Maíra Ribeiro Rodrigues

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  • Última atualização do currículo em 25/07/2018


Possui doutorado em Ciências da Computação pela Universidade de Southampton, UK (2007), mestrado em Ciências da Computação pela Universidade Federal do Rio Grande do Sul (2003) e graduação em Ciência da Computação pela Universidade Católica de Pelotas (2000). Fez pós-doutorado na KU Leuven, Departement Elektrotechniek - ESAT, no grupo de Bioinformática da divisão de pesquisa STADIUS e do iMinds Medical IT Department, e no Laboratório de Diversidade Genética Humana do ICB - UFMG. Tem um perfil bastante interdisciplinar, com experiência nas áreas de Ciência da Computação, com ênfase em Inteligência Artificial e Bioinformática, e de Genética Humana, com ênfase em genética de populações e variabilidade genética. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Maíra Ribeiro Rodrigues
Nome em citações bibliográficas
RODRIGUES, M. R.;Rodrigues, Maira R;Rodrigues, Maíra;Rodrigues, Maíra R.;EPIGEN-Brazil Group;RODRIGUES, MAÍRA RIBEIRO;RODRIGUES, MAIRA R.

Endereço


Endereço Profissional
Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas da UNICAMP, Departamento de Genética Médica da FCM/UNICAMP.
Rua Albert Sabin
Cidade Universitária
13083894 - Campinas, SP - Brasil
Telefone: (19) 989558080


Formação acadêmica/titulação


2003 - 2007
Doutorado em PhD in Computer Science.
University of Southampton, SOUTHAMPTON, Inglaterra.
Título: Social techniques for effective interactions in open cooperative systems, Ano de obtenção: 2007.
Orientador: Michael M. Luck.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
Palavras-chave: Sistemas multiagente; Trocas sociais; Valores de troca; Sistemas distribuídos cooperativos; Avaliação de serviços computacionais; Bioinformática.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Inteligência Artificial / Especialidade: Sistemas Multiagente.
2001 - 2003
Mestrado em Computação.
Universidade Federal do Rio Grande do Sul, UFRGS, Brasil.
Título: Um Sistema de Valores de Troca para Suporte às Interações em Sociedades Artificiais,Ano de Obtenção: 2003.
Orientador: Antonio Carlos da Rocha Costa.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
Palavras-chave: Simulação social; Sistemas multiagente.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Setores de atividade: Informática.
1997 - 2000
Graduação em Ciência da Computação.
Universidade Católica de Pelotas, UCPEL, Brasil.
Título: Um ambiente para projeto e implementação de agentes improvisacionais de interface para sistemas na web.
Orientador: Antonio Carlos da Rocha Costa.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.


Pós-doutorado


2017
Pós-Doutorado.
Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
2016 - 2017
Pós-Doutorado.
Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
2016 - 2016
Pós-Doutorado.
Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, PUCRS, Brasil.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Botânica / Subárea: Bioinformática.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Botânica / Subárea: Genética Animal.
2014 - 2015
Pós-Doutorado.
Katholieke Universiteit Leuven, KU Leuven, Bélgica.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação.
2010 - 2014
Pós-Doutorado.
Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Bioinformática / Especialidade: Epidemiologia Genética.
2008 - 2010
Pós-Doutorado.
Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Bioinformática / Especialidade: Bancos de Dados Biológicos.


Atuação Profissional



Pontificia Universidad Católica de Valparaiso, PUCV, Chile.
Vínculo institucional

2010 - 2010
Vínculo: Professor Visitante, Enquadramento Funcional: Professor Visitante, Carga horária: 40


Universidade Federal do Rio Grande do Sul, UFRGS, Brasil.
Vínculo institucional

2003 - 2003
Vínculo: Bolsista DTI, Enquadramento Funcional: Aluno com Mestrado, Carga horária: 40

Atividades

03/2003 - 09/2003
Pesquisa e desenvolvimento , Instituto de Informática, .


Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.
Vínculo institucional

2008 - 2010
Vínculo: Bolsista recém-doutor, Enquadramento Funcional: Bolsista PRODOC, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações
Bolsista PRODOC do Programa de Doutorado em Bioinformática da Universidade Federal de Minas Gerais. Projeto financiado pela CAPES.

Atividades

3/2009 - Atual
Ensino, Bioinformática, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Tópicos em Bioinformática II - Bancos de Dados Biológicos A e B
9/2008 - Atual
Pesquisa e desenvolvimento , Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Bioquímica e Imunologia.


Totton College, TOTTON, Inglaterra.
Vínculo institucional

2005 - 2005
Vínculo: Professor, Enquadramento Funcional: Professor Substituto, Carga horária: 4

Atividades

01/2005 - 05/2005
Ensino, Information Technology in Organisations, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Contemporary Programming Methods

Universidade Católica de Pelotas, UCPEL, Brasil.
Vínculo institucional

1997 - 2000
Vínculo: Bolsista de IC, Enquadramento Funcional: Aluno, Carga horária: 20, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações
Bolsista BIC/UCpel no período de 03/1998 até 10/1999. Bolsista ITI/CNPq no período de 11/1999 até 11/2000.

Atividades

3/1998 - 12/2000
Pesquisa e desenvolvimento , Centro de Ciências Exatas Tecnologia e Informática, Escola de Informática.

8/1998 - 12/1998
Estágios , Centro de Ciências Exatas Tecnologia e Informática, Escola de Informática.

Estágio realizado
Monitoria da disciplina de ARQUITETURA E ORGANIZAÇÃO DE COMPUTADORES I.
3/1998 - 7/1998
Estágios , Centro de Ciências Exatas Tecnologia e Informática, Escola de Informática.

Estágio realizado
Monitoria da disciplina ALGORITMOS E PROGRAMAÇÃO.
8/1997 - 12/1997
Estágios , Centro de Ciências Exatas Tecnologia e Informática, Escola de Informática.

Estágio realizado
Monitoria da disciplina INTRODUÇÃO AO LABORATÓRIO DE INFORMÁTICA.


Linhas de pesquisa


1.
Agentes Improvisacionais de Interface
2.
Integração de Serviços Computacionais
3.
Sistemas multiagente
4.
Bioinformatica
5.
Bioinformática
6.
Bancos de Dados Biológicos


Projetos de pesquisa


2012 - Atual
Dinâmica da miscigenação em Brasil e América Latina: novos dados, metodologias e ferramentas bioinformáticas
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2010 - Atual
Diversidade genômica humana e saúde pública em populações da américa latina
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2009 - Atual
Epidemiologia genômica de doenças complexas em coortes brasileiras de base populacional EPIGEN/BRASIL
Descrição: O objetivo deste projeto é determinar a estrutura genética e ancestralidade genômica de três coortes brasileiras de base populacional (Pelotas/RS, Salvador/BA e Bambui/MG), e investigar a associação entre variantes genéticas comuns do genoma e doenças complexas e outras variáveis de interesse biomédico. O projeto envolve a varredura genômica dos indivíduos participantes (~1 milhão de SNPs). Objetivos adicionais são estudar do ponto de vista metodológico a influência da miscigenação no desenho de estudos epidemiológicos, o desenvolvimento de ferramentas bioinformáticas para facilitar os estudos de genética de populações humanas e epidemiologia genômica e a formação de recursos humanos altamente qualificados nestas áreas do conhecimento. A Dra. Maira Ribeiro Rodrigues foi responsável pelo grupo de Informática do projeto EPIGEN-Brasil..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2008 - 2010
Integração de bancos de dados biológicos para estudos avançados de biomoléculas
Descrição: Os trabalhos serão iniciados com a descrição do projeto principal de Bancos de Dados Biológicos (BDBs) a ser utilizado e a modelagem dos dados a serem inseridos nos BDBs. O desenvolvimento começará pela instalação do servidor a ser utilizado para hospedar os BDBs. Esta etapa envolve a escolha e instalação do sistema operacional do servidor, a instalação dos sistemas de gerenciamento de BDBs (DBMS), a instalação dos clientes de BDBs para permitir o acesso dos usuários, a instalação do servidor web e criação da interface de acesso. Com relação à modelagem dos dados será feita ainda a criação dos modelos de dados individuais para cada subconjunto dos dados a serem inseridos e a descrição das dependências funcionais de acordo com os modelos estabelecidos. Nesta etapa, os primeiros dados a serem modelados são aqueles que se referem à análise proteômica. Para isso serão armazenados os dados de eletroforese bi-dimensional e espectrometria de massa. Segue-se a esta etapa a modelagem semântica, que tem por objetivo definir de forma não-ambígua os termos para cada entidade bioquímica representada no BDB, para permitir a integração de dados de origem diversa. Após a modelagem, será iniciada então a instalação dos BDBs propriamente ditos utilizando o DBMS e a inserção dos conjuntos de dados..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
2006 - Atual
DIVERGENOMA
Descrição: Desenvolvimento de uma ferramenta bioinformática para estudos de genética de populações e epidemiologia genética..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) .
Integrantes: Maíra Ribeiro Rodrigues - Integrante / Wagner Magalhães - Integrante / Alessanfra Faria-Campos - Integrante / Eduardo Tarazona-Santos - Coordenador.Financiador(es): Universidade Federal de Minas Gerais - Remuneração / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
2001 - 2003
Modelos de Interação Social para Sociedades Artificiais
Descrição: Este projeto visa investigar modelos de interação social entre agentes para aplicações em sistemas de simulação social. Para simular fenômenos sociais em sociedades humanas é necessário que o comportanto social de interação entre pessoas seja caracterizado através de modelos computacionais, ou seja, tal modelo deve capturar qual a motivação para iniciar, manter ou terminar interações sociais. Este projeto tem caráter teórico, e o objetivo final é a descrição de um modelo computacional de interações entre agentes no contexto de trocas sociais..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.


Membro de corpo editorial


2013 - 2013
Periódico: Revista de Sistemas de Informação da FSMA


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação.
2.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Inteligência Artificial.
3.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Inteligência Artificial/Especialidade: Sistemas Multiagente.
4.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Inteligência Artificial/Especialidade: Sistemas Distribuídos Cooperativos.
5.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Teoria da Computação/Especialidade: Computabilidade e Modelos de Computação.


Idiomas


Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.


Prêmios e títulos


2000
Prêmio Jovem Pesquisador - segundo lugar, UFPel, UCPel e FURG.
2000
Diploma Dom Antônio Zattera - classificação em primeiro lugar na turma de formandos em Ciência da Computação 2000/02, UCPel.


Produções



Produção bibliográfica
Artigos completos publicados em periódicos

1.
MAGALHÃES, WAGNER C.S.2018MAGALHÃES, WAGNER C.S. ; ARAUJO, NATHALIA M. ; LEAL, THIAGO P. ; ARAUJO, GILDERLANIO S. ; VIRIATO, PAULA J.S. ; KEHDY, FERNANDA S. ; COSTA, GUSTAVO N. ; BARRETO, MAURICIO L. ; HORTA, BERNARDO L. ; LIMA-COSTA, MARIA FERNANDA ; PEREIRA, ALEXANDRE C. ; Tarazona-Santos, Eduardo ; Rodrigues, Maíra R. . EPIGEN-Brazil Initiative resources: a Latin American imputation panel and the Scientific Workflow. GENOME RESEARCH, v. 00, p. xxxx, 2018.

2.
ZUCCHERATO, L. W.2017ZUCCHERATO, L. W. ; SCHNEIDER, S. ; TARAZONA-SANTOS E ; HARDWICK, R. J. ; BERG, D. E. ; BOGLE, H. ; GOUVEIA, M. ; MACHADO, L. R. ; MACHADO, M. ; RODRIGUES-SOARES, FERNANDA ; SOARES-SOUZA, GIORDANO B. ; TOGNI, D. L. ; ZAMUDIO, R ; GILMAN, ROBERT H. ; DUARTE, D. ; HOLLOX, E. J. ; RODRIGUES, M. R. . Population genetics of immune-related multilocus CNV in Native Americans. Journal of the Royal Society Interface, v. 14, p. 1-8, 2017.

3.
FIGUEIRÓ, HENRIQUE V.2017FIGUEIRÓ, HENRIQUE V. LI, GANG TRINDADE, FERNANDA J. ASSIS, JULIANA PAIS, FABIANO FERNANDES, GABRIEL SANTOS, SARAH H. D. HUGHES, GRAHAM M. KOMISSAROV, ALEKSEY ANTUNES, AGOSTINHO TRINCA, CRISTINE S. Rodrigues, Maíra R. LINDEROTH, TYLER BI, KE SILVEIRA, LEANDRO AZEVEDO, FERNANDO C. C. KANTEK, DANIEL RAMALHO, EMILIANO BRASSALOTI, RICARDO A. VILLELA, PRISCILLA M. S. NUNES, ADAUTO L. V. TEIXEIRA, RODRIGO H. F. MORATO, RONALDO G. LOSKA, DAMIAN SARAGÜETA, PATRICIA , et al.GABALDÓN, TONI TEELING, EMMA C. O?BRIEN, STEPHEN J. NIELSEN, RASMUS COUTINHO, LUIZ L. Oliveira, Guilherme MURPHY, WILLIAM J. EIZIRIK, EDUARDO ; Genome-wide signatures of complex introgression and adaptive evolution in the big cats. SCIENCE ADVANCES, v. 3, p. e1700299, 2017.

4.
LIMA-COSTA, M. FERNANDA2015LIMA-COSTA, M. FERNANDA RODRIGUES, LAURA C. BARRETO, MAURÍCIO L. GOUVEIA, MATEUS HORTA, BERNARDO L. MAMBRINI, JULIANA KEHDY, FERNANDA S. G. PEREIRA, ALEXANDRE RODRIGUES-SOARES, FERNANDA VICTORA, CESAR G. Tarazona-Santos, Eduardo CESAR, CIBELE C. CONCEIÇÃO, JACKSON S. COSTA, GUSTAVO N.O. ESTEBAN, NUBIA FIACCONE, ROSEMEIRE L. FIGUEIREDO, CAMILA A. FIRMO, JOSÉLIA O.A. HORIMOTO, ANDREA R.V.R. LEAL, THIAGO P. Machado, Moara MAGALHÃES, WAGNER C.S. DE OLIVEIRA, ISABEL OLIVEIRA PEIXOTO, SÉRGIO V. Rodrigues, Maíra R. , et al.SANTOS, HADASSA C. SILVA, THIAGO M. ; Genomic ancestry and ethnoracial self-classification based on 5,871 community-dwelling Brazilians (The Epigen Initiative). Scientific Reports, v. 5, p. 9812, 2015.

5.
KEHDY, FERNANDA S. G.2015 KEHDY, FERNANDA S. G. GOUVEIA, MATEUS H. Machado, Moara Magalhães, Wagner C. S. HORIMOTO, ANDREA R. HORTA, BERNARDO L. MOREIRA, RENNAN G. LEAL, THIAGO P. SCLIAR, MARILIA O. SOARES-SOUZA, GIORDANO B. RODRIGUES-SOARES, FERNANDA ARAÚJO, GILDERLANIO S. ZAMUDIO, ROXANA SANT ANNA, HANAISA P. SANTOS, HADASSA C. DUARTE, NUBIA E. FIACCONE, ROSEMEIRE L. FIGUEIREDO, CAMILA A. SILVA, THIAGO M. COSTA, GUSTAVO N. O. BELEZA, SANDRA BERG, DOUGLAS E. CABRERA, LILIA DEBORTOLI, GUILHERME Duarte, Denise , et al.GHIROTTO, SILVIA GILMAN, ROBERT H. GONÇALVES, VANESSA F. MARRERO, ANDREA R. MUNIZ, YARA C. WEISSENSTEINER, HANSI YEAGER, MEREDITH RODRIGUES, LAURA C. BARRETO, MAURICIO L. LIMA-COSTA, M. FERNANDA PEREIRA, ALEXANDRE C. Rodrigues, Maíra R. Tarazona-Santos, Eduardo ; Origin and dynamics of admixture in Brazilians and its effect on the pattern of deleterious mutations. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America (Online), v. 112, p. 8696-8701, 2015.

6.
SANTOS, HADASSA C.2015SANTOS, HADASSA C. ; HORIMOTO, ANDREA R.V.R. ; Tarazona-Santos, Eduardo ; RODRIGUES-SOARES, FERNANDA ; BARRETO, MAURÍCIO L. ; HORTA, BERNARDO L. ; LIMA-COSTA, M. FERNANDA ; GOUVEIA, MATEUS ; MACHADO, M. ; SILVA, THIAGO M. ; SANCHES, J. ; ESTEBAN, NUBIA ; RODRIGUES, M. R. ; KEHDY, FERNANDA S. G. ; PEREIRA, ALEXANDRE . A minimum set of ancestry informative markers for determining admixture proportions in a mixed American population: the Brazilian set. European Journal of Human Genetics, p. 1, 2015.

7.
ZAMUDIO, ROXANA2015ZAMUDIO, ROXANA ; PEREIRA, L. ; ROCHA, C. D. ; BERG, DOUGLAS E. ; MUNIZ-QUEIROZ, T. ; SANTANNA, H. P. ; CABRERA, LILIA ; COMBE, J. ; HERRERA, P ; JAHUIRA, M. ; LEAO, F. B. ; LYON, F. ; PRADO, W. A. ; Rodrigues, Maira R ; RODRIGUES-SOARES, FERNANDA ; SANTOLALLA, M. L. ; ZOLINI, C. ; SILVA, A. M. ; GILMAN, ROBERT H. ; TARAZONA-SANTOS E ; KEHDY, FERNANDA S. G. . Population, Epidemiological, and Functional Genetics of Gastric Cancer Candidate Genes in Peruvians with Predominant Amerindian Ancestry. Digestive Diseases and Sciences, p. 1-10, 2015.

8.
COSTA, GUSTAVO N. O.2015COSTA, GUSTAVO N. O. ; DUDBRIDGE, FRANK ; FIACCONE, ROSEMEIRE L. ; DA SILVA, THIAGO M. ; CONCEIÇÃO, JACKSON S. ; STRINA, AGOSTINO ; FIGUEIREDO, CAMILA A. ; Magalhães, Wagner C. S. ; RODRIGUES, MAIRA R. ; GOUVEIA, MATEUS H. ; KEHDY, FERNANDA S. G. ; HORIMOTO, ANDREA R. V. R. ; HORTA, BERNARDO ; BURCHARD, ESTEBAN G. ; PINO-YANES, MARIA ; DEL RIO NAVARRO, BLANCA ; ROMIEU, ISABELLE ; HANCOCK, DANA B. ; LONDON, STEPHANIE ; LIMA-COSTA, MARIA FERNANDA ; PEREIRA, ALEXANDRE C. ; TARAZONA, EDUARDO ; RODRIGUES, LAURA C ; BARRETO, MAURICIO L. . A genome-wide association study of asthma symptoms in Latin American children. BMC Genetics (Online), v. 16, p. 1-11, 2015.

9.
ARAÚJO, GILDERLANIO S.2015 ARAÚJO, GILDERLANIO S. ; LIMA, LUCAS HENRIQUE C. ; SCHNEIDER, SILVANA ; LEAL, THIAGO P. ; DA SILVA, ANA PAULA C. ; VAZ DE MELO, PEDRO O. S. ; Tarazona-Santos, Eduardo ; SCLIAR, MARÍLIA O. ; Rodrigues, Maíra R. . Integrating, summarizing and visualizing GWAS-hits and human diversity with DANCE (Disease-ANCEstry Networks). Bioinformatics (Oxford. Print), v. 1, p. btv708-btv708, 2015.

10.
RODRIGUES, M. R.2014 RODRIGUES, M. R.; LUCK, M. . Effective Cooperations Through Non-Monetary Exchanges: A Computational Framework. International Journal of Cooperative Information Systems (Singapore), v. 1, p. 1450002, 2014.

11.
Scliar MO2014Scliar MO ; GOUVEIA, M. ; Benazzo A ; GHIROTTO, S. ; Fagundes NJ ; Leal TP ; MAGALHÃES WCS ; Pereira L ; RODRIGUES, M. R. ; Soares-Souza GB ; Cabrera L ; Berg D ; Gilman RH ; Bertorelle G ; TARAZONA-SANTOS E . Bayesian inferences suggest that Amazon Yunga Natives diverged from Andeans less than 5000 ybp: implications for South American prehistory. BMC Evolutionary Biology (Online), v. 14, p. 1-16, 2014.

12.
Magalhães, Wagner C. S.2012Magalhães, Wagner C. S. ; Rodrigues, Maíra R. ; (primeira autoria compartilhada) ; Iannini, Márcia L. ; Cerqueira, Gustavo C. ; Faria-Campos, Alessandra C. ; Soares-Souza, Giordano ; Silva, Donnys ; Tarazona-Santos, Eduardo . DIVERGENOME: A Bioinformatics Platform to Assist Population Genetics and Genetic Epidemiology Studies. Genetic Epidemiology (Print), v. 36, p. 360-367, 2012.

13.
LOBO, F. P.2012LOBO, F. P. ; RODRIGUES, M. R. ; RODRIGUES, G. O. L. ; HILARIO, H. O. ; Souza, R. A. ; TAUCH, A. ; MIYOSHI, A. ; Franco, G. C. ; AZEVEDO, V. ; FRANCO, G. R. . KOMODO: a web tool for detecting and visualizing biased distribution of groups of homologous genes in monophyletic taxa. Nucleic Acids Research, v. 40, p. W491-W497, 2012.

14.
PEREIRA, L.2012PEREIRA, L. ; ZAMUDIO, R ; Soares-Souza GB ; HERRERA, P ; CABRERA, L. ; HOOPER, C. C. ; COK, J. ; COMBE, J. ; VARGAS, G. ; PRADO, W. A. ; SCHNEIDER, S. ; KEHDY, F. ; RODRIGUES, M. R. ; CHANOCK, S. J. ; BERG, D. ; GILMAN, R. H. ; TARAZONA-SANTOS, E. . Socioeconomic and nutritional factors account for the association of gastric cancer with Amerindian ancestry in a Latin American admixed population. Plos One, v. 7, p. e41200, 2012.

15.
Rodrigues, Maira R2012 Rodrigues, Maira R; Magalhaes, Wagner CS ; Machado, Moara ; Tarazona-Santos, Eduardo . A graph-based approach for designing extensible pipelines. BMC Bioinformatics, v. 13, p. 163, 2012.

16.
Machado, Moara2011Machado, Moara ; Magalhaes, Wagner CS ; Sene, Allan ; Araujo, Bruno ; Faria-Campos, Alessandra C ; Chanock, Stephen J ; Scott, Leandro ; Oliveira, Guilherme ; Tarazona-Santos, Eduardo ; RODRIGUES, M. R. . Phred-Phrap package to analyses tools: a pipeline to facilitate population genetics re-sequencing studies. Investigative Genetics, v. 2, p. 3, 2011.

17.
Tagliani-Ribeiro, A2011Tagliani-Ribeiro, A ; Oliveira, M ; RODRIGUES, M. R. ; Zagonel-Oliveira, M ; Steinman, G ; Matte, U ; Fagundes, NJR ; Schuler-Faccini, L . Twin Town in South Brazil: A Nazi's Experiment or a Genetic Founder Effect?. Plos One, v. 6, p. e20328, 2011.

18.
Faria-Campos, Alessandra2011Faria-Campos, Alessandra ; Fernandes-Rausch, Herbert ; Val, Celina ; Thorun, Peter ; Abreu, Vinicius ; Batista, Paulo ; Mendonça, Paulo ; Alves, Vinicius ; Rodrigues, Maíra ; Pimenta, Adriano ; Franco, Glória ; Campos, Sérgio . PRODIS: a proteomics data management system with support to experiment tracking. BMC Genomics, v. 12, p. S15, 2011.

19.
SEYFFERT, N.2011SEYFFERT, N. ; PACHECO, L. G. C. ; SILVA, W. M. ; CASTRO, T. L. P. ; SANTOS, A. V. ; SANTOS, ANDERSON R. ; MCCULLOCH, J. A. ; RODRIGUES, M. R. ; Santos, S. G. ; Farias, L. M. ; Carvalho, M. A.R. ; Pimenta, A. M. C. ; Silva, A. ; MEYER, R. ; MIYOSHI, A. ; AZEVEDO, Vasco . Serological secretome analysis of Corynebacterium pseudotuberculosis. Journal of Integrated OMICS, v. 1, p. 193-197, 2011.

Capítulos de livros publicados
1.
FERRUGEM, A. P. ; LUCAS, D. C. ; RODRIGUES, M. R. . Autômatos Celulares. In: Dante Barone. (Org.). Sociedades Artificiais: A Nova Fronteira da Inteligência nas Máquinas. 1ed.Porto Alegre: Bookman, 2002, v. , p. 41-60.

Trabalhos completos publicados em anais de congressos
1.
RODRIGUES, M. R.; LUCK, M. . Cooperative interactions: An exchange values model. In: European Conference on Artificial Intelligence, 2007, Riva del Garda. Coordination, Organizations, Institutions, and Norms in Agent Systems II, Lecture Notes in Artificial Intelligence. Berlin: Springer-Verlag, 2007. v. 4386. p. 356-371.

2.
RODRIGUES, M. R.; LUCK, M. . Evaluating Dynamic Services in Bioinformatics. In: Tenth International Workshop on Cooperative Information Agents, 2006, Edinburgo. Cooperative Information Agents X, Lecture Notes in Artificial Intelligence. Berlin: Springer-Verlag, 2006. v. 4149. p. 183-197.

3.
RODRIGUES, M. R.; LUCK, M. . Analysing Partner Selection through Exchange Values. In: Multiagent-based Simulation Workshop at the AAMAS Conference, 2006, Utrecht. Multi-Agent-Based Simulation VI, Lecture Notes in Artificial Intelligence. Berlin: Springer-Verlag, 2006. v. 3891. p. 24-40.

4.
RODRIGUES, MAÍRA RIBEIRO; DA ROCHA COSTA, A. C. ; BORDINI, RAFAEL H. . A system of exchange values to support social interactions in artificial societies. In: the second international joint conference, 2003, Melbourne. Proceedings of the second international joint conference on Autonomous agents and multiagent systems - AAMAS '03. New York: ACM Press. p. 81.

5.
RODRIGUES, M. R.; COSTA, A. C. R. . Using Qualitative Exchange Values to Improve the Modelling of Social Interactions. In: The 4th Workshop on Multi-Agent Based Simulation, 2003, Melbourne. Multi-Agent Based Simulation IV, Lecture Notes in Artificial Intelligence. Berlin: Springer-Verlag, 2003. v. 2927. p. 57-72.

6.
RODRIGUES, M. R.; COSTA, A. C. R. ; DIMURO, G. P. . Um Ambiente para Projeto e Implementação de Agentes Improvisacionais de Interface para sistemas na Web. In: XV Congresso Regional de Iniciação Científica e Tecnológica em Engenharia, 2000, Rio Grande. CRICTE 2000. Rio Grande: FURG, 2000.

7.
COSTA, A. C. R. ; MORAES, M. C. ; RODRIGUES, M. R. . Improvisational interface agents for e-commerce systems.. In: Symposium on Multi-Agent and Mobile Agents in Virtual Organizations and E-Commerce at the International ICSC Congress on Intelligent Systems & Applications, 2000, Wollongong. Symposium on Multi-Agent and Mobile Agents in Virtual Organizations and E-Commerce at the International ICSC Congress on Intelligent Systems & Applications. Wetaskiwin: ICSC Academic Press, 2000. p. 446-451.

8.
RODRIGUES, M. R.; SOUZA, E. ; COSTA, A. C. R. ; DIMURO, G. P. . Vendedores Virtuais. In: XIV Congresso Regional de Iniciação Científica e Tecnológica, 1999, Santa Maria. XIV CRICTE 1999, 1999. p. 149-152.

9.
RODRIGUES, M. R.; COSTA, A. C. R. ; DIMURO, G. P. . Agentes Improvisacionais. In: III Oficina de Inteligência Artificial, 1999, Pelotas. III Oficina de Inteligência Artificial. Pelotas: Educat, 1999. p. 137-145.

Resumos expandidos publicados em anais de congressos
1.
RODRIGUES, M. R.; LUCK, M. . Effective Multiagent Interactions for Open Cooperative Systems Rich in Services. In: International Conference on Autonomous Agents and Multiagent Systems, 2009, Budapeste. Proceedings of the 8th International Conference on Autonomous Agents and Multiagent Systems, 2009.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
MACHADO, M. ; MAGALHÃES, W. C. S. ; ARAUJO, B. ; FARIA-CAMPOS, A. ; TARAZONA-SANTOS, E. ; RODRIGUES, M. R. . From Phred-Phrap-Consed-PolyPhred to DnaSP: A Pipeline to Facilitate Population Genetics Re-Sequencing Studies. In: X-Meeting The Fifth International Conference of The Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2009, Angra dos Reis. X-Meeting Abstracts Book, 2009. p. 168.

2.
LOBO, F. P. ; RODRIGUES, M. R. ; HILARIO, H. O. ; RODRIGUES, G. O. L. ; AZEVEDO, V. ; MIYOSHI, A. ; FRANCO, G. R. . Evaluating Adaptive Patterns in Metabolic Pathways: Using Kegg Orthology to Reveal Metabolic Strategies in Monophyletic Groups of Prokaryote Genomes. In: X-Meeting The Fifth International Conference of The Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2009, Angra dos Reis. X-Meeting Abstracts Book, 2009. p. 33.

3.
MENDONCA, P. H. S. ; RODRIGUES, M. R. ; FARIA-CAMPOS, A. ; CAMPOS, S. V. A. . Mass Spectrometry Data Storage and Processing With PRODIS System. In: X-Meeting The Fifth International Conference of The Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2009, Angra dos Reis. X-Meeting Abstracts Book, 2009. p. 110.

4.
RODRIGUES, M. R.; COSTA, A. C. R. ; DIMURO, G. P. . Um Ambiente para Projeto e Implementação de Agentes Improvisacionais de Interface para Sistemas na Web. In: XII SALÃO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 2000, Porto Alegre, 2000.

5.
RODRIGUES, M. R.; COSTA, A. C. R. ; DIMURO, G. P. . Um Ambiente para Projeto e Implementação de Agentes Improvisacionais de Interface para Sistemas na Web. In: IX Congresso de Iniciação Cientifica da UFPel, UCPel e FURG, 2000, Pelotas. IX Congresso de Iniciação Cientifica da UFPel, UCPel e FURG. Pelotas: UFPel, 2000. p. 128-128.

6.
RODRIGUES, M. R.; COSTA, A. C. R. . Utilizando Uma Metodologia de Projeto de Agentes Improvisacionais para Criar Agentes de Interface para Sistemas na Web. In: VIII Laboratório de Pesquisa da UCPel, 2000, Pelotas. VIII Laboratório de Pesquisa da UCPel. Pelotas: UCPel, 2000. p. 193-193.

7.
RODRIGUES, M. R.; COSTA, A. C. R. . Agentes Improvisacionais como Agentes de Interface para Web. In: Congresso de Iniciação Científica FURG, UCPel e UFPel, 1999, Rio Grande. Congresso de Iniciação Científica FURG, UCPel e UFPel. Rio Grande: Editora da FURG, 1999. p. 35-35.

8.
RODRIGUES, M. R.; COSTA, A. C. R. . Agentes Tutores para Páginas de Ensino a Distância. In: VII Laboratório de Pesquisa da UCPel, 1999, Pelotas. VII Laboratório de Pesquisa da UCPel, 1999. p. 118-118.

9.
RODRIGUES, M. R.; SOUZA, E. ; COSTA, A. C. R. ; DIMURO, G. P. . Agentes Improvisacionais Representanto Vendedores Virtuais. In: XI Salão de Iniciação Científica, 1999, Porto Alegre. XI Salão e VIII Feira de Iniciação Científica, 1999.

10.
RODRIGUES, M. R.; COSTA, A. C. R. ; DIMURO, G. P. . Um Estudo sobre o Modelo de Objetos do MSAgent. In: VII Congresso de Iniciação Científica UFPel, UCPel e FURG, 1998, Pelotas. VII Congresso de Iniciação Científica UFPel, UCPel e FURG. Pelotas: Editora e Gráfica Universitária UFPel, 1998. p. 118-118.

11.
DEUS, A. M. R. ; RODRIGUES, M. R. ; COSTA, A. C. R. ; DIMURO, G. P. . Um Ambiente para a Edição de Peças para Teatro Virtual. In: VII Congresso de Iniciação Científica UFPel, UCPel e FURG, 1998, Pelotas. VII Congresso de Iniciação Científica UFPel, UCPel e FURG. Pelotas: Editora e Gráfica Universitária UFPel, 1998. p. 103-103.

12.
DEUS, A. M. R. ; RODRIGUES, M. R. ; MACHADO, R. P. ; CARDOSO, R. C. ; ELIAS, R. ; VIEGAS, P. ; COSTA, A. C. R. ; DIMURO, G. P. . Um Ambiente para Editoração de Peças para Teatro Virtual. In: X Salão de Iniciação Científica, 1998, Porto Alegre. XI Salão VIII Feira Iniciação Científica, 1998.

13.
RODRIGUES, M. R.; VIZZOTO, J. K. ; DIMURO, G. P. ; SCHNEIDER, G. . Um Estudo Sobre a Definição Recursiva da Aritmética nos Números Naturais. In: V Encontro Regional de Matemática Aplicada e Computacional, 1998, Santa Maria. 5 ERMAC. Santa Maria: UFSM, 1998. p. 22-23.

Apresentações de Trabalho
1.
RODRIGUES, M. R.. Sistemas distribuídos ricos em dados e serviços: vantagens e desafios para bioinformática cooperativa. 2008. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

2.
RODRIGUES, M. R.; LUCK, M. . Evaluating Dynamic Services in Bioinformatics. 2006. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

3.
RODRIGUES, M. R.; LUCK, M. . Cooperative interactions: An exchange values model. 2006. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

4.
RODRIGUES, M. R.; LUCK, M. . Analysing Partner Selection through Exchange Values. 2005. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

Outras produções bibliográficas
1.
RODRIGUES, M. R.. Social techniques for effective interactions in open cooperative systems 2007 (Tese de Doutorado).

2.
RODRIGUES, M. R.; COSTA, A. C. R. . Um Sistema de Valores de Troca para Suporte às Interações em Sociedades Artificiais. Porto Alegre: UFRGS, 2003 (Dissertação de Mestrado).

3.
RODRIGUES, M. R.; COSTA, A. C. R. ; DIMURO, G. P. . Um Ambiente para Projeto e Implementação de Agentes de Interface para Sistemas na Web. Pelotas: Universidade Católica de Pelotas, 2000 (Projeto de Graduação).


Produção técnica
Trabalhos técnicos
1.
RODRIGUES, M. R.. Comitê de Programa do WESAAC - Workshop-Escola de Sistemas de Agentes, seus Ambientes e Aplicações. 2014.

2.
RODRIGUES, M. R.. Comitê de Programa do BWSS - 4th Brazilian Workshop on Social Simulation. 2014.

3.
RODRIGUES, M. R.. Comitê de Programa do JCC - Jornadas Chilenas de Computacion. 2014.

4.
RODRIGUES, M. R.. Comitê de Programa do WESAAC - Workshop-Escola de Sistemas de Agentes, seus Ambientes e Aplicações. 2013.

5.
RODRIGUES, M. R.. Comitê de Programa do WESAAC - Workshop-Escola de Sistemas de Agentes, seus Ambientes e Aplicações. 2012.

6.
RODRIGUES, M. R.. Comitê de Programa do WESAAC - Workshop-Escola de Sistemas de Agentes, seus Ambientes e Aplicações. 2011.

7.
RODRIGUES, M. R.. Comitê de Programa do JCC - Jornadas Chilenas de Computacion. 2010.


Demais tipos de produção técnica
1.
RODRIGUES, M. R.. Curso de Gerenciamento de Bancos de Dados Biológicos. 2012. .



Bancas



Participação em bancas de trabalhos de conclusão
Mestrado
1.
Duarte, Denise; FRANCO, G. C.; SILVA, R. S.; RODRIGUES, M. R.. Participação em banca de Silvana Schneider. Estimação de Proporções Alélicas e Genotípicas em Dados de Copy Number Variation. 2013. Dissertação (Mestrado em Estatística) - Universidade Federal de Minas Gerais.

2.
RODRIGUES, M. R.; L. A. M. Palazzo; R. H. S. Reiser. Participação em banca de André Vinícius dos Santos. Avaliação Fuzzy de Trocas Sociais em Sistemas Multiagentes. 2007. Dissertação (Mestrado em Informática) - Universidade Católica de Pelotas.

Teses de doutorado
1.
ORTEGA, J. M.; Cantão, ME; LOBO, F. P.; RAMOS, RTJ; BLEICHER, L; RODRIGUES, M. R.. Participação em banca de Henrique Velloso Ferreira Melo. Ferramentas e Serviços Online para a Análise da Origem Cladística de Genes e Vias Metabólicas. 2014. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.

Qualificações de Doutorado
1.
RODRIGUES, M. R.; ORTEGA, J. M.; SANTORO, M. M.. Participação em banca de Eduardo Campos Santos. TargetDB - um banco de dados de alvos terapêuticos. 2009. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.

2.
RODRIGUES, M. R.; FRANCO, G. R.; FARIA-CAMPOS, A.. Participação em banca de Gabriel da Rocha Fernandes. Integração de dados de genes homólogos e aplicações em análises de sequências. 2009. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais.



Participação em bancas de comissões julgadoras
Concurso público
1.
RODRIGUES, M. R.. Concurso para Professor Adjunto. 2011. Universidade Estadual de Santa Cruz.

Outras participações
1.
TARAZONA-SANTOS, E.; ORTEGA, J. M.; RODRIGUES, M. R.. Processo Seletivo de Mestrado e Doutorado do Programa de Pós-Graduação em Bioinformática. 2014. Universidade Federal de Minas Gerais.

2.
RODRIGUES, M. R.; SANTORO, M. M.; ORTEGA, J. M.; BARTHOLOMEU, D. C.. Seleção de Doutorado em Bioinformática. 2009. Universidade Federal de Minas Gerais.



Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
X-Meeting The Fifth International Conference of The Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology. FROM PHRED-PHRAP-CONSED-POLYPHRED TO DNASP: A PIPELINE TO FACILITATE POPULATION GENETICS RE-SEQUENCING STUDIES. 2009. (Congresso).

2.
Coordination, Organization, Institutions and Norms in Agent Systems at ECAI Conference. Cooperative interactions: An exchange values model. 2006. (Congresso).

3.
Tenth International Workshop on Cooperative Information Agents. Evaluating Dynamic Services in Bioinformatics. 2006. (Congresso).

4.
Multiagent-based Simulation Workshop at the AAMAS Conference. Analysing Partner Selection through Exchange Values. 2005. (Congresso).

5.
The Sixth European Agent Systems Summer School. 2004. (Outra).

6.
First European Workshop on Multi-Agent Systems. 2003. (Simpósio).


Organização de eventos, congressos, exposições e feiras
1.
ORTEGA, J. M. ; RODRIGUES, M. R. . SB-meeting, the Brasil-Deutschland Systems Biology Meeting. 2010. (Congresso).



Orientações



Orientações e supervisões em andamento
Tese de doutorado
1.
Gilderlanio Santana de Araújo. Integração de redes complexas de interação e perfis moleculares de dados biológicos para estudos de variabilidade genética. Início: 2013. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Coorientador).


Orientações e supervisões concluídas
Dissertação de mestrado
1.
Thiago Peixoto Leal. ABORDAGENS DE BIOLOGIA COMPUTACIONAL PARA O ESTUDO DA DIVERSIDADE GENÔMICA DOS BRASILEIROS. 2014. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais, . Orientador: Maíra Ribeiro Rodrigues.

2.
Silvana Schneider. Estimação de proporções alélicas e genotípicas individuais de dados CNVs (Copy Number Variations). 2013. Dissertação (Mestrado em Estatística) - Universidade Federal de Minas Gerais, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Coorientador: Maíra Ribeiro Rodrigues.

Tese de doutorado
1.
Giordano Bruno Soares Souza. Integração de Bases de Dados Biológicas em Estudos de Genética de Populações e Epidemiologia Genética: Aplicações em DIVERGENOME e o Projeto EPIGEN-BRASIL. 2010. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Coorientador: Maíra Ribeiro Rodrigues.

Iniciação científica
1.
Guilherme Pereira Gasparini Kingma. Estudo de Sistemas Multiagente para Anotação de SNPs. 2011. Iniciação Científica. (Graduando em Ciência da Computação) - Pontifícia Universidade Católica de Minas Gerais, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Maíra Ribeiro Rodrigues.

2.
Donnys Silva. Desenvolvimento de Bancos de Dados Biológicos para aplicações em Genética de Populaçṍes e Epidemiologia Genética. 2010. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado em Ciências da Computação) - Universidade Federal de Minas Gerais, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais. Orientador: Maíra Ribeiro Rodrigues.

3.
Bruno Araújo. Integração de ferramentas computacionais para análises em genética de populações. 2009. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado em Ciências da Computação) - Universidade Federal de Minas Gerais, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais. Orientador: Maíra Ribeiro Rodrigues.




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