Eduardo de Paula Costa

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  • Última atualização do currículo em 08/11/2018


Eduardo de Paula Costa graduou-se em Bacharelado em Ciências da Computação pela Universidade Estadual Paulista (Unesp) - Campus Rio Claro, em dezembro de 2005. Ele então ingressou no programa de mestrado em Ciências da Computação e Matemática Computacional na Universidade de São Paulo (USP) - Campus São Carlos, onde obteve seu título de mestre em março de 2008, com a dissertação de mestrado intitulada "Investigação de técnicas de classificação hierárquica para problemas de bioinformática". Em maio de 2008, ele se juntou ao grupo DTAI (Declarative Languages and Artificial Intelligence) da Universidade de Leuven (KU Leuven) na Bélgica. Depois de ser aprovado no programa de pré-doutorado, ele iniciou seus estudos de doutorado em janeiro de 2009. Em julho de 2013 ele obteve o título de doutor em Engenharia (especialidade: Ciências da Computação), com a tese intitulada ?Algoritmos para análise de sequências biológicas?. Eduardo então retornou ao Brasil, onde trabalhou como pós-doutorando na Universidade de São Paulo e como professor substituto na Unesp - Campus de Rio Claro. No final de 2014, Eduardo se juntou à empresa Dow AgroSciences (DAS) como analista de pesquisa no grupo de Biologia Computacional da empresa. Nos seus primeiros anos na DAS ele se dedicou à plataforma de sementes da companhia, trabalhando em parceria com o departamento de melhoramento genético. Seus principais projetos foram: seleção ampla no genoma e análises estatísticas para análise de dados fenotipicos. Em 2017, Eduardo foi um dos 5 ganhadores do NEON Great Start Award, um prêmio legado da DAS que reconhecia funcionários exemplares no início de suas carreiras, abrangendo todas as áreas da empresa, em todos os países e departamentos. Atualmente, Eduardo é cientista de pesquisa associado no departamento de Ciências de Dados de Informática na Corteva Agriscience?, a divisião de agricultura da DowDuPont. Ele está envolvido no desenvolvimento de projetos na área de toxicogenômica da plataforma de defensivos agrícolas da empresa. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Eduardo de Paula Costa
Nome em citações bibliográficas
COSTA, E. P.;DE PAULA COSTA, EDUARDO;Costa, Eduardo P.;Costa, Eduardo


Formação acadêmica/titulação


2009 - 2013
Doutorado em Engenharia (especialidade: Ciência da Computação).
Katholieke Universiteit Leuven, KU Leuven, Bélgica.
Título: Algorithms for analyzing biological sequences, Ano de obtenção: 2013.
Orientador: Hendrik Blockeel.
Coorientador: Jan Ramon.
Palavras-chave: Machine Learning; Bioinformatics; Artificial Intelligence.
2006 - 2008
Mestrado em Ciências da Computação e Matemática Computacional.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: Investigação de Técnicas de Classificação Hierárquica para Problemas de Bioinformática,Ano de Obtenção: 2008.
Orientador: André Carlos Ponce de Leon Ferreira de Carvalho.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
2002 - 2005
Graduação em Bach. em Ciências da Computação.
Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.
Título: Ambiente Computacional para Análise de Elementos Transponíveis.
Orientador: Carlos Norberto Fischer.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.


Pós-doutorado


2013
Pós-Doutorado.
Universidade de São Paulo - São Carlos/SP, USP, Brasil.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Bioinformática.


Formação Complementar


2011 - 2011
Unsupervised pattern recognition. (Carga horária: 15h).
Universidad Politécnica de Madrid, UPM, Espanha.
2011 - 2011
Statistical Inference. (Carga horária: 15h).
Universidad Politécnica de Madrid, UPM, Espanha.
2011 - 2011
Hidden Markov models. (Carga horária: 15h).
Universidad Politécnica de Madrid, UPM, Espanha.
2011 - 2011
Support Vector Machine and Kernel Models. (Carga horária: 15h).
Universidad Politécnica de Madrid, UPM, Espanha.
2011 - 2011
Feature Subset Selection. (Carga horária: 15h).
Universidad Politécnica de Madrid, UPM, Espanha.
2011 - 2011
Supervised Pattern Recognition. (Carga horária: 15h).
Universidad Politécnica de Madrid, UPM, Espanha.
2010 - 2010
Academic Writing. (Carga horária: 20h).
Katholieke Universiteit Leuven, KU Leuven, Bélgica.
2010 - 2010
Presentation skills (English). (Carga horária: 20h).
Katholieke Universiteit Leuven, KU Leuven, Bélgica.
2010 - 2010
Dutch as a foreign language - Academic Dutch. (Carga horária: 60h).
Katholieke Universiteit Leuven, KU Leuven, Bélgica.
2009 - 2010
Dutch as a foreign language - Advanced. (Carga horária: 80h).
Katholieke Universiteit Leuven, KU Leuven, Bélgica.
2009 - 2009
Dutch as a foreign language - Level 2. (Carga horária: 80h).
Katholieke Universiteit Leuven, KU Leuven, Bélgica.
2008 - 2009
Dutch as a foreign language - Level 1. (Carga horária: 80h).
Katholieke Universiteit Leuven, KU Leuven, Bélgica.
2006 - 2006
Inglês Intermediário. (Carga horária: 48h).
Dialog Idiomas, DIALOG, Brasil.
2004 - 2004
Estratégias de Sequenciamento de DNA e Montagem. (Carga horária: 3h).
Workshop Brasileiro de Bioinformática, WOB, Brasil.
2003 - 2003
Curso Básico de Programação em Linguagem C. (Carga horária: 39h).
INFO Júnior Projetos, Assessoria e Consultoria, INFOJR, Brasil.
1998 - 1999
Curdo Integrado de Ambiente Windows. (Carga horária: 80h).
Microcamp Internacional, MICROCAMP, Brasil.


Atuação Profissional



Katholieke Universiteit Leuven, KU Leuven, Bélgica.
Vínculo institucional

2009 - 2013
Vínculo: Estudante de doutorado, Enquadramento Funcional: Estudante de doutorado, Carga horária: 38, Regime: Dedicação exclusiva.

Vínculo institucional

2008 - 2008
Vínculo: Aluno de pré-doutorado, Enquadramento Funcional: Aluno de pré-doutorado, Carga horária: 38, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações
O programa de pré-doutorado é obrigatório para estudantes oriundos de países que não integram o Espaço Econômico Europeu e que desejam ingressar em um programa de doutorado na KU Leuven. Para mais informações, acesse o link abaixo (informações em inglês): http://www.kuleuven.be/admissions/statuses/f_predoc_eea.html


Universidade de São Paulo - São Carlos/SP, USP, Brasil.
Vínculo institucional

2013 - Atual
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pós-dotorando, Carga horária: 40

Vínculo institucional

2006 - 2008
Vínculo: Estudante de mestrado, Enquadramento Funcional: Estudante de mestrado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Vínculo institucional

2007 - 2007
Vínculo: Estagiário PAE, Enquadramento Funcional: Estagiário PAE, Carga horária: 6
Outras informações
PAE: Programa de Aperfeiçoamento de Ensino Disciplina: Introdução à Compilação

Vínculo institucional

2007 - 2007
Vínculo: Estagiário PAE, Enquadramento Funcional: Estagiário PAE, Carga horária: 6
Outras informações
PAE: Programa de Aperfeiçoamento de Ensino Disciplina: Introdução à Bioinformática

Vínculo institucional

2006 - 2006
Vínculo: Estagiário PAE, Enquadramento Funcional: Estagiário PAE, Carga horária: 6
Outras informações
PAE: Programa de Aperfeiçoamento de Ensino Disciplina Teoria da Computação e Linguagens Formais


Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.
Vínculo institucional

2014 - Atual
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor substituto, Carga horária: 12
Outras informações
Professor das disciplinas "Introdução à Computação I" (90 horas de curso), e "Estruturas de Dados I" (60 horas de curso)

Vínculo institucional

2002 - 2005
Vínculo: Aluno de graduação, Enquadramento Funcional: Aluno de graduação, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.



Projetos de pesquisa


2010 - Atual
Using machine learning methods for annotation of transposable elements.

Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Carlos Norberto Fischer em 26/05/2014.
Descrição: Projeto de colaboração bilateral entre a Unesp e a KU Leuven (Bélgica)..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2006 - 2007
Investigação de técnicas de classificação hierárquicas para problemas de bioinformática

Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) André Carlos Ponce de Leon Ferreira de Carvalho em 26/05/2014.
Descrição: Projeto de mestrado, financiado pela Fapesp, sob orientação do Prof. Dr. André Carvalho.
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
2005 - 2005
Ambiente de análise para elementos transponíveis

Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Carlos Norberto Fischer em 03/01/2018.
Descrição: Bolsa de iniciação científica concedida pela Fapesp a Eduardo de Paula Costa, com orientaçào do Prof Dr Carlos N Fischer..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
2004 - 2005
Sistema de Gerenciamento do fluxo de trabalho em Laboratórios de Evolução Molecular (SiGLEM)

Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Carlos Norberto Fischer em 03/01/2018.
Descrição: Projeto de ininicação científica financiado pelo Fapesp.
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
2003 - 2004
Integração de Dados usando XML

Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Carlos Norberto Fischer em 03/01/2018.
Descrição: Projeto de iniciação científica. Financiado pela bolsa de ajuda a alunos carentes da Unesp..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.


Idiomas


Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Holandês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Espanhol
Compreende Bem, Fala Pouco, Lê Bem, Escreve Pouco.
Francês
Compreende Razoavelmente, Fala Pouco, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.
Português
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.


Prêmios e títulos


2017
2017 NEON Great Start Award - Dow AGroSciences, Dow AgroSciences.
2005
Homenagem pelo melhor desempenho acadêmico no curso de Bacharelado em Ciências da Computação Integral dentre os alunos formados em 2005, Instituto de Geociências e Ciências Exatas - Unesp - Campus de Rio Claro.


Produções



Produção bibliográfica
Citações

SCOPUS
Total de trabalhos:7
Total de citações:16
Costa, E. P.  Data: 16/06/2014

Outras
Total de trabalhos:13
Total de citações:77
Pesquisado por nome dos trabalhos  Data: 18/06/2014

Artigos completos publicados em periódicos

1.
SCHIETGAT, LEANDER2018SCHIETGAT, LEANDER ; VENS, CELINE ; CERRI, RICARDO ; FISCHER, CARLOS N. ; Costa, Eduardo ; RAMON, JAN ; CARARETO, CLAUDIA M. A. ; BLOCKEEL, HENDRIK . A machine learning based framework to identify and classify long terminal repeat retrotransposons. PLOS COMPUTATIONAL BIOLOGY (ONLINE), v. 14, p. e1006097, 2018.

2.
GONÇALVES, VINÍCIUS P.2017GONÇALVES, VINÍCIUS P. ; Costa, Eduardo P. ; VALEJO, ALAN ; FILHO, GERALDO P. R. ; JOHNSON, THIENNE M. ; PESSIN, GUSTAVO ; UEYAMA, JÓ . Enhancing intelligence in multimodal emotion assessments. APPLIED INTELLIGENCE (DORDRECHT. ONLINE), v. 46, p. 470-486, 2017.

3.
FISCHER, CARLOS N.2015FISCHER, CARLOS N. ; CARARETO, CLAUDIA M. A. ; DOS SANTOS, RENATO A. C. ; CERRI, RICARDO ; Costa, Eduardo ; SCHIETGAT, LEANDER ; VENS, CELINE . Learning HMMs for nucleotide sequences from amino acid alignments. BIOINFORMATICS, v. 31, p. 1836-1838, 2015.

4.
COSTA, E. P.;DE PAULA COSTA, EDUARDO;Costa, Eduardo P.;Costa, Eduardo2013 COSTA, E. P.; MENSCHAERT, G. ; LUYTEN, W. ; DE GRAVE, K. ; RAMON, J. . PIUS: peptide identification by unbiased search. Bioinformatics, v. 29, p. 1913-1914, 2013.

5.
DE PAULA COSTA, EDUARDO2013 DE PAULA COSTA, EDUARDO; DE PAULA COSTA, EDUARDO ; VENS, CELINE ; BLOCKEEL, HENDRIK . Top-Down Clustering for Protein Subfamily Identification. Evolutionary Bioinformatics Online, v. 9, p. 185-202, 2013.

6.
BACCI JR, M.2005BACCI JR, M. ; Soares, R. R. S. ; TAJARA, E. ; AMBAR, G. ; FISCHER, C. N. ; GUILHERME, I. R. ; COSTA, E. P. ; MIRANDA, V. F. O. . Identification and frequency of transposable elements in Eucalyptus. Genetics and Molecular Biology, Brazil, v. 28(3), p. 634-639, 2005.

Trabalhos completos publicados em anais de congressos
1.
COSTA, E. P.; VEWER, S. ; BLOCKEEL, H. . Estimating Prediction Certainty in Decision Trees. In: The Eleventh International Symposium on Intelligent Data Analysis, 2013, Londres. Lecture Notes in Computer Science. Berlin: Springer Berlin Heidelberg, 2013. v. 8207.

2.
VENS, CELINE ; COSTA, E. P. ; BLOCKEEL, HENDRIK . Top-Down Induction of Phylogenetic Trees. In: European Conference on Evolutionary Computation, Machine Learning and Data Mining in Bioinformatics, 2010, Istanbul. Lecture Notes in Computer Science. Berlin: Springer Berlin Heidelberg, 2010. v. 6023. p. 62-73.

3.
COSTA, E. P.; LORENA, A. C. ; CARVALHO, A. C. P. L. F. ; FREITAS, A. A. . Top-Down Hierarchical Ensembles of Classifiers for Predicting G-Protein-Coupled-Receptor Functions. In: Brazilian Symposium on Bioinformatics - BSB, 2008, Santo Andre. Proceedings BSB 2008, 2008. v. LNBI.

4.
FISCHER, C. N. ; CERRI, R. ; COSTA, E. P. ; BACCI JR, M. . SATEComp: a Tool for in Silico Analysis of Transposable Elements. In: 5th International Conference on Bioinformatics, Computational and Systems Biology, 2008, Veneza. Proc. of World Academy of Science, Engineering and Technology, 2008. v. 34. p. 878-882.

5.
CERRI, R. ; CARVALHO, A. C. P. L. F. ; COSTA, E. P. ; FREITAS, A. A. . Classificação Hierárquica de Proteínas utilizando Abordagens Top-Down e Big-Bang. In: IV Workshop em Algoritmos e Aplicações de Mineração de Dados, 2008, Campinas. Anais do IV Workshop em Algoritmos e Aplicações de Mineração de Dados, 2008.

6.
CERRI, R. ; CARVALHO, A. C. P. L. F. ; COSTA, E. P. . Classificação Hierárquica de Proteínas utilizando Técnicas de Aprendizado de Máquina. In: II Workshop on Computational Intelligence, 2008, Salvador. Anais do II Workshop on Computational Intelligence, 2008.

7.
COSTA, E. P.; LORENA, A. C. ; CARVALHO, A. C. P. L. F. ; FREITAS, A. A. ; HOLDEN, N. . Comparing Several Approaches for Hierarchical Classification of Proteins with Decision Trees. In: Brazilian Symposium on Bioinformatics, 2007, Angra dos Reis - RJ. Lecture Notes on Bioinformatics. Berlin: Springer-Verlag, 2007. v. 4643. p. 126-137.

8.
COSTA, E. P.; LORENA, A. C. ; CARVALHO, A. C. P. L. F. ; FREITAS, A. A. . A Review of Performance Evaluation Measures for Hierarchical Classifiers. In: AAAI07 - II Workshop on Evalution for Machine Learning - Twenty-Second Conference on Artificial Intelligence (AAAI-07), 2007, Vancouver. Lecture Notes in Computer Science, 2007. p. 1-6.

Resumos expandidos publicados em anais de congressos
1.
COSTA, E. P.; SCHIETGAT, L. ; CERRI, R. ; VENS, CELINE ; FISCHER, C. N. ; CARARETO, C. ; RAMON, J. ; BLOCKEEL, HENDRIK . Annotating transposable elements in the genome using relational decision tree ensembles. In: The 23rd INternational Conference on Inductive Logic Programming, 2013, Rio de Janeiro. Proc. of the 23rd INternational Conference on Inductive Logic Programming, 2013.

2.
COSTA, E. P.; VENS, CELINE ; BLOCKEEL, HENDRIK . Protein Subfamily Identification using Clustering Tree. In: The 20th Belgian Dutch Conference on Machine Learning, 2011, The Hagge. Proceedings of the 20th Belgian Dutch Conference on Machine Learning, 2011. p. 105-106.

3.
VENS, CELINE ; COSTA, E. P. ; BLOCKEEL, HENDRIK . Top-down phylogenetic tree reconstruction. In: 4th IAPR International Conference on Pattern Recognition in Bioinformatics, 2009, Shefield. Proceedings of the 4th IAPR International Conference on Pattern Recognition in Bioinformatics, 2009.

4.
COSTA, E. P.; FISCHER, C. N. ; BACCI JR, M. ; CERRI, R. . Ambiente para Análise de Elementos Transponíveis. In: 17º Congresso de Iniciação Científica da UNESP, 2005, Rio Claro. Anais (CD-ROM) do 17º Congresso de Iniciação Científica da UNESP, 2005.

5.
CERRI, R. ; FISCHER, C. N. ; COSTA, E. P. ; BACCI JR, M. . Alinhamentos contra Banco de Biosseqüências Remotos. In: 17º Congresso de Iniciação Científica da UNESP, 2005, Rio Claro. Anais (CD-ROM) do 17º Congresso de Iniciação Científica da UNESP, 2005.

6.
FISCHER, C. N. ; GUILHERME, I. R. ; BACCI JR, M. ; TAKIMOTO, Celso Shiguemi ; COSTA, E. P. ; CAYRES, Marcel Ronald . Controle de Fluxo de Trabalho em Laboratórios de Evolução Molecular. In: III Brazilian Workshop on Bioinformatics, 2004, Brasilia. Anais (CD-ROM) do 3º Workshop Brasileiro de Bioinformática, 2004.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
YAN, Z. ; COSTA, E. P. ; TERRY, C. ; JOHNSON, K. ; WANG, A. . The future of Agrochemical Risk Assessment: Predicting Toxicity Point of Departure with Transcriptome Data. In: Society of Toxicology Annual Meeting, 2018, San Antonio, TX. The Toxicologist. Supplement to Toxicological Sciences, 2018.

2.
COSTA, E. P.; VENS, CELINE ; BLOCKEEL, HENDRIK . Clustering trees for protein subfamily identification, classification and characterization. In: Workshop on Algorithms in Bioinformatics, 2013, Sophia Antipolis. Proc. of the Workshop on Algorithms in Bioinformatics, 2013.

3.
COSTA, E. P.; Verwer, Sicco ; BLOCKEEL, HENDRIK . New procedure for estimating prediction certainty in decision trees. In: Belgian-Dutch Conference on Machine Learning, 2012, Ghent. Proceedings of the 21st Belgian-Dutch Conference on Machine Learning, 2012. p. 60.

4.
COSTA, E. P.; VENS, CELINE ; BLOCKEEL, HENDRIK . Identification and classification of protein subfamilies using top-down phylogenetic tree reconstruction. In: European Conference on Computational Biology, 2011, Vienna. Proc. of the 10th European Conference on Computational Biology, 2011.

5.
COSTA, E. P.; VENS, CELINE ; BLOCKEEL, HENDRIK . Evaluating the use of clustering trees for protein subfamily identification. In: BeNeLux Bioinformatics Conference (BBC), 2011, Luxembourg. Proc. of the 6th BeNeLux Bioinformatics Conference (BBC), 2011.

6.
COSTA, E. P.; VENS, CELINE ; BLOCKEEL, HENDRIK . Reconstructing phylogenetic trees from clustering trees. In: The 9th European Conference on Computational Biology, 2010, Ghent. Proc of the 9th European Conference on Computational Biology, 2010.

7.
COSTA, E. P.; VENS, CELINE ; BLOCKEEL, HENDRIK . Top-down phylogenetic tree reconstruction: a decision tree approach. In: International Workshop on Machine Learning in Systems Biology, 2009, Ljubljana. Proc. of the International Workshop on Machine Learning in Systems Biology, 2009.

8.
COSTA, E. P.; VENS, CELINE ; BLOCKEEL, HENDRIK . Top-down phylogenetic tree reconstruction. In: The 4th BeNeLux Bioinformatics Conference (BBC), 2009, Liege. The 4th BeNeLux Bioinformatics Conference (BBC), 2009.

9.
COSTA, E. P.; FISCHER, C. N. ; BACCI JR, M. ; CERRI, R. . A Computational Tool for Transposable Element Analysis. In: X- meeting - 1st International Conference of the AB3C, 2005, Caxambú. Anais do X- meeting - 1st International Conference of the AB3C, 2005.

10.
COSTA, E. P.; FISCHER, C. N. ; CERRI, R. ; BACCI JR, M. . Automação de Tarefas em Análises de Elementos Transponíveis. In: 13º Simpósio Internacional de Iniciação Científica da USP, 2005, São Carlos. Anais (CD-ROM) do 13º Simpósio Internacional de Iniciação Científica da USP, 2005.

11.
CERRI, R. ; FISCHER, C. N. ; COSTA, E. P. ; BACCI JR, M. . Integrando Ferramentas BLAST para Alinhamentos Locais e Remotos. In: 13º Simpósio Internacional de Iniciação Científica da USP, 2005, São Carlos. Anais (CD-ROM) do 13º Simpósio Internacional de Iniciação Científica da USP, 2005.

12.
COSTA, E. P.; FISCHER, C. N. ; CAYRES, Marcel Ronald ; TAKIMOTO, Celso Shiguemi ; GULHERME, Ivan Rizzo ; BACCI JR, M. . Sistema para Controle de Laboratórios de Evolução Molecular. In: 12º Simpósio Internacional de Iniciação Científica da USP, 2004, São Paulo. Anais (CD-ROM) do 12º Simpósio Internacional de Iniciação Científica da USP, 2004.

13.
COSTA, E. P.; FISCHER, C. N. ; CAYRES, Marcel Ronald ; GUILHERME, I. R. ; BACCI JR, M. ; TAKIMOTO, Celso Shiguemi . Automação de Laboratórios de Evolução Molecular. In: 16º Congresso de Iniciação Científica da UNESP, 2004, Ilha Solteira. Anais (CD-ROM) do 16º Congresso de Iniciação Científica da UNESP, 2004.

Apresentações de Trabalho
1.
COSTA, E. P.. Data Sciences serving the needs of the growing world. 2018. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).


Produção técnica
Programas de computador sem registro
1.
COSTA, E. P.; VENS, CELINE ; BLOCKEEL, H. . Protein subfamily Identification using Clustering Trees. 2013.

2.
COSTA, E. P.; DE GRAVE, K. ; MENSCHAERT, G. ; LUYTEN, W. ; RAMON, J. . PIUS (Peptide identification by unbiased search). 2013.

3.
COSTA, E. P.; VENS, CELINE ; BLOCKEEL, H. . Top-down construction of phylogenetic trees. 2010.

4.
CERRI, R. ; FISCHER, C. N. ; COSTA, E. P. ; BACCI JR, M. . SATEComp: sistema de análise de Elementos Transponíveis.. 2007.

5.
COSTA, E. P.; FISCHER, C. N. ; BACCI JR, M. . Sistema para Gerenciamento de Laboratórios de Evolução Molecular. 2005.

Entrevistas, mesas redondas, programas e comentários na mídia
1.
COSTA, E. P.. Mesa Redonda de Recepção de Alunos Ingressantes de Ciências da Computação da Unesp Rio Claro. 2018. (Programa de rádio ou TV/Mesa redonda).

2.
COSTA, E. P.. Painel: Inteligência Artificial na Indústria. 2018. (Programa de rádio ou TV/Mesa redonda).

3.
COSTA, E. P.. Filhos da Terra: Eduardo de Paula Costa. 2013. (Programa de rádio ou TV/Entrevista).


Demais tipos de produção técnica
Demais trabalhos
1.
COSTA, E. P.; FISCHER, C. N. . Ambiente para Análise de Elementos Transponíveis em Bancos de ESTs - Financiamento Fapesp. 2005 (Projeto de Iniciação Científica) .

2.
COSTA, E. P.; FISCHER, C. N. . Sistema de Gerenciamento do fluxo de trabalho em Laboratórios de Evolução Molecular (SiGLEM) Financiamento Fapesp. 2004 (Projeto de Iniciação Científica) .

3.
COSTA, E. P.; FISCHER, C. N. . Integração de Dados usando XML. 2003 (Projeto de Iniciação Científica) .



Bancas



Participação em bancas de trabalhos de conclusão
Mestrado
1.
BLOCKEEL, H.; MACE, C.; COSTA, E. P.. Participação em banca de Elvis Ndah. Algorithms for reconstruction of genealogical trees of ancient text. 2012. Dissertação (Mestrado em Master in Artificial Intelligence) - Katholieke Universiteit Leuven.

Trabalhos de conclusão de curso de graduação
1.
Oliveira, M. C. F.; COSTA, E. P.. Participação em banca de Alexandre Paes.Desenvolvimento e aperfeiçoamento de um sistema de targeting de e-mail. 2014. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo - São Carlos/SP.

2.
Aluisio, S. M.; COSTA, E. P.. Participação em banca de Danilo S de Souza.Sistema de Gestão da Pró-Reitoria de Gestão de Pessoas. 2014. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado em Ciências da Computação) - Universidade de São Paulo - São Carlos/SP.




Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
The 23rd International Conference on Inductive Logic Programming. Annotating transposable elements in the genome using relational decision tree ensembles. 2013. (Congresso).

2.
Belgian-Dutch Conference on Machine Learning. New procedure for estimating prediction certainty in decision trees. 2012. (Congresso).

3.
Madrid Summer School on Advanced Statistics and Data Mining. 2011. (Outra).

4.
The 20th Belgian Dutch Conference on Machine Learning. Protein Subfamily Identification using Clustering Trees. 2011. (Congresso).

5.
European Conference on Evolutionary Computation, Machine Learning and Data Mining in Bioinformatics. Top-down induction of phylogenetic trees. 2010. (Congresso).

6.
The 9th European Conference on Computational Biology. Reconstructing phylogenetic trees from clustering trees. 2010. (Congresso).

7.
4th IAPR International Conference on Pattern Recognition. Top-down phylogenetic tree reconstruction. 2009. (Congresso).

8.
Workshop of the Royal Flemish Chemical Society - section Proteomics. 2009. (Encontro).

9.
ECML/PKDD 2008 - European Conference on Machine Learning and Principles and Practice of Knowledge Discovery in Databases. 2008. (Congresso).

10.
AAAI07 - II Workshop on Evalution for Machine Learning. A Review of Performance Evaluation Measures for Hierarchical Classifiers. 2007. (Congresso).

11.
Brazilian Symposium on Bioinformatics.Comparing Several Approaches for Hierarchical Classification of Proteins with Decision Trees. 2007. (Simpósio).

12.
III Workshop do PAE - Programa de Aperfeiçoamento de Ensino. 2007. (Oficina).

13.
II Workshop do Programa de Aperfeiçoamento de Ensino - PAE. 2007. (Encontro).

14.
X Simpósio de Teses e Dissertações. 2006. (Simpósio).

15.
13º Simpósio Internacional de Iniciação Científica da Usp.Automação de Tarefas em Análises de Elementos Transponíveis.. 2005. (Simpósio).

16.
17º Congresso de Iniciação Científica da Unesp. Ambiente para Análise de Elementos Transponíveis.. 2005. (Congresso).

17.
I Workshop de Ciência e Tecnologia da Unesp de Rio Claro.Automação de Tarefas em Análises de Elementos Transponíveis.. 2005. (Encontro).

18.
XIII Semana de Estudos da Ciência da Computação - Unesp Rio Claro. 2005. (Encontro).

19.
12º Simpósio Internacional de Iniciação Científica da Usp.Sistema para Controle de Laboratórios de Evolução Molecular. 2004. (Simpósio).

20.
16º Congresso de Iniciação Científica da Unesp. Automação de Laboratórios de Evolução Molecular. 2004. (Congresso).

21.
III Brazilian Workshop on Bioinformatics. Controle de Fluxo de Trabalho em Laboratórios de Evolução Molecular. 2004. (Congresso).

22.
XII Semana de Estudos da Ciência da Computação - Unesp Rio Claro. 2004. (Encontro).

23.
XI Semana de Estudos da Ciência da Computação - Unesp Rio Claro. 2003. (Encontro).

24.
X Semana de Estudos da Ciência da Computação - Unesp Rio Claro. 2002. (Encontro).




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