Cristiane de Souza Rocha

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  • Última atualização do currículo em 11/12/2017


Possui graduação em Curso Superior de Tecnologia em Informática pela Universidade Estadual de Campinas (2006) e doutorado em Fisiopatologia Medica pela Universidade Estadual de Campinas (2011). Tem experiência na área de Genética, com ênfase em Genética Humana e Médica, atuando principalmente nos seguintes temas:Bioinformática, Next-Generation sequencing, macroarrays, development e arranjos de dna. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Cristiane de Souza Rocha
Nome em citações bibliográficas
ROCHA, C. S.;Rocha, Cristiane;Rocha, Cristiane S.;Rocha, Cristiane de Souza;Cristiane de S. Rocha;Cristiane de Souza Rocha;Rocha, C.D.S.;Rocha, Cristiane de S;Rocha, C.;Rocha, Cristiane de S.;ROCHA, CS;Cristiane de SOUZA ROCHA;DE S. ROCHA, CRISTIANE

Endereço


Endereço Profissional
Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas da UNICAMP.
Rua Tessália Vieira de Camargo
Cidade Universitária
13083-970 - Campinas, SP - Brasil - Caixa-postal: 6010
Telefone: (19) 35219129
URL da Homepage: http://lgm.fcm.unicamp.br:9001/


Formação acadêmica/titulação


2007 - 2011
Doutorado em Fisiopatologia Medica.
Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.
Título: Desenvolvimento de Ferramentas de Bioinformática para Análises de Expressão Gênica em Larga Escala, Ano de obtenção: 2011.
Orientador: Iscia Lopes-Cendes.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
Palavras-chave: análise de dados; DNA arrays; microarray.
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação / Especialidade: Banco de Dados.
Setores de atividade: Desenvolvimento de Programas (Software); Atividades de Banco de Dados.
2001 - 2006
Graduação em Curso Superior de Tecnologia em Informática.
Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.
1994 - 1998
Curso técnico/profissionalizante em Biotecnologia.
Escola Técnica Federal de Química, ETFQ-RJ, Brasil.


Pós-doutorado


2014
Pós-Doutorado.
Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Humana e Médica.
2011 - 2013
Pós-Doutorado.
Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Humana e Médica.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Animal.


Formação Complementar


2013 - 2013
Biological Interpretation of Next-Generation Seque. (Carga horária: 40h).
European Molecular Biology Laboratory, EMBL, Alemanha.
2011 - 2011
Algoritmos e técnicas para montagem de genomas.. (Carga horária: 40h).
Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.
2010 - 2010
Introduction to High Performance Computing. (Carga horária: 30h).
Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.


Atuação Profissional



Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.
Vínculo institucional

2007 - 2011
Vínculo: Aluna de Doutorado, Enquadramento Funcional: Aluna de Doutorado em Fisiopatologia Médica, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Vínculo institucional

2005 - 2007
Vínculo: Bolsa de Capacitação Técnica, Enquadramento Funcional: Bioinformata, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Vínculo institucional

2002 - 2005
Vínculo: Bioinformata, Enquadramento Funcional: Bioinformata, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações
Bolsa de Capacitacao Tecnica

Atividades

08/2005 - Atual
Serviços técnicos especializados , Faculdade de Ciências Médicas da UNICAMP, .

Serviço realizado
Programação para bioinformática; Administração e gerencimento de Banco de dados.
07/2002 - 07/2005
Pesquisa e desenvolvimento , Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética, .



Linhas de pesquisa


1.
Desenvolvimento de ferramentas para análises de expressão de genes


Projetos de pesquisa


2015 - Atual
Brazilian Initiative on Precision Medicine - BIPMed

Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Iscia Teresinha Lopes Cendes em 09/05/2018.
Descrição: Precision Medicine recently emerged as a concept in which scientific knowledge and technology will come together to provide the bases for medicine in the 21st century. It includes translational research, genomic medicine and personalized medicine and proposes a new level of integration of data in order to improve health care. The Brazilian Initiative on Precision Medicine (BIPMed) is an initiative of five Research Innovation and Dissemination Centers (RIDCs) supported by FAPESP.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2012 - Atual
Investigando os mecanismos moleculares da epileptogêngese pela análise de expressão gênica em larga escala

Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Iscia Teresinha Lopes Cendes em 10/05/2013.
Descrição: A análise do perfil de expressão de um tecido fornece informação biológica relevante sobre os mecanismos moleculares intricados potencialmente envolvidos em fenômenos biológicos complexos. O estudo de expressão por sequenciamento de alto desempenho é certamente uma tecnologia que vem acrescentar informação podendo levar a identificação e caracterização de novas vias biológicas relevantes, com esta tecnologia iremos investigar os mecanismos moleculares da epileptogênese pela análise de expressão gênica por sequenciamento de alto desempenho e correlação com dados fenotípicos em dois modelos animais de epilepsia de lobo temporal mesial (ELTM) sem a indução de status epilepticus (SE): modelo de estimulação elétrica da via perfurante e pilocarpina sem SE..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.


Revisor de periódico


2011 - Atual
Periódico: Brazilian Journal of Medicine and Biological Research


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Humana e Médica.
2.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: TECNOLOGIA EM INFORMATICA.
3.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação/Especialidade: Banco de Dados.
4.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Sistemas de Computação/Especialidade: Software Básico.


Idiomas


Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.


Prêmios e títulos


2010
Prêmio de 1º lugar como pôster pelo trabalho Gene-diet interaction and energetic metabolism: a differential gene expression study in CETP transgenic mice, International Conference on Nutrigenomics.
2008
Basic Science - Melhor trabalho apresentado nesta categoria, CInAPCe - II Workshop..


Produções



Produção bibliográfica
Artigos completos publicados em periódicos

1.
DE PAIVA LIMA, CAROLINA2017DE PAIVA LIMA, CAROLINA ; DA SILVA E SILVA, DANIEL ALMEIDA ; DAMASCENO, SAMARA ; RIBEIRO, ANDREA FROZINO ; Rocha, Cristiane S. ; BERENGUER DE MATOS, ALEXANDRE H. ; CORREIA, DIEGO ; BOERNGEN-LACERDA, ROSELI ; BRUNIALTI GODARD, ANA LÚCIA . Loss of control over the ethanol consumption: differential transcriptional regulation in prefrontal cortex. Journal of Neurogenetics, v. 31, p. 1-8, 2017.

2.
CORBI, SÂMIA CRUZ TFAILE2017CORBI, SÂMIA CRUZ TFAILE ; BASTOS, ALLINY SOUZA ; NEPOMUCENO, RAFAEL ; CIRELLI, THAMIRIS ; SANTOS, RAQUEL ALVES DOS ; TAKAHASHI, CATARINA SATIE ; Rocha, Cristiane S. ; ORRICO, SILVANA REGINA PEREZ ; Maurer-Morelli, Claudia V. ; SCAREL-CAMINAGA, RAQUEL MANTUANELI . Expression Profile of Genes Potentially Associated with Adequate Glycemic Control in Patients with Type 2 Diabetes Mellitus. Journal of Diabetes Research, v. 2017, p. 1-9, 2017.

3.
VIEIRA, A. S.2016VIEIRA, A. S. ; DE MATOS, A. H. ; DO CANTO, A. M. ; ROCHA, C. S. ; CARVALHO, B. S. ; PASCOAL, V. D. B. ; NORWOOD, B. ; BAUER, S. ; ROSENOW, F. ; GILIOLI, R. ; CENDES, F. ; LOPES-CENDES, I. . RNA sequencing reveals region-specific molecular mechanisms associated with epileptogenesis in a model of classical hippocampal sclerosis. Scientific Reports, v. 6, p. 22416, 2016.

4.
DE ANDRADE, HELEN M.T.2016DE ANDRADE, HELEN M.T. ; DE ALBUQUERQUE, MILENA ; AVANSINI, SIMONI H. ; DE S. ROCHA, CRISTIANE ; DOGINI, DANYELLA B. ; NUCCI, ANAMARLI ; CARVALHO, BENILTON ; Lopes-Cendes, Iscia ; FRANÇA, MARCONDES C. . MicroRNAs-424 and 206 are potential prognostic markers in spinal onset amyotrophic lateral sclerosis. JOURNAL OF THE NEUROLOGICAL SCIENCES, v. 368, p. 19-24, 2016.

5.
DA SILVA E SILVA, DANIEL ALMEIDA2016DA SILVA E SILVA, DANIEL ALMEIDA ; FROZINO RIBEIRO, ANDREA ; DAMASCENO, SAMARA ; Rocha, Cristiane S. ; BERENGUER DE MATOS, ALEXANDRE H. ; BOERNGEN-LACERDA, ROSELI ; CORREIA, DIEGO ; BRUNIALTI GODARD, ANA LÚCIA . Inflexible ethanol intake: A putative link with the Lrrk2 pathway. BEHAVIOURAL BRAIN RESEARCH, v. 313, p. 30-37, 2016.

6.
DIAS, R. G.2015DIAS, R. G. ; SILVA, M. S. M. ; DUARTE, N. E. ; BOLANI, W. ; ALVES, C. R. ; JUNIOR, J. R. L. ; DA SILVA, J. L. ; DE OLIVEIRA, P. A. ; ALVES, G. B. ; DE OLIVEIRA, E. M. ; ROCHA, C. S. ; MARSIGLIA, J. D. C. ; NEGRAO, C. E. ; KRIEGER, E. M. ; KRIEGER, J. E. ; PEREIRA, A. C. . PBMCs express a transcriptome signature predictor of oxygen uptake responsiveness to endurance exercise training in men. Physiological Genomics (Print), v. 47, p. 13-23, 2015.

7.
LUCON, DANIELLE RIBEIRO2013LUCON, DANIELLE RIBEIRO ; Rocha, Cristiane de Souza ; CRAVEIRO, ROGERIO BASTOS ; DILLOO, DAGMAR ; CARDINALLI, IZILDA A. ; CAVALCANTI, DENISE PONTES ; AGUIAR, SIMONE DOS SANTOS ; MAURER-MORELLI, CLAUDIA ; YUNES, JOSE ANDRES . Downregulation of 14q32 microRNAs in Primary Human Desmoplastic Medulloblastoma. Frontiers in Oncology, v. 3, p. 1/254-14, 2013.

8.
AVANSINI, SIMONI HELENA2013AVANSINI, SIMONI HELENA ; TORRES, FÁBIO ROSSI ; DOGINI, DANYELLA B. ; ROGERIO, F. ; COAN, ANA CAROLINA ; SECOLIN, RODRIGO ; ROCHA, C. S. ; PASCOAL, V. D. B. ; COSTA, A ; PIAZA, ANA CLAÚDIA SPARAPANI ; REIS, L. ; OLIVEIRA, Evandro de ; TEDESCHI, H. ; QUEIROZ, LUCIANO ; CENDES, F. ; Lopes-Cendes, Iscia . Down-Regulation of DICER1 Leading to Abnormal Expression of Mature microRNAs and NEUROG2 Is Involved with Aberrant Neuroglial Differentiation in Focal Cortical Dysplasias (FCD) (S08.002). Neurology (Cleveland, Ohio), v. 12, p. 80, 2013.

9.
Maurer-Morelli, Claudia V.2012 Maurer-Morelli, Claudia V. ; Maurer-Morelli, Claudia V. ; de Vasconcellos, Jaira F. ; Reis-Pinto, Fernanda C. ; Rocha, Cristiane de S. ; Domingues, Romenia R. ; Yasuda, Clarissa L. ; Tedeschi, Helder ; de Oliveira, Evandro ; Lopes-Cendes, Iscia ; Yasuda, Clarissa L. ; Cendes, Fernando ; Domingues, Romenia R. ; Lopes-Cendes, Iscia ; de Vasconcellos, Jaira F. ; Tedeschi, Helder ; Rocha, Cristiane de S. ; Reis-Pinto, Fernanda C. ; de Oliveira, Evandro . A comparison between different reference genes for expression studies in human hippocampal tissue. Journal of Neuroscience Methods, v. 208, p. 44-47, 2012.

10.
MATOS, AHB2012MATOS, AHB ; PASCOAL, VDB ; NASCIMENTO, DR ; MARTINS, S ; ROCHA, CS ; VASCONCELLOS, JF ; CHAMMA, MT ; MAURER-MORELLI, CV ; MARTINS, ASB ; VALLE, AC ; GODARD, ALB ; LOPES-CENDES, I . A caracterização do perfil de expressão gênica em larga escala em modelos genéticos de epilepsia fornece elementos para entender os mecanismos envolvidos na epileptogênese em roedores. Journal of Epilepsy and Clinical Neurophysiology (Impresso), v. 18, p. 50-52, 2012.

11.
DOGINI, D. B.2012DOGINI, D. B. ; SECOLIN, R. ; AVANSINI, S. H. ; TORRES, F. R. ; ROCHA, C. S. ; SECOLIN, R. ; YASUDA, C. ; COAN, A. C. ; COSTA, A. F. ; PIAZA, A. C. ; REIS, L. A. M. R. ; QUEIROZ, L. S. ; TEDESCHI, H. ; OLIVEIRA, E. P. ; CENDES, F. ; LOPES-CENDES, I. . MicroRNA expression profile in epilepsy: breaking molecular barriers. Journal of Epilepsy and Clinical Neurophysiology (Impresso), v. 18, p. 57-59, 2012.

12.
DOGINI, D. B.2008DOGINI, D. B. ; Ribeiro, Patrícia A. O. ; ROCHA, C. S. ; Pereira, Tiago C. ; Lopes-Cendes, Iscia . MicroRNA Expression Profile in Murine Central Nervous System Development. Journal of Molecular Neuroscience, v. 35, p. 331-337, 2008.

13.
SECOLIN, R2008SECOLIN, R ; ROCHA, C. S. ; TORRES, F ; SANTOS, M ; MAURERMORELLI, C ; SANTOS, N ; LOPES-CENDES, I. ; LOPESCENDES, I . LINKGEN: A new algorithm to process data in genetic linkage studies. Genomics (San Diego), v. 91, p. 544-547, 2008.

14.
Pereira, Tiago Campos2007Pereira, Tiago Campos ; Bittencourt, Vinícius D'Ávila Pascoal ; Secolin, Rodrigo ; Rocha, Cristiane de Souza ; Maia, Ivan de Godoy ; Lopes-Cendes, Iscia . Strand Analysis, a free online program for the computational identification of the best RNA interference (RNAi) targets based on Gibbs free energy. Genetics and Molecular Biology (Impresso), v. 30, p. 1206-1208, 2007.

15.
Flavia Stal Papini-Terzi2005Flavia Stal Papini-Terzi ; Flavia Riso Rocha ; Felix, JM ; Renato Vicentini ; ROCHA, C. S. ; Eugênio Cêsar Ulian ; Sônia Marli Zingaretti di Mauro ; Carlos Alberto de Bragança Pereira ; Menossi, M ; Gláucia Mendes Souza . Transcription Profiling of Signal Transduction-Related Genes in Sugarcane Tissues. DNA Research, Japão, v. 12, p. 27-38, 2005.

16.
DRUMMOND, Rodrigo D2005ROCHA, C. S.; DRUMMOND, Rodrigo D ; PINHEIRO, A. ; MENOSSI, Marcelo . ISER: selection of differentially expressed genes from DNA array data by non-linear data transformations and local fitting. Bioinformatics (Oxford. Print), v. 21, p. 4427-4429, 2005.

Capítulos de livros publicados
1.
MAURER-MORELLI, C. V. ; ROCHA, C. S. ; Domingues, R. R. ; TEDESCHI, H. ; De OLIVEIRA, E. P. L. ; CENDES, F. ; Lopes-Cendes, I. . Perfil da Expressão Gênica na Epilepsia de Lobo Temporal Mesial Familial Associada a Atrofia Hipocampal. In: Li Li Min; Paula Teixeira Fernandes; Roberto J M Covolan; Fernando Cendes. (Org.). Neurociências e Epilepsia. 1ed.São Paulo: Plêiade, 2008, v. , p. 197-204.

Trabalhos completos publicados em anais de congressos
1.
MAURER-MORELLI, C. V. ; Domingues, R. R. ; ROCHA, C. S. ; Secolin, R. ; TEDESCHI, H. ; De OLIVEIRA, E. P. L. ; CENDES, F. ; Lopes-Cendes, I. . Estudos Moleculares na Epilepsia de Lobo Temporal Mesial Associada a Atrofia Hipocampal. In: XXXII Congresso da Liga Brasileira de Epilepsia e XXII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Neurofisiologia Clínica, 2008, Campinas. Journal of Epilepsy and Clinical Neurophysiology. Porto Alegre: Supernova editora, 2008. v. 14. p. 20-21.

Resumos expandidos publicados em anais de congressos
1.
Torres, F. R. ; TSUNEDA, S. S. ; YAMAMOTO, H. E. ; SECOLIN, R ; ROCHA, C. S. ; ARTIGUENAVE, F. M. ; BORGES, M. G. ; IDE, W. T. S. ; Cendes, Fernando ; GUERREIRO, M. ; Lopes-Cendes, I. . Clonagem do Gene Responsável pela Polimicrogiria Perisylviana Bilateral Congênita. In: Congresso Brasileiro de Epilepsia, 2012, Ribeirão Preto. Congresso Brasileiro de Epilepsia 2012, 2012.

2.
MATOS, A. H. B. ; PASCOAL, V. D. B. ; NASCIMENTO, D. R. ; MARTINS, S. ; ROCHA, C. S. ; Vasconcelos, J. F. ; CHAMMA, M. T. ; MAURER-MORELLI, C. V. ; MARTINS, A. S. ; VALLE, A. C. ; GODARD, A. L. B. ; Lopes-Cendes, I. . A caracterização do perifl de expressão gênica em larga escala em modelos genéticos de epilepsia fornece elementos para entender os mecanismos envolvidos na epileptogênese em roedores. In: XXXIV Congresso Brasileiro de Epilepsia, 2012, Ribeirão Preto. XXXIV Congresso Brasileiro de Epilepsia, 2012.

3.
DOGINI, D. B. ; AVANSINI, S. H. ; TORRES, F ; ROCHA, C. S. ; SECOLIN, R ; YASUDA, C. L. ; COAN, A. C. ; COSTA, F. A. ; PIAZA, A. C. S. ; REIS, L. A. M. R. .. ; QUEIROZ, L. S. ; TEDESCHI, H. ; OLIVEIRA, E. P. M. ; CENDES, F. . MicroRNA expression orifile in epilepsy: Breaking molecular barriers. In: XXXIV Congresso Brasileiro de Epilepsia, 2012, Ribeirão Preto. Journal of Epilepsy and Clinical Neurophysiology, 2012. v. 18. p. 57-59.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
BORGES, M. G. ; ROCHA, CS ; CARVALHO, B. S. ; LOPES-CENDES, I. . Whole Exome Sequencing Depth Varies Among Samples with Different Ethnic Background. In: 2nd Congress CEPID BRAINN, 2015, Campinas. Journal of Epilepsy and Clinical neurophysiology, 2015. v. 21. p. 50-50.

2.
CORBI, S. C. T. ; BASTOS, AS ; OLIVEIRA, R. N. ; FINOTI, LS ; ANOVAZZI, G. ; PIGOSSI, S. C. ; ORRICO, S. R. P. ; SANTOS, R. A. ; TAKAHASHI, C. S. ; ROCHA, C. S. ; MAURER-MORELLI, C. V. ; CAMINAGA, R. M. S. . Poor-controlled type-2 Diabetes Mellitus, Dyslipidemia and Periodontitis: Genome-based Expression Study. In: 93rd International Association for Dental Research, 2015, Boston. J Dent Res, 2015. v. 93.

3.
CAMINAGA, R. M. S. ; CORBI, S. C. T. ; OLIVEIRA, R. N. ; BASTOS, AS ; SANTOS, R. A. ; TAKAHASHI, C. S. ; Rocha, C. ; MAURER-MORELLI, C. V. ; ORRICO, S. R. P. . Dyslipidemia and periodontitis in type-2 diabetes mellitus: Genome Transcript Profiling. In: 93rd International Association for Dental Research, 2015, Boston. J Dent Res, 2015. v. 93.

4.
MATOS, A. H. B. ; VIEIRA, A. S. ; PASCOAL, VDB ; ROCHA, C. S. ; MORAES, M. F. D. ; MAURER-MORELLI, C. V. ; NASCIMENTO, DR ; MARTINS, S. ; MARTINS, A. S. ; VALE, A. C. ; GODARD, ALB ; LOPES-CENDES, I. . Evidence pointing to abnormal energy metabolism in two genetic animal models of epilepsy. In: 64th Annual Meeting of the American Society of Human Genetics. In: 64th Annual Meeting of the American Society of Human Genetics, 2014, SanDiego, California.. 64th Annual Meeting of the American Society of Human Genetics, 2014.

5.
BORGES, M. G. ; ROCHA, C. S. ; CARVALHO, B. S. ; LOPES-CENDES, I. . Comparisons on whole exome capturing homogeneity among diferent versions of capturing kits and populations. In: 64th Annual Meeting of the American Society of Human Genetics, 2014, SanDiego, California. 64th Annual Meeting of the American Society of Human Genetics, 2014.

6.
MATOS, A. H. B. ; PASCOAL, V. D. B. ; NASCIMENTO, D. R. ; ROCHA, C. S. ; Vasconcelos, J. F. ; CHAMMA, M. T. ; MAURER-MORELLI, C. V. ; MARTINS, A. S. ; VALLE, A. C. ; GODARD, A. L. B. ; LOPES-CENDES, I. . Gene expression profile in genetic models of generalized epilepsy: clues into underlying mechanism. In: 64th American Academy of Neurology Annual Meeting., 2012, New Orleans. Scientific Abstract Book, 2012. v. 2012. p. 91-91.

7.
DOGINI, D. B. ; ROCHA, C. S. ; YASUDA, C. L ; TEDESCHI, H. ; De OLIVEIRA, E. P. L. ; MAURER-MORELLI, C. V. ; CENDES, F. ; LOPES-CENDES, I. . microRNA expression profile in mesial temporal sclerosis provides insight into underlying mechanisms.. In: 64th American Academy of Neurology Annual Meeting, 2012, New Orleans. Scientific Abstract Book, 2012. v. 2012.

8.
Vasconcelos, J. F. ; MAURER-MORELLI, C. V. ; ROCHA, C. S. ; YASUDA, C. L ; OLIVEIRA, E. ; CENDES, F. ; Lopes-Cendes, I. . A Gene Expression-Based In Silico Approach Identifies New Biological Targets in Human Mesial Temporal Lobe Epilepsy. In: 64th Annual Meeting of American Academy of Neurology, 2012, New Orleans. 64th Annual Meeting of American Academy of Neurology, 2012.

9.
ROCHA, C. S.; MAURER-MORELLI, C. V. ; Lopes-Cendes, I. ; ARTIGUENAVE, F. M. . A Tool for selecting endogenous control for qRT-PCR using high throughput expression data.. In: American Society of Human Genetics Annual Meeting, 2012, San Francisco. American Society of Human Genetics Annual Meeting, 2012.

10.
Rocha, Cristiane de Souza; Maurer-Morelli, Cláudia V. ; Lopes-Cendes, Iscia . NOVA PIPELINE PARA ANÁLISE DE DADOS DE EXPRESSÃO GÊNICA POR MICROARRAYS. In: 5ª SEMANA DE PESQUISA DA FACULDADE DE CIÊNCIAS MÉDICAS DA UNICAMP, 2011, Campinas. 5ª SEMANA DE PESQUISA DA FACULDADE DE CIÊNCIAS MÉDICAS DA UNICAMP. Campinas: Unicamp, 2011.

11.
Vasconcelos, J. F. ; MAURER-MORELLI, C. V. ; ROCHA, C. S. ; YASUDA, C. L ; Tedeschi, H. ; De OLIVEIRA, E. P. L. ; CENDES, F. ; Lopes-Cendes, I. . Gene Set Enrichment Analysis: an approach for interpreting gene expression profiles of hippocampal tissue from patients with mesial temporal lobe epilepsy. In: 5a. Semana de estudos da FCM - UNICAMP, 2011, Campinas. Caderno de resumos da 5ª. Semana de Estudos da FCM. Campinas: Unicamp, 2011. v. 1. p. 84-84.

12.
SABHA, M. ; ROCHA, C. S. ; KATO, L. ; RAPOSO, H. ; LANCELLOTTI, M. ; OLIVEIRA, H. C. F. . Gene-diet interaction and energetic metabolism: a differential gene expression study in CETP transgenic mice. In: International Conference on Nutrigenomics, 2010, Guarujá. International Conference on Nutrigenomics, 2010.

13.
Dogini, Danyella B. ; Rocha, Cristiane ; Yassuda, C. L. ; Oliveira, E. ; Tedeschi, H. ; MAURER-MORELLI, C. V. ; CENDES, F. ; Lopes-Cendes, Iscia . Diferenças no padrão de expressão de microRNAs em esclerose mesial temporal. In: XXXIII CONGRESSO DA LIGA BRASILEIRA DE EPILEPSIA, 2010, Brasilia. XXXIII CONGRESSO DA LIGA BRASILEIRA DE EPILEPSIA, 2010.

14.
DOGINI, D. B. ; Rocha, Cristiane ; Oliveira, E. ; Tedeschi, H. ; MAURER-MORELLI, C. V. ; CENDES, F. ; Lopes-Cendes, Iscia . Análise do padrão de expressão de microRNAs em esclerose mesial temporal.. In: IV Workshop CinAPCe, 2010, São Carlos. IV Workshop CinAPCe, 2010.

15.
DOGINI, D. B. ; Rocha, Cristiane ; Yassuda, C. L. ; TEDESCHI, H. ; Oliveira, E. ; MAURER-MORELLI, C. V. ; CENDES, F. ; Lopes-Cendes, I. . Changes in MicroRNA expression profile in mesial temporal sclerosis.. In: 62nd Annual Meeting of The American Academy of Neurology, 2010, Toronto. 62nd Annual Meeting of The American Academy of Neurology, 2010.

16.
DOGINI, D. B. ; Pereira, Tiago C. ; Rocha, Cristiane ; Yasuda, C L ; Tedeschi, H. ; Oliveira, E. ; MAURER-MORELLI, C. V. ; CENDES, F. ; Lopes-Cendes, Iscia . The role of microRNAs in temporal lobe epilepsy.. In: II Workshop CInAPCe, 2009, Ribeirão Preto. Caderno de Resumos, 2009.

17.
DOGINI, D. B. ; Pereira T. C. ; Rocha, Cristiane ; Yassuda, C. L. ; Tedeschi, H. ; Oliveira, E. ; MAURER-MORELLI, C. V. ; CENDES, F. ; Lopes-Cendes, Iscia . MicroRNA expression in hipocamppal tissue from patients with temporal lobe epilepsy. In: 59th Annual Meeting of the American Society of Human Genetics, 2009, Honolulu. ASHG Program Book 2009, 2009. p. 187-187.

18.
Dogini, Danyella B. ; Rocha, Cristiane ; Pereira T. C. ; Yassuda, C. L. ; Tedeschi, H. ; Oliveira, E. ; MAURER-MORELLI, C. V. ; CENDES, F. ; Lopes-Cendes, Iscia . Evidence of microRNA regulation in mesial temporal sclerosis.. In: AES 63rd Annual Meeting of the American Epilepsy Societ, 2009, Boston. Epilepsia, 2009. v. 50. p. 302-302.

19.
DOGINI, D. B. ; Ribeiro, Patrícia A. O. ; Rocha, Cristiane ; Pereira T. C. ; Lopes-Cendes, Iscia . QUANTIFICATION OF microRNA IN CENTRAL NERVOUS SYSTEM DEVELOPMENT AND CORTICAL DYSPLASIA.. In: XXXII Congresso Brasileiro de Epilepsia, 2008, Campinas. ournal of Epilepsy and Clinical Neurophysiiology, 2008. v. 14. p. 74-74.

20.
DOGINI, D. B. ; Ribeiro, Patrícia A. O. ; Rocha, Cristiane ; Pereira T. C. ; Lopes-Cendes, Iscia . MicroRNA expression profile during embryonic central nervous system development.. In: American 2008 Annual Meeting - American Academy of Neurology, 2008, Chicago. Neurololgy, 2008. v. 70. p. A315-A315.

21.
MAURER-MORELLI, C. V. ; Domingues, R. R. ; ROCHA, C. S. ; Secolin, R. ; Tedeschi, H. ; De OLIVEIRA, E. P. L. ; CENDES, F. ; Lopes-Cendes, I. . Mapeando Genes que Influenciam a Gravidade da Doença na Epilepsia de Lobo Temporal Mesial Familiar. In: XXXII Congresso Brasileiro de Epilepsia, 2008, Campinas. Journal of Epilepsy and Clinical Neurophysiology.. Porto Alegre: Supernova Editora, 2008. v. 14. p. 19-20.

22.
Secolin, R. ; ROCHA, C. S. ; Lopes-Cendes, I. . Validação de nova estratégia estatística para mapeamento de genes modificadores em síndromes complexas. In: 53 Congresso Brasileiro de Genética, 2007, Águas de Lindóia. Sociedade Brasileira de Genética, 2007.

23.
DOGINI, D. B. ; RIBEIRO, P. A. O. ; Pereira T. C. ; ROCHA, C. S. ; Lopes-Cendes, I. . QUANTIFICATION OF microRNA DURING CENTRAL NERVOUS SYSTEM DEVELOPMENT.. In: The American Society of Human Genetics 57th Annual Meeting, 2007, San Diego. The American Society of Human Genetics, 2007.

24.
Secolin, R. ; ROCHA, C. S. ; Lopes-Cendes, I. . A new statistical approach for mapping modifier genes taken advantage of family structure.. In: The American Society of Human Genetics 57th Annual Meeting, 2007, San Diego. The American Society of Human Genetics, 2007.

25.
MAURER-MORELLI, C. V. ; ROCHA, C. S. ; Secolin, R. ; Domingues, R. R. ; CENDES, F. ; Lopes-Cendes, I. . Analysis of gene expression in familial mesial temporal lobe epilepsy associated with hippocampal atrophy.. In: The American Society of Human Genetics 57th Annual Meeting, 2007, San Diego. The American Society of Human Genetics, 2007.

26.
ROCHA, C. S.; Lopes-Cendes, I. . Affymetrix Annotation Search, a tool for data mining with Affymetrix data.. In: The American Society of Human Genetics 57th Annual Meeting, 2007, San Diego. The American Society of Human Genetics, 2007.

27.
Dogini, Danyella B. ; RIBEIRO, P. A. O. ; Rocha, Cristiane ; Pereira T. C. ; Lopes-Cendes, Iscia . . MicroRNA expression pattern during embryonic central nervous system development.. In: XXVI Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology - SBBQ and 10th International Union of Biochemistry and MOlecular Biology (IUBMB), 2007, Salvador. Anais do XXXVI Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology - SBBQ and 10th International Union of Biochemistry and MOlecular Biology (IUBMB), 2007.

28.
Secolin, R. ; ROCHA, C. S. ; Lopes-Cendes, I. . Um novo algoritmo para manipulação de dados nos estudos de ligação genética em doenças humanas. In: 52 Congresso Brasileiro de Genética, 2006, Foz do Iguaçu. 52 Congresso Brasileiro de Genética, 2006.

29.
Drumond, RD ; A., Pinheiro ; ROCHA, C. S. ; Menossi, M . Selection of differentially expressed genes from DNA arrays data by nonlinear data transformations and local fitting.. In: XXXIII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2004, Caxambu. SBBQ, 2004.

30.
Renato Vicentini ; ROCHA, C. S. ; Drumond, RD ; Menossi, M . Use of Pipeline for Macro and microarray Analyses (PMmA) for analyse expression profile of sugarcane genes in macroarrays.. In: XXXIII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2004, Caxambu. XXXIII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. Caxambu: SBBq, 2004.

31.
CANÇADO, G. M. A. ; Nogueira, F. T. S. ; Felix, JM ; Drumond, RD ; Renato Vicentini ; ROCHA, C. S. ; Jorge, R. A. ; Menossi, M . Identification and expression analysis of aluminum-responsive genes in maize.. In: XXXIII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2004, Caxambu. XXXIII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. Caxambú: SBBq, 2004.

32.
ROCHA, F. R. ; PAPINI-TERZI, F. ; VENCIO, R. Z. N. ; Kátia Cristina Oliveira ; ROCHA, C. S. ; Felix, JM ; Camargo, SC ; Renato Vicentini ; Menossi, M . Expression profile analysis of sugarcane receptors, proteins kinases and R-genes.. In: 50o. Congresso Brasileiro de Genética, 2004, Florianópolis. 50o. Congresso Brasileiro de Genética. Florianópolis: SBG, 2004.

33.
Flavia Riso Rocha ; PAPINI-TERZI, F. ; VENCIO, R. Z. N. ; Oliveira, KCP ; Felix, JM ; Camargo, SC ; ROCHA, C. S. ; Renato Vicentini ; Menossi, M ; SOUZA, G. M. . The sugarcane kinome. In: Plant & Animal Genomes XII Conference, 2004, San Diego. Plant & Animal Genomes XII Conference, 2004.

34.
ROCHA, C. S.; PAPINI-TERZI, F. ; ROCHA, F. R. ; VENCIO, R. Z. N. ; Kátia Cristina Oliveira ; Felix, JM ; Camargo, SC ; Vicentini, R ; Menossi, M ; SOUZA, G. M. . Transcription profiles of sugarcane signaling components in different tissues and stress conditions.. In: Plant & Animal Genomes XII Conference, 2004, San Diego. Plant & Animal Genomes XII Conference. San Diego: Plant & Animal Genomes XII Conference, 2004.

35.
ROCHA, C. S.; Vicentini, R ; Drumond, RD ; Menossi, M . Ferramentas e sistemas para a análise de arranjos de DNA. In: 49 Congresso Brasileiro de Genética, 2003, Águas de Lindóia. 49 congresso Nacional de genética, 2003.

36.
Felix, JM ; Drumond, RD ; Mondego, JMC ; Vicentini, R ; ROCHA, C. S. ; Ulian, EC ; Menossi, M . Expression Analysis of Genes Involved in Sucrose Accumulation in Sugarcane. In: 49 congresso Nacional de Genética, 2003, Águas de Lindóia. 49 congresso Nacional de Genética, 2003.

37.
Menossi, M ; Felix, JM ; Drumond, RD ; Camargo, SC ; Reis, CP ; ROCHA, C. S. . Cross-Species Hybridization of Nylon Arrays Containing Sugarcane ESTs to Identify Root Specific Genes From Maize. In: 49 congresso Nacional de Genética, 2003, Águas de Lindóia. 49 congresso Nacional de Genética, 2003.

38.
Drumond, RD ; PINHEIRO, A. ; ROCHA, C. S. ; Menossi, M . Identificação de Genes Diferencialmente expressos em arranjos de DNA utilizando transformações não lineares e ajuste Local. In: 49 congresso Nacional de Genética, 2003, Águas de Lindoia. 49 congresso Nacional de Genética, 2003.

39.
ROCHA, F. R. ; PAPINI-TERZI, F. ; Camargo, SC ; ROCHA, C. S. ; Vicentini, R ; Felix, JM ; Menossi, M ; SIMOES, A. C. Q. ; da SILVA, A. M. ; SOUZA, G. M. . The Sugarcane Kinome. In: 49 congresso Nacional de Genética, 2003, Águas de Lindóia. 49 congresso Nacional de Genética, 2003.

40.
PAPINI-TERZI, F. ; ROCHA, F. R. ; VENCIO, R. Z. N. ; Oliveira, KCP ; Felix, JM ; Camargo, SC ; ROCHA, C. S. ; Vicentini, R ; Menossi, M ; SOUZA, G. M. . Expression patterns of sugarcane signal transduction components revealed by microarrays and in silico analysis. In: 49 Congresso Brasileiro de Genética, 2003, Águas de Lindóia. 49 Congresso Brasileiro de Genética, 2003.

41.
Mondego, JMC ; Drumond, RD ; Felix, JM ; BENGTSON, M. H. ; Vicentini, R ; ROCHA, C. S. ; MALUF, M. ; SOGAYAR, M. C. ; GUERREIRO, O. ; Menossi, M . Characterization of coffea Genes Expressed During Resistance to the coffee Leaf Miner (Leucoptera Coffeella). In: 49 Congresso Brasileiro de Genética, 2003, Águas de Lindóia. 49 Congresso Brasileiro de Genética, 2003.

Artigos aceitos para publicação
1.
CORBI, S. C. T. ; BASTOS, AS ; OLIVEIRA, R. N. ; SANTOS, R. A. ; TAKAHASHI, C. S. ; Rocha, C. ; ORRICO, S. R. P. ; MAURER-MORELLI, C. V. ; CAMINAGA, R. M. S. . Genome-based expression profiling in poorly/well-controlled type 2 diabetes or normoglycemic patients with dyslipidemia and chronic periodontitis. Molecular and Cellular Endocrinology (Print), 2016.


Produção técnica
Programas de computador sem registro
1.
Secolin, R. ; Maurer-Morelli, Cláudia V. ; Rocha, Cristiane S. ; Torres, Fábio R. ; Lopes-Cendes, I. ; Santos, M. L. ; Santos, N. F. . JINGLEFIX. 2010.

2.
ROCHA, C. S.; Lopes-Cendes, I. . Affymetrix Annotation Search. 2007.

3.
ROCHA, C. S.; Pereira T. C. ; Pascoal, V. ; Secolin, R. ; Maia, I. G. ; Lopes-Cendes, I. . Strand Analysis Program. 2006.

4.
ROCHA, C. S.; Lopes-Cendes, I. . Strand Analysis to Blast. 2006.

5.
Drumond, RD ; ROCHA, C. S. ; A., Pinheiro ; Menossi, M . ISER - Intensity-dependent Selection of Expression Ratios. 2005.

6.
ROCHA, C. S.; Matiolli, A. M. P. ; Vicentini, R ; Menossi, M . LGF-EGO 05. 2005.


Demais tipos de produção técnica
1.
ROCHA, CS. Análise de Microarrays utilizando o R. 2013. .



Bancas



Participação em bancas de trabalhos de conclusão
Qualificações de Mestrado
1.
França Jr., M. C.; MONTENEGRO, M. A. S.; ROCHA, C. S.. Participação em banca de Murilo Guimarães Borges. Desenvolvimento de protocolos e métodos em bioinformática para análise de sequenciamento de exomas humanos. 2015. Exame de qualificação (Mestrando em Fisiopatologia Medica) - Universidade Estadual de Campinas.




Orientações



Orientações e supervisões concluídas
Dissertação de mestrado
1.
KÁTIA CRISTIANE BRUMATTI GONÇALVES. ESTUDO DE BIOINFORMÁTICA APLICADO À ANÁLISE DE EXPRESSÃO GÊNICA UTILIZANDO DADOS ORIUNDOS DE SEQUENCIAMENTO POR TECNOLOGIA DE ?NEXT- GENERATION? EM ANIMAIS CONTROLE E EM MODELOS DE EPILEPSIA DO LOBO TEMPORAL MESIAL.. 2015. Dissertação (Mestrado em Fisiopatologia Medica) - Universidade Estadual de Campinas, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Coorientador: Cristiane de Souza Rocha.



Inovação



Projetos de pesquisa


Outras informações relevantes


Gerente de projeto da base de dados BIPMed (Brazilian Initiative on Precision Medicine)



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