José Salvatore Leister Patané

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  • Última atualização do currículo em 24/09/2018


Graduado em Ciências Biológicas pela Universidade de São Paulo (USP), com Mestrado no Departamento de Genética e Biologia Evolutiva da USP (Genética de Populações de moscas-das-frutas da espécie Anastrepha fraterculus), Doutorado no mesmo departamento da USP (Filogenética, Evolução e Biogeografia das espécies de tucanos, gênero Ramphastos). Pós-Doutorados concluídos no Laboratório de Ecologia e Evolução do Instituto Butantan (Filogeografia de populações de Bothrops jararaca), Laboratório de Bioinformática do Depto. de Bioquímica do IQ-USP (Filogenética e Filogeografia de linhagens patogênicas de bactérias), e no Computational Biology Institute da George Washington University em Washington, D.C., EUA (Metagenômica na comparação taxonômica e funcional em Meleagris gallopavo doentes e saudáveis). Foi pesquisador colaborador do Laboratório de Parasitologia do Instituto Butantan entre Fev-Set 2014. Atualmente realiza Pós-Doutoramento (Genômica Comparativa de linhagens patogênicas) no Lab. de Bioinformática do Depto. de Bioquímica do IQ-USP (Setulab). Tem experiência nas áreas de Bioinformática, Metagenômica, Genética e Evolução (ênfase em Filogenômica, Filogeografia, e Evolução Molecular). (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
José Salvatore Leister Patané
Nome em citações bibliográficas
PATANÉ, J.S.L.;Patané, José S.L.;Patane, J. S. L., Patane, JSL;PATANE, JOSÉ S. L.;PATANÉ, JOSÉ;PATANÉ, JOSÉS L.;PATANÉ, JOSÉ S. L.;PATANÉ, JOSÉ SALVATORE LEISTER

Endereço


Endereço Profissional
Laboratório de Bioinformática, Departamento de Bioquímica, IQ-USP.
Avenida Professor Lineu Prestes
Butantã
05508000 - São Paulo, SP - Brasil
Telefone: (11) 30919162


Formação acadêmica/titulação


2002 - 2007
Doutorado em Ciências Biológicas (Biologia Genética).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
com período sanduíche em Field Museum of Natural History (Orientador: John M. Bates).
Título: Filogenia molecular e biogeografia das espécies e subespécies do gênero Ramphastos (Piciformes: Ramphastidae), Ano de obtenção: 2007.
Orientador: Anita Wajntal.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
Palavras-chave: Ramphastos; Filogenia; Evolução molecular.
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Animal / Especialidade: Evolução Molecular.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Zoologia / Subárea: Taxonomia dos Grupos Recentes.
1997 - 2001
Mestrado em Ciências Biológicas (Biologia Genética).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: Avaliação do emprego da técnica ISSR (Inter-Simple Sequence Repeat) em Anastrepa fraterculus (Diptera: Tephritidae).,Ano de Obtenção: 2001.
Orientador: Sergio Russo Matioli.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
Palavras-chave: ISSR; Anastrepha; Índice de similaridade.
1992 - 1996
Graduação em Ciências Biológicas.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: Aplicação da técnica DS-PCR (Double-Stringency Polymerase Chain Reaction) em Anastrepha spp..
Orientador: Sergio Russo Matioli.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.


Pós-doutorado


2018
Pós-Doutorado.
Laboratório de Bioinformática, SETULAB, Brasil.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
Grande área: Ciências Biológicas
2017 - 2017
Pós-Doutorado.
Computational Biology Institute, CBI, Estados Unidos.
Grande área: Ciências Biológicas
2014 - 2016
Pós-Doutorado.
Laboratório de Bioinformática, SETULAB, Brasil.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
Grande área: Ciências Biológicas
2009 - 2014
Pós-Doutorado.
Instituto Butantan, IBU, Brasil.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: GENÉTICA DE POPULAÇÕES.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Animal.


Formação Complementar


2016 - 2016
SSB Phylogenetics Symposium + SSB Software School. (Carga horária: 14h).
University of Texas at Austin, UT Austin, Estados Unidos.
2014 - 2014
Análise Bioinformática de Dados de RNA/DNA-seq. (Carga horária: 40h).
Laboratório Central de Tecnologias de Alto Desempenho em Ciências da Vida, LACTAD, Brasil.
2011 - 2011
Workshop on molecular evolution - Europe. (Carga horária: 80h).
Workshop on Molecular Evolution, WME, República Tcheca.
2011 - 2011
Synth. datab. fossil calib.:div. dating and beyond. (Carga horária: 24h).
National Evolutionary Synthesis Center, NESCENT, Estados Unidos.
2010 - 2010
São Paulo Open Science Grid school. (Carga horária: 40h).
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.
2010 - 2010
Aplicações e impacto do sequenc. de nova geração. (Carga horária: 6h).
56o Congresso Brasileiro de Genética, 56O CBG, Brasil.
2010 - 2010
Desc. recentes e perspect. em Bioinf. e Genômica. (Carga horária: 8h).
Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.
2010 - 2010
DNAs satélites: muito mais que mais do mesmo. (Carga horária: 4h).
56o Congresso Brasileiro de Genética, 56O CBG, Brasil.
2010 - 2010
International Symposium on Phylogeography. (Carga horária: 16h).
Faculdade de Economia, Administração e Contabilidade - USP, FEAC/USP, Brasil.
2008 - 2008
Computational Phyloinformatics. (Carga horária: 54h).
National Evolutionary Synthesis Center, NESCENT, Estados Unidos.
2008 - 2008
Origens da Vida. (Carga horária: 18h).
Faculdade de Arquitetura e Urbanismo, FAU, Brasil.
2004 - 2004
Introdução à Sistemática Filogenética de Aves. (Carga horária: 8h).
XII Congresso Brasileiro de Ornitologia, XII CBO, Brasil.
2004 - 2004
Evolution, Phylogeography and Conservation. (Carga horária: 10h).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
2004 - 2004
Evol. Genet., Comparative Biol. and Morphol. Evol.. (Carga horária: 10h).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
2004 - 2004
Biometr. Marcadores Genét. Aplicados à Gen. Pop.. (Carga horária: 3h).
50o Congresso Brasileiro de Genética, 50O CBG, Brasil.
2003 - 2003
Filog. Moleculares e Conservação da Biodiversidade. (Carga horária: 3h).
49o Congresso Nacional de Genética, 49O CNG, Brasil.
2003 - 2003
Métodos de Análise Filogenética. (Carga horária: 3h).
49o Congresso Nacional de Genética, 49O CNG, Brasil.
1998 - 1998
Tecnologia do DNA Recombinante. (Carga horária: 4h).
Instituto de Biociências - USP, IB-USP, Brasil.
1998 - 1998
Evolução e Filogenias Moleculares. (Carga horária: 4h).
Instituto de Biociências - USP, IB-USP, Brasil.
1997 - 1997
Inter-taxonomic comparisons in biology. (Carga horária: 8h).
Instituto de Biociências - USP, IB-USP, Brasil.


Atuação Profissional



George Washington University, GWU, Estados Unidos.
Vínculo institucional

2017 - 2017
Vínculo: Pós-Doutorando, Enquadramento Funcional: Põs-Doutorando, Carga horária: 40


Instituto Butantan, IBU, Brasil.
Vínculo institucional

2014 - 2014
Vínculo: Pesquisador colaborador, Enquadramento Funcional: Pesquisador colaborador, Carga horária: 40
Outras informações
Genética de populações e Filogeografia de linhagens de mosquitos do gênero Anopheles (Diptera: Culicidae).

Vínculo institucional

2009 - 2014
Vínculo: Bolsista recém-doutor, Enquadramento Funcional: Pós-Doutorando, Carga horária: 40
Outras informações
Pos-Doutorado voltado à análise filogeográfica de populações de Bothrops jararaca (Serpentes:Viperidae), a partir de marcadores moleculares e mitocondriais.


Instituto de Química - USP, IQ-USP, Brasil.
Vínculo institucional

2018 - Atual
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pós-Doutorando, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Vínculo institucional

2014 - 2016
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pós-Doutorando, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.



Projetos de pesquisa


2017 - 2017
Metagenômica de indivíduos saudáveis e doentes da espécie Meleagris gallopavo
Descrição: Pós-Doutorado.
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
2014 - Atual
Filogenômica de bactérias patogênicas
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2009 - 2014
Filogeografia de populações de Bothrops jararaca (Serpentes: Viperidae) continentais e formas insulares, baseada em marcadores nucleares e mitocondriais
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.


Revisor de periódico


2011 - 2011
Periódico: Genetics and Molecular Biology (Impresso)
2016 - 2016
Periódico: BMC Bioinformatics
2016 - 2016
Periódico: BMC Bioinformatics
2015 - 2015
Periódico: BMC Bioinformatics
2015 - 2015
Periódico: BMC Bioinformatics
2015 - Atual
Periódico: BMC Bioinformatics
2015 - 2015
Periódico: RECOMB
2015 - 2015
Periódico: International Symposium on Bioinformatics Research and Applications
2015 - 2015
Periódico: Brazilian Journal of Biology (Impresso)
2018 - 2018
Periódico: FRONTIERS IN VETERINARY SCIENCE
2018 - 2018
Periódico: PLoS One
2018 - 2018
Periódico: MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Animal/Especialidade: Evolução Molecular.
2.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Animal/Especialidade: Sistemática Filogenética.
3.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Filogeografia.
4.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Bioinformática.
5.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação/Especialidade: Linguagens de Programação.


Idiomas


Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Italiano
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.
Espanhol
Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Pouco.


Produções



Produção bibliográfica
Artigos completos publicados em periódicos

1.
2TEIXEIRA, M.M.2017TEIXEIRA, M.M. MORENO, L.F. STIELOW, B.J. MUSZEWSKA, A. HAINAUT, M. GONZAGA, L. ABOUELLEIL, A. PATANÉ, J.S.L. PRIEST, M. SOUZA, R. YOUNG, S. FERREIRA, K.S. ZENG, Q. DA CUNHA, M.M.L. GLADKI, A. BARKER, B. VICENTE, V.A. DE SOUZA, E.M. ALMEIDA, S. HENRISSAT, B. VASCONCELOS, A.T.R. DENG, S. VOGLMAYR, H. MOUSSA, T.A.A. GORBUSHINA, A. , et al.FELIPE, M.S.S. CUOMO, C.A. SYBREN DE HOOG, G. ; Exploring the genomic diversity of black yeasts and relatives (Chaetothyriales, Ascomycota). STUDIES IN MYCOLOGY, v. 1, p. 1, 2017.

2.
1PATANÉ, JOSÉ S. L.2017PATANÉ, JOSÉ S. L.; MARTINS, JOAQUIM ; BEATRIZ CASTELÃO, ANA ; NISHIBE, CHRISTIANE ; MONTERA, LUCIANA ; BIGI, FABIANA ; ZUMÁRRAGA, MARTIN J. ; CATALDI, ANGEL A. ; FONSECA JUNIOR, ANTÔNIO ; ROXO, ELIANA ; LUIZA, ANA ; OSÓRIO, A. R. ; JORGE (UFMS), KLÁUDIA S. ; THACKER, TYLER C. ; ALMEIDA, NALVO F. ; ARAÚJO, FLABIO R. ; SETUBAL, JOÃO C. . Patterns and processes of Mycobacterium bovis evolution revealed by phylogenomic analyses. Genome Biology and Evolution, v. 1, p. 1, 2017.

3.
LANDULFO, GABRIEL ALVES2017LANDULFO, GABRIEL ALVES ; PATANÉ, JOSÉ SALVATORE LEISTER ; SILVA, DALTON GIOVANNI NOGUEIRA DA ; JUNQUEIRA-DE-AZEVEDO, INÁCIO LOIOLA MEIRELLES ; MENDONCA, RONALDO ZUCATELLI ; SIMONS, SIMONE MICHAELA ; CARVALHO, ENEAS DE ; BARROS-BATTESTI, DARCI MORAES . Gut transcriptome analysis on females of Ornithodoros mimon (Acari: Argasidae) and phylogenetic inference of ticks. REVISTA BRASILEIRA DE PARASITOLOGIA VETERINARIA, v. 26, p. 185-204, 2017.

4.
ASSIS, RENATA DE A. B.2017ASSIS, RENATA DE A. B. ; POLLONI, LORRAINE CRISTINA ; PATANÉ, JOSÉ S. L. ; THAKUR, SHALABH ; FELESTRINO, ÉRICA B. ; DIAZ-CABALLERO, JULIO ; DIGIAMPIETRI, LUCIANO ANTONIO ; GOULART, LUIZ RICARDO ; ALMEIDA, NALVO F. ; NASCIMENTO, RAFAEL ; DANDEKAR, ABHAYA M. ; ZAINI, PAULO A. ; SETUBAL, JOÃO C. ; GUTTMAN, DAVID S. ; MOREIRA, LEANDRO MARCIO . Identification and analysis of seven effector protein families with different adaptive and evolutionary histories in plant-associated members of the Xanthomonadaceae. Scientific Reports, v. 7, p. 16133, 2017.

5.
4TEIXEIRA, MARCUS DE M.2016TEIXEIRA, MARCUS DE M. ; PATANÉ, JOSÉ S. L. ; TAYLOR, MARIA L. ; GÓMEZ, BEATRIZ L. ; THEODORO, RAQUEL C. ; DE HOOG, SYBREN ; ENGELTHALER, DAVID M. ; ZANCOPÉ-OLIVEIRA, ROSELY M. ; FELIPE, MARIA S. S. ; BARKER, BRIDGET M. . Worldwide Phylogenetic Distributions and Population Dynamics of the Genus Histoplasma. PLoS Neglected Tropical Diseases (Online), v. 10, p. e0004732, 2016.

6.
3FUZITA, FELIPE J.2016FUZITA, FELIPE J. ; PINKSE, MARTIJN W. H. ; PATANE, JOSÉ S. L. ; VERHAERT, PETER D. E. M. ; LOPES, ADRIANA R. . High throughput techniques to reveal the molecular physiology and evolution of digestion in spiders. BMC Genomics, v. 17, p. 716, 2016.

7.
5FUZITA, FELIPE J.2015FUZITA, FELIPE J. ; PINKSE, MARTIJN W. H. ; PATANE, JOSÉ S. L. ; JULIANO, MARIA A. ; VERHAERT, PETER D. E. M. ; LOPES, ADRIANA R. . Biochemical, Transcriptomic and Proteomic Analyses of Digestion in the Scorpion Tityus serrulatus: Insights into Function and Evolution of Digestion in an Ancient Arthropod. Plos One, v. 10, p. e0123841, 2015.

8.
7SCHWARTZ, ALLISON R.2015SCHWARTZ, ALLISON R. ; POTNIS, NEHA ; TIMILSINA, SUJAN ; WILSON, MARK ; PATANÉ, JOSÉ ; MARTINS, JOAQUIM ; MINSAVAGE, GERALD V. ; DAHLBECK, DOUGLAS ; AKHUNOVA, ALINA ; ALMEIDA, NALVO ; VALLAD, GARY E. ; BARAK, JERI D. ; WHITE, FRANK F. ; MILLER, SALLY A. ; RITCHIE, DAVID ; GOSS, ERICA ; BART, REBECCA S. ; SETUBAL, JOÃO C. ; JONES, JEFFREY B. ; STASKAWICZ, BRIAN J. . Phylogenomics of Xanthomonas field strains infecting pepper and tomato reveals diversity in effector repertoires and identifies determinants of host specificity. Frontiers in Microbiology (Online), v. 6, p. 1, 2015.

9.
8KSEPKA, DANIEL T.2015KSEPKA, DANIEL T. ; PARHAM, JAMES F. ; ALLMAN, JAMES F. ; BENTON, MICHAEL J. ; CARRANO, MATTHEW T. ; CRANSTON, KAREN A. ; DONOGHUE, PHILIP C. J. ; HEAD, JASON J. ; HERMSEN, ELIZABETH J. ; IRMIS, RANDALL B. ; JOYCE, WALTER G. ; KOHLI, MANPREET ; LAMM, KRISTIN D. ; LEEHR, DAN ; PATANÉ, JOSÉS L. ; POLLY, P. DAVID ; PHILLIPS, MATTHEW J. ; SMITH, N. ADAM ; SMITH, NATHAN D. ; VAN TUINEN, MARCEL ; WARE, JESSICA L. ; WARNOCK, RACHEL C. M. . The Fossil Calibration Database-A New Resource for Divergence Dating. Systematic Biology (Philadelphia. Print), v. 64, p. syv025, 2015.

10.
6LORENZ, CAMILA2015LORENZ, CAMILA ; Patané, José S.L. ; SUESDEK, LINCOLN . Morphogenetic characterisation, date of divergence, and evolutionary relationships of malaria vectors Anopheles cruzii and Anopheles homunculus. Infection, Genetics and Evolution (Print), v. 1, p. 1, 2015.

11.
9LUTZ, HOLLY L.2013LUTZ, HOLLY L. ; Weckstein, Jason D. ; Patané, José S.L. ; Bates, John M. ; Aleixo, Alexandre . Biogeography and spatio-temporal diversification of Selenidera and Andigena Toucans (Aves: Ramphastidae). Molecular Phylogenetics and Evolution (Print), v. x, p. x-0, 2013.

12.
12Patel, Swati2011Patel, Swati ; Weckstein, Jason D. ; Patané, José S.L. ; Bates, John M. ; Aleixo, Alexandre . Temporal and spatial diversification of Pteroglossus araçaris (AVES: Ramphastidae) in the neotropics: Constant rate of diversification does not support an increase in radiation during the Pleistocene. Molecular Phylogenetics and Evolution (Print), v. 58, p. 105-115, 2011.

13.
10Parham, J. F.2011 Parham, J. F. ; Donoghue, P. C. J. ; Bell, C. J. ; Calway, T. D. ; Head, J. J. ; Holroyd, P. A. ; Inoue, J. G. ; Irmis, R. B. ; Joyce, W. G. ; Ksepka, D. T. ; Patane, J. S. L. ; Smith, N. D. ; Tarver, J. E. ; Van Tuinen, M. ; Yang, Z. ; Angielczyk, K. D. ; Greenwood, J. M. ; Hipsley, C. A. ; Jacobs, L. ; Makovicky, P. J. ; Muller, J. ; Smith, K. T. ; Theodor, J. M. ; Warnock, R. C. M. ; Benton, M. J. . Best Practices for Justifying Fossil Calibrations. Systematic Biology (Philadelphia. Print), v. -, p. -, 2011.

14.
11Ksepka, D. T.2011 Ksepka, D. T. ; Benton, M. J. ; Carrano, M. T. ; Gandolfo, M. A. ; Head, J. J. ; Hermsen, E. J. ; Joyce, W. G. ; Lamm, K. S. ; Patane, J. S. L. ; Phillips, M. J. ; Polly, P. D. ; Van Tuinen, M. ; Ware, J. L. ; Warnock, R. C. M. ; Parham, J. F. . Synthesizing and databasing fossil calibrations: divergence dating and beyond. Biology Letters (Print), v. 7, p. 801-803, 2011.

15.
13PATANÉ, J.S.L.;Patané, José S.L.;Patane, J. S. L., Patane, JSL;PATANE, JOSÉ S. L.;PATANÉ, JOSÉ;PATANÉ, JOSÉS L.;PATANÉ, JOSÉ S. L.;PATANÉ, JOSÉ SALVATORE LEISTER2009 PATANÉ, J.S.L.; Weckstein, Jason D. ; Aleixo, Alexandre ; Bates, John M. . Evolutionary history of Ramphastos toucans: molecular phylogenetics, temporal diversification, and biogeography. Molecular Phylogenetics and Evolution, p. -, 2009.

Capítulos de livros publicados
1.
PATANÉ, JOSÉ S. L.; MARTINS, JOAQUIM ; SETUBAL, JOÃO C. . Phylogenomics. Methods in Molecular Biology. 1ed.: Springer New York, 2018, v. , p. 103-187.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
Almeida, Keila A. ; PATANÉ, J.S.L. ; Silva, M.J.J. . Análises filogenéticas de roedores do gênero Euryoryzomys (Rodentia: Cricetidae) baseadas em sequências do gene mitocondrial citocromo-b. In: 56o Congresso Brasileiro de Genética, 2010, Guarujá. 56o Congresso Brasileiro de Genética, 2010.

2.
PATANÉ, J.S.L.. PEGA - Programa para download e extração de sequências gênicas anotadas do GenBank. In: 56o Congresso Brasileiro de Genética, 2010, Guarujá. 56o Congresso Brasileiro de Genética, 2010.

3.
Weckstein, Jason D. ; Patel, Swati ; Lutz, H. ; PATANÉ, J.S.L. ; Bates, John M. ; Aleixo, Alexandre . Molecular phylogenetics and the pattern and timing of diversification of toucans (Family: Ramphastidae). In: 25th International Ornithological Congress, 2010, Campos do Jordão. 25th International Ornithological Congress, 2010.

4.
PATANÉ, J.S.L.; WAJNTAL, A. . Evolução das espécies do gênero Ramphastos (Aves: Piciformes) a partir de sequências de DNA mitocondrial. In: XII Congresso Brasileiro de Ornitologia, 2004, Blumenau, SC. XII Congresso Brasileiro de Ornitologia, 2004.

5.
PATANÉ, J.S.L.; WAJNTAL, A. . Filogenia preliminar do gênero Ramphastos baseada em seqüências da região controladora e do 12S mitocondriais. In: 50º Congresso Brasileiro de Genética, 2004, Florianópolis - SC. 50º Congresso Brasileiro de Genética, 2004.

6.
PATANÉ, J.S.L.; WAJNTAL, A. . Análise filogenética preliminar de espécies do gênero Ramphastos (Aves: Piciformes: Ramphastidae) baseada em um fragmento de 387pb do gene mitocondrial 12S. In: 49º Congresso Brasileiro de Genética, 2003, Águas de Lindóia, SP. 49º Congresso Brasileiro de Genética, 2003.

7.
PATANÉ, J.S.L.; MATIOLI, S. R. . Análise da herança de marcadores ISSR (Inter-Simple Sequence Repeat) em Anastrepha fraterculus (Diptera: Tephritidae). In: 48º Congresso Brasileiro de Genética, 2002, Águas de Lindóia, SP. 48º Congresso Brasileiro de Genética, 2002.

8.
PATANÉ, J.S.L.; MATIOLI, S. R. . Marcadores de microssatélites em Anastrepha spp.. In: 44º Congresso Brasileiro de Genética, 1998, Águas de Lindóia, SP. 44º Congresso Brasileiro de Genética, 1998.

Apresentações de Trabalho
1.
PATANÉ, J. S. L.. The evolutionary path to Xanthomonas citri pathotypes. 2018. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

2.
PATANÉ, J.S.L.. Partenogênese. 2015. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

3.
PATANÉ, J.S.L.. Bioinformatics and genomics research in the Setubal Lab. 2015. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

4.
PATANÉ, J.S.L.. Phylogenomics of pathogenic bacteria: case studies and current advances. 2015. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

5.
PATANÉ, J.S.L.. Genética e evolução molecular. 2013. (Apresentação de Trabalho/Outra).

6.
PATANÉ, J.S.L.. Métodos de análise filogenética. 2013. (Apresentação de Trabalho/Outra).

7.
Patané, José S.L.. Diversificação genética de populações de Bothrops jararaca. 2012. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

8.
Patané, José S.L.. Introdução à análise filogenética envolvendo muitos táxons. 2012. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

9.
Patané, José S.L.. Relações filogenéticas profundas em aves, baseadas no maior número possível de táxons e genes. 2011. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

10.
PATANÉ, J.S.L.. Filogenia e Filogeografia: avanços e perspectivas. 2011. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

11.
PATANÉ, J.S.L.. Histórico, avanços e perspectivas em Filogeografia. 2011. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

12.
PATANÉ, J. S. L.; Ferrarezzi, H. . Supermatrix, Supertrees, and individual gene phylogenetic analyses in assessing deep avian phylogeny. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

13.
PATANÉ, J.S.L.. Métodos de Reconstrução Filogenética. 2009. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

14.
Patané, José S.L.. Filogeografia de populações de Bothrops jararaca (Serpentes: Viperidae) continentais e formas insulares associadas, baseadas em marcadores microssatélites. 2009. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

15.
PATANÉ, J. S. L.. Uso do software BEAST para inferência de datações filogenéticas. 2009. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

16.
PATANÉ, J. S. L.. Aspectos de Evolução Molecular. 2009. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

17.
PATANÉ, J. S. L.. Evolução Molecular Biológica. 2009. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

18.
PATANÉ, J.S.L.. Evolução Molecular. 2008. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

19.
PATANÉ, J.S.L.; WECKSTEIN, J. D. ; ALEIXO, A. ; WAJNTAL, A. . Phylogenetic and biogeographic aspects of toucans of the genus Ramphastos (Piciformes: Ramphastidae). 2007. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

20.
PATANÉ, J.S.L.; WECKSTEIN, J. D. ; WAJNTAL, A. . Filogenias moleculares e distâncias genéticas indicam ausência de diferenciação genética entre 2 subespécies de R. vitellinus ssp. e de R. tucanus ssp.. 2006. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

21.
PATANÉ, J.S.L.; TAKATA, R. . Ciências Biológicas. 2006. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

Outras produções bibliográficas
1.
PATANÉ, J.S.L.. Filogenia Molecular e Biogeografia das Espécies e Subespécies do Gênero Ramphastos (Piciformes: Ramphastidae) 2007 (Tese de Doutorado).

2.
PATANÉ, J.S.L.. Avaliação do emprego da técnica ISSR (Inter-Simple Sequence Repeat) em Anastrepha fraterculus (Diptera: Tephritidae) 2001 (Dissertação de Mestrado).


Produção técnica
Programas de computador sem registro
1.
PEGA 1.0 - Program for Extraction of GenBank Annotated sequences. 2010.


Demais tipos de produção técnica
1.
PATANÉ, J.S.L.. Datando evolução de filogenias com o software BEAST. 2014. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

2.
PATANÉ, J.S.L.. Análise Filogenética Computacional. 2013. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

3.
PATANÉ, J. S. L.. Análise Filogenética Computacional. 2013. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

4.
Patané, José S.L.. Filogeografia: detectando processos e padrões. 2012. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

5.
Patané, José S.L.. Análise filogenética envolvendo milhares de táxons. 2012. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

6.
PATANÉ, J.S.L.. Filogeografia: detectando processos e padrões. 2012. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

7.
PATANÉ, J.S.L.. Análise filogenética envolvendo milhares de táxons. 2012. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

8.
PATANÉ, J. S. L.. Decifrando a árvore da vida: algumas aplicações práticas da filogenética. 2009. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

9.
PATANÉ, J.S.L.. Decifrando a árvore da vida: algumas aplicações práticas da filogenética. 2009. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).



Bancas



Participação em bancas de trabalhos de conclusão
Mestrado
1.
Sílvia Nassif Del Lama; Érika Martins Braga.; PATANÉ, J.S.L.. Participação em banca de Cynthia Martins Villar. Prevalência e identificação de linhagens de hemoparasitas em populações brasileiras e africanas de Bubulcus ibis (Ardeidae, Pelecaniformes, Aves). 2013. Dissertação (Mestrado em Genética Evolutiva e Biologia Molecular) - Universidade Federal de São Carlos.

2.
Alexandre Luís Padovan Aleixo; Fernando Jorge Guimarães Sequeira; Luciano Nicolás Naka; PATANÉ, J. S. L.. Participação em banca de LUCAS EDUARDO ARAÚJO SILVA. Filogeografia de Phaethornis bourcieri (Aves: Trochilidae): implicações taxonômicas e biogeográficas. 2012. Dissertação (Mestrado em Zoologia) - Museu Paraense Emílio Goeldi.

Teses de doutorado
1.
BRITO, R. A.; PATANÉ, J. S. L.; SOLFERINI, V.; MORAES, E. M.; FREIRE, C.. Participação em banca de Carlos Congrains Castillo. Padrões evolutivos inferidos por transcriptomas de moscas-das-frutas do gênero Anastrepha (Diptera: Tephritidae). 2017. Tese (Doutorado em Genética e Evolução) - Universidade Federal de São Carlos.

2.
SANTOS, S. M. A.; MESS, A. M.; MARQUES, O. A. V.; NOGUEIRA, C. C.; IANNINI, C. A. N.; PATANÉ, J.S.L.. Participação em banca de Henrique Bartolomeu Pereira Braz. Evolução da viviparidade nas serpentes da tribo Hydropsini. 2013 - Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia.




Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
60º Congresso Brasileiro de Genética. Datando evolução de filogenias com o software BEAST. 2014. (Congresso).

2.
56o Congresso Brasileiro de Genética. PEGA - Programa para download e extração de sequências gênicas anotadas do GenBank. 2011. (Congresso).

3.
NESCent Working Group on Fossil Calibrations.Synthesizing and databasing fossil calibrations: divergence dating and beyond. 2011. (Encontro).

4.
25th International Ornithological Congress. Supermatrix, Supertrees, and individual gene phylogenetic analyses in assessing deep avian phylogeny. 2010. (Congresso).

5.
Descobertas recentes e perspectivas em Bioinformática e da Genômica: uma tripla comemoração. 2010. (Simpósio).

6.
XI Semana da Biologia.Aspectos de Evolução Molecular. 2009. (Encontro).

7.
X São Paulo Research Conference (Origens da Vida). 2008. (Simpósio).

8.
VIII Neotropical Ornithological Congress. Phylogenetic and biogeographic aspects of toucans of the genus Ramphastos (Piciformes: Ramphastidae). 2007. (Congresso).

9.
XIV Congresso Brasileiro de Ornitologia. Filogenias moleculares e distâncias genéticas indicam ausência de diferenciação entre 2 subespécies de R. vitellinus spp. e de R. tucanus ssp.. 2006. (Congresso).

10.
50º Congresso Brasileiro de Genética. Filogenia preliminar do gênero Ramphastos baseada em seqüências da região controladora e do 12S mitocondriais. 2004. (Congresso).

11.
Conferências André Dreyfus - 2004. 2004. (Seminário).

12.
XII Congresso Brasileiro de Ornitologia. Evolução das espécies do gênero Ramphastos (Aves: Piciformes) a partir de sequências de DNA mitocondrial. 2004. (Congresso).

13.
49º Congresso Brasileiro de Genética. Análise filogenética preliminar de espécies do gênero Ramphastos (Aves: Piciformes: Ramphastidae) baseada em um fragmento de 387pb do gene mitocondrial 12S. 2003. (Congresso).

14.
48º Congresso Brasileiro de Genética. Análise da herança de marcadores ISSR (Inter-Simple Sequence Repeat) em Anastrepha fraterculus. 2002. (Congresso).

15.
I Simpósio de Genética de Aves Neotropicais. 2002. (Simpósio).

16.
44º Congresso Brasileiro de Genética. Marcadores de microssatélites em Anastrepha spp.. 1998. (Congresso).

17.
Evolução e filogenias moleculares. 1998. (Simpósio).

18.
I Semana Temática do Instituto de Biociências da USP. 1998. (Simpósio).

19.
Conferências André Dreyfus sobre Evolução. 1997. (Simpósio).


Organização de eventos, congressos, exposições e feiras
1.
PATANÉ, J.S.L.. Prokaryote comparative genomics, phylogenetics, and evolution. 2015. (Congresso).

2.
PATANÉ, J.S.L.. Curso "Análise Filogenética Computacional". 2013. (Outro).

3.
PATANÉ, J.S.L.. Organização dos seminários apresentados no Laboratório de Ecologia e Evolução, Instituto Butantan. 2011. (Outro).



Educação e Popularização de C & T



Cursos de curta duração ministrados
1.
PATANÉ, J.S.L.. Datando evolução de filogenias com o software BEAST. 2014. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

2.
PATANÉ, J.S.L.. Análise Filogenética Computacional. 2013. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

3.
PATANÉ, J.S.L.. Filogeografia: detectando processos e padrões. 2012. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

4.
PATANÉ, J.S.L.. Análise filogenética envolvendo milhares de táxons. 2012. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

5.
PATANÉ, J.S.L.. Decifrando a árvore da vida: algumas aplicações práticas da filogenética. 2009. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).


Organização de eventos, congressos, exposições e feiras
1.
PATANÉ, J.S.L.. Prokaryote comparative genomics, phylogenetics, and evolution. 2015. (Congresso).

2.
PATANÉ, J.S.L.. Organização dos seminários apresentados no Laboratório de Ecologia e Evolução, Instituto Butantan. 2011. (Outro).




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