Helen Andrade Arcuri

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  • Última atualização do currículo em 17/05/2016


Possui graduação em Ciencia da Computação pela Pontifícia Universidade Católica de Minas Gerais (2002), mestrado (2005) e doutorado (2008) em Biofísica Molecular com enfâse em Bioinformática Estrutural pela Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho. Tem experiência em algumas técnicas Biofísicas, atuando principalmente nos seguintes temas: bioinformática estrutural e integrativa, desenho de drogas, screening virtual, simulação de docking e dinamica molecular focado ao estudo de pequenas moléculas, proteinas e genomas. Desenvolvimento e integração de aplicações computacionais para tratamaneto e analise de dados biológicos utilizando técnicas de mineração de dados; arquiteturas paralelas de alto desempenho como cluster e GPU e banco de dados. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Helen Andrade Arcuri
Nome em citações bibliográficas
ARCURI, HA;Arcuri, H. A.;ARCURI, HELEN ANDRADE;ANDRADE ARCURI, HELEN;ARCURI, H.A.;ARCURI, HELEN A.;ARCURI, HELEN

Endereço


Endereço Profissional
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Instituto de Biociências de Rio Claro.
UNESP - Universidade do Estado de São Paulo
Jardim Bela Vista
13506900 - Rio Claro, SP - Brasil
Telefone: (19) 35264164
URL da Homepage: http://www.rc.unesp.br/lbez


Formação acadêmica/titulação


2005 - 2008
Doutorado em Biofísica Molecular.
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.
Título: Bioinformática Estrutural Aplicada ao Estudo das Enzimas da Via Metabólica do Ácido Chiquímico., Ano de obtenção: 2008.
Orientador: Prof. Dr. Mario Sergio Palma.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
2003 - 2005
Mestrado em Biofísica Molecular.
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.
Título: Bioinformática Estrutural Aplicada ao Estudo de Enzimas da Via Metabólica do Ácido Chiquímico da Xylella fastidiosa,Ano de Obtenção: 2005.
Orientador: Prof. Dr. Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
1998 - 2002
Graduação em Ciencia da Computação.
Pontifícia Universidade Católica de Minas Gerais, PUC Minas, Brasil.
Bolsista do(a): Fundação Mariana Resende Costa, FUMARC, Brasil.
1992 - 1996
Curso técnico/profissionalizante.
Escola Profissional Dom Bosco, EPDB, Brasil.


Pós-doutorado


2015
Pós-Doutorado.
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.
2013 - 2014
Pós-Doutorado.
Massachusetts Institute of Technology, MIT, Estados Unidos.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
2012 - 2014
Pós-Doutorado.
Universidade Federal de Rondônia, UNIR, Brasil.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
2009 - 2012
Pós-Doutorado.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
2010 - 2011
Pós-Doutorado.
Instituto de Tecnologia Quimica e Biologica - UNL, ITQB, Portugal.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.


Formação Complementar


2011 - 2011
Bioinformatics and Comparative Genome Analyses. (Carga horária: 86h).
Instituto Pasteur, IP, França.
2009 - 2009
Extensão universitária em Tópicos Especiais em Modelagem Computacional. (Carga horária: 36h).
Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.
2008 - 2008
II Curso de Escrita Científica. (Carga horária: 36h).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
2008 - 2008
Proteomics and Bioinformatics tools. (Carga horária: 32h).
Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.
2006 - 2006
Introdução e Programação Avançada em Java. (Carga horária: 120h).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
2006 - 2006
Curso de Introdução a Bioinformática. (Carga horária: 80h).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.


Atuação Profissional



Faculdade de Medicina de Botucatu, FMB, Brasil.
Vínculo institucional

2011 - 2011
Vínculo: Professora Convidada, Enquadramento Funcional: Professora Convidada, Carga horária: 4
Outras informações
Professora convidada para ministrar o tópico "Bioinformática Proteômica" na disciplina de ?Métodos Analíticos para o Estudo de Macromoléculas?, no Programa de Pós-graduação em Doenças Tropicais da Faculdade de Medicina da UNESP, Campus Botucatu. Carga Horária: 30 horas.


Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Vínculo institucional

2012 - Atual
Vínculo: Pesquisador Colaborador, Enquadramento Funcional: Pesquisador Colaborador

Vínculo institucional

2009 - 2012
Vínculo: Pós-Doutoramento, Enquadramento Funcional: Estudante de Pos-Doutoramento, Regime: Dedicação exclusiva.


Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.
Vínculo institucional

2008 - Atual
Vínculo: Pesquisador Colaborador, Enquadramento Funcional: Pesquisador Colaborador

Vínculo institucional

2005 - 2008
Vínculo: Livre, Enquadramento Funcional: Doutorado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Vínculo institucional

2005 - 2005
Vínculo: Professor Substituto, Enquadramento Funcional: Professor Substituto, Carga horária: 12
Outras informações
Professora substituta da disciplina de graduaçao de "Introdução a Ciência da Computação e Linguagem Computacional" do curso de Matemática e Fisíca Biológica.

Vínculo institucional

2003 - 2005
Vínculo: Livre, Enquadramento Funcional: Mestrado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.


Universidade Federal de Alfenas, UNIFAL/MG, Brasil.
Vínculo institucional

2011 - Atual
Vínculo: Pesquisador Colaborador, Enquadramento Funcional: Pesquisador Colaborador


Natura Inovação e Tecnologia de Produtos, NATURA, Brasil.
Vínculo institucional

2014 - Atual
Vínculo: Acessoria, Enquadramento Funcional: Acessoria em Bioinformatica e Bioestatistica, Carga horária: 24



Projetos de pesquisa


2015 - Atual
Peptídeos dos venenos de Hymenoptera sociais como modelos de desenvolvimento de novas drogas para uso terapêutico.

Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Mario Sergio Palma em 23/12/2015.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2012 - Atual
Estudo e caracterização estrutural dos peptídeos presentes nos venenos das vespas sociais para pesquisa de novas drogas para o controle de doenças negligenciadas com especial ênfase em Leishmaniose e Malária.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2012 - Atual
Identificação, produção e caracterização de novos alérgenos regionais
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) .
Integrantes: Helen Andrade Arcuri - Integrante / Keity S Santos - Coordenador / Clovis Eduardo Galvão - Integrante / Ariana Campos Yang - Integrante / Fabio Fernandes Morato Castro - Integrante.Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
2009 - 2011
Caracterização dos epítopos lineares sintéticos do alérgeno antígeno-5 do veneno da vespa social Polybia paulista (Hymenoptera, Vespidae)
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
2009 - Atual
Desenvolvimento de um banco de dados alérgenos e aplicações uteis para pesquisa em imunologia e alergologia.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2007 - 2008
Caracterização Molecular do Alérgeno Hialuronidase do Veneno da Vespa Social Polybia paulista (Hymenoptera, Vespidae)
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
2006 - 2006
Bioinformática Estrutural Aplicada ao Estudo de Proteínas Relacionadas á Anemia Hereditária
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
2006 - 2006
Modelagem molecular da chaperone molecular Hsp40 DjA1
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
2005 - Atual
Bioinformática Estrutural Aplicada ao Estudo de Enzimas da Via Metabólica do Ácido Chiquímico.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2003 - 2005
Bioinformática Estrutural Aplicada ao Estudo de Enzimas da Via Metabólica do Ácido Chiquímico da Xylella fastidiosa
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.


Membro de corpo editorial


2012 - Atual
Periódico: Dataset Papers in Bioinformatics


Revisor de periódico


2009 - Atual
Periódico: Bioinformatics (Oxford)
2011 - Atual
Periódico: African Journal of Biotechnology


Revisor de projeto de fomento


2011 - Atual
Agência de fomento: Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Bioinformática.
2.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação/Especialidade: Banco de Dados Biológicos.
3.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Computação de Alto Desempenho.


Idiomas


Espanhol
Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Bem.
Inglês
Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.


Prêmios e títulos


2011
Travel Fellowship - Bioinformatics and Comparative Genome Analyses, EMBO, Instituto Pasteur e FCT.
2008
Melhor Tese de Doutorado - DARCY FONTOURA DE ALMEIDA STUDENT AWARD, CNPQ, FAPERJ, CAPES, LNCC e VBI.
2008
Travel Fellowship ? International Conference Drug Design and Discovery for Developing Countries, ISC-UNIDO e FAPESP.


Produções



Produção bibliográfica
Citações

Web of Science
Total de trabalhos:11
Total de citações:114
Fator H:6
Arcuri, Helen A  Data: 13/07/2015

Artigos completos publicados em periódicos

1.
ARCURI, HELEN ANDRADE2016ARCURI, HELEN ANDRADE; GOMES, PAULO CESAR ; DE SOUZA, BIBIANA MONSON ; DIAS, NATHALIA BAPTISTA ; BRIGATTE, PATRÍCIA ; STABELI, RODRIGO GUERINO ; PALMA, MARIO S. . Paulistine - The Functional Duality of a Wasp Venom Peptide Toxin. Toxins, v. 8, p. 61, 2016.

2.
CHURA-CHAMBI, R. M.2016CHURA-CHAMBI, R. M. ; ARCURI, H.A. ; OLIVEIRA, F. L. S. ; SILVA, N. V. ; PALMA, M. S. ; MORGANTI, L. . Structural studies of the protein endostatin in fusion with BAX BH3 death domain, a hybrid that present enhanced antitumoral activity. Biotechnology and Applied Biochemistry, v. 64, p. 1-10, 2016.

3.
DOS SANTOS-PINTO, JOSÉ ROBERTO APARECIDO2016DOS SANTOS-PINTO, JOSÉ ROBERTO APARECIDO ; GARCIA, ANA MARIA CAVIQUIOLI ; ARCURI, HELEN ANDRADE ; ESTEVES, FRANCIELE GREGO ; SALLES, HELIANA CLARA ; LUBEC, GERT ; Palma, Mario Sérgio . Silkomics: insight into the silk spinning process of spiders. Journal of Proteome Research (Print), v. 1, p. acs.jproteome.5b01056, 2016.

4.
DE PONTES, LETICIA GOMES2016DE PONTES, LETICIA GOMES ; CAVASSAN, NAYARA RODRIGUES VIEIRA ; CRESTE, CAMILA FERNANDA ZORZELLA ; JUNIOR, AIRTON LOURENÇO ; ARCURI, HELEN ANDRADE ; FERREIRA, RUI SEABRA ; BARRAVIERA, BENEDITO ; GAGETE, ELAINE ; DOS SANTOS, LUCILENE DELAZARI . Crotoxin: a novel allergen to occupational anaphylaxis. Annals of Allergy, Asthma & Immunology, v. 16, p. 30053-30059, 2016.

5.
APARECIDO DOS SANTOS-PINTO, JOSÉ ROBERTO2015APARECIDO DOS SANTOS-PINTO, JOSÉ ROBERTO ; DELAZARI DOS SANTOS, LUCILENE ; ARCURI, HELEN ANDRADE ; RIBEIRO DA SILVA MENEGASSO, ANALLY ; PÊGO, PALOMA NAPOLEÃO ; SANTOS, KEITY SOUZA ; CASTRO, FÁBIO MORATO ; KALIL, JORGE ELIAS ; DE-SIMONE, SALVATORE GIOVANNI ; Palma, Mario Sergio . B-cell linear epitopes mapping of antigen-5 allergen from Polybia paulista wasp venom. Journal of Allergy and Clinical Immunology, v. 135, p. 264-267.e8, 2015.

6.
MORENO, ADRIANA S.2015MORENO, ADRIANA S. ; VALLE, SOLANGE O.R. ; LEVY, SOLONI ; FRAN'A, ALFEU T. ; SERPA, FARADIBA S. ; ARCURI, HELEN A. ; PALMA, MARIO S. ; CAMPOS, WAGNER N. ; DIAS, MARINA M. ; PONARD, DENISE ; MONNIER, NICOLE ; LUNARDI, JOEL ; BORK, KONRAD ; SILVA, JR., WILSON ARAUJO ; ARRUDA, L. KARLA . Coagulation Factor XII Gene Mutation in Brazilian Families with Hereditary Angioedema with Normal C1 Inhibitor. International Archives of Allergy and Immunology, v. 166, p. 114-120, 2015.

7.
DOS SANTOS-PINTO, JOSÉ ROBERTO APARECIDO2015DOS SANTOS-PINTO, JOSÉ ROBERTO APARECIDO ; ARCURI, HELEN ANDRADE ; PRIEWALDER, HELGA ; SALLES, HELIANA CLARA ; Palma, Mario Sérgio ; LUBEC, GERT . A Structural Model for the Spider Silk Protein Spidroin-1. Journal of Proteome Research (Print), v. 1, p. 150727043619009, 2015.

8.
DOS SANTOS-PINTO, JOSÉ ROBERTO APARECIDO2014DOS SANTOS-PINTO, JOSÉ ROBERTO APARECIDO ; DOS SANTOS, LUCILENE DELAZARI ; ANDRADE ARCURI, HELEN ; CASTRO, FÁBIO MORATO ; KALIL, JORGE ELIAS ; Palma, Mario Sergio . Using Proteomic Strategies for Sequencing and Post-Translational Modifications Assignment of Antigen-5, a Major Allergen from the Venom of the Social Wasp Polybia paulista. Journal of Proteome Research (Print), v. 13, p. 855-865, 2014.

9.
MOURELLE, D.2014MOURELLE, D. ; Brigatte, P. ; BRINGANTI, L.D.B. ; DE SOUZA, B.M. ; ARCURI, HA ; GOMES, P.C. ; Baptista-Saidemberg, N.B. ; RUGGIERO NETO, J. ; PALMA, M. S. . Hyperalgesic and edematogenic effects of Secapin-2, a peptide isolated from Africanized honeybee (Apis mellifera) venom. Peptides (New York, N.Y. 1980), v. 59, p. 42-52, 2014.

10.
RUGGIERO NETO, J.2014RUGGIERO NETO, J. ; GOMES, PAULO CESAR ; ARCURI, HA ; DIAS, NATHALIA BAPTISTA ; BRIGATTE, PATRÍCIA ; MOURELLE, DANILO ; Arcuri, Helen Andrade ; dos Santos Cabrera, Marcia Perez ; STABELI, RODRIGO GUERINO ; Palma, Mario Sergio . Structure-function relationships of the peptide Paulistine: A novel toxin from the venom of the social wasp Polybia paulista. Biochimica et Biophysica Acta. G, General Subjects (Print), v. 1840, p. 170-183, 2014.

11.
SANTOS, K. S.2013SANTOS, K. S. ; GADERMAIER, G. ; VEJVAR, E. ; Arcuri, H. A. ; GALVAO, C. E. ; YANG, A. C. ; RESENDE, V. M. F. ; MARTINS, C. O. ; HIMLY, M. ; MARI, A. ; LISO, M. ; SCALA, E. ; BREITENEDER, H. ; WAGNER, S. ; KALIL, JE ; FERREIRA, F. ; CASTRO, FFM . Novel allergens from ancient foods: Man e 5 from manioc ( Manihot esculenta Crantz) cross reacts with Hev b 5 from latex. Molecular Nutrition & Food Research (Print), p. n/a-1109, 2013.

12.
DE AMICIS, KARINE M.2013DE AMICIS, KARINE M. ; DE BARROS, SAMAR FRESCHI ; ALENCAR, RAQUEL E. ; POSTÓL, EDILBERTO ; MARTINS, CARLO DE OLIVEIRA ; ARCURI, HELEN ANDRADE ; GOULART, CIBELLY ; KALIL, JORGE ; GUILHERME, LUIZA . Analysis of the coverage capacity of the StreptInCor candidate vaccine against Streptococcus pyogenes. Vaccine (Guildford), v. 00, p. 00, 2013.

13.
YAMASAKI, LHT2012YAMASAKI, LHT ; ARCURI, HA ; JARDIM, ACG ; BITTAR, C ; de Carvalho-Mello, Isabel Maria VG ; RAHAL, P . New insights regarding HCV-NS5A structure/function and indication of genotypic differences. Virology journal, v. 9, p. 14, 2012.

14.
BAPTISTA-SAIDEMBERG, NB2012BAPTISTA-SAIDEMBERG, NB ; SAIDEMBERG, DM ; RIBEIRO, R. A. ; ARCURI, HA ; PALMA, MS ; CARNEIRO, EM . Agelaia MP-I: A peptide isolated from the venom of the social wasp, Agelaia pallipes pallipes, enhances insulin secretion in mice pancreatic islets. Toxicon (Oxford), v. 1, p. 1-1, 2012.

15.
PINTO, JRAS2012PINTO, JRAS ; SANTOS, LD ; ARCURI, HA ; DIAS, NB ; PALMA, MS . Proteomic characterization of the hyaluronidase (E.C. 3.2.1.35) from the venom of the social wasp Polybia paulist. Protein and Peptide Letters, v. 19, p. 625-635, 2012.

16.
ARCURI, HA;Arcuri, H. A.;ARCURI, HELEN ANDRADE;ANDRADE ARCURI, HELEN;ARCURI, H.A.;ARCURI, HELEN A.;ARCURI, HELEN2011ARCURI, HA; PALMA, MS . Understanding the Structure, Activity and Inhibition of Chorismate Synthase from Mycobacterium tuberculosis. Current Medicinal Chemistry, v. 18, p. 1311-1317, 2011.

17.
Ferraro, M. F.2011Ferraro, M. F. ; Moreno, A. S. ; Castelli, E. C. ; Donadi, E. A. ; Palma, M. S. ; ARCURI, HA ; Lange, A. P. ; Bork, K. ; Sarti, W. ; Arruda, L. K. . A single nucleotide deletion at the C1 inhibitor gene as the cause of hereditary angioedema: insights from a Brazilian family. Allergy (Copenhagen), p. no-no, 2011.

18.
ARCURI, HA2010ARCURI, HA; Zafalon, Geraldo FD ; Marucci, Evandro A ; Bonalumi, Carlos E ; da Silveira, Nelson JF ; Machado, Jose M ; de Azevedo, Walter F ; Palma, Mario S . SKPDB: a structural database of shikimate pathway enzymes. BMC Bioinformatics, v. 11, p. 12, 2010.

19.
Provazzi, Paola JS2010Provazzi, Paola JS ; ARCURI, HA ; de Carvalho-Mello, Isabel Maria VG ; Pinho, João Renato R ; Nogueira, Maurício L ; Palma, Mário S ; Rahal, Paula . Structural studies of Helicase NS3 variants from Hepatitis C virus genotype 3 in virological sustained responder and non-responder patients. BMC Research Notes, v. 3, p. 196, 2010.

20.
da Silva, Alessandra Vaso Rodrigues2009da Silva, Alessandra Vaso Rodrigues ; Resende, Virginia Maria Ferreira ; ARCURI, HA ; dos Santos Cabrera, Marcia Perez ; Ruggiero Neto, João ; Palma, Mario Sergio . Characterization of two novel polyfunctional mastoparan peptides from the venom of the social wasp Polybia paulista. Peptides (New York, N.Y. 1980), v. 30, p. 1387-1395, 2009.

21.
ARCURI, HA;Arcuri, H. A.;ARCURI, HELEN ANDRADE;ANDRADE ARCURI, HELEN;ARCURI, H.A.;ARCURI, HELEN A.;ARCURI, HELEN2008ARCURI, HA; BORGES, JC ; FONSECA, IO ; PEREIRA, JH ; RUGGIERO NETO, J ; BASSO, LA ; SANTOS, DS ; DE AZEVEDO JR, WF . Structural studies shikimate 5-dehydrogenase from Mycobacterium tuberculosis. Proteins (Online), v. 72, p. 720-730, 2008.

22.
ARCURI, HA;Arcuri, H. A.;ARCURI, HELEN ANDRADE;ANDRADE ARCURI, HELEN;ARCURI, H.A.;ARCURI, HELEN A.;ARCURI, HELEN2008ARCURI, HA; APPONI, L ; VALENTINI, S ; DURIGON, E ; DEAZEVEDOJR, W ; FOSSEY, M ; RAHAL, P ; DESOUZA, F . Expression and purification of human respiratory syncytial virus recombinant fusion protein?. Protein Expression and Purification, p. 146, 2008.

23.
DA SILVEIRA, NJF2007DA SILVEIRA, NJF ; BONALUMI, CE ; ARCURI, HA ; DE AZEVEDO JR, WF . Molecular modeling databases: a new way in the search of protein targets for drug development. Current Bioinformatics (Print), v. 2, p. 1-10, 2007.

24.
SANTOS, LD2007SANTOS, LD ; SANTOS, KS ; DE SOUZA, BM ; ARCURI, HA ; CUNHA-NETO, E ; CASTRO, FFM ; KALIL, JE ; PALMA, MS . Purification, sequencing and structural characterization of the phospholipase A 1 from the venom of the social wasp Polybia paulista (Hymenoptera, Vespidae). Toxicon, v. 50, p. 923-937, 2007.

25.
DA SILVEIRA, NJF2005DA SILVEIRA, NJF ; ARCURI, HA ; BONALUMI, CE ; DE SOUZA, FP ; MELLO, IMVGC ; RAHAL, P ; PINHO, JRRP ; DE AZEVEDO JR, WF . Molecular models of NS3 protease variants of the Hepatitis C virus. BMC STRUCTURAL BIOLOGY, v. 5, p. 1-5, 2005.

26.
MANHANI, KK2005MANHANI, KK ; ARCURI, HA ; DA SILVEIRA, NJF ; UCHÔA, HB ; DE AZEVEDO JR, WF ; CANDURI, F . Molecular Model of Protein Kinase 6 from Plasmodium falciparum. Journal of Molecular Modeling (Online), v. 12, p. 42-48, 2005.

27.
ARCURI, HA;Arcuri, H. A.;ARCURI, HELEN ANDRADE;ANDRADE ARCURI, HELEN;ARCURI, H.A.;ARCURI, HELEN A.;ARCURI, HELEN2004 ARCURI, HA; CANDURI, F ; PEREIRA, JH ; DA SILVEIRA, NJF ; CÂMERA JR, JC ; DE OLIVEIRA, JS ; BASSO, LA ; PALMA, MS ; SANTOS, DS ; DE AZEVEDO JR, WF . Molecular models for shikimate pathway enzymes of Xylella fastidiosa. Biochemical and Biophysical Research Communications, v. 320, n.3, p. 979-991, 2004.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
ARCURI, HA; ZIMBARDI, D. . Dinamic transcriptomic signatures detected in female skin aging.. In: Society for Investigative Dermatology Annual Meeting, 2015, Atlanta. Society for Investigative Dermatology Annual Meeting, 2015.

2.
MORENO, AS ; ARCURI, HELEN ; PALMA, MS ; ARRUDA, LK . Structural and Molecular Changes Caused By Mutations Thr328Lys and Thr328Arg In FXII Associated With Hereditary Angioedema With Normal C1 Inhibitor. In: American Academy of Allergy Asthma and Immunology 2014 Annual Meeting, 2014, San Diego. Journal of Allergy and Clinical Immunology, 2014. v. 133. p. AB39.

3.
MORENO, AS ; Valle, S.O.R. ; Franca, A.T. ; Levy, S.A. ; SERPA, F. S. ; Monnier, N. ; Ponard, D. ; LUNARDI, JOEL ; DIAS, M. M. ; CAMPOS, W. N. ; ARCURI, HA ; PALMA, MS ; SILVA JUNIOR, W. A. ; ARRUDA, LK . Mutation in factor XII gene in Brazilian families associated with hereditary angioedema with normal C1 inhibitor. In: World Allergy and Asthma Congress 2013 - European Academy of Allergy and World Allergy Organization, 2013, Milan. Allergy, 2013. v. 68. p. 14-15.

4.
GOMES, P. C. ; DE SOUZA, BM ; DIAS, NB ; BRIGATTE, P. ; MOURELLE, D. ; CABRERA, M. P. S. ; ARCURI, HA ; RUGGIERO NETO, J ; PALMA, MS . Influence of Intramolecular Disulfide Bridge on the Structure and Action of the Novel Peptide Isolated from the Venom of the Social Wasp Polybia paulista.. In: XLI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular SBBq, 2012, Foz do Iguaçu. XLI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular SBBq, 2012.

5.
ARCURI, HA; KALIL, JE ; PALMA, MS ; CASTRO, FFM . AllergenNet: a database applied to the study of allergenic proteins. In: 19th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB) and 10th European Conference on Computational Biology (ECCB), 2011, Viena. Abstract book. USA: International Society for Computational biology, 2011. v. 1. p. 48-48.

6.
ARCURI, HA; SANTOS, KS ; KALIL, JE ; PALMA, MS ; CASTRO, FFM . AllergenNet: uma base de dados de proteínas alergênicas. In: XXXVIII Congresso Brasileiro de Alergia e Imunopatologia, 2011, Fortaleza. CD de Resumos. São Paulo: Sociedad de Alergia e Imunologia, 2011. v. 1. p. 1-1.

7.
Delgado, CC ; ARCURI, HA ; Almeida, JS ; MIRAGAIA, Maria ; LANCASTRE, H ; DEUS, H. F. . A new user-friendly Web Infrastructure for the study of the Molecular Epidemiology of Staphylococcus aureus. In: Microbiotec´11, 2011, Braga. Abstract book, 2011.

8.
BAPTISTA-SAIDEMBERG, NB ; SAIDEMBERG, DM ; ARCURI, HA ; MARTINS, JCR ; RIBEIRO, RA ; CAMARGO, RL ; PALMA, MS ; CARNEIRO, EM . Insulin release stimulated by Agelaia MPI, a peptide Iiolated from the social wasp Agelaia pallipes pallipes venom.. In: 17th Meeting of the European Section of the International Society on Toxinology (IST), 2011, Valência. 17th Meeting of the European Section of the International Society on Toxinology (IST), 2011.

9.
ARCURI, HA; KALIL, JE ; PALMA, MS ; CASTRO, FFM . The web server AllergenNet: database and analysis resource for allergenic proteins. In: 14th International Conference on Research in Computational Molecular Biology (RECOMB), 2010, Lisboa. Abstract book. Lisboa: RECOMB, 2010. v. 1. p. 1-1.

10.
PROVAZZI, PJS ; ARCURI, HA ; OLIVA, CB ; PALMA, MS ; MELLO, IMVGC ; PINHO, JRR ; RAHAL, P . Structural studies of helicase NS3 variants from hepatitis C virus. In: 13 International Symposium on Viral Hepatitis and Liver Disease, 2009, Washington. Abstract Book. Washington: American Associaton for the study of liver diseases, 2009. v. 1. p. 42-42.

11.
YAMASAKI, LHT ; ARCURI, HA ; JARDIM, ACG ; OLIVA, CB ; MELLO, IMVGC ; PINHO, JRR ; RAHAL, P . Estudo In Silico de Estrutura e Função da Proteína Não-Estrutural 5a (NS5A) do Vírus da Hepatite C (HCV) em Pacientes Infectados com o Genótipo 1 e 3. In: 25 Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2009, Porto de Galinhas. Abstract Book, 2009. v. 1.

12.
ARCURI, HA; DA SILVEIRA, NJF ; BONALUMI, CE ; DE AZEVEDO JR, WF ; PALMA, MS . SKPDB: a database of comparative protein structure models for shikimate pathway enzymes of microorganisms. In: International Conference Drug Design and Discovery for Developing Countries, 2008, Trieste - Italia. Book of Abstracts. Trieste - Italia: ICS UNIDO, 2008. v. 1. p. 113-113.

13.
YAMASAKI, LHT ; ARCURI, HA ; JARDIM, ACG ; BITTAR, C ; MELLO, IMVGC ; PINHO, JRRP ; RAHAL, P . Bioinformatics analysis of Hepatitis C virus protein NS5A in patients with different responses to treatment. In: First Brazilian School on Bioinformatics (EBB - Escola Brasileira de Bioinformática), 2008, Santo André - SP. Abstract Book, 2008. v. 1.

14.
ARCURI, HA; BORGES, JC ; FONSECA, IO ; PEREIRA, JH ; RUGGIERO NETO, J ; BASSO, LA ; SANTOS, DS ; DE AZEVEDO JR, WF . Structural studies shikimate 5-dehydrogenase from Mycobacterium tuberculosis. In: X Meeting, 2007, São Paulo. CD com Resumos. Campinas: EMBRAPA Informatica Agropecuaria, 2007. v. 1. p. 1-1.

15.
DOMINGUES, MN ; GAVA, LM ; ARCURI, HA ; RAMOS, CHI ; RUGGIERO NETO, J ; BORGES, JC . Molecular Modeling of human molecular chaperone Hsp40 DjA1 as monomer and dimer. In: XXXV Reunião Anual Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular SBBq, 2006, Águas de Lindóia - SP. Programa e Resumos da XXXII Reunião Anual/2006. São Paulo: Sociedade Brasileira de Bioquimica e Biologia Molecular - SBBq, 2006. v. 1.

16.
DA SILVEIRA, NJF ; BONALUMI, CE ; ARCURI, HA ; DE AZEVEDO JR, WF . DBMODELING - A database of structural models of proteins. In: In Silico Analysis of Proteins - Celebrating the 20th Anniversary of Swiss Prot, 2006, Fortaleza - CE. Program and Abstract Book, 2006. v. 1.

17.
ARCURI, HA; CANDURI, F ; PEREIRA, JH ; DA SILVEIRA, NJF ; CÂMERA JR, JC ; DE OLIVEIRA, JS ; BASSO, LA ; SANTOS, DS ; DE AZEVEDO JR, WF . Structural Bioinformatics Applied to Study for Shikimate Pathway Enzymes of Xylella fastidiosa. In: 1 st Latin American Protein Society Meeting (1st LAPSM), 2004, Angra dos Reis - RJ. Abstracts and Programs. Angra dos Reis - RJ, 2004. v. 1. p. 265-265.

18.
ARCURI, HA; CANDURI, F ; CÂMERA JR, JC ; PANZARINI JR, JR ; DE SOUZA, D ; DE AZEVEDO JR, WF . Structural Bioinformatics Applied to Stydy of Fastidian Gum Enzymes of Xylella fastidiosa. In: II International Conference on Bioinformatics and Computational Biology (ICOBICOBI), 2004, Andra dos Reis - RJ. Livro de Resumos. Angra dos Reis - RJ, 2004. v. 1. p. 24-24.

19.
ARCURI, HA; PEREIRA, JH ; CANDURI, F ; CÂMERA JR, JC ; DA SILVEIRA, NJF ; DE AZEVEDO JR, WF . Molecular Model of Shikimate Kinase Isolated from Xylella fastidiosa. In: XXXII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquimica e Biologia Molecular - SBBq, 2003, Caxambú - MG. SBBq/ Programa e Resumos da XXXII Reunião Anual/2003. São Paulo: Sociedade Brasileira de Bioquimica e Biologia Molecular - SBBq, 2003. v. 1. p. 261-261.

Apresentações de Trabalho
1.
ARCURI, HA. AllergenNet: a database of the natural allergens and in silico tools for clinic interest. 2012. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

2.
ARCURI, HA; KALIL, JE ; PALMA, MS ; CASTRO, FFM . AllergenNet: a database applied to the study of allergenic proteins. 2011. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

3.
ARCURI, HA; SANTOS, KS ; KALIL, JE ; PALMA, MS ; CASTRO, FFM . AllergenNet: uma base de dados de proteínas alergênicas. 2011. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

4.
ARCURI, HA; KALIL, JE ; PALMA, MS ; CASTRO, FFM . The web server AllergenNet: database and analysis resource for allergenic proteins. 2010. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

5.
ARCURI, HA; DA SILVEIRA, NJF ; BONALUMI, CE ; DE AZEVEDO JR, WF ; PALMA, MS . SKPDB: a database of comparative protein structure models for shikimate pathway enzymes of microorganisms. 2008. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

6.
ARCURI, HA; BORGES, JC ; FONSECA, IO ; PEREIRA, JH ; RUGGIERO NETO, J ; BASSO, LA ; SANTOS, LD ; DE AZEVEDO JR, WF . Structural studies shikimate 5-dehydrogenase from Mycobacterium tuberculosis. 2007. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

7.
DA SILVEIRA, NJF ; BONALUMI, CE ; ARCURI, HA ; DE AZEVEDO JR, WF . DBMODELING - A database of structural models of proteins. 2006. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

8.
ARCURI, HA; CANDURI, F ; CÂMERA JR, JC ; PANZARINI JR, JR ; DE SOUZA, D ; DE AZEVEDO JR, WF . Structural Bioinformatics Applied to Stydy of Fastidian Gum Enzymes of Xylella fastidiosa. 2004. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

9.
ARCURI, HA; CANDURI, F ; PEREIRA, JH ; DA SILVEIRA, NJF ; CÂMERA JR, JC ; DE OLIVEIRA, JS ; BASSO, LA ; SANTOS, DS ; DE AZEVEDO JR, WF . Structural Bioinformatics Applied to Study for Shikimate Pathway Enzymes of Xylella fastidiosa. 2004. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

10.
ARCURI, HA; PEREIRA, JH ; CANDURI, F ; CÂMERA JR, JC ; DA SILVEIRA, NJF ; DE AZEVEDO JR, WF . Molecular Model of Shikimate Kinase Isolated from Xylella fastidiosa. 2003. (Apresentação de Trabalho/Congresso).


Produção técnica
Programas de computador sem registro
1.
ARCURI, HA; SANTOS, KS ; KALIL, JE ; PALMA, MS ; CASTRO, FFM . AllergenNet. 2010.

2.
ARCURI, HA; LIMA, AN ; BORGES, JC ; DOMINGOS, CRB . Hemoglobinopahties Database - HbDB. 2007.

3.
ARCURI, HA; DA SILVEIRA, NJF ; BONALUMI, CE ; DE AZEVEDO JR, WF ; PALMA, MS . Shikimate Pathway Database - SKPDB. 2007.

4.
DA SILVEIRA, NJF ; BONALUMI, CE ; JORGE, GE ; ARCURI, HA ; OLIVEIRA, NA ; DE AZEVEDO JR, WF . DBMODELING. 2005.

5.
DA SILVEIRA, NJF ; ARCURI, HA ; BONALUMI, CE ; DE AZEVEDO JR, WF . NS3 protease variants of the Hepatitis C virus Database. 2005.

Entrevistas, mesas redondas, programas e comentários na mídia
1.
ARCURI, HA; SANTOS, KS ; KALIL, JE ; PALMA, MS ; CASTRO, FFM . Alergia - O mal do seculo. 2010. (Programa de rádio ou TV/Entrevista).


Demais tipos de produção técnica


Bancas



Participação em bancas de trabalhos de conclusão
Mestrado
1.
RODRIGUES, I. C.; VELOSO, M. P.; ARCURI, H.A.. Participação em banca de Washington Almeida Pereira. Docking de Fragmentos Aplicados no Desenvolvimento de Inibidores Tirosina Quinase em Leucemia Mieloide Crônica.. 2015. Dissertação (Mestrado em Química) - Universidade Federal de Alfenas.

2.
da Silveira, Nelson JF; VELOSO, M. P.; ARCURI, H.A.. Participação em banca de Thiago Castilho Elias. Simulação Computacional de Mutações em Plasmodium falciparum que podem conferir resistência e busca de novos farmacos capazes de combater o mutante. 2014. Dissertação (Mestrado em Química) - Universidade Federal de Alfenas.



Participação em bancas de comissões julgadoras
Outras participações
1.
Arcuri, H. A.. IV BioCelMol - Simpósio de Biologia Celular e Molecular. 2015. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.



Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
9° International Workshop on Molecular Biology of Stress Responses. 2012. (Encontro).

2.
I Congresso Latino Americano de Métodos Alternativos ao Uso de Animais no Ensino, Pesquisa e Indústria - COLAMAma. AllergenNet: a database of the natural allergens and in silico tools for clinic interest. 2012. (Congresso).

3.
19th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB) and 10th European Conference on Computational Biology (ECCB). AllergenNet: a database applied to the study of allergenic proteins. 2011. (Congresso).

4.
XXXVIII Congresso Brasileiro de Alergia e Imunopatologia. AllergenNet: uma base de dados de proteínas alergênicas.. 2011. (Congresso).

5.
14th Conference on Research in Computational Molecular Biology. The web server AllergenNet: database and analysis resource for allergenic proteins. 2010. (Congresso).

6.
XII Encontro Cientifico da Disciplina de Imunologia Clinica e Alergia da Faculdade de Medicina da USP. 2010. (Encontro).

7.
First Workshop in Proteomics in the New World. 2008. (Outra).

8.
International Conference Drug Design and Discovery for Developing Countries. SKPDB: a database of comparative protein structure models for shikimate pathways enzymes of microorganisms. 2008. (Congresso).

9.
XI Encontro Cientifico da Disciplina de Imunologia Clinica e Alergia da Faculdade de Medicina da USP. 2008. (Encontro).

10.
X Meeting. Structural studies shikimate 5-dehydrogenase from Mycobacterium tuberculosis. 2007. (Congresso).

11.
Silico Analysis of Proteins - Celebrating the 20th Anniversary of Swiss Prot. DBMODELING - A database of strctural models of proteins. 2006. (Congresso).

12.
II Escola de Modelagem Modelagem Molecular em Sistemas Biologicos (EMSB). 2004. (Outra).

13.
Molecular Models for Shikimate Pathway Enzymes of Xylella fastidiosa.I Semana da Pós-Graduação em Biofísica Molecular. 2004. (Outra).

14.
Structural Bioinformatics Applied to Study for Shikimate Pathway Enzymes of Xylella fastidiosa. 1 st Latin American Protein Society Meeting (1st LAPSM). 2004. (Congresso).

15.
Structural Bioinformatics Applied to Stydy of Fastidian Gum Enzymes of Xylella fastidiosa. II International Conference on Bioinformatics and Computational Biology (ICOBICOBI). 2004. (Congresso).

16.
Curso de Extensão de Verão em Biofisica Molecular.Curso de Extensão de Verão em Biofisica Molecular. 2003. (Outra).

17.
Molecular Model of Shikimate Kinase Isolated from Xylella fastidiosa. XXXII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquimica e Biologia Molecular - SBBq. 2003. (Congresso).



Orientações



Orientações e supervisões concluídas
Dissertação de mestrado
1.
Lilian Hiromi Tomonari Yamasaki. Análise por ferramentas de bioinformática da proteína não-estrutural 5A do vírus da hepatite C genótipo 1 e 3 em amostras pré-tratamento. 2008. Dissertação (Mestrado em Microbiologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Coorientador: Helen Andrade Arcuri.




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