Bruno Araujo Cautiero Horta

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  • Última atualização do currículo em 30/10/2018


Bruno A. C. Horta possui graduação em Química pela Universidade Federal de Juiz de Fora (2004), doutorado direto pela Universidade Federal do Rio de Janeiro (2008), pós-doutorado com duração de 3 anos pela ETH-Zurich (2011) e mais um ano de pós-doutorado pela EPFL (2012). Em julho de 2012, foi contratado pela PUC-Rio como Professor do quadro Conveniado com vínculo de 2 anos (até julho de 2014) determinado pela duração do projeto de pesquisa financiado pela Petrobrás. Nesse mesmo período, foi Professor adjunto da Universidade Estadual da Zona Oeste atuando no Departamento de Biotecnologia. Em julho de 2014, foi aprovado no Concurso para Professor Adjunto do Instituto de Química da Universidade Federal do Rio de Janeiro, tomando posse em agosto de 2014. Tem experiência na área de Química Orgânica e Físico-Química Orgânica, atuando principalmente nos seguintes temas: modelagem molecular, simulação por dinâmica molecular, docking, química medicinal, carreadores de fármacos, catálise enzimática, cálculo de propriedades eletrônicas e espectroscopia de ressonância magnética nuclear. É revisor de vários periódicos de alto impacto incluindo Nature Communications, Journal of the American Chemical Socienty e Journal of Chemical Theory and Computation. É desenvolvedor dos softwares: GROMOS simulation package, MKTOP, MDWiz e pyPolyBuilder. É o pesquisador principal do recentes campos de força da família GROMOS: 53a6oxy, 53a6oxy+d, 53a6oxy+a e 2016H66. É Jovem Cientista do Nosso Estado (FAPERJ). (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Bruno Araujo Cautiero Horta
Nome em citações bibliográficas
HORTA, B. A. C.;Horta, Bruno Araújo Cautiero;Horta, Bruno A.C.;Horta, Bruno A. C.;HORTA, BRUNO A C;CAUTIERO HORTA, BRUNO ARAÚJO;HORTA, BRUNO

Endereço


Endereço Profissional
Universidade Federal do Rio de Janeiro, Instituto de Quimica.
CT - Centro de Tecnologia, bloco A, sala 609
Cidade Universitária
21941909 - Rio de Janeiro, RJ - Brasil
Telefone: (21) 39387132


Formação acadêmica/titulação


2004 - 2008
Doutorado em Química.
Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.
Título: Estudo por Dinâmica Molecular do Fator de Crescimento Vascular Endotelial (VEGF), Ano de obtenção: 2008.
Orientador: Ricardo Bicca de Alencastro.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
Palavras-chave: movimentos correlacionados; VEGF; dinâmica molecular; teses.
2000 - 2003
Graduação em Química.
Universidade Federal de Juiz de Fora, UFJF, Brasil.
Título: Estudo de Estrutura e Propriedades de Compostos Azonitroaromaticos.
Orientador: Helio Ferreira dos Santos.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.


Pós-doutorado


2011 - 2012
Pós-Doutorado.
Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne, EPFL, Suiça.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Química / Subárea: Química Computacional.
2008 - 2011
Pós-Doutorado.
Swiss Federal Institute of Technology Zurich, ETH Zurich, Suiça.
Bolsista do(a): Swiss National Fundation, SNF, Suiça.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Química / Subárea: Físico-Química / Especialidade: Química Teórica.
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Química / Subárea: Química Computacional.


Formação Complementar


2009 - 2009
Ludens Seminar and Private Coaching. (Carga horária: 16h).
Swiss Federal Institute of Technology Zurich, ETH Zurich, Suiça.
2006 - 2006
Extensão universitária em Special Topics in Advanced Stereochemistry. (Carga horária: 40h).
Departamento de Química Orgânica - IQ - UFRJ, DQO-IQ/UFRJ, Brasil.
2005 - 2005
Columbus in Rio: Um curso de Química Quântica. (Carga horária: 36h).
Instituto Militar de Engenharia, IME, Brasil.
2005 - 2005
Spectroscopy of Hydrogen-Bonded Systems. (Carga horária: 10h).
Departamento de Química Orgânica - IQ - UFRJ, DQO-IQ/UFRJ, Brasil.
2005 - 2005
Introdução à Programação - NCE- UFRJ. (Carga horária: 30h).
Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.
2004 - 2004
Extensão universitária em Fundamentos de Biologia Molecular. (Carga horária: 16h).
Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho - UFRJ, IBCCF, Brasil.
2002 - 2002
Recursos de Educação Química Informatizada. (Carga horária: 6h).
Sociedade Brasileira de Química, SBQ, Brasil.
2002 - 2002
Espectroscopia NIR: Fundamentos e Aplicações. (Carga horária: 6h).
Sociedade Brasileira de Química, SBQ, Brasil.


Atuação Profissional



Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.
Vínculo institucional

2014 - Atual
Vínculo: , Enquadramento Funcional: Professor Adjunto, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

8/2016 - Atual
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Quimica, .

Cargo ou função
Representante docente na comissão deliberativa da Pós-Graduação em Química..
9/2014 - Atual
Direção e administração, Instituto de Quimica, .

Cargo ou função
Coordenador do Laboratório de Informática da Graduação (LIG-Química).
08/2014 - Atual
Pesquisa e desenvolvimento , Instituto de Química, .

08/2014 - Atual
Ensino, Química, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Laboratório de Química Orgânica II
08/2014 - Atual
Ensino, Engenharia Química, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Laboratório de Química Orgânica II
Química Orgânica I

Pontifícia Universidade Católica do Rio de Janeiro, PUC-Rio, Brasil.
Vínculo institucional

2012 - 2014
Vínculo: Pesquisador, Enquadramento Funcional: Pesquisador


Centro Universitário da Zona Oeste, UEZO, Brasil.
Vínculo institucional

2013 - 2014
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Adjunto, Carga horária: 40


ETH Zürich, ETHZ, Suiça.
Vínculo institucional

2017 - 2017
Vínculo: Professor Visitante, Enquadramento Funcional: Professor Visitante, Carga horária: 40



Linhas de pesquisa


1.
Simulação Computacional de Sistemas Moleculares
2.
Cálculo de propriedades eletrônicas e espectro de RMN
3.
Estudo computacional de catálise enzimática
4.
Drug-design e química medicinal
5.
Simulação de dendrímeros e mecanismos de liberação controlada de fármacos
6.
Desenvolvimento de campos de força para simulações de dinâmica molecular


Projetos de pesquisa


2016 - Atual
Ampliação e Validação do Campo de Força 2016H66 e Aplicação na Simulação por Dinâmica Molecular de Sistemas de Interesse Biológico.
Descrição: Jovem Cientista do Nosso Estado (FAPERJ).
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (1) .
Integrantes: Bruno Araujo Cautiero Horta - Coordenador.
2016 - Atual
Desenvolvimento de estratégias contra a infecção pelo vírus Zika: estudos in silico da proteína NS1.
Descrição: O vírus Zika (ZIKV) é um flavivírus causador de uma doença re-emergente que abrange a escala mundial. Clinicamente, a doença se manifesta como um episódio de febre aguda, acompanhado de cefaléia e exantema. Outros sintomas como mialgia e dores articulares que acometem principalmente as mãos, joelhos e tornozelos também podem ocorrer ao longo da infecção. Em virtude do seu recente e rápido espalhamento na América Latina e tendo sido associado a casos de microcefalia, a Organização Mundial de Saúde anunciou que o surto causado por ZIKV representa uma questão emergencial de saúde pública. Devido à indisponibilidade de tratamento específico contra o ZIKV e dada a atual importância epidemiológica desta arbovirose, o desenvolvimento de medidas contra a doença torna-se de grande valia para a saúde pública. No caso do ZIKV, um interessante alvo para a pesquisa de novos fármacos ou estratégias vacinais é a proteína não estrutural 1 (NS1). Além deste alvo ser altamente conservadao entre os flavivírus ele parece desempenhar papel biológico importante para a manutenção do ciclo replicativo viral. Dessa forma, o presente projeto visa a pesquisa de estratégias para o combate ao ZIKV tendo como base métodos computacionais (in silico) e a proteína NS1. Técnicas de química e biologia computational como modelagem por homologia, triagem virtual, docking, dinâmica molecular e cálculos de energia livre serão empregadas para identificar potenciais fármacos atuantes na proteína NS1 de ZIKV ou mesmo identificar mutações determinantes na atenuação viral. Novos candidatos terapêuticos ou propostas de mutação podem, por sua vez, ser testados experimentalmente mediante parceria com outros laboratórios com a finalidade de definir melhor o impacto destes na infecção in vitro..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2013 - Atual
Otimização via CMA-ES de novos parâmetros no campo de força GROMOS para simulação computacional de dendrímeros por dinâmica molecular.
Descrição: Dendrímeros são moléculas altamente ramificadas que crescem radialmente, formando cavidades e possuindo superfícies altamente funcionalizadas. Dendrímeros têm sido usados em materiais, formulações farmacêuticas, nano-sensores, contrastes para ressonância magnética (MRI), terapia genética, cristalização, suportes para resinas, catálise, solubilização de moléculas e formulações cosméticas. Devido à crescente importância dos dendrímeros, vários estudos computacionais têm sido realizados no intuito de melhor entender suas propriedades estruturais e dinâmicas, bem como a natureza de suas interações com biomoléculas. No entanto, esses modelos necessitam de funções empíricas para o cálculo de energia, o chamado campo de força. Os últimos estudos sobre a interação de dendrímeros com biomoléculas têm sido muito importantes, mas tem revelado que ainda há muito a se melhorar no aspecto da construção desses campos de força e na compatibilidade desses com campos de força biomoleculares. O presente projeto tem como objetivo o desenvolvimento de um campo de forças para simulação de dendrímeros que seja compatível com o campo de força biomolecular GROMOS. Para isso, uma metodologia combinando o processo clássico de parametrização com métodos da inteligência computacional, como o CMA-ES, é proposta..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) .
Integrantes: Bruno Araujo Cautiero Horta - Integrante / Marco Aurélio Cavalcanti Pacheco - Coordenador / André Vargas Abs da Cruz - Integrante / Douglas Mota Dias - Integrante / Reinaldo Bellini Gonçalves - Integrante / Ricardo Bicca de Alencastro - Integrante / Marley Maria Bernardes Rebuzzi Vellasco - Integrante / Karla Tereza Figueiredo Leite - Integrante.Financiador(es): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ - Auxílio financeiro.
2012 - 2015
Método multi-docking generalizado: uma nova abordagem computacional para a modelagem de sistemas moleculares com aplicações em Nanotecnologia
Descrição: O presente projeto tem como foco a formação e consolidação de um grupo de pesquisa interdisciplinar envolvendo as instituições PUC-Rio, UFRJ e LNCC no intuito de desenvolver modelos computacionais para o estudo de sistemas de interesse em nanotecnologia. A interdisciplinaridade inerente dos estudos computacionais em sistemas nanotecnológicos está relacionada ao grau de diversidade do conjunto de ferramentas computacionais necessário para o entendimento dos sistemas em diversas escalas e níveis de teoria. No presente projeto, pretende-se desenvolver um algoritmo multi-docking generalizado (MDG), a partir do desenvolvimento de um sistema aqui denominado GeMDock, que permitirá o estudo das interações moleculares em sistemas complexos como nanotubos, dendrímeros, vesículas e sistemas porosos (e.g. zeólitas). As inúmeras aplicações industrais envolvendo tais sistemas abrangem desde o desenvolvimento de materiais semicondutores (i.e. transistores e outros nanocomponentes eletrônicos), passando por catálise heterogênea (i.e. indústria de intermediários e de combustíveis), até aplicações medicinais (i.e. sistemas de liberação controlada de fármacos). Para o desenvolvimento do algoritmo de MDG, assim como do aplicativo GeMDock, será necessário empregar técnicas de modelagem molecular, docking, dinâmica molecular, otimização e algoritmos evolutivos, tudo no contexto de programação orientada a objeto e envolvendo técnicas de computação de alto desempenho, principalmente, métodos de aceleração por GPU. Desta forma, é imprescindível a colaboração de forma interdisciplinar entre grupos especializados em modelagem computacional, modelagem molecular e computação de alto desempenho. Espera-se, desenvolver, testar e distribuir um código com múltiplas funcionalidades para multi-docking que seja flexível, eficiente, de fácil manutenção e modular. Espera-se também, aplicar os métodos desenvolvidos em sistemas de interesse tecnológico..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Doutorado: (1) .
Integrantes: Bruno Araujo Cautiero Horta - Integrante / Magaly Girão de Albuquerque - Integrante / Ribeiro, André A. S. T. - Integrante / Marco Aurélio Cavalcanti Pacheco - Coordenador / André Vargas Abs da Cruz - Integrante / Douglas Mota Dias - Integrante / Reinaldo Bellini Gonçalves - Integrante / Marco Antônio Chaer Nascimento - Integrante / Laurent Emmanuel Dardenne - Integrante / Isabela Guedes - Integrante / Ricardo Bicca de Alencastro - Integrante.Financiador(es): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ - Auxílio financeiro.


Projetos de extensão


2013 - 2013
I Seminário de Tecnologia Offshoe
Descrição: O evento é fruto de uma parceria entre a PUC-Rio e a Maersk Training. Seminário voltado para todos aqueles que tem interesse em aprender um pouco mais sobre o mercado Offshore Brasileiro, as demandas de mercado, regulamentos que regem essa indústria, salários praticados e obter um entendimento geral sobre a ciência por detrás desse mercado. Temas abordados: Frota Brasileira de Apoio Marítimo; Plataformas de Petróleo em águas Brasileiras; O Código ISPS (International Ship and Port Security Code) no Brasil; Introdução a Tecnologia Marítima; Sistema de Posicionamento Dinâmico; Introdução a Tecnologia da Perfuração; Processo de Produção de Petróleo; Demanda de profissionais para a indústria offshore e seus esperados salários..
Situação: Concluído; Natureza: Extensão.


Revisor de periódico


2007 - 2007
Periódico: Bioinformatics and Biology Insights
2010 - Atual
Periódico: Journal of Molecular Graphics & Modelling
2010 - Atual
Periódico: Journal of Computational Chemistry
2010 - Atual
Periódico: Journal of Chemical Theory and Computation
2011 - Atual
Periódico: Journal of the American Chemical Society (Print)
2012 - Atual
Periódico: Chemical Physics Letters (Print)
2014 - Atual
Periódico: Biopolymers Peptide Science
2014 - Atual
Periódico: Nature Communications
2015 - Atual
Periódico: Journal of Chemical Information and Modeling
2015 - Atual
Periódico: Journal of Molecular Modeling (Print)
2015 - Atual
Periódico: Langmuir
2016 - Atual
Periódico: Scientific Reports


Revisor de projeto de fomento


2014 - Atual
Agência de fomento: Fondo Nacional de Desarrollo Científico y Tecnológico


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Química / Subárea: Modelagem e Simulação de Sistemas Moleculares.
2.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Química / Subárea: Química Computacional.
3.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Química / Subárea: Química Teórica.


Idiomas


Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Espanhol
Compreende Pouco, Fala Pouco, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.
Alemão
Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.
Português
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Francês
Compreende Pouco, Fala Pouco, Lê Pouco, Escreve Pouco.


Prêmios e títulos


2017
Front Cover: European Journal of Organic Chemistry (EurJOC, 2017, 1566.), Wiley..
2016
Cientista do Nosso Estado, FAPERJ.
2015
Inside Cover: ChemCatChem 7, 984 (2015), Wiley.
2008
Bolsa Pós-doutorado, Swiss National Fundation.
2007
Aluno Destaque 2007, Programa de Pós-Graduação em Química Orgânica - IQ - UFRJ.
2007
Terceiro melhor painel apresentado na XIV SBQT, Simpósio Brasileiro de Química Teórica - SBQT.
2006
Aluno destaque 2006, Programa de Pós-Graduação em Química Orgânica - IQ - UFRJ.
2005
Melhor painel apresentado na XIII SBQT, Simpósio Brasileiro de Química Teórica - SBQT.
2004
Bolsa de mestrado, CAPES.
2004
Bolsa de doutorado (aprovado em primeiro lugar) - promovido para doutorado direto, CNPq.
2003
Segundo melhor painel apresentadado na XII SBQT, Simpósio Brasileiro de Química Teórica - SBQT.
2002
Bolsa Iniciação científica PIBIC, CNPq.


Produções



Produção bibliográfica
Citações

Web of Science
Total de trabalhos:39
Total de citações:557
Fator H:11
Horta, Bruno AC  Data: 30/10/2018

Artigos completos publicados em periódicos

1.
SILVA, RONALDO PEDRO DA2018SILVA, RONALDO PEDRO DA ; AMBRÓSIO, MATEUS FELIPE SCHUCHTER ; PIOVESAN, LUCIANA ALMEIDA ; FREITAS, MARIA CLARA RAMALHO ; AGUIAR, DANIEL LIMA MARQUES DE ; Horta, Bruno Araújo Cautiero ; EPPRECHT, EUGENIO KAHN ; SAN GIL, ROSANE AGUIAR DA SILVA ; VISENTIN, LORENZO DO CANTO . New Polymorph Form of Dexamethasone Acetate. JOURNAL OF PHARMACEUTICAL SCIENCES, v. 107, p. 672-681, 2018.

2.
MELLO, ISIS L.2018MELLO, ISIS L. ; LUBE, LEONARDO M. ; NEVES, EDUARDO S. ; TERRA, WAGNER S. ; FERNANDES, CHRISTIANE ; MATOS, CARLOS R.R. ; FRANCO, ROBERTO W.A. ; RESENDE, JACKSON A.L.C. ; VALENTE, DANIEL C.A. ; Horta, Bruno A.C. ; CARDOZO, THIAGO M. ; HORN, ADOLFO . Experimental and theoretical studies of a greener catalytic system for saturated hydrocarbon chlorination composed by trichloroisocyanuric acid and a copper(II) compound. APPLIED CATALYSIS A-GENERAL, v. 562, p. 150-158, 2018.

3.
DE SOUZA, RODRIGO OCTAVIO MENDONÇA ALVES2018DE SOUZA, RODRIGO OCTAVIO MENDONÇA ALVES ; SOTER, LEANDRO ; LEÃO, RAQUEL ; SUVEGES, NICOLAS ; RODRIGUEZ, ANDERSON ; DIEDERICHS, CARLA ; DE SOUZA, STEFANIA ; HORTA, BRUNO ; PEDRAZA, SERGIO ; VIANA, OTAVIO ; TERRA, JOSÉ HENRIQUE ; CEODARO, KARLA . Continuous-flow Synthesis of (R)-Propylene Carbonate: An Important Intermediate in the Synthesis of Tenofovir. EUROPEAN JOURNAL OF ORGANIC CHEMISTRY, v. x, p. x, 2018.

4.
DA SILVA, GUILHERME C. Q.2018DA SILVA, GUILHERME C. Q. ; CARDOZO, THIAGO MESSIAS ; AMARANTE, GIOVANNI WILSON ; ABREU, CHARLLES R. A. ; Horta, Bruno A. C. . Solvent effects on the decarboxylation of trichloroacetic acid: insights from ab initio molecular dynamics simulations.. PHYSICAL CHEMISTRY CHEMICAL PHYSICS, v. 20, p. 21988-21998, 2018.

5.
OLIVEIRA, EDSON R.A.2017OLIVEIRA, EDSON R.A. ; MOHANA-BORGES, RONALDO ; de Alencastro, Ricardo B. ; Horta, Bruno A.C. . The flavivirus capsid protein: Structure, function and perspectives towards drug design. Virus Research (Print), v. 227, p. 115-123, 2017.

6.
PEREIRA, ADRIANE A2017PEREIRA, ADRIANE A ; PEREIRA, AMANDA A ; DE MELLO, AMANDA C ; CARPANEZ, ARTHUR G ; HORTA, BRUNO A C ; AMARANTE, GIOVANNI WILSON . Methylsulfenylation of Electrophilic Carbons: Reaction Development, Scope, and Mechanism. European Journal of Organic Chemistry (Print), v. 2017, p. 1578-1582, 2017.

7.
DAVID, KATLYN SILVA2017DAVID, KATLYN SILVA ; OLIVEIRA, EDSON R.A. ; Horta, Bruno A.C. ; VALENTE, ANA PAULA ; DE PAULA, VIVIANE SILVA . Insights into CC chemokine ligand 2 - chemokine receptor 2 molecular recognition: a step forward towards anti-chemotactic agents. BIOCHEMISTRY, v. 56, p. 3197-3210, 2017.

8.
OLIVEIRA, EDSON R. A.2017OLIVEIRA, EDSON R. A. ; de Alencastro, Ricardo B. ; Horta, Bruno A. C. . New insights into flavivirus biology: the influence of pH over interactions between prM and E proteins. JOURNAL OF COMPUTER-AIDED MOLECULAR DESIGN, v. 31, p. 1009-1019, 2017.

9.
SENAC, CAROLINE2017SENAC, CAROLINE ; URBACH, WLADIMIR ; KURTISOVSKI, EROL ; HÜNENBERGER, PHILIPPE HENRY ; Horta, Bruno A.C. ; TAULIER, NICOLAS ; FUCHS, PATRICK FRANÇOIS JIMI . Simulating bilayers of nonionic surfactants with the GROMOS-compatible 2016H66 force field. LANGMUIR, v. 33, p. 10225-10238, 2017.

10.
ORTIZ-COLLAZOS, STEPHANIE2016ORTIZ-COLLAZOS, STEPHANIE ; GONÇALVES, YAN M.H. ; Horta, Bruno A.C. ; PICCIANI, PAULO H.S. ; LOURO, SONIA R.W. ; OLIVEIRA, OSVALDO N. ; PIMENTEL, ANDRÉ S. . Langmuir films and mechanical properties of polyethyleneglycol fatty acid esters at the air-water interface. Colloids and Surfaces. A, Physicochemical and Engineering Aspects (Print), v. 498, p. 50-57, 2016.

11.
OLIVEIRA, E. R. A.2016OLIVEIRA, E. R. A. ; ALENCASTRO, R. B. ; HORTA, B. A. C. . The mechanism by which P250L mutation impairs flavivirus-NS1 dimerization: an investigation based on molecular dynamics simulations. European Biophysics Journal, v. -, p. ---, 2016.

12.
Horta, Bruno A.C.2016 Horta, Bruno A.C.; MERZ, PASCAL T. ; FUCHS, PATRICK FRANÇOIS,JIMI ; Dolenc, Jozica ; Riniker, Sereina ; HÜNENBERGER, PHILIPPE HENRY . A GROMOS-compatible force field for small organic molecules in the condensed phase: The 2016H66 parameter set.. Journal of Chemical Theory and Computation, v. 12, p. 3825-3850, 2016.

13.
LANER, MONIKA2015LANER, MONIKA ; Horta, Bruno A.C. ; Hünenberger, Philippe H. . Long-timescale motions in glycerol-monopalmitate lipid bilayers investigated using molecular dynamics simulation. Journal of Molecular Graphics & Modelling, v. 55, p. 48-64, 2015.

14.
DE'MIRANDA, AMANDA S.2015DE'MIRANDA, AMANDA S. ; SIMON, ROBERT C. ; GRISCHEK, BARBARA ; DE'PAULA, GABRIEL C. ; Horta, Bruno A. C. ; DE'MIRANDA, LEANDRO S. M. ; KROUTIL, WOLFGANG ; KAPPE, C. OLIVER ; DE'SOUZA, RODRIGO O. M. A. . Chiral Chlorohydrins from the Biocatalyzed Reduction of Chloroketones: Chiral Building Blocks for Antiretroviral Drugs. ChemCatChem, v. 7, p. 984-992, 2015.

15.
BELLINI, REINALDO G.2015BELLINI, REINALDO G. ; GUIMARÃES, ANA P. ; PACHECO, MARCO A.C. ; DIAS, DOUGLAS M. ; FURTADO, VANESSA R. ; de Alencastro, Ricardo B. ; Horta, Bruno A.C. . Association of the anti-tuberculosis drug rifampicin with a PAMAM dendrimer. Journal of Molecular Graphics & Modelling, v. 60, p. 34-42, 2015.

16.
CAMPOMANES, P.2014CAMPOMANES, P. ; NERI, M. ; HORTA, B. A. C. ; ROEHRIG, U. ; VANNI, S. ; TAVERNELLI, I. ; ROTHLISBERGER, U. . Origin of the Spectral Shifts among the Early Intermediates of the Rhodopsin Photocycle. Journal of the American Chemical Society, v. 136, p. 3842-3851, 2014.

17.
LANER, MONIKA2014LANER, MONIKA ; Horta, Bruno A. C. ; Hünenberger, Philippe H. . Effect of the cosolutes trehalose and methanol on the equilibrium and phase-transition properties of glycerol-monopalmitate lipid bilayers investigated using molecular dynamics simulations. European Biophysics Journal, v. 43, p. 517-544, 2014.

18.
LANER, MONIKA2013LANER, MONIKA ; Horta, Bruno A.C. ; Hünenberger, Philippe H. . Phase-transition properties of glycerol-monopalmitate lipid bilayers investigated by molecular dynamics simulation: influence of the system size and force-field parameters. Molecular Simulation (Online), v. 39, p. 563-583, 2013.

19.
RUSU, VICTOR H.2013RUSU, VICTOR H. ; HORTA, VITOR A.C. ; Horta, Bruno A.C. ; LINS, ROBERTO D. ; BARON, RICCARDO . MDWiZ: A Platform for the Automated Translation of Molecular Dynamics Simulations. Journal of Molecular Graphics & Modelling, v. 48, p. 80-86, 2013.

20.
Kunz, Anna-Pitschna E.2012Kunz, Anna-Pitschna E. ; Allison, Jane R. ; Geerke, Daan P. ; Horta, Bruno A. C. ; Hünenberger, Philippe H. ; Riniker, Sereina ; Schmid, Nathan ; van Gunsteren, Wilfred F. . New functionalities in the GROMOS biomolecular simulation software. Journal of Computational Chemistry, v. 33, p. 340-353, 2012.

21.
Riniker, Sereina2012Riniker, Sereina ; Horta, Bruno A. C. ; Thijssen, Bram ; Gupta, Saumya ; van Gunsteren, Wilfred F. ; Hünenberger, Philippe H. . Temperature Dependence of the Dielectric Permittivity of Acetic Acid, Propionic Acid and Their Methyl Esters: A Molecular Dynamics Simulation Study. ChemPhysChem (Print), v. 13, p. 1182-1190, 2012.

22.
Hoelz, Lucas V.B.2012Hoelz, Lucas V.B. ; Ribeiro, André A.S.T. ; Bernardi, Rafael C. ; Horta, Bruno A.C. ; Albuquerque, Magaly G. ; da Silva, Joaquim F.M. ; Pascutti, Pedro G. ; de Alencastro, Ricardo B. . The role of helices 5 and 6 on the human β 1 -adrenoceptor activation mechanism. Molecular Simulation (Print), v. 2011, p. 1-5, 2012.

23.
Fuchs, Patrick F. J.2012 Fuchs, Patrick F. J. ; Hansen, Halvor S. ; Hünenberger, Philippe H. ; Horta, Bruno A. C. . A GROMOS Parameter Set for Vicinal Diether Functions: Properties of Polyethyleneoxide and Polyethyleneglycol. Journal of Chemical Theory and Computation, v. 8, p. 3943-3963, 2012.

24.
Horta, Bruno A. C.2012Horta, Bruno A. C.; Lin, Zhixiong ; Huang, Wei ; Riniker, Sereina ; van Gunsteren, Wilfred F. ; Hünenberger, Philippe H. . Reoptimized interaction parameters for the peptide-backbone model compound N-methylacetamide in the GROMOS force field: Influence on the folding properties of two beta-peptides in methanol. Journal of Computational Chemistry, v. 33, p. 1907-1917, 2012.

25.
HORTA, B. A. C.2011HORTA, B. A. C.; ALENCASTRO, Ricardo Bicca de . Structural and dynamic effects of changing the pattern of disulfide bonds in the vascular endothelial growth factor. REVISTA VIRTUAL DE QUÍMICA, v. 3, p. 37-50, 2011.

26.
Horta, Bruno A. C.2011 Horta, Bruno A. C.; Fuchs, Patrick F. J. ; van Gunsteren, Wilfred F. ; Hu nenberger, Philippe H. . New Interaction Parameters for Oxygen Compounds in the GROMOS Force Field: Improved Pure-Liquid and Solvation Properties for Alcohols, Ethers, Aldehydes, Ketones, Carboxylic Acids, and Esters. Journal of Chemical Theory and Computation, v. 7, p. 1016-1031, 2011.

27.
Hoelz, Lucas V.B.2011Hoelz, Lucas V.B. ; Bernardi, Rafael C. ; Horta, Bruno A.C. ; Araújo, Jocley Q. ; Albuquerque, Magaly G. ; da Silva, Joaquim F.M. ; Pascutti, Pedro G. ; de Alencastro, Ricardo B. . Dynamical behaviour of the human ß -adrenoceptor under agonist binding. Molecular Simulation (Print), v. 37, p. 907-913, 2011.

28.
Eichenberger, Andreas P.2011Eichenberger, Andreas P. ; Allison, Jane R. ; Dolenc, Jo ica ; Geerke, Daan P. ; Horta, Bruno A. C. ; Meier, Katharina ; Oostenbrink, Chris ; Schmid, Nathan ; Steiner, Denise ; Wang, Dongqi ; van Gunsteren, Wilfred F. . GROMOS++ Software for the Analysis of Biomolecular Simulation Trajectories. Journal of Chemical Theory and Computation, v. 7, p. 3379-3390, 2011.

29.
Horta, Bruno A. C.2011Horta, Bruno A. C.; Hu nenberger, Philippe H. . Enantiomeric Segregation in the Gel Phase of Lipid Bilayers. Journal of the American Chemical Society (Print), v. 133, p. 8464-8466, 2011.

30.
Horta, Bruno A.C.2010Horta, Bruno A.C.; Peri -Hassler, Lovorka ; Hünenberger, Philippe H. . Interaction of the disaccharides trehalose and gentiobiose with lipid bilayers: A comparative molecular dynamics study. Journal of Molecular Graphics & Modelling, v. 29, p. 331-346, 2010.

31.
Horta, Bruno A. C.2010 Horta, Bruno A. C.; de Vries, Alex H. ; Hu nenberger, Philippe H. . Simulating the Transition between Gel and Liquid-Crystal Phases of Lipid Bilayers: Dependence of the Transition Temperature on the Hydration Level. Journal of Chemical Theory and Computation, v. 6, p. 2488-2500, 2010.

32.
Hoelz, L. V. B.2010Hoelz, L. V. B. ; HORTA, B. A. C. ; ARAUJO, J. Q. ; Albuquerque, M. G. ; ALENCASTRO, Ricardo Bicca de ; Silva, J. F. M. . Quantitative structure-activity relationships of antioxidant phenolic compounds. Journal of Chemical and Pharmaceutical Research, v. 2, p. 291-306, 2010.

33.
HORTA, B. A. C.;Horta, Bruno Araújo Cautiero;Horta, Bruno A.C.;Horta, Bruno A. C.;HORTA, BRUNO A C;CAUTIERO HORTA, BRUNO ARAÚJO;HORTA, BRUNO2009HORTA, B. A. C.; Sodero, Ana Carolina Rennó ; ALENCASTRO, Ricardo Bicca de . Investigating the differential activation of vascular endothelial growth factor (VEGF) receptors. Journal of Molecular Graphics & Modelling, v. 28, p. 287-296, 2009.

34.
SILVA, B. V.2009SILVA, B. V. ; HORTA, B. A. C. ; ALENCASTRO, Ricardo Bicca de ; PINTO, A. C. . Proteínas quinases: características estruturais e inibidores químicos. QUIMICA NOVA, v. 32, p. 453-462, 2009.

35.
HORTA, B. A. C.;Horta, Bruno Araújo Cautiero;Horta, Bruno A.C.;Horta, Bruno A. C.;HORTA, BRUNO A C;CAUTIERO HORTA, BRUNO ARAÚJO;HORTA, BRUNO2008HORTA, B. A. C.; CIRINO, José Jair Vianna ; ALENCASTRO, Ricardo Bicca de . Correction of -Dynamical behavior of the vascular endothelial growth factor: Biological implications-. PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS, v. 70, p. 307-308, 2008.

36.
HORTA, B. A. C.;Horta, Bruno Araújo Cautiero;Horta, Bruno A.C.;Horta, Bruno A. C.;HORTA, BRUNO A C;CAUTIERO HORTA, BRUNO ARAÚJO;HORTA, BRUNO2008HORTA, B. A. C.; CIRINO, José Jair Vianna ; ALENCASTRO, Ricardo Bicca de . On the structure, interactions, and dynamics of bound VEGF. Journal of Molecular Graphics & Modelling, v. 26, p. 1091-1103, 2008.

37.
Ribeiro, A. A. S. T.2008Ribeiro, A. A. S. T. ; HORTA, B. A. C. ; ALENCASTRO, Ricardo Bicca de . MKTOP: a program for automatic construction of molecular topologies. Journal of the Brazilian Chemical Society (Impresso), v. 19, p. 1433-1435, 2008.

38.
DEMIRANDA, J2008DEMIRANDA, J ; DASILVACOELHO, J ; DEMOURA, L ; HERBST, M ; HORTA, B. A. C. ; DEALENCASTRO, R ; ALBUQUERQUE, M . Deamination process in the formation of a copper(II) complex with glutamic acid and a new ligand derived from guanidinoacetic acid: Synthesis, characterization, and molecular modeling studies. Polyhedron, v. 27, p. 2386-2394, 2008.

39.
HORTA, B. A. C.;Horta, Bruno Araújo Cautiero;Horta, Bruno A.C.;Horta, Bruno A. C.;HORTA, BRUNO A C;CAUTIERO HORTA, BRUNO ARAÚJO;HORTA, BRUNO2007HORTA, B. A. C.; CIRINO, José Jair Vianna ; ALENCASTRO, Ricardo Bicca de . Dynamical behavior of the vascular endothelial growth factor: Biological implications. Proteins (Print), v. 67, p. 517-525, 2007.

40.
CHOU, T-F2007CHOU, T-F ; TIKH, I. B. ; HORTA, B. A. C. ; GOSH, B. ; ALENCASTRO, Ricardo Bicca de ; Wagner, C. R. . Engineered Monomeric Human Histidine Triad Nucleotide-binding Protein 1 Hydrolyzes Fluorogenic Acyl-adenylate and Lysyl-tRNA Synthetase-generated Lysyl-adenylate. The Journal of Biological Chemistry (Print), v. 282, p. 15137-15147, 2007.

41.
ESTEVES, Pierre M.2005ESTEVES, Pierre M. ; ARAÚJO, Carolina Leite de ; HORTA, B. A. C. ; ALVAREZ, Luis Javier ; ZICOVICH-WILSON, Claudio M. ; RAMÍREZ-SOLÍS, Alejandro . The Isobutylene-Isobutane Alkylation Process in Liquid HF Revisited. Journal of Physical Chemistry B, The, v. 109, p. 12946-12955, 2005.

Trabalhos completos publicados em anais de congressos
1.
TAVARA, EDWIN GERMAN MALDONADO ; VELLASCO, MARLEY M. B. R ; Horta, Bruno A. C. ; CUSTODIO, FABIO L. . Feature importance calculation and protein quality assessment on the decoy discrimination problem. In: 2017 International Joint Conference on Neural Networks (IJCNN), 2017, Anchorage. 2017 International Joint Conference on Neural Networks (IJCNN), 2017. p. 248.

Resumos expandidos publicados em anais de congressos
1.
HORTA, B. A. C.; ALENCASTRO, Ricardo Bicca de ; ARAÚJO, Carolina Leite de ; ALVAREZ, Luis Javier ; ZICOVICH-WILSON, Claudio M. ; RAMÍREZ-SOLÍS, Alejandro ; ESTEVES, Pierre M. . Isobutylene-isobutane alkylation process in liquid HF revisited (oral contribution). In: American Chemical Society 232nd National Meeting & Exposition, september, 2006, San Francisco, CA. Preprints - American Chemical Society, Division of Petrolium Chemistry, 2006. v. 51. p. 610-613.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
GONCALVES, R. B. ; Guimarães, A. P. ; DIAS, D. M. ; PACHECO, M. A. C. ; FURTADO, V. R. ; de Alencastro, Ricardo B. ; Horta, Bruno A.C. . Association of the anti-tuberculosis drug rifampicin with PAMAM dendrimer: a molecular dynamics simulation study. In: BrazMedChem, 2014, Campos do Jordão. BrazMedChem 2014, 2014.

2.
Horta, Bruno A.C.. Enantio- and diastereo-segregation in the gel phase of lipid bilayers investigated by molecular dynamics simulations. In: Simpósio Brasileiro de Química Teórica (SBQT), 2013, Angra dos Reis. Simpósio Brasileiro de Química Teórica (SBQT), 2013.

3.
Horta, Bruno A.C.; Hünenberger, Philippe H. . Test and extension of the GROMOS 53A6OXY force field. In: BIOMOS symposium, 2010, Burg Arras. BIOMOS symposium, 2010.

4.
Horta, Bruno A.C.; Hünenberger, Philippe H. . Development of the new GROMOS 53A6OXY force field and application to the simulation of biodiesel models. In: Gordon Conference ? Computational Chemistry, 2010, Les Diablerets. Gordon Conference ? Computational Chemistry, 2010.

5.
Horta, Bruno A.C.; Hünenberger, Philippe H. . Development of new interaction parameters for the simulation of oxygen-containing compounds. In: BIOMOS symposium, 2009, Burg Arras. BIOMOS symposium, 2009.

6.
HORTA, B. A. C.; ALENCASTRO, Ricardo Bicca de . VEGF BINDING: A DYNAMICALLY DRIVEN PROCESS?. In: XXXVI Annual Meeting of the SBBq, 2007. Abstract Book of the XXXVI Annual Meeting of the SBBq, 2007.

7.
HORTA, B. A. C.; ALENCASTRO, Ricardo Bicca de . Molecular Dynamics Simulations of Bound VEGF. In: 234th ACS National Meeting, 2007, Boston. Abstract book of the 234th ACS National Meeting, 2007.

8.
HORTA, B. A. C.; ALENCASTRO, Ricardo Bicca de . The Dynamical Behavior of Angiogenic Signaling Proteins (selected for oral contribution). In: 3rd Brazilian Symposium on Medicinal Chemistry, november, 2006, São Pedro. Abstract Book of the 3rd Brazilian Symposium on Medicinal Chemistry, 2006. v. 3. p. S3-197.

9.
Clementino, L. F. ; HORTA, B. A. C. ; ALENCASTRO, Ricardo Bicca de . The Role of the Cystine Knot on the Dynamics of VEGF. In: 3rd Brazilian Symposium on Medicinal Chemistry, november, 2006, São Pedro. The Role of the Cystine Knot on the Dynamics of VEGF, 2006. v. 3. p. S3-196.

10.
Hoelz, L. V. B. ; HORTA, B. A. C. ; ALENCASTRO, Ricardo Bicca de ; Albuquerque, M. G. ; Silva, J. F. M. . Quantitative Structure-Antioxidant Activity Relationships of Phenolic Compounds. In: 3rd Brazilian Symposium on Medicinal Chemistry, november, 2006, São Pedro. Abstract Book of the 3rd Brazilian Symposium on Medicinal Chemistry, 2006. v. 3. p. S1-022.

11.
HORTA, B. A. C.; ARAÚJO, Carolina Leite de ; RAMÍREZ-SOLÍS, Alejandro ; ESTEVES, Pierre M. . Investigação do Mecanismo de Alquilação Isobutileno-Isobutano Catalisada por HF. In: 28 Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Química, 2005, Poços de Caldas - MG. Livro de Resumos da 28 RASBQ, 2005.

12.
HORTA, B. A. C.; OLIVEIRA, César Augusto Fernandes de ; ALENCASTRO, Ricardo Bicca de . Estudo Teórico da Bioativação do CB 1954 pela Nitrorredutase de Escherichia coli: Abordagem Termodinâmica, Estrutural e Eletrônica.. In: 28 Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Química, 2005, Poços de Caldas - MG. Livro de Resumos da 28 RASBQ, 2005.

13.
HORTA, B. A. C.; Correa, Rodrigo J ; OLIVEIRA, César Augusto Fernandes de ; ALENCASTRO, Ricardo Bicca de . Molecular Dynamics Simulation and AIM Theory Study on the Interactions of CB 1954 with the Nitroreductase Enzyme of the Bacteria Escherichia coli. In: 8th Latin American Conference on Physical Organic Chemistry, 2005, Florianópolis - SC. Abstract Book of the 8th Latin American Conference on Physical Organic Chemistry, 2005.

14.
HORTA, B. A. C.; Fleming, Felipe P ; ALENCASTRO, Ricardo Bicca de ; ESTEVES, Pierre M. . Theoretical Investigation on the Hydride Transfer Between Primary, Secondary and Tertiary Hydrocarbons. In: 8th Latin American Conference on Physical Organic Chemistry, 2005, Florianópolis - SC. Abstract Book of the 8th Latin American Conference on Physical Organic Chemistry, 2005.

15.
HORTA, B. A. C.; CIRINO, José Jair Vianna ; ALENCASTRO, Ricardo Bicca de . Molecular Dynamics Simulation of the Vascular Endothelial Growth Factor (VEGF) and Study of interactions with Inhibitors. In: XIII Simpósio Brasileiro de Química Teórica, 2005, São Pedro - SP. Livro de Resumos do XIII SBQT, 2005. p. 75-75.

16.
HORTA, B. A. C.; CIRINO, José Jair Vianna ; ALENCASTRO, Ricardo Bicca de . Estudo via dinâmica molecular do fator de crescimento endotelial (VEGF): um alvo molecular na inibição da angiogênese.. In: 28 Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Química, 2005, Poços de Caldas - MG. Livro de Resumos da 28 RASBQ, 2005.

17.
HORTA, B. A. C.; ALENCASTRO, Ricardo Bicca de . Abordagem por Orbitais Moleculares da Redução Enzimática do CB 1954: Uma Pródroga no Tratamento de Tumores Sólidos. In: II Workshop em Física Molecular e Espectroscopia, 2004, Niterói. http://www.fis.ufba.br/~iiwfme, 2004.

18.
HORTA, B. A. C.; COSTA, Luiz Antônio Sodré ; ROCHA, Willian R ; ALMEIDA, Wagner B de ; SANTOS, Helio Ferreira dos . Hydrolysis Process of Propylenic Cisplatin Analogues: An ab initio Study. In: XII Simpósio Brasileiro de Química Teórica, 2003, Caxambu. Livro de Resumos do XII SBQT, 2003. v. XII. p. P165-P165.

19.
COSTA, Luiz Antônio Sodré ; HORTA, B. A. C. ; ROCHA, Willian R ; ALMEIDA, Wagner B de ; SANTOS, Helio Ferreira dos . Estudo Teórico dos Processos de Hidrólise de Análogos da CIsplatina Com Propriedades Biológicas Promissoras. In: XVII Encontro Regional da SBQ-MG, 2003, Juiz de Fora. Livro de Resumos, 2003.

20.
HORTA, B. A. C.; COSTA, Luiz Antônio Sodré ; ROCHA, Willian R ; ALMEIDA, Wagner B de ; SANTOS, Helio Ferreira dos . Estudo ab initio de Análogos da Cisplatina: Uma Análise Cinética do Mecanismo da Reação de Hidrólise. In: 26 Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Química, 2003, Poços de Caldas - MG. Livro de Resumos, 2003.

21.
HORTA, B. A. C.; COURI, Mara Rubia C ; LIMA, Marlise A Viana ; ALMEIDA, Mauro V de ; SANTOS, Helio Ferreira dos . Estrutura e Propriedades Moleculares de Compostos Azo-Nitroaromáticos. In: VIII Escola Brasileira de Estrutura Eletrônica, 2002, Juiz de Fora-MG. Livro de Resumos - VIII Escola Brasileira de Estrutura Eletrônica (2002), 2002. p. 20-20.

22.
HORTA, B. A. C.; COSTA, Luiz Antônio Sodré ; ROCHA, Willian R ; ALMEIDA, Wagner B de ; SANTOS, Helio Ferreira dos . Estudo ab inito da hidrólise da cis-dicloropropilenodiaminoplatina (II): Uma análise cinética do mecanismo de ação. In: XVI Encontro Regional da SBQ-MG, 2002, Viçosa-MG. Livro de Resumos em CD-ROM, 2002.

Apresentações de Trabalho
1.
HORTA, B. A. C.. Drug-dendrimer association: structure and dynamics investigated by computer simulation. 2015. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

2.
Horta, Bruno A. C.. Molecular dynamics simulations of glycerolmonopalmitate bilayers: assessing the transition between gel and liquid-crystalline phases.. 2015. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

3.
HORTA, B. A. C.. Simulação Computacional de Biomoléculas. 2014. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

4.
HORTA, B. A. C.. Campos de Força Clássicos. 2014. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

5.
HORTA, B. A. C.. Metodologia de Dinâmica Molecular. 2014. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

6.
Horta, Bruno A.C.. Simulação Computacional de Biomoléculas. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

7.
HORTA, B. A. C.. Computer-Assisted Nanotechnology. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

8.
HORTA, B. A. C.. New Interaction Parameters for organic chemical functions in the GROMOS force field. 2012. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

9.
HORTA, B. A. C.. Nanotecnologia Computacional. 2012. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

10.
HORTA, B. A. C.. Applications of Molecular Dynamics Simulations in Biomolecular Systems. 2010. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

11.
HORTA, B. A. C.. Métodos Computacionais Aplicados ao Estudo de Biomoléculas. 2007. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

12.
HORTA, B. A. C.. The dynamical behaviour of angiogenic signaling proteins. 2006. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).


Produção técnica
Programas de computador sem registro
1.
RUSU, VICTOR H. ; HORTA, VITOR A.C. ; HORTA, B. A. C. ; LINS, ROBERTO D. ; BARON, RICCARDO . MDWiz. 2014.

2.
van Gunsteren, Wilfred F. Hünenberger, Philippe H. Allison, Jane R. Bakowies, Dirk Boerjesson, Ulf Buergui, Roland Choutko, Alexandra Christ, Clara Christen, Markus Dolenc, Jozica Eichenberger, Andreas P. Geerke, Daan P. Glaettli, Alice Hansen, Halvor Horta, Bruno A.C. Kastenholz, Mika Kunz, Anna-Pitschna E. Meier, Katharina Oostenbrink, Chris Peter, Christine Reif, Maria Riniker, Sereina Schaefer, Heiko Schmid, Nathan Steiner, Denise , et al.Wang, Dongqi Yu, Haibo ; GROMOS Simulation Software. 2011.

3.
Ribeiro, A. A. S. T. ; HORTA, B. A. C. ; ALENCASTRO, Ricardo Bicca de . MKTOP: A Program for generating molecular topologies. 2008.

Entrevistas, mesas redondas, programas e comentários na mídia
1.
HORTA, B. A. C.; WEISSMULLER, G. ; COSTA, L. T. . Ensino de Nanotecnologia - III Jornada de Nanotecnologia da UFRJ. 2013. (Programa de rádio ou TV/Mesa redonda).


Demais tipos de produção técnica
1.
HORTA, B. A. C.. Simulação Computacional de Sistemas Moleculares. 2013. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

2.
HORTA, B. A. C.. Molecular Dynamics Simulation Course. 2011. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

3.
HORTA, B. A. C.; ALENCASTRO, Ricardo Bicca de . Participação no módulo de Ácidos e Bases do Curso de Nivelamento do PGQO. 2007. (Curso de curta duração ministrado/Outra).



Bancas



Participação em bancas de trabalhos de conclusão
Mestrado
1.
PIMENTEL, A. S.; GRAMATGES, A. P.; CARVALHO, M. S.; HORTA, B. A. C.. Participação em banca de Stephanie Ortiz Collazos. Filmes de Langmuir de Ésteres de Polietilenoglicol Derivados de Ácidos Graxos. 2015. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação em Química da PUC-Rio) - Pontifícia Universidade Católica do Rio de Janeiro.

2.
SOUZA, P. L.; PIRES, M. P.; HORTA, B. A. C.; PACIORNIK, S.. Participação em banca de Jose Eduardo Ruiz Rosero. Caracterização óptica e morfológica de pontos quânticos de InAs.. 2015. Dissertação (Mestrado em Pós-Graduação em Eng. Elétrica - Nanotecnologia) - Pontifícia Universidade Católica do Rio de Janeiro.

Teses de doutorado
1.
PACHECO, M. A. C.; ALENCASTRO, Ricardo Bicca de; FURTADO, V. R.; HORTA, B. A. C.; CAFFARENA, E. R.; LAZO, J. L.. Participação em banca de Reinaldo Bellini Gonçalves. Modelagem Teórica/Computacional de Dendrímeros para o Transporte de Tuberculostáticos. 2012. Tese (Doutorado em Engenharia Elétrica) - Pontifícia Universidade Católica do Rio de Janeiro.

Qualificações de Doutorado
1.
PACHECO, M. A. C.; KUBRUSLY, C.; BARBOSA, A. G. H.; HORTA, B. A. C.; CRUZ, A. V. A.. Participação em banca de Iury Steiner. Novo método pós-Hartree-Fock por Algoritmos Evolutivos. 2012. Exame de qualificação (Doutorando em Doutorado em Engenharia Elétrica - Pontifícia Universidade Católica, RJ) - Pontifícia Universidade Católica do Rio de Janeiro.

Trabalhos de conclusão de curso de graduação
1.
ABREU, C. R. A.; CARDOZO, T. M.; SILVEIRA, A. J.; HORTA, B. A. C.; CARDOSO, M. J. E. M.. Participação em banca de Guilherme Carneiro Queiroz da Silva.Modelagem atomística de líquidos iônicos de interesse na indústria de alimentos. 2015. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia de Alimentos) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.




Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
Advanced School on Biomolecular Simulation.Molecular dynamics simulations of glycerol-monopalmitate bilayers: assessing the transition between gel and liquid-crystalline phases. 2015. (Outra).

2.
Congresso Regional da Sociadade Brasileira de Biofísica. PyPolyBuilder: A Python Program for the Creation of Molecular Topologies for Branched Macromolecules, Polymers and Supramolecular Structures. 2015. (Congresso).

3.
XL Annual Meeting of the Sociedade Brasileira de Biofísica. Drug-dendrimer association: structure and dynamics investigated by computer simulation. 2015. (Congresso).

4.
BrazMedChem. Association of the anti-tuberculosis drug rifampicin with PAMAM dendrimer: a molecular dynamics simulation study. 2014. (Congresso).

5.
Simpósio Brasileiro de Química Teórica (SBQT).Enantio- and diastereo-segregation in the gel phase of lipid bilayers investigated by molecular dynamics simulations. 2013. (Simpósio).

6.
BIOMOS symposium.Test and extension of the GROMOS 53A6OXY force field. 2010. (Simpósio).

7.
Gordon Conference ? Computational Chemistry. Development of the new GROMOS 53A6OXY force field and application to the simulation of biodiesel models. 2010. (Congresso).

8.
BIOMOS symposium.Development of new interaction parameters for the simulation of oxygen-containing compounds. 2009. (Simpósio).

9.
Workshop em Bioinformática Estrutural - LNLS. 2007. (Oficina).

10.
XXXVI Annual Meeting of the SBBq. VEGF BINDING: A DYNAMICALLY DRIVEN PROCESS?. 2007. (Congresso).

11.
3rd Brazilian Symposium on Medicinal Chemistry, november.The Dynamical Behavior of Angiogenic Signaling Proteins. 2006. (Simpósio).

12.
American Chemical Society 232nd National Meeting & Exposition, september.The isobutylene-isobutane alkylation process in liquid HF revisited. 2006. (Encontro).

13.
28 Reunião Anual da SBQ. 28 Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Química. 2005. (Congresso).

14.
8th Latin American Conference on Physical Organic Chemistry. 8th Latin American Conference on Physical Organic Chemistry. 2005. (Congresso).

15.
International Symposium of Advanced Therapies. 2005. (Simpósio).

16.
XIII Simpósio Brasileiro de Química Teórica.XIII Simpósio Brasileiro de Química Teórica. 2005. (Simpósio).

17.
II Workshop de Física Molecular e Espectroscopia. II Workshop de Física Molecular e Espectroscopia. 2004. (Congresso).

18.
26 Reunião Anual da SBQ. Estudo ab initio de Análogos da Cisplatina: Uma Análise Cinética do Mecanismo da Reação de Hidrólise. 2003. (Congresso).

19.
XII Simpósio Brasileiro de Química Teórica.XII Simpósio Brasileiro de Química Teórica. 2003. (Simpósio).

20.
XVII Encontro Regional da Sociedade Brasileira de Química - MG.Estudo Teórico dos Processos de Hidrólise de Análogos da CIsplatina Com Propriedades Biológicas Promissoras. 2003. (Encontro).

21.
25 Reunião Anual da SBQ. 2002. (Congresso).

22.
VIII Escola Brasileira de Estrutura Eletrônica.Estrutura e Propriedades Moleculares de Compostos Azo-Nitroaromáticos. 2002. (Outra).

23.
Workshop em Química Teórica - Evento Satélite do XVI Encontro Regional da Sociedade Brasileira de Química - MG. 2002. (Outra).

24.
XVI Encontro Regional da SBQ-MG.Estudo ab inito da hidrólise da cis-dicloropropilenodiaminoplatina (II): Uma análise cinética do mecanismo de ação. 2002. (Encontro).

25.
XV Encontro Regional da SBQ-MG. 2001. (Encontro).



Orientações



Orientações e supervisões em andamento
Dissertação de mestrado
1.
Mayk Caldas Ramos. Simulação de dendrímeros PAMAM e PPI utilizando o campo de força 2016H66: propriedades dos dendrímeros em solução e estudo da liberação controlada de fármacos.. Início: 2017. Dissertação (Mestrado em Química) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Orientador).

Tese de doutorado
1.
André Borges Farias. Estudo da inibição das proteínas IRAK-1 e IRAK-4: importantes alvos para o tratamento de inflamações. Início: 2018. Tese (Doutorado em Química) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Orientador).

2.
Yan Marques Henriques Gonçalves. Ampliação e Validação do Campo de Força 2016H66 através de metodologias avançadas de otimização de parâmetros.. Início: 2018. Tese (Doutorado em Química) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. (Orientador).

3.
Guilherme Carneiro Queiroz da Silva. Simulação multi-escala de surfactantes: avaliação de propriedades de transporte, escoamento em meios porosos e espalhabilidade. Início: 2017. Tese (Doutorado em Química) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. (Orientador).

4.
Adriane Antonia Pereira. O Emprego de Organocatálise no Estudo da Reatividade de Azalactonas Frente à Nucleófilos. Início: 2015. Tese (Doutorado em Química) - Universidade Federal de Juiz de Fora, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Coorientador).

5.
Edwin Germán Maldonado Távara. Inteligência computacional na análise de proteínas. Início: 2014. Tese (Doutorado em Doutorado) - Pontifícia Universidade Católica do Rio de Janeiro, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Coorientador).

Supervisão de pós-doutorado
1.
Edson Roberto Alves de Oliveira. Início: 2015. Universidade Federal do Rio de Janeiro, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior.

Iniciação científica
1.
Luciano Mariano da Silva Junior. Avaliação de diferentes derivações de cargas parciais no cálculo de propriedades de moléculas aromáticas por dinâmica molecular. Início: 2017. Iniciação científica (Graduando em Engenharia Química) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. (Orientador).


Orientações e supervisões concluídas
Dissertação de mestrado
1.
Carla Conti Diederichs. Resolução cinética do glicidol: um intermediário da síntese do Tenofovir. 2017. Dissertação (Mestrado em Química) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Coorientador: Bruno Araujo Cautiero Horta.

2.
Yan Marques Henriques Gonçalves. Estudo do efeito de correções de longo alcance das interações não-ligadas nas propriedades termodinâmicas de líquidos usando o campo de força 2016H66. 2016. Dissertação (Mestrado em Química) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Bruno Araujo Cautiero Horta.

3.
Rogério Cortez Brito Leite Póvoa. Otimização estrutural de aglomerados de carbono por programação genética. 2012. Dissertação (Mestrado em Engenharia Elétrica) - Pontifícia Universidade Católica do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Coorientador: Bruno Araujo Cautiero Horta.

Tese de doutorado
1.
Rogério Cortez Brito Leite Póvoa. Aplicação de métodos de inferência e otimização no desenvolvimento de materiais semicondutores. 2014. Tese (Doutorado em Doutorado) - Pontifícia Universidade Católica do Rio de Janeiro, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Coorientador: Bruno Araujo Cautiero Horta.

Iniciação científica
1.
Yan Marques. Cálculo de RMN de moléculas flexíveis. 2015. Iniciação Científica. (Graduando em Engenharia em Nanotecnologia) - Pontifícia Universidade Católica do Rio de Janeiro. Orientador: Bruno Araujo Cautiero Horta.

2.
Gabriel Coutinho de Paula. Método multi-docking generalizado: uma nova abordagem computacional para a modelagem de sistemas moleculares com aplicações em Nanotecnologia. 2013. Iniciação Científica. (Graduando em Engenharia em Nanotecnologia) - Pontifícia Universidade Católica do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Bruno Araujo Cautiero Horta.

Orientações de outra natureza
1.
Saumya Gupta. Temperature dependence of the dielectric permittivity of acetic acid, propionic acid and their methyl esters: A molecular dynamics simulation study. 2011. Orientação de outra natureza - Swiss Federal Institute of Technology Zurich. Orientador: Bruno Araujo Cautiero Horta.

2.
Bram Thijssen. Temperature dependence of the dielectric permittivity of acetic acid, propionic acid and their methyl esters: A molecular dynamics simulation study. 2011. Orientação de outra natureza - Swiss Federal Institute of Technology Zurich. Orientador: Bruno Araujo Cautiero Horta.



Inovação



Projetos de pesquisa


Educação e Popularização de C & T



Apresentações de Trabalho
1.
HORTA, B. A. C.. Applications of Molecular Dynamics Simulations in Biomolecular Systems. 2010. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).


Cursos de curta duração ministrados
1.
HORTA, B. A. C.. Molecular Dynamics Simulation Course. 2011. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

2.
HORTA, B. A. C.. Simulação Computacional de Sistemas Moleculares. 2013. (Curso de curta duração ministrado/Outra).




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