John Anthony McCulloch

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  • Última atualização do currículo em 28/05/2018


Possui graduação em Farmácia e Bioquímica pela Universidade de São Paulo (1999) e Doutorado em Farmácia (Análises Clínicas) pela Universidade de São Paulo (2006). Fez pós-doutorado no Institut National de la Recherche Agronomique na França e no Instituto de Ciências Biológicas da Universidade Federal de Minas Gerais. Entre 2009 e 2015 ocupou o cargo de professor adjunto no Instituto de Ciências Biológicas da Universidade Federal do Pará. Tem experiência na área de Microbiologia, com ênfase em Bacterologia, concentrando-se principalmente nos seguintes temas: bioprospecção, genômica bacteriana e resistência a antibióticos. Foi coordenador do Programa de Pós-graduação em Biotecnologia da UFPA. Foi bolsista FAPESP de estágio pós-doutoral na Faculdade de Ciências Farmacêuticas da Universidade de São Paulo. Atualmente é pesquisador do National Cancer Institute no National Institutes of Health, em Bethesda, nos Estados Unidos da América, onde desenvolve abordagens de bioinformática e biologia molecular para o estudo do cross-talk entre a microbiota e o hospedeiro no contexto do câncer. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
John Anthony McCulloch
Nome em citações bibliográficas
MCCULLOCH, J. A.;McCulloch, John Anthony;MCCULLOCH, J;McCulloch, J.A.;McCulloch, John;McCulloch, John A;McCulloch, John A.

Endereço


Endereço Profissional
National Institutes of Health, National Cancer Institute.
9000 Rockville Pike
North Bethesda
20892 - Bethesda, - Estados Unidos
Telefone: (301) 4964000
URL da Homepage: https://www.nih.gov/about-nih/what-we-do/nih-almanac/national-cancer-institute-nci


Formação acadêmica/titulação


2002 - 2006
Doutorado em Farmácia (Fisiopatologia e Toxicologia).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: Avaliação da funcionalidade do locus accessory gene regulator (agr) em cepas brasileiras de Staphylococcus aureus com sensibilidade reduzida à vancomicina, Ano de obtenção: 2006.
Orientador: Elsa Masae Mamizuka.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
Palavras-chave: Staphylococcus aureus; agr; resistência; vancomicina; virulência.
Grande área: Ciências da Saúde
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia / Subárea: Biologia e Fisiologia dos Microorganismos.
Setores de atividade: Cuidado À Saúde das Populações Humanas.
1994 - 1999
Graduação em Farmácia e Bioquímica.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
1990 - 1993
Ensino Médio (2º grau).
Escola Britância de São Paulo Saint Pauls School, EBSP, Brasil.


Pós-doutorado


2013
Pós-Doutorado.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências da Saúde / Área: Saúde Coletiva / Subárea: Saúde Pública.
2009 - 2009
Pós-Doutorado.
Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
Grande área: Ciências Biológicas
2007 - 2009
Pós-Doutorado.
Institut National de la Recherche Agronomique, INRA/UMR/CSGA, França.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
Grande área: Ciências Biológicas


Atuação Profissional



Instituto Evandro Chagas, IEC, Brasil.
Vínculo institucional

2012 - 2013
Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Pesquisador, Carga horária: 10
Outras informações
Atualmente vice-coordenador do Núcleo de Genômica do CIT-IEC http://www.iec.pa.gov.br/cit/ngenomica/pt/equipe.html


Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Vínculo institucional

2013 - 2016
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pós-Doutorando, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações
Bolsista de Pós-Doutorado da FAPESP

Vínculo institucional

2012 - 2016
Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Professor Colaborador de Programa de Pós Grad, Carga horária: 2
Outras informações
Professor Colaborador do Programa de Pós Graduação em Fisiopatologia e Toxicologia da Faculdade de Ciências Farmacêuticas da Universidade de São Paulo. Disciplina ministrada: Bioinformática para Análises Clínicas (FBC 5771)

Vínculo institucional

2001 - 2006
Vínculo: Aluno de Pós-Graduação (doutor, Enquadramento Funcional: Aluno de Pós-Graduação, Carga horária: 40

Vínculo institucional

2000 - 2001
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Técnico de Nível Superior, Carga horária: 40

Atividades

07/2012 - Atual
Ensino, Farmácia (Fisiopatologia e Toxicologia), Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Bioinformática para Análises Clínicas (FBC5771)
07/2002 - 07/2007
Ensino, Farmácia e Bioquímica, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
FBC502 Microbiologia Clínica (Professor Convidado)
02/2004 - 06/2004
Ensino, Farmácia e Bioquímica, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Programa de Aperfeiçoamento de Ensino (PAE) para a disciplina FBC502 Microbiologia Clínica
5/2000 - 5/2001
Serviços técnicos especializados , Faculdade de Ciências Farmacêuticas, Departamento de Análises Clínicas e Toxicológicas.

Serviço realizado
Técnico de nível superior pelo programa PROCONTES da Pró-Reitoria de Pesquisa.

Universidade Federal do Pará, UFPA, Brasil.
Vínculo institucional

2009 - 2015
Vínculo: , Enquadramento Funcional: Professor Adjunto, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações
Professor Adjunto da Faculdade de Biotecnologia Lotado no Instituto de Ciências Biológicas Foi coordenador do Programa de Pós Graduação em Biotecnologia da UFPA (PBiotec)

Vínculo institucional

2011 - 2011
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Coordenador de Curso de Pós Graduação, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações
Coordenador do Curso de Pós Graduação em Biotecnologia (PBiotec) do ICB-UFPA

Atividades

03/2012 - 09/2013
Ensino, Farmácia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Biologia Celular (Bioquímica)
01/2011 - 09/2013
Ensino, BIOTECNOLOGIA, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Aspectos Sociais da Biotecnologia
Biotecnologia Médica
08/2010 - 09/2013
Ensino, Biotecnologia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Microbiologia aplicada à Biotecnologia
04/2010 - 09/2013
Ensino, Genética e Biologia Molecular, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Bases Genéticas da Resistência dos Microrganismos aos Antibióticos
Genética de Microrganismos
03/2010 - 06/2010
Ensino, Medicina, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Mecanismos de Agressão e Defesa - Bacteriologia
03/2010 - 06/2010
Ensino, Odontologia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Ciências Patológicas - Bacteriologia
11/2009 - 12/2009
Ensino, Medicina, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Mecanismos de Agressão e Defesa
09/2009 - 12/2009
Ensino, Nutrição, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Imunologia e Microbiologia para Nutrição

Institut National de la Recherche Agronomique, INRA/UMR/CSGA, França.
Vínculo institucional

2007 - 2009
Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Pós-Doutorado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.


Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.
Vínculo institucional

2007 - 2011
Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Pesquisador, Carga horária: 1


National Institutes of Health, NIH, Estados Unidos.
Vínculo institucional

2016 - Atual
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Research Fellow, Regime: Dedicação exclusiva.



Projetos de pesquisa


2012 - 2016
Estudo da resistência heterogênea à vancomicina em Staphylococcus aureus através da genética comparativa de subpopulações de um isolado
Descrição: A vancomicina é um antibiótico de primeira linha e, não raro, única alternativa viável contra infecções por S. aureus resistente a meticilina (MRSA). O surgimento de cepas de MRSA que não respondem ao tratamento com vancomicina (cepas VISA) está ligado a um fenótipo de resistência cujo mecanismo envolve o paulatino engrossamento da parede celular bacteriana, o que pode ocorrer por conjuntos diferentes de mutações em vários genes. Logo, não há, como na resistência a outros antibióticos, genes únicos que podem servir como marcadores moleculares de resistência, o que impede a detecção do fenótipo VISA por biologia molecular. Ademais, certas linhagens pré-VISA apresentam o fenômeno de resistência heterogênea à vancomicina, em que dentro de uma dada população celular, subpopulações apresentam concentrações inibitórias mínimas (CIMs) altas de vancomicina, sendo a CIM média populacional baixa o suficiente para levar a um resultado falso sensível quando pesquisado no laboratório clínico de rotina por métodos tradicionais. Todavia, quando se cultiva uma cepa hetero-VISA, há a ocorrência de subpopulações com CIMs maiores do que a maioria, que não seriam detectadas por sequenciamento, já que as outras versões polimórficas de um gene em questão, por ocorrerem em número muito maior, levariam a um resultado representativo somente daquele polimorfismo. A proposição do presente projeto é, portanto, usar um approach de célula única (single cell) para identificar quais genes previamente atribuídos ao fenótipo de resistência intermediária homogênea à vancomicina (VISA) encontram-se mutados em subpopulações de linhagens hetero-VISA. Os genomas amplificados por MDA das células únicas isoladas serão sequenciados completamente e comparar-se-ão as sequencias de todas as CDSs, e em especial as dos genes SA1702, vraS, agrC, prsA, yycH, graR e graS de células isoladas por diluição obtidas de uma única colônia de linhagens hetero-VISA. O mesmo será feito com células obtidas de linhagens com.
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) .
Integrantes: John Anthony McCulloch - Coordenador / Geraldo Alécio de Oliveira - Integrante / Elsa Masae Mamizuka - Integrante / Paula Juliana Pérez Chaparro - Integrante / Evonnildo da Costa Gonçalves - Integrante / Marcio Roberto Teixeira Nunes - Integrante / Pedro Alves d?Azevedo - Integrante / Alessandro Conrado de Oliveira Silveira - Integrante.Financiador(es): Instituto Evandro Chagas - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
2012 - 2014
Genômica da Microbiota Endofítica do Açaí
Descrição: O açaí é uma fonte de alimento tradicional na Amazônia oriental, mas vem sendo o alvo de estudos que visam a utilização de subprodutos bioativos oriundos desse fruto. Por ser rico em compostos fenólicos, antioxidantes e ter composição distinta de outros frutos, esse estudo visa caracterizar a microbiota bacteriana endofítica do açaí com fins de bioprospecção de novos biocatalisadores com ação sobre esses compostos, e também para compreender quais vias metabólicas potencialmente participam do processo de fermentação bacteriana natural da polpa de açaí. Foram isoladas espécies bacterianas endofíticas do açaí, que foram sequenciadas. Através de genômica comparativa, buscar-se-ão regiões de diferença genômica entre os isolados encontrados e isolados da mesma espécie isolados de outros contextos ecológicos disponíveis no GenBank, para também compreender quais genes estão correlacionados com um modus vivendi endofítico..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (0) .
Integrantes: John Anthony McCulloch - Coordenador / Paula Juliana Pérez Chaparro - Integrante / Evonnildo da Costa Gonçalves - Integrante / Hervé Louis Ghislain Rogez - Integrante / Marcio Roberto Teixeira Nunes - Integrante.Financiador(es): Instituto Evandro Chagas - Auxílio financeiro.
Número de produções C, T & A: 1
2012 - Atual
Análise metagenômica da microbiota periodontal subgengival em indivíduos com e sem doença periodontal
Descrição: A periodontite é uma doença infecciosa polimicrobiana apontada como um problema de saúde mundial pela OMS. A busca da etiologia da periodontite já dura mais de três séculos, mas cada avanço da tecnologia microbiológica tem apenas mostrado, com cada vez maior resolução, a imensa complexidade da interação da microbiota oral com o hospedeiro. As técnicas de biologia molecular permitiram a detecção de microrganismos não cultiváveis em amostras periodontais, o que avançou muito a compreensão da etiologia. As técnicas usadas até agora para o catálogo de espécies microbianas numa amostra periodontal têm se concentrado na amplificação por PCR de um marcador filogenético tal como 16S rDNA a partir de DNA metagenômico. Apesar de terem rendido avanços no conhecimento da microbiota periodontal, já há ampla discussão na literatura sobre suas limitações. As técnicas de sequenciamento de nova geração permitiram o sequenciamento direto de DNA metagenômico, diminuindo os vieses incorridos na clonagem gênica. Essa abordagem tem sido empregada em poucos estudos da microbiota oral e tem rendido resultados que descrevem uma diversidade microbiana com ordens de grandeza maiores que os estudos dependentes de PCR e clonagem. Este estudo pretende avaliar a estrutura da microbiota e das funções metabólicas por ela efetuadas da placa subgengival em vários sítios de um paciente com periodontite e com sítios de controles pareados sem periodontite empregando como abordagem o sequenciamento direito de DNA metagenômico..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2011 - 2014
Sequenciamento de Genoma de Cepas Produtoras de Beta-Lactamase KPC Brasileiras
Descrição: Por serem muito estáveis, as carbapenemas são antibióticos de último recurso para o tratamento de infecções por Klebsiella pneumoniae. BlaKPC (Klebsiella pneumoniae Carbapenemase) é uma beta-lactamase classe A, de amplo espectro, que foi identificada pela primeira vez em 2001. Uma vez que antibióticos carbapenêmicos são a última opção terapêutica no tratamento de infecções por bactérias multi-resistentes, a sua disseminação entre bactérias de interesse médico é um problema de saúde pública. O fato de blaKPC ser mobilizado horizontalmente por plasmídeos, tem contribuído para a rápida disseminação entre bactérias do mesmo gênero e outros gêneros e famílias. O objetivo desse projeto é, através de uma abordagem genômica, estudar a evolução do conteúdo e arquitetura genômica de cepas de K. pneumoniae portadoras de genes de carbapenemase KPC endêmicas no Brasil, isoladas entre 2005 e 2010, tanto de elementos cromossomais quanto extra-cromossomais para que se compreenda o modo de disseminação desse determinante de resistência no pool genético..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) .
Integrantes: John Anthony McCulloch - Coordenador / Elsa Masae Mamizuka - Integrante / Nilton Lincopan - Integrante / Paula Juliana Pérez Chaparro - Integrante / Evonnildo da Costa Gonçalves - Integrante / Cerdeira, Louise Teixeira - Integrante / Carlos Emílio Levy - Integrante / Marcio Roberto Teixeira Nunes - Integrante / Jorge Luiz Mello Sampaio - Integrante.Financiador(es): Instituto Evandro Chagas - Auxílio financeiro.
Número de produções C, T & A: 2 / Número de orientações: 1
2010 - 2012
Cultivo, Isolamento e Caracterização de Microrganismos Produtores de Lipases com Ação sobre Óleos Vegetais da Região Amazônica
Descrição: A demanda por enzimas catalíticas na crescente indústria de biocombustíveis muitas vezes é atendida pela importação desses insumos, o que gera enorme potencial para o crescimento de empresas provedoras de tais insumos no Brasil. Uma fonte que é, prima facie, natural para a bioprospecção de lipases com ação específica sobre óleos de espécies amazônicas é os microrganismos endofíticos de plantas oleaginosas, uma vez que estes devem ser altamente adaptados ao seu nicho. O objetivo desse trabalho foi o de isolar novos genes que codificam lipases presentes na comunidade microbiana endofítica do fruto de Elaeis guineensis Jacq. (dendê), potencialmente com ação sobre óleo de dendê. Para tal, foi preparado um microcosmo da microbiota endofítica a partir de três amostras de frutos de Elaeis guineensis Jacq (dendê) coletadas no estado do Pará. O DNA metagenômico de um microcosmo de cultura de enriquecimento foi extraído e então usado para construir uma biblioteca de fragmentos que foi sequenciada na plataforma 454 FLX, tendo sido possível identificar novos genes que codificam lipases e outros biocatalizadores..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (2) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) .
Integrantes: John Anthony McCulloch - Coordenador / Paula Juliana Pérez Chaparro - Integrante / Alberdan Silva Santos - Integrante / Luciana Pereira Xavier - Integrante / Evonnildo da Costa Gonçalves - Integrante / Cerdeira, Louise Teixeira - Integrante / Hervé Louis Ghislain Rogez - Integrante / Marcio Roberto Teixeira Nunes - Integrante / João Lídio da Silva Gonçalves Vianez Jr - Integrante / Thaís Cristina Oliveira Coelho - Integrante / Izabela Priscilla de Lima Coelho - Integrante.Financiador(es): Instituto Evandro Chagas - Auxílio financeiro / Fundação Amazônia Paraense de Amparo à Pesquisa - Auxílio financeiro.
Número de produções C, T & A: 2 / Número de orientações: 5
2010 - 2012
Apoio Técnico ao Estudo do Pangenoma de Corynebacterium pseudotuberculosis no estado do Pará
Descrição: O objetivo geral deste trabalho é auxiliar na análise, por bioinformática, de várias sequências de genomas completos de cepas de C. pseudotuberculosis obtidas pela Rede Paraense de Genômica e Proteômica..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (1) / Doutorado: (0) .
Integrantes: John Anthony McCulloch - Coordenador / Vasco Azevedo - Integrante / Artur Luiz da Costa da Silva - Integrante / Sara Cuadros Orellana - Integrante / Siomar de Castro Soares - Integrante.Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.Número de orientações: 1
2009 - 2011
Rede de Engenharia Biológica (Rede Paraense de Genômica e Proteômica)
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
2008 - 2009
Estudo da especificidade de hospedeiro de cepas de Staphylococcus aureus isoladas de ovinos, caprinos, bovinos e humanos.
Descrição: Como patógeno, S. aureus tem a capacidade de causar uma ampla gama de infecções inclusive infecções piogênicas e síndromes tóxicas. Em humanos, essa espécie é encontrada com frequência (em aproximadamente 30% da população em geral) como parte da microbiota de indivíduos sadios, principalmente colonizando a mucosa da cavidade nasal. Em animais não humanos, S. aureus é frequentemente isolado de ruminantes leiteiros e é encontrado no leite desses animais destinado ao consumo humano. A presença de S. aureus na mucosa nasal ou pele de animais é caracterizada por uma relação comensal entre a bactéria e o hospedeiro, todavia, quando essa espécie penetra a mama, o resultado é sempre uma infecção do tecido mamário caracterizado por sinais e sintomas deletérios à saúde do animal. As interações entre S. aureus e o tecido mamário de um hospedeiro ainda não foram elucidadas por completo. As cepas de S. aureus isoladas de mastites são também um problema para a saúde coletiva humana, uma vez que cepas isoladas do leite obtido de glândulas mamárias bovinas infectadas muitas vezes têm genes de enterotoxinas. A contaminação do leite com S. aureus pode, contudo ocorrer devido ao contacto deste com humanos portadores. A pesquisa e o isolamento de S. aureus em leite e derivados como parte da garantia de qualidade efetuada por indústrias de laticínios não possibilita, todavia, a determinação da origem da contaminação de um produto se apenas o produto final for analisado. A exploração de diferenças entre os genótipos de cepas obtidas de hospedeiros diferentes poderia, portanto, produzir um marcador genético de especificidade de hospedeiro. Em estudos realizados anteriormente por nosso grupo, determinou-se que certos genes parecem ser específicos de cepas isoladas de diferentes hospedeiros. Foram comparadas 3 cepas (origem ovina, bovina e humana) e três regiões únicas a cada cepa foram identificadas. Iniciadores foram desenhados de modo que quando utilizados para amplificaçãoporPCRsejames.
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) .
Integrantes: John Anthony McCulloch - Integrante / Vasco Azevedo - Coordenador / Yves LeLoir - Integrante.Financiador(es): Institut National de la Recherche Agronomique - Cooperação.
2007 - 2008
Caracterização molecular de cepas de Staphylococcus aureus isoladas de hospedeiros ovinos, bovinos e caprinos.
Descrição: S. aureus é uma espécie bacteriana cuja capacidade de causar uma ampla gama de infecções, desde infecções de pele a síndromes tóxicas, preocupação em saúde pública tanto humana quanto veterinária. Outra preocupação com relação a essa espécie é a apresentação de altas taxas de resistência a agentes antimicrobianos, e a possibilidade de que isolados possam servir de reservatório de genes de resistência a antibióticos. Em ruminantes, S. aureus é um dos principais agentes etiológicos de mastite, o que leva não só a perdas significativas na produção de leite como também à contaminação do leite e seus derivados. No entanto, S. aureus pode ser encontrado em uma relação comensal com hospedeiros tanto ruminantes quanto humanos, o que o torna um patógeno oportunista. Não se sabe até que ponto ocorre transmissão lateral dessa espécie bacteriana entre espécies diferentes de hospedeiro (animais domesticados e humanos) nem qual a sua importância, assim como não se conhece ainda a relação entre isolados bacterianos obtidos de diferentes tecidos de um mesmo animal. Uma caracterização molecular de isolados de diferentes materiais (narina, teta e leite) de pequenos ruminantes (ovinos e caprinos ? subfamília caprinae) e de grandes ruminantes (bovinos ? subfamília bovinae) mostrou que existe uma correlação entre o genótipo (linhagem) de uma cepa e a subfamília do hospedeiro. A linhagem dos isolados foi determinada por eletroforese em gel de campo pulsado (PFGE). Os outros parâmetros avaliados foram: polimorfismo do locus accessory gene regulator ? agr (sistema de regulação de genes acessórios), polimorfismo do polissacarídeo da cápsula bacteriana e perfil de resistência a antibióticos. A natureza do sistema agr e da cápsula bacteriana praticamente não havia sido caracterizada em cepas ovino-caprinas, que por serem genotipicamente diferentes de cepas humanas e bovinas, poderiam potencialmente apresentar grandes diferenças tanto no sistema agr quanto na cápsula bacteriana..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (1) .
Integrantes: John Anthony McCulloch - Integrante / Vasco Azevedo - Coordenador / Yves LeLoir - Integrante / Priscila Diniz Alves - Integrante.Financiador(es): Institut National de la Recherche Agronomique - Cooperação.
2002 - 2006
Estudo do lócus agr de cepas de Staphylococcus aureus isoladas no Brasil com sensibilidade reduzida à vancomicina.
Descrição: O tratamento de infecções por Staphylococcus aureus tem sido problemático devido ao surgimento de cepas resistentes a vários antibióticos. O antibiótico de escolha para o tratamento de infecções por S. aureus resistente à oxacilina é o glicopeptídeo vancomicina. Desde o primeiro isolamento de cepas com sensibilidade reduzida à vancomicina (VISA) em 1997, existe preocupação cada vez maior com a disseminação da resistência a esse antibiótico. Os mecanismos moleculares que levam à resistência de baixo nível à vancomicina ainda não foram elucidados. A detecção deste fenótipo na rotina de laboratório clínico é trabalhosa, pois as técnicas disponíveis são de difícil execução e interpretação. Até agora, não há relato de transmissão horizontal de infecção por VISA, e todas as cepas com esse fenótipo foram isoladas de pacientes que faziam uso prolongado de vancomicina. Uma deficiência no locus regulador de genes acessórios (agr) foi postulada como fator de risco para a aquisição do fenótipo VISA por uma cepa sensível a esse antibiótico. Para esse estudo, foram selecionadas 47 cepas de S. aureus, com sensibilidades variadas à vancomicina, inclusive 5 cepas VISA isoladas no Brasil. Determinou-se nas cepas as concentrações inibitórias mínimas de vancomicina e oxacilina, a atividade hemolítica em ágar sangue de carneiro e de coelho, a capacidade de aderir ao poliestireno e o polimorfismo do locus agr. Determinou-se a integridade do locus agr por PCR-RFLP e o sequenciamento de bases em 13 cepas representativas das 47 estudadas. A integridade do locus regulador acessório sarA também foi avaliada por sequenciamento de bases nessas 13 cepas. Foram escolhidas 18 cepas sensíveis à vancomicina com características fenotípicas variadas e essas cepas foram submetidas à indução de resistência à vancomicina pela passagem seriada em concentrações crescentes desse antibiótico. A taxa de mutação que leva à capacidade de crescimento em 6 g/mL de vancomicina foi avaliada em 8 cepas..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (1) .
Integrantes: John Anthony McCulloch - Integrante / Elsa Masae Mamizuka - Coordenador / Cristina Reinert - Integrante / Anna Paula Horwath - Integrante / Marina S Barreira - Integrante.Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.


Membro de corpo editorial


2014 - Atual
Periódico: Brazilian Journal of Microbiology (Impresso)


Revisor de periódico


2009 - 2010
Periódico: Veterinary Microbiology (Amsterdam. Print)
2010 - Atual
Periódico: Brazilian Journal of Microbiology (Impresso)
2014 - Atual
Periódico: Antimicrobial Agents and Chemotherapy (Print)


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.
2.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia / Subárea: Biologia e Fisiologia dos Microorganismos/Especialidade: Bacteriologia.
3.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia / Subárea: Microbiologia Aplicada.


Idiomas


Português
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Espanhol
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.
Francês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Alemão
Compreende Pouco, Fala Pouco, Lê Pouco, Escreve Pouco.


Prêmios e títulos


2004
Primeiro Lugar (categoria poster) na IX Semana Farmacêutica de Ciência e Tecnologia da FCF-USP, Faculdade de Ciências Farmacêuticas.
2003
Primeiro Lugar da Apresentação Oral na VIII Semana Farmacêutica de Ciência e Tecnologia da FCF-USP, Faculdade de Ciências Farmacêuticas da USP.


Produções



Produção bibliográfica
Artigos completos publicados em periódicos

1.
1MA, CHI2018MA, CHI ; HAN, MIAOJUN ; HEINRICH, BERND ; FU, QIONG ; ZHANG, QIANFEI ; SANDHU, MILAN ; AGDASHIAN, DAVID ; TERABE, MASAKI ; BERZOFSKY, JAY A. ; FAKO, VALERIE ; RITZ, THOMAS ; LONGERICH, THOMAS ; THERIOT, CASEY M. ; McCulloch, John A. ; ROY, SOUMEN ; YUAN, WUXING ; THOVARAI, VISHAL ; SEN, SHURJO K. ; RUCHIRAWAT, MATHUROS ; KORANGY, FIROUZEH ; WANG, XIN WEI ; TRINCHIERI, GIORGIO ; GRETEN, TIM F. . Gut microbiome-mediated bile acid metabolism regulates liver cancer via NKT cells. SCIENCE, v. 360, p. eaan5931, 2018.

2.
6LOPES, RALF2017LOPES, RALF ; CERDEIRA, LOUISE T. ; FERNANDES, MIRIAM R. ; PÉREZ-CHAPARRO, PAULA J. ; McCulloch, John A. ; LINCOPAN, Nilton . Draft genome sequence of a CTX-M-15-producing endophytic Klebsiella pneumoniae ST198 isolate from commercial lettuce. Journal of Global Antimicrobial Resistance, v. 10, p. 19-20, 2017.

3.
2ROSSHART, STEPHAN P.2017 ROSSHART, STEPHAN P. ; VASSALLO, BRIAN G. ; ANGELETTI, DAVIDE ; HUTCHINSON, DIANE S. ; MORGAN, ANDREW P. ; TAKEDA, KAZUYO ; HICKMAN, HEATHER D. ; McCulloch, John A. ; BADGER, JONATHAN H. ; AJAMI, NADIM J. ; TRINCHIERI, GIORGIO ; PARDO-MANUEL DE VILLENA, FERNANDO ; YEWDELL, JONATHAN W. ; REHERMANN, BARBARA . Wild Mouse Gut Microbiota Promotes Host Fitness and Improves Disease Resistance. CELL, v. 171, p. 1015-1028.e13, 2017.

4.
3FERNANDES, MIRIAM R.2016FERNANDES, MIRIAM R. ; McCulloch, John A. ; VIANELLO, MARCO A. ; MOURA, QUÉZIA ; PÉREZ-CHAPARRO, PAULA J. ; ESPOSITO, FERNANDA ; SARTORI, LUCIANA ; DROPA, MILENA ; MATTÉ, MARIA H. ; LIRA, DÉBORA P. A. ; MAMIZUKA, ELSA M. ; LINCOPAN, Nilton . First Report of the Globally Disseminated IncX4 Plasmid Carrying the Gene in a Colistin-Resistant ST101 isolated from a Human Infection in Brazil. ANTIMICROBIAL AGENTS AND CHEMOTHERAPY, v. 60, p. 6415-6417, 2016.

5.
4SELLERA, FÁBIO P.2016SELLERA, FÁBIO P. ; FERNANDES, MIRIAM R. ; SARTORI, LUCIANA ; CARVALHO, MARCELO P. N. ; ESPOSITO, FERNANDA ; NASCIMENTO, CRISTIANE L. ; DUTRA, GUSTAVO H. P. ; Mamizuka, Elsa M. ; PÉREZ-CHAPARRO, PAULA J. ; McCulloch, John A. ; LINCOPAN, Nilton . Escherichia coli carrying IncX4 plasmid-mediated mcr-1 and bla CTX-M genes in infected migratory Magellanic penguins ( Spheniscus magellanicus ). JOURNAL OF ANTIMICROBIAL CHEMOTHERAPY (ONLINE), v. 72, p. dkw543, 2016.

6.
9DE ALMEIDA, LARA M.2015DE ALMEIDA, LARA M. ; PIRES, CARLOS ; Cerdeira, Louise T. ; DE OLIVEIRA, THÉO G. M. ; McCulloch, John Anthony ; PEREZ-CHAPARRO, PAULA JULIANA ; SACRAMENTO, ANDREY G. ; BRITO, ARTEMIR C. ; DA SILVA, JOÁS L. ; DE ARAÚJO, MARIA RITA E. ; LINCOPAN, Nilton ; MARTIN, MELISSA J. ; GILMORE, MICHAEL S. ; MAMIZUKA, ELSA M. . Complete Genome Sequence of Linezolid-Susceptible Staphylococcus haemolyticus Sh29/312/L2, a Clonal Derivative of a Linezolid-Resistant Clinical Strain. Genome Announcements, v. 3, p. e00494-15, 2015.

7.
8McCulloch, John Anthony2015McCulloch, John Anthony; SILVEIRA, ALESSANDRO CONRADO DE OLIVEIRA ; LIMA MORAES, ALINE DA COSTA ; PÉREZ-CHAPARRO, PAULA JULIANA ; FERREIRA SILVA, MANOELLA ; ALMEIDA, LARA MENDES ; D?AZEVEDO, PEDRO ALVES ; MAMIZUKA, Elsa Masae . Complete Genome Sequence of FCFHV36, a Methicillin-Resistant Strain Heterogeneously Resistant to Vancomycin. Genome Announcements, v. 3, p. e00893-15, 2015.

8.
5PEREZ-CHAPARRO, P. J.2014 PEREZ-CHAPARRO, P. J. ; CERDEIRA, L. T. ; QUEIROZ, M. G. ; SILVA DE LIMA, C. P. ; LEVY, C. E. ; PAVEZ, M. ; Lincopan, N. ; GONCALVES, E. C. ; Mamizuka, E. M. ; SAMPAIO, J. L. M. ; Nunes, M. R. T. ; MCCULLOCH, J. A. . Complete nucleotide sequences of two blaKPC-2 bearing IncN plasmids isolated from ST442 Klebsiella pneumoniae clinical strains four years apart. Antimicrobial Agents and Chemotherapy (Print), v. 58, p. 2958-2960, 2014.

9.
12LIMA, A. R. J.2014LIMA, A. R. J. ; SIQUEIRA, A. S. ; DOS SANTOS, B. G. S. ; DA SILVA, F. D. F. ; LIMA, C. P. ; CARDOSO, J. F. ; VIANEZ JUNIOR, J. L. D. S. G. ; Dall'agnol, L. T. ; MCCULLOCH, J. A. ; Nunes, M. R. T. ; GONCALVES, E. C. . Draft Genome Sequence of the Brazilian Cyanobium sp. Strain CACIAM 14. Genome Announcements, v. 2, p. e00669-14-e00669-14, 2014.

10.
10NEVES, P. R.2014NEVES, P. R. ; CERDEIRA, L. T. ; MITNE-NETO, M. ; OLIVEIRA, T. G. M. ; MCCULLOCH, J. A. ; SAMPAIO, J. L. M. ; Mamizuka, E. M. ; LEVY, C. E. ; SATO, M. I. Z. ; Lincopan, N. . Complete Genome Sequence of an F8-Like Lytic Myovirus ( SPM-1) That Infects Metallo- -Lactamase-Producing Pseudomonas aeruginosa. Genome Announcements, v. 2, p. e00061-14-e00061-14, 2014.

11.
11MCCULLOCH, J. A.2014MCCULLOCH, J. A.; DE OLIVEIRA, V. M. ; DE ALMEIDA PINA, A. V. ; PEREZ-CHAPARRO, P. J. ; DE ALMEIDA, L. M. ; DE VASCONCELOS, J. M. ; DE OLIVEIRA, L. F. ; DA SILVA, D. E. A. ; ROGEZ, H. L. G. ; CRETENET, M. ; Mamizuka, E. M. ; Nunes, M. R. T. . Complete Genome Sequence of Lactococcus lactis Strain AI06, an Endophyte of the Amazonian Acai Palm. GENOME ANNOUNCEMENTS, v. 2, p. e01225-14-e01225-14, 2014.

12.
14PAIVA, ANDYARA L.2013PAIVA, ANDYARA L. ; LINCOPAN, Nilton ; SILVA, KETRIN C ; NEVES, PATRÍCIA R ; MORENO, ANDREA M ; McCulloch, John A ; ASTOLFI-FERREIRA, CLAUDETE S ; FERREIRA, ANTONIO JP . Low-virulence phylogenetic background of CTX-M-producing Escherichia coli isolated from extraintestinal infections. Journal of Infection in Developing Countries (Online), v. 7, p. 756-760, 2013.

13.
13RUFINO, CLAUDIA PINHEIRO2013RUFINO, CLAUDIA PINHEIRO ; MORAES, PABLO HENRIQUE GONÇALVES ; REIS, THAIS ; CAMPOS, RUAN ; AGUIAR, DÉLIA CRISTINA FIGUEIRA ; McCulloch, John Anthony ; MENESES, ANDRE MARCELO CONCEIÇÃO ; GONÇALVES, EVONNILDO COSTA . Detection of Ehrlichia canis and Anaplasma platys DNA Using Multiplex PCR. Vector Borne and Zoonotic Diseases (Larchmont, N.Y.), v. 13, p. 131009070451003, 2013.

14.
7OLIVEIRA, S.2013OLIVEIRA, S. ; MOURA, R. A. ; SILVA, K. C. ; PAVEZ, M. ; MCCULLOCH, J. A. ; DROPA, M. ; MATTE, M. H. ; Mamizuka, E. M. ; SATO, M. I. Z. ; PESTANA DE CASTRO, A. F. ; Lincopan, N. . Isolation of KPC-2-producing Klebsiella pneumoniae strains belonging to the high-risk multiresistant clonal complex 11 (ST437 and ST340) in urban rivers. Journal of Antimicrobial Chemotherapy (Online), v. 69, p. 849-852, 2013.

15.
15Santana, Priscila Bessa2012Santana, Priscila Bessa ; Ghilardi Junior, Rubens ; Alves, Claudio Nahum ; Silva, Jeronimo Lameira ; McCulloch, John Anthony ; Schneider, Maria Paula Cruz ; Silva, Artur da Costa da . Diversity and three-dimensional structures of the alpha Mcr of the methanogenic Archaea from the anoxic region of Tucuruí Lake, in Eastern Brazilian Amazonia. Genetics and Molecular Biology (Impresso), v. 35, p. 126-133, 2012.

16.
16Dall'agnol, L. T.2012Dall'agnol, L. T. ; Ghilardi-Junior, R. ; MCCULLOCH, J. A. ; Schneider, H. ; Schneider, M. P. C. ; Silva, A. . Phylogenetic and gene trees of Synechococcus: choice of the right marker to evaluate the population diversity in the Tucurui Hydroelectric Power Station Reservoir in Brazilian Amazonia. Journal of Plankton Research, v. 34, p. 245-257, 2012.

17.
17Seyffert, Nubia2012Seyffert, Nubia ; Le Maréchal, Caroline ; Jardin, Julien ; McCulloch, John A. ; Rosado, Fabio R. ; Miyoshi, Anderson ; Even, Sergine ; Jan, Gwenaël ; Berkova, Nadia ; Vautor, Eric ; Thiéry, Richard ; AZEVEDO, Vasco ; Le Loir, Yves . Staphylococcus aureus proteins differentially recognized by the ovine immune response in mastitis or nasal carriage. Veterinary Microbiology (Amsterdam. Print), v. 157, p. 439-447, 2012.

18.
19Ruiz, Jerônimo C.2011Ruiz, Jerônimo C. D'Afonseca, Vívian Silva, Artur Ali, Amjad Pinto, Anne C. Santos, Anderson R. Rocha, Aryanne A. M. C. Lopes, Débora O. Dorella, Fernanda A. Pacheco, Luis G. C. Costa, Marcília P. Turk, Meritxell Z. Seyffert, Núbia Moraes, Pablo M. R. O. Soares, Siomar C. Almeida, Sintia S. Castro, Thiago L. P. Abreu, Vinicius A. C. Trost, Eva Baumbach, Jan Tauch, Andreas Schneider, Maria Paula C. McCulloch, John Cerdeira, Louise T. Ramos, Rommel T. J. , et al.Zerlotini, Adhemar Dominitini, Anderson Resende, Daniela M. Coser, Elisângela M. Oliveira, Luciana M. Pedrosa, André L. Vieira, Carlos U. Guimarães, Cláudia T. Bartholomeu, Daniela C. Oliveira, Diana M. Santos, Fabrício R. Rabelo, Élida Mara Lobo, Francisco P. Franco, Glória R. Costa, Ana Flávia ; Evidence for Reductive Genome Evolution and Lateral Acquisition of Virulence Functions in Two Corynebacterium pseudotuberculosis Strains. Plos One, v. 6, p. e18551, 2011.

19.
22Cerdeira, Louise Teixeira2011Cerdeira, Louise Teixeira ; Carneiro, Adriana Ribeiro ; Ramos, Rommel Thiago Jucá ; de Almeida, Sintia Silva ; D´Afonseca, Vivian ; Schneider, Maria Paula Cruz ; Baumbach, Jan ; Tauch, Andreas ; McCulloch, John Anthony ; Azevedo, Vasco Ariston Carvalho ; Silva, Artur . Rapid hybrid de novo assembly of a microbial genome using only short reads: Corynebacterium pseudotuberculosis I19 as a case study. Journal of Microbiological Methods, v. 86, p. 218-223, 2011.

20.
21Costa, Marcilia P2011Costa, Marcilia P ; McCulloch, John A ; Almeida, Sintia S ; Dorella, Fernanda A ; Fonseca, Cristina T ; Oliveira, Diana M ; Teixeira, Maria FS ; Laskowska, Ewa ; Lipinska, Barbara ; Meyer, Roberto ; Portela, Ricardo W ; Oliveira, Sergio C ; Miyoshi, Anderson ; AZEVEDO, Vasco . Molecular characterization of the Corynebacterium pseudotuberculosis hsp60-hsp10 operon, and evaluation of the immune response and protective efficacy induced by hsp60 DNA vaccination in mice. BMC Research Notes, v. 4, p. 243, 2011.

21.
25Chaparro, Paula Juliana Pérez2011 Chaparro, Paula Juliana Pérez ; McCulloch, John Anthony ; Cerdeira, Louise Teixeira ; Al-Dilaimi, Arwa ; de Sá, Lena Lillian Canto ; de Oliveira, Rodrigo ; Tauch, Andreas ; Azevedo, Vasco Ariston de Carvalho ; Schneider, Maria Paula Cruz ; da Silva, Artur Luiz da Costa . Whole Genome Sequencing of environmental Vibrio cholerae O1 from 10 nanograms of DNA using short reads. Journal of Microbiological Methods, v. 87, p. 208-212, 2011.

22.
18Santos, Anderson R2011Santos, Anderson R ; Santos, Marcos A ; Baumbach, Jan ; McCulloch, John A ; Oliveira, Guilherme C ; Silva, Artur ; Miyoshi, Anderson ; AZEVEDO, Vasco . A singular value decomposition approach for improved taxonomic classification of biological sequences. BMC Genomics, v. 12, p. S11, 2011.

23.
24McCulloch, John Anthony2011McCulloch, John Anthony; Chaparro, Paula Juliana Pérez . Single Cell Genomics. Microbiologia in Foco, v. 17, p. 5-8, 2011.

24.
23Seyffert, Núbia2011Seyffert, Núbia ; Pacheco, Luis G.C. ; Silva, Wanderson M. ; Castro, Thiago L.P. ; Santos, Agenor V. ; Santos, Anderson ; McCulloch, John A. ; Rodrigues, Maira R. ; Santos, Simone G. ; Farias, Luiz M. ; Carvalho, Maria A.R. ; Pimenta, Adriano M.C. ; Silva, Artur ; Meyer, Roberto ; Miyoshi, Anderson ; AZEVEDO, Vasco . Serological secretome analysis of Corynebacterium pseudotuberculosis. Journal of Integrated OMICS, v. 1, p. 193-197, 2011.

25.
20Graças, Diego A.2011Graças, Diego A. ; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz ; Miranda, Paulo R. ; Baraúna, Rafael A. ; MCCULLOCH, J. A. ; Ghilardi, Rubens ; SILVA, Artur . Microbial Diversity of an Anoxic Zone of a Hydroelectric Power Station Reservoir in Brazilian Amazonia. Microbial Ecology, v. 62, p. 853-861, 2011.

26.
27Le Maréchal, C.2009Le Maréchal, C. ; Jan, G. ; EVEN, S. ; McCulloch, J.A. ; Azevedo, V. ; Thiéry, R. ; VAUTOR, E. ; Le Loir, Y. . Development of serological proteome analysis of mastitis by Staphylococcus aureus in ewes. Journal of Microbiological Methods, v. 79, p. 131-136, 2009.

27.
28MCCULLOCH, J. A.2009MCCULLOCH, J. A.; LELOIR, Yves . Variabilidade Genômica de Cepas de Staphylococcus aureus. Microbiologia in Foco, v. 1, p. 19-25, 2009.

28.
26Guimarães, A.S.2009Guimarães, A.S. ; Seyffert, N. ; Bastos, B.L. ; Portela, R.W.D. ; Meyer, R. ; Carmo, F.B. ; Cruz, J.C.M. ; McCulloch, J.A. ; Lage, A.P. ; Heinemann, M.B. . Caseous lymphadenitis in sheep flocks of the state of Minas Gerais, Brazil: Prevalence and management surveys. Small Ruminant Research, v. 87, p. 86-91, 2009.

29.
30REINERT, Cristina2008REINERT, Cristina ; MCCULLOCH, J. A. ; Watanabe, Shinya ; ITO, Teruyo ; HIRAMATSU, Keiichi ; MAMIZUKA, Elsa Masae . Type IV SCCmec found in decade old Brazilian MRSA isolates. The Brazilian Journal of Infectious Diseases, v. 12, p. 213, 2008.

30.
29ALVES, P2008ALVES, P ; MCCULLOCH, J ; EVEN, S ; LEMARECHAL, C ; THIERRY, A ; GROSSET, N ; AZEVEDO, V ; ROSA, C ; VAUTOR, E ; LELOIR, Y . Molecular characterisation of Staphylococcus aureus strains isolated from small and large ruminants reveals a host rather than tissue specificity. Veterinary Microbiology (Amsterdam. Print), v. 137, p. 190-195, 2008.

31.
31LINCOPAN, N.2005LINCOPAN, N. ; MCCULLOCH, J. A. ; REINERT, C. ; CASSETTARI, V. C. ; Gales, A. C. ; MAMIZUKA, E. M. . First Isolation of Metallo- -Lactamase-Producing Multiresistant Klebsiella pneumoniae from a Patient in Brazil. Journal of Clinical Microbiology (Print), v. 43, p. 516-519, 2005.

32.
32DELLAAQUILA, A2004DELLAAQUILA, A ; MCCULLOCH, J. A. ; MAMIZUKA, Elsa Masae ; SANTOS, Silvia R ; PEREIRA, Carlos A . Serum levels of vancomycin should be monitored in burn patients. Burns (Oxford), Inglaterra, v. 30, n.4, p. 386-387, 2004.

33.
33TRINDADE, P. A.2003TRINDADE, P. A. ; MCCULLOCH, J. A. ; Oliveira, G. A. ; Mamizuka, E. M. . Molecular techniques for MRSA typing: current issues and perspectives. The Brazilian Journal of Infectious Diseases, Brasil, v. 7, n.1, p. 32-43, 2003.

Capítulos de livros publicados
1.
MCCULLOCH, J. A.; Mamizuka, E.M. . Staphylococcus aureus. In: Trabulsi; Alterthum. (Org.). Microbiologia. 6ed.São Paulo: Atheneu, 2015, v. 1, p. 179-188.

2.
Neves, P.R. ; McCulloch, J.A. ; Mamizuka, E.M. ; Lincopan, N. . PSEUDOMONAS | Pseudomonas aeruginosa. Encyclopedia of Food Microbiology. 1ed.: Elsevier, 2014, v. 3, p. 253-260.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
SILVEIRA, A. O. ; MORAES, A. L. ; SILVA, M. F. ; Pérez-Chaparro, P. J. ; D?AZEVEDO, P. A. ; MAMIZUKA, ELSA M. ; MCCULLOCH, J. A. . Low And High Frequency Polymorphisms Present In A Vancomycin-heterogeneously Intermediate Staphylococcus Aureus Strain, But Not In Its Vancomycin-susceptible Counterpart Of The Same Lineage.. In: Interscience Conference of Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 2015, San Diego, CA, USA. Interscience Conference of Antimicrobial Agents and Chemotherapy Abstracts, 2015.

2.
OLIVEIRA, R. S. ; Pérez-Chaparro, P. J. ; BARATA, R. R. ; LIMA, C. P. S. ; CARDOSO, J. F. ; RAIOL, P. R. ; VIANEZ, J.L.S.G. ; ROGEZ, H. L. G. ; GONCALVES, E. C. ; Santos, A. S. ; MCCULLOCH, J. A. . Pirossequenciamento do DNA Total Obtido do Microcosmo da Microbiota Endofítica de frutos de Elaeis guineensis Revela Rica Fonte de Biocatalizadores. In: XXI ALAM - Congresso Latinoamericano de Microbiologia, 2012, Santos - SP. Anais do XXI ALAM - Congresso Latinoamericano de Microbiologia, 2012.

3.
OLIVEIRA, R. ; BARATA, R. R. ; MOURA, F. G. ; Pérez-Chaparro, P. J. ; ROGEZ, H. L. G. ; McCulloch, John Anthony . Amplificação de Genes de Microrganismos Endofíticos a partir de DNA Metagenômico Obtido de Frutos Oleaginosos. In: 26° Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2011, Foz do Iguaçu - PR. Anais do 26° Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2011. v. 1. p. 764-1-764-1.

4.
QUEIROZ, M. G. ; Cerdeira, Louise Teixeira ; ALMEIDA, E. L. ; PAVEZ, Mónica ; Pérez-Chaparro, P. J. ; LEVY, C. E. ; SAMPAIO, J. ; LINCOPAN, Nilton ; MAMIZUKA, Elsa Masae ; McCulloch, John Anthony . Seqüenciamento de genoma completo de duas cepas de Klebsiella pneumoniae *ST442 produtoras de KPC isoladas em São Paulo com quatro anos de diferença. In: 26° Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2011, Foz do Iguaçu - PR. Anais do 26° Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2011. v. 1. p. 972-1-972-1.

5.
Seyffert, Núbia ; Le MARECHAL, C. ; JARDIN, J. ; McCulloch, John Anthony ; ROSADO, F. ; EVEN, S. ; VAUTOR, E. ; THIERY, R. ; Azevedo, Vasco Ariston de Carvalho ; LELOIR, Yves . Análise imunoproteômica de Staphylococcus aureus causador da mastite ovina revela polipeptídeos diferencialmente reconhecidos por soros de animais infectados e portadores. In: 26° Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2011, Foz do Iguaçu - PR. Anais do 26° Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2011. v. 1. p. 1206-2-1206-2.

6.
Pérez-Chaparro, P. J. ; McCulloch, John Anthony ; Cerdeira, Louise Teixeira ; AL-DILAIMI, A. ; SA, L. L. C. ; OLIVEIRA, R. ; Tauch, Andreas ; Azevedo, Vasco Ariston de Carvalho ; Maria Paula Cruz Schneider ; SILVA, A. L. C. . Sequenciamento de genoma completo de Vibrio cholerae O1 ambiental usando leituras curtas a partir de apenas 10 ng de DNA. In: 26° Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2011, Foz do Iguaçu - PR. Anais do 26° Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2011. v. 1. p. 1927-2-1927-2.

7.
LAMARCK, R. ; Pérez-Chaparro, P. J. ; BARATA, R. R. ; RAIOL, P. R. ; Santos, A. S. ; MCCULLOCH, J. A. . Isolamento de microorganismos endofiticos produtores de lípase de tucumã (Astrocaryum aculeatum). In: 26° Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2011, Foz do Iguaçu - PR. Anais do 26° Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2011. v. 1. p. 1927-3-1927-3.

8.
SOARES, S. C. ; Abreu, Vinicius A. C. ; McCulloch, J.A. ; D Afonseca, V ; Ramos, Rommel T. J. ; Ali, Amjad ; SANTOS, A. R. ; Pinto, Anne C. ; Almeida, Sintia S. ; Silva, Artur ; Miyoshi, A. ; AZEVEDO, Vasco . Pathogenicity Island Prediction Software. In: 6th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, X-meeting, 2010, Ouro Preto - MG. Anais do 6th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology -X meeting, 2010.

9.
MCCULLOCH, J. A.; ALVES, P. D. ; EVEN, S. ; Le MARECHAL, C. ; AZEVEDO, Vasco ; ROSA, C. ; VAUTOR, E. ; LELOIR, Yves . Molecular characterization of S. aureus strains isolated from small and large ruminants reveals a host rather than tissue specificity. In: International Symposium on Staphylococci and Staphylococcal Infections, 2008, Cairns. Abstracts of the 13th International Symposium on Staphylococci and Staphylococcal Infections, 2008. p. 90-90.

10.
DELL'AQUILA, Adriana M ; MCCULLOCH, J. A. ; MAMIZUKA, Elsa Masae ; SANTOS, Silvia R ; PEREIRA, Carlos A . Serum Vancomycin and Minimum Inhibitory Concentration Relationship for Staphylococcus aureus in Burned Patients. In: XII International Congress on Infectious Diseases - ICAD12, 2006, Lisboa, Portugal. Abstracts: International Society for Infectious Diseases. Brighton, UK: IJID Editorial Office, 2006. p. S130.

11.
VIANELLO, Marco Aurélio ; REINERT, Cristina ; MCCULLOCH, J. A. ; MAMIZUKA, Elsa Masae . Caracterização genotípica dos fatores de virulência e seu regulador de genes acessórios (agr) em cepas de Staphylococcus aureus sensíveis a meticilina (MSSA).. In: XXIII CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 2005, Santos - SP. Sociedade Brasileira de Microbiologia, Resumos, 2005. p. 121-121.

12.
REINERT, Cristina ; MCCULLOCH, J. A. ; WATANABE, S ; ITO, Teruyo ; HIRAMATSU, Keiichi ; MAMIZUKA, Elsa Masae . Type IV SCCmec in Brazilian nosocomial isolates of methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA). In: XXIII CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 2005, Santos-SP. Sociedade Brasileira de Microbiologia, Resumos, 2005. p. 122-122.

13.
MCCULLOCH, J. A.; REINERT, Cristina ; HORWATH, Anna Paula ; MAMIZUKA, Elsa Masae . Avaliação da funcionalidade do locus accessory gene regulator (agr) em cepas de Staphylococcus aureus brasileiras com susceptibilidade reduzida à vancomicina.. In: XXIII CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 2005, Santos-SP. Sociedade Brasileira de Microbiologia, Resumos, 2005. p. 122-122.

14.
HORWATH, Anna Paula ; LEIS, Renato ; MCCULLOCH, J. A. ; MAMIZUKA, Elsa Masae . Funcionalidade do locus agr de cepas de Staphylococcus aureus com susceptibilidade reduzida à vancomicina.. In: XIII Simpósio Internacional de Iniciação Científica da USP, 2005, Ribeirão Preto - SP. Anais do XIII Simpósio Internacional de Iniciação Científica da USP, 2005.

15.
LINCOPAN, Nilton ; MCCULLOCH, J. A. ; CHIARATTO, Valéria ; GALES, Ana Cristina ; MAMIZUKA, Elsa Masae . Aquisição de multiresistência em Klebsiella pneumoniae associada à expressão de integron de classe I. In: IX Semana Farmacêutica de Ciência e Tecnologia da Faculdade de Ciências Farmacêuticas da USP, 2004, São Paulo. Journal of Pharmaceutical Sciences, 2004.

16.
LINCOPAN, Nilton ; MCCULLOCH, J. A. ; CHIARATTO, Valéria ; MAMIZUKA, Elsa Masae . Two Isolated cases of Infection by IMP and CTX Extended-Spectrum B-lactamase Producing Klebsiella Pneumoniae in Brazil.. In: 44 th Annual Interscience Conference on Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 2004, Washington. ICAAC American Society for Microbiology, 2004. p. 3433.

17.
LINCOPAN, Nilton ; MCCULLOCH, J. A. ; REINERT, Cristina ; CHIARATTO, Valéria ; MAMIZUKA, Elsa Masae . Appearance of a metallo-beta-lactamase producing multiresistant Klebsiella pneumoniae clinical isolate in Brazil.. In: VIII semana farmacêutica da ciência e tecnologia da faculdade de ciências farmacêuticas da USP, 2003, São Paulo. Braz J Pharm Sciences., 2003. v. 39. p. 24-24.

18.
OLIVEIRA, Geraldo Alécio de ; MCCULLOCH, J. A. ; DELLÁQUILA, A. M. ; ROSSI, F. ; MAMIZUKA, Elsa Masae . Characterization of heterogeneous vancomycin-resistant Staphylococcus aureus (hetero-VRSA) isolated in Brazilian hospitals.. In: XXI Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2001, Foz do Iguaçu - PR. XXI Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2001 Foz do Iguaçu - Paraná, Sociedade Brasileira de Microbiologia, RESUMOS, 2001. v. IH-037. p. 148-148.

19.
OLIVEIRA, Geraldo Alécio de ; OKADA, S. S. ; MCCULLOCH, J. A. ; DELLÁQUILA, A. M. ; MAMIZUKA, Elsa Masae . Vancomycin-resistant Staphylococcus aureus (VRSA): A Brazilian experience. In: XXI Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2001, Foz do Iguaçu - PR. XXI Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2001 Foz do Iguaçu - Paraná, Sociedade Brasileira de Microbiologia, RESUMOS, 2001. v. IH-038. p. 148-148.

Artigos aceitos para publicação
1.
PÉREZ-CHAPARRO, P.JULIANA ; McCulloch, John Anthony ; MAMIZUKA, Elsa Masae ; MORAES, ALINE DA COSTA LIMA ; FAVERI, MARCELO ; FIGUEIREDO, LUCIENE CRISTINA ; DUARTE, POLIANA MENDES ; FERES, MAGDA . Do different probing depths exhibit striking differences in microbial profiles?. JOURNAL OF CLINICAL PERIODONTOLOGY, 2017.


Produção técnica
Trabalhos técnicos
1.
MCCULLOCH, J. A.; SILVEIRA, A. O. ; MORAES, A. L. ; Pérez-Chaparro, P. J. ; SILVA, M. F. ; ALMEIDA, L. M. ; D?AZEVEDO, P. A. ; Mamizuka, E. M. . Staphylococcus aureus strain FCFHV36, complete genome. 2015.


Demais tipos de produção técnica
1.
MCCULLOCH, J. A.. Bioinformática para o Microbiologista. 2015. .

2.
McCulloch, J.A.; CERDEIRA, L. T. . Bioinformática para o Microbiologista. 2013. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

3.
PEREZ-CHAPARRO, P. J. ; CERDEIRA, L. T. ; QUEIROZ, M. G. ; LIMA, C. P. S. ; LEVY, C. E. ; PAVEZ, M. ; LINCOPAN, N. ; GONCALVES, E. C. ; MAMIZUKA, E. M. ; SAMPAIO, J. L. M. ; Nunes, M. R. T. ; MCCULLOCH, J. A. . Sequência completa do plasmídeo pFCF13/05 que carrega blaKPC-2, Genbank Accession Number CP004366. 2013. (Sequenciamento completo de plasmídeo).

4.
Pérez-Chaparro, P. J. ; CERDEIRA, L. T. ; QUEIROZ, M. G. ; LIMA, C. P. S. ; LEVY, C. E. ; PAVEZ, M. ; LINCOPAN, N. ; GONCALVES, E. C. ; MAMIZUKA, E. M. ; SAMPAIO, J. L. M. ; Nunes, M. R. T. ; MCCULLOCH, J. A. . Sequência completa do plasmídeo pFCF/3SP que carrega blaKPC-2 GenBank Accession number CP004367. 2013. (Sequenciamento completo de plasmídeo).

5.
MCCULLOCH, J. A.; Cerdeira, Louise Teixeira . Bioinformática para o Microbiologista. 2012. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

6.
PEREZ CHAPARRO, PAULA JULIANA ; MCCULLOCH, J. A. ; Cerdeira, Louise Teixeira ; Al-Dilaimi, Arwa ; de Oliveira, Rodrigo ; Tauch, Andreas ; Azevedo, Vasco Ariston Carvalho ; Schneider, Maria Paula Cruz ; SILVA, A. L. C. . Vibrio cholerae LMA3894-4 chromosome II, complete sequence Accession Number CP002556.1. 2011. (Sequenciamento Completo de Genoma Bacteriano).

7.
PEREZ CHAPARRO, PAULA JULIANA ; MCCULLOCH, J. A. ; Cerdeira, Louise Teixeira ; AL-DILAIMI, A. ; de Sá, Lena Lillian Canto ; de Oliveira, Rodrigo ; Tauch, Andreas ; Azevedo, Vasco Ariston Carvalho ; Schneider, Maria Paula Cruz ; SILVA, A. L. C. . Vibrio cholerae LMA3894-4 chromosome I, complete sequence Accession Number CP002555.1. 2011. (Sequenciamento Completo de Genoma Bacteriano).

8.
MCCULLOCH, J. A.. Caracterização Fenotípica e Molecular de Resistência a Antimicrobianos de Cocos Gram-Positivos ? Família Staphyloccaceae. 2010. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

9.
McCulloch, John Anthony. Caracterização Fenotípica e molecular de resistência a antimicrobianos de cocos Gram-positivos. 2009. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

10.
MCCULLOCH, J. A.. Resistência Bacteriana aos Antibióticos e Como Detectá-la no Laboratório Clínico (Gram-positivos). 2005. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

11.
MCCULLOCH, J. A.; LINCOPAN, Nilton . Curso de Capacitação de Microbiologia dos Hospitais Sentinelas e LACEN: Identificação Bioquímica e Avaliação do Perfil de Resistência Microbiana. 2005. (Curso de curta duração ministrado/Outra).



Bancas



Participação em bancas de trabalhos de conclusão
Mestrado
1.
MCCULLOCH, J; DARNET, S. H.; Santos, Agenor V.; SOUZA, C. R. B.. Participação em banca de Rodrigo Santos de Oliveira. Bioprospecção de novos genes de lipases a partir do DNA metagenômico do microcosmo da microbiota endofítica de frutos de Elaeis guineensis. 2013. Dissertação (Mestrado em BIOTECNOLOGIA) - Universidade Federal do Pará.

2.
XAVIER, L. P.; SANTORO, M. M.; McCulloch, John Anthony; NASCIMENTO, L. A. S.. Participação em banca de Raimundo Nonato da Silva Barbosa Júnior. Otimização do processo biotecnológico de produção de lipases por batelada em cultivo submerso de Penicillium citrinum. 2013. Dissertação (Mestrado em BIOTECNOLOGIA) - Universidade Federal do Pará.

3.
Silva, Artur; McCulloch, J.A.; XAVIER, L. P.; GONCALVES, E. C.. Participação em banca de Rafael Azevedo Baraúna. Proteômica Comparativa da Chromobacterium violaceum linhagem ATCC 12472 durante o processo de metabolização do cianato. 2011. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

4.
SILVA, A. L. C.; DARNET, S. H.; McCulloch, J.A.. Participação em banca de Rommel Thiago Jucá Ramos. Desenvolvimento de uma suíte de aplicativos computacionais para suporte à montagem de genomas bacterianos a partir de leituras curtas. 2011. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

5.
SILVA, A. L. C.; PELLIZARI, V. H.; McCulloch, John Anthony; AZEVEDO, Vasco. Participação em banca de Diego Assis das Graças. Ocorrência de arquéias metanogênicas no reservatório da usina hidrelétrica de Tucuruí. 2011. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

6.
SILVA, J. L.; McCulloch, J.A.; MOLFETA, F. A.; DARNET, S. H.. Participação em banca de Gleiciane Leal Moraes. Modelagem por Homologia e Dinâmica Molecular da Proteína Reguladora PhoP de Corynebacterium pseudotuberculosis. 2010. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

Teses de doutorado
1.
MATTE, M. H.; HACHICH, E. M.; MCCULLOCH, J. A.; SATO, M. I. Z.; GALES, Ana Cristina. Participação em banca de Miriam Lopes da Silva. Detecção e caracterização de elementos conjugativos e integrativos em bactérias isoladas de amostras ambientais. 2014. Tese (Doutorado em Programa de Pós Graduação em Saúde Pública) - Universidade de São Paulo.

2.
Martins, L. C.; McCulloch, John Anthony; Cruz, E. M.; ISHAK, M. O. G.. Participação em banca de Katarine Antônia dos Santos Barile. PREVALÊNCIA DOS GENES DE VIRULÊNCIA vacA, cagA E babA2 E CARACTERIZAÇÃO NUCLEOTÍDICA DA SUBUNIDADE 23S DO rRNA RELACIONADA À RESISTÊNCIA À CLARITROMICINA DAS CEPAS DE Helicobacer pylori ISOLADAS DE PACIENTES COM DOENÇAS GÁSTRICAS DA AMAZÔNIA ORIENTAL. 2009. Tese (Doutorado em Biologia de Agentes Infecciosos e Parasitários) - Universidade Federal do Pará.

Qualificações de Doutorado
1.
SILVA, A. L. C.; McCulloch, J.A.; PELLIZARI, V. H.; AZEVEDO, Vasco. Participação em banca de Adriana Ribeiro Carneiro. Montagem e análise comparativa do genoma de Exiguobacterium antarcticum linhagem B7. 2011. Exame de qualificação (Doutorando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

2.
SILVA, A. L. C.; Sara Cuadros Orellana; JESUS, E. C.; McCulloch, John Anthony. Participação em banca de Hivana Patrícia Melo Barbosa. Análise Transcriptômica de Exiguobacterium antarticum em diferentes regimes termais. 2010. Exame de qualificação (Doutorando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

3.
SILVA, A. L. C.; ISHAK, M. O. G.; MCCULLOCH, J. A.; CORVELO, T. C. O.. Participação em banca de Katarine Antonia dos Santos Barile. Caracterização Nucleotídica da Susbunidade 23S de RNAr Relacionada a Resistência à Claritromicina e à Prevalência dos Genes de Virulência vacA, cagA e babA2b das Cepas de H. pylori em Pacientes com Patologia Gástrica na Amazônia Brasileira. 2009. Exame de qualificação (Doutorando em Biologia de Agentes Infecciosos e Parasitários) - Universidade Federal do Pará.

Qualificações de Mestrado
1.
LIMA, K. V. B.; McCulloch, John Anthony; SILVA, R. C.. Participação em banca de Marília Lima da Conceição. Resistência aos antimicrobianos e tipagem molecular de Pseudomonas aeruginosa proveniente de hospital sentinela em Belém - PA. 2013. Exame de qualificação (Mestrando em BIOLOGIA PARASITÁRIA NA AMAZÔNIA) - Universidade do Estado do Pará.

Trabalhos de conclusão de curso de graduação
1.
SA, L. L. C.; MCCULLOCH, J. A.; Ramos, Rommel T. J.. Participação em banca de Daniel Rios Garza.Genética e dinâmica evolutiva do Vibrio cholerae na Amazônia Brasileira. 2013. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Pará.

2.
SILVA, A. L. C.; McCulloch, J.A.; Maria Paula Cruz Schneider. Participação em banca de Rafael Ribeiro Barata.Diversidade Procariótica de uma Amostra de Solo do Domo de Monte Alegre. 2010. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Pará.



Participação em bancas de comissões julgadoras
Concurso público
1.
ROMERO, O. B.; PASSOS, F. M. L.; MCCULLOCH, J. A.. Concurso Público para Professor Adjunto na Matéria Fundamentos de Biotecnologia e Técnicas de Biologia Molecular. 2010. Universidade Federal da Bahia.

Outras participações
1.
MCCULLOCH, J. A.; SILVA, M. B.; SENA, L. S.. Comissão de Avaliação de Progressão para a Classe de Professor Adjunto. 2011. Universidade Federal do Pará.



Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
III Simpósio Internacional de Microbiologia Clínica - SIMC.CA-MRSA, HA-MRSA, VISA e MRSCoN. 2012. (Simpósio).

2.
26° Congresso Brasileiro de Microbiologia. Single Cell Genomics. 2011. (Congresso).

3.
26° Congresso Brasileiro de Microbiologia. Entenda como funcionam as novas tecnologias. 2011. (Congresso).

4.
II Simpósio Internacional de Microbiologia Clínica.Base Genética da Resistência a Glicopeptídeos em S. aureus. 2010. (Simpósio).

5.
O 3° Congresso sobre Diversidade Microbiana da Amazônia (CDMicro). Prospecção de biocatalisadores em microrganismos. 2010. (Congresso).

6.
Workshop Bioinformática "Next-Gen": Montagem e Anotação de Genomas Bacterianos Completos.Biologia Celular. 2009. (Simpósio).

7.
XXV Congresso Brasileiro de Microbiologia. Caracterização Fenotípica e molecular de resistência a antimicrobianos de cocos Gram-positivos. 2009. (Congresso).

8.
Sympo Staph.Les profils génotypiques de souches de S. aureus isolées de ruminants bovins, ovins et caprins révèlent une spécificité d'hôte plutôt que tissulaire.. 2008. (Simpósio).

9.
XVe colloque du Club des bactéries lactiques. 2007. (Congresso).

10.
XXIII Congresso Brasileiro de Microbiologia da Sociedade Brasileira de Microbiologia. Resistência bacteriana aos antibióticos e como detectá-la no laboratório clínico. 2005. (Congresso).

11.
IX semana farmacêutica da ciência e tecnologia da faculdade de ciências farmacêuticas da USP. Aquisição de multiresistência em Klebsiella pneumoniae associada à expressão de integron de classe I. 2004. (Congresso).

12.
VIII semana farmacêutica da ciência e tecnologia da faculdade de ciências farmacêuticas da USP. Appearance of a Metallo-Beta-Lactamase Producing Multiresistant Klebsiella pneumoniae Clinical Isolate in Brazil. 2003. (Congresso).



Orientações



Orientações e supervisões em andamento
Iniciação científica
1.
Manoella Ferreira Silva. Isolamento, amplificação e caracterização de células únicas de Staphylococcus aureus resistente à vancomicina. Início: 2015. Iniciação científica (Graduando em Farmácia) - Faculdades Oswaldo Cruz. (Orientador).


Orientações e supervisões concluídas
Dissertação de mestrado
1.
Maíse Gomes Queiroz. Estudo e Caracterização dos Elementos Genéticos Móveis que conferem Resistência às Carbapenemas em Klebsiella pneumoniae. 2011. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará, . Orientador: John Anthony McCulloch.

2.
Rodrigo de Oliveira. Bioprospecção de novos genes codificadores de lipase usando DNA metagenômico extraído de frutos oleaginosos da amazônia. 2011. Dissertação (Mestrado em BIOTECNOLOGIA) - Universidade Federal do Pará, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: John Anthony McCulloch.

3.
Rafael Ribeiro Barata. Detecção de Variações Adaptativas nos Genomas de Bactérias Endofíticas Associadas a Frutos da Amazônia. 2011. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: John Anthony McCulloch.

4.
Andreza Pinheiro Malheiros. Echinococcus oligarthrus na Amazônia Brasileira: Hospedeiros, Caracterização Molecular e Morfológica. 2010. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará, . Orientador: John Anthony McCulloch.

Trabalho de conclusão de curso de graduação
1.
Marília Lima da Conceição. Detecção e Caracterização in silico de Ilhas de Patogenicidade. 2010. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Farmácia) - Universidade Federal do Pará, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: John Anthony McCulloch.

Iniciação científica
1.
Eduardo Leão de Almeida. Apoio Técnico ao Estudo do Pangenoma de Corynebacterium pseudotuberculosis no estado do Pará. 2011. Iniciação Científica. (Graduando em Biotecnologia) - Universidade Federal do Pará, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: John Anthony McCulloch.

2.
Pamela Raiol Rodrigues. Bioprospecção de novos genes codificadores de lipase usando DNA metagenômico extraído de frutos oleaginosos da amazônia. 2011. Iniciação Científica. (Graduando em Biotecnologia) - Universidade Federal do Pará, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: John Anthony McCulloch.

3.
Pamela Raiol Rodrigues. Bioprospecção e melhoramento genético de novas lipases oriundas da microbiota endofítica de frutos de Elaeis guineensis Jacq.. 2011. Iniciação Científica. (Graduando em Biotecnologia) - Universidade Federal do Pará, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: John Anthony McCulloch.

4.
Pamela Raiol Rodrigues. . Cultivo, Isolamento e Caracterização de Microrganismos Produtores de Lipases com Ação sobre Óleos Vegetais da Região Amazônica. 2010. Iniciação Científica. (Graduando em Biotecnologia) - Universidade Federal do Pará, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: John Anthony McCulloch.

5.
Rachel Lamarck. Cultivo, Isolamento e Caracterização de Microrganismos Produtores de Lipases com Ação sobre Óleos Vegetais da Região Amazônica. 2010. Iniciação Científica. (Graduando em Odontologia) - Universidade Federal do Pará, Fundação Amazônia Paraense de Amparo à Pesquisa. Orientador: John Anthony McCulloch.



Educação e Popularização de C & T



Cursos de curta duração ministrados
1.
McCulloch, J.A.; CERDEIRA, L. T. . Bioinformática para o Microbiologista. 2013. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).




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