Adriano Velasque Werhli

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  • Última atualização do currículo em 10/09/2018


Possui graduação em Licenciatura em Física pela Universidade do Vale do Rio dos Sinos (1998), mestrado em Computação Aplicada pela Universidade do Vale do Rio dos Sinos (2003) e doutorado em Informática - University of Edinburgh (2007) -, atuando principalmente nos seguintes temas: Machine Learning, Bayesian Networks, Genetic Regulatory Networks, MCMC, Postgenomic data integration e Algoritmos Genéticos. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Adriano Velasque Werhli
Nome em citações bibliográficas
WERHLI, A. V.;WERHLI, ADRIANO V.;WERHLI, ADRIANO V;Werhli, Adriano V.;Werhli, Adriano Velasque;WERHLI, ADRIANO;WERHLI, ADRIANO WERHLI;WERHLI, A.V.;WEHRLI, ADRIANO

Endereço


Endereço Profissional
Universidade Federal do Rio Grande, Centro de Ciências Computacionais - C3.
Av Italia, km 8
Campus Carreiros
96201-900 - Rio Grande, RS - Brasil


Formação acadêmica/titulação


2004 - 2007
Doutorado em Informática.
University of Edinburgh, EDINBURGH, Escócia.
Título: Reconstruction of gene regulatory networks from postgenomic data, Ano de obtenção: 2007.
Orientador: Dirk Husmeier.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
Palavras-chave: Machine Learning; MCMC; Bayesian Networks; Data integration; Genetic Networks; Graphical Gaussian Models.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Probabilidade e Estatística / Subárea: Estatística.
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Matemática da Computação / Especialidade: Modelos Analíticos e de Simulação.
2001 - 2003
Mestrado em Computação Aplicada.
Universidade do Vale do Rio dos Sinos, UNISINOS, Brasil.
Título: Analise do Desempenho de um Algoritmo Genético na Determinação da Estrutura Tridimensional de Polialaninas,Ano de Obtenção: 2003.
Orientador: Ney Lemke.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
Palavras-chave: Algoritmos Genéticos; Dobramento de Proteínas; Inteligência Artificial.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
1994 - 1998
Graduação em Licenciatura em Física.
Universidade do Vale do Rio dos Sinos, UNISINOS, Brasil.
1991 - 1991
Curso técnico/profissionalizante em Técnico em Instrumentação.
Cetemp, SENAI, Brasil.




Atuação Profissional



Universidade Federal do Rio Grande, FURG, Brasil.
Vínculo institucional

2008 - Atual
Vínculo: , Enquadramento Funcional: Professor Adjunto III, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

09/2012 - Atual
Direção e administração, Centro de Ciências Computacionais - C3, .

Cargo ou função
Coordenador de curso Lato Sensu: Especialização em Engenharia de Automação e Instrumentação PROMINP.
09/2012 - Atual
Ensino, Tecnologia da Informação e Comunicação na Educação, Nível: Especialização

Disciplinas ministradas
Alfabetização Digital
06/2012 - Atual
Ensino, Toxicologia Ambiental, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Bioinformática aplicada a toxicologia
06/2012 - Atual
Ensino, Engenharia de Automação, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Instrumentação para a Engenharia de Automação
06/2012 - Atual
Ensino, Modelagem Computacional, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Introdução à Bioinformática
06/2012 - Atual
Ensino, Engenharia de Computação, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Introdução e Algoritmos para Biologia Computacional
06/2012 - Atual
Ensino, Engenharia de Automação e Instrumentação, Nível: Especialização

Disciplinas ministradas
Instrumentação
03/2012 - Atual
Ensino, Engenharia de Automação, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Matemática Discreta
03/2012 - Atual
Ensino, Engenharia de Computação, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Sistemas Inteligentes
03/2012 - Atual
Ensino, Sistemas de Informação, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Introdução à Ciência da Computação
01/2010 - Atual
Direção e administração, Centro de Ciências Computacionais - C3, .

Cargo ou função
Coordenador de Curso: Engenharia de Automação.
07/2008 - Atual
Pesquisa e desenvolvimento , Centro de Ciências Computacionais - C3, .

Linhas de pesquisa
Biologia de Sistemas
07/2008 - Atual
Pesquisa e desenvolvimento , Centro de Ciências Computacionais - C3, .

Linhas de pesquisa
Bioinformática
06/2011 - 12/2012
Ensino, Engenharia de Automação, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Instrumentação para a Engenharia de Automação
03/2011 - 12/2011
Ensino, Engenharia de Automação, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Matemática Discreta
03/2011 - 12/2011
Ensino, Sistemas de Informação, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Introdução a Ciência da Computação
03/2011 - 12/2011
Ensino, Engenharia de Computação, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Sistemas Inteligentes
03/2010 - 12/2011
Ensino, Engenharia de Automação, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Matemática Discreta
03/2010 - 12/2011
Ensino, Tecnologia da Informação e Comunicação na Educação, Nível: Especialização

Disciplinas ministradas
Alfabetização Digital
03/2011 - 07/2011
Ensino, Modelagem Computacional, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Elementos de Inteligência Artificial
08/2010 - 12/2010
Ensino, Tecnólogo em Toxicologia Ambiental, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Bioinformática aplicada a toxicologia
03/2010 - 12/2010
Ensino, Sistemas de Informação, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Introdução a Ciência da Computação
03/2010 - 12/2010
Ensino, Engenharia de Computação, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Tópicos em Sistemas Inteligentes
Sistemas Inteligentes
03/2010 - 07/2010
Ensino, Modelagem Computacional, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Elementos de Inteligência Artificial
03/2009 - 03/2010
Ensino, Engenharia de Computação, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Atividades de Integração II
Sistemas inteligentes
07/2009 - 12/2009
Ensino, Modelagem Computacional, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Aprendizado de Máquina aplicado a Bioinformática
03/2009 - 12/2009
Ensino, Engenharia de Automação, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Introdução a Engenharia de Automaçãp
Matemática Discreta
03/2009 - 12/2009
Ensino, Sistemas de Informação, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Introdução a Ciência da Computação
08/2008 - 12/2008
Ensino, Engenharia de Computação, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Inteligência Artificial
Estrutura de Dados

Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, PUCRS, Brasil.
Vínculo institucional

2007 - 2008
Vínculo: Funcionário, Enquadramento Funcional: Desenvolvedor Jr I, Carga horária: 44


COPESUL COMPANHIA PETROQUIMICA DO SUL, CPS, Brasil.
Vínculo institucional

1997 - 2004
Vínculo: Técnico, Enquadramento Funcional: Técnico de manutenção, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.



Linhas de pesquisa


1.
Biologia de Sistemas

Objetivo: Desenvolver e aplicar métodos teóricos, modelagem matemática e técnicas de simulação computacional para o estudo de sistemas biológicos, sociais e comportamentais..
2.
Bioinformática

Objetivo: Pesquisar, desenvolver ou aplicar ferramentas computacionais e metodologias para incrementar o uso de dados biológicos, médicos, de comportamento ou de saúde, incluindo os procedimentos para adquirir, armazenar, organizar, arquivar, analisar e visualizar todos estes tipos de dados..


Projetos de pesquisa


2015 - Atual
PEIXES TRANSGÊNICOS FLUORESCENTES: UM NOVO CAMPO PARA A PISCICULTURA ORNAMENTAL NO BRASIL - Edital Universal 2014
Descrição: A piscicultura ornamental é uma área promissora da aquacultura no Brasil, considerando a alta demanda do mercado internacional e a capacidade brasileira de produção e exportação de organismos aquáticos ornamentais. Desta forma, a presente proposta objetiva utilizar tecnologias inovadoras, já estabelecidas pelo grupo de pesquisa proponente, para produção de peixes ornamentais fluorescentes. Esses organismos podem apresentar atrativos diferenciados, os quais poderão amenizar os problemas atualmente enfrentados por este mercado, como extrativismo, introdução de espécies exóticas e baixa novidade de mercado. Na presente proposta, serão produzidas novas variantes de proteínas fluorescentes através de mutagênese, a fim de gerar proteínas que apresentem características importantes para a produção de linhagens de peixes ornamentais fluorescentes como: estabilidade, espectro de emissão de luz mais próximo ao visível e diferentes cores. Para isto serão colaboradores o grupo de pesquisa coordenado pelo Prof. Dr. Luis Fernando Marins (ICB/FURG), o qual foi pioneiro na produção de linhagens transgênicas do peixe Danio rerio no Brasil. Essas linhagens foram produzidas com o objetivo principal de conhecer os mecanismos relacionados ao processo de crescimento em peixes. Paralelamente, essas linhagens carregam proteínas fluorescentes marcadoras de transgenia, as quais emitem fluorescência somente sob radiação ultravioleta. As análises de bioinformática serão desenvolvidas em colaboração com os grupos de pesquisas coordenados pelos professores Dr. Adriano Velasque Werhli e Dra. Karina dos Santos Machado, ambos do Centro de Ciências Computacionais (C3/FURG). Essas análises permitirão identificar as estruturas moleculares capazes de tornar as proteínas fluorescentes mais adequadas a produção de peixes ornamentais fluorescentes..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2014 - Atual
Bioinformática Estrutural de Proteínas: modelos, algoritmos e aplicações biotecnológicas
Descrição: Este projeto propõe-se enfrentar dois desafios biotecnológicos de grande relevância nacional. O primeiro envolve a ricina, uma potente fitotoxina encontrada na mamoneira. Co-produtos da produção do óleo de mamona podem conter quantidades letais de ricina. Além do risco de intoxicação animal e humana do bagaço, isso tem dificultado sua reutilização e reciclagem, em especial no semiárido nordestino. A ricina preocupa também pelo seu potencial uso como arma química. Portanto, há forte apelo para se encontrar meios efetivos de neutralizar, inibir e/ou detectar a ricina. O segundo envolve a modelagem de celulases multifuncionais, capazes de degradar eficientemente a lignocelulose, composto base para a produção de biocombustíveis de segunda geração, os quais têm por princípio a utilização de subprodutos de plantas que não podem ser usados na alimentação humana. Ambos desafios exigem uma abordagem multidisciplinar sinérgica entre a modelarem teórica in silico e experimental in vitro. Objetivos: 1) Prever in silico e validar in vitro ligantes de ricina 2) Simular in silico e caracterizar in vitro efeitos causados por intervenções estratégicas em beta-glicosidases modificadas. 3) Projetar, implementar e validar modelos, algoritmos e ferramentas de Quimioinformática e Bioinformática Estrutural de Proteínas que permitam dar suporte aos objetivos biotecnológicos previamente descritos. Espera-se que este projeto possa revelar novas plataformas químicas para o desenvolvimento de inibidores, kits de detecção, biossensores, neutralizadores (substratos suicidas) e outros produtos de inovação biotecnológica baseados na ricina, com potencial para alavancar o agronegócio da mamona e a indústria nacional de fármacos. Espera-se também a modelagem de celulases multifuncionais, capazes especialmente de orientar a manipulação genética de algas produtoras de $\beta$-glicosidases, com características catalíticas eficientes e de tolerância à inibição por glicose e celobiose, permitindo seu uso industrial na produção de etanol de segunda geração. Espera-se, em fim, que esses desafios possam inspirar novas metodologias matemáticas, computacionais, químicas e bioquímicas integradas, de modo a gerar artefatos biotecnológicos inovadores, bem como contribuir para a formação de profissionais com perfil multidisciplinar altamente qualificados...
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (6) / Doutorado: (6) .
Integrantes: Adriano Velasque Werhli - Coordenador / Leonardo Ramos Emmendorfer - Integrante / Karina dos Santos Machado - Integrante / Raquel Cardoso de Melo Minard - Integrante / Carlos Henrique da Silveira - Integrante / Wagner Meira Jr - Integrante / Marcelo Matos Santoro - Integrante / Douglas Eduardo Valente Pires - Integrante / François Artiguenave - Integrante / Marcos Augusto dos Santos - Integrante / Karine Bastard - Integrante / Marcel Salanoubat - Integrante / Gisele Lobo Pappa - Integrante / aldete Maria Gonçalves-Almeida - Integrante / Sabrina Azevedo Silveira - Integrante / DAVID VALLENET - Integrante / Thiago Ferreira Noronha - Integrante / Demetrius Antonio Machado de Araújo - Integrante / Gerd Bruno da Rocha - Integrante / Luis Fernando Fernandes Marins - Integrante / David Ascher - Integrante / Tom Blundell - Integrante / Liv Soares Severino - Integrante / Luis Cesar Rodrigues - Integrante / Paulo Lilles Jorge Drews Jr - Integrante / Bráulio Roberto Gonçalves Marinho Couto - Integrante.
2013 - Atual
Simulação e Inferência de Modelos Mecanicistas de vias biológicas
Descrição: Um grande desafio em Biologia Computacional é a modelagem das redes regulatórias através de modelos mecanicistas, ou seja por sistemas de equações diferenciais acopladas. Neste caso o número de parâmetros e a necessidade de conhecimento da estrutura da redes tornam o seu uso proibitivo para a maioria dos casos. Porém, com o avanço de métodos de medição de variáveis biológica e poder computacional alguns modelos mecanicistas de pequenas redes regulatórias são desenvolvidas atualmente com grande sucesso. Nesta proposta estamos especificamente interessados na investigação de métodos estatístico e computacionais para a inferência da estrutura e parâmetros de redes regulatórias modeladas por sistemas de equações diferenciais ordinárias (ODEs)..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) .
Integrantes: Adriano Velasque Werhli - Coordenador / Dirk Husmeier - Integrante / Karina dos Santos Machado - Integrante.Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
2011 - 2013
Inferência de vias biológicas a partir de dados pós-genômicos
Descrição: Ultimamente temos testemunhado um rápido desenvolvimento de diferentes técnicas para a medição de grandes quantidades de dados biológicos. Também, é cada vez mais claro que não são os componentes biológicos isolados, mas sim sua combinação em intrincadas redes, os responsáveis por funções biológicas complexas como, por exemplo, o desenvolvimento e a manutenção da vida. Nesta projeto de pesquisa estamos especificamente interessados na investigação da performance de diferentes técnicas de reconstrução de redes regulatórias biológicas. Em particular, pretendemos propor novos métodos de inferência de Redes Booleanas e compará-los com alguns métodos já existentes: Redes Bayesianas, Redes de Relevância e Modelos Gráficos Gaussianos.
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) .
Integrantes: Adriano Velasque Werhli - Coordenador / Leonardo Ramos Emmendorfer - Integrante / Karina dos Santos Machado - Integrante.Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Número de produções C, T & A: 3 / Número de orientações: 1
2009 - 2011
SACI - Sistema Avançado de Supervisão, Inspeção e Diagnóstico de Sistemas Elétricos: Geração, Transmissão e Distribuição
Descrição: Desenvolvimento de Arquitetura de Hardware e Software para monitoramento, diagnótico e prognóstico da vida útil para equipamentos do sistema elétrico de potência, mais precisamente condutores dedicados a geração, distribuição baseada em redes de sensores móveis composta por robôs móveis de inspeção aérea e subterrânea. FINEP Edital Rede Ct-energ FURG, UFRN e UFRGS..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) .
Integrantes: Adriano Velasque Werhli - Coordenador / Leonardo Ramos Emmendorfer - Integrante / Silvia Silva da Costa Botelho - Integrante / Vinícius Menezes de Oliveira - Integrante / Nelson Lopes Duarte Filho - Integrante / Denis Teixeira Franco - Integrante / Diana Francisca Adamatti - Integrante / Eder Gonçalves - Integrante / Adelardo Medeiros - Integrante / Carlos Eduardo Pereira - Integrante.Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.
2009 - Atual
Inferência de estrutura de redes biológicas com a combinação de métricas de Redes Bayesianas
Descrição: Nos últimos tempos, temos testemunhado o aparecimento de novas técnicas de medição que permitem investigar os sistemas biológicos com uma riqueza de detalhes nunca obtida antes. Dentre estas técnicas, a possibilidade de medição da expressão de milhares de genes ao mesmo tempo fez surgir, dentre muitas outras, a idéia de que poderíamos inferir a estrutura regulatória destes genes, ou seja, como estes genes regulam uns aos outros. De modos a possibilitar esta inferência, levando em consideração os dados obtidos, várias métricas diferentes para atribuir uma pontuação (score) a estas redes foram criadas. Dentre estas métricas duas muito importantes e vastamente exploradas são destacadas: Bayesian Dirichlet (Heckerman, 1995) (BDe) e Bayesian Gaussian (BGe) (Heckerman, 1994). Em resumo, estas duas métricas são a solução analítica da integração sobre todo o espaço de parâmetros da equação que fornece a métrica, a qual indica o quanto um modelo é adequado frente aos dados observados. Devido a características intrínsecas de cada uma destas métricas, sabe-se antecipadamente que ambas apresentam vantagens e desvantagens na sua utilização. Até os dias de hoje, quando se infere uma rede regulatória genética escolhe-se somente um destes scores para a classificação dos modelos. Neste projeto apresentamos uma proposta de um novo método para a inferência da estrutura de redes regulatórias utilizando os dois scores de uma maneira combinada. O método proposto é baseado em um modelo probabilista hierárquico Bayesiano e possibilita a integração dos dois scores além de conhecimento a priori sobre a estrutura da rede regulatória em estudo..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2008 - 2010
Engenharia reversa de redes biológicas a partir de dados pós genômicos
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) .
Integrantes: Adriano Velasque Werhli - Coordenador.Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Número de produções C, T & A: 2 / Número de orientações: 2


Revisor de periódico


2011 - 2011
Periódico: Bioinformatics (Oxford. Print)
2007 - 2007
Periódico: Bioinformatics (Oxford. Print)
2010 - 2010
Periódico: TEMA. Tendências em Matemática Aplicada e Computacional
2010 - 2011
Periódico: Communications in Statistics. Simulation and Computation
2011 - 2011
Periódico: BMC Bioinformatics
2011 - Atual
Periódico: Mathematical Biosciences
2011 - 2011
Periódico: PLoS Computational Biology
2013 - Atual
Periódico: IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics (Print)
2013 - 2013
Periódico: Bioinformatics (Oxford. Print)
2013 - 2013
Periódico: Bioinformatics (Oxford. Print)
2013 - Atual
Periódico: PLoS Computational Biology
2013 - Atual
Periódico: Statistics and Computing
2013 - Atual
Periódico: The Malaysian Journal of Medical Science
2013 - Atual
Periódico: Statistical applications in genetics and molecular biology


Revisor de projeto de fomento


2013 - Atual
Agência de fomento: Executive Agency for Higher Education, Research, Development and Innovation
2011 - 2012
Agência de fomento: Executive Agency for Higher Education, Research, Development and Innovation


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação.


Idiomas


Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Espanhol
Compreende Razoavelmente, Fala Pouco, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.


Produções



Produção bibliográfica
Artigos completos publicados em periódicos

1.
19DA LUZ, RENAN MARTINEZ2017DA LUZ, RENAN MARTINEZ ; Adamatti, Diana Francisca ; Werhli, Adriano Velasque . Modelo de dobramento de proteína em jogo computacional. REVISTA BRASILEIRA DE COMPUTAÇÃO APLICADA, v. 9, p. 42, 2017.

2.
6MARIANO, D.C.B.2017MARIANO, D.C.B. ; LEITE, C. ; SANTOS, L.H.S. ; MARINS, L.F. ; MACHADO, K.S. ; WERHLI, A.V. ; LIMA, L.H.F. ; DE MELO-MINARDI, R.C. . Characterization of glucose-tolerant β-glucosidases used in biofuel production under the bioinformatics perspective: a systematic review. GENETICS AND MOLECULAR RESEARCH, v. 16, p. 1, 2017.

3.
1GONZÁLEZ-DURRUTHY, MICHAEL2017 GONZÁLEZ-DURRUTHY, MICHAEL ; Werhli, Adriano V. ; SEUS, VINICIUS ; MACHADO, KARINA S. ; PAZOS, ALEJANDRO ; MUNTEANU, CRISTIAN R. ; GONZÁLEZ-DÍAZ, HUMBERTO ; MONSERRAT, JOSÉ M. . Decrypting Strong and Weak Single-Walled Carbon Nanotubes Interactions with Mitochondrial Voltage-Dependent Anion Channels Using Molecular Docking and Perturbation Theory. Scientific Reports, v. 7, p. 1, 2017.

4.
5RAMOS, PATRÍCIA2017RAMOS, PATRÍCIA ; SCHMITZ, MARCOS ; GAMA, SIBELE ; PORTANTIOLO, ALINE ; DURRUTHY, MICHAEL GONZALEZ ; DE SOUZA VOTTO, ANA PAULA ; CORNETET, LUISA RODRIGUES ; DOS SANTOS MACHADO, KARINA ; WEHRLI, ADRIANO ; TONEL, MARIANA ZANCAN ; FAGAN, SOLANGE BINOTTO ; YUNES, JOÃO SARKIS ; MONSERRAT, JOSÉ MARIA . Cytoprotection of lipoic acid against toxicity induced by saxitoxin in hippocampal cell line HT-22 through in silico modeling and in vitro assays. TOXICOLOGY, v. 393, p. 171, 2017.

5.
MORAES, M. F.2017MORAES, M. F. ; BORBA, A. O. ; MATTOS, V. L. D. ; WERHLI, ADRIANO V ; Adamatti, D. F. . Aplicação de Teste de Hipóteses em Dados Provenientes de Simulação Baseada em Agentes: Um Estudo de Caso Para a Curva de Crescimento do Mycobacterium Tuberculosis. REVISTA DE ENGENHARIA E TECNOLOGIA, v. 9, p. 133, 2017.

6.
14CAMARGO, A. D.2016CAMARGO, A. D. ; WERHLI, ADRIANO V. ; MACHADO, K. S. . A comparison of molecular dynamics simulations using GROMACS with GPU and CPU. Revista de Informática Teórica e Aplicada: RITA, v. 23, p. 325-328, 2016.

7.
15SEUS, VINICIUS ROSA2016SEUS, VINICIUS ROSA ; MACHADO, K. S. ; WERHLI, ADRIANO V. . A proposal to the manipulatioon of a set of protein structures from PDB. Revista de Informática Teórica e Aplicada: RITA, v. 23, p. 330, 2016.

8.
16Mendoza, M. R.2016Mendoza, M. R. ; WERHLI, ADRIANO V. ; PINTO, G. H. ; SILVELLO, D. ; COHEN, C. R. ; CLAUSELL, N. O. ; ROHDE, L. E. P. ; BIOLO, A. . Functional analysis of microRNA and transcription factor co-regulatory network in pathological cardiac hypertrophy. Revista de Informática Teórica e Aplicada: RITA, v. 23, p. 356-359, 2016.

9.
17CORNETET, L. R.2016CORNETET, L. R. ; DURRUTHY, M. G. -. ; MONSERRAT, J. M. ; WERHLI, ADRIANO V. ; MACHADO, K. S. . Data Mining Applied to Molecular Docking Experiments. Revista de Informática Teórica e Aplicada: RITA, v. 23, p. 379-381, 2016.

10.
2GONZALEZ-DURRUTHY, MICHEL2016 GONZALEZ-DURRUTHY, MICHEL ; WERHLI, ADRIANO WERHLI ; CORNETET, LUISA ; MACHADO, KARINA S ; GONZALEZ-DIAZ, HUMBERTO ; WASILIESKY JR, WILSON ; RUAS, CAROLINE P. ; GELESKY, MARCOS A. ; MONSERRAT, JOSE M. . Predicting the Binding Properties of Single Walled Carbon Nanotubes (SWCNT) with ADP/ATP Mitochondrial Carrier using Molecular Docking, Chemoinformatics, and Nano-QSBR Perturbation Theory. RSC Advances, v. 1, p. 1, 2016.

11.
20LUZ, R. M.2016LUZ, R. M. ; Adamatti, D. F. ; Werhli, Adriano V. . Jogo Computacional no Dobramento de Proteínas: Descoberta de Conhecimento com o Auxílio da Inteligência Humana. REVISTA ELETRÔNICA ARGENTINA-BRASIL DE TECNOLOGIAS DA INFORMAÇÃO E DA COMUNICAÇÃO, v. 1, p. 1, 2016.

12.
21SILVA, F. N.2016SILVA, F. N. ; Werhli, Adriano V. ; Adamatti, Diana Francisca . Using Bayesian Networks to Structure the OCC Emotions Model. JOURNAL OF INTELLIGENT COMPUTING, v. 7, p. 156, 2016.

13.
3AGOSTINHO, NILZAIR B.2015AGOSTINHO, NILZAIR B. ; MACHADO, KARINA S. ; Werhli, Adriano V. . Inference of regulatory networks with a convergence improved MCMC sampler. BMC BIOINFORMATICS, v. 16, p. 306, 2015.

14.
18BARBAT, M. M.2015BARBAT, M. M. ; DUTRA, N. C. ; ADAMATTI, D. F. ; WERHLI, A. V. . Teaching industrial plant using serious games. Bulletin of the Technical Committee on Learning Technology, v. 17, p. 6-9, 2015.

15.
22BARBAT, MAURO MEDEIROS2015BARBAT, MAURO MEDEIROS ; DUTRA, NILO CESAR ; Adamatti, Diana Francisca ; Werhli, Adriano Velasque . Desenvolvimento de um jogo sério para ensino sobre a elaboração, operação e manutenção de plantas industriais.. SCIENTIA PLENA, v. 11, p. 5, 2015.

16.
12BARBAT, M. M.2014BARBAT, M. M. ; ADAMATTI, D. F. ; WERHLI, A. V. . Desenvolvimento de um jogo sério para modelagem, operação e manutenção de plantas industriais. Revista Junior de Iniciação Científica em Ciências Exatas e Engenharia, v. 7, p. 1-6, 2014.

17.
7SEUS, VINICIUS ROSA2014SEUS, VINICIUS ROSA ; PERAZZO, GIOVANNI XAVIER ; WINCK, ANA T. ; Werhli, Adriano V. ; MACHADO, KARINA S. . An Infrastructure to Mine Molecular Descriptors for Ligand Selection on Virtual Screening. Journal of Biomedicine and Biotechnology (Print), v. 2014, p. 1-9, 2014.

18.
11BARBAT, M. M.2014BARBAT, M. M. ; DUTRA JUNIOR, N. C. S. ; WERHLI, A. V. ; ADAMATTI, D. F. . A Serious Game to teach modeling, operating and maintenance of industrial plants. International Journal of Computer and Information Technology, v. 3, p. 1-12, 2014.

19.
8WERHLI, A. V.2012 WERHLI, A. V.. Comparing the reconstruction of regulatory pathways with distinct Bayesian networks inference methods. BMC Genomics, v. 13, p. S2, 2012.

20.
10WERHLI, ADRIANO V.2008WERHLI, ADRIANO V.; HUSMEIER, DIRK . GENE REGULATORY NETWORK RECONSTRUCTION BY BAYESIAN INTEGRATION OF PRIOR KNOWLEDGE AND/OR DIFFERENT EXPERIMENTAL CONDITIONS. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, v. 06, p. 543, 2008.

21.
9WERHLI, A. V.;WERHLI, ADRIANO V.;WERHLI, ADRIANO V;Werhli, Adriano V.;Werhli, Adriano Velasque;WERHLI, ADRIANO;WERHLI, ADRIANO WERHLI;WERHLI, A.V.;WEHRLI, ADRIANO2007WERHLI, A. V.; Husmeier, D. . Reconstructing Gene Regulatory Networks with Bayesian Networks by Combining Expression Data with Multiple Sources of Prior Knowledge. Statistical applications in genetics and molecular biology, v. 6, p. 15, 2007.

22.
4WERHLI, A. V.;WERHLI, ADRIANO V.;WERHLI, ADRIANO V;Werhli, Adriano V.;Werhli, Adriano Velasque;WERHLI, ADRIANO;WERHLI, ADRIANO WERHLI;WERHLI, A.V.;WEHRLI, ADRIANO2006 WERHLI, A. V.; Grzegorczyk, Marco ; Husmeier, D. . Comparative evaluation of reverse engineering gene regulatory networks with Relevance networks, Graphical Gaussian models and Bayesian networks. Bioinformatics (Oxford), v. 22, p. 2523-2531, 2006.

23.
13WERHLI, A. V.;WERHLI, ADRIANO V.;WERHLI, ADRIANO V;Werhli, Adriano V.;Werhli, Adriano Velasque;WERHLI, ADRIANO;WERHLI, ADRIANO WERHLI;WERHLI, A.V.;WEHRLI, ADRIANO2003WERHLI, A. V.; LEMKE, N. . Análise do Desempenho de um Novo Operador Evolutivo na Determinação da Estrutura Tridimensional de Polialaninas. Scientia (UNISINOS), São Leopoldo - RS, v. 14, n.2, p. 293-308, 2003.

Livros publicados/organizados ou edições
1.
Adamatti, D. F. (Org.) ; LUGO, G.G (Org.) ; Emmendorfer, L. R. (Org.) ; WERHLI, A. V. (Org.) . Anais do IV Workshop- Escola de Sistemas de Agentes, seus Ambientes e apliCações. Rio Grande: FURG, 2010. 174p .

2.
WERHLI, A. V.; Emmendorfer, L. R. (Org.) ; COSTA, A. C. R. (Org.) ; Retamoso, M. (Org.) . IV MCSUL Southern Conference on Computational Modeling / IX ERMAC Encontro regional de Matemática Aplicada e Computacional. , 2010.

Capítulos de livros publicados
1.
Fonseca de Moraes, Marcilene ; Adamatti, Diana Francisca ; Oliveira de Borba, Albano ; Werhli, Adriano Velasque ; von Groll, Andrea . Using Probability Distributions in Parameters of Variables at Agent-Based Simulations. Advances in Computational Intelligence and Robotics. 1ed.: IGI Global, 2017, v. , p. 333-355.

2.
Werlang, Pablo ; Fagundes, Michel Q. ; Adamatti, Diana F. ; MACHADO, KARINA S. ; von Groll, Andrea ; da Silva, Pedro E. A. ; Werhli, Adriano V. . Multi-Agent-Based Simulation of Mycobacterium Tuberculosis Growth. Lecture Notes in Computer Science. 1ed.: Springer Berlin Heidelberg, 2014, v. , p. 131-142.

3.
Werlang, Pablo ; Fagundes, Michel Q. ; Adamatti, Diana Francisca ; Machado, Karina Santos ; von Groll, Andrea ; da Silva, Pedro E. A. ; Werhli, Adriano Velasque . Estimation of Parameters of Mycobacterium tuberculosis Growth: A Multi-Agent-Based Simulation Approach. Lecture Notes in Computer Science. 1ed.: Springer International Publishing, 2014, v. , p. 599-610.

4.
Salvá, Thyago ; Emmendorfer, Leonardo R. ; Werhli, Adriano V. . Inference of Genetic Regulatory Networks Using an Estimation of Distribution Algorithm. Lecture Notes in Computer Science. 1ed.: Springer International Publishing, 2013, v. 8213, p. 148-159.

5.
Husmeier, D. ; WERHLI, A. V. ; Grzegorczyk, Marco . Advanced Applications of Bayesian Networks in Systems Biology. In: MPH Stumpf; DJ Balding; M. Girolami. (Org.). Handbook of Statistical Systems Biology. Chichester: John Wiley & Sons, Ltd, 2011, v. , p. 270-289.

6.
Grzegorczyk, Marco ; Husmeier, D. ; WERHLI, A. V. . Reverse Engineering Gene Regulatory Networks with Various Machine. In: Frank Emmert-Streib; Matthias Dehmer. (Org.). Analysis of Microarray Data - A Network-Based Approach. 1ed.Weinheim: Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, 2008, v. 1, p. 101-142.

7.
WERHLI, A. V.; Grzegorczyk, Marco ; Chiang M.T. ; Husmeier, D. . Improved Gibbs sampling for detecting mosaic structures in DNA sequence alignments. In: Wolfgang Urfer; M. Antónia Amaral Turkman. (Org.). Statistics in Genomics and Proteomics. Coimbra: Centro Internacional de Matemática, 2006, v. , p. 23-34.

Trabalhos completos publicados em anais de congressos
1.
BARRETO, NILZAIR M. ; MACHADO, KARINA S. ; Werhli, Adriano V. . Inference of regulatory networks with MCMC sampler guided by mutual information. In: the Symposium, 2017, Marrakech. Proceedings of the Symposium on Applied Computing - SAC '17. New York: ACM Press, 2017. p. 18.

2.
SANTOS, E. S. F. ; XAVIER, W. B. ; Botelho, S. S. C. ; WERHLI, ADRIANO V. . Vision Based Measurement Applied to Industrial Instrumentation. In: The 20th World Congress of the International Federation of Automatic Control, 2017, Tolouse. The 20th World Congress of the International Federation of Automatic Control, 2017. p. 1-6.

3.
SILVA, R. ; MAURELL, I. ; WERHLI, ADRIANO V ; Botelho, S. S. C. ; STEFFENS, C. . ANÁLISE INTELIGENTE DE MODOS DE TRANSFERÊNCIA METÁLICA EM SOLDAGEM GMAW A PARTIR DE VISÃO COMPUTACIONAL. In: Simpósio Brasileiro de Automação Inteligente SBAI, 2017, 2017. Simpósio Brasileiro de Automação Inteligente SBAI, 2017.

4.
FONSECA, T. ; RODRIGUES, R. N. ; SANTOS, E. S. F. ; WERHLI, ADRIANO V ; Botelho, S. S. C. ; GONCALVES, E. ; ESPINDOLA, D. B. ; MACIEL, B. K. ; FREITAS, A. L. ; GARCIA, N. ; MARQUES JR, M. R. ; GARCIA, A. T. ; BALOTA, G. M. ; FONSECA, R. T. ; SOARES, L. B. . Visão de Máquina a instrumentação de processos na indústria 4.0. In: Simpósio Brasileiro de Automação Inteligente - SBAI, 2017, Porto Alegre. Simpósio Brasileiro de Automação Inteligente - SBAI, 2017. v. 1. p. 1.

5.
SEUS, VINICIUS ROSA ; SILVA, LANDE ; GOMES, JORGE ; da Silva, Pedro E. A. ; Werhli, Adriano V. ; MACHADO, KARINA S. . A framework for virtual screening. In: the 31st Annual ACM Symposium, 2016, Pisa. Proceedings of the 31st Annual ACM Symposium on Applied Computing - SAC '16. New York: ACM Press, 2016. p. 31.

6.
FONSECA, T. ; RODRIGUES, R. N. ; Werhli, Adriano V. ; GARCIA, N. ; AMARAL, R. ; MARQUES JR, M. R. ; SALOMAO, J. P. H. ; Botelho, S. S. C. . Sistema de Visão de Máquina para Instrumentação de Processos Industriais. In: Congresso Brasileiro de Automática, 2016, Vitória. XXI Congresso Brasileiro de Automática - CBA2016, 2016. v. 1. p. 2831-2836.

7.
SANTOS, E. S. F. ; RODRIGUES, R. N. ; Botelho, S. S. C. ; XAVIER, W. B. ; WERHLI, A. V. . Proposta e avaliação de um método de medição de indicadores de ponteiro baseado em visão computacional. In: Simpósio Brasileiro de Automação Inteligente, 2015, Natal/RN. Simpósio Brasileiro de Automação Inteligente, 2015.

8.
WERHLI, ADRIANO; CAMARGO, ALEX ; MACHADO, KARINA . Evaluation of computational tools for thermodynamics and structural analysis of protein stability upon point mutation prediction. In: MOL2NET, International Conference on Multidisciplinary Sciences, 2015, Sciforum.net. Proceedings of MOL2NET, International Conference on Multidisciplinary Sciences. p. F001.

9.
SEUS, VINICIUS ; MACHADO, KARINA ; WERHLI, ADRIANO . A Proposal Tool for Manipulation of a Set of Protein Structures from PDB. In: MOL2NET, International Conference on Multidisciplinary Sciences, 2015, Sciforum.net. Proceedings of MOL2NET, International Conference on Multidisciplinary Sciences. p. b013.

10.
Mendoza, M. R. ; WERHLI, A. V. ; BAZZAN, A. L. C. . An epsilon-greedy mutation operator based on prior knowledge for GA convergence and accuracy improvement: an application to networks inference.. In: Simpósio Brasileiro de Redes Neurais, 2012, Curitiba. Proc. of the SBRN 2012, 2012.

11.
WERHLI, A. V.. Bayesian Network Structure Inference with an Hierarchical Bayesian Model. In: Brazilian Symposium on Artificial Intelligence, 2010, São Bernardo do Campo. Lecture Notes in Artificial Intelligence, subseries of Lecture Notes in Computer Science. Berlim: Springer-Verlag, 2010. p. 92-101.

12.
Mendoza, M. R. ; WERHLI, A. V. . Inferring Genetic Regulatory Networks with an Hierarchical Bayesian Model and a Parallel Sampling Algorithm. In: Brazilian Symposium on Neural network, 2010, São Bernardo do Campo. 2010 Eleventh Brazilian Symposium on Neural Networks (SBRN 2010). California: Conference Publishing Services (CPS), 2010. p. 91-96.

13.
Botelho, S. S. C. ; BRAUNSTEI, S. H. ; WERHLI, A. V. . Análise Exploratória de Dados para o Desenvolvimento de Sistemas de Previsão de Alarmes em Plantas Industriais. In: Simposio Brasileiro de Automação Inteligente, 2009, Brasília. Anais do IX Simpósio Brasileiro de Automação Inteligente,, 2009. v. 9.

14.
Marcelo Paravisi ; WERHLI, A. V. ; Julio C. S. Jaques Jr. ; RODRIGUES, R. ; BICHO, A. ; JUNG, C. R. ; MUSSE, S. R. . Continuum Crowds with Local Control. In: Computer Graphics International, 2008, Istanbul. Proceedings of Computer Graphics International, 2008. p. 108-115.

15.
Husmeier, D. ; WERHLI, A. V. . Bayesian Integration of Biological Prior Knowledge into the Reconstruction of Gene Regulatory Networks with Bayesian Networks. In: COMPUTATIONAL SYSTEMS BIOINFORMATICS, 2007, San Diego. Proceedings of the CSB 2007 Conference. Georgia: Peter Markstein and Ying Xu, 2007. v. 6. p. 85-95.

16.
WERHLI, A. V.; LEMKE, N. . Um novo operador evolutivo para determinação de estrutura tridimensional de proteínas.. In: XXIII Congresso da Sociedade Brasileira de Computação, 2003, Campinas. Anais do XXIII Congresso da Sociedade Brasileira de Computação. Porto Alegre: Editora da SBC, 2003. v. 7. p. 287-296.

17.
WERHLI, A. V.; BORBA, A. H. ; HENNEMANN, L. . A Method to Choose the Best Calibration Gas for Catalytic Combustion Gas Sensors. In: Isa Expo 2003, 2003, Houston. Isa Expo 2003, 2003.

18.
WERHLI, A. V.; CECHIN, A. L. ; WAGNER, A. ; HEINEN, F. ; LEMKE, N. ; OSORIO, F. S. . Comparação entre algoritmos genéticos e redes neurais aplicados ao problema da cinemática inversa. In: InfoUYclei2002, 2002, Montevideo. Programas y Resumenes de InfoUYclei2002, 2002. v. 1. p. 1-11.

Resumos expandidos publicados em anais de congressos
1.
WAGNER, A. ; Emmendorfer, L. R. ; WERHLI, A. V. . DESCOBERTA DE CONHECIMENTO EM BANCOS DE DADOS: APLICADO AO CASO DE ALUNOS COM SUBSÍDIO NO NÚCLEO DE ASSITÊNCIA ESTUDANTIL NAE DA UNIVERSIDADE FEDERAL DO RIO GRANDE - FURG. In: XIX Seminário de Iniciação Científica da UNIJUÍ, 2011, Ijuí. Salão do Conhecimento - XIX Seminário de Iniciação Científica, 2011. p. 1-5. CD-ROM.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
CAMARGO, A. D. ; WERHLI, ADRIANO V ; MACHADO, KARINA S. . Predição de estabilidade em pontos de mutação em proteína através de ferramentas computacionais. In: Encontro de Pós-Graduação na 13a. Mostra da Produção Universitária - MPU 2015, 2015, Rio Grande. 13a. Mostra da Produção Universitária - MPU 2015, 2015. p. 1-2.

2.
CAMARGO, A. D. ; Werhli, Adriano Velasque ; MACHADO, K. S. . A comparison of molecular dynamics simulations using GROMACS with GPU and CPU. In: Escola Gaúcha de Bioinformática - EGB 2015, 2015, Porto Alegre. Escola Gaúcha de Bioinformática - EGB 2015, 2015. v. 1. p. 1-4.

3.
BARRETO, N. M. ; WERHLI, A. V. . Inferência de Redes Genéticas Regulatórias Utilizando Redes Booleanas. In: Mostra de Produção Universitária, 2011, Rio Grande. Mostra de Produção Universitária, 2011.

4.
DUARTE, K. P. ; WERHLI, A. V. . Inferência de Estrutura de Redes Biológicas com a Combinação de Métricas de Redes Bayesianas. In: Mostra de Produção Universitária - FURG, 2011, Rio Grande. Mostra de Produção Universitária - FURG, 2011.

5.
LORENZ, W. G. ; WERHLI, A. V. . Data Mining: Aplicado ao Caso de Alunos com Subsídio no Núcleo de Assistência Estudantil - NAE da Universidade Federal do Rio Grande - FURG. In: Mostra de Produção Universitária - FURG, 2011, Rio Grande. Mostra de Produção Universitária - FURG, 2011.

6.
WERHLI, A. V.. Comparison of Bayesian networks and its extensions applied to the inference of regulatory networks. In: 9th European Conference on Computational Biology, 2010, Ghent. 9th European Conference on Computational Biology, 2010.

7.
Mendoza, M. R. ; WERHLI, A. V. . Inferring genetic regulatory networks with an hierarchical Bayesian model and a parallel sampling algorithm. In: 9th European Conference on Computational Biology, 2010, Ghent. 9th European Conference on Computational Biology, 2010.

Apresentações de Trabalho
1.
WERHLI, A. V.; Husmeier, D. . Combining gene expression data and different sources of biological prior knowledge for inferring genetic regulatory networks with Bayesian networks. 2007. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

2.
WERHLI, A. V.. Inferring regulatory networks using multiple data sources. 2007. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

3.
WERHLI, A. V.; Grzegorczyk, Marco ; Husmeier, D. . Comparative Evaluation of the Accuracy of Reverse Engineering Gene Regulatory Networks with various Machine Learning Methods. 2006. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

Outras produções bibliográficas
1.
WERHLI, A. V.; GHAZAL, P. . Discussion on the Paper by Handcock, Raftery and Tantrum: Model-based clustering for social networks. Oxford: Blackwell Synergy, 2007 (Discussão de artigo).


Produção técnica
Programas de computador sem registro
1.
WERHLI, A. V.. MCMC sampler of DAGs with BDe score. 2010.

2.
WERHLI, A. V.. MCMC sampler of DAGs with BGe score. 2010.

Demais trabalhos
1.
WERHLI, A. V.. ENIA2011. 2011 (Comitê de Programa) .

2.
WERHLI, A. V.. Simposio Brasileiro de Inteligencia Artificial (Comitê de Programa). 2010 (Comitê de Programa) .

3.
WERHLI, A. V.. CONFIAM - VI Congresso de Física aplicada a medicina (Comitê de Programa). 2010 (Comitê de Programa) .

4.
WERHLI, A. V.. XXIV CRICTE 2010 (Comitê de Programa). 2010 (Comitê de Programa) .

5.
WERHLI, A. V.. IV MCSUL Southern Conference on Computational Modeling / IX ERMAC Encontro regional de Matemática Aplicada e Computacional (Comitê de programa). 2010 (Comitê de Programa) .

6.
WERHLI, A. V.. IV Workshop- Escola de Sistemas de Agentes, seus Ambientes e apliCações (Comitê de Programa). 2010 (Comitê de Programa) .

7.
WERHLI, A. V.. III MCSUL (Comitê de Programa). 2009 (Comitê de Programa) .



Bancas



Participação em bancas de trabalhos de conclusão
Mestrado
1.
da Silva, Pedro E. A.; WERHLI, A. V.; GROLL, A. V.; AMORIM, H. L. N.. Participação em banca de João Luís Rheingantz Scaini. Modelagem Molecular da Bomba de Efluxo Tap. 2016. Dissertação (Mestrado em Ciências da Saúde) - Universidade Federal do Rio Grande.

2.
LEONARDO, B. Q.; WERHLI, A. V.; ROSA, V. S.; ZATT, B.. Participação em banca de Bruno Quaresma Leonardo. Plataforma de HW/SW baseada em FPGA para mapeamento de chanfros metálicos utilizando o robô portátil Bug-O Matic Weaver. 2016. Dissertação (Mestrado em Engenharia de Computação) - Universidade Federal do Rio Grande.

3.
Adamatti, D. F.; WERHLI, A. V.. Participação em banca de Diego de Abreu Porcellis. Modelando a Variação da Biomassa do Fitoplâncton no Estuário da Lagoa dos Patos através da Simulação Baseada em Multiagentes. 2016. Dissertação (Mestrado em Modelagem Computacional) - Universidade Federal do Rio Grande.

4.
REMBOLD, S. B.; RODRIGUES, R. G.; WERHLI, A. V.. Participação em banca de Vanessa de Oliveira Gil. Análise de Agrupamentos de Parâmetros Morfométricos para Classificação de Galáxias. 2015. Dissertação (Mestrado em Modelagem Computacional) - Universidade Federal do Rio Grande.

5.
MACHADO, KARINA S.; WINCK, ANA T.; WERHLI, A. V.. Participação em banca de Caroline Tomasini. Seleção automática de índices internos de validação de agrupamento. 2015. Dissertação (Mestrado em Engenharia de Computação) - Universidade Federal do Rio Grande.

6.
FROZZA, R.; WERHLI, A. V.; Emmendorfer, L. R.. Participação em banca de Mirian Blank Born. Uma Proposta Híbrida baseada em Agentes e Algoritmos Genéticos para a determinação dos tempos de semáforo visando a redução da Poluição: Estudo de caso do Centro de Rio Grande/RS. 2015. Dissertação (Mestrado em Modelagem Computacional) - Universidade Federal do Rio Grande.

7.
WERHLI, A. V.; FONTOURA, L. M.; PIVETA, E. K.. Participação em banca de Catherine de Lima Barchet. ANÁLISE DE DEPENDÊNCIA DE RISCOS EM GERENCIAMENTO COLABORATIVO DE RISCOS. 2015. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Santa Maria.

8.
DORN, M.; BILLA, C.; WERHLI, A. V.. Participação em banca de Rafael Castro do Couto. Uma proposta de algoritmo para o Modelo AB de dobramento de proteínas. 2014. Dissertação (Mestrado em Engenharia de Computação) - Universidade Federal do Rio Grande.

9.
Emmendorfer, L. R.; WERHLI, A. V.; CHAVES NETO, A.. Participação em banca de Débora Spenassato. TEORIA DA RESPOSTA AO ITEM: INFERÊNCIA BAYESIANA EM MODELOS SIMÉTRICO E ASSIMÉTRICO. 2011. Dissertação (Mestrado em Modelagem Computacional) - Universidade Federal do Rio Grande.

10.
WERHLI, A. V.; Botelho, S. S. C.. Participação em banca de Sérgio Halpern Braunstein. UTILIZAÇÃO DE MAPAS AUTO-ORGANIZÁVEIS PARA PREDIÇÃO DE ALARMES EM PLANTAS INDUSTRIAIS. 2010. Dissertação (Mestrado em Modelagem Computacional) - Universidade Federal do Rio Grande.

Teses de doutorado
1.
WERHLI, A. V.; RAMOS, D.; AMORIM, H. L. N.; SILVA, P. E. A.. Participação em banca de Lande Vieira da Silva Júnior. ?Bioinformática como ferramenta para o estudo do mecanismo de efluxo da bomba multidroga AcrB. 2016. Tese (Doutorado em Ciências da Saúde) - Universidade Federal do Rio Grande.

2.
SOUZA, O. N.; RUIZ, D. D.; WERHLI, A. V.; BECKER, K.. Participação em banca de Ana Trinade Winck. 3D-Tri: Um Algoritmo de Indução de Árvore de Regressão para Propriedades Tridimensionais - um estudo sobre dados de docagem molecular considerando a flexibilidade do receptor. 2012. Tese (Doutorado em Programa de Pós Graduação em Ciência da Computação) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul.

3.
WERHLI, A. V.; RUIZ, D. D.; SOUZA, O. N.. Participação em banca de Karina dos Santos Machado. SELEÇÃO EFICIENTE DE CONFORMAÇÕES DE RECEPTOR FLEXÍVEL EM SIMULAÇÕES DE DOCAGEM MOLECULAR. 2011. Tese (Doutorado em Ciência da Computação) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul.

Trabalhos de conclusão de curso de graduação
1.
ESPINDOLA, D. B.; RODRIGUES, R. N.; WERHLI, A. V.. Participação em banca de Guilherme Brunel Zaffari.Sistema de Controle e Automação Para Tanques de Pesquisa de Microalgas. 2015. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia de Automação) - Universidade Federal do Rio Grande.

2.
WERHLI, A. V.; MACHADO, K. S.; ADAMATTI, D. F.. Participação em banca de Tiago Fossati Otero.Simulação da dispersão de ovas e larvas da Garoupa-Verdadeira entre o Parcel do Carpinteiro e os Molhes da Barra. 2015. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade Federal do Rio Grande.

3.
WERHLI, A. V.; GONCALVES, E.; RODRIGUES, R. N.. Participação em banca de Leonardo Zamberlam.Controle Distribuído com IEC 61499 e Redes de Petri em um Ambiente de Manufatura Distribuída. 2015. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia de Automação) - Universidade Federal do Rio Grande.

4.
SANTOS, R. A. P.; WERHLI, A. V.; ADAMATTI, D. F.. Participação em banca de Matheus Simões Santos.POKFURG - Um agente jogador de poker. 2015. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia de Computação) - Universidade Federal do Rio Grande.

5.
WERHLI, A. V.; SIMAS, G. M.; Botelho, S. S. C.. Participação em banca de Marcio Rozante Aguiar.BANCADA DE CALIBRAÇÃO E VALIDAÇÃO DE SISTEMAS VBM. 2015. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia de Automação) - Universidade Federal do Rio Grande.

6.
RODRIGUES, R. N.; OLINTO, C. R.; WERHLI, A. V.. Participação em banca de Bruno Pereira Franco.Desenvolvimento de uma Planta de Testes Simuladora de um Dispositivo de Conversão de Energia das Ondas do Tipo Coluna de Água Oscilante. 2015. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia de Automação) - Universidade Federal do Rio Grande.

7.
WERHLI, A. V.; RODRIGUES, R. N.; MARCOS, P. B.. Participação em banca de Átila Astor Weis.Rastreio de Recursos de Manufatura com tecnologia RFID e GPS: estudo de caso para aplicações em Estaleiros. 2015. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia de Automação) - Universidade Federal do Rio Grande.

8.
DREWS JR., P. L. J.; BEM, R. A.; WERHLI, A. V.. Participação em banca de Pablo Neves Machado.Aprendizado Semi-Supervisionado na Classificação de Microalgas. 2012. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia de Computação) - Universidade Federal do Rio Grande.

9.
Emmendorfer, L. R.; MACHADO, K. S.; WERHLI, A. V.. Participação em banca de Wagner Gadêa Lorenz.Modelagem estatística e computacional do comportamento de alunos bolsistas de programas de apoio do Núcleo de Assistência Estudantil da Universidade Federal do Rio Grande. 2012. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia de Computação) - Universidade Federal do Rio Grande.

10.
Adamatti, D. F.; VARGAS, A. P.; WERHLI, A. V.. Participação em banca de Franthiesca V. da Silva.Um Jogo de Estratégia Aplicando Técnicas de Inteligência Artificial. 2012. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia de Computação) - Universidade Federal do Rio Grande.

11.
Adamatti, D. F.; Emmendorfer, L. R.; WERHLI, A. V.; DIMURO, G. P.. Participação em banca de Josimara de Avila Silveira e Thiago Lipinski Paes.Poder das árvores de decisão para a captura do comprtamento de agentes: Experimentos em cenários com diversas complexidades. 2011. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia de Computação) - Universidade Federal do Rio Grande.

12.
Adamatti, D. F.; Emmendorfer, L. R.; WERHLI, A. V.. Participação em banca de Felipe Neves da Silva.Utilização de autômatos celulares para simulação de impactos ambientais. 2011. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia de Computação) - Universidade Federal do Rio Grande.

13.
Adamatti, D. F.; WERHLI, A. V.; RODRIGES, C. L. L.; Emmendorfer, L. R.. Participação em banca de Rodrigo Barbosa Sousa Orrego.Modelagem e análise de simulações automobilísticas. 2011. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia de Computação) - Universidade Federal do Rio Grande.

14.
Adamatti, D. F.; Emmendorfer, L. R.; WERHLI, A. V.. Participação em banca de Pablo Santos Werlang.Simulação comportamental de organismos artificiais. 2011. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia de Computação) - Universidade Federal do Rio Grande.

15.
Emmendorfer, L. R.; DIMURO, G. P.; WERHLI, A. V.. Participação em banca de Pedro de Botelho Marcos.Um sistema de acompanhamento musical orientado a performance: Uma abordagem utilizando o Processo de Decisão de Markov. 2011. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia de Computação) - Universidade Federal do Rio Grande.

16.
FREITAS, A. L. C.; Franco, D. T.,; WERHLI, A. V.. Participação em banca de Diego Saraiva de Oliveira.UM ESTUDO COMPARATIVO ENTRE AS TECNOLOGIAS WEB SERVICE. 2010. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia de Computação) - Universidade Federal do Rio Grande.

17.
Botelho, S. S. C.; Adamatti, D. F.; WERHLI, A. V.. Participação em banca de Gabriel Leivas Oliveira.MAPAS AUTO-ORGANIZÁVEIS ESFÉRICOS PARA LOCALIZAÇÃO E MAPEAMENTO DE ROBÔS MÓVEIS. 2010. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia de Computação) - Universidade Federal do Rio Grande.

18.
Botelho, S. S. C.; WERHLI, A. V.; ESTRADA, E. S. D.. Participação em banca de Thiago da Silva Santos.PROJETO DE UM SISTEMA ROBÓTICO MÓVEL APLICADO AO FUTEBOL DE ROBÔS. 2010. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia de Computação) - Universidade Federal do Rio Grande.

19.
BICHO, A.; Emmendorfer, L. R.; WERHLI, A. V.. Participação em banca de Wesley Adonay Castelluber.UM MÉTODO PARA RECONHECIMENTO DE COMPORTAMENTOS EM SIMULAÇÃO DE MULTIDÕES. 2010. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia de Computação) - Universidade Federal do Rio Grande.

20.
BICHO, A.; WERHLI, A. V.; ESPINDOLA, D. B.. Participação em banca de Tiago Pasito Schultz.GERAÇÃO AUTOMÁTICA DE REDES DE PETRI APLICÁVEIS NO CONTROLE GLOBAL DE ANIMAÇÕES POR COMPUTADOR. 2010. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia de Computação) - Universidade Federal do Rio Grande.

21.
Emmendorfer, L. R.; FREITAS, A. L. C.; WERHLI, A. V.. Participação em banca de Aaron Concha Vasquez Hengles e Zenon Gilberto Fraga de Olive.Um estudo sobre programação orientada a aspectos. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia de Computação) - Universidade Federal do Rio Grande.

22.
FREITAS, A. L. C.; Emmendorfer, L. R.; WERHLI, A. V.. Participação em banca de Erivaldo de Carli.Reúso de software. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia de Computação) - Universidade Federal do Rio Grande.

23.
FREITAS, A. L. C.; Emmendorfer, L. R.; WERHLI, A. V.. Participação em banca de Katreen Schmidt.Estudo sobre teste de software em aplicações orientadas a objetos. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia de Computação) - Universidade Federal do Rio Grande.

24.
ROCHA, C.; GONCALVES, G. A.; WERHLI, A. V.. Participação em banca de Cassiano Valle Tartari.GPSBusca: Um software sobre o georreferenciamento de imagens com base em tecnologia móvel celular e Android. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia de Computação) - Universidade Federal do Rio Grande.



Participação em bancas de comissões julgadoras
Concurso público
1.
Botelho, S. S. C.; Oliveira, V. M.; WERHLI, A. V.. Concurso público - Professor Adjunto. 2009. Universidade Federal do Rio Grande.

2.
Nelson Lopes Duarte Filho; Geralcy Carneiro da Silva; WERHLI, A. V.. Concurso público - Professor Adjunto. 2009. Universidade Federal do Rio Grande.

3.
CAPUA, M. F.; BRANCO, R. M.; WERHLI, A. V.. Concurso público - Professor Carreira de Magistério do Ensino Básico, Técnico e Tecnológico. 2009. Universidade Federal do Rio Grande.



Eventos



Organização de eventos, congressos, exposições e feiras
1.
Adamatti, D. F. ; LUGO, G.G ; Emmendorfer, L. R. ; WERHLI, A. V. . IV Workshop- Escola de Sistemas de Agentes, seus Ambientes e apliCações. 2010. (Congresso).

2.
WERHLI, A. V.; COSTA, A. C. R. ; Emmendorfer, L. R. ; Retamoso, M. . IV MCSUL Southern Conference on Computational Modeling / IX ERMAC Encontro regional de Matemática Aplicada e Computacional. 2010. (Congresso).



Orientações



Orientações e supervisões em andamento
Dissertação de mestrado
1.
Wolmer Dias Quaresma Junior. Alinhamento estrutura sequência de genes e proteínas. Início: 2017. Dissertação (Mestrado em Engenharia de Computação) - Universidade Federal do Rio Grande, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Orientador).

2.
Eduardo Soares De Abreu. Análise de expressão diferencial em cardiomiopatias. Início: 2017. Dissertação (Mestrado em Engenharia de Computação) - Universidade Federal do Rio Grande. (Orientador).


Orientações e supervisões concluídas
Dissertação de mestrado
1.
Renan Zafalon da Silva. Visão computacional aplicada na análise de características da poça de fusão e da transferência metálica. 2017. Dissertação (Mestrado em Engenharia de Computação) - Universidade Federal do Rio Grande, . Orientador: Adriano Velasque Werhli.

2.
Roger Sá da Silva. Previsão de Fluorescência de Proteínas. 2016. Dissertação (Mestrado em Engenharia de Computação) - Universidade Federal do Rio Grande, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Adriano Velasque Werhli.

3.
Mauro Medeiros Barbat. Classificação de sedimentos superficiais de leitos oceânicos e de águas continentais: Uma abordagem baseada em super segmentação e sabedoria das massas. 2016. Dissertação (Mestrado em Engenharia de Computação) - Universidade Federal do Rio Grande, Agência Nacional do Petróleo. Orientador: Adriano Velasque Werhli.

4.
Eduardo S. F. dos Santos. Sensor Visual: Mensuração de Instrumento de Ponteiro a Partir de Vídeo. 2015. Dissertação (Mestrado em Engenharia de Computação) - Universidade Federal do Rio Grande, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio Grande do Sul. Orientador: Adriano Velasque Werhli.

5.
Nilzair Mendes Barreto. Um método hierárquico Bayesiano para melhorar a convergência de Markov Chain Monte Carlo. 2014. Dissertação (Mestrado em Modelagem Computacional) - Universidade Federal do Rio Grande, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio Grande do Sul. Orientador: Adriano Velasque Werhli.

6.
Thyago Salvá. Inferência de Redes Regulatórias utilizando Algoritmos de Estimação de Distritribuição. 2014. Dissertação (Mestrado em Engenharia de Computação) - Universidade Federal do Rio Grande, . Orientador: Adriano Velasque Werhli.

7.
Renan Luz. Um jogo para extração de conhecimento do problema de dobramento de proteínas modelo HP. 2014. Dissertação (Mestrado em Modelagem Computacional) - Universidade Federal do Rio Grande, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Adriano Velasque Werhli.

8.
Pablo Werlang. Simulação do crescimento de Mycobacterium tuberculosis com um modelo Multiagentes.. 2013. Dissertação (Mestrado em Modelagem Computacional) - Universidade Federal do Rio Grande, . Orientador: Adriano Velasque Werhli.

9.
Sergio Braunstein. Data Mining e Métodos de Diagnóstico para Sistemas de Manutenção Inteligente - Um estudo de caso em Usinas Geradoras de Energia Eletrica. 2008. Dissertação (Mestrado em Modelagem Computacional) - Universidade Federal do Rio Grande, . Coorientador: Adriano Velasque Werhli.

Tese de doutorado
1.
Mariana Recamonde Mendoza. Exploring ensemble learning techniques to optimize the reverse engineering of gene regulatory networks. 2014. Tese (Doutorado em Computação) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul, . Coorientador: Adriano Velasque Werhli.

Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização
1.
Cristiane da Silveira Fernandes. Abordagem ao uso indevido de drogas na escola com o apoio das tecnologias. 2014. Monografia. (Aperfeiçoamento/Especialização em Tecnologia da Informação e Comunicação na Educação) - Universidade Federal do Rio Grande. Orientador: Adriano Velasque Werhli.

2.
Jorge Roberto Pereira Peixe. Ler e Interpretar o mundo com o auxílio das Tecnologias. 2014. Monografia. (Aperfeiçoamento/Especialização em Tecnologia da Informação e Comunicação na Educação) - Universidade Federal do Rio Grande. Orientador: Adriano Velasque Werhli.

3.
Eduardo Luiz Enderle de Oliveira. Uma Avaliação do Uso das Tecnologias da Informação e Comunicação no Ensino da História. 2014. Monografia. (Aperfeiçoamento/Especialização em Tecnologia da Informação e Comunicação na Educação) - Universidade Federal do Rio Grande. Orientador: Adriano Velasque Werhli.

4.
Eduardo Soldera Oliveira. Recursos Tecnológicos: Possibilidades de Aplicação na Educação Física Escolar. 2014. Monografia. (Aperfeiçoamento/Especialização em Tecnologia da Informação e Comunicação na Educação) - Universidade Federal do Rio Grande. Orientador: Adriano Velasque Werhli.

5.
Bruno Sória. Controle de Temperatura de um Sistema de Produção Cervejeira Utilizando a Placa Arduino. 2014. Monografia. (Aperfeiçoamento/Especialização em Engenharia de Automação e Instrumentação) - Universidade Federal do Rio Grande. Orientador: Adriano Velasque Werhli.

6.
Caroline Strelow. FORMAÇÃO DE PROFESSORES COM O USO DAS TICS. 2012. Monografia. (Aperfeiçoamento/Especialização em Tecnologia da Informação e Comunicação na Educação) - Universidade Federal do Rio Grande. Orientador: Adriano Velasque Werhli.

7.
DINORAH AMARAL MATTE. OS DIFERENTES PERÍODOS HISTÓRICOS E A INFLUÊNCIA NA EDUCAÇÃO: ELENCADO NA ESCOLA WANDELINA NUNES DE SANTA VITÓRIA DO PALMAR. 2012. Monografia. (Aperfeiçoamento/Especialização em Tecnologia da Informação e Comunicação na Educação) - Universidade Federal do Rio Grande. Orientador: Adriano Velasque Werhli.

8.
ELIZABETH CENTENO. AS TECNOLOGIAS COMO FACILITADOR NA INCLUSÃO. 2012. Monografia. (Aperfeiçoamento/Especialização em Tecnologia da Informação e Comunicação na Educação) - Universidade Federal do Rio Grande. Orientador: Adriano Velasque Werhli.

9.
FERNANDA BORK. DESCOBRINDO AS TECNOLOGIAS DA INFORMAÇÃO E DA COMUNICAÇÃO (TIC) NA ESCOLA. 2012. Monografia. (Aperfeiçoamento/Especialização em Tecnologia da Informação e Comunicação na Educação) - Universidade Federal do Rio Grande. Orientador: Adriano Velasque Werhli.

10.
GISLEI DOS SANTOS CRUZ. Tecnologias de Informação e Comunicação na Educação Especial. 2012. Monografia. (Aperfeiçoamento/Especialização em Tecnologia da Informação e Comunicação na Educação) - Universidade Federal do Rio Grande. Orientador: Adriano Velasque Werhli.

11.
VERA DE OLIVEIRA LEAL. PRATIC ? Tecnologias em Prática. 2012. Monografia. (Aperfeiçoamento/Especialização em Tecnologia da Informação e Comunicação na Educação) - Universidade Federal do Rio Grande. Orientador: Adriano Velasque Werhli.

Trabalho de conclusão de curso de graduação
1.
Andre Luis Tibola. Implementação paralela do Danish Eulerian model. 2012. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Engenharia de Computação) - Universidade Federal do Rio Grande. Orientador: Adriano Velasque Werhli.

2.
Nilzair Mendes Barreto. Inferencia de Redes Booleanas. 2011. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Engenharia de Computação) - Universidade Federal do Rio Grande. Orientador: Adriano Velasque Werhli.

3.
Mariana Recamonde Mendoza. Reconstrução de redes regulatórias com um modelo Bayesiano hierárquico. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Engenharia de Computação) - Universidade Federal do Rio Grande. Orientador: Adriano Velasque Werhli.

4.
Guilherme Vaz Pereira e Roger Sá da Silva. Uma abordagem baseada em mineração de dados para aquisição automática de conhecimento sobre o processo seletivo da Universidade Federal do Rio Grande. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Engenharia de Computação) - Universidade Federal do Rio Grande. Orientador: Adriano Velasque Werhli.

Iniciação científica
1.
Khaoma Pires Duarte. Inferência de estrutura de redes biológicas com a combinação de métricas de Redes Bayesianas. 2010. Iniciação Científica. (Graduando em Engenharia de Automação) - Universidade Federal do Rio Grande, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Adriano Velasque Werhli.

2.
Franthiesca Valadão da Silva. Engenharia reversa de redes biológicas a partir de dados pós genômicos. 2009. Iniciação Científica. (Graduando em Engenharia de Computação) - Universidade Federal do Rio Grande, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Adriano Velasque Werhli.




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