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Carlos Frederico Martins Menck
Bolsista de Produtividade em Pesquisa do CNPq - Nível 1A

possui graduação em Ciencias Biológicas pela Universidade de São Paulo (1977) e doutorado em Bioquímica pela Universidade de São Paulo (1982). Atualmente é professor titular da Universidade de São Paulo. Tem experiência na área de Genética, com ênfase em Genética Molecular e de Microorganismos, atuando principalmente nos seguintes temas: reparo de dna, mutagenese, ultravioleta e transferência gênica com vetores virais. Também tem interesse no uso de RNA interferência no silenciamento de processos de reparo de DNA com objetivos de entender seus mecanismos e potencialização dos efeitos de quimioterápicos no tratamento de tumores.
(Texto informado pelo autor)

Última atualização do currículo em 28/09/2011
Endereço para acessar este CV:
http://lattes.cnpq.br/8043136069525312
Dados pessoais
NomeCarlos Frederico Martins Menck
Nome em citações bibliográficasMENCK CF;Menck, C. F. M.;Menck, Carlos F.M.;Menck, C. F.M.;Martins Menck, Carlos F;Menck, Carlos Frederico Martins
SexoMasculino
Endereço profissionalUniversidade de São Paulo, Instituto de Ciências Biomédicas, Departamento de Microbiologia.
Av. Prof. Lineu Prestes No 1374
Cid. Universitária
05508-900 - Sao Paulo, SP - Brasil
Telefone: (011) 30917499 Fax: (011) 30917354
URL da Homepage: http://www.icb.usp.br/~mutagene/

Formação acadêmica/Titulação
1991Livre-docência.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: Lesões em DNA e suas consequências biológicas, Ano de obtenção: 1991.
Palavras-chave: Carcinogenese; Dna Simples Fita; Morte Celular; Oxigenio Singlete; Photorepair; Mutagenese.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética.
1985 - 1988Pós-Doutorado .
Institut des Recherches Scientifiques sur le Cancer.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico ,CNPq ,Brasil .
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Mutagenese.
1978 - 1982Doutorado em Bioquímica .
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: Sobrevivência e Sistemas de reparo em células de mamíferos, Ano de Obtenção: 1982.
Orientador: Rogério Meneghini.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo ,FAPESP ,Brasil .
Palavras-chave: Reparo de Dna; Ultravioleta; Xeroderma; Mammalian Cells; Morte Celular.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.
1974 - 1977Graduação em Ciencias Biológicas .
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.

Atuação profissional
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Vínculo institucional
1996 - Atual Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor titular, Regime: Dedicação exclusiva.
Vínculo institucional
1991 - 1995 Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Associado, Regime: Dedicação exclusiva.
Vínculo institucional
1988 - 1991 Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Doutor, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Atividades
11/2009 - AtualAtividades de Participação em Projeto, Instituto de Ciências Biomédicas, Departamento de Microbiologia.
Projetos de pesquisa
Respostas celulares a lesões no genoma
02/1996 - AtualEnsino, Microbiologia para Ciencias Biológicas, Nível: Graduação.
Disciplinas ministradas
Microbiologia
02/1996 - AtualEnsino, Ciências Biológicas (Microbiologia), Nível: Pós-Graduação.
Disciplinas ministradas
Sistemas de expressão gênica em células humanas.
02/1996 - AtualAtividades de Participação em Projeto, Instituto de Ciências Biomédicas, .
Projetos de pesquisa
Evolução e função de genes de reparo de DNA
09/2005 - 09/2009Direção e administração, Instituto de Ciências Biomédicas, .
Cargo ou função
Vice Diretor da Unidade.
06/2004 - 09/2009Atividades de Participação em Projeto, Instituto de Ciências Biomédicas, .
Projetos de pesquisa
GENES DE REPARO DE DNA: ANÁLISE FUNCIONAL E EVOLUÇÃO.
10/2001 - 09/2005Direção e administração, Instituto de Ciências Biomédicas, Departamento de Microbiologia.
Cargo ou função
Chefe de Departamento.
01/1996 - 02/2003Pesquisa e desenvolvimento , Instituto de Ciências Biomédicas, Departamento de Microbiologia.
Linhas de pesquisa
Estudos de Reparo de DNA e suas consequências Biológicas
Universidade do Estado do Rio de Janeiro, UERJ, Brasil.
Vínculo institucional
1981 - 1988 Vínculo: Servidor público ou celetista, Enquadramento Funcional: PROFESSOR ADJUNTO, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Atividades
03/1982 - 03/1988Ensino, Biologia (Biociências Nucleares), Nível: Pós-Graduação.
Disciplinas ministradas
Radiobiologia
01/1982 - 03/1988Ensino, Nível: Graduação.
Disciplinas ministradas
PROFESSOR UNIVERSITARIO

Linhas de Pesquisa
1. Estudos de Reparo de DNA e suas consequências Biológicas
Objetivos: Este projeto visa estudar diferentes aspectos de reparo de DNA e suas principais consequências para a célula: morte e mutagênese. Em células de mamíferos em cultura estamos desenvolvendo sistemas de vetores virais para o controle da expressão de genes de reparo de DNA. Estamos dedicando especial atenção à expressão do gene da fotoliase de marsupial em células humanas. Com estes estudos, conseguimos demonstrar que o sinal necessário para iniciar o estímulo de apoptose por UV em células humanas pode ser fotorreativado, o que indica a participação da lesão CPD (dímeros de pirimidina) e permite realizar uma série de investigações da sequência de eventos que levam a morte celular. A expressão de genes de reparo de DNA através de vetores adenovirais tem sido uma das abordagens principais deste laboratório. Vetores ponte de replicação epissomal estão também sendo empregados em estudos de mutagênese, possibilitando a determinação da "assinatura" molecular de mutagênese de agentes como o oxigênio singlete e ozônio. Estamos também envolvidos em caracterizar genes envolvidos em reparo de DNA de em outros organismos, como plantas e a bactéria modelo Caulobacter crescentus..
Palavras-chave: Adenovirus; Apoptose; Dimeros de Pirimidina; Especies Ativas de Oxigenio; Evolução; Photorepair.

Projetos de Pesquisa
2009 - AtualRespostas celulares a lesões no genoma
Descrição: O material genético celular está constantemente sujeito a agressões, gerando lesões na molécula de DNA. Estas afetam diretamente a replicação do DNA e transcrição do RNA, desencadeando respostas que interferem em vários processos metabólicos, inclusive ciclo celular. Para as células, lesões não removidas no DNA podem resultar em mutagênese ou morte celular e, para organismos multicelulares, as conseqüências são carcinogênese e envelhecimento. Este projeto busca estudar as respostas celulares após a indução de lesões no genoma, visando compreender os processos genéticos envolvidos na remoção (reparo de DNA), ou na tolerância aos danos. Empregamos vários modelos biológicos para esse estudo, eucariontes e procariontes, graças ao alto grau de conservação evolutiva dessas respostas, e que, por outro lado, nos dá uma visão abrangente do tema..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação ( 3) / Mestrado acadêmico ( 2) / Doutorado ( 7) .
Integrantes: Carlos Frederico Martins Menck - Coordenador.
Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro..
2004 - 2009Evolução e função de genes de reparo de DNA
Descrição: Este projeto visa o estudo de sistemas de proteção ao material genético celular, assim como a evolução, com a busca de genes novos relacionados a esses sistemas. Quatro subprojetos são apresentados. Nos dois primeiros propomos o estudo mecanismos de reparo de DNA em células animais com prioridade para estudos com células humanas primárias. Pretendemos empregar vetores genéticos, sobretudo derivados de adenovírus, para transduzir genes de reparo de DNA em células humanas, sobretudo relacionados a síndromes humanas com deficiência nesse processo (síndromes conhecidas como xeroderma pigmentosum). Esses vetores estão sendo previstos para serem usados em processos de diagnóstico que identificam o defeito celular e no estudo da dinâmica dessas proteínas dentro das células. Pretendemos também continuar a decifrar os sinais apoptóticos que são induzidos pela presença de lesões no genoma. Em outro subprojeto, buscamos compreender os sistemas pelos quais os vegetais protegem seu genoma de lesões no seu genoma. Como alvo, pretendemos estudar a função e a expressão de dois genes clonados por nós (AtXPB e Thi1). Finalmente, pretendemos realizar uma investigação de genômica funcional, para identificar genes envolvidos em reparo de DNA na bactéria modelo Caulobacter crescentus. Este subprojeto é exploratório e pretende a construção e o estudo de mutantes bacterianos. A facilidade de sincronização do ciclo celular nessas bactérias também pode ser útil na determinação efeito do ciclo em funções de reparo nessa célula..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação ( 2) / Mestrado acadêmico ( 1) / Doutorado ( 9) .
Integrantes: KM Lima-Bessa - Integrante / Carlos Frederico Martins Menck - Coordenador.
Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.Número de orientações: 6.
2003 - 2009GENES DE REPARO DE DNA: ANÁLISE FUNCIONAL E EVOLUÇÃO.
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação ( 4) / Mestrado acadêmico ( 1) / Doutorado ( 9) .
Integrantes: Carlos Frederico Martins Menck - Coordenador.
Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro..

Membro de corpo editorial
2002 - Atual Periódico: Genetics and Molecular Biology
2002 - Atual Periódico: Mutation Research-Fundamental and Molecular Mechanisms of Mutagenesis
2007 - Atual Periódico: Environmental and Molecular Mutagenesis
2009 - Atual Periódico: Photochemistry and Photobiology

Revisor de periódico
2004 - Atual Periódico: Current Biology
2005 - Atual Periódico: Oncogene
2005 - Atual Periódico: Experimental Parasitology
2007 - Atual Periódico: Photochemistry and Photobiology
2000 - Atual Periódico: DNA Repair (Print)
2001 - Atual Periódico: Genetics and Molecular Biology (Impresso)
2001 - Atual Periódico: Mutation Research. Reviews in Mutation Research
2005 - Atual Periódico: Mutation Research. Fundamental and Molecular Mechanisms of Mutagenesis

Áreas de atuação
1. Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.
2. Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Mutagenese.
3. Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.

Idiomas
Inglês Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Espanhol Fala Bem, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.
Francês Fala Bem, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.

Prêmios e títulos
2005Eleito Membro Titular da Academia Brasileira de Ciências, Academia Brasileira de Ciências.
2005Homenageado no VII Congresso Brasileiro de Mutagênese, Carcinogênese e Teratogênese Ambiental, Sociedade Brasileira de Mutagênese, Carcinogênese e Teratogênese Ambiental- SBMCTA.
2005Guggenheim Fellowship Award, John Simon Guggenheim Memorial Foundation, New York, USA.
2000Prêmio Mérito Científico e Tecnológico do Estado de São Paulo, pela sua participação no sequenciamento completo do Genoma da bactéria Xylella fastidiosa., Governo do Estado de São Paulo.
1999Eleito Membro Associado da Academia Brasileira de Ciências, Academia Brasileira de Ciências.
1996Nomeado Professor Titular, Depto. de Microbiologia, ICB, USP.


Produção em C,T & A
Produção bibliográfica
Citações
Web of Science
Total de trabalhos125Total de citações3444Fator H27
Menck C*  Data: 01/08/2011
Artigos completos publicados em periódicos
1. Yagura, Teiti ; Makita, Kazuo ; Yamamoto, Hiromasa ; Menck, Carlos F.M. ; Schuch, André P. . Biological Sensors for Solar Ultraviolet Radiation. Sensors (Basel), v. 11, p. 4277-4294, 2011.
2. Carvalho, Helotonio ; Garrido, Leandro M. ; Furlan, Renata L. A. ; Padilla, Gabriel ; Agnoletto, Mateus ; Guecheva, Temenouga ; Henriques, João A. P. ; Saffi, Jenifer ; Menck, Carlos Frederico Martins . DNA damage induced by the anthracycline cosmomycin D in DNA repair-deficient cells. Cancer Chemotherapy and Pharmacology, v. 65, p. 989-994, 2010.
3. Saffi, Jenifer ; Agnoletto, Mateus H. ; Guecheva, Temenouga N. ; Batista, Luís F.Z. ; Carvalho, Helotonio ; Henriques, João A.P. ; Stary, Anne ; Menck, Carlos F.M. ; Sarasin, Alain . Effect of the anti-neoplastic drug doxorubicin on XPD-mutated DNA repair-deficient human cells. DNA Repair (Print), v. 9, p. 40-47, 2010.
4. Cutiño-Jiménez, Ania M. ; Martins-Pinheiro, Marinalva ; Lima, Wanessa C. ; Martín-Tornet, Alexander ; Morales, Osleidys G. ; Menck, Carlos F.M. . Evolutionary placement of Xanthomonadales based on conserved protein signature sequences. Molecular Phylogenetics and Evolution (Print), v. 54, p. 524-534, 2010.
5. BERRA, C. M. ; MENCK CF ; MARTINEZ, G. R. ; OLIVEIRA, C. S. ; Baptista MS ; MASCIO, P. . Plasmid DNA damage induced by singlet molecular oxygen released from the naphthalene endoperoxide DHPNO2 and photoactivated methylene blue.. Química Nova (Online), v. 33, p. 279-283, 2010.
6. Olivero, Ofelia A. ; Larramendy, Marcelo ; Soloneski, Sonia ; Menck, Carlos F.M. ; Matta, Jaime ; Folle, Gustavo A. ; Zamorano-Ponce, Enrique ; Spivak, Graciela . Impact of EMS outreach: Successful developments in Latin America. Environmental and Molecular Mutagenesis, p. NA-NA, 2010.
7. Schuch, André Passaglia ; Menck, Carlos Frederico Martins . The genotoxic effects of DNA lesions induced by artificial UV-radiation and sunlight. Journal of Photochemistry and Photobiology. B, Biology, v. 99, p. 111-116, 2010.
8. Batista, Luís F.Z. ; Kaina, Bernd ; Meneghini, Rogério ; Menck, Carlos F.M. . How DNA lesions are turned into powerful killing structures: Insights from UV-induced apoptosis. Mutation Research. Reviews in Mutation Research, v. 681, p. 197-208, 2009.
9. Batista, L. F.Z. ; Roos, W. P. ; KAINA, B. ; Menck, C. F.M. . p53 Mutant Human Glioma Cells Are Sensitive to UV-C-Induced Apoptosis Due to Impaired Cyclobutane Pyrimidine Dimer Removal. Molecular Cancer Research, v. 7, p. 237-246, 2009.
10. SCHUCH, A. ; GALHARDO, R. ; LIMA-BESSA, K. ; Schuch, NJ ; MENCK CF . Development of a DNA-dosimeter system for monitoring the effects of solar-ultraviolet radiation. Photochemical & Photobiological Sciences, v. 8, p. 111, 2009.
11. LIMA, W. C. ; Varani, A. M. ; Menck, C. F.M. . NAD Biosynthesis Evolution in Bacteria: Lateral Gene Transfer of Kynurenine Pathway in Xanthomonadales and Flavobacteriales. Molecular Biology and Evolution, v. 26, p. 399-406, 2009.
12. Perpetuo, Elen Aquino ; Marques, Regina Célia Pereira ; Mendes, Maria Anita ; Lima, Wanessa Cristina ; Menck, Carlos Frederico Martins ; Nascimento, Claudio Augusto Oller do . Characterization of the phenol monooxygenase gene from Chromobacterium violaceum: Potential use for phenol biodegradation. Biotechnology and Bioprocess Engineering, v. 14, p. 694-701, 2009.
13. Lima-Bessa, K. M. ; SOLTYS, DT ; Marchetto, M. C. N. ; MENCK CF . Xeroderma pigmentosum: living in the dark but with hope in therapy. Drugs of the Future, v. 34, p. 665-672, 2009.
14.   LIMA-BESSA, K. ; ARMELINI, M. ; CHIGANCAS, V. ; JACYSYN, J. ; AMARANTES-MENDES, G. ; SARASIN, A. ; MENCK CF . CPDs and 6-4PPs play different roles in UV-induced cell death in normal and NER-deficient human cells. DNA Repair, v. 7, p. 303-312, 2008.
15. COSTA, R. M. A. ; QUAYLE, C. ; JACYSYN, J. ; AMARANTES-MENDES, G. ; SARASIN, A. ; MENCK CF . Resistance to ultraviolet-induced apoptosis in DNA repair deficient growth arrested human fibroblasts is not related to recovery from RNA transcription blockage. Mutation Research. Fundamental and Molecular Mechanisms of Mutagenesis, v. 640, p. 1-7, 2008.
16. ROCHA, R. ; PAQUOLA, A. ; MARQUES, M. ; MENCK CF ; GALHARDO, R. . Characterization of the SOS regulon of Caulobacter crescentus. Journal of Bacteriology, v. 190, p. 1209-1218, 2008.
17. LIMA, W. C. ; PAQUOLA, A. ; Varani AM ; M.A. VanSluys ; MENCK CF . Laterally transferred genomic islands in Xanthomonadales related to pathogenicity and primary metabolism.. FEMS Microbiology Letters, v. 281, p. 87-97, 2008.
18. LIMA, W. C. ; MENCK CF . Replacement of the Arginine Biosynthesis Operon in Xanthomonadales by Lateral Gene Transfer. Journal of Molecular Evolution, v. 66, p. 266-275, 2008.
19. CARVALHO, H. ; ORTOLAN, T. G. ; PAULA, T. ; LEITE, R. A. ; WEINLICH, R. ; AMARANTES-MENDES, G. ; MENCK CF . Sustained activation of p53 in confluent nucleotide excision repair-deficient cells resistant to ultraviolet-induced apoptosis.. DNA Repair, v. 7, p. 922-931, 2008.
20. CHIGANCAS, V. ; Lima-Bessa, K. M. ; STARY, A. ; Menck, C. F.M. ; SARASIN, A. . Defective Transcription/Repair Factor IIH Recruitment to Specific UV Lesions in Trichothiodystrophy Syndrome. Cancer Research, v. 68, p. 6074-6083, 2008.
21. Leite, Ricardo A ; Marchetto, Maria C ; Muotri, Alysson R ; de Moraes Vasconcelos, Dewton ; Prado de Oliveira, Zilda N ; Rivitti Machado, Maria C ; Martins Menck, Carlos F . Identification of XP Complementation Groups by Recombinant Adenovirus Carrying DNA Repair Genes. Journal of Investigative Dermatology, v. 129, p. 502-506, 2008.
22. ROOS, W. ; BATISTA, L. F. Z. ; NAUMANN, S. ; WELLER, M. ; MENCK CF ; KAINA, B. . Mechanism of apoptotic death triggered by methylating agent-induced DNA damage in glioma cells. Oncogene (Basingstoke), v. 26, p. 186-197, 2007.
23. MARTINS-PINHEIRO, M. ; MARQUES, R. ; MENCK CF . Genome analysis of DNA repair genes in the alpha proteobacterium Caulobacter crescentus. BMC Microbiology (Online), v. 7, p. 17, 2007.
24. NENE, V. ; WORTMAN, J. R. ; SEVERALAUTHORS, O. ; MENCK CF ; VERJOVSKI-ALMEIDA, S. ; SEVERSON, D. . Genome sequence of Aedes aegypti, a major arbovirus vector. Science, v. 316, p. 1718-1723, 2007.
25. MENCK CF ; ARMELINI, M. ; LIMA-BESSA, K. . On the search for skin gene therapy strategies of xeroderma pigmentosum disease.. Current Gene Therapy, v. 7, p. 163-174, 2007.
26. OJOPI, E. ; OLIVEIRA, P. ; NUNES, D. N. ; PAQUOLA, A. ; DEMARCO, R. ; GREGORIO, S. P. ; AIRES, K. ; MENCK CF ; LEITE, L. ; VERJOVSKI-ALMEIDA, S. ; DIAS-NETO, E. . A quantitative view of the transcriptome of Schistosoma mansoni adult-worms using SAGE. BMC Genomics, v. 8, p. 186, 2007.
27. ARMELINI, M. ; LIMA-BESSA, K. ; MARCHETTO, M. ; MUOTRI, A. R. ; CHIGANCAS, V. ; LEITE, R. ; CARVALHO, H. ; MENCK CF . Exploring DNA damage responses in human cells with recombinant adenoviral vectors.. Human & Experimental Toxicology, v. 6, p. 1340-1344, 2007.
28. BATISTA, L. F. Z. ; ROOS, W. ; CHRISTMANN, M. ; MENCK CF ; KAINA, B. . Differential sensitivity of malignant glioma cells to methylating and chloroethylating anticancer drugs: p53 determines the switch by regulating xpc, ddb2 and DNA double-strand breaks.. Cancer Research, v. 67, p. 11886-11895, 2007.
29. MEDINA-SILVA, R. ; BARROS, M. ; GALHARDO, R. ; NETTO, L. E. S. ; COLEPICOLO, P. ; MENCK CF . Heat stress promotes mitochondrial instability and oxidative responses in yeast deficient in thiazole biosynthesis.. Research in Microbiology (Paris), v. 157, n. 3, p. 275-281, 2006.
30. BATISTA, L. F. Z. ; CHIGANCAS, V. ; BRUMATTI, G. P. ; AMARANTES-MENDES, G. ; MENCK CF . Involvement of DNA replication in ultraviolet-induced apoptosis of mammalian cells.. Apoptosis (London), v. 11, p. 1139-1148, 2006.
31. BECKER, C. ; LACCHINI, S. ; MUOTRI, A. R. ; SILVA, G. ; CASTELLI, J. ; VASSALLO, P. ; MENCK CF ; KRIEGER, J. . Skeletal muscle cells expressing VEGF induce capillary formation and reduce cardiac injury in rats. International Journal of Cardiology, v. 113, p. 348-354, 2006.
32. LIMA-BESSA, K. ; CHIGANCAS, V. ; STARY, A. ; KANOUCHE, P. ; SARASIN, A. ; ARMELINI, M. ; JACYSYN, J. ; AMARANTES-MENDES, G. ; AL, E. ; MENCK CF . Adenovirus mediated transduction of the human DNA polymerase eta cDNA. DNA Repair, v. 5, p. 925-934, 2006.
33. MARCHETTO, M. ; CORREAL, R. ; MENCK CF ; MUOTRI, A. R. . Functional lentiviral vectors for xeroderma pigmentosum gene therapy. Journal of Biotechnology, v. 126, p. 424-430, 2006.
34. Godoi, P. H. C. ; Galhardo, R. S. ; LUCHE, D. D. ; Van Sluys, M.-A. ; MENCK CF ; Oliva, G. . Structure of the Thiazole Biosynthetic Enzyme THI1 from Arabidopsis thaliana. The Journal of Biological Chemistry, v. 281, p. 30957-30966, 2006.
35. BERRA, C. M. ; MENCK CF ; MASCIO, P. . Oxidative stress, genome lesions and signaling pathways in cell cycle control, in press. Química Nova (Online), v. 29, p. 1340-1344, 2006.
36. MALAVAZI, I. ; SAVOLDI, M. ; DIMAURO, S. M. ; MENCK CF ; HARRIS, S. D. ; Goldman MH ; Goldman GH . Transcriptome analysis of Aspergillus nidulans exposed to camptothecin-induced DNA damage.. Eukaryotic Cell, v. 5, p. 1688-1704, 2006.
37. ARMELINI, M. ; MUOTRI, A. R. ; MARCHETTO, M. ; LIMA-BESSA, K. ; SARASIN, A. ; MENCK CF . Restoring DNA repair capacity of cells from three distinct diseases by XPD gene recombinant adenovirus. Cancer Gene Therapy, England, v. 12, n. 4, p. 389-396, 2005.
38. COSTA, R. M. A. ; RIOU, L. ; PAQUOLA, A. ; MENCK CF ; SARASIN, A. . Transcriptional profiles of unirradiated or UV-irradiated human cells expressing either the cancer-prone XPB/CS allele or the non cancer-prone XPB/TTD allele. Oncogene (Basingstoke), Estados Unidos, v. 24, n. 8, p. 1359-1374, 2005.
39. MORGANTE, P. G. ; BERRA, C. M. ; NAKABASHI, M. ; COSTA, R. M. A. ; MENCK CF ; M.A. VanSluys . Function XPB/RAD25 redundancy in Arabidopsis genome: characterization of AtXPB2 and expression analysis. Gene (Amsterdam), Netherlands, v. 344, p. 93-103, 2005.
40. Lima-Bessa, Keronninn M. ; Menck, Carlos F.M. . Skin Cancer: Lights on Genome Lesions. Current Biology, England, v. 15, n. 2, p. R58-R61, 2005.
41. RIBEIRO, D. T. ; LP Farias ; ALMEIDA, J. ; KASHIWABARA, P. ; RIBEIRO, A. ; MC Silva-Filho ; MENCK CF ; M.A. VanSluys . Functional characterization of the thi1 promoter region from Arabidopsis thaliana. Journal of Experimental Botany, England, v. 56, n. 417, p. 1797-1804, 2005.
42.   GALHARDO, R. ; ROCHA, R. ; MARQUES, M. ; MENCK CF . A SOS-regulated operon involved in damage-inducible mutagenesis in Caulobacter crescentus. Nucleic Acids Research (Online), England, v. 33, n. 8, p. 2603-2614, 2005.
43. LIMA, W. C. ; M.A. VanSluys ; MENCK CF . Non-gamma-proteobacteria gene islands contribute to the Xanthomonas genome.. Journal of Integrative Biology / Omics (Larchmont), Estados Unidos, v. 9, n. 2, p. 158-170, 2005.
44. DEMARCO, R. ; KOWALTOWSKI, A. ; MACHADO, A. ; SOARES, M. ; GARGIONI, C. ; KAWANO, T. ; RODRIGUES, V. ; MENCK CF ; AL, E. ; VERJOVSKI-ALMEIDA, S. . Saci-1, -2, and -3 and Perere, four novel retrotransposons with high transcriptional activities from the human parasite Schistosoma mansoni.. Journal of Virology, United States, v. 78, n. 6, p. 2967-2978, 2004.
45. VINCENTZ, M. ; CARA, F. ; OKURA, V. ; PEDROSA, G. ; HEMERLY, A. ; CAPELLA, A. ; MARINS, M. ; AL, E. ; MENCK CF . Evaluation of Monocot and Eudicot Divergence Using the Sugarcane Transcriptome. Plant Physiology (Bethesda), Estados Unidos, v. 134, n. 3, p. 951-959, 2004.
46. NASCIMENTO, A. ; MARTINS, E. ; KO, A. ; MONTEIRO-VITORELLO, C. ; VERJOVSKI-ALMEIDA, S. ; HARTSKEERL, R. ; MARQUES, M. ; MENCK CF ; AL, E. ; M.A. VanSluys . Comparative genomics of two Leptospira interrogans serovars reveals novel insights into physiology and pathogenesis.. Journal of Bacteriology, Estados Unidos, v. 186, n. 7, p. 2164-2172, 2004.
47.   CHIGANCAS, V. ; SARASIN, A. ; MENCK CF . CPD-photolyase adenovirus-mediated gene transfer in normal and DNA-repair-deficient human cells. Journal of Cell Science, England, v. 117, p. 3579-3592, 2004.
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Capítulos de livros publicados
1. COSTA, R. M. A. ; ORTOLAN, T. G. ; LIMA-BESSA, K. ; Menck, C. F. M. . Processos de Reparo de DNA: os guardiões do genoma celular. In: Carlos Gil Ferreira; José Cláudio Casali da Rocha. (Org.). Oncologia Molecular. 2 ed. São Paulo: Editora Atheneu, 2010, v. 20, p. 41-61.
2. Menck, C. F. M. . A Nova grande promessa da inovação em fármacos: RNA interfêrencia saindo do laboratório para a cliínica.. Estudos Avançados. São Paulo: Scielo, 2010, v. 24, p. 99-107.
3. MENCK CF . RNA interferência: a nova corrida do ouro. In: Carlos Taborda e Walderez Gambale. (Org.). Microbiologia em foco. Sao Paulo: Sociedade Brasileira de Microbiologia, 2007, v. 1, p. 17-21.
4. COSTANZI-STRAUSS, E. ; MENCK CF ; BONAMINO, M.H. . Terapia Gênica do Câncer. In: Marcelo Morales. (Org.). Terapias avançadas: Células-tronco, Terapia gênica e Nanotecnologia Aplicada à Saúde. 158 ed. Sao Paulo: Atheneu, 2007, v. , p. -149.
5. MENCK CF ; VENTURA, A. . Manipulando os genes em busca de cura: o futuro da Terapia Gênica.. In: Coordenadoria de Comunicação Social. (Org.). Revista USP. Pensando o futuro: ciências biológicas. São Paulo: USP, 2007, v. 75, p. 48-61.
6. COSTA, R. M. A. ; MENCK CF . Genes de reparo de DNA. In: Carlos G. Ferreira; José Claudio C. Rocha. (Org.). Oncologia Molecular. 1 ed. São Paulo: Atheneu, 2004, v. 1, p. 43-55.
7. RACZ, M. ; MENCK CF . Propriedades Gerais dos Vírus. In: Luiz Rachid Trabulsi; Flávio Althertum. (Org.). Microbiologia. 4 ed. São Paulo: Atheneu, 2004, v. , p. 509-514.
8. MENCK CF ; M.A. VanSluys . Fundamentos da Biologia Molecular. In: Luis Mir. (Org.). Genômica. São Paulo: Atheneu, 2004, v. , p. 3-21.
9. AGNEZ, L. F. ; MEDEIROS, S. ; MARQUES, R. ; PINHEIRO, M. ; MENCK CF . Processos de reparo de DNA: garantindo a estabilidade do material genético. In: Lúcia Regina Ribeiro; Daisy Maria F. Salvadori; Edmundo Kanan Marques. (Org.). Mutagênese Ambiental. : , 2003, v. , p. 49-79.
10. MENCK CF ; OLIVEIRA, M. C. . Origem da vida: um tempo curto para uma experiência bem-sucedida.. Biologia Molecular e evolução. Ribeirão Preto: Holos Editora Ltda-ME, 2001, v. , p. 11-14.
11. OLIVEIRA, M. C. ; MENCK CF . O mundo de RNA e a origem da complexidade da vida.. In: Sérgio Russo Matioli. (Org.). Biologia Molecular e Evolução. Ribeirão Preto: Holos, Editora Ltda-ME, 2001, v. , p. 15-26.
12. NETTO, L. E. S. ; MENCK CF . Estabilidade do material genético: mutagênese e reparo.. Biologia Molecular e Evolução. : Ribeirão Preto, 2001, v. 575, p. 40-50.
13. MENCK CF . Shuttle Vector Between Prokaryotes And Eukaryotes For Assaying Singlet Oxygen Induced Dna Damage And Mutagenicity. Methods in Enzymology. : , 1994, v. 234, p. 115-122.
14. MENCK CF ; JAMES, M. R. ; RENAULT, G. ; SARASIN, A. . Shuttle Virus And Episomal Vectors For Mutagenesis And Gene Expression Studies In Monkey And Human Cells. ESTADOS UNIDOS: Alan R. Liss, Inc., 1988, v. , p. 511-519.
15. MENEGHINI, R. ; MENCK CF . Pyrimidine Dimers In Dna Strands Of Mammalian Cells Synthesized After Uv Irradiation. ESTADOS UNIDOS: Academic Press, 1978, v. , p. 493-497.
16. MENEGHINI, R. ; MENCK CF ; SCHUMACHER, R. I. ; CORDEIRO-STONE, M. . Repair Mechanisms And Their Relations To Uv Inducibility Of Cancer. BRASIL: Academia Brasileira de Ciencias, 1978, v. , p. 81-91.
Textos em jornais de notícias/revistas
1. MUOTRI, A. R. ; MARCHETTO, M. ; CASTELLI, J. ; VENTURA, A. ; MENCK CF . Vetores adenovirais: adenovírus recombinantes como uma poderosa ferramenta de transferência gênica.. Biotecnologia: Ciência e Desenvolvimento, p. 38 - 43.
2. DURAN, N. ; RETTORI, D. ; MENCK CF . quem é a Chromobacterium violaceum? perspectivas farmacológicas e industriais na era ós-genômica. Biotecnologia: Ciência e Desenvolvimento, São Paulo, p. 38 - 43.
3. COSTA, R. M. A. ; MENCK CF . Biomonitoramento de mutagênese ambiental: Emprego de plantas trangênicas em mutagênese ambiental. Biotecnologia: Ciência e Desenvolvimento, São Paulo, p. 24 - 26.
Resumos publicados em anais de congressos
1. MENCK CF ; ARMELINI, M. ; CHIGANCAS, V. ; LIMA-BESSA, K. . Comparing the action of the UV DNA photoproducts (CPDs and 6-4PPs) in apoptosis induction of human normal and xeroderma pigmentosum cells. In: Genome Instability and Repair, Keystone Symposia, 2007, Breckenridge, Colorado. Genome Instability and Repair, Keystone Symposia, 2007.
2. MENCK CF ; MARCHETTO, M. ; MUOTRI, A. R. ; FRIEDBERG, E. . Preventing UVB induced cancer in xeroderma pigmentosum mice with adenovirus vectors. In: Gordon Conference, 2005, Ventura, CA. Gordon Conference, 2005.
3. NAHUM, L. A. ; MENCK CF ; LIMA-BESSA, K. ; ARMELINI, M. ; CARVALHO, H. ; COSTA, R. M. A. . DNA Damage and replication involved in UV-Induced Apoptosis in DNA Repair deficient human cells. In: 9th International Conference on Environmental Mutagens & 36th Annual Meeting of The Environmental Mutagen Society, 2005, San Francisco, California. 9th International Conference on Environmental Mutagens & 36th Annual Meeting of The Environmental Mutagen Society, 2005.
4. ZIMBERGER, L. ; ROOS, W. ; KAINA, B. ; MENCK CF . Death pathways and P53 response after induction of different DNA Lesions on the Double-Helix. In: 9th International Conference on Environmental Mutagens & 36th Annual Meeting of The Environmental Mutagen Society, 2005, San Francisco, California. 9th International Conference on Environmental Mutagens & 36th Annual Meeting of The Environmental Mutagen Society, 2005.
5. GALHARDO, R. ; ROCHA, R. ; MARQUES, M. ; MENCK CF . Characterization of the SOS dependent Mutagenesis in Caulobacter crescentus. In: 9th International Conference on Environmental Mutagens & 36th Annual Meeting of The Environmental Mutagen Society, 2005, San Francisco, California. 9th International Conference on Environmental Mutagens & 36th Annual Meeting of The Environmental Mutagen Society, 2005.
6. CARVALHO, H. ; WEINLICH, R. ; AMARANTES-MENDES, G. ; MENCK CF . Effect of cell confluence on ultraviolet light apoptotic responses in nucleotide excision repair deficient fibroblasts. In: 9th International Conference on Environmental Mutagens & 36th Annual Meeting of The Environmental Mutagen Society, 2005, San Francisco, California. 9th International Conference on Environmental Mutagens & 36th Annual Meeting of The Environmental Mutagen Society, 2005.
7. MENCK CF ; MARCHETTO, M. ; MUOTRI, A. R. ; BATISTA, L. F. Z. ; CHIGANCAS, V. . RNA Transcription and DNA Replication of Damaged Templates are Implicated in Ultraviolet Induced Apoptosis in Mammalian Cells. In: XIX International Congress of Genetics, 2003, Melbourne. XIX International Congress of Genetics, 2003. p. 25-25.
8. CHIGANCAS, V. ; BRUMATTI, G. P. ; Pessini G ; Amarante-Mendes C.F ; MENCK CF . Inhibition of Parp Activity Prevents UV-C-Induced RNA Polymerase Arrest and Apoptosis.. In: 32nd Annual Meeting of European Environmental Mutagen Society., 2002, Warsaw. DNA Damage and Repair Fundamental Aspects and Contribution to Human Disorders, 2002. p. 100-100.
9. GALHARDO, R. ; MEDINA-SILVA, R. ; LUCHE, D. D. ; MENCK CF . Site-Directed Mutagenesis of Arabidopsis thaliana thi1 Gene: Distinct Activities for Mitochondrial DNA Damage Tolerance and Thiamin Biosynthesis. In: 32nd Annual Meeting of European Environmental Mutagen Society, 2002, Warsaw. DNA Damage and Repair Fundamental Aspects and Contribution to Human Disorders, 2002. p. 109-109.
10. MENCK CF ; VENTURA, A. ; MARCHETTO, M. ; MUOTRI, A. R. . High Efficiency of DNA Repair Complementation by XPA and XPC Recombinant Adenovirus. In: 32nd Annual Meeting of European Environmental Mutagen Society, 2002, Warsaw. DNA Damage and Repair Fundamental Aspects and Contribution to Human Disorders, 2002. p. 219-219.
11. CHIGANCAS, V. ; MIYAJI, E. N. ; YASUI, A. ; MENCK CF . Photorepair prevents the induction of apoptosis by RNA transcription arrest and P73 accumulation after UV irradiation in CHO cells. In: Workshop DNA repair: Interplay with other cellular processes, 2001, Noordwijkerhout. Interplay with other cellular processes, 2001. p. 79.
12. LUCHE, D. D. ; PH Godoi ; G Oliva ; CHABREGAS, S. M. ; MC Silva-Filho ; MENCK CF . The thi1 gene from Arabidopsis thaliana encodes for a novel DNA polymerase for plant organelles. In: Worshop DNA repair: Interplay with other cellular processes, 2001, Noordwijkerhout. Interplay with other cellular processes, 2001. p. 133.
13. MORGANTE, P. G. ; NAKABASHI, M. ; COSTA, R. M. A. ; MENCK CF ; M.A. VanSluys . AtXPB expression and promoter analysis in Arabidopsis plants. In: Workshop DNA repair: Interplay with other cellular processes, 2001, Noordwijkerhout. Interplay with other cellular processes, 2001. p. 183.
14. COSTA, R. M. A. ; MORGANTE, P. G. ; M.A. VanSluys ; MENCK CF . T-DNA targeting for one of teh Arabidopsis thaliana XPB homologue (araXPB1).. In: ASM Conference on DNA repair and Mutagenesis, 1999, Hilton Head, SC. ASM Conference on DNA repair and Mutagenesis, 1999. p. 76.
15. MENCK CF ; LUCHE, D. D. ; PH Godoi ; G Oliva ; S Chabregas ; MC Sliva-Filho . A deoxynucleotidil transferase for the organelles-targeted THI1 protein from Arabidopsis thaliana. In: ASM Conference on DNA repair and Mutagenesis, 1999, Hilton Had. ASM Conference on DNA repair and Mutagenesis, 1999. p. 97-98.
16. M.A. VanSluys ; PAPINI, F. S. ; LP Farias ; MENCK CF . THI1 expression in wild type and mutant Arabidopsis thaliana. In: ASM Conference on DNA repair and Mutagenesis, 1999, Hilton Head. ASM Conference on DNA repair and Mutagenesis, 1999. p. 107.
17. MENCK CF ; RIBEIRO, D. T. ; MACHADO, C. R. . Identification Of Dna Repair Genes In Plants. In: 7TH INTERNATIONAL CONFERENCE ON ENVIRONMENTAL MUTAGENS, 1997. MUTATUION RESEARCH. TOULOSE, FRANCE. v. 379. p. 92.
18. MENCK CF ; LUCHE, D. D. ; MACHADO, C. R. . Caracterização Funcional do Gene Thi1 de Arabidopsis Thaliana Através de Ensaios Fenotípicos Em Escherichia Coli. In: 42o Congresso Nacional de Genética, 1996. Revista Brasileira de Genética. Caxambu, MG. v. 19. p. 318.
19. MENCK CF ; AGNEZ, L. F. . Crescimento Preferencial de Plasmídeos Contendo Gene Supf Mutado Em Cepas de Escherichia Coli Deficientes Em Exonuclease Iii.. In: 42o Congresso Nacional de Genética, 1996. Revista Brasileira de Genética. Caxambu, MG. v. 19. p. 310.
20. MENCK CF ; MACHADO, C. R. ; PRAEKELT, U. M. ; OLIVEIRA, R. C. . Discovery Of A Plant Gene With Possible Dna Repair Activity In Cell Organeles.. In: XXV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 1996. Caxambu, MG.
21. MENCK CF ; BARROS, A. M. ; OLIVEIRA, R. C. . Estudo de Genes Envolvidos No Reparo de Dna Em Plantas: Metabolismo de Lesões Induzidas Por Agentes Metilantes. In: 42o Congresso Nacional de Genética, 1996. Revista Brasileira de Genética. Caxambu, MG. v. 19. p. 317.
22. MENCK CF ; PAPINI, F. S. ; MACHADO, C. R. ; PRAEKELT, U. M. ; VAN, M. A. . Estudos de Complementação de Mutantes de Arabidopsis Thaliana Com O Gene Thi1.. In: 42o Congresso Nacional de Genética, 1996. Revista Brasileira de Genética. Caxambu, MG. v. 19. p. 318.
23. MENCK CF ; NAHUM, L. A. . Isolamento de Sequências de Trypanosoma Cruzi Com Homologia A Domínios de Helicases. In: 42o Congresso Nacional de Genética, 1996. Revista Brasileira de Genética. Caxambu, MG. v. 19. p. 308.
24. MENCK CF ; MORGANTE, P. G. ; VAN, M. A. . Negative Selection In Tomato (Lycopersicon Sculentum L.) Using The Herpes Simplex Virus Thimidine Kinase Gene.. In: 42o Congresso Nacional de Genética, 1996. Revista Brasileira de Genética. Caxambu, MG. v. 19. p. 324.
25. MENCK CF ; AGNEZ, L. F. ; OLIVEIRA, R. C. ; MASCIO, P. . Singlet Oxygen-Induced Mutations In Escherichia Coli Strain Deficient In Exonuclease Iii. In: logia XXV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e BioMolecular, 1996. XXV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. Caxambu, MG. v. S-51. p. 180.
26. MENCK CF ; MUOTRI, A. R. ; JORGE, S. A. C. . Partial Inhibition Of The Xpa Dna Repair Gene In Human At Cells Expressed In Epstein-Barr (Ebv) Derived Vector.. In: VIII Encontro Nacional de Virologia, 1996. São Lourenço, MG. v. B-47. p. 108.
Apresentações de Trabalho
1. Menck, C. F. M. ; T., Y. ; Schuch, NJ . The Biological relevance of CPDs and 6-4 PPs induced by UVA and direct sunlight. 2009. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
Produção técnica
Processos ou técnicas
1. SCHUCH, A. ; MENCK CF . Dosímetro biológico de DNA, Método de Quantificação e qualificação de lesões induzidas pela radiação ultravioleta solar e seus usos. 2007.

Eventos
Participação em eventos
1. Dia Darwin II - Origens.Origem da vida. 2010. (Simpósio).
2. Aplicações das Ciências Biomédicas Implicações da Transferencia Gênica na Pesquisa Translacional e Inovação Terapêutica.Matando Células de Glioma O papel dos mecanismos de reparo de DNA depois de tratamento quimioterápico. 2010. (Simpósio).
3. XV Meeting of the Brazilian Society For Cell Biology.Using RNA interference to modulate DNA repair and induce cancer cell Death. 2010. (Simpósio).
4. 15th International Congress on Photobiology.The Biological relevance of CPDs and 6-4 PPs induced by UVA and direct sunlight. 2009. (Congresso).
5. 10th International Conference on Environmental Mutagens-.Cell-Cycle Blockage Affects DNA Damage Responses That Lead To Death in Human Primary Fibroblasts.. 2009. (Congresso).
6. 46th Congress of The European Societies of Toxicology- Safety for people and Environment, EUROTOX 2009.Ultraviolet Light induced DNA damage that triggers apoptosis pathways.. 2009. (Congresso).
7. 39th Annual Meeting da Environmental Mutagen Society. Gene and the Environment: From Molecular Mechanisms To Risk.DNA Repair in Caulobacter crescentus. 2008. (Congresso).

Orientações
Orientações em andamento
Dissertação de mestrado
1. Barbara Helen Cortat Santos. Obtenção das enzimas CPD-fotoliase e (6-4)-fotoliase e seus anticorpos para o estudo da importância relativa das lesões induzidas pela luz solar. Início: 2008. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. (Orientador).
Tese de doutorado
1. Juliana Vilar. Reparo de DNA e quimioterápicos para glioblastomas.. Início: 2008. Tese (Doutorado em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas - USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. (Orientador).
2. Carolina Quayle. Estudo do efeito de lesões no DNA causadas por irradiação ultravioleta em MEFs e camundongos nocaute para genes de reparo de DNA. Início: 2007. Tese (Doutorado em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas - USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. (Orientador).
3. Raquel P. Rocha. Mecanismos SOS em Caulobacter crescentus. Início: 2006. Tese (Doutorado em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas - USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. (Orientador).
4. André Passaglia Schuch. Desenvolvimento e aplicação do sistema dosímetro de DNA para avaliação da Ação Mutogênico Induzido pela Radiação Ultravioleta Solar na Molécula de DNA.. Início: 2005. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. (Orientador).
5. Daniela T. Soltys. Identificação de mutação em pacientes XPG brasileiros. Início: 2004. Tese (Doutorado em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas - USP. (Orientador).
6. Apuã Paquola. Identificação de sistemas regulatórios em Caulobacter crescentus através do desenvolvimento de ferramentas in silico. Início: 2004. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Instituto de Matemática e Estatística. (Orientador).
Supervisões e orientações concluídas
Dissertação de mestrado
1. Barbara Helen Cortat Santos. "Papel Biológico dos dímeros de pirimidina em células humanas irradiadas com irradiação UVA". 2010. Dissertação (Mestrado em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas - USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Carlos Frederico Martins Menck.
2. CARLA IVANE GANZ VOGEL. Identificação e seqüenciamento de genes envolvidos no reparo de DNA por excisão de nucleotídeos (NER) em cana de açúcar (Saccharum sp). 2002. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Microbiologia)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Carlos Frederico Martins Menck.
3. CAROLINA MARIA BERRA. Caracterização funcional do gene AtXPB2 em leveduras mutantes no gene homólogo RAD25. 2002. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Microbiologia)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Carlos Frederico Martins Menck.
4. MARINALVA MARTINS PINHEIRO. Genes de reparo de DNA em dois fitopatógenos: Xylella fastidiosa e Xanthomonas axonopodis pv.citri. 2001. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Microbiologia)) - Universidade de São Paulo, . Orientador: Carlos Frederico Martins Menck.
5. SORAIA ATTIE CALIL JORGE. Expressão do Antígeno de Superfície do Vírus da Hepatite B (Hbsag) Em Células de Mamíferos.. 1995. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Carlos Frederico Martins Menck.
6. Soraia Attie Calil Jorge. "Expressão de antígeno de superfície do vírus da hepatite B (HbsAg) em células de mamíferos". 1995. Dissertação (Mestrado em Biologia/Genética) - Instituto de Biociências - USP, . Orientador: Carlos Frederico Martins Menck.
7. LUCYMARA FASSARELA AGNEZ. Estudo dos Mecanismos de Reparo de Lesões de Dna Induzidas Por Oxigênio Singlete Em Escherichia Coli. 1994. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Carlos Frederico Martins Menck.
8. CARLOS RENATO MACHADO. Caracterizacao Parcial do Genoma de Um Baculovirus de Camarao (Baculovirus Penaei). 1993. Dissertação . Orientador: Carlos Frederico Martins Menck.
9. DENISE TEIXEIRA RIBEIRO. Lesões e Mutagênese Induzidas Por Oxigênio Singlete Em Vetor Simples Fita Derivado de Sv40. 1991. Dissertação . Orientador: Carlos Frederico Martins Menck.
10. JULIO CESAR DA PAIXAO. Inibição e Recuperação de Replicação de Dna Em Células de Roedores Uv - Irradiadas. 1987. Dissertação - Universidade do Estado do Rio de Janeiro, . Orientador: Carlos Frederico Martins Menck.
11. JANUARIO BISPO CABRAL NETO. Estudos Na Inativação de Fago Lambda Na Presença de Acetona Triplete Gerada Enzimaticamente. 1985. Dissertação - Universidade do Estado do Rio de Janeiro, . Orientador: Carlos Frederico Martins Menck.
Tese de doutorado
1. Raquel Paes da Rocha. A resposta SOS de Caulobacter crescentus e relações dos mecanismos de reparo com a progressão do ciclo celular. 2011. Tese (Doutorado em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas - USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Carlos Frederico Martins Menck.
2. Apuã César de Miranda Paquola. Identificação de transferência gênica horizontal em procariotos, estudo do regulon SOS de Caulobacter crescentus e análise estatística de colocalização de posições genômicas.. 2010. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Instituto de Ciências Biomédicas - USP, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Carlos Frederico Martins Menck.
3. Daniela Tathiana Soltys. "Analise da natureza genotípica de pacientes xeroderma pigmentosum Brasileiros". 2010. Tese (Doutorado em Genética) - Instituto de Ciências Biomédicas - USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Carlos Frederico Martins Menck.
4. André Passaglia Schuch. Avaliação da ação genotóxica induzida pela radiação ultravioleta solar na molécula de DNA. 2009. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Instituto de Ciências Biomédicas - USP, . Orientador: Carlos Frederico Martins Menck.
5. Regina Célia Pereira Marques. Identificação de genes de reparo de DNA em Caulobacter crescentos através de seleção de clones sensíveis a agentes genotóxicos.. 2008. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Microbiologia)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Carlos Frederico Martins Menck.
6. Luis Francisco Zirnberger Batista. Mecanismos de indução de apoptose pela presença de danos ao DNA: um estudo sobre o papel p53 na resistência de células de glioma a agentes quimioterápicos.. 2008. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Microbiologia)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Carlos Frederico Martins Menck.
7. Ricardo Alexandre Leite. Uso de vetores adenovirais na identificação de grupo de complementação de pacientes com xeroderma pigmentosum e em animais deficientes em reparo de DNA.. 2008. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Microbiologia)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Carlos Frederico Martins Menck.
8. Carolina Maria Berra. Estudos de reparo de DNA por excisão de nucleotídeos em lesões oxidativas em células de mamíferos. 2008. Tese (Doutorado em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas - USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Carlos Frederico Martins Menck.
9. WANESSA CRISTINA DE LIMA. Mapeamento de ilhas de trasferência gênica em Xanthomonas axonopodis pv. citri e Xanthomonas campestris pv. campestris. 2007. Tese (Doutorado em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas - USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Carlos Frederico Martins Menck.
10. Melissa Gava Armelini. Estudos de reparo de DNA por excisão de nucleotídeos utilizando vetores virais. 2007. Tese (Doutorado em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas - USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Carlos Frederico Martins Menck.
11. Marinalva Martins Pinheiro. Busca por genes relacionados a fenótipos mutadores em Caulobacter crescentus. 2007. Tese (Doutorado em Microbiologia) - Instituto de Ciências Biomédicas - USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Carlos Frederico Martins Menck.
12. KERONNINN MORENO LIMA BESSA. Estudo de respostas celulares induzidas por irradiação ultravioleta através da transdução de cDNA da polierase eta e fotoliases. 2006. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Instituto de Ciências Biomédicas - USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Carlos Frederico Martins Menck.
13. MARIA CAROLINA NASSER MARCHETTO. Transdução gênica in vitro e in vivo de genes relacionados à síndrome humana xeroderma pigmentosum. 2005. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Microbiologia)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Carlos Frederico Martins Menck.
14. RENATA MEDINA DA SILVA. Envolvimento da proteína Thi4 na proteção à instabilidade mitocondrial e ao estresse oxidativo em Saccharomyces cerevisiae. 2004. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Microbiologia)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Carlos Frederico Martins Menck.
15. VANESSA CHIGANÇAS. Mecanismos sinalizadores de apoptose após UV em células de mamíferos. 2003. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Carlos Frederico Martins Menck.
16. RODRIGO DA SILVA GALHARDO. Aspectos evolutivos e funcionais do gene thi1 de Arabdopsis thaliana. 2003. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Microbiologia)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Carlos Frederico Martins Menck.
17. DOUGLAS DALLE LUCHE. Estudo das atividades bioquímicas da proteína Thi1 de Arabidopsis thaliana. 2002. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo, . Orientador: Carlos Frederico Martins Menck.
18. ALYSSON RENATO MUOTRI. Modulação da expressão do gene de reparo de DNA xpa por meio de vetores genéticos em células humanas. 2001. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo, . Orientador: Carlos Frederico Martins Menck.
19. SORAIA ATTIE CALIL JORGE. Estudo de Reparo de DNA e mutagênese em células de mamíferos empregando vetores epissomais. 2000. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo, . Orientador: Carlos Frederico Martins Menck.
20. RENATA MARIA AUGUSTO DA COSTA. Participação do gene ATXPB1 no reparo de DNA em Arabidopsis thaliana. 2000. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Carlos Frederico Martins Menck.
21. LUCYMARA FASSARELA AGNEZ. Reparo e Mutagenese de Lesoes de Dna Induzidas Por Oxigenio Singlete. 1998. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Carlos Frederico Martins Menck.
22. DENISE TEIXEIRA RIBEIRO. Clonagem de Um Cdna de Arabidopsis Thaliana Homólogo Ao Gene Humano Xpb Envolvido Em Reparo de Dna e Transcrição.. 1997. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Carlos Frederico Martins Menck.
23. ELIANE NAMIE MIYAJI. Mecanismos de Morte Celular Induzidos Por Luz Ultravioleta Em Células de Rato-Canguru (Potorous Tridactylus).. 1997. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo, . Orientador: Carlos Frederico Martins Menck.
24. CARLOS RENATO MACHADO. Thi1, Um Gene de Arabidopsis Thaliana Envolvido Na Síntese de Tiamina e Na Estabilidade do Dna de Organelas.. 1997. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Carlos Frederico Martins Menck.

Outras informações relevantes 
Em 2009, participou de 6 Bancas de Doutorado, 2 de Mestrado, 3 de Qualificação e 2 Concursos de Professor Titular. Emitiu 100 pareceres e ministrou 8 seminários.
     Em 2008, participou de 11 Bancas de Doutorado, 3 de Qualificação, 2 Concursos de Admissão de Docentes, 2 Concursos de Professor Titular e 1 Concurso de Livre Docente. Emitiu 85 pareceres e ministrou 13 seminários.
     Em 2007, participou de 7 Bancas de Doutorado, 1 de  Mestrado, 1 de Qualificação  e 1 Concurso de Livre Docente. Emitiu 93 pareceres e ministrou 9 seminários.
     Em 2006, participou de 8 Bancas de Doutorado, 4 de Qualificação, 4 Concursos de Admissão de Professor Titular. Emitiu 94 pareceres e ministrou 12 seminários.
     Em 2005. participou de 4 bancas de Doutorado, 1 mestrado, 1 qualificação, 4 concursos de admissão de docentes, sendo 1para Professor Titular. Emitiu 74 pareceres e ministrou 3 seminários.
     Em 2004, participou de 8 Bancas de Doutorado, 4 Mestrado, 2 Qualificação, 3 Concursos de Admissão de Docentes, 2 Concursos de Professor Titular e 1 Concurso de Livre Docente. Emitiu 86 pareceres.
     Em 2003, participou de 15 bancas examinadoras de Mestrado, Doutorado, Livre-Docência e Titular, na USP 8 e outras instituições de Pesquisa do País 7; 2 concursos de admissão de docente, entrevistas para: Revista FAPESP, Folha de São Paulo e Revista Super Interessante..
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