Adhemar Zerlotini Neto

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  • Última atualização do currículo em 10/09/2018


Adhemar Zerlotini possui graduação em Ciência da Computação pela UNINCOR (2002) e doutorado em Bioinformática pela UFMG (2009). Durante seu doutorado, passou um ano na University of Georgia (UGA) estudando integração de dados genômicos utilizando o GUS (Genomics Unified Schema) que resultou na publicação do banco de dados SchistoDB (http://schistodb.net). Em sua tese de doutorado, entitulada ?Integração de de dados genômicos de Schistosoma mansoni na identificação de candidatos a alvos terapêuticos?, drogas foram selecionadas utilizando as informações integradas no SchistoDB e a atividade esquistossomicida foi mensurada através de testes in vivo. Adhemar é co-autor nos artigos de publicação do genoma de Schistosoma mansoni e Schistosoma haematobium. Atualmente é pesquisador na Embrapa Informática Agropecuária CNPTIA-SP, onde trabalha com integração de dados e análise de sequências de nova geração. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Adhemar Zerlotini Neto
Nome em citações bibliográficas
ZERLOTINI, ADHEMAR;Zerlotini, A.;Neto,;ZERLOTINI NETO, ADHEMAR;ZERLOTINI-NETO, ADHEMAR

Endereço


Endereço Profissional
Embrapa Informática Agropecuária.
Av. André Tosello, 209
Barão Geraldo
13083886 - Campinas, SP - Brasil
Telefone: (019) 32115799
URL da Homepage: http://www.agropediabrasilis.cnptia.embrapa.br/web/lmb/home


Formação acadêmica/titulação


2006 - 2009
Doutorado em Bioinformática.
Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.
com período sanduíche em University of Georgia (Orientador: Jessica Kissinger).
Título: Integração e uso de dados genômicos de Schistosoma mansoni na busca de candidatos à alvos terapêuticos, Ano de obtenção: 2009.
Orientador: Guilherme Correa Oliveira.
Bolsista do(a): FOGARTY INTERNATIONAL CENTER / NIH, FIC, Estados Unidos.
Palavras-chave: Schistosoma mansoni; Drogas experimentais; Banco de dados; Genômica; Metabolômica.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Biologia Computacional / Especialidade: Metabolômica.
Setores de atividade: Desenvolvimento de Produtos Tecnológicos Voltados Para A Saúde Humana; Atividades de Banco de Dados.
1999 - 2002
Graduação em Ciência da Computação.
Universidade Vale do Rio Verde de Três Corações, UNINCOR, Brasil.
Título: SisEduc - Sistema de Controle para Secretarias de Educação.
Orientador: Wanderson Gomes de Souza.


Pós-doutorado


2009 - 2011
Pós-Doutorado.
Centro de Pesquisas René Rachou / FIOCRUZ, CPQRR, Brasil.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais, FAPEMIG, Brasil.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra


Formação Complementar


2015 - 2015
Train the Trainer. (Carga horária: 40h).
European Bioinformatics Institute, EMBL, Inglaterra.
2014 - 2014
RNA-Seq and ChIP-Seq Data Analysis Course. (Carga horária: 28h).
Biotechnology and Biological Sciences Research Council, BBSRC, Inglaterra.
2013 - 2013
Curso de computação cientifica com Python. (Carga horária: 8h).
Embrapa Informática Agropecuária, CNPTIA, Brasil.
2011 - 2011
Galaxy Workflow System CIBA. (Carga horária: 40h).
Embrapa Informática Agropecuária, CNPTIA, Brasil.
2011 - 2011
Curso Introdutório à Virtualização utilizando Xen. (Carga horária: 16h).
Embrapa Informática Agropecuária, CNPTIA, Brasil.
2008 - 2008
Comparative genomics and phylogenomics. (Carga horária: 40h).
Centro de Pesquisas René Rachou / FIOCRUZ, CPQRR, Brasil.
2008 - 2008
Biological Network Modeling. (Carga horária: 3h).
Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, AB3C, Brasil.
2006 - 2006
Acessibilidade, Web Standards e Usabilidade. (Carga horária: 45h).
Centro de Pesquisas René Rachou / FIOCRUZ, CPQRR, Brasil.
2005 - 2005
Curso de GUS (Genomics Unified Schema). (Carga horária: 45h).
Centro de Pesquisas René Rachou / FIOCRUZ, CPQRR, Brasil.
2005 - 2005
Algorítmos e heurísticas comparações de sequências. (Carga horária: 6h).
Sociedade Brasileira de Computação - Porto Alegre, SBC, Brasil.
2005 - 2005
Comparative Genomics. (Carga horária: 45h).
Cold Spring Harbor Laboratory, CSHL, Estados Unidos.
1995 - 1995
Pet Preliminary English Test.
University of Cambridge, CAM, Inglaterra.


Atuação Profissional



Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária, EMBRAPA, Brasil.
Vínculo institucional

2013 - Atual
Vínculo: , Enquadramento Funcional:


Embrapa Informática Agropecuária, CNPTIA, Brasil.
Vínculo institucional

2011 - Atual
Vínculo: Celetista formal, Enquadramento Funcional: Pesquisador A, Carga horária: 40


Centro de Pesquisas René Rachou / FIOCRUZ, CPQRR, Brasil.
Vínculo institucional

2004 - 2011
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Bioinformata, Carga horária: 40

Vínculo institucional

2003 - 2004
Vínculo: Terceirizado, Enquadramento Funcional: Analista de Sistemas / Programador, Carga horária: 40

Atividades

03/2003 - 10/2004
Direção e administração, Centro de Pesquisas René Rachou, Fiocruz Minas.

Cargo ou função
Analista de Sistemas / Programador.

Secretaria Municipal de Educação de Três Corações, SEDUC, Brasil.
Vínculo institucional

2002 - 2002
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Analista de Sistemas / Programador, Carga horária: 40

Atividades

09/2002 - 12/2002
Direção e administração, .

Cargo ou função
Analista de Sistemas / Programador.

TRICOR Telecomunicações, TRICOR, Brasil.
Vínculo institucional

2001 - 2002
Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Analista de Sistemas / Programador, Carga horária: 44

Atividades

10/2001 - 06/2002
Direção e administração, .

Cargo ou função
Analista de Sistemas / Programador.

Rede Pegasus, RP, Brasil.
Vínculo institucional

2000 - 2001
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Administrador de Bancos de Dados e Redes, Carga horária: 40

Atividades

01/2000 - 10/2001
Direção e administração, .

Cargo ou função
Administrador de Bancos de Dados e Redes.


Projetos de pesquisa


2013 - Atual
BASES MOLECULARES DA QUALIDADE DA CARNE EM BOVINOS DA RAÇA NELORE
Descrição: O Brasil é um dos principais produtores e exportadores mundiais de carne bovina e sua vantagem competitiva deve-se principalmente ao custo de produção do bovino brasileiro, que é um dos mais baixos do mundo. Para ampliar sua importância no mercado, é necessário adequar sua produção de carne aos padrões estabelecidos pelos importadores. Entre os quesitos de qualidade, a maciez, quantidade e tipo de gordura intramuscular podem influenciar as características sensoriais e o valor nutricional da carne bovina. A seleção para qualidade da carne não tem sido efetiva em programas de melhoramento de gado de corte no Brasil. Metodologias para sequenciamento, genotipagem e análise de expressão do genoma em larga escala têm contribuído para o conhecimento das bases genéticas da variação e para a seleção precoce de bovinos. Um projeto anterior intitulado Estratégias genéticas para produção de carne bovina de qualidade produziu 796 novilhos, descendentes de 34 touros selecionados para amostrar a diversidade da raça Nelore, os quais foram avaliados para eficiência alimentar e qualidade da carne, bem como submetidos à análise de associação genômica com um painel de SNPs (Illumina BovineHD chip). Esse projeto permitiu identificar regiões genômicas associadas a características de produção e qualidade de carne. O presente projeto tem por objetivo alcançar melhor compreensão dos mecanismos genéticos envolvidos na variação de caracteres quantitativos apontados pela análise de associação. Para tanto, propõe-se complementar as análises de associação genômica para incluir novos fenótipos, expandir as análises do genoma funcional (RNA, microRNA e proteínas), avaliar o significado de CNVs e capacitar recursos humanos nas áreas de bioinformática e genômica..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2013 - Atual
Desenvolvimento e aplicação de ferramentas de bioinformática em suporte a projetos de melhoramento e sistemas de produção animal
Descrição: O advento das novas tecnologias de sequenciamento de DNA viabilizaram a concepção e execução de novos projetos, que se baseiem em abordagens como resequenciamento, sequenciamento de novo, genotipagem por sequenciamento, imputação, metagenômica, etc., mas que demandam armazenamento, tratamento e análise de uma quantidade muito grande de dados. O grande desafio deste projeto, na fase II da Rede Genômica Animal (RGA), é, em parceria com o Laboratório Multiusuário de Bionformática da Embrapa (LMB), disponibilizar soluções de bioinformática para alavancar os projetos agregados à RGA e os novos projetos que se baseiem na utilização de dados oriundos das novas tecnologias de sequenciamento. Além disso, este projeto também se ocupará de prover ferramentas de bioinformática para (i) suporte aos programas de melhoramento que objetivam incorporar a Seleção Genômica como ferramenta para avaliação e seleção de animais de mérito genético superior; (ii) suporte à prospecção de genes que afetam características de interesse pecuário; (iii) suporte aos projetos que visam gerar informações e ferramentas básicas para espécies pouco caracterizadas, em fase de domesticação e pré-melhoramento (ex: peixes nativos); (iv) suporte aos projetos de metagenômica que visam caracterizar populações de microorganismos dos aparelhos digestivo e reprodutivo, glândula mamária, etc., com o objetivo de desenvolver ferramentas e processos biotecnológicos inovadores, como por exemplo, a diminuição da produção de gás metano mesentérico, o melhoramento do desempenho produtivo e reprodutivo dos animais em questão, entre outros..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2013 - Atual
CNPq-BBSRC: Pre-breeding for durable resistance to rust diseases in hexaploid wheat
Descrição: O presente projeto é uma parceria entre o Brasil e o Reino Unido no intuito de stabelecer uma base de conhecimentos a respeito da resistência durável às ferrugens do trigo e visa apoiar os projetos de pesquisa dos estudantes brasileiros de doutorado e pós-doutores. Os interesses do grupo de pesquisas Ferrugens dos Cereais de Inverno (http://dgp.cnpq.br/diretorioc/fontes/detalhegrupo.jsp?grupo=0192501HT2A JV4) liderado por Márcia Chaves (Embrapa) e José Martinelli (UFRGS) são paralelos àqueles da Dra. Lesley Boyd e Dr. Donal O'Sullivan (NIAB, UK). Os grupos envolvidos possuem genótipos de trigo interessantes quanto aos caracteres em questão, o que será mutuamente benéfico, permitindo a identificação de novas fontes de resistência durável, potencialmente a múltiplos patógenos do trigo. A tualmente, um número de genes conferindo RPA e resistência múltipla a várias doenças estão bem caracterizados, como por exemplo o Lr34/Yr18/Pm38 e Lr46/Yr29/Pm39. Os objetivos do projeto são: 1) Identificar locos de trigo que conferem resistência não específica à raça e a múltiplos patógeno como à ferrugem amarela, à ferrugem da folha e à do colmo, como recurso genético para introgredir a resistência em genótipos elite do Reino Unido e do Brasil, como parte de um programa de pré-melhoramento genético. 2) Identificar as alterações moleculares e celulares responsáveis pela resistência não específica à raça de ferrugem da folha na cultivar brasileira Toropi, proporcionando uma compreensão dos mecanismos desta resistência que é potencialmente durável. 3) Refinar o mapeamento de QTLs para RPA à ferrugem da folha na cultivar Toropi usando os marcadores polimórficos (SNP) Kaspar que serão desenvolvidas a partir de genes relacionados com a resistência no projeto SCPRID BB/J011525/1, fornecendo marcadores de DNA para seleção assistida em programas de melhoramento e definir as bases para o trabalho de clonagem dos genes/QTLs de Toropi. A parceria será gerenciada pelos Drs. Chaves e Martinelli no Brasil e pela Dra. Lesley Boyd no Reino Unido e proporcionará a formação de uma base sólida para o desenvolvimento de pesquisas que investigam a diversidade genética na qual se baseiam as formas duráveis de resistência às ferrugens do trigo. Marcadores de DNA para uso em seleção assistida também serão identificados, ao mesmo tempo em que serão caracterizadas as rotas metabólicas envolvidas nestas formas particulares de resistência..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Doutorado: (2) .
Integrantes: Adhemar Zerlotini Neto - Integrante / Paula R. Kuser - Integrante / Márcia Soares Chaves - Coordenador / José Antônio Martinelli - Integrante / Felipe André Sganzerla Graichen - Integrante / Sandra P Brammer - Integrante / Paulo R da Silva - Integrante / Sandra Maria Mansur Scagliusi - Integrante / Lesley Boyd - Integrante / Paula Wiethölter - Integrante / Alice Casassola - Integrante / Adriano Silverio - Integrante / Elene Yamazaki Lau - Integrante / Ana Lúcia Soares Chaves - Integrante / Caroline Wesp Guterres - Integrante / OSullivan Donal - Integrante / Andrew Greenland - Integrante / Erika Sayuri Maneti Koshikumo - Integrante.
2012 - Atual
Tecnologias para computação distribuída, armazenamento de grandes volumes de dados e workflow científico, em suporte à pesquisa agropecuária
Descrição: A demanda por armazenamento e processamento de grandes volumes de dados em aplicações científicas tem se ampliado consideravelmente na atualidade, exigindo investimentos e aperfeiçoamento técnico por parte das organizações que têm a pesquisa e inovação como sua área fim. A Embrapa não é diferente e já enfrenta em vários de seus projetos um volume expressivo de dados; e percebendo o problema, tem desencadeado ações para mitigá-lo. Como exemplo, pode-se citar a criação do Laboratório Multiusuário de Bioinformática da Embrapa (LMB) que fornece serviços para análise de dados genômicos para projetos de pesquisa vinculados ao Sistema Nacional de Pesquisa Agropecuária (SNPA), bem como promove o intercâmbio de conhecimento em análise de dados genômicos, multiplicando competências em bioinformática no SNPA. A empresa, por intermédio da Embrapa Informática Agropecuária, atua fortemente em apoio a essa iniciativa, que busca racionalizar recursos e atender mais adequadamente às demandas da bioinformática, uma área de pesquisa que exige processamento e armazenamento de grandes volumes de dados. Outro exemplo de demanda por processamento e armazenamento de grandes volumes de dados ocorre em pesquisas relacionadas a mudanças climáticas, pois simulações nesta área utilizam fontes diversas de informações com longos históricos. Este, por exemplo, é o cenário vislumbrado pelo projeto SCAF(01.07.06.001.01). Desta forma, o presente projeto se propõe a construir e adaptar tecnologias para processamento distribuído, armazenamento de grandes volumes de dados e workflow científico, em suporte a aplicações científicas, utilizando como casos de uso o LMB e iniciativa relacionadas com simulações em mudanças climáticas, sendo que há uma ênfase maior em aplicações do primeiro caso. Os resultados esperados ao final do projeto são: o estabelecimento de um sistema de armazenamento distribuído resiliente, com alta capacidade de armazenamento e com custo-benefício.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2012 - Atual
Perfil transcriptômico de animais extremos para eficiência alimentar da raça Nelore
Descrição: O Brasil é um dos principais produtores e exportadores mundiais de carne bovina. Dentre as raças de produção de carne no país, a raça Nelore é a que apresenta maior destaque devido aos seus índices notáveis de produção, o que pode ser atribuído principalmente à adaptabilidade e resistência dessa raça em ambientes tropicais. A eficiência alimentar é uma característica produtiva de extrema importância, porém, apesar de apresentar herdabilidade moderada, não está sendo contemplada nos programas de avaliação genética do Brasil, devido ao fato da mensuração ser onerosa e tardia. A seleção para animais mais eficientes poderá contribuir para reduções de área de pasto e produção de poluentes, com maior rentabilidade para o produtor. É nesse contexto que a genética molecular pode contribuir para implementação dessa característica em programas de melhoramento. Recentes desenvolvimentos em genética molecular, como plataformas de genotipagem e seqüenciamento genômico, oferecem oportunidade de identificar um grande número de loci associados com características de interesse produtivo. Essa pesquisa objetiva identificar genes diferencialmente expressos em animais extremos para eficiência alimentar, usando a metodologia de seqüenciamento de RNA (RNA-seq) para obter informações de perfis de expressão genômico nas diferentes classes fenotípicas (animais eficientes e não eficientes), bem como identificar isoformas e splicing alternativo, além de prospectar Polimorfismos de Única Base (Single Nucleotide Polymorphisms SNPs) em genes diferencialmente expressos.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2009 - 2013
Schistosoma Epigenetics - Targets, Regulation, New Drugs (SetTReND)
Descrição: We propose to develop novel drug leads for the therapy of the major human parasitic disease, schistosomiasis, using a holistic approach that will enable us to progress from cloned target proteins to the lead compounds and from epigenetic inhibitors to the validation of crucial targets. For this, we have chosen to target the histone modifying enzymes (HME) ; : histone deacetylases (HDAC), histone acetyltransferases (HAT), histone methyltransferases (HMT) and histone demethylases (HDM) of Schistosoma mansoni. In the course of the project, the members of the HDAC, HAT, HMT and HDM families encoded in the genome will be identified. In parallel, a reverse chemical genetics approach using generic inhibitors of HME subclasses available within the consortium in cultures of schistosome larvae will identify those classes that are bona fide drug targets. These enzymes will be validated as therapeutic targets individually or collectively using RNAi to invalidate the corresponding genes. Potential inhibitors (HDACi, HATi, HMTi, HDMi) will be screened by in silico docking to the modelled catalytic domains of the enzymes and collections containing both analogous and diverse compounds of analogues will be tested for their ability to inhibit the activity of the corresponding recombinant proteins in high-throughput assays. We will also establish gene expression profiles corresponding to HME invalidation (by RNAi) and inhibition (using drug candidates in cultured larval stages (schistosomula)) that will enable the determination of the specificity of action of the compounds. Finally, in vivo testing of the best candidates will be done in infected mice. In this way, during the study period we aim to develop a series of candidate molecules that can progress to clinical trials..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2009 - 2010
Genome sequencing of Schistosoma haematobium
Descrição: Parte do projeto SCORE - B&MG Foundation Sequenciamento do genoma de S. haematobium para a geração de marcadores moleculares..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2008 - 2011
Centro de Excelência em Bioinformática
Descrição: www.cebio.org Objetivo Prover empresas e pesquisadores com treinamento, computadores de alta capacidade de processamento e armazenamento para a realização de análises computacionais de informação biológica. Objetivos específicos. De modo mais pontual, os principais objetivos do Centro de Excelência em Bioinformática de Minas Gerais serão: 1. Prover infra-estrutura computacional para a academia e setor privado. 2. Promover um ambiente interativo entre o setor privado, com especial atenção ao APL de Biotecnologia e a academia. 3. Disseminação do conhecimento em bioinformática. 4. Retenção de recursos humanos em Minas. 5. Dar suporte às redes de pesquisa financiadas pela FAPEMIG, especialmente a Rede Genoma de Minas Gerais, Rede Mineira de Biomoléculas, Rede Mineira de Biotecnologia para o Agronegócio e Rede Mineira de Propriedade Intelectual..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2008 - 2009
Projeto de atividades da Rede Genoma de Minas Gerais Biênio 2008-2009
Descrição: Os principais objetivos do projeto são: 1 - Identificação de determinantes de patogenicidade e virulência dos fungos causadores das ferrugens da soja, eucalipto e café. 2 - Identificação de determinantes de virulência e identificação candidatos a vacina da Corynebacterium pseudotuberculosis e seqüenciamento genômico de C. ulcerans Ver http://rg,g.cpqrr.fiocruz.br..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2007 - 2009
Schistosoma mansoni, resistência ao Praziquantel e descoberta de novos alvos para o desenvolvimento de drogas
Descrição: Projeto Pesquisador Mineiro Desenvolvimento de novos alvos para droga contra o Schistosoma mansoni..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
2004 - 2010
Informatics training for Brazilian vector and parasitic diseases.
Descrição: Este projeto representa uma parceria de colaboração entre pesquisadores da Universidade da Georgia, do Centro de Pesquisas René Rachou FIOCRUZ em Belo Horizonte, Brasil, a Universidade George Washington e o Instituto Oswaldo Cruz FIOCRUZ no Rio de Janeiro, Brasil. O CPqRR atualmente tem 15 laboratórios, 3 projetos financiados pelo NIH (um de treinamento em doenças emergentes e re-emergentes, um projeto ICIDR em correlatos genéticos do hospedeiro em esquistossomose e um na arquitetura de doença cardíaca em áreas rurais no Brasil). O objetivo desta proposta de treinamento é estabelecer uma infraestrutura sustentável no CPqRR nas áreas de bioinformática, epidemiologia e evolução molecular que irão complementar financiamento existente pelo NIH e facilitar a pesquisa conduzida em outros laboratórios. O foco da pesquisa no CPqRR é em parasitas tropicais, seus vetores e hospedeiros. Estes organismos incluem: Plasmodium falciparum, Trypanosoma cruzi, Toxoplasma gondii, Schistosoma mansoni, Anopheles, Biomphalaria e seres humanos. Este projeto foi elaborado para atender às necessidades do CPqRR iniciando um período de treinamento de 5 anos que envolve estudantes pré- e pós-doutoramento de vários dos 15 laboratórios no CPqRR. Treinamento avançado será realizado por meio de workshops, cursos, e treinamento de curta e longa duração tanto no Brasil quanto nos Estados Unidos. O treinamento envolverá projetos em colaboração originados das necessidades do CPqRR focando os vários aspectos da esquistossomose. O projeto unificante para este treinamento será a criação de um banco de dados relacional do genoma do Schistosoma mantido em servidores do CPqRR. Este banco de dados irá conter dados genômicos, do transcriptoma e dados epidemiológicos sendo gerados no CPqRR. Treinamento em evolução molecular irá focar no Schistosoma e no vetor, Biomphalaria e dados epidemiológicos e bioestatísticos serão gerados e analisados por projetos já financiados..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (2) / Doutorado: (1) .
Integrantes: Adhemar Zerlotini Neto - Integrante / Guilherme Correia Oliveira - Coordenador.Financiador(es): FOGARTY INTERNATIONAL CENTER / NIH - Auxílio financeiro.


Projetos de extensão


2009 - 2014
Infectious Disease Genomics and Bioinformatics Training in Brazil
Descrição: This proposal represents a renewal of a current ITGH D43 collaborative training partnership between researchers at the University of Georgia, the Instituto Oswaldo Cruz-FIOCRUZ in Rio de Janeiro, the Universidade Federal de Minas Gerais and the Centro de Pesquisas Rene Rachou (CPqRR) - FIOCRUZ in Belo Horizonte, Brazil. The CPqRR currently has 14 laboratories and 5 funded NIH research awards. The goal of this training proposal is to establish a sustainable core infrastructure at the CPqRR in the areas of bioinformatics, epidemiology and molecular evolution that will complement existing NIH-funded research and facilitate research conducted in other laboratories. The focus of research at the CPqRR is tropical parasites, their vectors and their hosts. These organisms include: Plasmodium sp., Trypanosoma cruzi, Toxoplasma gondii, Schistosoma mansoni, Anopheles, Biomphalaria and Humans. This proposal is designed to meet the needs of the CPqRR by continuing a very productive training program that involves pre-and post-doctoral students from many of the 14 laboratories at the CPqRR for an additional 5 years. Advanced training will be conducted via workshops, courses, short- and long-term training both within Brazil and abroad. Training will involve collaborative research projects originating from the needs of the CPqRR and focusing on several aspects of schistosomiasis. The unifying project for this training will be the continued maintenance and extension (to include population diversity and other omics data) of a Schistosoma genome database created and housed the CPqRR during the first phase of the training award. Molecular evolution training will focus on the Schistosome vector, Biomphalaria and epidemiological/biostatistical data will be derived and analyzed from existing funded projects. The technology and knowledge acquired from this training and implementation exercise will be directly applicable to research on other parasitic organisms. We will ..
Situação: Em andamento; Natureza: Extensão.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (2) .
Integrantes: Adhemar Zerlotini Neto - Integrante / Guilherme Oliveira - Coordenador.Financiador(es): National Institute Of Health - Auxílio financeiro.


Revisor de periódico


2018 - Atual
Periódico: PLoS One


Revisor de projeto de fomento


2010 - Atual
Agência de fomento: (FACEPE) Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Biologia Computacional.
2.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação/Especialidade: Banco de Dados.


Idiomas


Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Espanhol
Compreende Bem, Fala Pouco, Lê Bem, Escreve Pouco.


Produções



Produção bibliográfica
Citações

Web of Science
Total de trabalhos:18
Total de citações:1248
Fator H:12
Zerlotini, Adhemar  Data: 31/01/2018

SCOPUS
Total de trabalhos:24
Total de citações:1472
Zerlotini, Adhemar  Data: 31/01/2018

Artigos completos publicados em periódicos

1.
STAFUZZA, NEDENIA BONVINO2017 STAFUZZA, NEDENIA BONVINO ; ZERLOTINI, ADHEMAR ; LOBO, FRANCISCO PEREIRA ; YAMAGISHI, MICHEL EDUARDO BELEZA ; CHUD, TATIANE CRISTINA SELEGUIM ; CAETANO, ALEXANDRE RODRIGUES ; MUNARI, DANÍSIO PRADO ; GARRICK, DORIAN J. ; MACHADO, MARCO ANTONIO ; MARTINS, MARTA FONSECA ; CARVALHO, MARIA RAQUEL ; COLE, JOHN BRUCE ; BARBOSA DA SILVA, MARCOS VINICIUS GUALBERTO . Single nucleotide variants and InDels identified from whole-genome re-sequencing of Guzerat, Gyr, Girolando and Holstein cattle breeds. Plos One, v. 12, p. e0173954, 2017.

2.
STAFUZZA, N. B.2017STAFUZZA, N. B. ; Zerlotini, A. ; LOBO, F. P. ; YAMAGISHI, M. E. B. ; BUZANSKAS, M. E. ; CHUD, T. C. S. ; CAETANO, A. R. ; MUNARI, D. P. ; GARRICK, D. J. ; MACHADO, M. A. ; MARTINS, M. F. ; CARVALHO, M. R. ; COLE, J. B. ; DA SILVA, M. V. G. B. . 165 Genetic variants with potential loss of function in Gyr, Girolando, and Guzerat cattle breeds by resequencing. JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE, v. 95, p. 81-81, 2017.

3.
CESAR, ALINE S. M.2016CESAR, ALINE S. M. ; REGITANO, LUCIANA C. A. ; POLETI, MIRELE D. ; ANDRADE, SÓNIA C. S. ; TIZIOTO, POLYANA C. ; OLIVEIRA, PRISCILA S. N. ; FELÍCIO, ANDREZZA M. ; DO NASCIMENTO, MICHELE L. ; CHAVES, AMÁLIA S. ; LANNA, DANTE P. D. ; TULLIO, RYMER R. ; NASSU, RENATA T. ; KOLTES, JAMES E. ; FRITZ-WATERS, ERIC ; MOURÃO, GERSON B. ; ZERLOTINI-NETO, ADHEMAR ; REECY, JAMES M. ; COUTINHO, LUIZ L . Differences in the skeletal muscle transcriptome profile associated with extreme values of fatty acids content. BMC Genomics, v. 17, p. 961, 2016.

4.
TIZIOTO, POLYANA C.2016TIZIOTO, POLYANA C. ; COUTINHO, LUIZ L. ; OLIVEIRA, PRISCILA S. N. ; CESAR, ALINE S. M. ; DINIZ, WELLISON J. S. ; LIMA, ANDRESSA O. ; ROCHA, MARINA I. ; DECKER, JARED E. ; SCHNABEL, ROBERT D. ; MOURÃO, GERSON B. ; TULLIO, RYMER R. ; ZERLOTINI, ADHEMAR ; TAYLOR, JEREMY F. ; REGITANO, LUCIANA C. A. . Gene expression differences in Longissimus muscle of Nelore steers genetically divergent for residual feed intake. Scientific Reports, v. 6, p. 39493, 2016.

5.
ROSSE, IZINARA C.2016ROSSE, IZINARA C. ; ASSIS, JULIANA G. ; OLIVEIRA, FRANCISLON S. ; LEITE, LAURA R. ; ARAUJO, FLÁVIO ; ZERLOTINI, ADHEMAR ; VOLPINI, ANGELA ; DOMINITINI, ANDERSON J. ; LOPES, BEATRIZ C. ; ARBEX, WAGNER A. ; MACHADO, MARCO A. ; PEIXOTO, MARIA G. C. D. ; VERNEQUE, RUI S. ; MARTINS, MARTA F. ; COIMBRA, RONEY S. ; SILVA, MARCOS V. G. B. ; OLIVEIRA, Guilherme ; CARVALHO, MARIA RAQUEL S. . Whole genome sequencing of Guzerá cattle reveals genetic variants in candidate genes for production, disease resistance, and heat tolerance. Mammalian Genome, v. 1, p. 1-15, 2016.

6.
TIZIOTO, POLYANA C2015TIZIOTO, POLYANA C ; COUTINHO, LUIZ L ; DECKER, JARED E ; SCHNABEL, ROBERT D ; ROSA, KAMILA O ; OLIVEIRA, PRISCILA SN ; SOUZA, MARCELA M ; MOURÃO, GERSON B ; TULLIO, RYMER R ; CHAVES, AMÁLIA S ; LANNA, DANTE PD ; ZERLOTINI-NETO, ADHEMAR ; MUDADU, MAURICIO A ; TAYLOR, JEREMY F ; REGITANO, LUCIANA CA . Global liver gene expression differences in Nelore steers with divergent residual feed intake phenotypes. BMC Genomics, v. 16, p. 242, 2015.

7.
HONGO, JORGE A.2015HONGO, JORGE A. ; DE CASTRO, GIOVANNI M. ; CINTRA, LEANDRO C. ; ZERLOTINI, ADHEMAR ; Lobo, Francisco P. . POTION: an end-to-end pipeline for positive Darwinian selection detection in genome-scale data through phylogenetic comparison of protein-coding genes. BMC Genomics, v. 16, p. 567, 2015.

8.
ALMEIDA, GIULLIANA T.2015ALMEIDA, GIULLIANA T. ; LAGE, REGINA C. G. ; ANDERSON, LETICIA ; VENANCIO, THIAGO M. ; NAKAYA, HELDER I. ; MIYASATO, PATRÍCIA A. ; ROFATTO, HENRIQUE K. ; ZERLOTINI, ADHEMAR ; NAKANO, ELIANA ; OLIVEIRA, GUILHERME ; VERJOVSKI-ALMEIDA, SERGIO . Synergy of Omeprazole and Praziquantel In Vitro Treatment against Schistosoma mansoni Adult Worms. PLoS Neglected Tropical Diseases (Online), v. 9, p. e0004086, 2015.

9.
GRATIVOL, CLÍCIA2014GRATIVOL, CLÍCIA ; REGULSKI, MICHAEL ; BERTALAN, MARCELO ; MCCOMBIE, W. RICHARD ; DA SILVA, FELIPE RODRIGUES ; ZERLOTINI NETO, ADHEMAR ; VICENTINI, RENATO ; FARINELLI, LAURENT ; HEMERLY, ADRIANA SILVA ; MARTIENSSEN, ROBERT A. ; FERREIRA, PAULO CAVALCANTI GOMES . Sugarcane genome sequencing by methylation filtration provides tools for genomic research in the genus. Plant Journal (Print), v. epub, p. n/a-n/a, 2014.

10.
GLENN, TRAVIS C2013GLENN, TRAVIS C ; LANCE, STACEY L ; MCKEE, ANNA M ; WEBSTER, BONNIE L ; EMERY, AIDAN M ; ZERLOTINI, ADHEMAR ; Oliveira, Guilherme ; Rollinson, David ; FAIRCLOTH, BRANT C . Significant variance in genetic diversity among populations of Schistosoma haematobium detected using microsatellite DNA loci from a genome-wide database. Parasites & Vectors, v. 6, p. 300, 2013.

11.
PEREIRA, ULISSES DE PÁDUA2013PEREIRA, ULISSES DE PÁDUA ; RODRIGUES DOS SANTOS, ANDERSON ; HASSAN, SYED SHAH ; ABURJAILE, FLÁVIA FIGUEIRA ; SOARES, SIOMAR DE CASTRO ; Ramos, Rommel Thiago Jucá ; Carneiro, Adriana Ribeiro ; Guimarães, Luís Carlos ; SILVA DE ALMEIDA, SINTIA ; DINIZ, CARLOS AUGUSTO ALMEIDA ; BARBOSA, Maria Silvanira ; GOMES DE SÁ, PABLO ; Ali, Amjad ; BAKHTIAR, SYEDA MARRIAM ; DORELLA, FERNANDA ALVES ; ZERLOTINI, ADHEMAR ; ARAÚJO, FLÁVIO MARCOS GOMES ; LEITE, LAURA RABELO ; OLIVEIRA, GUILHERME ; MIYOSHI, Anderson ; SILVA, A. ; Azevedo, Vasco ; FIGUEIREDO, HENRIQUE CÉSAR PEREIRA . Complete genome sequence of Streptococcus agalactiae strain SA20-06, a fish pathogen associated to meningoencephalitis outbreaks. STAND GENOMIC SCI, v. 8, p. 188-197, 2013.

12.
Protasio, Anna V.2012Protasio, Anna V. ; Tsai, Isheng J. ; Babbage, Anne ; Nichol, Sarah ; Hunt, Martin ; Aslett, Martin A. ; De Silva, Nishadi ; Velarde, Giles S. ; Anderson, Tim J. C. ; Clark, Richard C. ; Davidson, Claire ; Dillon, Gary P. ; Holroyd, Nancy E. ; LoVerde, Philip T. ; Lloyd, Christine ; McQuillan, Jacquelline ; OLIVEIRA, Guilherme ; Otto, Thomas D. ; Parker-Manuel, Sophia J. ; Quail, Michael A. ; Wilson, R. Alan ; ZERLOTINI, ADHEMAR ; Dunne, David W. ; Berriman, Matthew . A Systematically Improved High Quality Genome and Transcriptome of the Human Blood Fluke Schistosoma mansoni. PLoS Neglected Tropical Diseases (Online), v. 6, p. e1455, 2012.

13.
Young, Neil D2012 Young, Neil D Jex, Aaron R Li, Bo Liu, Shiping Yang, Linfeng Xiong, Zijun Li, Yingrui Cantacessi, Cinzia Hall, Ross S Xu, Xun Chen, Fangyuan Wu, Xuan ZERLOTINI, ADHEMAR OLIVEIRA, Guilherme Hofmann, Andreas Zhang, Guojie Fang, Xiaodong Kang, Yi Campbell, Bronwyn E Loukas, Alex Ranganathan, Shoba Rollinson, David Rinaldi, Gabriel Brindley, Paul J Yang, Huanming , et al.Wang, Jun Wang, Jian Gasser, Robin B ; Whole-genome sequence of Schistosoma haematobium. Nature Genetics (Print), v. 1, p. 1, 2012.

14.
Azevedo, Vasco2012Azevedo, Vasco ; D'Afonseca, V ; Ali, ; Santos, Anderson ; Pinto, ; Magalhães, ; Faria, ; Barbosa, ; Guimarães, ; Eslabão, ; Almeida, ; Neto, ; Carneiro, ; Cerdeira, Louise ; Ramos, Rommel ; Hirata-Jr, ; Mattos-Guaraldi, AL ; Trost, ; Tauch, ; Silva, ; Schneider, ; Miyoshi, ; Azevedo, Vasco . Reannotation of the Corynebacterium diphtheriae NCTC13129 genome as a new approach to studying gene targets connected to virulence and pathogenicity in diphtheria. Open Access Bioinformatics, v. 1, p. 1, 2012.

15.
Lepesant, Julie MJ2012Lepesant, Julie MJ ; Cosseau, Celine ; Boissier, Jerome ; Freitag, Michael ; Portela, Julien ; Climent, Deborah ; Perrin, Cecile ; ZERLOTINI, ADHEMAR ; Grunau, Christoph . Chromatin structure changes around satellite repeats on the Schistosoma mansoni female sex chromosome suggest a possible mechanism for sex chromosome emergence. GenomeBiology.com (London. Print), v. 13, p. R14, 2012.

16.
Silva, Larissa Lopes2012Silva, Larissa Lopes ; MARCET-HOUBEN, MARINA ; NAHUM, LAILA ALVES ; ZERLOTINI, ADHEMAR ; GABALDÓN, TONI ; OLIVEIRA, G. C. ; Oliveira, Guilherme . The Schistosoma mansoni phylome: using evolutionary genomics to gain insight into a parasite's biology. BMC Genomics, v. 13, p. 617, 2012.

17.
Zerlotini, A.2012 Zerlotini, A.; AGUIAR, E. R. G. R. ; YU, F. ; XU, H. ; LI, Y. ; YOUNG, N. D. ; GASSER, R. B. ; PROTASIO, A. V. ; BERRIMAN, M. ; ROOS, D. S. ; Kissinger, J. C. ; Oliveira, G. . SchistoDB: an updated genome resource for the three key schistosomes of humans. Nucleic Acids Research (Online), v. Online, p. Nov. 17, 2012, 2012.

18.
Simoes, Mariana C2011Simoes, Mariana C ; Lee, Jonathan ; Djikeng, Appolinaire ; Cerqueira, Gustavo C ; ZERLOTINI, ADHEMAR ; da Silva-Pereira, Rosiane A ; Dalby, Andrew R ; LoVerde, Philip ; El-Sayed, Najib M ; OLIVEIRA, Guilherme . Identification of Schistosoma mansoni microRNAs. BMC Genomics, v. 12, p. 47, 2011.

19.
Ruiz, Jerônimo C.2011Ruiz, Jerônimo C. D'Afonseca, Vívian Silva, Artur Ali, Amjad Pinto, Anne C. Santos, Anderson R. Rocha, Aryanne A. M. C. Lopes, Débora O. Dorella, Fernanda A. Pacheco, Luis G. C. Costa, Marcília P. Turk, Meritxell Z. Seyffert, Núbia Moraes, Pablo M. R. O. Soares, Siomar C. Almeida, Sintia S. Castro, Thiago L. P. Abreu, Vinicius A. C. Trost, Eva Baumbach, Jan Tauch, Andreas Schneider, Maria Paula C. McCulloch, John Cerdeira, Louise T. Ramos, Rommel T. J. , et al.ZERLOTINI, ADHEMAR DOMINITINI, Anderson Resende, Daniela M. Coser, Elisângela M. Oliveira, Luciana M. Pedrosa, André L. Vieira, Carlos U. Guimarães, Cláudia T. Bartholomeu, Daniela C. Oliveira, Diana M. Santos, Fabrício R. Rabelo, Élida Mara Lobo, Francisco P. Franco, Glória R. Costa, Ana Flávia ; Evidence for Reductive Genome Evolution and Lateral Acquisition of Virulence Functions in Two Corynebacterium pseudotuberculosis Strains. Plos One, v. 6, p. e18551, 2011.

20.
Andrade, Luiza F2011Andrade, Luiza F ; Nahum, Laila A ; Avelar, Livia G.A. ; Silva, Larissa L ; ZERLOTINI, ADHEMAR ; Ruiz, Jeronimo C ; OLIVEIRA, Guilherme . Eukaryotic Protein Kinases (ePKs) of the Helminth Parasite Schistosoma mansoni. BMC Genomics, v. 12, p. 215, 2011.

21.
SILVA, L.2011SILVA, L. ; MARCET-HOUBEN, M. ; Zerlotini, A. ; GABALDON, T. ; OLIVEIRA, Guilherme ; NAHUM, L. . Evolutionary histories of expanded peptidase families in Schistosoma mansoni. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz (Impresso), v. 106, p. 864-877, 2011.

22.
ZERLOTINI, ADHEMAR2010ZERLOTINI, ADHEMAR; OLIVEIRA, Guilherme . The contributions of the Genome Project to the study of schistosomiasis. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz (Impresso), v. 105, p. 367-369, 2010.

23.
Zerlotini, A.2009 Zerlotini, A.; HEIGES, M. ; Wang, H ; MORAIS, Romulo ; DOMINITINI, Anderson ; RUIZ, J. ; Kissinger, J ; OLIVEIRA, Guilherme . SchistoDB: a Schistosoma mansoni genome resource. Nucleic Acids Research, v. 37, p. 579-582, 2009.

24.
Berriman, Matthew2009 Berriman, Matthew Haas, Brian J. LoVerde, Philip T. Wilson, R. Alan Dillon, Gary P. Cerqueira, Gustavo C. Mashiyama, Susan T. Al-Lazikani, Bissan Andrade, Luiza F. Ashton, Peter D. Aslett, Martin A. Bartholomeu, Daniella C. Blandin, Gaelle Caffrey, Conor R. Coghlan, Avril Coulson, Richard Day, Tim A. Delcher, Art DeMarco, Ricardo Djikeng, Appolinaire Eyre, Tina Gamble, John A. Ghedin, Elodie Gu, Yong Hertz-Fowler, Christiane , et al.Hirai, Hirohisha Hirai, Yuriko Houston, Robin Ivens, Alasdair Johnston, David A. Lacerda, Daniela Macedo, Camila D. McVeigh, Paul Ning, Zemin OLIVEIRA, Guilherme Overington, John P. Parkhill, Julian Pertea, Mihaela Pierce, Raymond J. Protasio, Anna V. QUAIL, M. A. RAJANDREAM, M. ROGERS, J. SAJID, M. SALZBERG, S. L. STANKE, M. TIVEY, A. R. WHITE, O. WILLIAMS, D. L. WORTMAN, J. WU, W. ZAMANIAN, M. Zerlotini, A. FRASER-LIGGETT, C. M. BARRELL, B. G. EL-SAYED, N. M. ; The genome of the blood fluke Schistosoma mansoni. Nature (London), v. 460, p. 352-358, 2009.

25.
SIMÕES, Mariana2007SIMÕES, Mariana ; BAHIA, D. ; ZERLOTINI, ADHEMAR ; Artiguenave, F. ; Neshich G. ; Kuser, P. ; OLIVEIRA, Guilherme . Single nucleotide polymorphisms identification in expressed genes of Schistosoma mansoni.. Molecular and Biochemical Parasitology (Print), v. 154, p. 134-140, 2007.

Capítulos de livros publicados
1.
Márcia Flores da Silva Ferreira ; Adésio Ferreira ; Wellington Ronildo Clarindo ; Zerlotini, A. ; Nina Claudia Barbosa da Silva . Genômica e aspectos etnomedicinais de Psidium. In: Felipe Vaz Andrade; Renato Ribeiro Passos; Eduardo de Sá Mendonça; Julião Soares de Souza Lima; Adésio Ferreira. (Org.). Tópicos Especiais em Produção Vegetal II. 1ed.: Universidade Federal do Espírito Santo, 2011, v. 1, p. 163-173.

Resumos expandidos publicados em anais de congressos
1.
ZERLOTINI, ADHEMAR; MORAIS, Romulo ; HEIGES, M. ; Wang, H ; Stahl, AO ; Kissinger, J ; Ludolf, F. ; Atwood, J. ; Orlando, R. ; OLIVEIRA, Guilherme . Identification of new antigens for vaccine development for Schistosoma mansoni. Integration of genomic and post-genomic data a and proteomic analysis.. In: Keystone Symposium. Challenges of Global Health Vaccine Development., 2007, Cidade do Cabo. Challenges of Global Vaccine Development, 2007.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
Isabel R Gerhardt ; Poliana F Giachetto ; Michel E B Yamagishi ; Francisco P Lobo ; Ricardo M Penchel ; Alexandre Missiaggia ; Zerlotini, A. ; Felipe R Silva . RNA-SEQ ANALYSIS OF EUCALYPTUS GENOTYPES THAT DIFFER IN CARBON ALLOCATION. In: ISMB, 2012, Long Beach. ISMB 2012 online proceedings, 2012.

2.
ZERLOTINI, ADHEMAR; HEIGES, M. ; Wang, H ; Coeli, R ; MORAIS, Romulo ; Dominitini, A. J. ; Kissinger, J ; OLIVEIRA, Guilherme . Integration and use of Schistosoma mansoni genomic data towards the identification of candidate therapeutic targets. In: ISCB Latin-America, 2010, Montevideo. ISCB Latin-America, 2010.

3.
ZERLOTINI, ADHEMAR; HEIGES, M. ; Wang, H ; Coeli, R ; MORAIS, Romulo ; Dominitini, A. J. ; Kissinger, J ; OLIVEIRA, Guilherme . Integration and use of Schistosoma mansoni genomic data towards the identification of candidate therapeutic targets. In: SB-Meeting, 2010, Ouro Preto. SB-Meeting, 2010.

4.
ZERLOTINI, ADHEMAR; PAIS, F. ; SIMÕES, Mariana ; OLIVEIRA, Guilherme . SchistoDB 2.5 - An updated Schistosoma mansoni bioinformatics resource. In: X-Meeting. Sixth International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2010, Ouro Preto. X-Meeting Eletronic Abstracts Book 2010, 2010.

5.
Zerlotini, A.; HEIGES, M. ; Wang, H ; Coeli, R ; MORAIS, Romulo ; Dominitini, A. J. ; Kissinger, J ; OLIVEIRA, Guilherme . Integration and use of Schistosoma mansoni genomic data towards finding canditate therapeuthic targets. In: X-Meeting. Fifth International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2009, Angra dos Reis - RJ - Brazil. X-Meeting Eletronic Abstracts Book 2009, 2009.

6.
Moraes, R. L. V. ; Ruiz, J. C. ; Zerlotini, A. ; OLIVEIRA, Guilherme . Computational analysis of the Schistosoma mansoni genome for the identification of vaccine candidates. In: X-Meeting. Fifth International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2009, Angra dos Reis - RJ - Brazil. X-Meeting Eletronic Abstracts Book 2009, 2009.

7.
ZERLOTINI, ADHEMAR; Kissinger, J . From genes to drug targets: Applications for parasitic organisms. In: 3rd Annual Computational and Systems Biology Symposium, Mar. 21st, 2008, 2008, Athens, GA. 3rd Annual Computational and Systems Biology Symposium, Mar. 21st, 2008, 2008.

8.
ZERLOTINI, ADHEMAR; OLIVEIRA, Guilherme ; Kissinger, J . From genes to drug targets: Applications for parasitic organisms. In: 16th Annual International Conference Intelligent Systems for Molecular Biology, 2008, Toronto, CA. 16th Annual International Conference Intelligent Systems for Molecular Biology, 2008.

9.
ZERLOTINI, ADHEMAR; HEIGES, M. ; Wang, H ; Kissinger, J ; OLIVEIRA, Guilherme . Integration and use of Schistosoma mansoni genomic data for the discovery of candidate therapeutic targets. In: 16th Annual International Conference Intelligent Systems for Molecular Biology, 2008, Toronto, CA. 16th Annual International Conference Intelligent Systems for Molecular Biology, 2008.

10.
ZERLOTINI, ADHEMAR; HEIGES, M. ; Wang, H ; Kissinger, J ; OLIVEIRA, Guilherme . Integration and use of Schistosoma mansoni genomic data for the discovery of candidate therapeutic targets. In: X-Meeting. Fourth International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2008, Salvador. X-Meeting. Fourth International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2008.

11.
ZERLOTINI, ADHEMAR; HEIGES, M. ; Wang, H ; Kissinger, J ; OLIVEIRA, Guilherme . Integration and use of Schistosoma mansoni genomic data for the discovery of candidate therapeutic targets. In: 11th International Symposium on Schistosomiasis, 2008, Salvador. 11th International Symposium on Schistosomiasis, 2008.

12.
MORAIS, Romulo ; RUIZ, J. ; Zerlotini, A. ; OLIVEIRA, Guilherme . Computational analysis of the Schistosoma mansoni genome for the identification of vaccine candidates. In: X International Symposium on Schistomiasis, 2008, Salvador - BA. X International Symposium on Schistomiasis, 2008.

13.
ANDRADE, L. F. ; ZERLOTINI, ADHEMAR ; OLIVEIRA, Guilherme . Characterization of MAPKs and MKPs in Schistosoma mansoni genome: An in silico and experimental approach. In: X International Symposium on Schistomiasis, 2008, Salvador - BA. X International Symposium on Schistomiasis, 2008.

14.
ZERLOTINI, ADHEMAR; MORAIS, Romulo ; HEIGES, M. ; Wang, H ; Stahl, AO ; RUIZ, J. ; Kissinger, J ; OLIVEIRA, Guilherme . SchistoDB - An integrated Schistosoma mansoni database. In: 15th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB) & 6th European Conference on Computational Biology (ECCB), 2007, Viena. 15th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB) & 6th European Conference on Computational Biology (ECCB), 2007.

15.
ZERLOTINI, ADHEMAR; MORAIS, Romulo ; HEIGES, M. ; Wang, H ; Stahl, AO ; RUIZ, J. ; Kissinger, J ; OLIVEIRA, Guilherme . SchistoDB - An integrated Schistosoma mansoni database. In: International Workshop on Genomic Databases, IWGD 2007, 2007, Angra dos Reis. International Workshop on Genomic Databases, IWGD 2007, 2007.

16.
ALMEIDA, Luiza Freire de Andrade ; RUIZ, J. ; ZERLOTINI, ADHEMAR ; MORAIS, Romulo ; DISSOUS, Colette ; PIERCE, Raymond ; OLIVEIRA, Guilherme . Characterization of MAPKs and MKPs in Schistosoma mansoni genome: An in silico and experimental approach. In: X-Meeting. Third International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2007, São Paulo. X-Meeting. Third International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2007.

17.
ZERLOTINI, ADHEMAR; MORAIS, Romulo ; HEIGES, M. ; Wang, H ; Stahl, AO ; RUIZ, J. ; Kissinger, J ; OLIVEIRA, Guilherme . SchistoDB - An integrated Schistosoma mansoni database. In: X-Meeting. Third International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2007, São Paulo. X-Meeting. Third International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2007.

18.
ZERLOTINI, ADHEMAR; MORAIS, Romulo ; Coeli, R ; HEIGES, M. ; Wang, H ; Kissinger, J ; OLIVEIRA, Guilherme . Integration and use of Schistosoma mansoni Genomic Data for the Discovery of New Drug Targets. In: X IUBMB Conference, 2007, Salvador. X IUBMB Conference, 2007.

19.
FRANCO, Glória ; FARIA-CAMPOS, Alessandra ; ORTEGA, José Miguel ; ZERLOTINI, ADHEMAR ; OLIVEIRA, Guilherme . The Schistosoma mansoni Transcriptome. In: X International Symposium on Schistomiasis, 2005, Belo Horizonte. X International Symposium on Schistomiasis, 2005.

20.
SIMÕES, Mariana ; BAHIA, D. ; ZERLOTINI, ADHEMAR ; Torres, K. ; Artiguenave, F. ; Kuser, P. ; Neshich G. ; OLIVEIRA, Guilherme . SNP Identification in Schistosoma mansoni Expressed Genes. In: X-meeting - 1st International Conference of the AB3C, 2005, Caxambú - MG. Genetic Molecular Research 4(4) 2005, 2005.

21.
SIMÕES, Mariana ; BAHIA, D. ; Artiguenave, F. ; ZERLOTINI, ADHEMAR ; Torres, K. ; OLIVEIRA, Guilherme . SNP identification in Schistosoma mansoni expressed genes. In: X Simpósio Internacional Sobre Esquistossomose, 2005, Belo Horizonte. X Simpósio Internacional Sobre Esquistossomose, 2005.

22.
OLIVEIRA, Guilherme ; CASTRO, Ieso ; CARNEIRO, Newton ; MORAIS, Romulo ; DOMINITINI, Anderson ; SIMÕES, Mariana ; BROMMONSCHENKEL, Sérgio ; PAIVA, Luciano ; GOULART, Luiz ; FARIA-CAMPOS, Alessandra ; ORTEGA, José Miguel ; ZERLOTINI, ADHEMAR ; FRANCO, Glória . Large scale production of EST of Schistosoma mansoni. In: American Society of Tropical Medicine and Hygiene, 2005, Washington. American Society of Tropical Medicine and Hygiene, 2005.

Apresentações de Trabalho
1.
Zerlotini, A.. Aplicação da ferramenta Galaxy na análise de RNA-Seq. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

2.
Zerlotini, A.; HEIGES, M. ; Wang, H ; Coeli, R ; MORAIS, Romulo ; Dominitini, A. J. ; Kissinger, J ; OLIVEIRA, Guilherme . Integration and use of Schistosoma mansoni genomic data towards the identification of candidate therapeutic targets. 2010. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

3.
Zerlotini, A.. Reconstrução computacional de vias metabólicas. 2009. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

4.
ZERLOTINI, ADHEMAR; HEIGES, M. ; Wang, H ; Kissinger, J ; OLIVEIRA, Guilherme . Integration and use of Schistosoma mansoni genomic data for the discovery of candidate therapeutic targets. 2008. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

5.
OLIVEIRA, Guilherme ; Zerlotini, A. . Bioinformatics course. 2005. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

Outras produções bibliográficas
1.
ZERLOTINI NETO, ADHEMAR; CINTRA, L. C. . Análise de dados de RNA-Seq utilizando o Galaxy. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2016 (Série Documentos).


Produção técnica
Programas de computador sem registro
1.
ZERLOTINI, ADHEMAR. Intranet do Centro de Pesquisas René Rachou. 2003.


Demais tipos de produção técnica
1.
Zerlotini, A.. Aplicação da ferramenta Galaxy na análise de RNA-Seq. 2013. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

2.
Zerlotini, A.. Modelos Computacionais Aplicados à Bioinformática e Biologia Computacional. 2013. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

3.
Zerlotini, A.. Análise de dados de RNA-Seq utilizando o Galaxy. 2013. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

4.
Zerlotini, A.. Introdução à Bioinformática. 2013. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

5.
ZERLOTINI, ADHEMAR; Felipe Rodrigues da Silva ; Francisco P Lobo . Análise de RNA-Seq utilizando o Galaxy. 2012. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

6.
COIMBRA, R. S. ; ZERLOTINI, ADHEMAR ; AGUIAR, E. ; Dominitini, A. J. ; PAIS, F. ; ARAUJO, F. ; SILVA, F. ; OLIVEIRA, Guilherme ; NAHUM, L. ; JACQUES, L. ; ANDRADE, L. F. ; SILVA, M. V. B. ; SIMÕES, Mariana ; MORAIS, Romulo ; PEREIRA, R. ; MAFRA, T. . II Curso de Nivelamento em Bioinformática. 2010. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

7.
COIMBRA, R. S. ; ZERLOTINI, ADHEMAR ; DOMINITINI, Anderson ; DRUMOND, B. ; ASCIPRIANO, D. ; AGUIAR, E. ; PAIS, F. ; SILVA, F. ; NAHUM, L. ; SILVA, L. ; JACQUES, L. ; ANDRADE, L. F. ; MORAIS, Romulo ; PEREIRA, R. . I Curso de Nivelamento em Bioinformática. 2010. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

8.
OLIVEIRA, Guilherme ; ZERLOTINI, ADHEMAR . CABI - Curso de Aperfeiçoamento em Bioinformática. 2007. .

9.
RUIZ, J. ; OLIVEIRA, Guilherme ; ZERLOTINI, ADHEMAR ; MORAIS, Romulo . Programando em Bioinformática: Utilizando Perl e seus Módulos. 2007. .

10.
OLIVEIRA, Guilherme ; ZERLOTINI, ADHEMAR . Curso de Introdução à Bioinformática.. 2005. .

11.
OLIVEIRA, Guilherme ; ORTEGA, José Miguel ; FARIA-CAMPOS, Alessandra ; Kuser, P. ; ZERLOTINI, ADHEMAR . Introdução à ferramentas de bioinformática. 2005. .



Bancas



Participação em bancas de trabalhos de conclusão
Mestrado
1.
Zerlotini, A.; Regina Célia Mingroni Neto; Carlos Frederico Martins Menck. Participação em banca de Lívia Maria Silva Moura. Busca de variantes em sequência de DNA proveniente de pacientes com deficiência em processos de reparo do genoma. 2015. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

2.
Bruno Malveira Peixoto; Zanoni Dias; João Carlos Setubal; ZERLOTINI, ADHEMAR. Participação em banca de Bruno Malveira Peixoto. Classificação de Sequências e Análise de Diversidade em Metagenômica. 2013. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas.

3.
Eduardo Martin Tarazona Santos; FARIA-CAMPOS, Alessandra; Ana Lúcia Brunialti Godard; Zerlotini, A.. Participação em banca de MÁRCIA LOBÃO IANNINI. DESENVOLVIMENTO DE UMA INTERFACE WEB PARA A PLATAFORMA DIVERGENOME. 2010. Dissertação (Mestrado em Genética) - Universidade Federal de Minas Gerais.

Teses de doutorado
1.
Maria Raquel Santos Carvalho; Zerlotini, A.; LOBO, F. P.; GUIMARAES, S. E. F.; Cláudia Teixeira Guimarães. Participação em banca de Izinara Rosse da Cruz. Genoma do Guzerá e do Gir: Identificação e análises funcionais de polimorfismos nos principais genes envolvidos no metabolismo da glândula mamária de zebuínos. 2015. Tese (Doutorado em Genética) - Universidade Federal de Minas Gerais.

2.
YAMAGISHI, M. E. B.; COUTINHO, L. L.; MUDADO, M. A.; HIGA, R. H.; Zerlotini, A.. Participação em banca de Joaquim Manoel da Silva. DETECÇÃO DE VARIAÇÕES GENÔMICAS EM BOVINOS DA RAÇA NELORE USANDO DADOS DE GENOTIPAGEM E RESSEQUENCIAMENTO. 2015. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Qualificações de Doutorado
1.
Izinara Rosse da Cruz; Maria Raquel Santos Carvalho; Leandro Márcio Moreira; ZERLOTINI, ADHEMAR. Participação em banca de Izinara Rosse da Cruz. Identificação e análises funcionais de polimorfismos nos principais genes envolvidos no metabolismo de lipídeos da glândula mamária de bovinos da raça Guzerá. 2013. Exame de qualificação (Doutorando em Genética) - Universidade Federal de Minas Gerais.

Qualificações de Mestrado
1.
SANTOS, R. V.; Zerlotini, A.; BRANDAO, M. M.. Participação em banca de Felipe Alonso Martins. Aplicação de ferramentas de Biologia de Sistemas em levedura industrial para produção de bioetanol de segunda geração. 2014. Exame de qualificação (Mestrando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.



Participação em bancas de comissões julgadoras
Concurso público
1.
Jesus Aparecido Ferro; João Carlos Setubal; Ana Tereza Ribeiro de Vasconcelos; Felipe Rodrigues da Silva; ZERLOTINI, ADHEMAR. Pesquisador III. 2012. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.



Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
ISMB. RNA-SEQ ANALYSIS OF EUCALYPTUS GENOTYPES THAT DIFFER IN CARBON ALLOCATION. 2012. (Congresso).

2.
ISCB Latin-America. Integration and use of Schistosoma mansoni genomic data towards the identification of candidate therapeutic targets. 2010. (Congresso).

3.
SB-Meeting. Integration and use of Schistosoma mansoni genomic data towards the identification of candidate therapeutic targets. 2010. (Congresso).

4.
X-Meeting. Sixth International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology. SchistoDB 2.5 - An updated Schistosoma mansoni bioinformatics resource. 2010. (Congresso).

5.
11th International Symposium on Schistosomiasis. Integration and use of Schistosoma mansoni genomic data for the discovery of candidate therapeutic targets. 2008. (Congresso).

6.
16th Annual International Conference Intelligent Systems for Molecular Biology. Integration and use of Schistosoma mansoni genomic data for the discovery of candidate therapeutic targets. 2008. (Congresso).

7.
3rd Annual Computational and Systems Biology Symposium, Mar. 21st, 2008. From Genes to Drug Targets: An Approach for Parasitic Organisms. 2008. (Congresso).

8.
X-Meeting. Fourth International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology. Integration and use of Schistosoma mansoni genomic data for the discovery of candidate therapeutic targets. 2008. (Congresso).

9.
Treinamento em GUS. 2007. (Oficina).

10.
ISMB - Intelligent Systems for Molecular Biology. 2006. (Congresso).

11.
PathwayTools Workshop. 2006. (Outra).

12.
Workshop de anotação de ESTs - Rede Genoma de Minas Gerais. 2006. (Outra).

13.
X-Meeting - Second International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology. 2006. (Congresso).

14.
GUS Workshop. 2005. (Outra).

15.
X International Symposium on Schistomiasis. SNP Identification in Schistosoma mansoni Expressed Genes. 2005. (Congresso).

16.
X-meeting - 1st International Conference of the AB3C. SNP Identification in Schistosoma mansoni Expressed Genes. 2005. (Congresso).

17.
XXV Congresso da Sociedade Brasileira de Computação. 2005. (Congresso).

18.
I CONINFOR - Convenção de Informática da UNINCOR. 2000. (Congresso).



Orientações



Orientações e supervisões em andamento
Tese de doutorado
1.
Marcela Maria de Souza. Avaliação da expressão alélica em genes associados à maciez de carne em animais Nelore por meio de análise transcriptômica.. Início: 2013. Tese (Doutorado em Genética e Evolução) - Universidade Federal de São Carlos. (Coorientador).


Orientações e supervisões concluídas
Dissertação de mestrado
1.
Luís Augusto Eijy Nagai. Identificação de genes relacionados à qualidade da carne de bovinos das raças Angus e Nelore por análise da expressão diferencial. 2013. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, . Coorientador: Adhemar Zerlotini Neto.



Educação e Popularização de C & T



Cursos de curta duração ministrados
1.
ZERLOTINI, ADHEMAR; Felipe Rodrigues da Silva ; Francisco P Lobo . Análise de RNA-Seq utilizando o Galaxy. 2012. (Curso de curta duração ministrado/Outra).




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