Ricardo De Marco

Bolsista de Produtividade em Pesquisa do CNPq - Nível 1D

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  • Última atualização do currículo em 11/12/2018


possui graduação em Quimica pela Universidade de São Paulo (1998) e doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica) pela Universidade de São Paulo (2003). Atualmente é professor associado do Instituto de Física de São Carlos- USP. Tem experiência na área de Bioquímica, com ênfase em Biologia Molecular, atuando principalmente nos seguintes temas: esquistosoma, mrna, schistosoma mansoni, expressão heterologa de proteínas e biologia molecular. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Ricardo De Marco
Nome em citações bibliográficas
DeMarco, Ricardo;DeMarco, R.

Endereço


Endereço Profissional
Universidade de São Paulo, Instituto de Física de São Carlos, Departamento de Física e Ciência Interdisciplinar.
Av. Trabalhador Sao Carlense, 400
centro
13560-590 - Sao Carlos, SP - Brasil
Telefone: (16) 33738789
URL da Homepage: http://www.ifsc.usp.br/~rdemarco/


Formação acadêmica/titulação


1999 - 2003
Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: CONSTRUÇÃO E CARACTERIZAÇÃO DE MINI-BIBLIOTECAS DE EST GERADAS COM RT-PCR DE BAIXA ESTRINGENCIA E CLONAGEM DE UMA APIRASE DE Schistosoma mansoni., Ano de obtenção: 2003.
Orientador: Sergio Verjovski-Almeida.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
Palavras-chave: bioquimica; Biologia molecular; Schistosoma mansoni.
Grande área: Ciências Biológicas
Setores de atividade: Desenvolvimento de Produtos Tecnológicos Voltados Para A Saúde Humana.
1995 - 1998
Graduação em Quimica.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.


Pós-doutorado e Livre-docência


2015
Livre-docência.
Instituto de Fisica de São Carlos- USP, IFSC-USP, Brasil.
Título: Estudo da biologia molecular do Schistosoma mansoni, Ano de obtenção: 2015.
2007 - 2007
Pós-Doutorado.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
2006 - 2007
Pós-Doutorado.
University of York, YORK, Inglaterra.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
Grande área: Ciências Biológicas
2003 - 2006
Pós-Doutorado.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
Grande área: Ciências Biológicas


Atuação Profissional



Instituto de Fisica de São Carlos- USP, IFSC-USP, Brasil.
Vínculo institucional

2016 - Atual
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Associado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Vínculo institucional

2007 - 2016
Vínculo: , Enquadramento Funcional: Professor Doutor, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

10/2009 - Atual
Ensino, Fisica aplicada (biomolecular), Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
SFI5839- Biomoléculas: Estrutura e Função
SFI5878Biossegurança e Biocontenção em Laboratório
03/2008 - Atual
Ensino, Ciencias fisicas e biomoleculares, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
FFI730- Biologia Molecular e Celular I
FFI0710- Biologia celular
FFI0760- Biologia molecular computacional
11/2007 - Atual
Ensino, Licenciatura em Ciências Exatas - São Carlos, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
SLC0620 Biologia I
SLC0559 Biologia III
SLC0547 - Biologia I
03/2013 - 05/2016
Conselhos, Comissões e Consultoria, IFSC, .

Cargo ou função
Membro titular do conselho do FCI.
03/2010 - 09/2014
Conselhos, Comissões e Consultoria, IFSC, .

Cargo ou função
Presidente da comissão interna de biossegurança.
03/2011 - 02/2013
Conselhos, Comissões e Consultoria, IFSC, .

Cargo ou função
Membro titular da congregação do IFSC.
03/2009 - 03/2011
Conselhos, Comissões e Consultoria, IFSC, .

Cargo ou função
Membro Titular do conselho do departamento FFI.

Instituto de Química da Universidade de São Paulo, IQ/USP, Brasil.
Vínculo institucional

2004 - 2005
Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Professor doutor em RTP, Carga horária: 12
Outras informações
Contaratado pela USP em acordo com a FAPESP de acordo com a portaria CS 14/2004 da FAPESP. Contrato temporario com duração de um ano.

Atividades

8/2004 - 7/2005
Ensino, Farmacia Bioquimica, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Bioquimica Experimental
Biologia Molecular do Gene

University of Bath, UB, Grã-Bretanha.
Vínculo institucional

2016 - 2017
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Professor visitante, Carga horária: 40



Projetos de pesquisa


2016 - 2017
Analise de agrupamentos de genes de Schistosoma mansoni envolvidos na diferenciação do parasita e infecção do hospedeiro.
Descrição: bolsa FAPESP exterior.
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
2015 - Atual
Septinas: estudos comparativos visando correlacionar estrutura e função

Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Richard Charles Garratt em 18/08/2017.
Descrição: Projeto temático FAPESP.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2014 - 2015
Estudo dos genes de micro-exon (MEGs) do parasita humano Schistosoma mansoni e da interação de seus produtos proteicos com células humanas.
Descrição: Auxilio regular FAPESP.
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (1) .
Integrantes: Ricardo De Marco - Coordenador / ORCIA, DÉBORA - Integrante / ZERAIK, ANA ELIZA - Integrante / Ana felizatti - Integrante.Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
2012 - 2017
Prospecção de linhagens bacterianas termofílicas produtoras de surfactantes e de enzimas do grupo lipase/esterase em reservatórios de petróleo.

Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Nelma Regina Segnini Bossolan em 07/12/2017.
Descrição: Prospecção e identificação de linhagens bacterianas produtoras de surfactantes e de enzimas do grupo lipase/esterase oriundas de rocha e/ou fluidos de reservatórios de petróleo, com salinidade e temperatura elevadas, a partir de cultivos enriquecidos em condições de anaerobiose e de técnicas moleculares. Lípases/esterases representam uma das classes mais importantes de biocatalisadores usados na indústria devido a sua capacidade de catálise em meios orgânicos. O uso de formas ativas e estáveis destas enzimas a altas temperaturas, isoladas a partir de microrganismos termofílicos, poderão abrir rotas competitivas para suas aplicações.
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (1) .
Integrantes: Ricardo De Marco - Integrante / Ana Paula Ulian de Araujo - Integrante / Nelma Regina Segnini Bossolan - Coordenador.Financiador(es): Petróleo Brasileiro - Rio de Janeiro - Matriz - Auxílio financeiro.
2012 - 2014
Estudo dos genes de micro-exon (MEGs) do parasita humano Schistosoma mansoni e seus produtos protéicos
Descrição: Auxilio regular FAPESP.
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (1) .
Integrantes: Ricardo De Marco - Coordenador / ORCIA, DÉBORA - Integrante / ZERAIK, ANA ELIZA - Integrante / natalia oliveira alves - Integrante.Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
2008 - 2012
Estudo de genes envolvidos na relação parasita-hospedeiro na esquistosomose
Descrição: Auxilio Jovem pesquisador FAPESP.
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.


Revisor de periódico


2007 - Atual
Periódico: International Journal for Parasitology
2007 - Atual
Periódico: FEBS Letters
2006 - Atual
Periódico: PARASITOLOGY
2018 - Atual
Periódico: BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-BIOMEMBRANES
2017 - Atual
Periódico: BMC EVOLUTIONARY BIOLOGY
2017 - Atual
Periódico: BMC GENOMICS


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.
2.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Enzimologia.


Idiomas


Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.


Prêmios e títulos


2004
Prêimio jovem cientista, modalidade pos gradução, Departamento de Bioquímica do Instituto de Química da USP.
1998
Prêmio Lavoisier,de melhor aluno do curso de bacharelado em Química (IQ-USP), CRQ-SP.


Produções



Produção bibliográfica
Citações

Web of Science
Total de trabalhos:52
Total de citações:1645
Fator H:18
DeMarco, Ricardo  Data: 24/09/2018

SCOPUS
Total de trabalhos:53
Total de citações:1729
Ricardo DeMarco  Data: 24/09/2018

Artigos completos publicados em periódicos

1.
LI, XIAO-HONG2018LI, XIAO-HONG ; DeMarco, Ricardo ; NEVES, LEANDRO X. ; JAMES, SALLY R. ; NEWLING, KATHERINE ; Ashton, Peter D. ; CAO, JIAN-PING ; WILSON, R. Alan ; CASTRO-BORGES, WILLIAM . Microexon gene transcriptional profiles and evolution provide insights into blood processing by the Schistosoma japonicum esophagus. PLoS Neglected Tropical Diseases, v. 12, p. e0006235, 2018.

2.
MARTINS, THAÍS VIANA FIALHO2018MARTINS, THAÍS VIANA FIALHO ; ZERAIK, ANA ELIZA ; ALVES, NATÁLIA OLIVEIRA ; DE OLIVEIRA, LEANDRO LICURSI ; DE OLIVEIRA MENDES, TIAGO ANTÔNIO ; DeMarco, Ricardo ; DE ALMEIDA MARQUES-DA-SILVA, EDUARDO . Lipophosphoglycan 3 From Leishmania infantum chagasi Binds Heparin With Micromolar Affinity. BIOINFORMATICS AND BIOLOGY INSIGHTS, v. 12, p. 117793221876336, 2018.

3.
KUMAGAI, PATRICIA S.2018KUMAGAI, PATRICIA S. ; GUTIERREZ, RAISSA F. ; LOPES, JOSE L. S. ; MARTINS, JULIA M. ; JAMESON, DAVID M. ; CASTRO, ALINE M. ; MARTINS, LUIZ F. ; DeMarco, Ricardo ; BOSSOLAN, NELMA R. S. ; WALLACE, B. A. ; ARAUJO, ANA P. U. . Characterization of esterase activity from an Acetomicrobium hydrogeniformans enzyme with high structural stability in extreme conditions. EXTREMOPHILES, v. 22, p. 781-793, 2018.

4.
TORINI, JULIANA ROBERTA2018TORINI, JULIANA ROBERTA ; Romanello, Larissa ; BATISTA, FERNANDA APARECIDA HELENO ; SERRÃO, VITOR HUGO BALASCO ; FAHEEM, MUHAMMAD ; ZERAIK, ANA ELIZA ; BIRD, LOUISE ; NETTLESHIP, JOANNE ; REDDIVARI, YAMINI ; OWENS, RAY ; DeMarco, Ricardo ; BORGES, JÚLIO CÉSAR ; BRANDÃO-NETO, JOSÉ ; PEREIRA, HUMBERTO D?MUNIZ . The molecular structure of Schistosoma mansoni PNP isoform 2 provides insights into the nucleoside selectivity of PNPs. PLoS One, v. 13, p. e0203532, 2018.

5.
KUMAGAI, PATRICIA S.2017KUMAGAI, PATRICIA S. ; DeMarco, Ricardo ; LOPES, JOSE L. S. . Advantages of synchrotron radiation circular dichroism spectroscopy to study intrinsically disordered proteins. EUROPEAN BIOPHYSICS JOURNAL WITH BIOPHYSICS LETTERS, v. 46, p. 599-606, 2017.

6.
SERRÃO, VITOR HUGO BALASCO2017SERRÃO, VITOR HUGO BALASCO ; Romanello, Larissa ; CASSAGO, ALEXANDRE ; SOUZA, JULIANA ROBERTA TORINI DE ; CHELESKI, JULIANA ; DeMarco, Ricardo ; BRANDÃO-NETO, JOSÉ ; PEREIRA, HUMBERTO D?MUNIZ . Structure and kinetics assays of recombinant Schistosoma mansoni dihydrofolate reductase. Acta Tropica, v. 170, p. 190-196, 2017.

7.
Romanello, Larissa2017Romanello, Larissa ; SERRÃO, VITOR HUGO BALASCO ; TORINI, JULIANA ROBERTA ; BIRD, LOUISE E. ; NETTLESHIP, JOANNE E. ; RADA, HEATHER ; REDDIVARI, YAMINI ; OWENS, RAY J. ; DeMarco, Ricardo ; BRANDÃO-NETO, JOSÉ ; PEREIRA, HUMBERTO D?MUNIZ . Structural and kinetic analysis of Schistosoma mansoni Adenylosuccinate Lyase ( Sm ADSL). Molecular and Biochemical Parasitology (Print), v. 214, p. 27-35, 2017.

8.
ZERAIK, ANA ELIZA2017ZERAIK, ANA ELIZA ; BALASCO SERRÃO, VITOR HUGO ; Romanello, Larissa ; TORINI, JULIANA ROBERTA ; CASSAGO, ALEXANDRE ; DeMarco, Ricardo ; PEREIRA, HUMBERTO D?MUNIZ . Schistosoma mansoni displays an adenine phosphoribosyltransferase preferentially expressed in mature female gonads and vitelaria. MOLECULAR AND BIOCHEMICAL PARASITOLOGY, v. 214, p. 82-86, 2017.

9.
PINTO, ANDRESSA P.A.2017PINTO, ANDRESSA P.A. ; PEREIRA, HUMBERTO M. ; ZERAIK, ANA E. ; CIOL, HELOISA ; FERREIRA, FREDERICO M. ; BRANDÃO-NETO, JOSÉ ; DeMarco, Ricardo ; NAVARRO, MARCOS V. A. S. ; RISI, CRISTINA ; GALKIN, VITOLD E. ; GARRATT, RICHARD C. ; ARAUJO, ANA P.U. . Filaments and fingers: novel structural aspects of the single septin from Chlamydomonas reinhardtii. JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, v. 292, p. 10899-10911, 2017.

10.
SCORTECCI, JÉSSICA FERNANDES2017SCORTECCI, JÉSSICA FERNANDES ; SERRÃO, VITOR HUGO BALASCO ; CHELESKI, JULIANA ; TORINI, JULIANA ROBERTA ; Romanello, Larissa ; DeMarco, Ricardo ; D'MUNIZ PEREIRA, HUMBERTO . Spectroscopic and calorimetric assays reveal dependence on dCTP and two metals (Zn 2+ + Mg 2+ ) for enzymatic activity of Schistosoma mansoni deoxycytidylate (dCMP) deaminase. BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-PROTEINS AND PROTEOMICS, v. 1865, p. 1326-1335, 2017.

11.
ORCIA, DÉBORA2017ORCIA, DÉBORA ; ZERAIK, ANA ELIZA ; LOPES, JOSÉ L.S. ; MACEDO, JOCI N.A. ; SANTOS, CLARISSA ROMANO DOS ; Oliveira, Katia C. ; ANDERSON, LETICIA ; WALLACE, B.A. ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio ; ARAUJO, ANA P.U. ; DeMarco, Ricardo . Interaction of an esophageal MEG protein from schistosomes with a human S100 protein involved in inflammatory response. BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-GENERAL SUBJECTS, v. 1861, p. 3490-3497, 2017.

12.
DA SILVA NETO, ANTÔNIO MARINHO2016DA SILVA NETO, ANTÔNIO MARINHO ; TORINI DE SOUZA, JULIANA ROBERTA ; Romanello, Larissa ; CASSAGO, ALEXANDRE ; SERRÃO, VITOR HUGO BALASCO ; DeMarco, Ricardo ; BRANDÃO-NETO, JOSÉ ; GARRATT, RICHARD CHARLES ; PEREIRA, HUMBERTO D'MUNIZ . Analysis of two Schistosoma mansoni uridine phosphorylases isoforms suggests the emergence of a protein with a non-canonical function. Biochimie (Paris. Print), v. 125, p. 12-22, 2016.

13.
LOPES, JOSE L. S.2016LOPES, JOSE L. S. ; YONEDA, JULIANA S. ; MARTINS, JULIA M. ; DeMarco, Ricardo ; JAMESON, DAVID M. ; CASTRO, ALINE M. ; BOSSOLAN, NELMA R. S. ; WALLACE, B. A. ; ARAUJO, ANA P. U. . Environmental Factors Modulating the Stability and Enzymatic Activity of the Petrotoga mobilis Esterase (PmEst). Plos One, v. 11, p. e0158146, 2016.

14.
PHILIPPSEN, GISELE S.2016PHILIPPSEN, GISELE S. ; AVACA-CRUSCA, JULIANA S. ; ARAUJO, ANA P.U. ; DeMarco, Ricardo . Distribution patterns and impact of transposable elements in genes of green algae. Gene (Amsterdam), v. 594, p. 151-159, 2016.

15.
ZERAIK, ANA ELIZA2016ZERAIK, ANA ELIZA ; STAYKOVA, MARGARITA ; FONTES, MARINA GABRIEL ; NEMURAIT', INDR' ; QUINLAN, ROY ; ARAÚJO, ANA PAULA ULIAN ; DeMarco, Ricardo . Biophysical dissection of schistosome septins: insights into oligomerization and membrane binding. Biochimie (Paris. Print), v. 131, p. 96-105, 2016.

16.
TORINI, JULIANA ROBERTA2016TORINI, JULIANA ROBERTA ; BRANDÃO-NETO, JOSÉ ; DeMarco, Ricardo ; PEREIRA, HUMBERTO D'MUNIZ . Crystal Structure of Schistosoma mansoni Adenosine Phosphorylase/5?-Methylthioadenosine Phosphorylase and Its Importance on Adenosine Salvage Pathway. PLoS Neglected Tropical Diseases (Online), v. 10, p. e0005178, 2016.

17.
PHILIPPSEN, G. S.2015 PHILIPPSEN, G. S. ; WILSON, R. A. ; DeMarco, R. . Accelerated evolution of Schistosome genes coding for proteins located at the host-parasite interface.. Genome Biology and Evolution, v. 7, p. 431-443, 2015.

18.
WILSON, R. Alan2015WILSON, R. Alan ; LI, XIAO HONG ; MACDONALD, SANDY ; NEVES, LEANDRO XAVIER ; VITORIANO-SOUZA, JULIANA ; LEITE, Luciana C. C. ; FARIAS, LEONARDO P. ; JAMES, SALLY ; Ashton, Peter D. ; DeMarco, Ricardo ; CASTRO BORGES, WILLIAM . The Schistosome Esophagus Is a -Hotspot? for Microexon and Lysosomal Hydrolase Gene Expression: Implications for Blood Processing. PLoS Neglected Tropical Diseases (Online), v. 9, p. e0004272, 2015.

19.
ANDERSON, LETÍCIA2015ANDERSON, LETÍCIA ; AMARAL, MURILO S. ; BECKEDORFF, FELIPE ; SILVA, LUCAS F. ; DAZZANI, BIANCA ; Oliveira, Katia C. ; ALMEIDA, GIULLIANA T. ; GOMES, MONETE R. ; PIRES, DAVID S. ; SETUBAL, João C. ; DeMarco, Ricardo ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio . Schistosoma mansoni Egg, Adult Male and Female Comparative Gene Expression Analysis and Identification of Novel Genes by RNA-Seq. PLoS Neglected Tropical Diseases (Online), v. 9, p. e0004334, 2015.

20.
GARCIA, ASSUERO F.2014GARCIA, ASSUERO F. ; DYSZY, FABIO ; MUNTE, CLAUDIA E. ; DeMarco, Ricardo ; BELTRAMINI, LEILA M. ; OLIVA, GLAUCIUS ; COSTA-FILHO, ANTONIO J. ; ARAUJO, ANA P.U. . THI1, a protein involved in the biosynthesis of thiamin in Arabidopsis thaliana: Structural analysis of THI1(A140V) mutant. Biochimica et Biophysica Acta. Proteins and Proteomics, v. 1844, p. 1094-1103, 2014.

21.
ZERAIK, ANA E.2014ZERAIK, ANA E. ; GALKIN, VITOLD E. ; RINALDI, GABRIEL ; GARRATT, RICHARD C. ; SMOUT, MICHAEL J. ; LOUKAS, ALEX ; MANN, VICTORIA H. ; ARAUJO, ANA P.U. ; DeMarco, Ricardo ; BRINDLEY, PAUL J. . Reversible paralysis of Schistosoma mansoni by forchlorfenuron, a phenylurea cytokinin that affects septins. International Journal for Parasitology, v. 44, p. 523-531, 2014.

22.
ZERAIK, A. E.2014ZERAIK, A. E. ; PEREIRA, H. M. ; SANTOS, Y. V. ; BRANDAO-NETO, J. ; SPOERNER, M. ; SANTOS, M. S. ; COLNAGO, L. A. ; GARRATT, R. C.. ; ARAUJO, A. P. U. ; DeMarco, R. . Crystal structure of a Schistosoma mansoni septin reveals the phenomenon of strand slippage in septins dependent on the nature of the bound nucleotide. The Journal of Biological Chemistry (Print), v. 289, p. 7799-7811, 2014.

23.
Romanello, Larissa2013Romanello, Larissa ; BACHEGA, JOSÉ FERNANDO RUGUIERO ; CASSAGO, ALEXANDRE ; BRANDÃO-NETO, JOSÉ ; DeMarco, Ricardo ; GARRATT, RICHARD CHARLES ; PEREIRA, HUMBERTO D'MUNIZ . Adenosine kinase from Schistosoma mansoni : structural basis for the differential incorporation of nucleoside analogues. Acta Crystallographica. Section D, Biological Crystallography, v. 69, p. 126-136, 2013.

24.
LOPES, JOSE LUIZ S.2013LOPES, JOSE LUIZ S. ; ORCIA, DEBORA ; ARAUJO, ANA PAULA U. ; DeMarco, Ricardo ; WALLACE, B.A. . Folding Factors and Partners for the Intrinsically Disordered Protein Micro-Exon Gene 14 (MEG-14). Biophysical Journal (Print), v. 104, p. 2512-2520, 2013.

25.
LI, XIAO-HONG2013LI, XIAO-HONG ; DE CASTRO-BORGES, WILLIAM ; PARKER-MANUEL, SOPHIE ; VANCE, GILLIAN M. ; DeMarco, Ricardo ; NEVES, LEANDRO X. ; EVANS, GARETH J. O. ; WILSON, R. Alan . The Schistosome Oesophageal Gland: Initiator of Blood Processing. PLoS Neglected Tropical Diseases (Online), v. 7, p. e2337, 2013.

26.
ZERAIK, ANA E.2013ZERAIK, ANA E. ; RINALDI, GABRIEL ; MANN, VICTORIA H. ; POPRATILOFF, ANASTAS ; ARAUJO, ANA P. U. ; DeMarco, Ricardo ; BRINDLEY, PAUL J. . Septins of Platyhelminths: Identification, Phylogeny, Expression and Localization among Developmental Stages of Schistosoma mansoni. PLoS Neglected Tropical Diseases (Online), v. 7, p. e2602, 2013.

27.
Almeida, G.T.2012Almeida, G.T. ; SENA, M. ; AMARAL, M. S. ; BECKDORFF, F.C.F. ; KITAJIMA, João P. ; DeMarco, Ricardo ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio . Exploring the Schistosoma mansoni adult male transcriptome using RNA-seq. Experimental Parasitology, v. 132, p. 22-31, 2012.

28.
Marques, Ivo de Almeida2012Marques, Ivo de Almeida ; Romanello, Larissa ; DeMarco, Ricardo ; Pereira, Humberto D Muniz . Structural and Kinetic Studies of Schistosoma mansoni Adenylate Kinases. Molecular and Biochemical Parasitology (Print), v. 185, p. 157-160, 2012.

29.
VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio2011VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio ; DeMarco, Ricardo . Gene structure and splicing in schistosomes. Journal of Proteomics, v. 74, p. 1515-1518, 2011.

30.
JACINTO, DANIELE S.2011JACINTO, DANIELE S. ; MUNIZ, HELOISA DOS SANTOS ; Venancio, Thiago M. ; WILSON, R. Alan ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio ; DeMarco, Ricardo . Curupira-1 and Curupira-2, two novel Mutator-like DNA transposons from the genomes of human parasites Schistosoma mansoni and Schistosoma japonicum. Parasitology (London. Print), v. 138, p. 1124-1133, 2011.

31.
Venancio, Thiago M.2010Venancio, Thiago M. ; WILSON, R. Alan ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio ; DeMarco, Ricardo . Bursts of transposition from non-long terminal repeat retrotransposon families of the RTE clade in Schistosoma mansoni. International Journal for Parasitology, v. 40, p. 743-749, 2010.

32.
DeMarco, R.2010 DeMarco, R.; mathieson, W. ; Manuel, S. J. ; DILLON, G. P. ; Curwen, R. S. ; ASHTON, P. D. ; Ivens, A. C. ; Berriman, M. ; Verjovski-Almeida, S. ; WILSON, R. A. . Protein variation in blood-dwelling schistosome worms generated by differential splicing of micro-exon gene transcripts. Genome Research, v. 20, p. 1112-1121, 2010.

33.
DeMarco, Ricardo;DeMarco, R.2009DeMarco, Ricardo; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio . Schistosomes - proteomics studies for potential novel vaccines and drug targets. Drug Discovery Today, v. 14, p. 472-478, 2009.

34.
Santos, Ramon F.2009Santos, Ramon F. ; Pôssa, Marcela A. S. ; Bastos, Matheus S. ; Guedes, Paulo M. M. ; Almeida, Márcia R. ; DeMarco, Ricardo ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio ; Bahia, Maria T. ; Fietto, Juliana L. R. . Influence of Ecto-Nucleoside Triphosphate Diphosphohydrolase Activity on Trypanosoma cruzi Infectivity and Virulence. PLoS Neglected Tropical Diseases (Online), v. 3, p. e387, 2009.

35.
Berriman, Matthew2009 Berriman, Matthew Haas, Brian J. LoVerde, Philip T. WILSON, R. Alan Dillon, Gary P. Cerqueira, Gustavo C. Mashiyama, Susan T. Al-Lazikani, Bissan Andrade, Luiza F. Ashton, Peter D. Aslett, Martin A. Bartholomeu, Daniella C. Blandin, Gaelle Caffrey, Conor R. Coghlan, Avril Coulson, Richard Day, Tim A. Delcher, Art DeMarco, Ricardo Djikeng, Appolinaire Eyre, Tina Gamble, John A. Ghedin, Elodie Gu, Yong Hertz-Fowler, Christiane , et al.Hirai, Hirohisha Hirai, Yuriko Houston, Robin Ivens, Alasdair Johnston, David A. Lacerda, Daniela Macedo, Camila D. McVeigh, Paul Ning, Zemin Oliveira, Guilherme Overington, John P. Parkhill, Julian Pertea, Mihaela Pierce, Raymond J. Protasio, Anna V. ; The genome of the blood fluke Schistosoma mansoni. Nature (London), v. 460, p. 352-358, 2009.

36.
Oliveira, Katia C.2009Oliveira, Katia C. ; Carvalho, Mariana L. P. ; Venancio, Thiago M. ; Miyasato, Patricia A. ; KAWANO, Toshie ; DeMarco, Ricardo ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio . Identification of the Schistosoma mansoni TNF-Alpha Receptor Gene and the Effect of Human TNF-Alpha on the Parasite Gene Expression Profile. Plos Neglected Tropical Diseases, v. 3, p. e556, 2009.

37.
VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio2008VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio ; DeMarco, Ricardo . Current developments on Schistosoma proteomics. Acta Tropica, v. 108, p. 183-185, 2008.

38.
LEVANO-GARCIA, J.2007LEVANO-GARCIA, J. ; MORTARA, Renato Arruda ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio ; DeMarco, Ricardo . Characterization of Schistosoma mansoni ATPDase2 gene, a novel apyrase family member.. Biochemical and Biophysical Research Communications, v. 352, p. 384-389, 2007.

39.
OJOPI, Elida P. B.2007OJOPI, Elida P. B. ; oliveira PS ; nunes DN ; PAQUOLA, A. C. M. ; DeMarco, Ricardo ; GREGORIO, S. P. ; Aires KA ; MENCK, Carlos F. M. ; LEITE, Luciana C C ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio ; DIAS-NETO, Emmanuel . A quantitative view of the transcriptome of Schistosoma mansoni adult-worms using SAGE.. BMC Genomics, v. 8, p. 186, 2007.

40.
DeMarco, Ricardo;DeMarco, R.2007DeMarco, Ricardo; mathieson, W. ; DILLON, G. P. ; WILSON, R. Alan . Schistosome albumin is of host, not parasite, origin. International Journal for Parasitology, v. 37, p. 1201-1208, 2007.

41.
VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio2007VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio ; VENANCIO, Thiago M ; Almeida, G.T. ; OLIVEIRA, Katia C ; DeMarco, Ricardo . Use of a 44k oligoarray to explore the transcriptome of Schistosoma mansoni adult worms. Experimental Parasitology, v. 117, p. 236-245, 2007.

42.
VENANCIO, Thiago M2007VENANCIO, Thiago M ; DeMarco, Ricardo ; Almeida, G.T. ; OLIVEIRA, Katia C ; SETUBAL, João C ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio . Analysis of Schistosoma mansoni genes shared with Deuterostomia and with possible roles in host interactions. BMC Genomics, v. 8, p. 407, 2007.

43.
DeMarco, Ricardo;DeMarco, R.2006DeMarco, Ricardo; OLIVEIRA, Katia C ; VENANCIO, Thiago M ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio . Gender biased differential alternative splicing patterns of the transcriptional cofactor CA150 gene in Schistosoma mansoni. Molecular and Biochemical Parasitology (Print), v. 150, n.2, p. 123-131, 2006.

44.
DeMarco, Ricardo;DeMarco, R.2006DeMarco, Ricardo; VENANCIO, Thiago M ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio . SmTRC1, a novel Schistosoma mansoni DNA transposon, discloses new families of animal and fungi transposons belonging to the CACTA superfamily.. BMC Evolutionary Biology (Online), v. 6, p. 89, 2006.

45.
DeMarco, Ricardo;DeMarco, R.2005DeMarco, Ricardo; MACHADO, Abimael A ; BISSON FILHO, Alexandre W ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio . Identification of 18 new transcribed retrotransposons in Schistosoma mansoni. Biochemical and Biophysical Research Communications (Print), Estado Unidos, v. 333, p. 230-240, 2005.

46.
DeMarco, Ricardo;DeMarco, R.2004 DeMarco, Ricardo; KOWALTOSKI, Andre T ; MACHADO, Abimael A ; SOARES, M. B. ; GARGIONI, Cybele ; KAWANO, Toshie ; RODRIGUES, Vanderlei ; MADEIRA, Alda M B N ; WILSON, R. A. ; MENCK, Carlos F M ; SETUBAL, João C ; DIAS-NETO, E. ; LEITE, Luciana C C ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio . Saci-1, -2, and -3 and Perere, Four Novel Retrotransposons with High Transcriptional Activities from the Human Parasite Schistosoma mansoni. Journal of Virology, v. 78, n.6, p. 2967-2978, 2004.

47.
FIETTO, Juliana L R2004FIETTO, Juliana L R ; DeMarco, Ricardo ; NASCIMENTO, Ivan P ; CASTRO, Ieso M ; CARVALHO, T. M. U. ; SOUZA, Wanderlei de ; BAHIA, Maria T ; ALVES, Maria J M ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio . Characterization and immunolocalization of an NTP diphosphohydrolase of Trypanosoma cruzi. Biochemical and Biophysical Research Communications (Print), v. 316, p. 454-460, 2004.

48.
MADEIRA, Luciana2003MADEIRA, Luciana ; DeMarco, Ricardo ; GAZARINI, M. L. ; VERJOVSKI-ALMEIDA, S. ; GARCIA, Celia R S . Human malaria parasites display a receptor for activated C kinase ortholog.. Biochemical and Biophysical Research Communications (Print), v. 306, n.4, p. 995-1001, 2003.

49.
DeMarco, Ricardo;DeMarco, R.2003DeMarco, Ricardo; KOWALTOWSKI, A. T. ; MORTARA, Renato Arruda ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio . Molecular characterization and immunolocalization of Schistosoma mansoni ATP-diphosphohydrolase.. Biochemical and Biophysical Research Communications, v. 307, n.4, p. 831-838, 2003.

50.
VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio2003 VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio DeMarco, Ricardo MARTINS, ELIZABETH A L GUIMARÃES, PEDRO E M OJOPI, ELIDA P B PAQUOLA, APUÃ C M PIAZZA, JOÃO P NISHIYAMA, MILTON Y KITAJIMA, JOÃO P ADAMSON, RACHEL E ASHTON, PETER D BONALDO, MARIA F COULSON, PATRICIA S DILLON, GARY P FARIAS, LEONARDO P GREGORIO, SHEILA P HO, PAULO L LEITE, RICARDO A MALAQUIAS, L COSME C MARQUES, REGINA C P MIYASATO, PATRICIA A NASCIMENTO, ANA L T O OHLWEILER, FERNANDA P REIS, EDUARDO M RIBEIRO, MARCELA A , et al.SÁ, RENATA G STUKART, GAËLLE C SOARES, M BENTO GARGIONI, Cybele KAWANO, Toshie RODRIGUES, Vanderlei MADEIRA, Alda M B N WILSON, R ALAN MENCK, Carlos F M SETUBAL, João C LEITE, Luciana C C DIAS-NETO, Emmanuel ; Transcriptome analysis of the acoelomate human parasite Schistosoma mansoni. Nature Genetics (Print), v. 35, p. 148-157, 2003.

51.
FIETTO, Juliana Lopes Rangel2001FIETTO, Juliana Lopes Rangel ; DeMarco, Ricardo ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Segio . Use of degenerate primers and touchdown PCR for construction of cDNA libraries.. BioTechniques, v. 32, n.6, p. 1404-1411, 2001.

Capítulos de livros publicados
1.
DeMarco, Ricardo. Transcriptômica e proteômica. In: Carlos F.M. Menck; Marie-Anne Van Sluys. (Org.). Genética molecular básica. 1ed.Rio de Janeiro: Guanabara Koogan, 2017, v. , p. 243-260.

2.
DeMarco, Ricardo; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio . Expressed Sequence Tags (ESTs) and Gene Discovery: Schistosoma mansoni. In: Arthur Gruber; Alan M. Durham; Chuong Huynh; Hernando del Portilho. (Org.). Bioinformatics for Tropical Disease Research: A Practical and Case-Study Approach. Bethesda (MD): National Library of Medicine (US), NCBI, 2008, v. B06, p. -.

3.
DeMarco, Ricardo; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio . Schistosome DNA Transposons. In: Brindley, P.J.. (Org.). Mobile Genetic Elements in Metazoan Parasites. Austin,TX: Eureka/Landes Bioscience, 2007, v. , p. -.

4.
VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio ; DeMarco, Ricardo . The schistosoma transcriptome. In: A.G. Maule; N J Marks.. (Org.). Parasitic Flatworms: Molecular Biology, Biochemistry, Immunology and Control.. : CAB International, 2005, v. , p. 138-148.

Textos em jornais de notícias/revistas
1.
VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio ; DeMarco, Ricardo . Genoma contra a Esquistossomose.. Scientific american brasil, Brasil, , v. 28, p. 54 - 61, 01 set. 2004.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
DeMarco, Ricardo; KOWALTOSKI, Andre T ; MACHADO, Abimael A ; SOARES, M. Bento ; GARGIONI, Cybele ; KAWANO, Toshie ; RODRIGUES, Vanderlei ; MADEIRA, Alda M B N ; WILSON, R. Alan ; MENCK, Carlos F M ; SETUBAL, João C ; DIAS-NETO, Emmanuel ; LEITE, Luciana C C ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio . Saci-1, -2, -3 and Perere, four novel retrotransposons with high transcriptional activities from the human parasite Schistosoma mansoni.. In: XXXIII Reunião anual, Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2004, cAXAMBU. Programa e resumos da XXXIII Reunião anual, Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. Sao Paulo: Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular.

2.
Levano-GARCIA, Julio C ; DeMarco, Ricardo ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio . Expression and purification of a recombinant ATP-diphosphohydrolase from the parasite Schistosoma mansoni.. In: XXXIII Reunião anual, Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2004, Caxambu. Programa e resumos da XXXIII Reunião anual, Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. Sao Paulo: Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2004.

3.
FIETTO, Juliana Lopes Rangel ; DeMarco, Ricardo ; NASCIMENTO, Ivan P ; CASTRO, Ieso M ; SOUZA, Wanderlei de ; BAHIA, Maria T ; ALVES, Maria J M ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio . Characterization and immunolocalization of an NTPDase of Trypanosoma cruzi. In: XXXIII Reunião anual, Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2004, Caxambu. Programa e resumos da XXXIII Reunião anual, Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. São Paulo: Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2004.

4.
DeMarco, Ricardo; KOWALTOSKI, Andre T ; MORTARA, Renato Arruda ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio . Production of polyclonal antibody and immunolocalization of Schistosoma mansoni apyrase. In: XXXII Reunião anual, Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2003, Caxambu. Programa e resumos da XXXII Reunião anual, Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. São Paulo: Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2003.

5.
DeMarco, Ricardo; KOWALTOWSKI, A. T. ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio . Cloning of an ATP-diphosphohydrolase of Schistosoma mansoni.. In: XXXI Reunião anual da Sociedade brasileira de Bioquimica e Biologia Molecular, 2002, Caxambu, 2002.

6.
VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio ; DIAS-NETO, Emmanuel ; GARGIONI, Cybele ; KAWANO, Toshie ; LEITE, Luciana C. C. ; MADEIRA, Alda M B N ; MENCK, Carlos F. M. ; RODRIGUES, Vanderlei ; SETUBAL, João C. ; GRUBER, Arthur ; HO, Paulo L. ; KITAJIMA, João P. ; MARTINS, Elizabeth A. L. ; NASCIMENTO, Ana L. T. O. ; DeMarco, Ricardo ; OHLWEILER, Fernanda P. ; OJOPI, Elida P. B. ; SÁ, Renata G. . Schistosoma mansoni GENOME PROJECT: A PRELIMINARY ANALYSIS OF THE FIRST 22,000 ESTs FROM ADULT WORMS.. In: XXXI Reunião anual da Sociedade brasileira de Bioquimica e Biologia Molecular, 2002, Caxambu. Programa e resumos da XXXI Reunião anual, Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. São Paulo: Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2002.

7.
MADEIRA, Luciana ; DeMarco, Ricardo ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio ; GARCIA, Celia R S . Cloning of a Plasmodium falciparum receptor for activated C kinase (PfRACK).. In: XXXI Reunião anual, Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2002, Caxambu. Programa e resumos da XXXI Reunião anual, Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. São Paulo: Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2002.

8.
DeMarco, Ricardo; FIETTO, Juliana Lopes Rangel ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Segio . Analysis of primer annealing in low stringency RT-PCR using Arbitrary Consensus-Degenerate Hybrid Oligonucleotide Primers. In: XXX Reunião anual da Sociedade brasileira de Bioquimica e Biologia Molecular, 2001, Caxambu, 2001.

9.
DeMarco, Ricardo; FIETTO, J. L. R. ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio . Construction of Libraries from cDNA obtained with Arbitrary Consensus-degenerate Hybrid Oligonucleotide Primers and Low-Stringency RT-PCR. In: Brasilian International Genome Congress, 2001, Angra dos Reis, 2001.

10.
DeMarco, Ricardo; FIETTO, Juliana L R ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Segio . ESTs de Schistosoma mansoni: analise do transcriptoma com ferramentas de informática.. In: XXX Reunião anual da Sociedade brasileira de Bioquimica e Biologia Molecular, 2001, Caxambu. Programa e resumos da XXX Reunião anual. São Paulo: Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2001.

11.
DeMarco, Ricardo; FIETTO, J. G. L. ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio . BUILDING OF A Schistosoma mansoni EST MINILIBRARY USING CONSENSUS-DEGENERATE HYBRID OLIGONUCLEOTIDE PRIMERS. In: XXIX Reunião anual da Sociedade brasileira de Bioquimica e Biologia Molecular, 2000, Caxambu, 2000.

12.
FIETTO, Juliana Lopes Rangel ; DeMarco, Ricardo ; ELEUTERIO, A. A. ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Segio . cloning of new Schistosoma mansoni genes using consensus degenerate hybrid oligonucleotide primers. In: XXVIII Reunião anual da ScociedadeBrasileira de bioquimica e biologia molecular, 1999, Caxambu, 1999.

Resumos publicados em anais de congressos (artigos)
1.
VENANCIO, Thiago M2005VENANCIO, Thiago M ; DeMarco, Ricardo ; OLIVEIRA, Katia C ; SIMOES, Ana Carolina ; SILVA, Aline M da ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio . Genomics and gene expression management tools for the Schistosoma mansoni cDNA microarray project. Lecture Notes in Computer Science, v. 3594, p. 198-201, 2005.

Apresentações de Trabalho
1.
DeMarco, Ricardo. Correndo para ficar parado:uma visão dinâmica do genoma do Schistosoma mansoni. 2018. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

2.
DeMarco, Ricardo. Micro-Exon Genes:a complex genetic system to produce variant antigens in schistosomes. 2016. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

3.
DeMarco, Ricardo. Micro-Exon Gene: a complex genetic system to produce variant antigens in schistosomes. 2015. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

4.
DeMarco, Ricardo. Protein variation in blood-dwelling schistosome worms generated by differential splicing of micro-exon gene transcripts.. 2011. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

5.
Almeida, G.T. ; BECKEDORFF, F. ; SENA, M. ; DeMarco, Ricardo ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio . Male-female interaction: a transcriptomic view. 2010. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

6.
DeMarco, Ricardo. Estudo Genomicos e pós-genomicos do Schistosoma mansoni. 2010. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

7.
DeMarco, Ricardo. O genoma e o Schistosoma mansoni. 2007. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

8.
DeMarco, Ricardo. Novos retrotransposons transcritos em S. mansoni. 2005. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

9.
DeMarco, Ricardo. Saci-1, -2 e -3 e Perere, quatro novos retrotransposons com alta atividade transcricional do parasita humano Schistosoma mansoni. 2004. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

10.
DeMarco, Ricardo. Retrotransposon diversity in S. mansoni. 2004. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

11.
DeMarco, Ricardo. Análise do transcriptoma do Schistosoma mansoni a partir de 163.000 ESTs do Schistosoma mansoni EST Genome Project. 2003. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).


Demais tipos de produção técnica
1.
DeMarco, Ricardo. Elementos de transposição e evolução de genomas. 2013. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

2.
DeMarco, Ricardo. Elementos de transposição e sua relação com os genomas de celulas eucarioticas. 2009. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).



Bancas



Participação em bancas de trabalhos de conclusão
Mestrado
1.
ANIBAL, F. F.; DeMarco, R.; FONSECA, M. G.. Participação em banca de Bruna Dias de Lima Fragelli. Efeito das enzimas recombinantes de Schistosoma mansoni Hipoxantina-Guanina fosforibosiltransferase (HGPRT) e Purina Nucleosídeo fosforilase (PNP) no tratamento da esquistossomose experimental. 2018. Dissertação (Mestrado em Genética Evolutiva e biologia molecular) - Universidade Federal de São Carlos.

2.
COSTA, M. C. N.; DeMarco, Ricardo; AMBROSIO, A. L. B.. Participação em banca de /aline Kusumota luiz de souza. Clonagem, expressão heterologa e caracterização do gene Smp_158240 de Schistosoma mansoni. 2013. Dissertação (Mestrado em Ciências Farmacêuticas) - Universidade de São Paulo.

3.
BARANAUKAS, J. A.; COSTA, L. F.; DeMarco, Ricardo. Participação em banca de Erica Akemi Tanaka. Uma adaptação do Método Binary Relevance Utilizando Arvores de decisão para problemas de classificação Multirrótulo Aplicado a gênomica funcional. 2013. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

4.
MANSUR, M. T. M. N.; BERTOLINI, M. C.; DeMarco, Ricardo. Participação em banca de Carolina Moretto Carnielli. Analise proteomica diferencial de proteínas totais e superficiais da membrana de Xanthomonas spp. em interação com hospedeiro cítrico. 2013. Dissertação (Mestrado em Genética Evolutiva e biologia molecular) - Universidade Federal de São Carlos.

5.
FIETTO, J. L. R.; DeMarco, Ricardo; OLIVEIRA, L. L.; BRESSAN, G. C.; RAMOS, H. J. O.. Participação em banca de Christiane Mariotini Moura. Expressão heteróloga, purificação e busca de inibidores da NTPDase-1 de Trypanosoma cruzi.. 2010. Dissertação (Mestrado em Biologia Celular e Estrutural) - Universidade Federal de Viçosa.

6.
FIETTO, J. L. R.; DeMarco, Ricardo; SILVA, E. A. M.; RAMOS, J. R. L. S.; PETERNELLI, E. F. O.. Participação em banca de Raphael de Souza Vasconcellos. EXPRESSÃO HETERÓLOGA E CARACTERIZAÇÃO BIOQUÍMICA DA NUCLEOSÍDEO TRIFOSFATO DIFOSFOHIDROLASE-2 (NTPDase-2) DE Leishmania infantum chagasi. 2010. Dissertação (Mestrado em Biologia Celular e Estrutural) - Universidade Federal de Viçosa.

7.
DeMarco, Ricardo; CARARETO, C. M.; VANZELA, A. L. L.. Participação em banca de Julcimary Ricci. Analise da ocorrência de elementos de transposição em regiões reguladoras dos genes da família CYP em especies de Drosophila. 2009. Dissertação (Mestrado em Biociências) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

8.
DeMarco, Ricardo; Oliva, G; GOZZO, F. C.. Participação em banca de Aline Regis Faro. Estudos estruturais e funcionais da Xylellaina, uma cisteino protease da bacteria Xylella fastidiosa. 2008. Dissertação (Mestrado em Fisica Aplicada- Biomolecular) - Universidade de São Paulo.

Teses de doutorado
1.
BORGES, W. C.; DeMarco, Ricardo; SÁ, Renata G.; CASTRO, Ieso M; PALMISANO, G.. Participação em banca de Leandro Xavier Neves. Proteômica quantitativa baseada em espectrometria de massas para estudo do trato alimentar de Schistosoma mansoni com ênfase na glândula esofagiana e suas secreções. 2018. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade Federal de Ouro Preto.

2.
CAMARGO, I. L. B. C.; ARAUJO, A. P. U.; DeMarco, Ricardo. Participação em banca de Suelen Scarpa de Mello. Estudo das vias alternativas aos sistemas LiasFSR e YycFGHIJ que levam a diminuição da sensibilidade à daptomicina em Enterococcus faecium. 2018. Tese (Doutorado em Genética e Evolução) - Universidade Federal de São Carlos.

3.
DeMarco, Ricardo; MURAKAMI, M. T.; Souza DH; POLIKARPOV, I.; REZENDE, C. A.. Participação em banca de Danilo Elton Evangelista. Estudos funcionais e estruturais de pectinases e xilanases com potencial para aplicações biotecnológicas. 2017. Tese (Doutorado em Fisica aplicada (biomolecular)) - Instituto de Fisica de São Carlos- USP.

4.
LEITE, Luciana C. C.; MALDONADO, G. P.; LEAO, S. L. P. C.; BARBUTO, J. A. M.; DeMarco, Ricardo. Participação em banca de Alex Issamu Kanno. Expressão de antígenos de Schistosoma mansoni em BCG recombinante. 2013. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.

5.
CARARETO, C. M.; GAIESKY, V. L. S. V.; VIEIRA, C.; Souza, F.P.; DeMarco, Ricardo. Participação em banca de Adriana Granzotto. A regulação do elemento transponível Helena em Drosophila. 2011. Tese (Doutorado em Biociências) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

6.
ARAUJO, A. P. U.; MALAVAZI, I.; CIANCAGLINI, P.; MOREIRA, R. A.; DeMarco, Ricardo. Participação em banca de Luis Fernando Reyes. Proteinas inativadoras de ribossomos: identificação de novas proteínas e estudos de interação da cadeia-A da puchelina (PAC) com monocamada de Langmuir. 2011. Tese (Doutorado em Fisica aplicada (biomolecular)) - Instituto de Fisica de São Carlos- USP.

7.
LEITE, Luciana C C; SANTELLI, G. M. M.; FERREIRA, L. C. S.; BORGES, W. C.; DeMarco, Ricardo. Participação em banca de Cibele Aparecida Tararam. Investigação de genes diferencialmente expressos em estágios intra-hospedeiro de Schistosoma mansoni como candidatos vacinais. 2011. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.

8.
LEITE, Luciana C C; SANTELLI, G. M. M.; WINTER, C. E.; DAFFRE, S.; DeMarco, Ricardo. Participação em banca de Bogar Omar Araujo Montoya. Investigação da carboxipeptidase, esfingomielinase e fosfatase alcalina de Schistosoma mansoni como potenciais antigenos. 2011. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.

9.
LORETO, E. L. S.; GAIESKY, V. L. S. V.; LEAL, B. C. P. B.; FREITAS, L. B.; DeMarco, Ricardo. Participação em banca de ADRIANA LÜDWIG. Diversidade e evolução de elementos de transposição em Drosophila. 2010. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

10.
DeMarco, R.; GARRATT, R. C.; FRANCO, G. R.; KOBARD, J.; BERTOLI, M. C.. Participação em banca de Joci Neuby Alves Macedo. Estudos estruturais e funcionais de septinas humanas: a ligação e hidrólise de GTP por SEPT3 e a busca de parceiros funcionais de SEPT1, SEPT5 e SEPT7. 2010. Tese (Doutorado em Fisica Aplicada-Opção Fisica Biomolecular) - Universidade de São Paulo.

11.
DeMarco, R.; FRANCO, G. R.; FANTAPIE, MR; Nagem, RA. Participação em banca de Marcela Gonçalves Drummond. Estudos sobre estrutura e função de SmZF1, um provável fator de transcrição de Schistosoma mansoni. 2010. Tese (Doutorado em Bioquímica e Imunologia) - Universidade Federal de Minas Gerais.

12.
DeMarco, Ricardo; SILVA, F. H.; GARRATT, R. C.; CUNHA, A. F.; BORGES, J. C.; ARAUJO, H. S.. Participação em banca de Marcia Dellamano. esudos funcionais de cisteino peptidases da cana-de-açucar e caracterização de uma cisteíno peptidase de sphenophorus levis, uma importante praga da cultura canvieira. 2009. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade Federal de São Carlos.

13.
SILBER, A. M.; THIEMANN, O. H.; ARAUJO, H. S.; COSTA, P. I.; DeMarco, Ricardo. Participação em banca de Elisandra márcia rodrigues. Estudos moleculares das enzimas envolvidas na biossíntese de selenocisteina em Trypanosoma brucei e Leishmania major. 2008. Tese (Doutorado em Fisica Aplicada-Opção Fisica Biomolecular) - Universidade de São Paulo.

14.
POLIKARPOV, I.; KELLERMANN, G.; ABERGO, J. R. B.; LIMA, L. M. T. R. E.; DeMarco, Ricardo. Participação em banca de Mario de Oliveira Neto. Espalhamento de raios-X a baixo ângulo aplicado ao estudo estrutural de proteínas. 2008. Tese (Doutorado em Doutorado em Fisica Aplicada) - Universidade de São Paulo.

15.
DeMarco, Ricardo; GOMES, Suely L; MARTINS, Elizabeth A. L.; ALVES, Maria J M. Participação em banca de Debora Rose de Oliveira. Caracterização de clones que codificam membros da familia multigenica TC-85 de trypanosoma cruzi. 2004. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Qualificações de Doutorado
1.
DeMarco, Ricardo; AMBROSIO, A. L. B.; WARD, R. J.. Participação em banca de Diego Antonio Leonardo Cabrejos. Determinantes estruturais para a especificidade de interação nas interfaces G e NC de septinas: validando as regras de substituição na montagem do filamento.. 2018. Exame de qualificação (Doutorando em Fisica aplicada (biomolecular)) - Instituto de Fisica de São Carlos- USP.

2.
DeMarco, Ricardo; BUCKERIDGE, M. S.; MURAKAMI, M. T.. Participação em banca de EVANDRO JOSÉ MULINARI. Prospecção, clonagem, expressão e caracterização heteróloga de enzimas termofílicas do fungo Thielavia terrestris com aplicação biotecnológica. 2017. Exame de qualificação (Doutorando em Fisica aplicada (biomolecular)) - Instituto de Fisica de São Carlos- USP.

3.
DeMarco, Ricardo; Neto, MO; Souza DH. Participação em banca de Larissa Romanello. Estudos estruturais e cinéticos das enzimas adenosina kinase, hipoxantina-guanina fosforibosiltransferase, adenilato succinato sintetase e adenilcuccinato liase de Schistosoma mansoni. 2014. Exame de qualificação (Doutorando em Fisica aplicada (biomolecular)) - Instituto de Fisica de São Carlos- USP.

4.
BORVA, H.; CARRILHO, E.; DeMarco, Ricardo. Participação em banca de Adriano Aquino. Analise por 2DPAGE e espectrometri de massas do albumen, plasma e fração granular de ovos de codorna não fertilizados submetidos a diferentes emperaturas de estocagem e aplicação do OFFGEL para busca de novas proteínas em albumen. 2014. Exame de qualificação (Doutorando em Química Orgânica) - Universidade de São Paulo.

5.
DeMarco, Ricardo; NEGRINI, B. V. M.; NISCHKE, M.. Participação em banca de Andrei Nicoli Gebieluca Dabul. Estudo epidemiológico molecular de Saphylococcus aureus resistentes a metacilina (MRSA) isolados no Brasil e estudo da proteína reguladora de resposta GraR. 2013. Exame de qualificação (Doutorando em Fisica aplicada (biomolecular)) - Instituto de Fisica de São Carlos- USP.

6.
VENTURI FILHO, W. G.; DeMarco, Ricardo; LI, M. S.. Participação em banca de Éverton Sérgio Estracanholli. In-line absorption sensor based on coiled optical microfiber. 2012. Exame de qualificação (Doutorando em Física) - Universidade de São Paulo.

7.
DeMarco, Ricardo; NASCIMENTO, A. S.; SILVA, D. H. S.. Participação em banca de Wanessa Fernanda Altei. Triagem biológica, identificação e planejamento de novos candidatos a agentes anticâncer a partir de produtos naturais e compostos sintetícos. 2012. Exame de qualificação (Doutorando em Fisica aplicada (biomolecular)) - Universidade de São Paulo.

8.
NAPOLITANO, R. J.; DeMarco, Ricardo; CHAHINE, J.. Participação em banca de Guilherme Nery Prata. Limites fundamentais na supressão de flutuações moleculares. 2011. Exame de qualificação (Doutorando em Fisica aplicada) - Instituto de Fisica de São Carlos- USP.

9.
REGITANO, L. C. A.; SILVA, F. H.; DeMarco, Ricardo. Participação em banca de Carmem Lucia Salla Pontes. Produção recombinante e caracterização de uma desintegrina do veneno de Bothrops alternatus com atividade anti-trombotica e anti-metastatica visando o desenvolvimento de um novo farmaco. 2010. Exame de qualificação (Doutorando em Genética e Evolução) - Universidade Federal de São Carlos.

10.
MARQUES, Marilis Do Valle; DeMarco, Ricardo; NASCIMENTO, Ana Lucia Tabet Oller. Participação em banca de Douglas silva domingues. Caracterização gênomica e funcional de sequências relacionadas ao retrotransposon Tnt1 em cana-de-açucar. 2006. Exame de qualificação (Doutorando em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.

Qualificações de Mestrado
1.
DeMarco, Ricardo; UYEMURA, S. A.; GARBELLINI, C. P. A.. Participação em banca de Iara Aimê Cardoso. Caracterização estrutural e bioquimicada enzima fumarato hidratase de Schistosoma mansoni. 2018. Exame de qualificação (Mestrando em Ciências Farmacêuticas) - Universidade de São Paulo.

2.
BORRA, R. C.; DeMarco, Ricardo. Participação em banca de Ana Carolina Maragno Fattori. Efeito da imunização com adenosina kinase (AK) e hipoxantina-guanina fosforibosiltransferase (HGPRT) recombinantes de Schistosoma mansoni e analise proteômica dos parasitos: controle da infecção murina. 2015. Exame de qualificação (Mestrando em Genética Evolutiva e biologia molecular) - Universidade Federal de São Carlos.

3.
DeMarco, Ricardo; FUENTES, A. S. C.. Participação em banca de Camila Zanolo Bragatto. Mapeamento fisico de introgressões de kDNA no genoma humano. 2015. Exame de qualificação (Mestrando em Genética Evolutiva e biologia molecular) - Universidade Federal de São Carlos.

4.
NAKAYA, H. I.; DeMarco, R.; BARREIRA, J.. Participação em banca de Bruno Ferreira de Souza. Estudo dos genes de microexons de Schistosoma mansoni. 2015. Exame de qualificação (Mestrando em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

5.
BUZALAF, M. A. R.; DeMarco, Ricardo. Participação em banca de Patty Karina dos Santos. Proteoma da peçonha de Lachesis muta rhombeata. 2012. Exame de qualificação (Mestrando em Genética Evolutiva e biologia molecular) - Universidade Federal de São Carlos.

6.
SILVA, F. H.; DeMarco, Ricardo. Participação em banca de Carolina Moreto Carnielli. Analise proteomica diferencial de proteinas calulares de superficie marcadas com fulorescência (2D-DIGE) dos tipos A e B de Xanthomonas sp em interação com citros-hospedeiros. 2012. Exame de qualificação (Mestrando em Genética Evolutiva e biologia molecular) - Universidade Federal de São Carlos.

7.
DeMarco, Ricardo; KISHI, L. T.. Participação em banca de Victor Borges Rezende. Comparação de transcriptomas de proxima geração da cabeça de Anastrepha fraterculus e perfis de expressão gênica entre os sexos. 2012. Exame de qualificação (Mestrando em Genética Evolutiva e biologia molecular) - Universidade Federal de São Carlos.



Participação em bancas de comissões julgadoras
Concurso público
1.
DeMarco, Ricardo; BOSSOLAN, N. R. S.; CAMARGO, I. L. B. C.. Concurso Público - BIÓLOGO - Edital IFSC-26/2011. 2012. Universidade de São Paulo.



Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
XL Annual Meeting of the Brazilian society for Biochemistry and Molecular Biology. Pos-genomic challenges. 2011. (Congresso).

2.
55o Congresso Brasileiro de Genetica. Elementos de transposição e sua relação com os genomas de celulas eucarioticas. 2009. (Congresso).

3.
Biologia do Schistosoma mansoni: do laboratório à pesquisa clínica.Use of microarrays to explore the Schistosoma mansoni transcriptome. 2008. (Simpósio).

4.
XXXIII Reunião anual da Sociedade brasileira de Bioquimica e Biologia molecular. XXXIII Reunião anual da Sociedade brasileira de Bioquimica e Biologia molecular. 2004. (Congresso).

5.
Reunião anual da Sociedade brasileira de Bioquimica e Biologia molecular. XXXII Reunião anual da Sociedade brasileira de Bioquimica e Biologia molecular. 2003. (Congresso).

6.
S. mansoni Genome Network Meeting.S. mansoni Genome Network Meeting. 2002. (Encontro).

7.
XXXI Reunião anual da Sociedade brasileira de Bioquimica e Biologia molecular. XXXI Reunião anual da Sociedade brasileira de Bioquimica e Biologia molecular. 2002. (Congresso).

8.
Brasilian International Genome Conference. Brasilian International Genome Conference. 2001. (Congresso).

9.
XXX Reunião anual da Sociedade brasileira de Bioquimica e Biologia molecular. XXX Reunião anual da Sociedade brasileira de Bioquimica e Biologia molecular. 2001. (Congresso).

10.
XXIX Reunião anual da Sociedade brasileira de Bioquimica e Biologia molecular. XXIX Reunião anual da Sociedade brasileira de Bioquimica e Biologia molecular. 2000. (Congresso).

11.
XXVII Reunião anual da Sociedade brasileira de Bioquimica e Biologia molecular. XXVII Reunião anual da Sociedade brasileira de Bioquimica e Biologia molecular. 1999. (Congresso).



Orientações



Orientações e supervisões em andamento
Dissertação de mestrado
1.
Luiza Zuvanov de Faria. Caracterização e abordagem evolutiva de micro-introns em Schistosoma mansoni. Início: 2018. Dissertação (Mestrado em fisica aplicada (Biomolecular)) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. (Orientador).

2.
Diogo Maciel Duarte da Mota. Análise evolutiva e estrutural de éxons pertencentes aos genes associados à Diabetes Mellitus tipo 2. Início: 2017. Dissertação (Mestrado em Fisica aplicada (biomolecular)) - Instituto de Fisica de São Carlos- USP. (Orientador).


Orientações e supervisões concluídas
Dissertação de mestrado
1.
Ana Paula Felizatti. MEGs de S. mansoni contendo hélices anfipáticas: caracterização da interação com bicamadas lipídicas. 2017. Dissertação (Mestrado em Fisica aplicada (biomolecular)) - Instituto de Fisica de São Carlos- USP, . Orientador: Ricardo De Marco.

2.
Nátália Oliveira Alves. Estudos estruturais e ensaios biológicos de proteínas codificadas pro genes de micro-exon (MEG) de Schistosoma mansoni. 2014. Dissertação (Mestrado em Genética Evolutiva e biologia molecular) - Centro de Ciências Biológicas e da Saúde da UFSCAR, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Ricardo De Marco.

3.
Camila Macêdo Ribeiro. Estudo proteômico de vermes adultos machos e fêmeas de Schistosoma mansoni. 2011. Dissertação (Mestrado em Fisica Aplicada- Biomolecular) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Ricardo De Marco.

Tese de doutorado
1.
Debora Orcia. Estudo da estrutura e parceiros proteicos de proteínas codificadas por genes de micro-exons de Schistosoma mansoni. 2015. Tese (Doutorado em Fisica aplicada (biomolecular)) - Instituto de Fisica de São Carlos- USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Ricardo De Marco.

2.
Gisele Strieder Philippsen. Estudo da influência de elementos transponíveis nos genomas das algas C. reinhardtii e V. carteri. 2014. Tese (Doutorado em fisica aplicada (computacional)) - Instituto de Física de São Carlos, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Ricardo De Marco.

3.
Daniele Santini Jacinto. Estudo comparativo da arquitetura dos genômas de Schistosoma mansoni e Schistosoma japonicum utilizando recursos bioinformaticos. 2014. Tese (Doutorado em Fisica aplicada (biomolecular)) - Instituto de Física de São Carlos, . Orientador: Ricardo De Marco.

4.
Ana Eliza Zeraik. Caracterização estrutural e funcional de septinas de Schistosoma mansoni. 2013. Tese (Doutorado em Fisica aplicada (biomolecular)) - Instituto de Física de São Carlos, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Ricardo De Marco.

Supervisão de pós-doutorado
1.
Ana Eliza Zeraik. Estudo da correlação entre a dinâmica de septinas e a homeostase de Ca2+ em células musculares de Schistosoma mansoni. 2016. Instituto de Fisica de São Carlos- USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Ricardo De Marco.

Iniciação científica
1.
Marina Gabriel Fontes. Estudos biofísicos da septina SmSEPT10G de Schistosoma mansoni na presença forchlorfenuron, composto que afeta a dinâmica de septinas. 2015. Iniciação Científica - Instituto de Fisica de São Carlos- USP, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Ricardo De Marco.

2.
Clarissa Romano dos Santos. IDENTIFICAÇÃO DE INTERAÇÕES PROTÉICAS ENTRE O PRODUTO PROTÉICO DE MEG14 (GENE DE MICRO-EXONS) DE Schistosoma mansoni E PROTEÍNAS LEUCOCITÁRIAS HUMANAS. 2011. Iniciação Científica - Instituto de Física de São Carlos, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Ricardo De Marco.

3.
Yuri Volpato Santos. Clonagem, Expressão e Estudos Estruturais de Septinas de Schistosoma mansoni. 2011. Iniciação Científica - Instituto de Física de São Carlos, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Ricardo De Marco.

4.
Debora Orcia. Estudo de splicing diferencial de transcritos do Schistosoma mansoni. 2010. Iniciação Científica - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Ricardo De Marco.

5.
Heloisa Muniz. Estudo de um novo transposon do parasita Schistosoma mansoni pertencente à família Mu. 2010. Iniciação Científica. (Graduando em Ciencias fisicas e biomoleculares) - Instituto de Fisica de São Carlos- USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Ricardo De Marco.

6.
Amanda Souza Câmara. Clonagem e expressão em sistema heterologo de proteínas secretadas do Schistosoma mansoni. 2009. Iniciação Científica - Universidade de São Paulo. Orientador: Ricardo De Marco.

7.
Luciano Censoni. Analise bioinformatica de transposons do Schistosoma mansoni. 2008. Iniciação Científica - Universidade de São Paulo. Orientador: Ricardo De Marco.

8.
Atilio Tomazini junior. Expressão e caracterização de apirases de S. mansoni. 2008. Iniciação Científica - Universidade de São Paulo. Orientador: Ricardo De Marco.

Orientações de outra natureza
1.
Patricia Fernandes Matheus. Atividades de apoio de extração de RNA, clongaem e seqüenciamento de transcritos. 2011. Orientação de outra natureza - Instituto de Fisica de São Carlos- USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Ricardo De Marco.



Inovação



Projetos de pesquisa



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