Gabriela Antunes

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  • Última atualização do currículo em 01/11/2017


Possui graduação em Psicologia pela Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho (2002), graduação em Química pela Universidade de São Paulo (2007), Doutorado em Psicobiologia pela Universidade de São Paulo (2007), especialização em Química Farmacêtica e Terapêutica (2013) pela Universidade de Lisboa, Pós-doutoramento em Neurociência Computacional (2011) pelo Okinawa Institute of Science and Technology (OIST/Japan), Pós-doutoramento em Neurociência e Farmacologia (2014) pelo Instituto de Medicina Molecular da Universidade de Lisboa, Pós-doutoramento (2014-2017) no laboratódio de Sistemas Neurais do Departamento de Física da FFCLRP/USP. Tem experiência na área de Neurociência Computacional e Teórica e Systems Biology, com ênfase no desenvolvimento de modelos computacionais estocásticos de plasticidade sináptica. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Gabriela Antunes
Nome em citações bibliográficas
ANTUNES, G.;ANTUNES, GABRIELA;Antunes G;Gabriela Antunes


Formação acadêmica/titulação


2003 - 2007
Doutorado em Doutorado em Ciências.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
com período sanduíche em University of Colorado (Orientador: Mark Dell'Acqua).
Título: Modelo Computacional dos mecanismos pós-sinápticos da potenciacao sináptica de longa duracao inicial NMDA-dependente em células piramidais hipocampais CA1, Ano de obtenção: 2007.
Orientador: Antonio Carlos Roque da Silva Filho.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
Palavras-chave: Plasticidade Sináptica; Neurociência Computacional; Sinapse excitatória; Vias de sinalização.
2012 - 2013
Especialização em Química Farmacêutica e Terapêutica. (Carga Horária: 180h).
Universidade de Lisboa, UL, Portugal.
Título: Visualização in vitro e in vivo da atividade de enzimas com relevância terapêutica: conjugando a proteómica e a imagiologia.
Orientador: Rui Moreira.
2003 - 2007
Graduação em Química.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
1999 - 2002
Graduação em Psicologia.
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.
Orientador: Amauri Gouveia Junior.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.


Pós-doutorado


2014 - 2017
Pós-Doutorado.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Farmacologia / Subárea: Plasticidade Sináptica.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica.
2013 - 2014
Pós-Doutorado.
Instituto de Medicina Molecular, IMM, Portugal.
2009 - 2011
Pós-Doutorado.
Okinawa Institute of Science and Technology, OIST, Japão.


Formação Complementar


2011 - 2011
Telluride Workshop on Neuromorphic Engineering. (Carga horária: 144h).
NIH, NIH, Estados Unidos.
2005 - 2005
Introduction to the Passive Modeling of Membranes. (Carga horária: 4h).
Federação das Sociedades de Biologia Experimental, FeSBE, Brasil.
2004 - 2004
Computação de Alta Performance II: Cluster. (Carga horária: 12h).
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.
2001 - 2001
Development of the Nervous System. (Carga horária: 12h).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
2001 - 2001
Neural Plasticity: Functional and Molecular Aspect. (Carga horária: 4h).
Federação das Sociedades de Biologia Experimental, FeSBE, Brasil.


Atuação Profissional



Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Vínculo institucional

2014 - 2017
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pós-Doutorado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Vínculo institucional

2007 - 2008
Vínculo: Estágio, Enquadramento Funcional: Estagiária, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações
Trabalhou no projeto "Modelo da dinâmica de cálcio em Células de Leydig" no Departamento de Fisiologia da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto e teve uma bolsa de pós-doc aprovada pela FAPESP.

Vínculo institucional

2003 - 2007
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Bolsista de Doutorado, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações
Bolsista de doutorado da FAPESP no laboratório de Sistema Neurais, da Universidade de São Paulo de Ribeirão Preto. Projeto : "Modelo Computacional dos mecanismos pós-sinápticos da potenciação sináptica de longa duração inicial NMDA-dependente em células piramidais hipocampais CA1".

Vínculo institucional

1997 - 1997
Vínculo: Estágio não remunerado, Enquadramento Funcional: Assistente de Laboratório
Outras informações
Assistente do laboratório de Química Orgânica do departamento de química da Universidade de São Paulo de Ribeirão Preto.


Instituto de Medicina Molecular, IMM, Portugal.
Vínculo institucional

2013 - 2014
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pós Doutorado, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações
Trabalho no projeto de desenvolvimento de um modelo computacional das vias de sinalização envolvidas com o processo de adaptação olfativa em células receptoras olfativas na Unidade de Neurociências do Instituto de Medicina Molecular (IMM) da Universidade de Lisboa.


Okinawa Institute of Science and Technology, OIST, Japão.
Vínculo institucional

2009 - 2011
Vínculo: Pós Doutorado, Enquadramento Funcional: Investigadora Científica, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações
Trabalhou no projeto "Modelagem estocástica das vias de sinalização involvidas na indução da depressão sináptica de longa duração cerebelar" no Okinawa Institute os Science and Technology (OIST), no Japão.


University of Colorado, UC, Estados Unidos.
Vínculo institucional

2006 - 2007
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: estagiário, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.


Universidade do Texas, UTSA, Estados Unidos.
Vínculo institucional

2004 - 2005
Vínculo: estagiária, Enquadramento Funcional: estagiária, Carga horária: 40
Outras informações
Desenvolvimento de modelos computacionais de processos de dinâmica de cálcio em neurônios


Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.
Vínculo institucional

1999 - 2001
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Bolsista de Iniciação Científica, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações
Bolsista de Iniciação Científica PIBIC (CNPQ) com o projeto "A influência do ciclo estral em ratos sobre o efeito do diazepam no labirinto em T elevado", realizado no departamento de psicologia da UNESP de Bauru-SP.



Projetos de pesquisa


2016 - Atual
Cell signalling on hierarchical molecular networks
Descrição: Colaboração Brasil-Alemanha.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Doutorado: (1) .
Integrantes: Gabriela Antunes - Coordenador / martin falcke - Integrante.
2014 - 2017
Modelo computacional dos mecanismos pós-sinápticos da integração dopaminérgica e glutamatérgica em uma espinha dendrítica hipocampal em condições fisiológicas saudáveis e patológicas

Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Antonio Carlos Roque da Silva Filho em 31/01/2016.
Descrição: Em neurônios do hipocampo, a ação da dopamina sobre a transmissão glutamatérgica modula a potenciação (LTP) e a depressão (LTD) sináptica de longa duração e, consequentemente, a aprendizagem e memória de eventos reforçadores. Alterações da integração dopaminérgica e glutamatérgica hipocampal são consideradas como possíveis substratos moleculares para os sintomas cognitivos de diversas patologias. No entanto, a dinâmica dos mecanismos moleculares envolvidos nesta integração ainda é pouco conhecida. Portanto, o objetivo deste projeto é desenvolver um modelo computacional de uma espinha dendrítica hipocampal contento os receptores sinápticos de glutamato e de dopamina, suas respectivas vias de sinalização e os mecanismos responsáveis por sua integração em situações fisiológicas saudáveis e patológicas. Este modelo unificará as informações da literatura experimental para simular a ação da dopamina sobre o glutamato durante a ocorrência de LTP e LTD. Posteriormente, a partir de simulações de alterações fisiológicas descritas na literatura como mudanças na quantidade de dopamina e na composição de receptores sinápticos, três processos patológicos serão investigados: a doença de Parkinson, a esquizofrenia e a toxicodependência em cocaína. As alterações fisiológicas associadas a essas patologias prejudicam a ocorrência de LTP e LTD hipocampal e serão simuladas de maneira sistemática para se analisar suas consequências na dinâmica do modelo. A partir destas análises, serão feitas modificações em componentes do modelo para restaurar seu padrão de funcionamento fisiológico normal. Espera-se que os resultados deste trabalho tragam contribuições significativas na busca por novos alvos terapêuticos para tratar as patologias investigadas..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
2003 - 2007
Simulação computacional da rede de sinalização bioquímica implicada com a potencialização sináptica de longa duração entre células piramidais das áreas CA1 e CA3 do hipocampo.

Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Antonio Carlos Roque da Silva Filho em 01/11/2017.
Descrição: O processo de Potencialização de Longa Duração (LTP) é uma das principais formas de plasticidade sináptica e tem sido um dos modelos moleculares mais estudados para a compreensão da memória. Entretanto, esse processo ainda não é totalmente conhecido havendo várias dúvidas e contradições quanto a diversos pontos da cadeia de reações e da seqüência de alterações anatômicas e fisiológicas envolvidas na LTP. Em função disso, este trabalho tem como objetivo construir um modelo computacional de uma sinapse entre células piramidais das áreas CA1 e CA3 do hipocampo, contendo as principais vias de sinalização bioquímicas envolvidas no processo de LTP com o intuito de reproduzir algumas das propriedades características desse fenômeno, como aumento da eficiência sináptica e síntese protéica..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Doutorado: (1) .
Integrantes: Gabriela Antunes - Integrante / ROQUE, ANTÔNIO C. - Coordenador.


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Neurociência Computacional.
2.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Farmacologia / Subárea: Plasticidade Sináptica.
3.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Farmacologia / Subárea: Neurociência.
4.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Farmacologia / Subárea: SInalização Celular.
5.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Biofísica.


Idiomas


Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Sueco
Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente, Escreve Razoavelmente.
Dinamarquês
Compreende Razoavelmente, Fala Pouco, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.


Prêmios e títulos


2009
Promising Star, Okinawa Institute of Science and Technology.
2007
Menção Honrosa, Federação das Sociedades de Biologia Experimental (FeSBE).


Produções



Produção bibliográfica
Artigos completos publicados em periódicos

1.
ANTUNES, GABRIELA2016 ANTUNES, GABRIELA; ROQUE, ANTONIO C. ; SIMOES DE SOUZA, FABIO M. . Modelling intracellular competition for calcium: kinetic and thermodynamic control of different molecular modes of signal decoding. Scientific Reports, v. 6, p. 23730, 2016.

2.
ANTUNES, G.2016 ANTUNES, G.; ROQUE, A. C. ; SIMOES-DE-SOUZA, F. M. . Stochastic Induction of Long-Term Potentiation and Long-Term Depression. Scientific Reports, v. 6, p. 30899, 2016.

3.
ANTUNES, GABRIELA2014ANTUNES, GABRIELA; SEBASTIÃO, ANA MARIA ; SIMOES DE SOUZA, FABIO MARQUES . Mechanisms of Regulation of Olfactory Transduction and Adaptation in the Olfactory Cilium. Plos One, v. 9, p. e105531, 2014.

4.
SIMõES-DE-SOUZA, FáBIO M.2014SIMõES-DE-SOUZA, FáBIO M. ; ANTUNES, GABRIELA ; ROQUE, ANTONIO C. . Electrical responses of three classes of granule cells of the olfactory bulb to synaptic inputs in different dendritic locations. Frontiers in Computational Neuroscience, v. 8, p. 128, 2014.

5.
ANTUNES, G.2012ANTUNES, G.; DE SCHUTTER, E. . A Stochastic Signaling Network Mediates the Probabilistic Induction of Cerebellar Long-Term Depression. The Journal of Neuroscience, v. 32, p. 9288-9300, 2012.

6.
DE SCHUTTER, ERIK2010DE SCHUTTER, ERIK ; ANTUNES, GABRIELA . Stochastic modeling of LTD induction and AMPA receptor trafficking at the parallel fiber synapse. Neuroscience Research, v. 68, p. e37, 2010.

7.
GOUVEIA JR, AMAURI2009GOUVEIA JR, AMAURI ; ANTUNES, GABRIELA ; MAXIMINO, CAIO ; MORATO, SILVIO . The effects of diazepam on the elevated T-maze are depended on the estrous cycle of rats. Psychology & Neuroscience (Online), v. 2, p. 227-233, 2009.

8.
ANTUNES, GABRIELA2009ANTUNES, GABRIELA; DE SCHUTTER, ERIK . The regulatory role of NO-PKG in the cerebellar long-term depression. BMC Neuroscience (Online), v. 10, p. P198, 2009.

9.
SOUZA, FABIO MARQUES SIMOES DE2007SOUZA, FABIO MARQUES SIMOES DE ; ANTUNES, GABRIELA . Biophysics of olfaction. Reports on Progress in Physics (Print), v. 70, p. 451-491, 2007.

10.
SIMOES DE SOUZA, FABIO M.2007SIMOES DE SOUZA, FABIO M. ; ANTUNES, GABRIELA . Investigating the properties of adaptation in a computational model of the olfactory sensory neuron. Neurocomputing (Amsterdam), v. 70, p. 1663-1667, 2007.

11.
ANTUNES, G.2004ANTUNES, G.; RICO, V. V. ; GOUVEIA JR., A. . Variações da ansiedade relatada em função do ciclo menstrual e do uso de pílulas anticoncepcionais. Interação em Psicologia (Online), v. 8, p. 81-87, 2004.

12.
GOUVEIA JR., A.2004GOUVEIA JR., A. ; SANTOS, U. ; FELISBINO, F. ; AFONSECA, T. ; ANTUNES, G. ; MORATO, SILVIO . Influence of the estrous cycle on the behavior of rats in the elevated T-maze. Behavioural Processes (Print), v. 67, p. 167-171, 2004.

13.
ANTUNES, GABRIELA2003ANTUNES, GABRIELA; ROQUE, ANTÔNIO C. . Sensitivity of AMPA receptor channel to calcium oscillations: a computational study. Neurocomputing (Amsterdam), v. 52-54, p. 341-346, 2003.

Capítulos de livros publicados
1.
ANTUNES, GABRIELA; SIMOES DE SOUZA, FABIO MARQUES . Olfactory receptor signaling. Methods in Cell Biology. 132ed.: Elsevier, 2015, v. , p. 1-.

2.
SANTAMARIA, F. ; ANTUNES, G. ; DE SCHUTTER, E. . Breakdown of Mass-Action Laws in Biochemical Computation. In: N. Le Novère. (Org.). http://link.springer.com/chapter/10.1007/978-94-007-3858-4_4. 1ed.: Springer Netherlands, 2012, v. , p. 119-132.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
ANTUNES, G.; DE SCHUTTER, E. . Bistable induction of cerebellar long-term depression in a stochastic model. In: Society for Neuroscience (SfN) Meeting, 2010, San Diego. Society for Neuroscience (SfN) Meeting, 2010.

2.
ANTUNES, G.; DE SCHUTTER, E. . Stochastic model of the induction of cerebellar long-term depression. In: FENS Meeting, 2010, Amsterdam. FENS Meeting, 2010.

3.
ANTUNES, G.; DE SCHUTTER, E. . The role of NO-PKG in the induction of cerebellar LTD. In: Computational Cell Biology Meeting, 2010, Hinxton. Computational Cell Biology Meeting, 2010.

4.
ANTUNES, G.; SIMOES DE SOUZA, FABIO M. ; ROQUE, ANTÔNIO C. . Computational Model of Signaling Pathways Involved in the AMPA Receptor Trafficking During LTP. In: Society for Neuroscience (SfN) Meeting, 2007, San Diego. Society for Neuroscience (SfN) Meeting, 2007.

5.
ANTUNES, G.; SIMOES DE SOUZA, FABIO M. ; ROQUE, ANTÔNIO C. . Modelo computacional das vias de sinalização implicadas com a plasticidade sináptica: o papel do trânsito de receptores AMPA no aumento do peso sináptico. In: Reunião Anual da Federação das Sociedades de Biologia Experimental (FeSBE), 2007, Águas de Lindóia. Reunião Anual da FeSBE, 2007.

6.
ANTUNES, G.; ROQUE, ANTÔNIO C. . Activation of CaMKII under different Ca2+ oscillations mediated by PP2B, AC and PDE. In: Computational Neuroscience Meeting, 2006, Edimburgo. Computational Neuroscience Meeting, 2006.

7.
ANTUNES, G.; ROQUE, ANTÔNIO C. . The role of RC3 in the activation of CaMKII: a computational model. In: Computational Neuroscience Meeting, 2006, Atlanta. Computational Neuroscience Meeting, 2006.

8.
ANTUNES, G.; ROQUE, ANTÔNIO C. . Oxidative modification of neurogranin by nitric oxide and its role in the activation of CaMKII: a computational model. In: 14th Annual International Conference of Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB), 2006, Fortaleza. 14th Annual International Conference of Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB), 2006.

9.
Gabriela Antunes; ROQUE, ANTÔNIO C. . Biochemical simulation of the activation of calcium/calmodulin ? dependent protein kinase II under different frequencies of calcium, mediated by the activation of adenylate cyclase, cyclic nucleotide phosphodiesterase, and protein phosphatase 2B. In: Society for Neuroscience Meeting, 2005, Washington. Program No.496.10, 2005.

Artigos aceitos para publicação
1.
Gabriela Antunes; FARIA DA SILVA, S. F. ; SIMOES DE SOUZA, FABIO M. . Modeling Mirror Neurons Through Spike-Timing Dependent Plasticity. International Journal of Neural Systems, 2018.

Apresentações de Trabalho
1.
Gabriela Antunes. Systems Biology in Neuroscience. 2015. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

2.
Gabriela Antunes; ROQUE, ANTÔNIO C. ; SIMOES DE SOUZA, FABIO M. . STOCHASTIC INDUCTION OF CEREBELLAR LONG-TERM DEPRESSION AND LONG-TERM POTENTIATON. 2014. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

3.
Gabriela Antunes. Probabilistic and bistable induction of cerebellar long-term depression. 2012. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

4.
ANTUNES, GABRIELA. Stochastic modeling of signaling pathways involved in induction of cerebellar long-term depression. 2010. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

5.
ANTUNES, GABRIELA. Stochastic modeling of signaling pathways involved in induction of cerebellar long-term depression. 2010. (Apresentação de Trabalho/Seminário).



Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
International Workshop on Synaptic Plasticity ? IWSYP?14.Stochastic induction of cerebellar long-term depression and long term potentiation. 2014. (Simpósio).

2.
Computational Cell Biology Meeting.The role of NO-PKG in the induction of cerebellar LTD. 2010. (Encontro).

3.
FENS Meeting. Stochastic model of the induction of cerebellar long-term depression. 2010. (Congresso).

4.
Society for Neuroscience (SfN) Meeting. Computational Model of Signaling Pathways Involved in the AMPA Receptor Trafficking During LTP. 2010. (Congresso).

5.
Society for Neuroscience (SfN) Meeting. Bistable induction of cerebellar long-term depression in a stochastic model. 2010. (Congresso).

6.
Computational Neuroscience Meeting.The regulatory role of NO-PKG in the cerebellar long-term depression. 2009. (Encontro).

7.
Reunião Anual da Federação das Sociedades de Biologia Experimental (FeSBE). Modelo computacional das vias de sinalização implicadas com a plasticidade sináptica: o papel do trânsito de receptores AMPA no aumento do peso sináptico. 2007. (Congresso).

8.
Computational Neuroscience Meeting.Activation of CaMKII under different Ca2+ oscillations mediated by PP2B, AC and PDE. 2006. (Encontro).

9.
Society for Neuroscience (SfN) Meeting.The role of RC3 in the activation of CaMKII: a computational model. 2006. (Encontro).

10.
Society for Neuroscience (SfN) Meeting.Biochemical simulation of the activation of calcium/calmodulin ? dependent protein kinase II under different frequencies of calcium, mediated by the activation of adenylate cyclase, cyclic nucleotide phosphodiesterase, and protein phosphatase 2B. 2005. (Encontro).

11.
First Neuroscience Symposium of the International Institute of Neuroscience of Natal.Sensitivity of AMPA receptor channel to calcium oscillations arising through the activation of the metabotropic glutamate receptor. 2004. (Simpósio).



Inovação



Projetos de pesquisa



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