Luiz Manoel Rocha Gadelha Júnior

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  • Última atualização do currículo em 29/08/2018


Possui graduação em Matemática pela Universidade de Brasília (1997), mestrado em Ciência da Computação pela Universidade de Brasília (2000) e doutorado em Engenharia de Sistemas e Computação pela Universidade Federal do Rio de Janeiro (2012). Atualmente é Tecnologista Pleno no Laboratório Nacional de Computação Científica. Tem experiência nas áreas de gerência de dados científicos, computação de alto desempenho e segurança computacional, atuando principalmente nos seguintes temas: proveniência, workflows científicos paralelos e distribuídos, bioinformática e informática na biodiversidade. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Luiz Manoel Rocha Gadelha Júnior
Nome em citações bibliográficas
GADELHA JR., L. M. R.;Gadelha Jr., Luiz M.R.;Gadelha, Luiz;Gadelha Jr., Luiz M. R.;Gadelha, Luiz M. R.;GADELHA, L;GADELHA, LUIZ M.R.

Endereço


Endereço Profissional
Laboratório Nacional de Computação Científica, Coordenação de Métodos Matemáticos e Computacionais.
Av. Getúlio Vargas, 333
Quitandinha
25651075 - Petrópolis, RJ - Brasil
Telefone: (24) 22336206
URL da Homepage: http://www.lncc.br/~lgadelha


Formação acadêmica/titulação


2007 - 2012
Doutorado em Engenharia de Sistemas e Computação.
Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.
com período sanduíche em University of Chicago (Orientador: Ian Foster).
Título: Gerência de Proveniência em Workflows Paralelos e Distribuídos, Ano de obtenção: 2012.
Orientador: Marta Lima de Queiros Mattoso.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
1999 - 2000
Mestrado em Ciências da Computação.
Universidade de Brasília, UnB, Brasil.
Título: Aplicações de Técnicas de Reescrita ao Problema da Palavra de Grupos,Ano de Obtenção: 2000.
Orientador: Mauricio Ayala Rincón.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
Palavras-chave: Sistemas de Reescrita de Palavras; Problema da Palavra em Grupos; Procedimento Completador de Knuth-Bendix.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Matemática da Computação / Especialidade: Matemática Simbólica.
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Matemática / Subárea: Álgebra.
1993 - 1997
Graduação em Matemática.
Universidade de Brasília, UnB, Brasil.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.




Atuação Profissional



Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.
Vínculo institucional

2015 - Atual
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Tecnologista Senior, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Vínculo institucional

2004 - 2015
Vínculo: , Enquadramento Funcional: Tecnologista Pleno, Carga horária: 40

Atividades

11/2014 - Atual
Ensino, Modelagem Computacional, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
GB-500 Tópicos Especiais em Modelagem Computacional: Introdução a workflows científicos e suas aplicações
GA-009 Banco de dados
06/2012 - Atual
Conselhos, Comissões e Consultoria, Diretoria, .

Cargo ou função
Membro do Conselho de Pesquisa e Formação de Recursos Humanos - CPFRH.
01/2012 - Atual
Conselhos, Comissões e Consultoria, Diretoria, .

Cargo ou função
Membro da Comissão de Segurança.
09/2004 - Atual
Pesquisa e desenvolvimento , Centro Nacional de Processamento de Alto Desempenho no RJ (CENAPAD-RJ), .

09/2004 - Atual
Serviços técnicos especializados , Coordenação de Sistemas e Redes, .

Serviço realizado
Suporte a sistemas de computação de alto desempenho..

Global Biodiversity Information Facility, GBIF, Dinamarca.
Vínculo institucional

2013 - 2015
Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Representante da América Latina no NSG

Vínculo institucional

2012 - 2015
Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Gerente do nó brasileiro


Computation Institute, University of Chicago/Argonne National Laboratory, CI,UCHICAGO/ANL, Estados Unidos.
Vínculo institucional

2010 - 2011
Vínculo: Doutorado Sanduíche - CAPES, Enquadramento Funcional: Guest Graduate, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.


Rede Nacional de Ensino e Pesquisa, RNP, Brasil.
Vínculo institucional

2006 - 2007
Vínculo: Contrato, Enquadramento Funcional: Instrutor

Atividades

04/2007 - 04/2007
Ensino, Escola Superior de Redes, Nível: Aperfeiçoamento

Disciplinas ministradas
Segurança de Sistemas e Redes
10/2006 - 10/2006
Ensino, Escola Superior de Redes, Nível: Aperfeiçoamento

Disciplinas ministradas
Segurança de Sistemas e Redes
09/2006 - 09/2006
Ensino, Escola Superior de Redes, Nível: Aperfeiçoamento

Disciplinas ministradas
Segurança de Sistemas e Redes

Certisign Certificadora Digital S.A., CERTISIGN, Brasil.
Vínculo institucional

2001 - 2004
Vínculo: , Enquadramento Funcional: Analista de Suporte, Carga horária: 40

Atividades

04/2002 - 08/2004
Serviços técnicos especializados , Diretoria de Operações, .

Serviço realizado
Desenvolvimento de sistemas de certificação digital com bibliotecas OpenSSL e Verisign..
04/2001 - 08/2004
Serviços técnicos especializados , Diretoria de Operações, .

Serviço realizado
Administração de sistemas de certificação digital..
04/2001 - 08/2004
Serviços técnicos especializados , Diretoria de Operações, .

Serviço realizado
Administração de sistemas Unix, redes e segurança..

Universidade Estadual do Oeste do Paraná, UNIOESTE, Brasil.
Vínculo institucional

2000 - 2001
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Auxiliar, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

2/2000 - 3/2001
Ensino,

Disciplinas ministradas
Pesquisa Operacional
Projeto e Análise de Algoritmos
Teoria da Computação

Universidade de Brasília, UnB, Brasil.
Vínculo institucional

1999 - 2000
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Bolsista de Mestrado (CAPES), Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

08/1999 - 12/1999
Ensino, Ciência da Computação, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Teoria da Computação


Linhas de pesquisa


1.
Computação de alto desempenho
2.
Gerenciamento de dados científicos
3.
Bioinformática
4.
Informática na Biodiversidade


Projetos de pesquisa


2017 - Atual
Arcabouço computacional escalável para modelagem de nicho ecológico

Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Marinez Ferreira de Siqueira em 25/07/2017.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2016 - Atual
Metodologias, Ferramentas e Abstrações para Produtividade em Computação Científica de Alto Desempenho
Descrição: Pesquisas multidisciplinares envolvendo processamento e gerenciamento de grandes volumes de dados em ambientes de computação de alto desempenho, como aquelas geradas por áreas como a bioinformática, biofísica, biodiversidade, métodos numéricos multiescala, entre outras, ainda são nascentes no Brasil, mesmo sendo fundamentais para o desenvolvimento científico do país Este projeto tem como objetivo o desenvolvimento de metodologias, ferramentas e abstrações para permitir que as tanto os experimentos científicos computacionais quanto as aplicações que os compõem sejam implementados com ferramentas mais produtivas, permitindo que tirem proveito em um prazo mais curto de recursos computacionais de alto desempenho como supercomputadores e plataformas para processamento de Big Data..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2016 - Atual
Gerenciamento e Análise de Dados Biológicos em Plataformas de Computação de Alto Desempenho (HPC) e de Processamento de Grandes Massas de Dados (Big Data)

Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Kary Ann del Carmen Ocaña Gautherot em 08/11/2016.
Descrição: O desafio em questão é a melhor maneira de processar, gerenciar e analisar o biologicalbig data em ambientes HPC paralelos e distribuídos e torná-la em uma metodologia exitosa. Os cientistas precisam de um grau de abstração, a fim de integrar eficientemente experimentos de bioinformática a várias tecnologias computacionais como sistemas de gerenciamento de workflows científicos (SGWfC), sistemas de gerenciamento de banco de dados (SGBD), aplicações aceleradas por GPU (do inglês, graphics processing unit), aprendizagem de máquina e profundo (do inglês machine and deep learning), sistemas Web, e sistemas de segurança em uma arquitetura HPC como clusters de supercomputadores. No entanto, a integração, o uso e o acoplamento destas tecnologias para ambientes HPC têm muitos outros desafios relacionados principalmente à gerência de recursos em larga escala de dados, tarefas, simulações computacionais, número de processadores e segurança de dados..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2014 - 2015
Aplicações de Metadados de Proveniência à Gerência de Experimentos Científicos Computacionais em Larga Escala com Estudo de Caso sobre Modelos de Distribuição de Espécies
Descrição: A pesquisa científica é cada vez mais apoiada por experimentos computacionais, que são frequentemente dados por um grande número de tarefas computacionais (MTC, many-task computing) que são especificadas e automatizadas como workflows científicos. Nesta proposta, abordamos o problema do gerência de informações de proveniência sobre computações que envolvam muitas tarefas (MTC), implementadas através de workflows científicos, e que sejam realizadas em ambientes paralelos e distribuídos de alto desempenho. Neste contexto de larga escala, as questões envolvidas no gerenciamento de proveniência tornam-se mais complexas pois os mecanismos utilizados na coleta e armazenamento dessas informações podem ter um impacto que prejudique a escalabilidade do experimento computacional. Por outro lado, o nível de detalhe das informações capturadas deve ser suficiente para permitir a análise do experimento de maneira satisfatória. Além de permitir a análise do processo de derivação de dados de um experimento, a proveniência pode apoiar a depuração e otimização de estratégias de execução e de manuseio de dados de workflows, se as respectivas informações relativas a consumo de recursos computacionais forem adicionadas. Desenvolvemos o MTCProv, um arcabouço para consultas de proveniência que captura os detalhes do tempo de execução em sistemas paralelos e distribuídos, além da proveniência prospectiva e retrospectiva padrões. Uma interface de consulta esconde as complexidades da consulta relacional, mas permite associar proveniência com detalhes do paralelismo e acesso aos dados do domínio da aplicação. Este projeto propõe estender o MTCProv com novas funcionalidades para gerência de informações de proveniência e implementar um workflow científico para a execução em larga escala de modelos de distribuição de espécies como estudo de caso..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
2014 - Atual
Rede Avançada em Biologia Computacional (RABICÓ)
Descrição: A Rede Avançada em Biologia Computacional (RABICÓ) terá sua sede no LNCC e pretende oferecer um conjunto de softwares com tecnologia moderna e atualizada para o desenvolvimento de aplicações que requerem alto poder computacional e recursos avançados de visualização científica, possibilitar a geração e estimular o desenvolvimento da pesquisa de forma integrada com equipes multidisciplinares, para o estudo de problemas relacionados à saúde humana, animal, vegetal e ambiental, e principalmente, formar recursos humanos qualificados na Graduação e na Pós-Graduação..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2014 - Atual
Rede Nacional de Pesquisa em Biotecnologia Marinha (BiotecMar)
Descrição: O Brasil detém vasta área marinha, denominada em conjunto, como a Amazônia Azul (aprox. 4,5 milhões de Km2), onde habitam organismos de ocorrência restrita ao Brasil. Estes holobiontes (hospedeiro+microbiota) endêmicos são fonte potencial para descoberta de novas moléculas e produtos biotecnológicos. A Rede Nacional de Pesquisa em Biotecnologia Marinha compreende quatro projetos complementares e articulados, visando o desenvolvimento de temáticas de fronteira da biotecnologia marinha. O objetivo principal da rede é desenvolver pesquisa inovadora de fronteira nas áreas de biodiversidade, prospecção, genômica, pós-genômica (ômicas) e transferência para o setor produtivo.A Rede Nacional de Pesquisa em Biotecnologia Marinha desenvolve estudos pioneiros nas Ilhas Oceânicas, região costeira e mar profundo. Nossa meta é colocar o Brasil mais próximo da liderança internacional em pesquisa e tecnologia marinha. Parcerias estratégicas com empresas do Brasil e do exterior estão abrindo a possibilidade de desenvolvimento de produtos e processos, visando a produção de divisas para o nosso país. A Rede Nacional de Pesquisa em Biotecnologia Marinha esta estruturada em quatro grandes eixos temáticos e conta com grupos consolidados e emergentes das cinco regiões geográficas do Brasil compondo os diferentes eixos temáticos. Ao todo, estão envolvidos 20 programas de pós-graduação em áreas complementares do conhecimento em Biotecnologia Marinha e Ciências do Mar, incluindo programas considerados de excelência pela CAPES (notas 6 e 7) e programas novos e em consolidação. A equipe compreende pelo menos 120 pesquisadores (22 pesquisadores de produtividade do CNPq) e estudantes de laboratórios que contam com tecnologia de ponta nas temáticas..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2014 - Atual
Model-R: arcabouço escalável para modelagem de nichos ecológicos

Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Marinez Ferreira de Siqueira em 28/11/2016.
Descrição: Ferramentas de análise espacial e síntese dos resultados são fundamentais para identificar as melhores soluções na conservação da biodiversidade. A importância da automação de processos está associada ao aumento da eficiência e desempenho tanto nas fases de pré-processamento e de pós-análise dos resultados gerados pelos pacotes e programas de modelagem. O arcabouço Model-R foi desenvolvido com o objetivo principal de oferecer ferramentas de modelagem de nicho ecológico, como scripts de modelagem, bibliotecas para recuperação de dados ocorrências, e uma interface web que automatiza as etapas do processo de modelagem. O RJabot, por exemplo, permite a pesquisa e recuperação de dados relativos à ocorrências de espécies do Jabot, a principal referência em dados sobre ocorrências de espécies botânicas no Brasil. As consultas retornam dados em um formato adequado para ser consumido por outros componentes do arcabouço. Atualmente, as ferramentas são multi-projeção, que podem assim ser aplicadas a diferentes conjuntos de dados temporais ou espaciais. Modelo-R também é multi-algoritmo, com sete algoritmos disponíveis para a modelagem: BIOCLIM, distância de Mahalanobis, MAXENT, GLM, RandomForest, SVM e Domain. Os algoritmos, bem como todo o processo de modelagem pode ser parametrizado através de ferramentas de linha de comando ou através de uma interface web. Esperamos que o uso desta aplicação, não só por especialistas de modelagem, mas também como uma ferramenta de ensino no assunto, é uma contribuição significativa para o desenvolvimento contínuo desse tipo de análise sobre temas como a conservação da biodiversidade..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2013 - 2015
Sistema de Informação em Saúde Silvestre (SISS-Geo)
Descrição: O Sistema de Informação em Saúde Silvestre ? SISS-Geo é a plataforma computacional essencial e inerente ao funcionamento do Centro de Informação em Saúde Silvestre ? CISS. O projeto tem como objetivos: gerar, a partir dos registros georreferenciadas informados pelos usuários, modelos de alerta de ocorrências de agravos na fauna silvestre, especialmente os com potencial de acometimento humano, e modelos de previsão de oportunidades ecológicas para emergência de doenças; proporcionar de maneira rápida e eficiente, o fluxo de informações entre o CISS; a Rede Participativa em Saúde Silvestre e a Rede de Laboratórios em Saúde Silvestre; a sociedade, por meio da ciência cidadã, e os setores de governo e tomadores de decisão; disponibilizar informações sobre os resultados das modelagens para a comunidade, tomadores de decisão e a sociedade. Integrar-se às plataformas governamentais georreferenciadas, especialmente o Sistema de Informação sobre a Biodiversidade Brasileira- SIBBr e a Plataforma INDE, com padrão de Metadados. O SISS irá receber registros de animais silvestres no campo, com a descrição de anormalidades observadas, o que poderá ser feito por qualquer pessoa interessada em participar desse esforço, especialista ou não. O aplicativo para acesso ao SISS pode ser instalado em aparelhos móveis como celulares, smarthphones, tablets e, posteriormente, em computadores (desktops, notebooks)..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
2012 - 2015
Portal de Ocorrências de Espécias e de Dados Ecológicos do Sistema de Informação sobre a Biodiversidade Brasileira (SiBBr)
Descrição: Iniciativa do Ministério da Ciência, Tecnologia e Inovação (MCTI), por meio da sua Secretaria de Políticas e Programas de Pesquisa e Desenvolvimento (SEPED), com suporte técnico do Programa das Nações Unidas para o Meio Ambiente (PNUMA) e apoio financeiro do Fundo Global para o Meio Ambiente (GEF), o Sistema de Informação sobre a Biodiversidade Brasileira (SiBBr) é o primeiro passo para o Brasil consolidar uma sólida infraestrutura nacional de dados e conteúdos em biodiversidade. O SiBBr é uma plataforma on-line que pretende reunir a maior quantidade de dados e informações existentes sobre a biodiversidade do Brasil. Seu objetivo é apoiar a produção científica e processos de formulação de políticas públicas e tomada de decisões associadas à conservação ambiental e ao uso sustentável dos recursos naturais, por meio do estímulo e facilitação à digitalização, publicação na internet, integração de dados de livre acesso e uso de informações sobre a biodiversidade brasileira. Com o SiBBr, o governo brasileiro atende a uma recomendação da Convenção sobre a Diversidade Biológica (CDB), do qual o Brasil é um dos países signatários, no que concerne a integração e disponibilização de informações sobre biodiversidade. O projeto é associado à Plataforma Global de Informação sobre Biodiversidade (GBIF, na sigla em inglês), a maior iniciativa multilateral de acesso virtual a informações biológicas de aproximadamente 60 países. O GBIF soma mais de 570 milhões de registros de espécies provenientes de 766 instituições. Assim, com o SiBBr, o Brasil integra o maior esforço global para conhecer melhor a biodiversidade do planeta e disponibilizar gratuitamente as informações existentes..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
2012 - 2015
SI2-SSE: Enhancement and Support of Swift Parallel Scripting
Descrição: The Swift parallel scripting language enables scientists, engineers, and data analysts to express and coordinate parallel invocations of application programs on distributed and parallel computing platforms: one of the dominant modes of performing computation in science and engineering. Swift runs on a variety of HPC clusters and clouds, and enables users to move their application scripts between computing environments with relative ease. Swift comprises a programming model, scripting language, and runtime engine. Its implicitly parallel programming model allows users with minimal programming expertise to transparently utilize parallel and distributed systems. The scripting language is simple, minimal and standalone; the programming model has also been embedded into the Python and R languages. Swift is employed in many diverse domains, including biochemistry, neuroscience, climate model analysis, earthquake simulation, hydrology, energy forecasting, economics modeling, mass media analysis, materials science, and astronomy. This project makes usability and programmatic expressiveness enhancements to Swift, broadens its utility library, performs the testing and hardening needed to serve a large-scale national and global community, and extends existing documentation and training material in a manner that will create and serve a broad user base. It also develops enhancements in configuration, script debugging, exception handling, parallel collection processing, and data typing and mapping to make Swift increasingly productive. Swift enables users with little or no experience in parallel programming to leverage parallel and distributed computing environments ranging in scale from desktops to petascale supercomputers. It opens up powerful cyberinfrastructure like XSEDE, Open Science Grid, FutureGrid, and Blue Waters to a wide range and scale of scientific user communities, thus broadening participation in high performance computing..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.


Revisor de periódico


2010 - Atual
Periódico: Future Generation Computer Systems
2010 - 2010
Periódico: Concurrency and Computation
2014 - 2014
Periódico: Plos One
2015 - Atual
Periódico: IEEE Transactions on Cloud Computing
2015 - Atual
Periódico: IEEE Transactions on Services Computing
2011 - 2011
Periódico: International Journal of Computer Applications
2016 - Atual
Periódico: Rodriguésia (Impresso)
2016 - Atual
Periódico: PeerJ Computer Science


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação/Especialidade: Banco de Dados.
2.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação/Especialidade: Sistemas de Informação.
3.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Sistemas de Computação/Especialidade: Sistemas Distribuídos.


Idiomas


Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Alemão
Compreende Pouco, Fala Pouco, Lê Pouco, Escreve Pouco.
Espanhol
Compreende Bem, Fala Pouco, Lê Bem, Escreve Pouco.


Prêmios e títulos


2016
Melhor Demonstração do 31o Simpósio Brasileiro de Banco de Dados (SBBD), SBC.
2014
Melhor projeto do 3o. Seminário Grandes Desafios para a Computação na categoria Saúde, SBC.
2007
ACM/IFIP/USENIX 8th International Middleware Conference Student Travel Grant, Association for Computing Machinery.
2003
Sun Certified System Administrator for the Solaris 8 Operating System, Sun Microsystems.
1999
Certificate of Proficiency in English, University of Michigan.


Produções



Produção bibliográfica
Artigos completos publicados em periódicos

1.
MONDELLI, MARIA LUIZA2018MONDELLI, MARIA LUIZA ; MAGALHÃES, THIAGO ; LOSS, GUILHERME ; Wilde, Michael ; Foster, Ian ; Mattoso, Marta ; KATZ, DANIEL ; BARBOSA, HELIO ; DE VASCONCELOS, ANA TEREZA R. ; OCAÑA, KARY ; GADELHA, LUIZ M.R. . BioWorkbench: a high-performance framework for managing and analyzing bioinformatics experiments. PeerJ, v. 6, p. e5551, 2018.

2.
COSTA, RAQUEL L.2017COSTA, RAQUEL L. ; Gadelha, Luiz ; RIBEIRO-ALVES, MARCELO ; PORTO, F?BIO . GeNNet: an integrated platform for unifying scientific workflows and graph databases for transcriptome data analysis. PeerJ, v. 5, p. e3509, 2017.

3.
MEIRELLES, PEDRO M.2015MEIRELLES, PEDRO M. ; AMADO-FILHO, GILBERTO M. ; PEREIRA-FILHO, GUILHERME H. ; PINHEIRO, HUDSON T. ; DE MOURA, RODRIGO L. ; JOYEUX, JEAN-CHRISTOPHE ; MAZZEI, ERIC F. ; BASTOS, ALEX C. ; EDWARDS, ROBERT A. ; DINSDALE, ELIZABETH ; PARANHOS, RODOLFO ; SANTOS, EIDY O. ; IIDA, TETSUYA ; GOTOH, KAZUYOSHI ; NAKAMURA, SHOTA ; SAWABE, TOMOO ; REZENDE, CARLOS E. ; Gadelha, Luiz M. R. ; FRANCINI-FILHO, RONALDO B. ; THOMPSON, CRISTIANE ; THOMPSON, FABIANO L. . Baseline Assessment of Mesophotic Reefs of the Vitória-Trindade Seamount Chain Based on Water Quality, Microbial Diversity, Benthic Cover and Fish Biomass Data. Plos One, v. 10, p. e0130084, 2015.

4.
MEIRELLES, PEDRO MILET2015MEIRELLES, PEDRO MILET ; Gadelha, Luiz M. R. ; FRANCINI-FILHO, RONALDO BASTOS ; DE MOURA, RODRIGO LEÃO ; AMADO-FILHO, GILBERTO MENEZES ; BASTOS, ALEX CARDOSO ; PARANHOS, RODOLFO PINHEIRO DA ROCHA ; REZENDE, CARLOS EDUARDO ; SWINGS, JEAN ; SIEGLE, EDUARDO ; ASP NETO, NILS EDVIN ; LEITÃO, SIGRID NEUMANN ; COUTINHO, RICARDO ; Mattoso, Marta ; SALOMON, PAULO S. ; VALLE, ROGÉRIO A.B. ; PEREIRA, RENATO CRESPO ; KRUGER, RICARDO HENRIQUE ; THOMPSON, CRISTIANE ; THOMPSON, FABIANO L. . BaMBa: towards the integrated management of Brazilian marine environmental data. DATABASE-OXFORD, v. 2015, p. bav088, 2015.

5.
ZORRILLA, R2014ZORRILLA, R ; POLTOSI, M ; GADELHA, L ; PORTO, F ; MOURA, A ; DALTO, A ; LAVRADO, H P ; VALENTIN, Y ; TENÓRIO, M ; XAVIER, E . Conceptual View Representation of the Brazilian Information System on Antarctic Environmental Research. Data Science Journal, v. 13, p. 1-7, 2014.

6.
Gadelha, Luiz M. R.2012Gadelha, Luiz M. R.; Wilde, Michael ; Mattoso, Marta ; Foster, Ian . MTCProv: a practical provenance query framework for many-task scientific computing. Distributed and Parallel Databases (Dordrecht. Online), v. 30, p. 351-370, 2012.

7.
Gadelha Jr., Luiz M.R.2011Gadelha Jr., Luiz M.R.; Clifford, Ben ; Mattoso, Marta ; Wilde, Michael ; Foster, Ian . Provenance management in Swift. Future Generation Computer Systems, v. 27, p. 775-780, 2011.

8.
GADELHA JR., L. M. R.;Gadelha Jr., Luiz M.R.;Gadelha, Luiz;Gadelha Jr., Luiz M. R.;Gadelha, Luiz M. R.;GADELHA, L;GADELHA, LUIZ M.R.1998GADELHA JR., L. M. R.; RINCÓN, M. A. . Some Applications of (Semi-)Decision Algorithms for Presburger Arithmetic in Automated Deduction based on Rewriting Techniques. Revista de la Sociedad Chilena de Ciencia de la Computación, v. 2, n.1, p. 14-23, 1998.

Capítulos de livros publicados
1.
Sánchez-Tapia, Andrea ; de Siqueira, Marinez Ferreira ; Lima, Rafael Oliveira ; Barros, Felipe Sodré M. ; Gall, Guilherme M. ; Gadelha, Luiz M. R. ; da Silva, Luís Alexandre E. ; Osthoff, Carla . Model-R: A Framework for Scalable and Reproducible Ecological Niche Modeling. In: High Performance Computing - Fourth Latin American Conference, CARLA 2017. (Org.). Communications in Computer and Information Science. 1ed.: Springer International Publishing, 2018, v. 796, p. 218-232.

2.
CHAME, M. ; BARBOSA, H. J. C. ; Gadelha, Luiz ; AUGUSTO, D. A. ; KREMPSER, E. ; ABDALLA, L. . Sistema de Informação em Saúde Silvestre - SISS-GEO. In: Ana Carolina Salgado; Claudia Lage Rebello da Motta; Flavia Maria Santoro. (Org.). Grandes Desafios da Computação no Brasil - Relatos do 3o seminário. 1aed.: , 2015, v. , p. 72-87.

3.
Gadelha, Luiz M. R.; Mattoso, Marta . Applying Provenance to Protect Attribution in Distributed Computational Scientific Experiments. In: Provenance and Annotation of Data and Processes - The Fifth Provenance and Annotation Workshop (IPAW 2014). (Org.). Lecture Notes in Computer Science. 1ed.: Springer International Publishing, 2015, v. 8628, p. 139-151.

Trabalhos completos publicados em anais de congressos
1.
MONDELLI, M. L. B. ; GADELHA JR., L. M. R. ; ZIVIANI, A. . O Que os Países Escutam: Analisando a Rede de Gêneros Musicais ao Redor do Mundo. In: BraSNAM, 2018. Anais do VII Brazilian Workshop on Social Network Analysis and Mining, 2018. p. 148-159.

2.
MONDELLI, M. L. B. ; OCANA, K. ; VASCONCELOS, A. T. R. ; GADELHA JR., L. M. R. . Análise de Desempenho a partir do Perfilamento de Workflows Científicos de Filogenia. In: III Escola Regional de Alto Desempenho do Rio de Janeiro, 2017, Rio de Janeiro. ERAD-RJ 2017, 2017.

3.
MONDELLI, M. L. B. ; GALHEIGO, M. M. ; MEDEIROS, Vívian ; BASTOS, B. F. ; GOMES, A. T. A. ; MATTOSO, M. ; VASCONCELOS, A. T. R. ; GADELHA JR., L. M. R. . Integrating Scientific Workflows with Scientific Gateways: A Bioinformatics Experiment in the Brazilian National High-Performance Computing Network. In: X Brazilian e-Science Workshop, 2016, Porto Alegre. Anais do XXXVI Congresso da Sociedade Brasileira de Computação, 2016. p. 277-284.

4.
MONDELLI, M. L. B. ; TONELLI, M. ; OCANA, K. ; VASCONCELOS, A. T. R. ; Gadelha Jr., Luiz M. R. . HPSW-Prof: A Provenance-Based Framework for Profiling High Performance Scientific Workflows. In: 31st Brazilian Symposium on Databases (SBBD 2016), 2016, Salvador. Proceedings of Satellite Events of the 31st Brazilian Symposium on Databases (SBBD 2016), 2016. p. 117-122.

5.
Gadelha Jr., Luiz M.R.; GUIMARAES, P. ; MOURA, A. M. ; DRUCKER, D. ; DALCIN, E. ; GALL, G. ; TAVARES JR., J. ; PALAZZI, D. ; POLTOSI, M. ; PORTO, F. ; MOURA, F. ; LEO, W. V. . SiBBr: Uma Infraestrutura para Coleta, Integração e Análise de Dados sobre a Biodiversidade Brasileira. In: VIII Brazilian e-Science Workshop (BRESCI 2014), 2014, Brasília. VIII Brazilian e-Science Workshop (BRESCI 2014), 2014.

6.
GADELHA JR., L. M. R.; MATTOSO, M. ; Wilde, Michael ; Foster, Ian . Provenance Query Patterns for Many-Task Scientific Computing. In: 3rd USENIX Workshop on the Theory and Practice of Provenance (TaPP 2011), 2011, Heraklion. Proc. 3rd USENIX Workshop on the Theory and Practice of Provenance (TaPP 2011), 2011.

7.
Gadelha Jr., Luiz M.R.; Wilde, Michael ; MATTOSO, M. ; Foster, Ian . Exploring Provenance in High Performance Scientific Computing. In: First Annual Workshop on High Performance Computing Meets Databases (HPCDB 2011), 2011, Seattle, Estados Unidos. Proceedings of the First Annual Workshop on High Performance Computing Meets Databases, 2011.

8.
CRUZ, S. M. S. ; SILVA, F. N. ; GADELHA JR., L. M. R. ; CAVALCANTI, M. C. R. ; CAMPOS, M. L. M. ; MATTOSO, M. . A Lightweight Middleware Monitor for Distributed Scientific Workflows. In: 3rd International Workshop on Workflow Systems in e-Science (WSES 08), 2008, Lyon, França. Proceedings of the 8th IEEE International Symposium on Cluster Computing and the Grid (CCGrid 2008), 2008. p. 693-698.

9.
GADELHA JR., L. M. R.; MATTOSO, M. . Kairos: An Architecture for Securing Authorship and Temporal Information of Provenance Data in Grid-Enabled Workflow Management Systems. In: 3rd International Workshop on Scientific Workflows and Business Workflow Standards in e-Science (SWBES 2008), 2008, Indianapolis, Estados Unidos. Proceedings of the 4th IEEE International Conference on e-Science (e-Science 2008), 2008. p. 597-602.

10.
GADELHA JR., L. M. R.; SCHULZE, B. R. . On the Management of Grid Credentials. In: 5th International Workshop on Middleware for Grid Computing (MGC 2007), 2007, Newport Beach, Estados Unidos. Proceedings of the 5th International Workshop on Middleware for Grid Computing (MGC 2007), 2007.

11.
GADELHA JR., L. M. R.; RINCÓN, M. A. . An Efficient Strategy for Word-Cycle Completion in Finitely Presented Groups. In: XXI International Conference of the Chilean Computer Science Society, 2001, Punta Arenas, Chile. Proceedings: XXI International Conference of the Chilean Computer Science Society. Los Alamitos, CA: IEEE Computer Society, 2001. p. 80-85.

12.
GADELHA JR., L. M. R.; RINCÓN, M. A. . Applications of Decision Algorithms for Presburger Arithmetic in Rewrite Automated Deduction. In: PANEL´97 - XXIII Latin American Conference on Informatics, 1997, Valparaiso, Chile. Proc. PANEL'97 (XXIII Latin American Conference on Informatics), 1997.

Resumos expandidos publicados em anais de congressos
1.
ZORRILLA, R. ; POLTOSI, M. ; Gadelha, Luiz ; PORTO, F. ; MOURA, A. M. . Design and Implementation of the Brazilian Information System on Antarctic Environmental Research. In: International Forum on Polar Data Activities in Global Data Systems, 2013, Tóquio. Proceedings of the International Forum on Polar Data Activities in Global Data Systems, 2013. p. 17-18.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
TONELLI, M. ; Gadelha Jr., Luiz M.R. . Avaliação do Modelo PGAS de Programação Paralela para Algoritmos de Álgebra Linear. In: ERAD-RJ - Fórum de Iniciação Científica, 2018. IV Escola Regional de Alto Desempenho do Rio de Janeiro, 2018.

2.
ALBUQUERQUE, M. ; Gadelha Jr., Luiz M.R. . Paralelização do Model-R baseada em Dataflow com Apache Spark. In: ERAD-RJ - Fórum de Inciação Científica, 2018. IV Escola Regional de Alto Desempenho do Rio de Janeiro, 2018.

3.
TONELLI, M. ; MONDELLI, M. L. B. ; OCANA, K. ; GADELHA JR., L. M. R. . Perfilamento Preditivo de Workflows Científicos em Larga Escala baseado em Dados Massivos de Proveniência. In: III Escola Regional de Alto Desempenho do Rio de Janeiro, 2017, Rio de Janeiro. ERAD-RJ 2017, 2017.

4.
ALBUQUERQUE, M. ; GADELHA JR., L. M. R. . Paralelização de Workflows Científicos para Análises Metagenômicas. In: III Escola Regional de Alto Desempenho do Rio de Janeiro, 2017, Rio de Janeiro. ERAD-RJ 2017, 2017.

5.
MONDELLI, M. L. B. ; TORRENO, O. ; OCANA, K. ; MATTOSO, M. ; WILDE, M. ; VASCONCELOS, A. T. R. ; GADELHA JR., L. M. R. . SwiftGECKO: a provenance-enabled parallel comparative genomics workflow. In: X-Meeting 2015 - 11th International Conference of th AB3C + Brazilian Symposium of Bioinformatics, 2015, São Paulo. Proceedings X-Meeting 2015, 2015. p. 268.

6.
MONDELLI, M. L. B. ; VILASBOAS, F. ; OCANA, K. ; MATTOSO, M. ; WILDE, M. ; VASCONCELOS, A. T. R. ; GADELHA JR., L. M. R. . Provenance-based Profiling of Swift Parallel and Distributed Scientific Workflows. In: X-Meeting 2015 - 11th International Conference of th AB3C + Brazilian Symposium of Bioinformatics, 2015, São Paulo. Proceedings X-Meeting 2015, 2015. p. 176.

7.
Gadelha, Luiz M. R.; Wilde, Michael ; Mattoso, Marta ; Foster, Ian . Provenance traces of the swift parallel scripting system. In: the Joint EDBT/ICDT 2013 Workshops, 2013, Genoa. Proceedings of the Joint EDBT/ICDT 2013 Workshops on - EDBT '13. New York: ACM Press, 2013. p. 325-326.

8.
Gadelha Jr., Luiz M. R.; STANZANI, S. ; CORREA, P. ; DALCIN, E. ; GOMES, C. R. O. ; SATO, L. ; SIQUEIRA, M. . Scalable and Provenance-Enabled Scientific Workflows for Predicting Distribution of Species. In: 8th International Conference on Ecological Informatics, 2012, Brasília. Proceedings of the 8th International Conference on Ecological Informatics, 2012. p. 222-224.

9.
GADELHA JR., L. M. R.; MATTOSO, M. ; Wilde, Michael ; Foster, Ian . Towards a Threat Model for Provenance in e-Science. In: Third International Provenance and Annotation Workshop (IPAW 2010), 2010, Troy. Provenance and Annotation of Data and Processes - The Third Provenance and Annotation Workshop (IPAW 2010), Lecture Notes in Computer Science, 2010. v. 6378. p. 277-279.

10.
GADELHA JR., L. M. R.; LICHT, F. L. ; MEDEIROS, Vívian ; SCHULZE, B. R. . Políticas e Práticas de Certificação para Grades. In: VI Workshop de Computação em Grid e Aplicações (WCGA 2008), 2008, Rio de Janeiro. Anais do VI Workshop de Computação Grid e Aplicações (WCGA 2008), 2008. p. 157-158.

11.
GADELHA JR., L. M. R.. Specification of a MyProxy Plugin for Mozilla. In: IV Workshop de Computação em Grid e Aplicações (WCGA 2006), 2006, Curitiba. Anais IV Workshop de Computação em Grid e Aplicações (WCGA 2006), 2006. p. 155-156.

12.
GADELHA JR., L. M. R.; RINCÓN, M. A. . Métodos de Decisão para a Aritmética de Presburger na Dedução Automática com Técnicas de Reescrita. In: Congresso Nacional de Matemática Aplicada e Computacional, 1997, Gramado. Anais do XX Congresso Nacional de Matemática Aplicada e Computacional, 1997.

13.
GADELHA JR., L. M. R.; RINCÓN, M. A. . Aplicação de Métodos de Programação Linear Inteira para Decisão na Teoria da Aritmética de Presburger. In: Congresso Nacional de Matemática Aplicada e Computacional, 1996, Goiânia. Anais do XIX Congresso Nacional de Matemática Aplicada e Computacional, 1996.

Apresentações de Trabalho
1.
CLIFFORD, B. ; GADELHA JR., L. M. R. . Tracking Provenance in Swift. 2009. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

2.
GADELHA JR., L. M. R.. Grades Computacionais no Contexto do SINAPAD. 2007. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

3.
GADELHA JR., L. M. R.. Grade - GIGA: Uma Grade Computacional de Alto Desempenho de Produção , para Apoio ao Ensino e Pesquisa. 2007. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

4.
GADELHA JR., L. M. R.; SCHULZE, B. R. . SINAPAD Grid PKI. 2006. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

Outras produções bibliográficas
1.
GADELHA JR., L. M. R.. Aplicações de Técnicas de Reescrita ao Problema da Palavra de Grupos. Departamento de Ciência da Computação, Universidade de Brasília, 2000 (Dissertação de Mestrado).


Produção técnica
Programas de computador sem registro
1.
GALHEIGO, M. M. ; MEDEIROS, Vívian ; BASTOS, B. F. ; OCANA, K. ; GOMES, A. T. A. ; GADELHA JR., L. M. R. ; VASCONCELOS, A. T. R. ; OLIVEIRA, P. S. L. ; TEIXEIRA, S. M. R. ; LUIZ, G. F. R. ; PEREIRA, J. G. C. ; NAGAMATSU, S. T. . Bioinfo-Portal: A Bioinformatics Suite for Program Execution at LABINFO and SINAPAD-LNCC (http://www.bioinfo.lncc.br/). 2016.

2.
MONDELLI, M. L. B. ; TONELLI, M. ; GADELHA JR., L. M. R. ; OCANA, K. . HPSW-Prof: A Provenance-Based Framework for Profiling High Performance Scientific Workflows (https://github.com/mmondelli/swift-prof e https://subversion.assembla.com/svn/provweb). 2016.

3.
COSTA, R. L. ; PORTO, F. ; GADELHA JR., L. M. R. ; RIBEIRO-ALVES, M. ; CAVALCANTI, M. C. R. ; ROBERTSON, D. ; MARC-SCHWARTZ, J. ; SOARES, M. A. . Host Immune Transcriptome Interaction Data for SIV and HIV (http://hihisiv.dexl.lncc.br/). 2016.

4.
SANCHEZ-TAPIA, A. ; LIMA, R. O. ; GALL, G. ; SIQUEIRA, M. ; SILVA, L. A. E. ; GADELHA JR., L. M. R. . Model-R: arcabouço escalável para modelagem de nichos ecológicos. 2016.

5.
GADELHA JR., L. M. R.; MEIRELLES, PEDRO MILET ; RIBEIRO, M. L. ; ALBUQUERQUE, M. ; THOMPSON, F. L. . BaMBa: Brazilian Marine Biodiversity Database (https://marinebiodiversity.lncc.br). 2015.

6.
MONDELLI, M. L. B. ; GADELHA JR., L. M. R. ; WILDE, M. ; OCANA, K. ; TORRENO, O. ; MATTOSO, M. ; VASCONCELOS, A. T. R. ; TRELLES, O. . SwiftGECKO: a provenance-enabled parallel comparative genomics workflow (https://github.com/mmondelli/swift-gecko). 2015.

7.
GUIMARAES, P. ; MOURA, F. ; TAVARES JR., J. ; PALAZZI, D. ; POLTOSI, M. ; GADELHA, L . SiBBr: Sistema de Informação sobre a Biodiversidade Brasileira (http://www.sibbr.gov.br). 2014.

8.
AUGUSTO, D. A. ; KREMPSER, E. ; WERDT, P. ; ABDALLA, L. ; BRASIL, F. C. L. ; SANTOS, T. ; GADELHA JR., L. M. R. ; BARBOSA, H. J. C. ; CHAME, M. . SISS-Geo: Sistema de Informação em Saúde Silvestre (http://sissgeo.lncc.br/). 2014.

9.
GADELHA JR., L. M. R.; WILDE, M. ; MATTOSO, M. ; Foster, Ian . MTCProv: a practical provenance query framework for many-task scientific computing (https://svn.ci.uchicago.edu/svn/vdl2/provenancedb). 2012.

10.
GADELHA JR., L. M. R.; RINCÓN, M. A. . Protótipo do Procedimento de Semi-Decisão de Shostak para a Aritmética de Presburger. 1996.

Trabalhos técnicos
1.
GADELHA JR., L. M. R.. Implantação da Autoridade Certificadora do LNCC (GT ICPEDU - RNP). 2007.

2.
GADELHA JR., L. M. R.. Revisão do documento "Declaração de Práticas de Certificação da AC de Correio Eletrônico da Infra-Estrutura de Chaves Públicas para Pesquisa e Ensino (ICPEDU)". 2007.

3.
GADELHA JR., L. M. R.. Elaboração de documento técnico baseado na RFC 3647: "Política de Certificados e Declaração de Práticas de Certificação da Autoridade Certificadora do Laboratório Nacional de Computação Científica". 2007.


Demais tipos de produção técnica
1.
CLIFFORD, B. ; GADELHA JR., L. M. R. ; MATTOSO, M. ; Wilde, Michael ; Foster, Ian . Tracking Provenance in Swift. 2009. (Relatório de pesquisa).

2.
GADELHA JR., L. M. R.. Introdução às Infraestruturas de Chaves Públicas: Certificados Digitais e suas Aplicações. 2007. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

3.
GADELHA JR., L. M. R.. Introdução às Infraestruturas de Chaves Públicas. 2006. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).



Bancas



Participação em bancas de trabalhos de conclusão
Mestrado
1.
SIQUEIRA, M.; GADELHA JR., L. M. R.; SOUZA, M. G.. Participação em banca de Rafael Oliveira Lima. Desenvolvimento de programas para automatização de processos em análises espaciais e ecológicas no ambiente R. 2016. Dissertação (Mestrado em Botânica) - Instituto de Pesquisa Jardim Botânico do Rio de Janeiro.

Qualificações de Doutorado
1.
GADELHA JR., L. M. R.. Participação em banca de Felipe Hernandes Coutinho. Bioinformática aplicada ao estudo de micro-organismos marinhos. 2014. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Trabalhos de conclusão de curso de graduação
1.
GADELHA JR., L. M. R.. Participação em banca de Maria Luiza Botelho Mondelli.Construção de uma Interface Web para Elaboração, Execução e Análise de Workflows Científicos. 2014. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Tecnologia da Informação e Comunicação) - Faculdade de Educação Tecnológica do Estado do Rio de Janeiro.



Participação em bancas de comissões julgadoras
Concurso público
1.
CHAME, M.; EVSUKOFF, A.; GADELHA JR., L. M. R.. Pesquisador - Otimização e modelagem a partir de dados em ambientes computacionais de alto desempenho. 2014. Fundação Oswaldo Cruz.



Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
5th International Provenance and Annotation Workshop (IPAW 2014). 2014. (Oficina).

2.
Biodiversity Information Standards Conference (TDWG). 2014. (Congresso).

3.
Biodiversity Information Standards Conference (TDWG). 2013. (Congresso).

4.
8th International Conference on Ecological Informatics. 2012. (Congresso).

5.
3rd USENIX Workshop on the Theory and Practice of Provenance (TaPP 2011). 2011. (Oficina).

6.
ACM SIGMOD/PODS Conference. 2011. (Congresso).

7.
GlobusWorld 2010. 2010. (Simpósio).

8.
Third International Provenance and Annotation Workshop (IPAW 2010). 2010. (Oficina).

9.
Third Provenance Challenge. 2009. (Oficina).

10.
2nd Brazilian e-Science Workshop. 2008. (Oficina).

11.
4th IEEE International Conference on e-Science (e-Science 2008). 2008. (Congresso).

12.
7th IEEE International Symposium on Cluster Computing and the Grid. 2007. (Simpósio).

13.
ACM/IFIP/USENIX 8th International Middleware Conference. 2007. (Congresso).

14.
I Workshop DES-Brazil. 2007. (Oficina).

15.
Workshop de P&D do Projeto GIGA/RNP. 2007. (Oficina).

16.
IV Workshop de Computação em Grid e Aplicações. 2006. (Simpósio).

17.
XXIV Simpósio Brasileiro de Redes de Computadores. 2006. (Simpósio).

18.
III Workshop de Computação em Grid e Aplicações. 2005. (Simpósio).

19.
II Workshop on Cryptographic Algorithms and Protocols. 2005. (Simpósio).

20.
V Simpósio Brasileiro de Segurança da Informação e de Sistemas Computacionais. 2005. (Simpósio).

21.
I Workshop on Cryptographic Algorithms and Protocols. 2003. (Simpósio).

22.
9th Workshop on Logic, Language, Information and Computation. 2002. (Simpósio).

23.
XXI Conferencia Internacional de la Sociedad Chilena de Ciencia de la Computación. 2001. (Congresso).

24.
XX Congresso Nacional de Matemática Aplicada e Computacional. 1997. (Congresso).

25.
XIX Congresso Nacional de Matemática Aplicada e Computacional. 1996. (Congresso).

26.
25.o Colóquio Brasileiro de Matemática. 1995. (Congresso).


Organização de eventos, congressos, exposições e feiras
1.
GADELHA JR., L. M. R.. Jornada de Informática na Biodiversidade. 2015. (Outro).

2.
GADELHA JR., L. M. R.; CRUZ, S. M. S. . 9.o BRESCI - Brazilian e-Science Workshop. 2015. (Outro).

3.
GADELHA JR., L. M. R.. GBIF Latin America Regional Nodes Meeting. 2014. (Outro).

4.
GADELHA JR., L. M. R.; KARAM FILHO, J. ; COSTA, M. I. S. ; VIEIRA, P. C. M. ; PORTUGAL, R. ; MONTEIRO, S. L. . Programa de Verão 2013 do LNCC. 2013. (Outro).



Orientações



Orientações e supervisões em andamento
Tese de doutorado
1.
Maria Luiza Botelho Mondelli. Bioinformática. Início: 2017. Tese (Doutorado em Modelagem Computacional) - Laboratório Nacional de Computação Científica, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Orientador).

Supervisão de pós-doutorado
1.
Mariano Pereira Silva. Início: 2017. Laboratório Nacional de Computação Científica.

Iniciação científica
1.
Matheus Tonelli. Aplicações de Técnicas de Aprendizagem de Máquina à Análise de Dados de Domínio e de Tempo de Execução de Workflows de Bioinformática. Início: 2016. Iniciação científica (Graduando em Engenharia de Computação) - Centro Federal de Educação Tecnológica Celso Suckow da Fonseca, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. (Orientador).

2.
Matheus Machado da Rosa Albuquerque. Gerenciamento e Análise de Dados da Biodiversidade Marinha Brasileira. Início: 2016. Iniciação científica (Graduando em Engenharia de Computação) - Centro Federal de Educação Tecnológica Celso Suckow da Fonseca, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. (Orientador).


Orientações e supervisões concluídas
Dissertação de mestrado
1.
Pedro Correia de Siracusa. Ciência de Redes Aplicada à Biodiversidade. 2018. Dissertação (Mestrado em Modelagem Computacional) - Laboratório Nacional de Computação Científica, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Coorientador: Luiz Manoel Rocha Gadelha Júnior.

2.
Maria Luiza Botelho Mondelli. RASflow: um Ambiente de Alto Desempenho para Análise de Doenças Associadas à RASopatias. 2017. Dissertação (Mestrado em Modelagem Computacional) - Laboratório Nacional de Computação Científica, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Luiz Manoel Rocha Gadelha Júnior.

Supervisão de pós-doutorado
1.
Adriana Galindo Dalto. 2015. Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Luiz Manoel Rocha Gadelha Júnior.

Trabalho de conclusão de curso de graduação
1.
Maria Luiza Botelho Mondelli. Construção de uma Interface Web para Elaboração, Execução e Análise de Workflows Científicos. 2014. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Tecnologia da Informação e Comunicação) - Faculdade de Educação Tecnológica do Estado do Rio de Janeiro. Orientador: Luiz Manoel Rocha Gadelha Júnior.

Iniciação científica
1.
Régio Pires da Silva. Desenvolvimento de Ferramenta para Suporte ao Ciclo de Vida de Certificados Digitais. 2009. Iniciação Científica. (Graduando em Tecnologia da Informação e Comunicação) - Faculdade de Educação Tecnológica do Estado do Rio de Janeiro. Orientador: Luiz Manoel Rocha Gadelha Júnior.

Orientações de outra natureza
1.
Maycon Leite Ribeiro. BaMBa: Brazilian Marine Biodiversity Database. 2015. Orientação de outra natureza. (Tecnologia da Informação e Comunicação) - Faculdade de Educação Tecnológica do Estado do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Luiz Manoel Rocha Gadelha Júnior.



Inovação



Programa de computador sem registro
1.
GADELHA JR., L. M. R.; WILDE, M. ; MATTOSO, M. ; Foster, Ian . MTCProv: a practical provenance query framework for many-task scientific computing (https://svn.ci.uchicago.edu/svn/vdl2/provenancedb). 2012.

2.
GUIMARAES, P. ; MOURA, F. ; TAVARES JR., J. ; PALAZZI, D. ; POLTOSI, M. ; GADELHA, L . SiBBr: Sistema de Informação sobre a Biodiversidade Brasileira (http://www.sibbr.gov.br). 2014.

3.
GADELHA JR., L. M. R.; MEIRELLES, PEDRO MILET ; RIBEIRO, M. L. ; ALBUQUERQUE, M. ; THOMPSON, F. L. . BaMBa: Brazilian Marine Biodiversity Database (https://marinebiodiversity.lncc.br). 2015.

4.
AUGUSTO, D. A. ; KREMPSER, E. ; WERDT, P. ; ABDALLA, L. ; BRASIL, F. C. L. ; SANTOS, T. ; GADELHA JR., L. M. R. ; BARBOSA, H. J. C. ; CHAME, M. . SISS-Geo: Sistema de Informação em Saúde Silvestre (http://sissgeo.lncc.br/). 2014.

5.
GALHEIGO, M. M. ; MEDEIROS, Vívian ; BASTOS, B. F. ; OCANA, K. ; GOMES, A. T. A. ; GADELHA JR., L. M. R. ; VASCONCELOS, A. T. R. ; OLIVEIRA, P. S. L. ; TEIXEIRA, S. M. R. ; LUIZ, G. F. R. ; PEREIRA, J. G. C. ; NAGAMATSU, S. T. . Bioinfo-Portal: A Bioinformatics Suite for Program Execution at LABINFO and SINAPAD-LNCC (http://www.bioinfo.lncc.br/). 2016.

6.
MONDELLI, M. L. B. ; GADELHA JR., L. M. R. ; WILDE, M. ; OCANA, K. ; TORRENO, O. ; MATTOSO, M. ; VASCONCELOS, A. T. R. ; TRELLES, O. . SwiftGECKO: a provenance-enabled parallel comparative genomics workflow (https://github.com/mmondelli/swift-gecko). 2015.

7.
MONDELLI, M. L. B. ; TONELLI, M. ; GADELHA JR., L. M. R. ; OCANA, K. . HPSW-Prof: A Provenance-Based Framework for Profiling High Performance Scientific Workflows (https://github.com/mmondelli/swift-prof e https://subversion.assembla.com/svn/provweb). 2016.

8.
COSTA, R. L. ; PORTO, F. ; GADELHA JR., L. M. R. ; RIBEIRO-ALVES, M. ; CAVALCANTI, M. C. R. ; ROBERTSON, D. ; MARC-SCHWARTZ, J. ; SOARES, M. A. . Host Immune Transcriptome Interaction Data for SIV and HIV (http://hihisiv.dexl.lncc.br/). 2016.

9.
SANCHEZ-TAPIA, A. ; LIMA, R. O. ; GALL, G. ; SIQUEIRA, M. ; SILVA, L. A. E. ; GADELHA JR., L. M. R. . Model-R: arcabouço escalável para modelagem de nichos ecológicos. 2016.




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