João Eduardo Ferreira

Bolsista de Produtividade em Pesquisa do CNPq - Nível 2

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  • Última atualização do currículo em 29/09/2018


Graduação Bacharelado em Física - Opção Física-Computacional pela Universidade de São Paulo (1988); mestrado (1991) e doutorado (1996) em Fisica-Computacional pela Universidade de São Paulo; graduação em Pedagogia pela Universidade Federal de São Carlos (1989). Pós-doutorado pela Georgia Tech, Atlanta-USA (2010). Atualmente é professor associado (livre docente) junto ao departamento de Ciência da Computação do Instituto de Matemática e Estatística da Universidade de São Paulo. É editor associado do periódico IEEE Transactions on Services Computing e tem participado de vários comitês de programas incluindo IEEE Web Services, WISE, ICSOC, ICWS, ICDE, IEEE Big Data, ENASE e SBBD. Publicou mais de 100 artigos nas áreas de bancos de dados e e-Science e tem recebido apoio regular das agências de fomento FAPESP, CNPq, CAPES, Ministério da Saúde e NIH-USA para financiamento de suas pesquisas. Os principais temas de interesse são: integração de bancos de dados; modelagem, análise e implementação de sistemas de informação cientes de processos; data warehouse; qualidade de dados; transações assíncronas; e recuperação de informação. Membro da Sociedade Brasileira de Computação (SBC), da IEEE-CS e da ACM. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
João Eduardo Ferreira
Nome em citações bibliográficas
FERREIRA, J. E.;Ferreira, Joao Eduardo;Ferreira, João Eduardo;Ferreira, João E.;FERREIRA, JOAO E.;FERREIRA, JOÃO E;Joao Eduardo Ferreira;Joao E. Ferreira;FERREIRA, JOAO;FERREIRA, J.E.;João Eduardo Ferreira,;João Eduardo Ferreira;FERREIRA, JO??O E.;CUSTER, BRIAN

Endereço


Endereço Profissional
Universidade de São Paulo, Instituto de Matemática e Estatística, Departamento de Ciência da Computação.
Rua do Matão 1010
Butanta
05508900 - São Paulo, SP - Brasil
Telefone: (11) 30916134
Ramal: 6134
Fax: (11) 30916135
URL da Homepage: http://www.ime.usp.br


Formação acadêmica/titulação


1992 - 1996
Doutorado em Fisica-Computacional.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: Compartilhamento de Objetos Compostos entre Base de Dados Orientadas a Objetos, Ano de obtenção: 1996.
Orientador: Caetano Traina Junior.
Palavras-chave: compartilhamento de dados; distribuição de objetos; banco de dados; dados heterogêneos.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Setores de atividade: Atividades de Banco de Dados.
1989 - 1991
Mestrado em Fisica-Computacional.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: Estudo da Distribuição de Base de Dados Orientada a Objetos,Ano de Obtenção: 1991.
Orientador: Caetano Traina Junior.
Palavras-chave: Base de Dados distribuídas; objetos; objetos complexos; compartilhamento de dados.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Setores de atividade: Atividades de Banco de Dados.
1984 - 1989
Graduação em Pedagogia.
Universidade Federal de São Carlos, UFSCAR, Brasil.
1983 - 1988
Graduação em Bacharelado em Física - Opção Física-Computacional.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.


Pós-doutorado e Livre-docência


2008
Livre-docência.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: Modelagem e Controle de Transações em Bancos de Dados, Ano de obtenção: 2008.
Palavras-chave: banco de dados heterogêneos; control-flow; transacoes assincronas.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Setores de atividade: Educação.
2010 - 2010
Pós-Doutorado.
Georgia Tech Insitute, GATECH, Estados Unidos.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra


Atuação Profissional



Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Vínculo institucional

2008 - Atual
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Livre docente, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Vínculo institucional

1999 - 2008
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Assistente MS-3, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Vínculo institucional

1987 - 1989
Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: tecnico nivel superior, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

4/2001 - Atual
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Matemática e Estatística, Departamento de Ciência da Computação.

Cargo ou função
Membro titular (MS-3) do conselho departamental.
4/2000 - Atual
Extensão universitária , Instituto de Matemática e Estatística, Departamento de Ciência da Computação.

Atividade de extensão realizada
BIOINFO -USP núcleo de bioinformática.
4/2000 - Atual
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Matemática e Estatística, Departamento de Ciência da Computação.

Cargo ou função
Membro do Conselho do Núcleo de Pesquisa em Bioinformática-USP, BIOINFO: http://www.bioinfo.usp.br/.
3/1999 - Atual
Pesquisa e desenvolvimento , Instituto de Matemática e Estatística, Departamento de Ciência da Computação.

3/1999 - Atual
Ensino, Ciências da Computação, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Controle de Concorrência e Distribuição de Dados
Introdução aos Sistemas de Banco de Dados
3/1999 - Atual
Ensino, Bacharelado em Ciência da Computação, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Introdução à Computação
Sistemas de Banco de Dados
Laboratório de Banco de Dados
2/2000 - 6/2001
Outras atividades técnico-científicas , Instituto de Matemática e Estatística, Instituto de Matemática e Estatística.

Atividade realizada
mebro do comite de programa do Simpósio Brasileiro de Banco de Dados. edição 2000 e2001.
9/2000 - 12/2000
Estágios , Instituto de Matemática e Estatística, Departamento de Ciência da Computação.

Estágio realizado
atividades de pesquisa com o Prof. Shamkant Navathe, College of Computing at Georgia Tech, Atlanta(http://www.cc.gatech.edu/~sham/).

Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.
Vínculo institucional

1990 - 1999
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Assistente MS-2 e MS-3, Carga horária: 40
Outras informações
Professor Assistente efetivo do quadro UNESP

Vínculo institucional

1989 - 1990
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Assistente MS-1, Carga horária: 40

Atividades

4/1990 - 2/1999
Ensino, Bacharelado em Ciências da Computação, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Compiladores
Sistemas Orientados a Objetos
Estrutura de Dados II
Programação Orientada a Objetos
Linguagens Formais e Autômatos
Estágio Supervisionado e Trabalho de Graduação
Linguagens de Programação
12/1997 - 1/1999
Extensão universitária , Instituto de Geociências e Ciências Exatas de Rio Claro, Departamento de Estatística, Matemática Aplicada e Computacional.

Atividade de extensão realizada
Consultor Técnico da Secretaria da Fazenda do Governo do Estado de São Paulo, no Programa de Modernização da Arrecadação Tributária (PROMOCAT), projeto financiado pelo BID-PNUD..
3/1996 - 11/1998
Outras atividades técnico-científicas , Instituto de Geociências e Ciências Exatas de Rio Claro, Instituto de Geociências e Ciências Exatas de Rio Claro.

Atividade realizada
Avaliador do Conselho Estadual de Educação do Governo do Estado de São Paulo para implantação e avaliação de cursos universitários..
8/1996 - 7/1998
Outras atividades técnico-científicas , Instituto de Geociências e Ciências Exatas de Rio Claro, Instituto de Geociências e Ciências Exatas de Rio Claro.

Atividade realizada
Orientaçào iniciação científica CNPq processo - 800383/92-3.
3/1995 - 6/1998
Outras atividades técnico-científicas , Instituto de Geociências e Ciências Exatas de Rio Claro, Instituto de Geociências e Ciências Exatas de Rio Claro.

Atividade realizada
mebro da comissão de avaliadores do Simpósio Brasileiro de Banco de Dados.
6/1996 - 11/1997
Extensão universitária , Instituto de Geociências e Ciências Exatas de Rio Claro, Departamento de Estatística, Matemática Aplicada e Computacional.

Atividade de extensão realizada
Projeto UNIMED- Construão de Sistemas Modulares para Gestào de Serviços Médicos.
9/1993 - 8/1995
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Geociências e Ciências Exatas de Rio Claro, Departamento de Estatística, Matemática Aplicada e Computacional.

Cargo ou função
Membro titular da Comissão de Ensino segundo portaria IGCE no. 074/93.
9/1993 - 8/1995
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Geociências e Ciências Exatas de Rio Claro, Departamento de Estatística, Matemática Aplicada e Computacional.

Cargo ou função
Coordenador de Curso de Graduação portaria IGCE 061/93.
3/1993 - 9/1993
Outras atividades técnico-científicas , Instituto de Geociências e Ciências Exatas de Rio Claro, Instituto de Geociências e Ciências Exatas de Rio Claro.

Atividade realizada
Desenvolvedor do Projeto: "Construção do Protótipo para Sistemas de Gerenciamento de Pessoas" no contexto dos Sistemas de Administração Central da USP..
8/1989 - 3/1990
Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Ciências de Bauru, Departamento de Computação.

Cargo ou função
membro de conselho de departamento.
4/1989 - 3/1990
Ensino, Bacharelado em Ciências da Computação, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Introduçào à Computação
Inteligência Artificial
Banco de Dados
Gerência e Recuperação da Informação


Linhas de pesquisa


1.
Banco de dados para extração de conhecimento e análise de dados

Objetivo: Criar novas técnicas para para extração de conhecimento e análise de dados em bancos de dados de e-Science.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação / Especialidade: Sistemas de Informação.
Setores de atividade: Desenvolvimento de Programas (Software) e Prestação de Serviços em Informática.
Palavras-chave: análise de dados; banco de dados; banco de dados analíticos.
2.
Controle de Transações e Integração de Sistemas de Bancos de Dados

Objetivo: Prover novas técnicas e conceitos para Controle de Transações e Integracao de Sistemas de Bancos de Dados.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação / Especialidade: Engenharia de Software.
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação / Especialidade: Sistemas de Informação.
Setores de atividade: Desenvolvimento de Programas (Software) e Prestação de Serviços em Informática.
Palavras-chave: banco de dados heterogêneos; Base de Dados distribuídas; base de dados heterogêneas; scientific workflows.


Projetos de pesquisa


2016 - Atual
Storage, Modeling and Analysis of Dynamical Systems for e-Science Applications.
Descrição: The astonishing fast rate of technology evolution has given rise to a new era of scientific knowledge discovery. This new age of science, known as e-Science, is described as the new great computational and multidisciplinary team science requiring novel methodologies for data storage, modeling and analysis. In particular, the development of transactional and analytical software systems for e-Science applications when viewed from a dynamic systems perspective, presents a number of new computational challenges. Among them are the scientific knowledge discovery processes, which involve frequent changes of requirements for data storage, modeling and analysis. The need to address scientific dynamic systems in order to cope with complex applications of e-Science has woken up the scientific community for the development of robust and evolutionary software systems to meet these new challenges. Dynamical system is the classical mathematical formalism to represent phenomena that evolute with time, which are of great interest in science. In this project, our main goal is to develop computational models and methodologies to support e-Science applications viewed as dynamic systems. Our fundamental research covers three key research areas, namely storage, modeling, and analysis of dynamic systems. These research areas are significant and relevant to the FAPESP e-Science Program since many of the present e-Science challenges are related to the proper treatment of dynamic systems. Hence, we plan to develop and apply computational methodologies that will ease the development of e-Science applications, thereby contributing to the improvement of worldwide scientific knowledge, while respecting legal and ethical restrictions in data management..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (2) .
Integrantes: João Eduardo Ferreira - Coordenador.Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
2015 - Atual
The use of modern autopsy techniques to investigate human diseases
Descrição: Ao longo de toda a história, desde os primeiros estudos anatômicos conhecidos na Idade Média até o uso de modernas técnicas moleculares para o estudo de processos fisiopatológicos, a autópsia mostrou ser um processo importante e fonte de muito material para o avanço do conhecimento científico. Apesar do surgimento de um amplo conjunto de técnicas de imagem vários estudos têm demonstrado que a autópsia continua a ser crucial para a avaliação integrada do processo de doença, a avaliação de novas patologias e controle de qualidade do serviço médico. Neste projeto objetiva-se empregar novas técnicas apoiada pelos serviços computacionais tanto para controle operacional como análise de dados..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (2) .
Integrantes: João Eduardo Ferreira - Integrante / Paulo Hilário Nascimento Saldiva - Coordenador / Antonio Carlos Pedroso de Lima - Integrante / Julio da Motta Singer - Integrante.Financiador(es): (FAPESP) Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
2015 - Atual
Detecção de Multieventos em Fontes de Dados Ativas e Altamente Heterogêneas
Descrição: A Internet tem tratado várias fontes de dados ativas e altamente heterogêneas permitindo novas aplicações e acesso a informações valiosas. Duas dimensões da heterogeneidade têm dificultado o acesso pleno e crescente de novas informações. A primeira dimensão é a enorme variedade de fontes de dados e conteúdo incluindo seu formato e estrutura. A segunda dimensão é o crescimento exponencial das fontes de dados ativas e inteligentes, como smartphones, que geram muitos tipos de dados com mais de 20 sensores físicos e com enorme variedade nas mídias sociais. Assim, propomos uma pesquisa para a integração de fontes de dados ativas e altamente heterogêneas para detectar multieventos. Multieventos são sequências de eventos que terminam em um evento principal. Exemplos de multieventos incluem desastres naturais, tais como desliza-mentos de terra e desastres nucleares. Primeiro, vamos construir ferramentas de software para apoiar dois tipos de alta heterogeneidade: fontes mutáveis e muitas fontes de multimídia não-estruturadas incluindo mídia social em línguas estrangeiras. Em seguida vamos utilizar esses conceitos e ferramentas em aplicações para mostrar sua viabilidade e avaliar a sua eficácia..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (1) .
Integrantes: João Eduardo Ferreira - Coordenador / Calton Pu - Integrante.Financiador(es): CAPES - Centro Anhanguera de Promoção e Educação Social - Auxílio financeiro.
2012 - 2014
Transactional Model and Performance Analysis for Business Processes and e-Science Applications.
Descrição: In modern science and business process studies the main challenge is not anymore in data acquisition but mainly in data processing, analysis, storage and transfer. To treat these challenges, work ow and business process systems have received increased attention from research and industry communities. Despite of the signi cant eorts and software tools developed, the work ows and business processes still oer a scenario with several research challenges, mainly related to the scalability and reliability of their execution in the new collaborative and high-performance computing platforms. In this pro ject, we are focusing in two important issues (called axes) belonging to this scenario: transaction processing and prediction of performance related to dierent phases of the work ow life cycle. The rst axis is related to transaction processing aiming to grant a exible and reliable environment for the modeling and execution of work ows. The second research axis is related to prediction of performance of work ows by means of formal modeling, in order to support a better provisioning of resources and a better scheduling of tasks in such type of applications. To validate the results obtained in these two research axes, we will use two real-world case studies that are important examples of both work ows and e-Science applications. In addition to the academic results provided in this project, we also hope to increase the research capability of the DATA group through two important research axes and also the validation of academic results based on two important case studies..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (2) .
Integrantes: João Eduardo Ferreira - Coordenador / Luciano V Araújo - Integrante / Marcio Katsumi Oikawa - Integrante / Osvaldo Kotaro Takai - Integrante / Kelly Rosa Braghetto - Integrante / Pedro Paulo de Souza Bento da Silva - Integrante / André Luis schwerz - Integrante / Marcela Ortega Garcia - Integrante / Rafael Liberato - Integrante.Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
2012 - Atual
Modelos e métodos de e-Science para ciências da vida e agrárias

Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Roberto Marcondes Cesar Junior em 05/08/2012.
Descrição: Este projeto visa a criação de uma rede colaborativa de eScience para acelerar pesquisa avançada em ciências da vida (biologia, medicina, oceanografia) e ciências agrárias. Está estruturado em tomo de cinco linhas de pesquisa - biologia de sistemas, planejamento de safras, computação visual, modelagem matemática e bancos de dados. Vigência: 01 de fevereiro de 2012 - 31 de janeiro de 2016. Coordenador Geral Roberto Marcondes Cesar Jr.. Coordenador da área de Banco de Dados: João Eduardo Ferreira..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Doutorado: (2) .
Integrantes: João Eduardo Ferreira - Integrante / Marcelo Camacho Souza - Integrante / Roberto Marcondes Cesar Junior - Coordenador / João Marcelo Borovina Josko - Integrante.
2012 - Atual
Núcleo e-Science de Apoio a Pesquisa da Universidade de São Paulo

Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Roberto Marcondes Cesar Junior em 05/08/2012.
Descrição: Projeto financiado pela Pró-Reitoria de Pesquisa da Universidade de Sáo Paulo. vigência 30/06/2012 a 30/05/2016. Coordenador Geral: Roberto Marcondes Cesar Jr.. Coordenador da área de Banco de Dados: João Eduardo Ferreira..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (1) .
Integrantes: João Eduardo Ferreira - Integrante / Marcelo Camacho Souza - Integrante / Roberto Marcondes Cesar Junior - Coordenador / Mina Cintho - Integrante / João Marcelo Borovina Josko - Integrante.Financiador(es): Universidade de São Paulo - Auxílio financeiro.
2012 - Atual
Sao Paulo- Minas Gerais Neglected Tropical Disease Research Center for Biomarker Discovery

Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Ester Cerdeira Sabino em 18/01/2013.
Descrição: Chagas disease remains one of the most neglected diseases in the world, with recent estimates indicating 8-10 million infected people in Latin and Central America and only one marginally effective therapeutic. The lack of good biomarkers for active infection or clinical end-points poses a problem both for individual patient prognosis and for assessing the performance of new drugs or therapeutic interventions. In this project the main computer challenge is the development of database system in order to integrate data clinical and data tests from patients..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (1) .
Integrantes: João Eduardo Ferreira - Integrante / Ester C. Sabino - Coordenador / Osvaldo Kotaro Takai - Integrante / Helves Domingues - Integrante / Leonardo Tadashi Kamaura - Integrante.Financiador(es): National Institure of Health- USA - Auxílio financeiro.
2010 - Atual
Criação e análise de indicadores de dados clínicos e moleculares de pacientes HIV para gestão e tomada de decisão do PN-DST-AIDS
Descrição: Desenvolvimento de ferramentas computacionais para criação e análise de indicadores dos dados clínicos e moleculares de pacientes HIV para gestão e tomada de decisão do Departamento de DST, Aids e Hepatites Virais, bem como a Implementação do Teste de Genotipagem para detecção de mutações que geram resistência ao Inibidor de Entrada ? Enfuvirtida ? em pacientes submetidos ao HAART, mas sem tratamento prévio com esta classe de drogas..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) .
Integrantes: João Eduardo Ferreira - Coordenador / Luciano V Araújo - Integrante / Ester C. Sabino - Integrante / Leonardo Tadashi Kamaura - Integrante.Financiador(es): Ministéria da Saúde - Programa Nacional Doenças Sexualmente Transmissíveis - Cooperação.
2007 - 2009
Análise e Classificação de Comportamentos de Doadores de Sangue em Banco de Dados Multidimensionais
Descrição: Um dos desafios para aplicações E-Science é a análise em larga escala de séries temporais, originárias de grandes bancos de dados multidimensionais. Este projeto propõe a integração de algoritmos de visualização e classificação não-supervisionada de séries temporais armazenadas em banco de dados multidimensionais. Essa integração será validada com a utilização de um banco de dados real de doadores de sangue de três grandes hemocentros do Brasil, de modo a melhor caracterizar o comportamento desses doadores tendo em vista a melhoria da segurança transfusional..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (2) .
Integrantes: João Eduardo Ferreira - Coordenador / Roberto Marcondes Cesar Junior - Integrante / Ester C. Sabino - Integrante / Nina Sumiko Tomita Hirata - Integrante.Financiador(es): (CNPq) Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
2007 - Atual
Retrovirus Epidemiology Donor Study - REDS
Descrição: Descrição: Há 15 anos os National Institute of Health nos Estados Unidos financia um grupo de seis bancos de sangue nos EUA denominado REDS (Retrovirus Epidemiology Donor Study) que desenvolvem pesquisas relacionadas à segurança transfusional. Em 2005, uma concorrência para que outros países submetessem projetos de pesquisa para fazerem parte desta rede. Com base no mérito do trabalho, foram escolhidos o Brasil e a China para participarem desta nova etapa, que se chama REDS Internacional O projeto terá duração de 4 anos e serão aplicados cerca de US 3 milhões na proposta brasileira. Três hemocentro brasileiros (Fundação Pró-Sangue/ Hemocentro de São Paulo, Hemominas, e HEMOPE) submeteram um proposta juntamente com o Blood Systems Research Institute (BSRI) em São Francisco. Este projeto também terá a participação do Departamento de Ciência da Computação do IME/USP e do Depto. de Medicina Preventiva e Social da UFMG. O projeto será liderado pela Dra Ester C Sabino da Fundação Pró-Sangue e terá a participação dos seguintes pesquisadores do Brasil: Anna Barbara F. Carneiro-Proietti- Fundação Hemominas Divaldo Sampaio - HEMOPE Thelma Gonzalez - Fundação Pró-Sangue Hemocentro de São Paulo Fernando A Proietti - Depto. de Medicina Preventiva e Social da Universidade Federal de Minas Gerais João Eduardo Ferreira - Departamento de Ciência da Computação do Instituto de Matemática e Estatística da Universidade de São Paulo. O principal objetivo do estudo é obter informações que possam reverter na melhoria da segurança transfusional. O projeto prevê o desenvolvimento de um banco de dados que auxilie os hemocentros a analisar os dados guardados por seu sistema operacional. Serão desenvolvidos 3 projetos de pesquisa: a) Risco residual de transmissão de HIV b) Estudo epidemiológico epidemiológico relacionado à validade das perguntas usadas na triagem de doadores. c) Historia Natural da doença de Chagas, com História natural da doença de Chagas..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (1) .
Integrantes: João Eduardo Ferreira - Coordenador / Pedro Paulo de Souza Bento da Silva - Integrante / Pedro L. Takecian - Integrante.Financiador(es): National Institure of Health- USA - Cooperação.
2006 - 2009
Processamento de Requisições em Larga Escala Utilizando o Conceito de Plano de Navegação
Descrição: Processamento de requisição é uma aplicação importante no gerenciamento de processos de negócio. Dois dos principais desafios para projeto e implementação de sistemas de processamento de requisi-ções são: (1) inter-operação e integração de sistemas de informação autônomos e heterogêneos; (2) evolução flexível e composição de elementos de software que implementam o workflow de processa-mento de requisições. Nesse projeto de pesquisa propomos o conceito de Plano de Navegação como solução para vários desafios de processamento de requisições. A hipótese principal de nossa pesquisa é que os três estágios de processamento de requisições podem ser separados, implementados, integrados e executados através de interfaces que apóiam tanto a integração de sistemas autônomos e heterogêneos como também a evolução flexível de workflows. Os três estágios são: primeiro, um cli-ente (usuário ou outro programa) gera uma requisição, isto é, um pedido de informação, materiais ou serviços; segundo, a requisição é validada através de uma série de passos de negócio. Isso é impor-tante desde que as requisições validadas possam ser finalizadas apenas quando elas satisfaçam as exigências especificadas nos passos de negócio; terceiro, a requisição validada é submetida aos pro-cessos de execução apropriados para atender às exigências especificadas. A representação e execu-ção de passos de negocio em ambientes de workflows tem gerado vários desafios. Um deles é: Qual é a melhor fundamentação formal e linguagem para controlar padrões de workflow? Algumas das lin-guagens workflow advogam abordagem de Redes de Petri ou Álgebra de Processos, como fundamen-tação formal. Entretanto, a implementação de padrões de workflow descritas por Álgebra de Proces-sos ainda é um problema em aberto. Nessa pesquisa, Álgebra de Processos tem sido usada para representar uma descrição semi-formal da linguagem de definição de Plano de Navegação (NPDL). Seis atividades são propostas nesse projeto de pesquisa para aprofu.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (3) Doutorado: (3) .
Integrantes: João Eduardo Ferreira - Coordenador.Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.Número de orientações: 2
2002 - 2006
Desenvolvimento de ambiente informatizado para análise determinística de dados epidemiológicos e de resistência genotípica do HIV-1.
Descrição: Este projeto pretende implementar um banco de dados através da integração de bancos do Programa de DST-AIDS já existentes (SICLOM, SISCEL e RENAGENO) de modo a viabilizar os elementos analíticos para cruzamento de informações vinculadas aos aspectos clínicos, epidemiológicos e de genotipagem dos pacientes com HIV positivo. Pretende-se também adequar ferramentas de bioinformática que permitam analisar sequências do HIV, gerando laudos de genotipagem e subtipagem..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Especialização: (2) / Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (1) .
Integrantes: João Eduardo Ferreira - Coordenador.Financiador(es): Ministério da Saúde - Auxílio financeiro.Número de orientações: 2
2001 - 2006
Aproximação Genômica e Pós-Genômica ao Estudo das Malárias Humanas de Plasmodium vivax e Plasmodium falciparum na Amazônia Brasileira.-ClinMalDB
Descrição: A finalização do genoma de P. falciparum, bem como avanços significativos no genoma de P. vivax foram anunciados recentemente na revista Nature [415:702-709 (2002)]. Este projeto propõe o uso de abordagens genômicas e pós-genômicas em três áreas principais de pesquisa em malária: fatores de virulência, genética de populações e quimioterapia. Além disso, através da integração com o Núcleo de Bioinformática da USP, propomos a criação de um banco de dados de seqüências e imagens de microarrays (MalDB) para explorar de modo completo toda essa nova informação biológica..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) .
Integrantes: João Eduardo Ferreira - Integrante / Hernando A del Portillo, - Coordenador.Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.Número de orientações: 1
2000 - 2003
Indexing and Data Mining in Multimedia Databases-ImiMD
Descrição: Indexação de resultados de classificadores em grandes volumes de dados..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) .
Integrantes: João Eduardo Ferreira - Integrante / Caetano Traina Junior - Coordenador.Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.Número de orientações: 1
1999 - 2003
Cooperation for Analysis of Gene Expression-CAGE
Descrição: Cooperação entre professores dos departamentos de Bioquímica e Ciência da Computação da USP para o desenvolvimento de tecnologia para a análise de expressão gênica em diversos contextos biológicos. O projeto contempla a montagem de um laboratório de microarrays na Bioquímica e um laboratório de bioinformática na Computação, que permitam o desenvolvimento de todo processo de análise de expressão gênica por microarrays, desde a preparação bioquímica dos experimentos e aquisição dos dados, até a análise quantitativa desses dados..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) .
Integrantes: João Eduardo Ferreira - Integrante / Hugo H Armelin - Coordenador.Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.Número de orientações: 2


Projetos de desenvolvimento


2015 - Atual
Conectividade da USPnet com a ANSP: Resiliência da USPnet e Hospedagem da InterNuvem.
Descrição: O objtivo principal é a evolução tecnológica da rede de telecomunicações da USP (USPnet) para que a mesma disponibilize ao usuário final uma estrutura de comunicação ubíqua e pervasiva. Mais concretamente pretende-se assegurar à USPnet um desempenho de qualidade boa e equiparável em qualquer localização ou campi da USP, independente do ponto de provimento..
Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento.
2010 - 2011
Desenvolvimento de ferramentas computacionais para criação e análise de indicadores dos dados clínicos e moleculares de pacientes HIV para gestão e tomada de decisão do Departamento de DST, Aids e Hepatites Virais
Descrição: O Departamento de DST, Aids e Hepatites Virais precisa de ferramentas de Bioinformática para auxiliar a análise dos seus resultados. Esse projeto deseja alcançar: 1) capacitação técnica para entendimento do ambiente computacional e o código fonte dos sistemas: DBCollHIV, HIVdag e extração e análise de indicadores dos dados clínicos e moleculares; 2) domínio e aplicação das técnicas de classificação e análise de dados clínicos e moleculares bem como a identificação automatizada das associações entre mutações e resistência a drogas. 3) desenvolvimento do algoritmo para identificação de mutações tendo como ponto de partida arquivos de seqüências em formato FASTA; 4) Sistemas transacionais para inserção de dados clinicos e moleculares confiáveis e disponívieis na internet..
Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento.
2002 - 2004
Data Warehouse para análise de dados do banco de sangue do Hospital Israelita Albert Einstein
Descrição: Data Warehouse para análise de dados do banco de sangue do Hospital Israelita Albert Einstein..
Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento.
Alunos envolvidos: Especialização: (2) / Mestrado acadêmico: (2) .
Integrantes: João Eduardo Ferreira - Coordenador.Financiador(es): Instituto Israelita de Ensino e Pesquisa Albert Einstein - Auxílio financeiro.Número de orientações: 2
2001 - 2003
Banco de dados de produtos e serviços para pessoas portadoras de deficiência
Descrição: Banco de dados de produtos e serviços para pessoas portadoras de deficiência, junto ao CECAE-USP.
Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento.
2000 - 2004
Otimização de acesso a disco para grandes volumes de dados.
Descrição: otimização de técnicas de acesso a disco baseado em dois conceitos de projeto físico de bancos de dados: indexação e cache..
Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento.


Membro de corpo editorial


2012 - Atual
Periódico: IEEE Transactions on Services Computing


Membro de comitê de assessoramento


2009 - Atual
Agência de fomento: (FAPESP) Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo


Revisor de periódico


2006 - Atual
Periódico: Journal of the Brazilian Computer Society (0104-6500)
2006 - Atual
Periódico: INFOCOMP. Journal of Computer Science (1807-4545)
2005 - Atual
Periódico: Revista de Informática Teórica e Aplicada (0103-4308)
2005 - Atual
Periódico: Genetics and molecular research
2011 - Atual
Periódico: Journal of IEEE Transactions on Services Computing


Revisor de projeto de fomento


2010 - Atual
Agência de fomento: (CAPES) Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
2008 - Atual
Agência de fomento: (FAPESP) Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo
2008 - Atual
Agência de fomento: (CNPq) Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Sistemas de Computação/Especialidade: Arquitetura de Sistemas de Computação.
2.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação/Especialidade: Banco de Dados.
3.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação.


Idiomas


Inglês
Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Bem.
Português
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Espanhol
Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente, Escreve Razoavelmente.


Prêmios e títulos


2018
Best Student Paper Award:, Services Conference Federation -ICWS 2018.
2018
Outstanding Services Awards for SCF 2018, Services Conference Federation.
2017
Prêmio de Destaque CIO SP de 2017, IT4CIO.
2014
Prêmio de Melhor Artigo dos Anais do SBBD 2014: http://www.inf.ufpr.br/sbbd-sbsc2014/sbbd/premiacao.htm, Sociedade Brasileira de Computação.
2009
Prêmio de Incentivo em Ciência e Tecnologia para o SUS com o trabalho: HIVSetSubtype, Software for subtype classification of HIV-1, SUS-Ministério da Saúde.
2008
Best Student Paper Award:"Business Processes Management Using Process Algebra and Relational Database Model", International Conference in e-Business (ICE-B).
2007
Prêmio de Incentivo em Ciência e Tecnologia para o SUS com o trabalho: Sistema Cooperativo para Estudos do HIV/AIDS no Brasil., Ministério da Saúde.
2007
Professor homenageado dos formandos do BCC - 2007, USP - São Paulo, IME-USP.
2004
2 º colocado do concurso modalidade Monografias do VII Prêmio CONIP 2004 de Excelência em Informática Aplicada aos Serviços Públicos., VII Prêmio CONIP 2004 - Órgão: SUCESU-SP e IDETI..
2003
Prêmio jovens talentos 2003 - Coordenador da equipe, IBM - http://www.ibm.com/news/br/2003/03/18-03-2003.html.
2001
Melhor Site Transacional de Serviços Públicos - Posto Fiscal Eletrônico Secretaria da Fazenda do Estado de São Paulo, CONIP - 2001.
1996
Paraninfo dos Formandos de 1996 - BCC Unesp Rio Claro, UNESP- Rio Claro.
1995
Professor homenageado dos formandos do BCC - 1995, UNESP - Rio Claro.
1994
Professor homenageado dos formandos do BCC de 1994, UNESP - Rio Claro.


Produções



Produção bibliográfica
Citações

Web of Science
Total de trabalhos:60
Total de citações:292
Fator H:8
Ferreira, João E  Data: 21/07/2018

SCOPUS
Total de trabalhos:76
Total de citações:475
h-index 11: https://www.scopus.com/authid/detail.uri?authorId=7403252472  Data: 12/07/2017

Outras
Total de trabalhos:184
Total de citações:1223
h-index 19: https://scholar.google.com/citations?user=wR2O6I0AAAAJ&hl=en  Data: 12/07/2018

Artigos completos publicados em periódicos

1.
SCHWERZ, ANDRE LUIS2018 SCHWERZ, ANDRE LUIS ; LIBERATO, RAFAEL ; Pu, Calton ; Ferreira, Joao Eduardo . Robust and Reliable Process-Aware Information Systems. IEEE Transactions on Services Computing, v. 1, p. 1-1, 2018.

2.
DIGIAMPIETRI, LUCIANO ANTONIO2018DIGIAMPIETRI, LUCIANO ANTONIO ; Ferreira, João Eduardo . Desambiguação de nomes de autores para a identificação automática de perfis acadêmicos. EM QUESTÃO, v. 24, p. 37, 2018.

3.
CARNEIRO-PROIETTI, ANNA B. F.2018CARNEIRO-PROIETTI, ANNA B. F. ; KELLY, SHANNON ; MIRANDA TEIXEIRA, CAROLINA ; Sabino, Ester C. ; ALENCAR, CECILIA S. ; Capuani, Ligia ; SALOMON SILVA, TASSILA P. ; ARAUJO, ADERSON ; LOUREIRO, PAULA ; MÁXIMO, CLÁUDIA ; LOBO, CLARISSE ; FLOR-PARK, MIRIAM V. ; RODRIGUES, DANIELA O. W. ; MOTA, ROSIMERE A. ; Gonçalez, Thelma T. ; HOPPE, CAROLYN ; Ferreira, João E. ; OZAHATA, MINA ; PAGE, GRIER P. ; GUO, YUELONG ; PREISS, LILIANA R. ; BRAMBILLA, DONALD ; Busch, Michael P. ; Custer, Brian . Clinical and genetic ancestry profile of a large multi-centre sickle cell disease cohort in Brazil. BRITISH JOURNAL OF HAEMATOLOGY, v. 1, p. bjh.15462, 2018.

4.
YANCY-CABALLERO, DAISON2017YANCY-CABALLERO, DAISON ; LING, LIU Y. ; ARCHILHA, NATHALY L. ; FERREIRA, J. E. ; DRIEMEIER, C. . Mineral Particles in Sugar Cane Bagasse: Localization and Morphometry Using Microtomography Analysis. ENERGY & FUELS (ONLINE), v. 31, p. 12288-12296, 2017.

5.
Capuani, Ligia2017Capuani, Ligia ; BIERRENBACH, ANA LUIZA ; PEREIRA ALENCAR, AIRLANE ; Mendrone, Alfredo ; FERREIRA, J. E. ; Custer, Brian ; P. RIBEIRO, ANTONIO LUIZ ; SABINO, Ester Cerdeira . Mortality among blood donors seropositive and seronegative for Chagas disease (1996-2000) in São Paulo, Brazil: A death certificate linkage study. PLoS Neglected Tropical Diseases, v. 11, p. e0005542, 2017.

6.
BOROVINA JOSKO, J. M.2016BOROVINA JOSKO, J. M. ; FERREIRA, J. E. . Visualization properties for data quality visual assessment: An exploratory case study. Information Visualization (Print), v. 1, p. 1-20, 2016.

7.
CARDOSO, CLARECI SILVA2016CARDOSO, CLARECI SILVA ; Sabino, Ester Cerdeira ; OLIVEIRA, CLAUDIA DI LORENZO ; DE OLIVEIRA, LEA CAMPOS ; FERREIRA, ARIELA MOTA ; CUNHA-NETO, EDÉCIO ; BIERRENBACH, ANA LUIZA ; Ferreira, João Eduardo ; HAIKAL, DESIRÉE SANT'ANA ; REINGOLD, ARTHUR L ; RIBEIRO, ANTONIO LUIZ P . Longitudinal study of patients with chronic Chagas cardiomyopathy in Brazil (SaMi-Trop project): a cohort profile. BMJ Open, v. 6, p. e011181, 2016.

8.
DRIEMEIER, CARLOS2016DRIEMEIER, CARLOS ; LING, LIU YI ; SANCHES, GUILHERME M. ; PONTES, ANGÉLICA O. ; MAGALHÃES, PAULO S. GRAZIANO ; Ferreira, João E. . A computational environment to support research in sugarcane agriculture. Computers and Electronics in Agriculture, v. 130, p. 13-19, 2016.

9.
ALMEIDA, FERNANDA NASCIMENTO2016ALMEIDA, FERNANDA NASCIMENTO ; TUNES, GISELA ; DA COSTA, JULIO CEZAR BRETTAS ; Sabino, Ester Cerdeira ; MENDRONE-JÚNIOR, ALFREDO ; Ferreira, João Eduardo . A provenance model based on declarative specifications for intensive data analyses in hemotherapy information systems. Future Generation Computer Systems, v. 59, p. 105-113, 2016.

10.
Busch, Michael P.2016Busch, Michael P. ; Sabino, Ester C. ; BRAMBILLA, DONALD ; LOPES, MARIA ESTHER ; Capuani, Ligia ; CHOWDHURY, DHULY ; MCCLURE, CHRISTOPHER ; LINNEN, JEFFREY M. ; PRINCE, HARRY ; SIMMONS, GRAHAM ; LEE, TZONG-HAE ; KLEINMAN, STEVEN ; CUSTER, BRIAN . Duration of Dengue Viremia in Blood Donors and Relationships Between Donor Viremia, Infection Incidence and Clinical Case Reports During a Large Epidemic. JOURNAL OF INFECTIOUS DISEASES, v. 214, p. 49-54, 2016.

11.
Sabino, Ester C.2016Sabino, Ester C. ; LOUREIRO, PAULA ; LOPES, MARIA ESTHER ; Capuani, Ligia ; MCCLURE, CHRISTOPHER ; CHOWDHURY, DHULY ; DI-LORENZO-OLIVEIRA, CLAUDIA ; OLIVEIRA, LEA C. ; LINNEN, JEFFREY M. ; LEE, TZONG-HAE ; GONÇALEZ, THELMA ; BRAMBILLA, DONALD ; KLEINMAN, STEVE ; Busch, Michael P. ; CUSTER, BRIAN . Transfusion-Transmitted Dengue and Associated Clinical Symptoms During the 2012 Epidemic in Brazil. JOURNAL OF INFECTIOUS DISEASES, v. 213, p. 694-702, 2016.

12.
DIAZ, RICARDO SOBHIE2015DIAZ, RICARDO SOBHIE ; INOCÊNCIO, LILIAN A. ; SUCUPIRA, Maria Cecilia Araripe ; PEREIRA, ANDERSON ALVARENGA ; HUNTER, JAMES ; FERREIRA, J. E. ; ARAÚJO, LUCIANO V. ; SOUZA, DENISE F. C. ; SABINO, Ester Cerdeira . The Virological and Immunological Characteristics of the HIV-1-Infected Population in Brazil: From Initial Diagnosis to Impact of Antiretroviral Use. Plos One, v. 10, p. e0139677, 2015.

13.
OZAHATA, MINA CINTHO2015OZAHATA, MINA CINTHO ; Sabino, Ester Cerdeira ; DIAZ, R. S. ; CESAR-JR, ROBERTO M ; FERREIRA, J. E. . Data-intensive analysis of HIV mutations. BMC Bioinformatics, v. 16, p. PMC4344997, 2015.

14.
FERREIRA, S. C.2014FERREIRA, S. C. ; DE ALMEIDA-NETO, C. ; NISHIYA, A. S. ; DI-LORENZO-OLIVEIRA, C. ; FERREIRA, J. E. ; ALENCAR, C. S. ; LEVI, J. E. ; SALLES, N. A. ; MENDRONE-JUNIOR, A. ; SABINO, E. C. . Prevalence of Treponema pallidum DNA among blood donors with two different serologic tests profiles for syphilis in São Paulo, Brazil. Vox Sanguinis (Basel. 1956), v. 106, p. 376-378, 2014.

15.
FERREIRA, S. C.2014FERREIRA, S. C. ; DE ALMEIDA-NETO, C. ; NISHIYA, A. S. ; OLIVEIRA, C. D. L. ; FERREIRA, J. E. ; ALENCAR, C. S. ; LEVI, J. E. ; SALLES, N. A. ; MENDRONE JR., A. ; SABINO, E. C. . Demographic, risk factors and motivations among blood donors with reactive serologic tests for syphilis in São Paulo, Brazil. Transfusion Medicine (Print), v. 24, p. 169-175, 2014.

16.
Capuani, Ligia2014Capuani, Ligia ; BIERRENBACH, ANA LUIZA ; ABREU, FATIMA ; TAKECIAN, PEDRO LOSCO ; FERREIRA, J. E. ; SABINO, Ester Cerdeira . Accuracy of a probabilistic record-linkage methodology used to track blood donors in the Mortality Information System database. Cadernos de Saúde Pública (ENSP. Impresso), v. 30, p. 1623-1632, 2014.

17.
STEINMACHER, Igor Fábio2014STEINMACHER, Igor Fábio ; WIESE, Igor Scaliante ; SCHWERZ, André Luís ; ROBERTO, Rafael Liberato ; FERREIRA, J. E. ; GEROSA, Marco Aurélio . HISTORICAL ANALYSIS OF MESSAGE CONTENTS TO RECOMMEND ISSUES TO OPEN SOURCE SOFTWARE CONTRIBUTORS. REVISTA ELETRÔNICA DE SISTEMAS DE INFORMAÇÃO (RESI), v. 13, p. 6, 2014.

18.
LOUREIRO, PAULA2014LOUREIRO, PAULA ; ALMEIDA-NETO, CESAR DE ; PROIETTI, ANNA BÁRBARA CARNEIRO ; Capuani, Ligia ; GONÇALEZ, THELMA TEREZINHA ; OLIVEIRA, CLAUDIA DI LORENZO DE ; Leão, Silvana Carneiro ; LOPES, MARIA INÊS ; Sampaio, Divaldo ; Patavino, Giuseppina Maria ; Ferreira, João Eduardo ; Blatyta, Paula Fraiman ; LOPES, MARIA ESTHER DUARTE ; MENDRONE-JUNIOR, ALFREDO ; Salles, Nanci Alves ; KING, MELISSA ; MURPHY, EDWARD ; Busch, Michael ; Custer, Brian ; Sabino, Ester Cerdeira . Contribution of the Retrovirus Epidemiology Donor Study (REDS) to research on blood transfusion safety in Brazil. Revista Brasileira de Hematologia e Hemoterapia, v. 36, p. 152-158, 2014.

19.
Takecian, Pedro L.2013Takecian, Pedro L. ; OIKAWA, MARCIO K. ; BRAGHETTO, KELLY R. ; ROCHA, PAULO ; LUCENA, FRED ; KAVOUNIS, KATHERINE ; SCHLUMPF, KAREN S. ; ACKER, SUSAN ; CARNEIRO-PROIETTI, ANNA B.F. ; Sabino, Ester C. ; Custer, Brian ; Busch, Michael P. ; Ferreira, João E. . Methodological guidelines for reducing the complexity of data warehouse development for transactional blood bank systems. Decision Support Systems, v. 55, p. 728-739, 2013.

20.
De Almeida-Neto, Cesar2013De Almeida-Neto, Cesar ; Sabino, Ester Cerdeira ; Liu, Jing ; Blatyta, Paula Fraiman ; Mendrone-Junior, Alfredo ; Salles, Nanci Alves ; Leão, Silvana Carneiro ; Wright, David J. ; Basques, Fernando Valadares ; Ferreira, João Eduardo ; Busch, Michael P. ; Murphy, Edward L. ; NHLBI RETROVIRUS EPIDEMIOLOGY DONOR STUDY-II (REDS-II), INTERNATIONAL COMPONENT . Prevalence of serologic markers for hepatitis B and C viruses in Brazilian blood donors and incidence and residual risk of transfusion transmission of hepatitis C virus. Transfusion (Arlington, Va.), v. 53, p. 827-834, 2013.

21.
Gonçalez, Thelma T.2013Gonçalez, Thelma T. ; Sabino, Ester C. ; SCHLUMPF, KAREN S. ; Wright, David J. ; MENDRONE, ALFREDO ; LOPES, MARIA ; LEÃO, SILVANA ; MIRANDA, CAROLINA ; Capuani, Ligia ; CARNEIRO-PROIETTI, ANNA BARBARA F. ; BASQUES, FERNANDO ; Ferreira, João E. ; Busch, Michael ; Custer, Brian ; NHLBI RETROVIRUS EPIDEMIOLOGY DONOR STUDY-II (REDS-II), INTERNATIONAL COMPONENT . Analysis of donor deferral at three blood centers in Brazil. Transfusion (Arlington, Va.), v. 53, p. 531-538, 2013.

22.
ALMEIDA, FERNANDA N.2013ALMEIDA, FERNANDA N. ; Sabino, Ester C. ; TUNES, GISELA ; Schreiber, George B. ; B. DA SILVA, PEDRO PAULO S. ; CARNEIRO-PROIETTI, ANNA BARBARA F. ; Ferreira, João Eduardo ; Mendrone-Junior, Alfredo . Predictors of low haematocrit among repeat donors in São Paulo, Brazil: eleven year longitudinal analysis. Transfusion and Apheresis Science, v. 49, p. 553-559, 2013.

23.
4BRAGHETTO, K. R.2012BRAGHETTO, K. R. ; FERREIRA, J. E. ; VINCENT, J. . Performance evaluation of resource-aware business processes using stochastic automata networks. INTERNATIONAL JOURNAL OF INNOVATIVE COMPUTING, INFORMATION & CONTROL, v. v.8, p. 5295-5316, 2012.

24.
Patavino, Giuseppina Maria2012Patavino, Giuseppina Maria ; De Almeida-Neto, Cesar ; Liu, Jing ; Wright, David J. ; Mendrone-Junior, Alfredo ; Ferreira, Maria Inês Lopes ; de Freitas Carneiro, Anna Bárbara ; Custer, Brian ; Ferreira, João Eduardo ; Busch, Michael P. ; Sabino, Ester Cerdeira . Number of recent sexual partners among blood donors in Brazil: associations with donor demographics, donation characteristics, and infectious disease markers. Transfusion (Arlington, Va.), v. 52, p. 151-159, 2012.

25.
Sabino, Ester C.2012Sabino, Ester C. ; Gonçalez, Thelma T. ; Carneiro-Proietti, Anna Bárbara ; Sarr, Moussa ; Ferreira, João Eduardo ; Sampaio, Divaldo A. ; Salles, Nanci A. ; Wright, David J. ; Custer, Brian ; Busch, Michael ; FOR THE NHLBI RETROVIRUS EPIDEMIOLOGY DONOR STUDY-II (REDS-II), INTERNATIONAL COMPONENT . Human immunodeficiency virus prevalence, incidence, and residual risk of transmission by transfusions at Retrovirus Epidemiology Donor Study-II blood centers in Brazil. Transfusion (Arlington, Va.), v. 52, p. 870-879, 2012.

26.
Goncalez, Thelma T.2012Goncalez, Thelma T. ; Sabino, Ester C. ; Capuani, Ligia ; Liu, Jing ; Wright, David J. ; Walsh, Judy H. ; FERREIRA, JOAO E. ; Chamone, Dalton A. ; Busch, Michael P. ; Custer, Brian . Blood transfusion utilization and recipient survival at Hospital das Clinicas in São Paulo, Brazil. Transfusion (Arlington, Va.), v. 52, p. 729-738, 2012.

27.
GARCIA, M. O.2012GARCIA, M. O. ; BRAGHETTO, K. R. ; PU, C. ; FERREIRA, J. E. . An Implementation of a Transaction Model for Business Process Systems. Journal of Information and Data Management - JIDM, v. 3, p. 271, 2012.

28.
FERREIRA, J. E.;Ferreira, Joao Eduardo;Ferreira, João Eduardo;Ferreira, João E.;FERREIRA, JOAO E.;FERREIRA, JOÃO E;Joao Eduardo Ferreira;Joao E. Ferreira;FERREIRA, JOAO;FERREIRA, J.E.;João Eduardo Ferreira,;João Eduardo Ferreira;FERREIRA, JO??O E.;CUSTER, BRIAN2012FERREIRA, J. E.; ARAUJO, L. V. ; BRAGHETTO, K. R. ; ITALIANO, I. C. ; OIKAWA, M. K. ; Takecian, P. L. . Long Lived Transaction Processing for Business Processes and Scientific Workflows. Journal of Information and Data Management - JIDM, v. 3, p. 33-50, 2012.

29.
Souza, Glaucia Mendes2011Souza, Glaucia Mendes ; Berges, Helene ; Bocs, Stephanie ; Casu, Rosanne ; D?HONT, ANGELIQUE ; Ferreira, João Eduardo ; Henry, Robert ; Ming, Ray ; Potier, Bernard ; Sluys, Marie-Anne ; Vincentz, Michel ; Paterson, Andrew H. . The Sugarcane Genome Challenge: Strategies for Sequencing a Highly Complex Genome. Tropical Plant Biology (Print), v. 4, p. 145-156, 2011.

30.
Araújo, Luciano V2011Araújo, Luciano V ; Malkowski, Simon ; Braghetto, Kelly R ; Passos-Bueno, Maria R ; Zatz, Mayana ; Pu, Calton ; FERREIRA, JOÃO E . A rigorous approach to facilitate and guarantee the correctness of the genetic testing management in human genome information systems. BMC Genomics, v. 12, p. S13-8, 2011.

31.
De Almeida-Neto, Cesar2011De Almeida-Neto, Cesar ; Liu, Jing ; Wright, David J. ; Mendrone-Junior, Alfredo ; Takecian, Pedro L. ; Sun, Yu ; Ferreira, Joao Eduardo ; de Alencar Fischer Chamone, Dalton ; Busch, Michael P. ; Sabino, Ester Cerdeira ; FOR THE NHLBI RETROVIRUS EPIDEMIOLOGY DONOR STUDY-II (REDS-II), INTERNATIONAL COMPONENT . Demographic characteristics and prevalence of serologic markers among blood donors who use confidential unit exclusion (CUE) in São Paulo, Brazil: implications for modification of CUE polices in Brazil. Transfusion (Arlington, Va.), v. 51, p. 191-197, 2011.

32.
12CARNEIRO-PROIETTI, A. B.2010CARNEIRO-PROIETTI, A. B. ; SABINO, E. C. ; Sampaio, Divaldo ; Proietti, Fernando A. ; GONCALVES, T. T. ; OLIVEIRA, C. D. L. ; FERREIRA, J. E. ; Liu, Jing ; Schreiber, George B. ; Murphy, Edward L. ; BUSCH, M. P. . Demographic profile of blood donors at three major Brazilian blood centers: results from the International REDS-II study, 2007 to 2008. TRANSFUSION (ONLINE), v. 50, p. 918-925, 2010.

33.
11OIKAWA, M. K.2010OIKAWA, M. K. ; MERINO, E. F. ; FERNANDEZ-BECERRA, C. ; WUNDERLICH, G. ; VILLALOBOS, J. M. ; SILVA, P. P. S. B. ; BARRERA, J. ; DURHAM, A. M. ; DELPORTILLO, H. A. ; FERREIRA, J. E. . CLINMALDB: A Clinical Field-Research Oriented Relational Database to Study Human Malaria. IADIS International Journal on WWWInternet, v. 8, p. 181-191, 2010.

34.
13CANTAO, M.2007CANTAO, M. ; FERREIRA, J. E. ; LEMOS, E. G. M. . Optimal Clones Identifier for Genomic Shotgun Libraries: OC Identifier Tool. GENETICS AND MOLECULAR RESEARCH, v. 6, p. 743-755, 2007.

35.
17ITALIANO, I.2006ITALIANO, I. ; FERREIRA, J. E. . Synchronization Options for Data Warehouse Designs. COMPUTER, v. 39, p. 53-57, 2006.

36.
18BARRETO, C. C.2006BARRETO, C. C. ; ARAÚJO, L. V. ; FERREIRA, J. E. ; SABINO, E. C. . Trends in Antiretroviral Drug Resistance and Clade Distributions Among HIV-1--Infected Blood Donors in Sao Paulo, Brazil. JAIDS-JOURNAL OF ACQUIRED IMMUNE DEFICIENCY SYNDROMES, v. 41, n.3, p. 388-341, 2006.

37.
16MERINO, E. F.2006MERINO, E. F. ; FERNANDEZ-BECERRA, C. ; DURHAM, A. M. ; FERREIRA, J. E. ; TUMILASCI, V. F. ; DARC-NEVES, J. ; DADARIO, A. ; SILVA-NUNES, M. ; FERREIRA, M. U. ; WICKRAMARACHCHI, T. A. ; PORTILLO, H. A. . Multi-character population study of the vir subtelomeric multigene superfamily of Plasmodium vivax, a major human malaria parasite. MOLECULAR AND BIOCHEMICAL PARASITOLOGY, v. 149, p. 10-16, 2006.

38.
15ALBRECHT, L.2006ALBRECHT, L. ; MERINO, E. F. ; HOFFMANN, E. H. E. ; FERREIRA, M. U. ; FERREIRA, R. G. M. ; OSAKABE, A. L. ; MARTHA, R. C. D. ; RAMHARTER, M. ; DURHAM, A. M. ; FERREIRA, J. E. ; PORTILLO, H. A. . Extense variant gene family repertoire overlap in Western Amazon Plasmodium falciparum isolates. MOLECULAR AND BIOCHEMICAL PARASITOLOGY, v. 150, p. 157-165, 2006.

39.
14ARAÚJO, L. V.2006ARAÚJO, L. V. ; SOARES, M. A. ; TANURI, A. ; OLIVEIRA, S. M. ; CHEQUER, P. ; SABINO, E. C. ; FERREIRA, J. E. . DBCollHIV: A Database System for Collaborative HIV analysis in Brazil. GENETICS AND MOLECULAR RESEARCH, v. 5, p. 203-215, 2006.

40.
19BARRERA, J.2004BARRERA, J. ; CESAR JUNIOR, R. M. ; FERREIRA, J. E. ; GUBITOSO, M. D. . An environment for knowledge discovery in biology. COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE, Washington, DC ,USA, July 2004, v. 34, n.5, p. 371-459, 2004.

41.
20OIKAWA, M. K.2004OIKAWA, M. K. ; BROINIZI, M. E. ; DERMAGOS, A. ; ARMELIN, H. A. ; FERREIRA, J. E. . GenFlow: generic flow for integration, management and analysis of molecular biology data. GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY, http://www.scielo.br/, v. 27, n.4, p. 691-695, 2004.

Livros publicados/organizados ou edições
1.
FERREIRA, J. E.; SPANOUDAKIS, G. (Org.) ; Ma, Y. (Org.) ; ZHANG, L-J (Org.) . Services Computing SCC 2018. 1. ed. Switzerland: Lecture Notes in Computer Science - Springer, 2018. v. 10969. 192p .

2.
Marcovitch, Jacques ; Goldemberg, José ; Axel-Berg, Justin ; Righetti, Sabine ; Santos, Solange Maria dos ; Oliveira, Luiz Nunes de ; Grácio, Maria Cláudia Cabrini ; Rosas, Fábio Sampaio ; Ranieri, Nina ; Pedrosa, Renato ; Pereira, Micael Waldhelm ; Cruz, Carlos Henrique de Brito ; Shimizu, Karen ; Ferreira, João Eduardo ; Machado, Raul ; Segurado, Aluisio Cotrim ; Beppu, Marisa Masumi ; Holland, Helber ; Guimarães, José Augusto Chaves . Repensar a universidade: desempenho acadêmico e comparações internacionais. 1a. ed. Universidade de São Paulo. Escola de Comunicações e Artes, 2018.

3.
MUSAEV, A. (Org.) ; FERREIRA, J. E. (Org.) ; HIGASHINO, T. (Org.) . 37th IEEE International Conference on Distributed Computing Systems Workshops - ICDCSW 2017. 1. ed. Atlanta-GA: IEEE Computer Society, 2017. v. 1. 101p .

4.
MORO, M. M. (Org.) ; GALANTE, R. (Org.) ; HARA, C. S. (Org.) ; MARTINS, V. (Org.) ; MACEDO, J. A. (Org.) ; SOUZA, F. R. C. (Org.) ; FERREIRA, J. E. (Org.) ; PORTO, F. (Org.) ; BRAGANHOLO, V. (Org.) . Proceedings of the 29th Brazilian Symposium on Databases. 29. ed. Porto Alegre, RS: Sociedade Brasileira de Computação, 2014. v. 1. 465p .

5.
CASANOVA, M. A. (Org.) ; FERREIRA, J. E. (Org.) ; GALANTE, R. (Org.) ; MONTEIRO FILHO, J. M. S. (Org.) ; MACHADO, J. C. (Org.) ; PORTO, F. (Org.) ; MOURA, A. M. C. (Org.) ; CIFERRI, C. D. A. (Org.) ; OIKAWA, M. K. (Org.) . Proceedings of the 27th Brazilian Symposium on Databases. 1. ed. Porto Alegre: Sociedade Brasileira de Computação, 2012. v. 1. 464p .

6.
MATTOSO, M. L. Q. (Org.) ; FERREIRA, J. E. (Org.) ; BRAGANHOLO, V. P. (Org.) . e-Science Workshop. 1. ed. Sociedade Brasileira de Computação, 2007. v. 1. 82p .

7.
FERREIRA, J. E.; FINGER, M. . Controle de Concorrência e Distribuição de Dados: a teoria clássica, suas limitações e extensões modernas. 1a. ed. Sao Paulo: Escola Brasileira de Computaçao 2000, 2000. 180p .

Capítulos de livros publicados
1.
FERREIRA, J. E.; FRANCO, B. D. G. M. ; CATARINO, M. H. ; TAKECIAN, P. L. ; AGOPYAN, V. . Datausp-PosGrad: Um Conjunto de Serviços Analíticos para Apoio à Tomada de Decisão da PRPG da USP. In: José Goldemberg. (Org.). USP 80 anos. 1ed.São Paulo - SP: EDUSP, 2015, v. 1, p. 431-452.

2.
BRAGHETTO, K. R. ; FERREIRA, J. E. ; PU, C. . NPTool: Towards Scalability and Reliability of Business Process Management (preprint). In: Joaquim Filipe; Mohammad S. Obaidat. (Org.). (Org.). e-Business and Telecommunications, Communications in Computer and Information Science.. 1ed.Berlin, Heidelberg: Springer, 2009, v. 48, p. 99-112.

3.
FERREIRA, J. E.; TAKAI, O. K. . Understanding database modeling. In: NCBI bookshelf. (Org.). Bioinformatics Tropical Disease Research: A Pratical Approach. : NCBI, 2008, v. , p. -.

Textos em jornais de notícias/revistas
1.
FERREIRA, J. E.. E-Science e workflows científicos: uma nova onda ou de fato um novo desafio ?. Computação Brasil, Porto Alegre RS, p. 3 - 3, 01 jan. 2007.

2.
FERREIRA, J. E.; TRAINA JUNIOR, C. . Multimédia: mythus - CD e som estéreo. Folha de São Paulo - Caderno de Informática. Folha de São Paulo, São Paulo, p. 6 - 8, 20 jul. 1994.

Trabalhos completos publicados em anais de congressos
1.
LIMA, R. A. ; Pu, Calton ; TAKECIAN, P. L. ; KAMAURA, L. T. ; FERREIRA, J. E. . Modeling Time-Critical Processes with WED-Flow. In: International Conference on Web Services, 2018, 2018, Seattle-WA. International Conference on Web Services. Switzerland: Lecture Notes in Computer Science - Springer - DOI 10.1109/UIC-ATC.2017.8397574, 2018. v. 10966. p. 34-48.

2.
PADILHA, BRUNO ; ROBERTO, R. L. ; SCHWERZ, A. L. ; PU, C. ; FERREIRA, J. E. . WED-SQL: an intermediate declarative language for PAIS execution. In: International Conference on Web Services, 2018, 2018, Seattle-WA. International Conference on Web Services. Switzerland: Lecture Notes in Computer Science - Springer - http://doi.org/10.1007/978-3-319-94289-6_26, 2018. v. 10966. p. 407-421.

3.
Ferreira, Joao Eduardo; LOSCO TAKECIAN, PEDRO ; KAMAURA, LEONARDO TADASHI ; PADILHA, BRUNO ; Pu, Calton . Dependency Management with WED-flow Techniques and Tools: A Case Study. In: 2017 IEEE 3rd International Conference on Collaboration and Internet Computing (CIC), 2017, San Jose. 2017 IEEE 3rd International Conference on Collaboration and Internet Computing (CIC), 2017. p. 379.

4.
FERREIRA, J. E.; OKAMOTO JUNIOR, J. ; VISINTIN, J. A. ; PU, C. . Smart Services: A Case Study on Smarter Public Safety by a Mobile App for University of São Paulo. In: IEEE Smart City Innovations 2017, 2017, San Francisco. 2017 IEEE Smart World Conference Proceedings. San Francisco: IEEE - DOI 10.1109/UIC-ATC.2017.8397574, 2017. p. 1218-1223.

5.
BOROVINA JOSKO, J. M. ; OIKAWA, M. K. ; FERREIRA, J. E. . A Formal Taxonomy to Improve Data Defect Description. In: Database Systems for Advanced Applications, 2016, Dallas - Texas. DASFAA 2016. Switzerland: 10.1007/978-3-319-32055-7_25, 2016. v. 9645. p. 307-320.

6.
HÜBLER, PATRICIA ; RUIZ, DUNCAN ; Ferreira, João Eduardo ; DE SOUZA, OSMAR NORBERTO . P-SaMI. In: the 30th Annual ACM Symposium, 2015, Salamanca. Proceedings of the 30th Annual ACM Symposium on Applied Computing - SAC '15. p. 54.

7.
BROINIZI, MARCOS EDUARDO BOLELLI ; MUTTI, DANILO ; Ferreira, Joao Eduardo . Application Configuration Repository for Adaptive Service-Based Systems: Overcoming Challenges in an Evolutionary Online Advertising Environment. In: 2014 IEEE International Conference on Web Services (ICWS), 2014, Anchorage. 2014 IEEE International Conference on Web Services. v. 1. p. 670-28.

8.
LIBERATO, R. ; SCHWERZ, A. L. ; FERREIRA, J. E. . Gerenciador de Dados Compartilhados entre Processos de Negócio: Data-Control Process para WED-Tool.. In: VIII Workshop Brasileiro em Gestão de Processos de Negócios., 2014, Londrina, PR. X Simpósio Brasileiro de Sistemas de Informação, 2014. v. 2. p. 26-33.

9.
JOSKO, J. M. B. ; FERREIRA, JOAO E. . Data quality assessment of very large database through visualization system. In: Workshop de Teses e Dissertações do XXIX SBBD, 2014, Curitiba. Simpósio Brasileiro de Bancos de Dados Proceedings. Porto Alegre, RS: SBC, 2014. v. 1. p. 295-303.

10.
ALMEIDA, FERNANDA NASCIMENTO ; TUNES, GISELA ; Sabino, Ester Cerdeira ; MENDRONE-JUNIOR, ALFREDO ; Ferreira, Joao Eduardo . A Provenance Model Based on Declarative Specifications for Intensive Data Analyses in Hemotherapy Information Systems. In: 2014 IEEE 10th International Conference on eScience (eScience), 2014, Sao Paulo. 2014 IEEE 10th International Conference on e-Science. p. 92.

11.
DRIEMEIER, CALROS EDUARDO ; LING, LIU YI ; PONTES, ANGELICA O. ; SANCHES, GUILHERME M. ; FRANCO, HENRIQUE C.J. ; MAGALHAES, PAULO S.G. ; FERREIRA, JOAO E. . Data Analysis Workflow for Experiments in Sugarcane Precision Agriculture. In: 2014 IEEE 10th International Conference on eScience (eScience), 2014, Sao Paulo. 2014 IEEE 10th International Conference on e-Science. p. 163.

12.
CASIMIRO, A. ; BROINIZI, M. E. ; FERREIRA, J.E. . Principais componentes na ordenação de anúncios: um experimento em ambiente real de publicidade computacional. In: Simpósio Brasileiro de Bancos de Dados, 2014, Curitiba. Anais do XXIX Simpósio Brasileiro de Bancos de Dados. Porto Alegre, RS: Sociedade Brasileira de Computação, 2014. v. 1. p. 147-156.

13.
SCHWERZ, A. L. ; LIBERATO, R. ; WIESE, I. S. ; STEINMACHER, I. F. ; GEROSA, M. A. ; FERREIRA, J. E. . Predizendo a Participação de Desenvolvedores em Discussões em Projetos de Software Livre. In: XIV Workshop de Software Livre, 2013, Porto Alegre - RS. XIV Workshop de Software Livre, 2013.

14.
RODRIGUES, MAURICIO CHUI ; Ferreira, Joao Eduardo ; Pu, Calton . Web Services Composition through Data Events Approach. In: 2013 IEEE International Conference on Services Computing (SCC), 2013, Santa Clara. 2013 IEEE International Conference on Services Computing, 2013. p. 320.

15.
FERREIRA, JOAO E.; BRAGHETTO, KELLY R. ; TAKAI, OSVALDO K. ; Pu, Calton . Transactional Recovery Support for Robust Exception Handling in Business Process Services. In: 2012 IEEE 19th International Conference on Web Services (ICWS), 2012, Honolulu. 2012 IEEE 19th International Conference on Web Services. p. 303.

16.
CINTHO, MINA ; MARCONDES CESAR, ROBERTO ; Ferreira, Joao Eduardo . Data-intensive analysis of HIV mutations. In: 2012 IEEE 8th International Conference on EScience (eScience), 2012, Chicago. 2012 IEEE 8th International Conference on E-Science. p. 1.

17.
SCHWERZ, ANDRE LUIS ; LIBERATO, RAFAEL ; WIESE, IGOR SCALIANTE ; STEINMACHER, IGOR ; GEROSA, MARCO AURELIO ; Ferreira, Joao Eduardo . Prediction of Developer Participation in Issues of Open Source Projects. In: Simpósio Brasileiro de Sistemas Colaborativos (SBSC 2012), 2012, São Paulo. Simpósio Brasileiro de Sistemas Colaborativos (SBSC 2012), 2012. p. 109.

18.
DOMINGUES, H. ; Kon, F ; FERREIRA, J. E. . Asynchronous Replication for Evolutionary Database Development: A Design for the Experimental Assessment of a Novel Approach. In: OnTheMove Federated Conferences - ODBASE, DOI 10.1007/978-3-642-25106-1_29, 2011, Hersonissos, Crete.. OTM 2011, Part II, LNCS 7045. Berlin Heidelberg: Springer-Verlag, 2011. v. II. p. 816-823.

19.
BRAGHETTO, K. R. ; FERREIRA, J. E. ; VINCENT, J. . Performance Evaluation of Business Processes through a Formal Transformation to SAN.. In: In: 8th European Performance Engineering Workshop, 2011, Borrowdale, UK. 8th European Performance Engineering Workshop, EPEW 2011. Berlin Heidelberg: Springer, 2011. p. 42-56.

20.
ALMEIDA, F. N. ; SILVA, P. P. S. B. ; Mendrome, A. ; SABINO, E. C. ; FERREIRA, J. E. . Aplicando Procedência de Dados para a Geração e Análise de Perfis de Doadores de Sangue. In: XXX Congresso da Sociedade Brasileira de Computação, e-Science - IV, 2010, Belo Horizonte. Anais e-Science 2010 SBC, 2010. p. 169-176.

21.
Garcia, M.O. ; ARAÚJO, L. V. ; Passos-Bueno, M. R ; SCHLESINGER, D. ; FERREIRA, J. E. . Indexação de Dados Semi-Estruturados para Apoio a Diagnósticos Médicos. In: XII Congresso Brasileiro de Informática em Saúde - CBIS, 2010. XII Congresso Brasileiro de Informática em Saúde, 2010.

22.
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41.
BROINIZI, MARCOS E. B. ; Ferreira, João Eduardo ; GOLDMAN, ALFREDO . Using annotations in the naked objects framework to explore data requirements. In: the 2008 ACM symposium, 2008, Fortaleza. Proceedings of the 2008 ACM symposium on Applied computing - SAC '08. p. 630.

42.
DE ARAÚJO, LUCIANO VIEIRA ; Sabino, Ester C. ; Ferreira, João Eduardo . HIV drug resistance analysis tool based on process algebra. In: the 2008 ACM symposium, 2008, Fortaleza. Proceedings of the 2008 ACM symposium on Applied computing - SAC '08. p. 1358.

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NETTO, F. S. ; FERREIRA, J. E. ; GOUVEA, M. A. . The use of Multidimensional Scaling as Applied to the BPM Performance in Brazilian e-Government Administration. In: Database and Expert Systems Applications - DEXA, 2007, Alemanha. Eletronic Government Conference Workshop. Austria: Trauner Druck, 2007. v. 1. p. 229-240.

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NARDI, A. ; FERREIRA, J. E. . Padrões para Controle de Fluxo e sua Execução em Grade. In: E-Science Workshop, 2007, Fortaleza. E-Science Workshop - SBBD-SBES 2007. Porto Alegre: Sociedade Brasileira de Computação, 2007. v. 1. p. 20-28.

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FERREIRA, J.E.; TAKAI, O.K. ; PU, C. . Integration of Business Processes with Autonomous Information Systems: A Case Study in Government Services. In: Seventh IEEE International Conference on ECommerce Technology (CEC'05), 2005, Munich. Seventh IEEE International Conference on E-Commerce Technology (CEC'05). p. 471.

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FERREIRA, J. E.; ZULIANI, D. ; NETTO, F. S. . The unified interface for the government business registration through unified model. In: 1st. International Conference on Information Systems and Technology Management. Local: FEA/USP, 2004, São Paulo. In. CONTECSI, 1., 2004, São Paulo. Anais, São Paulo:TECSI, jun. 2004. p. 14. (CD-ROM).. São Paulo: In. CONTECSI, 1., 2004, São Paulo. Anais, São Paulo:TECSI, jun. 2004. p. 14. (CD-ROM)., 2004. p. 14-23.

54.
NETTO, F. S. ; ZULIANI, D. ; FERREIRA, J. E. . O Processo Unificado de Cadastramento de Empresas: um estudo de caso. In: CONIP-2004 SUCESU-SP e IDETI, 2004, São Paulo. CONIP 2004- Serviços de Excelência em Informática Aplicada aos Serviços Públicos. Sao Paulo: SUCESU-SP e IDETI, 2004. p. 1-10.

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56.
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FERREIRA, J. E.; TRAINA JUNIOR, C. . Adding conceptual constructs to support distribution in an object oriented model. In: Simpósio Brasileiro de Banco de Dados, 1994, São Carlos. IX Simpósio Brasileiro de Banco de Dados. São Carlos: SBBD, 1994. v. 1. p. 216-229.

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FERREIRA, J. E.; TRAINA JUNIOR, C. . Distribution Aspects In Databases for Project Suppot Environmrnts. In: XII International Conference of the Chilean Computer Science Society, 1992, Santiago do Chile. XII International Conference of the Chilean Computer Science Society. Santiago do Chile: Computer Science Society, 1992. v. 1. p. 345-360.

Resumos expandidos publicados em anais de congressos
1.
BOROVINA JOSKO, J. M. ; FERREIRA, J. E. . Vis4DD: A visualization system that supports Data Quality Visual Assessment. In: 32nd Brazilian Symposium on Databases, 2017, Uberlândia. Demos and Applications Session. Porto Alegre: Sociedade Brasileira de Computação, 2017. v. 1. p. 46-51.

2.
SILVA, P. P. S. B. ; BRAGHETTO, K. R. ; FERREIRA, J. E. . Uma abordagem ad hoc para o tratamento de exceções em processos transacionais. In: Simpósio Brasileiro de Bancos de Dados, 2012, São Paulo. Proceedings of the 27th Brazilian Symposium on Databases - Short Papers. Porto Alegre: Sociedade Brasileira de Computação, 2012. v. 1. p. 153-160.

3.
Garcia, M.O. ; SILVA, P. P. S. B. ; BRAGHETTO, K. R. ; FERREIRA, J. E. . WED-tool: uma ferramenta para o controle de execução de processos de negócio transacionais. In: Simpósio Brasileiro de Bancos de Dados, 2012, São Paulo. Proceedings of the 27th Brazilian Symposium on Databases - Demos and Applications. Porto Alegre: Sociedade Brasileira de Computação, 2012. v. 1. p. 19-24.

4.
TAKECIAN, P. L. ; FERREIRA, J. E. . Methodological Guidelines and Adaptive Statistical Data Validation to Build Effective DataWarehouses. In: Simpósio Brasileiro de Bancos de Dados, 2012, São Paulo. Proceedings of the 27th Brazilian Symposium on Databases - Thesis and Dissertation Workshop. Sâo Paulo: Sociedade Brasileira de Computação, 2012. v. 1. p. 61-68.

5.
CORREIA, R. ; Kon, F ; FERREIRA, J. E. . Um Sistema de Software Livre para Gerenciamento de Centros de Saúde. In: Anais do III Simpósio de Iniciação Científica e Pós-Graduação do IME-USP, 2008, Sao Paulo. Anais do III Simpósio de Iniciação Científica e Pós-Graduação do IME-USP, 2008. v. 1.

6.
ARAÚJO, L. V. ; TANURI, A. ; SABINO, E. C. ; DIAZ, R. S. ; BRINDEIRO, R. M. ; FERREIRA, J. E. . Bioinformatic tools for HIV-1 sequences analyses developed for the Brazilian STD/AIDS programme network for genotype testing. In: XV International AIDS Conference, 2004, BangKok, Thailand 11-16 July 2. In anais XV International AIDS Conference , BangKok, Thailand 11-16 July 2004. BangKok, Thailand 11-16 July 2: In anais XV International AIDS Conference, 2004. p. 14-15.

7.
GONCALVES, B. M. T. ; SABINO, E. C. ; ARAÚJO, L. V. ; FERREIRA, J. E. . Data Warehouse Development for the Brazilian STD/AIDS Programme.. In: In anais XV International AIDS Conference, 2004, BangKok, Thailand 11-16 July 2. In anais XV International AIDS Conference. BangKok, Thailand 11-16 July 2: XV International AIDS Conference, 2004. p. 15-18.

8.
OIKAWA, M. K. ; FERREIRA, J. E. . Heterogeneous database integration to support data mining. In: The International Conference on Bioinformatics 2002, 2002, Bangkok, Thailand. Incob 2002. bangkok, Thailand: Incob 2002, 2002. v. 1. p. 88-94.

9.
ARAÚJO, L. V. ; FERREIRA, J. E. . Cache semântico para computação sem fio baseado na abstração de composição de dados. In: I Workshop SIDAM, 2000, São Paulo. I Workshop SIDAM, 2000.

10.
SOUZA, M. C. ; FERREIRA, J. E. . Integração assíncrona de instâncias de base de dados em esquemas homogêneos. In: I Workshop SIDAM, 2000, São Paulo. I Workshop SIDAM, 2000.

Apresentações de Trabalho
1.
LIMA, R. A. ; PU, C. ; TAKECIAN, P. L. ; KAMAURA, L. T. ; PADILHA, BRUNO ; FERREIRA, J.E. . Modeling Time-Critical Processes with WED-flow. 2018. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

2.
Chui, M. ; FERREIRA, J. E. ; PU, C. . Web Services Composition through Data Events Approach. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

3.
Ferreira, Joao Eduardo. Transactional Recovery Support for Robust Exception Handling in Business Process Services. 2012. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

4.
Ferreira, Joao Eduardo. Transaction Processing for e-Science Applications. 2012. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

5.
Ferreira, Joao Eduardo. Fourth International Workshop on Scientific Workflows. 2010. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

6.
Ferreira, Joao Eduardo. Reducing Exception Handling Complexity in Business Process Modeling and Implementation: the WED-Flow Approach. 2010. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

7.
OIKAWA, M. K. ; FERREIRA, J. E. ; MALKOWSKI, S. ; PU, C. . Towards Algorithmic Generation of Business Processes: From Business Step Dependencies to Process Algebra Expressions. 2009. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

8.
DOMINGUES, H. ; Kon, F ; FERREIRA, J. E. . Banco de dados evolutivos e metodos ageis. 2008. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

9.
FERREIRA, J. E.. The RiverFish Approach to Business Process Modeling: Linking Business Steps to Control-Flow Patterns. 2008. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

10.
FERREIRA, J. E.. The use of Multidimensional Scaling as Applied to the BPM Performance in Brazilian e-Government Administration. 2007. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

11.
FERREIRA, J. E.. Using Control-Flow Patterns for Specifying Business Processes in Cooperative Environments. 2007. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

12.
FERREIRA, J. E.. Integration of Business Processes with Autonomous Information Systems: A Case Study. 2005. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

13.
FERREIRA, J. E.. Data Updating Between the Operational and Analytical Databases Through DW-Log Algorithm. 2005. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

14.
FERREIRA, J. E.. Mini-curso SBBD 2004: Naked Objects. 2004. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

15.
FERREIRA, J. E.. Database modularization design for the construction of flexible information systems. 1999. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

16.
FERREIRA, J. E.. Sharing of heterogeneous databases. 1999. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

17.
FERREIRA, J. E.. Use of a semantically grained database system for distribution and control within design environments. 1997. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

18.
FERREIRA, J. E.. Controle de compartilhamento e acesso em GBDOO baseado em composição de objetos. 1996. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

19.
FERREIRA, J. E.. Adding conceptual constructs to support distribution in an object oriented model. 1994. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

Outras produções bibliográficas
1.
FERREIRA, J. E.; TAKAI, O. K. . PROJETO E MODELAGEM DE BANCO DE DADOS - revisão técnica. Rio de Janeiro: Editora Campus/Elsevier, 2006. (Tradução/Livro).

2.
TAKAI, O. K. ; FERREIRA, J. E. . Naked Objects, 2004. (Tradução/Livro).


Produção técnica
Programas de computador sem registro
1.
FERREIRA, J. E.; DUARTE G. L. ; LIMA, A. M. ; KAMAURA, L. T. ; MULLER, R. ; CINTHO, M. . DIDB - Diagnostics Interview Database. 2011.

2.
ARAÚJO, L. V. ; FERREIRA, J. E. ; Ortega, M . CEGH System: GENETIC TESTING MANAGEMENT IN HUMAN GENOME INFORMATION SYSTEMS. 2010.

3.
ARAÚJO, L. V. ; FERREIRA, J. E. ; SABINO, E. C. . HIV Dag. 2010.

4.
FERREIRA, J. E.; KAMAURA, L. T. ; MULLER, R. ; COLLI, E. . Colmeia. 2010.

5.
FERREIRA, J. E.; OIKAWA, M. K. ; DURHAM, A. M. ; PORTILLO,, H. A. . ClinMalDB. 2006.

6.
FERREIRA, J. E.; ARAÚJO, L. V. ; SABINO, E. C. ; ULIANA, R. ; DADARIO, A. . DBCollHIV. 2005.

7.
FERREIRA, J. E.. Posto Fiscal Eletrônico. 2001.

8.
FERREIRA, J. E.; TRAINA JUNIOR, C. . Sistema MASTER-UNIMED. 1997.

9.
FERREIRA, J. E.; TRAINA JUNIOR, C. . Autorizador de Serviços Médicos para o Complexo UNIMED. 1997.

10.
FERREIRA, J. E.. FRUIT Manager. 1995.

11.
FERREIRA, J. E.. Easy Dental. 1994.

Trabalhos técnicos
1.
BARRERA, J. ; FERREIRA, J. E. ; GUBITOSO, M. D. ; CESAR JUNIOR, R. M. . An Integrated environment for Storage and Analysis of Genetic. 2001.

2.
ITALIANO, I. ; FERREIRA, J. E. ; TAKAI, O. K. . Aspectos Conceituais em Data Warehouse. 2001.

3.
FERREIRA, J. E.; NETTO, F. S. ; ZULIANI, D. . Arquitetura do Sistema de Informação para os Serviços Eletrônicos da Secretaria da Fazenda do Estado de São Paulo. 2000.

4.
FERREIRA, J. E.; TRAINA JUNIOR, C. . Relatório Final do Projeto Master-UNIMED. 1997.

Demais trabalhos
1.
FERREIRA, J. E.. Desenvolvimento de um Software Modular para Análise de Expressão Gênica. 2004 (Projeto PIPE-FAPESP) .

2.
FERREIRA, J. E.. Arquitetura de Sistemas de Informação para fiscalização tributária. 1999 (Consultor da Secretaria da Fazenda do Estado de São Paulo) .



Patentes e registros



Programa de computador
1.
FERREIRA, J. E.; LIMA, A. M. ; MULLER, R. ; DIAS, R. ; CINTHO, M. . DIDB - Dynamic Interview Database. 2013.
Patente: Programa de Computador. Número do registro: BR51201300020-4, data de registro: 09/09/2013, título: "DIDB - Dynamic Interview Database" , Instituição de registro: INPI - Instituto Nacional da Propriedade Industrial.



Bancas



Participação em bancas de trabalhos de conclusão
Mestrado
1.
FERREIRA, J.E.; HIRATA JUNIOR, R.; DIGIAMPIETRI, L. A.. Participação em banca de Rafael Germano Rossi. Análise de Componentes Principais em Data Warehouses. 2017. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

2.
FERREIRA, J.E.; OIKAWA, M. K.; SILVA, F. S. C.. Participação em banca de Marino Hilario Catarino. Integrando banco de dados relacional e orientado a grafos para otimizar consultas com alto grau de indireção. 2017. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

3.
FERREIRA, J.E.; HIRATA, N. S. T.; SANTANCHE, A.. Participação em banca de André Henrique Serafim Casimiro. Principais variáveis na ordenação de anúncios. 2016. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

4.
DIGIAMPIETRI, L. A.; FERREIRA, J. E.; CHAIM, M. L.. Participação em banca de Caio Rafael do Nascimento Santiago. Desenvolvimento de um ambiente de computação voluntária baseado em computação ponto-a-ponto. 2015. Dissertação (Mestrado em SISTEMAS DE INFORMAÇÃO) - Universidade de São Paulo.

5.
MACHADO, J. C.; MACEDO, J. A.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Felipe Timbó Brito. Uma Abordagem Distribuida para Preservação de Privacidade na Publicação de Dados de Trajetória. 2015. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade Federal do Ceará.

6.
HIRATA, N. S. T.; NOMA, A.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Davi Souto Grangeiro. ExpressMath Online: um sistema web para o tratamento de dados de expressões matemáticas manuscritas. 2015. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

7.
BUSICHIA, G.; FERREIRA, J. E.; OLIVEIRA, H. C.. Participação em banca de Gustavo Bartz Guedes. Projeto evolutivo de bases de dados: uma abordagem iterativa e incremental. 2014. Dissertação (Mestrado em Faculdade de Tecnologia) - Universidade Estadual de Campinas.

8.
FERREIRA, J. E.; PORTO, F.; MONTEIRO FILHO, J. M. S.. Participação em banca de Marcela Ortega Garcia. Implementação do arcabouço WED-flow para controle de processos transacionais. 2013. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

9.
FELIPE, J. C.; FERREIRA, J. E.; SILVA JUNIOR, W. A.. Participação em banca de Newton Shydeo Brandão Miyosshi. Genômica translacional: integrando dados clínicos e biomoleculares. 2013. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

10.
FERREIRA, J. E.; MORAES FILHO, J. A.; AMORIM, F. A. B.. Participação em banca de Pedro Paulo de Souza Bento da Silva. Uma abordagem transacional para o tratamento de exceções em processos de negócio. 2013. Dissertação (Mestrado em Ciências da Comunicação) - Universidade de São Paulo.

11.
FERREIRA, J.E.; WIVES, L. K.; ENGEL, P. M.. Participação em banca de Bruno Winiemko Vollino. Descoberta de perfis de uso de web services. 2013. Dissertação (Mestrado em Computação) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

12.
CIFERRI, R. R.; RESENDE, S. O.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Juliana Lilian Duque. Um processo baseado em parágrafos para a extração de tratamentos de artigos científicos do domínio biomédico. 2012. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Federal de São Carlos.

13.
FERREIRA, J. E.; REVERBEL, F. R.; CAMOLESI JR, L.. Participação em banca de Maurício Chui Rodrigues. Tratamentos de eventos aplicado à composição de serviços web. 2012. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

14.
CAMPOS, E. G. L.; MASSETTO, F. I.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de André Ippolito. Um estudo de caso de alinhamento de esquemas de bancos de dados heterogêneos. 2012. Dissertação (Mestrado em Engenharia de Computação) - Instituto de Pesquisas Tecnológicas do Estado de São Paulo.

15.
RAIMUNDO, M. S.; CAMPOS, E. G. L.; SETUBAL, J. C.; FERREIRA, J. E.; SOUZA, S. N. A.. Participação em banca de Milton Saulo Raimundo. Estudo de Caso de Uso de Regras de Negócio e Semântica de Vocabulário de Negócio na Área Financeira. 2010. Dissertação (Mestrado em Engenharia de Computação) - Instituto de Pesquisas Tecnológicas do Estado de São Paulo.

16.
FERREIRA, J. E.; CAMOLESI JR, L.; SILVA, F. S. C.. Participação em banca de Guilherme Tozo de Carvalho. Aplicacao de praticas ageis na construcao de data warehouse evolutivo. 2009. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

17.
CAMPOS, E. G. L.; REVERBEL, F. R.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Maritza Maura de Carvalho. Análise de viabilidade e estudo comparativo de aboradagens de gerenciamento de qualidade de dados. 2009. Dissertação (Mestrado em Engenharia de Computação) - Instituto de Pesquisas Tecnológicas do Estado de São Paulo.

18.
FERREIRA, J. E.; ALMEIDA JUNIOR, J. R.; HIRATA JUNIOR, R.. Participação em banca de Grace Anne Pontes Borges. Fluxo de dados em redes de Petri coloridas e em grafos orientados a atores. 2008. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

19.
FERREIRA, J. E.; PEREZ-ALCAZAR, J. J.; RUIZ, D. D. A.. Participação em banca de Pedro Losco Takecian. ACP e LOTOS: um estudo comparativo baseado em conceitos de BPEL e padroes de controle de fluxo. 2008. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

20.
FERREIRA, J. E.; RUIZ, D. D. A.; SOUZA, O. N.. Participação em banca de Leandro Paulo Bogoni. Um método evolutivo para Aplicação de Programas de Métricas em Processos de Desenvolvimento de Software. 2007. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul.

21.
HIRATA, N. S. T.; TRAINA JUNIOR, C.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Philipe Dalla Bernardina. PCA-tree: uma proposta para indexação multidimensional. 2007. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística.

22.
HIRATA, N. S. T.; CAMOLESI JR, L.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Gustavo Bianchi Maia. Ferramenta para integração de modelos multidimensionais e softwares de visualização de séries temporais. 2007. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística.

23.
FERREIRA, J. E.; RUIZ, D. D. A.; SOUZA, O. N.. Participação em banca de Karina dos Santos Machado. Um Workflow Científico para a Modelagem do Processo de Desenvolvimento de Fármacos Assistido por Computador Utilizando Receptor Flexível. 2007. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul.

24.
FERREIRA, J. E.; CAMOLESI JR, L.; ALVES, R. F.. Participação em banca de Luciano Matarazzo Regno. Implantação de Sistemas CRM: Metodologia e Sistema de Apoio Orientados a Interação. 2006. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Metodista de Piracicaba.

25.
FERREIRA, J. E.; CALONEGO JR., N.; COELHO, R. C.. Participação em banca de Carlos Eduardo Della Coletta. Realidade Virtual Aplicada à Visualização de Informações Web. 2006. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Metodista de Piracicaba.

26.
FERREIRA, J. E.; ANIDO, R. O.; MELLO FILHO, R. D. B. P.. Participação em banca de Elton Gustavo Fanelli. Tecnicas de Otimização do Mergesort Externo num Ambiente de Banco de Dados. 2006. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas.

27.
FERREIRA, J. E.; CAMPOS, E. G. L.; BARROS, L. N.. Participação em banca de Julio Cesar Mila. O uso de ontologias para apoiar a representação de regras e processos de negocio em sistemas de computação. 2006. Dissertação (Mestrado em Engenharia de Computação) - Instituto de Pesquisas Tecnológicas do Estado de São Paulo.

28.
VIEIRA, M. T. P.; FERREIRA, J. E.; BIAJIZ, M.. Participação em banca de Luciene Cristina Pizzi. Mineração Multi-Relacional: O algoritmo GFP-Growth. 2006. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Federal de São Carlos.

29.
FERREIRA, J. E.; FINGER, M.; MEDEIROS, C. M. B.. Participação em banca de Kelly Rosa Braguetto. Padrões de fluxos de processos em banco de dados relacionais. 2006. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

30.
SETZER, V. W.; FERREIRA, J. E.; MEDEIROS, C. M. B.. Participação em banca de Yen Chin Shen. Por que usar banco de dados orientados a objetos ?. 2006. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

31.
FERREIRA, J. E.; REVERBEL, F. R.; CAMPOS, E. G. L.. Participação em banca de Ricardo da Silva Carvalheiro. Integração de estruturas de endereçamento para automatizar o georreferenciamento de cadastros. 2006. Dissertação (Mestrado em Engenharia de Computação) - Instituto de Pesquisas Tecnológicas do Estado de São Paulo.

32.
FERREIRA, J. E.; CAMPOS, E. G. L.; PEREZ-ALCAZAR, J. J.. Participação em banca de Devanir Zuliani. Diretrizes para Projeto Conceitual de Workflow. 2006. Dissertação (Mestrado em Engenharia de Software) - Instituto de Pesquisas Tecnológicas do Estado de São Paulo.

33.
LAENDER, A. H. F.; Goldman A.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Marcos Eduardo Bolelli Broinizi. Validação ágil e precisa de projetos conceituais de banco de dados. 2006. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística.

34.
TRAINA JUNIOR, C.; HIRATA, N. S. T.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Andre Rodrigo Sanches. Redução de dimensionalidade em séries temporais. 2006. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística.

35.
COSTA, L. F.; CARRER, H.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Pablo Rodrigo Sanches. Sistema de gerenciamento e análise de dados por bioinformática. 2006. Dissertação (Mestrado em Física) - Universidade de São Paulo.

36.
FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Claudia Alves de Souza Mello. Metadados para Apoio a Recuperação de Componentes de Software baseada em Agrupamento por Rede Neural. 2005. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Federal de São Carlos.

37.
FERREIRA, J. E.; CAMPOS, E. G. L.; REZENDE, M. N.. Participação em banca de Carlo Borsoi Moura. Desenvolvimento de uma ontologia para o compartilahmento do conhecimento corporativo. 2005. Dissertação (Mestrado em Engenharia de Computação) - Instituto de Pesquisas Tecnológicas do Estado de São Paulo.

38.
FERREIRA, J. E.; CAMPOS, E. G. L.; SETZER, V. W.. Participação em banca de Sergio Linares Filho. Analise de requisitos de software baseada em modelagem conceitual de dados e protótipos. 2005. Dissertação (Mestrado em Engenharia de Computação) - Instituto de Pesquisas Tecnológicas do Estado de São Paulo.

39.
FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Sálvio Padlipskas. Ajuste de consultas a banco de dados utilizando padrões. 2005. Dissertação (Mestrado em Engenharia de Computação) - Instituto de Pesquisas Tecnológicas do Estado de São Paulo.

40.
FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Alan Borsato. Metodos de prevalência de objetos. 2004. Dissertação (Mestrado em Engenharia de Sistemas e Computação) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

41.
FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Bei Yi. Banco de Dados. 2004. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas.

42.
FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Clovis K. Hanashiro. Armazenamento de Documentos XML Text-Centric e Data-Centric em Sistemas Relacionais e Objeto-Relacionais. 2004. Dissertação (Mestrado em Engenharia Eletrica) - Escola Politécnica da Universidade de São Paulo.

43.
FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Humberto Luiz Razente. Análise Visual em Processos de Redução de Dimensionalidade para Mineração em Sistemas de Bases de Dados. 2004. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo.

44.
FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Francisco Aparecido Rodrigues. Técnicas de Orientação ao Objeto para Computação Científica Paralela. 2004. Dissertação (Mestrado em Ciências Físicas Aplicadas) - Instituto de Física e Química de São Carlos.

45.
FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Marco Eugênio Madeira Di Beneditto. Analise de Padrões em banco de dados. 2004. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

46.
FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Gustavo T. Okida. Otimização de consultas por conteúdo em bancos de dados heterogêneos. 2004. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

47.
FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Marcio Katsumi Oikawa. Integracao para dados e aplicacoes em biologia molecular computacional. 2003. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

48.
FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Mauricio Serrano. Um Sistema de Recomendação para Mídias Baseado em Conteúdo Nebuloso. 2003. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Federal de São Carlos.

49.
FERREIRA, J. E.; KOFUJI, S. T.; NETTO, M. L.. Participação em banca de Elcio Yukio Nanba. Escalonamento de tarefas em clusters de servidores SMP heterogeneos para aplicação de biologia molecular. 2003. Dissertação (Mestrado em Engenharia Elétrica) - Universidade de São Paulo.

50.
FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Marcelo Camacho Souza. Componente de controle transacional para integracao assincrona de bases de dados. 2003. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

51.
FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Márcio K. Oikawa. Integração para dados e aplicações em biologia molecular computacional. 2003. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

52.
FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Isabel Cristina Italiano. Um Modelo hibrido para atualizacao de dados em projetos de data warehouse. 2002. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

53.
FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Luciano Vieira de Araujo. CCICLO: Componente para cruzamento e integração de objetos classificados. 2002. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

54.
FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Bianka M. M. Teixeira Goncalves. Alternativas para propagacao das atualizacoes de um banco de dados operacional para um data warehouse. 2002. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

55.
FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Valmir Ferreira Marques. Análise dos Dados da base de dados do Programa de Melhoramento Genético da Raça Nelore. 2002. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo.

56.
FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Myrthes Cavalcante de Aguiar. Arquiteturas de Componentização de Servidores como Integradoras de Bancos de Dados Distribuídos. 2002. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

57.
FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Carlos Henrique Maia Braga. Metamodelo para controle de estratégias assíncronas de replicação de dados. 2001. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

58.
FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Francisco Sobreira Netto. Elementos propulsores e inibidores do uso de soluções informatizadas na modernização da prestação de serviços públicos na administração brasileira. 2001. Dissertação (Mestrado em Administração) - Centro Universitário Municipal de Franca.

59.
FURTADO, M. DE O.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Mabelly de Oliveira Furtado. Tratamento de Regras ativas em Banco de Dados. 2000. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

60.
MANTOVANI, L. A. T.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Leonardo A. T. Mantovani. Uma Alternativa para Simplificação do Sincronismo de dados entre os Ambientes Operacionais e Analíticos. 2000. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo.

61.
FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Gisele Busichia. Construção de Sistemas Modulares com Integração pelo Gerenciador de Dados. 1999. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo.

62.
FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Larissa P. S. Gomes. Método para Projeto de Aplicativos centrados em BDOO utilizando Abstração de Generalização. 1999. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo.

Teses de doutorado
1.
GARCIA, V. C.; FERREIRA, J.E.; BRAGANHOLO, V.; LIMA FILHO, F. J. C.; BARBOSA, L. A.. Participação em banca de André Magno Costa de Araújo. Um Framework para Criação de Esquemas de Dados, Geração de Interfaces Gráficas de Usuário e Persistência Poliglota do RES Utilizando Arquétipos. 2018. Tese (Doutorado em Centro de Informática) - Universidade Federal de Pernambuco.

2.
FERREIRA, J.E.; FINGER, M.; OIKAWA, M. K.; RUIZ, D. D. A.; MACHADO, J. C.. Participação em banca de André Luis Schwerz. Sistemas de informação cientes de processos, robustos e confiáveis. 2016. Tese (Doutorado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

3.
FERREIRA, J.E.; ARAUJO, L. V.; PORTO, F.; JACKOWSKI, M. P.; AMORIM, F. A. B.. Participação em banca de Rafael Liberato Roberto. Aumentando a migração de instâncias não complacentes em sistemas de informação cientes de processos. 2016. Tese (Doutorado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

4.
WASSERMANN, R.; BREITANI, H. P.; FARIA, C. R. G.; FINGER, M.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Ricardo Moura Sekeff Budaruiche. Uso de Ontologias modulares para classificação de pacientes da Sindrome de Li-Fraumeni: estudo de caso no A.C. Camargo Cancer Center. 2016. Tese (Doutorado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

5.
FARIA, C. R. G.; FERREIRA, J.E.; TINOS, R.; SIMOES, Z. L. P.; PINHEIRO, D. G.. Participação em banca de Gabriela Der Agopian Guardia. Suporte ao desenvolvimento e à composição de serviços web semânticos para a análise de expressão gênica. 2016. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

6.
BRAGHETTO, K. R.; FERREIRA, J.E.; CAMARGO, R. Y.; OIKAWA, M. K.; COSTA, F. M.. Participação em banca de Eduardo Cotrin Teixeira. Informações de suporte ao escalonamento de workflows científicos para a execução em plataformas de computação em nuvem. 2016. Tese (Doutorado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

7.
FERREIRA, J.E.; HIRATA JUNIOR, R.; CAMOLESI JR, L.; ITALIANO, I. C.; MELLO, R. S.. Participação em banca de João Marcelo Borovina Josko. Uso de propriedades visuais-interativas na avaliação da qualidade de dados. 2016. Tese (Doutorado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

8.
SANTANCHE, A.; HARA, C. S.; TORRES, R. S.; WANNER, L. F.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Luiz Celso Gomes Junior. Quering and Managing Complex Networks. 2015. Tese (Doutorado em Doutorado em Ciência da Computação - UNICAMP) - Universidade Estadual de Campinas.

9.
BREITANI, H.; WASSERMANN, R.; FINGER, M.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Diogo Ferreira da Costa Patrão. Desenvolvimento e avalição de ferramentas computacionais para triagem automática de sujeitos de pesquisa. 2014. Tese (Doutorado em Pós-Graduação em Ciências - Fund. Antonio Prudente) - Universidade de São Paulo.

10.
FERREIRA, J. E.; ITALIANO, I. C.; WASSERMANN, R.; OIKAWA, M. K.; SALGADO, A. C. B.. Participação em banca de Pedro Losco Takecian. Diretrizes metodológicas e validação estatística de dados para a construção de data warehouses. 2014. Tese (Doutorado em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo.

11.
TRAINA, A. J. M.; BATISTA NETO, J. E. S.; FERREIRA, J. E.; MARANA, A. N.; MARQUES, P. M. A.. Participação em banca de Pedro Henrique Bugatti. Arcabouço para recuperação de imagens por conteúdo visando à percepção do usuário. 2012. Tese (Doutorado em Ciência da Computação (São Carlos)) - Universidade de São Paulo.

12.
PU, C.; NAVATHE, S.; LIU, L.; MARK, L.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Gong Zang. Data and application migration in cloud based data centers - architectures and techiques. 2011. Tese (Doutorado em Graduate in Computer Science) - Georgia Institute of Technology.

13.
PU, C.; MARK, L.; NAVATHE, S.; LIU, L.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Simon J. Malkowski. An empiracal approach to automated performance management for elastic N-tier applications in compute clouds. 2011. Tese (Doutorado em Graduate in Computer Science) - Georgia Institute of Technology.

14.
TRAINA JUNIOR, C.; MORO, M. M.; HEUSER, C. A.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Robson Leonardo Ferreira Cordeiro. Data Mining in Large Sets of Complex Data. 2011. Tese (Doutorado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

15.
HUBLER, P. N.; SOUZA, O. N.; FERREIRA, J. E.; RUIZ, D. D. A.. Participação em banca de Patrícia Nogueira Hubler. P-MIA Padrão Múltiplas Instâncias Autoadaptáveis - Um Padrão de Dados para Workflows Científicos. 2010. Tese (Doutorado em Pós-Graduação em Ciência da Computação) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul.

16.
FERREIRA, J. E.; FORTES, R. P. M.; SALGADO, A. C. B.; TOLEDO, M. B. F.; PIMENTEL, M. G. C.. Participação em banca de Cassio Vinicius Serafim Prazeres. Servicos Web Semanticos: da modelagem 'a composicao. 2009. Tese (Doutorado em Ciência da Computação (São Carlos)) - Universidade de São Paulo.

17.
FERREIRA, J. E.; DIGIAMPIETRI, L. A.; REVERBEL, F. R.; NAVAUX, P. O. A.; RUIZ, D. D. A.. Participação em banca de Alexandre Ricardo Nardi. Uma arquitetura de baixo acoplamento para excucao de padroes de controle de fluxo em grades. 2009. Tese (Doutorado em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo.

18.
FERREIRA, J. E.; FINGER, M.; DIGIAMPIETRI, L. A.; MATTOSO, M. L. Q.; RUIZ, D. D. A.. Participação em banca de Marcio Katsumi Oikawa. Geracao de expressoes algebricas para processos de negocio usando reducoes de digrafos serie-paralelo. 2008 - Universidade de São Paulo.

19.
SETUBAL, J. C.; TOLEDO, M. B. F.; MATTOSO, M. L. Q.; TORRES, R. S.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Luciano Antonio Digiampietri. Gerenciamento de Workflows Científicos em Bioinformática. 2007. Tese (Doutorado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas.

20.
ALMEIDA JUNIOR, J. R.; SOUZA, S. N. A.; TRAINA JUNIOR, C.; CORREA, P. L. P.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Sidney da Silva Viana. Uma linguagem de gerência de regras como extensão da linguagem SQL3. 2007. Tese (Doutorado em Engenharia Elétrica) - Universidade de São Paulo.

21.
ALMEIDA JUNIOR, J. R.; SATO, L. M.; FERREIRA, J. E.; BECERRA, J. L. R.; PENTEADO, R. A. D.. Participação em banca de Isabel Cristina Italiano. Um modelo para manutenção de esquema e de dados em data warehouse implementados em plataformas móvies. 2007. Tese (Doutorado em Engenharia Elétrica) - Universidade de São Paulo.

22.
FERREIRA, J. E.; SATO, L. M.; TRAVIESO, G.; CUCCHIERI, A.; SANTANA, R. H. C.. Participação em banca de Eloiza Helena Sonoda. OOPS - Object-Oriented Parallel Ssytem. Um Framework de classes para a programação cientifica paralela. 2006. Tese (Doutorado em Fisica-Computacional) - Universidade de São Paulo.

23.
GOUVEA, M. A.; FERREIRA, J. E.; DINIZ, E. H.; SOUZA, C. A.; PLANTULLO, V. L.. Participação em banca de Francisco Sobreira Netto. Medição de desempenho do gerenciamento de processos de negócio - BPM no PNAFE: uma proposta de modelo. 2006. Tese (Doutorado em Fac de Economia, Administração e Contabilidadade) - Universidade de São Paulo.

24.
MATTOSO, M. L. Q.; FERREIRA, J. E.; HEUSER, C. A.. Participação em banca de Luiz Antonio Vivacqua C. Meyer. Gerenciamento de paralelismo em workflows científicos. 2006. Tese (Doutorado em Engenharia de Sistemas e Computação) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

25.
TRAINA JUNIOR, C.; FERREIRA, J. E.; HEUSER, C. A.; AMO, S. A.; REZENDE, S. O.. Participação em banca de Maria Camila Nardini Barioni. Operação de consulta por similaridade em grandes bases de dados complexos. 2006. Tese (Doutorado em Ciência da Computação (São Carlos)) - Universidade de São Paulo.

26.
FERREIRA, J. E.; ZUFFO, J. A.; SANTOS, C. A. S.; NETTO, M. L.; KOFUJI, S. T.. Participação em banca de Reinaldo Lourenso. Segmentação de objetos complexos em um sistema de banco de dados objeto relacional baseado em Grids. 2005. Tese (Doutorado em Engenharia Elétrica) - Universidade de São Paulo.

27.
FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Eugênio Akihiro Nassu. Consultas sobre "Aqui" em Sistemas de Bancos de Dados em Ambientes de Computação Nômade. 2003. Tese (Doutorado em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo.

Qualificações de Doutorado
1.
WASSERMANN, R.; FERREIRA, J. E.; BREITANI, H.. Participação em banca de Ricardo Moura Sekeff. Uso de ontologias para integração de dados clínicos. 2014. Exame de qualificação (Doutorando em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo.

2.
FERREIRA, J. E.; REIS, E. M. R.; FARIA, C. R. G.. Participação em banca de Diego Martinez Salvanha. Ferramentas web para integração e visualização de dados em escala genômica. 2014. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

3.
BRAGUETTO, K. R.; Goldman A.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Eduardo Cotrin Teixeira. Modelagem e escalonamento de workflows científicos para execução em plataformas de computação em nuvem. 2013. Exame de qualificação (Doutorando em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo.

4.
FERREIRA, J. E.; SILVA, A. S.; CRISTO, M.. Participação em banca de Marcos Eduardo Bolelli Broinizi. Funções de ordenação de anúncios para publicidade computacional. 2013. Exame de qualificação (Doutorando em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo.

5.
FERREIRA, J. E.; SILVA, A. S.; CRISTO, M.. Participação em banca de Marcos Eduardo Bolelli Broinizi. Uma abordagem para encontrar funções de ordenação de anúncios em publicidade computacional.. 2013. Exame de qualificação (Doutorando em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo.

6.
FERREIRA, J. E.; OIKAWA, M. K.; ITALIANO, I.C.. Participação em banca de Pedro Losco Takecian. Diretrizes metodológicas e validação estatística adaptativa de dados para a construção de data warehouses. 2012. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo.

7.
FINGER, M.; ALMEIDA JUNIOR, J. R.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Helves Humberto Domingues. Replicação Assíncrona em Bancos de Dados Evolutivos. 2010. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências da Comunicação) - Universidade de São Paulo.

8.
MEDEIROS, C. M. B.; FORTES, R. P. M.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Mônica Ribeiro Porto Ferreira. Optimizing similarity queries in metric spaces meeting users expectations. 2009. Exame de qualificação (Doutorando em Ciência da Computação (São Carlos)) - Universidade de São Paulo.

9.
FINGER, M.; BARROS, L. N.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Marcio Katsumi Oikawa. Geração semi-automática de expressões algébricas para workflows científicos. 2007. Exame de qualificação (Doutorando em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística.

10.
FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Fabio Passeti. Indentificação de marcadores genéticos. 2006. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

11.
FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Bruno Augusto Nassif Travençolo. Reconhecimento de formas em Bioinformática. 2006. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

12.
PIMENTEL, M. G. C.; FORTES, R. P. M.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Renata Maria Porto. Gerenciamento de serviços em ambientes ubíquos: uso de semântica no controle de informações compartilhadas. 2006. Exame de qualificação (Doutorando em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo.

13.
ALMEIDA JUNIOR, J. R.; BECERRA, J. L. R.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Isabel Cristina Italiano. Implementação de data warehouse para ambientes móveis. 2006. Exame de qualificação (Doutorando em Engenharia Elétrica) - Universidade de São Paulo.

14.
FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Ana Carolina Quirino Simões. Análise e armazenamento de dados em microarray. 2006. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

15.
MEDEIROS, C. M. B.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Luciano Digiampietri. Sistemas de workflow para bioinformatica. 2005. Exame de qualificação (Doutorando em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas.

16.
GOUVEA, M. A.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Francisco Sobreira Neto. Sistema de Medição de Desempenho para Gerenciamento de Processos de Negócio. 2005. Exame de qualificação (Doutorando em Fac de Economia, Administração e Contabilidadade) - Universidade de São Paulo.

Trabalhos de conclusão de curso de graduação
1.
RAMALHO, L. G. S.; MUCHERONI, M. L.; FERREIRA, J. E.. Participação em banca de Luciano Gama de Sousa Ramalho.O Modelo de Dados Semiestruturado em Bases Bibliográficas: do CDS/ISI ao Apache CouchDB. 2010. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biblioteconomia) - Universidade de São Paulo.



Participação em bancas de comissões julgadoras
Concurso público
1.
HEUSER, C. A.; MEIRA JUNIOR, W.; MINGHIM, R.; PIMENTEL, M. G.; FERREIRA, J. E.. Comissão de seleção para contratação docente RDIDP edital 028/2012. 2013. Universidade de São Paulo.

2.
CARVALHO, A. C. P. L. F.; BATISTA NETO, J. E. S.; MORO, M. M.; SILVA, A. S.; FERREIRA, J. E.. Concurso para professor doutor em RDIDP ICMC-USP edital 62/2009. 2010. Universidade de São Paulo.

3.
AMO, S. A.; SANTOS, M. P.; FERREIRA, J. E.. Membro titular da banca de contratação. 2009. Universidade Federal de Uberlândia.

4.
FERREIRA, J. E.; CORREA, P. L. P.; TRAINA JUNIOR, C.. Membro titular da comissao julgadora do concurso publico Banco de Dados e Engenharia Software. 2008. Universidade de São Paulo.

5.
FERREIRA, J. E.; MASIERO, P. C.; BARROS, L. N.. Membro titular da comissao julgadora do concurso publico Sistema Informacao e Banco de Dados EACH-USP. 2008. Universidade de São Paulo.

6.
FERREIRA, J. E.. Membro titular da comissão do processo seletivo para preenchimento de uma função professor assistente na disciplina Banco de Dados. 2007. Universidade de São Paulo.

7.
FERREIRA, J. E.. Membro titular da comissão do processo seletivo para preenchimento de uma função professor assistente das disciplinas Sistemas de Informação e Banco de Dados. 2006. Universidade de São Paulo - Zona Leste.

8.
FERREIRA, J. E.. Membro titular da banca para contratação de um docente na categoria Professor Doutor, na área de Ciência da Computação ? Especialidade II: Banco de Dados. 2005. Universidade de São Paulo.

9.
FERREIRA, J. E.. Membro titular da banca para provimento de um cargo de Professor Assistente ?. 2005. Universidade Estadual Paulista - Júlio de Mesquita Filho.

10.
FERREIRA, J. E.. Membro titular da Banca Examinadora do Concurso Publico de Porvas e Titulos para preenchimento de uma função professor assistente na disciplina Sistemas orientados a objetos. 2005. Universidade Estadual Paulista.

11.
FERREIRA, J. E.. Membro titular da banca para provimento de um cargo de Professor Assistente ? UNESP Rio Claro. 2004. UNESP/RIO CLARO - Centro de Estudos de Insetos Sociais.

12.
FERREIRA, J. E.. Membro titular da banca para provimento de um cargo de Professor Assistente ? UNESP Rio Claro. Disciplina: Teoria da Computação. 2004. UNESP/RIO CLARO - Centro de Estudos de Insetos Sociais.

13.
FERREIRA, J. E.. Membro titular da banca para contratação de um docente na categoria Professor Doutor, na área de Ciência da Computação ? Especialidade: Banco de Dados nas disciplinas MC-526 e MO-410. 2004. Universidade Estadual de Campinas.

14.
FERREIRA, J. E.. Membro titular da banca para efetivação de Prof. Assistente - UNESP Rio Claro- Banco de dados. 2003. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

15.
FERREIRA, J. E.. Membro titular da banca para efetivação de Prof. Assistente - UNESP Rio Claro - Compiladores. 2003. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

16.
FERREIRA, J. E.. Membro titular da Banca para o cargo de Prof. Adjunto - Departamento da Computação. 2001. Universidade Federal de São Carlos.

17.
FERREIRA, J. E.. Membro titular da banca examinadora de concurso público de títulos e provas para provimento de um cargo efetivo - disciplina Teoria da Computação. 2000. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Livre docência
1.
ROMERO, R. A. F.; FERREIRA, J. E.; LEITE, N. J.; AMO, S.; BRAYNER, A. R. A.. Membro Titular da Banca do Concurso de Livre docência em Banco de Dados. 2015. Universidade de São Paulo.

2.
SERAPIAO, A. B. S.; FERREIRA, J. E.; MALTEMPI, M. V.; RUIZ, E. E. S.; CARVALHO, A. C. P. L. F.. Membro Titular da Banca do Concurso de Livre docência em Organização de Computadores. 2015. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

3.
MENDONCA NETO, C. F. X.; MARQUES, F. L. S. N.; PEDRINI, H.; COSTA, A. H. R.; FERREIRA, J. E.. Membro Titular da Banca do Concurso de Livre Docência em Algoritmos e Estrutura de Dados. 2015. Universidade de São Paulo.

4.
MENDONCA NETO, C. F. X.; MARQUES, F. L. S. N.; FERREIRA, J. E.. Membro Titular da Banca do Concurso de Livre Docência em Gestão e Desenvolvimento de Sistemas de Informação. 2014. Universidade de São Paulo.

Avaliação de cursos
1.
FERREIRA, J. E.; GUILHERME, I. R.. Relatório Circunstanciado sobre curso de graduação em tecnologia em informática-CEE 478/2006. 2006. Conselho Estadual de Educação.

2.
LIESENBERG, H.; FERREIRA, J. E.. Relatório circunstanciado para efeito de autorização de funcionamento do curso de Engenharia de Informática no IMES de Assis-GP 0106/95. 1995. Centro Estadual de Educação Tecnológica Paula Souza.



Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
International Conference on Web Services, 2018. Modeling Time-Critical Processes with WED-flow. 2018. (Congresso).

2.
IEEE International Conference on Services Computing. Web Services Composition through Data Events Approach. 2013. (Congresso).

3.
19th International Conference on Web Services. Transactional Recovery Support for Robust Exception Handling in Business Process Services. 2012. (Congresso).

4.
5th LNCC Meeting om Computacional Modeling. 2012. (Congresso).

5.
The São Paulo School of Advanced Science on e-Science for Bioenergy Research.Transaction Processing for e-Science Applications. 2012. (Simpósio).

6.
XXVII Simpósio Brasileiro de Bancos de Dados. Workshop de Teses e Dissertações no SBBD 2012. 2012. (Congresso).

7.
CoopIS 2010 - OTM. Reducing Exception Handling Complexity in Business Process Modeling and Implementation: The WED-Flow Approach. 2010. (Congresso).

8.
Semana de Sistemas de Informação.Transações Assíncronas para Workflows Científicos. 2010. (Simpósio).

9.
Simpósio Brasileiro de Banco de Dados. 2010. (Congresso).

10.
Business Process Management. Towards Algorithmic Generation of Business Processes: From Business Step Dependencies to Process Algebra Expressions. 2009. (Congresso).

11.
Simposio Brasileiro de Banco de Dados. Banco de dados evolutivos e metodos ageis. 2008. (Congresso).

12.
The 4th International Conference on Collaborative Computing. The RiverFish Approach to Business Process Modeling: Linking Business Steps to Control-Flow Patterns. 2008. (Congresso).

13.
Congresso de Tecnologias para Gestão de Dados e Metadados do Cone Sul. Gerenciamento de Processos de Negócio Usando Álgebra de Processos. 2007. (Congresso).

14.
Database and Expert Systems Applications - DEXA. The use of Multidimensional Scaling as Applied to the BPM Performance in Brazilian e-Government Administration. 2007. (Congresso).

15.
Symposium on Apllied Computing. Using Control-Flow Patterns for Specifying Business Processes in Cooperative Environments. 2007. (Congresso).

16.
Intelligent Systems for Molecular Biology. 2006. (Congresso).

17.
Simpósio Brasileiro de Banco de Dados. 2006. (Congresso).

18.
1o. International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computacional Biology. A Database System for Collaborative HIV analysis in Brazil. 2005. (Congresso).

19.
7th International IEEE Conference on E-Commerce Technology. Integration of Business Processes with Autonomous Information Systems: A Case Study in Government Services. 2005. (Congresso).

20.
IDEAS-2005. International Database Engineering and Applications Symposium. 2005. (Congresso).

21.
International IEEE Conference om E-Commerce Techonology. Integration of Business Processes with Autonomous Information Systems: A Case Study in Government Services. 2005. (Congresso).

22.
Simpósio Brasileiro de Banco de Dados. 2005. (Congresso).

23.
1st. International Conference on Information Systems and Technology Management. Local: FEA/USP. The unified interface for the government business registration through unified model. 2004. (Congresso).

24.
CONIP-2004 SUCESU-SP e IDETI. O Processo Unificado de Cadastramento de Empresas: um estudo de caso. 2004. (Congresso).

25.
III Latin American Course on Bioinformatics for Tropical Disease Research - OMS.Workshop: Introduction to Bioinformatics Databases. 2004. (Oficina).

26.
SBBD 2004. Mini-curso SBBD 2004: Naked Objects. 2004. (Congresso).

27.
Simpósio Brasileiro de Banco de Dados. Simpósio Brasileiro de Banco de Dados. 2004. (Congresso).

28.
1st International Conference on Bioinformatics and Computational Biology. Genflow: generic flow for integration, management and analysis. 2003. (Congresso).

29.
CN DST e Aids.Projeto de Construção de Data Warehouse e Desenvolvimento de Ferramentas para Bioinformática. 2003. (Outra).

30.
Encontro de Informática da Unesp.Estratégias de Distribuição e Replicação de Dados em Sistemas Corporativos. 2003. (Encontro).

31.
ENITEC.I Encontro de Informação e Tecnologia - ENITEC. 2003. (Encontro).

32.
II Latin American Course on Bioinformatics for Tropical Disease Research.Introduction for Bioinformatic Databases - OMS. 2003. (Oficina).

33.
Escola Brasileira de Computação 2000.Controle de Concorrência e distribuição de dados: a teoria clássica, suas limitações e extensões modernas. 2000. (Outra).

34.
Microarray Patterns.Microarray database patterns. 2000. (Encontro).

35.
ADBIS'99 (Advances in Databases and Information Systems). Sharing of heterogeneous databases. 1999. (Congresso).

36.
IDEAS99. Database modularization design for the construction of flexible information systems. 1999. (Congresso).

37.
Simpósio Brasileiro de Banco de Dados. Compartilhamento de módulos heterogêneos de dados através de objetos integradores. 1999. (Congresso).

38.
6o. Congresso Nacional de Desenvolvimento de Sistemas e Orientacao a Objetos. Usando templates orientados a objetos para acesso a basse de dados relacionais. 1997. (Congresso).

39.
Third Internacional Euro-Par Conference. Use of a semantically grained database system for distribution and control within design environments. 1997. (Congresso).

40.
Simpósio Brasileiro de Banco de Dados. Controle de compartilhamento e acesso em GBDOO baseado em composição de objetos. 1996. (Congresso).

41.
Simpósio Brasileiro de Banco de Dados. Adding conceptual constructs to support distribution in an object oriented model. 1994. (Congresso).


Organização de eventos, congressos, exposições e feiras
1.
CESAR JUNIOR, R. M. ; MEDEIROS, C. M. B. ; FERREIRA, J. E. ; OLIVEIRA, M. C. F. . IEEE e-Science 2014. 2014. (Congresso).

2.
FERREIRA, J. E.. 27th Brazilian Symposium on Databases. 2012. (Congresso).

3.
FERREIRA, J. E.. Iberoamerican Congress on Pattern Recognition. 2010. (Congresso).

4.
FERREIRA, J. E.. Comitê de Programa Sixteenth Conference on Information and Knowledge Management. 2007. (Congresso).

5.
FERREIRA, J. E.. Comitê de Programa e-Science Workshop. 2007. (Congresso).

6.
FERREIRA, J. E.. Xmeeting - Comitê Editorial. 2006. (Congresso).

7.
FERREIRA, J. E.. Xmeeting - Comitê Editorial. 2005. (Congresso).

8.
FERREIRA, J. E.. SBBD - Comitê de Programa. 2005. (Congresso).

9.
FERREIRA, J. E.. ICOBICOBI - comitê organizador. 2004. (Congresso).

10.
FERREIRA, J. E.. SBBD - Comitê de Programa. 2004. (Congresso).

11.
FERREIRA, J. E.. ICOBICOBI - comitê organizador. 2003. (Congresso).

12.
FERREIRA, J. E.. SBBD - Comitê de Programa. 2001. (Congresso).

13.
FERREIRA, J. E.. SBBD - Comitê de Programa. 2000. (Congresso).

14.
FERREIRA, J. E.. SBBD - Comitê Organizador. 1996. (Congresso).

15.
FERREIRA, J. E.. SBBD - Comitê Organizador. 1994. (Congresso).



Orientações



Orientações e supervisões em andamento
Dissertação de mestrado
1.
Holger Elias R. Espinola. Análise de dados semi-estruturados. Início: 2017. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo. (Orientador).

2.
Gabriel Torres G. Pato. Análise de mutações e suas correlações com fenótipos. Início: 2017. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. (Orientador).

3.
Rodrigo Müller de Carvalho. Análise de padrões em Sistemas de Informação Cientes de Processos. Início: 2016. Dissertação (Mestrado profissional em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo. (Orientador).

4.
Bruno Padilha. Ambiente transacional baseado em WED-flow. Início: 2014. Dissertação (Mestrado profissional em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, National Institutes of Health. (Orientador).

Tese de doutorado
1.
MINA CINTHO OZAHATA. Análise de dados para segurança transfusional de sangue. Início: 2014. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. (Orientador).

Supervisão de pós-doutorado
1.
Daison Manuel Yancy Caballero. Início: 2017. Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo.


Orientações e supervisões concluídas
Dissertação de mestrado
1.
Marino Hilario Catarino. Integrando banco de dados relacional e orientado a grafos para otimizar consultas com alto grau de indireção. 2017. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Orientador: João Eduardo Ferreira.

2.
Rafael Germano Rossi. Análise de Componentes Principais em Data Warehouses. 2017. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Orientador: João Eduardo Ferreira.

3.
Ester Risério Matos Bertoldi. Modelagem e implementação de banco de dados para identificação de marcadores moleculares no câncer de pâncreas. 2017. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Coorientador: João Eduardo Ferreira.

4.
Rodrigo Alves Lima. Modeling of Time WED-flow. 2017. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: João Eduardo Ferreira.

5.
André Casimiro. Principais variáveis na ordenação de anúncios. 2016. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Orientador: João Eduardo Ferreira.

6.
Marcela Ortega. Implementação do arcabouço WED-flow para controle de processos transacionais. 2013. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, NIH-USA Fundacao Pro-Sangue. Orientador: João Eduardo Ferreira.

7.
Pedro P. de S. B. da Silva. Uma abordagem transacional para o tratamento de exceções em processos de negócio. 2013. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: João Eduardo Ferreira.

8.
Gustavo Luiz Duarte. Metadados para reconciliação de transações em bancos de dados autônomos. 2012. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: João Eduardo Ferreira.

9.
Mauricio Chui Rodrigues. Tratamento de Eventos Aplicado à Composição de Serviços We. 2012. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Orientador: João Eduardo Ferreira.

10.
Elisa Pereira Kameda. Redução de dimensionalidade em modelos de bancos de dados multidimensionais. 2010. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Orientador: João Eduardo Ferreira.

11.
Mina Cintho. Framework para classificação das mutações de HIV. 2010. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: João Eduardo Ferreira.

12.
Guilherme Tozo de Carvalho. Aplicação de práticas ágeis na construção de data warehouse evolutivo. 2009. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Orientador: João Eduardo Ferreira.

13.
Pedro Losco Takecian. ACP e LOTOS: um estudo comparativo baseado em conceitos de BPEL e padrões de controle de fluxo. 2008. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, National Institutes of Health. Orientador: João Eduardo Ferreira.

14.
Grace Anne Pontes Borges. Fluxo de dados em redes de Petri coloridas e em grafos orientados a atores. 2008. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Orientador: João Eduardo Ferreira.

15.
Gustavo Bianchi Maia. Ferramenta para integração de banco de dados multidimensionais e softwares de visualização de séries temporais. 2007. Dissertação (Mestrado em Pós graduação Computação) - Instituto de Matemática e Estatística, . Orientador: João Eduardo Ferreira.

16.
RICARDO DA SILVA CARVALHEIRO. Integração de estruturas de endereçamento para viabilizar a automatização do georreferenciamento de cadastros: Um estudo de caso. 2006. Dissertação (Mestrado em Engenharia de Computação) - Instituto de Pesquisas Tecnológicas do Estado de São Paulo, . Orientador: João Eduardo Ferreira.

17.
Kelly Rosa Braghetto. CONTROLE DE PADRÕES DE FLUXOS DE PROCESSOS EM BANCOS DE DADOS RELACIONAIS. 2006. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: João Eduardo Ferreira.

18.
Devanir Zuliani. Projeto Conceitual de Workflow. 2006. Dissertação (Mestrado em Engenharia de Software) - Instituto de Pesquisas Tecnológicas do Estado de São Paulo, . Orientador: João Eduardo Ferreira.

19.
Marcos Eduardo Bolelli Broinizi. Validacao Agil e Precisa de Projetos Conceituais de Banco de Dados. 2006. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: João Eduardo Ferreira.

20.
Julio Cesar Mila. Utilização de ontologias na especificacao de processos e regras de negocio. 2005. Dissertação (Mestrado em Engenharia de Computação) - Instituto de Pesquisas Tecnológicas do Estado de São Paulo, . Orientador: João Eduardo Ferreira.

21.
Gustavo Tadao Okida. Índices para consultas por conteúdo em bancos de dados heterogêneos. 2004. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Orientador: João Eduardo Ferreira.

22.
Marcio Katsumi Oikawa. Integracao para dados e aplicacoes em biologia molecular computacional. 2003. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: João Eduardo Ferreira.

23.
Marcelo Camacho de Souza. Componente de controle transacional para integracao assincrona de bases de dados. 2003. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Orientador: João Eduardo Ferreira.

24.
Elcio Yukio Nanba. Escalonamento de tarefas em clusters de servidores SMP heterogeneos para aplicacoes de biologia molecular. 2003. Dissertação (Mestrado em Engenharia Elétrica) - Universidade de São Paulo, . Coorientador: João Eduardo Ferreira.

25.
Isabel Italiano. Um Modelo hibrido para atualizacao de dados em projetos de data warehouse. 2002. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Orientador: João Eduardo Ferreira.

26.
Bianka M. M. Teixeira Goncalves. Alternativas para propagacao das atualizacoes de um banco de dados operacional para um data warehouse. 2002. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Orientador: João Eduardo Ferreira.

27.
Luciano Vieira de Araujo. CCICLO: Componente para cruzamento e integracao de objetos classificados. 2002. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Orientador: João Eduardo Ferreira.

28.
LEONARDO AUGUSTO TANIGUTI MANTOVANI. Uma alternativa para Simplificação de Sincronismo de Dados Temporais entre Ambientes Operacionais e Analíticos. 2001. 98 f. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo, . Orientador: João Eduardo Ferreira.

29.
CARLOS HENRIQUE MAIA BRAGA. Meta Modelo para Controle Corporativo de Estratégia de Replicação de Dados. 2001. 112 f. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, . Orientador: João Eduardo Ferreira.

30.
Gisele Busichia. Construção de Sistemas Modulares com Integração pelo Gerenciador de Dados. 1999. 110 f. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação e Matemática Computacional) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: João Eduardo Ferreira.

Tese de doutorado
1.
André Luis Schwerz. Sistemas de informação cientes de processos, robustos e confiáveis. 2016. Tese (Doutorado em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: João Eduardo Ferreira.

2.
Rafael Liberato Roberto. Aumentando a migração de instâncias não complacentes em sistemas de informação cientes de processos. 2016. Tese (Doutorado em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: João Eduardo Ferreira.

3.
João Marcelo Borovina Josko. João Marcelo Borovina Josko. 2016. Tese (Doutorado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: João Eduardo Ferreira.

4.
Marcos E. B. Broinizi. Ordenação evolutiva de anúncios em publicidade computacional.. 2015. Tese (Doutorado em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo, . Orientador: João Eduardo Ferreira.

5.
Milton Y. Nishiyama Jr. Desenvolvimento da Plataforma CaneRegNet para Anotação Funcional e Análise do Transcriptoma da Cana-de-Açucar. 2015. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Coorientador: João Eduardo Ferreira.

6.
Pedro Losco Takecian. Diretrizes metodológicas e validação estatística de dados para a construção de data warehouses. 2014. Tese (Doutorado em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo, NIH-USA Fundacao Pro-Sangue. Orientador: João Eduardo Ferreira.

7.
Fernanda Nascimento Almeida. Descrição da proveniência de dados para extração de conhecimento em sistemas de informação de hemoterapia. 2012. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Coorientador: João Eduardo Ferreira.

8.
Kelly Rosa Braghetto. Técnicas de Modelagem para a Análise de Desempenho de Processos de Negócio. 2011. Tese (Doutorado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: João Eduardo Ferreira.

9.
Helves Humberto Domingues. Replicação assíncrona em bancos de dados evolutivos. 2010. Tese (Doutorado em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Coorientador: João Eduardo Ferreira.

10.
Alexandre Ricardo Nardi. Uma arquitetura de baixo acoplamento para execução de padrões de controle de fluxo em grades. 2009. Tese (Doutorado em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo, . Orientador: João Eduardo Ferreira.

11.
Maurício Egidio Cantão. Abordagem algébrica para seleção de clones ótimos em projetos genomas e metagenomas. 2009. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Coorientador: João Eduardo Ferreira.

12.
Márcio Katsumi Oikawa. Geração de expressões algébricas para processos de negócio usando reduções de digrafos série-paralelo. 2008. Tese (Doutorado em Ciencia da Computacao) - Universidade de São Paulo, NIH-USA Fundacao Pro-Sangue. Orientador: João Eduardo Ferreira.

13.
Luciano Vieira de Araújo. Sistema colaborativo para armazenamento e análise de dados de HIV. 2008. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, NIH-USA Fundacao Pro-Sangue. Orientador: João Eduardo Ferreira.

14.
Francisco Sobreira Netto. Medição de desempenho do gerenciamento de processos de negócio -BPM no PNAFE: uma proposta de modelo. 2006. Tese (Doutorado em Administração) - Universidade de São Paulo, . Coorientador: João Eduardo Ferreira.

Supervisão de pós-doutorado
1.
Marcelo Ris. 2016. Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. João Eduardo Ferreira.

2.
Helves Humberto Domingues. 2012. Universidade de São Paulo, NIH-USA Fundacao Pro-Sangue. João Eduardo Ferreira.

Iniciação científica
1.
Mina Cintho. Classificação das mutações de vírus HIV. 2010. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado em Ciência da Computação) - Universidade de São Paulo, NIH-USA Fundacao Pro-Sangue. Orientador: João Eduardo Ferreira.

2.
Marcela Ortega. Indexação de Dados Semi-estruturados para o Sistema de Informação CEGH. 2009. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado em Ciência da Computação) - Universidade de São Paulo, NIH-USA Fundacao Pro-Sangue. Orientador: João Eduardo Ferreira.

3.
Pedro Paulo de Souza Bento da Silva. Atualização Incremental de Data Warehouses. 2009. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado em Ciência da Computação) - Universidade de São Paulo, NIH-USA Fundacao Pro-Sangue. Orientador: João Eduardo Ferreira.

4.
Mauricio Chui Rodrigues. Encapsulando a NavigationPlanTool como Serviços Web. 2007. Iniciação Científica. (Graduando em Ciência da Computação) - Instituto de Matemática e Estatística, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: João Eduardo Ferreira.

5.
Marcos Eduardo Bolelli Broinzi. Genflow: um ambiente para integração de dados e processos em aplicações de bioinformática. 2003. Iniciação Científica - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: João Eduardo Ferreira.

6.
Leonardo A. T. Montavani. Modelagem de dados multidimensionais. 1998. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado em Ciências da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: João Eduardo Ferreira.

7.
André Luis Munhos Matos. Controle de transações assíncronas. 1997. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado em Ciências da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: João Eduardo Ferreira.

8.
Marcelo Camargo. Banco de dados orientados a objetos. 1995. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado em Ciências da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: João Eduardo Ferreira.

9.
Patricia Maura Angelini. Integração de dados. 1994. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado em Ciências da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: João Eduardo Ferreira.

10.
Fernanda Juliana Teixeira. Banco de dados distribuídos. 1993. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado em Ciências da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho. Orientador: João Eduardo Ferreira.



Inovação



Programa de computador registrado
1.
FERREIRA, J. E.; LIMA, A. M. ; MULLER, R. ; DIAS, R. ; CINTHO, M. . DIDB - Dynamic Interview Database. 2013.
Patente: Programa de Computador. Número do registro: BR51201300020-4, data de registro: 09/09/2013, título: "DIDB - Dynamic Interview Database" , Instituição de registro: INPI - Instituto Nacional da Propriedade Industrial.


Projetos de pesquisa


Educação e Popularização de C & T



Apresentações de Trabalho
1.
Chui, M. ; FERREIRA, J. E. ; PU, C. . Web Services Composition through Data Events Approach. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).


Programa de Computador registrado
1.
FERREIRA, J. E.; LIMA, A. M. ; MULLER, R. ; DIAS, R. ; CINTHO, M. . DIDB - Dynamic Interview Database. 2013.
Patente: Programa de Computador. Número do registro: BR51201300020-4, data de registro: 09/09/2013, título: "DIDB - Dynamic Interview Database" , Instituição de registro: INPI - Instituto Nacional da Propriedade Industrial.


Organização de eventos, congressos, exposições e feiras
1.
FERREIRA, J. E.. 27th Brazilian Symposium on Databases. 2012. (Congresso).



Outras informações relevantes


- Membro da Comissão de Avaliadores do Simpósio Brasileiro de Banco de Dados respectivamente nos anos de 1995 a 2010 e 2012-atual.
- Membro do Comitê de Programa dos eventos: ICWS (2010-atual), ICSOC(2011-atual), WISE (2011-atual), SBBD (2012-atual), eScience (2014-atual).
- Assessor de Informática da Pró-Reitoria de Pós-Graduação da Universidade de São Paulo: 2012-2013.
- Diretor do Departamento de Tecnologia da Informação da Universidade de São Paulo. 2014-2015
- Pesquisador Associado ao CTBE-CNPEM. O principal tema da atividade de pesquisa refere-se a Integração de Bancos de Dados, Análise e Visualização de Dados em Larga Escala 2013-2014.
- Membro do Conselho de Pesquisa do Instituto de Matemática e Estatística da Universidade de São Paulo, 2013, 2014, 2015.
- Superintendente de Tecnologia da Informação da Universidade de São Paulo. 2014-atual. Detalhes em: http://www.sti.usp.br.



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