Nelson Augusto Alves

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  • Última atualização do currículo em 03/10/2018


Nelson Augusto Alves possui graduação em Física pelo Instituto de Física da Universidade de São Paulo (IFUSP - 1980), mestrado em Física pelo Instituto de Física Teórica (IFT) e doutorado em Física pelo Instituto de Física Teórica (IFT). Com Pós-Doutorado no Department of Physics no High Energy Physics group, Florida State University (FSU - USA) e no Supercomputer Computations Research Institute (SCRI) na FSU, no período de 1988 a 1990. Recebeu bolsa de pesquisa da Fundação Alexander von Humboldt (Alemanha) para Pós-doutorado na Fakültat für Physik na Universidade de Bielefeld (Alemanha) de 1990 a 1991. Professor Associado (2004) na Universidade de São Paulo, Campus de Ribeirão Preto. Desenvolve atualmente pesquisas na área de Física da Matéria Condensada com enfoque em simulações utilizando ensembles generalizados em sistemas de spin e no estudo do enovelamento de proteínas. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Nelson Augusto Alves
Nome em citações bibliográficas
ALVES, N. A.;Alves, Nelson A.;Alves, N A;Nelson A Alves;ALVES, N.'A.

Endereço


Endereço Profissional
Universidade de São Paulo, Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto.
Av. Bandeirantes, 3900
Monte Alegre
14040901 - Ribeirão Preto, SP - Brasil
Telefone: (16) 33153777
Fax: (16) 6339949
URL da Homepage: http://www.ffclrp.usp.br/docentes/fisicaematematica/nelsonaugustoalves.html


Formação acadêmica/titulação


1983 - 1988
Doutorado em Fisica.
Instituto de Fisica Teorica, IFT - UNESP, Brasil.
Título: SIMULACOES DE LANGEVIN E MONTE CARLO EM MODELOS SIGMA-NAO LINEARES, Ano de obtenção: 1988.
Orientador: MARIA CRISTINA BATONI ABDALLA.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
Palavras-chave: Monte Carlo; Modelo CPN-1; Equacao de Langevin.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Física Geral / Especialidade: Física Clássica e Física Quântica; Mecânica e Campos.
Setores de atividade: Outros Setores.
1981 - 1983
Mestrado em Fisica.
Instituto de Fisica Teorica, IFT - UNESP, Brasil.
Título: RESSONANCIAS EM POTENCIAIS DE ALCANCE FINITO,Ano de Obtenção: 1983.
Orientador: VALDIR CASSACA AGUILERA-NAVARRO.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
Palavras-chave: MATRIZ S; Matriz Q; Metodo variacional; Autovalor complexo.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Física Geral / Especialidade: Métodos Matemáticos da Física.
Setores de atividade: Outros Setores.
1977 - 1980
Graduação em Bacharel Em Fisica.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.


Pós-doutorado e Livre-docência


2004
Livre-docência.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: Simulações numéricas para a caracterização do comportamento crítico em sistemas de spins e em proteínas, Ano de obtenção: 2004.
Palavras-chave: Monte Carlo; simulação multicanônica; Transição de fase; Expoentes críticos; enovelamento de proteínas.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Física da Matéria Condensada / Especialidade: Biofísica.
Setores de atividade: Produtos e Processos Biotecnológicos.
1990 - 1991
Pós-Doutorado.
Universitat Bielefeld, BIELEFELD, Alemanha.
Bolsista do(a): Alexander Von Humboldt, HUMBOLDT, Alemanha.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Física Geral / Especialidade: Métodos Matemáticos da Física.
1990 - 1990
Pós-Doutorado.
Supercomputer Computations Research Institute, S.C.R.I., Estados Unidos.
Bolsista do(a): Supercomputer Computations Research Institute, S.C.R.I., Estados Unidos.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Física Geral / Especialidade: Métodos Matemáticos da Física.
1988 - 1990
Pós-Doutorado.
Florida State University, FSU, Estados Unidos.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Física das Partículas Elementares e Campos / Especialidade: Teorias Específicas e Modelos de Interação; Sistemática de Partículas; Raios Cósmicos.


Atuação Profissional



Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Vínculo institucional

2013 - Atual
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Associado 2, Regime: Dedicação exclusiva.

Vínculo institucional

2004 - 2013
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Associado, Regime: Dedicação exclusiva.

Vínculo institucional

1997 - 2004
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor doutor, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações
Antes de 1997, esteve ligado a USP como bolsista junto ao FMA-IFUSP e ao DFM-FFCLRP. De outubro de 1997 a novembro de 2004: contratado em processo seletivo como Professor Doutor (RDIDP); desde dezembro de 2004 até a presente data, Professor Associado (RDIDP).

Vínculo institucional

1997 - 1997
Vínculo: Bolsa Jovem Pesquisador Centro, Enquadramento Funcional: Pesquisador nível JP-3, Carga horária: 0, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações
Local: Departamento de Física e Matemática da Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto (FFCLRP). Bolsa de Pesquisador JP-3 da FAPESP. Titulo do projeto: Técnicas de simulação numérica e análise estatística de dados aplicadas ao estudo de séries temporais e transições de fase.

Vínculo institucional

1996 - 1996
Vínculo: Bolsa Pesquisador Associado 2C, Enquadramento Funcional: Pesquisador associado, Carga horária: 0, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações
Local: Departamento de Física e Matemática da Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras (FFCLRP), Campus de Ribeirão Preto. Bolsa de Pesquisador Associado Nível 2C (CNPq). Titulo do projeto: Teoria quântica de campos na rede e sistemas de spins: transições de fase, técnicas de simulação e de análise de dados.

Vínculo institucional

1994 - 1995
Vínculo: Bolsa Pesquisador Associado 2C, Enquadramento Funcional: Pesquisador associado, Carga horária: 0, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações
Local: Departamento de Física Matemática do Instituto de Física da USP (IFUSP); campus de São Paulo. Bolsa de Pesquisador Associado Nivel 2C (CNPq).

Vínculo institucional

1992 - 1994
Vínculo: Bolsista de Pós-Doutorado, Enquadramento Funcional: Pós-doutorado, Carga horária: 0, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações
Bolsa concedida pelo CNPq para desenvolver projeto de pesquisa: Aspectos críticos de modelos da teoria quântica de campos na rede e de sistemas de spins. Local: Instituto de Física da USP (IFUSP).

Vínculo institucional

1991 - 1992
Vínculo: Bolsista de Pós-Doutorado, Enquadramento Funcional: Pós-doutorado, Carga horária: 0, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações
Bolsa concedida pela FAPESP para desenvolver o projeto de pesquisa: Teoria quântica de campos: métodos analíticos e computacionais. Local: Instituto de Física da USP (IFUSP).

Atividades

08/2018 - Atual
Ensino, Psicologia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Estatística Aplicada I
08/2018 - Atual
Ensino, Fisica Medica, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Física Estatística
01/1998 - Atual
Pesquisa e desenvolvimento , Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto, Departamento de Física e Matemática.

08/2018 - 10/2018
Ensino, Fisica Aplicada a Medicina e Biologia, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Entropias em Física Estatística e teoria da informação - Aplicações em análise de sinais
08/2016 - 08/2018
Direção e administração, Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto, Departamento de Fisica.

Cargo ou função
Chefia do Departamento de Fisica.
08/2016 - 08/2018
Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto, .

Cargo ou função
Representante no Conselho Tecnico Administrativo (CTA).
08/2016 - 08/2018
Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto, .

Cargo ou função
Representante do Depto de Fisica na Congregacao da FFCLRP.
03/2018 - 06/2018
Ensino, Física Médica, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Mecânica Quântica
08/2017 - 12/2017
Ensino, Psicologia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Estatistica Aplicada II
08/2017 - 12/2017
Ensino, Fisica Medica, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Física Estatística
03/2017 - 06/2017
Ensino, Psicologia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Estatistica Aplicada I
03/2017 - 05/2017
Ensino, Fisica Aplicada a Medicina e Biologia, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Fundamentos de Fisica Estatistica e Enovelamento de Proteinas
08/2016 - 12/2016
Ensino, Psicologia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Estatistica Aplicada II
08/2016 - 12/2016
Ensino, Fisica Medica, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Fisica Matematica I
03/2016 - 06/2016
Ensino, Psicologia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Estatistica Aplicada I
02/2014 - 02/2016
Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto, Departamento de Fisica.

Cargo ou função
Representante no Conselho do Departamento.
08/2015 - 12/2015
Ensino, Fisica Medica, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Estatistica Basica
Fisica Matematica I
03/2015 - 06/2015
Ensino, Pedagogia (59052), Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Estatistica Aplicada a Educacao
03/2015 - 06/2015
Ensino, Fisica Medica, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Fisica II
03/2015 - 05/2015
Ensino, Fisica Aplicada a Medicina e Biologia, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Fundamentos de Fisica Estatistica e Enovelamento de Proteinas
03/2014 - 02/2015
Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto, Departamento de Fisica.

Cargo ou função
Comissao Coordenadora do Programa de Pos-graduacao do Depto de Fisica.
08/2014 - 12/2014
Ensino, Fisica Medica, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Estatistica Basica
03/2014 - 06/2014
Ensino, Biologia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Estatistica II
03/2014 - 06/2014
Ensino, Fisica Medica, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Fisica II
08/2013 - 12/2013
Ensino, Psicologia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Estatistica Aplicada II
08/2013 - 12/2013
Ensino, Fisica Medica, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Estatistica Basica
Mecanica Teorica
11/2011 - 10/2013
Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto, .

Cargo ou função
Vice-presidente da Comissao de Pesquisa.
10/2011 - 10/2013
Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto, .

Cargo ou função
Representante na Congregacao da FFCLRP.
03/2013 - 06/2013
Ensino, Biologia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Estatistica II
03/2011 - 03/2013
Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto, .

Cargo ou função
Comissao de Pesquisa.
08/2012 - 12/2012
Ensino, Fisica Medica, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Estatistica Basica
Mecanica Teorica
08/2012 - 10/2012
Ensino, Fisica Aplicada a Medicina e Biologia, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Fundamentos de Fisica Estatistica e Enovelamento de Proteinas
03/2012 - 06/2012
Ensino, Biologia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Estatistica II
03/2012 - 06/2012
Ensino, Ciência da Informação e Documentação, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Introducao a Estatistica
08/2011 - 12/2011
Ensino, Fisica Medica, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Estatistica Basica
09/2009 - 09/2011
Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto, .

Cargo ou função
Representante na Congregacao da FFLCRP.
03/2011 - 06/2011
Ensino, Biologia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Estatistica II
03/2011 - 06/2011
Ensino, Ciência da Informação e Documentação, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Introducao a Estatisitca
03/2008 - 02/2011
Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto, Departamento de Fisica.

Cargo ou função
Comissao Coordenadora do Programa de Pos-graduacao do Depto de Fisica.
09/2010 - 12/2010
Ensino, Fisica Medica, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Fisica Estatistica
Mecanica Teorica
03/2010 - 11/2010
Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto, .

Cargo ou função
Comissao Assessora para Assuntos de Moradia Estudantil - Pos-graduacao.
10/2008 - 10/2010
Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto, Departamento de Física e Matemática.

Cargo ou função
Vice-coordenador do Programa de Pos-graduacaoem Fisica Aplicada a Medicina e Biologia (FAMB).
03/2010 - 06/2010
Ensino, Biologia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Estatistica II
03/2010 - 06/2010
Ensino, Ciência da Informação e Documentação, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Introducao a Estatistica
08/2009 - 12/2009
Ensino, Fisica Medica, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Fisica Estatistica
08/2009 - 10/2009
Ensino, Fisica Aplicada a Medicina e Biologia, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Mecanica Estatistica
08/2007 - 08/2009
Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto, .

Cargo ou função
Representação dos Professores Associados junto à Congregação da Faculdade (FFCLRP).
03/2009 - 06/2009
Ensino, Biologia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Estatistica II
03/2009 - 06/2009
Ensino, Ciência da Informação e Documentação, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Introducao a Estatistica
04/2007 - 04/2009
Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto, Departamento de Física e Matemática.

Cargo ou função
Membro do Conselho do Departamento de Fisica e Matematica.
08/2008 - 12/2008
Ensino, Fisica Medica, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Fisica Estatistica
08/2008 - 10/2008
Ensino, Fisica Aplicada a Medicina e Biologia, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Mecanica Quantica I
03/2008 - 06/2008
Ensino, Biologia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Estatistica II
03/2008 - 05/2008
Ensino, Fisica Aplicada a Medicina e Biologia, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Mecanica Estatistica
08/2007 - 12/2007
Ensino, Fisica Medica, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Fisica Estatistica
08/2007 - 12/2007
Ensino, Biologia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Estatistica I
08/2005 - 08/2007
Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto, .

Cargo ou função
Suplente na representação dos Professores Associados junto à Congregação da Faculdade (FFCLRP).
03/2007 - 06/2007
Ensino, Biologia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Estatistica II
04/2007 - 05/2007
Ensino, Física Aplicada à Medicina e Biologia, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Mecânica Quântica
04/2005 - 03/2007
Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto, Departamento de Física e Matemática.

Cargo ou função
Membro Titular - Conselho do Departamento de Física e Matemática.
08/2006 - 12/2006
Ensino, Fisica Medica, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Fisica Estatistica
Mecanica Teorica
08/2006 - 12/2006
Ensino, Informática Biomédica, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Desenvolvimento de Projeto II (IBM 10641)
08/2006 - 10/2006
Ensino, Física Aplicada à Medicina e Biologia, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Mecânica Estatística
03/2006 - 06/2006
Ensino, Ciência da Informação e Documentação, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Introdução à Estatística
03/2006 - 06/2006
Ensino, Biologia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Estatistica II
08/2005 - 12/2005
Ensino, Fisica Medica, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Fisica Estatistica
08/2005 - 12/2005
Ensino, Economia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Introducao a Probabilidade e Estatistica II
08/2005 - 10/2005
Ensino, Física Aplicada à Medicina e Biologia, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Mecânica Estatística
03/2005 - 06/2005
Ensino, Economia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Introducao a Probabilidade e Estatistica II
03/2005 - 06/2005
Ensino, Biologia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Estatistica II
08/2004 - 12/2004
Ensino, Economia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Introducao a Probabilidade e Estatistica I
08/2004 - 12/2004
Ensino, Fisica Medica, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Fisica Computacional
03/2004 - 06/2004
Ensino, Biologia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Estatistica II
03/2004 - 06/2004
Ensino, Fisica Medica, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Mecanica Teorica
08/2003 - 12/2003
Ensino, Física Aplicada à Medicina e Biologia, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Seminários em Física Médica e Biológica I
Mecanica Estatistica (50%)
08/2003 - 12/2003
Ensino, Fisica Medica, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Fisica Matematica I
12/2001 - 12/2003
Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto, Departamento de Física e Matemática.

Cargo ou função
Coordenador do programa de pós-graduação em Física Aplicada à Medicina e Biologia (FAMB).
12/2001 - 12/2003
Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto, Departamento de Física e Matemática.

Cargo ou função
Comissão de Distribuição de Bolsas do programa (FAMB).
04/2002 - 10/2003
Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto, .

Cargo ou função
Comissão de Pós-Graduação.
03/2003 - 06/2003
Ensino, Física Aplicada à Medicina e Biologia, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Seminários em Física Médica e Biológica I
03/2003 - 06/2003
Ensino, Economia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Introducao a Probabilidade e Estatistica II
08/2002 - 12/2002
Ensino, Física Aplicada à Medicina e Biologia, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Seminários em Física Médica e Biológica I
08/2002 - 12/2002
Ensino, Fisica Medica, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Fisica Matematica I
03/2002 - 06/2002
Ensino, Física Aplicada à Medicina e Biologia, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Seminários em Física Médica e Biológica I
Mecanica Estatistica
07/2000 - 06/2002
Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto, .

Cargo ou função
Comissão de Assessoramento em Informática da FFCLRP.
06/2001 - 05/2002
Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto, Departamento de Física e Matemática.

Cargo ou função
Comissão de equivalência de disciplinas.
05/1999 - 04/2002
Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto, .

Cargo ou função
Comissao de Graduacao.
08/2001 - 12/2001
Ensino, Fisica Medica, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Fisica Matematica I
08/2001 - 12/2001
Ensino, Economia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Introducao a Probabilidade e Estatistica I
09/2000 - 12/2001
Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto, Departamento de Física e Matemática.

Cargo ou função
Vice-coordenador do programa de pós-graduação em Física Aplicada à Medicina e Biologia (FAMB).
03/2001 - 06/2001
Ensino, Psicologia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Estatistica Aplicada II
08/2000 - 12/2000
Ensino, Psicologia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Estatística Aplicada II
Estatística I
08/2000 - 12/2000
Ensino, Economia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Introducao a Probabilidade e Estatistica I
03/2000 - 06/2000
Ensino, Economia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Introducao a Probabilidade e Estatistica II
03/2000 - 06/2000
Ensino, Ciências Contábeis, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Introducao a Probabilidade e Estatistica II
08/1999 - 12/1999
Ensino, Administração de Empresas, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Estatistica Basica
08/1999 - 12/1999
Ensino, Economia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Introducao a Probailidade e Estatistica I
03/1999 - 06/1999
Ensino, Economia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Introducao a Probabilidade e Estatistica II
03/1999 - 06/1999
Ensino, Ciências Contábeis, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Introducao a Probabilidade e Estatistica II
08/1998 - 12/1998
Ensino, Economia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Introducao a Probabillidade e Estatistica I
08/1998 - 12/1998
Ensino, Ciências Contábeis, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Introducao a Probabilidade e Estatistica I
03/1998 - 06/1998
Ensino, Economia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Introdução à Probabilidade e Estatística II
03/1998 - 06/1998
Ensino, Ciências Contábeis, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Introducao a Probabilidade e Estatistica II
08/1997 - 12/1997
Ensino, Ciências Contábeis, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Introdução à Probabilidade e Estatística I
08/1997 - 12/1997
Ensino, Administração de Empresas, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Estatística Básica
08/1997 - 12/1997
Ensino, Psicologia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Estatística I
01/1997 - 12/1997
Pesquisa e desenvolvimento , Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto, Departamento de Física e Matemática.

4/1996 - 8/1996
Pesquisa e desenvolvimento , Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto, Departamento de Física e Matemática.

10/1994 - 3/1995
Pesquisa e desenvolvimento , Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto, Departamento de Física e Matemática.



Linhas de pesquisa


1.
Fractalidade de séries temporais

Objetivo: Estuda-se a fractalidade de séries temporais obtidas de simulações de Monte Carlo e do movimentod Browniano, via a técnica de wavelets..
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Palavras-chave: wavelets; Dimensão fractal; Simulações de Monte Carlo.
2.
Simulações de teorias de gauge na rede

Objetivo: Estudar os aspectos críticos das teorias de gauge SU(2) e SU(3) na rede por meio dos zeros da função de partição obtidos em simulações de Monte Carlo, além dos correspondentes cálculos para modelos na mesmas classes de universalidade: modelos de Ising e Potts de q-estados..
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Física das Partículas Elementares e Campos / Especialidade: Teoria Geral de Partículas e Campos.
Palavras-chave: Simulações de Monte Carlo; Expoente crítico; SU2 model; SU3 model; Modelo de Ising; modelo de potts.
3.
Aspectos críticos de sistemas de spin via simulações de Monte Carlo

Objetivo: Estudamos os aspectos criticos de modelos de spin via zeros da função de partição obtidos por meio de simulações de Monte Carlo..
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Palavras-chave: Simulações de Monte Carlo; Zeros de Yang-Lee; Finite size scaling; Modelo de Ising; Expoentes críticos; simulação multicanônica.
4.
Simulações do enovelamento de proteínas

Objetivo: Estudar a formação de conformações compactas de proteínas por meio de simulações numéricas. Efetuamos as simulações numéricas por meio do algoritmo multicanônico para evitar os mínimos locais no perfíl de energia livre. A formação de estruturas secundárias também é examinada em função de um campo de forças que procura descrever a interação entre todos os átomos e também a interação destes com o ambiente solvente por meio de um termo implicito..
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Física da Matéria Condensada / Especialidade: Biofísica.
Palavras-chave: Helix-coil transition; hidrofobicidade; simulação multicanônica; Expoentes críticos.
5.
Aspectos críticos de sistemas de spin via simulações de Monte Carlo

Objetivo: Determinar os expoentes críticos em modelos de spin e a ordem da transição de fase utilizando-se técnicas de escala de tamanho finito para os zeros da função de partição, calor específico e suscetibilidade, calculados em redes finitas por meio das simulações de Monte Carlo..
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Palavras-chave: Expoentes críticos; Função de partição; Simulações de Monte Carlo; Transição de fase; Zeros de Yang-Lee.


Projetos de pesquisa


2016 - Atual
Análise sistemática in silico do comportamtneo crítico do peptídeo amilóide beta e de alguns dos seus mutantes
Descrição: Utilizamos simulações de dinâmica molecular para descrever estados intermediários dos peptídeos amilóide beta com 40 e 42 resíduos, além de um conjunto de peptídeos mutantes obtidos trocando-se pontualmente aminoácidos nas sequências Abeta. Os peptídeos Abeta e seus variantes mutantes desempenham um papel central na doença de Alzheimer e apresentam diferentes níveis de toxicidade e propensidade à conversão das formas solúveis em formas de agregados fibrilares insolúveis. Objetivamos determinar as propriedades críticas e características conformacionais destes peptíideos para descrever os efeitos das mutações sobre as suas propensidades..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Doutorado: (1) .
Integrantes: Nelson Augusto Alves - Coordenador / Jacyana Saraiva Marthes Martins Galvão - Integrante.Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
2010 - 2015
Análise de Modos Normais dos movimentos conformacionais em proteinas
Descrição: As propriedades intrínsecas da dinâmica da rede formada pelos resíduos protéicos podem ser capturadas pelo modelo de rede gaussiana (GNM). Neste modelo, estudamos os modos normais de vibração, os quais podem ser relacionados com o fator de temperatura destes resíduos. Este modelo é modificado para reproduzir melhor o fator de temperatura experimental..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Doutorado: (1) .
Integrantes: Nelson Augusto Alves - Coordenador / Matheus R Mendonça - Integrante.
2009 - 2014
Simulações de Monte Carlo utilizando ensembles generalizados
Descrição: Algoritmos de amostragem uniforme são aplicados ao estudo das transições de fase no modelo de Ising dipolar bidimensional e na caracterização dos estados de transição em proteínas descritos por um modelo mínimo "off-lattice"..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) .
Integrantes: Nelson Augusto Alves - Integrante / Leandro G. Rizzi - Coordenador / Pedro Henrique Rodrigues da Silva - Integrante.
2008 - 2011
Transições de fase no ensemble gaussiano estendido
Descrição: O ensemble gaussiano e sua versão estendida desempenham o papel importante de ensembles interpolantes entre os ensembles microcanônico e canônico. As propriedades termodinâmicas do modelo de Blume-Capel (BC) com interações de alcance infinito são analisadas por meio do ensemble gaussiano estendido (EGE)..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Doutorado: (2) .
Integrantes: Nelson Augusto Alves - Coordenador / Rafael B. Frigori - Integrante / Leandro G. Rizzi - Integrante.
Número de produções C, T & A: 2
2007 - 2011
Redes complexas e caracterização de domínios em proteínas
Descrição: Desenvolvimento de algoritmo para determinar de modo eficiente as comunidades numa rede complexa. Pretendemos utilizar este algoritmo em proteínas descritas por uma rede onde os sítios são os carbonos alfa e as arestas as correspondentes interações entre os carbonos alfa, que estejam entre si no máximo a uma determinada distancia pré-definida. Pretendemos usar o conceito de comunidade para identificar domínios em proteínas..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Doutorado: (1) .
Integrantes: Nelson Augusto Alves - Coordenador / Luiz Carlos Büttner Mostaço Guidolin - Integrante.
Número de produções C, T & A: 2 / Número de orientações: 1
2007 - Atual
Estudo das transições de fase no modelo de Ising dipolar
Descrição: A presença do termo dipolar altera o esperado estado fundamental ferromagnético do modelo de Ising puro para uma série de fases tipo faixas como função das intensidades das interações. Simulações de Monte Carlo e técnicas de histogramas ponderados aplicados a múltiplos histogramas, são utilizadas na identificação das temperaturas críticas das transições de fase que ocorrem para faixas de largura h em redes quadradas..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (1) .
Integrantes: Nelson Augusto Alves - Coordenador / Leandro Gutierrez Rizzi - Integrante / ? Jacyana Saraiva Marthes Fonseca - Integrante.
Número de produções C, T & A: 2 / Número de orientações: 2
2006 - 2008
Simulação numérica de conformações nativas de proteínas e modelos de spin (ffclrp)
Descrição: Um problema de destaque em biofísica molecular é o chamado problema de enovelamento de proteínas (protein folding). Ele consiste em entender como proteínas se enovelam de forma a conseguir a mesma conformação espacial nativa, correspondendo à sua forma biologicamente ativa. Um modo de compreender o processo de enovelamento é por meio das simulações computacionais. Entretanto, para isso é necessário uma modelagem da cadeia de átomos, quer por meio dos chamados modelos mínimos ou por meio de um campo de forças que leve em conta a interação entre todos os átomos da cadeia. Além disso, por causa da enorme quantidade de mínimos locais, algoritmos eficientes são necessários para que possamos encontrar as conformações nativas. Procuraremos desenvolver uma estrutura computacional aliada ao conhecimento de algoritmos que possam superar em eficiência o algoritmo que temos usado em nossa pesquisa: o algoritmo multicanônico, o qual já se mostra pouco eficiente para cadeias maiores (mais que 30 manômetros). A correta identificação das conformações nativas passa pela adequada formação das estruturas secundárias: hélice alfa e folha beta, o que nos leva a estudar de que forma podemos simular numericamente a formação dessas estruturas em polipeptídeos. Aspectos do enovelamento em termos de uma teoria crítica continuará sendo utilizada por nós para uma compreensão teórica da formação de estados nativos, além de procurarmos verificar que mecanismos levam a essa formação..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (1) .
Integrantes: Nelson Augusto Alves - Coordenador.Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
2005 - 2008
Simulações numéricas para a caracterização do comportamento crítico em sistemas de spins e em proteínas (PQ-2)
Descrição: Exploramos os aspectos críticos em modelos de spins e em proteínas. Esta caracterização é obtida por meio das simulaçoes de MC. As simulaçoes são efetuadas usando-se diferentes abordagens, dentre elas a chamada dinâmica de tempos curtos, conduzindo à determinação dos expoentes dinâmicos e estáticos do modelo. Aspectos referentes ao estado nativo em proteínas são também investigados por meio de funções hidrofóbicas..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (1) .
Integrantes: Nelson Augusto Alves - Coordenador / Ulrich H E Hansmann - Integrante / V. Aleksenko - Integrante / Alexandre Souto Martinez - Integrante.Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.
Número de produções C, T & A: 15 / Número de orientações: 7
2003 - 2005
Estudo da criticalidade em sistemas de spin e em proteínas (PQ-2C)
Descrição: Estudamos novamente o modelo AGA para investigar o papel do solvente na formação de estruturas secundárias e terciárias. Um ponto em questão é se a formação da estrutura secundária ocorre antes, depois ou ao mesmo tempo que a terciária. Outro aspecto da nossa análise concerne em verificar em que grau a formação das estruturas secundárias e folding são determinadas pelas propriedades intrínsecas da proteína ou pelo ambiente solvente..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
2001 - 2003
Estudo da criticalidade em sistemas de spin e em proteínas (PQ-2C)
Descrição: Exploramos os aspectos críticos em modelso de spins e em proteínas..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) .
Integrantes: Nelson Augusto Alves - Coordenador / Jose Roberto Drugowich de Felicio - Integrante / Ulrich H E Hansmann - Integrante / Jeaneti Pimenta Navas Ferrite - Integrante / Roberto da Silva - Integrante.Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.
Número de produções C, T & A: 18 / Número de orientações: 4
1997 - 1997
Técnicas de simulação e análise estatística de dados aplicados ao estudo de séries temporais e transições de fase (ffclrp)
Descrição: Determinamos numericamento os zeros da função de partição nos modelos de Ising por meio de simulações de monte carlo utilizando a técnica de repesagem..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) .
Integrantes: Nelson Augusto Alves - Coordenador / Jose Roberto Drugowich de Felicio - Integrante.Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.
Número de produções C, T & A: 3
1996 - 1996
Teoria quântica de campos na rede e de sistemas de spins: Transições de fase, técnicas de simulação e de análise de dados (ffclrp)
Descrição: Estudamos numericamento os expoentes criticos modelos de Ising e Potts de q-estados utilizando-se os zeros da função de partição obtidos por meio de simulações de monte carlo e usando a técnica de repesagem. Os aspectos fractais das séries temporais das teorias de gauge SU(2) e SU(3) geradas por Monte Carlo são também consideradas..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) .
Integrantes: Nelson Augusto Alves - Coordenador.Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.
Número de produções C, T & A: 2
1994 - 1995
Aspectos críticos dos modelos da teoria quântica de campos na rede e de sistemas de spins (ifusp)
Descrição: Determinamos numericamento os expoentes criticos e a ordem da transição de fase nos modelos de gauge na rede SU(2) e SU(3), além dos modelos de Ising e Potts de q-estados utilizando-se os zeros da função de partição obtidos por meio de simulações de monte carlo..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) .
Integrantes: Nelson Augusto Alves - Coordenador.Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.
Número de produções C, T & A: 2
1992 - 1994
Aspectos criticos dos modelos na teoria quântica de campos na rede e de sistemas de spins (ifusp)
Descrição: Determinamos numericamento os expoentes criticos e a ordem da transição de fase nos modelos de gauge na rede SU(2) e SU(3), além dos modelos de Ising e Potts de q-estados utilizando-se os zeros da função de partição obtidos por meio de simulações de monte carlo..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) .
Integrantes: Nelson Augusto Alves - Coordenador.Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.
Número de produções C, T & A: 3
1991 - 1992
Teoria quântica de campos: métodos analíticos e computacionais (ifusp)
Descrição: Estudamos os aspectos críticos de modelos de gauge SU(2) e SU(3) na rede por meio dos zeros da função de partição obtidos em simulações de Monte Carlo e utilizando a técnica de repesagem..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) .
Integrantes: Nelson Augusto Alves - Coordenador.Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.
Número de produções C, T & A: 1


Revisor de periódico


2003 - Atual
Periódico: Physical Review E - Statistical Physics, Plasmas, Fluids and Related Interd
2004 - Atual
Periódico: Physical Review Letters
2004 - Atual
Periódico: Journal of Physics. Condensed Matter
2003 - Atual
Periódico: Journal of Physics. A, Mathematical and Theoretical


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Física da Matéria Condensada.
2.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Enovelamento de Proteínas.
3.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Fisica Estatística.


Idiomas


Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Alemão
Compreende Razoavelmente, Fala Pouco, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.


Produções



Produção bibliográfica
Citações

Web of Science
Total de trabalhos:44
Total de citações:678
Fator H:15
Alves, Nelson Augusto  Data: 03/10/2018

SCOPUS

Artigos completos publicados em periódicos

1.
Alves, Nelson A.2018Alves, Nelson A.; FRIGORI, RAFAEL B. . Structural Interconversion in Alzheimer?s Amyloid-β(16-35) Peptide in an Aqueous Solution. JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B, v. 122, p. 1869-1875, 2018.

2.
Alves, Nelson A.2016Alves, Nelson A.; FRIGORI, RAFAEL B. . Superstatistics and the quest of generalized ensembles equivalence in a system with long-range interactions. Physica. A (Print), v. 446, p. 195-203, 2016.

3.
RIZZI, L.'G.2016RIZZI, L.'G. ; ALVES, N.'A. . Comment on -Nature of Long-Range Order in Stripe-Forming Systems with Long-Range Repulsive Interactions-. Physical Review Letters (Print), v. 117, p. 239601, 2016.

4.
ALVES, N. A.;Alves, Nelson A.;Alves, N A;Nelson A Alves;ALVES, N.'A.2015ALVES, N. A.; MORERO, L. D. ; RIZZI, LEANDRO G. . Microcanonical thermostatistics analysis without histograms: Cumulative distribution and Bayesian approaches. Computer Physics Communications, v. 191, p. 125-131, 2015.

5.
DE MENDONÇA, MATHEUS R.2014DE MENDONÇA, MATHEUS R. ; RIZZI, L. G. ; CONTESSOTO, VINICIUS ; LEITE, VITOR B. P. ; ALVES, N. A. . Inferring a weighted elastic network from partial unfolding with coarse-grained simulations. Proteins (Print), v. 82, p. 119-129, 2014.

6.
FRIGORI, RAFAEL B.2013FRIGORI, RAFAEL B. ; Rizzi, Leandro G. ; Alves, Nelson A. . Microcanonical thermostatistics of coarse-grained proteins with amyloidogenic propensity. The Journal of Chemical Physics, v. 138, p. 015102, 2013.

7.
Fonseca, Jacyana2012Fonseca, Jacyana ; Rizzi, Leandro G. ; Alves, Nelson A. . Stripe-tetragonal phase transition in the two-dimensional Ising model with dipole interactions: Partition function zeros approach. Physical Review. E, Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics (Print), v. 86, p. 011103, 2012.

8.
Rizzi, Leandro G.2011Rizzi, Leandro G. ; Alves, Nelson A. . Communication: Multicanonical entropy-like solution of statistical temperature weighted histogram analysis method. The Journal of Chemical Physics, v. 135, p. 141101, 2011.

9.
Rizzi, L. G.2011Rizzi, L. G. ; Alves, N A . Multicanonical simulation and trapping due to high free-energy barriers in an Ising model for ultrathin magnetic films. Journal of Computational Interdisciplinary Sciences, v. 2, p. 79-86, 2011.

10.
Rizzi, Leandro G.2010Rizzi, Leandro G. ; Alves, Nelson A. . Phase transitions and autocorrelation times in two-dimensional Ising model with dipole interactions. Physica. B, Condensed Matter (Print), v. 405, p. 1571-1579, 2010.

11.
Frigori, R. B.2010Frigori, R. B. ; Rizzi, L. G. ; ALVES, N. A. . Extended gaussian ensemble solution and tricritical points of a system with long-range interactions. The European Physical Journal. B, Condensed Matter Physics (Print), v. 75, p. 311-318, 2010.

12.
Frigori, R B2010Frigori, R B ; Rizzi, L G ; Alves, N A . The extended Gaussian ensemble and metastabilities in the Blume Capel model. Journal of Physics. Conference Series (Online), v. 246, p. 012018-7, 2010.

13.
ALVES, N. A.;Alves, Nelson A.;Alves, N A;Nelson A Alves;ALVES, N.'A.2007ALVES, N. A.; MARTINEZ, Alexandre Souto . Inferring topological features of proteins from amino acid residue networks. Physica. A (Print), v. 375, p. 336-344, 2007.

14.
ALVES, N. A.;Alves, Nelson A.;Alves, N A;Nelson A Alves;ALVES, N.'A.2007ALVES, N. A.. Unveiling community structures in weighted networks. Physical Review E - Statistical Physics, Plasmas, Fluids and Related Interdisciplinary Topics, v. 76, p. 036101, 2007.

15.
ALVES, N. A.;Alves, Nelson A.;Alves, N A;Nelson A Alves;ALVES, N.'A.2005ALVES, N. A.; ALEKSENKO, V. ; HANSMANN, Ulrich H e . A simple hydrophobicity-based score for profiling protein structures. Journal of Physics. Condensed Matter, v. 17, p. S1595-S1606, 2005.

16.
ALVES, N. A.;Alves, Nelson A.;Alves, N A;Nelson A Alves;ALVES, N.'A.2004ALVES, N. A.; Yong, Peng ; Hansmann, Ulrich H.E. . All-atom protein-folding simulations in generalized-ensembles. Brazilian Journal of Physics, v. 34, p. 363-367, 2004.

17.
ALVES, N. A.;Alves, Nelson A.;Alves, N A;Nelson A Alves;ALVES, N.'A.2003ALVES, N. A.; PENG, Y. ; HANSMANN, Ulrich H e . Solution effects and the order of the helix-coil transition in polyalanine. Journal of Chemical Physics, Estados Unidos, v. 118, n.5, p. 2374-2380, 2003.

18.
ALVES, N. A.;Alves, Nelson A.;Alves, N A;Nelson A Alves;ALVES, N.'A.2003ALVES, N. A.; SILVA, R. ; DRUGOWICH DE FELICIO, J. R. D. . Global persistence exponent of the two-dimensional Blume-Capel model. Physical Review E - Statistical Physics, Plasmas, Fluids and Related Interdisciplinary Topics, Estados Unidos, v. 67, p. 57102-57102-4, 2003.

19.
Alves, Nelson A.2003Alves, Nelson A.; Hansmann, Ulrich H. E. . Helix-formation and folding as studied in generalized-ensemble simulations. Brazilian Journal of Physics, Brasil, v. 33, n.3, p. 600-604, 2003.

20.
ALVES, N. A.;Alves, Nelson A.;Alves, N A;Nelson A Alves;ALVES, N.'A.2003ALVES, N. A.; HANSMANN, Ulrich H e . Solution effects and the folding of an artificial peptide. Journal of Physical Chemistry. B, Estados Unidos, v. 107, n.37, p. 10284-10291, 2003.

21.
ALVES, N. A.;Alves, Nelson A.;Alves, N A;Nelson A Alves;ALVES, N.'A.2002ALVES, N. A.; FERRITE, J. P. N. ; HANSMANN, Ulrich H e . Numerical comparison of two approaches for the study of phase transitions in small systems. Physical Review E - Statistical Physics, Plasmas, Fluids and Related Interdisciplinary Topics, Estados Unidos, v. 65, p. 36110-36118, 2002.

22.
ALVES, N. A.;Alves, Nelson A.;Alves, N A;Nelson A Alves;ALVES, N.'A.2002ALVES, N. A.; DRUGOWICH DE FELICIO, J. R. D. ; SILVA, R. . Mixed initial conditions to estimate the dynamic critical exponent in short-time Monte Carlo simulation. Physics Letters A, Holanda, v. 298, n.5-6, p. 325-329, 2002.

23.
Alves, Nelson A.2002Alves, Nelson A.; Hansmann, Ulrich H.E. ; Peng, Yong . Structural transitions in biomolecules - a numerical comparison of two approaches for the study of phase transitions in small systems. International Journal of Molecular Sciences (Online), suiça, v. 3, n.1, p. 17-29, 2002.

24.
ALVES, N. A.;Alves, Nelson A.;Alves, N A;Nelson A Alves;ALVES, N.'A.2002ALVES, N. A.; HANSMANN, Ulrich H e . Helix formation and folding in an artificial peptide. Journal of Chemical Physics, Estados Unidos, v. 117, n.5, p. 2337-2343, 2002.

25.
ALVES, N. A.;Alves, Nelson A.;Alves, N A;Nelson A Alves;ALVES, N.'A.2002ALVES, N. A.; SILVA, R. ; DRUGOWICH DE FELICIO, J. R. D. . Universality and scaling study of the tricritical behavior of the two-dimensional Blume-Capel model in short-time dynamics. Physical Review E - Statistical Physics, Plasmas, Fluids and Related Interdisciplinary Topics, Estados Unidos, v. 66, p. 26130--7, 2002.

26.
ALVES, N. A.;Alves, Nelson A.;Alves, N A;Nelson A Alves;ALVES, N.'A.2001ALVES, N. A.; HANSMANN, Ulrich H e . Yang-Lee zeros and the helix-coil transition in a continuum model of polyalanine. Physica. A, Holanda, v. 292, p. 509-518, 2001.

27.
ALVES, N. A.;Alves, Nelson A.;Alves, N A;Nelson A Alves;ALVES, N.'A.2000 ALVES, N. A.; HANSMANN, Ulrich H e . Partition function zeros and finite size scaling of helix-coil transitions in a polypeptide. Physical Review Letters, v. 84, n.8, p. 1836-1839, 2000.

28.
ALVES, N. A.;Alves, Nelson A.;Alves, N A;Nelson A Alves;ALVES, N.'A.2000ALVES, N. A.; HANSMANN, Ulrich H e . Glass transition temperature and fractal dimension of protein free energy landscapes. International Journal of Modern Physics C, v. 11, n.2, p. 301-308, 2000.

29.
ALVES, N. A.;Alves, Nelson A.;Alves, N A;Nelson A Alves;ALVES, N.'A.2000ALVES, N. A.; ALBUQUERQUE, L. C. ; DALMAZI, D. . Yang_lee zeros of the Ising model on random graphs of non planar topology. Nuclear Physics. B, Holanda, v. 580, n.3, p. 739-756, 2000.

30.
ALVES, N. A.;Alves, Nelson A.;Alves, N A;Nelson A Alves;ALVES, N.'A.2000ALVES, N. A.; DRUGOWICH DE FELICIO, J. R. D. ; HANSMANN, Ulrich H e . Partition function zeros and leading-order scaling correction of the 3D Ising model from multicanonical simulations. Journal of Physics. A, Mathematical and General, Inglaterra, v. 33, p. 7489-7498, 2000.

31.
ABDALLA, E.1999ABDALLA, E. ; ALVES, N. A. . Bound-State Structure of Two-dimensional QCD: Formalism and Numerical Results. Annals of Physics (New York), New York, v. 277, n.1, p. 74-93, 1999.

32.
ALVES, N. A.;Alves, Nelson A.;Alves, N A;Nelson A Alves;ALVES, N.'A.1997ALVES, N. A.; DRUGOWICH DE FELICIO, J. R. D. ; HANSMANN, Ulrich H e . A new look at the 2D Ising model from exact partition function zeros for large lattice sizes. International Journal of Modern Physics C, v. 8, n.5, p. 1063-1071, 1997.

33.
ALVES, N. A.;Alves, Nelson A.;Alves, N A;Nelson A Alves;ALVES, N.'A.1994ALVES, N. A.. Finite-size scaling behaviour of the SU(2) lattice gauge theory. Physics Letters. Section B, v. 324, p. 437-441, 1994.

34.
ALVES, N. A.;Alves, Nelson A.;Alves, N A;Nelson A Alves;ALVES, N.'A.1992ALVES, N. A.. Surface tension in SU(3) at finite temperature. Physical Review D, v. 46, n.8, p. 3678-3681, 1992.

35.
ALVES, N. A.;Alves, Nelson A.;Alves, N A;Nelson A Alves;ALVES, N.'A.1992 ALVES, N. A.; BERG, B. A. ; SANIELEVICI, S. . Spectral density study of the SU(3) deconfining phase transition. Nuclear Physics. B, v. 376, p. 218-252, 1992.

36.
ALVES, N. A.;Alves, Nelson A.;Alves, N A;Nelson A Alves;ALVES, N.'A.1992ALVES, N. A.; BERG, B. A. ; DUKE, D. W. ; IRBACK, A. ; SANIELEVICI, S. . Spectral density analysis of the chiral transition in nf=4 finite temperature QCD. Physics Letters. Section B, v. 280, p. 261-266, 1992.

37.
ALVES, N. A.;Alves, Nelson A.;Alves, N A;Nelson A Alves;ALVES, N.'A.1991ALVES, N. A.; BERG, B. A. ; VILLANOVA, R. . Potts models: Density of states and mass gap from Monte Carlo calculations. Physical Review B - Condensed Matter and Materials Physics, v. 43, n.7, p. 5846-5856, 1991.

38.
ALVES, N. A.;Alves, Nelson A.;Alves, N A;Nelson A Alves;ALVES, N.'A.1991ALVES, N. A.; VILLANOVA, R. ; BERG, B. A. . Density of States and Finite Size Scaling Investigations. Nuclear Physics. B, Proceedings Supplement, Holanda, v. 20, p. 665-668, 1991.

39.
ALVES, N. A.;Alves, Nelson A.;Alves, N A;Nelson A Alves;ALVES, N.'A.1990 ALVES, N. A.; BERG, B. A. ; SANIELEVICI, S. . Partition function zeros and the SU(3) deconfining phase transition. Physical Review Letters, v. 64, n.26, p. 3107-3110, 1990.

40.
ALVES, N. A.;Alves, Nelson A.;Alves, N A;Nelson A Alves;ALVES, N.'A.1990ALVES, N. A.; BERG, B. A. ; SANIELEVICI, S. . Binder energy cumulant for SU(3) lattice gauge theory. Physics Letters. Section B, v. 241, n.4, p. 557-560, 1990.

41.
ALVES, N. A.;Alves, Nelson A.;Alves, N A;Nelson A Alves;ALVES, N.'A.1990 ALVES, N. A.; BERG, B. A. ; VILLANOVA, R. . Ising-model Monte Carlo simulations: Density of states and mass gap. Physical Review B - Condensed Matter and Materials Physics, v. 41, n.1, p. 383-394, 1990.

42.
ABDALLA, E.1990ABDALLA, E. ; ABDALLA, M. C. B. ; ALVES, N. A. ; CARNEIRO, C. E. I. . Numerical simulations of the O(3) and CP1 models using the Langevin equations and the Metropolis algorithm. Physical Review D, v. 41, n.2, p. 571-580, 1990.

43.
ALVES, N. A.;Alves, Nelson A.;Alves, N A;Nelson A Alves;ALVES, N.'A.1990ALVES, N. A.; BERG, B. A. . correlation length finite size scaling investigations. Nuclear Physics. B, Proceedings Supplement, Holanda, v. 17, p. 194-198, 1990.

44.
ALVES, N. A.;Alves, Nelson A.;Alves, N A;Nelson A Alves;ALVES, N.'A.1988 ALVES, N. A.; DRIGO FILHO, E. . The factorisation method and supersymmetry. Journal of Physics. A, Mathematical and General, v. 21, p. 3215-3225, 1988.

45.
ALVES, N. A.;Alves, Nelson A.;Alves, N A;Nelson A Alves;ALVES, N.'A.1986ALVES, N. A.; ARATYN, H. ; ZIMERMAN, A. H. . beta Dependence on the Witten index. Physics Letters. Section B, v. 173, n.3, p. 327-331, 1986.

46.
AGUILERANAVARRO, V. C.1986AGUILERANAVARRO, V. C. ; ALVES, N. A. ; ZIMERMAN, A. H. ; KOO, E. L. . On the determination of resonance energies and widths for short-range potentials. Journal of Physics. B, Atomic, Molecular and Optical Physics, v. 19, p. 2979-2994, 1986.

47.
ALVES, N. A.;Alves, Nelson A.;Alves, N A;Nelson A Alves;ALVES, N.'A.1985ALVES, N. A.; ARATYN, H. ; ZIMERMAN, A. H. . Fractionization of the Witten index in some soluble models. Physical Review D, v. 31, n.12, p. 3298-3300, 1985.

Trabalhos completos publicados em anais de congressos
1.
ALVES, N. A.; ALEKSENKO, V. ; KWAK, W. ; Hansmann, Ulrich H.E. . Protein folding as studied in generalized-ensemble simulations of all-atom protein models. In: Conference Joint Conference of ICCP6 and CCP2003, 2003, Beijing. Computational physics : proceedings of the joint conference of ICCP6 and CCP2003. Paramus, NJ 07652 (USA): Rinton Press, 2003.

2.
Nelson A Alves. Lattice QCD calculations of relevant parameters for the nucleation of the hadronic matter. In: Festschrift for Abraham H. Zimerman, 1998, São Paulo. Topics in Theoretical Physics. São Paulo: IFT/UNESP, 1998. v. II. p. 53-60.

Resumos expandidos publicados em anais de congressos
1.
Rizzi, L. G. ; ALVES, N. A. . Estudo numérico da convergência do somatório de Ewald em redes bidimensional. In: ERMAC: I Encontro Regional de Matemática Aplicada e Computacional, 2008, Bauru. Encontro Regional de Matemática Aplicada e Computacional, 2008.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
Nelson A Alves; MORERO, L. D. ; RIZZI, L. G. . Microcanonical thermostatistics analysis from canonical simulations without histograms. In: XXXVIII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 2015, Foz do Iguaçu. XXXVIII ENFMC, 2015.

2.
RIZZI, L. G. ; Frigori, R. B. ; Alves, Nelson A. . Microcanonical thermostatistics of protein-like heteropolymer from replica exchange Monte Carlo simulations. In: XXXV Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 2012, Águas de Lindóia. XXXV ENFMC, 2012.

3.
Rizzi, L. G. ; GALVAO, J. S. M. M. ; Nelson A Alves . Partition function zeros approach in the 2D Ising model with dipole interactions and the stripe-tetragonal phase transition. In: XXXV Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 2012, Águas de Lindóia. XXXV ENFMC, 2012.

4.
Frigori, R. B. ; Alves, N A . Agregação de IAPP e a Diabetes-II sob a perspectiva de simulações microcanônicas. In: Encontro de Física 2011, 2011, Foz do Iguaçu. Encontro de Física 2011, 2011.

5.
Alves, N A. Termodinâmica da agregação de proteínas via a coarse-grained model. In: Simpósio Interdisciplinar Física + Bioinformática 2011, 2011, São José do Rio Preto. Simpósio Interdisciplinar Física + Bioinformática 2011, 2011.

6.
Mendonça, M. R. ; Alves, N A . Estudo da relação entre hidrofobicidade e fatores-B experimentais para proteínas. In: Simpósio Interdisciplinar Física + Bioinformática 2011, 2011, São José do Rio Preto. Simpósio Interdisciplinar Física + Bioinformática 2011, 2011.

7.
Rizzi, L. G. ; Alves, N A . Termoestatística microcanônica via simulações de Monte Carlo canônicas. In: Simpósio Interdisciplinar Física + Bioinformática 2011, 2011, São José do Rio Preto. Simpósio Interdisciplinar Física + Bioinformática 2011, 2011.

8.
Frigori, R. B. ; Alves, N A . Microcanonical simulations of protein folding and aggregation. In: XXXIII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 2010, Águas de Lindóia. XXXIII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 2010.

9.
Mendonça, M. R. ; Frigori, R. B. ; ALVES, N. A. . Elastic network model with relative weights for the bonded and non-bonded interactions between residues in proteins. In: XXXIII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 2010, Águas de Lindóia. XXXIII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 2010.

10.
Rizzi, Leandro G. ; Alves, N A . Feedback-optimized multicanonical Monte Carlo simulations. In: XXXIII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 2010, Águas de Lindóia. XXXIII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 2010.

11.
Rizzi, L. G. ; ALVES, N. A. . Monte Carlo simulations applied to study of phase transitions in two-dimensional Ising model with dipole interactions. In: XXXII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 2009, Águas de Lindóia. XXXII ENCONTRO NACIONAL DE FÍSICA DA MATÉRIA CONDENSADA, 2009.

12.
Frigori, R. B. ; Rizzi, L. G. ; ALVES, N. A. . Extended Gaussian ensemble and phase transition in systems with long-range interactions. In: XXXII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 2009, Águas de Lindóia. XXXII ENCONTRO NACIONAL DE FÍSICA DA MATÉRIA CONDENSADA, 2009. p. 62-62.

13.
Frigori, R. B. ; Rizzi, L. G. ; Alves, N A . Extended Gaussian ensemble for the mean-field Blume-Capel model. In: XI Latin American Workshop on Nonlinear Phenomena (LAWNP?09), 2009, Buzios. LAWNP'09 ABSTRACT BOOK, 2009. p. 29.

14.
Rizzi, L. G. ; ALVES, N. A. . Aspectos críticos do modelo de Ising bidimensional com interações dipolares. In: XXXI Encontro Nacional de Fisica da Matéria Condensada, 2008, Águas de Lindóia. XXXI ENFMC - programa, 2008.

15.
ALVES, N. A.. Identificando estruturas de comunidades em redes. In: XXX Encontro Nacional de Fisica da Matéria Condensada, 2007, São Lourenço. XXX ENFMC - programa, 2007. p. 51-51.

Apresentações de Trabalho
1.
Alves, Nelson A.. Termodinâmica no enovelamento de proteínas. 2018. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

2.
Alves, Nelson A.. Termodinâmica no enovelamento de proteínas. 2016. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

3.
Alves, N A. Ubiquitin: looking for intermediate state and ST-WHAM data analysis. 2015. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

4.
Alves, N A. Conformações e termodinâmica de proteinas com propensidade a formar agregados. 2015. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

5.
Alves, N A. Termodinâmica da agregação de proteínas via a coarse-grained model. 2011. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

6.
Alves, N A. É possível obter calores específicos negativos ?. 2009. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

7.
ALVES, N. A.. Identificando estruturas de comunidade em redes. 2007. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

8.
Alves, N A. Protein folding problem: theoretical and numerical approaches to obtain and understand the native conformations. 2007. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

9.
Alves, N A. Enovelamento de proteínas. 2005. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

10.
ALVES, N. A.. Abordagem dinâmica de tempos curtospara o estudo do comportamento crítico de sistemas de spin e de polipeptídeos. 2004. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

11.
Alves, N A. Caracterização de estruturas de proteínas em 3D por meio de funções hidrofóbicas. 2004. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

12.
ALVES, N. A.. Universality and scaling in short-time critical dynamics. 2003. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

13.
Alves, N A. Aspectos termodinâmicos no enovelamento de proteínas. 2003. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

14.
ALVES, N. A.. Zeros de Yang-Lee e o problema "protein folding". 2002. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

15.
Alves, N A. Lattice QCD calculations of relevant parameters for the nucleation of the hadronic matter. 1998. (Apresentação de Trabalho/Outra).

16.
ALVES, N. A.. Séries temporais: tempo de autocorrelação integrado e descrição fractal. 1996. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

17.
ALVES, N. A.. Zeros da função partição e indices críticos via simulações de Monte Carlo. 1995. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

18.
ALVES, N. A.. Estudo de objetos fractais: Dimensão de auto similaridade e de Haussdorf-Besicovich. 1995. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

19.
ALVES, N. A.. Transições de fase em teorias de gauge a temperaturas finitas. 1993. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

20.
Alves, N A. Transições de fase em teorias de gauge a temperaturas finitas. 1993. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

21.
Alves, N A; ABDALLA, E. ; ABDALLA, M. C. B. ; CARNEIRO, C. E. I. . Determinação numérica do gap de massa no modelo CP1. 1987. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

22.
Alves, N A; ARATYN, H. ; ZIMERMAN, A. H. . Indice de Witten fracionário em alguns modelos solúveis. 1984. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

23.
Alves, N A. Quebra da supersimetria e o índice de Witten. 1984. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

24.
Alves, N A. Utilização de caixa esférica para a determinação de energias de ressonância. 1982. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

Demais trabalhos
1.
ALVES, N. A.. Técnicas de simulação e análise estatística de dados aplicados ao estudo de séries temporais e transições de fase. 1997 (Projeto Científico) .

2.
ALVES, N. A.. A quantização Estocástica (IFT- M.01/87). 1987 (Monografia) .

3.
ALVES, N. A.. Quebra da supersimetria e o Índice de Witten (IFT-agosto de 1984). 1984 (Monografia) .



Bancas



Participação em bancas de trabalhos de conclusão
Mestrado
1.
Giuliatti, G.; Costa, C. T. A.; Nelson A Alves; Simões, R.T.. Participação em banca de Elvira Regina Tamarozzi. Modelagem e análise in silico das variantes européias da oncoproteína E6 do Papilomavírus humano tipo 16. 2016. Dissertação (Mestrado em Genética) - Faculdade de Medincina de Ribeirão Preto.

2.
Dias, L. G.; ARANTES, G. M.; Alves, N A. Participação em banca de Paulo Siani. Estudo via dinamica molecular dos compostos Azul de Metileno e 1,9-Dimetil Azul de Metilleno em membrana de POPC. 2013. Dissertação (Mestrado em Quimica) - Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP.

3.
DRIGO FILHO, E.; Alves, N A; Machado, J.M.. Participação em banca de Marcelo Tozo de Araujo. Estudos dos métodos de solução da equação de Fokker-Planck linear e não-linear. 2011. Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - UNESP.

4.
DRIGO FILHO, E.; Alves, N A; Ruggiero, J. R.. Participação em banca de Franciele Polotto. Soluções da equação de Fokker-Planck para um potencial isoespectral ao potencial de Morse. 2009. Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - UNESP.

5.
DALMAZI, D.; ALVES, N. A.; Hott M B. Participação em banca de Fernanda Lopes Sá. Posição e densidade dos zeros de Yang-Lee do modelo de Blume-Emery-Griffiths unidimensional sobre anéis conexos e desconexos. 2007. Dissertação (Mestrado em Física) - Faculdade de Engenharia de Guaratinguetá.

6.
KREIN, G. I.; ALVES, N. A.; BRANDT, F. T. C.. Participação em banca de Nadiane Cristina Cassol Seewald. Um estudo sobre transições de fase dinâmicas e equações estocásticas de Ginzburg-Landau-Langevin. 2006. Dissertação (Mestrado em Fisica) - Instituto de Fisica Teorica Unesp.

7.
MARTINEZ, Alexandre Souto; ALVES, N. A.; Ramos F.E.. Participação em banca de Rodrigo Silva González. Difusão anômala: transição entre os regimes localizado e estendido na caminhada do turista unidimensional. 2006. Dissertação (Mestrado em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP.

8.
LYRA, J. L.; ALVES, N. A.; CARNEIRO, Carlos Eugênio Imbassahy. Participação em banca de Francisco Dellatorre Borges. O comportamento das flutuações dos campos em modelos de campos escalares. 2002. Dissertação (Mestrado em Física) - Universidade de São Paulo.

9.
ALVES, N. A.; LYRA, J. L.; OLIVEIRA, M. J.. Participação em banca de José Cleriston Campos de Souza. Pontos críticos de transições de fase na teoria quântica de campos da rede Euclidiana. 2002. Dissertação (Mestrado em Física) - Universidade de São Paulo.

10.
LYRA, J. L.; ALVES, N. A.; TEOTÔNIO SOBRINHO, P.. Participação em banca de Edgar Rodolfo Randán Sanabria. Trivialidade do modelo sigma não-linear SO(2) na rede Euclidiana em d=3 e d=4.. 2001. Dissertação (Mestrado em Física) - Universidade de São Paulo.

11.
LYRA, J. L.; ALVES, N. A.; CARNEIRO, Carlos Eugênio Imbassahy. Participação em banca de Silvana Peres. O conceito de partícula na teoria quântica de campos na rede Euclidiana. 2000. Dissertação (Mestrado em Física) - Universidade de São Paulo.

12.
ALVES, N. A.; CALIRI, Antonio; PASSOS, A. D. C.. Participação em banca de Eliamar Francelino do Prado. Regras locais e globais na difusão epidêmica. 1999. Dissertação (Mestrado em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Universidade de São Paulo.

13.
DRUGOWICH DE FELICIO, J. R. D.; ALVES, N. A.; LIBERO, V. L.. Participação em banca de Claudia dos Santos Simões. Algoritmo genético e formulação entrópica aplicados a vidros de spins. 1996. Dissertação (Mestrado em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Universidade de São Paulo.

Teses de doutorado
1.
Pereira Leite, V. B.; CHAHINE, J.; Pascutti, P. G.; Dias, L. G.; Alves, Nelson A.. Participação em banca de Vinicius Martins de Oliveira. Efeito das interações eletrostáticas e de pH no enovelamento e estabilidade de proteínas. 2017. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - UNESP.

2.
SJ de Carvalho; Ruggiero Neto, J; DRIGO FILHO, E.; Alves, Nelson A.; Dias, L. G.. Participação em banca de Daniel Lucas Zago Caetano. Estudo das interações eletrostáticas em superfícies e macromoléculas por meio de simulações de Monte Carlo. 2017. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - UNESP.

3.
DRIGO FILHO, E.; Alves, N A; OLIVEIRA, M. J.; BASTOS, W. D.; Ruggiero Neto, J. Participação em banca de Marcelo Tozo de Araujo. Aplicação da equação de Fokker-Planck no estudo de canais iônicos. 2015. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - UNESP.

4.
NEVES, U. P. C.; ALVES, N. A.; R. Tinós; CALIRI, Antonio; RIBEIRO, E. M. S.. Participação em banca de Sandro Martinelli Reia. Atividade, transição de fase e efeito de midia em um modelo sociocultural. 2015. Tese (Doutorado em Física Aplicada à Medicina e Biologia (FAMB)) - Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP.

5.
DRIGO FILHO, E.; CORNELIO, M. L.; LIMA, M. F.; ALVES, N. A.; MARTINHO, H. S.. Participação em banca de Fabricio Ramos Silva. Confinamento molecular e sitio ativo de proteinas. 2014. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

6.
DALMAZI, D.; Dutra, A.S.; Hott M B; Alves, N A; Sarandy, M.S.. Participação em banca de Fernanda Lopes Sá. Novo comportamento crítico da singularidade de Yang-Lee. 2011. Tese (Doutorado em Física) - Faculdade de Engenharia de Guaratinguetá (UNESP).

7.
Pereira Leite, V. B.; ARAUJO, A. F. P.; Alves, N A; Scott, L.P.B.; Ruggiero, J. R.. Participação em banca de Ronaldo Junio de Oliveira. Estudo do coeficiente de difusão no enovelamento de proteína. 2011. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - UNESP.

8.
Silva, C.H.T.P.; Montanari, C. A.; SILVA, M.; Alves, N A; Valim, Y.M.L.. Participação em banca de Vinicius Barreto da Silva. Modelagem molecular, síntese e avaliação da atividade biológica de potenciais antineoplásticos com a proteína hnRNP K e culturas de células tumorais. 2011. Tese (Doutorado em Química e Física Biológica) - Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto.

9.
T. Mendes; T. Tomé; G. Francisco; ALVES, N. A.; ONODY, R. N.. Participação em banca de Wanderson Gonçalves WanzellerI. Dinâmica de percolação e comportamento crítico. 2007. Tese (Doutorado em Doutorado em Física) - Fundação Instituto de Física Teórica.

10.
ALVES, N. A.; CALIRI, Antonio; I. Borissevitch; MF Colombo; CHAHINE, J.. Participação em banca de Maria Eulália Pinto Tarragó. Potencial estéreo-hidrofóbico e propriedades topológicas no enovelamento de proteínas. 2003. Tese (Doutorado em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Universidade de São Paulo.

11.
ALVES, N. A.; DRUGOWICH DE FELICIO, J. R. D.; OLIVEIRA, M. J.; PMC de Oliveira; R Dickman. Participação em banca de Roberto da Silva. Universalidade e leis de escala em sistemas fora do equilibrio. 2002. Tese (Doutorado em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Universidade de São Paulo.

12.
DRUGOWICH DE FELICIO, J. R. D.; ALVES, N. A.; CAPARICA, A. A.; CHAHINE, J.; FIGUEIREDO, W.. Participação em banca de Claudia dos Santos Simões. Caracterização do comportamento crítico dinâmico para generalizações não triviais do modelo de Ising. 2001. Tese (Doutorado em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Universidade de São Paulo.

Qualificações de Doutorado
1.
Dias, L. G.; da Silva, F.L.B.; Nelson A Alves. Participação em banca de Paulo Siani. An overview of molecular dynamics simulations of oxidized lipid systems, with a comparison of ELBA and MARTINI force fields for coarse grained lipid simulations. 2016. Exame de qualificação (Doutorando em Quimica) - Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP.

2.
CALIRI, Antonio; SILVA, M. A. A.; ALVES, N. A.. Participação em banca de Sandro Martinelli Reia. Caracterizacao de modelo socio-cultural. 2013. Exame de qualificação (Doutorando em Física Aplicada à Medicina e Biologia (FAMB)) - Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP.

3.
HUGUENIN, F. C.; OLIVI, P.; Alves, N A. Participação em banca de Nelson Alexandre Galiote Silva. Nanomaterials for Lithium-air batteries. 2013. Exame de qualificação (Doutorando em Quimica) - Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP.

4.
Alves, N A; Silva, C.H.T.P.; PINHEIRO, D. G.. Participação em banca de Nilson Nicolau Junior. Modelling and molecular dynamics of the intrinsically disordered E7 proteins form high- and low-risk types of human papillomavirus (HPV). 2012. Exame de qualificação (Doutorando em Genética) - Faculdade de Medincina de Ribeirão Preto.

5.
Felipe, J. C.; Alves, N A; R. Tinós. Participação em banca de Tenysson Will de Lemos. Métricas de similaridade em corregistro aplicado à elastografia. 2011. Exame de qualificação (Doutorando em Física Aplicada à Medicina e Biologia (FAMB)) - Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP.

6.
Carneiro, A.A.O.; Felipe, J. C.; Alves, N A. Participação em banca de Ivan Christensen Nali. Registro multimodal de imagens pela maximização da medida qualitativa-quantitativa de informação mútua. 2009. Exame de qualificação (Doutorando em Física Aplicada à Medicina e Biologia (FAMB)) - Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP.

7.
ALVES, N. A.; NEVES, Ubiraci Pereira da Costa; ALVES, D.. Participação em banca de Cesar Augusto Sangaletti Terçariol. Momentos exatos numa caminhada aleatória em tempo contínuo com memória completa de seu histórico. 2007. Exame de qualificação (Doutorando em Física Aplicada à Medicina e Biologia (FAMB)) - Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP.

8.
ALVES, N. A.; MARTINEZ, Alexandre Souto; NEVES, Ubiraci Pereira da Costa. Participação em banca de Mônica Guimarães Campiteli. Auto-similaridade em redes complexas. 2005. Exame de qualificação (Doutorando em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Universidade de São Paulo.

9.
ALVES, N. A.. Participação em banca de Marcelo Takara. Estudos de Espectroscopia de Correlação de Fluorescência de Ligações de Peptídeo e Proteína em Vesículas Fosfolipídicas. 2004. Exame de qualificação (Doutorando em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Universidade de São Paulo.

10.
ALVES, N. A.; I. Borissevitch; Amando S Ito. Participação em banca de Maria Eulália Pinto Tarragó. Parâmetros topológicos do estado nativo e taxa de enovelamento de proteínas globulares. 2002. Exame de qualificação (Doutorando em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Universidade de São Paulo.

11.
ALVES, N. A.; SILVA, M. A. A.; ALVES, D.. Participação em banca de Roosevelt Alves da Silva. Origem da força nativa que governa o enovelamento de proteínas. 2001. Exame de qualificação (Doutorando em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Universidade de São Paulo.

12.
ALVES, N. A.; ALVES, D.; KINOUCHI FILHO, O.. Participação em banca de Roberto da Silva. Persistência no modelo de reação difusão unidimensional A+B -> /0. 2001. Exame de qualificação (Doutorando em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Universidade de São Paulo.

13.
ALVES, N. A.; NEVES, Ubiraci Pereira da Costa; KINOUCHI FILHO, O.. Participação em banca de Osvaldo Eduardo Aielo. Estatística de extinção e sobrevivência em sistemas Lotka-Volterra. 2000. Exame de qualificação (Doutorando em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Universidade de São Paulo.

14.
ALVES, N. A.; CALIRI, Antonio; SILVA FILHO, Antonio Carlos Roque da. Participação em banca de Cláudia dos Santos Simões. Limiar de erro em populações finitas. 1998. Exame de qualificação (Doutorando em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Universidade de São Paulo.

Qualificações de Mestrado
1.
Giuliatti, G.; Silva JR, W. A.; Alves, Nelson A.. Participação em banca de Jadson Carlos dos Santos. Análise da tetramerização da proteína de membrana CD38 em sua porção extracelular por meio de docking molecular. 2017. Exame de qualificação (Mestrando em Genética) - Faculdade de Medincina de Ribeirão Preto.

Trabalhos de conclusão de curso de graduação
1.
Cléver R. G. de Farias; ALVES, N. A.; R. Tinós. Participação em banca de Ricardo Cacheta Waldemarin.Desenvolvimento de um sistema de distribuição de cargas para a execução de simulações moleculares. 2011. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado em Informática Biomédica) - Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP.

2.
Giuliatti, G.; Silva, C.H.T.P.; Alves, N A. Participação em banca de Mariana Laureano de Souza.Modelagem por homologia de estruturas protéicas do veneno de Apis mellifera. 2008. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Informatica Biomedica) - Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP.

3.
Coelho-Castelo A.; Giuliatti, G.; Alves, N A. Participação em banca de Renata Ariza Marques Rossetti.Predição da estrutura 3D da proteína Hsp65 e da estrutura secundária de seu RNA mensageiro usando análises in silico. 2008. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Informatica Biomedica) - Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP.

4.
Alves, N A; Murta Junior, L.O.; Giuliatti, G.. Participação em banca de Olavo Augusto Feitosa.Estudos de modelagem molecular do marcador set e ligantes em câncer de cabeça e pescoço. 2007. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Informatica Biomedica) - Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP.

5.
R. Tinós; Giuliatti, G.; ALVES, N. A.. Participação em banca de Gabriela Felix dos Santos.Classificação das relações de inibição entre plantas medicinais e venenos de animais via redes neurais artificiais. 2006. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Informatica Biomedica) - Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP.

6.
ALVES, N. A.; Giuliatti, G.; CALIRI, Antonio. Participação em banca de Felipe Elias Cardoso dos Santos.Classificação Vetorial das seqüências primarias de proteínas. 2006. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Informatica Biomedica) - Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP.



Participação em bancas de comissões julgadoras
Concurso público
1.
Gelamo, R.V.; Mulato, M; Nelson A Alves. Professor do magistério superior ? Classe A. 2017. Universidade Federal do Triângulo Mineiro.

2.
Alves, N A; SALES, N. L. L.; SIQUEIRA JUNIOR, J. R.. Concurso de Professor Adjunto. 2015. Universidade Federal do Triângulo Mineiro.

3.
Condeles, J. Fernando; Mulato, Marcelo; Alves, N A; Lourenço, Sidney A.; Rossi, Alexandre. Comissão Julgadora do Concurso de Professor Adjunto - Univ. Fed. Triângulo Mineiro - Disciplina 2.2. 2009. Universidade Federal do Triângulo Mineiro.

4.
Condeles, J. Fernando; Mulato, Marcelo; Alves, N A; Lourenço, Sidney A.; Rossi, Alexandre. Comissão Julgadora do Concurso de Professor Adjunto - Univ. Fed. Triângulo Mineiro - Disciplina 2.3. 2009. Universidade Federal do Triângulo Mineiro.

5.
Mulato, Marcelo; Alves, N A; Lourenço, Sidney A.; Condeles, J. Fernando; Jorge, David C.. Comissão Julgadora do Concurso de Professor Adjunto - Univ. Fed. Triângulo Mineiro- Discipl;ina Física/Laboratória e Física/Termodinâmica. 2009. Universidade Federal do Triângulo Mineiro.

6.
ALVES, N. A.; ONODY, R. N.; CALIRI, Antonio; PMC de Oliveira; Pereira Leite, V. B.. Comissão Julgadora do Concurso de Professor Doutor junto ao departamento de Física e Matemática - área de conhecimento: Mecânica Clássica e Física Estatística. 2008. Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP.

7.
MARTINEZ, Alexandre Souto; CALIRI, Antonio; CARNEIRO, Carlos Eugênio Imbassahy; ALVES, N. A.; LÍBERO, Valter Luiz. Comissão Julgadora do Concurso de Professor Doutor junto ao departamento de Física e Matemática - área de conhecimento: Mecânica Estatística Aplicada a Moléculas e Sinais Biológicos. 2005. Universidade de São Paulo.

8.
ALVES, N. A.; CALIRI, Antonio; LAVRADOR, M. A.. Processo seletivo para escolha de um docente, professor doutor em RTP, junto ao Departamento de Fisica e Matemática- FFCLRP - USP, na área de Estatística Aplicada, edital FFCLRP 11/2002.. 2002. Universidade de São Paulo.

9.
ALVES, N. A.. Concurso Público para contratação de Professor assistente em RDIDP no Departamento de Física e Química, Faculdade de Engenharia, UNESP - Campus de Ilha Solteira. 2002. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Livre docência
1.
GOLDMAN, G. H.; SILVA, M. A. A.; SILVA, A. B. F.; Alves, Nelson A.; WARD, R. J.. Concurso de Livre-Docencia. 2016. Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto.

2.
Ruggiero Neto, J; DRIGO FILHO, E.; ALVES, N. A.; CALIRI, Antonio; Amando S Ito. Concurso de Livre-Docência em Física. 2007. Universidade Estadual Paulista.

3.
Sigulem D.; MARIN, H. F.; Triana, A.J.M.; SILVA FILHO, Antonio Carlos Roque da; ALVES, N. A.. Concurso de Livre-docência do Dep. Física e Matemática, na área de conhecimento Ciências de Computação, especialidade Processamento de Sinais Biológicos. 2006. Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP.

4.
SILVA FILHO, Antonio Carlos Roque da; CALIRI, Antonio; OLIVEIRA, Mário José de; ALVES, N. A.; COSTA, Oswaldo Luiz Do Valle. Concurso de Livre-docência do Dep. Física e Matemática, na área de conhecimento Física, especialidade Física Estatística e Computacional. 2005. Universidade de São Paulo.

Outras participações
1.
ALVES, N. A.. Exame de seleção candidatos à pós-graduação FAMB (Física Aplicada à Medicina e Biologia). 2013. Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP.

2.
Alves, Nelson A.; MURTA JUNIOR, L. O.; MELLO, R. F.; PEREZ, E. C. B.; YOSETAKE, F.. Concurso publico para Tecnico de Informatica para o Departamento de Física, FFCLRP - Ribeirão Preto. 2013. Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP.

3.
Alves, N A. Exame de seleção candidatos à pós-graduação FAMB (Física Aplicada à Medicina e Biologia). 2011. Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP.

4.
Alves, N A. Exame de seleção candidatos à pós-graduação FAMB (Física Aplicada à Medicina e Biologia). 2010. Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP.

5.
ALVES, N. A.. Exame de seleção candidatos à pós-graduação FAMB (Física Aplicada à Medicina e Biologia). 2006. Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP.

6.
ALVES, N. A.. Processo Seletivo para escolha de um Auxiliar de Ensino em RTP, edital FFCLRP n0 50/2004, Área: Matemática Computacional. 2004. Universidade de São Paulo.

7.
ALVES, N. A.. Processo Seletivo de Funcionário no Departamento de Física e Matemática, FFCLRP - Ribeirão Preto. 2002. Universidade de São Paulo.

8.
ALVES, N. A.. Exame de seleção candidatos à pós-graduação FAMB (Física Aplicada à Medicina e Biologia). 2001. Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP.

9.
ALVES, N. A.. Processo Seletivo de Funcionário no Departamento de Física e Matemática, FFCLRP - Ribeirão Preto. 1997. Universidade de São Paulo.



Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
Encontro de Outono da Sociedade Brasileira de Física.Structural interconversion in Alzheimer?s amyloid-Beta(16-35) peptide in an aqueous solution. 2018. (Encontro).

2.
Encontro de Outono da Sociedade Brasileira de Física.A molecular dynamics analysis of human and porcine Islet Amyloid Polypeptides. 2018. (Encontro).

3.
XLIII Congresso da Sociedade Brasileira de Biofísica. In silico comparative study of human and porcine amylin. 2018. (Congresso).

4.
Workshop Physics and biology of proteins.Structural conversion of Abeta(1-40) and the role of its unstructured residues. 2017. (Oficina).

5.
XXXVIII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada.Microcanonical thermostatistics analysis from canonical simulations without histograms. 2015. (Encontro).

6.
22º Simpósio internacional de Iniciação Científica da USP (SIICUSP).Participação como avaliador de pôsteres. 2014. (Simpósio).

7.
21º Simpósio internacional de Iniciação Científica da USP (SIICUSP).Participação como avaliador de pôsteres. 2013. (Simpósio).

8.
21º Simpósio internacional de Iniciação Científica da USP (SIICUSP).Simulações de dinâmica molecular com GROMACS dos peptideos Abeta(1-40) e Abeta(1-42). 2013. (Simpósio).

9.
XXXVI Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada.Role of flexible regions in native conformations for the initial dimerization of identical proteins. 2013. (Encontro).

10.
20º Simpósio internacional de Iniciação Científica da USP (SIICUSP).Participação como avaliador de pôsteres. 2012. (Simpósio).

11.
XXXV Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada.Microcanonical thermostatistics of protein-like heteropolymers from replica exchange Monte Carlo simulations. 2012. (Encontro).

12.
XXXV Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada.Partition function zeros approach in the 2D Ising model with dipole interactions and the stripe-tetragonal phase transition. 2012. (Encontro).

13.
19º Simpósio internacional de Iniciação Científica da USP (SIICUSP).Participação como avaliador de pôsteres. 2011. (Simpósio).

14.
IX Semana de Informática Biomédica, Depto de Computação e Matemática.Aplicações dos modelos de rede elástica em proteínas. 2011. (Outra).

15.
IX Semana de Informática Biomédica, Depto de Computação e Matemática.ermodinâmica do processo de agregação de proteínas. 2011. (Outra).

16.
Simpósio Interdisciplinar Física + Bioinformática 2011.ermoestatística microcanônica via simulações de Monte Carlo canônicas. 2011. (Simpósio).

17.
Simpósio Interdisciplinar Física + Bioinformática 2011.Estudo da relação entre hidrofobicidade e fatores-B experimentais para proteínas. 2011. (Simpósio).

18.
XXXIII Encontro Nacional de Fisica da Materia Condensada.Elastic network model with relative weights for the bonded and non-bonded interactions between residues in proteins. 2010. (Encontro).

19.
XXXIII Encontro Nacional de Fisica da Materia Condensada.Microcanonical simulations of protein folding and aggregation. 2010. (Encontro).

20.
XXXIII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada.Feedback-optimized multicanonical Monte Carlo simulations. 2010. (Encontro).

21.
17º Simpósio internacional de Iniciação Científica da USP (SIICUSP).Participação como avaliador de pôsteres. 2009. (Simpósio).

22.
I Escola e Conferência em Modelagem Computacional.Extended gaussian ensemble and phase transitions in systems with long-range interactions. 2009. (Outra).

23.
I Escola e Conferência em Modelagem Computacional.Dissimilarity score to identify protein domains: a network approach. 2009. (Outra).

24.
XXXII Encontro Nacional de Fisica da Materia Condensada.Extended gaussian ensemble and phase transitions in systems with long-range interactions. 2009. (Encontro).

25.
16º Simpósio internacional de Iniciação Científica da USP (SIICUSP).Modelagem de proteínas por sequências binárias e análise de correlações. 2008. (Simpósio).

26.
16º Simpósio internacional de Iniciação Científica da USP (SIICUSP).Participação como avaliador de pôsteres. 2008. (Simpósio).

27.
XXXI Encontro Nacional de Fisica da Materia Condensada.Aspectos críticos do modelo de Ising bidimensional com interações dipolares. 2008. (Encontro).

28.
15º Simpósio internacional de Iniciação Científica da USP (SIICUSP).Caracterização da estabilidade de proteínas por meio de redes complexas. 2007. (Simpósio).

29.
15º Simpósio internacional de Iniciação Científica da USP (SIICUSP).Participação como avaliador de pôsteres. 2007. (Simpósio).

30.
II Encontro Nacional de Física Teórica e Computacional.Protein folding problem: theoretical and numerical approaches to obtain and understand the native conformations. 2007. (Encontro).

31.
14º Simpósio internacional de Iniciação Científica da USP (SIICUSP).Participação como avaliador de pôsteres. 2006. (Simpósio).

32.
14º Simpósio internacional de Iniciação Científica da USP (SIICUSP).Classificação Vetorial em Sequências Primárias de Proteínas. 2006. (Simpósio).

33.
X Congresso brasileiro de informática em Saúde (X CBIS). Classificação vetorial das seqüências primárias de proteínas. 2006. (Congresso).

34.
II Escola de Computação de alto desempenho para sistemas complexos.Enovelamento de proteínas. 2005. (Outra).

35.
XXVII Encontro Nacional de Fisica da Matéria Condensada.Caracterização de estruturas de proteínas em 3D por meio de funções hidrofóbicas. 2004. (Encontro).

36.
Escola de computação de alto desempenho para sistemas complexos.Aspectos termodinâmicos no enovelamento de proteínas. 2003. (Outra).

37.
Festschrift for Abraham Hirz Zimerman.Lattice QCD calculations of relevant parameters for the nucleation of the hadronic matter. 1998. (Outra).

38.
3rd Rio de Janeiro Workshop on Relativistic Aspects of Nuclear Physics.Lattice QCD calculations of relevant parameters for the nucleation of the hadronic matter. 1993. (Outra).

39.
TASI-89 (Theoretical Advanced Study Institute in Elementary Particle Physics). 1989. (Outra).

40.
4a Escola de Verão Jorge André Swieca - Partículas e Campos. 1987. (Outra).

41.
VIII Encontro Nacional de Fisica de partículas e Campos.Determinação numérica do gap de massa no modelo CP1. 1987. (Encontro).

42.
VII Encontro Nacional de Física de Partículas e Campos. 1986. (Encontro).

43.
3a Escola de Verão Jorge André Swieca - Partículas e Campos. 1985. (Outra).

44.
VI Encontro Nacional de Fisica de Partículas e Campos. 1985. (Encontro).

45.
V Encontro Nacional de Fisica de Partículas e Campos.Indice de Witten fracionário em alguns modelos solúveis. 1984. (Encontro).

46.
VII Congresso Estudantil de Fisica Teórica. Quebra da supersimetria e o índice de Witten. 1984. (Congresso).

47.
2a Escola de Verão Jorge André Swieca - Partículas e Campos. 1983. (Outra).

48.
IV Encontro Nacional de Física de Partículas e Campos. 1983. (Encontro).

49.
V Congresso Estudantil de Física Teórica (IFT). Utilização de caixa esférica para a determinação de energias de ressonância. 1982. (Congresso).


Organização de eventos, congressos, exposições e feiras
1.
DRIGO FILHO, E. ; FP de Souza ; SJ de Carvalho ; ARNI, R. K. ; H Cabral ; G Weber ; Nelson A Alves ; H Verli . SIFBio2011 ? Simpósio Interdisciplinar de Física e Bioinformática. 2011. (Congresso).

2.
Nelson A Alves; JR Drugowich de Felicio . FAMB 15 ANOS. 2001. (Outro).



Orientações



Orientações e supervisões concluídas
Dissertação de mestrado
1.
Jacyana Saraiva Marthes Fonseca. Zeros de Fisher e aspectos críticos do modelo de Ising dipolar. 2011. Dissertação (Mestrado em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Nelson Augusto Alves.

2.
Matheus Rodrigues de Mendonça. Análise de modos normais em proteínas. 2010. Dissertação (Mestrado em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Nelson Augusto Alves.

3.
Leandro Gutierrez Rizzi. Simulações numéricas de Monte Carlo aplicadas no estudo das transições de fase do modelo de Ising dipolar bidimensional. 2009. Dissertação (Mestrado em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Nelson Augusto Alves.

4.
Jeaneti Pimenta Pereira Navas Ferrite. Transições de fase em sistemas pequenos e análise bootstrap dos zeros da função de partição. 2002. Dissertação (Mestrado em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Universidade de São Paulo, . Orientador: Nelson Augusto Alves.

5.
Marcelo Oliveira de Morais. Análise de séries temporais por meio da transformada de wavelets. 2001. Dissertação (Mestrado em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Nelson Augusto Alves.

Tese de doutorado
1.
Matheus Rodrigues de Mendonça. Análise de modos normais dos movimentos conformacionais em proteínas. 2015. Tese (Doutorado em Física Aplicada à Medicina e Biologia (FAMB)) - Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Nelson Augusto Alves.

2.
Leandro Gutierrez Rizzi. Algoritmos de Monte Carlo generalizados e criticalidade no modelo de Ising dipolar e em proteinas descritas por um modelo minimo. 2013. Tese (Doutorado em Física Aplicada à Medicina e Biologia (FAMB)) - Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Nelson Augusto Alves.

3.
Luiz Carlos Büttner Mostaço Guidolin. Identificação de domínios em proteínas com redes complexas. 2011. Tese (Doutorado em Física Aplicada à Medicina e Biologia (FAMB)) - Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP, . Orientador: Nelson Augusto Alves.

4.
Rafael Bertolini Frigori. Simulações microcanônicas de proteínas. 2010. Tese (Doutorado em Física Aplicada à Medicina e Biologia (FAMB)) - Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP, . Orientador: Nelson Augusto Alves.

Supervisão de pós-doutorado
1.
Rafael Bertolini Frigori. 2017. Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP, . Nelson Augusto Alves.

Trabalho de conclusão de curso de graduação
1.
Felipe Elias Cardoso dos Santos. Classificação vetorial das sequências primárias de proteínas. 2006. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Informatica Biomedica) - Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP. Orientador: Nelson Augusto Alves.

Iniciação científica
1.
João Pedro Fiorelli. Simulação de dinâmica molecular de proteínas beta-amilóides e de alguns dos seus mutantes. 2016. Iniciação Científica. (Graduando em Física Médica) - Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP, Programa Unificado de Bolsas. Orientador: Nelson Augusto Alves.

2.
Lucas Dadalt Morero. Estudo termodinâmico das proteínas Beta-amiloides via simulações de dinâmica molecular. 2015. Iniciação Científica. (Graduando em Física Médica) - Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP, Bolsa Institucional USP. Orientador: Nelson Augusto Alves.

3.
João Pedro Fiorelli. Simulação de dinâmica molecular de proteínas globulares. 2015. Iniciação Científica. (Graduando em Física Médica) - Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP, Programa Unificado de Bolsas. Orientador: Nelson Augusto Alves.

4.
Miriã dos Santos Godoi. Simulação de dinâmica molecular de proteínas globulares. 2015. Iniciação Científica. (Graduando em Física Médica) - Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP, Programa Unificado de Bolsas. Orientador: Nelson Augusto Alves.

5.
Guilherme Casabona Martins. Simulação de dinâmica molecular de proteínas globulares. 2015. Iniciação Científica. (Graduando em Física Médica) - Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP, Programa Unificado de Bolsas. Orientador: Nelson Augusto Alves.

6.
Lucas Dadalt Morero. Estudo do campo de forcas no GROMACS e simulacao dos peptideos Tyr-Gly-Phe-Met (met-enkphalin) e Ab(1-42). 2014. Iniciação Científica. (Graduando em Física Médica) - Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP, Bolsa Institucional USP. Orientador: Nelson Augusto Alves.

7.
Pedro Henrique Rodrigues da Silva. Estudo do campo de forc,as no GROMACS e simulacao do peptideo Ab(1-42). 2012. Iniciação Científica. (Graduando em Física Médica) - Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP, Reitoria da USP. Orientador: Nelson Augusto Alves.

8.
Luander Bernardes. Estabilidade e correlações em sequências binárias de modelos simplificados de proteínas. 2008. Iniciação Científica. (Graduando em Física Médica) - Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Nelson Augusto Alves.

9.
Vitor Soares Pereira. Caracterização da estabilidade das proteínas por meio de redes complexas. 2007. Iniciação Científica. (Graduando em Informatica Biomedica) - Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Nelson Augusto Alves.

10.
Felipe Elias Cardoso dos Santos. Classificação vetorial das sequências primárias de proteínas. 2006. Iniciação Científica. (Graduando em Informatica Biomedica) - Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Nelson Augusto Alves.

11.
Maico de Oliveira Pita. Caracterização da conformação nativa de proteínas por meio de redes complexas. 2005. 0 f. Iniciação Científica. (Graduando em Fisica Medica) - Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Nelson Augusto Alves.

Orientações de outra natureza
1.
Matheus Rodrigues de Mendonça. Estágio Supervisionado na disciplina Física Estatística. 2010. Orientação de outra natureza. (Física Médica) - Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP. Orientador: Nelson Augusto Alves.

2.
Jacyana Saraiva Marthes Fonseca. Estágio Supervisionado na disciplina Física Estatística. 2009. Orientação de outra natureza. (Física Médica) - Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP. Orientador: Nelson Augusto Alves.

3.
Luiz Carlos Büttner Mostaço Guidolin. Estágio Supervisionado na disciplina Física Estatística. 2008. Orientação de outra natureza. (Física Médica) - Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP. Orientador: Nelson Augusto Alves.

4.
Ivan Paulo Akatsu. Estágio Supervisionado na disciplina Estatística II. 2008. Orientação de outra natureza. (Biologia) - Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP. Orientador: Nelson Augusto Alves.

5.
Leandro Rizzi. Estágio Supervisionado na disciplina Física Estatistica. 2007. Orientação de outra natureza - Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP, Universidade de São Paulo. Orientador: Nelson Augusto Alves.

6.
Brenno Caetano Troca Cabella. Estágio Supervisionado na disciplina Física Estatistica. 2006. Orientação de outra natureza - Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP, Universidade de São Paulo. Orientador: Nelson Augusto Alves.

7.
Nattan Roberto Caetano. Estágio Supervisionado na disciplina Física Matemática I. 2003. Orientação de outra natureza - Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP, Universidade de São Paulo. Orientador: Nelson Augusto Alves.

8.
Roberto da Silva. Estágio Supervisionado na disciplina Estatistica Aplicada II. 2001. Orientação de outra natureza - Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP. Orientador: Nelson Augusto Alves.

9.
Lisiane Junges Subtil. Estágio Supervisionado na disciplina Física Matemática I. 2001. Orientação de outra natureza - Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP. Orientador: Nelson Augusto Alves.

10.
Roberto da Silva. Estágio Supervisionado na disciplina Estatistica I. 2000. Orientação de outra natureza - Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP. Orientador: Nelson Augusto Alves.



Educação e Popularização de C & T



Apresentações de Trabalho
1.
Alves, Nelson A.. Termodinâmica no enovelamento de proteínas. 2018. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).



Outras informações relevantes


1) Vice-coordenador do programa de pós-graduação FAMB de 09/2000 a 12/2001.
2) Coordenador do programa de pós-graduação em Física Aplicada à Medicina e Biologia (FAMB) do Depto de Física e Matemática (FFCLRP-USP) de 12/2001 a 12/2003
3) Pesquisador visitante na Michigan Technological University, MTU, (EUA), em 2003.
  Recurso financeiro: Grant de U.H.E. Hansmann (National Institutes of Heath).



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