brasília.
2. Rangel, P.H.N.; Ferreira, M.E.; PAPPAS Jr, G. J.. Participação em banca de Thaísa Sant´Anna Lacerda. DESENVOLVIMENTO DE PAINÉIS MULTIPLEX DE MARCADORES MICROSSATÉLITES PARA seleção assistida para QUALIDADE DE GRÃOS de ARROZ (ORYZA SATIVA l.). 2009. Dissertação (Mestrado em Ciências Genômicas e Biotecnologia) - Universidade Católica de Brasília.
3. WALTER, M. E.; PAPPAS Jr, G. J.. Participação em banca de Roberto Ternes Arrial. Predição de RNAs não-codificadores no transcritoma do fungo Paracoccidioides brasiliensis usando apendizagem de máquina. 2008. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Biologia Molecular)) - Universidade de Brasília.
4. Coelho, A.S.G.; Pappas Jr, G.J.; BATAUS, L. A. M.. Participação em banca de Marcela Mendes Salazar. Anotação e caracterização preliminar de genes de celulose sintase em diferentes espécies de Eucalyptus. 2006. Dissertação (Mestrado em Biologia) - Universidade Federal de Goiás.
5. PAPPAS Jr, G. J.; COSTA, M. C. M.. Participação em banca de Marie Ikemoto Honda. Implementação do algortimo de Hartman para o problema de ordenação por transposições. 2004. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade de Brasília.
6. BARRERA, Junior; VASCONCELOS, Ana Tereza Ribeiro; PAPPAS Jr, G. J.. Participação em banca de Caetano Jiminez Carezzato. Análise de classificadores de sequências projetados por aprendizado computacional supervisionado e não supervisionado. 2004. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.
7. PAPPAS Jr, G. J.; MEIDANIS, J.; WALTER, M. E.. Participação em banca de Eugênia Thereza Gonçalves de Oliveira. Implementações de algoritmos para o problema da ordenação por transposições. 2001. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade de Brasília.
Teses de doutorado
1. PAPPAS Jr, G. J.; Durhan, A.; Gruber, A.; Verjoski-Almeida, S.; Franco, G.M.. Participação em banca de Thiago Motta Venancio. Análise computacional da expressão gênica em Schistosoma mansoni. 2008. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.
2. Grattapaglia, Dario; Pappas Jr, G.J.; Coelho, A.S.G.; Ferreira, M.E.. Participação em banca de Marco Aurélio Caldas de Pinho Pessoa Filho. Diversidade genética, expressão gênica, e mapeamento de QTLs de tolerância à seca em arroz (Oryza sativa L.). 2008. Tese (Doutorado em Biologia Molecular) - Universidade de Brasília.
3. Grattapaglia, D.; Ferreira, M.E.; PEREIRA, R. W.; Pappas Jr, G.J.. Participação em banca de Danielle Assis de Faria. Estudos genômicos em Eucalyptus: mapeamento de genes candidatos e QTLs, estimativa de desequilíbrio de ligação e analise de estrutura de populações. 2008. Tese (Doutorado em Ciências Genômicas e Biotecnologia) - Universidade Católica de Brasília.
4. Vasconcelos, A.T.R; Pena, S.D.; PAPPAS Jr, G. J.. Participação em banca de Francisco Prosdocimi. Racionalizando a utilização do algoritmo PHRED para análise de seqüências de DNA. 2006. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.
5. PAPPAS Jr, G. J.; PEREIRA DE ARAÚJO, A. F.; MUNDIM, K. C.; FREITAS, S. M.; CALIRI, A.. Participação em banca de Leandro Guimarães Garcia. Estudo termodinâmico e cinético de modelos protéicos minimalistas em retículo. 2004. Tese (Doutorado em Biologia Molecular) - Universidade de Brasília.
Trabalhos de Conclusão de Curso de graduação
1. PAPPAS Jr, G. J.; MARTINS, W. S.. Participação em banca de Ana Carolilna Medeiros de Brito. SWDNA - Servidor de web para armazenamento e consultas de seqüências de DNA. 2001 - Universidade Católica de Brasília.
2. PAPPAS Jr, G. J.; MARTINS, W. S.. Participação em banca de Antônio Lino de Araújo Júnior. SWS - Servidor web para comparação de seqüências. 2001 - Universidade Católica de Brasília.
3. PAPPAS Jr, G. J.; MARTINS, W. S.. Participação em banca de Eduardo Antônio Melo Torres. Genolyptus - Serviços web para estudos genômicos. 2001 - Universidade Católica de Brasília.

Eventos
Participação em eventos
1. IUFRO Tree Biotechnology Conference 2011: From Genomes to Integration and Delivery.Eucalyptus research in the post-genome era. 2011. (Congresso).
2. Plant & Animal Genome XIV Conference.Analysis Of Resistance Gene Analogs In Musa acuminata Subsp. Burmannicoides, var. calcutta 4. 2006. (Congresso).
3. IUFRO Tree Biotechnology 2005.SAMPLE SEQUENCING OF 3 MEGABASES OF SHOTGUN DNA OF EUCALYPTUS GRANDIS : GENOME STRUCTURE, REPETITIVE ELEMENTS AND GENES. 2005. (Congresso).
4. Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB).Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB). 2004. (Congresso).

Orientações
Orientações em andamento
Supervisão de pós-doutorado
1. Sergio Amorim de Alencar. Início: 2011. Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária, Financiadora de Estudos e Projetos.
Supervisões e orientações concluídas
Dissertação de mestrado
1. Alexandre Peixoto Figueira. Análise comparativa de algoritmos de agrupamento de ESTs (Expressed Sequence Tags). 2006. Dissertação (Mestrado em Ciências Genômicas e Biotecnologia) - Universidade Católica de Brasília, . Orientador: Georgios Joannis Pappas Júnior.
2. Alexandre Marques Póvoa. Estudo da variabilidade nucleotídica dos gene CAD2 e COMT2 para três espécies do gênero Eucalyptus. 2005. Dissertação (Mestrado em Ciências Genômicas e Biotecnologia) - Universidade Católica de Brasília, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Georgios Joannis Pappas Júnior.
3. Felipe Liberman. Análise dos fatores determinantes para a qualidade da anotação genômica automática. 2004. Dissertação (Mestrado em Ciências Genômicas e Biotecnologia) - Universidade Católica de Brasília, . Orientador: Georgios Joannis Pappas Júnior.

Outras informações relevantes 
Projeto aprovado pelo CNPq: Rede de pesquisa e desenvolvimento em bioinformática do centro-oeste.
Página gerada pelo Sistema Currículo Lattes em 12/02/2012 às 2:14:59