Marco Antonio Alves da Silva

Bolsista de Produtividade em Pesquisa do CNPq - Nível 2

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  • Última atualização do currículo em 26/12/2017


Possui graduação em Física pela Fundação Educacional de Bauru (1977), graduação em Ciências pela Fundação Educacional de Bauru (1977), mestrado em Física pela Universidade de São Paulo (1983) e doutorado em Física pela Universidade de São Paulo (1987). Atualmente é Professor Associado da Universidade de São Paulo e mantém colaboração com o grupo de Física Estatística e Sistemas Complexos do Departamento de Física Teórica e Experimental da Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN). Tem experiência na área de Física, com ênfase em FÍSICA BIOLÓGICA, atuando principalmente nos seguintes temas: Monte Carlo, Folding, processos difusivos, crescimento de tumores e doenças priônicas. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Marco Antonio Alves da Silva
Nome em citações bibliográficas
DA SILVA, M. A. A.;DASILVA, M. A. A.;DA SILVA, MARCO ANTONIO ALVES;DASILVA MARCO ANTONIO ALVES;Silva, Marco Antonio Alves da;da Silva, M. A.A.;Alves da Silva, Marco Antonio;da Silva, M. A.;da Silva, M.;Silva, M. A. A.;DA SILVA, M A A;DA SILVA, M.A.A.

Endereço


Endereço Profissional
Universidade de São Paulo, Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto.
AV. DO CAFÉ S/N - sala 62 A-M - 3º andar
MONTE ALEGRE
14040903 - Ribeirão Preto, SP - Brasil
Telefone: (16) 33154172
Fax: (16) 33154880


Formação acadêmica/titulação


1983 - 1987
Doutorado em Física.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: SIMULACAO MONTE CARLO E ESTUDOS ANALITICOS EM PROCESSOS DE SOLIDIFICACAO, Ano de obtenção: 1987.
Orientador: BERNHARD JOACHIM MOKROSS.
Palavras-chave: Crescimento de Cristais; Discos Duros; Simulacao Monte Carlo.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
1978 - 1983
Mestrado em Física.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: PROPAGACAO DA LUZ EM MEIOS NAO LINEARES DE DOIS NIVEIS COM ESTADO EXCITADO DEGENERADO,Ano de Obtenção: 1983.
Orientador: ROGERIO CANTARINO TRAJANO DA COSTA.
Palavras-chave: Aproximacao Semiclassica; Nao Linearidade; Otica.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
1974 - 1977
Graduação em Física.
Fundação Educacional de Bauru, FEBAURU, Brasil.
1974 - 1977
Graduação em Ciências.
Fundação Educacional de Bauru, FEBAURU, Brasil.


Pós-doutorado e Livre-docência


2000
Livre-docência.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: Simulação Monte Carlo e suas aplicações: da Física à Biologia, Ano de obtenção: 2000.
Palavras-chave: Simulação Monte Carlo.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
1997 - 1999
Pós-Doutorado.
Carnegie Mellon University, CMU, Estados Unidos.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.


Atuação Profissional



Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.
Vínculo institucional

2003 - 2010
Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Professor Associado, Carga horária: 0


Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Vínculo institucional

1989 - Atual
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: PROFESSOR ASSOCIADO, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

03/2015 - Atual
Direção e administração, Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto, .

Cargo ou função
Membro Titular do Conselho do Departamento de Física e Química.
06/2014 - Atual
Direção e administração, Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto, .

Cargo ou função
Membro Suplente do Conselho Técnico-Administrativo (CTA).
06/2013 - Atual
Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto, .

Cargo ou função
Representante Suplente da Categoria dos Professores Associados junto à Congregação.
03/2013 - Atual
Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto, .

Cargo ou função
Membro Titular representante dos Professores Associados junto ao Conselho do Departamento de Fisica e Química.
01/2012 - Atual
Ensino, Física Aplicada à Medicina e Biologia, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Ministra a disciplina de Física Computacional no curso de Pós-Graduação na FFCLRP/USP
01/2012 - Atual
Ensino, Física Aplicada à Medicina e Biologia, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Orientador de mestrado e doutorado no curso de Pós-Graduação da FFCLRP/USP
01/2007 - Atual
Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto, .

Cargo ou função
Membro da Subcomissão de Acompanhamento de Egressos da Comissão de Graduação da FCFRP.
8/2005 - Atual
Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto, Departamento de Física e Química.

Cargo ou função
Membro da Comissão de Apoio Pedagógico do Departamento de Física e Química.
9/2001 - Atual
Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto, Departamento de Física e Química.

Cargo ou função
Coordenador da Comissão Intradepartamental de Estágios do De. de Fìsica e Química da Unidade.
3/1993 - Atual
Ensino, Medicina (Clínica Médica), Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Metodologia de Investigação Médica I. Princípios Básicos. Instrumentação Essencial. (ministração de aulas sobre Teoria dos Erros)
3/1992 - Atual
Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto, Departamento de Física e Química.

Cargo ou função
Representante da Unidade junto à Comissão de Redes do Campus da USP de Rib. Preto.
11/1990 - Atual
Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto, Departamento de Física e Química.

Cargo ou função
Representante Suplente da Uniade junto ao Conselho de Usuários do Centro de Computação Eletrônica da USP.
8/1990 - Atual
Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto, Departamento de Física e Química.

Cargo ou função
Membro da Comissão de Expansão do Campus de Ribeirão Preto da FCFRP.
07/1990 - Atual
Ensino, Física Aplicada à Medicina e Biologia, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
TERMODINÂMICA E MECÂNICA ESTATÍSTICA
8/1989 - Atual
Ensino, Fármacia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Física
Físico-Química
Físico-Química de Polímeros e Sistemas Dispersos
05/1989 - Atual
Pesquisa e desenvolvimento , Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto, Departamento de Física e Química.

06/2011 - 06/2013
Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto, .

Cargo ou função
Representante Suplente da Categoria dos Professores Associados junto à Congregação.
04/2013 - 04/2013
Outras atividades técnico-científicas , Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto, Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto.

Atividade realizada
Presidente da Mesa na eleição para escolha de dois representantes titulares e seus respectivos suplentes, representantes docentes da FCFRP, da categoria farmacêutico, para constituir o Comitê de Ética em Pesquisa da FCFRP.
04/2011 - 03/2013
Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto, Departamento de Física e Química.

Cargo ou função
Membro Titula rrepresentante dos Professores Associados junto ao Depto. de Física e Química.
01/2006 - 12/2011
Ensino, Ciências Farmacêuticas, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Biofísica Química Molecular
Computação simbólica: álgebra e cálculo para biociências
Introdução à Cristalografia
Técnicas de Simulação em Sistemas Moleculares
Teoria dos Líquidos Simples e Moleculares
Termodinâmica e Cinética para Ciências Físicas e Biológicas
01/2006 - 12/2011
Ensino, Ciências Farmacêuticas, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Orientador de mestrado e doutorado no curso de Pós-Graduação da FCFRP/USP - área de Química e Física Biológica
06/2009 - 06/2011
Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto, .

Cargo ou função
Representante Titular da Categoria dos Professores Associados junto à Congregação.
03/2009 - 03/2011
Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto, Departamento de Física e Química.

Cargo ou função
Membro Titular representante dos Professores Associados junto ao Conselho do Departamento de Física e Química.
10/2005 - 10/2009
Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto, Departamento de Física e Química.

Cargo ou função
Membro Suplente da Comissão de Graduação.
07/2005 - 07/2007
Direção e administração, Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto, Departamento de Física e Química.

Cargo ou função
Suplente de Chefe do Departamento de Física e Química.
6/2007 - 6/2007
Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto, Departamento de Física e Química.

Cargo ou função
Membro da Comissão de Seleção de Novos Alunos, para ingresso no Mestrado e Doutorado do Programa de Pós-Graduação em Ciências Farmacêuticas da FCFRP-USP.
3/2005 - 03/2007
Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto, Departamento de Física e Química.

Cargo ou função
Membro Titular representante dos Professores Associados junto ao Conselho do Depto. de Fìsica e Química.
3/2003 - 3/2005
Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto, Departamento de Física e Química.

Cargo ou função
Membro suplente representante dos Professores Associados junto ao Dep. de Fìsica e Química da Unidade.
3/2001 - 3/2003
Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto, Departamento de Física e Química.

Cargo ou função
Membro Titular representante dos Professores Associados junto ao Dep. de Fìsica e Química da Unidade.
5/1996 - 5/1998
Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto, Departamento de Física e Química.

Cargo ou função
Representate Titular da Unidade no Conselho Deliberativo do Centro de Informática de Rib. Preto (CIRP).
3/1995 - 3/1998
Conselhos, Comissões e Consultoria, Grupo de Assessoramento Técnico de Informática da Cci Gati, Cci.

Cargo ou função
Membro do Grupo de Assessoramento Técnico de Informática da CCI.
4/1995 - 8/1997
Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto, Departamento de Física e Química.

Cargo ou função
Presidente da Comissão de Computação do Departamento de Física e Química.
7/1994 - 8/1997
Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto, Departamento de Física e Química.

Cargo ou função
Coordenador da Rede de Informática da Unidade.
3/1995 - 3/1997
Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto, Departamento de Física e Química.

Cargo ou função
Representante Titular dos Professores Doutores no Conselho do Departamento de Fìsica e Química.
3/1993 - 3/1995
Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto, Departamento de Física e Química.

Cargo ou função
Representante suplente dos Professores Doutores na Congregação da Unidade.
2/1991 - 7/1994
Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto, Departamento de Física e Química.

Cargo ou função
Membro da Comissão de Computação da Unidade.
4/1990 - 6/1993
Ensino, Fármacos e Medicamentos, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Introdução à Física Farmacêutica (ministração de aulas sobre Equilíbiro Físico e Regra das Fases)
8/1991 - 12/1992
Ensino, Física Aplicada à Medicina e Biologia, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Termodinâmica e Mecânica Estatística com Aplicações em Sistemas Biológicos
3/1991 - 7/1991
Ensino, Física Aplicada à Medicina e Biologia, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Mecânica Quântica Aplicada
8/1990 - 12/1990
Ensino, Física Aplicada à Medicina e Biologia, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Física dos Materiais


Linhas de pesquisa


1.
Métodos computacionais aplicados a reações físico-químicas e processos difusivos

Objetivo: Tem como objetivos estudar: 1)Fenômenos difusivos em geral, tais como: propagação de doenças na população, difusão com memória e difusão de príons. 2)Reações de enovelamento e de agregação de proteínas. Nesses estudos utilizamos ferramentas da Mecânica Estatística, sendo a principal técnica utilizada o Método Monte Carlo tradicional e o Dinâmico..
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Palavras-chave: Doenças Priônicas; processos estocásticos; folding de macromoléculas; enovelamento protéico; Ensemble; Modelos epidêmicos.


Projetos de pesquisa


2016 - Atual
Caracterização e efeitos de memória em processos estocásticos
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (2) .
Integrantes: Marco Antonio Alves da Silva - Coordenador.Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
2012 - 2014
Sobre mecanismos mesoscópicos do crescimento de tumores - Proc FAPESP 2012/03823-5
Descrição: VigÊncia: 01/06/2012 a 31/05/2014 Material Permanente Importado: US$ 100.171,00.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2012 - 2014
Sobre mecanismos mesoscópicos do crescimento de tumores - PRPq- Projeto 1
Descrição: Proc. nº 2012.1.20637.1.6 Valor - R$ 6.000,00 Vigência - 2012/2013.
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
2011 - 2013
Processos Difusivos: caminhantes aleatórios com memória - FAPESP 2011/06757-0
Descrição: Valor: U$ 114.908,00.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2011 - 2012
Modelagem Analítica e Computacional de Sistemas Difusivos - FAPESP 2011/13685-6
Descrição: Valor: R$ 102.438,00 - para manutenção de visitantes no país - Prof.Dr. José Carlos Cressoni (UFAL) FAPESP - 2011/13685-6 - Vigência: 01/09/2011 a 31/08/2012.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2008 - 2010
Físico-Química de Macromoléculas: Simulação de Complexos Protéicos e Proteínas de Membrana
Descrição: Embora o tema ?complexos protéicos? possa envolver proteínas de membrana, aqui tratamos como dois tópicos distintos, pois, no primeiro vamos considerar apenas a complexação proteína-proteína e no segundo o aspecto de folding. Contudo, estes problemas estão intimamente correlacionados, quer no tratamento de suas interações entre suas partes e com o meio, quer nas ferramentas utilizadas para abordá-los. Assim, dividimos o projeto em duas partes: (a) Complexos Protéicos (b) Proteínas de Membrana.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) .
Integrantes: Marco Antonio Alves da Silva - Coordenador / Antonio Caliri - Integrante / Alexandre Suman de Araujo - Integrante.Financiador(es): CAPES/PRODOC - Bolsa / CAPES/PRODOC - Auxílio financeiro.
2007 - 2009
Processo de difusão e agregação em Fìsica Biológica: doenças prionicas e passeios aleatórios com memória - FAPESP 07/04220-4
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2003 - 2010
Orientação da aluna Lessandra Eller
Descrição: Simulação do enovelamento de modelos proteicos utilizando o método de crescimento de cadeias..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) .
Integrantes: Marco Antonio Alves da Silva - Coordenador.
2003 - 2006
Núcleo de excelência em fenômenos críticos e não lineares
Descrição: valor: R$ 180.000,00 - PRONEX Coordenador; Prof.Dr. Marcelo Leite Lyra Colaborador: Prof.Dr. José Carlos Cressoni.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) .
Integrantes: Marco Antonio Alves da Silva - Integrante / José Carlos Cressoni - Integrante / Marcelo Leite Lyra - Coordenador.Financiador(es): Coordenação do Pronex - Auxílio financeiro.
1997 - 1998
Expansão e Modernização da Rede Computacional da FCFRPnet (FAPESP 96/11648-4)
Descrição: Valor: R$ 140.000,00.
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) .
Integrantes: Marco Antonio Alves da Silva - Coordenador.Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
1996 - 1997
Simulação e Visualização Científica (FAPESP 95/6408-1)
Descrição: Valor: U$ 58,807.75.
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) .
Integrantes: Marco Antonio Alves da Silva - Integrante / Antonio Caliri - Coordenador.Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
1995 - 1995
Expansão/Implementação da Rede de Microcomputadores da FCFRP (CCI-USP)
Descrição: Valor: R$ 10.500,00.
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) .
Integrantes: Marco Antonio Alves da Silva - Coordenador.Financiador(es): Centro de Computação e Informática da Usp Reitoria - Auxílio financeiro.
1995 - 1995
Informatização dos Laboratórios do Dep. de Física e Química da FCFRP (CCI-USP)
Descrição: Valor: R$ 10.200,00.
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) .
Integrantes: Marco Antonio Alves da Silva - Coordenador.Financiador(es): Centro de Computação e Informática da Usp Reitoria - Auxílio financeiro.
1994 - 1995
Expansão da Rede Computacional da FCFRP-USP (FAPESP 1994/5098-6)
Descrição: Valor: R$ 42.099,00.
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) .
Integrantes: Marco Antonio Alves da Silva - Integrante / Antonio Caliri - Coordenador.Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
1992 - 1994
Vidros de Spin e a Mecânica Estatística do Folding de Proteínas (CNPq)
Descrição: -.
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) .
Integrantes: Marco Antonio Alves da Silva - Integrante / Antonio Caliri - Coordenador.Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.


Revisor de periódico


2009 - Atual
Periódico: Mathematics and Computers in Simulation (Print)
2013 - 2013
Periódico: movement ecology


Revisor de projeto de fomento


2011 - Atual
Agência de fomento: Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: FÍSICA BIOLÓGICA.
2.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Física Geral/Especialidade: Física Estatística e Termodinâmica.
3.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Física da Matéria Condensada/Especialidade: Equação de Estado, Equilíbrio de Fases e Transições de Fase.


Idiomas


Inglês
Compreende Razoavelmente, Fala Pouco, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.


Prêmios e títulos


2007
Prêmio Semana de Recepção aos Calouros à FCFRP/USP pelas atividades programadas e executadas, Reitoria e Pró-Reitoria de Graduação da USP.
2001
PROFESSOR ASSOCIADO, UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO.


Produções



Produção bibliográfica
Citações

Web of Science
Total de trabalhos:31
Total de citações:124
Fator H:6
da Silva, Marco A A  Data: 05/07/2016

SCOPUS

Artigos completos publicados em periódicos

1.
1DINIZ, R. M. B.2017DINIZ, R. M. B. ; Cressoni, J. C. ; DA SILVA, M. A. A. ; Mariz, A. M. ; DE ARAÚJO, J. M. . Narrow log-periodic modulations in non-Markovian random walks. PHYSICAL REVIEW E, v. 96, p. 062143, 2017.

2.
3MOURA, T. R. S.2016MOURA, T. R. S. ; VISWANATHAN, G.M. ; DA SILVA, M.A.A. ; CRESSONI, J.C. ; SILVA, L. R. . Transient superdiffusion in random walks with a. Physica. A (Print), v. 453, p. 259-263, 2016.

3.
2GRANZOTTI, C. R. F.2016GRANZOTTI, C. R. F. ; MARTINEZ, A. S. ; DA SILVA, M. A. A. . Scaling analysis of random walks with persistence lengths: Application to self-avoiding walks. PHYSICAL REVIEW E, v. 93, p. 052116, 2016.

4.
5DA SILVA, M.A.A.2015DA SILVA, M.A.A.; VISWANATHAN, G.M. ; CRESSONI, J.C. . A two-dimensional non-Markovian random walk leading to anomalous diffusion. Physica. A (Print), v. 421, p. 522-532, 2015.

5.
4COSTA, F.H.S.2015COSTA, F.H.S. ; CAMPOS, M. ; DA SILVA, M.A.A. . The universal growth rate behavior and regime transition in adherent cell colonies. Journal of Theoretical Biology, v. 387C, p. 181-188, 2015.

6.
7ALVES, G A2014ALVES, G A ; DE ARAÚJO, J M ; CRESSONI, J C ; DA SILVA, L R ; DA SILVA, M A A ; VISWANATHAN, G M . Superdiffusion driven by exponentially decaying memory. Journal of Statistical Mechanics, v. 2014, p. P04026, 2014.

7.
6DA SILVA, M. A. A.2014DA SILVA, M. A. A.; Viswanathan, G. M. ; Cressoni, J. C. . Ultraslow diffusion in an exactly solvable non-Markovian random walk. Physical Review. E, Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics (Print), v. 89, p. 052110, 2014.

8.
10DA SILVA, M. A. A.2013DA SILVA, M. A. A.; Cressoni, J. C. ; SCHÜTZ, GUNTER M. ; Viswanathan, G. M. ; TRIMPER, STEFFEN . Non-Gaussian propagator for elephant random walks. Physical Review. E, Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics (Print), v. 88, p. 022115, 2013.

9.
9COSTA, F.H.S.2013COSTA, F.H.S. ; CAMPOS, M. ; AIELLO, O. E. ; DA SILVA, M. A. A. . Basic ingredients for mathematical modeling of tumor growth in vitro: Cooperative effects and search for space. Journal of Theoretical Biology, v. 337, p. 24-29, 2013.

10.
8Cressoni, J. C.2013Cressoni, J. C. ; Viswanathan, G. M. ; da Silva, M. A.A. . Exact solution of an anisotropic 2D random walk model with strong memory correlations. Journal of Physics. A, Mathematical and Theoretical (Print), v. 46, p. 505002, 2013.

11.
14Cressoni, J.2012Cressoni, J. ; Cressoni, J. ; da Silva, M. ; Viswanathan, G. ; Ferreira, A. ; Viswanathan, G. ; Ferreira, A. ; da Silva, M. . Weakly anomalous diffusion with non-Gaussian propagators. Physical Review. E, Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics (Print), v. 86, p. 022103, 2012.

12.
13Borges, G. M.2012Borges, G. M. ; Ferreira, A. S. ; Silva, M. A. A. ; Cressoni, J. C. ; Viswanathan, G. M. ; Mariz, A. M. . Superdiffusion in a non-Markovian random walk model with a Gaussian memory profile. European Physical Journal. B, Condensed Matter and Complex Systems (Internet), v. 85, p. 310, 2012.

13.
12CRESSONI, José Carlos2012CRESSONI, José Carlos ; VISWANATHAN, Ghandi Mohan ; FERREIRA, A.S. ; da Silva, M. A.A. . Alzheimer random walk model: Two previously overlooked diffusion regimes. Physical Review. E, Statistical, Nonlinear and Soft Matter Physics (Online), v. 86, p. 042101, 2012.

14.
11Cressoni, J. C.2012Cressoni, J. C. ; SILVA, L. R. ; VISWANATHAN, Gandhi Mohan ; da Silva, M. A.A. . Robustness of the non-Markovian Alzheimer walk under stochastic perturbation. Europhysics Letters (Print), v. 100, p. 60003, 2012.

15.
15Dal Molin, J.2011Dal Molin, J. ; da Silva, M. A. ; CALIRI, A. . Effect of local thermal fluctuations on folding kinetics: A study from the perspective of nonextensive statistical mechanics. Physical Review. E, Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics (Print), v. 84, p. 041903, 2011.

16.
16Ferreira, A. S.2010Ferreira, A. S. ; Cressoni, J. C. ; Viswanathan, G. M. ; Alves da Silva, Marco Antonio . Anomalous diffusion in non-Markovian walks having amnestically induced persistence. Physical Review. E, Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics (Print), v. 81, p. 011125, 2010.

17.
17Dal Molin, J. P.2009Dal Molin, J. P. ; Silva, Marco Antonio Alves da ; Silva, I. R. da ; Caliri, A . Nonextensive statistical mechanics applied to protein folding problem: kinetics aspects. Brazilian Journal of Physics (Impresso), v. 39, p. 435-437, 2009.

18.
18FELISBERTO, M. L.2009FELISBERTO, M. L. ; PASSOS, F. S. ; Ferreira, A. S. ; da Silva, M. A.A. ; Cressoni, J. C. ; Viswanathan, G. M. . Sudden onset of log-periodicity and superdiffusion in non-Markovian random walks with amnestically induced persistence: exact results. European Physical Journal B, v. 72, p. 427-433, 2009.

19.
19DASILVA, M. A. A.2008DASILVA, M. A. A.; VISWANATHAN, Ghandi Mohan ; FERREIRA, Arlan da Silva ; CRESSONI, José Carlos . Spontaneous symmetry breaking in amnestically induced persistence. Physical Review. E, Statistical, Nonlinear and Soft Matter Physics, v. 77, p. 040101-1-040101-4, 2008.

20.
20CRESSONI, José Carlos2007 CRESSONI, José Carlos ; DA SILVA, M. A. A. ; VISWANATHAN, Gandhi Mohan . Amnestically induced persistence in random walks. Physical Review Letters, v. 98, p. 070603-1-4, 2007.

21.
21DA SILVA, M. A. A.;DASILVA, M. A. A.;DA SILVA, MARCO ANTONIO ALVES;DASILVA MARCO ANTONIO ALVES;Silva, Marco Antonio Alves da;da Silva, M. A.A.;Alves da Silva, Marco Antonio;da Silva, M. A.;da Silva, M.;Silva, M. A. A.;DA SILVA, M A A;DA SILVA, M.A.A.2006DA SILVA, M. A. A.; CRESSONI, José Carlos ; VISWANATHAN, Gandhi Mohan . Discrete-time non-Markovian random walks: The effect of memory limitations on scaling. Physica. A, v. 364, p. 70-78, 2006.

22.
23FERREIRA, Arlan da Silva2003 FERREIRA, Arlan da Silva ; DA SILVA, M. A. A. ; CRESSONI, José Carlos . Stochastic Modeling Approach to the Incubation Time of Prionic Diseases. Physical Review Letters, v. 90, n.19, p. 198101-1-198101-4, 2003.

23.
22AIELLO, Osvaldo Eduardo2003 AIELLO, Osvaldo Eduardo ; DA SILVA, M. A. A. . New approach to dynamical Monte Carlo methods: application to an epidemic model. Physica. A, v. 327, p. 525-534, 2003.

24.
24SILVA, Roosevelt Alves da2001SILVA, Roosevelt Alves da ; DA SILVA, M. A. A. ; CALIRI, Antonio . Deterministic folding: The role of entropic forces and steric specificities. Journal of Chemical Physics, v. 114, n.9, p. 4235-4242, 2001.

25.
25DA SILVA, M. A. A.;DASILVA, M. A. A.;DA SILVA, MARCO ANTONIO ALVES;DASILVA MARCO ANTONIO ALVES;Silva, Marco Antonio Alves da;da Silva, M. A.A.;Alves da Silva, Marco Antonio;da Silva, M. A.;da Silva, M.;Silva, M. A. A.;DA SILVA, M A A;DA SILVA, M.A.A.2000DA SILVA, M. A. A.; AIELLO, O. E. ; HAAS, V. J. ; CALIRI, A. . Solution of deterministic-stochastic epidemic models by dynamical Monte Carlo Method. Physica. A, New York, v. 282, p. 546-558, 2000.

26.
26DA SILVA, M. A. A.;DASILVA, M. A. A.;DA SILVA, MARCO ANTONIO ALVES;DASILVA MARCO ANTONIO ALVES;Silva, Marco Antonio Alves da;da Silva, M. A.A.;Alves da Silva, Marco Antonio;da Silva, M. A.;da Silva, M.;Silva, M. A. A.;DA SILVA, M A A;DA SILVA, M.A.A.1999DA SILVA, M. A. A.; HAAS, V. J. ; CALIRI, A. . Temporal Duration and Event Size Distribution at the Epidemic Threshold. Journal of Biological Physics, Holanda, v. 25, p. 309-324, 1999.

27.
27DA SILVA, M. A. A.;DASILVA, M. A. A.;DA SILVA, MARCO ANTONIO ALVES;DASILVA MARCO ANTONIO ALVES;Silva, Marco Antonio Alves da;da Silva, M. A.A.;Alves da Silva, Marco Antonio;da Silva, M. A.;da Silva, M.;Silva, M. A. A.;DA SILVA, M A A;DA SILVA, M.A.A.1997DA SILVA, M. A. A.; CALIRI, A. . Geometrical Effects on folding of macromolecules. Journal of Chemical Physics, EUA, v. 106, n.18, p. 7856, 1997.

28.
28DA SILVA, M. A. A.;DASILVA, M. A. A.;DA SILVA, MARCO ANTONIO ALVES;DASILVA MARCO ANTONIO ALVES;Silva, Marco Antonio Alves da;da Silva, M. A.A.;Alves da Silva, Marco Antonio;da Silva, M. A.;da Silva, M.;Silva, M. A. A.;DA SILVA, M A A;DA SILVA, M.A.A.1996DA SILVA, M. A. A.; ROCHA, L. F. O. ; CALIRI, A. . Entropic force and folding of macromolecules. Physics Letters A, EUA, v. 220, p. 178-182, 1996.

29.
29DA SILVA, M. A. A.;DASILVA, M. A. A.;DA SILVA, MARCO ANTONIO ALVES;DASILVA MARCO ANTONIO ALVES;Silva, Marco Antonio Alves da;da Silva, M. A.A.;Alves da Silva, Marco Antonio;da Silva, M. A.;da Silva, M.;Silva, M. A. A.;DA SILVA, M A A;DA SILVA, M.A.A.1995DA SILVA, M. A. A.; SANTOS, C. B. ; PASSOS, A. . Epidemia: uma questão para a Física?. Ciência Hoje, Brasil, v. 18, n.107, p. 44, 1995.

30.
30FARIA, A. C.1991FARIA, A. C. ; DA SILVA, M. A. A. ; CALIRI, A. ; A, M. A. . Thermal Properties Of The +-J Infinite-Range Sherrington-Kirkpatrick Model By Analysis Of The Partition Function Zeros. Physics Letters A, v. 154, n.5-6, p. 287-292, 1991.

31.
31CALIRI, A.1989CALIRI, A. ; DA SILVA, M. A. A. ; MOKROSS, B. J. ; A, M. A. . A New Technique For Grand Canonical Monte Carlo Simulation. Journal of Chemical Physics, v. 91, n.10, p. 6328-6336, 1989.

32.
32DA SILVA, M. A. A.;DASILVA, M. A. A.;DA SILVA, MARCO ANTONIO ALVES;DASILVA MARCO ANTONIO ALVES;Silva, Marco Antonio Alves da;da Silva, M. A.A.;Alves da Silva, Marco Antonio;da Silva, M. A.;da Silva, M.;Silva, M. A. A.;DA SILVA, M A A;DA SILVA, M.A.A.1987 DA SILVA, M. A. A.; CALIRI, A. ; MOKROSS, B. J. . Phase Transition In A System Of Hard Disks By Monte Carlo Simulation. Physical Review Letters, v. 58, n.22, p. 2312-2314, 1987.

Capítulos de livros publicados
1.
DA SILVA, M. A. A.; CALIRI, A. . Monte Carlo methods applied to epidemics. In: Carlton A. Taft; Carlos H. T. P. Silva. (Org.). Current Methods in Medicinal Chemistry and Biological Physics. 1ed.Trivandrum: Research Signpost, 2007, v. 1, p. 163-186.

Textos em jornais de notícias/revistas
1.
CRESSONI, José Carlos ; DA SILVA, M. A. A. ; VISWANATHAN, Ghandi Mohan . Trio simula mal de Alzheimer no computador. Globo.com, 06 mar. 2007.

Trabalhos completos publicados em anais de congressos
1.
SAITO, Y. ; DA SILVA, M. A. A. ; ALVES, D. . A PROBABILISTIC CELLULAR AUTOMATA TO STUDYING THE SPREADING OF PNEUMONIA IN A POPULATION. In: BIOMAT 2009 International Symposium on Mathematical and Computational Biology, 2010, Brasilia. BIOMAT 2009 - International Symposium on Mathematical and Computational Biology. Singapore: World Scientific Publishing Co. Pte. Ltd., 2009. p. 354-365.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
COSTA, F.H.S. ; da Silva, M. A. . Dynamical Monte Carlo approach to tumor growth: the role of the waiting times. In: XXXVI Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 2013, Águas de Lindóia, SP. Resumos, 2013. p. 1-1.

2.
DAL MOLIN, João Paulo ; DA SILVA, M. A. A. ; CALIRI, Antonio . The role of entropic index q over protein native structure stability in the stereochemical model context. In: XXXV Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 2012, Águas de Lindóia, SP. Programa, 2012. v. 1. p. 3-Poster P255-3-Poster P255.

3.
BORGES, G. ; VISWANATHAN, Gandhi Mohan ; MARIZ, A.M. ; FERREIRA, Arlan da Silva ; DA SILVA, M. A. A. ; CRESSONI, José Carlos . Random walk with amnésia: A Gaussian memory profile model. In: XXXV Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 2012, Águas de Lindóia, SP. Programa, 2012. v. 1. p. 8- Poster P267-8- Poster P267.

4.
CRESSONI, José Carlos ; VISWANATHAN, Gandhi Mohan ; FERREIRA, Arlan da Silva ; DA SILVA, M. A. A. . Localized memory in a non-Markovian random walk model. In: XXXV Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 2012, Águas de Lindóia, SP. Programa, 2012. v. 1. p. 8-Poster P269-8-Poster P269.

5.
DAL MOLIN, João Paulo ; DA SILVA, M. A. A. . Characteristic folding time evaluated by Nonextensive Statistical Mechanics. In: XXXIV Encontro Nacional de Fìsica da Matéria Condensada, 2011, Foz do Iguaçu, PR. Resumos, 2011. v. 1. p. ID 2038-1/P060-D 2038-1/P060.

6.
COSTA, F.H.S. ; DA SILVA, M. A. A. . Computational and Mathematical Modeling of In Vitro Tumor Growth. In: XXXIV Encontro Nacional de Fìsica da Matéria Condensada, 2011, Foz do Iguaçu, PR. Resumos, 2011. v. 1. p. ID:515-1/P346-ID:515-1/P346.

7.
COSTA, F.H.S. ; DA SILVA, M. A. A. . Building a Mathematical Model to Evaluate the Dynamical Features of HeLa Cell Lineage. In: XXXIV Encontro Nacional de Fìsica da Matéria Condensada, 2011, Foz do Iguaçu, PR. Resumos, 2011. v. 1. p. ID:833-1/P348-ID:833-1/P348.

8.
DAL MOLIN, João Paulo ; DA SILVA, MARCO ANTONIO ALVES ; CALIRI, Antonio . The role nonextensive statistical mechanics on the search stage of the protein native state. In: 8th International Congress of Pharmaceutical Sciences, 2011, Ribeirão Preto, SP. Oficial Program, 2011. p. PB-010-PB-010.

9.
RIBEIRO, G.G. ; COSTA, F.H.S. ; OLIVEIRA, R.J.S. ; DA SILVA, M. A. A. ; REIS, R.M. . Potencial role of Computational Modeling in pharmacological studies of tumor cell line behavior. In: 8th International Congress of Pharmaceutical Sciences, 2011, Ribeirão Preto, SP. Oficial Program, 2011. p. PP-022-PP-022.

10.
COSTA, F.H.S. ; DA SILVA, M. A. A. . Analysis of tumor growth using Epidemic Models. In: XXXIII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 2010, Águas de Lindóia, SP. Livro de resumos - CD, 2010. v. 1. p. Poster 120-Poster 120.

11.
DAL MOLIN, João Paulo ; DA SILVA, M. A. A. ; CALIRI, Antonio . The characteristic folding time determined by the topology of the native structure of globular proteins. In: XXXII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 2009, Águas de Lindóia, SP. Resumos, 2009. v. 1. p. 123-124.

12.
FERREIRA, Arlan da Silva ; CRESSONI, José Carlos ; VISWANATHAN, Gandhi Mohan ; DA SILVA, M. A. A. . Non-Markovian randon Walk with loss of memory. In: XXXII Encontro Nacional de Fìsica da Matéria Condensada, 2009, Águas de Lindóia, SP. Resumos, 2009. v. 1. p. 419-419.

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ARAUJO, A.S. ; DA SILVA, M. A. A. . Investigations of the globular proteins folding process by molecular dynamic simulations using a simple solvation model and non-periodic boundary conditions. In: 7th International Congress of Pharmaceutical Sciences, 2009, Ribeirão Preto, SP. Program and Abstracts, 2009. v. 1. p. res. FQ013-res. FQ013.

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MACIEL, Naira Rezende ; DA SILVA, M. A. A. ; FERREIRA, Arlan da Silva ; CRESSONI, José Carlos . Tempo de incubação de doenças priônicas: simulações com modelos simplificados para vCJD. In: XXXI Encontro Nacional de Fìsica da Matéria Condensada, 2008, Águas de Lindóia, SP. Programa / CD-ROM, 2008. p. ID: 442-1-ID: 442-1.

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MACIEL, Naira Rezende ; FERREIRA, Arlan da Silva ; CRESSONI, José Carlos ; DA SILVA, M. A. A. . Studies of the incubation times of prionic diseases by dynamical Monte Carlo Method. In: III SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE PÓS-GRADUAÇÃO E PESQUISA -SINPOSPq, 2008, Ribeirão Preto, SP. Resumos do Simpósio - CD Rom, 2008. v. 1. p. res. FQ10-res. FQ10.

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DAL MOLIN, João Paulo ; DA SILVA, M. A. A. ; SILVA, Inês Regina ; CALIRI, Antonio . Nonextensive statistical mechanics applied to protein folding problem: kinetics aspects. In: 7th International Conference on Statistical Mechanics- Foundations and Applications, 2008, Maringá, PR. Abstracts, 2008. p. 51-51.

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FERREIRA, Arlan da Silva ; CRESSONI, José Carlos ; VISWANATHAN, Ghandi Mohan ; da Silva, M. A. . Processos não-Markovianos com perda de memória. In: XXVI Encontro de Físicos do Norte e Nordeste, 2008, Recife, PE. Resumos, 2008. p. 109-109.

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19.
SANTARINE, G. ; STEIN-BARANA, Alzira C M ; DA SILVA, M. A. A. . Signal to noise ratio enhancement detection in liquids flash spectroscopy experiments via sample's container geometric analysis. In: XXX Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 2007, São Lourenço, MG. CD Room, 2007. p. 538-1-538-1.

20.
MACIEL, Naira Rezende ; FERREIRA, Arlan da Silva ; CRESSONI, José Carlos ; DA SILVA, M. A. A. . The importance of the autocatalytic term to the incubation time of prionic diseases. In: 6º International Congress of Pharmaceutical Congress, 2007, Ribeirão Preto, SP. CD-ROM, 2007. v. 1. p. Res. FQ 024-Res. FQ 024.

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DA SILVA, M. A. A.; CRESSONI, José Carlos ; VISWANATHAN, Gandhi Mohan . Passeio aleatório não-Markoviano em rede unidimensional. In: XXVIII ENCONTRO NACIONAL DE FÍSICA DA MATÉRIA CONDENSADA, 2005, Santos, SP. Resumos, 2005. p. 425-426.

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ELLER, Lessandra ; CHAHINE, Jorge ; DA SILVA, M. A. A. . Análise de scaling e enovelamento para grandes polímeros em rede. In: XXVII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 2004, Poços de Caldas, MG. Resumos, 2004. v. 1. p. 168-168.

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TARRAGÓ, Maria Eulália Pinto ; ROCHA, Luiz Faustino Oliveira ; DA SILVA, M. A. A. ; CALIRI, Antonio . O papel das forças hidrofóbicas e das especificidades estéricas no processo de folding de proteínas. In: XXVI Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 2003, Caxambú, MG. Resumos, 2003. v. 1. p. 114-114.

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AIELLO, Osvaldo Eduardo ; DA SILVA, M. A. A. . Revisitando R1 para modelos epidêmicos. In: XXVI Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 2003, Caxambú, MG. Resumos, 2003. v. 1. p. 159-159.

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AIELLO, Osvaldo Eduardo ; CALIRI, Antonio ; DA SILVA, M. A. A. ; CRESSONI, José Carlos . Monte Carlo Dinâmico nas Ciências Exatas e Naturais: apenas um aferramenta para resolver equações integro-diferenciais?. In: XXVI Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 2003, Caxambu, MG. Resumos, 2003. v. 1. p. 114-114.

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Faria Jr.,M.F. ; REIS, L. M. ; DA SILVA, M. A. A. . Cadeias Com Auto-Interação Randômica. In: XV ENCONTRO DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA, 1992, Caxambú-MG. Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. São Paulo: Sociedade Brasileira de Física, 1992. v. 15. p. 53.

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BORIN, I. A. ; DEGREVE, L. ; DA SILVA, M. A. A. . Difusão Em Sistemas Bidimensionais. In: XV ENCONTRO DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA, 1992, Caxambú-MG. Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. São Paulo: Sociedade Brasileira de Física, 1992. v. 15. p. 148.

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DA SILVA, M. A. A.; CALIRI, A. ; SANTOS, C. B. ; Faria Jr.,M.F. ; AIELLO, O. E. ; REIS, L. M. . Crescimento, Vidros de Spin e suas Analogias. In: XIV ENCONTRO DA FISICA DA MATERIA CONDENSADA, 1991, Caxambú-MG. Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. São Paulo: Sociedade Brasileira de Física, 1991. v. 14. p. 128-0.

52.
Faria Jr.,M.F. ; REIS, L. M. ; DA SILVA, M. A. A. ; CALIRI, A. . Folding de Proteínas, Vidros de Spin e Modelos de Memória. In: XIV ENCONTRO DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA, 1991, Caxambú-MG. Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. São Paulo: Sociedade Brasileira de Física, 1991. v. 14. p. 52.

53.
SANTOS, C. B. ; CALIRI, A. ; DA SILVA, M. A. A. . Difusão Epidêmica e Percolação. In: XIV ENCONTRO DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA, 1991, Caxambú-MG. Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. São Paulo: Sociedade Brasileira de Física, 1991. v. 14. p. 123-0.

54.
AIELLO, O. E. ; DA SILVA, M. A. A. ; CALIRI, A. . Crescimento de Cristais de Macromoléculas Biológicas e a Transição de Rugosidade. In: XIV Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 1991, Caxambú-MG. Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. São Paulo: Sociedade Brasileira de Física, 1991. v. 14. p. 52.

55.
DA SILVA, M. A. A.; CALIRI, A. . Distribuition Of Zeros Of The +-J Long-Range Model In The Complex Temperature Plane. In: XIII ENCONTRO DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA, 1990, Caxambú-MG. Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. São Paulo: Sociedade Brasileira de Física, 1990. v. 13. p. 78.

56.
CALIRI, A. ; DA SILVA, M. A. A. ; MOKROSS, B. J. . Simulação Monte Carlo no Ensemble Pseudo-Gran-Canônico. In: XII ENCONTRO DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA, 1989, Caxambú-MG. Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. São Paulo: Sociedade Brasileira de Física, 1989. v. 12. p. 85.

57.
DA SILVA, M. A. A.; CALIRI, A. ; MOKROSS, B. J. . Investigação do Potencial Químico e da Transição de Fase Líquido- Sólido de Sistemas Bidimensionais de Esferas Duras. In: XII ENCONTRO DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA, SBF, 1989, Caxambú-MG. Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. São Paulo: Sociedade Brasileira de Física, 1989. v. 12. p. 57.

58.
SANTARINE, G. ; DA SILVA, M. A. A. . Desenvolvimento de Dispositivo Fotoacústico Para Determinação do Calor específico de Sólidos. In: XII ENCONTRO DE FISICA DA MATERIA CONDENSADA, 1989, Caxambú-MG. Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. São Paulo: Sociedade Brasileira de Física, 1989. v. 12. p. 116.

59.
MURER, R. D. ; DA SILVA, M. A. A. . Computação Gráfica - Desenvolvimento de Superfície Tridimensional Sólida. In: VIII CONGRESSO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E TECNOLÓGICA EM ENGENHARIA, 1989, São Carlos. Congresso de Iniciação Científica e Tecnológica em Engenharia, 1989. v. 8. p. 313.


Produção técnica
Assessoria e consultoria
1.
DA SILVA, M. A. A.. Assessor ad-hoc - Comissão de Pesquisa da FCFRP/USP. 2008.

2.
DA SILVA, M. A. A.. Assessor ad-hoc - Comissão de Pesquisa da FCFRP/USP. 2007.

Trabalhos técnicos
1.
DA SILVA, M. A. A.. Comissão Assessora e Coordenadora de Estágios do Dep. de Física e Química da FCFRP/USP. 2008.

2.
DA SILVA, M. A. A.. Comissão Assessora e Coordenadora de Estágios do Dep. de Física e Química da FCFRP/USP. 2007.

3.
DA SILVA, M. A. A.. Comissão Assessora e Coordenadora de Estágios do Dep. de Física e Química da FCFRP/USP. 2006.

4.
DA SILVA, M. A. A.. Comissão Assessora e Coordenadora de Estágios do Dep. de Física e Química da FCFRP/USP. 2005.

5.
DA SILVA, M. A. A.. Comissão Assessora e Coordenadora de Estágios do Dep. de Física e Química da FCFRP/USP. 2004.

6.
DA SILVA, M. A. A.. Comissão Assessora e Coordenadora de Estágios do Dep. de Física e Química da FCFRP/USP. 2003.

7.
DA SILVA, M. A. A.. Comissão Assessora e Coordenadora de Estágios do Dep. de Física e Química da FCFRP/USP. 2002.


Demais tipos de produção técnica
1.
CALIRI, Antonio ; DA SILVA, M. A. A. . Apostilas de Laboratório de Física. 1994. (Desenvolvimento de material didático ou instrucional - Apostilas).



Bancas



Participação em bancas de trabalhos de conclusão
Mestrado
1.
Silva, M. A. A.. Participação em banca de Cristiano Roberto Fabri Granzotti. Caminhadas com Memória em Meios Regulares e Desordenados: Aspectos Estáticos e Dinâmicos. 2015. Dissertação (Mestrado em Ciências - Física Aplicada à Medicina e a Biologia) - Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto.

2.
Alves da Silva, Marco Antonio; MARTINEZ, Alexandre Souto; MOMBACH, José Carlos Merino. Participação em banca de Flávio Henrique Sant?Ana Costa. Modelagem e simulação computacional do crescimento de tumores "in vitro". 2012. Dissertação (Mestrado em Ciências Farmacêuticas) - Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto-USP.

3.
SILVA, Fernando Luís Barroso da; DELBEM, A.C.B.; VENCIO, R.Z.N.; DASILVA, M. A. A.. Participação em banca de Tulio Marcus Ribeiro Calixto. Análises de propriedades eletrostáticas e estruturais de complexos de proteínas para o desenvolvimento de preditores de complexação em larga escala. 2010. Dissertação (Mestrado em Ciências Farmacêuticas Área Física Biológica) - Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Riebirão Preto.

4.
MARTINEZ, Alexandre Souto; KRAENKEL, R.A.; DA SILVA, MARCO ANTONIO ALVES. Participação em banca de Juliana Militão da SIlva Berbert. Transição entre os comportamentos estendido e localizado em caminhadas estocásticas parcialmente auto-repulsivas em sistemas desordenados unidimensionais. 2009. Dissertação (Mestrado em Ciências - Física Aplicada à Medicina e a Biologia) - Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto.

5.
CALIRI, Antonio; DA SILVA, M. A. A.; MARTINEZ, Alexandre Souto. Participação em banca de Ricardo Oliveira dos Santos Soares. Predição de estruturas terciárias de neurotoxinas contendo pontes dissulfeto. 2008. Dissertação (Mestrado em Ciências Farmacêuticas) - Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto-USP.

6.
DA SILVA, M. A. A.. Participação em banca de Vanessa A. Martins. Predição de segmentos da interface do complexo Trail-DR5 baseado em primeiros princípios. 2008. Dissertação (Mestrado em Engenharia Biomédica) - Universidade do Vale do Paraíba.

7.
DA SILVA, M. A. A.; CALIRI, Antonio; MARTINEZ, Alexandre Souto. Participação em banca de Naira Rezende Maciel. Estudos dos tempos de incubação de doenças priônicas utilizando o método Monte Carlo Dinâmico. 2008. Dissertação (Mestrado em Ciências Farmacêuticas) - Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto-USP.

8.
S, CHTP (Carlos Henrique Tomich de Paula da Silva); Carvalho, Ivone; COSTA, Fernando Batista; DA SILVA, M. A. A.. Participação em banca de Vinicius Barreto da Silva. Estudos de modelagem molecular e relação estrutura atividade da oncoproteína hnRNPL e ligantes (QUALIFICAÇÃO DE MESTRADO). 2007. Dissertação (Mestrado em Ciências Farmacêuticas) - Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto-USP.

9.
DASILVA, M. A. A.; CALIRI, Antonio; Alves, Domingos. Participação em banca de Naira Rezende Maciel. Estudos do tempo de incubação de doenças priônicas utilizando o método Monte Carlo Dinâmico (QUALIFICAÇÃO DE MESTRADO). 2007. Dissertação (Mestrado em Ciências Farmacêuticas) - Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto-USP.

10.
CHAHINE, Jorge; DA SILVA, M. A. A.; LEITE, Vitor Barbanti Pereira; CALIRI, Antonio; RUGGIERO, José Roberto. Participação em banca de André Luiz Martins. Predição de Estrutura de Proteínas utilizando o algoritmo da rede elástica. 2005. Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas da Unesp.

11.
DA SILVA, M. A. A.. Participação em banca de Arlan da Silva Ferreira. Modelagem Analítico-Estocástica de Doenças Priônicas. 2005. Dissertação (Mestrado em Física) - Universidade Federal de Alagoas.

12.
DA SILVA, M. A. A.. Participação em banca de Lessandra Eller. O uso do Método de crescimento de cadeias no estudo do enovelamento de modelos de proteínas. 2003. Dissertação (Mestrado em Física) - Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas da Unesp.

13.
DA SILVA, M. A. A.. Participação em banca de Eliamar Francelino do Prado. Regras locais e globais na difusão epidêmica. 1999. Dissertação (Mestrado em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Universidade de São Paulo.

14.
DA SILVA, M. A. A.. Participação em banca de Osvaldo Eduardo Aiello. Método Monte Carlo Dinâmico e suas aplicações. 1993. Dissertação (Mestrado em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Universidade de São Paulo.

15.
DA SILVA, M. A. A.. Participação em banca de Milton Faria Junior. Simulação Monte Carlo de um Mecanismo para o enovelamento de proteínas: estudos de influências de distribuições de interações randômicas. 1993. Dissertação (Mestrado em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Universidade de São Paulo.

16.
DA SILVA, M. A. A.. Participação em banca de Maria do Socorro Nogueira. Interações de fótons de baixas energias com o esmalte humano e o númeo atômico efetivo. 1991. Dissertação (Mestrado em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Universidade de São Paulo.

17.
DA SILVA, M. A. A.. Participação em banca de Maria Nazaré Bandeira dos Santos. Projeto e contrução de um sistema mecânico para registro de força isométrica dos músculos flexores e extensores do ante braço humano. 1991. Dissertação (Mestrado em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Universidade de São Paulo.

18.
DA SILVA, M. A. A.. Participação em banca de Paulo Sérgio Pilz Augusto. Análise de alguns aspectos mecânicos do ciclo cardíaco. 1990. Dissertação (Mestrado em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Universidade de São Paulo.

19.
DA SILVA, M. A. A.. Participação em banca de Cláudia Benedita dos Santos. Difusão epidêmica e percolação. 1990. Dissertação (Mestrado em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Universidade de São Paulo.

Teses de doutorado
1.
da Silva, M. A.A.. Participação em banca de Aline Amabile Viol Barbosa. Entropia de Shannon e Propriedades Topológicas de Redes Funcionais do Cérebro Humano sob Efeito de Ayahuasca. 2015. Tese (Doutorado em Física) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

2.
da Silva, M. A.A.. Participação em banca de Franciele Polotto. Equação de Fokker-Planck e Enovelamento de Proteinas. 2015. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

3.
S, CHTP (Carlos Henrique Tomich de Paula da Silva); DA SILVA, M A A; LOURENCO, R. V.; ALMEIDA, W. P.; MONTANARI, C. A.. Participação em banca de Ricardo Pereira Rodrigues. Caseína quinase 1 cmo alvo para o planejamento de fármacos em mal de Alzheimer. 2014. Tese (Doutorado em Ciências Farmacêuticas - Química e Física Biológic) - Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto-USP.

4.
NEVES, U. P. C.; DA SILVA, M A A; MARTINEZ, Alexandre Souto; ONODY, R.N.; RIBEIRO, E. M. S.. Participação em banca de Mairon Marques dos Santos. Probabilidade de controle tumoral: modelos e estatísticas. 2014. Tese (Doutorado em Física Aplicada à Medicina e a Biologia) - Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto.

5.
Silva, M. A. A.. Participação em banca de Gladstone de Alencar Alves. O Paradoxo da superdifusão de uma caminhada aleatória com memória exponencial. 2014. Tese (Doutorado em Física) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

6.
KRAENKEL, R.A.; COUTINHO, S.G.; Silva, M. A. A.; RODRIGUES NETO, C.; AMAKU, M.. Participação em banca de Juliana Militão da Silva Berbet. Mecanismos de movimentação animal embasados na memória espacial. 2013. Tese (Doutorado em Física) - Instituto de Física Teórica/UNESP-SP.

7.
CHAHINE, Jorge; CARVALHO, S.J.; FOSSEY, M.A.; OLIVEIRA, L.C.; OLIVEIRA, R.J.; da Silva, M. A.A.. Participação em banca de André Luiz Martins. Uso de modelos de rede no estudo de enovelamento de proteínas. 2012. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas da Unesp.

8.
MARTINEZ, Alexandre Souto; SILVA FILHO, A. C. R.; DA SILVA, M. A. A.; ONODY, R.N.; DA SILVA, R.. Participação em banca de Wilnice Tavares Reis Oliveira. Novos resultados nas caminhadas deterministas parcialmente autorepulsivas em meios aleatórios obtidos com o gerenciamento numérico da memória dos caminhantes. 2010. Tese (Doutorado em Física Aplicada à Medicina e a Biologia) - Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto.

9.
Alves da Silva, Marco Antonio; CALIRI, Antonio; ARAUJO, A.S.; CARVALHO, S.J.; RUGGIERO NETO, J.. Participação em banca de Lessandra Eller. Simulação do enovelamento de modelo de proteínas desnaturadas utilizando o método de crescimento de cadeias em rede tetraédrica. 2010. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas da Unesp.

10.
CRESSONI, José Carlos; DA SILVA, M. A. A.. Participação em banca de Arlan da Silva Ferreira. Expoente de Hurst e Diagrama de Fase para Persisitência Induzida Amnesticamente em Processos não-Markovianos. 2009. Tese (Doutorado em Ciências) - Instituto de Fìsica - UFAL.

11.
SILVA, Fernando Luís Barroso da; PASCUTTI, Pedro Geraldo; DA SILVA, M. A. A.; RUGGIERO, José Roberto; TIERA, Márcio José. Participação em banca de Sidney Jurado de Carvaho. Estudo dos aspectos eletrostáticos da interação entre polieletrolitos e macroíons. 2008. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas da Unesp.

12.
MARTINEZ, Alexandre Souto; Mitrowsky, Rafael Andres Rosales; DA SILVA, M. A. A.; Mendes, Tereza Cristina da Rocha; Rosa, Reinaldo Roberto. Participação em banca de César Augusto Sangaletti Terçariol. Caminhadas deterministas parcialmente auto-repulsivas:resultados analíticos para o efeito da memória do turista na exploração de meios desordenados. 2008. Tese (Doutorado em Física Aplicada à Medicina e a Biologia) - Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto.

13.
MOKROSS,B.J.; CALIRI, Antonio; MEYER, Erich; POUSSEP, Iouri; DA SILVA, M. A. A.. Participação em banca de Norberto Helil Pasqua. Teoria entrópica da nucleação e função entropia aplicadas à condensação do vapor de água. 2007. Tese (Doutorado em Ciências - Física Básica) - Instituto de Física de São Carlos-USP.

14.
MOKROSS,B.J.; MAREGA JUNIOR, Euclydes; GOMES, G . A .; HAI, G.Q.; DA SILVA, M. A. A.. Participação em banca de Weber da Silva Robazzi. Emprego de modelos de campo médio para descrição termodinâmica de monocamadas de Langmuir. 2007. Tese (Doutorado em Ciências - Física Básica) - Instituto de Física de São Carlos-USP.

15.
CALIRI, Antonio; CHAHINE, Jorge; COLOMBO, Márcio Francisco; ARAUJO, Antonio Francisco Pereira de; DA SILVA, M. A. A.. Participação em banca de Luiz Faustino Oliveira rocha. Mecanismo de folding de macromoléculas: estudo sobre o papel das especificidades topológicas e químicas das interações. 2005. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas da Unesp.

16.
CALIRI, Antonio; DA SILVA, M. A. A.. Participação em banca de Inês Regina Silva. Enovelamento protéico: fatores topológicos. 2005. Tese (Doutorado em Física Aplicada à Medicina e a Biologia) - Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto.

17.
DA SILVA, M. A. A.. Participação em banca de Alexandre César Dourado Neves. Efeitos de osmólitos e solvatação na termodinâmica do enovelamento de modelos de proteínas na rede e sua correlação com experimentos. 2003. Tese (Doutorado em Física) - Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas da Unesp.

18.
DA SILVA, M. A. A.. Participação em banca de Roosevelt Alves da Silva. Folding de proteínas: o papel das interações hidrofóbicas e estéricas. 2003. Tese (Doutorado em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Universidade de São Paulo.

19.
CHAHINE, Jorge; GARRET, Richard Charles; PASCUTTI, Pedro Geraldo; SILVA, Luis Fernando Barroso da; LEITE, Vitor Barbanti Pereira; DA SILVA, M. A. A.. Participação em banca de Luis Paulo Barbour Scott. Investigação da utilização de algorítmos genéticos e redes neurais artificiais na predição de estruturas protéicas. 2003. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

20.
DA SILVA, M. A. A.. Participação em banca de Fátima Maria Helena Simões Pereira da Silva. Aplicação de dinâmica não-linear no estudo da resposta dos intervalos R-R do eletrocardiograma durante o exercício físico dinâmico em indivíduos sadios. 2001. Tese (Doutorado em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Universidade de São Paulo.

21.
DA SILVA, M. A. A.. Participação em banca de Osvaldo Eduardo Aiello. O método Monte Carlo Dinâmico: uma nova abordagem. 2000. Tese (Doutorado em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Universidade de São Paulo.

22.
DA SILVA, M. A. A.. Participação em banca de Silvana Giuliatti. Sistema de Controle com retroalimentação aplicado no estudo da complacência arterial. 2000. Tese (Doutorado em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Universidade de São Paulo.

23.
DA SILVA, M. A. A.. Participação em banca de Vanderlei José Haas. Origem e difusão das doenças. 1999. Tese (Doutorado em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Universidade de São Paulo.

Qualificações de Doutorado
1.
CALIRI, Antonio; da Silva, M. A.; ALVES, N.A.. Participação em banca de Sandro Martinelli Reia. Caracterização de modelo sócio-cultural. 2013. Exame de qualificação (Doutorando em Física Aplicada à Medicina e a Biologia) - Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto.

2.
da Silva, M. A.; Kinouchi Filho, Osame; NEVES, U. P. C.. Participação em banca de Rafael Arantes. Comportamento do rato no labirinto em cruz elevado: modelagem e estudo por cadeias de Markov. 2013. Exame de qualificação (Doutorando em Física Aplicada à Medicina e a Biologia) - Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto.

3.
SILVA FILHO, A. C. R.; SANTOS, Jair Licio Ferreira; DA SILVA, M. A. A.. Participação em banca de Brenno Caetano Troca Cabella. Modelos universais de dinâmica de populações e epidemiologia. 2010. Exame de qualificação (Doutorando em Física Aplicada à Medicina e a Biologia) - Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto.

4.
RUIZ, E.E.S.; GIULIATTI, Silvana; DA SILVA, MARCO ANTONIO ALVES. Participação em banca de Luiz Carlos Büttner Mostaço-Guidolin. Identificação de domínios em proteínas com redes complexas. 2009. Exame de qualificação (Doutorando em Física Aplicada à Medicina e a Biologia) - Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto.

5.
DEGREVE, L.; Ciancaglini, Pietro; CALIRI, Antonio; Oliveira, Arthur Henrique Cavalcanti; DA SILVA, M. A. A.. Participação em banca de Carlos Alessandro Fuzo. Estudos, por simulação molecular, de sistemas peptídeos/bicamadas liídias: aplicação à relação estrutura/atividade antibacteriana da indolicidina e de análogos. 2008. Exame de qualificação (Doutorando em Química) - Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto.

6.
DA SILVA, M. A. A.; Kinouchi Filho, Osame; Mitrowsky, Rafael Andres Rosales. Participação em banca de Rodrigo Silva González. Caminhadas deterministas e estocásticas em meios desordenados. 2008. Exame de qualificação (Doutorando em Física Aplicada à Medicina e a Biologia) - Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto.

7.
DA SILVA, M. A. A.. Participação em banca de Roosevelt Alves da Silva. Origem da força nativa que governa o enovelamento de proteínas. 2001. Exame de qualificação (Doutorando em Física Aplicada à Medicina e a Biologia) - Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto.

Qualificações de Mestrado
1.
TINÓS, R.; Silva, M. A. A.. Participação em banca de Helder Ken Shimo. Auto-Organização da População em Sistemas Imunológicos Artificiais aplicados ao docking de proteínas. 2011. Exame de qualificação (Mestrando em Bioinformática) - Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto.

Trabalhos de conclusão de curso de graduação
1.
DA SILVA, MARCO ANTONIO ALVES. Participação em banca de Flávio Henrique Sant'Ana Costa.Estudo do crescimento de tumores pelo Método de Monte Carlo Dinâmico. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Licenciatura - Fìsica) - Centro Universitário da Fundação Educacional de Barretos.

2.
Alves, Domingos; DA SILVA, M. A. A.; MURTA JUNIOR, Luiz Otávio. Participação em banca de Yuri Saito.Desenvolvimento de um autômato celular para estudar o espalhamento e a evolução da pneumonia por Pneumococos em uma população. 2008. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Informática Biomédica) - Fac.Medicina e Fac. de Fisolofia, Ciências e Letras de RIbeirão Preto.

Outros tipos
1.
DA SILVA, M. A. A.. Participação em banca de Fernanda Marur Mazzé. Determinação de uma escala de anfipatia por simulação molecular. 2003. Outra participação, Universidade de São Paulo.

2.
DA SILVA, M. A. A.. Participação em banca de Maria do Socorro Nogueira. Interações de fótons de baixas energias com o esmalte humano e o número atômico efetivo. 1990. Outra participação, Universidade de São Paulo.



Participação em bancas de comissões julgadoras
Concurso público
1.
LIBARDI, A.K.M.; KONING, M.; Silva, M. A. A.. Concurso Público de Provas e Títulos para preenchimento de um cargo efetivo de Prof.Assistente Doutor em RDIDP no conjunto de disciplinas- Laboratório de Física I e II e Laboratório Avançado de Fisica I e II do Departamento de Física. 2012. Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas da Unesp.

2.
LAKS, Bernardo; DRIGO FILHO, Elso; REYNOSO, Vitor Ciro Solano; DA SILVA, M. A. A.. Banca Examinadora do Processo Seletivo para contratação de Professor Assistente, em RDIDP, junto ao Departamento: Física e Química da Faculdade de Engenharia de Ilha Solteira/UNESP. 2006. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

3.
LOPES, João Luís Callegari; DA SILVA, M. A. A.; ITO, Armando; BAFFA FILHO, Oswaldo; POLIKARPOV, Igor. Comissão Julgadora do Concurso para provimento de um cargo de Professor Doutor junto ao Departamento de Física e Quimica da FCFRP-USP. 2006. Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Riebirão Preto.

4.
DRIGO FILHO, Elso; CALIRI, Antonio; FREITAS, Luiz Carlos Gomide; RUGGIERO, José Roberto; DA SILVA, M. A. A.. Concurso Público de Provas e Títulos para preenchimento de uma vaga de Prof. Assistente, RDIDP, junto ao Departamento de Física -UNESP/São José do Rio Preto. 2004. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

5.
DA SILVA, M. A. A.. Concurso para Provimento de cargo de Professor Doutor em RTC para o Dep. de Física e Química da FCFRP-USP. 2003. Universidade de São Paulo.

6.
DA SILVA, M. A. A.. Concurso de Provimento de Cargo de Professor Doutor da FCFRP/USP. 2001. Universidade de São Paulo.

7.
DA SILVA, M. A. A.. Processo Seletivo para Contratação de um Docente MS-3 na área de Físco-Química do Departamneto de Química da FFCLRP-USP. 1995. Universidade de São Paulo.

8.
DA SILVA, M. A. A.. Concurso para Provimento de Cargo de Prof. Assistente no Dep. de Física, na disciplçina de Física Experimental/UNESP-Rio Claro. 1993. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

9.
DA SILVA, M. A. A.. Concurso de provimento de cargo de Professor Assistente no Dep. de Física, na disciplina de Laboratório de Estrutura da Matéria, UNESP-Rio Claro. 1990. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

10.
DA SILVA, M. A. A.. Concurso para Provimento de Cargo de Prof. Assistente no Dep. de Ciências, disciplina de Física UNESP-Ilha Solteira. 1989. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Livre docência
1.
da Silva, M. A.A.. Noções de Planejamento de Fármacos. 2016. Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Riebirão Preto.

2.
CALIRI, Antonio; UYEMURA, S.A.; BAFFA FILHO, Oswaldo; BERTOLINI, M.C.; BISCH, P.M.; da Silva, M. A.A.. Comissão Julgadora do Concurso de Livre-Docência com base no conjunto de disciplinas de Cálculo, Física, Física II e Bioquímica I do Departamento de Física e Química da Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto-USP. 2013. Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto-USP.

3.
LIMA, Regina Aparecida Garcia; COSTA-JÚNIOR, Moacyr Lobo; SANTOS, Jair Licio Ferreira; VIANNA, Lucila Amaral Carneiro; DA SILVA, M. A. A.. Concurso para obtenção do título de Livre Docente junto ao Departamento de Enfermagem Materno-Infantil e Saúde Pública da EERP/USP. 2008. Escola de Enfermagem de Ribeirão Preto-USP.

4.
DA SILVA, M. A. A.. Concurso para obtenção do título de Livre Docente junto ao Departamento de Física e Química da Faculdade de Engenharia de Ilha Solteira-UNESP. 2001. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Outras participações
1.
ARANTES, Eliane Candiani; SILVA, Fernando Luís Barroso da; DA SILVA, M. A. A.; SEGATO, Maria Aparecida de Almeida Consuli. Banca Examinadora do Processo Seletivo para uma vaga na função de Especialista em Laboratório (PROCONTES) no Dep. de Física e Química. 2005. Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Riebirão Preto.

2.
DA SILVA, M. A. A.. Banca Examinadora para Mudança de Categoria Docente, Auxiliar de Ensino para Assistente do Dep. de Física da UNESP/Bauru. 1988. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

3.
DA SILVA, M. A. A.. Banca Examinadora para Mudança de Categoria Docente, Auxiliar de Ensino para Assistente do Dep. de Física da UNESP/Bauru. 1988. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.



Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
XXXVI Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. 2013. (Congresso).

2.
XXXVI Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. Dynamical Monte Carlo approach to tumor growth: the role of the waiting times. 2013. (Congresso).

3.
XXXVI Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. Coordenador da sessão Stochastic Methods, Games and Population Problems in Statistical Mechanics. 2013. (Congresso).

4.
XXXV Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. 2012. (Encontro).

5.
XXXIV Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. 2011. (Encontro).

6.
XXXIII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. Analysis of tumor growth using Epidemic Models. 2010. (Congresso).

7.
XXXII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. Poster. 2009. (Congresso).

8.
XXXI Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. Tempo de incubação de doneças priônicas: simulações com modelos simplificados para vCJD. 2008. (Congresso).

9.
10a. Semana Temática da Biologia - do Instituto de Biociências da USP.Palestra: Termodinâmica e a Vida. 2007. (Outra).

10.
6º International Congress of Pharmaceutical Congress. Estrutura e organização em sistemas biológicos: de proteínas a populações. 2007. (Congresso).

11.
6º International Congress of Pharmaceutical Congress. Membro do Comitê que ofereceu o Prêmio de Melhor Poster Apresentado. 2007. (Congresso).

12.
6º International Congress of Pharmaceutical Congress. 2007. (Congresso).

13.
XXX Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. Loss of memory in non-Markovian random walks: amnestically induced persistence. 2007. (Congresso).

14.
XXX Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. 2007. (Congresso).

15.
XXIX Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. XXIX Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. 2006. (Congresso).

16.
Fundação Educacional de Barretos.Palestra proferida: Prions. 2005. (Simpósio).

17.
Visita ao Centro de Ciências Exatas e Naturais da Universidade Federal de Alagoas - Laboratório do Prof. Dr. José Carlos Cressoni, para discussão de trabalhos relacionados ao Projeto Milênio/PRONEX do qual fazem parte..Visita ao Centro de Ciências Exatas e Naturais da Universidade Federal de Alagoas - Laboratório do Prof. Dr. José Carlos Cressoni, para discussão de trabalhos relacionados ao Projeto Milênio/PRONEX do qual fazem parte.. 2005. (Outra).

18.
XXVIII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. XXVIII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. 2005. (Congresso).

19.
Programa de Seminários em Biologia Computacional. 2004. (Seminário).

20.
Programa de Seminários em Biologia Computacional. 2004. (Seminário).

21.
Programa de Seminários em Biologia Computacional. 2004. (Seminário).

22.
Programa de Seminários em Biologia Computacional. 2004. (Seminário).

23.
Tutorial WebCT. 2004. (Outra).

24.
XXVII Encontro Nacional de Fìsica da Matéria Condensada.XXVII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. 2004. (Encontro).

25.
A Inovação no Processo de Desenvolvimento de Vacinas. 2003. (Seminário).

26.
Efeito de mutações pontuais na termodinâmica e cinética de enovelamento em um modelo protéico hidrofóbico. 2003. (Seminário).

27.
Programa de Seminários em Biologia Computacional.Simulação do enovelamento de modelos proteícos com uma função de energia hidrofóbica. 2003. (Seminário).

28.
Programa de Seminários em Biologia Computacional. 2003. (Seminário).

29.
Programa de Seminários em Biologia Computacional.Enovelamento de proteínas - técnicas de simulação. 2003. (Seminário).

30.
XXVI Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. XXVI Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. 2003. (Congresso).

31.
Recognition at macromolecular interfaces: protein Dossier and Protein Fingerprints produce Surface Signatures, a simple and powerful technique for coding and comparing compound and receptor shape information (Dr. Goran Neshich do Centro de BioInformati. 2002. (Seminário).

32.
Simulação Monte Carlo de macromoléculas biológicas (I Workshop em Modelagem Molecular.Simulação Monte Carlo de macromoléculas biológicas (I Workshop em Modelagem Molecular. 2002. (Outra).

33.
XXV Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. XXV Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. 2002. (Congresso).

34.
3rd Congress of Pharmaceutical Sciences. Folding Analyses by Monte Carlo Method. 2001. (Congresso).

35.
O Método Monte Carlo: do Equilíbrio ao não Equilíbrio.O Método Monte Carlo: do Equilíbrio ao não Equilíbrio. 2001. (Seminário).

36.
Monte Carlo Dinâmico.Monte Carlo Dinâmico. 2000. (Seminário).

37.
XXIII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. XXIII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. 2000. (Congresso).

38.
1999 Workshop: Monte Carlo and Structure Optimization Methods for Biology, Chemistry and Physics.1999 Workshop: Monte Carlo and Structure Optimization Methods for Biology, Chemistry and Physics. 1999. (Outra).

39.
Centenial Meeting of the American Physical Society. Centenial Meeting of the American Physical Society. 1999. (Congresso).

40.
XX Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. XX Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. 1997. (Congresso).

41.
XIX Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. XIX Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. 1996. (Congresso).

42.
Fractais.Fractais. 1995. (Outra).

43.
XVIII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. XVIII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. 1995. (Congresso).

44.
XVI Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. XVI Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. 1993. (Congresso).

45.
XV Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. XV Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. 1992. (Congresso).

46.
VI Simpósio Brasileiro de Química Teórica.VI Simpósio Brasileiro de Química Teórica. 1991. (Simpósio).

47.
XIV Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. XIV Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. 1991. (Congresso).

48.
Crescimento de Cristais e a Mecânica Quântica.Crescimento de Cristais e a Mecânica Quântica. 1989. (Seminário).

49.
XII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. XII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. 1989. (Congresso).

50.
Energia Nuclear no Brasil.Energia Nuclear no Brasil. 1988. (Outra).

51.
Latin-American Conference on High Temperature Superconductivity and Brazilian School on Superconductivity Jorge Andre Swieca. Latin-American Conference on High Temperature Superconductivity and Brazilian School on Superconductivity Jorge Andre Swieca. 1988. (Congresso).

52.
XI Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. XI Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. 1988. (Congresso).

53.
Simulação Monte Carlo da Transição de Rugosidade do Xenônio Adsorvido em Paládio.Simulação Monte Carlo da Transição de Rugosidade do Xenônio Adsorvido em Paládio. 1987. (Seminário).

54.
X Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. X Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. 1987. (Congresso).

55.
Discos Duros: Simulação Monte Carlo e o Loop de van der Waals.Discos Duros: Simulação Monte Carlo e o Loop de van der Waals. 1986. (Seminário).

56.
IX Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada.IX Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. 1986. (Encontro).

57.
III Encontro de Trabalhos de Mecânica Estatística e Teoria de Campos.III Encontro de Trabalhos de Mecânica Estatística e Teoria de Campos. 1985. (Encontro).

58.
Modelos Teóricos em Crescimento de Cristais.Modelos Teóricos em Crescimento de Cristais. 1985. (Seminário).

59.
Segunda Escola Brasileira de Física de Semi-Condutores. Segunda Escola Brasileira de Física de Semi-Condutores. 1985. (Congresso).

60.
VII IEncontro Nacional de Física da Matéria Condensada.VIII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. 1985. (Encontro).

61.
VII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada.VII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. 1984. (Encontro).

62.
VI Brazilian Symposium on Theoretical Physics. VI Brazilian Symposium on Theoretical Physics. 1980. (Congresso).


Organização de eventos, congressos, exposições e feiras
1.
SILVA, Fernando Luís Barroso da ; CALIRI, Antonio ; DA SILVA, M. A. A. ; Nonato, M. C. . 1o. Workshop em Modelagem Molecular de Ribeirão Preto. 2002. (Outro).



Orientações



Orientações e supervisões em andamento
Dissertação de mestrado
1.
Igor Henrique Camargo Ferreira. Modelagem e Simulação Computacional de Câncer de Pele. Início: 2016. Dissertação (Mestrado em Ciências - Física Aplicada à Medicina e a Biologia) - Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto. (Orientador).

Tese de doutorado
1.
Cristiano Roberto Fabri Granzontti. Caminhadas Autorrepulsivas em Meios Regulares e Desordenados. Início: 2016. Tese (Doutorado em Física Aplicada à Medicina e a Biologia) - Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Coorientador).

Supervisão de pós-doutorado
1.
Flávio Henrique Sant'Ana Costa. Início: 2016. Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Riebirão Preto.

Iniciação científica
1.
Kleython José Coriolano Cavalcanti de Lacerda. Difusão Anômala: Caminhante com Mal de Alzheimer. Início: 2016 - Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Riebirão Preto. (Orientador).

2.
Ramon Moreno Acherman Teixeira Alves. Estudos da disseminação da dengue em Ribeirão Preto. Início: 2016. Iniciação científica (Graduando em Ciências Farmacêuticas) - Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Riebirão Preto, Universidade de São Paulo. (Orientador).


Orientações e supervisões concluídas
Dissertação de mestrado
1.
Flávio Henrique Sant´Ana Costa. Modelagem e Simulação Computacional do crescimento de tumores in vitro. 2012. Dissertação (Mestrado em Ciências Farmacêuticas Área Física Biológica) - Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto-USP, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Marco Antonio Alves da Silva.

2.
Naira Rezende Maciel. Estudos do tempo de incubação de doenças Priônicas utilizando o método Monte Carlo Dinâmico. 2008. Dissertação (Mestrado em Ciências Farmacêuticas Área Física Biológica) - Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Riebirão Preto, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Marco Antonio Alves da Silva.

3.
Osvaldo Eduardo Aielo. Metodo Monte Carlo Dinâmico e Suas Aplicações. 1993. Dissertação (Mestrado em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Marco Antonio Alves da Silva.

4.
Milton Faria Junior. Simulação Monte Carlo de Um Mecanismo Para O Enovelamento de Proteinas: Estudos de Influencias de Distribuicoes de Interacoes Randomicas. 1993. Dissertação (Mestrado em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Marco Antonio Alves da Silva.

5.
Lucila Marques dos Reis. Grafos e a Transição Unfolded-Folded em Macromoléculas Biológicas. 1990. 0 f. Dissertação (Mestrado em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Marco Antonio Alves da Silva.

Tese de doutorado
1.
Flávio Henrique Sant'Ana Costa. Sobre mecanismos mesoscópicos do crescimento de tumores. 2012. Tese (Doutorado em Física Aplicada à Medicina e a Biologia) - Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Marco Antonio Alves da Silva.

2.
Lessandra Eller. Simulação do Enovelamento de Proteínas Desnaturadas Utilizando o Método de Crescimento de Cadeias em Rede Tetraédrica. 2010. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas da Unesp, . Orientador: Marco Antonio Alves da Silva.

3.
Osvaldo Eduardo Aielo. Método Monte Carlo Dinâmico para processos Markovianos. 2000. Tese (Doutorado em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Universidade de São Paulo, . Orientador: Marco Antonio Alves da Silva.

Iniciação científica
1.
Guilherme Thomaz Pereira Brancini. Simulação computacional e modelagem de macromoléculas biológicas para estudos de seus processos de enovelamento. 2010. Iniciação Científica. (Graduando em Ciências Farmacêuticas) - Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Riebirão Preto, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Marco Antonio Alves da Silva.

Orientações de outra natureza
1.
Daniele Oliveira Pierazzo. Atividades voltadas para experimentos em crescimento de células tumorais in vitro e utilização de quimioterapia com complexos de Rutênio e Cisplatina, bem como, desenvolvimento teórico da evolução dos tumores. 2015. Orientação de outra natureza. (Física Médica) - Centro Universitário da Fundação Educacional de Barretos. Orientador: Marco Antonio Alves da Silva.

2.
Thamires Silva Pires de Araujo. Atividades voltadas para experimentos em crescimento de células tumorais in vitro e em sílico (simulação computacional). 2014. Orientação de outra natureza. (Física Médica) - Centro Universitário da Fundação Educacional de Barretos. Orientador: Marco Antonio Alves da Silva.

3.
Alexandre Suman de Araujo. Físico-Química de Macromoléculas: Simulação de Complexos Protéicos e Proteínas de Membrana. 2011. Orientação de outra natureza - Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Riebirão Preto, CAPES/PRODOC. Orientador: Marco Antonio Alves da Silva.

4.
João Paulo Dal Molin. Físico-Química de Macromoléculas: Simulação de Complexos Protéicos e Proteínas de Membrana. 2011. Orientação de outra natureza. (Ciências Farmacêuticas) - Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto-USP, CAPES/PRODOC. Orientador: Marco Antonio Alves da Silva.

5.
Joane Kathelen Rodrigues Rustiguel. PAE - Disciplina de Física. 2009. Orientação de outra natureza. (Pós-Graduação em Ciências Farmacêuticas) - Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto-USP, Universidade de São Paulo-PAE. Orientador: Marco Antonio Alves da Silva.

6.
João Paulo Dal Molin. PAE - Disciplina de Física. 2009. Orientação de outra natureza. (Pós-Graduação em Ciências Farmacêuticas) - Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto-USP, Universidade de São Paulo-PAE. Orientador: Marco Antonio Alves da Silva.

7.
Armando Godoy Andino Juinior. Monitoria junto à disciplina de Física do Deparamento de Fìsica e Química. 2008. Orientação de outra natureza. (Ciências Farmacêuticas) - Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto-USP, Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto - Discip.Física. Orientador: Marco Antonio Alves da Silva.

8.
Thiago Bueno Palopoli. Monitoria junto à Disciplina de Física do Departamento de Física e Química. 2008. Orientação de outra natureza. (Ciências Farmacêuticas) - Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto-USP, Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto - Discip.Física. Orientador: Marco Antonio Alves da Silva.

9.
Fabiana Spineti dos Santos. Monitoria junto à Disciplina de Física do Departamento de Física e Química. 2007. Orientação de outra natureza. (Ciências Farmacêuticas) - Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto-USP, Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto - Discip.Física. Orientador: Marco Antonio Alves da Silva.

10.
Simone Sakagute Tavares. Monitoria junto à Disciplina de Física do Departamento de Física e Química. 2007. Orientação de outra natureza. (Ciências Farmacêuticas) - Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto-USP, Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto - Discip.Física. Orientador: Marco Antonio Alves da Silva.

11.
Osvaldo Eduardo Aiello. Monte Carlo Dinâmico para Sistemas Epidêmicos (PÓS-DOUTORADO). 2003. 0 f. Orientação de outra natureza - Universidade de São Paulo. Orientador: Marco Antonio Alves da Silva.



Outras informações relevantes


Supervisor de Pós-Doutorando com bolsa da Fapesp (proc. n. 00/11635-7);
Projeto de Infra-estrutura da Fapesp (proc. 1996/11648-4), com vigência
de 1997 a 1998 no valor de R$ 140.000,00



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