Ricardo Oliveira dos Santos Soares

Bolsista de Pós-doutorado Júnior do CNPq

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  • Última atualização do currículo em 11/07/2014


possui graduação tipo Bacharelado e Licenciatura em Ciências Biológicas pela Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo (com extensão de 1 ano na Tübingen Universität), Mestrado em Ciências Farmacêuticas (área de Física Biológica) pela Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (USP), e Doutorado em Ciências na mesma instituição. Possui experiência anterior na utilização de Monte-Carlo em Teoria dos Jogos para o estudo da evolução da cooperação na natureza. Atua na área de Biologia Estrutural e Bioinformática, utilizando ferramentas computacionais, principalmente Dinâmica Molecular, aplicadas ao estudo de proteínas de interesse biológico, como a Fumarato Hidratase de Leishmania major e de T. cruzi, Galectina 4 humana e LAAO. Estuda o processo de infecção do vírus do Dengue com ênfase em aspectos estruturais proteína E e suas interações com a bicamada lipídica viral. Atualmente também promove experimentos de biologia molecular e cristalografia de proteínas como auxílio da caracterização estrutural e funcional da proteína Fumarato Hidratase de Leishmania major. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Ricardo Oliveira dos Santos Soares
Nome em citações bibliográficas
SOARES, R. O. S.;Soares, ROS

Endereço


Endereço Profissional
Universidade de São Paulo, Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto, Departamento de Física e Química.
Av. Bandeirantes, 3900
Monte Alegre
14040901 - Ribeirao Preto, SP - Brasil
URL da Homepage: http://fisbio.fcfrp.usp.br


Formação acadêmica/titulação


2013
Pós-Doutorado.
Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto-USP.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Biologia Estrutural.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Dinâmica Molecular.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Cristalografia de Proteínas.
2009 - 2013
Doutorado em Ciências Farmacêuticas.
Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto-USP.
Título: Processos preliminares da infecção viral: estudo estéreo-químico da (glico)proteína E do envelope do vírus do Dengue., Ano de obtenção: 2013.
Orientador: Antonio Caliri.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo.
Palavras-chave: Dinâmica molecular; Dengue Virus; Induced Fit; Biologia Estrutural.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Estrutural.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Proteômica.
Setores de atividade: Pesquisa e desenvolvimento científico.
2007 - 2009
Mestrado em Física Biológica.
Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto-USP.
Título: Dinâmica molecular de proteínas: estabilidade e renaturação.,Ano de Obtenção: 2009.
Orientador: Antonio Caliri.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior.
Palavras-chave: Protein Folding; Biologia Estrutural; Física Biológica.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: FÍSICA BIOLÓGICA.
2001 - 2008
Graduação em Licenciatura em Ciências Biológicas.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
2001 - 2004
Graduação em Bacharelado Em Ciências Biológicas.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: Estudo e modelagem da evolução da cooperação em sistemas naturais através da teoria dos jogos.
Orientador: Alexandre Souto Martinez.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo.


Formação Complementar


2013 - 2013
IPGN - Iniciando um Pequeno e Grande Negócio. (Carga horária: 30h).
Serviço de Apoio às Micro e Pequenas Empresas de São Paulo.
2013 - 2013
MEI Microempreendedor Individual.
Serviço de Apoio às Micro e Pequenas Empresas de São Paulo.
2013 - 2013
MEG - Primeiros Passos para a Excelência.
Serviço de Apoio às Micro e Pequenas Empresas de São Paulo.
2012 - 2012
AE - Aprender a Empreender. (Carga horária: 16h).
Serviço de Apoio às Micro e Pequenas Empresas de São Paulo.
2005 - 2006
Extensão universitária em Allgemeine Biologie.
Eberhard Karls Universität Tübingen.


Atuação Profissional



Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto-USP, FCFRP-USP, Brasil.
Vínculo institucional

2007 - Atual
Vínculo: Pós-Graduando, Enquadramento Funcional: Estudante



Projetos de desenvolvimento


2009 - 2012
PROCESSOS PRELIMINARES DA INFECÇÃO VIRAL: ESTUDO ESTEREO-QUÍMICO DA (GLICO)PROTEÍNA "E" DO DENGUE

Descrição: Projeto de Doutorado.
Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento.

Integrantes: Ricardo Oliveira dos Santos Soares - Integrante / Antonio Caliri - Coordenador.


Revisor de periódico


2013 - Atual
Periódico: Plos One
2013 - Atual
Periódico: African Journal of Pharmacy and Pharmacology


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: FÍSICA BIOLÓGICA/Especialidade: Dinâmica Molecular.
2.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Bioinformática.
3.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Biologia Estrutural.
4.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Virologia.
5.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Proteômica.
6.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Computação de Alto Desempenho.


Idiomas


Alemão
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Espanhol
Compreende Razoavelmente, Fala Pouco, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.


Produções



Produção bibliográfica
Citações

Web of Science
Total de trabalhos:1
Total de citações:3
Fator H:1
Soares ROS  Data: 10/06/2008

SCOPUS
Total de trabalhos:1
Total de citações:8
soares, R.O.S.  Data: 17/09/2012

Artigos completos publicados em periódicos

1.
SOARES, R. O. S.2012 SOARES, R. O. S. ; CALIRI, A. . Stereochemical Features of the Envelope Protein Domain III of Dengue Virus Reveals Putative Antigenic Site in the Five-Fold Symmetry Axis. Biochimica et Biophysica Acta. Proteins and Proteomics, v. 1834, p. 221-230, 2012.

2.
SOARES, R. O. S.2006 SOARES, R. O. S. ; MARTINEZ, Alexandre Souto . The geometrical pattern of the evolution of cooperation in the Spatial Prisoner's Dilemma: an intra-group model. Physica. A, Amsterdam, Holanda, v. 369, p. 823-829, 2006.

Resumos expandidos publicados em anais de congressos
1.
SOARES, R. O. S. ; MARTINEZ, Alexandre Souto . The prisoner's dilemma: spatiotemporal model of intra and inter-populational cooperation among agents. In: 12 SIICUSP, 2004, Ribeirão Preto - SP - Brazil. XII - SIICUSP (Simpósio Internacional de Iniciação Científica da Universidade de São Paulo, 2004.

2.
SOARES, R. O. S. ; MARTINEZ, Alexandre Souto . XI - SIICUSP (Simpósio Internacional de Iniciação Científica da Universidade de São Paulo). In: 11 SIICUSP, 2003, Ribeirão Preto - SP - Brazil. XI - SIICUSP (Simpósio Internacional de Iniciação Científica da Universidade de São Paulo, 2003.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
SOARES, R. O. S. ; MARTINEZ, Alexandre Souto . The prisoner´s dilemma: spatiotemporal model of intra and inter-populational cooperation among agents. In: 2nd International Conference on Bioinformatics and Computational Biology, 2004, Angra dos Reis, RJ. Proceedings of the 2nd ICOBICOBI, 2004.

2.
SOARES, R. O. S. ; MARTINEZ, Alexandre Souto . The prisoner's dilemma: spatiotemporal model of intra and inter-populational cooperation among agents. In: II Icobicobi - International Conference on Bioinformatics and Computational Biology, 2004, Angra dos Reis- RJ - Brazil. Proceedings of the 2nd ICOBICOBI, 2004, 2004.

Artigos aceitos para publicação
1.
MULLER, M. ; SOARES, R. O. S. ; SANTOS-JUNIOR, N. N. ; Cintra, A. C. ; FIGUEIREDO, L. T. ; CALIRI, A. ; VILELA, S. ; AQUINO, V. H. . (**SUBMETIDO**) Phospholipase A2 isolated from the venom of Crotalus durissus terrificus inactivates Dengue virus and other enveloped viruses by disrupting the viral envelope. Plos One, 2014.

Apresentações de Trabalho
1.
SOARES, R. O. S. . Exploring large systems: defining the effect of Dengue virus envelope proteins on membrane curvature.. 2014. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

2.
SOARES, R. O. S. . Modelando sistemas biológicos através de simulações computacionais: o vírus do Dengue. 2012. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

3.
SOARES, R. O. S. ; CALIRI, A. . Avaliação da estabilidade do Domínio III da proteína E do vírus do Dengue por dinâmica molecular. 2011. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

4.
SOARES, R. O. S. ; CALIRI, A. . Evaluating the effects of intensive thermodynamics variations on the affinity between monoclonal antibodies and Dengue virus glycoprotein E domain III. 2011. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

5.
SOARES, R. O. S. ; CALIRI, A. . Characterization of the standalone stability of domain III of dengue virus E protein. 2011. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

6.
SOARES, R. O. S. ; CALIRI, A. . IN SILICO IDENTIFICATION OF TWO HIGH FLEXIBLE REGIONS IN THE DENGUE PROTEIN E DOMAIN III: POSSIBLE IMPLICATIONS FOR COUNTER INFECTION STRATEGIES. 2011. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

7.
SOARES, R. O. S. ; CALIRI, A. . NATIVE STATE IN BOILING WATER: PLAYING WITH STABILIZING BONDS OF GLOBULAR PROTEINS. 2009. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

8.
SOARES, R. O. S. ; CALIRI, A. . Avaliação do papel de pontes dissulfeto na estabilização estrutural protéica através de simulações de desnaturação térmica por dinâmica molecular. 2009. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

9.
SOARES, R. O. S. ; CALIRI, A. . Assessment of disulfide bonds' role on protein structural stabilization by molecular dynamics thermal unfolding simulations.. 2008. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

10.
SOARES, R. O. S. ; CALIRI, A. . A CRITICAL VIEW OF THE ONLINE MAIN PROTEIN PREDICTORS. 2007. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

11.
SOARES, R. O. S. ; HANISCH, F. . Araukaria Baum modellierung mit XFrog. 2005. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

12.
SOARES, R. O. S. ; MARTINEZ, Alexandre Souto . The prisoner's dilemma: spatiotemporal model of intra and inter-populational cooperation among agents. 2004. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

13.
SOARES, R. O. S. ; MARTINEZ, Alexandre Souto . The prisoner's dilemma: spatiotemporal model of intra and inter-populational cooperation among agents. 2004. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

14.
SOARES, R. O. S. ; MARTINEZ, Alexandre Souto . A evolução e emergência da cooperação entre agentes: a teoria dos jogos em sistemas naturais. 2003. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

15.
SOARES, R. O. S. ; MARTINEZ, Alexandre Souto . A evolução e emergência da cooperação entre agentes: a teoria dos jogos em sistemas naturais. 2003. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

Outras produções bibliográficas
1.
SOARES, R. O. S. ; MARTINEZ, Alexandre Souto . Estudo e modelagem da cooperação em sistemas naturais através da teoria dos jogos 2004 (Monografia de Conclusão de Curso - Ciências Biológicas FFCLRP-USP).


Produção técnica
Assessoria e consultoria
1.
SOARES, R. O. S. . Avaliador de resumos para o VI SINPOSPq. 2014.

2.
SOARES, R. O. S. . Avaliador de pôsteres do SIICUSP. 2012.

3.
SOARES, R. O. S. . Avaliador de pôsteres do SIICUSP. 2011.

4.
SOARES, R. O. S. . Avaliador de pôsteres do SIICUSP. 2010.

Programas de computador sem registro
1.
SOARES, R. O. S. ; SOARES, R. O. S. . readHBmap.py. 2014.

2.
SOARES, R. O. S. ; SOARES, R. O. S. . Electrostatic Maps to MPG. 2013.

3.
SOARES, R. O. S. ; MARTINEZ, Alexandre Souto . Prisone's Dilemma Lattice. 2003.

Trabalhos técnicos

Demais tipos de produção técnica
1.
SOARES, R. O. S. . Tópico de Dinâmica Molecular (Teoria) - Disciplina de Física Computacional na pós-graduação da FCFRP-USP. 2014. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

2.
SOARES, R. O. S. . Tópico de Dinâmica Molecular (Prática) - Disciplina de Física Computacional na pós-graduação da FCFRP-USP. 2014. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

3.
SOARES, R. O. S. . Introdução ao GROMACS e dinâmica molecular em Português (BR). 2014. (Desenvolvimento de material didático ou instrucional - Tutorial).

4.
SOARES, R. O. S. . Tópico de Dinâmica Molecular (Teoria) - Disciplina de Física Computacional na pós-graduação da FCFRP-USP. 2013. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

5.
SOARES, R. O. S. . Tópico de Dinâmica Molecular (Prática) - Disciplina de Física Computacional na pós-graduação da FCFRP-USP. 2013. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

6.
SOARES, R. O. S. . Tópico de Dinâmica Molecular (Teoria) - Disciplina de Física Computacional na pós-graduação da FCFRP-USP. 2012. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

7.
SOARES, R. O. S. . Tópico de Dinâmica Molecular (Prática) - Disciplina de Física Computacional na pós-graduação da FCFRP-USP. 2012. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

8.
SOARES, R. O. S. . Relatório de Doutorado - III. 2012. (Relatório de pesquisa).

9.
SOARES, R. O. S. . Tópico de Dinâmica Molecular (Teoria) - Disciplina de Física Computacional na pós-graduação da FCFRP-USP. 2011. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

10.
SOARES, R. O. S. . Tópico de Dinâmica Molecular (Prática) - Disciplina de Física Computacional na pós-graduação da FCFRP-USP. 2011. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

11.
SOARES, R. O. S. . GROMACS - Dinâmica Molecular para iniciantes (Tutorial Prático) - Versão 1.2. 2011. (Desenvolvimento de material didático ou instrucional - Tutorial de Método).

12.
SOARES, R. O. S. . Relatório de Doutorado - II. 2011. (Relatório de pesquisa).

13.
SOARES, R. O. S. . Relatório de Doutorado - I. 2010. (Relatório de pesquisa).

14.
SOARES, R. O. S. . Relatório de Mestrado - II. 2009. (Relatório de pesquisa).

15.
SOARES, R. O. S. . GROMACS - Dinâmica Molecular para iniciantes (Tutorial Prático). 2008. (Desenvolvimento de material didático ou instrucional - Tutorial de Método).

16.
SOARES, R. O. S. . Relatório de Mestrado - I. 2008. (Relatório de pesquisa).

17.
SOARES, R. O. S. . Relatório de atividades de intercâmbio do programa UNIBRAL-CAPES/DAAD (Tübingen 2005-2006). 2006. (Relatório de pesquisa).

18.
SOARES, R. O. S. ; HANISCH, F. . Araukaria Baum modellierung mit XFrog. 2005. (Ambiente virtual de floresta de araucárias do sul do Brasil).

19.
SOARES, R. O. S. ; MARTINEZ, Alexandre Souto . Estudo e modelagem da cooperação em sistemas naturais através da teoria dos jogos. 2004. (Relatório de pesquisa).

20.
SOARES, R. O. S. ; MARTINEZ, Alexandre Souto . A evolução e emergência da cooperação entre agentes: a teoria dos jogos em sistemas naturais II. 2003. (Relatório de pesquisa).

21.
SOARES, R. O. S. ; MARTINEZ, Alexandre Souto . O dilema do prisioneiro: modelo spaço-temporal de cooperação intra e inter-populacional entre agentes. 2003. (Relatório de pesquisa).

22.
SOARES, R. O. S. ; MARTINEZ, Alexandre Souto . A evolução e emergência da cooperação entre agentes: a teoria dos jogos em sistemas naturais I. 2002. (Relatório de pesquisa).



Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
II Workshop da Pós Graduação da FCFRP-USP.Modelando sistemas biológicos através de simulações computacionais: o vírus do Dengue.. 2012. (Oficina).

2.
36th FEBS Congress. Evaluating the effects of intensive thermodynamic variations on the affinity between monoclonal antibodies and Dengue virus glycoprotein E domain III. 2011. (Congresso).

3.
Ninth triennial congress of the World Association of Theoretical and Computational Chemists. Characterization of the stand-alone stability of domain III of dengue virus "E" protein. 2011. (Congresso).

4.
Encontro Nacional de Virologia. IN SILICO IDENTIFICATION OF TWO HIGH FLEXIBLE REGIONS IN THE DENGUE PROTEIN E DOMAIN III: POSSIBLE IMPLICATIONS FOR COUNTER INFECTION STRATEGIES. 2011. (Congresso).

5.
VI Encontro de Virologia do Mercosul. IN SILICO IDENTIFICATION OF TWO HIGH FLEXIBLE REGIONS IN THE DENGUE PROTEIN E DOMAIN III: POSSIBLE IMPLICATIONS FOR COUNTER INFECTION STRATEGIES. 2011. (Congresso).

6.
I Workshop da Pós Graduação da FCFRP-USP.(Apresentação do andamento dos experimentos do doutorado). 2011. (Oficina).

7.
VII CIFARP - International Congress of Pharmaceutical Sciences. NATIVE STATE IN BOILING WATER: PLAYING WITH STABILIZING BONDS OF GLOBULAR PROTEINS. 2009. (Congresso).

8.
XV SBQT - Simpósio Brasileiro de Química Teórica.Avaliação do papel de pontes dissulfeto na estabilização estrutural protéica através de simulações de desnaturação térmica por dinâmica molecular. 2009. (Simpósio).

9.
Workshop on Recent Trends in Computer Simulations of Biomolecular Systems. 2009. (Oficina).

10.
School of Advanced Topics on Molecular Modeling - David van der Spoel & Gerrit Groenhoff. 2008. (Oficina).

11.
XXXI Encontro Nacional da Física da Matéria Condensada.Assessment of disulfide bonds' role on protein structural stabilization by molecular dynamics thermic unfolding simulations.. 2008. (Encontro).

12.
IV Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos. 2008. (Outra).

13.
II Conference on Computational and Mathematical Population Dynamics- CMPD2. 2007. (Congresso).

14.
VI CIFARP - International Congress of Pharmaceutical Sciences. A CRITICAL VIEW OF THE ONLINE MAIN PROTEIN PREDICTORS. 2007. (Congresso).

15.
II ICoBiCoBi - International Conference on Bioinformatics and Computational Biology. The Prisoner's Dilemma: a space/time model for intra and inter group agent cooperation. 2004. (Congresso).

16.
12 SIICUSP.The Prisoner's Dilemma: a space/time model for intra and inter group agent cooperation. 2004. (Simpósio).

17.
11 SIICUSP.A evolução e emergência da cooperação entre agentes: a teoria dos jogos em sistemas naturais. 2003. (Simpósio).


Organização de eventos, congressos, exposições e feiras
1.
SOARES, R. O. S. . 3º Simpósio Internacional de Pós Graduação e Pesquisa - 3rd SINPOSPq. 2008. (Outro).



Inovação



Programa de computador sem registro
1.
SOARES, R. O. S. ; SOARES, R. O. S. . readHBmap.py. 2014.



Educação e Popularização de C & T



Apresentações de Trabalho
1.
SOARES, R. O. S. . Exploring large systems: defining the effect of Dengue virus envelope proteins on membrane curvature.. 2014. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).


Programa de Computador sem registro de patente
1.
SOARES, R. O. S. ; SOARES, R. O. S. . Electrostatic Maps to MPG. 2013.


Cursos de curta duração ministrados
1.
SOARES, R. O. S. . Tópico de Dinâmica Molecular (Teoria) - Disciplina de Física Computacional na pós-graduação da FCFRP-USP. 2012. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

2.
SOARES, R. O. S. . Tópico de Dinâmica Molecular (Prática) - Disciplina de Física Computacional na pós-graduação da FCFRP-USP. 2012. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

3.
SOARES, R. O. S. . Tópico de Dinâmica Molecular (Teoria) - Disciplina de Física Computacional na pós-graduação da FCFRP-USP. 2013. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

4.
SOARES, R. O. S. . Tópico de Dinâmica Molecular (Prática) - Disciplina de Física Computacional na pós-graduação da FCFRP-USP. 2013. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

5.
SOARES, R. O. S. . Tópico de Dinâmica Molecular (Teoria) - Disciplina de Física Computacional na pós-graduação da FCFRP-USP. 2014. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

6.
SOARES, R. O. S. . Tópico de Dinâmica Molecular (Prática) - Disciplina de Física Computacional na pós-graduação da FCFRP-USP. 2014. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

7.
SOARES, R. O. S. . Tópico de Dinâmica Molecular (Teoria) - Disciplina de Física Computacional na pós-graduação da FCFRP-USP. 2011. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

8.
SOARES, R. O. S. . Tópico de Dinâmica Molecular (Prática) - Disciplina de Física Computacional na pós-graduação da FCFRP-USP. 2011. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).


Desenvolvimento de material didático ou instrucional
1.
SOARES, R. O. S. . Introdução ao GROMACS e dinâmica molecular em Português (BR). 2014. (Desenvolvimento de material didático ou instrucional - Tutorial).



Outras informações relevantes


Bolsas:
- PIBIC/CNPq/USP no período de agosto/2002 a julho/2003.
- FAPESP no período de agosto/2003 a julho/2004.
- DAAD/CAPES (UNIBRAL), estudando 12 meses na Universidade de Tübingen (Alemanha), onde cursei de disciplinas na faculdade de Biologia (Fachbereich Biologie) bem como de um projeto de modelagem gráfica (floresta de coníferas) no departamento de Bioinformática (Mathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultät, Zentrum für Bioinformatik Tübingen).
- Capes,  Mestrado (2007-2009)
- FAPESP, Doutorado (2009-2013)
- Capes, Pós-Doutorado (2013-2014)

Conhecimento em Computação: 
 - Linguagens  de programação: Python; FORTRAN; BASH; C++, HTML/CSS
 - Softwares em geral: LaTeX; xmgrace; vi; gedit; kate; ssh & scp; blast; clustalW; MUSCLE; APBS; pdb2pqr; propKA; autodock; modeller; Microcal Origin; Microsoft Excel; Microsoft Word; Microsoft Powerpoint; Photoshop;
 - Sistemas Operacionais: Linux (gnome e KDE), Windows, Android
 - Dinâmica Molecular: GROMACS, VMD, PyMol, Bio3D (baseado em R), readHBmap.py e apbs_movie(script próprios)
 - Experiência na utilização de clusters: Bluegene/P (RICE University); DAVinCI (RICE); Discovery (Northeastern University); SGI Altix 1300; Computação em Núvem USP;



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