Tomas Hrbek

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  • Última atualização do currículo em 21/06/2018


Possui graduação em Bioquímica pela Universidade de Binghamton (1992) e doutorado em Ecology, Evolution and Population Biology - Washington University em Saint Louis (1999). Fez pós-doutorado na Universidade do Konstanz, Alemanha (1999-2002), e na Escola da Medicina da Washington University em Saint Louis (2002-2004). Em 2004 foi bolsista do programa Fulbright atuando na Universidade Federal do Amazonas (UFAM) e Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia (INPA). De 2005 a 2010 foi professor Adjunto e Associado da Universidad de Puerto Rico (UPR). Em 2010 foi selecionado como Professor Adjunto na cadeira de Genética de Populações da Universidade Federal do Amazonas (UFAM). Em 2014-2015 fez um ano sabático na Brigham Young University com Sites Jack. Tem experiência na área de Genética e Biologia Evolutiva, com ênfase em Genética Animal, atuando principalmente nos seguintes temas: genética da conservação, genética de populações, genética quantitativa, ecologia molecular e sistemática molecular. Estuda principalmente ictiofauna e herpetofauna da Amazônia. Faz parte do corpo permanente dos professores orientadores do curso de pós-graduação em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva (INPA, desde 2004), Ecologia (INPA, desde 2014) e Zoologia (UFAM, desde 2015). Entre 2011 e 2014 foi coordenador do programa de pós-graduação em Diversidade Biológica (UFAM, 2006-2014). Atua como colaborador no curso de pós-graduação da Rede Bionorte (UFAM, deste 2011) e pesquisador do Center for Applied Tropical Ecology and Conservation (UPR). Review editor do Frontiers of Ecology and Evolution (ISSN 2296-701X) desde 2013, e editor associado do Journal of Heredity (ISSN 0022-1503) e PeerJ (ISSN 2167-8359) desde 2015. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome Social
Tomas Hrbek
Nome em citações bibliográficas
HRBEK, T.;HRBEK, TOMAS

Endereço


Endereço Profissional
Universidade Federal do Amazonas, Reitoria, Laboratório de Evolução e Genética Animal.
Ave. Gen. Rodrigo Otavio Ramos, 3000
Coroado II
69077000 - Manaus, AM - Brasil
Telefone: (92) 33054233
Ramal: 92
Fax: (92) 33054229
URL da Homepage: http://www.evoamazon.net/


Formação acadêmica/titulação


1993 - 1999
Doutorado em Ecology Evolution And Population Biology.
Washington University Saint Louis, WUSL, Estados Unidos.
Título: Phenotypic evolution in Killifishes (Aplocheiloidei: Cyprinodontiformes): phylogenetic relationships, population genetics and biogeography., Ano de obtenção: 1999.
Orientador: Allan Larson.
Bolsista do(a): Washington University Saint Louis, WUSL, Estados Unidos.
Palavras-chave: Killifishes; Population genetics; Evolutionary biology; Molecular phylogeny; Biogeography; Life-history.
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Ecologia / Subárea: Ecologia Aplicada.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Zoologia / Subárea: Taxonomia dos Grupos Recentes.
Setores de atividade: Produtos e Serviços Voltados Para A Defesa e Proteção do Meio Ambiente, Incluindo O Desenvolvimento Sustentado.
1988 - 1992
Graduação em Biochemistry.
Binghamton University, BU, Estados Unidos.
Título: Biochemistry.
Orientador: Karl Wilson.


Pós-doutorado


2014 - 2015
Pós-Doutorado.
Brigham Young University, BYU, Estados Unidos.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
2002 - 2004
Pós-Doutorado.
Washington University School Of Medicine Saint Louis, WUMS, Estados Unidos.
Bolsista do(a): National Institute Of Health, NIH, Estados Unidos.
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Quantitativa.
1999 - 2002
Pós-Doutorado.
Universität Konstanz, UNI KONSTANZ, Alemanha.
Bolsista do(a): National Science Foundation, NSF, Estados Unidos.
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Zoologia / Subárea: Taxonomia dos Grupos Recentes.


Formação Complementar


2008 - 2008
Summer Institute in Statistical Genetics. (Carga horária: 130h).
University of Washington, WASHINGTON, Estados Unidos.
2005 - 2005
Curso Básico de ArcView. (Carga horária: 30h).
Instituto Piagaçu, IPI, Brasil.
2003 - 2003
Evolutionary Developmental Genetics. (Carga horária: 80h).
Stanford University, STANFORD, Estados Unidos.


Atuação Profissional



Universidade Federal do Amazonas, UFAM, Brasil.
Vínculo institucional

2010 - Atual
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Adjunto I, Regime: Dedicação exclusiva.

Vínculo institucional

2004 - 2010
Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Pesquisador Colaborador, Carga horária: 10
Outras informações
Professor orientador no curso pos-graduação: Biotechnologia e Diversidade Biológica Pesquisador no Genética, Instituto de Ciencias Biológicas

Atividades

5/2005 - Atual
Pesquisa e desenvolvimento , Reitoria, Laboratório de Evolução e Genética Animal.

8/2004 - Atual
Ensino, Biotecnologia, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Systemática Molecular
Genética Populacional
Metodos Moleculares para Biologia da Conservação
8/2003 - Atual
Pesquisa e desenvolvimento , Reitoria, Laboratório de Evolução e Genética Animal.


Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, INPA, Brasil.
Vínculo institucional

2005 - Atual
Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Pesquisador Colaborador, Carga horária: 10
Outras informações
Professor orientador no curso pos-graduação: Genética, Conservação e Biologia Evolutiva

Atividades

1/2005 - Atual
Pesquisa e desenvolvimento , Departamento de Biologia Aquática e Limnologia, Divisão de Biologia e Ecologia de Peixes.

7/2010 - 7/2010
Ensino, Genética, Conservação e Biologia Evolutiva, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Sistemática Molecular
6/2009 - 6/2009
Ensino, Genética, Conservação e Biologia Evolutiva, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Ferramentas para Análises Genéticas em Nível Intraespecífico
5/2008 - 5/2008
Ensino, Genética, Conservação e Biologia Evolutiva, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Sistemática Molecular
5/2007 - 5/2007
Ensino, Genética, Conservação e Biologia Evolutiva, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Sistemática Molecular
5/2006 - 5/2006
Ensino, Genética, Conservação e Biologia Evolutiva, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Sistemática Molecular
8/2005 - 8/2005
Ensino, Genética, Conservação e Biologia Evolutiva, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Genética da Populações

Universidad de Puerto Rico Recinto de Rio Piedras, UPR, Porto Rico.
Vínculo institucional

2010 - 2010
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Associate Professor, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Vínculo institucional

2005 - 2010
Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Diretor Sequencing and Genotyping Facility, Carga horária: 10

Vínculo institucional

2005 - 2009
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Assistant Professor, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

8/2007 - Atual
Conselhos, Comissões e Consultoria, Facultad de Ciencias Naturales, .

Cargo ou função
Faculty of Natural Sciences representative on the UPR-wide Council of Graduates Studies and Research.
1/2007 - Atual
Direção e administração, Facultad de Ciencias Naturales, Departamento de Biología.

Cargo ou função
Director of Sequencing and Genotyping Facility at UPR.
8/2006 - Atual
Conselhos, Comissões e Consultoria, Facultad de Ciencias Naturales, Departamento de Biología.

Cargo ou função
Member, Graduate committee (Biology).
1/2005 - Atual
Pesquisa e desenvolvimento , Facultad de Ciencias Naturales, Departamento de Biología.

8/2009 - 12/2009
Ensino, Biology, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Genetics (Biol 3449)
8/2009 - 12/2009
Ensino, Biology, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Speciation and Species Concepts (Biol 6996)
8/2008 - 12/2008
Ensino, Biology, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Genetics (Biol 3349)
8/2008 - 12/2008
Ensino, Biology, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Microevolution and Evolutionary Theory (Biol 6996)
8/2007 - 12/2007
Ensino, Biology, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Genetics (Biol 3349)
8/2007 - 12/2007
Ensino, Biology, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Phylogenetic Systematics (Biol 6120)
8/2006 - 12/2006
Ensino, Biology, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Evolution (Biol 6996)
8/2006 - 12/2006
Ensino, Biology, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Genetics (Biol 3349)
1/2006 - 6/2006
Ensino, Biology, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Graduate Student Colloquium II (Biol 6002)
8/2005 - 12/2005
Ensino, Biology, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Graduate Student Colloquium I (Biol 6001)
8/2005 - 12/2005
Ensino, Biology, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Genetics (Biol 3349)

Washington University School Of Medicine Saint Louis, WUMS, Estados Unidos.
Vínculo institucional

2002 - 2004
Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Research Associate, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

7/2002 - 7/2004
Pesquisa e desenvolvimento , Division Of Biological And Biomedical Sciences, .


Universität Konstanz, UNI KONSTANZ, Alemanha.
Vínculo institucional

1999 - 2002
Vínculo: Bolsista recém-doutor, Enquadramento Funcional: Postdoctoral researcher, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

7/1999 - 6/2002
Pesquisa e desenvolvimento , University Of Konstanz, .

4/2002 - 4/2002
Ensino, Evolutionary Biology, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Vertiefungskurs (Population Genetics)
4/2001 - 4/2001
Ensino, Evolutionary Biology, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Vertiefungskurs (Population Genetics)
4/2000 - 4/2000
Ensino, Evolutionary Biology, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Vertiefungskurs (Population Genetics)

Washington University Saint Louis, WUSL, Estados Unidos.
Vínculo institucional

1993 - 1999
Vínculo: Graduate Research Associate, Enquadramento Funcional: Graduate Student, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

8/1993 - 6/1999
Pesquisa e desenvolvimento , Division Of Biological And Biomedical Sciences, .

8/1993 - 6/1999
Ensino, Evolution, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Molecular Evolution
Principles of Biology
Evolution

University of Arkansas, UARK, Estados Unidos.
Vínculo institucional

1991 - 1991
Vínculo: Outro, Enquadramento Funcional: Undergraduate student, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações
Field research

Atividades

5/1991 - 8/1991
Pesquisa e desenvolvimento , University Of Arkansas, .

State University Of New York At Stony Brook, SUNY-SB, Estados Unidos.
Vínculo institucional

1990 - 1990
Vínculo: Outro, Enquadramento Funcional: Laboratory Research Assistant, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações
Laboratory Research Assistant

Vínculo institucional

1989 - 1989
Vínculo: Outro, Enquadramento Funcional: Field Reseach Assistant, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações
Field Research Assistant

Atividades

5/1990 - 8/1990
Pesquisa e desenvolvimento , State University Of New York At Stony Brook, .

5/1989 - 8/1989
Pesquisa e desenvolvimento , State University Of New York At Stony Brook, .



Linhas de pesquisa


1.
Morphological Evolution
2.
Evolutionary Biology
3.
Morphological Evolution
4.
Evolutionary Biology
5.
Population Genetics
6.
Phylogenetics
7.
Evolutionary Biology
8.
Population genetics
9.
Phylogenetic systematics
10.
Biogeography
11.
Evolutionary Biology
12.
Quantiative Expression
13.
Genomics
14.
Molecular Genetics
15.
Quantitative Genetics
16.
Criação do centro de estudos integrados da conservação e manejo de recursos aquáticos
17.
Filogeografia e genética das populações de peixes ornamentais e importancia económica
18.
Population Genetics
19.
Conservation Genetics
20.
Quantitative Genetics
21.
Molecular Phylogenetics
22.
Systematics and Taxonomy
23.
Biodiversidade de Peixes da Amazônia
24.
Morfología da Família Rivulidae


Projetos de pesquisa


2014 - Atual
Testando hipoteses de diferenciação da fauna aquatica do rio Madeira

Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (1) .

Integrantes: Tomas Hrbek - Coordenador / Izeni Pires Farias - Integrante / Waleska Gravena - Integrante / Fábio de Lima Muniz - Integrante.
2012 - Atual
Biogeografia dos peixes Characiformes reofílicos nos escudos Guianense e Brasileiro

Descrição: O objetivo principal dessa proposta é gerar um banco de dados de peixes reofílicos dos rios da Guiana Francesa, e combinar esse banco de dados com um banco de dados de peixes reofílicos da Amazônia Brasileira. O financiamento para as coletas no Brasil vem da proposta EDITAL N. 023/2009 ? PRONEX/FAPEAM sob coordenação da Dra. Izeni Pires Farias e projeto Edital MCT/CNPq 14/2010 ? Universal processo 483155/2010-1 sob coordenação do Dr. Tomas Hrbek. Tais objetivos da proposta visam responder as seguintes questões: Como são as comunidades biológicas construídas? Quais são os processos ecológicos e evolutivos que geraram e que mantém estas comunidades? Quais processos são dominantes? A presente proposta pretende responder a estas perguntas, uma vez que o conhecimento da biodiversidade de peixes (principalmente a críptica) nos trechos de cachoeiras e corredeiras de alguns tributários do rio Amazonas estão ameaçados pelas construções de hidroelétricas..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.

Integrantes: Tomas Hrbek - Coordenador / Izeni Pires Farias - Integrante / Maria da Conceição Freitas Santos - Integrante / Valéria Machado - Integrante / Jegu, Michel - Integrante / Geraldo Mendes Santos - Integrante.
2011 - Atual
Rede de pesquisa para ampliação do conhecimento sobre a biodiversidade de vertebrados da Amazônia brasileira com aplicações sobre seu uso e conservação ? Rede BioPHAM

Descrição: Esta proposta tem como objetivo primário criar uma rede de pesquisadores e instituições trabalhando com as principais questões relacionadas a amostrar e caracterizar de maneira padronizada a biodiversidade de grupos alvos de vertebrados do bioma Amazônia. A finalidade da Rede é de construir um banco de dados de referência de taxonomia, barcoding moleculares, taxonomia, citogenética/citogenômica e através da bioinformática integrar este banco de dados com banco de dados de tecidos depositados nas instituições fiéis depositárias, e dados biológicos associados. O bioproduto resultante será a formação de um banco de dados de referência para futura caracterização, fiscalização e bioprospecção da biodiversidade amazônica, atendendo assim os requisitos do United Nations Convention on Biological Diversity, ratificado pelo governo do Brasil em 1994-02-28. O segundo objetivo primário será a formação de recursos humanos qualificados através de treinamentos na área de taxonomia dos grupos estudados, biotecnologia e bioinformática, uma vez que a biotecnologia e a bioinformática tornaram-se ferramentas científicas poderosas. O poder da biotecnologia se estende ao conhecimento da biodiversidade e seu uso sustentável. A bioinformática permite-nos analisar e extrair as informações dos dados gerados pelas ferramentas biotecnológicas. Considerando isto, a proposta visa treinar futuros profissionais que usarão tais ferramentas para lidar com a imensa biodiversidade da Amazônia..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.

Integrantes: Tomas Hrbek - Integrante / Iracilda Sampaio - Integrante / Jorge Ivan Rebêlo Porto - Integrante / Eliana Feldberg - Integrante / Marcelo Gordo - Integrante / Andréa Martins Cantanhede - Integrante / Izeni Pires Farias - Coordenador / José Alves-Gomes - Integrante / Jacqueline da Silva Batista - Integrante / Maria Nazaré Ferreira da Silva - Integrante / Mário Cohn-Haft - Integrante / Horacio Schneider - Integrante / Kyara Formiga Aquino - Integrante / Maria Claudia Gross - Integrante / Jean Philippe Boubli - Integrante / Albertina Pimentel Lima - Integrante / Camila Cherem Ribas - Integrante / Jansen Alfredo Sampaio Zuanon - Integrante / Marcelo Menin - Integrante / Lúcia Helena Rapp Py-Daniel - Integrante / Alberto Akama - Integrante / Janice Muriel Fernandes Lima da Cunha - Integrante / Horacio Antonio Braga Fernandes de Oliveira - Integrante / Maria Ermelinda Oliveira - Integrante / Marina Anciães - Integrante / Rubiani de Cassia Pagotto - Integrante / Waldesse Piragé de Oliveira Junior - Integrante / Fábio Röhe - Integrante / Manoel dos Santos Filho - Integrante / Rogério Vieira Rossi - Integrante / Gislene Torrente Vilara - Integrante / Jonathan Ready - Integrante / Elineide Marques - Integrante / Carolina Rodrigues da Costa Doria - Integrante.
Financiador(es): Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado do Amazonas - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
2011 - Atual
Base de dados integrados da biodiversidade da ictiofauna dos rios de corredeiras/cachoeiras da Amazônia

Descrição: Esta proposta tem como objetivo amostrar e caracterizar de maneira padronizada a biodiversidade aquática de corredeiras/cachoeiras da região amazônica com fins de construir um banco de dados de referência de barcoding molecular, e através da bioinformática integrar este banco de dados com banco de dados de tecidos depositados nas instituições fiéis depositárias, e dados biológicos associados. O bioproduto resultante será a formação de um banco de dados de referência para futura caracterização, fiscalização e bioprospecção da biodiversidade amazônica, atendendo assim os requisitos do United Nations Convention on Biological Diversity, ratificado pelo governo do Brasil em 1994-02-28. O segundo objetivo primário será promover um treinamento na área de biotecnologia e bioinformática, uma vez que a biotecnologia e a bioinformática tornaram-se ferramentas científicas poderosas. O poder da biotecnologia se estende ao conhecimento da biodiversidade e seu uso sustentável. A bioinformática permite-nos analisar e extrair as informações dos dados gerados pelas ferramentas biotecnológicas. Considerando isto, a proposta visa treinar futuros profissionais que usarão tais ferramentas para lidar com a imensa biodiversidade da Amazônia..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.

Integrantes: Tomas Hrbek - Integrante / Izeni Pires Farias - Coordenador / José Alves-Gomes - Integrante / Jacqueline da Silva Batista - Integrante / Camila Cherem Ribas - Integrante / Jansen Alfredo Sampaio Zuanon - Integrante / Lúcia Helena Rapp Py-Daniel - Integrante / Cristina Motta Bührnheim - Integrante / Alberto Akama - Integrante / Janice Muriel Fernandes Lima da Cunha - Integrante / Horacio Antonio Braga Fernandes de Oliveira - Integrante / Gislene Torrente Vilara - Integrante / Leandro Melo de Sousa - Integrante.
Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado do Amazonas - Auxílio financeiro.
2011 - Atual
Conservação de Vertebrados Aquáticos Amazônicos

Descrição: O objetivo geral do projeto apresentado pelo Instituto de Desenvolvimento Sustentável Mamirauá, com a colaboração e parceria de reconhecidas instituições de gestão, educação e pesquisadores, é a conservação da biodiversidade amazônica, principalmente das espécies dos grandes Vertebrados Aquáticos que habitam as várzeas e igapós das reservas de desenvolvimento sustentável Mamirauá (RDSM) e Amanã (RDSA). A estratégia de conservação adotada é baseada em sólida pesquisa científica, monitoramento e uso sustentável dos recursos naturais. Parte fundamental do modus operandi do Instituto Mamirauá é o esforço para a promoção de uma intensa participação comunitária na gestão das unidades de conservação e nos diferentes programas desenvolvidos, atuando sempre no eixo da co-responsabilidade entre a instituição e as comunidades. As ações visam principalmente à geração de conhecimento populacional sobre espécies aquáticas ameaçadas ou carismáticas, a educação, a capacitação para uso sustentado de recursos aquáticos, e o fortalecimento dos instrumentos de planejamento. As intervenções propostas envolverão principalmente a pesquisa, a aplicação de técnicas de manejo sustentado dos recursos naturais e a educação ambiental. Para garantir a conservação de Mamíferos e Répteis (Jacarés e Quelônios) aquáticos e seus hábitats são propostas ações aglutinadas em três linhas principais. Os objetivos específicos do projeto envolvem o desenvolvimento de pesquisas sobre ocorrência e distribuição, dinâmica populacional de espécies de Vertebrados Aquáticos, perspectivas de manejo e aplicação de manejo adaptativo. Estes objetivos serão desenvolvidos com enfoque em 2 grupos de grandes Vertebrados Aquáticos: Mamíferos (peixes-boi, botos e ariranhas) e Répteis (Jacarés e Quelônios). O componente de Mamíferos Aquáticos já foi contemplado com patrocínio ?individual? em 2000, e grupos de pesquisa do IDSM o foram durante o edital Petrobras Ambiental 2004, com projeto submetido pela Sociedade Civil Mam.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.

Integrantes: Tomas Hrbek - Integrante / Ronis Da Silveira - Integrante / Izeni Pires Farias - Integrante / Stella Maris Lazzarini - Integrante / Boris Marioni - Integrante / Maria das Neves Viana - Integrante / Cleiton Fantin Rezende - Integrante / Eduardo Eizirik - Integrante / Fabrício R. Santos - Integrante / Deyla Paula de Oliveira - Integrante / Miriam Marmontel - Coordenador / Robinson Botero-Arias - Integrante / Fernando Trujillo - Integrante / Mário A. Cozzuol - Integrante / Lúcia da Costa Ferreira - Integrante / José de Sousa e Silva Júnior - Integrante / Cristiana Simão Seixas - Integrante / Armando Muniz Calouro - Integrante.
Financiador(es): Programa Petrobras Ambiental - Auxílio financeiro.
2011 - Atual
Compreendendo sistemas complexos: o manejo pesqueiro como indutor de desenvolvimento sustentável, proteção ambiental e bem estar social

Descrição: O cerne da proposta é o desenvolvimento de estratégias sustentáveis de utilização dos recursos naturais, com ênfase nos recursos pesqueiros, na região do Médio Rio Negro, com a finalidade de contribuir para a preservação dos estoques naturais e para a melhoria da qualidade de vida dos habitantes desta região..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.

Integrantes: Tomas Hrbek - Integrante / Jorge Ivan Rebêlo Porto - Integrante / Izeni Pires Farias - Integrante / Carlos E. C. Freitas - Coordenador / Alexandre A. F. Rivas - Integrante / Alvaro C. Lima - Integrante / Bruce R. Forsberg - Integrante / Antonio C. Witkoski - Integrante / Gregory Cooper - Integrante / James R. Kahn - Integrante / Julio Siqueira - Integrante / Lawrence E. Hurd - Integrante / Lucirene A. Souza - Integrante / Maria A. Laredo - Integrante / Miguel Petrere Jr - Integrante / Renata R. Mourao - Integrante / Therezinha J. P. Fraxe - Integrante.
Financiador(es): Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado do Amazonas - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
2011 - Atual
Desvendando processos atuais e históricos dos peixes migradores e sedentários: uma análise genético-populacional trans-fronteirística e trans-bacia

Descrição: Com uma rede de bacias hidrográficas inigualáveis e a ictiofauna mais rica do planeta, as bacias dos rios Amazonas e Orinoco têm na pesca, uma das atividades econômicas mais importantes para a região, como fonte de proteína de fácil acesso para as populações locais e os moradores das grandes cidades, e como fonte de renda gerada pela venda de peixes para o consumo e pela exportação de peixes ornamentais. As duas bacias estão caracterizadas pela sua alta diversidade ictiofaunística estimada entre 1300 a 3000 espécies de peixes (Reis et al. 2003), sendo que os Characiformes e Siluriformes representam 83% desse total (Lowe-McConnell 1999). Os peixes dessas duas ordens são os mais explorados pela pesca comercial e também de subsistência nas bacias do Amazonas e Orinoco, sendo que apenas 30 espécies representam 80% dos desembarques comerciais em ambas às bacias (Novoa 2002; Taphorn B. 2003; Barthem and Fabré 2004; Barthem and Goulding 2007). Dentro dos peixes ornamentais, onde 25 espécies representam a maioria de peixes exportadas, a família Cichlidae também tem um papel significante (Chao 2001; Fernandez Acosta et al. 2008). O número significante das espécies de importância econômica é compartilhado entre as bacias (e.g. Colossoma macropomum, Piaractus brachypomus, Paracheirodon axelrodi, Carnegiella marthae, Nannostomus unifasciatus, Pterophyllum altum, Fluviphylax obscurum e Osteoglossum ferreirae). No caso do Brachyplatystoma rousseauxii (B. flavicans), Pseudoplatystoma fasciatum (P. orinocoense), P. fasciatum (P. orinocoense) e P. tigrinum (P. metaense), ainda não é claro se as bacias realmente contêm as duas espécies diferentes. Por exemplo, somente recentemente as espécies P. orinocoense e P. metaense foram descritas para diferenciar as espécies P. fasciatum e P. tigrinum da bacia Amazônica dos peixes da bacia do Orinoco (Buitrago-Suárez e Burr 2007). Entretanto, as diferenças morfológicas entre os pares B. rousseauxii / B. flavicans, P. fasciatum / P. orinocoense.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (2) .

Integrantes: Tomas Hrbek - Coordenador / Jorge Ivan Rebêlo Porto - Integrante / Izeni Pires Farias - Integrante / José Alves-Gomes - Integrante / Maria da Conceição Freitas Santos - Integrante / María Doris Escobar Lizarazo - Integrante / José Gregorio Martínez - Integrante / Susana Josefina Caballero Gaitán - Integrante / Hugo Fernando López Arevalo - Integrante / Ana Maria Olivares - Integrante.
Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
2010 - Atual
Ferramentas biotecnológicas aplicadas à conservação e manejo sustentável dos peixes ornamentais da Amazônia

Descrição: Os peixes ornamentais estão entre os principais recursos aquáticos considerados renováveis na Amazônia, com um grande potencial para servirem como modelo de manejo sustentável, especialmente nos tributários do Rio Negro, Tapajós e Xingu. A exploração destes recursos é o principal meio de subsistência das comunidades ribeirinhas e uma atividade de grande importância sócio-cultural na região. O comércio de peixes ornamentais é baseado em novidades para o mercado internacional, e muitas espécies são exportadas, entretanto, freqüentemente com nomes de peixes da lista oficial. Existem também outros casos onde as espécies exportadas são morfologicamente crípticas. Em sumário, existem muito mais espécies sendo exportadas pelo comércio de aquariofilia/ornamentação do que é oficialmente permitido ou conhecido. Na prática, estima-se que no minimo 250 espécies estão sendo efetivamente comercializadas oriundas de coleta na natureza. O Brasil está exportante uma grande quantidade de sua biodiversidade. Qual é esta biodiversidade que está sendo exportada? Como esta atividade comercial de exploração está afetando esta biodiversidade? Ou ainda, se desta biodiversidade está sendo perdida sem mesmo ser conhecida? Estás são as pergunta que nosso grupo usou como base para o desenvolvimento da presente proposta. Nosso grupo é composto por pesquisadores experientes envolvidos em estudos do conhecimento da biodiversidade Amazônica do ponto vista da genetica, morfologia e ecologia, os quais vêm formando recursos humanos na área, e gerando conhecimento e aplicações em várias linhas de atuação na Amazônia..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (1) .

Integrantes: Tomas Hrbek - Integrante / Jorge Ivan Rebêlo Porto - Integrante / Izeni Pires Farias - Coordenador / Jacqueline da Silva Batista - Integrante / Kyara Formiga Aquino - Integrante / Camila Cherem Ribas - Integrante / Jansen Alfredo Sampaio Zuanon - Integrante.
Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
2010 - Atual
Inventários Biológicos na Amazônia Ocidental ? Sub-Rede Manaus

Descrição: O Projeto Associado ?Inventários Biológicos na Amazônia Ocidental? será composto por pesquisadores e colaboradores das maiores instituições de ensino e pesquisa de Manaus envolvidas em estudos sobre a biodiversidade, formando um Projeto Associado à Rede PPBio Amazônia Ocidental e com objetivos complementares aos seus Projetos Associados. O termo ?biodiversidade? será usado nesta proposta seguindo as Diretrizes para a Política Nacional de Biodiversidade (DECRETO Nº 4.339 22/08/2002) (DPNB), que definem a posição oficial do governo Brasileiro no que se refere às áreas abrangidas por esse termo. O objetivo desta proposta é consolidar e integrar coletas de grupos biológicos realizadas nas grades da FEX-UFAM, ReBio Uatumã e nos módulos ao longo da BR-319 com a Rede PPBio Amazônia Ocidental e com seus Projetos Associados. O Inventário de grupos biológicos e organização de banco de dados de DNA Barcodes presente nesta proposta preencherá lacunas de conhecimento sobre biodiversidade na região, podendo gerar bases científicas para políticas públicas e de conservação..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (6) Doutorado: (2) .

Integrantes: Tomas Hrbek - Coordenador / Izeni Pires Farias - Integrante / Albertina Pimentel Lima - Integrante / Jansen Alfredo Sampaio Zuanon - Integrante / Marcelo Menin - Integrante / Nair Otaviano Aguiar - Integrante / Flávia Regina Capellotto Costa - Integrante / Elizabeth Franklin - Integrante / Cláudia Keller - Integrante / Thierry R. J. Gasnier - Integrante / José Wellington de Morais - Integrante.
Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
2010 - Atual
Desvendando a biodiversidade da fauna de peixes dos rios de corredeiras

Descrição: O Brasil possui a maior biodiversidade do mundo com uma estimativa de deter entre 15 a 20% da biodiversidade global, e pelo menos metade está na floresta amazônica. De fato, para o Brasil se tornar líder na área da biotecnologia e bioprospeção, e utilizar de maneira sustentável a biodiversidade da bacia Amazônica, é imprescindível que conheça sua biodiversidade. Uma das metodologias recentemente propostas, mas já validada em escalas nacionais em países como Canadá, Austrália e Noruega, e recentemente adotada como metodologia padrão pelo México, é o uso de marcadores moleculares padronizados para acessar de forma rápida e eficiente a biodiversidade presente no ecossitema a qual é denominada como código de barras - DNA barcode. Desta forma, esta proposta tem como objetivo principal amostrar e caracterizar de maneira padronizada a biodiversidade aquática de corredeiras/cachoeiras da região amazônica com fins de construir um banco de dados de referência de DNA barcodes, e através da bioinformática integrar este banco de dados com banco de dados de tecidos depositados nas instituições fiéis depositárias, e incluindo tamnbém dados biológicos associados. O banco de dados vai consistir de dados moleculares de seqüências do gene COI (o marcador genético padrão para estudos da biodiversidade), e dados morfológicos, ecológicos e ambientais. Os bioprodutos resultantes se tornarão um banco de dados de referência para futura caracterização, fiscalização e bioprospecção da biodiversidade amazônica, atendendo assim os requisitos do United Nations Convention on Biological Diversity, ratificado pelo governo do Brasil em 1994-02-28..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) .

Integrantes: Tomas Hrbek - Coordenador / Jorge Ivan Rebêlo Porto - Integrante / Izeni Pires Farias - Integrante / José Alves-Gomes - Integrante / Jacqueline da Silva Batista - Integrante / Kyara Formiga Aquino - Integrante / Natasha Verdasca Meliciano - Integrante / Valéria Machado - Integrante / Jansen Alfredo Sampaio Zuanon - Integrante / Lúcia Helena Rapp Py-Daniel - Integrante / Cristina Motta Bührnheim - Integrante / Alberto Akama - Integrante / Janice Muriel Fernandes Lima da Cunha - Integrante / Horacio Antonio Braga Fernandes de Oliveira - Integrante / Olavo Pinhatti Colatreli - Integrante.
Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.Número de orientações: 1
2010 - Atual
Genômica comparada de peixes amazônicos frente a diferentes desafios ambientais

Descrição: O projeto Genômica comparativa de peixes amazônicos frente a diferentes desafios ambientais pretende utilizar a citogenética clássica e molecular, o sequenciamento de DNA e a expressão gênica de espécies de peixes amazônicos expostos a desafios ambientais naturais, ou seja, diferentes característica físicoquímicas de água, bem como ambientes antropizados urbanos. Atualmente o grupo Genética Animal-INPA é o único grupo já consolidado do estado a trabalhar com aspectos citogenéticos de peixes e, com o apoio do laboratório Laboratório Temático de Biologia Molecular (INPA-AM), Laboratório de Evolução e Genética Animal (LEGAL-UFAM), Laboratório de Genômica Integrativa (UNESP-Botucatu) e Laboratório de Biologia do Músculo Estriado (UNESP-Botucatu), inovadoramente visa efetuar o mapeamento físico cromossômico comparativo em espécies da região e verificar a expressão de genes em espécies submetidas a diferentes ambientes. Além disso, o projeto possibilitará a interiorização da proposta, com a inclusão dos dois grupos de pesquisa emergentes que trabalham com abordagens citogenômicas no interior da Amazônia brasileira, sendo eles Laboratório de Biologia do Centro de Estudos Superiores de Parintins (UEA-AM), Laboratório de Genética & Biodiversidade (UFPA - Campus de Santarém). Pretende-se usar espécies de peixes representativa de ambientes naturais e antropizados, para: a) estudar uma classe de DNA repetitivo chamada de elementos transponíveis; b) saber qual destes elementos transponíveis são encontrados no seu genoma; c) quais estão sendo expressos; d) como esses elementos podem conferir plasticidade e adaptabilidade às espécies frente as diferentes características físico-químicas dos rios amazônicos. Aplicação de técnicas modernas de análise dos elementos transponíveis, como seqüenciamento nucleotídico, análise da expressão gênica diferencial em tempo real e mapeamento físico cromossômico..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.

Integrantes: Tomas Hrbek - Integrante / Jorge Ivan Rebêlo Porto - Integrante / Eliana Feldberg - Coordenador / Izeni Pires Farias - Integrante / Maria Claudia Gross - Integrante / Cesar Martins - Integrante / Adriane Pinto Wasko - Integrante / Adailton Moreira Silva - Integrante.
2009 - 2013
Testando o efeito de barreiras na história evolutiva do boto (Inia geoffrensis de Blainville, 1817): delimitação de espécies e implicações para conservação

Descrição: O boto da Amazônia (Inia geoffrensis) ainda apresenta controvérsias com relação à sua sistemática. A classificação mais utilizada para o gênero Inia separou-o, por análises morfológicas, em três subespécies: Inia geoffrensis geoffrensis, Inia geoffrensis boliviensis e Inia geoffrensis humboldtiana. No entanto, alguns autores, baseados em análises morfológicas e moleculares, o dividem em duas espécies: Inia boliviensis e Inia geoffrensis, sendo que esta última ainda é dividida em duas subespécies: Inia geoffrensis geoffrensis e Inia geoffrensis humboldtiana. O boto está amplamente distribuído nos rios da bacia Amazônica, Orinoco e bacia Boliviana. Tem como principais limites para sua distribuição as grandes corredeiras, cachoeiras e rios. A presente proposta testará: 1) o limite das espécies do gênero Inia usando uma estratégia multigênica (um marcador de herança materna-mtDNA, três marcadores de herança paterna-genes do cromossom Y, quatro marcadores de herança biparental, e no mínimo 10 loci de marcadores microssatélites desenvolvidos para Inia geoffrensis); 2) o limite do fluxo gênico das espécies/populações no alto rio Madeira; 3) se a diferenciação das espécies/populações no alto rio Madeira é o resultado da diferenciação ao longo de um cline, ou uma diferenciação alopátrica seguida de um contato secundário. Com isso nosso objetivo geral é contribuir para o conhecimento da história evolutiva do gênero Inia na Amazônia afim de conhecer questões básicas com relação aos limites das espécies, e fatores e processos que levaram a formação dos padrões atualmente observados da diversidade genética das espécies/populações. Serão implementadas análises estatísticas para cada hipótese a ser testada utilizando abordagens de parcimônia estatística, Bayesianas e de máxima-verossimilhança nos bancos de dados obtidos. As implicações dos resultados provenientes desta proposta para a conservação da espécie estão diretamente relacionados a delimitação das espécies de Inia, e a ide.
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Doutorado: (2) .

Integrantes: Tomas Hrbek - Integrante / Vera Maria Ferreira da Silva - Integrante / Izeni Pires Farias - Coordenador / Waleska Gravena - Integrante / Nicole Cristina Lopes Dutra - Integrante.
Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
2009 - 2010
An evaluation of Pleistocene climate change on the demographic history of Amazonian fishes

Descrição: Starting with early naturalists such as Humboldt, Bates and Wallace, biodiversity of the Amazon basin has fascinated scientists and the lay public alike. Two major hypotheses have been proposed for how this biodiversity is generated. The hydrogeographical hypothesis supposes that since the establishment of present day South American River basins, the aquatic fauna has essentially been stable. The refugium/museum hypothesis supposes that marine incursions in the Pleistocene resulted in extinctions followed by colonization(s) of the eastern and central Amazon basin. Pleistocene climate changes therefore had a major role in shaping current patterns of biodiversity in the Neotropics. The fauna of these areas represent an aglomeration of faunas existing in refugial areas. Even more importantly, the underlying implication of this process is that as an ecosystem, the central and eastern Amazon rainforest is ecologically young, is highly dynamic, and subject to radical environmental changes throughout its recent history. Differentiating among these two alternatives is the critical first step of deciphering the major processes that have led to the diversification of the Amazonian aquatic vertebrates. If we as a society we hope to be good stewards of our planet, we not only need to preserve the standing biodiversity, we also need to understand the fundamental processes underlying the generation and maintenance of this biodiversity. Such understanding is critical to fully link biodiversity patterns with evolutionary processes and to more effectively manage and meliorate the biodiversity crisis. The proposed study will also provide quantitative data for modeling the effects of future climate change, and will lay a framework for responsible stewardship of our biodiversity resources. Intellectual merit: The Neotropics comprise only approximately 3% of all freshwater habitats, yet they are estimated to contain nearly 50% of all aquatic biodiversity. Given the current biodiversit.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (2) .

Integrantes: Tomas Hrbek - Coordenador / Izeni Pires Farias - Integrante / Natasha Verdasca Meliciano - Integrante / Maria da Conceição Freitas Santos - Integrante / Kelmer Batalha Passos - Integrante / Silvia Planas - Integrante / Valéria Machado - Integrante / María Doris Escobar Lizarazo - Integrante / Karla Z. Maldonado-Mena - Integrante.
Financiador(es): The National Science Foundation - Auxílio financeiro.
2009 - Atual
Rio Madeira: sua contribuição nos mecanismos de diversificação da fauna na Amazônia

Descrição: Considerando a riqueza em biodiversidade e os eventos antrópicos que os ameaçam, esta proposta tem como objetivo mais amplo contribuir para o conhecimento da biodiversidade da região do alto rio Madeira, dos processos que geraram e geram esta biodiversidade no contexto da biogeografia da bacia Amazônica. Além disso, o estudo dará subsídios ao desenvolvimento de estratégias de mitigação das conseqüências do distúrbio ambiental iminente pelos estudos atuais antes da construção das hidroelétricas. Para isso, estudaremos espécies-chaves da fauna aquática e semi-aquática que serão caracterizadas através de coletas de dados genéticos, ecológicos, morfológicos e comportamentais, e os resultados interpretados de uma maneira comparativa. Pretendemos estudar 10 grupos de peixes, duas espécies de anuros, quatro espécies de crocodilianos, três espécies de quelônios e o boto rosa..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (6) / Doutorado: (7) .

Integrantes: Tomas Hrbek - Integrante / Vera Maria Ferreira da Silva - Integrante / Izeni Pires Farias - Coordenador / José Alves-Gomes - Integrante / Boris Marioni - Integrante / William Rangel Vasconcelos - Integrante / Maria das Neves Viana - Integrante / Jacqueline da Silva Batista - Integrante / George Henrique Rebêlo - Integrante / Zilca Maria da Silva Campos - Integrante / Waleska Gravena - Integrante / Edvaldo Pereira Mota - Integrante / Maria da Conceição Freitas Santos - Integrante / Cleiton Fantin Rezende - Integrante / Fábio de Lima Muniz - Integrante / Albertina Pimentel Lima - Integrante / Pedro Ivo Simões - Integrante / Rafaela Cardoso dos Santos - Integrante / Juarez Carlos Brito Pezzuti - Integrante / Valéria Machado - Integrante / Mauro de Freitas Ortiz - Integrante / Fabiola Costa Rodrigues - Integrante / Guiliano Carlos Huergo - Integrante / Jackson Pantoja - Integrante / Deyla Paula de Oliveira - Integrante / Nicole Cristina Lopes Dutra - Integrante / Daniela M. Leroy e Vieira - Integrante.
Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
2007 - 2013
Taxonomic status and conservation assessment of the Madeira River pink dolphins

Descrição: The pink river dolphin (Inia geoffrensis) is widely distributed in the Amazon and Orinoco River basins. It also occurs in the Bolivian sub-basin which is separated from the Amazon River basin by a series of rapids between Abuña/Guajara Mirim/Riberalta and Porto Velho on the upper Madeira River. The pink dolphin occurs within the rapids region as well. We are conducting a survey of the dolphins in the rapids region, non-invasively collecting epithelial tissue samples, and in the laboratory conducting molecular conservation genetic analyses in order to understand the evolutionary history and the taxonomic status of the pink river dolphins of the upper Madeira River. Based on our results we plan to propose conservation and management strategies for these threatened animals..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Doutorado: (1) .

Integrantes: Tomas Hrbek - Integrante / Vera Maria Ferreira da Silva - Integrante / Izeni Pires Farias - Integrante / Waleska Gravena - Coordenador.
Financiador(es): Society for Marine Mammalogy - Auxílio financeiro / Cleveland Metroparks Zoo - Auxílio financeiro.
Número de produções C, T & A: 2
2007 - Atual
Biotecnologia aplicada ao estudo das populações de peixes de importância econômica para a Amazônia

Descrição: Com uma rede de bacias hidrográficas inigualáveis e a ictiofauna mais rica do planeta, a Amazônia tem na pesca, uma das atividades econômicas mais importantes para a região, como fonte de renda e de proteína de fácil acesso para as populações locais. Cerca de 30 espécies de peixes são capturadas para fins alimentícios e comerciais na Amazônia movimentando milhões de reais através de vários personagens da pesca como pescadores, armadores, frigoríficos, bodegas, carreteiros, etc. Grande parte destas espécies de peixes, como por exemplo, o tambaqui, o pirarucu, a curimatã e o aruanã constituem recursos pesqueiros compartilhados por vários países da América do Sul. A necessidade de usar conhecimento científico para manejar e garantir a sustentabilidade destes recursos é fundamental para que o mesmo continue a gerar renda, emprego e fonte de alimento para as populações. Garantir a melhoria do benefício sócio-econômico gerado pela atividade da pesca na Amazônia, bem como a sua continuidade, dependem diretamente de políticas que garantam o uso sustentável destes recursos, mas preservando a diversidade genética das espécies. Hoje, com o desenvolvimento e aprimoramento de métodos biotecnológicos os quais incluem marcadores genéticos moleculares, é possível obter e elucidar informações fundamentais sobre a estrutura genética e populacional, principalmente das espécies da ictiofauna de alto valor comercial para a região Amazônica. De posse dessas informações, setores da administração pública, não só como tomadores de decisões mais também de fiscalização, poderão implementar e melhorar as estratégias, em várias escalas temporais e espaciais, de monitoramento, conservação e manejo. O acesso ás informações genéticas, otimizará o aproveitamento de mais de uma década de obtenção de conhecimento, geração de recursos humanos especializados resultando no desenvolvimento de sistemas colaborativos entre instituições, pesquisadores e tomadores decisões..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (7) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (5) .

Integrantes: Tomas Hrbek - Integrante / Jorge Ivan Rebêlo Porto - Integrante / Eliana Feldberg - Integrante / Izeni Pires Farias - Coordenador / William Rangel Vasconcelos - Integrante / Yane Santos Almeida - Integrante / Audrey Alencar Arruda D'Assunção - Integrante / Mario da Silva Nunes - Integrante / Mauro Ruffino - Integrante / Daniel Toffoli Ribeiro - Integrante / Waleska Gravena - Integrante / Manuela Villar Amado - Integrante / Edvaldo Pereira Mota - Integrante / Adam Souza de Alencar Leão - Integrante / Themis de Jesus da Silva - Integrante / Eduardo Rodrígues de Souza - Integrante / Maria da Conceição Freitas Santos - Integrante / Maria Claudia Gross - Integrante / Carlos Henrique Schneider - Integrante / Kelmer Batalha Passos - Integrante / Pedro Senna Taylor Bittencourt - Integrante.
Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Número de produções C, T & A: 9 / Número de orientações: 7
2007 - Atual
Distribuição da variedade genética de organismos Amazônicos com potencial biotecnológico

Descrição: Cadeias produtivas utilizando produtos de origem animal e vegetal na Amazônia brasileira crescem a um ritmo superior ao acúmulo de conhecimento a respeito das espécies encontradas na região. Propostas para a exploração comercial de organismos amazônicos, ainda hoje, utilizam modelos biogeográficos de especiação primária, geralmente desconsiderando variações genéticas e fenotípicas existentes entre populações de uma mesma espécie ou considerando grupos taxonomicamente diversos como constituindo um único táxon. Visto que idéias errôneas sobre a homogeneidade genética e taxonômica de grupos com potencial econômico podem ter efeitos negativos drásticos sobre sua conservação e sobre a viabilidade das cadeias produtivas a longo prazo, este projeto tem como objetivo avaliar a variabilidade geográfica em características genéticas e fenotípicas de 4 grupos de organismos amazônicos com potencial comercial: anfíbios anuros das espécies Allobates femoralis e Phyllomedusa bicolor (visados pela indústria farmacêutica), jacarés do gênero Caiman (visados pelo comércio de carne e pele) e arbustos da espécie Heliconia accuminata (visados pelo comércio de plantas ornamentais). Informações básicas obtidas pelo projeto auxiliarão na tomada de decisão sobre a exploração sustentável e a conservação dessas espécies a longo prazo..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (3) Doutorado: (2) .

Integrantes: Tomas Hrbek - Integrante / Izeni Pires Farias - Integrante / William Rangel Vasconcelos - Integrante / Maristerra Lemes - Integrante / Edvaldo Pereira Mota - Integrante / Albertina Pimentel Lima - Coordenador / Pedro Ivo Simões - Integrante / Rafael Soares de Arruda - Integrante / Daniela Maria Leroy e Vieira - Integrante.
Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.Número de orientações: 1
2006 - 2009
Genética populacional de Gavião-Real (Harpia harpyja) no Brasil: Variabilidade genética de indivíduos representantes de três biomas Brasileiros (Amazônia, Mata Atlântica e Pantanal)

Descrição: O gavião-real ocorre nas florestas da região Neotropical e sua distribuição é ampla no Brasil, onde existem registros principalmente na Amazônia e Mata Atlântica. Entre esses biomas existe um corredor de vegetação aberta com conexões florestais, onde também existem alguns registros da espécie. As florestas brasileiras têm sido drasticamente reduzidas pela ação antrópica, o que tem promovido a perda de habitat para o gavião-real. Agravando ainda mais a situação, muitos indivíduos têm sido removidos da natureza. Essos processos antrópico faz do gavião-real uma espécie vulnerável que ainda não teve seu status modificado na lista das espécies ameaçadas do Brasil e da IUCN, onde consta como quase ameaçada. O objetivo principal deste estudo foi determinar e avaliar a distribuição da variabilidade genética do gavião-real no Brasil. Para isso foi realizada uma análise conjunta dos dados genéticos da região controle do DNAmt e microssatélites nuclear em uma amostragem extensiva do gavião-real, com sexo determinado geneticamente..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Doutorado: (1) .

Integrantes: Tomas Hrbek - Integrante / Izeni Pires Farias - Integrante / Aureo Banhos dos Santos - Coordenador / Tânia Margarete Sanaiotti - Integrante.
2006 - 2009
Quantitative genetic basis of vertebrate senescence and developmental diapause

Descrição: We propose to combine phylogenetics, life history data, QTL analyses and selection experiments to study senescence, developmental diapause and associated life history traits in the fish super-family Aplocheiloidei. This super-family contains species that lay continuously developing eggs, as well as species that lay eggs undergoing up to three developmental diapauses, and many species with more intermediate developmental conditions. Our analyses suggest that developmental diapause has five or more independent origins within this super-family; three independent origins in South America and at least two independent origins in Africa. Anatomical studies of eggs demonstrate that there are specific physiological and developmental adaptations associated with developmental diapause. Ecological studies indicate that senescence and life-span, and developmental diapause have clear ecological correlates, and respond to selection. The specific goals of the current proposal thus are to: 1) characterize developmental diapause in representative subset of species in the super-family, 2) do a laboratory selection experiment on developmental diapause length, 3) do a laboratory selection experiment on life-span, 4) investigate the correlates of developmental diapause length and life-span, 5) generate of a F2 intercross based on two parental strains with differing lengths of developmental diapause, 6) generate of a F2 intercross based on two parental strains with differing life-span lengths, 7) perform a Quantitative Trait Locus (QTL) analysis of the developmental genetic basis of diapause and life-span, 8) generate an F10 advanced intercross (AI) lines for fine-mapping of QTL regions identified in F2 intercross analysis, and 9) generate recombinant inbreed (RI) lines and their derivatives for narrowing down QTL confidence intervals, for gene discovery, sequencing and quantitative PCR analysis of candidate genes identified within QTL regions once QTL regions have been reduced to 1 cM..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) .

Integrantes: Tomas Hrbek - Coordenador / Silvia Planas - Integrante.
Financiador(es): National Institute Of Health - Auxílio financeiro.
2006 - Atual
Aplicações de métodos biotecnológicos para o estudo da reprodução em pirarucu (Arapaima gigas), um peixe economicamente importante para a Amazônia

Descrição: Existem dois problemas importantes sobre o conhecimento dos mecanismos reprodutivos do pirarucu que, se solucionados, seriam de grande ajuda para as pesquisas de criação de pirarucu em cativeiro e em lagos semi-abertos. São eles: a determinação da paternidade (ou maternidade) dos filhotes como uma estratégia para se conhecer o padrão de reprodução da espécie (contribuindo para melhorar as condições de criação em cativeiro, mantendo a diversidade genética das matrizes); e a questão da determinação do sexo nos indivíduos ainda juvenis e mesmo nos adultos. O habitat desses animais normalmente dificulta as observações do seu comportamento reprodutivo e de seus padrões de parentesco. Essas duas questões podem ser resolvidas com a ajuda de métodos da biologia molecular. Seria mais uma contribuição dos métodos biotecnológicos para as pesquisas aplicadas ao manejo e conservação das espécies amazônicas. Desta forma nosso projeto pretende utilizar marcadores moleculares de microssatélites, para análise de parentesco em pirarucu (Arapaima gigas), com o intuito de fornecer informações sobre o perfil genético da prole e o padrão do sistema reprodutivo de espécie; e desenvolver marcadores moleculares de sexo para Arapaima gigas através da utilização da técnica de AFLP..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) .

Integrantes: Tomas Hrbek - Integrante / Marcelo Crossa - Integrante / Izeni Pires Farias - Coordenador / Waleska Gravena - Integrante / Adam Souza de Alencar Leão - Integrante / Alexandre Honczaryk - Integrante.
Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
2005 - 2010
Phylogenetic systematics and evolution of complex life-histories in the Cyprinodontiformes

Descrição: A multi-gene analysis is being used in an investigation of the phylogenetic relationships of fishes of the order Cyprinodontiformes. Preliminary analysis suggests a high concordance with global geological history. This hypothesis contradicts previously proposed phylogenetic hypothesis based on morphological data. Analysis of complex life-histories and morphologies suggests multiple, phylogenetically-independent evolutionary instances of diapausing eggs, annualism, copulatory organs, internal fertilization, live-bearing and maternal provisioning. The conclusions derived from the molecular hypothesis suggest many more phylogenetically-independent origins of complex life-histories and associated morphologies. While life-histories appear to repeatedly evolve in ecologically appropriate circumstances, similarities in morphologies and in the development of these morphologies begs the question of whether the underlying developmental genetic basis of complex life-histories and morphologies evolved convergently or due to parallelism..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (1) .

Integrantes: Tomas Hrbek - Coordenador / Donald C. Taphorn - Integrante / Claudia Pereira de Deus - Integrante / Izeni Pires Farias - Integrante / Eduardo Rodrígues de Souza - Integrante / Dania M. Rodríguez - Integrante.
Financiador(es): American Killifish Association - Auxílio financeiro / National Science Foundation - Auxílio financeiro.
Número de produções C, T & A: 27 / Número de orientações: 2
2005 - 2008
Genética, conservação e manejo do fauna aquática do várzea Amazônica

Descrição: O presente projecto tem por objetivo caracterizar e delimitar populações de espécies aquáticas chaves através de análises genéticas para subsidiar o desenvolvimento de estratégias regionais e políticas para a conservação e manejo da fauna aquática da várzea Amazônica. É evidente que um dos grandes problemas para o manejo e conservação dos recursos da fauna da várzea na Amazônia é a falta de informações sobre a exploração e sua biologia em ambiente natural, assim como sua integração com as condições de vida do ribeirinho. A aquisição de conhecimento sobre a genética populacional para cada espécie de interesse é de grande importância para o manejo das espécies estudadas e, conseqüentemente para sua utilização e conservação com maior eficiência por parte das comunidades ribeirinhas, que são os principais atores a contribuir para a conservação e desenvolvimento sustentável na Amazônia. Nossa proposta envolverá um estudo de avaliação genético-populacional da fauna da várzea que inclui as espécies de peixes economicamente importantes, quelônios e crocodilianos, bem como uma abordagem genético-conservacionista das espécies de mamíferos aquáticos. Por pertencerem a um grupo de grande valor econômico, tais espécies de peixes e répteis da várzea estão tradicionalmente sujeitos às mais variadas formas de exploração, legal e/ou ilegal. Os peixes-bois, com comércio clandestino, e os botos, sendo utilizados como iscas para algumas espécies de peixes, fazem desses mamíferos aquáticos símbolos para conservação de nossa fauna aquática da várzea Amazônica e deverão ser mais bem conhecidos sob os aspectos biológicos, bem como serem melhor compreendidos e conservados pelos ribeirinhos. Nossos resultados serão combinados aos resultados da sub-rede, para um melhor entendimento dos aspectos biológico-populacionais das espécies e contribuirão para a elaboração de estratégias de conservação e manejo regionais da fauna da várzea..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (2) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (4) .

Integrantes: Tomas Hrbek - Integrante / Luis Alberto dos Santos Monjeló - Integrante / Andréa Martins Cantanhede - Integrante / Vera Maria Ferreira da Silva - Integrante / Izeni Pires Farias - Coordenador / William Rangel Vasconcelos - Integrante / Maria das Neves Viana - Integrante / Jacqueline da Silva Batista - Integrante / Yane Santos Almeida - Integrante / Mario da Silva Nunes - Integrante / Daniel Toffoli Ribeiro - Integrante / Waleska Gravena - Integrante / Manuela Villar Amado - Integrante / Edvaldo Pereira Mota - Integrante / Kyara Formiga Aquino - Integrante / Themis de Jesus da Silva - Integrante / Eduardo Rodrígues de Souza - Integrante / Natasha Verdasca Meliciano - Integrante / Maria da Conceição Freitas Santos - Integrante / Kelmer Batalha Passos - Integrante / Pedro Senna Taylor Bittencourt - Integrante.
Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Número de produções C, T & A: 56 / Número de orientações: 5
2004 - 2007
Avaliação multidisciplinar para a implementação de um sistema de manejo de lagos visando à conservação do pirarucu (Arapaima gigas) em ambientes naturais do Estado do Amazonas

Descrição: reconhecida importância comercial do pirarucu (Arapaima gigas) causou uma situação preocupante com relação aos estoques naturais, uma vez que já foi detectada uma diminuição no volume de desembarque e no tamanho médio das mantas desembarcadas, levando muitos administradores de pesca e pesquisadores a afirmar que o recurso se encontra em situação de sobrepesca. No estado do Amazonas a pesca do pirarucu encontra-se proibida devido ao decréscimo da produção. Porém, o comércio ilegal continua acontecendo. É evidente que um dos grandes problemas para o manejo do pirarucu na Amazônia é a falta de informações sobre a pesca e sua biologia em ambiente natural, assim como as condições de vida do pescador. Estudos e experiências comunitárias recentes estão gerando informações importantes sobre a realidade da pesca do pirarucu, e seu potencial produtivo em áreas de desenvolvimento sustentável (RDS Mamirauá no Estado do Amazonas) e de uso comum da União (Ilha de São Miguel, ilha de Ituqui e a região do Tapará, Estado do Pará). Embora existam diferenças na situação legal dessas áreas, as formas de manejo são semelhantes e se apóiam na avaliação e monitoramento dos estoques e na participação efetiva das comunidades no controle do acesso aos lagos, esforço de pesca, fiscalização e, em alguns casos, na comercialização. Os componentes bio-ecológicos, sociais e econômicos na Amazônia constituem um tripé que determina as formas de uso dos recursos naturais, cujo conhecimento e avaliação permite explicar como o homem amazônico, principalmente "o ribeirinho", usufrui os recursos aquáticos. Assim, este projeto visa fornecer elementos para o manejo e gestão deste recurso pesqueiro da Amazônia considerando sua distribuição, a abundância, a dinâmica populacional, os níveis de variabilidade genética das populações explotadas, a pesca, as formas de organizações dos pescadores e suas relações com o mercado, e as tecnologias apropriadas para um melhor aproveitamento do recurso..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissional: (4) / Doutorado: (4) .

Integrantes: Tomas Hrbek - Integrante / Luis Alberto dos Santos Monjeló - Integrante / Izeni Pires Farias - Coordenador / Wallice Duncan - Integrante / Maria das Neves Viana - Integrante / Jacqueline da Silva Batista - Integrante / Elisabeth Farias Vieira - Integrante / Keid Nolan Silva Sousa - Integrante / Tony Marcos Porto Braga - Integrante / Roseane de P. G. Moraes - Integrante / Guillermo Moisés Bendezú Estupinán - Integrante / Antônio José Inhamuns da Silva - Integrante / Pedro Roberto de Oliveira - Integrante / Charles Henry Faria Júnior - Integrante / José Fernandes Barros - Integrante / Oscar Tadeu Ferreira da Costa - Integrante / Maria Lúcia Góes de Araújo - Integrante.
Financiador(es): Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado do Amazonas - Auxílio financeiro.
Número de produções C, T & A: 20
2004 - 2007
Genética das populações do macaco Sauim-de-coleira (Saguinus bicolor) : implicações para conservação

Descrição: Saguinus bicolor é o primata amazônico mais ameaçado e menos estudado, apesar de ocorrer em áreas verdes dentro da cidade de Manaus. Apenas um trabalho sobre ecologia e comportamento de um único grupo foi feito durante um ano. Os demais artigos existentes sobre a espécie se referem principalmente à distribuição geográfica, sugerindo que S. bicolor está altamente ameaçado de extinção, por ter sua distribuição restrita à região de Manaus e que vem sendo reduzida nos últimos anos, se concentrando cada vez mais no pólo de desenvolvimento da cidade de Manaus. Apesar da grande ameaça causada pelo crescimento urbano da cidade de Manaus é importante o estudo de várias áreas da biologia deste animal, os quais os resultados virão subsidiar planos de conservação para esta espécie que se encontra cada vez mais isolada em fragmentos florestais. Portanto, estudos genéticos dos grupos utilizando marcadores moleculares de microssatélites são imprescindíveis para o desenvolvimento de um plano de manejo para a conservação desta espécie..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) .

Integrantes: Tomas Hrbek - Integrante / Wancley Garcia Santos - Integrante / Marcelo Gordo - Coordenador / Izeni Pires Farias - Integrante.
Financiador(es): Ministério do Meio Ambiente e da Amazonia Legal - Auxílio financeiro.
Número de produções C, T & A: 4 / Número de orientações: 1
2004 - 2007
Filogeografia e genética das populaces de peixe ornamental acará-discus (Symphysodon spp.)

Descrição: Ornamental fishes of the Rio Negro region account for 90% of the ornamental fishes exported from the State of Amazonas, Brazil. It is estimated that at least 35 million individuals, over 85% of which are the cardinal tetra (Paracheirodon axelrodi), are exported annually from Manaus. Significant portion of the remaining 15% are the highly-valuable discus fish (Symphysodon discus and S. aequifasciatus). The export value of these fish is estimated to be over $4.5 million, and at least 10,000 Amazonians take part in the business. The ornamental fish industry depends on extractive activities which are promoted as a viable and sustainable alternative to deforestation of the region. However, history of extractive activities in the Amazon basin has repeatedly shown that in majority cases extractive activities are not sustainable. By analyzing the distribution of genetic diversity within and between collecting localities, and comparing these results among species, I will address to what extent, if any, have populations of these heavily exploited aquarium fishes been impacted by commercial harvesting. These results will be used to access whether current levels of harvesting are sustainable. If harvested species show negative impact of overexploitation, I will work with management agencies to devise a sustainable harvest policy..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Doutorado: (1) .

Integrantes: Tomas Hrbek - Integrante / Izeni Pires Farias - Coordenador / Manuela Villar Amado - Integrante.
Financiador(es): International Foundation for Science - Auxílio financeiro.
Número de produções C, T & A: 4 / Número de orientações: 1
2004 - 2005
Avaliação da variabilidade genética de duas espécies de peixes ornamentais da Reserva de Desenvolvimento Sustentável Mamirauá: implicações para o manejo sustentado e conservação

Descrição: Entre os peixes de valor econômico de Mamirauá o aruanã (Osteoglossum bicirrhosum, família Osteoglossidae) e o acará-disco (Symphysodon aequeifasciatus, família Ciclidae) merecem destaque uma vez que estão na lista dos peixes mais valorizados pelo comércio. Os peixes ornamentais estão entre os principais recursos aquáticos considerados renováveis na Amazônia, com um grande potencial para servirem como modelo de manejo sustentável. A exploração destes recursos foi um dos principais meios de subsistência das comunidades ribeirinhas da RDS Mamirauá há alguns, o que levou a escassez de algumas espécies, principalmente do acará-disco o qual foi caracterizado como sobrepescado nesta região. Devido a este fato a pesca de peixes ornamentais foi proibida na RDSM. Apesar da importância deste recurso para os ribeirinhos, o conhecimento necessário ainda é incipiente no que tange a diversidade, ecologia, genética das populações, o estado atual dos estoques naturais, as características dos ambientes em que o ciclo de vida das mesmas se desenvolve e o perfil sócio-econômico da sua exploração. Na etapa inicial do projeto, o grupo se propõe a realizar um diagnóstico da situação atual através da coleta de informações sobre a biologia e a avaliação da variabilidade genética das populações de acará-disco e aruanã nas 11 micro-bacias da RDSM. Com os resultados deste projeto poderemos avaliar se este recurso já encontra-se recuperado do processo de sobrepesca pelo qual passou. Com isto pretende-se definir áreas prioritárias para preservação e áreas para exploração, e finalmente, contribuir para a criação de um modelo de manejo sustentável que considere todos os aspectos genéticos e biológicos destas espécies. O projeto tem como meta procurar meios de preservar a diversidade e promover a sustentabilidade dos recursos aquáticos explorados pelos ribeirinhos, fornecendo subsídios para um manejo efetivo destes recursos..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (1) .

Integrantes: Tomas Hrbek - Integrante / Iracilda Sampaio - Integrante / Izeni Pires Farias - Coordenador.
Financiador(es): Instituto de Desenvolvimento Sustentável Mamirauá - Auxílio financeiro.
2004 - 2005
Genética e ecologia molecular das populações de crocodilianos da Amazônia

Descrição: O presente projeto tem como objetivo principal acessar o material genético de populações das quatro espécies de crocodilianos (ou cinco, caso se considere o status específico de Caiman yacare) da Amazônia. Para isso, nossos objetivos específicos são: a) Sobre uma abordagem Amazônica: 1. Descobrir como a variabilidade genética das populações naturais de crocodilianos está atualmente distribuída na geografia amazônica; 2. Constatar a presença ou ausência de eventos evolutivos históricos nos padrões genéticos e demográficos intra-específicos associando com a paleogeografia da Amazônia; 3. Inferir se as populações encontram-se em equilíbrio genético uma vez que sofreram uma grande exploração no passado; b) Sobre uma abordagem específica para o rio Madeira: 4. Avaliar o status das espécies Caiman crocodilus, Caiman yacare, Paleosuchus trigonatus e Paleosuchus palpebrosus através das análises morfológica, ecológica e genética; c) Sobre uma abordagem combinada de a e b: 5. Diagnosticar possíveis unidades de manejo com base nas análises genéticas entre as populações..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (1) .

Integrantes: Tomas Hrbek - Integrante / Ronis Da Silveira - Integrante / Izeni Pires Farias - Coordenador / William Rangel Vasconcelos - Integrante / George Henrique Rebêlo - Integrante / William Ernest Magnusson - Integrante / Zilca Maria da Silva Campos - Integrante / Fábio de Lima Muniz - Integrante.
Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Número de produções C, T & A: 1
2003 - 2005
Estimativa da variabilidade genética inter e intra-populacionais do jacaré-açu (Melanosuchus niger) e do jacaré-tinga (Caiman crocodilus) com implicações para a conservação e o manejo destas espécies na Amazônia Brasileira

Descrição: As cinco espécies de crocodilianos que ocorrem no Brasil pertencem a Família Alligatoridae, quatro destas ocorrem na Amazônia. O jacaré-tinga (Caiman crocodilus crocodilus) e o jacaré-açú (Melanosuchus niger) são os jacarés mais abundantes nas florestas alagáveis da Amazônia Brasileira. São animais de grande valor econômico e estão tradicionalmente sujeitos as mais variadas formas de manejo. Esta pesquisa tem como objetivo principal estimar a variabilidade genética e comparar a estrutura genética inter e intrapopulacional destas duas espécies de crocodilos nos principais tributários da Amazônia. Esperamos que os resultados provenientes deste projeto possam ser considerados durante a implementação de planos de manejo das espécies em questão, e desta forma contribuir para a conservação de suas diversidades gênicas..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) .

Integrantes: Tomas Hrbek - Coordenador / Ronis Da Silveira - Integrante / Luis Alberto dos Santos Monjeló - Integrante / John Thorbjarnarson - Integrante / Izeni Pires Farias - Integrante / William Rangel Vasconcelos - Integrante.
Financiador(es): The Wildlife Conservation Society - Auxílio financeiro / The Nature Conservancy Of Brasil - Auxílio financeiro.
2002 - 2006
Genetic basis of dietary obesity

Descrição: Genetic variation in response to high fat diets is important in understanding the recent secular trends that have led to increases in obesity and Type II diabetes mellitus. The examination of quantitative trait loci (QTL) both for obesity and diabetes-related traits and their responses to a high fat diet can be effectively addressed in mouse models systems, including the LGXSM recombinant inbred (RI) mouse strains. A wide range of obesity and diabetes-related traits were measured in animals from 16 RI strains with 8 animals of each sex fed a high or low fat diet from each strain. Marker associations were measured at 506 microsatellite markers spread throughout the mouse genome using a nested ANOVA. Locations with significant effects on the traits themselves and/or trait dietary responses were identified after correction for multiple comparisons by limiting the false detection rate. Non-syntenic associations of marker genotypes were common at QTL locations so that the significant results were limited to loci still significant in multiple QTL models. We discovered 91 QTLs at 39 locations. Many of these locations (n = 31) also showed genetic effects on dietary response, typically because the loci produced significantly larger effects on the high fat diet. Fat depot weights, leptin levels, and body weight at necropsy tended to map to the same locations and were responsible for a majority of the dietary response QTLs. Basal glucose levels and response to glucose challenge mapped together in locations distinct from those affecting obesity. These QTL locations form a panel for further research and fine-mapping of loci affecting obesity and diabetes-related traits and their responses to high fat feeding..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.

Integrantes: Tomas Hrbek - Integrante / James M. Cheverud - Coordenador.
Financiador(es): National Institute Of Health - Auxílio financeiro.
Número de produções C, T & A: 7
1999 - 2002
Role of vicariant events in generation biological diversity

Descrição: I will test the temporal concordance assumption of geographical speciational models using the genus Aphanius as a model system. Specifically, I will test speciational hypotheses derived from Messinian and Plio-Pleistocene Mediterranean Sea level fluctuations, and closing of the Tethys Sea. I will also test concordance of haplotypic, morphologic, and geologic data in a Turkish species complex, results additionally relevant to conservation..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) .

Integrantes: Tomas Hrbek - Coordenador.
Financiador(es): National Science Foundation - Bolsa.
Número de produções C, T & A: 25
1993 - 1999
Life-history evolution, phylogenetic systematics, population genetics and biogeography of Rivulidae

Descrição: In this thesis I investigate the microevolutionary and the macroevolutionary processes resulting in the spectacular diversification of aplocheiloid killifishes. In Part I, I reconstruct the phylogenetic relationships of the suborder Aplocheiloidei in order to investigate the role of Gondwanaland breakup in the speciation of this group. I investigate the role of major macroevolutionary processes, in this case vicariance events associated with the breakup of Gondwanaland, on phylogenesis. The origins of annualism and developmental diapause are addressed. The straightforward use of the macroevolutionary approach is appropriate. In Part II, I reconstruct the phylogenetic relationships of the family Rivulidae, a nested subset of the Aplocheiloidei. I also investigate the role of vicariance on phylogenesis in this group of South American fishes; however, the main focus of this study is the origin of annualism and developmental diapause in these fishes. Again, the straightforward use of the macroevolutionary approach. In Part III, I investigate the population genetic structure of two South American killifish species. I employ statistically rigorous methods that are able to differentiate those groups appropriate for microevolutionary analysis, from those that are not. Partitioning variation in such a manner leads to valid inferences regarding the microevolutionary and macroevolutionary processes responsible for the observed microevolutionary and macroevolutionary patterns. Finally in Part IV, I review the taxonomic history of the Aplocheiloidei, and look at the taxonomic implications of the molecular results..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.

Integrantes: Tomas Hrbek - Coordenador / Allan Larson - Integrante.
Financiador(es): National Science Foundation - Auxílio financeiro.
Número de produções C, T & A: 24


Projetos de desenvolvimento


2010 - 2013
MRI-R2: Acquisition of genomic and bioinformatic technology to promote research at the University of Puerto Rico

Descrição: Overview: The Sequencing and Genotyping facility (SGF) at the University of Puerto Rico, Rio Piedras Campus (UPR-RP) proposes to acquire a Roche 454 GS Titanium next generation sequencer and computational infrastructure for analysis of genomic data. The SGF serves as a catalyst for the transformation of UPR-RP into a full fledged Hispanic minority serving research 1 university through genome enabled research. The mission of SGF is to provide a) state-of-the-art research support for the University of Puerto Rico scientific community, and research and academic institutions in Puerto Rico and the Caribbean, c) data analysis workshops, d) training of human resources at the graduate, undergraduate and post-doctoral levels. SGF has the following strengths: a) demonstrated capacity to generate efficiently and rapidly genomic data, b) a proven Center management plan, c) a commitment to fomenting inter- and trans disciplinary collaborations among researchers within and outside the University of Puerto Rico system, d) a focus on student training and faculty capacitation that enables participants to address research questions through the use of genomic and bioinformatics approaches. The goal of SGF is to become the leading provider of genomic services to the UPR-RP community, and to researchers throughout Puerto Rico and the Caribbean region. As a proof of the importance of SGF to the research community, we have recently received a support though an NIH-COBRE grant in the form of a salaried five year genomics specialist position and a service contract for our ABI 3730xl. The University has further committed itself to the renovation of the SGF facility, and to the construction of a bioinformatics laboratory that will process and store genomic data generated by the SGF. Research Activities of the Components: Our unifying theme is biodiversity research in the Neotropics. The acquisition of the Roche 454 GS Titanium will significantly enhance research productivity and the t.
Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento.

Integrantes: Tomas Hrbek - Coordenador.
2009 - Atual
Centro de Estudos Integrados da Biodiversidade Amazônica (CENBAM)

Descrição: O instituto tem por objetivo integrar as pesquisas biológicas na Amazônia em cadeias de produção científico/tecnológico eficientes. Atualmente, a biodiversidade amazônica não está sendo conservada ou aproveitada eficientemente por falta de conhecimento científico/tecnológico. As poucas pesquisas estão concentradas perto dos maiores centros populacionais, Belém e Manaus. Os centros regionais enfrentam um circulo vicioso em que a falta de recursos desestimula a fixação de pessoas qualificadas no interior, a falta de pessoal qualificado resulta em pouca produção científica, a falta de produção impede a captação de recursos, e a falta de recursos dificulta a capacitação de pessoas locais. O IBA atuará diretamente na capacitação de pessoas locais em diversos níveis, desde assistentes de campo e parataxonomistas até alunos de escolas, técnicos de laboratório e alunos de pós-graduação, além de viabilizar a adequação de infra-estrutura, como museus, herbários e coleções vivas, a instalação e recuperação de equipamentos e laboratórios, e o intercâmbio necessário para o aproveitamento dos recursos disponíveis. O planejamento e execução serão realizados em colaboração com os usuários das informações, como laboratórios de biotecnologia, gestores de reservas biológicas, áreas de produção madeireira e órgãos responsáveis para avaliação de impactos ambientais e monitoramento de áreas de influência de grandes obras..
Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento.
Alunos envolvidos: Doutorado: (1) .

Integrantes: Tomas Hrbek - Integrante / Jorge Ivan Rebêlo Porto - Integrante / Izeni Pires Farias - Integrante / Maria Nazaré Ferreira da Silva - Integrante / William Ernest Magnusson - Coordenador / Vera Scarpassa - Integrante / Charles Roland Clement - Integrante.
Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado do Amazonas - Auxílio financeiro.Número de orientações: 1
2007 - Atual
Center for Applied Tropical Ecology and Conservation: Biodiversity conservation under the scenario of climate change

Descrição: Overview: The Center for Applied Tropical Ecology (CATEC) serves as a catalyst for systemic change in educational, research development and structural institutional transformation in a Hispanic minority serving institution. CATEC's mission is to promote a) training of human resources at the graduate, undergraduate and post-doctoral levels, b) state-of-the-art research in conservation biology and environmental issues, c) infrastructure improvement, and d) production of relevant results for policy and conservation management. The Center has the following strengths: a) a focus on student training and faculty development that enables participants to address research questions related to complex environmental and conservation issues facing the Neotropics, b) a proven Center management plan, c) a demonstrated capacity to do competitive research at multiple biological scales, from molecular genetics to ecosystem functioning, d) a commitment to inter- and trans disciplinary collaborations among research fellows, and with stakeholders and other national and international institutions, and e) a strong strategic academic-governmental alliance with state and federal agencies. Research Activities of the Components: Our unifying theme is biodiversity conservation under the scenario of climate change. The questions addressed were chosen for their potential to be applied at the scale of the Caribbean Basin, or to the Tropics in general, and to serve as foundations for projects at the regional or international level. The program focuses on three areas: The Molecular Ecology, Evolution and Genetics (MEEG) area, the Species and Population Management (SPM) area, and the Ecosystem Processes (EP) area. All projects foster inter- and trans disciplinary synergies and interactions among research fellows within each thrust area, with other thrust areas, the University of Puerto Rico, and the local, national and international scientific communities..
Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento.
Alunos envolvidos: Graduação: (10) / Mestrado acadêmico: (7) / Doutorado: (4) .

Integrantes: Tomas Hrbek - Integrante / Eugenio Santiago-Valentin - Integrante / Jason T. Rauscher - Integrante / Elvira Cuevas - Coordenador / Elvia J. Melendez-Ackerman - Integrante.
Financiador(es): The National Science Foundation - Bolsa / The National Science Foundation - Auxílio financeiro.


Membro de corpo editorial


2015 - Atual
Periódico: Journal of Heredity
2015 - Atual
Periódico: PEERJ
2013 - Atual
Periódico: Frontiers in Ecology and Evolution
2007 - 2007
Periódico: Genetics and Molecular Biology


Revisor de periódico


2006 - Atual
Periódico: Ecological applications (1051-0761)
1998 - Atual
Periódico: Molecular Phylogenetics and Evolution
2005 - Atual
Periódico: Animal Conservation
2005 - Atual
Periódico: Journal of Fish Biology (0022-1112)
2005 - Atual
Periódico: Journal of Zoological Systematics and Evolutionary Research (0947-5745)
2000 - Atual
Periódico: Copeia
1999 - Atual
Periódico: Marine Biology (Berlin) (0025-3162)
1999 - Atual
Periódico: Molecular Biology and Evolution (0737-4038)
1999 - Atual
Periódico: Journal of Molecular Evolution (0022-2844)
2000 - Atual
Periódico: Evolution
2001 - Atual
Periódico: Gene (Amsterdam) (0378-1119)
2001 - Atual
Periódico: Biological Journal of the Linnean Society
2003 - Atual
Periódico: Behaviour (Leiden) (0005-7959)
2006 - Atual
Periódico: Micron (Oxford) (0968-4328)
2005 - Atual
Periódico: Conservation genetics
2006 - Atual
Periódico: Genetics and Molecular Biology
2005 - Atual
Periódico: Zootaxa (Auckland)
2007 - Atual
Periódico: Journal of Zoology
2007 - Atual
Periódico: Molecular Ecology
2007 - Atual
Periódico: Zoologica Scripta
2007 - Atual
Periódico: Zoology (Jena)
2008 - Atual
Periódico: BMC Evolutionary Biology (Online)
2009 - Atual
Periódico: Journal of Biogeography (Print)
2009 - Atual
Periódico: ZooKeys
2009 - Atual
Periódico: Marine Biology (Berlin)
2010 - Atual
Periódico: Environmental Biology of Fishes
2013 - Atual
Periódico: Plos One


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Animal.
2.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Quantitativa.
3.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.
4.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.
5.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Zoologia / Subárea: Taxonomia dos Grupos Recentes.
6.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Zoologia / Subárea: Morfologia dos Grupos Recentes.


Idiomas


Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Alemão
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Tcheco
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Espanhol
Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.
Francês
Compreende Razoavelmente, Fala Pouco, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.
Português
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.


Prêmios e títulos


2010
Pesquisador visitante - UFAM, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico.
2004
Senior Scholar (lecturing/research award) - Brazil, J. William Fulbright Foundation.
1997
Raney Award, American Society of Ichthyologists and Herpetologists.
1993
NSF pre-doctoral fellowship (honorable mention), National Science Foundation.


Produções



Produção bibliográfica
Citações

Web of Science
Total de trabalhos:87
Total de citações:1403
Fator H:21
Hrbek, Tomas  Data: 10/04/2018

SCOPUS
Total de trabalhos:87
Total de citações:1614
Hrbek, T  Data: 10/04/2018

Outras
Total de trabalhos:116
Total de citações:2455
Hrbek, T  Data: 10/04/2018

Artigos completos publicados em periódicos

1.
COLLINS, RUPERT A2018COLLINS, RUPERT A ; Hrbek, Tomas . An In Silico Comparison of Protocols for Dated Phylogenomics. SYSTEMATIC BIOLOGY, v. 67, p. 1-18, 2018.

2.
SILVA, FELIPE E.2018SILVA, FELIPE E. ; COSTA-ARAÚJO, RODRIGO ; BOUBLI, JEAN P. ; SANTANA, MARCELO I. ; FRANCO, CAETANO L. B. ; BERTUOL, FABRÍCIO ; NUNES, HERMANO ; DE SOUZA SILVA-JÚNIOR, JOSÉ ; FARIAS, IZENI ; Hrbek, Tomas . In search of a meaningful classification for Amazonian marmosets: Should dwarf marmosets be considered Mico congenerics?. ZOOLOGICA SCRIPTA, v. 47, p. 133-143, 2018.

3.
COLLINS, RUPERT A.2018COLLINS, RUPERT A. ; BIFI, ALESSANDRO G. ; DE OLIVEIRA, RENILDO R. ; RIBEIRO, EMANUELL D. ; LUJAN, NATHAN K. ; RAPP PY-DANIEL, LÚCIA H. ; Hrbek, Tomas . Biogeography and species delimitation of the rheophilic suckermouth catfish genus Pseudolithoxus (Siluriformes: Loricariidae), with the description of a new species from the Brazilian Amazon. SYSTEMATICS AND BIODIVERSITY, v. 15, p. 1-13, 2018.

4.
MACHADO, VALERIA N.2018MACHADO, VALERIA N. ; COLLINS, RUPERT A. ; OTA, RAFAELA P. ; ANDRADE, MARCELO C. ; FARIAS, IZENI P. ; Hrbek, Tomas . One thousand DNA barcodes of piranhas and pacus reveal geographic structure and unrecognised diversity in the Amazon. Scientific Reports, v. 8, p. 8387, 2018.

5.
MOTTA, JESSICA2018MOTTA, JESSICA ; MENIN, MARCELO ; ALMEIDA, ALEXANDRE P. ; Hrbek, Tomas ; Farias, Izeni Pires . When the unknown lives next door: a study of central Amazonian anurofauna. ZOOTAXA (ONLINE), v. 4438, p. 79-104, 2018.

6.
CARNEIRO, JEFERSON2018CARNEIRO, JEFERSON ; SAMPAIO, IRACILDA ; DE SOUSA E SILVA-JÚNIOR, JOSÉ ; FARIAS, IZENI ; Hrbek, Tomas ; PISSINATTI, ALCIDES ; SILVA, RONYLSON ; MARTINS-JUNIOR, ANTÔNIO ; BOUBLI, JEAN ; FERRARI, STEPHEN FRANCIS ; SCHNEIDER, HORACIO . Phylogeny, molecular dating and zoogeographic history of the titi monkeys ( Callicebus , Pitheciidae) of eastern Brazil. MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION, v. 124, p. 10-15, 2018.

7.
MARTÍNEZ, JOSÉ GREGORIO2017MARTÍNEZ, JOSÉ GREGORIO ; MACHADO, VALÉRIA NOGUEIRA ; CABALLERO-GAITÁN, SUSANA J. ; SANTOS, MARIA DA C. FREITAS ; ALENCAR, RODRIGO MACIEL ; ESCOBAR L., MARIA DORIS ; Hrbek, Tomas ; Farias, Izeni Pires . SNPs markers for the heavily overfished tambaqui Colossoma macropomum, a Neotropical fish, using next-generation sequencing-based de novo genotyping. Conservation Genetics Resources, v. 9, p. 29-33, 2017.

8.
FRAZAO, L.2017FRAZAO, L. ; VIANA, J. A. ; OLIVEIRA, M. E. ; CARVALHO, VINÍCIUS TADEU DE ; HRBEK, T. . New record and revised distribution map of Pseudoboa martinsi Zaher et al., 2008 (Squamata: Dipsadidae) in state of Amazonas, Brazil. HERPETOLOGY NOTES, v. 10, p. 193-195, 2017.

9.
MENIN, MARCELO2017MENIN, MARCELO ; CARVALHO, VINICIUS TADEU DE ; ALMEIDA, ALEXANDRE P. ; GORDO, MARCELO ; OLIVEIRA, DEYLA P. ; LUIZ, LUCIANA F. ; CAMPOS, JULIANA V. ; Hrbek, Tomas . Amphibians from Santa Isabel do Rio Negro, Brazilian Amazonia. PHYLLOMEDUSA: JOURNAL OF HERPETOLOGY, v. 16, p. 183, 2017.

10.
MUNIZ, F. L.2017MUNIZ, F. L. ; CAMPOS, Z. ; HERNÁNDEZ RANGEL, S. M. ; MARTÍNEZ, J. G. ; SOUZA, B. C. ; de THOISY, B. ; BOTERO-ARIAS, R. ; HRBEK, T. ; FARIAS, I. P. . Delimitation of evolutionary units in Cuvier?s dwarf caiman, Paleosuchus palpebrosus (Cuvier, 1807): insights from conservation of a broadly distributed species. CONSERVATION GENETICS, v. 19, p. 1-12, 2017.

11.
BOUBLI, JEAN P.2017BOUBLI, JEAN P. ; DA SILVA, MARIA N.F. ; RYLANDS, ANTHONY B. ; NASH, STEPHEN D. ; BERTUOL, FABRÍCIO ; NUNES, MÁRIO ; MITTERMEIER, RUSSELL A. ; BYRNE, HAZEL ; DA SILVA, FELIPE E. ; RÖHE, FÁBIO ; SAMPAIO, IRACILDA ; SCHNEIDER, HORACIO ; FARIAS, IZENI P. ; Hrbek, Tomas . How many Pygmy Marmoset ( Cebuella Gray, 1870) species are there? A taxonomic re-appraisal based on new molecular evidence. MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION, v. 120, p. 170-182, 2017.

12.
DE OLIVEIRA, ROBERTA CUNHA2017DE OLIVEIRA, ROBERTA CUNHA ; Santos, Maria da Conceição Freitas ; BERNARDINO, GERALDO ; Hrbek, Tomas ; Farias, Izeni Pires . From river to farm: an evaluation of genetic diversity in wild and aquaculture stocks of Brycon amazonicus (Spix & Agassiz, 1829), Characidae, Bryconinae. HYDROBIOLOGIA, v. 801, p. 75-88, 2017.

13.
VIANA, MARIA DAS NEVES S.2017VIANA, MARIA DAS NEVES S. ; OLIVEIRA, JESSICA DOS ANJOS ; AGOSTINI, MARIA AUGUSTA PAES ; ERICKSON, JOSÉ ; DE MORAIS, GIOVANNE MATIAS ; MONJELÓ, LUIZ ALBERTO DOS SANTOS ; ANDRADE, PAULO CÉSAR M. ; FÉLIX-SILVA, DANIELY ; DE OLIVEIRA JÚNIOR, WALDESSE PIRAGÉ ; SITES, , JACK W. ; VOGT, RICHARD C. ; Hrbek, Tomas ; Farias, Izeni Pires . Population Genetic Structure of the Threatened Amazon River Turtle, Podocnemis sextuberculata (Testudines, Podocnemididae). CHELONIAN CONSERVATION AND BIOLOGY, v. 16, p. 128-138, 2017.

14.
BITTENCOURT, P. S. T.2017BITTENCOURT, P. S. T. ; MARSHALL, B. G. ; HRBEK, T. ; FARIAS, I. P. . Life after a drought: temporal genetic diversity of Paracheirodon axelrodi Schultz, 1956 (Characiformes: Characidae) in the middle Negro River. PAN-AMERICAN JOURNAL OF AQUATIC SCIENCES, v. 12, p. 184-193, 2017.

15.
BYRNE, HAZEL2016BYRNE, HAZEL ; RYLANDS, ANTHONY B. ; CARNEIRO, JEFERSON C. ; ALFARO, JESSICA W. LYNCH ; BERTUOL, FABRICIO ; DA SILVA, MARIA N. F. ; MESSIAS, MARILUCE ; GROVES, COLIN P. ; MITTERMEIER, RUSSELL A. ; FARIAS, IZENI ; Hrbek, Tomas ; SCHNEIDER, HORACIO ; SAMPAIO, IRACILDA ; BOUBLI, JEAN P. . Phylogenetic relationships of the New World titi monkeys (Callicebus): first appraisal of taxonomy based on molecular evidence. FRONT ZOOL, v. 13, p. 10, 2016.

16.
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HRBEK, T.;HRBEK, TOMAS1990HRBEK, T.. Book Review: Cichlid Catalogue des Cichlides/Katalog der Buntbarche (Pisces, Perciformes, Cichlidae Bonaparte 1840). By A.Uferman, R. Allgayer and M. Geerts (1987). Copeia, USA, v. 1990, n.3, p. 594-595, 1990.

Livros publicados/organizados ou edições
1.
MARCON, J. L. ; MENIN, M. ; ARAUJO, M. G. P. ; HRBEK, T. . Biodiversidade Amazônica: Caracterização, Ecologia e Conservação. 1. ed. Manaus, AM: EDUA, 2012. v. 1. 368p .

Capítulos de livros publicados
1.
BOUBLI, J. P. ; HRBEK, T. . Introdução a Biodiversidade Amazônica. In: Jaydione Luiz Marcon; Marcelo Menin; Maria Gracimar Pacheco de Araújo; Tomas Hrbek. (Org.). Biodiversidade Amazônica: caracterização, ecologia e conservação. 1ed.Manaus, AM: EDUA, 2012, v. 1, p. 11-17.

2.
GALETTI JR., P. M. ; RODRIGUES, F. P. ; SOLE-CAVA, A. M. ; MIYAKI, C. Y. ; CARVALHO, D. ; EIZIRIK, E. ; SANTOS, F. R. ; FARIAS, I. P. ; VIANA, J. A. ; OLIVEIRA, L. R. ; WEBER, L. I. ; LAMA, S. N. ; SICILIANO, S. ; FREITAS, T. R. O. ; HRBEK, T. ; MOLINA, W. F. . Genética da conservação brasileira. In: Galetti Jr., Pedro M.;. (Org.). Fundamentos de Genética da Conservação. Ribeirão Preto, SP, Brazil: Editora SBG, 2008, v. 10, p. 244-274.

3.
FARIAS, I. P. ; VASCONCELOS, W. R. ; NUNES, M. S. ; MOTA, E. P. ; HRBEK, T. . Padrões genético-populacionais de peixes da várzea. In: Renno, J.-F.; García-Dávila, C.; Duponchelle, F.; Nuñez, J.. (Org.). Biología de las Poblaciones de Peces de la Amazonía y Piscicultura. Lima, Peru: IIAP - Peru / IRD - Paris, 2006, v. , p. 91-95.

4.
HRBEK, T.; CROSSA, M. ; FARIAS, I. P. . Genética da conservação de Arapaima gigas: implicações para localização de areas protegidas. In: Renno, J.-F.; García-Dávila, C.; Duponchelle, F.; Nuñez, J.. (Org.). Biología de las Poblaciones de Peces de la Amazonía y Piscicultura. Lima, Peru: IIAP - Peru / IRD - Paris, 2006, v. , p. 96-101.

Resumos expandidos publicados em anais de congressos
1.
D'ASSUNÇÃO, A. A. A. ; PORTO, J. I. R. ; HRBEK, T. . Estudo da variabilidade genetica do cardinal (Ostaryophysi: Characiformes: Paracheirodon axelrodi) na bacia do rio Negro. In: I Encontro de Pós-Graduação do Estado do Amazonas e II Mostra POSGRAD/FAPEAM, 2006, Manaus, AM. Anais do I Encontro de Pós-Graduação do Estado do Amazonas e II Mostra POSGRAD/FAPEAM, 2006. v. 1. p. 1-5.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
HRBEK, T.; FARIAS, I. P. . Conservation genetics of fisheries resources of the Amazon basin. In: XIX Encontro Brasileiro de Ictiologia, 2011, Manaus, AM. Anais do XIX Encontro Brasileiro de Ictiologia, 2011.

2.
HRBEK, T.. DNA barcoding approach to the study of community structure of rheophilic fishes of rio Araguaia. In: XIX Encontro Brasileiro de Ictiologia, 2011, Manaus, AM. Anais do XIX Encontro Brasileiro de Ictiologia, 2011.

3.
HRBEK, T.; FARIAS, I. P. . Population structuring and demographic history of Arapaima gigas from the Amazon basin. In: XIX Encontro Brasileiro de Ictiologia, 2011, Manaus, AM. Anais do XIX Encontro Brasileiro de Ictiologia, 2011.

4.
ESCOBAR-LIZARAZO, M. D. ; FARIAS, I. P. ; TAPHORN, D. C. ; LANDINEZ-PARRA, M. A. ; HRBEK, T. . Identificación molecular de las arawanas Osteoglossum ferreirae Kanazawa, 1966 y O. bicirrhosum (Cuvier, 1829) de las cuencas del Orinoco y Amazonas, Suramerica. In: XIX Encontro Brasileiro de Ictiologia, 2011, Manaus, AM. Anais do XIX Encontro Brasileiro de Ictiologia, 2011.

5.
SOUZA, E. R. ; RIBEIRO, L. B. ; FELDBERG, E. ; FARIAS, I. P. ; HRBEK, T. ; GROSS, M. C. . Análise meiótica e mitótica de Fluviphylax simplex e Fluviphylax zonatus (Cyprinodontiformes: Poeciliidae): os menores peixes da Amazônia. In: XIX Encontro Brasileiro de Ictiologia, 2011, Manaus, AM. Anais do XIX Encontro Brasileiro de Ictiologia, 2011.

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OTERO, L. ; VELEZ-ZUAZO, X. ; COLEMAN, R. ; MAJIL, I. ; GIBSON, J. ; DUTTON, P. H. ; HRBEK, T. . Natal origin and genetic diversity of the hawksbill foraging aggregation from Glover?s Reef Atoll, Belize. In: -2011 31st Annual Symposium on Sea Turtle Biology and Conservation, San Diego, CA, USA: Poster ?Natal origin and genetic diversity of the hawksbill foraging aggregation from Glover?s Reef Atoll, Belize?, 2011, San Diego, CA. Anais do 31st Annual Symposium on Sea Turtle Biology and Conservation, 2011.

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Artigos aceitos para publicação
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2.
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3.
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4.
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5.
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6.
HRBEK, T.. DNA barcoding approach to the study of rheophilic fishes of rio Araguaia. 2011. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

7.
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26.
HRBEK, T.. Genes and genetic diversity in natural populations of killifishes. 2002. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

27.
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31.
HRBEK, T.. Geological activity, biological diversity and the conservation of the Aphanius species complex of central Turkey. 2001. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

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HRBEK, T.; MEYER, A. . Closing of the Tethys and the phylogeny of Eurasian killifishes (Cyprinodontiformes: Cyprinodontidae). 2001. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

33.
HRBEK, T.; FARIAS, I. P. ; CROSSA, M. ; MEYER, A. ; CUNHA, J. ; SAMPAIO, I. . Population genetic structure of Arapaima gigas: implications for conservation. 2001. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

34.
HRBEK, T.. Phylogenies are everywhere: Macro to Micro analyses. 2001. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

35.
HRBEK, T.; PARSONS, K. ; MEYER, A. . Sympatric speciation in nature: fact or fiction?. 2000. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

36.
HRBEK, T.. Ecological similarity and genetic diversity in annual and non-annual killifishes. 2000. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

37.
HRBEK, T.; LARSON, A. . Annualism and population structuring in Lake Maracaibo basin killifishes (Rivulidae: Cyprinodontiformes). 1998. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

38.
HRBEK, T.. Molecular phylogeny of the Rivulidae (Cyprinodontiformes) and its relevance to taxonomy. 1997. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

39.
HRBEK, T.; TAPHORN, D. C. ; LARSON, A. . Nested cladistic analysis and population history of Austrofundulus killifishes. 1997. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

40.
HRBEK, T.; LARSON, A. . Gondwanan vicariance and the phylogenetic relationships of aplocheiloid killifishes. 1996. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

41.
HRBEK, T.; TAPHORN, D. C. ; LARSON, A. . Rise of the Andes and the speciation of Austrofundulus (Rivulidae, Cyprinodontiformes). 1996. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

42.
HRBEK, T.. Ecology of annual habitats of the Maracaibo basin, Venezuela. 1995. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).


Produção técnica
Assessoria e consultoria
1.
HRBEK, T.. Julgador de bolsas de estudos da pos-graduação submetidos para NSF. 2010.

2.
HRBEK, T.. Julgador de bolsas de estudos da pos-graduação submetidos para NSF. 2009.

3.
HRBEK, T.. Julgador de bolsas de estudos da pos-graduação submetidos para NSF. 2008.

4.
HRBEK, T.. Julgador de bolsas de estudos da pos-graduação submetidos para NSF. 2007.

5.
HRBEK, T.. Julgador de bolsas para pos-graduação no exterior CAPES/Fulbright. 2004.

Trabalhos técnicos
1.
HRBEK, T.. Parecer de planos de Doctorado e Mestrado no GCBEV-INPA/UFAM. 2012.

2.
HRBEK, T.. Parecer de planos de Doctorado e Mestrado na Ecologia-INPA/UFAM. 2012.

3.
HRBEK, T.. Parecer Ad Hoc - Bolsa de Atração de Jovens Talentos - CAPES/CNPq/FAPs. 2012.

4.
HRBEK, T.. Parecer Ad Hoc - Bolsas no País - Produtividade em Pesquisa - PQ - 2012 (Ecologia). 2012.

5.
HRBEK, T.. Parecer Ad Hoc - Bolsas no País - Produtividade em Pesquisa - PQ - 2012 (Genética Animal). 2012.

6.
HRBEK, T.. Parecer Ad Hoc - Chamada 14/2012 - Universal - Faixa A (Genetica Animal). 2012.

7.
HRBEK, T.. Parecer Ad Hoc - Chamada 14/2012 - Universal - Faixa B (Genetica Animal). 2012.

8.
HRBEK, T.. Parecer Ad Hoc - Chamada 14/2012 - Universal - Faixa A (Ecologia). 2012.

9.
HRBEK, T.. Parecer de planos de Doctorado e Mestrado no GCBEV-INPA/UFAM. 2011.

10.
HRBEK, T.. Parecer de planos de Doctorado e Mestrado na Ecologia-INPA/UFAM. 2011.

11.
HRBEK, T.. Parecer de planos de Doctorado e Mestrado no GCBEV-INPA/UFAM. 2010.

12.
HRBEK, T.. Parecer de projectos de pesquisa submetidos para NSF. 2010.

13.
HRBEK, T.. Parecer de projectos de pesquisa submetidos para SNF. 2010.

14.
HRBEK, T.. Parecer de planos de Doctorado e Mestrado no GCBEV-INPA/UFAM. 2009.

15.
HRBEK, T.. Parecer de projectos de pesquisa submetidos para NSF. 2009.

16.
HRBEK, T.. Parecer de planos de Doctorado e Mestrado no GCBEV-INPA/UFAM. 2008.

17.
HRBEK, T.. Parecer de projectos de pesquisa submetidos para NSF. 2008.

18.
HRBEK, T.. Parecer de planos de Doctorado e Mestrado no GCBEV-INPA/UFAM. 2007.

19.
HRBEK, T.. Parecer de planos de Doctorado e Mestrado no GCBEV-INPA/UFAM. 2006.

20.
HRBEK, T.. Parecer de projectos de pesquisa submetidos para NSF. 2006.

21.
HRBEK, T.. Parecer de planos de Doctorado e Mestrado no GCBEV-INPA/UFAM. 2005.


Demais tipos de produção técnica
1.
MARCON, J. L. ; MENIN, M. ; ARAUJO, M. G. P. ; HRBEK, T. . Biodiversidade Amazônica: Caracterização, Ecologia e Conservação. 2012. (Editoração/Livro).

2.
HRBEK, T.; ZUANON, J. ; FARIAS, I. P. ; BATISTA, J. S. ; FORMIGA, K. . EIA/RIMA Santa Isabel. 2010. (Relatório de pesquisa).

3.
HRBEK, T.; FARIAS, I. P. ; PORTO, J. I. R. . EIA/RIMA Maraba. 2010. (Relatório de pesquisa).

4.
HRBEK, T.. Analytical tools for conservation genetic studies. 2008. (Curso de curta duração ministrado/Especialização).

5.
HRBEK, T.; FARIAS, I. P. . Filogeografia e genética de conservação. 2002. (Curso de curta duração ministrado/Especialização).

Demais trabalhos
1.
HRBEK, T.. Website for Grupo UFAM-LEGAL. 2004 (Website) .

2.
HRBEK, T.; FARIAS, I. P. ; BRINKMANN, H. . Construction and Screening of a Subgenomic Library Highly Enriched for Microsatellite Regions. 2002 (Molecular protocol) .



Bancas



Participação em bancas de trabalhos de conclusão
Mestrado
1.
ANCIAES, M.; HRBEK, T.. Participação em banca de João Marcos Guimarães Capurucho. Combinando filogeografia e genética da paisagem para compreender a evolução de Xenopipo atronitens (Aves; Pipridae), uma espécie característica das campinas Amazônicas. 2012. Dissertação (Mestrado em Biologia (Ecologia)) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia.

2.
HRBEK, T.; SCARPASSA, V.; CARVALHO, F. R.. Participação em banca de Francis Paola Castro Paz. Hyphessobrycon Durbin (Characiformes: Characidae) das bacias do rio Negro e do Amazonas. 2012. Dissertação (Mestrado em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia.

3.
LIMA, A. P.; KELLER, C.; HRBEK, T.; SOARES, R. C.. Participação em banca de Francisco Cardoso de Freitas. As características das desovas e morfologia dos girinos são caracteres que refletem diferenciação genética. 2011. Dissertação (Mestrado em Diversidade Biológica) - Universidade Federal do Amazonas.

4.
RAPP PY-DANIEL, L. H. R.; HRBEK, T.; RIBAS, C.. Participação em banca de Carolina Rebelo Maia. Diferenciação genética e relações filogenéticas entre linhagens de Microsternarchus (Gymnotiformes: Hypopomidae) na bacia do rio Negro, em função de marcadores moleculares mitocondriais e nucleares. 2011. Dissertação (Mestrado em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia.

5.
ACKERMAN, J.; HRBEK, T.; TREMBLAY, R. L.; RAUSCHER, J. T.. Participação em banca de Nadia Paola Flores-Saldaña. Reproductive barriers among three closely related, sympatric species of Poitea (Fabaceae) in Puerto Rico. 2010. Dissertação (Mestrado em Biology) - Universidad de Puerto Rico Recinto de Rio Piedras.

6.
RAUSCHER, J. T.; HRBEK, T.; ACKERMAN, J.; GIRAY, T.. Participação em banca de Silvia Planas Soto-Navarro. Molecular characterization of hybridization and interspecific introgression in the Espeletia complex. 2010. Dissertação (Mestrado em Biology) - Universidad de Puerto Rico Recinto de Rio Piedras.

7.
CLEMENT, C. R.; RIBAS, C.; RODRIGUES, D. P.; HRBEK, T.; VICENTINI, A.. Participação em banca de Gabriela Souza Farias. Estrutura genética de populações e filogeografia da acariquara (Minquartia guianensis Aubl., Olacaceae). 2010. Dissertação (Mestrado em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia.

8.
AIDE, T. M.; LOISELLE, B.; ZIMMERMANN, J.; HRBEK, T.. Participação em banca de Carlos M. Zambrana-Torrelio. The effects of climate stability and geographic isolation on the distribution of rare species richness in the Andes. 2009. Dissertação (Mestrado em Biology) - Universidad de Puerto Rico Recinto de Rio Piedras.

9.
HRBEK, T.; OLIVEIRA, R. L.; ALVES, L. C.; RIBOLLA, P.; SILVA, G. A. C.. Participação em banca de Rafael Trindade Maia. Genética de populações de Aedes albopictus (Díptera: Culicidae) da cidade de Manaus, AM, Brasil, com o emprego do gene ND5 do DNA mitocondrial. 2008. Dissertação (Mestrado em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia.

10.
HRBEK, T.. Participação em banca de Carlos Henrique Schneider. Filogeografia do peixe ornamental Carnegiella strigata (Characiformes, Gasteropelecidae) de três rios de água preta da Amazônia Central. 2007. Dissertação (Mestrado em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia.

11.
HRBEK, T.. Participação em banca de Rafaela Cardoso dos Santos. Estrutura genética das populações de irapuca (Podocnemis erythrocephala, Podocnemididae) da Amazônia Brasileira: implicações para a conservação. 2007. Dissertação (Mestrado em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia.

12.
HRBEK, T.. Participação em banca de Sergio Marques de Souza. Taxonomia do gênero Leposoma (Squamata, Gymnophthalmidae) na bacia do rio Madeira, Amazonas, Brasil, e o papel dos rios na variação morfológica de Leposoma osvaldoi (Avila-Pires, 1995). 2007. Dissertação (Mestrado em Biologia (Ecologia)) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia.

13.
HRBEK, T.; PORTO, J. I. R.; PIEDADE, M. T. F.; FARIAS, I. P.; COHN-HAFT, M.. Participação em banca de Tatiana de Almeida Menicucci. Filogeografia e estructura genética de populações da mungubeira (Pseudobombax munguba, Malvaceae - Bombacoideae) na Amazônia Brasileira. 2006. Dissertação (Mestrado em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia.

14.
HRBEK, T.; ROSAS, F. C. W.; LEMES, M.; SCARPASSA, V.. Participação em banca de Waleska Gravena. Isolamento e caracterização de marcadores microssatélites para análise de parentesco no boto-vermelho (Inia geoffrensis). 2006. Dissertação (Mestrado em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia.

15.
HRBEK, T.; FARIAS, I. P.; VIANA, M. N.; PORTO, J. I. R.; PEREIRA, J. O.. Participação em banca de Daniel Esteves Raid. Evolução dirigida da a-amilase de Bacillus subtilis. 2006. Dissertação (Mestrado em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia.

16.
HRBEK, T.; RAUSCHER, J. T.; GIRAY, T.; ACKERMAN, J.. Participação em banca de Silvia Planas. Molecular characterization of hybridization and interspecific introgression in the Espeletia complex. 2006. Dissertação (Mestrado em Biology) - Universidad de Puerto Rico Recinto de Rio Piedras.

17.
HRBEK, T.. Participação em banca de Aureo Banhos dos Santos. Distribuição da variabilidade genética de gavião real (Harpia harpyja) no Brasil: implicações para conservação. 2006. Dissertação (Mestrado em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia.

18.
HRBEK, T.. Participação em banca de Maria de Fátima Ferreira da Costa Pinto. Análise da estrutura populacional de Melipona compressipes e Melipona seminigra (Hymenoptera: Apidae, Meliponina) na região da Amazônia Central. 2006. Dissertação (Mestrado em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia.

19.
HRBEK, T.; REBÊLO, G. H.; SAMPAIO, I.; MAGNUSSON, W. E.; FIGUEIREDO, W. M. B.. Participação em banca de William Rangel Vasconcelos. Diversidade genética e estructure populacional dos crocodilianos jacaré-açú (Melanosuchus niger) e jacaré-tinga (Caiman crocodilus) da Amazônia. 2005. Dissertação (Mestrado em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia.

20.
ALEIXO, A. L. P.; HRBEK, T.; OLIVEIRA, M. L.; SOARES, R. C.; FARIAS, I. P.. Participação em banca de Carla Haisler Sardelli. Variação geográfica e genética de Hemitriccus minor (Aves: Tyrannidae) na bacia do rio Madeira. 2005. Dissertação (Mestrado em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia.

21.
HRBEK, T.; SILVA, M. N. F.; SAMPAIO, I.; LEMES, M.; SOUZA, M. N. V.. Participação em banca de Wancley Garcia Santos. Genética das populações do sauim-de-coleira (Saguinus bicolor - Callitrichidae) em fragmentos florestais e floresta contínua: implicações para conservação. 2005. Dissertação (Mestrado em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia.

Teses de doutorado
1.
HRBEK, T.; KAEFER, I. L.; VICENTINI, A.; PRATA, E. M. B.; AMARAL, F. R.. Participação em banca de Matteus Ferreira. Filogenia e biogeografia de três famílias de aves do Neotrópico. 2018. Tese (Doutorado em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia.

2.
HRBEK, T.; WERNECK, F. P.; BORGES, S.. Participação em banca de Glauco Kohler. Phylogeny and biogeography of genus Lophotriccus (Aves: Rhynchocyclidae): diversification across the Anes and Amazonia lowlands. 2016. Tese (Doutorado em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia.

3.
HRBEK, T.; RIBAS, C.; CLEMENT, C. R.; HOPKINS, M. J. G.; FIASCHI, P.. Participação em banca de Mário Henrique Terra-Araujo. Filogenia, Biogeografia e Taxonomia de Pradosia (Sapotaceae, Chrysophylloideae). 2013. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Botânica)) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia.

4.
SCHNEIDER, H.; HRBEK, T.; BRITO, R. A.; SOUZA, M. N. V.; SENA, L. S.. Participação em banca de Eduardo Sousa Varela. Diversidade e estrutura genética das populações do caranguejo-uçá do genêro Ucides (Brachyura: Ucididae) com base em loci nucleares e mitocondriais. 2012. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

5.
BUCKUP, P. A.; OLIVEIRA, C.; HRBEK, T.; CAMPOS-DA-PAZ, R.; BRITTO, M. R.. Participação em banca de Javier Alejandro Maldonado-Ocampo. Filogenia molecular da família Sternopygidae (Gymnotiformes: Sternopygoidei). 2011. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Zoologia)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

6.
HRBEK, T.; FELDBERG, E.; RODRIGUES, D. P.. Participação em banca de Manuella Villar Amado. Caracterização genética de populações do peixe ornamental acará-disco (Symphysodon spp., Cichlidae, Perciformes), utilizando marcadores microssatélites. 2007. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade Federal do Amazonas.

7.
HRBEK, T.; BRUCK, D.; THOMAS, R.; SANTIAGO-VALENTIN, E.; BAUER, A.; ABDALA, V.. Participação em banca de Juan D. Daza. Morphological approaches toward gekkotan history. 2007. Tese (Doutorado em Biology) - Universidad de Puerto Rico Recinto de Rio Piedras.

8.
HRBEK, T.; BONATTO, S. L.; UIEDA, W.; REDONDO, R. A. F.; PORTO, J. I. R.; AGUIAR, L. M. S.; SCHNEIDER, P.. Participação em banca de Paulo Estefano Dineli Bobrowiec. Caracterização molecular da dieta do morcego hematófago Desmodus rotundus (Mammalia: Chiroptera) na Amazônia brasileira. 2007. Tese (Doutorado em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia.

9.
HRBEK, T.; VIANA, M. N.; VOGT, R. C.. Participação em banca de Cleiton Fantin Rezende. Desenvolvimento de marcadores moleculares de microssatélites em três espécies de tartarugas do gênero Podocnemis, para determinação do tipo de paternidade. 2006. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade Federal do Amazonas.

Qualificações de Doutorado
1.
HRBEK, T.; COHN-HAFT, M.; BORGES, S. H.. Participação em banca de Eduardo de Deus Schultz. Biogeografia Histórica Dos Habitats Alagáveis Amazônicos: Uma Perspectiva Ornitológica. 2018. Exame de qualificação (Doutorando em Biologia (Ecologia)) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia.

2.
HRBEK, T.; RIBAS, C.; VICENTINI, A.. Participação em banca de Lidia Farias Martins. Integrando abordagens populacionais e evolutivas para entender a demografia histórica e o futuro das populações de lagartos de formações abertas Amazônicas. 2017. Exame de qualificação (Doutorando em Biologia (Ecologia)) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia.

3.
HRBEK, T.; COHN-HAFT, M.; BORGES, S. H.. Participação em banca de Matteus Ferreira. Phylogeography of the Galbula leucogastra / chalcothorax (Aves, Galbulidae) superspecies: evidences for mtDNA capture and insights on the evolution of white-sand environments in the Amazon basin. 2017.

4.
HRBEK, T.; RIBAS, C.; VICENTINI, A.; RODRIGUES, D. P.; CLEMENT, C. R.. Participação em banca de Nathan Phillips Smith. Lecythis (Lecythidaceae): Estudo filogenético dos clados Chartacea e Poiteaui. 2012. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Biológicas (Botânica)) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia.

5.
HRBEK, T.; RIBAS, C.; CLEMENT, C. R.; HOPKINS, M. J. G.; FERRAZ, G.. Participação em banca de Eduardo Magalhães Borges Prata. Filogenia e processos de especiação no complexo guianensis, Pagamea Aubl. (Rubiaceae). 2012. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Biológicas (Botânica)) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia.

6.
ACKERMAN, J.; ALVERSON, W.; HRBEK, T.; RAUSCHER, J. T.. Participação em banca de Fabiola Aceres. Taxonomy and conservation of the endangered Peltaea subpandurata (Malvaceae). 2010. Exame de qualificação (Doutorando em Biology) - Universidad de Puerto Rico Recinto de Rio Piedras.

7.
TORRANZOS, G.; HRBEK, T.; SABAT, A.; MOLINA, M.. Participação em banca de Ana Rita Patricio. Green turtles (Chelonia mydas) juveniles at Culebra archipelago, Puerto Rico: an insight to the epidemiology of fibropapillomatosis. 2009. Exame de qualificação (Doutorando em Biology) - Universidad de Puerto Rico Recinto de Rio Piedras.

8.
HRBEK, T.; MCMILLAN, W. O.; RAUSCHER, J. T.; JIGGINS, C.; LINARES, M.. Participação em banca de Hector Alejandro Merchan. Evolution of a geographically variable adaptation in the Andean butterfly Heliconius cydno. 2006. Exame de qualificação (Doutorando em Biology) - Universidad de Puerto Rico Recinto de Rio Piedras.

9.
HRBEK, T.; ROSAS, F. C. W.; LEMES, M.; COHN-HAFT, M.; SILVA, M. N. F.. Participação em banca de Andréa Martins Cantanhede. Genética populacional de peixe-boi da Amazônia, Trichechus inunguis Natterer, 1883 (Mammalia: Sirenia) na Amazônia brasileira: Implicações para sua conservação. 2005. Exame de qualificação (Doutorando em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia.

10.
HRBEK, T.. Participação em banca de Jacqueline da Silva Batista. Caracterização genética de estoques pesqueiros da Dourada - Brachyplatystoma rousseauxii (Siluriformes-Pimelodidae) na Amazônia utilizando marcadores moleculares mitocondriais e microsatélites. 2005. Exame de qualificação (Doutorando em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia.

Qualificações de Mestrado
1.
HRBEK, T.; WERNECK, F. P.; KAEFER, I. L.. Participação em banca de Arielli Fabrício Machado. Biogeografia de Hylaeamys megacephalus (Rodentia: Sigmodontinae): integração entre modelos de nicho ecológico e filogeografia. 2014. Exame de qualificação (Mestrando em Biologia (Ecologia)) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia.

2.
HRBEK, T.; COSTA, F. R. C.; HOPKINS, M. J. G.. Participação em banca de Alysson Silva da Matta Barbosa. Revisão do complexo Aniba panurensis (Meissner)Mez. s.l., Lauraceae Juss.. 2014. Exame de qualificação (Mestrando em Ciências Biológicas (Botânica)) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia.

3.
HRBEK, T.; COHN-HAFT, M.; FRISCHE, C. C.. Participação em banca de Affonso Henrique Nascimento de Souza. Fatores ecológicos e evolutivos na organização da diversidade genética de aves ao longo do interflúvio Purus-Madeira, Amazônia Ocidental. 2013. Exame de qualificação (Mestrando em Biologia (Ecologia)) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia.

4.
HRBEK, T.; BATISTA, J. S.; COHN-HAFT, M.. Participação em banca de Jessica Motta de Souza. Genética de paisagem de Xenopipo atronitens (Cabanis, 1847) (Aves: Pipridae): conectividade populacional em campinas Amazônicas. 2013. Exame de qualificação (Mestrando em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia.

Trabalhos de conclusão de curso de graduação
1.
GREGORIN, R.; HRBEK, T.; FERREIRA, W. D.; RIBEIRO, T. H. C.. Participação em banca de Luana Portela Faria e Ávila.Análise filogenômica do complexo de subespécies de Saguinus labiatus (callitrichidae, primates) utilizando sequenciamento de última geração (NGS). 2017. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de Lavras.

2.
HRBEK, T.; SIMOES, P. I.; FANTIN, C.. Participação em banca de Roberta de Castro Canton.Diversidade genética em espécies do gênero Leptodactylus (Anura) em um transecto no rio Madeira. 2011. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biologia) - Universidade Federal do Amazonas.



Participação em bancas de comissões julgadoras
Outras participações
1.
HRBEK, T.. NSF doctoral research fellowships in biology (evolutionary biology and genetics). 2010. The National Science Foundation.

2.
HRBEK, T.. NSF doctoral research fellowships in biology (evolutionary biology and genetics). 2009. The National Science Foundation.

3.
HRBEK, T.. NSF doctoral research fellowships in biology (evolutionary biology and genetics). 2008. The National Science Foundation.

4.
HRBEK, T.. NSF doctoral research fellowships in biology (evolutionary biology and genetics). 2007. The National Science Foundation.

5.
HRBEK, T.. CAPES/Fulbright doctorate fellowship. 2004. Fulbright Comissão para o Intercâmbio entre os Estados Unidos e o Brasil.



Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
Conresso Brasileiro dos Recursos Geneticos II. Conservação e sustentabilidade de animais aquáticos da Amazônia Brasileira. 2012. (Congresso).

2.
Fourth International Barcode of Life Conference. DNA barcoding approach to the study of community structure of rheophilic fishes of rio Araguaia. 2011. (Congresso).

3.
XIV Simpósio de Citogenética e Genética de Peixes.Genética de populações e conservação genética de peixes amazônicos. 2011. (Encontro).

4.
XIX Encontro Brasileiro de Ictiologia.Uso de ferramentas moleculares na identificação de espécies ? DNA barcode. 2011. (Encontro).

5.
56th Congresso Brasileiro de Genética. Inesperada alta diversidade filogenética em peixes reofílicos do rio Araguaia. 2010. (Congresso).

6.
Annual meeting of the American Society of Ichthyologists and Herpetologists. Livebearing fishes and their relatives as model systems in biology. 2009. (Congresso).

7.
Association of Marine Laboratories of the Caribbean 34th Scientific Conference. Profiling coral-associated bacterial communities using 16S rDNA microarrays in healthy and diseased colonies of the elkhorn coral A. palmata. 2009. (Congresso).

8.
Gordon conference - Quantitative genetics and genomics. 2009. (Congresso).

9.
III Encontro de Genética da Região Norte.Os problemas relacionados com a conceituação de espécie. 2009. (Encontro).

10.
III Encontro de Genética da Região Norte.Filogeografia de peixes da bacia Amazônica. 2009. (Encontro).

11.
Third International Barcode of Life Conference. 2009. (Congresso).

12.
X Simposio Colombiano de Ictiología, II Encuentro Colombo-Venezolano de Ictiólogos y Primer Encuentro Suramericano de Ictiólogos.Patrones de diversificación en los peces disco (Symphysodon spp.). 2009. (Simpósio).

13.
11th International Coral Reef Symposium. Characterizing uncultured coral-associated bacteria in genotypically distinct colonies of Acropora palmata using universal 16S rDNA primers. 2008. (Congresso).

14.
54th Congresso Brasileiro de Genética. Marcadores microssatélites para tambaqui (Colossoma macropomum), peixe de importância econômica e ambiental para regiâo amazônica. 2008. (Congresso).

15.
6th World Congress of Herpetology. Diversity and distribution of Caiman sp. from Amazon to Pantanal, Brazil. 2008. (Congresso).

16.
Sirenian Population Genetics Conference. Molecular genetics of Amazonian and Marine manatees of Brazil. 2008. (Congresso).

17.
XXVII Congresso Brasileiro de Zoologia. Expansão populacional do gavião-real (Harpia harpyja) na região do arco do desmatamento da Amazônia: considerações para conservação. 2008. (Congresso).

18.
3ro Congresso Brasileiro de Herpetologia. Phylogeography of Amazonian jacaré-açú Melnosuchus niger from different South American river systems. 2007. (Congresso).

19.
53rd Congresso Brasileiro de Genética. Filogeografia de espécie Pterophyllum scalare Schultze, 1823 (Cichlidae) na bacia amazônica, utilizando o gene do citochromo b. 2007. (Congresso).

20.
Annual meeting of the American Society of Ichthyologists and Herpetologists. Biogeographic inferences from the phylogenetic relationships of the Guyana Shield clade of Rivulus (Rivulidae: Cyprinodontiformes). 2007. (Congresso).

21.
Gordon conference - Quantitative genetics and genomics. 2007. (Congresso).

22.
Third International Workshop of Crocodilian Genetics & Genomics. Comparative phylogeography and conservation genetic analysis of Amazonian Caiman and Melanosuchus. 2007. (Congresso).

23.
VIII Congreso de Ornitología Neotropical. Phylogeography of passerines confirms importance of mini-interfluves between the Tapajós and Madeira Rivers in the Brazilian Amazon and conflicts with current taxonomy. 2007. (Congresso).

24.
II Encontro de Genética da Região Norte.Mitochondrial and nuclear DNA phylogeography of the Discus (Symphysodon spp., Cichlidae, Perciformes). 2006. (Encontro).

25.
Primera Reunión Internacional sobre el Estudio de Mamíferos Acuáticos SOMEMMA-SOLAMAC. Relatedness levels within two aggregations of the pink-river dolphin (Inia geoffrensis) in lower Negro River, Amazonas-Brazil. 2006. (Congresso).

26.
Third International Symposium on Viviparous Fishes. Phylogenetic relationships of Poeciliids. 2006. (Congresso).

27.
XI Brazilian Symposium on Fish Cytogenetics and Genetics and I International Congress on Fish Genetics. Test of vicariant hypotheses and evolution of diapause in the killifish suborder Aplocheiloidei (Atherinomorpha, Cyprinodontiformes. 2006. (Congresso).

28.
1° Reunião de Monitoramento do Programa Ciência e Tecnologia para Amazonas Verde - Ação Edital Temático. 2005. (Encontro).

29.
51st Congresso Brasileiro de Genética.Phylogeny of the New World Rivulidae based on morphological and molecular data. 2005. (Simpósio).

30.
Annual meeting of the American Society of Ichthyologists and Herpetologists.Phylogeny of Cyprinodontiformes based on combined analysis of molecular and morphological characters. 2005. (Simpósio).

31.
Annual meeting of the Society for Conservation Biology.Population genetic analysis of Arapaima gigas: implications for management and conservation. 2005. (Simpósio).

32.
Workshop Internacional en el Marco de la RIA - Biología de las Poblaciones de Peces de la Amazonía y Piscicultura.Conservation genetics of Arapaima gigas: implication for the location of protected areas. 2005. (Encontro).

33.
50th Congresso Brasileiro de Genética. Phylogeography and population genetics of the endangered Amazonian manatee, Trichechus inunguis Natterer, 1883 (Mammalia, Sirenia). 2004. (Congresso).

34.
Annual meeting of the Society for the Study of Evolution. Population genetic analysis of the Discus fishes from the Amazon basin. 2004. (Congresso).

35.
Workshop - Manejo do Pirarucu. 2004. (Simpósio).

36.
49th Congresso Brasileiro de Genética.Evaluation of species status of the ornamental discus fish (Symphysodon spp., Cichlidae, Perciformes): phylogeography and population genetics. 2003. (Simpósio).

37.
Annual meeting of the American Society of Ichthyologists and Herpetologists. Phylogeography and conservation of Arapaima gigas. 2003. (Congresso).

38.
Evolution and Biodiversity seminar series.Evolution and Biodiversity seminar series. 2003. (Seminário).

39.
Mouse Genomics conference. Genetic variation and gene mapping of diabetes-related traits in the LGxSM recombinant inbred strain set. 2003. (Congresso).

40.
Third international conference on childhood and adolescent obesity. Gene by environment interactions in a murine obesity model. 2003. (Congresso).

41.
48th Congresso Brasileiro de Genética. Estimating population genetic structure of Pirarucu (Arapaima gigas), the biggest freshwater fish of South America, using mitochondrial DNA sequences. 2002. (Congresso).

42.
Annual meeting of the Society for the Study of Evolution. Why are ecological replacement species so similar?. 2002. (Congresso).

43.
Seventh workshop of the European marmoset research group. The pied bare-faced tamarin (Saguinus bicolor) in urban Manaus: a challenge for conservation biologists. 2002. (Congresso).

44.
Sixteenth working meeting of the crocodile specialist group. Population genetic structure of Amazonian crocodilians: preliminary results. 2002. (Congresso).

45.
Bi-annual meeting of the European Society of Evolutionary Biologists. Geological activity and biological diversity: The Aphanius species complex of central Turkey. 2001. (Congresso).

46.
Conservation Genetics Meeting.Geological activity, biological diversity and the conservation of the Aphanius species complex of central Turkey. 2001. (Simpósio).

47.
European Congress of Ichthyology - X. Closing of the Tethys and the phylogeny of Eurasian killifishes (Cyprinodontiformes: Cyprinodontidae). 2001. (Congresso).

48.
Annual meeting of the Deutschen Zoologischen Gesellschaft. The evolution of life-history traits reconstructed from a molecular phylogeny of the family Poeciliidae (Pisces). 2000. (Congresso).

49.
Annual meeting of the Society for the Study of Evolution. Sympatric speciation in nature: fact or fiction?. 2000. (Congresso).

50.
Annual meeting of the Society for the Study of Evolution. Annualism and population structuring in Lake Maracaibo basin killifishes (Rivulidae: Cyprinodontiformes). 1998. (Congresso).

51.
Annual meeting of the Neotropical Ichthyological Association. Molecular phylogeny of the Rivulidae (Cyprinodontiformes), and its relevance to taxonomy. 1997. (Congresso).

52.
Annual meeting of the Society for the Study of Evolution. Nested cladistic analysis and population history of Austrofundulus killifishes. 1997. (Congresso).

53.
Annual meeting of the American Society of Ichthyologists and Herpetologists. Gondwanan vicariance and the phylogenetic relationships of aplocheiloid killifishes. 1996. (Congresso).

54.
Annual meeting of the Society for the Study of Evolution. Rise of the Andes and the speciation of Austrofundulus (Rivulidae: Cyprinodontiformes). 1996. (Congresso).

55.
Annual meeting of the Society for the Study of Evolution. Ecology of annual habitats of the Maracaibo basin, Venezuela. 1995. (Congresso).


Organização de eventos, congressos, exposições e feiras
1.
FARIAS, I. P. ; HRBEK, T. . Sustainable managemente and conservation of várzea fishes in the Amazon. 2005. (Outro).

2.
HRBEK, T.. Integrando dados morfológicos e moleculares em filogenia de peixes neotropicais. 2005. (Outro).

3.
ORTÍ, G. ; HRBEK, T. ; MAYDEN, R. ; WILEY, E. . Interrelationships of fishes III: towards a synthesis of morphology and molecules. 2005. (Outro).



Orientações



Orientações e supervisões em andamento
Dissertação de mestrado
1.
Carolina Moreira Fernandes Ferreira. Diversificação da cor de plumagem em Lepidothrix coronata (Aves, Passeriformes): Uma abordagem filogenética e ambiental. Início: 2017. Dissertação (Mestrado em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. (Orientador).

2.
Ingrid de Souza Nunes. Estruturação Filogenética e Diversificação de lagartos amazônicos. Início: 2016. Dissertação (Mestrado em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado do Amazonas. (Orientador).

3.
Gustavo Ladeira Ferreira. Efeitos da insularização artificial na Amazônia Central sobre aspectos genômicos em Arthrosaura reticulata (Squamata:Gymnophthalmidae). Início: 2016. Dissertação (Mestrado em Biologia (Ecologia)) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. (Coorientador).

Tese de doutorado
1.
Joiciane Gonçalves Farias. Padrões evolutivos em golfinhos fluviais. Início: 2017. Tese (Doutorado em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado do Amazonas. (Orientador).

2.
Gerson Paulino Lopes. Filogenia e biogeografia do grupo Saguinus mystax (Primates, Cebidae, Callitrichinae). Início: 2017. Tese (Doutorado em Zoologia (12001015063P6)) - Universidade Federal do Amazonas, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Coorientador).

3.
Fabio Rohe. Sistemática molecular e biogeografia do gênero Leontocebus (Wagner, 1839) (Callitrichidae, Primates). Início: 2016. Tese (Doutorado em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia. (Coorientador).

4.
Igor Joventino Roberto. Species delimitation and cryptic lineages in the genus Caiman (Crocodylia: Alligatoridae) as a conservation strategy to delimit conservation units.. Início: 2016. Tese (Doutorado em Zoologia (12001015063P6)) - Universidade Federal do Amazonas, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Coorientador).

5.
Rodrigo Costa Araújo. Taxonomia, biogeografia e conservação de primatas dos gêneros Mico e Callibella. Início: 2015. Tese (Doutorado em Biologia (Ecologia)) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Orientador).

6.
Rommel Roberto Rojas Zamora. Revelando padrões evolutivos do gênero Amazophrynella (Amphibia: Anura: Bufonidae): uma abordagem integrativa para revelar processos de diversificação da biota amazônica. Início: 2015. Tese (Doutorado em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Orientador).

7.
Luciana Frazão Luiz. Estrutura filogenética e funcional de assembleias de serpentes na Amazônia brasileira. Início: 2015. Tese (Doutorado em Biologia (Ecologia)) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia. (Orientador).

8.
Fabio Muniz Lima. Filogeografia e genética populacional de jacaré-paguá (Paleosuchus palpebrosus) na Amazônia: SNPs por next-generation sequencing. Início: 2014. Tese (Doutorado em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado do Amazonas. (Orientador).


Orientações e supervisões concluídas
Dissertação de mestrado
1.
Sarah Ventura Carvalho. Análise genético-populacional de Brycon amazonicus (Spix & Agassiz, 1829) da bacia Amazônica. 2017. Dissertação (Mestrado em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado do Amazonas. Orientador: Tomas Hrbek.

2.
Israela da Silva de Souza. Os Botos da Bacia do Rio Madeira, Diversidade Genética, Hibridização e Conservação. 2017. Dissertação (Mestrado em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado do Amazonas. Coorientador: Tomas Hrbek.

3.
Juliana Viera Campos. Efeito das drenagens fluviais (atuais e históricas) na estruturação genética de Leptodactylus pentadactylus (Anura: Leptodactylidae) na Amazônia Central. 2016. Dissertação (Mestrado em Diversidade Biológica) - Universidade Federal do Amazonas, Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado do Amazonas. Orientador: Tomas Hrbek.

4.
Bruna Soares. O papel das corredeiras e a clima no Pleistoceno na diferenciação do Prochilodus nigricans. 2016. Dissertação (Mestrado em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Tomas Hrbek.

5.
Rejane Medeiros da Silva. Adaptaçoes genomicos associados com diferentes ambientes amazônicos em Colossoma macropomum. 2016. Dissertação (Mestrado em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Tomas Hrbek.

6.
Diana Sanchez Bernal. Phylogeography and genetic diversity of two Neotropical fish species shared between Orinoco and Amazon basins: Evaluating connectivity and current and historical patterns. 2016. Dissertação (Mestrado em Biologia) - Universidad de los Andes Colombia, . Coorientador: Tomas Hrbek.

7.
Ana Paula Melo Corrêa. Verificando a ocorrência de hibridização entre duas espécies de preguiça, Bradypus tridactylus LINNAEUS, 1758 e Bradypus variegatus SCHINZ, 1825 no município de Manaus, Amazonas - Brasil. 2015. Dissertação (Mestrado em Diversidade Biológica) - Universidade Federal do Amazonas, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Tomas Hrbek.

8.
Elciomar Araújo de Oliveira. Filogeografia de Pristimantis fenestratus (Amphibia: Anura) na Amazônia brasileira. 2015. Dissertação (Mestrado em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Tomas Hrbek.

9.
Fabricio Bertuol. Testando limites especificos dos Uakaris pretos sensus Herschkovitz (1987) (Pitheciidae: Primata). 2015. Dissertação (Mestrado em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Tomas Hrbek.

10.
Sandra Rangel Hernandez. Dinâmica e estrutura populacional do jacaré-açú (Melanosuchus niger) da Amazônia brasileira. 2015. Dissertação (Mestrado em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Coorientador: Tomas Hrbek.

11.
Joiciane Gonçalves Farias. Filogeografia e genética populacional de Inia geoffrensis geoffrensis e Inia geoffrensis humboldtiana (Cetartiodactyla: Iniidae) nos rios Branco e Negro e sistema Orinoco. 2015. Dissertação (Mestrado em Diversidade Biológica) - Universidade Federal do Amazonas, Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado do Amazonas. Coorientador: Tomas Hrbek.

12.
Roberta de Castro Canton. Análise da variação fenotípica e genotípica do complexo Brotogeris sanctithomae sanctithomae/takatsukasae (Aves: Psittaciformes). 2014. Dissertação (Mestrado em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado do Amazonas. Coorientador: Tomas Hrbek.

13.
Ana Paula Costa de Carvalho. Código de barras de DNA como ferramenta para o estudo da biodiversidade de peixes da família Cichlidae na bacia Amazônica. 2014. Dissertação (Mestrado em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Tomas Hrbek.

14.
Rommel Roberto Rojas Zamora. Revisão taxonômica e distribuição geográfica do complexo Amazophrynella minuta (Amphibia: Anura: Bufonidae) da região Amazônica. 2014. Dissertação (Mestrado em Diversidade Biológica) - Universidade Federal do Amazonas, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Tomas Hrbek.

15.
Emanuell Duarte Ribeiro. Padrões da biodiversidade molecular da ictiofauna reofílica do escudo Brasileiro. 2013. Dissertação (Mestrado em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Tomas Hrbek.

16.
Guilherme Fernandes Dias. Testando limites interespecíficos entre Leopardus pardalis e L. wiedii na Amazônia. 2013. Dissertação (Mestrado em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Coorientador: Tomas Hrbek.

17.
Jennifer Gomes Ferreira. Padrões genéticos em Spizaetus (Aves: Accipitridae): dinâmica populacional e delimitação de espécies. 2013. Dissertação (Mestrado em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Tomas Hrbek.

18.
Dania M. Rodríguez. Analysis of mitochondrial gene rearrangements in rivulid killifishes. 2012. Dissertação (Mestrado em Biology) - Universidad de Puerto Rico Recinto de Rio Piedras, National Science Foundation. Orientador: Tomas Hrbek.

19.
Olavo P. Colatreli. DNA barcoding aplicado aos estudos de comunidades de peixes dos igarapés. 2012. Dissertação (Mestrado em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, . Orientador: Tomas Hrbek.

20.
Karla Z. Maldonado-Mena. Dissecting genetic basis of spot color and pattern inheritance: QTL analysis and mapping of Heliconius butterflies. 2011. Dissertação (Mestrado em Biology) - Universidad de Puerto Rico Recinto de Rio Piedras, National Science Foundation. Orientador: Tomas Hrbek.

21.
Ana Rita Caldas Patrício. Survival probabilities of Green Turtles from Culebra, Puerto Rico and evolution and phylogeography of thefibropapillomatosis-associated turtle herpesvirus. 2011. Dissertação (Mestrado em Biology) - Universidad de Puerto Rico Recinto de Rio Piedras, . Coorientador: Tomas Hrbek.

22.
Yadira Ruiz Ortiz. Evolutionary history of insular invasive Caribbean goats and pigs. 2011. Dissertação (Mestrado em Biology) - Universidad de Puerto Rico Recinto de Rio Piedras, National Science Foundation. Orientador: Tomas Hrbek.

23.
Deyla Paula de Oliveira. Análise da paternidade de Caiman crocodilus (L.) da reserva de desenvolvimento sustentável Piagaçu-Purus, através de marcadores microssatélites. 2010. Dissertação (Mestrado em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Tomas Hrbek.

24.
Mauro de Freitas Ortiz. Validação do conceito do DNA barcode como indentificador de espécies biológicas: um estudoe de case no gênero Pseudoplatystoma. 2010. Dissertação (Mestrado em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Coorientador: Tomas Hrbek.

25.
Daniela Maria Leroy e Vieira. Taxonomia e filogenia molecular do grupo Rhinella margaritifer (Amphibia, Anura, Bufonidae) da Amazônia brasileira. 2010. Dissertação (Mestrado em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Tomas Hrbek.

26.
Felix Araujo. Linkage disequillibrium mapping of wing-color pattern genes in Heliconius butterflies. 2009. Dissertação (Mestrado em Biology) - Universidad de Puerto Rico Recinto de Rio Piedras, National Science Foundation. Orientador: Tomas Hrbek.

27.
Kelmer Batalha Passos. Genética populacional do jaraqui de escama grossa (Semaprochilodus insignis - Prochilodontidae, Characiformes). 2009. Dissertação (Mestrado em Diversidade Biológica) - Universidade Federal do Amazonas, Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado do Amazonas. Orientador: Tomas Hrbek.

28.
Adam Souza de Alencar Leão. Análise da variabilidade genética das populaçoes de pirarucu (Arapaima gigas, Schinz 1822) dos principais tributaries do rio Amazonas. 2009. Dissertação (Mestrado em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado do Amazonas. Coorientador: Tomas Hrbek.

29.
Eduardo Rodrígues de Souza. Filogeografia do gênero neotropical Fluviphylax (Cyprinodontiformes: Poeciliidae) das bacias do Amazonas e do Orinoco. 2008. 0 f. Dissertação (Mestrado em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Tomas Hrbek.

30.
Natasha Verdasca Meliciano. Estudo filogeográfico do gênero Pterophyllum, Heckel, 1840 (Cichlidae / Heroini) na Bacia Amazônica, utilizando o gene do citocromo b e morfometria geométrica. 2008. 0 f. Dissertação (Mestrado em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Tomas Hrbek.

31.
Jason Macrander. Ecological-genomic approach to characterizing disease susceptibility in Gorgonia ventalina. 2007. Dissertação (Mestrado em Biology) - Universidad de Puerto Rico Recinto de Rio Piedras, . Orientador: Tomas Hrbek.

32.
Yane Santos Almeida. Teste de parentesco em pirarucu (Arapaima gigas Cuvier, 1817) utilisando de DNA microssatélites. 2006. 0 f. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade Federal do Amazonas, Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado do Amazonas. Coorientador: Tomas Hrbek.

33.
Audrey Alencar Arruda D'Assunção. Estudo da variabilidade genérica do cardinal (Ostariophysi: Characiformes: Paracheirodon axelrodi) na bacia do rio Negro. 2006. 67 f. Dissertação (Mestrado em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado do Amazonas. Coorientador: Tomas Hrbek.

34.
Daniel Toffoli Ribeiro. História evolutiva de espécies do gênero Potamotrygon Garman, 1877 (Potamotrygonidae) na Bacia Amazônica. 2006. Dissertação (Mestrado em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Coorientador: Tomas Hrbek.

35.
Wancley Garcia Santos. Genética das populaces do sauim-de-coleira (Saguinus bicolor ? Callitrichidae) em fragmentos florestais e florestas continua: implicações para conservação. 2005. 50 f. Dissertação (Mestrado em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado do Amazonas. Coorientador: Tomas Hrbek.

36.
William Rangel Vasconcelos. Diversidade genética populacional dos crocodilianos jacaré-açú (Melanosuchus niger) e jacaré-tinga (Caiman crocodilus) da Amazônia. 2005. 0 f. Dissertação (Mestrado em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Coorientador: Tomas Hrbek.

Tese de doutorado
1.
Valeria Nogueira Machado. Filogenia de comunidade de caracideo reofilicos. 2016. Tese (Doutorado em BIODIVERSIDADE E BIOTECNOLOGIA - REDE BIONORTE) - Universidade Federal do Amazonas, Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado do Amazonas. Orientador: Tomas Hrbek.

2.
Jose Gregorio Martínez. Desvendando processos atuais e históricos dos peixes migradores e sedentários: uma análise genético-populacional trans-fronteirística e trans-bacia. 2015. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade Federal do Amazonas, . Coorientador: Tomas Hrbek.

3.
Deyla Paula de Oliveira. Estruturação filogenética de comunidades de lagartos da Amazônia ocidental. 2015. Tese (Doutorado em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, . Orientador: Tomas Hrbek.

4.
María Doris Escobar Lizarazo. Diversidade genetica e padrões populacionais da pirapitinga Piaractus brachypomus (Cuvier, 1818) Characiformes: um criterio para seu manejo. 2013. Tese (Doutorado em Diversidade Biológica) - Universidade Federal do Amazonas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Tomas Hrbek.

5.
Waleska Gravena. O boto vermelho (Inia sp.) nos rios Madeira, Mamoré e Guaporé: Distribuição, evolução e estrutura populacional. 2013. Tese (Doutorado em Genética, Conservação e Biologia Evolutiva) - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Tomas Hrbek.

6.
Daniel Toffoli Ribeiro. Testando a radiação adaptativa na evolução das arraias de água doce do grupo roseta-ocelado (Chondrichthyes:Potamotrygonidae). 2013. Tese (Doutorado em Genética e Evolução) - Universidade Federal de São Carlos, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Coorientador: Tomas Hrbek.

7.
Pascal Mège. Population structure of Acropora palmata and structure of its bacterial communities in relation to White Band disease. 2011. Tese (Doutorado em Biology) - Universidad de Puerto Rico Recinto de Rio Piedras, . Orientador: Tomas Hrbek.

8.
Maria da Conceição Freitas Santos. Caracterização da diversidade genética de populações naturais de tambaqui (Colossoma macropomum) através de marcadores moleculares: uma contribuição para manejo, criação em cativeiro e conservação da espécie. 2010. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade Federal do Amazonas, Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado do Amazonas. Coorientador: Tomas Hrbek.

9.
Themis de Jesus da Silva. Utilização de marcadores moleculares nucleares e mitocondriais para análise da variabilidade genético-populacional e paternidade de peixes aruanãs (Osteoglossum spp. - Osteoglossidae). 2009. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade Federal do Amazonas, Superintendencia da Zona Franca de Manaus. Coorientador: Tomas Hrbek.

10.
Manuella Villar Amado. Caracterização genética de populações de peixe ornamental Acará-disco (Symphysodon spp., Cichlidae, Perciformes), utilizando marcadores microssatélites. 2008. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade Federal do Amazonas, Superintendencia da Zona Franca de Manaus. Coorientador: Tomas Hrbek.

Supervisão de pós-doutorado
1.
Rupert Collins. 2015. Universidade Federal do Amazonas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Tomas Hrbek.

2.
Waleska Gravena. 2014. Universidade Federal do Amazonas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Tomas Hrbek.

Iniciação científica
1.
Israela da Silva de Souza. Efeitos do rio Madeira nos padrões biogeográficos de pequenos mamíferos: caso de estudo com Micoureus demararae. 2011. Iniciação Científica - Universidade Federal do Amazonas, Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado do Amazonas. Orientador: Tomas Hrbek.

2.
Sarah Ventura. Código de barras como ferramenta para o estudo da biodiversidade Amazônica. 2011. Iniciação Científica - Universidade Federal do Amazonas, Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado do Amazonas. Orientador: Tomas Hrbek.



Educação e Popularização de C & T



Livros e capítulos
1.
MARCON, J. L. ; MENIN, M. ; ARAUJO, M. G. P. ; HRBEK, T. . Biodiversidade Amazônica: Caracterização, Ecologia e Conservação. 1. ed. Manaus, AM: EDUA, 2012. v. 1. 368p .

1.
BOUBLI, J. P. ; HRBEK, T. . Introdução a Biodiversidade Amazônica. In: Jaydione Luiz Marcon; Marcelo Menin; Maria Gracimar Pacheco de Araújo; Tomas Hrbek. (Org.). Biodiversidade Amazônica: caracterização, ecologia e conservação. 1ed.Manaus, AM: EDUA, 2012, v. 1, p. 11-17.


Apresentações de Trabalho
1.
HRBEK, T.; GRAVENA, W. ; FARIAS, J. ; DUTRA, N. C. L. ; SILVA, V. M. F. ; FARIAS, I. P. . What do we really know about the diversification of freshwater cetaceans (Inia: Cetacea) within and outside the Amazon basin?. 2014. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).




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