Marbella Maria Bernardes da Fonseca

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  • Última atualização do currículo em 29/10/2018


Atualmente realiza pós-doutorado no Laboratório de Biologia Molecular e Genômica - UFRN, atua como professora colaboradora no Depto de Biologia Celular e Genética - UFRN, ministrando aulas na Disciplina de Genética (DBG0146) no curso de Ciências Biológicas -Licenciatura (UFRN) e cursa graduação em Estatística na UFRN. Possui graduação em Ciências Biológicas, bacharelado (2003) e licenciatura (2005) pela UFRN e mestrado em Genética e Biologia Molecular pela mesma instituição (2006). Além de graduação em Sistemas de Informação pela Universidade Potiguar (2006). Em 2011, obteve o título de doutor em Ciências Biológicas (Genética) pela UFRJ, sendo sua tese desenvolvida no Labinfo no LNCC, no Centro de Biotecnologia da UFRGS e no PROCC na FioCruz. Realizou oito meses de pós-doutorado no LNCC/Labinfo (2011/2012), dois anos (2012-2014) no SGC (Structural Genomics Consortium) na Universidade de Oxford e um ano no Instituto do Cérebro (UFRN) (2014-2015) . Tem experiência na área de Estrutura de proteína, Biologia Molecular e Bioinformática atuando principalmente nos seguintes temas: micoplasma, modelagem e dinâmica molecular, drug screening, Bromodomínios, metagenômica. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Marbella Maria Bernardes da Fonseca
Nome em citações bibliográficas
FONSÊCA, M. M. B.;Fonsêca, Marbella Maria;da Fonsêca, Marbella Maria;DA FONSECA;DA FONSÊCA, Marbella Maria;DA FONSÊCA, Marbella M.;FONSÊCA, MARBELLA MARIA B. DA;FONSECA, MARBELLA;DA FONSECA, MARBELLA MARIA BERNARDES

Endereço


Endereço Profissional
Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Instituto do Cérebro.
Avenida Nascimento de Castro -
Lagoa Nova
59056450 - Natal, RN - Brasil
Telefone: (84) 32152709
URL da Homepage: http://www.thesgc.org/scientists/groups/oxford/


Formação acadêmica/titulação


2007 - 2011
Doutorado em Ciências Biológicas (Genética).
Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.
Título: Caracterização estrutural e funcional de proteínas hipotéticas em Mycoplasma hyopneumoniae, Ano de obtenção: 2011.
Orientador: Ana Tereza Ribeiro de Vasconcelos.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
2004 - 2006
Mestrado em Genética e Biologia Molecular.
Universidade Federal do Rio Grande do Norte, UFRN, Brasil.
Título: Modelo estrutural da proteína recA de Mycoplasma synoviae,Ano de Obtenção: 2006.
Orientador: Lucymara Fassarela Agnez-Lima.
Palavras-chave: DNA repair; recombination; RecA; Mycoplasma synoviae.
2016
Graduação em andamento em Estatística.
Universidade Federal do Rio Grande do Norte, UFRN, Brasil.
1998 - 2006
Graduação em Sistemas de Informação.
Universidade Potiguar, UnP, Brasil.
Título: Sistema de Controle de Beneficiamento de Algodão.
Orientador: Hildeljundes Macedo Paulino.
2004 - 2005
Graduação em Ciências Biológicas.
Universidade Federal do Rio Grande do Norte, UFRN, Brasil.
1999 - 2003
Graduação em Ciências Biológicas.
Universidade Federal do Rio Grande do Norte, UFRN, Brasil.
Título: Análise e Identificação dos genes envolvidos nas vias de reparo por excisão em Mycoplasma synoviae.
Orientador: Lucymara Fassarela Agnez-Lima.


Pós-doutorado


2014
Pós-Doutorado.
Universidade Federal do Rio Grande do Norte, UFRN, Brasil.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
2012 - 2014
Pós-Doutorado.
Structural Genomics Consortium, SGC, Grã-Bretanha.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Química de Macromoléculas / Especialidade: Proteínas.
2011 - 2012
Pós-Doutorado.
Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.


Formação Complementar


2013 - 2013
Computational Biochemistry. (Carga horária: 40h).
University of Oxford, OX, Inglaterra.
2009 - 2009
Bioinformatic: Computer Methods Molecular Biology. (Carga horária: 80h).
Int Centre for Genetic Engineering and Biotechnology, ICGEB, Itália.
2009 - 2009
Bioinformatics & Comparative Genome Analysis. (Carga horária: 90h).
Institut Pasteur, IP, Hong Kong.
2008 - 2008
Third Workshop Comparative Microbial Genomics and. (Carga horária: 60h).
Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.
2008 - 2008
First Workshop Proteomics in the New World. (Carga horária: 40h).
Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.
2006 - 2006
Theoretical and Practical Course in Bioinformatics. (Carga horária: 80h).
Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.
2006 - 2006
Français Langue Étrangère. (Carga horária: 260h).
Language Studies Canada, LSC, Canadá.
2003 - 2003
Intensive English Language Course. (Carga horária: 80h).
Emerald Cultural Institute, ECI, Irlanda.
2002 - 2002
ELICOS Course. (Carga horária: 140h).
Phoenix English Language Academy, PELA, Austrália.


Atuação Profissional



Structural Genomics Consortium, SGC, Grã-Bretanha.
Vínculo institucional

2012 - 2014
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pós-doutoranda


Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.
Vínculo institucional

2011 - 2012
Vínculo: Livre, Enquadramento Funcional: Pós-doutoranda, Regime: Dedicação exclusiva.


Universidade Federal do Rio Grande do Sul, UFRGS, Brasil.
Vínculo institucional

2008 - 2008
Vínculo: Livre, Enquadramento Funcional: Pesquisadora visitante, Regime: Dedicação exclusiva.


Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.
Vínculo institucional

2007 - 2011
Vínculo: Livre, Enquadramento Funcional: Doutoranda, Regime: Dedicação exclusiva.


Universidade Federal do Rio Grande do Norte, UFRN, Brasil.
Vínculo institucional

2017 - Atual
Vínculo: Professor Visitante, Enquadramento Funcional: Professor colaborador
Outras informações
Disciplina GENÉTICA ministrada para o curso de Ciências Biológicas,sob o código DBG0146. O Programa de Professor Colaborador Voluntário foi instituído na UFRN de acordo com a resolução n 095/2006-CONSEPE de 18 de julho de 2006.

Vínculo institucional

2014 - Atual
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pós-doutoranda

Vínculo institucional

2004 - 2006
Vínculo: Livre, Enquadramento Funcional: Mestranda

Vínculo institucional

2002 - 2004
Vínculo: Livre, Enquadramento Funcional: Estagiária



Projetos de pesquisa


2016 - Atual
Metagenômica aplicada à avaliação dos efeitos da injeção de CO2 na microbiota de reservatórios
Descrição: Esta proposta envolve diferentes domínios de investigação para chegar a uma abordagem multidisciplinar coordenada visando o desenvolvimento de ferramentas e procedimentos para identificar (a) padrões de diversidade taxonômica e funcional de comunidades microbianas e (b) novos genes envolvidos com redução de sulfato, metanogênese, degradação de hidrocarbonetos, produção de surfactantes, entre outros, os quais possuem potencial para o desenvolvimento de estratégias biotecnológicas aplicadas a produção de petróleo. A partir disso, pretende-se monitorar a dinâmica das comunidades microbianas presentes em reservatórios submetidos à injeção de CO2 e estimar os impactos dessas microbiotas sobre a produção de petróleo. A partir do conhecimento adquirido será possível entender melhor os mecanismos bioquímicos envolvidos e propor estratégias que visem redução de perdas e otimização de processos...
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2016 - Atual
Núcleo de Genômica
Descrição: O laboratório de Genômica e Biologia Molecular da UFRN oferece serviços de análise genômica de larga escala para a comunidade científica através do Núcleo de Genômica- NUGEN. O NUGEN também oferece teste de Nutrigenética e outros testes de diagnóstico molecular..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2014 - 2015
Biologia Sistêmica do Cancer
Descrição: Identificação de genes envolvidos em câncer dentro do surfaceoma humano através da integração de dados genômicos. Além de busca por novos "Câncer/Testis Antigens" utilizando dados genômicos..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
2012 - 2014
Reconhecimento de histonas e análise estrutural em larga escala da família de bromodomínios (BRDs) em 12 diferentes espécies
Descrição: Fornecer uma visão geral da evolução dos BRDs em 12 organismos (Plasmodium falciparum, Cryptosporidium hominis, Entamoeba histolytica, Dictyostelium discoideum, S. cerevisiae, Monosiga brevicollis, Caenorhabditis elegans, Arabidopsis thaliana, Drosophila melanogaster, Strongylocentrotus purpuratus, Danio rerio, Mus musculus). Entender a expansão do número desses domínios dentre os organismos e correlacionar com eventos de duplicação, perda gênica. Visando complementar a análise evolutiva e a análise dos resultados de bioinformática, BRD de diversos organismos modelos, como Plasmodium falciparum, Cryptosporidium parvum, Arabidopsis thaliana e Drosophila melanogaster serao alvos de experimentos de cristalografia, screening de compostos e peptideos..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
2012 - 2012
Abordagem multidisciplinar no estudo da biodiversidade, interação e metabolismo bacteriano em suínos
Descrição: exploração bioinformática da biodiversidade do ecossistema bacteriano do trato respiratório de suínos..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
2007 - 2011
Genômica Computacional: geração, processamento e interpretação de dados genômicos
Descrição: Aprimorar a anotação do organismo M. hyopneumoniae 7448 utilizando a metodologia de threading, modelagem molecular e ensaios experimentais.
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Doutorado: (1) .
Integrantes: Marbella Maria Bernardes da Fonseca - Integrante / Ana Tereza Vasconcelos - Coordenador / Arnaldo Zaha - Integrante / Caffarena, Ernesto R. - Integrante.
2004 - 2006
Genoma funcional de Chromobacterium violaceum e Mycoplasma synoviae:. Grupo RL
Descrição: Este projeto é uma continuação do projeto genoma brasileiro, formado por 25 laboratórios distribuidos por todo Brasil, sob coordenação geral da Dra. Ana Tereza de Vasconcelos (LNCC-MCT). O principal objetivo deste projeto é verificar a atividade de 28 genes, os quais foram objeto de patente, visando a validação das patentes solicitadas. Dentre as atividades que estão sendo estudadas estão: atividade antimicrobiana, biodegradação de xenobióticos, biorremediação de metais pesados, entre outras. Está sob responsabilidade do grupo RL (UFRN) os seguintes objetivos: a) realizar a caracterização da violaceína, pigmento produzido pela Chromobacterium violaceum, quanto ao seu potencial como fotossensibilizador; b) Construção de uma biblioteca de mutantes de C. violaceum por inserção aleatória de elementos de transposição c) avaliar se polimorfismos da proteína RecA de diferentes isolados de Mycoplasma synoviae e Mycoplasma hyopneumoniae estariam relacionadas a maior ou menor eficiência de recombinação em regiões repetitivas dos genomas relacionadas a patogenicidade.
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) .
Integrantes: Marbella Maria Bernardes da Fonseca - Integrante / Kátia Castanho Scortecci - Integrante / Silvia Bastistuzzo de Medeiros - Integrante / Lucymara Fassarela Agnez Lima - Coordenador / Lucila Carmem Monte Egito - Integrante / Aurizangela Oliveira de Sousa - Integrante.


Revisor de periódico


2013 - Atual
Periódico: BMC Genomics
2015 - Atual
Periódico: Brazilian Journal of Veterinary Research and Animal Science (Impresso)


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética.
2.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.


Idiomas


Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.
Francês
Compreende Razoavelmente, Fala Pouco, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.


Produções



Produção bibliográfica
Artigos completos publicados em periódicos

1.
DA FONSECA, MARBELLA MARIA BERNARDES2019DA FONSECA, MARBELLA MARIA BERNARDES; MINNICELLI, CAROLINA FONSECA ; SILVA-PORTELA, RITA DE CÁSSIA BARRETO ; DE FARIAS, MIRNA FERREIRA ; DOS SANTOS, PAULA RAFAELA SILVA ; FERNANDES, GLAUBER JOSÉ TUROLLA ; Agnez-Lima, Lucymara Fassarella . Unlocking and functional profiling of the bacterial communities in diesel tanks upon additive treatment. FUEL, v. 236, p. 1311-1320, 2019.

2.
GOLBERT, DAIANE CRISTINA F.2017GOLBERT, DAIANE CRISTINA F. ; SANTANA-VAN-VLIET, ELIANE ; RIBEIRO-ALVES, MARCELO ; FONSÊCA, MARBELLA MARIA B. DA ; LEPLETIER, AILIN ; MENDES-DA-CRUZ, DANIELLA ARÊAS ; LOSS, GUILHERME ; COTTA-DE-ALMEIDA, VINÍCIUS ; VASCONCELOS, ANA TEREZA R. ; SAVINO, WILSON . Small interference ITGA6 gene targeting in the human thymic epithelium differentially regulates the expression of immunological synapse-related genes. Cell Adhesion & Migration, v. 11, p. 1-16, 2017.

3.
DA SILVA, VANDECLECIO2017DA SILVA, VANDECLECIO ; FONSECA, ANDRÉ ; FONSECA, MARBELLA ; DA SILVA, THAYNA ; COELHO, ANA ; KROLL, JOSÉ ; DE SOUZA, JORGE ; STRANSKY, BEATRIZ ; DE SOUZA, GUSTAVO ; DE SOUZA, SANDRO . Genome-wide identification of cancer/testis genes and their association with prognosis in a pan-cancer analysis. Oncotarget, v. 10, p. 92966-92977, 2017.

4.
FONSECA, ANDRÉ L.2016FONSECA, ANDRÉ L. ; DA SILVA, VANDECLÉCIO L. ; DA FONSÊCA, Marbella M. ; MEIRA, ISABELLA T. J. ; DA SILVA, THAYNÁ E. ; KROLL, JOSÉ E. ; RIBEIRO-DOS-SANTOS, ANDRÉ M. ; FREITAS, CLÉBER R. ; FURTADO, RAIMUNDO ; DE SOUZA, JORGE E. ; STRANSKY, BEATRIZ ; DE SOUZA, SANDRO J. . Bioinformatics Analysis of the Human Surfaceome Reveals New Targets for a Variety of Tumor Types. International Journal of Genomics, v. 2016, p. 1-7, 2016.

5.
SIQUEIRA, FRANCIELE MABONI2013SIQUEIRA, FRANCIELE MABONI ; THOMPSON, CLAUDIA ELIZABETH ; VIRGINIO, VERIDIANA GOMES ; GONCHOROSKI, TAYLOR ; REOLON, LUCIANO ; ALMEIDA, LUIZ GONZAGA ; da Fonsêca, Marbella Maria ; DE SOUZA, RANGEL ; PROSDOCIMI, FRANCISCO ; SCHRANK, IRENE SILVEIRA ; Ferreira, Henrique Bunselmeyer ; DE VASCONCELOS, ANA TEREZA ; Zaha, Arnaldo . New insights on the biology of swine respiratory tract mycoplasmas from a comparative genome analysis. BMC Genomics, v. 14, p. 175, 2013.

6.
Lorenzatto, Karina Rodrigues2012 Lorenzatto, Karina Rodrigues ; Monteiro, Karina Mariante ; Paredes, Rodolfo ; Paludo, Gabriela Prado ; da Fonsêca, Marbella Maria ; Galanti, Norbel ; Zaha, Arnaldo ; Ferreira, Henrique Bunselmeyer . Fructose-bisphosphate aldolase and enolase from Echinococcus granulosus: Genes, expression patterns and protein interactions of two potential moonlighting proteins. Gene (Amsterdam), v. 506, p. 76-84, 2012.

7.
FONSÊCA, M. M. B.;Fonsêca, Marbella Maria;da Fonsêca, Marbella Maria;DA FONSECA;DA FONSÊCA, Marbella Maria;DA FONSÊCA, Marbella M.;FONSÊCA, MARBELLA MARIA B. DA;FONSECA, MARBELLA;DA FONSECA, MARBELLA MARIA BERNARDES2011FONSÊCA, M. M. B.; ZAHA, Arnaldo ; Caffarena, Ernesto R. ; Vasconcelos, Ana Tereza Ribeiro . Structure-based functional inference of hypothetical proteins from Mycoplasma hyopneumoniae. Journal of Molecular Modeling (Print), v. xx, p. xx, 2011.

8.
Fonseca, Marbella Maria2007Fonseca, Marbella Maria ; Alarcon, Frank J.B. ; Vasconcelos, Ana Tereza de ; Agnez-Lima, Lucymara Fassarela ; Fonsêca, Marbella Maria . A model for the RecA protein of Mycoplasma synoviae. Genetics and Molecular Biology (Impresso), v. 30, p. 290-295, 2007.

9.
Carvalho, Fabíola Marques2005 Carvalho, Fabí ; Fonseca, Marbella Maria ; Batistuzzo De Medeiros, Sí ; Scortecci, Kátia Castanho ; BLAHA, Carlos Alfredo Galindo ; Agnez-Lima, Lucymara Fassarella ; Fonsêca, Marbella Maria . DNA repair in reduced genome: The Mycoplasma model. Gene (Amsterdam), v. 360, p. 111-119, 2005.

Resumos expandidos publicados em anais de congressos
1.
FONSÊCA, M. M. B.; ZAHA, A. ; Caffarena, Ernesto R. ; VASCONCELOS, Ana Tereza . Structure-based functional inference of hypothetical proteins from Mycoplasma hyopneumoniae. In: VI X-meeting, 2010, Ouro Preto. VI X-meeting, 2010.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
A. Delga ; JAUNEAU, A. ; POUZET, C. ; Fonsêca, Marbella Maria ; KRAUT, A. ; KNAPP, S. ; MARCO, Y. ; DESLANDES, L. . The Ralstonia solanacearum Popp2 effector acetylates bromodomain Containing proteins: towards a novel virulence stra Tegy that targets Epigenetic readers?. In: International Congress on Molecular Plant-Microbe Interactions, 2014, Rhodes. XVI International Congress on Molecular Plant-Microbe Interactions, 2014.

2.
FONSÊCA, M. M. B.; VASCONCELOS, Ana Tereza ; ZAHA, A. . Using threading for gene function prediction in Mycoplasma hyopneumoniae 7448 genome. In: X-meeting 2007, 2007, São Paulo. X-meeting.

3.
FONSÊCA, M. M. B.; ALARCON, Frank J B ; VASCONCELOS, Ana Tereza ; LIMA, Lucymara Fassarela Agnez . A structural model to RecA protein from Mycoplasma synoviae. In: In-silico Analysis of Proteins: Celebrating the 20th Anniversary of Swiss-Prot, 2006, Fortaleza. Celebrating the 20th Anniversary of Swiss-Prot, 2006.

4.
FONSÊCA, M. M. B.; LIMA, Lucymara Fassarela Agnez . Análise de Polimorfismos da protéina RecA em diferentes isolados de Mycoplasma synoviae. In: VII Congresso Brasileiro de Mutagênese, Carcinogênese e Teratogênese Ambiental, 2005, Natal. VII Congresso Brasileiro de Mutagênese, Carcinogênese e Teratogênese Ambiental, 2005.

5.
FONSÊCA, M. M. B.; CARVALHO, F. M. ; LIMA, L. F. A. ; MEDEIROS, S. R. B. . Reparo de DNA em genoma reduzido: Modelo Mycoplasma. In: 50º Congresso Brasileiro de Genética, 2004, Florianópolis. 50º Congresso Brasileiro de Genética, 2004.

6.
FONSÊCA, M. M. B.; CARVALHO, F. M. ; DUARTE, Fábio Teixeira ; BLAHA, Carlos Galindo ; MEDEIROS, Silvia Bastistuzzo de ; LIMA, L. F. A. . Identificação de Genes Envlvidos nas vias de Reparo de DNA de Mycoplasma synoviae. In: 49° Congresso Brasileiro de Genética, 2003, Águas de Lindóia, 2003.


Demais tipos de produção técnica
1.
LIMA, L. F. A. ; FONSÊCA, M. M. B. . Análise Metagenômica: Da extração de DNA à análise de dados de sequenciamento. 2018. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

2.
FONSÊCA, M. M. B.. Genômica Funcional de Microrganismos Patogênicos. 2009. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).



Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
VI X-meeting. STRUCTURE-BASED FUNCTIONAL INFERENCE OF HYPOTHETICAL PROTEINS FROM MYCOPLASMA HYOPNEUMONIAE. 2010. (Congresso).

2.
The Third Workshop on Comparative Microbial Genomics and Taxonomy. 2008. (Simpósio).

3.
X-meeting 2007, The Third Annual Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology. Using threading for gene function prediction in Mycoplasma hyopneumoniae 7448 genome. 2007. (Congresso).

4.
Global Diagogues on Emerging Science and Technology (GDEST) - Conference on Bioinformatics. 2006. (Encontro).

5.
In-silico Analysis of Proteins: Celebrating the 20th Anniversary of Swiss-Prot. A structural model to RecA protein from Mycoplasma synoviae. 2006. (Congresso).

6.
51° Congresso Brasileiro de Genética. 2005. (Congresso).

7.
VII Congresso Brasileiro de Mutagênese, Carcinogênese e Teratogênese Ambiental. Análise de Polimorfismos da protéina RecA em diferentes isolados de Mycoplasma synoviae. 2005. (Congresso).

8.
50° Congresso Brasileiro de Genética. Reparo de DNA em genoma reduzido: MODELO Mycoplasma. 2004. (Congresso).

9.
49° Congresso Nacional de Genética. Identificação de genes envolvidos nas vias de Reparo de DNA de Mycoplasma synoviae. 2003. (Congresso).

10.
XIV Congresso de Iniciação Científica. Análise Filogenética de genes de reparo de DNA de Mycoplasma synoviae. 2003. (Congresso).

11.
XXI Congresso da Sociedade Brasileira de Computação. 2001. (Congresso).

12.
XX Congresso Nacional da Sociedade Brasileira de Computação. 2000. (Congresso).

13.
XXIII Congresso Brasileiro de Zoologia. 2000. (Congresso).

14.
XIV Encontro de Genética do Nordeste. 1999. (Encontro).



Outras informações relevantes


Submeteu-se e passou nos seguintes exame de língua inglesa promovidos pela Universidade de Cambridge, Inglaterra: FCE (First Certificate in English) e CAE (Cambridge in Advanced English). Assim como passou no DELF (Diplôme d'Etudes en Langue Française), nível A1.



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