Carlos Henrique da Silveira

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  • Última atualização do currículo em 28/09/2018


Possui graduação incompleta em Ciências Biológicas (1988-1990) e graduação completa em Ciência da Computação (1991-1994), ambas pela Universidade Federal de Minas Gerais - UFMG. Doutorou-se em Bioinformática, também pela UFMG (2008). Teve sua tese eleita a melhor do programa em Workshop de 2007. Tem um perfil interdisciplinar, com experiência de mercado e acadêmica. No mercado, foi Gerente de TI pela RM Sistemas (1997-2001), Sócio-Gerente e Fundador da Polygonus Ltda (2001-2007). No ensino, atuou como Professor Assistente na Pontifícia Universidade Católica de Minas Gerais - PUC-MG e Professor Adjunto na Universidade Federal de Itajubá - UNIFEI. Foi professor adjunto III, do Departamento de Biotecnologia, Centro de Biotecnologia - CBIOTEC, na Universidade Federal da Paraíba - UFPB. Retornou à UNIFEI - Campus de Itabira, no final de 2013, onde está como professor associado I. Na pesquisa, tem experiência acadêmica na área de Bioinformática, com ênfase em Bioinformática Estrutural, Quimioinformática e Nanobioinformática, atuando principalmente nos seguintes temas: Modelagem Computacional de Biomoléculas e Nanomateriais Bioativos, Integração de Banco de Dados Bioquímicos, Mineração de Dados Bioquímicos, Simulações de Dinâmica Molecular e Ancoragem Molecular, Triagem Virtual de Alvos Biomoleculares Terapêuticos, Ligantes Moleculares ou Nanoestruturas Biomiméticas Drogáveis, Relação Sequência-Estrutura em Biomoléculas, Interfaces Proteína-Proteína, Redes Complexas em Biomoléculas. Colaborador no Programa de Pós-Graduação Multicêntrico em Química - PPGMQ-MG, da Rede Mineira de Química - RQ-MG. Colaborador no Programa Interunidades de Pós-Graduação em Bioinformática - UFMG. Na extensão, atuou na pós-graduação lato sensu em Engenharia Web da UNIFEI - campus de Itajubá (2010). Administrativamente, foi membro do colegiado do curso de Ciência da Computação, na UNIFEI - campus de Itajubá, e coordenador do curso de Engenharia da Computação, UNIFEI - campus de Itabira (2010-2012). Assessor de TI - CBiotec/UFPB, membro do NDE do curso de Biotecnologia/UFPB (2013) e do NDE do curso de Engenharia de Computação - campus de Itabira (2014-2015). Diretor de Pesquisa e Pós-Graduação da UNIFEI - Campus de Itabira (2015-2017). (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Carlos Henrique da Silveira
Nome em citações bibliográficas
silveira, c. h.;da silveira, c. h.;da Silveira, Carlos H.;da Silveira, Carlos H;DA SILVEIRA, CARLOS HENRIQUE;SILVEIRA, CARLOS H. DA

Endereço


Endereço Profissional
Universidade Federal de Itajubá, Campus Avançado de Itabira-MG.
Rua Irmã Ivone Drumond, 200
Distrito Industrial II
35903087 - Itabira, MG - Brasil
Telefone: (31) 38343544


Formação acadêmica/titulação


2003 - 2008
Doutorado em Bioinformática.
Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.
Título: Protein Cutoff Scanning: Aplicação da Varredura Exaustiva de Distâncias Inter-resíduos na Análise de Contatos Intracadeia em Proteínas Globulares., Ano de obtenção: 2008.
Orientador: Marcelo Santoro, Wagner Meira, Carlos Ramos, Goran Neshich.
Palavras-chave: Estrutura e Função de Proteínas; Bioinformática.
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Biofísica Molecular / Especialidade: Estrutura e Função de Proteínas.
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: BIOINFORMÁTICA / Especialidade: Proteômica.
1991 - 1994
Graduação em Ciência da Computação.
Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.
Título: Algoritmo Genético Aplicado à Modelagem Molecular: o Caso do Fechamento Geométrico de Loopings em Proteínas.
Orientador: Osvaldo Sérgio Farhat de Carvalho e Saul Gdansky Jacchieri.
1988 interrompida
Graduação interrompida em 1990 em Ciências Biológicas.
Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.
Título: Curso Incompleto.
Ano de interrupção: 1990
1987 interrompida
Graduação interrompida em 1987 em Licenciatura Curta Em Ciências.
Universidade Federal de São João Del-Rei, UFSJ, Brasil.
Título: Curso Incompleto.
Ano de interrupção: 1987




Formação Complementar


2007 - 2007
X-Meeting 2007 - Genomic Signal Processing. (Carga horária: 6h).
Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, AB3C, Brasil.
1999 - 1999
MS SQL 7.0 Administration. (Carga horária: 40h).
TBA Informática, TBA-MG, Brasil.
1997 - 1997
MS Windows NT 4.0 Advanced. (Carga horária: 40h).
TBA Informática, TBA-MG, Brasil.
1997 - 1997
MS Exchange Server 5.0 Administrator. (Carga horária: 40h).
TBA Informática, TBA-MG, Brasil.
1995 - 1995
Modeling Molecules: An Advanced Training Course. (Carga horária: 12h).
Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, SBBQ, Brasil.
1995 - 1995
Int. à Cristalografia e à Modelagem Molecular. (Carga horária: 24h).
Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.
1994 - 1994
Métodos Avançados p/ Análise Estrutural de Biomol.. (Carga horária: 80h).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.


Atuação Profissional



Universidade Federal de Itajubá, UNIFEI, Brasil.
Vínculo institucional

2013 - Atual
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Associado I, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações
A partir de 12/2013, em atividade novamente na UNIFEI por recondução. De 03/2013 a 12/2013, na UFPB. Adjunto III DE de 12/2013 a 02/2016 Adjunto IV DE de 02/2016 a 04/2018 Associado I DE de 04/2018 até o presente

Vínculo institucional

2008 - 2013
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Adjunto III, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações
Adjunto I DE de 07/2008 a 07/2010. Adjunto II DE de 08/2010 a 08/2012. Adjunto III DE de 09/2012 a 02/2013

Atividades

07/2015 - 12/2017
Direção e administração, Campus Avançado de Itabira-MG, .

Cargo ou função
Diretor de Pesquisa e Pós-Graduação.
08/2015 - 12/2015
Ensino, Engenharia de Computação, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
ECO021 - Rede de Computadores (Prática e Teórica)
08/2015 - 12/2015
Ensino, Multicêntrico em Química de Minas Gerais, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Seminários
08/2015 - 12/2015
Ensino, Engenharia da Mobilidade, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
ECOI05.2 - Fundamentos de Lógica de Programação (Prática)
08/2015 - 12/2015
Ensino, Engenharia de Materiais, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
ECOI05.2 - Fundamentos de Lógica de Programação (Prática)
03/2015 - 07/2015
Ensino, Engenharia de Computação, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
ECOI02 - Introdução à Programação - Teórica e Prática
03/2015 - 07/2015
Ensino, Engenharia de Computação, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
ECOI03 - Matemática Discreta - Teórica
06/2014 - 06/2015
Conselhos, Comissões e Consultoria, Campus Avançado de Itabira-MG, .

Cargo ou função
Membro do NDE - Núcleo Docente Estruturante - Engenharia de Computação.
08/2014 - 12/2014
Ensino, Engenharia de Computação, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
ECO021 - Rede de Computadores - Teoria e Prática
05/2014 - 12/2014
Conselhos, Comissões e Consultoria, Campus Avançado de Itabira-MG, .

Cargo ou função
Comissão de estudos para criação de programas de pós­-graduação.
02/2014 - 07/2014
Ensino, Engenharia Mecânica, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
BAC004 - Introdução à Programação - Teórica e Prática
02/2014 - 07/2014
Ensino, Engenharia de Materiais, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
BAC004 - Introdução à Programação - Teórica e Prática
10/2012 - 02/2013
Ensino, Engenharia de Computação, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
BAC006 - Eletricidade - Prática
12/2011 - 12/2012
Conselhos, Comissões e Consultoria, Campus Avançado de Itabira-MG, .

Cargo ou função
Comissão para Elaboração do Código de Conduta da UNIFEI.
11/2011 - 12/2012
Conselhos, Comissões e Consultoria, Campus Avançado de Itabira-MG, .

Cargo ou função
Comissão de Reforma das Normas de Colegiados de Cursos de Graduação.
10/2011 - 12/2012
Conselhos, Comissões e Consultoria, Campus Avançado de Itabira-MG, .

Cargo ou função
Comissão de Acompanhamento do Projeto Urbanístico-Arquitetônico do Campus Itabira.
01/2011 - 12/2012
Direção e administração, Campus Avançado de Itabira-MG, .

Cargo ou função
Coordenador de Curso.
03/2012 - 07/2012
Ensino, Engenharia da Computação, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
BACI01 - Ciência, Tecnologia e Sociedade - Teórico e Prática
ECO021 - Redes de Computadores - Teórico e Prática
08/2011 - 12/2011
Ensino, Engenharia da Computação, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
BAC004 - Introdução à Programação - Prática
ECO010 - Algoritmos e Estruturas de Dados I - Prática
03/2011 - 07/2011
Ensino, Engenharia da Computação, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
BAC001 - Ciência, Tecnologia e Sociedade
BAC004 - Introdução à Informática
08/2010 - 12/2010
Ensino, Engenharia da Computação, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
ECO-010 - Algoritmos e Estrutura de Dados II
03/2010 - 07/2010
Ensino, Ciência da Computação, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
CCT-410, ECO-501, ECO-601 - Redes de Computadores
CSP-210 - Empreendedorismo I
03/2010 - 07/2010
Ensino, Sistemas de Informação, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
SIF-410 - Metodologia Científica para Informática
03/2010 - 07/2010
Extensão universitária , Instituto de Ciências, Departamento de Matemática e Computação.

Atividade de extensão realizada
EWEB02 - Disciplina Programação WEB I: Web Estática (HTML, CSS e JavaScript), Pós-graduação Especialização.
04/2009 - 07/2010
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Ciências, Departamento de Matemática e Computação.

Cargo ou função
Membro do Colegiado do Curso de Ciência da Computação.
08/2009 - 12/2009
Ensino, Ciência da Computação, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
CCF-902 - Tópicos Especiais em Programação II - Introdução à Linguagem de Programação R
08/2009 - 12/2009
Ensino, Física Bacharelado, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
CCO-013 - Fundamentos de Programação
08/2009 - 12/2009
Ensino, Engenharia Mecânica, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
CCO-013 - Fundamentos de Programação
03/2009 - 07/2009
Ensino, Ciência da Computação, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
CCF-130 - Algoritmos e Estrutura de Dados III
CCO-313 - Computador e Sociedade
CCT-410,ECO-501, ECO-601 - Redes de Computadores
ECA-803 - Sistemas de Tempo Real
02/2009 - 07/2009
Extensão universitária , Instituto de Ciências, Departamento de Matemática e Computação.

Atividade de extensão realizada
EWEB02 - Disciplina Programação WEB I: Web Estática ( HTML, CSS e JavaScript), Pós-graduação Especialização em Engenharia Web..
01/2009 - 01/2009
Direção e administração, Instituto de Ciências, Departamento de Matemática e Computação.

Cargo ou função
Chefe de Departamento.
08/2008 - 12/2008
Ensino, Engenharia de Produção Mecânica, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
CCO-013 - Fundamentos de Programação
08/2008 - 12/2008
Ensino, Engenharia Elétrica, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
CCO-012 - Fundamentos de Programação II
CCO-013 - Fundamentos de Programação

Universidade Federal da Paraíba, UFPB, Brasil.
Vínculo institucional

2013 - 2013
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Adjunto III, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

10/2013 - 12/2013
Ensino, Biotecnologia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Disciplina Flexível - Introdução à Bioestatística
07/2013 - 12/2013
Direção e administração, Centro de Biotecnologia - Campus I, .

Cargo ou função
Assessor de TI.
04/2013 - 12/2013
Direção e administração, Centro de Biotecnologia - Campus I, .

Cargo ou função
Membro do NDE - Nucleo Docente Estruturante - da graduação de Biotecnologia.
10/2013 - 10/2013
Ensino, Doutorado em Biotecnologia - RENORBIO, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Bioinformática

Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.
Vínculo institucional

2008 - Atual
Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Colaborador, Carga horária: 4
Outras informações
Projetos de colaboração com o programa de doutorado em Bioinformática.

Vínculo institucional

1993 - 1994
Vínculo: Iniciação Científica, Enquadramento Funcional: Iniciação Científica, Carga horária: 20

Vínculo institucional

1988 - 1992
Vínculo: Voluntário, Enquadramento Funcional: Voluntário, Carga horária: 20

Atividades

09/2008 - 12/2008
Ensino, Bioinformática, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
BIQ-856 - Tópicos em Bioinformática: Introdução à Linguagem de Programação Estatística R
1/2003 - 2/2008
Pesquisa e desenvolvimento , Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Bioquímica e Imunologia.

1/2005 - 6/2005
Ensino, Bioinformática, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Tópicos em Bioinformática: Introdução à Ferramenta Sting.
6/1994 - 6/1997
Estágios , Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Bioquímica e Imunologia.

Estágio realizado
Estágio voluntário na implantação e gerenciamento da ICB-Net - Rede de Dados do ICB/UFMG.
1/1995 - 12/1996
Pesquisa e desenvolvimento , Instituto de Ciências Exatas, Departamento de Ciência da Computação.

1/1993 - 12/1994
Pesquisa e desenvolvimento , Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Bioquímica e Imunologia.

1/1989 - 6/1989
Estágios , Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Bioquímica e Imunologia.

Estágio realizado
Estágio Voluntário na Purificação e Caracterização de DAF no Lab. do Prof. Dr. Francisco Juarez Ramalho Pinto.

Pontifícia Universidade Católica de Minas Gerais, PUC Minas, Brasil.
Vínculo institucional

2008 - 2008
Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Professor Assistente I, Carga horária: 27

Atividades

02/2008 - 06/2008
Ensino, Sistemas de Informação, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Projeto de Diplomação I
Informática para Administração
Informática para Enfermágem
Interface Homem-Máquina
Linguagens de Programação
Sistemas Distribuídos

Polygonus - Tecnologia da Informação, PTI, Brasil.
Vínculo institucional

2001 - 2007
Vínculo: Diretor Presidente-Fundador, Enquadramento Funcional: Sócio-gerente

Atividades

05/2001 - 08/2007
Direção e administração, Diretoria de Tecnologia, .

Cargo ou função
Diretor Presidente.

Inspetoria Madre Mazzarello, IMM, Brasil.
Vínculo institucional

2003 - 2007
Vínculo: Assessor de TI, Enquadramento Funcional: Pessoa Jurídica, Carga horária: 20

Atividades

04/2003 - 04/2007
Serviços técnicos especializados , Diretoria Institucional I, .

Serviço realizado
Gerenciamento do parque tecnológico.

RM Sistemas, RM, Brasil.
Vínculo institucional

1997 - 2001
Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Gerente de Tecnologia da Informação, Carga horária: 40
Outras informações
Contratação CLT.

Atividades

06/1997 - 06/2001
Direção e administração, Departamento de T.I., .

Cargo ou função
Gerente de T.I..


Linhas de pesquisa


1.
Quimioinformática
2.
Nanobioinformática
3.
Modelagem Computacional
4.
Banco de Dados Biológicos
5.
Estrutura e Função de Proteínas
6.
Bioinformática Estrutural
7.
Computação Científica


Projetos de pesquisa


2014 - 2018
Previsão in silico e validação in vitro de ligantes de ricina: estudos multidisciplinares conjugados de triagem virtual, ancoragem flexível, análises termodinâmicas e de citotoxicidade
Descrição: Iniciar um estudo de descoberta racional de ligantes de ricina, num ciclo mais completo de previsão in silico e validação in vitro. Para isso, empreenderá: a construção de um banco de dados de ricinas e de uma vasta biblioteca de compostos; o uso de uma metodologia inovadora de triagem virtual (virtual screening), chamada CSM - Cutoff Scanning Matrix - desenvolvida pelo proponente para seleção de compostos candidatos (hits); o refino dessa seleção por ancoragem (docking) flexível, utilizando dinâmica molecular clássica e cálculos semiempíricos; a aquisição dos compostos mais promissores; a validação in vitro desses compostos, em ensaios termodinâmicos e citotoxicológicos..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
2014 - Atual
Bioinformática Estrutural de Proteínas: modelos, algoritmos e aplicações biotecnológicas
Descrição: Este projeto propõe-se enfrentar dois desafios biotecnológicos de grande relevância nacional. O primeiro envolve a ricina, uma potente fitotoxina encontrada na mamoneira. Co-produtos da produção do óleo de mamona podem conter quantidades letais de ricina. Além do risco de intoxicação animal e humana do bagaço, isso tem dificultado sua reutilização e reciclagem, em especial no semiárido nordestino. A ricina preocupa também pelo seu potencial uso como arma química. Portanto, há forte apelo para se encontrar meios efetivos de neutralizar, inibir e/ou detectar a ricina. O segundo envolve a modelagem de celulases multifuncionais, capazes de degradar eficientemente a lignocelulose, composto base para a produção de biocombustíveis de segunda geração, os quais têm por princípio a utilização de subprodutos de plantas que não podem ser usados na alimentação humana. Ambos desafios exigem uma abordagem multidisciplinar sinérgica entre a modelarem teórica in silico e experimental in vitro. Objetivos: 1) Prever in silico e validar in vitro ligantes de ricina 2) Simular in silico e caracterizar in vitro efeitos causados por intervenções estratégicas em beta-glicosidases modificadas. 3) Projetar, implementar e validar modelos, algoritmos e ferramentas de Quimioinformática e Bioinformática Estrutural de Proteínas que permitam dar suporte aos objetivos biotecnológicos previamente descritos. Espera-se que este projeto possa revelar novas plataformas químicas para o desenvolvimento de inibidores, kits de detecção, biossensores, neutralizadores (substratos suicidas) e outros produtos de inovação biotecnológica baseados na ricina, com potencial para alavancar o agronegócio da mamona e a indústria nacional de fármacos. Espera-se também a modelagem de celulases multifuncionais, capazes especialmente de orientar a manipulação genética de algas produtoras de $\beta$-glicosidases, com características catalíticas eficientes e de tolerância à inibição por glicose e celobiose, permitindo seu uso industrial na produção de etanol de segunda geração. Espera-se, em fim, que esses desafios possam inspirar novas metodologias matemáticas, computacionais, químicas e bioquímicas integradas, de modo a gerar artefatos biotecnológicos inovadores, bem como contribuir para a formação de profissionais com perfil multidisciplinar altamente qualificados..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (6) / Doutorado: (6) .
Integrantes: Carlos Henrique da Silveira - Integrante / Wagner Meira Junior - Integrante / Douglas Eduardo Valente Pires - Integrante / Valdete M. G. Almeida - Integrante / Marcos A. Santos - Integrante / SILVEIRA, SABRINA A. - Integrante / Raquel Cardoso de Melo Minardi - Coordenador / liv Soares Severino - Integrante / Gerd Bruno da Rocha - Integrante / Demetrius Antônio Machado de Araújo - Integrante / François Artiguenave - Integrante / Karine Bastard - Integrante / Marcel Salanoubat - Integrante / Gisele Lobo Pappa - Integrante / David Vallenet - Integrante / Thiago Ferreira Noronha - Integrante / Adriano Velasque Werhli - Integrante / Karina dos Santos Machado - Integrante / Luis Fernando Fernandes Marins - Integrante / David Ascher - Integrante / Tom Blundell - Integrante / Luis Cesar Rodrigues - Integrante / Leonardo Ramos Emmendorfer - Integrante / Paulo Lilles Jorge Drews Jr - Integrante / Bráulio Roberto Gonçalves Marinho Couto - Integrante.Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.
2011 - 2012
Caracterização das Transições entre Elementos de Estrutura Secundária em Proteínas
Descrição: Tem por objetivo identificar e caracterizar possíveis padrões de propensão nas transições entre elementos de estrutura secundária, especialmente hélices e fitas em cadeias que são preponderantemente compostas por fitas..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) .
Integrantes: Carlos Henrique da Silveira - Coordenador / Marcelo Matos Santoro - Integrante / Douglas Eduardo Valente Pires - Integrante / Matheus Venturyne Xavier Ferreira - Integrante.Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais - Bolsa.Número de orientações: 1
2010 - 2013
Modelos, algoritmos e heurísticas para a predição funcional de proteínas
Descrição: Investigação de técnicas computacionais que possibilitem a predição e classificação funcional de proteínas. Trabalharemos principalmente em três linhas de investigação: computação natural, métodos de aprendizagem supervisionada, redes de contatos..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2008 - 2012
Caracterização de Interfaces em Complexos Proteicos
Descrição: Tem por objetivo o desenvolvimento de métodos computacionais de identificação e caracterização de sítios catalíticos e interfaces proteína-proteína, através da implementação e testes de estratégias geométricas e heurísticas mistas..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) .
Integrantes: Carlos Henrique da Silveira - Coordenador / Marcelo Matos Santoro - Integrante / Wagner Meira Junior - Integrante / Douglas Eduardo Valente Pires - Integrante / Raquel Melo Minardi - Integrante / Valdete M. G. Almeida - Integrante / Fernando Afonso Santos - Integrante.Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais - Bolsa.
Número de produções C, T & A: 7 / Número de orientações: 1
2008 - 2010
Bioinformática e Nanobioinformática Estrutural
Descrição: Desenvolvimento de novas metodologias em Bioinformática e Nanobioinformática através da: caracterização de redes de contatos interatômicos em biomoléculas e biomateriais nanoestruturados; definição de algoritmos mais eficientes de geometria computacional aplicada à caracterização de contatos intrabiomoleculares; organização e integração de bases de dados biomoleculares e de nanoestruturas biofuncionais; recuperação e correlação de informações biomoleculares e de nanoestruturas em sistemas distribuídos..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (2) .
Integrantes: Carlos Henrique da Silveira - Coordenador / Marcelo Matos Santoro - Integrante / Caio Veloso - Integrante / Wagner Meira Junior - Integrante / Cristina Ribeiro - Integrante / Goran Neshich - Integrante / Douglas Eduardo Valente Pires - Integrante / Raul Habesch - Integrante / Júlio Cesar Dias Lopes - Integrante / Sabrina Silveira - Integrante / Raquel Melo Minardi - Integrante / Álvaro Antônio Alencar Queiroz - Integrante.Financiador(es): Pontifícia Universidade Católica de Minas Gerais - Cooperação / Universidade Federal de Itajubá - Cooperação / Universidade Federal de Minas Gerais - Cooperação / Embrapa Informática Agropecuária - Cooperação.
Número de produções C, T & A: 5 / Número de orientações: 3
2004 - 2006
Estudos da genômica, proteômica e estrutura de globinas
Descrição: Anotação genômica. Modelagem estrutural por SAXS. Bioinformática de globinas..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (3) .
Integrantes: Carlos Henrique da Silveira - Integrante / Marcelo Matos Santoro - Integrante / Raquel Cardoso de Melo - Integrante / Carlos Henrique Inácio Ramos - Coordenador.Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Número de produções C, T & A: 1 / Número de orientações: 1


Revisor de projeto de fomento


2009 - 2009
Agência de fomento: (FINEP) Financiadora de Estudos e Projetos


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: BIOINFORMÁTICA/Especialidade: Bioinformática Estrutural.
2.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Matemática da Computação/Especialidade: Modelos Analíticos e de Simulação.
3.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Biofísica Molecular/Especialidade: Estrutura e Função de Proteínas.
4.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Biofísica Molecular/Especialidade: Simulação e Modelagem Molecular.
5.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação/Especialidade: Banco de Dados.


Idiomas


Inglês
Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.
Espanhol
Compreende Razoavelmente, Fala Pouco, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.


Prêmios e títulos


2017
Best Student Paper Award, IEEE 17th International Conference on Bioinformatics and Bioengineering.
2016
Distinguished Student Paper Awards, IEEE 16th International Conference on Bioinformatics and Bioengineering.
2013
Co-orientação da Melhor Tese do Programa de Pós-Graduação em Bioinformática 2013 e Menção Honrosa Grande Prêmio UFMG de Teses na Área de Ciências Biológicas., Universidade Federal de Minas Gerais.
2008
Poster selecionado para a sessão "Paineis Sobre Além do Estado da Arte", 1o Simpósio Sobre Inovação e Criatividade Científica na EMBRAPA.
2007
1o lugar entre 14 como melhor projeto de tese no 1o Workshop da Bioinformática - UFMG, Programa de Doutorado em Bioinformática da UFMG..
2007
Poster "PDBEST - PDB Enhanced Structures Toolkit" escolhido para seção de flash talks como melhor trabalho na categoria databases., X-Meeting 2007 - AB3C.
1996
10 melhores trabalhos na V Semana de Iniciação Científica, UFMG - Universidade Federal de Minas Gerais.
1994
Menção Honrosa na III Semana de Iniciação Científica - Ciências da Vida, UFMG - Universidade Federal de Minas Gerais.
1994
Menção Honrosa na III Semana de Iniciação Científica - Ciências Exatas, UFMG - Universidade Federal de Minas Gerais.
1987
1o Lugar no Vestibular da UFSJ para o Curso de Licenciatura em Ciências, UFSJ - Universidade Federal de São João Del-Rei.


Produções



Produção bibliográfica
Artigos completos publicados em periódicos

1.
GONCALVES, W. R. S.2015GONCALVES, W. R. S. ; Goncalves-Almeida, V. M. ; ARRUDA, A. L. ; Meira, W. ; da silveira, c. h. ; PIRES, D. E. V. ; DE MELO-MINARDI, R. C. . PDBest: a user-friendly platform for manipulating and enhancing protein structures. Bioinformatics (Oxford. Print), v. 31, p. 2849-2896, 2015.

2.
SILVEIRA, SABRINA A.2014SILVEIRA, SABRINA A. ; DE MELO-MINARDI, RAQUEL C. ; DA SILVEIRA, CARLOS HENRIQUE ; SANTORO, Marcelo Matos ; MEIRA JUNIOR, Wagner . ENZYMAP: Exploiting Protein Annotation for Modeling and Predicting EC Number Changes in UniProt/Swiss-Prot. Plos One, v. 9, p. e89162, 2014.

3.
PIRES, D. E. V.2013 PIRES, D. E. V. ; de Melo-Minardi, R. C. ; da silveira, c. h. ; CAMPOS, F. F. ; Meira, W. . aCSM: Noise-free graph-based signatures to large-scale receptor-based ligand prediction. Bioinformatics (Oxford. Print), v. 1, p. 1, 2013.

4.
Goncalves-Almeida, V. M.2012Goncalves-Almeida, V. M. ; PIRES, D. E. V. ; de Melo-Minardi, R. C. ; da silveira, c. h. ; Meira, W. ; Santoro, M. M. . HydroPaCe: understanding and predicting cross-inhibition in serine proteases through hydrophobic patch centroids. Bioinformatics (Oxford. Print), v. 28, p. 342-349, 2012.

5.
Pires, Douglas EV2011 Pires, Douglas EV ; de Melo-Minardi, Raquel C ; dos Santos, Marcos A ; da Silveira, Carlos H ; Santoro, Marcelo M ; Meira, Wagner . Cutoff Scanning Matrix (CSM): structural classification and function prediction by protein inter-residue distance patterns. BMC Genomics, v. 12, p. S12, 2011.

6.
Ribeiro, Cristina2010Ribeiro, Cristina ; Togawa, Roberto C ; Neshich, Izabella AP ; Mazoni, Ivan ; Mancini, Adauto L ; Minardi, Raquel ; da Silveira, Carlos H ; Jardine, José G ; Santoro, Marcelo M ; Neshich, Goran . Analysis of binding properties and specificity through identification of the interface forming residues (IFR) for serine proteases in silico docked to different inhibitors. BMC Structural Biology (Online), v. 10, p. 36, 2010.

7.
da Silveira, Carlos H.2009 da Silveira, Carlos H.; Pires, Douglas E. V. ; Minardi, Raquel C. ; Ribeiro, Cristina ; Veloso, Caio J. M. ; Lopes, Julio C. D. ; Meira, Wagner ; Neshich, Goran ; Ramos, Carlos H. I. ; Habesch, Raul ; Santoro, Marcelo M. . Protein cutoff scanning: A comparative analysis of cutoff dependent and cutoff free methods for prospecting contacts in proteins. Proteins, v. 74, p. 727-743, 2009.

8.
MELO, Raquel Cardoso de2007MELO, Raquel Cardoso de ; RIBEIRO, C. ; MURRAY, C. ; VELOSO, C. ; silveira, c. h. ; NESHICH, G. ; MEIRA JUNIOR, Wagner ; CARCERONI, Rodrigo Lima ; SANTORO, Marcelo Matos . Finding Protein-Protein Interaction Patterns by Contact Map Matching. Genetics and Molecular Research, v. 6, p. 946-963, 2007.

9.
VELOSO, C.2007VELOSO, C. ; silveira, c. h. ; RIBEIRO, C. ; MELO, Raquel Cardoso de ; LOPES, J. C. D. ; SANTORO, Marcelo Matos ; MEIRA JUNIOR, Wagner . On The Characterization Of Energy Networks Of Proteins. Genetics and Molecular Research, v. 6, p. 799-820, 2007.

10.
MELO, Raquel Cardoso de2006MELO, Raquel Cardoso de ; LOPES, C. E. R. ; FERNANDES JUNIOR, Fernando ; silveira, c. h. ; SANTORO, Marcelo Matos ; CARCERONI, Rodrigo Lima ; MEIRA JUNIOR, Wagner ; ARAUJO, A. A. . A contact map matching approach to protein structure similarity analysis. Genetics and Molecular Research, v. 5, p. 284-308, 2006.

11.
PRADO, Tiago2003PRADO, Tiago ; MEIRA JUNIOR, Wagner ; SANTORO, Marcelo Matos ; silveira, c. h. ; MELO, Raquel Cardoso de ; FONSECA, João Ayala ; FERNANDES JUNIOR, Fernando ; ANDRADE, Emílio ; CARVALHO, Marcio Bunte de ; CARCERONI, Rodrigo Lima ; RAMOS, Carlos Henrique Inácio . Using Structural Signatures for Identifying Globins: the intra-subunit electrostatic Interactions. Revista de Tecnologia da Informação, v. 3, n.2, p. 115-118, 2003.

Capítulos de livros publicados
1.
FASSIO, ALEXANDRE V. ; SANTANA, CHARLES A. ; CERQUEIRA, FABIO R. ; da Silveira, Carlos H. ; Romanelli, João P. R. ; DE MELO-MINARDI, RAQUEL C. ; SILVEIRA, SABRINA DE A. . An Interactive Strategy to Visualize Common Subgraphs in Protein-Ligand Interaction. Lecture Notes in Computer Science. 1ed.: Springer International Publishing, 2018, v. , p. 383-394.

Textos em jornais de notícias/revistas
1.
da Silveira, Carlos H. A Nova Acabira. O TREM, Itabira-MG, p. 1 - 15, 01 abr. 2013.

2.
SILVEIRA, C. H.. Gripe A: Qual o Tamanho do seu Medo?. Itajubá Notícias, Itajubá, MG, 19 ago. 2009.

3.
da Silveira, Carlos H. A Nuvem: o PC virtual está mais perto do que você imagina. Hoje em Dia, Belo Horizonte, 01 jan. 2008.

4.
MARTINS, R. P. ; MARI, H. ; da Silveira, Carlos H . Livro Marca Ação Interdisciplinar na UFMG. Hoje em Dia, Belo Horizonte, 02 nov. 2002.

Trabalhos completos publicados em anais de congressos
1.
MARTINS, PEDRO M. ; MAYRINK, VINÍCIUS D. ; DE A. SILVEIRA, SABRINA ; da Silveira, Carlos H. ; DE LIMA, LEONARDO H. F. ; DE MELO- MINARDI, RAQUEL C. . How to compute protein residue contacts more accurately?. In: the 33rd Annual ACM Symposium, 2018, Pau. Proceedings of the 33rd Annual ACM Symposium on Applied Computing - SAC '18, 2018. p. 60.

2.
MEDINA G., SUSANA ; FASSIO, ALEXANDRE VICTOR ; SILVEIRA, SABRINA DE A ; da Silveira, Carlos H. ; DE MELO-MINARDI, RAQUEL C. . CALI: A Novel Visual Model for Frequent Pattern Mining in Protein-Ligand Graphs. In: 2017 IEEE 17th International Conference on Bioinformatics and Bioengineering (BIBE), 2017, Washington. 2017 IEEE 17th International Conference on Bioinformatics and Bioengineering (BIBE), 2017. p. 352-358.

3.
SANTANA, CHARLES A. ; CERQUEIRA, FABIO R. ; SILVEIRA, CARLOS H. DA ; FASSIO, ALEXANDRE V. ; MELO-MINARDI, RAQUEL C. DE ; SILVEIRA, SABRINA DE A. . GReMLIN: A Graph Mining Strategy to Infer Protein-Ligand Interaction Patterns. In: 2016 IEEE 16th International Conference on Bioinformatics and Bioengineering (BIBE), 2016, Taichung. 2016 IEEE 16th International Conference on Bioinformatics and Bioengineering (BIBE). p. 28.

4.
SILVEIRA, SABRINA A. ; FASSIO, A. V. ; DA SILVEIRA, CARLOS HENRIQUE ; DE MELO-MINARDI, R. C. . Revealing protein-ligand interaction patterns through frequent subgraph mining. In: International Conference on Bioinformatics & Computational Biology (BIOCOMP), 2015, Las Vegas, USA. Proceedings of the International Conference on Bioinformatics & Computational Biology (BIOCOMP), 2015. p. 50.

5.
SILVEIRA, SABRINA A. ; RODRIGUES, ARTUR O. ; DE MELO-MINARDI, RAQUEL C. ; DA SILVEIRA, CARLOS HENRIQUE ; Meira, Wagner . ADVISe: Visualizing the dynamics of enzyme annotations in UniProt/Swiss-Prot. In: 2012 IEEE Symposium on Biological Data Visualization (BioVis), 2012, Seattle. 2012 IEEE Symposium on Biological Data Visualization (BioVis).

Resumos expandidos publicados em anais de congressos
1.
CESPEDES, J. G. ; SILVEIRA, C. H. ; DRUMMOND, I. ; MATTEDI, A. P. ; ALMEIDA, V. M. G. ; SANTORO, Marcelo Matos ; MEIRA JUNIOR, Wagner . Aplicação e Validação do Método de Agrupamento Hierárquico Bayesiano. In: 10o EBEB - Encontro Brasileiro de Estatística Bayesiana, 2010, Angra dos Reis. Anais do 10o EBEB - Encontro Brasileiro de Estatística Bayesiana, 2010.

2.
DRUMMOND, I. ; CESPEDES, J. G. ; SILVEIRA, C. H. ; MATTEDI, A. P. ; ALMEIDA, V. M. G. ; SANTORO, Marcelo Matos ; MEIRA JUNIOR, Wagner . Estudos Comparativos Envolvendo Classificação Bayesiana em Dados Protéicos. In: 10o EBEB - Encontro Brasileiro de Estatística Bayesiana, 2010, Angra dos Reis. Anais do 10o EBEB - Encontro Brasileiro de Estatística Bayesiana, 2010.

3.
FERNANDES JUNIOR, Fernando ; LOPES, C. E. R. ; MELO, Raquel Cardoso de ; SANTORO, Marcelo Matos ; CARCERONI, Rodrigo Lima ; MEIRA JUNIOR, Wagner ; silveira, c. h. ; ARAUJO, A. A. . An Image-Matching Approach to Protein Similarity Analysis. In: XVII Brazilian Symposium on Computer Graphics and Image Processing (SIBGRAPI), 2004, Curitiba. Proceedings of IEEE Computer Society Press, 2004.

4.
MELO, Raquel Cardoso de ; LOPES, C. E. R. ; FERNANDES JUNIOR, Fernando ; silveira, c. h. ; SANTORO, Marcelo Matos ; CARCERONI, Rodrigo Lima ; MEIRA JUNIOR, Wagner ; ARAUJO, A. A. . A Contact Map Matching Approach to Protein Structure Similarity Analysis. In: II International Conference on Bioinformatics and Computational Biology, 2004, Angra dos Reis. Annals of II International Conference on Bioinformatics and Computational Biology, 2004.

5.
silveira, c. h.; SANTORO, Marcelo Matos ; ARABE, J. N. C. . Parallel Simulation of Protein Folding by Search Space Partition. In: International Symposium on Theoretical and Experimental Aspects of Protein Folding, 1996, San Luis, Argentina. Annals of International Symposium on Theoretical and Experimental Aspects of Protein Folding, 1996.

6.
COELHO, L. S. ; silveira, c. h. ; CAMPOS, M. F. M. . The Use of Genetic Algorithms for the Evaluation of Inverse Kinematics of Manipulators. In: First Brazilian Simposium of Neuronal Network, 1994, Itajubá. Annals of the First Brazilian Simposium of Neuronal Network, 1994.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
MARTINS, P. M. ; GONÇALVES, W. R. S. ; ALMEIDA, V. M. G. ; SANTORO, Marcelo Matos ; SILVEIRA, C. H. ; DE MELO-MINARDI, R. C. . Comparative analysis of atomic interactions in protein-protein interfaces. In: X-Meeting BSB 2013 - International Conference of the AB3C and Brazilian Symposium on Bioinformatics, 2013, Recife. Annals of X-Meeting BSB 2013, 2013.

2.
MARTINS, P. M. ; CAMPELO, J. A. F. G. ; CABRAL, A. ; ALMEIDA, V. M. G. ; SANTORO, Marcelo Matos ; da Silveira, Carlos H ; MINARDI, R. M. . Mapping atomic interaction in protein-protein interfaces. In: X-Meeting 2012 - 8th International Conference of the AB3C, 2012, Campinas. Annals of X-Meeting 2012 - 8th International Conference of the AB3C, 2012.

3.
CAMPELO, J. A. F. G. ; CABRAL, A. ; MARTINS, P. M. ; ALMEIDA, V. M. G. ; SANTORO, Marcelo Matos ; da Silveira, Carlos H ; MINARDI, R. M. . Atomic accessibilities of polar and apolar residues. In: X-Meeting 2012 - 8th International Conference of the AB3C, 2012, Campinas. Annals of X-Meeting 2012 - 8th International Conference of the AB3C, 2012.

4.
CARVALHO, L. F. M. ; PIRES, D. E. V. ; MINARDI, R. M. ; SILVEIRA, C. H. ; SANTORO, Marcelo Matos ; MEIRA JUNIOR, Wagner . A Comparison of Dimensionality and Noise Reduction Methods Applied to Protein Function Prediction. In: X-Meeting 2011 - 7th International Conference of the AB3C, 2011, Florianópolis. Annals of X-Meeting 2011 - 7th International Conference of the AB3C, 2011.

5.
ALMEIDA, V. M. G. ; da silveira, c. h. ; OLIVEIRA, E. L. M. ; LOPES, J. C. D. ; MEIRA JUNIOR, Wagner ; CESPEDES, J. G. ; DRUMMOND, I. ; MATTEDI, A. P. ; SANTORO, Marcelo Matos . Application of Bayesian Hierarchical Clustering for Finding Patterns in Molecular Interfaces of Serine Proteases. In: SB-Meeting - Brasil Deutschland Systems Biology Meeting, 2010, Ouro Preto. Annals of SB-Meeting - Brasil Deutschland Systems Biology Meeting, 2010.

6.
PIRES, D. E. V. ; MEIRA JUNIOR, Wagner ; da silveira, c. h. ; SANTORO, Marcelo Matos . Relevant Patterns in Contact Networks of Globular Proteins. In: SB-Meeting - Brasil Deutschland Systems Biology Meeting, 2010, Ouro Preto. Annals of SB-Meeting - Brasil Deutschland Systems Biology Meeting, 2010.

7.
OLIVEIRA, A. B. N. ; SILVA, M. J. J. ; CRUZ, J. C. R. ; da silveira, c. h. ; SANTORO, Marcelo Matos . Study of Folding Process of Miniproteins. In: SB-Meeting - Brasil Deutschland Systems Biology Meeting, 2010, Ouro Preto. Annals of SB-Meeting - Brasil Deutschland Systems Biology Meeting, 2010.

8.
SOUZA, J. S. ; FELIX, C. P. ; SILVEIRA, C. H. ; QUEIROZ, A. A. A. . Molecular Dynamics Simulation of Polyglycerol Dendrimer in Physiological Medium. In: V EMMSB - Escola de Modelagem Molecular de Sistemas Biológicos, 2010, Petrópolis. Anais da V EMMSB - Escola de Modelagem Molecular de Sistemas Biológicos, 2010.

9.
CELSTINO, J. ; SOUZA, J. S. ; FELIX, C. P. ; SILVEIRA, C. H. ; QUEIROZ, A. A. A. . Gadolinium-Polyglycerol Dendrimer Complex and Some of Its Derivatives: A Molecular Dynamics Simulation. In: V Escola de Modelagem Molecular de Sistemas Biológicos, 2010, Petrópolis. Anais da V Escola de Modelagem Molecular de Sistemas Biológicos, 2010.

10.
PIRES, D. E. V. ; MINARDI, R. M. ; SANTOS, M. A. ; da silveira, c. h. ; SANTORO, Marcelo Matos ; MEIRA JUNIOR, Wagner . Cutoff Scanning Matrix (CSM): Function Prediction and Fold Recognition by Inter-Residue Distance Patterns. In: X-Meeting 2010 - 6th International Conference of the AB3C, 2010, Ouro Preto. Annals of X-Meeting 2010 - 6th International Conference of the AB3C, 2010.

11.
OLIVEIRA, E. L. M. ; ALMEIDA, V. M. G. ; MEIRA JUNIOR, Wagner ; da silveira, c. h. ; MINARDI, R. M. ; PIRES, D. E. V. ; SANTORO, Marcelo Matos ; LOPES, J. C. D. . Interactions Network in Protein-Ligand Complexes. In: X-Meeting 2010 - 6th International Conference of the AB3C, 2010, Ouro Preto. Annals of X-Meeting 2010 - 6th International Conference of the AB3C, 2010.

12.
CESPEDES, J. G. ; da silveira, c. h. ; DRUMMOND, I. ; ALMEIDA, V. M. G. ; SANTORO, Marcelo Matos ; MEIRA JUNIOR, Wagner . Comparison of partitional and hierarchical clustering in protein data. In: XXVth International Biometric Conference (IBC-2010), 2010, Florianópolis. Annals of XXVth International Biometric Conference (IBC-2010), 2010.

13.
ALVES, N. ; OLIVEIRA, A. B. N. ; XAVIER, L. P. ; SILVEIRA, C. H. ; SANTORO, Marcelo Matos . Finding a Parabolic Competitive Inhibition Site of Rat Tissue Kalikrein by Aprotinin. In: SB-Meeting - Brasil Deutschland Systems Biology Meeting, 2010, Ouro Preto. Annals of SB-Meeting - Brasil Deutschland Systems Biology Meeting, 2010.

14.
ALMEIDA, V. M. G. ; SILVEIRA, S. ; CREPALDE, M. A. ; GOMES, A. F. M. ; PIRES, D. E. V. ; SILVEIRA, C. H. ; LOPES, J. C. D. ; SANTORO, Marcelo Matos . Using Singular Value Decomposition on Patterns in Subtilase-Inhibitor Complexes. In: X-Meeting 2009 - 5th International Conference of the AB3C, 2009, Angra dos Reis. Proceedings of 5th International Conference of Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2009.

15.
SILVEIRA, S. ; SILVEIRA, C. H. ; MEIRA JUNIOR, Wagner . A Wiki Annotation System for Biological Databases. In: X-Meeting 2009 - 5th International Conference of the AB3C, 2009, Angra dos Reis. Proceedings of 5th International Conference of Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2009.

16.
SILVEIRA, S. ; LOPES, J. C. D. ; silveira, c. h. ; SANTORO, Marcelo Matos ; MEIRA JUNIOR, Wagner ; PIRES, D. E. V. . Virtual Integration of Biological Databases Through Web Services. In: X-Meeting 2008 - 4th International Conference of the AB3C, 2008, Salvador. Proceedings of 4th International Conference of Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2008.

17.
PIRES, D. E. V. ; silveira, c. h. ; HABESCH, R. ; SANTORO, Marcelo Matos ; MEIRA JUNIOR, Wagner . Orangines: Understanding proteins through sphere packing simulations. In: X-Meeting 2008 - 4th International Conference of the AB3C, 2008, Salvador. Proceedings of 4th International Conference of Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2008.

18.
MINARDI, R. M. ; GOMIDE, J. ; silveira, c. h. ; NESHICH, G. ; MEIRA JUNIOR, Wagner ; SANTORO, Marcelo Matos . Protein Family Structural Classification Based on Intra-Chain Contacts. In: X-Meeting 2008 - 4th International Conference of the AB3C, 2008, Salvador. Proceedings of 4th International Conference of Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2008.

19.
NESHICH, G. ; JARDINE, J. G. ; BERNARDES, R. ; MAZONI, I. ; MANCINI, A. ; silveira, c. h. . Cloud Computation na forma de serviços WEB para um banco de dados federativo do STING-RDB.. In: I Simpósio sobre Inovação e Criatividade Científica na Embrapa, 2008, Brasilia. Resumos do I Simpósio sobre Inovação e Criatividade Científica na Embrapa, 2008.

20.
ALMEIDA, V. M. G. ; SILVEIRA, S. ; CREPALDE, M. A. ; SANTOS, M. A. ; MINARDI, R. M. ; silveira, c. h. ; LOPES, J. C. D. ; SANTORO, Marcelo Matos . Using singular value decomposition and latent semantic indexing to search structural signatures in subtlase protein family. In: BIOMAT International Symposium on Mathematical and Computational Biology, 2008, Campos do Jordão. Annals of BIOMAT International Symposium on Mathematical and Computational Biology, 2008.

21.
PIRES, D. E. V. ; silveira, c. h. ; MEIRA JUNIOR, Wagner ; SANTORO, Marcelo Matos . PDBEST - PDB Enhanced Structures Toolkit. In: X-Meeting 2007 - 3rd Annual Conference of the AB3C, 2007, São Paulo. Annals of the X-Meeting 2007, 2007.

22.
WAISBERG, M. ; LOBO, F. P. ; silveira, c. h. ; SANTORO, Marcelo Matos . Classification of Globins based on amino acid content: An exploratory data analysis approach. In: X-Meeting 2005 - 1st International Conference of the AB3C, 2005, Caxambu. Annals of X-Meeting 2005 - 1st International Conference of the AB3C, 2005.

23.
MELO, Raquel Cardoso de ; MURRAY, C. ; ALVIM JUNIOR, M. S. A. ; silveira, c. h. ; CARCERONI, Rodrigo Lima ; MEIRA JUNIOR, Wagner ; SANTORO, Marcelo Matos . Predicting Globin Folding Pathways Using an Unfolding Heuristic. In: X-Meeting 2005 - 1st International Conference of the AB3C, 2005, Caxambu. Annals of X-Meeting 2005 - 1st International Conference of the AB3C, 2005.

24.
silveira, c. h.; SANTORO, Marcelo Matos ; RAMOS, Carlos Henrique Inácio ; MEIRA JUNIOR, Wagner ; MELO, Raquel Cardoso de ; RIBEIRO, C. ; VELOSO, C. . Why Different Amino Acid Sequences Can Determine Similar Protein Structures: the Search for a Structural-Sequencial Signature in Globins and Serino-Proteases Families?. In: II International Conference on Bioinformatics and Computational Biology, 2004, Angra dos Reis. Annals of II International Conference on Bioinformatics and Computational Biology, 2004.

25.
VELOSO, C. ; MEIRA JUNIOR, Wagner ; SANTORO, Marcelo Matos ; silveira, c. h. . Application of Information Theory Principles to Mine Relationships in Globins Helices. In: 1st International Conference on Bionformatics and Computacional Biology, 2003, Ribeirão Preto. Proceedings of the 1st International Conference on Bionformatics and Computacional Biology, 2003.

26.
MORAES, G. M. ; silveira, c. h. ; MARES-GUIA, M. L. ; SANTORO, Marcelo Matos . Molecular Modeling of Chemicaly Modified Human Insulin. In: XXVIa Reunião Anual da SBBq - Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 1997, Belo Horizonte. Anais da XXVIa Reunião Anual da SBBq - Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 1997.

27.
MITRE, Manuela ; FAGLIONI JUNIOR, W. ; LEAO FILHO, H. M. ; Barra, H. B. ; Leão, R. M. X. ; SILVEIRA, C. H. ; CRUZ, J. S. ; SANTORO, Marcelo Matos . Molecular Modeling of Ionic Channel Toxins. In: XXVIa Reunião Anual da SBBq - Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 1997, Caxambu. Anais da XXVIa Reunião Anual da SBBq - Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 1997.

28.
FERREIRA, W. A. ; silveira, c. h. ; JUNQUEIRA, R. G. ; MARES-GUIA, M. L. ; SANTORO, Marcelo Matos . Activation of alpha-Chymotrypsin by Substrate and Modifiers. Evidences of Allosteric Effects upon Enzyme Induced by Modifiers. In: XXV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular (SBBq), 1996, Caxambu. Anais da XXV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular (SBBq), 1996.

29.
silveira, c. h.; SANTORO, Marcelo Matos ; ARABE, J. N. C. . Parallel Simulation of Protein Folding by Search Space Partition. In: XXV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular (SBBq), 1996, Caxambu. Anais da XXV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular (SBBq), 1996.

30.
PRATES, C. C. ; silveira, c. h. ; TAVARES, C. A. P. ; JACCHIERI, S. G. . Implementação de um Tutorial PC compatível de Química Estrutural. In: V Semana de Iniciação Científica da Universidade Federal Minas Gerais (UFMG), 1996, Belo Horizonte. Anais da V Semana de Iniciação Científica da Universidade Federal Minas Gerais (UFMG), 1996.

31.
LEAO FILHO, H. M. ; FAGLIONI JUNIOR, W. ; silveira, c. h. ; CRUZ, J. S. ; SANTORO, Marcelo Matos . Modelagem Molecular de Toxinas que Agem em Canais Iônicos. In: V Semana de Iniciação Científica da Universidade Federal Minas Gerais (UFMG), 1996, Belo Horizonte. Anais da V Semana de Iniciação Científica da Universidade Federal Minas Gerais (UFMG), 1996.

32.
PEREIRA, H. M. ; RODRIGUEZ, M. B. ; SANTORO, Marcelo Matos ; silveira, c. h. ; ORTEGA, J. M. . Análise em 3-D de um Anticorpo de Cadeia Única. In: V Encontro de Pesquisa do Instituto de Ciências Biológicas da UFMG, 1996, Belo Horizonte. Anais do V Encontro de Pesquisa do Instituto de Ciências Biológicas da UFMG, 1996.

33.
FERREIRA, W. A. ; silveira, c. h. ; JUNQUEIRA, R. G. ; MARES-GUIA, M. L. ; SANTORO, Marcelo Matos . Kinetic Parameters for the Activation of the alfa-Chymotrypsin by N-Benzoyl-L-Tyrosil-p-Nitroanilide. In: XXIV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular (SBBq), 1995, Caxambu. Anais da XXIV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular (SBBq), 1995.

34.
FERREIRA, W. A. ; silveira, c. h. ; JUNQUEIRA, R. G. ; MARES-GUIA, M. L. ; SANTORO, Marcelo Matos . Activation of alpha-Chymotrypsin by Substrate and Modifiers. Evidences of Allosteric Effects upon Enzyme Induced by Modifiers. In: IX International Symposium of the Protein Society, 1995, Boston, USA. Annals of the IX International Symposium of the Protein Society, 1995.

35.
silveira, c. h.; SANTORO, Marcelo Matos . Estudo de Processos de Difusão através da Simulação do Movimento Browniano. In: III Semana de Iniciação Científica da Universidade Federal Minas Gerais (UFMG),, 1994, Belo Horizonte. Anais da III Semana de Iniciação Científica da Universidade Federal Minas Gerais (UFMG),, 1994.

36.
COELHO, L. S. ; silveira, c. h. ; CAMPOS, M. F. M. . Algoritmo Genético aplicado à Solução da Cinemática Inversa de Manipuladores. In: III Semana de Iniciação Científica da Universidade Federal Minas Gerais (UFMG), 1994, Belo Horizonte. Anais da III Semana de Iniciação Científica da Universidade Federal Minas Gerais (UFMG), 1994.

37.
silveira, c. h.; JACCHIERI, S. G. . An Interactive Tutorial of Molecular Modeling. In: XXIII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular (SBBq), 1994, Caxambu. Anais da XXIII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular (SBBq), 1994.

38.
ABRANTES, E. F. ; silveira, c. h. . Simulação da Deriva Genética em Populações Submetidas ou não a Processos de Seleção: um Programa de Apoio ao Ensino de Genética de Populações. In: 1o Simposio de Computação Aplicada à Biologia, 1993, Campinas. Anais do 1o Simposio de Computação Aplicada à Biologia, 1993.

Artigos aceitos para publicação
1.
RIBEIRO, V. S. ; FASSIO, ALEXANDRE V. ; CERQUEIRA, F. R. ; SILVEIRA, CARLOS H. DA ; Romanelli, João P. R. ; PATARROYO-VARGAS, A. ; OLIVEIRA, M. G. A. ; Goncalves-Almeida, V. M. ; IZIDORO, S. C. ; DE MELO- MINARDI, RAQUEL C. ; SILVEIRA, SABRINA DE A . visGReMLIN: graph mining-based detection and visualization of conserved motifs at 3D protein-ligand interface at the atomic level. BMC BIOINFORMATICS, 2018.

Apresentações de Trabalho
1.
da silveira, c. h.. Existe vida após a Pós ?. 2017. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

2.
DA SILVEIRA, CARLOS HENRIQUE. Da torre de marfim à torre de babel: testemunha ocular de uma iniciativa interdisciplinar em curso na triagem virtual e avaliação experimental de ligantes de ricina. 2015. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

3.
da silveira, c. h.. Pode uma planta ser dez vezes mais mortífera que a cascavel?. 2014. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

4.
DA SILVEIRA, CARLOS HENRIQUE. Biologia Estrutural da Ricina. 2014. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

5.
DA SILVEIRA, CARLOS HENRIQUE. Bioinformática: descobrindo agulhas (ai!) no palheiro. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

6.
da Silveira, Carlos H.. Introdução ao R. 2011. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

7.
da Silveira, Carlos H.. E-Science e Ciência 2.0. 2011. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

8.
SANTORO, Marcelo Matos ; da silveira, c. h. . Projeto ComBiNano: a Rede de Modelagem Computacional de Biomoléculas e Nanomateriais Bioativos, de Minas Gerais. 2010. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

9.
SILVEIRA, C. H.. E-science e a Bioinformática. 2010. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

10.
SILVEIRA, C. H.. Bioinformática Estrutural: Minerando Padrões em Escalas Nanométricas. 2009. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

11.
SILVEIRA, C. H.. Comparando Proteínas com Aglomerados de Estrelas? A História de um Estranho Encontro entre um Bioinformata e um Físico. 2009. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

12.
SILVEIRA, C. H.. Metáforas e a Reusabilidade Lógica em Ciência. 2008. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

13.
SILVEIRA, C. H.. Híbridos: mito ou realidade ?. 2008. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

14.
SILVEIRA, C. H.. Protein Cutoff Scanning (PCS): como a varredura exaustiva de distâncias interatômicas pode nos ajudar a compreender o empacotamento e enovelamento de proteínas.. 2007. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

15.
SILVEIRA, C. H.. Minimalismo em Globinas: a Busca de uma Nova Metáfora para o Problema do Enovelamento de Proteínas. 2003. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

16.
SILVEIRA, C. H.. An Interactive Tutorial of Molecular Modeling. 1994. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

17.
SILVEIRA, C. H.. Estudo de Processos de Difusão através da Simulação do Movimento Browniano. 1994. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

Outras produções bibliográficas
1.
SILVEIRA, C. H.. Notes on approximate golden spirals with whirling squares. Ithaca, NY: ArXiv.org - Cornell University Library, 2013 (pre-print).

2.
silveira, c. h.; SIQUEIRA, A. M. . Manual do Usuário da ICB-Net, Guia UNIX da Rede de Computadores do ICB/UFMG 1995 (Manual).


Produção técnica
Programas de computador sem registro
1.
SCHMIDT, M. ; silveira, c. h. ; HABESCH, R. ; VIEIRA, L. A. M. . ACROPOLY - Sistema 100% WEB de Gestão de Entidades Educacionais. 2007.

2.
BARROS FILHO, J. C. ; silveira, c. h. . CIEP - Sistema 100% WEB de Controle de Instalações Elétricas Prediais. 2002.

Entrevistas, mesas redondas, programas e comentários na mídia
1.
SILVEIRA, C. H.. UNIFEI promove congresso de pesquisa com participação das comunidades educacionais. 2017. (Programa de rádio ou TV/Entrevista).

2.
da silveira, c. h.. Aqui produzimos ciência e tecnologia. 2016. (Programa de rádio ou TV/Entrevista).

3.
DA SILVEIRA, CARLOS HENRIQUE; SILVA, S. ; MATOS, M. A. G. . Acita Notícias. 2015.


Demais tipos de produção técnica
1.
da silveira, c. h.. MINI-CURSO: Introdução à Bioinformática - I Simpósio de Biotecnologia. 2013. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

2.
silveira, c. h.; MELO, Raquel Cardoso de . MINI-CURSO: O Universo Protéico na Lógica da Vida - XVI Semana de Biologia da UFMG. 2005. (Curso de curta duração ministrado/Especialização).

3.
silveira, c. h.; SANTORO, Marcelo Matos . MINI-CURSO: Introdução à Proteínas para Cientistas da Computação. 2003. .



Patentes e registros



Programa de computador
1.
GONÇALVES, W. R. S. ; SILVEIRA, C. H. ; Minardi, Raquel C. ; Goncalves-Almeida, V. M. ; ARRUDA, A. L. L. ; Pires, Douglas E. V. ; MEIRA JUNIOR, Wagner . PDBest - PDB Enhanced Structures Toolkit. 2014.
Patente: Programa de Computador. Número do registro: BR512014001080-5, data de registro: 12/09/2014, título: "PDBest - PDB Enhanced Structures Toolkit" , Instituição de registro: INPI - Instituto Nacional da Propriedade Industrial.


Marca registrada
1.
 GONÇALVES, W. R. S. ; SILVEIRA, C. H. ; Minardi, Raquel C. ; PIRES, D. E. V. ; ARRUDA, A. L. L. ; Goncalves-Almeida, V. M. ; MEIRA JUNIOR, Wagner . PDBest - PDB Enhanced Structures Toolkit. 2014, Brasil.
Patente: Marca Registrada de Produto. Número do registro: 907998445, título: "PDBest - PDB Enhanced Structures Toolkit" , Instituição de registro: INPI - Instituto Nacional da Propriedade Industrial.

2.
 FASSIO, ALEXANDRE V. ; SANTANA, CHARLES A. ; CERQUEIRA, FABIO R. ; Romanelli, João P. R. ; SILVEIRA, CARLOS H. DA ; MELO-MINARDI, RAQUEL C. DE . visGReMLIN. 2017, Brasil.
Patente: Marca Registrada de Serviço. Número do registro: 913662968, título: "visGReMLIN" , Instituição de registro: INPI - Instituto Nacional da Propriedade Industrial.

3.
 FASSIO, ALEXANDRE VICTOR ; SANTANA, CHARLES A. ; CERQUEIRA, FABIO R. ; Romanelli, João P. R. ; SILVEIRA, C. H. ; DE MELO- MINARDI, RAQUEL C. . visGREMLIN. 2017, Brasil.
Patente: Marca Registrada de Produto. Número do registro: 913662763, título: "visGREMLIN" , Instituição de registro: INPI - Instituto Nacional da Propriedade Industrial.



Bancas



Participação em bancas de trabalhos de conclusão
Mestrado
1.
MELO, Raquel Cardoso de; ORTEGA, J. M.; SILVEIRA, CARLOS H. DA. Participação em banca de Francisco de Assis Sobrinho. Classificação funcional de proteínas utilizando assinaturas estruturais extraídas dos ângulos torsionais da cadeia polipeptídica. 2018. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.

2.
MEIRA JUNIOR, Wagner; MINARDI, R. M.; da Silveira, Carlos H.; SILVA, A. S.. Participação em banca de Elisa Boari de Lima. Utilizando agrupamento com restrições e agrupamento espectral para integração de dados de enzimas. 2011. Dissertação (Mestrado em Ciências da Computação) - Universidade Federal de Minas Gerais.

Teses de doutorado
1.
ORTEGA, J. M.; RAITTZ, R. T.; GOES NETO, A.; CINO, E. A.; SILVEIRA, CARLOS H. DA; NOBRE, C. N.; PIRES, D. E. V.. Participação em banca de Ricardo Assunção Vialle. Evidências de mudanças estruturais proteicas em transições macroevolutivas. 2017. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.

2.
PAPPA, G. L.; DE MELO-MINARDI, R. C.; DARDENNE, L.; BLEICHER, L.; FERREIRA, R. S.; DA SILVEIRA, CARLOS HENRIQUE. Participação em banca de Sandro Carvalho Izidoro. Algoritmos genéticos para identificação de sítios ativos em enzimas. 2015. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.

3.
QUEIROZ, A. A. A.; SOUSA, F. B.; DA SILVEIRA, CARLOS HENRIQUE; BARRAK, E. R.; FERNANDES, E. G. R.; HERCULANO, R. D.. Participação em banca de Esdras Duarte dos Passos. Propriedades físico-químicas e biológicas de arcabouços de poliglicerol arborescente eletrofiados. 2015. Tese (Doutorado em Materiais Para Engenharia) - Universidade Federal de Itajubá.

4.
DA SILVEIRA, CARLOS HENRIQUE; DE MELO-MINARDI, R. C.; BLEICHER, L.; SANTOS, M. A.; SILVA, J. M. S. F.; ALMEIDA, V. M. G.. Participação em banca de Nilma Rodrigues Alves. Mapeamento de correpondências hidrofóbicas em complexos serino peptidases e inibidores proteicos através da varredura de agrupamento espectral. 2015. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.

5.
DE MELO-MINARDI, R. C.; MEIRA JUNIOR, Wagner; DA SILVEIRA, CARLOS HENRIQUE; BLEICHER, L.; SANTOS, M. A.; NOBRE, C. N.. Participação em banca de Elisa Boari de Lima. Detecção de subfamílias proteicas isofuncionais utilizando integração de dados e agrupamento espectral. 2015. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.

6.
ARAUJO, D. A. M.; da Silveira, Carlos H; MACEDO, G. R.; SILVA, F. L. H.; SALINAS, C. R. M.. Participação em banca de Itácio Queiroz de Mello Padilha. Diversidade Bacteriana dos Solos da Mata Atlântica e da Agroindústria Sucroalcooleira, e Caracterização de Celulase e Xilase de Interesse Biotecnológico. 2014. Tese (Doutorado em Doutorado em Biotecnologia - RENORBIO) - Universidade Federal da Paraíba.

7.
LOPES, J. C. D.; MEIRA JUNIOR, Wagner; Alcântara, A. F. de C.; Taranto, A. G.; da Silveira, Carlos H. Participação em banca de Bernardo Figueirêdo Domingues. 3D-Pharma: Uma Ferramenta para Triagem Virtual Baseada em Fingerprints de Farmacóforos. 2012. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.

8.
SANTOS, M. A.; SANTORO, Marcelo Matos; ORTEGA, J. M.; ZAKI, M. J.; da Silveira, Carlos H.. Participação em banca de Bráulio Roberto Gonçalves Marinho Couto. Uso da álgebra linear para análise de similaridade e extração de padrões em sequências proteicas. 2010. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.

Qualificações de Doutorado
1.
SANTORO, Marcelo Matos; ORTEGA, J. M.; SILVEIRA, C. H.. Participação em banca de Ricardo Andrez Machado de Ávila. Prediçao de Epitopos da Mutalisina II e identificaçao de Assinaturs no Sitio Ativo das Metaloproteinases do Veneno de Serpentes por Bioinformatica. 2009. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.

Qualificações de Mestrado
1.
DA SILVEIRA, CARLOS HENRIQUE; SACHS, D.; LIMA, G. F.; LOPES, J. F.. Participação em banca de Christina Telles Borges. Estudo teórico da interação da proteína ATP7A com a cisplatina. 2015. Exame de qualificação (Mestrando em Multicêntrico em Química de Minas Gerais) - Universidade Federal de Itajubá.

Trabalhos de conclusão de curso de graduação
1.
BRANDAO, A. L. R.; VIEIRA, W. B.; da silveira, c. h.. Participação em banca de Cássio Martins Oliveira.Desenvolvimento de aplicativo Android para dimensionamento de vigas metálicas fletidas com perfil I. 2017. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia da Mobilidade) - Universidade Federal de Itajubá.

2.
NAGAI, W. A.; da silveira, c. h.; VELOSO, W. N. P.. Participação em banca de Ricardo Henrique de Souza.Desenvolvimento de uma Arquitetura REST Segura para Aplicativo WEB e Android. 2014. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia de Computação) - Universidade Federal de Itajubá.

3.
silveira, c. h.; VELOSO, C.; LAGE, M. C. G. R.. Participação em banca de Gabriela Borges Diniz Teixeira.Esforços Biomecânicos no Carnotaurus sastrei. 2008. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Sistemas de Informação) - Pontifícia Universidade Católica de Minas Gerais.

4.
RAMOS, A. C. B.; MATTEDI, A. P.; silveira, c. h.. Participação em banca de Semíramis Jensen Bittencourt e Silva;Thiago Viegas Frossard.Avaliação na Aprendizagem Utilizando Sistemas Especialistas. 2008. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Itajubá.

5.
JESUS, E. O.; MATTEDI, A. P.; silveira, c. h.. Participação em banca de Marilyn Menecucci Ibanez.Análise Morfológica e Contagem de Células Sangüíneas. 2008. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Itajubá.



Participação em bancas de comissões julgadoras
Concurso público
1.
SILVEIRA, CARLOS H. DA; FEITOSA, A. P.; CAMPOS, L. B. P.. Professor Substituto - Filosofia e Ciências Sociais. 2017. Universidade Federal de Itajubá.

2.
SILVEIRA, C. H.; PROSDOCIMI, F.; LIMA, L. H. F.. Professor Adjunto - Bioinformática. 2014. Universidade Federal de Itajubá.

3.
SILVEIRA, C. H.; SERAPHIM, E.; SILVA, F. R.; MORO, M. M.; MINARDI, R. M.. Professor Adjunto - Banco de Dados. 2011. Universidade Federal de Itajubá.

4.
SILVEIRA, C. H.; SILVA, F. R.; ZOCCAL, L. B.; SPADOTI, D. H.; TOFOLI, F. L.. Professor Adjunto - Projeto de Circuitos Integrados Analógicos. 2011. Universidade Federal de Itajubá.

5.
da Silveira, Carlos H.; SILVA, F. R.; PEREIRA, F. M. Q.. Professor Assistente - Compiladores. 2011. Universidade Federal de Itajubá.

6.
QUEIROZ, A. A. A.; SACHS, D.; da Silveira, Carlos H.; SANTOS, M. S.; SOARES, M. G.. Professor Adjunto - Química Orgânica - Produtos Naturais. 2010. Universidade Federal de Itajubá.

7.
BALDOCHI JUNIOR, L. A.; TEIXEIRA, C. A. C.; SILVEIRA, C. H.. Professor Assistente - Computação Ubíqua.. 2009. Universidade Federal de Itajubá.



Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
Somos todos nível 7 - celebração da progressão do programa em bioinformática da UFMG.Existe vida após a Pós ?. 2017. (Seminário).

2.
IV - SEACAD-UFSJ.Pode uma planta ser dez vezes mais mortífera que a cascavel?. 2014. (Seminário).

3.
V Semana de Sistemas de Informação da UFVJM.E-Science e Ciência 2.0: modismo ou revolução ?. 2011. (Encontro).

4.
Workshop: Gestão Universitária Moderna.Questões Estruturais. 2011. (Oficina).

5.
Workshop Cooperação e Tendências da Bioinformática na UFMG.Projeto ComBiNano: a Rede de Modelagem Computacional de Biomoléculas e Nanomateriais Bioativos, de Minas Gerais. 2010. (Encontro).

6.
1o Composium - Simpósio em Computação da UNIFEI.Metáforas e a Reusabilidade Lógica em Ciência. 2008. (Simpósio).

7.
X-Meeting 2008 - 4th International Conference of the AB3C. Híbridos: mito ou realidade ?. 2008. (Congresso).

8.
X-Meeting 2008 - 4th International Conference of the AB3C. Virtual Integration, Structural Classification, Sphere Packing Simulations. 2008. (Congresso).

9.
1o Workshop do Curso de Doutorado em Bioinformática - UFMG.Protein Cutoff Scanning (PCS): como a varredura exaustiva de distâncias interatômicas pode nos ajudar a compreender o empacotamento e enovelamento de proteínas.. 2007. (Seminário).

10.
I Workshop Mineiro sobre Bioinformatica Estrutural.Protein Cutoff Scanning (PCS): como a varredura exaustiva de distâncias interatômicas pode nos ajudar a compreender o empacotamento e o enovelamento de proteínas. 2007. (Oficina).

11.
X-Meeting 2007 - 3rd Annual Conference of the AB3C. PDBEST - PDB Enhanced Structures Toolkit. 2007. (Congresso).

12.
ISMB 2006 - Annual Meeting of the International Society for Computational Biology. On The Characterization Of Energy Networks Of Proteins. 2006. (Congresso).

13.
X-Meeting 2005 - 1st International Conference of the AB3C. Classification of Globins based on amino acid content: An exploratory data analysis approach. 2005. (Congresso).

14.
II Encontro Anual de Pesquisa em Bioquímica e Imunologia da UFMG. 2004. (Encontro).

15.
II International Conference on Bioinformatics and Computational Biology. Why Different Amino Acid Sequences Can Determine Similar Protein Structures: the Search for a Structural-Sequencial Signature in Globins and Serino-Proteases Families. 2004. (Congresso).

16.
XVII Brazilian Symposium on Computer Graphics and Image Processing (SIBGRAPI).An Image-Matching Approach to Protein Similarity Analysis. 2004. (Simpósio).

17.
1st International Conference on Bionformatics and Computacional Biology. Application of Information Theory Principles to Mine Relationships in Globins Helices. 2003. (Congresso).

18.
I Encontro Anual de Pesquisa em Bioquímica e Imunologia da UFMG. 2003. (Encontro).

19.
Second Brazilian Workshop on Bioinformatics - WOB 2003. Using Structural Signatures for Identifying Globins: the Intra-Subunit Electrostatic Interactions. 2003. (Congresso).

20.
Seminários da Bioinformática.Minimalismo em Globinas: a Busca de uma Nova Metáfora para o Problema do Enovelamento de Proteínas - Seminários da Pós-Graduação em Bioinformática - UFMG. 2003. (Seminário).

21.
XXXII Encontro da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular (SBBq). 2003. (Encontro).

22.
International Symposium on THEORETICAL AND EXPERIMENTAL ASPECTS OF PROTEIN FOLDING.Parallel Simulation of Protein Folding by Search Space Partition. 1996. (Simpósio).

23.
V Encontro de Pesquisa do Instituto de Ciências Biológicas da UFMG.Análise em 3-D de um Anticorpo de Cadeia Única. 1996. (Encontro).

24.
V Semana de Iniciação Científica.Implementação de um Tutorial PC compatível de Química Estrutural. 1996. (Outra).

25.
XXV Encontro da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular (SBBq).Parallel Simulation of Protein Folding by Search Space Partition. 1996. (Encontro).

26.
XXIV Encontro da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular (SBBq).Kinetic Parameters for the Activation of the alfa-Chymotrypsin by N-Benzoyl-L-Tyrosil-p-Nitroanilide. 1995. (Encontro).

27.
Curso e Workshop em Métodos Avançados para Análise Estrutural de Biomoléculas.An Interactive Tutorial of Molecular Modeling. 1994. (Oficina).

28.
III Semana de Iniciação Científica.Estudo de Processos de Difusão através da Simulação do Movimento Browniano. 1994. (Outra).

29.
XXIII Encontro da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular (SBBq).An Interactive Tutorial of Molecular Modeling. 1994. (Encontro).

30.
1o Simposio de Computação Aplicada à Biologia.Simulação da Deriva Genética em Populações Submetidas ou não a Processos de Seleção: um Programa de Apoio ao Ensino de Genética de Populações. 1993. (Simpósio).


Organização de eventos, congressos, exposições e feiras
1.
MELO, Raquel Cardoso de ; da silveira, c. h. . I Workshop do Projeto "Bioinformática Estrutural de Proteínas: Modelos, Algoritmos e Aplicações Biotecnológicas". 2014. (Outro).

2.
da silveira, c. h.. I Simpósio de Biotecnologia. 2013. (Congresso).

3.
MATTEDI, A. ; silveira, c. h. . I Composium - Simpósio em Computação da UNIFEI (ORGANIZADOR). 2008. (Congresso).

4.
silveira, c. h.; OUTROS, M. . X-Meeting 2008 - International Conference of the AB3C (AVALIADOR DE POSTERS). 2008. (Congresso).



Orientações



Orientações e supervisões em andamento
Tese de doutorado
1.
Fabiana Costa Guedes. Pesquisa e desenvolvimento de um e-science para organização e padronização de experimentos virtuais integrados em quimioinformática e química computacional. Início: 2016. Tese (Doutorado em Multicêntrico em Química de Minas Gerais) - Universidade Federal de Itajubá. (Orientador).

2.
Fabrícia Nunes de Jesus Guedes. Desenvolvimento de materiais nanoestruturados a base de politiofenos B-substituídos/nanocristais para aplicação em células solares. Início: 2016. Tese (Doutorado em Multicêntrico em Química de Minas Gerais) - Universidade Federal de Itajubá. (Orientador).

3.
Wandré Nunes de Pinho Veloso. Uma proposta integrada de ancoragem virtual baseada em estrutura e em ligantes usando a metodologia CSM ­ Cutoff Scanning Matrix. Início: 2014. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais. (Orientador).

4.
Biharck Muniz Araújo. Mineração de padrões em grafos de interações entre macromoléculas bioativas usando metodologias de assinatura estrutural. Início: 2014. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais. (Orientador).

Iniciação científica
1.
Brenda Oliveira Silva. Simulações e proveniência de dados integradas na plataforma BioNimbuZ. Início: 2018. Iniciação científica (Graduando em Engenharia de Materiais) - Universidade Federal de Itajubá, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. (Orientador).

2.
Pedro Celso Miranda Rocha Filho. Ranqueamento de ligantes da Ricina de acordo com a Afinidade de Ligação. Início: 2017. Iniciação científica (Graduando em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Itajubá, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. (Orientador).

3.
Arthur Vinicius Reis Procopio. Ambiente para experimentos in silício - estudo de caso: Ricina.. Início: 2017. Iniciação científica (Graduando em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Itajubá, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais. (Orientador).

4.
Guilherme Augusto Rodrigues de Jesus. Padrões hidrofóbicos na molécula da Ricina, baseado em estudos realizados nas Peptidases.. Início: 2017. Iniciação científica (Graduando em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Itajubá, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais. (Orientador).


Orientações e supervisões concluídas
Tese de doutorado
1.
Nilma Rodrigues Alves. Mapeamento de correspondências hidrofóbicas em complexos serino peptidases e inibidores proteicos através da varredura de agrupamento espectral. 2015. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais, . Orientador: Carlos Henrique da Silveira.

2.
Sabrina de Azevedo Silveira. ENZYMAP: explorando metadados proteicos para a modelagem e previsão de mudanças de anotação no Uniprot/Swiss-Prot. 2013. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais, . Coorientador: Carlos Henrique da Silveira.

3.
Douglas Eduardo Valente Pires. CSM: Uma Assinatura para Grafos Biológicos baseada em Padrões de Distâncias. 2012. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais, . Coorientador: Carlos Henrique da Silveira.

4.
Valdete Maria Gonçalves de Almeida. HYDROPACE: Uma Metodologia para Análise de Inibição Cruzada em Serino-Proteases Através de Centróides de Regiões Hidrofóbicas. 2011. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Coorientador: Carlos Henrique da Silveira.

Trabalho de conclusão de curso de graduação
1.
Yuri Souza, Tiago Visconti. Mineração de dados: análise comparativa de algoritmos. 2017. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Engenharia de Computação) - Universidade Federal de Itajubá. Orientador: Carlos Henrique da Silveira.

2.
Henrique Rezende de Souza Alves. Armazenamento em nuvem: estudo sobre o openstack. 2016. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Engenharia de Computação) - Universidade Federal de Itajubá. Orientador: Carlos Henrique da Silveira.

3.
Carlos Abreu Custódio. Estudo do uso do JavaFX como linguagem de desenvolvimento de aplicações Web no ambiente Google Application Engine. 2010. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Itajubá. Orientador: Carlos Henrique da Silveira.

4.
Wilker Delkerson, Flávio Henrique Moura de Abreu. Um Estudo da Acessibilidade nos Web Sites dos Departamentos e Institutos de Ciência da Computação no Brasil: Levantamento, Análise e Propostas. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Itajubá. Orientador: Carlos Henrique da Silveira.

5.
Renan Curvelo de Faria, Renato Lam Yee. Avaliação do Ambiente Computacional em Nuvem Google Application Engine como Ferramenta de Desenvolvimento e Virtualização de Aplicatiovs Web. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Itajubá. Orientador: Carlos Henrique da Silveira.

6.
Clara Moreira Senne, Joice Barbosa Mendes. Estudos de Arquitetura e Usabilidade dos Sites dos Departamentos ou Institutos de Ciência da Computação no Brasil Segundo os Postulados de Krug: Levantamento, Análise e Propostas. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Itajubá. Orientador: Carlos Henrique da Silveira.

7.
Sabrina de Azevedo Silveira. Integração de Bancos de Dados Biológicos. 2008. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Minas Gerais. Orientador: Carlos Henrique da Silveira.

8.
Douglas Eduardo Valente Pires. Estimando a melhor distância delimitadora da primeira camada de vizinhos em proteínas a nível atômico via cutoff scanning. 2008. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Minas Gerais. Orientador: Carlos Henrique da Silveira.

Iniciação científica
1.
Dan Quenaz Magdyan Silva Pimentel. Previsão in silico de ligantes de ricina: agrupamento espectral em interfaces ligante-proteína. 2016. Iniciação Científica. (Graduando em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Itajubá, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais. Orientador: Carlos Henrique da Silveira.

2.
João Guilherme de Souza Alves Costa. Triagem virtual de ligantes de ricina pela metodologia CSM - Cutoff Scanning Matrix. 2015. Iniciação Científica. (Graduando em Engenharia de Computação) - Universidade Federal de Itajubá, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais. Orientador: Carlos Henrique da Silveira.

3.
Guilherme de Oliveira Almeida Lima. Previsão in silico de ligantes de ricina: planejamento, montagem e validação do RicinDB. 2015. Iniciação Científica. (Graduando em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Itajubá, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais. Orientador: Carlos Henrique da Silveira.

4.
Matheus Venturyne Xavier Ferreira. Caracterização da descontinuidade de fitas em favor de hélices em estruturas proteicas toda-beta. 2012. Iniciação Científica. (Graduando em Engenharia da Computação) - Universidade Federal de Itajubá, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais. Orientador: Carlos Henrique da Silveira.

5.
Ricardo Henrique de Souza. Uma Estratégia Computacional Mista para o Alinhamento e Caracterização de Interfaces em Complexos Proteicos. 2011. Iniciação Científica. (Graduando em Engenharia da Computação) - Universidade Federal de Itajubá, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais. Orientador: Carlos Henrique da Silveira.

6.
Douglas Eduardo Valente Pires. O Problema do Empacotamento de Esferas Aplicado ao Estudo de Proteínas. 2007. Iniciação Científica - Universidade Federal de Minas Gerais, Financiadora de Estudos e Projetos. Orientador: Carlos Henrique da Silveira.

Orientações de outra natureza
1.
Lucas Eduardo Pereira Martins. Aprimoramento da Intranet da Prefeitura Municipal de Itabira. 2014. Orientação de outra natureza. (Engenharia de Computação) - Universidade Federal de Itajubá. Orientador: Carlos Henrique da Silveira.

2.
Jonas Pedro Pereira. Computação Quântica: um Paradigma Abstrato para o Processamento da Informação. 2009. Orientação de outra natureza. (Física Bacharelado) - Universidade Federal de Itajubá. Orientador: Carlos Henrique da Silveira.

3.
Pablo M. Oliveira, Breno L. de S. Ribeiro, Felipe R. Peixoto. Groundwork: Software Opensource para Monitoramento de Recursos Computacionais. 2009. Orientação de outra natureza. (Especialização em Engenharia Web) - Universidade Federal de Itajubá. Orientador: Carlos Henrique da Silveira.

4.
Raquel Cardoso de Melo. Estudos in silico de Proteínas Minimamente Constituídas: a Montagem de um Banco de Dados para Mineração de Dados em Proteínas. 2003. 0 f. Orientação de outra natureza - Universidade Federal de Minas Gerais, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Carlos Henrique da Silveira.

5.
Manuela Mitre. Modelagem Molecular de Toxinas que Agem em Canais Iônicos. 1997. 0 f. Orientação de outra natureza - Universidade Federal de Minas Gerais, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Carlos Henrique da Silveira.

6.
Carla Prates. Implementação de um Tutorial PC compatível de Química Estrutural. 1996. 0 f. Orientação de outra natureza - Universidade Federal de Minas Gerais, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais. Orientador: Carlos Henrique da Silveira.

7.
Gustavo M Moraes. Modelagem Molecular de Insulinas Humanas Quimicamente Modificadas. 1996. 0 f. Orientação de outra natureza - Universidade Federal de Minas Gerais, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais. Orientador: Carlos Henrique da Silveira.

8.
Wilson Faglioni Junior. Modelagem Molecular de Toxinas que Agem em Canais Iônicos. 1996. 0 f. Orientação de outra natureza - Universidade Federal de Minas Gerais. Orientador: Carlos Henrique da Silveira.

9.
Hilton M Leão Filho. Modelagem Molecular de Toxinas que Agem em Canais Iônicos. 1995. 0 f. Orientação de outra natureza - Universidade Federal de Minas Gerais, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais. Orientador: Carlos Henrique da Silveira.



Inovação



Programa de computador registrado
1.
GONÇALVES, W. R. S. ; SILVEIRA, C. H. ; Minardi, Raquel C. ; Goncalves-Almeida, V. M. ; ARRUDA, A. L. L. ; Pires, Douglas E. V. ; MEIRA JUNIOR, Wagner . PDBest - PDB Enhanced Structures Toolkit. 2014.
Patente: Programa de Computador. Número do registro: BR512014001080-5, data de registro: 12/09/2014, título: "PDBest - PDB Enhanced Structures Toolkit" , Instituição de registro: INPI - Instituto Nacional da Propriedade Industrial.


Marca registrada
1.
 FASSIO, ALEXANDRE VICTOR ; SANTANA, CHARLES A. ; CERQUEIRA, FABIO R. ; Romanelli, João P. R. ; SILVEIRA, C. H. ; DE MELO- MINARDI, RAQUEL C. . visGREMLIN. 2017, Brasil.
Patente: Marca Registrada de Produto. Número do registro: 913662763, título: "visGREMLIN" , Instituição de registro: INPI - Instituto Nacional da Propriedade Industrial.


Projetos de pesquisa


Educação e Popularização de C & T



Textos em jornais de notícias/revistas
1.
da Silveira, Carlos H. A Nuvem: o PC virtual está mais perto do que você imagina. Hoje em Dia, Belo Horizonte, 01 jan. 2008.

2.
MARTINS, R. P. ; MARI, H. ; da Silveira, Carlos H . Livro Marca Ação Interdisciplinar na UFMG. Hoje em Dia, Belo Horizonte, 02 nov. 2002.


Apresentações de Trabalho
1.
da silveira, c. h.. Pode uma planta ser dez vezes mais mortífera que a cascavel?. 2014. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

2.
DA SILVEIRA, CARLOS HENRIQUE. Da torre de marfim à torre de babel: testemunha ocular de uma iniciativa interdisciplinar em curso na triagem virtual e avaliação experimental de ligantes de ricina. 2015. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).


Cursos de curta duração ministrados
1.
da silveira, c. h.. MINI-CURSO: Introdução à Bioinformática - I Simpósio de Biotecnologia. 2013. (Curso de curta duração ministrado/Outra).


Entrevistas, mesas redondas, programas e comentários na mídia
1.
DA SILVEIRA, CARLOS HENRIQUE; SILVA, S. ; MATOS, M. A. G. . Acita Notícias. 2015.

2.
da silveira, c. h.. Aqui produzimos ciência e tecnologia. 2016. (Programa de rádio ou TV/Entrevista).

3.
SILVEIRA, C. H.. UNIFEI promove congresso de pesquisa com participação das comunidades educacionais. 2017. (Programa de rádio ou TV/Entrevista).


Organização de eventos, congressos, exposições e feiras
1.
da silveira, c. h.. I Simpósio de Biotecnologia. 2013. (Congresso).



Outras informações relevantes


Membro fundador do extinto GREI - Grupo de Estudos Interdisciplinares da UFMG.

Membro da SBBq - Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular 

Membro ordinário da AB3C - Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional.

Membro efetivo da SBC - Sociedade Brasileira de Computação - No 23128

Revisor de trabalhos da UNIPAC (2009)

Líder do Grupo de Pesquisa CNPq: SILICO - Grupo de Modelagem, Simulação e Inteligência Computacionais (2009-2012)

Membro de Comissões de Avaliação do Estágio Probatório - UNIFEI (2011-2012)



Página gerada pelo Sistema Currículo Lattes em 13/11/2018 às 17:10:00