Amanda Freire de Assis

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  • Última atualização do currículo em 05/11/2018


Graduada em Ciências Biológicas - Licenciatura Plena, pela Universidade do Estado de Minas Gerais (2005). Mestre (2010) e Doutora (2015) em Ciências Biológicas - Área de Concentração: Genética, pela Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto / USP. Realizou pós-doutoramento no laboratório de Imunogenética Molecular (Dep. de Genética, FMRP/USP). Atuou como pesquisadora visitante no laboratório da professora Nancy Manley (Department of Genetics University of Georgia) desenvolvendo um projeto sobre o papel dos microRNAs na diferenciação dos timos torácico e cervical em camundongos. Esta pesquisa é parte de um projeto colaborativo entre o CNPq (Brasil) e o NIH (EUA) coordenado pelos pesquisadores: Professora Dra. Nancy R. Manley (University of Georgia, Athens, GA, USA), Professora Dra. Ellen Richie (MD Anderson Cancer Center, Smithville, TX, USA) e Professor Dr. Geraldo A. S. Passos (Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, SP, Brazil). Possui experiência nas áreas de genética de populações, genética molecular, imunogenética molecular e genômica funcional (análise do transcriptoma) por meio da técnica de Microarrays, sequenciamento de Nova Geração, RT-qPCR e ferramentas de bioinformática. É coautora dos livros Transcriptomics in Health and Disease (Editora Springer 2014), Introdução ao mundo dos microRNAs (Editora CUBO/SBG 2015e Genome Editing and Engineering: From TALENs, ZFNs and CRISPRs to Molecular Surgery (Cambridge University Press, 2018). (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Amanda Freire de Assis
Nome em citações bibliográficas
ASSIS, AF;ASSIS AF;ASSIS, A.F.;ASSIS, AMANDA F.;FREIRE ASSIS, AMANDA;ASSIS, AMANDA FREIRE;A. F. Assis

Endereço


Endereço Profissional
Universidade do Estado de Minas Gerais, Unidade Passos.
Avenida Juca Stockler, 1130
Nossa Senhora das Graças
37902407 - Passos, MG - Brasil
Telefone: (35) 35296000
URL da Homepage: http://www.uemg.br/unidade.php?id=18


Formação acadêmica/titulação


2010 - 2015
Doutorado em Ciências Biológicas (Genética).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: Análise do transcriptoma do timo cervical de Mus musculus evidencia a semelhança funcional com o timo torácico, sugerindo que esses órgãos estão sob mesmo controle transcricional e pós-transcricional., Ano de obtenção: 2015.
Orientador: Geraldo Aleixo da Silva Passos.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
Palavras-chave: Segundo Timo; Transcriptoma; Mirnoma; Controle pós-transcricional.
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética.
2007 - 2010
Mestrado em Genética USP-RP.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: Estudo Populacional e Molecular de Nannotrigona testaceicornis Cockerell (Hymenoptera, Apidae, Meliponini) através do DNA mitocondrial,Ano de Obtenção: 2010.
Orientador: Ademilson Espencer Egea Soares.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
Palavras-chave: Nannotrigona testaceicornis; Meliponíneos; DNA mitocondrial; PCR RFLP; CO I; Sequenciamento.
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Ecologia.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Animal.
2002 - 2005
Graduação em Ciências Biológicas - Licenciatura Plena.
Universidade do Estado de Minas Gerais, UEMG, Brasil.
Título: Saúde e Ambiente: análise das desigualdades entre os municípios que compõem o comitê da bacia hidrográfica dos afluentes mineiros do médio Rio Grande..
Orientador: Marcelo dos Santos.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais, FAPEMIG, Brasil.


Pós-doutorado


2015 - 2016
Pós-Doutorado.
Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, FMRP - USP, Brasil.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Imunologia / Subárea: Imunogenética.


Formação Complementar


2016 - 2016
Minicurso de Introdução à Programação em Python aplicado à Bioinformática. (Carga horária: 9h).
Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto, FFCLRP, Brasil.
2016 - 2016
Ferramentas de Bioinformática Aplicadas às Análises de Sequências de RNASeq. (Carga horária: 80h).
Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.
2015 - 2015
IX Curso de Bioinformática. (Carga horária: 25h).
Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.
2014 - 2014
Análise de dados de RNA-Seq via bioconductor. (Carga horária: 3h).
Sociedade Brasileira de Genética, SBG, Brasil.
2014 - 2014
X Summer Course. (Carga horária: 55h).
Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, FMRP, Brasil.
2013 - 2013
Decodificando o DNA não-codificador. (Carga horária: 77h).
Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, FMRP, Brasil.
2012 - 2012
Extensão universitária em Workshop em Genética. (Carga horária: 40h).
Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, FMRP - USP, Brasil.
2012 - 2012
Bioinformatics Course. (Carga horária: 40h).
Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, FMRP, Brasil.
2012 - 2012
Estágio de curta duração. (Carga horária: 120h).
University of Georgia, UGA, Estados Unidos.
2011 - 2011
Advanced Topics of Human Molecular Genetics. (Carga horária: 60h).
Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.
2010 - 2010
Fundamentos Básicos e Aplicações para qRTPCR. (Carga horária: 8h).
Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, FMRP - USP, Brasil.
2008 - 2008
Molecular Phylogenetics and Evolution. (Carga horária: 15h).
Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, FMRP, Brasil.
2002 - 2002
Imunocitoquímica. (Carga horária: 10h).
Faculdade de Ensino Superior de Passos / UEMG, FESP/UEMG, Brasil.


Atuação Profissional



Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Vínculo institucional

2015 - 2016
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pós-doutoranda, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Vínculo institucional

2007 - 2015
Vínculo: Aluno de pós graduação, Enquadramento Funcional: Aluno de Pós Graduação, Regime: Dedicação exclusiva.

Vínculo institucional

2012 - 2012
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Estagiária PAE, Carga horária: 6

Atividades

02/2007 - 11/2016
Pesquisa e desenvolvimento , Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, .

07/2014 - 07/2014
Outras atividades técnico-científicas , Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto.

Atividade realizada
Monitor no VII Curso de Inverno em Imunologia.
07/2012 - 12/2012
Estágios , Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, .

Estágio realizado
Estágio realizado Programa de Aperfeiçoamento de Ensino - PAE. Desenvolvimento de atividades didáticas junto à disciplina de genética. humana - RFM0009.
11/2011 - 11/2011
Outras atividades técnico-científicas , Faculdade de Odontologia de Ribeirão Preto, Faculdade de Odontologia de Ribeirão Preto.

Atividade realizada
Monitor do curso de difusão "Introdução ao Estudo do Transcriptoma", realizado pela Pró-Reitoria de Cultura e Extensão Universitária.
07/2011 - 07/2011
Outras atividades técnico-científicas , Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto.

Atividade realizada
Monitor no IV Curso de Inverno em Imunologia.
01/2008 - 02/2008
Outras atividades técnico-científicas , Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto.

Atividade realizada
Monitor no XIII Curso de Verão em Genética.

Núcleo de Educação e Cultura, NEC, Brasil.
Vínculo institucional

2009 - 2010
Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Professor, Carga horária: 15

Atividades

08/2009 - 07/2010
Ensino,

Disciplinas ministradas
Inglês
08/2009 - 07/2010
Ensino,

Disciplinas ministradas
Inglês

AB Idiomas Ltda, FISK, Brasil.
Vínculo institucional

2003 - 2006
Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Professor de língua estrangeira, Carga horária: 20


Fundação Hemocentro de Ribeirão Preto, FUNDHERP, Brasil.
Vínculo institucional

2016 - 2016
Vínculo: Orientador, Enquadramento Funcional: Orientação no Programa Pequeno Cientista, Carga horária: 6


Universidade do Estado de Minas Gerais, UEMG, Brasil.
Vínculo institucional

2018 - Atual
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Designado Temporariamente, Carga horária: 20

Vínculo institucional

2004 - 2005
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Iniciação científica, Carga horária: 20

Atividades

10/2004 - 10/2004
Outras atividades técnico-científicas , Fundação de Ensino Superior de Passos, Fundação de Ensino Superior de Passos.

Atividade realizada
Monitor.


Linhas de pesquisa


1.
Genética
2.
Imunologia
3.
Imunogenética
4.
Biologia Molecular
5.
Genômica Funcional


Projetos de pesquisa


2018 - Atual
O papel do gene Autoimmune regulator (Aire) no controle do miRnoma de células epiteliais tímicas medulares
Descrição: O objetivo principal do projeto é avaliar o papel do gene Aire na expressão de miRNAs em células mTEC 3.10. O presente projeto justifica-se pela necessidade em se avaliar o papel dos miRNAs Aire-dependentes no controle pós-transcricional da PGE através da reconstrução de redes de interação miRNA-mRNAs de células mTECs 3.10 cujos transcritos de Aire foram silenciados pela técnica de siRNA. Ao se perturbar o gene Aire, esperamos estimar de maneira quantitativa e funcional a participação do mesmo na transcrição dos miRNAs e por conseguinte descrever a função específica desses miRNAs em ajustar diversos processos biológicos importantes na maturação e desenvolvimento dos linfócitos T no timo..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) .
Integrantes: Amanda Freire de Assis - Integrante / Geraldo A. Passos - Integrante / Marcelo dos Santos - Coordenador / Rauni Borges Marques - Integrante.Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais - Bolsa.
2018 - Atual
Revisão da medicação em idosos institucionalizados: aplicação dos critérios stopp e start
Descrição: O projeto tem por objetivo identificar os principais problemas de saúde, o perfil de utilização de medicamentos, os medicamentos potencialmente inapropriados (MPI) e os medicamentos potencialmente omitidos (MPO) envolvidos no tratamento de idosos institucionalizados do município de Passos (MG)..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) .
Integrantes: Amanda Freire de Assis - Integrante / Marcelo dos Santos - Coordenador / Camila Belfort Piantino - Integrante / Leonardo Bezerra Esteves - Integrante.
2018 - Atual
Qualidade do sono em estudantes pré-vestibulandos na cidade de Passos-MG.
Descrição: O presente projeto tem por objetivo verificar a prevalência de distúrbios do sono entre jovens em período pré-vestibular em escolas públicas e particulares e em alunos de cursos pré-vestibulares na cidade de Passos-MG..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) .
Integrantes: Amanda Freire de Assis - Coordenador / Elder Francisco Latorraca - Integrante / Tácio Fariñas Rodrigues - Integrante.
2015 - Atual
Regulação do destino celular durante a diferenciação entre o timo torácico e o cervical mediada por microRNAs.
Descrição: O presente projeto trata do estudo do papel dos microRNAs (miRNAs) na diferenciação do timo murino (camundongos Mus musculus), focando a organogênese do timo cervical como um novo modelo para identificar genes candidatos e novas vias moleculares.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2014 - Atual
Participação do Gene Aire e de MicroRNAs na Adesão entre Células mTEC e Timócitos
Descrição: Auxílio regular da FAPESP. Acordo de cooperação com o INSERM (U 1090, Marseille, França) e a Université Aix-Marseille (França) dentro do Programa Ciência sem Fronteiras (Pesquisador Visitante Especial, PVE) tendo como pesquisador estrangeiro o Dr. Denis Puthier. O timo é um órgão linfóide primário, no qual ocorre a indução da tolerância imunológica central aos antígenos do próprio que são expressos pelos tecidos periféricos (PTAs). A medula tímica é formada por células tímicas medulares epiteliais (mTECs) que expressam centenas desses PTAs que representam virtualmente todos os órgãos e tecidos do corpo. Esse fenômeno foi denominado de expressão gênica promíscua (PGE) a qual é parcialmente regulada pelo fator de transcrição Autoimmune regulator (Aire). Como o gene Aire controla parte da PGE/PTAs, presume-se que a ação deste gene deve influenciar a adesão mTECs-timócitos e indiretamente a apoptose dos timócitos (seleção negativa). Como este ponto é ainda elusivo, formulamos a seguinte hipótese deste projeto: ?A expressão de Aire e adesão mTECs-timócitos são processos entrelaçados e duplamente associados. Ao mesmo tempo em que é dependente de Aire, o contato físico entre essas células, incrementa sua expressão. Além disso, a adesão mTECs-timócitos modula a expressão transcricional em grande escala (transcriptoma) nas mTECs com forte influência de Aire?..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (4) .
Integrantes: Amanda Freire de Assis - Integrante / Geraldo Aleixo Passos - Coordenador / Ernna H Oliveira - Integrante / Denis Puthier - Integrante.
2010 - 2015
Análise do transcriptoma do timo cervical e torácico de murinos (Mus musculus) através de Oligo microArrays
Descrição: O projeto refere-se à análise da expressão gênica transcricional em grande escala do timo cervical de camundongos isogênicos fazendo uso da tecnologia dos oligo-microarrays. Camundongos Mus musculus além do timo principal torácico, apresentam um pequeno timo cervical (região do pescoço). O órgão mostra-se funcional, pois é colonizado por progenitores de células T derivadas da medula óssea gerando timócitos que são selecionados pelo repertório de TCR e exporta células T imunocompetentes maduras à periferia. É de interesse conhecer a diversidade e intensidade da expressão gênica do timo cervical, sobretudo daqueles genes que codificam auto-antígenos importantes para a seleção positiva e negativa e conseqüentemente a indução de tolerância imunológica. Além disso, não sabemos se o timo cervical participa na auto-imunidade agressiva e no surgimento de doenças auto-imunes. Como a diversidade dos auto-antígenos é a mais ampla possível incluindo aqueles que caracterizam virtualmente todos os órgãos e tecidos do corpo, somente com a análise do transcriptoma podemos ter acesso a essas informações.
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
2007 - 2010
Estudo Populacional e Molecular de Nannotrigona testaceicornis Cockerell (Hymenoptera, Apidae, Meliponini) através do DNA mitocondrial
Descrição: O projeto teve por objetivo o estudo populacional de Nannotrigona testaceicornis de ninhos encontrados no campus da Universidade de São Paulo, em Ribeirão Preto, bem como em outras localidades do estado de São Paulo e Minas Gerais. Tal estudo nos possibilitou levantar os haplótipos mitocondriais existentes nas áreas estudadas, caracterizar a diversidade necleotídica de um fragmento do gene mitocondrial COI, compementar as informações do GenBank sobre sequencias genômicas de meliponíneos, inferir as correlações de colonização das áreas estudadas e os porcessos histórico-evolutivos que atuaram sobre esta espécie..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) .
Integrantes: Amanda Freire de Assis - Coordenador / Ademilson Espencer Egea Soares - Integrante.Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.
2004 - 2005
Saúde e Ambiente: análise das desigualdades entre os municípios que compõem o Comitê da Bacia Hidrográfica dos Afluentes Mineiros do Médio Rio Grande
Descrição: O projeto Saúde e Ambiente: Análise das desigualdades entre os municípios que compõem o Comitê da Bacia Hidrográfica dos Afluentes Mineiros do Médio Rio Grande , faz parte de um projeto maior, multidisciplinar, que visa integrar os aspectos geomorfológicos, hidrológicos, ecológicos e suas inter-relações com as populações humanas usando a bacia hidrográfica do Médio Rio Grande como unidade de estudo. Os docentes das Faculdades de Agronomia, Ciências Biológicas, Enfermagem, Engenharia, e Nutrição estudariam os diferentes aspectos desse grande ecossistema com o intuito de realizar um diagnóstico ambiental, que fornecerá subsídios para a elaboração de novas Políticas de Gestão Ambiental, e dentro dessas, políticas relacionadas diretamente à saúde humana. No final, os projetos devem culminar com uma proposta de Plano Diretor para o manejo sustentável do Médio Rio Grande. Nosso projeto visa diagnosticar as desigualdades em saúde nos municípios que compõem o Comitê da Bacia Hidrográfica dos Afluentes Mineiros do Médio Rio Grande, buscando contribuir para: (1) identificar os municípios que são mais vulneráveis às desigualdades em saúde; (2) identificar variáveis e indicadores relevantes ao estudo das desigualdades em saúde que possam ser utilizados pelos gestores do Sistema Único de Saúde (SUS); (3) buscar a inter-relação entre as desigualdades em saúde e a degradação ambiental; e (4) subsidiar políticas públicas voltadas à redução dessas desigualdades e fornecer uma linha de base ( baseline ) para a avaliação dos efeitos/impactos das intervenções.
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (2) .
Integrantes: Amanda Freire de Assis - Coordenador / Marcelo dos Santos - Integrante / Xangou Aparecido Ribeiro - Integrante / Leisymara Alves Melo - Integrante / Natércia Ferreira do Nascimento - Integrante.Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais - Bolsa.


Projetos de extensão


2012 - 2012
Exposição Transcriptoma
Descrição: Curso teórico prático sobre o estudo do transcriptoma e as técnicas de biologia molecular utilizadas em tal estudo. Exposição sobre a evolução das técnicas utilizadas no estudo do trasncriptoma.
Situação: Concluído; Natureza: Extensão.
Alunos envolvidos: Graduação: (50) / Especialização: (50) / Mestrado acadêmico: (50) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (50) .
Integrantes: Amanda Freire de Assis - Integrante / Geraldo Aleixo da Silva Passos - Coordenador / Ernna Hérida Domingues Oliveira - Integrante / Janaína de Andrea Dernowsek - Integrante.
2011 - 2011
Curso de Difusão "Introdução ao Estudo do Transcriptoma"
Descrição: Curso de difusão universitária sobre o tema transcriptoma.
Situação: Concluído; Natureza: Extensão.
Alunos envolvidos: Graduação: (50) / Mestrado acadêmico: (50) / Doutorado: (50) .
Integrantes: Amanda Freire de Assis - Integrante / Geraldo A. Passos - Coordenador / Janaína de Andrea Dernowsek - Integrante / Ernna H Oliveira - Integrante.


Outros Projetos


2016 - 2016
Pequeno Cientista - DNA: O Segredo da Vida
Descrição: O programa Pequeno Cientista, é um programa da Casa da Ciência do Hemocentro de Ribeirão Preto, com a intenção de inserir alunos em projetos de investigação científica. Jovens do ensino fundamental e médio participam de encontros com pós-graduandos e graduandos e trabalham com temas específicos da Ciência. O Tema abordado por nós foi " DNA, o segredo da Vida", e foram adotados por cinco alunos, sendo desenvolvidas atividades teóricas e práticas para o aprendizado do tema abordado...
Situação: Concluído; Natureza: Outra.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (2) .
Integrantes: Amanda Freire de Assis - Integrante / Geraldo Aleixo da Silva Passos - Coordenador / Ernna Hérida Domingues Oliveira - Integrante / Rafaela de Freitas Martins Felício - Integrante.
2012 - 2012
Exposição Transcriptoma
Descrição: Curso de extensão universitária.
Situação: Concluído; Natureza: Outra.
2011 - 2011
Curso de Difusão "Introdução ao Estudo do Transcriptoma"
Descrição: Curso de extensão universitária na modalidade difusão..
Situação: Concluído; Natureza: Outra.
Alunos envolvidos: Doutorado: (10) .
Integrantes: Amanda Freire de Assis - Integrante / Geraldo A. Passos - Coordenador / Ernna H Oliveira - Integrante / DERNOWSEK, JANAÍNA A. - Integrante.


Revisor de periódico


2015 - Atual
Periódico: Frontiers in Immunology (Online)
2016 - Atual
Periódico: Plos One
2017 - Atual
Periódico: Brazilian journal of medical and biological research


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética.
2.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Imunologia / Subárea: Imunogenética.
3.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: TRANSCRIPTÔMICA.
4.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: GENÔMICA.
5.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral.
6.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Ecologia.


Idiomas


Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Espanhol
Compreende RazoavelmenteLê Razoavelmente.


Prêmios e títulos


2015
Melhor Apresentação Oral no V Workshop do Departamento de Genética da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto.


Produções



Produção bibliográfica
Artigos completos publicados em periódicos

1.
1ASSIS, AMANDA F.2018 ASSIS, AMANDA F.; LI, JIE ; DONATE, PAULA B. ; DERNOWSEK, JANAÍNA A. ; MANLEY, NANCY R. ; PASSOS, GERALDO A. . Predicted miRNA-mRNA-mediated posttranscriptional control associated with differences in cervical and thoracic thymus function. MOLECULAR IMMUNOLOGY, v. 99, p. 39-52, 2018.

2.
2SPECK-HERNANDEZ, CESAR A.2018 SPECK-HERNANDEZ, CESAR A. ; ASSIS, AMANDA F. ; FELICIO, RAFAELA F. ; COTRIM-SOUSA, LARISSA ; PEZZI, NICOLE ; LOPES, GABRIEL S. ; BOMBONATO-PRADO, KARINA F. ; GIULIATTI, SILVANA ; PASSOS, GERALDO A. . Aire Disruption Influences the Medullary Thymic Epithelial Cell Transcriptome and Interaction With Thymocytes. Frontiers in Immunology, v. 9, p. 964, 2018.

3.
6DERNOWSEK, JANAÍNA A.2017DERNOWSEK, JANAÍNA A. ; PEREIRA, MILENA C. ; FORNARI, THAÍS A. ; MACEDO, CLAUDIA ; ASSIS, AMANDA F. ; DONATE, PAULA B. ; BOMBONATO-PRADO, KARINA F. ; PASSOS-BUENO, MARIA RITA ; PASSOS, GERALDO A. . Posttranscriptional Interaction between miR-450a-5p and miR-28-5p and STAT1 mRNA Triggers Osteoblastic Differentiation of Human Mesenchymal Stem Cells. JOURNAL OF CELLULAR BIOCHEMISTRY, v. 118, p. 1-18, 2017.

4.
7SEMEGHINI, MAYARA SGARBI2017SEMEGHINI, MAYARA SGARBI ; DE AZEVEDO, FERNANDA GRILO ; FERNANDES, ROGER RODRIGO ; ASSIS, AMANDA FREIRE ; DERNOWSEK, JANAÍNA ANDREA ; ROSA, ADALBERTO LUIZ ; SIÉSSERE, SELMA ; PASSOS, GERALDO ALEIXO ; BOMBONATO-PRADO, KARINA FITTIPALDI . Menopause transition promotes distinct modulation of mRNAs and miRNAs expression in calvaria and bone marrow osteoblastic cells. CELL BIOLOGY INTERNATIONAL, v. 1, p. 1, 2017.

5.
3PASSOS, GERALDO ALEIXO2017 PASSOS, GERALDO ALEIXO ; SPECK-HERNANDEZ, CESAR A. ; ASSIS, AMANDA FREIRE ; MENDES-DA-CRUZ, DANIELLA A. . Update on Aire and thymic negative selection. IMMUNOLOGY, v. 1, p. IMM12831-20, 2017.

6.
9FONSECA, A. S.2017FONSECA, A. S. ; OLIVEIRA, E.J.F. ; FREITAS, G.S. ; ASSIS, AF ; SOUZA, C.C.M. ; CONTEL, E.P.B. ; SOARES, A. E. E. . Genetic Diversity in Nannotrigona testaceicornis (Hymenoptera: Apidae) Aggregations in Southeastern Brazil. JOURNAL OF INSECT SCIENCE, v. 17, p. 9, 2017.

7.
8WIMMERS FERREIRA, MAIDY REHDER2016WIMMERS FERREIRA, MAIDY REHDER ; RODRIGO FERNANDES, ROGER ; FREIRE ASSIS, AMANDA ; DERNOWSEK, JANAÍNA A. ; PASSOS, GERALDO A. ; VARIOLA, FABIO ; FITTIPALDI BOMBONATO-PRADO, KARINA . Oxidative Nanopatterning of Titanium Surface Influences mRNA and MicroRNA Expression in Human Alveolar Bone Osteoblastic Cells. International Journal of Biomaterials, v. 2016, p. 1-15, 2016.

8.
5PEZZI, NICOLE2016PEZZI, NICOLE ; ASSIS, AMANDA FREIRE ; COTRIM-SOUSA, LARISSA COTRIM ; LOPES, GABRIEL SARTI ; MOSELLA, MARITZA SALAS ; LIMA, DJALMA SOUSA ; BOMBONATO-PRADO, KARINA F. ; PASSOS, GERALDO ALEIXO . Aire knockdown in medullary thymic epithelial cells affects Aire protein, deregulates cell adhesion genes and decreases thymocyte interaction. Molecular Immunology, v. 77, p. 157-173, 2016.

9.
11BITENCOURT, TAMIRES APARECIDA2016BITENCOURT, TAMIRES APARECIDA ; MACEDO, CLAUDIA ; FRANCO, MATHEUS ELOY ; ASSIS, AMANDA FREIRE ; KOMOTO, TATIANA TAKAHASI ; STEHLING, ELIANA GUEDES ; BELEBONI, RENE OLIVEIRA ; MALAVAZI, IRAN ; MARINS, MOZART ; FACHIN, ANA LÚCIA . Transcription profile of Trichophyton rubrum conidia grown on keratin reveals the induction of an adhesin-like protein gene with a tandem repeat pattern. BMC Genomics, v. 17, p. 249, 2016.

10.
4FORNARI, THAIS A.2015FORNARI, THAIS A. ; DONATE, PAULA B. ; ASSIS, AMANDA F. ; MACEDO, CLAUDIA ; SAKAMOTO-HOJO, ELZA T. ; DONADI, EDUARDO A. ; PASSOS, GERALDO A. ; DOTTA, FRANCESCO . Comprehensive Survey of miRNA-mRNA Interactions Reveals That Ccr7 and Cd247 (CD3 zeta) are Posttranscriptionally Controlled in Pancreas Infiltrating T Lymphocytes of Non-Obese Diabetic (NOD) Mice. Plos One, v. 10, p. e0142688, 2015.

11.
10Oliveira, Eddy J. F.2009Oliveira, Eddy J. F. ; Freitas, Geusa S. ; Fonseca, Aline S. ; Sousa, Adna C. B. ; Campos, Tatiana ; ASSIS, AF ; Souza, Anete P. ; Contel, Eucleia P. B. ; Soares, Ademilson E. E. . Isolation and characterization of microsatellite markers from the stingless bee Nannotrigona testaceicornis. Conservation Genetics Resources (Print), v. 1, p. 97-99, 2009.

Capítulos de livros publicados
1.
ASSIS, AMANDA FREIRE; Hernandez, Cesar Speck ; COTRIM-SOUSA, LARISSA ; Felicio, Rafaela Martins ; Oliveira, Ernna Hérida ; Teixeira, Lorena Alves ; Valente, Valeria ; Silva, Wilson Araújo ; PASSOS, GERALDO A. . Use of the CRISPR/Cas9 System for Genome Editing of Immune System Cells, Defense Against HIV-1 and Cancer Therapies. In: George M. Church; Krishnarao Appasani. (Org.). Genome Editing and Engineering. 1ed.Cambridge: Cambridge University Press, 2018, v. 1, p. 401-413.

2.
ASSIS AF; GUERRA, BA ; TARCITANO, E ; OLIVEIRA, EHD ; MORI, MAS ; SILVA, SP ; PEREIRA, TC . Novas fronteiras em miRNAs (cap 17). In: Tiago Campos Pereira. (Org.). Introdução ao mundo dos microRNAs. 1ed.São Carlos: CUBO, 2015, v. 1, p. 321-338.

3.
ASSIS, A.F.; OLIVEIRA, EHD ; DONATE, PB ; GIULIATTI, S ; NGUYEN, C ; PASSOS, G. A. . What Is the Transcriptome and How it is Evaluated?. In: Geraldo A. Passos. (Org.). Transcriptomics in Health and Disease. 1ed.New York: Springer International, 2014, v. 1, p. 3-48.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
ASSIS, AMANDA FREIRE; DONATE, PB ; Dernowsek. JA ; PASSOS, GERALDO A. . Analysis of the transcriptome of Mus musculus cervical thymus shows the functional similarity with the thoracic thymus, suggesting that these organs are under same transcriptional and post-transcriptional control. In: 62º Congresso Brasileiro de Genética, 2016, Caxambú. Resumos dos trabalhos apresentados. Ribeirão Preto: SBG, 2016.

2.
Dernowsek. JA ; MACEDO, C. ; FORNARI, T. A. ; ASSIS, AF ; PEREIRA, M. C. ; FERREIRA, M. R. W. ; Bombonato-Prado, K.F. ; PASSOS, G. A. . Discovery of miRNA-mRNA interaction networks regulating the mechanism of osteoblast differentiation of humman dental pulp stem cells.. In: 60° Congresso Brasileiro de Genética, 2014, Guarujá. Anais do 60° Congresso Brasileiro de Genética, 2014.

3.
ASSIS, AF; LI, J. ; ARNS, T. ; Dernowsek. JA ; PEREIRA, M. C. ; MANLEY, N. R. ; PASSOS, G. A. . mRNA and miRNA expression profiles show a high transcriptomic similarity between thoracic and cervical thymi. In: 60° Congresso Brasileiro de Genética, 2014, Guarujá. Anais do 60° Congresso Brasileiro de Genética, 2014.

4.
LIMA, MHF ; OLIVEIRA, EH ; ASSIS, AF ; PASSOS, G. A. . TARGETING AUTOIMMUNE REGULATOR (AIRE) IN THE THYMUS BY MICRO RNAs. In: XXXVIII Congress of the Brazilian Society of Immunology, 2013, Natal. Annals of the XXXVIII Congress of the Brazilian Society of Immunology, 2013.

5.
PEREIRA, M. C. ; ASSIS, AF ; MACEDO, C. ; SAKAMOTO-HOJO, ET ; DONADI, EA ; PASSOS, G. A. . Genes related to oncogenesis are controlled by Autoimmune regulator (AIRE) in medullary thymic epithelial cells. In: 59° Congresso Brasileiro de Genética, 2013, Águas de Lindóia. Anais do 59° Congresso Brasileiro de Genética, 2013.

6.
PASSOS, GA ; OLIVEIRA, EH ; MACEDO, C. ; PEZZI, N. ; DONATE, PB ; ARNS, T. ; SAVINO, W ; ASSIS, AF ; LI, J ; MANLEY, NR ; SAKAMOTO-HOJO, E ; DONADI, E . The role of Aire and microRNAs in transcriptional and post-transcriptional control in the thymus. In: ThymUS International Conference 2012, 2012, Sunny Isles Beach. Thymus International Conference 2012, 2012.

7.
ASSIS, AF; MACEDO, C. ; DONATE, PB ; ARNS, T. ; CEZAR, NJB ; SAKAMOTO-HOJO, E. T. ; DONADI, EA ; PASSOS, G. A. . The transcriptome profiling of the murine cervical thymus reveals a cluster of upregulated genes related to immune system processes. In: XXXVII Congress of the Brazilian Society of Immunology and V Extra-Section of Clinical Immunology, 2012, Campos do Jordão. Anais do XXXVII Congress of the Brazilian Society of Immunology and V Extra-Section of Clinical Immunology, 2012.

8.
ARNS, T. ; ALMEIDA, RS ; EVANGELISTA, AF. ; ASSIS, AF ; CEZAR, NJB ; MACEDO, C. ; SAKAMOTO-HOJO, E. T. ; DONADI, EA ; PASSOS, G. A. . Comparison of global gene expression from peripheral blood mononuclear cells between type 1 diabetes patients and controls. In: XXXVII Congress of the Brazilian Society of Immunology and V Extra-Section of Clinical Immunology, 2012, Campos do Jordão. Anais do XXXVII Congress of the Brazilian Society of Immunology and V Extra-Section of Clinical Immunology, 2012.

9.
ASSIS, AF; PASSOS, G. A. . Transcriptome Analysis of Mouse Cervical and Thoracic Thymus by Means of Whole Functional Genome Oligo Microarrays. In: São Paulo School of Advanced Science - Advanced Topics of Human Molecular Genetics, 2011, Campinas. Second São Paulo School of Advanced Science, 2011.

10.
ASSIS, AF; DONADI, EA ; SAKAMOTO-HOJO, E. T. ; ROSSI, MA ; PASSOS, G. A. . HISTOLOGY AND FOXN1 EXPRESSION IN THE MURINE CERVICAL THYMUS. In: II Workshop do Programa de Pós-Graduação em Genética, 2011, Riberião Preto. Anais do II Workshop e Reunião dos 40 anos do Programa de Pós-Graduação em Genética FMRP/USP, 2011.

11.
ASSIS, AF; Souza, CCM ; FONSECA, A. S. ; OLIVEIRA, E. J. F ; FREITAS, G. S. ; SOARES, A. E. E. . Variabilidade genética da populaçõa de Nannotrigona testaceicornis (Hymenoptera, Apidae, Meliponini) do campus da USP Ribeirão Preto através de análise do DNA mitocondrial.. In: 55° Congresso Brasileiro de Genética, 2009, Águas de Lindóia. Anais do 55° Congresso Brasileiro de Genética, 2009.

12.
SOUZA, C. C. M. ; FREITAS, G. S. ; BAPTISTELLA, A. R. T. O. ; ASSIS, AF ; FONSECA, A. S. ; CONTEL, EPB ; SOARES, A. E. E. . Caracterização de locos microssatélites em Scaptotrigona aff depilis para estudos de agregações de ninhos. In: 54° Congresso Brasileiro de Gene´tica, 2009, Águas de Lindóia. Anais do 55° Congresso Brasileiro de Genética, 2009.

13.
FONSECA, A. S. ; Oliveira, E. J. F. ; ASSIS, AF ; SOUZA, C. C. M. ; OLIVEIRA, FG ; CONTEL, EPB ; SOARES, A. E. E. . Múltiplos acasalamentos e diversidade genética em abelhas indígenas Nannotrigona testaceicornis. In: 55° Congresso Brasileiro de Genética, 2009, Águas de Lindóia. Anais do 55° Congresso Brasileiro de Genética, 2009.

14.
ASSIS, AF; OLIVEIRA, E. J. F ; FREITAS, G. S. ; SOARES, A. E. E. . Estudo Populacional de Nannotrigona testaceicornis (Hymenoptera, Apidae, Meliponina) Através de Marcadores Micorssatélites e mtDNA. In: VIII Encontro sobre Abelhas, 2008, Ribeirão Preto. Anais do VIII Encontro sobre Abelhas. Ribeirão Preto: FUNPEC, 2008.

15.
ASSIS, AF; OLIVEIRA, E. J. F ; FREITAS, G. S. ; SOARES, A. E. E. . Diversidade Genética em Nannotrigona testaceicornis (Hymenoptera, Apidae, Meliponina). In: 17º Congresso Brasileiro de Apicultura e 3º de Meliponicultura, 2008, Belo Horizonte. Anais do 17º Congresso Brasileiro de Apicultura e 3º de Meliponicultura, 2008.

16.
ASSIS, AF; SOARES, A. E. E. . CARACTERIZAÇÃO DE mtDNA DE Nannotrigona testaceicornis (HYMENOPTERA, APIDAE, MELIPONINA) POR PCR+RFLP. In: 53º Congresso Brasileiro de Genética, 2007, Águas de Lindóia. Anais do 53ºCongresso Brasileiro de Genética, 2007.

17.
ASSIS, AF; SANTOS, L. L. ; ROCHA, C. J. ; NASCIMENTO, V. ; REIS, M. S. ; STRIPARI, N. L. ; RIGOLIN-SÁ, O. . Caracterização da Comunidade Bentônica dos Afluentes: Rio São João e Ribeirão Bocaina, Pertencentes à Bacia Hidrográfica do Médio Rio Grande. In: VII Congresso de Ecologia do Brasil, 2005, Caxambú. Anais do VII Congresso de Ecologia do Brasil. São Paulo: Editora da Sociedade de Ecologia do Brasil, 2005.

Apresentações de Trabalho
1.
ASSIS, AMANDA FREIRE. Transcriptômica na Medicina Translacional. 2017. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

2.
ASSIS, AMANDA FREIRE. Medicina Personalizada e ferramentas de diagnóstico em larga escala. 2017. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

3.
ASSIS, AF. Transcriptoma do Sistama Imune: o papel do gene Aire e de RNAs não-codificadores na tolerância central. 2017. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

4.
ASSIS, A.F.. Análise de microRNAs - in silico. 2017. (Apresentação de Trabalho/Outra).

5.
ASSIS, A.F.. Aire may control long non-coding RNAs (lncRNAs) in mTEC cells. 2017. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

6.
ASSIS, AMANDA FREIRE. Transcriptômica na Era dos RNAs não-codificadores. 2017. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

7.
ASSIS, AMANDA FREIRE; OLIVEIRA, EHD . Ferramentas Computacionais para identificação de alvos de microRNAs. 2016. (Apresentação de Trabalho/Outra).

8.
ASSIS, AMANDA FREIRE; OLIVEIRA, EHD ; PASSOS, GERALDO A. . Ensaio de luciferase e miRNAs mimics. 2016. (Apresentação de Trabalho/Outra).

9.
ASSIS, AMANDA FREIRE; DONATE, PAULA B. ; Dernowsek. JA ; PASSOS, GERALDO A. . Analysis of the transcriptome of Mus musculus cervical thymus shows the functional similarity with the thoracic thymus, suggesting that these organs are under same transcriptional and post-transcriptional control. 2016. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

10.
ASSIS, AF; OLIVEIRA, EHD . 'Tecnologia Genômica Aplicada à Imunologia'. 2015. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

11.
ASSIS, A.F.. Análise do Transcriptoma do Timo Cervical de Mus musculus Evidencia a Semelhança Funcional com o Timo Torácico, Sugerindo que esses Órgãos estão sob mesmo Controle Transcricional e Pós-transcricional. 2015. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

12.
ASSIS, AF; LI, J ; ARNS, T. ; Dernowsek. JA ; PEREIRA, M. C. ; MANLEY, NR ; PASSOS, G. A. . mRNA and miRNA expression profiles show a high transcriptomic similarity between thoracic and cervical thymi. 2014. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

13.
ASSIS, AF; PASSOS, G. A. . Análise do Transcriptoma Utilizando Microarrays. 2012. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

14.
ASSIS, AF; MACEDO, C. ; DONATE, PB ; ARNS, T. ; CEZAR, NJB ; SAKAMOTO-HOJO, E. T. ; DONADI, EA ; PASSOS, G. A. . The transcriptome profiling of the murine cervical thymus reveals a cluster of upregulated genes related to immune system processes. 2012. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

15.
ASSIS, AF; FONSECA, A. S. ; SOUZA, C. C. M. . Diversidade Genética em Meliponíneos. 2010. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

16.
ASSIS, AF; Oliveira, E. J. F. ; FONSECA, A. S. ; Souza, CCM ; FREITAS, G. S. ; SOARES, A. E. E. ; CONTEL, EPB . Estudo populacional e molecular de Nannotrigona testaceicornis Cockerell (Hymenoptera, Apidae, Meliponini) através da análise de um segmento do gene mitocondrial COI. 2010. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

17.
ASSIS, AMANDA FREIRE; Oliveira, Eddy J. F. ; Fonseca, Aline S. ; SOUZA, C. C. M. ; Freitas, Geusa S. ; CONTEL, E.P.B. ; Soares, Ademilson E. E. . Estudo populacional e molecular de Nannotrigona testaceicornis COCKERELL (Hymenoptera, Apidae, Meliponini) através de DNA mitocondrial. 2010. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

18.
ASSIS, AF; SOUZA, C. C. M. ; FONSECA, A. S. ; OLIVEIRA, E. J. F ; FREITAS, G. S. ; SOARES, A. E. E. . Variabilidade genética da populaçõa de Nannotrigona testaceicornis (Hymenoptera, Apidae, Meliponini) do campus da USP Ribeirão Preto através de análise do DNA mitocondrial.. 2009. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

19.
ASSIS, AF; OLIVEIRA, E. J. F ; FREITAS, G. S. ; SOARES, A. E. E. . Diversidade Genética em Nannotrigona testaceicornis (Hymenoptera, Apidae, Meliponina). 2008. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

20.
ASSIS, AMANDA FREIRE. Origem das abelhas e sua relação com o homem. 2008. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

21.
ASSIS, AF; SOARES, A. E. E. . Caracterização de mtDNA de Nannotrigona testaceicornis (Hymenoptera, Apidae, Meliponina) por PCR+RFLP. 2007. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

22.
ASSIS, A.F.. Uso do DNA mitocondrial como marcador molecular no estudo de populações. 2007. (Apresentação de Trabalho/Outra).

23.
ASSIS, AF; SANTOS, Marcelo dos ; RIBEIRO, Xangou Aparecido ; SILVEIRA, Vivian Freitas S B . Saúde e Ambiente: Análise das Desigualdades entre os Municípios que Compõem o Comitê da Bacia Hidrográfica dos Afluentes Mineiros do Médio Rio Grande. 2004. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

24.
ASSIS, AF; SANTOS, L. L. ; ROCHA, C. J. ; SILVA, D. F. ; CORREA, J. A. C. ; DOMINGOS, S. L.. ; BORGES, Z. M. T. ; SANTOS, Marcelo dos . Principais Causas de Mortalidade Infantil na Faixa Etária de 0 a 1 anos no Município de Passos-MG, no Período de Janeiro de 2002 a Julho de 2003. 2004. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

Outras produções bibliográficas
1.
FREITAS, G. S. ; ASSIS, AF ; SOUZA, C. C. M. ; SOUZA, J. ; SOARES, A. E. E. . O Doce Lar das Abelhas Indígenas Sem Ferrão. São Paulo: APACAME, 2009 (Artigo Publicado no Periódico Bimestral da Associação Paulista de Apicultura).


Demais tipos de produção técnica
1.
ASSIS, A.F.. Bioinformática: Introdução à plataforma R. 2017. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

2.
ASSIS, A.F.; OLIVEIRA, EHD ; FELICIO, R. F. M. ; PASSOS, G. A. . DNA: O Segredo da Vida - Programa Pequeno Cientista. 2016. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

3.
ASSIS, AF. XVII Curso de Verão Genética. 2012. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

4.
SOARES, A. E. E. ; AKATSU, I. P. ; FREITAS, G. S. ; SANTANA, W. C. ; ALVARENGA, P. E. F. ; ASSIS, AF ; FONSECA, A. S. ; SOUZA, C. C. M. ; BAPTISTELLA, A. R. T. O. ; PRATO, M. . Abelhas para a Melhor Idade. 2009. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

5.
SOARES, A. E. E. ; AKATSU, I. P. ; FREITAS, G. S. ; SANTANA, W. C. ; ALVARENGA, P. E. F. ; ASSIS, AF ; FONSECA, A. S. ; OLIVEIRA, E. J. F ; SOUZA, C. C. M. ; BAPTISTELLA, A. R. T. O. ; PRATO, M. . Abelhas para a Melhor Idade. 2008. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).



Bancas



Participação em bancas de trabalhos de conclusão
Teses de doutorado
1.
MENDES JUNIOR, C. T.; SIMOES, Z. L. P.; GIULIATTI, S.; FREITAS, J. O. C.; ASSIS, AF. Participação em banca de Nathalia Joanne Bispo Cezar. Perfil de expressão de microRNAs no diabetes mellitus gestacional. 2017. Tese (Doutorado em Genética USP-RP) - Universidade de São Paulo.

Qualificações de Doutorado
1.
ASSIS, AF; TIEZZI, D. G.; HUBER, J.. Participação em banca de Thiago Vidotto. Análise Integrada Revela Subtipos de Deleções de PTEN que Afetam o Perfil Genômico, Transcriptômico e de Infiltração de Células do Sistema Imune no Câncer de Próstata. 2017. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências) - Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto.

2.
SILVEIRA, V. S.; RODRIGUES, R. T. C. S.; ASSIS, AF. Participação em banca de Thaís Sarraf Sabedot. Análise Integrativa do Epigenoma de Gliomas com Fenótipo Metilador de Ilhas CpG (G-CIMP) Alto e Baixo: Caracterização e Desenvolvimento. 2016. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências) - Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto.

3.
FERRAZ, V. E. F.; SQUIRE, J. A.; ASSIS, AF. Participação em banca de Sabrina Pereira Santos. Distribuição de CNVs em Regiões Gênicas Associadas a Fendas Orofaciais Típicas. 2016. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências) - Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto.

Qualificações de Mestrado
1.
SILVEIRA, VS; RODRIGUES, RTCS; ASSIS, AF. Participação em banca de Thaís Sarraf Sabedot. Identificação de Assinaturas Epigenômicas que Definem Subgrupos de Gliomas. 2015. Exame de qualificação (Mestrando em Ciências) - Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto.



Participação em bancas de comissões julgadoras
Outras participações
1.
ASSIS, AF. 18° Simpósio Internacional de Iniciação Científica da Universidade de São Paulo. 2010. Universidade de São Paulo.



Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
62° Congresso Brasileiro de Genética. ANALYSIS OF THE TRANSCRIPTOME OF MUS MUSCULUS CERVICAL THYMUS SHOWS THE FUNCTIONAL SIMILARITY WITH THE THORACIC THYMUS, SUGGESTING THAT THESE ORGANS ARE UNDER SAME TRANSCRIPTIONAL AND POST-TRANSCRIPTIONAL CONTROL. 2016. (Congresso).

2.
IX Curso Internacional Teórico-Prático - CBAB.Ferramentas computacionais e moleculares para identificação de alvos de miRNAS. 2016. (Outra).

3.
IX Curso Internacional Teórico-Prático - CBAB.Ensaio de luciferase e miRNAs mimics. 2016. (Outra).

4.
V Workshop de Programa de Pós-Graduação em Genérica da FMRP-USP. 2015. (Outra).

5.
V Workshop do Programa de Pós-Graduação em Genética.Análise do transcriptoma do timo cervical de Mus musculus evidencia a semelhança funcional com o timo torácico, sugerindo que esses órgãos estão sob mesmo controle transcricional e pós-transcricional. 2015. (Outra).

6.
XX Curso de Verão em Genética.Tecnologia Genômica Aplicada `Imunologia. 2015. (Outra).

7.
60° Congresso Brasileiro de Genética. mRNA and miRNA expression profiles show a high transcriptomic similarity between thoracic and cervical thymi. 2014. (Congresso).

8.
CBAB: VII Curso Internacional Teórico- Prático.Ferramentas computacionais e moleculares para identificação de alvos de miRNAS. 2014. (Outra).

9.
IV Workshop do Programa de Pós-graduação em Genética. 2013. (Outra).

10.
III Workshop de Programa de Pós-Graduação em Genética FMRP-USP.The transcriptional profiling of the murine cervical thymus reveals a cluster of upregulated genes related to immune system processes. 2012. (Outra).

11.
XVII Curso de Verão em Genética.Análise do Transcriptoma Utilizando Microarrays. 2012. (Outra).

12.
XXXVII Congress of the Brazilian Society of Immunology and V Extra Section of Clinical Immunology. The transcriptome profiling of the murine cervical thymus reveals a cluster of upregulated genes related to immune system processes. 2012. (Congresso).

13.
II Workshop e Reunião dos 40 anos do Programa de Pós-Graduação em Genética FMRP/USP.HISTOLOGY AND FOXN1 EXPRESSION IN THE MURINE CERVICAL THYMUS. 2011. (Outra).

14.
Sao Paulo of Advanced Science - Advanced Topics of Human Molecular Genetics.Transcriptome analysis of mouse cervical ant thoracic thymus by means of whole functional genome oligo microarrays.. 2011. (Outra).

15.
I Workshop do Programa de Pós-Graduação em Gene´tica. 2010. (Outra).

16.
I Workshop do Programa de Pós-graduação em Genética.TRANSCRIPTOME ANALYSIS OF Mus musculus CERVICAL THYMUS BY MEANS OF OLIGO ARRAYS. 2010. (Oficina).

17.
IX Encontro Sobre Abelhas.Estudo populacional e molecular de Nannotrigona testaceicornis Cockerell (Hymenoptera, Apidae, Meliponini) através do DNA mitocondrial. 2010. (Outra).

18.
Semana Nacional de Ciência e Tecnologia.Estudo populacional e molecular de Nannotrigona testaceicornis (Hymenoptera, Apidae, Meliponini) através de um segmento do gene mitocondrial COI. 2010. (Outra).

19.
XV Curso de verão em Genética.Diversidade Genética em Meliponíneos. 2010. (Outra).

20.
55° Congresso Brasileiro de Genética. Variabilidade genética da populaçõa de Nannotrigona testaceicornis (Hymenoptera, Apidae, Meliponini) do campus da USP Ribeirão Preto através de análise do DNA mitocondrial.. 2009. (Congresso).

21.
17° Congresso Brasileiro de Apicultura e 3° de Meliponicultura. Diversidade Genética em Nannotrigona testaceicornis (Hymenoptera, Apidae, Meliponini). 2008. (Congresso).

22.
Curso de Extensão Universitária: "Abelhas para a Melhor Idade".Origem das Abelhas e sua Relação com o Homem. 2008. (Oficina).

23.
VIII Encontro Sobre Abelhas.Estudo Populacional de Nannotrigona testaceicornis (Hymenoptera, Apidae, Meliponina) Através de Marcadores Microssatélites e mtDNA.. 2008. (Encontro).

24.
XIII Curso de Verão em Genética.Uso do DNA mitocondrial no estudo de populações de abelhas sem ferrão. 2008. (Outra).

25.
53º Congresso Brasileiro de Genética. CARACTERIZAÇÃO DE mtDNA DE Nannotrigona testaceicornis (HYMENOPTERA, APIDAE, MELIPONINA) POR PCR+RFLP. 2007. (Congresso).

26.
I Encontro de Biologia do Desenvolvimento da USP. 2007. (Encontro).

27.
IV Semana Nacional de Ciência e Tecnologia.O DNA mitocondrial. 2007. (Outra).

28.
IV Semana Nacional de Ciência e Tecnologia.Atividade Prática com Abelhas. 2007. (Outra).

29.
VII Semana Universitária do Curso de Ciências Biológicas da FESP/UEMG.Uso do DNA mitocondrial como marcador molecular no estudo de populações. 2007. (Outra).

30.
VII Encontro Sobre Abelhas. 2006. (Encontro).

31.
Semana Universitária do Curso de Ciências Biológicas da Faculdade de Filosofia de Passos. 2005. (Encontro).

32.
6º Seminário de Iniciação Científica e 3º Encontro de Produção Científica. Saúde e Ambiente: Análise das Desigualdades entre os Municípios que Compõem o Comitê da Bacia Hidrográfica dos Afluentes Mineiros do Médio Rio Grande. 2004. (Congresso).

33.
6º Seminário de Iniciação Científica e 3º Encontro de Produção Científica. Principais Causas de Mortalidade Infantil na Faixa Etária de 0 a 1 ano no município de Passos - MG, no Período de Janiro de 2002 a Julho de 2003. 2004. (Congresso).

34.
I Semana Nacional de Ciência e Tecnologia. O DNA vai ao Supermercado. 2004. (Exposição).

35.
I Semana Nacional de Ciência e Tecnologia.O DNA vai ao Supermercado. 2004. (Outra).

36.
Semana Universitária da Faculdade de Filosofia de Passos. 2004. (Encontro).

37.
Semana Universitária da Faculdade de Filosofia de Passos. 2003. (Outra).

38.
Semana Universitária da Faculdade de Filosofia de Passos. 2002. (Outra).


Organização de eventos, congressos, exposições e feiras
1.
PASSOS, G. A. ; ASSIS, AF ; OLIVEIRA, EH ; Dernowsek. JA . Exposição Transcriptoma. 2012. (Exposição).

2.
ASSIS, AF; OLIVEIRA, EHD ; Dernowsek. JA ; PASSOS, G. A. . História do Transcriptoma. 2011. (Exposição).

3.
ASSIS, AF; OLIVEIRA, EHD ; Dernowsek. JA ; PASSOS, G. A. . Introdução ao Estudo do Transcriptoma. 2010. (Outro).

4.
SOARES, A. E. E. ; FREITAS, G. S. ; AKATSU, I. P. ; SOUZA, C. C. M. ; SANTANA, W. C. ; ALVARENGA, P. E. F. ; BAPTISTELLA, A. R. T. O. ; ASSIS, AF ; FONSECA, A. S. ; PRATO, M. ; OLIVEIRA, E. J. F . Curso de Extensão Universitária Abelhas para a Melhor Idade. 2009. (Outro).

5.
SOARES, A. E. E. ; ASSIS, AF ; FONTANA, V. ; EVANGELISTA, A. F. ; BOMTORIN, A. D. ; BREVE, A. L. S. ; JORGE, D. M. M. ; PERSINOTI, G. F. ; OLIVEIRA, J. C. ; SILVA-BERNARDI, E. C. C. . XIII Curso de Verão em Genética. 2008. (Outro).

6.
SOARES, A. E. E. ; AKATSU, I. P. ; FREITAS, G. S. ; SANTANA, W. C. ; ALVARENGA, P. E. F. ; ASSIS, AF ; BAPTISTELLA, A. R. T. O. ; FONSECA, A. S. ; SOUZA, C. C. M. ; PRATO, M. ; OLIVEIRA, E. J. F . Curso de Extensão Universitária Abelhas para a melhor idade. 2008. (Outro).

7.
ASSIS, AF. VII Encontro Sobre Abelhas. 2006. (Outro).

8.
ASSIS, AF. Semana Universitária da Faculdade de Filosofia da FESP/UEMG. 2004. (Outro).



Orientações



Orientações e supervisões concluídas
Dissertação de mestrado
1.
Cesar Augusto Speck Hernandez. Edição gênica de Aire em células mTEC induzida por CRISPR-Cas9 evidencia seu papel modulador da expressão gênica durante a adesão com timócitos. 2017. Dissertação (Mestrado em Imunologia Básica e Aplicada) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Coorientador: Amanda Freire de Assis.

Orientações de outra natureza
1.
Alunos ensino fundametal e médio. DNA: O Segredo da Vida. 2016. Orientação de outra natureza. (Casa da Ciência - Pequeno Cientista) - Fundação Hemocentro de Ribeirão Preto. Orientador: Amanda Freire de Assis.



Educação e Popularização de C & T



Apresentações de Trabalho
1.
ASSIS, AMANDA FREIRE. Transcriptômica na Medicina Translacional. 2017. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

2.
ASSIS, A.F.. Análise de microRNAs - in silico. 2017. (Apresentação de Trabalho/Outra).


Cursos de curta duração ministrados
1.
ASSIS, A.F.; OLIVEIRA, EHD ; FELICIO, R. F. M. ; PASSOS, G. A. . DNA: O Segredo da Vida - Programa Pequeno Cientista. 2016. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

2.
ASSIS, A.F.. Bioinformática: Introdução à plataforma R. 2017. (Curso de curta duração ministrado/Outra).



Outras informações relevantes


Recebe apoio finaceiro do CNPq



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