Gerald Weber

Bolsista de Produtividade em Pesquisa do CNPq - Nível 2

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  • Última atualização do currículo em 08/11/2018


Possui graduação, mestrado e doutorado em Física pela Universidade Estadual de Campinas (1984,1987,1990). Atualmente é professor da Universidade Federal de Minas Gerais. Trabalha em biofísica de DNA e RNA, especialmente com modelos mesoscópicos. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Gerald Weber
Nome em citações bibliográficas
WEBER, G.;Weber, G.;WEBER, GERALD

Endereço


Endereço Profissional
Universidade Federal de Minas Gerais, Instituto de Ciências Exatas, Departamento de Física.
Av. Antônio Carlos, 6627
Pampulha
31270901 - Belo Horizonte, MG - Brasil
Telefone: (31) 96462277
URL da Homepage: sites.google.com/site/geraldweberufmg/


Formação acadêmica/titulação


1987 - 1990
Doutorado em Física.
Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.
Título: Propriedades de impurezas rasas em semicondutores e heteroestruturas semicondutoras, Ano de obtenção: 1990.
Orientador: Luiz Eduardo Moreira Carvalho de Oliveira.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
Palavras-chave: Impurezas rasas.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
1985 - 1987
Mestrado em Física.
Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.
Título: Aplicação do método Monte Carlo no estudo de corrente induzida por feixe eletrônico em dispositivos semicondutores,Ano de Obtenção: 1987.
Orientador: Carlos Alberto Ribeiro.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
Palavras-chave: Metodo Monte Carlo.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
1980 - 1984
Graduação em Física.
Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.


Pós-doutorado


1993 - 1996
Pós-Doutorado.
Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
1991 - 1993
Pós-Doutorado.
Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
1990 - 1991
Pós-Doutorado.
University of Oxford, OX, Inglaterra.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra


Atuação Profissional



Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.
Vínculo institucional

2009 - Atual
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Adjunto, Regime: Dedicação exclusiva.

Vínculo institucional

1991 - 1993
Vínculo: Bolsista recém-doutor, Enquadramento Funcional: Bolsista Recém-Doutor, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

03/2017 - 07/2017
Ensino, Física, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Metodologia do Ensino de Física
Recursos didáticos para o Ensino de Física A
08/2016 - 12/2016
Ensino, Física, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Metodologia do Ensino de Física
Recursos didáticos para o Ensino de Física A
03/2016 - 07/2016
Ensino, Física, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Metodologia do Ensino de Física
Recursos didáticos para o Ensino de Física A
08/2015 - 12/2015
Ensino, Física, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Metodologia do Ensino de F[isica
Recursos didáticos para o Ensino de Física A
03/2015 - 07/2015
Ensino, Física, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Metodologia do Ensino de Física (1 turma, 4h/semana)
03/2015 - 07/2015
Ensino, Física, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Estruturação de Apresentações Didáticas em Física (1 turma, 4h/semana)
08/2014 - 12/2014
Ensino, Física, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Metodologia do Ensino de Física (2 turmas, 4h/semana)
02/2014 - 06/2014
Ensino, Física, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Metodologia do Ensino de Física (1 turma, 4h/semana)
02/2014 - 06/2014
Ensino, Física, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Tópicos em Ensino de Física (1 turma, 4h/semana)
08/2013 - 12/2013
Ensino, Física, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Metodologia do Ensino de Física (2 turmas, 4 h/semana)
03/2013 - 07/2013
Ensino, Física, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
FIS066 Fundamentos de Termodinâmica (2 turmas, 2h/semana)
03/2013 - 07/2013
Ensino, Física, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Tópicos de ensino de física (1 turma 4h/semana)
08/2012 - 12/2012
Ensino, Física, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
FIS132 Metodologia do Ensino de Física (4 h/semanais 2 turmas)
03/2012 - 07/2012
Ensino, Física, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Tópicos de ensino de física (1 turma 4h/semana)
03/2012 - 07/2012
Ensino, Física, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
FIS066 Fundamentos de Termodinâmica (2 h/semanais 2 turmas)
08/2011 - 12/2011
Ensino, Física, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
FIS132 Metodologia do Ensino de Física (2 turmas 4h/semana)
08/2010 - 12/2011
Ensino, Física, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
FIS132 Metodologia do Ensino de Física (4 h/semanais 2 turmas)
03/2011 - 07/2011
Ensino, Física, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Tópicos de ensino de física (1 turma 4h/semana)
03/2011 - 07/2011
Ensino, Física, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
FIS066 Fundamentos de Termodinâmica (2 turmas, 2h/semana)
03/2010 - 07/2010
Ensino, Física, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
FIS066 Fundamentos de Termodinâmica (2 h/semanais 3 turmas)
08/2009 - 12/2009
Ensino, Física, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
FIS132 Metodologia do Ensino de Física (4 h/semanais 1 turma)
10/1991 - 09/1993
Pesquisa e desenvolvimento , Instituto de Ciências Exatas, Departamento de Física.

01/1993 - 06/1993
Ensino, Física, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Física Geral II
09/1992 - 12/1992
Ensino, Física, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Física Geral I
04/1992 - 08/1992
Ensino, Física, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Física Geral I
10/1991 - 03/1992
Ensino, Física, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Física Geral I

Universidade Federal de Ouro Preto, UFOP, Brasil.
Vínculo institucional

2006 - 2009
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Adjunto, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

08/2009 - 11/2009
Ensino, Biotecnologia, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Fundamentos de Perl para Bioinformática
03/2009 - 07/2009
Ensino, Física, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
FIS119 Física no mundo moderno
03/2009 - 07/2009
Ensino, Engenharias (Ciclo Básico), Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
FIS210 Física Térmica
03/2008 - 07/2008
Ensino, Física, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Física Térmica (1 turma, 4 horas semanais)
03/2008 - 07/2008
Ensino, Engenharias (Ciclo Básico), Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Mecânica Racional (2 turmas, 4 horas semanais)
09/2007 - 02/2008
Ensino, Engenharias (Ciclo Básico), Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Mecânica Racional (2 turmas, 4 horas semanais cada)
09/2007 - 02/2008
Ensino, Ciências Biológicas, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Física Aplicada à Biologia (1 turma, 4 horas semanais)
05/2007 - 09/2007
Ensino, Engenharias (Ciclo Básico), Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Física Térmica (4 horas semanais)
Mecânica Racional (2 turmas, 4 horas semanais cada)
10/2006 - 04/2007
Ensino, Engenharias (Ciclo Básico), Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Mecânica Racional (2 turmas, 4 horas semanais cada)
10/2006 - 04/2007
Ensino, Ciências Biológicas, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Física aplicada à Biologia (4 horas semanais)
08/2006 - 08/2006
Pesquisa e desenvolvimento , Instituto de Ciências Exatas e Biológicas, Departamento de Fisica.


University Of Southampton, SOTON, Grã-Bretanha.
Vínculo institucional

2003 - 2006
Vínculo: Research Assistant, Enquadramento Funcional: Research Assistant, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

11/2003 - 08/2006
Pesquisa e desenvolvimento , School Of Chemistry, 4g Project.

Linhas de pesquisa
Bioinformática

Universidade São Francisco, USF, Brasil.
Vínculo institucional

1996 - 2002
Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Professor titular, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

01/2001 - 1/2002
Pesquisa e desenvolvimento , Centro de Ciências Biológicas e da Saúde, .

01/2001 - 1/2002
Ensino,

Disciplinas ministradas
Física III (4h-semanais)
Metodologia Científica (12h-semanais)
2/2000 - 12/2000
Ensino,

Disciplinas ministradas
Física I -Para Estudantes em Regime Especial (1h-semanal)
Estudo dirigido à Engenharia Mecânica (8h-semanais)
Física Fundamental (12h-semanais)
Álgebra Linear (4h-semanais)
3/1996 - 12/2000
Pesquisa e desenvolvimento , Centro de Ciências Exatas e Tecnológicas, .

3/1999 - 12/1999
Ensino,

Disciplinas ministradas
Física II (16 h-semanais)
3/1998 - 12/1998
Ensino,

Disciplinas ministradas
Física II (12 h-semanais)
3/1997 - 12/1997
Ensino,

Disciplinas ministradas
Física II (16h-semanais)
3/1996 - 12/1996
Ensino,

Disciplinas ministradas
Mecânica Geral (4h-semanais)
Álgebra Linear (4h-semanais)

Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.
Vínculo institucional

1993 - 1996
Vínculo: Bolsista recém-doutor, Enquadramento Funcional: Bolsista Recém-Doutor, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

10/1993 - 02/1996
Pesquisa e desenvolvimento , Instituto de Física Gleb Wataghin, Departamento de Física do Estado Sólido e Ciência dos Materiais.


Laboratório Nacional de Luz Síncrotron, LNLS, Brasil.
Vínculo institucional

1988 - 1990
Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Técnico Especializado, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

07/1988 - 07/1990
Direção e administração, .

Cargo ou função
Responsável pelo Centro de Computação.


Linhas de pesquisa


1.
Física teórica de semicondutores (DESATIVADO)
2.
Nano-Espectroscopia Óptica (DESATIVADO)
3.
Microscopia de campo-próximo (DESATIVADO)

Objetivo: Modelos teóricos para análise de imagens de microscopia de campo-próximo aplicadas a materiais biológicos. USF (1998-2002)..
4.
Física teórica de semicondutores (DESATIVADO)
5.
Bioinformática

Objetivo: Coordenação do grupo de Bioinformática do projeto 4G da Universidade de Southampton, Reino Unido. Elaborar estratégias computacionais para novas tecnologias de sequenciamento genético. (2003-2006)..
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Física da Matéria Condensada.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.
Palavras-chave: Reconstrução de Sequências Genéticas; Análise de Sequências Genéticas; DNA propriedades térmicas; Sondas de DNA.
6.
Estudo teórico de interação elétron-fônon em dispositivos semicondutores quânticos (DESATIVADO)
7.
Estudo teórico de interação elétron-fônon em dispositivos semicondutores quânticos (DESATIVADO)
8.
Bioinformática

Objetivo: Aplicação de modelos físicos em bioinformática tais como uso de estabilidade termodinâmica para descoberta de microRNAs precursores..
9.
Biofísica Computacional

Objetivo: Modelos de física estatística para o modelamento de propriedades térmicas e de flexibilidade de DNA..


Projetos de pesquisa


2016 - Atual
Modelos mesoscópicos e estruturas secundárias de DNA e RNA
Descrição: Projeto individual no âmbito do Programa Pesquisador Mineiro 2016 da Fapemig..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2015 - Atual
Modelo Peyrard-Bishop para híbridos de DNA/RNA no contexto de edições gênica
Descrição: Neste projeto visamos o estudo dos híbridos de DNA/RNA, isto é, estruturas onde uma das fitas da hélice dupla é DNA e a outra fita é composta por RNA. Embora já seja conhecido há muito tempo, este tipo de híbrido teve seu interesse renovado recentemente pela descoberta de edições gênicas via CRISPR (clustered regularly interspaced short palindromic repeats). Em 2013, dois artigos publicados simultaneamente na Science demonstraram que a edição gênica (a alteração do código genético em organismos vivos) é tremendamente simplificado pelo uso da técnica CRISPR em combinação com a nuclease cas9. No cerne da técnica CRISPR-cas9 está a hibridização DNA/RNA e o modelo Peyrard-Bishop é particularmente interessante para estudar as propriedades termodinâmicas deste sistema. A parte principal do nosso projeto consistirá na parametrização de DNA/RNA. Em 2009 nós desenvolvemos uma técnica teórica nova onde conseguimos a parametrizaçao para DNA partindo de dados de temperatura de denaturação (Nature Physics 2009). Esta técnica reduz a complexidade computacional da parametrização por algumas ordens de grandeza. Ainda assim, mesmo com este método, as parametrizações podem levar meses de processamento computacional. Neste projeto solicitamos auxílio para ampliar o nosso sistema computacional de modo a viabilizar a parametrização DNA/RNA e aplicar o modelo ao estudo do mecanismo de hibridização de edições gênicas via CRISPR..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2014 - Atual
Modelos mesoscópicos para o estudo de híbridos de DNA/RNA no contexto de edições gênicas
Descrição: Neste projeto visamos o estudo dos híbridos de DNA/RNA, isto é, estruturas onde uma das fitas da hélice dupla é DNA e a outra fita é composta por RNA. Embora já seja conhecido há muito tempo, este tipo de híbrido teve seu interesse renovado recentemente pela descoberta de edições gênicas via CRISPR (clustered regularly interspaced short palindromic repeats). Em 2013, dois artigos publicados simultaneamente na Science demonstraram que a edição gênica (a alteração do código genético em organismos vivos) é tremendamente simplificado pelo uso da técnica CRISPR em combinação com a nuclease cas9. No cerne da técnica CRISPR-cas9 está a hibridização DNA/RNA e o modelo Peyrard-Bishop é particularmente interessante para estudar as propriedades termodinâmicas deste sistema. A parte principal do nosso projeto consistirá na parametrização de DNA/RNA. Em 2009 nós desenvolvemos uma técnica teórica nova onde conseguimos a parametrizaçao para DNA partindo de dados de temperatura de denaturação (Nature Physics 2009). Esta técnica reduz a complexidade computacional da parametrização por algumas ordens de grandeza. Ainda assim, mesmo com este método, as parametrizações podem levar meses de processamento computacional. O objetivo do projeto é obter os parâmetros de pontes de hidrogênio e de empilhamento de híbridos de DNA/RNA usando modelos mesoscópicos. Uma vez obtidos estes parâmetros, modelar a dinâmica de edições gênicas por perfís de abertura média..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) .
Integrantes: Gerald Weber - Coordenador.Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
2013 - 2015
Parametrização do modelo Peyard-Bishop para oligonucleotídios
Descrição: O modelo Peyrard-Bishop tem crescido em importância para o entendimento dos aspectos físicos de ologonucleotíodios (DNA e RNA principalmente). Sua parametrização, isto é, a obtenção de parâmetros adequados para seu uso em aplicações biológicas no entanto ainda é um enorme desafio. Em 2009 nós desenvolvemos uma técnica teórica nova onde conseguimos a parametrizaçao para DNA partindo de dados de temperatura de denaturação (Nature Physics 2009). Esta técnica reduz a complexidade computacional da parametrização por algumas ordens de grandeza. Ainda assim, mesmo com este método, as parametrizações podem levar meses de processamento computacional. Neste projeto solicitamos auxílio para ampliar o nosso sistema computacional de modo a viabilizar novas parametrizações, em especial para DNA e RNA modifcados. Estas bases modificadas tem um enorme potencial tecnológico, mas a falta de modelos computacionalmente eficientes para estudá-los, como por exemplo o Peyrard-Bishop, carecem da necessária parametrização que é objeto do presente projeto..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
2010 - 2012
Modelos de flexibilidade microscópica de oligonucleotídios e suas aplicações em busca bioinformática de microRNA
Descrição: A flexibilidade de DNA e RNA é fator importante na interação com proteínas tais como a proteína TATA-box envolvida na transcrição ou a MutS que sinaliza sítios defeituosos em DNA. No entanto sabemos ainda muito pouco sobre a flexibilidade microscópica de DNA já que a maioria das técnicas experimentais é mesoscópica, isto é, mede a flexibilidade em uma escala muito maior do que a da interação com proteína. Nós desenvolvemos uma técnica teórica nova onde obtemos a flexibilidade de DNA a partir de dados de temperatura de denaturação disponíveis na literatura (Nature Physics, outubro de 2009). Neste projeto nós vamos explorar novas formas da Hamiltoniana de interação para aprimorar os resultados de flexibilidade e aplicá-los à RNA. Ao mesmo tempo aplicaremos os resultados obtidos em problemas de biologica molecular e bioinformática. Portanto, trata-se de um projeto com duas interfaces: uma de física teórica e outra de biologia computacional, uma apoiando a outra. O problema de biologia computacional que pretendemos abordar é o da busca de microRNAs novos, isto é, microRNAs que são completamente diferentes daqueles identificados por semelhança da sequência de nucleotídios. Os microRNAs, sequências de RNA de poucas dezenas de bases, são envolvidos no silenciamento gênico e assim atuam na regulação gênica e estão relacionados à diversas doenças. Descobrir microRNAs novos no entanto é um problema notoriamente difícil. Por isto, novas abordagens, tais como propostas neste projeto, tem um grande potencial de aplicação biotecnológica..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) .
Integrantes: Gerald Weber - Coordenador.Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais - Auxílio financeiro.
Número de produções C, T & A: 4 / Número de orientações: 1
2009 - 2012
Modelos de estabilidade térmica e flexibilidade microscópica de DNA e RNA
Descrição: Apresentamos aqui o nosso projeto para o estudo da estabilidade de estruturas primárias e secundárias de DNA e RNA com vistas à sua aplicação em problemas de bioinformática. A estabilidade térmica da hélice dupla está presente em práticamente todos os fenômenos envolvendo DNA, tais como hibridização, duplicação, e transcrição. No entanto a descrição física do fenômeno por meio de modelos e simulação, mesmo após mais de meio século da descoberta da hélice dupla, ainda permanece um enorme desafio. Para RNA o desafio é ainda maior devido às complicadas estruturas secundárias e terciárias que forma. Recentemente, o interesse na estabilidade térmica do RNA ganhou novas dimensões com a descoberta das funções do RNA interferente, ou RNAi. Estes são segmentos curtos de RNA que podem simplesmente desligar a função de um gene. Os modelos disponíveis que calculam as estruturas secundárias de RNA, datados da década 60, são extremamente simplificados que predizem corretamente somente 70% das estruturas conhecidas..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (1) .
Integrantes: Gerald Weber - Coordenador.Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.Número de orientações: 4
2009 - 2011
Estabelecimento de metodologias para localização de RNA não codificador e seus alvos em Schistosoma mansoni: modelos físicos, aplicativos de bioinformática e validação experimental
Descrição: Os RNAs não codificadores de proteínas (ncRNA) são um importante conjunto de RNA dentro da totalidade dos transcritos existentes nas células eucariotas. Os ncRNA contêm nas suas moléculas informações variadas que lhes permitem ter diversas funções. Até o momento foram descritos mais de 800 tipos distintos de ncRNA, entretanto, um aspecto fundamental para o entendimento do funcionamento são os aspectos relacionados a hibridização com seus alvos. O fenômeno do RNA de interferência (RNAi) desencadeado pelos ncRNA (mi/siRNA) revelou que a estabilidade e tradução dos RNA mensageiros (mRNA) e a estrutura da cromatina podem ser reguladas por esses ncRNA em vários modelos experimentais. A biogénese, mecanismos de ação e a distinção entre miRNA e siRNA estão sendo descobertos correlacionando a identificação com a especificidade celular. Neste projeto propomos estudar e validar novos métodos para localização de RNAS não codificadores e seus alvos. Em particular, aplicaremos esses métodos no genoma do Schistosoma mansoni para o qual até o momento não se conhecem o repertórios destas moléculas. Os métodos em uso para a localização de ncRNAs usam uma variedade de técnicas, por vezes mutuamente exclusivas, que raramente proporcionam uma visão geral e consistente de seus resultados. Nossa proposta é de abordar este tema pelos seus vários ângulos, ou seja, entender o mecanismo termodinâmico que dá a estabilidade á estrutura secundária do RNA, bem como este influencia a hibridização do ncRNA maduro com seu alvo. Complementando as estratégias de busca, serão desenvolvidos estudos sobre redes associativas entre ncRNA e seus alvos. Estes métodos combinados, devem resultar em protótipos de programas de bioinformática além de evidenciar novos mecanismos de regulação da expressão gênica neste parasito..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2008 - 2010
Estudo de modelos tipo Peyrard-Bishop no contexto de bioinformática
Descrição: O objetivo deste projeto é desenvolver técnicas de física teórica para o estudo de estabilidades térmicas e a formação das estruturas secundárias em DNA e RNA para em aplicativos de bioinformática. O projeto será desenvolvido no Departamento de Física do Instituto de Ciências Exatas e Biológicasda UFOP com colaborações internas (Departamento de Ciências Biológicas, Departamento de Matemática) e externas (Universidade de Southampton-UK e Unesp de São José do Rio Preto)..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) .
Integrantes: Gerald Weber - Coordenador.Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Número de produções C, T & A: 3 / Número de orientações: 5
2007 - 2009
Estabilidade térmica de RNA com aplicações em bioinformática
Descrição: Apresentamos aqui o nosso projeto para o estudo da estabilidade de estruturas primárias e secundárias de RNA com vistas à sua aplicação em problemas de bioinformática. O interesse na estabilidade térmica do RNA reacendeu com toda força com a descoberta das funções do RNA interferente, curtos segmentos de RNA que podem simplesmente desligar a função de um gene. Os modelos disponíveis que calculam esta estabilidade, datados da década 60, são extremamente simplificados e suscitam sérias dúvidas sobre sua validade. No entanto, todos programas aplicativos de bioinformática disponíveis tem por base exatamente estes rogramas. O objetivo deste projeto é desenvolver modelos mais realistas para a estabilidade térmica de RNA, incorporando por exemplo as interações moleculares entre as bases. Em seguida esses modelos serão usados para gerar novos aplicativos de bioinformática, em especial para determinar a estabilidade de precursores de microRNA e para localizar alvos de microRNA em genomas..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (2) .
Integrantes: Gerald Weber - Coordenador.Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais - Auxílio financeiro.
Número de produções C, T & A: 7 / Número de orientações: 6
1997 - 1999
Estudos Teóricos em Interação Elétron-Fônon e Estados de Impurezas Rasas em Heteroestruturas Semicondutoras
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (2) .
Integrantes: Gerald Weber - Coordenador.Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.
Número de produções C, T & A: 16 / Número de orientações: 3
1996 - 1999
Implantação do ``Grupo de Física dos Sólidos e Eletrônica Quântica'' na Universidade São Francisco
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (1) .
Integrantes: Gerald Weber - Coordenador / Ivan Costa da Cunha Lima - Integrante.Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Número de produções C, T & A: 28 / Número de orientações: 3
1992 - 1992
Estudo teórico de propriedades eletrônicas e óticas em poços quânticos e super-redes via interação elétron-fônon (interação Fröhlich) incluindo modos confinados e de interface
Situação: Desativado; Natureza: Pesquisa.


Projetos de extensão


1998 - 1998
Atualização em física e matemática e tópicos de pesquisa para professores do ensino médio
Descrição: Projeto Pró-Ciências para atualização de professores de física e de matemática da rede estadual de ensino médio..
Situação: Concluído; Natureza: Extensão.
1997 - 1997
Atualização em física básica e tópicos de pesquisa em física para professores de segundo grau
Descrição: Projeto Pró-Ciências para desenvolver cursos de atualização de professores de física da rede estadual de nível médio..
Situação: Concluído; Natureza: Extensão.


Membro de corpo editorial


2007 - 2010
Periódico: Revista da Física de Ouro Preto


Revisor de periódico


1991 - 2003
Periódico: Semiconductor Science and Technology
1993 - 2003
Periódico: Applied Physics Letters
1992 - Atual
Periódico: Journal of Physics. Condensed Matter
1992 - 2003
Periódico: Physical Review B - Condensed Matter and Materials Physics
1995 - Atual
Periódico: Physical Review Letters (0031-9007)
2007 - Atual
Periódico: Physical Review. E, Statistical, Nonlinear and Soft Matter Physics
2008 - Atual
Periódico: Europhysics Letters
2009 - Atual
Periódico: Chemical Physics Letters (Print)
2012 - Atual
Periódico: ACS Nano
2011 - Atual
Periódico: Brazilian Journal of Physics (Impresso)
2012 - Atual
Periódico: EURASIP Journal on Bioinformatics and Systems Biology (Print)
2012 - Atual
Periódico: The Journal of Chemical Physics
2013 - Atual
Periódico: Physica. A (Print)
2014 - Atual
Periódico: PLoS Computational Biology
2014 - Atual
Periódico: Computational and Structural Biotechnology Journal
2014 - Atual
Periódico: Applied Mathematics and Computation
1996 - 2001
Periódico: Journal of Applied Physics
2000 - 2000
Periódico: Physica Status Solidi. B, Basic Research
1996 - 1996
Periódico: Solid State Communications
2016 - Atual
Periódico: Bioinformatics (Oxford. Print)
2015 - Atual
Periódico: Journal of Theoretical Biology


Revisor de projeto de fomento


2012 - Atual
Agência de fomento: The National Science Foundation
2011 - Atual
Agência de fomento: Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Física aplicada a Biologia.
2.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Bioinformática.
3.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.
4.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Física Geral/Especialidade: Física Estatística e Termodinâmica.
5.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Física da Matéria Condensada.


Idiomas


Alemão
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Espanhol
Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.


Prêmios e títulos


2011
Menção honrosa da orientanda D. Fagundes Lima no 7 International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, Associação Brasileira de Bioinformatica e Biologia Computacional.
2010
Bolsa de produtividade em pesquisa nível 2, CNPq.
2008
Prêmio de melhor trabalho no Simpósio de Iniciação Científica da UFOP da orientanda Denise Fagundes-Lima., UFOP.
2007
Achievements of the Basic Technology Programme, Research Councils UK.
1999
Menção no Ranking da Ciência, Folha de São Paulo.
1997
Bolsa de produtividade em pesquisa nível 2B, CNPq.
1996
Bolsa de produtividade em pesquisa nível 2C, CNPq.


Produções



Produção bibliográfica
Citações

Web of Science
Total de trabalhos:51
Total de citações:628
Fator H:15
Weber, Gerald  Data: 01/08/2016

SCOPUS

Outras
Total de trabalhos:71
Total de citações:835
http://scholar.google.com/citations?user=Yr6VEtEAAAAJ  Data: 01/08/2015

Artigos completos publicados em periódicos

1.
MARTINS, E. O.2017MARTINS, E. O. ; Weber, G. . An asymmetric mesoscopic model for single bulges in RNA. JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS, v. 147, p. 155102, 2017.

2.
MIRANDA, PÂMELLA2017MIRANDA, PÂMELLA ; OLIVEIRA, LUCIANA M. ; WEBER, GERALD . Mesoscopic modelling of Cy3 and Cy5 dyes attached to DNA duplexes. BIOPHYSICAL CHEMISTRY, v. 230, p. 62-67, 2017.

3.
DIAS AMARANTE, TAUANNE2016DIAS AMARANTE, TAUANNE ; WEBER, GERALD . Evaluating Hydrogen Bonds and Base Stacking of Single, Tandem and Terminal GU Mismatches in RNA with a Mesoscopic Model. Journal of Chemical Information and Modeling, v. 56, p. 101-109, 2016.

4.
CEOLIN, LUCIELI2016CEOLIN, LUCIELI ; ROMITTI, MIRIAN ; RODRIGUES SIQUEIRA, DÉBORA ; VAZ FERREIRA, CARLA ; OLIBONI SCAPINELI, JESSICA ; ASSIS-BRAZIL, BEATRIZ ; VIEIRA MAXIMIANO, RODOLFO ; DIAS AMARANTE, TAUANNE ; DE SOUZA NUNES, MIRIAM CELI ; WEBER, GERALD ; MAIA, ANA LUIZA . Effect of 3-UTR RET Variants on RET mRNA Secondary Structure and Disease Presentation in Medullary Thyroid Carcinoma. Plos One, v. 11, p. e0147840, 2016.

5.
MAXIMIANO, R. V.2015MAXIMIANO, R. V. ; Weber, G. . Deoxyinosine mismatch parameters calculated with a mesoscopic model result in uniform hydrogen bonding and strongly variable stacking interactions. Chemical Physics Letters (Print), v. 631-632, p. 87-91, 2015.

6.
SILVA, I. F.;FERREIRA, I.2015SILVA, I. F. ; AMARANTE, T. D. ; Weber, G. . DNA terminal base pairs have weaker hydrogen bonds especially for AT under low salt concentration. The Journal of Chemical Physics, v. 143, p. 175101, 2015.

7.
AMARANTE, T. D.2014AMARANTE, T. D. ; WEBER, GERALD . Analysing DNA structural parameters using a mesoscopic model. Journal of Physics. Conference Series (Online), v. 490, p. 012203, 2014.

8.
Weber, G.2014Weber, G.. Optimization method for obtaining nearest-neighbour DNA entropies and enthalpies directly from melting temperatures. Bioinformatics (Oxford. Print), p. 871-877, 2014.

9.
Weber, G.2013 Weber, G.. Mesoscopic model parametrization of hydrogen bonds and stacking interactions of RNA from melting temperatures. Nucleic Acids Research, v. 41, p. e30-7, 2013.

10.
Weber, G.2013Weber, G.. TfReg: Calculating DNA and RNA melting temperatures and opening profiles with mesoscopic models. Bioinformatics (Oxford. Print), v. 29, p. 1345-1347, 2013.

11.
FAGUNDES-LIMA, D.2012FAGUNDES-LIMA, D. ; WEBER, G. . Comment on SCS: Signal, Context, and Structure Features for Genome-Wide Human Promoter Recognition. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics (Print), v. 9, p. 940-941, 2012.

12.
NUNES, M. C. S.2011NUNES, M. C. S. ; WANNER, E. F. ; WEBER, G. . Origin of multiple periodicities in the Fourier power spectra of the Plasmodium falciparum genome. BMC Genomics, v. 12, p. S4, 2011.

13.
WEBER, G.;Weber, G.;WEBER, GERALD2011WEBER, G.. Finite-enthalpy model parameters from DNA melting temperatures. Europhysics Letters (Print), v. 96, p. 68001, 2011.

14.
WEBER, G.;Weber, G.;WEBER, GERALD2009 WEBER, G.; HASLAM, N. ; ESSEX, J. W. ; NEYLON, C. . Thermal equivalence of DNA duplexes for probe design. Journal of Physics. Condensed Matter, v. 21, p. 034106-11, 2009.

15.
MACHADO, R. F.2009MACHADO, R. F. ; WEBER, G. . Wavelet coefficients as a guide to DNA phase transitions. Europhysics Letters, v. 87, p. 38005, 2009.

16.
WEBER, G.;Weber, G.;WEBER, GERALD2009 WEBER, G.; ESSEX, J. W. ; NEYLON, C. . Probing the microscopic flexibility of DNA from melting temperatures. Nature Physics (Print), v. 5, p. 769-773, 2009.

17.
WHITEFORD, N.2008WHITEFORD, N. ; HASLAM, N. ; WEBER, G. ; PRÜGEL-BENNETT, A. ; ESSEX, J. W. ; NEYLON, C. . Visualizing the Repeat Structure of Genomic Sequences. Complex Systems, v. 17, p. 381-398, 2008.

18.
HASLAM, N.2008HASLAM, N. ; WHITEFORD, N. ; WEBER, G. ; PRÜGEL-BENNETT, A. ; ESSEX, J. W. ; NEYLON, C. . Optimal probe length varies for targets with high sequence variation: Implications for probe library design for resequencing highly variable genes. Plos One, v. 3, p. e2500, 2008.

19.
WEBER, G.;Weber, G.;WEBER, GERALD2006 WEBER, G.; HASLAM, N. ; WHITEFORD, N. ; ESSEX, J. W. ; PRÜGEL-BENNETT, A. ; NEYLON, C. . Thermal equivalence of DNA duplexes without calculation of melting temperature. Nature Physics, v. 2, n.1, p. 55-59, 2006.

20.
WEBER, G.;Weber, G.;WEBER, GERALD2006 WEBER, G.. Sharp DNA denaturation due to solvent interaction. Europhysics Letters, v. 73, n.5, p. 806-811, 2006.

21.
WHITEFORD, N.2005WHITEFORD, N. ; HASLAM, N. ; WEBER, G. ; PRÜGEL-BENNETT, A. ; ESSEX, J. W. ; ROACH, P. L. ; BRADLEY, M. ; NEYLON, C. . An analysis of the feasibility of short read sequencing. Nucleic Acids Research, v. 33, n.19, p. e171, 2005.

22.
DE PAULA, A. M.2003DE PAULA, A. M. ; CHAVES, C. R. ; SILVA, H. B. ; WEBER, G. . Absorption coefficient imaging by near-field scanning optical microscopy in bacteria. Applied Optics, v. 46, p. 3005-3008, 2003.

23.
WEBER, G.;Weber, G.;WEBER, GERALD2002WEBER, G.; DE PAULA, A. M. . Shallow impurities in multiple V-groove quantum wires. Journal of Physics. Condensed Matter, v. 14, p. 471-482, 2002.

24.
ALCALDE, A. M.2002ALCALDE, A. M. ; MARQUES, G. E. ; WEBER, G. ; REINECKE, T. L. . Acoustic and optical phonon scattering rates in spherical quantum dots: magnetic effects. Physica. B, Condensed Matter, v. 316-317, p. 459-463, 2002.

25.
ALCALDE, A. M.2002ALCALDE, A. M. ; MARQUES, G. E. ; WEBER, G. ; REINECKE, T. L. . Electron-acoustic phonon scattering rates in spherical quantum dots: contribution of the macroscopic deformation potential. Brazilian Journal of Physics (Impresso), v. 32, p. 284-286, 2002.

26.
WEBER, G.;Weber, G.;WEBER, GERALD2001WEBER, G.; DE PAULA, A. M. . Shallow impurties in V-groove quantum wires. Physical Review. B, Condensed Matter. (Cessou 1997. Cont. 1098-0121 Physical Review. B, Condensed Matter and Materials Physics), v. 63, p. 113307, 2001.

27.
SILVA, H. B.2001SILVA, H. B. ; TOLEDO, J. A. ; SILVEIRA FILHO, K. ; WEBER, G. ; DE PAULA, A. M. . Near-field scanning optical transmission images in Pseudomonas aeruginosa. Acta Microscópica, v. 10, p. 99-102, 2001.

28.
ALCALDE, A. M.2000ALCALDE, A. M. ; WEBER, G. . Scattering rates due to electron--phonon interaction in CdS$_{1-x}$Se$_{x}$ quantum dots. Semiconductor Science and Technology, v. 15, p. 1082-1086, 2000.

29.
ALCALDE, A. M.2000ALCALDE, A. M. ; MARQUES, G. E. ; WEBER, G. ; REINECKE, T. L. . Electron--acoustic-phonon scattering rates in II-VI quantum dots: contribution of the macroscopic deformation potential. Solid State Communications, v. 116, p. 247-252, 2000.

30.
CRECI, G.1999CRECI, G. ; WEBER, G. . Electron and hole states in V-groove quantum wires: an effective potential calculation. Semiconductor Science and Technology, v. 14, p. 690-694, 1999.

31.
ALCALDE, A. M.1999ALCALDE, A. M. ; WEBER, G. . Electron-phonon relaxation rates in InGaAs-InP and HgCdTe-CdTe quantum wells. Journal of Applied Physics, v. 85, p. 7276-7281, 1999.

32.
WEBER, G.;Weber, G.;WEBER, GERALD1998WEBER, G.; DE PAULA, A. M. . Gamma to Xz electron transfer times in type-II GaAs/AlAs superlattices due to emission of confined and interface phonons. Superlattices and Microstructures, v. 23, p. 249-252, 1998.

33.
WEBER, G.;Weber, G.;WEBER, GERALD1998WEBER, G.; CARNEIRO, G. N. . Excited states of donors bound to X valleys in GaAs/AlAs Type-II structures. Superlattices and Microstructures, v. 23, p. 1075-1078, 1998.

34.
WEBER, G.;Weber, G.;WEBER, GERALD1998WEBER, G.; CARNEIRO, G. N. . Binding energies of ground and excited donor states bound to X valleys in GaAs/AlAs type-II quantum wells. Physical Review B - Solid State, v. 58, p. 7829-7833, 1998.

35.
LIMA, I. C. C.1997LIMA, I. C. C. ; WEBER, G. ; REINECKE, T. L. . Gamma-x hybridization effects on the carrier subband transition times in type I GaAs-AsAs quantum wells. Solid State Communications, v. 102, p. 799-801, 1997.

36.
ALCALDE, A. M.1997ALCALDE, A. M. ; WEBER, G. . Nonparabolicity effects on electron-phonon scattering rates in quantum wells. Physical Review B - Solid State, v. 56, p. 9619-9624, 1997.

37.
DE PAULA, A. M.1997DE PAULA, A. M. ; WEBER, G. . Temperature dependence of Gamma to Xz electron transfer times in type II GaAs/AlAs superlattices. Physica Status Solidi. B, Basic Research, v. 204, p. 198-200, 1997.

38.
SCHUMACHER, K. L.1996SCHUMACHER, K. L. ; COLLINGS, D. ; PHILLIPS, R. T. ; RITCHIE, D. A. ; WEBER, G. ; SCHULMAN, J. N. ; PLOOG, K. . Inter- and intrasubband relaxation times in GaAs-Al0.35Ga0.65As quantum wells measured by femtosecond time-resolved differential transmission. Semiconductor Science and Technology (Print), v. 11, p. 1173-1177, 1996.

39.
ALCALDE, A. M.1996ALCALDE, A. M. ; WEBER, G. . Nonparabolicity effects on transition rates due to confined phonons in quantum wells. Brazilian Journal of Physics, v. 25, p. 177-181, 1996.

40.
WEBER, G.;Weber, G.;WEBER, GERALD1995WEBER, G.. Donors bound to the X valleys in type-II GaAs-AlAs quantum well structures. Applied Physics Letters, v. 67, p. 1447-1449, 1995.

41.
ALCALDE, A. M.1995ALCALDE, A. M. ; WEBER, G. . Nonparabolicity effects on transiton rates due to confined phonons in GaAs-AlGaAs quantum wells. Solid State Communications, v. 96, p. 763-766, 1995.

42.
DE PAULA, A. M.1995DE PAULA, A. M. ; WEBER, G. . Carrier capture processes in semiconductor superlattices due to emission of confined phonons. Journal of Applied Physics, v. 77, p. 6306-6312, 1995.

43.
CARNEIRO, G. N.1995CARNEIRO, G. N. ; WEBER, G. ; OLIVEIRA, L. E. . Binding energies and intra-donor absorption spectra in GaAs-GaAlAs quantum wells. Semiconductor Science and Technology, v. 10, p. 41-44, 1995.

44.
DE PAULA, A. M.1994DE PAULA, A. M. ; WEBER, G. . Gamma to Xz electron transfer times in type II superlattices due to emission of confined phonons. Applied Physics Letters, v. 65, p. 1281-1283, 1994.

45.
DE PAULA, A. M.1994DE PAULA, A. M. ; WEBER, G. . Carrier capture via confined phonons in GaAs-AlGaAs multiple quantum wells. Semiconductor Science and Technology, v. 9, p. 730-732, 1994.

46.
WEBER, G.;Weber, G.;WEBER, GERALD1993WEBER, G.; DE PAULA, A. M. . Carrier capture processes in GaAs-AlGaAs quantum wells due to emission of confined phonons. Applied Physics Letters, v. 63, p. 3026-3028, 1993.

47.
WEBER, G.;Weber, G.;WEBER, GERALD1992WEBER, G.. Electron-confined-phonon interaction in quantum wells: reformulation of the slab model. Physical Review B - Solid State, v. 46, p. 16171-16173, 1992.

48.
WEBER, G.;Weber, G.;WEBER, GERALD1992WEBER, G.. The effect of electric field on intrasubband and intersubband transitions via interface phonons in GaAs-AlAs quantum wells. Journal of Physics. Condensed Matter, v. 4, p. 9831-9841, 1992.

49.
WEBER, G.;Weber, G.;WEBER, GERALD1992WEBER, G.. Electric-field induced ultrafast intersubband transitions in large GaAs-AlAs quantum wells via electron-interface-phonon interaction. Solid State Communications, v. 84, p. 595-598, 1992.

50.
WEBER, G.;Weber, G.;WEBER, GERALD1992WEBER, G.. Comment on contiunuum theories of optical phonons and polaritons in superlattices: a brief critique. Physical Review B - Solid State, v. 46, p. 12792-12793, 1992.

51.
WEBER, G.;Weber, G.;WEBER, GERALD1992WEBER, G.; RYAN, J. F. . Electron-confined-optical-phonon scattering rates in single quantum wells in an applied electric field. Physical Review B - Solid State, v. 45, p. 11202-11208, 1992.

52.
DE PAULA, A. M.1992DE PAULA, A. M. ; MACIEL, A. C. ; WEBER, G. ; RYAN, J. F. ; DAWSON, P. ; FOXON, C. T. . Subpicosecond real-space charge transfer in GaAs/AlAs type II superlattice. Semiconductor Science and Technology (Print), v. 7, p. B120-B123, 1992.

53.
WEBER, G.;Weber, G.;WEBER, GERALD1991WEBER, G.; DE PAULA, A. M. ; RYAN, J. F. . Electron-LO-phonon scattering rates in GaAs-AlGaAs quantum wells. Semiconductor Science and Technology (Print), v. 6, p. 397-400, 1991.

54.
WEBER, G.;Weber, G.;WEBER, GERALD1990WEBER, G.. Density of states and optical absorption spectra of shallow impurities in quantum wells under the influence of a longitudinal electric field. Physical Review B - Solid State, v. 41, p. 10043-10048, 1990.

55.
WEBER, G.;Weber, G.;WEBER, GERALD1989WEBER, G.; OLIVEIRA, L. E. . On the binding energy of D- states in doped germanium: effects of the valley-orbit corrections and compressive stress. Physica Status Solidi. B, Basic Research, v. 151, p. 605-613, 1989.

56.
WEBER, G.;Weber, G.;WEBER, GERALD1988WEBER, G.; SCHULZ, P. A. ; OLIVEIRA, L. E. . Density of states and energy spectra of hydrogenic impurities in quantum well wires. Physical Review B - Solid State, v. 38, p. 2179-2182, 1988.

Textos em jornais de notícias/revistas
1.
WEBER, G.. A perfeição matemática do TeX. Revista do Linux - Conexao Total, p. 38 - 43, 01 abr. 2001.

Trabalhos completos publicados em anais de congressos
1.
CASTRO-E-SILVA, A. ; WEBER, G. ; MACHADO, R. F. ; WANNER, E. F. ; GUERRA-SÁ, R. . Identity Transposon Networks in D. melanogaster. In: Brazilian Symposium on Bioinformatics, 2008, Santo André. Lecture Notes in Bioinformatics Advances in Bioinformatics and Computational Biology, 2008. v. 5167. p. 161-164.

2.
DE PAULA, A. M. ; TOLEDO, J. A. ; SILVA, H. B. ; WEBER, G. . Near-Field Scanning Optical Images of Bacteria. In: Advanced Biomaterials --- Characterization, Tissue Engineering and Complexity, 2002, Boston. Materials Research Society Symposium Proceedings, 2001. v. 711. p. 147-151.

3.
DE PAULA, A. M. ; CHAVES, C. R. ; SILVA, H. B. ; WEBER, G. . Near-field scanning optical images of bacteria. In: OSA Biomedical Topical Meetings, 2002, Miami. Technical Digest --- OSA Biomedical Topical Meetings, 2002. p. 424-426.

4.
DE PAULA, A. M. ; CHAVES, C. R. ; SILVA, H. B. ; WEBER, G. . Bacteria images by scanning near-field optical and scanning electron microscopy. In: II Latin American Congress of Artificial Organs and Biomaterial, 2001, Belo Horizonte. Proceedings of the II Latin American Congress of Artifical Organs and Biomaterials, 2001.

5.
WEBER, G.; ALCALDE, A. M. . Intra- and intersubband transition rates due to emission of optic phonons in quantum wells: effects of the subband nonparabolicity. In: 9TH INT. CONF. ON HOT CARRIERS IN SEMICONDUCTORS, 1996, Chicago. PROCEEDINGS OF THE 9TH INT. CONF. ON HOT CARRIERS IN SEMICONDUCTORS. NewYork: Plenum, 1996. p. 73-75.

6.
WEBER, G.; OLIVEIRA, L. E. . Optical absorption spectra associated to shallow impurities in GaAs-(Ga,Al)As quantumw well wires. In: Fourth International Conference on Shallow Impurities, 1990, Londres. MATERIAL SCIENCE FORUM, 1990. v. 65-66. p. 135-139.

7.
WEBER, G.. Electric field dependence of the density of states and energy spectra of shallow impurities in quantum-wells. In: 4TH BRAZILIAN SCHOOL OF SEMICONDUCTOR PHYSICS, 1990, Belo Horizonte. PROCEEDINGS OF THE 4TH BRAZILIAN SCHOOL OF SEMICONDUCTOR PHYSICS. Singapore: World Sicentific, 1990. p. 408.

8.
WEBER, G.; SCHULZ, P. A. ; OLIVEIRA, L. E. . Screening Effects And Density Of States Of Shallow Impurities In Ga-As-(Ga,Al) As Quantum-Well-Wires.. In: Fourth International Conference on Shallow Impurities, 1989, Londres. MATERIALS SCIENCE FORUM, 1990. v. 38-41. p. 1415-0.

9.
WEBER, G.; OLIVEIRA, L. E. . Valley-Orbit Corrections And Stress Effects On 'D Pot. -' States In Ge:P And Ge:Sb.. In: 19TH INT.CONF.ON THE PHYSICS OF SEMICONDUCTORS, 1989. PROCEEDINGS OF THE 19TH INT.CONF.ON THE PHYSICS OF SEMICONDUCTORS. v. 2. p. 1301.

10.
WEBER, G.; RIBEIRO, C. A. . Monte Carlo simulation method applied to the study of ebic in a semiconductor laser. In: THIRD BRAZILIAN SCHOOL OF SEMICONDUCTOR PHYSICS, 1987, Campinas. PROCEEDINGS OF THE THIRD BRAZILIAN SCHOOL OF SEMICONDUCTOR PHYSICS. Singapore: WORLD SCIENTIFIC, 1987. p. 261.

Resumos expandidos publicados em anais de congressos
1.
AMARANTE, T. D. ; MAXIMIANO, R. V. ; Weber, G. . Investigation of GU mismatch stability and parameters from melting temperatures by a mesoscopic model. In: III Simpósio Interdisciplinar Física+Bioinformática 2014, 2014, Uberlândia. Anais do III Simpósio Interdisciplinar Física+Bioinformática 2014, 2014.

2.
MAXIMIANO, R. V. ; Weber, G. . Determination of DNA mesoscopic model parameters for Inosine. In: III Simpósio Interdisciplinar Física+Bioinformática 2014, 2014, Uberlândia. Anais do III Simpósio Interdisciplinar Física+Bioinformática 2014, 2014.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
Weber, G.. MESOSCOPIC MODELS AS A TOOL FOR PROBING MOLECULAR INTERACTIONS IN DNA AND RNA. In: XLIII Annual Meeting of the Brazilian Biophysical Society, 2018, Santos. XLIII Annual Meeting of the Brazilian Biophysical Society, 2018.

2.
SILVA, I. F. ; AMARANTE, T. D. ; Weber, G. . Terminal effects in mesoscopic models of RNA. In: XLIII Annual Meeting of the Brazilian Biophysical Society, 2018, Santos. XLIII Annual Meeting of the Brazilian Biophysical Society, 2018.

3.
LEAL, M. R. ; Weber, G. . Three-dimensional helicoidal mesoscopic model for DNA. In: XLIII Annual Meeting of the Brazilian Biophysical Society, 2018, Santos. XLIII Annual Meeting of the Brazilian Biophysical Society, 2018.

4.
MIRANDA, P. ; Weber, G. . MODELING FLUORESCENCE OF CY3 AND CY5 DYES WITH PEYRARD-BISHOP MESOSCOPIC MODEL. In: XLIII Annual Meeting of the Brazilian Biophysical Society, 2018, Santos. XLIII Annual Meeting of the Brazilian Biophysical Society, 2018.

5.
BARBOSA, V. B. ; MAXIMIANO, R. V. ; Weber, G. . Evaluating the thermal stability of sub-optimal RNA folding associated to RET-MEN2 oncogene. In: XLIII Annual Meeting of the Brazilian Biophysical Society, 2018, Santos. XLIII Annual Meeting of the Brazilian Biophysical Society, 2018.

6.
BARBOSA, V. B. ; MARTINS, E. O. ; Weber, G. . Improved nearest-neighbour parameters for DNA/RNA duplexes. In: 9th IUPAP International Conference on Biological Physics, 2017, Rio de Janeiro. Resumos do 9th IUPAP International Conference on Biological Physics, 2017.

7.
MIRANDA, P. ; OLIVEIRA, L. M. ; Weber, G. . Mesoscopic models applied to oligonucleotides with Cy3 and Cy5 dyes. In: 9th IUPAP International Conference on Biological Physics, 2017, Rio de Janeiro. Resumos do {9th IUPAP International Conference on Biological Physics, 2017.

8.
Weber, G.. The power of combining mesoscopic models and melting temperatures to understand the intramolecular interactions of DNA and RNA. In: 9th IUPAP International Conference on Biological Physics, 2017, Rio de Janeiro. Resumos do 9th IUPAP International Conference on Biological Physics, 2017.

9.
MARTINS, E. O. ; Weber, G. . Evaluating RNA single bulges with a mesoscopic model. In: 9th IUPAP International Conference on Biological Physics, 2017, Rio de Janeiro. Resumos do 9th IUPAP International Conference on Biological Physics, 2017.

10.
Weber, G.; AMARANTE, T. D. ; MAXIMIANO, R. V. ; MARTINS, E. O. ; SILVA, I. F. . Mesoscopic models and melting temperatures: a tool to understand the molecular interactions in DNA and RNA. In: XXXIX Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 2016, Natal. Resumos do ENFMC, 2016.

11.
MARTINS, E. O. ; Weber, G. . Evaluating RNA single bulges with a mesoscopic model. In: X-Meeting 2016 12th International Conference of the AB3C, 2016, Belo Horizonte. Anais do X-Meeting 2016, 2016.

12.
MAXIMIANO, R. V. ; Weber, G. . Study on the variation of RNA Secondary Structure prediction as a function of Thermodynamic Parameters. In: X-Meeting 2016 12th International Conference of the AB3C, 2016, Belo Horizonte. Anais do X-Meeting 2016, 2016.

13.
BARBOSA, V. B. ; MARTINS, E. O. ; Weber, G. . Determining the stability of DNA/RNA hybrid duplexes. In: X-Meeting 2016 12th International Conference of the AB3C, 2016, Belo Horizonte. Anais do X-Meeting 2016, 2016.

14.
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104.
WEBER, G.. Optical absorption spectra of shallow impurities in quantum wells: effect of an applied electric field. In: Conference on Superlattices, Quantum Wells and MBE Technology, 1989, Brasília. Abctracts CSQWMBET, 1989. p. 48-48.

105.
WEBER, G.; SCHULZ, P. A. ; OLIVEIRA, L. E. . Efeitos de blindagem e densidades de estados de impurezas rasas em fios de poços quânticos de GaAs-(Ga,Al)As. In: XI ENFMC, 1988, Caxambu. Resumos XI ENFMC, 1988. p. 150-150.

106.
WEBER, G.; OLIVEIRA, L. E. . Efeitos de pressão uniaxial na energia de ligação de estados D- em Ge:Sb e Ge:As. In: X ENFMC, 1987, Caxambu. Resumos X ENFMC, 1987.

107.
WEBER, G.; OLIVEIRA, L. E. . Valley-orbit correction and stress effects on D- states in GeP and Ge:Sb. In: X Simposio Latinoamericano de Fisica del Estado Solido, 1987, Havana. Abstracts X SLAFES, 1987.

108.
WEBER, G.; SCHULZ, P. A. ; OLIVEIRA, L. E. . Energy spectra of hydrogenic impurities in GaAs-GaAlAs quantum-well-wires. In: X Simposio Latonoamericano de Fisica del Estado Solido, 1987, Havana. Abstracts X SLAFES, 1987.

109.
WEBER, G.; RIBEIRO, C. A. . Aplicação do método Monte Carlo na simulação da microssonda eletrônica. In: IX ENFMC, 1986, Poços de Caldas. Resumos IX ENFMC, 1986. p. 56-56.

Resumos publicados em anais de congressos (artigos)
1.
CARNEIRO, G. N.1995CARNEIRO, G. N. ; WEBER, G. ; OLIVEIRA, L. E. . Binding energies and intra-donor absorption spectra in GaAs-GaAlAs quantum wells. Solid State Communications, v. 93, p. 453-453, 1995.

Artigos aceitos para publicação
1.
MARTINS, E. O. ; BARBOSA, V. B. ; Weber, G. . DNA/RNA hybrid mesoscopic model shows strong stability dependence with deoxypyrimidine content and stacking interactions similar to RNA/RNA. CHEMICAL PHYSICS LETTERS, 2018.

Apresentações de Trabalho
1.
Weber, G.. Modelling DNA and RNA for Systems Biology and Chemistry. 2013. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

2.
OLIVEIRA, L. M. ; WEBER, G. . Free energy and flexibility basis of SNP occurrence. 2011. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

3.
WEBER, G.. The Peyrard-Bishop model as a predictor of oligonucleotide physical properties. 2011. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

4.
WEBER, G.. Flexibilidade microscópica de DNA e suas aplicações em bioinformática, seminário convidado no VII ERSBF. 2010. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

5.
SILVA, H. B. ; TOLEDO, J. A. ; SILVEIRA FILHO, K. ; WEBER, G. ; DE PAULA, A. M. . Near-field scanning optical transmission images in Pseudomonas aeruginosa. 2001. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

6.
WEBER, G.; DE PAULA, A. M. . Impurezas rasas em fios múltiplos tipo V-groove. 2001. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

7.
TOLEDO, J. A. ; SILVA, H. B. ; SILVEIRA FILHO, K. ; WEBER, G. ; DE PAULA, A. M. . Imagens topográficas e de transmissão óptica com resolução de nanometros em bactérias. 2001. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

8.
WEBER, G.; SILVA, H. B. ; TOLEDO, J. A. ; SILVEIRA FILHO, K. ; DE PAULA, A. M. . Cálculo de coeficientes de absorção óptica em materiais biológicos através de microscopia óptica de varredura em campo-próximo. 2001. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

9.
DE PAULA, A. M. ; CHAVES, C. R. ; SILVA, H. B. ; WEBER, G. . Optical absorption images of bacteria with nanometer resolution. 2001. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

10.
DE PAULA, A. M. ; SILVA, H. B. ; CHAVES, C. R. ; WEBER, G. . Calculated absorption coefficient imaging by near-field optical scanning microscopy in bacteria. 2001. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

11.
ALCALDE, A. M. ; MARQUES, G. E. ; WEBER, G. ; REINECKE, T. L. . Acoustic and Optical Phonon Scattering Rates in Spherical Quantum Dots: magnetic effects. 2001. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

12.
ALCALDE, A. M. ; MARQUES, G. E. ; WEBER, G. . Acoustical and optical scattering rates in narrow gap semiconductor quantum dots. 2001. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

13.
DE PAULA, A. M. ; CHAVES, C. R. ; SILVA, H. B. ; WEBER, G. . Bacteria images by scanning near-field optical and scanning electron microscopy. 2001. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

14.
ALCALDE, A. M. ; MARQUES, G. E. ; WEBER, G. ; REINECKE, T. L. . Relaxação de portadores via emissão de fônons acústicos em pontos quânticos esféricos. 2000. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

15.
ALCALDE, A. M. ; WEBER, G. . Electron-phonon scattering times in CdS_{1-x}Se_x quantum dots. 1999. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

16.
WEBER, G.; ALCALDE, A. M. . Carrier relaxation due to electron-phonon interaction in semiconductor quantum dots. 1999. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

17.
CRECI, G. ; WEBER, G. . Níveis de energia em fios quânticos tipo V-groove. 1998. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

18.
ALCALDE, A. M. ; WEBER, G. . Relaxação de portadores em pontos quânticos de CdSe: efeitos de alargamento homogêneo e não-homogêneo. 1998. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

19.
LIMA, I. C. C. ; WEBER, G. ; REINECKE, T. L. . Efeitos de hibridização $\Gamma$-$X$ nas transições sub-banda de portadores em poços quânticos tipo I. 1997. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

20.
ALCALDE, A. M. ; WEBER, G. . Efeitos de não-parabolicidade nas taxas de transição de portadores quentes em poços quânticos. 1997. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

21.
DE PAULA, A. M. ; WEBER, G. . Temperature dependence of Gamma to X_z electron transfer times in type-II GaAs/AlAs superlattices due to emission and absorption of optical phonons. 1997. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

22.
WEBER, G.; CARNEIRO, G. N. . EXCITED STATES OF DONORS BOUND TO X VALLEYS IN GAAS-ALAS TYPE II STRUCTURES. 1996. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

23.
WEBER, G.; DE PAULA, A. M. . GAMMA TO XZ ELECTRON TRANSFER TIMES IN TYPE-II GAAS/ALAS SUPERLATTICESDUE TO EMISSION OF CONFINED AND INTERFACE PHONONS. 1996. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

24.
WEBER, G.; CARNEIRO, G. N. . X valley 2s-donor states in GaAs-AlAs type II structures. 1996. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

25.
WEBER, G.; DE PAULA, A. M. . Gamma to X_z electron transfer times in type-II superlattices due to emission of optical phonons. 1996. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

26.
CARNEIRO, G. N. ; WEBER, G. . Estados excitados de doadores rasos ligados aos vales X em estruturas tipoII de GaAs/AlAs. 1996. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

27.
WEBER, G.; DE PAULA, A. M. . Transferência \Gamma-X_z em super-redes tipoII de GaAs/AlAs. 1996. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

28.
ALCALDE, A. M. ; WEBER, G. . INTRA- AND INTERSUBBAND TRANSITION RATES DUE TO EMISSION OF OPTIC PHONONS IN QUANTUM WELLS: EFFECTS OF THE SUBBAND NONPARABOLICITY. 1995. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

29.
ALCALDE, A. M. ; WEBER, G. . Nonparabolicity Effects On Transition Rates Due To Confined Phonons In Quantum Wells. 1995. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

30.
WEBER, G.. Binding energies of donors bound to X valleys in GaAs-AlAs type II structures. 1995. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

31.
ALCALDE, A. M. ; WEBER, G. . Nonparabolicity effects on transition rates due to confined and interface phonons in quantum wells. 1995. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

32.
SCHUMACHER, K. L. ; COLLINGS, D. ; WEBER, G. ; PHILLIPS, R. T. ; SCHULMAN, J. N. ; RITCHIE, D. A. ; PLOOG, K. . Inter- and intrasubband relaxation times in GaAs/Al0.35Ga0.65As quantum wells measured by femtosecond time-resolved differential transmission. 1995. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

33.
WEBER, G.. Energias de ligação de doadores rasos ligados aos vales X em estruturas tipo II de GaAs/AlAs. 1995. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

34.
ALCALDE, A. M. ; WEBER, G. . Efeitos de não-parabolicidade nas taxas de transição devido a fônons confinados em poços quânticos. 1995. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

35.
CARNEIRO, G. N. ; WEBER, G. ; OLIVEIRA, L. E. . BINDING ENERGIES AND INTRA-DONOR ABSORPTION SPECTRA IN GAAS-GAALAS QUANTUM WELLS. 1994. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

36.
WEBER, G.; DE PAULA, A. M. . Processos de captura de portadores em super-redes e poços quânticos devido a emissão de fônons confinados. 1994. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

37.
WEBER, G.; CARNEIRO, G. N. ; OLIVEIRA, L. E. . Energias de ligação e densidades de estados excitados de doadores rasos em poços quânticos de GaAs-AlGaAs. 1994. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

38.
DE PAULA, A. M. ; WEBER, G. . CARRIER CAPTURE VIA CONFINED PHONONS IN GAAS-ALGAAS MULTIPLE QUANTUM WELLS. 1993. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

39.
WEBER, G.; DE PAULA, A. M. . Captura de portadores em poços quânticos de GaAs-AlGaAs. 1993. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

40.
WEBER, G.. Intrasubband and intersubband scattering times due to confined and interface phonon modes in quantum wells under the influence of an electric field. 1992. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

41.
WEBER, G.; RYAN, J. F. . Taxas de espalhamento elétron-fônon em poços quânticos devido a fônons óticos em um campo elétrico longitudinal. 1992. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

42.
WEBER, G.. Transições intra- e intersub-banda em poços quânticos de GaAs-Ga_{1-x}Al_xAs devido a fônons de interface. 1992. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

43.
DE PAULA, A. M. ; WEBER, G. ; RYAN, J. F. . Espalhamento Raman em super-redes Tipo II de GaAs/AlAs. 1992. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

44.
DE PAULA, A. M. ; MACIEL, A. C. ; WEBER, G. ; RYAN, J. F. ; DAWSON, P. ; FOXON, C. T. . SUBPICOSECOND REAL-SPACE CHARGE TRANSFER IN GAAS/ALAS TYPE II SUPERLATTICES. 1991. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

45.
WEBER, G.; OLIVEIRA, L. E. . Optical Absorption Spectra Associated To Shallow Impurities In GaAs-(Ga,Al)As Quantum Well Wires.. 1990. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

46.
WEBER, G.. Effects of electric field on the optical spectra of shallow impurity states in quantum wells. 1990. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

47.
WEBER, G.. Efeito de campo elétrico no espectro ótico de impurezas hidrogênicas em poços quânticos. 1990. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

48.
WEBER, G.. Eletric Field Dependence Of The Density Of States And Energy Spectra Of Shallow Impurities In Quantum-Wells.. 1989. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

49.
WEBER, G.. Optical Absorpion Spectra Of Shallow Impurities In Quantum Wells: Effect Of An Applied Electric Field.. 1989. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

50.
WEBER, G.; OLIVEIRA, L. E. . Propriedades de absorção ótica devido a impurezas rasas em fios de poços quânticos de GaAs-(Ga,Al)As. 1989. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

51.
WEBER, G.. Absorção ótica devido a impurezas rasas em poços quânticos de GaAs-(Ga,Al)As: Efeito do campo elétrico longitudinal. 1989. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

52.
WEBER, G.; OLIVEIRA, L. E. . Valley-Orbit Corrections And Stress Effects On 'O Pot.-' States In Ge:P And Ge:Sb.. 1988. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

53.
WEBER, G.; OLIVEIRA, L. E. . Efeitos de pressão uniaxial na energia de ligação de estados D- em G:Sb e Ge:As. 1988. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

54.
WEBER, G.; SCHULZ, P. A. ; OLIVEIRA, L. E. . Efeitos de blindagem e densidades de estados de impurezas rasas em fios de poços quânticos de GaAs-(Ga,Al)As. 1988. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

55.
WEBER, G.; RIBEIRO, C. A. . Monte Carlo Simulation Method Applied To The Study Of Ebic In A Semiconductor Laser.. 1987. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

56.
WEBER, G.; OLIVEIRA, L. E. . On The Binding Energies Of 'D Pot.-' States In Doped Germanium: Effect Of Compressive Uniaxial Stress.. 1987. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

57.
WEBER, G.; SCHULZ, P. A. ; OLIVEIRA, L. E. . Energy Spectra Of Hydrogenic Impurities In 'Ga Al - Ga Ind1-X Al Ind.X As'. Quantum-Well-Wires. 1987. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

58.
WEBER, G.; RIBEIRO, C. A. . Aplicação do método Monte Carlo na simulação da microssonda eletrônica. 1986. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

59.
WEBER, G.; RIBEIRO, C. A. . Simulação por método Monte Carlo da microssonda eletrônica. 1984. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

60.
WEBER, G.; RIBEIRO, C. A. . Distribuição de elétrons do feixe primário em uma estrutura complexa semicondutora. 1984. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

61.
RAMOS, A. C. S. ; WEBER, G. ; RIBEIRO, C. A. . Medidas de corrente induzida por feixe eletrônico em Laser de semicondutor. 1984. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

Outras produções bibliográficas
1.
SATURNINO, G. B. ; GODINHO, C. P. S. ; FAGUNDES-LIMA, D. ; CASTRO-E-SILVA, A. ; Weber, G. . Detection of construction biases in biological databases: the case of miRBase 2014 (Artigo disponibilizado em repositório público arXiv:1407.6570).

2.
FAGUNDES-LIMA, D. ; Weber, G. . CG-content log-ratio distributions of Caenorhabditis elegans and Drosophila melanogaster mirtrons 2013 (Artigo disponibilizado em repositório público arXiv:1301.6099).


Produção técnica
Programas de computador sem registro
1.
Weber, G.. VarGibbs: nearest-neighbour parameters from DNA melting temperatures. 2014.

2.
Weber, G.. TfReg: Calculates melting temperatures of DNA and RNA with mesoscopic models. 2012.



Bancas



Participação em bancas de trabalhos de conclusão
Mestrado
1.
DICKMAN, R.; WARDIL, L. L.; Weber, G.. Participação em banca de Luisa Fernanda Ramirez Ochoa. Signs of criticality in a virtual vertebrate retina. 2018. Dissertação (Mestrado em Física) - Universidade Federal de Minas Gerais.

2.
PORTUGAL, R. V.; Weber, G.; BORGES, J. C.. Participação em banca de Alfredo Jose Florez Ariza. Análise estrutural do enovelamento do DNA no complexo da iniciação de transcrição bacteriano usando microscopia eletrônica de transmissão e análise de partículas isoladas. 2018. Dissertação (Mestrado em Física) - Universidade de São Paulo.

3.
MACHADO, R. F.; ROCHA, J. C. S.; Weber, G.. Participação em banca de Adelson de Brito Sales. Estudo das propriedades termodinâmicas do DNA via coeficientes de wavelets. 2017. Dissertação (Mestrado em Ciências) - Universidade Federal de Ouro Preto.

4.
DICKMAN, R.; MOL, L. A. S.; Weber, G.. Participação em banca de D'Angeles Lé Pereira de Lima. Simulação do comportamento crítico da atividade de um modelo neuronal em uma rede modular hierárquica. 2016. Dissertação (Mestrado em Física) - Universidade Federal de Minas Gerais.

5.
GUERRA-SÁ, R.; FRANCO, G. R.; Weber, G.. Participação em banca de Victor Fernandes de Oliveira. Identificação e caraterização de microRNAs específicos de Schistosoma mansoni. 2013. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade Federal de Ouro Preto.

6.
WEBER, G.. Participação em banca de Roberto Menezes Serra. Distribuição eletrônica em um poço quântico levemente dopado e compensado em função da temperatura. 1998. Dissertação (Mestrado em Física) - Universidade de São Paulo.

7.
WEBER, G.. Participação em banca de Gleise das Neves Carneiro. Estados excitados de impurezas hidrogenóides rasas em poços quânticos de GaAs-GaAlAs. 1994. Dissertação (Mestrado em Física) - Universidade Estadual de Campinas.

8.
WEBER, G.. Participação em banca de Pablo Héctor Rivera Riofano. Análise da dimensionalidade do emissor de um diodo de tunelamento ressonantes. 1994. Dissertação (Mestrado em Física) - Universidade Estadual de Campinas.

9.
WEBER, G.. Participação em banca de Vânia Aguiar Moura. A BarreiraSchottky na interface Al:$n$\--GaAs(100) preparada por MBE. 1992. Dissertação (Mestrado em Física) - Universidade Federal de Minas Gerais.

Teses de doutorado
1.
DaSilva JK; DICKMAN, R.; ARENZON, J. J.; CAMPOS, P. R. A.; Weber, G.. Participação em banca de Marco Antonio Ribeiro Amaral. Teoria dos jogos evolucionários e o surgimento da cooperação: dinâmicas inovativas e jogos mistos. 2017. Tese (Doutorado em Física) - Universidade Federal de Minas Gerais.

2.
WEBER, GERALD. Participação em banca de Fabiano Augusto de Paula Crisafuli. Caracterização das interações do DNA com as moléculas Actinomicina D e GelRed. 2016. Tese (Doutorado em Física) - Universidade Federal de Viçosa.

3.
MESQUITA, O. N.; ROCHA, M. S.; FIGUEIREDO, J. M. A.; Weber, G.; BARBOSA, M. C. B.; LUCIO, A. D.. Participação em banca de Patrícia Santos Alves Sales. Efeitos da elasticidade e blindagem eletrostática nas interações DNA-ligantes estudados via a técnica de pinçamento óptico. 2016. Tese (Doutorado em Física) - Universidade Federal de Minas Gerais.

4.
FRANCO, G. R.; FIETTO, J. L. R.; PASSETTI, F.; RABELO, E. M. L.; Weber, G.. Participação em banca de Mainá Bitar Lourenço. Genomic and transcriptomic surveys for the study of ncRNAs with a focus on tropical parasites. 2015. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.

5.
PASCUTTI, P. G.; BLEICHER, L.; ARAUJO, A. S.; SILVA, T. A. S.; Weber, G.. Participação em banca de Moema Monteiro Batista. Avaliação da ação do peptídeo antimicrobiano dermadisticina K em membrana modelo por dinâmica molecular. 2015. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.

6.
MOREIRA, J. G. M. A.; FARIA, A. A. P.; ANDRADE JUNIOR, J. S.; MENEZES, M. A. F.; Weber, G.. Participação em banca de Caio Franca Merelim Magalhães. Engarrafamento e segregação em empilhamentos abertos de grãos. 2013. Tese (Doutorado em Física) - Universidade Federal de Minas Gerais.

7.
Drigo Filho, E.; Weber, G.; CHAHINE, J.; GOLDMAN, C.; DUTRA, A. S. E.. Participação em banca de Natália Favaro Ribeiro. Modelos de redes unidimensionais aplicados ao estudo termodinâmico do DNA. 2013. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

8.
RUGGIERO, J. R.; Weber, G.; CALIRI, A.; LEONEL, E. D.; CHAHINE, J.. Participação em banca de Gabriel Gouvea Slade. Modelos mecânicos para o estudo da dinâmica do DNA. 2013. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

9.
DaSilva JK; PLASCAK, J. A.; MARTINEZ, A. S.; MARTINS, M. L.; Weber, G.. Participação em banca de Lucas Lages Wardil. Mecanismos cooperativos: adotando estratégias diferentes contra oponentes distintos no dilema do prisioneiro. 2012. Tese (Doutorado em Física) - Universidade Federal de Minas Gerais.

10.
DICKMAN, R.; MOREIRA, C. H. C.; DaSilva JK; OKUNO, E.; ALMEIDA, R. M. C.; WEBER, G.. Participação em banca de Fernando Pereira de Faria. Modelagem estocástica aplicada ao efeito bystander radioinduzido em culturas celulares e processos epidêmicos. 2012. Tese (Doutorado em Física) - Universidade Federal de Minas Gerais.

11.
RUIZ, J. C.; SILVEIRA FILHO, J. F.; MIRANDA, A. B.; WARD, R. J.; Weber, G.; BLEICHER, L.. Participação em banca de Antônio Mauro Rezende. Predição computacional de interações de proteína-proteína em proteomas preditos de Leishmania. 2012. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.

12.
Drigo Filho, E.; WEBER, G.; RICOTTA, R. M.; LUCA FILHO, J. V.; TSUCHIDA, M.. Participação em banca de Hernan Oscar Cortez Gutierrez. Modelo dinâmico e estatístico aplicado a transição de fase. 2009. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

13.
WEBER, G.. Participação em banca de João Carlos de Oliveira Guerra. Aplicação do modelo tetraédrico à termodinâmica de DNA e ao cálculo de correlações nucleotídicas ao longo da sequência de DNA. 2009. Tese (Doutorado em Física) - Universidade Federal de Minas Gerais.

14.
WEBER, G.. Participação em banca de Ricardo Alexandre dos Santos Silva. Modelo vibro-rotacional para a molécula de DNA. 2008. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

15.
WEBER, G.. Participação em banca de Ihosvany Camps Rodríguez. Estudo das propriedades eletrônicas e de emissão de um laser de fônons. 2001. Tese (Doutorado em Física) - Universidade Federal Fluminense.

16.
WEBER, G.. Participação em banca de Fábio de Jesus Ribeiro. Efeitos de campos externos sobre estados de impurezas em nanoestruturas semicondutoras. 1999. Tese (Doutorado em Física) - Universidade Federal Fluminense.

17.
WEBER, G.. Participação em banca de Sérvio Túlio Perez Merchancano. Fotoluminescência em fios quânticos cilíndricos de GaAs-(Ga,Al)As. 1997. Tese (Doutorado em Física) - Universidade Estadual de Campinas.

18.
WEBER, G.. Participação em banca de Victor Ciro Solano Reynoso. Estudo do controle do crescimento de nanoestruturas semicondutoras do tipo CdTe e CdTeS em matrizes vítreas borosilicatos. 1996. Tese (Doutorado em Física) - Universidade Estadual de Campinas.

19.
WEBER, G.. Participação em banca de Denise Fernandes de Mello. O papel da desordem local e da interferência quântica na localização dos estados eletrônicos. 1995. Tese (Doutorado em Física) - Universidade Estadual de Campinas.

Qualificações de Doutorado
1.
PINTO, F. C. F.; MAGALHAES, M. T. Q.; Weber, G.. Participação em banca de Giovanni Marques de Castro. Predição e validação de genes essenciais em insetos por aprendizado de máquina. 2018. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.

2.
LOBO, F. P.; GOES NETO, A.; Weber, G.. Participação em banca de Néli José da Fonseca Júnior. Modelagem e decomposição de redes de coevolução de aminoácidos: aplicações em determinação de especificidade e anotação de proteínas. 2018. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.

3.
Weber, G.; DICKMAN, R.; MESQUITA, O. N.. Participação em banca de Marco Antonio Amaral. Emergência da cooperação em jogos mistos e multi-games. 2015. Exame de qualificação (Doutorando em Física) - Universidade Federal de Minas Gerais.

4.
Weber, G.; DaSilva JK; MESQUITA, O. N.. Participação em banca de Bruno Barbosa Rodrigues. Estudo da interação entre DNA e intercalantes via simulação computacional. 2014. Exame de qualificação (Doutorando em Física) - Universidade Federal de Minas Gerais.

5.
Weber, G.; MOREIRA, J. G. M. A.; MESQUITA, O. N.. Participação em banca de Alexandre de Aquino Soares. A mutabilidade como adaptabilidade: a importância da seleção de segunda ordem de alelos mutadores. 2014. Exame de qualificação (Doutorando em Física) - Universidade Federal de Minas Gerais.

6.
FIGUEIREDO, J. M. A.; BARBOSA, P. L. M.; Weber, G.. Participação em banca de Patrícia Santos Alves Salles. Estudo da formação de clusters na interação DNA/ciclodextrina via a técnica de pinçamento óptico. 2014. Exame de qualificação (Doutorando em Física) - Universidade Federal de Minas Gerais.

7.
BLEICHER, L.; REGIS, W. C. B.; Weber, G.. Participação em banca de Moema Monteiro Batista. Simulações de dinâmica molecular com peptideo antimicrobiano dermadisticina K em mistura de TFE/água. 2013. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.

8.
FELICORI, L. F.; SAMMETH, M. A. M. T.; Weber, G.. Participação em banca de Mainá Bitar Lourenço. Aplicação da bioinformática no estudo de sequências e estruturas biológicas de agentes etiológicos de doenças tropicais. 2013. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.

9.
PFANNES, H. D.; PANIAGO, R. M.; Weber, G.. Participação em banca de Alexandre Alberto Chaves Cotta. Estudo da estrutura da face (001) de ligas de cobre e do crescimento de grafeno sobre superfície magnética. 2012. Exame de qualificação (Doutorando em Física) - Universidade Federal de Minas Gerais.

10.
Alexandre, S. S.; Pimenta, M. A.; WEBER, G.. Participação em banca de Ana Paula Moreira Barboza. Estudo de propriedades eletromecânicas de estruturas de carbono por SPM. 2011. Exame de qualificação (Doutorando em Física) - Universidade Federal de Minas Gerais.

11.
Pereira, E. A.; da Costa, B. V.; WEBER, G.. Participação em banca de Caio Franca Merelim Magalhães. Estudo da transição de engarrafamentoi e do efeito de segregação em empilhamento de materiais granulares. 2011. Exame de qualificação (Doutorando em Física) - Universidade Federal de Minas Gerais.

12.
WEBER, G.; PLASCAK, J. A.; BATISTA, U. A.. Participação em banca de Lucas Lages Wardil. Mecanismos promotores da cooperação entre indivíduos de populações biológicas. 2010. Exame de qualificação (Doutorando em Doutorado em Física) - Universidade Federal de Minas Gerais.

13.
PLASCAK, J. A.; DaSilva JK; WEBER, G.. Participação em banca de Júlio César Mansur Filho. Caminhantes aleatórios sonolentos: Análise exata e simulações de Monte Carlo. 2010. Exame de qualificação (Doutorando em Física) - Universidade Federal de Minas Gerais.

Trabalhos de conclusão de curso de graduação
1.
AGUIAR JUNIOR, O. G.; Weber, G.. Participação em banca de Túlio Galvão Oliveira.Ensino investigativo mediado por computador. 2016. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Física) - Universidade Federal de Minas Gerais.

2.
CASTRO-E-SILVA, A.; MOREIRA, L. M.; WEBER, G.. Participação em banca de Mariana Almeida de Souza.Comparação entre alinhamento global e alinhamento local através de redes de similaridade de elementos transponíveis de Homo sapiens. 2012. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de Ouro Preto.



Participação em bancas de comissões julgadoras
Concurso público
1.
WEBER, G.; ROCHA, M. S.; FRANCISCO NETO, A.. Concurso público para contatação de professor efetivo CPD 119/2010. 2011. Universidade Federal de São João Del-Rei.

2.
WEBER, G.; DE PAULA, A. M.; CASTRO-E-SILVA, A.. Concurso de professor efetivo na área de de tecnologia de materiais. 2008. Instituto Federal Minas Gerais.

3.
WEBER, G.. Concurso Edital 2007/35/UFOP. 2007. Universidade Federal de Ouro Preto.

Outras participações
1.
SANTOS JUNIOR, J. F. C.; LEITE, C. F.; WEBER, G.. Comissão de seleção para o Doutorado em Física da UFMG. 2010. Universidade Federal de Minas Gerais.



Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
XLIII Annual Meeting of the Brazilian Biophysical Society.MESOSCOPIC MODELS AS A TOOL FOR PROBING MOLECULAR INTERACTIONS IN DNA AND RNA. 2018. (Encontro).

2.
X-Meeting 2016 12th International Conference of the AB3C. Determining the stability of DNA/RNA hybrid duplexes. 2016. (Congresso).

3.
XXXIX Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada.Mesoscopic models and melting temperatures: a tool to understand the molecular interactions in DNA and RNA. 2016. (Encontro).


Organização de eventos, congressos, exposições e feiras
1.
WEBER, GERALD. Comitê Nacional do 9th IUPAP International Conference on Biological Physics. 2017. (Congresso).

2.
GUERRA, J. C. O. ; ANDRADE, P. C. P. ; Weber, G. . III Simpósio Interdisciplinar Física+Bioinformática. 2014. (Congresso).

3.
WEBER, G.; CASTRO-E-SILVA, A. ; GUERRA-SÁ, R. ; WANNER, E. F. ; RUIZ, J. C. . Simpósio Interdisciplinar Física+Bioinformática 2009. 2009. (Congresso).

4.
PERPETUO, G. J. ; WEBER, G. ; BOSELLI, M. A. ; CASTRO-E-SILVA, A. ; MACHADO, R. F. ; PINHEIRO, C. B. ; PAULA, H. F. E. ; ARMOND, R. A. S. Z. ; FERREIRA JUNIOR, S. C. . VI Encontro Regional da Sociedade Brasileira de Física. 2008. (Congresso).



Orientações



Orientações e supervisões em andamento
Dissertação de mestrado
1.
Pâmella Miranda de Moura. Influência de marcadores Cy3 e Cy5 na estabilidade térmica de DNA. Início: 2018. Dissertação (Mestrado profissional em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais. (Orientador).

Tese de doutorado
1.
Maria Izabel Muniz da Conceição. Modelos Mesoscópicos triplexos de DNA. Início: 2018. Tese (Doutorado em Física) - Universidade Federal de Minas Gerais, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Orientador).

2.
Mateus Rodrigues Leal. Adaptação helicoidal do modelo Peyrard-Bishop para DNA. Início: 2016. Tese (Doutorado em Física) - Universidade Federal de Minas Gerais, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Orientador).

Iniciação científica
1.
Vivianne Basílio Barbosa. Modelos mesoscópicos e de energia livre de Gibbs para oligonucleotídeos. Início: 2016. Iniciação científica (Graduando em Física) - Universidade Federal de Minas Gerais, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais. (Orientador).

2.
Izabela Ferreira da Silva. Parametrização do modelo Peyard-Bishop para oligonucleotídios. Início: 2014. Iniciação científica (Graduando em Física) - Universidade Federal de Minas Gerais, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais. (Orientador).


Orientações e supervisões concluídas
Dissertação de mestrado
1.
Mateus Rodrigues Leal. Análise da divergência na integral de transferência do modelo Peyrard-Bishop de DNA. 2016. Dissertação (Mestrado em Física) - Universidade Federal de Minas Gerais, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais. Orientador: Gerald Weber.

2.
Miriam Celi de Souza Nunes. Otimização de periodicidades fracas em genomas utilizando transformadas de Fourier e algorítmos genéticos. 2013. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade Federal de Ouro Preto, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Gerald Weber.

3.
Denise Fagundes Lima. Perfis de flexibilidade de regiões promotoras de organismos eucariotos. 2012. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade Federal de Ouro Preto, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Gerald Weber.

4.
Luciana Márcia de Oliveira. Estudos genômicos de flexibilidade e energia livre associados à distribuição de SNPs. 2011. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade Federal de Ouro Preto, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Gerald Weber.

5.
Augusto Miguel Alcalde Milla. EFEITOS DE NAO-PARABOLICIDADE DAS TAXAS DE TRANSICAO INTRA- E INTER- SUBBANDA EM POCOS QUANTICOS VIA EMISSAO DE FONONS OTICOS. 1996. Dissertação (Mestrado em Física) - Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Gerald Weber.

6.
Gleise das Neves Carneiro. ESTADOS EXCITADOS DE IMPUREZAS HIDROGENOIDES RASAS EM POCOS QUANTICOS DE GAAS-GAALAS (EM CO-ORIENTACAO, ORIENTADOR PRINCIPAL LUIZ E. OLIVEIRA). 1994. Dissertação (Mestrado em Física) - Universidade Estadual de Campinas, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Coorientador: Gerald Weber.

Tese de doutorado
1.
Rodolfo Vieira Maximiano. Estudos das propriedades da Inosina em DNA através do modelo Peyrard-Bishop e análise dos parâmetros termodinâmicos utilizados na predição de estruturas secundárias de RNA. 2018. Tese (Doutorado em Física) - Universidade Federal de Minas Gerais, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Gerald Weber.

2.
Erik de Oliveira Martins. Desenvolvimento de modelos mesoscópicos assimétricos para oligonucleotídios e sua aplicação a defeitos tipo single-bulges em RNA.. 2018. Tese (Doutorado em Física) - Universidade Federal de Minas Gerais, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Gerald Weber.

3.
Tauanne Dias Amarante. Análise da estabilidade termodinâmica e de parâmetros estruturais de DNA e RNA por modelos mesoscópicos. 2016. Tese (Doutorado em Física) - Universidade Federal de Minas Gerais, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Gerald Weber.

4.
Augusto Miguel Alcalde Milla. Relaxação de Portadores via Interação Elétron-Fônon em Pontos e Poços Quânticos. 1999. 0 f. Tese (Doutorado em Física) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Gerald Weber.

Supervisão de pós-doutorado
1.
Luciana Márcia de Oliveira. 2018. Universidade Federal de Minas Gerais, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Gerald Weber.

2.
Luciana Márcia de Oliveira. 2016. Universidade Federal de Minas Gerais, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Gerald Weber.

Trabalho de conclusão de curso de graduação
1.
Caio Padoan de Sá Godinho. Analise computacional de redes de RNAs nao codificantes. 2011. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de Ouro Preto, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Gerald Weber.

2.
Miriam Celi de Souza Nunes. Análises de periodicidades por transformada de Fourier no genoma do parasito Plasmodium falciparum. 2010. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de Ouro Preto, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais. Orientador: Gerald Weber.

3.
Denise Fagundes Lima. Métodos de busca bioinformática de microRNA. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de Ouro Preto. Orientador: Gerald Weber.

Iniciação científica
1.
Pâmella Miranda de Moura. Influência de marcadores Cy3 e Cy5 na estabilidade térmica de DNA. 2017. Iniciação Científica. (Graduando em Física) - Universidade Federal de Minas Gerais. Orientador: Gerald Weber.

2.
Guilherme Bicalho Saturnino. Simulação de redes de similaridade de transposons e de RNAs não codificantes. 2011. Iniciação Científica. (Graduando em Física) - Universidade Federal de Minas Gerais, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Gerald Weber.

3.
Caio Padoan de Sá Godinho. Desenvolvimento de aplicativos de bioinformática para deteção de motifs de RNA não-codificante. 2009. Iniciação Científica. (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de Ouro Preto, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Gerald Weber.

4.
Miriam Celi de Souza Nunes. Periodicidade de parâmetros físicos de flexibilidade de DNA em genomas por técnicas de processamento de sinais. 2008. Iniciação Científica. (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de Ouro Preto. Orientador: Gerald Weber.

5.
Denise Fagundes Lima. Desenvolvimento e análise de interfaces de bioinformática para busca de alvos de microRNA. 2007. Iniciação Científica. (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de Ouro Preto, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais. Orientador: Gerald Weber.

6.
Thiago Rodrigo Gomes da Silva. Estudo do programa Mfold para previsão de estruturas secundárias de RNA. 2007. Iniciação Científica. (Graduando em Física) - Universidade Federal de Ouro Preto. Orientador: Gerald Weber.

7.
Geraldo Creci Filho. Níveis de energia em fios quânticos tipo {\em v-groove}. 1999. Iniciação Científica. (Graduando em Engenharia de Automação e Sistemas) - Universidade São Francisco, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Gerald Weber.

8.
Carolina Chaves de Abreu. Fônons confinados e de interface em fios quânticos tipo {\em v-groove}. 1999. Iniciação Científica - Universidade São Francisco, Universidade São Francisco. Orientador: Gerald Weber.

Orientações de outra natureza
1.
Denise Fagundes Lima. Modelos de flexibilidade microscópica de oligonucleotídios e suas aplicações em busca bioinformática de microRNA. 2012. Orientação de outra natureza - Universidade Federal de Minas Gerais, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais. Orientador: Gerald Weber.

2.
Caio Padoan de Sá Godinho. Modelos de flexibilidade microscópica de oligonucleotídios e suas aplicações em busca bioinformática de microRNA. 2011. Orientação de outra natureza - Universidade Federal de Minas Gerais, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais. Orientador: Gerald Weber.



Outras informações relevantes


New& Views de M. Peyrard descrevendo a importância da nossa contribuíção na área de biofísica (Nature Phys., Jan 2006). Artigo convidado para a edição especial DNA melting da Journal of Physics: Condensed Matter (Jan 2009). Achievements of the Basic Technology Programme: menção de dois dos nossos artigos na página institucional do Research Councils UK.



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