Jedson Ferreira Cardoso

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  • Última atualização do currículo em 06/11/2018


Doutorando em Virologia pelo Instituto Evandro Chagas (2015). Mestre em Genética e Biologia Molecular, com ênfase em Bioinformática pela Universidade Federal do Pará - UFPA (2013). Possui Especialização em Gestão em Tecnologia da Informação pela Faculdade Ideal - FACI (2008), Graduação em Administração com Habilitação em Gestão em Sistemas de Informação pela Faculdade do Estado do Pará - FAP (2006), CRA-08227. Têm formação em Técnico em Desenvolvimento de Sistemas pelo CESEP-PA. Atualmente sou Analista de Suporte Multiplataforma Pleno - Montreal Informática Ltda. Na Bioinformática, possuo conhecimentos avançados em Linux aplicados em computação científica voltado para Configuração de Cluster HPC (High-Performance Computer), Computação com GPU's na utilização de algoritmos p/ Montagem de Genomas Virais, Procariotos e Eucariotos; Transcriptoma e Metagenômica com habilidade nos softwares: Newbler, Mira, Velvet, Geneious, IDBA, Trinity com aplicabilidade nas Plataformas NGS (Next Generation Sequencing) como: 454Flex e 454Jr (Roche Life Science), SOLID (Applied Biosystem), ION Sequencing, Solexa (Illumina) e MinION (Oxford Nanopore); Filogenia & Filogeografia e Evolução/Recombinação: (PhyMl, RAxML, FigTree, Beast, MrBayes, RDP4, DataMonkey); Alinhamento de Sequências: (Mafft, ClustalX, ClustalW, Muscle, Mauve); Anotação Estrutural e Funcional de Genomas (Blast, RAST, InterProScan e Blast2go). No presente momento, desenvolvo essas atividades no Núcleo de Bioinformática/Centro de Inovações Tecnológicas do Instituto Evandro Chagas/IEC/SVS/MS, Ananindeua-PA. Atuei por 5 anos como Professor Consultor da Universidade Paulista. Atuando também como Consultor e Analista de Suporte em TIC (Tecnologia da Informação e Comunicação) têm experiência de 03 (três) anos no Gerenciamento da Equipe de TIC (Tecnologia da Informação e Comunicação) e há mais de 15 (dez) anos em Suporte e Análise em Ambiente de Redes Corporativas constando de instalação, configuração e monitoramento da Rede Local (LAN - Local Area Networks) e Rede de Longa Distância (WAN - Wide Area Networks), e Tecnologias a serem implementadas. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Jedson Ferreira Cardoso
Nome em citações bibliográficas
CARDOSO, J. F.;CARDOSO, Jedson F.;Cardoso, Jedson Ferreira;CARDOSO, J.F.;Jedson Ferreira Cardoso;CARDOSO, JEDSON

Endereço


Endereço Profissional
Instituto Evandro Chagas.
Rodovia BR-316 km 7 s/n
Levilândia
67030-000 - Ananindeua, PA - Brasil
Telefone: (91) 32142295
URL da Homepage: http://www.iec.pa.gov.br/cit/index.html


Formação acadêmica/titulação


2015
Doutorado em andamento em Virologia.
Instituto Evandro Chagas, IEC, Brasil.
Título: Filogeografia e Evolução do Vírus da Febre Amarela (VFA) nas Américas,
Orientador: Pedro Fernando da Costa Vasconcelos.
Coorientador: Daniele Barbosa de Almeida Medeiros.
Palavras-chave: Filogeografia; Evolução Viral.
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.
2010 - 2013
Mestrado em Genética e Biologia Molecular.
Universidade Federal do Pará, UFPA, Brasil.
Título: Estratégia de Montagem de Procarioto por Abordagem ?De Novo?, Sequenciado pela Plataforma FLX 454: Micro-organismo Endofítico Extraído do Açaí,Ano de Obtenção: 2013.
Orientador: Prof Dr. Jeronimo Lameira Silva.
Coorientador: Prof. Dr. Márcio Roberto Teixeira Nunes.
Palavras-chave: Bioinformática; Computação Aplicada a Biomedicina.
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: GESTÃO EM TECNOLOGIA DA INFORMAÇÃO.
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: GESTÃO EM TECNOLOGIA DA INFORMAÇÃO / Especialidade: Segurança da Informação.
Setores de atividade: Pesquisa e desenvolvimento científico; Educação; Outras atividades profissionais, científicas e técnicas.
2007 - 2008
Especialização em Gestão em Tecnologia da Informação. (Carga Horária: 420h).
Faculdade Ideal, FACI, Brasil.
Título: GERPLAN - Gerador Automático de Plano de Negócios.
Orientador: Profª Claudia Sadalla.
2002 - 2006
Graduação em Administração.
Faculdade do Estado do Pará, FAP-PA, Brasil.
Título: Planejamento Estratégico de Tecnologia da Informação (PETI): Metodologia e Importância de sua Aplicação na Estrutura Organizacional.
Orientador: Luiz Alberto M. dos Santos Carapajó.
2000 - 2000
Curso técnico/profissionalizante.
CESEP - Centro de Serviços Educacionais do Pará, CESP, Brasil.
1989 - 1991
Ensino Médio (2º grau).
Visconde de Souza Franco, E.E.E.F.M VSF, Brasil.
1985 - 1988
Ensino Fundamental (1º grau).
E. E. Profa Ruth dos Santos de Almeida, E.E. RSA, Brasil.




Formação Complementar


2018 - 2018
Introduction to R. (Carga horária: 4h).
DataCamp, DATACAMP, Estados Unidos.
2016 - 2016
SN71-Storage Area Networking Fundamentals. (Carga horária: 32h).
Avnet Academy, AVNET, Brasil.
2016 - 2016
SSE1-IBM Storwize V7000 Implementation. (Carga horária: 32h).
Avnet Academy, AVNET, Brasil.
2016 - 2016
Workshop Tivoli Storage Manager - TSM. (Carga horária: 24h).
Suporte Informática, SI, Brasil.
2016 - 2016
Workshop Chassis Lâminas - Blade Center H. (Carga horária: 16h).
Suporte Informática, SI, Brasil.
2016 - 2016
Ecology and evolution of Infectious Diseases ? Module one. (Carga horária: 40h).
Fundação Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, Brasil.
2014 - 2014
Biologia Molecular e Evolução dos Vírus. (Carga horária: 46h).
Fundação Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, Brasil.
2014 - 2014
I Curso de Verão em Virologia. (Carga horária: 35h).
Instituto Evandro Chagas, IEC, Brasil.
2014 - 2014
Fund. em Gerenc. de Serv. de TI com base na ITIL. (Carga horária: 24h).
TIEXAMES Consultoria e Treinamento LTDA, TIEXAMES, Brasil.
2013 - 2013
Bioinformatics Workshop "Big data handling". (Carga horária: 35h).
Instituto Tecnológico Vale, ITV, Brasil.
2012 - 2012
How to set up a high performance computer cluster. (Carga horária: 3h).
Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, AB3C, Brasil.
2011 - 2011
MATLAB 7. (Carga horária: 20h).
Universidade Federal do Pará, UFPA, Brasil.
2010 - 2010
Introdução a Linguagem de Programação Perl. (Carga horária: 60h).
Universidade Federal do Pará, UFPA, Brasil.
2010 - 2010
Plataforma de Sequenciamento de Nova Geração "NGS". (Carga horária: 45h).
CBAB - Centro Brasileiro-Argentino de Biotecnologia, CBAB, Brasil.
2010 - 2010
Genética de Populações: Aplicações no Processo evo. (Carga horária: 44h).
Instituto Evandro Chagas, IEC, Brasil.
2008 - 2008
Firewall: Linux (Iptable+Squid). (Carga horária: 12h).
Red Links, REDLINKS, Brasil.
2006 - 2006
Switching Enterasys. (Carga horária: 20h).
Redisul Engenharia de Redes, REDISUL, Brasil.
2005 - 2005
Progr. de Gerenc. de Resíduos de Serv. de Saúde. (Carga horária: 4h).
Instituto Evandro Chagas, IEC, Brasil.
2005 - 2005
Interpretação das Normas ISO/17025 e NIT-DICLA/083. (Carga horária: 40h).
Ministério da Saúde, MS, Brasil.
2005 - 2005
Upgrade - Windows 2000SRV para Windows 2003SRV. (Carga horária: 110h).
CPD Informática, CPD, Brasil.
2005 - 2005
Monitor/2005 - Disciplina Administração de SI. (Carga horária: 336h).
Faculdade do Pará, FAP, Brasil.
2003 - 2003
Curso de HTML. (Carga horária: 15h).
MICROLINS - Centro de Formação Profissional, MICROLINS, Brasil.
2002 - 2002
Marketing Pessoal. (Carga horária: 20h).
Faculdade do Pará, FAP, Brasil.
2002 - 2002
MOC 2154 - Implementing and Administering MS2000AD. (Carga horária: 40h).
Amazon Corporation, AMAZON, Brasil.
2002 - 2002
MOC 2153 - Supporting a MSWin2000 Network Infra. (Carga horária: 40h).
Amazon Corporation, AMAZON, Brasil.
2001 - 2001
Supporting MS Windows 2000Pro and Server. (Carga horária: 40h).
TBA Informática, TBA, Brasil.
2001 - 2001
MOC 2151 - MSWindows 2000 Networking and Operating. (Carga horária: 40h).
Amazon Corporation, AMAZON, Brasil.
2001 - 2001
MOC 2152 - Supporting MSWin2000 Pro and Server. (Carga horária: 40h).
Amazon Corporation, AMAZON, Brasil.
2000 - 2000
Linux I. (Carga horária: 40h).
Conectiva Linux, CONECTIVA, Brasil.
1998 - 1998
Treinamento em TAB (TABDOS, TABWIN, TABNET). (Carga horária: 20h).
Ministério da Saúde, MS, Brasil.
1997 - 1997
Instalação e Administração de Rede Novell 4.10. (Carga horária: 30h).
Instituto Brasileiro de Pesquisa em Informática, IBPI, Brasil.
1997 - 1997
Programção Visual Basic 4.0. (Carga horária: 24h).
Centro de Informática Especializada S/C Ltda, CIE, Brasil.
1996 - 1996
Manutenção de Microcomputadores. (Carga horária: 16h).
Associação Profissional dos Técnicos Industriais do Pará e Amapá, APTIPA, Brasil.
1996 - 1996
Treinamento em Informática (Harvard Graphics). (Carga horária: 40h).
Ministério da Saúde, MS, Brasil.
1996 - 1996
Word - Excel - Powerpoint. (Carga horária: 100h).
Data Control - Escola Técnica em Informática, DATACONTROL, Brasil.
1996 - 1996
IPD/DOS - Windows - Word - Excel. (Carga horária: 40h).
Fundação Nacional de Saúde - Presidência, FUNASA, Brasil.
1993 - 1993
Micro-Informática. (Carga horária: 16h).
CESINF - Centro de Estudos de Informática, CESINF, Brasil.
1993 - 1993
Operação de Microcomputadores. (Carga horária: 72h).
CESINF - Centro de Estudos de Informática, CESINF, Brasil.
1993 - 1993
Introdução ao Sistema Operacional MS-DOS. (Carga horária: 16h).
CESINF - Centro de Estudos de Informática, CESINF, Brasil.
1993 - 1993
Sistema Operacional MS-DOS. (Carga horária: 20h).
CESINF - Centro de Estudos de Informática, CESINF, Brasil.
1993 - 1993
Editor de Texto Wordstar. (Carga horária: 20h).
CESINF - Centro de Estudos de Informática, CESINF, Brasil.
1991 - 1991
Administração de Material. (Carga horária: 40h).
Serviço Nacional de Aprendizagem Comercial - PA, SENAC, Brasil.
1991 - 1991
Datilografia. (Carga horária: 48h).
Centro de Obras Culturais e Sociais Leão XIII - Pa, COCSLXIII, Brasil.
1991 - 1991
Wordstar. (Carga horária: 22h).
Secretaria de Estado de Educação do Pará, SEDUC, Brasil.
1991 - 1991
Auxiliar de Escritório. (Carga horária: 40h).
Serviço Nacional de Aprendizagem Comercial - PA, SENAC, Brasil.


Atuação Profissional



Montreal Informática Ltda., MI, Brasil.
Vínculo institucional

2008 - Atual
Vínculo: Celetista formal, Enquadramento Funcional: Analista de Suporte Pleno, Carga horária: 40
Outras informações
Suporte Técnico constando de instalação, configuração e monitoramento da Rede Local (LAN - Local Area Networks) e Rede de Longa Distância (WAN - Wide Area Networks) nos servidores de rede, em especial ao ambiente HPC (High-Performance Computing) e outros do IEC/SVS/MS em Ambiente Operacional Linux, e também em Ambiente Operacional MS Windows 2003/2008 (Active Directory, DNS (Interno/Externo), FTP, Wins e DHCP), Servidor de Correio Eletrônico (Exchange Server 2003), Servidores de Arquivos e Impressão, Servidores Web (IIS e Apache), PHP, Servidores SGBD (MS SQLServer), Soluções Corporativas de (Anti-vírus OfficeScan Corporation Edition / ServerProtect, Anti-Spam/IMSS; e IWSS);- Suporte Técnico nas aplicações específicas inerentes as atividades operacionais das Seções/Setores do IEC/SVS/MS; Suporte Técnico aos usuários do IEC/SVS/MS na utilização de softwares (Aplicativos e Básicos) como Office XP/2003, Browsers, Clientes de Correios Eletrônicos (Outlook e Outlook Express), MS Windows Win9X/2000/XP/Seven Home/Professional, CorelDraw, AdobePhotoshop, Conhecimentos Avançados em Linux para uso em Bioinformática no IEC/SVS/MS aplicados em Montagem de Genomas Virais, Procariotos e Eucariotos: (Newbler, Mira, Geneious", Bioscope, Velvet, etc) das Plataformas NGS (Next Generation Sequencing) como 454 (Roche Life Science), SOLID (Applied Biosystem) e ION Sequencing; Filogenia e Evolução/Recombinação: (PhyMl, RAxML, TreeView, Beast, MrBayes, RDP4, DataMonkey, HyPhy, etc...); Alinhamento de Sequências: (Mafft, ClustalX, ClustalW, Muscle, Mauve); Anotação Estrutural e Funcional de Genomas (Blast, RAST, InterProScan e Blast2go) - Participação em reuniões que viabilizem ao IEC/SVS/MS suporte em TIC (Tecnologia da Informação e Comunicação), com vista a melhor servir aos usuários na utilização dos recursos computacionais e implementação de novas tecnologias


Universidade da Amazônia, UNAMA, Brasil.
Vínculo institucional

2015 - 2015
Vínculo: Professor Visitante, Enquadramento Funcional: Professor Convidado, Carga horária: 15
Outras informações
Ministrei a disciplina Gestão de Avanços Tecnológicos, para a 7ª turma do Curso de Pós-Graduação Lato Sensu em Gestão Pública.


Universidade Paulista, UNIP, Brasil.
Vínculo institucional

2009 - 2012
Vínculo: Celetista formal, Enquadramento Funcional: Professor Consultor, Carga horária: 16
Outras informações
Disciplinas: Projeto de Desenvolvimento de Sistemas de Informação; Custo, Benefício e Impactos Organizacionais dos Sistemas de Informação; Sistemas de Informação para Processos Produtivos; Lógica; Principios de SI; Sistema de Informação para Planejamento Estratégico; e Redes de Computadores e Telecomunicações.


Instituto Evandro Chagas, IEC, Brasil.
Vínculo institucional

1993 - 2002
Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Técnico em Informática, Carga horária: 40
Outras informações
- Instalação e configuração de redes locais (LAN - Local Area Networks) e redes de longa distância (WAN - Wide Area Networks), microcomputadores, placas e conexões (hubs, switches e roteadores) e outros; - Instalação, Administração e Suporte Técnico em Ambiente Operacional MS Windows NT/2000, Exchange, IIS, SNA, SMS e SQLServer; - Instalação e configuração de estações Client Windows 98/NT/2000/XP, Mac e Linux, Impressão, SQLServer 2000; - Suporte a usuários na utilização de softwares como (Office 4.2/95/97/2000; Browsers; Correios Eletrônicos, CorelDraw, AdobePhotoshop, etc); - Outras tarefas de mesma natureza e complexidade, de acordo com a necessidade do serviço e de novas tecnologias a serem implementadas; - abr/2000 à abr/2002 gerenciei a equipe do Setor de Informática /IEC/SVS/MS


Universidade Paulista, UNIP, Brasil.
Vínculo institucional

2007 - 2008
Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Professor Consultor, Carga horária: 16
Outras informações
Disc.: Estrutura de Sistemas de Informação; Técnicas de Informática; Fundamentos de Administração; Fundamentos de Redes Dados e Comunicação; Modelagem de Sistemas de Informação; Projeto de Desenvolvimento de Sistemas de Informação; e Tecnologia de Banco de Dados para SI.


CTIS Tecnologia S/A., CTIS, Brasil.
Vínculo institucional

2002 - 2008
Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Técnico em Processamento de Dados, Carga horária: 40
Outras informações
- Até mai-2003 gerenciei a equipe do Setor de Informática /IEC/SVS/MS; - Suporte Técnico constando de instalação, configuração e monitoramento da Rede Local (LAN - Local Area Networks) e Rede de Longa Distância (WAN - Wide Area Networks) nos servidores de rede, estações de trabalho, placas e conexões (hubs, switches e roteadores) e outros do IEC/SVS/MS compreendendo os Sites (IEC-BEL e IEC-ANA) em Ambiente Operacional MS Windows 2000/2003 (Active Directory, DNS (Interno/Externo), FTP, Wins e DHCP), Servidor de Correio Eletrônico (Exchange Server), Servidores de Arquivos e Impressão, Servidores Web (IIS e Apache), PHP, Servidores SGBD (MS SQLServer), Soluções Corporativas de (Anti-vírus OfficeScan Corporation Edition / ServerProtect, e Anti-Spam), Proxy/Firewall (MS Proxy 2.0/ISA Server 2000/2004/2006); - Suporte Técnico nas aplicações específicas inerentes as atividades operacionais das Seções/Setores do IEC/SVS/MS as quais destaco (SEVEP ? Controle Epidemiológico, SEPAR ? Doença de Chagas, SEBIO ? HAGBIOTERIO Controle de Animais, SEARB ? Controle de Dengue/FA, BIBLIOTECA ? BVS (Biblioteca Virtual em Saúde ? Padrão XML/XSL) e Ariel), assim como as aplicações administrativas via SCA; - Suporte Técnico aos usuários do IEC/SVS/MS na utilização de softwares (Aplicativos e Básicos) como Office XP/2003, Browsers, Clientes de Correios Eletrônicos (Outlook e Outlook Express), MS Windows Win9X/2000 e XP Home/Professional, CorelDraw, AdobePhotoshop, Conhecimentos de Linux, Desenvolvimento de aplicações em access e conhecimentos básicos de Delphi e VB; - Participação em reuniões que viabilizem ao IEC/SVS/MS suporte em TI, com vista a melhor servir aos usuários na utilização dos recursos computacionais e implementação de novas tecnologias, ?tendo como princípios a inovação, o desenvolvimento e aprimoramento no desempenho da empresa, através da tecnologia da informação, melhorando continuamente o padrão de qualidade?. Assim como, outras tarefas de mesma natureza e complex


STEFANINI CONS ASS INFORMATICA S/A, STEFANINI, Brasil.
Vínculo institucional

2008 - 2008
Vínculo: Celetista formal, Enquadramento Funcional: Ténico em Processamento de Dados Sênior, Carga horária: 40
Outras informações
Suporte Técnico constando de instalação, configuração e monitoramento da Rede Local (LAN - Local Area Networks) e Rede de Longa Distância (WAN - Wide Area Networks) nos servidores de rede, estações de trabalho, placas e conexões (hubs, switches e roteadores) e outros do IEC/SVS/MS compreendendo os Sites (IEC-BEL; IEC-ANA e CENP) em Ambiente Operacional MS Windows 2000/2003 (Active Directory, DNS (Interno/Externo), FTP, Wins e DHCP), Servidor de Correio Eletrônico (Exchange Server 2003), Servidores de Arquivos e Impressão, Servidores Web (IIS e Apache), PHP, Servidores SGBD (MS SQLServer), Soluções Corporativas de (Anti-vírus OfficeScan Corporation Edition / ServerProtect, Anti-Spam/IMSS; e IWSS), Proxy/Firewall (MS ISA Server 2006);- Suporte Técnico nas aplicações específicas inerentes as atividades operacionais das Seções/Setores do IEC/SVS/MS as quais destaco (SEVEP ? Controle Epidemiológico, SEPAR ? Doença de Chagas, SEBIO ? HAGBIOTERIO Controle de Animais, SEARB ? Controle de Dengue/FA, BIBLIOTECA ? BVS (Biblioteca Virtual em Saúde ? Padrão XML/XSL) e Ariel), assim como as aplicações administrativas via SCA;- Suporte Técnico aos usuários do IEC/SVS/MS na utilização de softwares (Aplicativos e Básicos) como Office XP/2003, Browsers, Clientes de Correios Eletrônicos (Outlook e Outlook Express), MS Windows Win9X/2000 e XP Home/Professional, CorelDraw, AdobePhotoshop, Conhecimentos de Linux para uso do CACIC, Desenvolvimento de aplicações em access e conhecimentos básicos de Delphi e VB;- Participação em reuniões que viabilizem ao IEC/SVS/MS suporte em TIC (Tecnologia da Informação e Comunicação), com vista a melhor servir aos usuários na utilização dos recursos computacionais e implementação de novas tecnologias. Assim como, outras tarefas de mesma natureza e complexidade, utilizando-se da metodologia da gestão de projetos com a utilização de ferramentas Projects.


Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
Vínculo institucional

2012 - Atual
Vínculo: , Enquadramento Funcional:



Projetos de pesquisa


2012 - Atual
Genômica da Microbiota Endofítica do Açaí
Descrição: O açaí é uma fonte de alimento tradicional na Amazônia oriental, mas vem sendo o alvo de estudos que visam a utilização de subprodutos bioativos oriundos desse fruto. Por ser rico em compostos fenólicos, antioxidantes e ter composição distinta de outros frutos, esse estudo visa caracterizar a microbiota bacteriana endofítica do açaí com fins de bioprospecção de novos biocatalisadores com ação sobre esses compostos, e também para compreender quais vias metabólicas potencialmente participam do processo de fermentação bacteriana natural da polpa de açaí. Foram isolados 10 espécies bacterianas e todas terão seu genoma sequenciado por completo. Através de genômica comparativa, buscar-se-ão regiões de diferença genômica entre os isolados encontrados e isolados da mesma espécie isolados de outros contextos ecológicos disponíveis no GenBank, para também compreender quais genes estão correlacionados com um modus vivendi endofítico. Já estão prontos os scaffolds genômicos de três isolados, sendo duas enterobactérias e uma bactéria láctica.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) .
Integrantes: Jedson Ferreira Cardoso - Integrante / Marcio Roberto Teixeira Nunes - Integrante / JOÃO LÍDIO DA SILVA GONÇALVES VIANEZ JÚNIOR - Integrante / P. J. Perez-Chaparro - Integrante / J. A. MCCULLOCH - Coordenador / Evonnildo Costa Gonçalves - Integrante / Louise Teixeira Cerdeira - Integrante / Hervé Louis Ghislain Rogez - Integrante / Thaís Cristina Oliveira Coelho - Integrante / Izabela Priscilla de Lima Coelho - Integrante.Financiador(es): Instituto Evandro Chagas - Auxílio financeiro.
2012 - Atual
Análise genômica estrutural de Callithrix penicillata (Primates, Platyrrhini)
Descrição: Os primatas não humanos têm sido utilizados como modelos para a pesquisa biomédica de doenças com diversas etiologias, incluindo múltiplos patógenos. Dentre os primatas do novo mundo os Callitrichinae representam um atraente modelo experimental não humano e em especial as espécies Callithrix jachhus e Callithrix penicillata têm sido utilizados em pesquisas no campo da neurociência, biologia reprodutiva, doenças infecciosas, pesquisa comportamental e no desenvolvimento de medicamentos e vacinas. As vantagens da sua utilização estão relacionadas ao custo de manutenção e tamanho do animal, cuidados de criação em cativeiro, biossegurança e características fisiológicas únicas, como sua particular suscetibilidade a infecções virais e bacterianas, o que é provavelmente devido a sua limitada variação genética inter-individual em ambas as classes I e II do Complexo Principal de Histocompatibilidade MHC. Aparentemente, cada gênero da subfamília Callitrichinae exibe um conjunto único de genes do MHC, assim, através de análises filogenéticas comparativas entre genomas de primatas não humanos do novo e do velho mundo e humanos podem explicar diferenças evolutivas entre os organismos, que por sua vez pode ser aplicado à pesquisa biomédica. Contudo, apesar de drafts genômicos estarem disponíveis para vários primatas do velho mundo, genomas completos de primatas do novo mundo, o maior grupo de primatas em número de espécies, foram obtidos apenas para duas espécies, Saimiri boliviensis e Callithrix jacchus. Nesse contexto, esta proposta objetiva caracterizar o genoma estrutural, em especial o Complexo Principal de Histocompatibilidade classe I e II, do primata não humano Callithrix penicillata, com vistas à identificação de genes homólogos, em comparação ao genoma humano, que possam estar envolvidos na susceptibilidade a doenças. Isto deve favorecer sua adequação como modelos experimentais através da compreensão dos mecanismos relacionados à resposta imune do modelo.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2012 - Atual
Estudo da resistência heterogênea à vancomicina em Staphylococcus aureus através da genética comparativa de subpopulações de um isolado
Descrição: Descrição: A vancomicina é um antibiótico de primeira linha e, não raro, única alternativa viável contra infecções por S. aureus resistente a meticilina (MRSA). O surgimento de cepas de MRSA que não respondem ao tratamento com vancomicina (cepas VISA) está ligado a um fenótipo de resistência cujo mecanismo envolve o paulatino engrossamento da parede celular bacteriana, o que pode ocorrer por conjuntos diferentes de mutações em vários genes. Logo, não há, como na resistência a outros antibióticos, genes únicos que podem servir como marcadores moleculares de resistência, o que impede a detecção do fenótipo VISA por biologia molecular. Ademais, certas linhagens pré-VISA apresentam o fenômeno de resistência heterogênea à vancomicina, em que dentro de uma dada população celular, subpopulações apresentam concentrações inibitórias mínimas (CIMs) altas de vancomicina, sendo a CIM média populacional baixa o suficiente para levar a um resultado falso sensível quando pesquisado no laboratório clínico de rotina por métodos tradicionais. Todavia, quando se cultiva uma cepa hetero-VISA, há a ocorrência de subpopulações com CIMs maiores do que a maioria, que não seriam detectadas por sequenciamento, já que as outras versões polimórficas de um gene em questão, por ocorrerem em número muito maior, levariam a um resultado representativo somente daquele polimorfismo. A proposição do presente projeto é, portanto, usar um approach de célula única (single cell) para identificar quais genes previamente atribuídos ao fenótipo de resistência intermediária homogênea à vancomicina (VISA) encontram-se mutados em subpopulações de linhagens hetero-VISA. Os genomas amplificados por MDA das células únicas isoladas serão sequenciados completamente e comparar-se-ão as sequencias de todas as CDSs, e em especial as dos genes SA1702, vraS, agrC, prsA, yycH, graR e graS de células isoladas por diluição obtidas de uma única colônia de linhagens hetero-VISA. O mesmo será feito com células obtidas de linhagens com..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) .
Integrantes: Jedson Ferreira Cardoso - Integrante / Marcio Roberto Teixeira Nunes - Integrante / JOÃO LÍDIO DA SILVA GONÇALVES VIANEZ JÚNIOR - Integrante / John Anthony McCulloch - Coordenador / Geraldo Alécio de Oliveira - Integrante / Elsa Masae Mamizuka - Integrante / Paula Juliana Pérez Chaparro - Integrante / Evonnildo Costa Gonçalves - Integrante / Louise Teixeira Cerdeira - Integrante / Pedro Alves de Azevedo - Integrante / Alessandro Conrado de Oliveira Silveira - Integrante.


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos/Especialidade: Bioinformática.
2.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genetics.
3.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Computer Systems Architecture.
4.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Information Systems.
5.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Segurança da Informação.
6.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Database.


Idiomas


Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.
Espanhol
Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente, Escreve Razoavelmente.


Prêmios e títulos


2011
Premiação em 1º lugar no I Workshop Internacional em Bioinformática, Instituto Evandro Chagas.
2011
Premiação em 2º lugar no I Workshop Internacional em Bioinformática, Instituto Evandro Chagas.
2011
Duas Menções Honrosas no I Workshop Internacional em Bioinformática, Instituto Evandro Chagas.
2007
Honra ao Mérito "Carreira de Docência e Notáveis Contribuições", UNIP - Universidade Paulista.
2006
Prêmio FAP de Excelência Educacional "Semestres letivos 2003.2 e 2005.2", FAP - Faculdade do Pará.


Produções



Produção bibliográfica
Artigos completos publicados em periódicos

1.
DE MELO, ARISTIDES BEZERRA2018DE MELO, ARISTIDES BEZERRA ; DE SOUZA, WILLIAM MARCIEL ; ACRANI, GUSTAVO OLSZANSKI ; CARVALHO, VALÉRIA LIMA ; ROMEIRO, MARILIA FARIGNOLI ; TOLARDO, ALINE LAVADO ; DA SILVA, SANDRO PATROCA ; Cardoso, Jedson Ferreira ; DE OLIVEIRA CHIANG, JANNIFER ; DA SILVA GONÇALVES VIANEZ, JOÃO LÍDIO ; DO SOCORRO DA SILVA AZEVEDO, RAIMUNDA ; FIGUEIREDO, LUIZ TADEU MORAES ; DA COSTA VASCONCELOS, PEDRO FERNANDO ; NUNES, MÁRCIO ROBERTO TEIXEIRA ; DE ALMEIDA MEDEIROS, DANIELE BARBOSA . Genomic characterization and evolution of Tacaiuma orthobunyavirus ( Peribunyaviridae family) isolated in Brazil. INFECTION GENETICS AND EVOLUTION, v. 60, p. 71-76, 2018.

2.
ARAGÃO, ANDRESSA DE OLIVEIRA2018ARAGÃO, ANDRESSA DE OLIVEIRA ; NUNES NETO, JOAQUIM PINTO ; CRUZ, ANA CECÍLIA RIBEIRO ; CASSEB, SAMIR MANSOUR MORAES ; Cardoso, Jedson Ferreira ; DA SILVA, SANDRO PATROCA ; ISHIKAWA, EDNA AOBA YASSUI . Description and phylogeny of the mitochondrial genome of Sabethes chloropterus , Sabethes glaucodaemon and Sabethes belisarioi (Diptera: Culicidae). GENOMICS, v. 1, p. 1-1, 2018.

3.
SILVA, DOROTÉA DE FÁTIMA LOBATO DA2018SILVA, DOROTÉA DE FÁTIMA LOBATO DA ; Cardoso, Jedson Ferreira ; SILVA, SANDRO PATROCA DA ; ARRUDA, LEDA MANI FRANÇA ; MEDEIROS, RENATO LOPES FERNANDES DE ; MORAES, MARLUCE MATOS ; SOUSA, RITA CATARINA MEDEIROS . HCMV UL97 phosphotransferase gene mutations may be associated with antiviral resistance in immunocompromised patients in Belém, PA, Northern Brazil. SOCIEDADE BRASILEIRA DE MEDICINA TROPICAL. REVISTA, v. 51, p. 141-145, 2018.

4.
NUNES, MÁRCIO ROBERTO TEIXEIRA2018NUNES, MÁRCIO ROBERTO TEIXEIRA ; DE SOUZA, WILLIAM MARCIEL ; ACRANI, GUSTAVO OLSZANSKI ; Cardoso, Jedson Ferreira ; DA SILVA, SANDRO PATROCA ; BADRA, SORAYA JABUR ; FIGUEIREDO, LUIZ TADEU MORAES ; VASCONCELOS, PEDRO FERNANDO DA COSTA . Revalidation and genetic characterization of new members of Group C (Orthobunyavirus genus, Peribunyaviridae family) isolated in the Americas. PLoS One, v. 13, p. e0197294, 2018.

5.
CONTRERAS-GUTIÉRREZ, MARÍA ANGÉLICA2018CONTRERAS-GUTIÉRREZ, MARÍA ANGÉLICA ; GUZMAN, HILDA ; CARDOSO, Jedson F. ; POPOV, VSEVOLOD L. ; NUNES, MARCIO R. T. ; URIBE, SANDRA ; WIDEN, STEVEN G. ; WOOD, THOMAS G. ; VASILAKIS, NIKOS ; TESH, ROBERT B. . Genome Sequence of Chiqui Virus, a Novel Reovirus Isolated from Mosquitoes Collected in Colombia. Microbiology Resource Announcements, v. 7, p. 1-2, 2018.

6.
WATANABE, LUCIANA2018WATANABE, LUCIANA ; GOMES, FÁTIMA ; VIANEZ, JOÃO ; NUNES, MÁRCIO ; CARDOSO, JEDSON ; LIMA, CLAYTON ; SCHNEIDER, HORACIO ; SAMPAIO, IRACILDA . De novo transcriptome based on next-generation sequencing reveals candidate genes with sex-specific expression in Arapaima gigas (Schinz, 1822), an ancient Amazonian freshwater fish. PLoS One, v. 13, p. e0206379-22, 2018.

7.
CONTRERAS-GUTIÉRREZ, MARÍA ANGÉLICA2017CONTRERAS-GUTIÉRREZ, MARÍA ANGÉLICA ; NUNES, MARCIO R.T. ; GUZMAN, HILDA ; URIBE, SANDRA ; GALLEGO GÓMEZ, JUAN CARLOS ; SUAZA VASCO, JUAN DAVID ; CARDOSO, Jedson F. ; POPOV, VSEVOLOD L. ; WIDEN, STEVEN G. ; WOOD, THOMAS G. ; VASILAKIS, NIKOS ; TESH, ROBERT B. . Sinu virus, a novel and divergent orthomyxovirus related to members of the genus Thogotovirus isolated from mosquitoes in Colombia. Virology (New York, N.Y. Print), v. 501, p. 166-175, 2017.

8.
NUNES, MARCIO R.T.2017NUNES, MARCIO R.T. ; CONTRERAS-GUTIERREZ, MARÍA ANGÉLICA ; GUZMAN, HILDA ; MARTINS, LIVIA C. ; BARBIRATO, MAYLA FEITOZA ; SAVIT, CHELSEA ; BALTA, VICTORIA ; URIBE, SANDRA ; VIVERO, RAFAEL ; SUAZA, JUAN DAVID ; OLIVEIRA, HAMILTON ; NUNES NETO, JOAQUIN P. ; CARVALHO, VALERIA L. ; DA SILVA, SANDRO PATROCA ; CARDOSO, Jedson F. ; DE OLIVEIRA, RODRIGO SANTO ; DA SILVA LEMOS, POLIANA ; WOOD, THOMAS G. ; WIDEN, STEVEN G. ; VASCONCELOS, PEDRO F.C. ; FISH, DURLAND ; VASILAKIS, NIKOS ; TESH, ROBERT B. . Genetic characterization, molecular epidemiology, and phylogenetic relationships of insect-specific viruses in the taxon Negevirus. Virology (New York, N.Y. Print), v. 504, p. 152-167, 2017.

9.
GOMES, FÁTIMA2017GOMES, FÁTIMA ; WATANABE, LUCIANA ; NOZAWA, SÉRGIO ; OLIVEIRA, LAYANNA ; CARDOSO, JEDSON ; VIANEZ, JOÃO ; NUNES, MÁRCIO ; SCHNEIDER, HORACIO ; SAMPAIO, IRACILDA . Identification and characterization of the expression profile of the microRNAs in the Amazon species Colossoma macropomum by next generation sequencing. GENOMICS, v. 1, p. 1-1, 2017.

10.
CARVALHO, VALÉRIA L.2017CARVALHO, VALÉRIA L. ; NUNES, MÁRCIO R. T. ; MEDEIROS, DANIELE B. A. ; DA SILVA, SANDRO PATROCA ; LIMA, CLAYTON P. S. ; INADA, DAVI T. ; CARDOSO, Jedson F. ; VIANEZ, JOÃO L. S. G. ; RODRIGUES, SUELI GUERREIRO ; VASCONCELOS, PEDRO F. C. . New Virus Genome Sequences of the Guama Serogroup (Genus Orthobunyavirus , Family Bunyaviridae ), Isolated in the Brazilian Amazon Region. Genome Announcements, v. 5, p. e01750-16-1, 2017.

11.
DA ROSA, JORGE FERNANDO TRAVASSOS2017DA ROSA, JORGE FERNANDO TRAVASSOS ; DE SOUZA, WILLIAM MARCIEL ; DE PAULA PINHEIRO, FRANCISCO ; FIGUEIREDO, MÁRIO LUIZ ; CARDOSO, J. F. ; ACRANI, GUSTAVO OLSZANSKI ; NUNES, M. R. T. . Oropouche Virus: Clinical, Epidemiological, and Molecular Aspects of a Neglected Orthobunyavirus. The American Journal of Tropical Medicine and Hygiene, v. 1, p. 16-0672, 2017.

12.
CONTRERAS-GUTIERREZ, MARIA ANGELICA2017CONTRERAS-GUTIERREZ, MARIA ANGELICA ; WATTS, DOUGLAS M. ; PERERA, DAVID ; TRAVASSOS DA ROSA, AMELIA P. A. ; NUNES, MARCIO R. T. ; FISH, DURLAND ; VASILAKIS, NIKOS ; CARDOSO, Jedson F. ; POPOV, VSEVOLOD L. ; WOOD, THOMAS G. ; TESH, ROBERT B. ; GUZMAN, HILDA ; YOUNG, KATHERINE I. ; WIDEN, STEVEN G. ; HANLEY, KATHRYN A. ; SAVIT, CHELSEA . Characterization of Three New Insect-Specific Flaviviruses: Their Relationship to the Mosquito-Borne Flavivirus Pathogens. AMERICAN JOURNAL OF TROPICAL MEDICINE AND HYGIENE, v. 1, p. 1-1, 2017.

13.
NUNES-NETO, JOAQUIM PINTO2017NUNES-NETO, JOAQUIM PINTO ; SOUZA, WILLIAM MARCIEL DE ; ACRANI, GUSTAVO OLSZANSKI ; ROMEIRO, MARILIA FARIGNOLI ; FUMAGALLI, MARCÍLIOJORGE ; VIEIRA, LUIZ CARLOS ; MEDEIROS, DANIELE BARBOSA DE ALMEIDA ; LIMA, JULIANA ABREU ; LIMA, CLAYTON PEREIRA SILVA DE ; Cardoso, Jedson Ferreira ; FIGUEIREDO, LUIZ TADEU MORAES ; SILVA, SANDRO PATROCA DA ; TESH, ROBERT ; NUNES, MÁRCIO ROBERTO TEIXEIRA ; VASCONCELOS, PEDRO FERNANDO DA COSTA . Characterization of the Bujaru, frijoles and Tapara antigenic complexes into the sandfly fever group and two unclassified phleboviruses from Brazil. JOURNAL OF GENERAL VIROLOGY, v. 98, p. 585-594, 2017.

14.
SILVA, S.P.2017SILVA, S.P. ; SILVA, L.N.P.P. ; RODRIGUES, E.D.L. ; CARDOSO, J.F. ; TAVARES, F.N. ; SOUZA, W.M. ; SANTOS, C.M.P. ; MARTINS, F.M.S. ; JESUS, I.S. ; BRITO, T.C. ; MOURA, T.P.C. ; NUNES, M.R.T. ; CASSEB, L.M.N. ; SILVA FILHO, E. ; CASSEB, A.R. . Full-length genomic and molecular characterization of Canine parvovirus in dogs from North of Brazil. GENETICS AND MOLECULAR RESEARCH, v. 16, p. 1-1, 2017.

15.
WANZELLER, ANA LUCIA M.2016WANZELLER, ANA LUCIA M. ; NUNES, MÁRCIO R. T. ; TAVARES, FERNANDO N. ; PINTO, WALBER V. M. ; JÚNIOR, EDIVALDO C. ; DE LIMA, CLAYTON P. S. ; DE OLIVEIRA, LAYANNA F. ; JÚNIOR, JOÃO LÍDIO S. G. V. ; CARDOSO, Jedson F. ; VASCONCELOS, PEDRO F. C. . Inhangapi Virus: Genome Sequencing of a Brazilian Ungrouped Rhabdovirus Isolated in the Amazon Region. Genome Announcements, v. 4, p. e01525-15, 2016.

16.
FARIA, N. R.2016FARIA, N. R. AZEVEDO, R. D. S. D. S. KRAEMER, M. U. G. SOUZA, R. CUNHA, M. S. HILL, S. C. THEZE, J. BONSALL, M. B. BOWDEN, T. A. RISSANEN, I. ROCCO, I. M. NOGUEIRA, J. S. MAEDA, A. Y. VASAMI, F. G. D. S. MACEDO, F. L. D. L. SUZUKI, A. RODRIGUES, S. G. CRUZ, A. C. R. NUNES, B. T. MEDEIROS, D. B. D. A. RODRIGUES, D. S. G. NUNES QUEIROZ, A. L. SILVA, E. V. P. D. HENRIQUES, D. F. TRAVASSOS DA ROSA, E. S. , et al.DE OLIVEIRA, C. S. MARTINS, L. C. VASCONCELOS, H. B. CASSEB, L. M. N. SIMITH, D. D. B. MESSINA, J. P. ABADE, L. LOURENCO, J. ALCANTARA, L. C. J. LIMA, M. M. D. GIOVANETTI, M. HAY, S. I. DE OLIVEIRA, R. S. LEMOS, P. D. S. OLIVEIRA, L. F. D. DE LIMA, C. P. S. DA SILVA, S. P. VASCONCELOS, J. M. D. FRANCO, L. CARDOSO, J. F. VIANEZ-JUNIOR, J. L. D. S. G. MIR, D. BELLO, G. DELATORRE, E. KHAN, K. CREATORE, M. COELHO, G. E. DE OLIVEIRA, W. K. TESH, R. PYBUS, O. G. NUNES, M. R. T. VASCONCELOS, P. F. C. ; Zika virus in the Americas: Early epidemiological and genetic findings. Science (New York, N.Y.), v. 1, p. 1-1, 2016.

17.
Silvestre, Rodrigo Vellasco Duarte2016Silvestre, Rodrigo Vellasco Duarte ; DE SOUZA, ALEX JUNIOR SOUZA ; JÚNIOR, EDIVALDO COSTA SOUSA ; SILVA, ALLAN KAIO ; DE MELLO, WYLLER ALENCAR ; NUNES, MARCIO ROBERTO T. ; JÚNIOR, JOÃO LÍDIO S. G. V. ; Cardoso, Jedson Ferreira ; DE VASCONCELOS, JANAINA MOTA ; DE OLIVEIRA, LAYANNA FREITAS ; DA SILVA, SANDRO PATROCA ; DA SILVA, ADRIANA MARQUES J. ; FRIES, BRIGIDA GOMES ; SUMMA, MARIA EUGÊNIA L. ; DE SÁ, LILIAN ROSE M. . First New World Primate Papillomavirus Identification in the Atlantic Forest, Brazil:. Genome Announcements, v. 4, p. e00725-16, 2016.

18.
AZEVEDO, RAIMUNDA S.S.2016AZEVEDO, RAIMUNDA S.S. ARAUJO, MARIALVA T. MARTINS FILHO, ARNALDO J. OLIVEIRA, CONSUELO S. NUNES, BRUNO T.D. CRUZ, ANA C.R. NASCIMENTO, ANA G.P.A.C. MEDEIROS, RITA C. CALDAS, CEZAR A.M. ARAUJO, FERNANDO C. QUARESMA, JUAREZ A.S. VASCONCELOS, BARBARA C.B. QUEIROZ, MARIA G.L. DA ROSA, ELIZABETH S. TRAVASSOS HENRIQUES, DANIELE F. SILVA, ELIANA V.P. CHIANG, JANNIFER O. MARTINS, LÍVIA C. MEDEIROS, DANIELE B.A. LIMA, JULIANA A. NUNES, MÁRCIO R.T. CARDOSO, Jedson F. SILVA, SANDRO P. SHI, PEI-YONG TESH, ROBERT B. , et al.RODRIGUES, SUELI G. VASCONCELOS, PEDRO F.C. ; Zika virus epidemic in Brazil. I. Fatal disease in adults: Clinical and laboratorial aspects. Journal of Clinical Virology, v. 85, p. 56-64, 2016.

19.
TAURO, LAURA B.2015TAURO, LAURA B. ; RIVAROLA, MARIA E. ; LUCCA, EDUARDO ; MARIÑO, BETINA ; MAZZINI, RUBÉN ; Cardoso, Jedson Ferreira ; BARRANDEGUY, MARÍA EDITH ; TEIXEIRA NUNES, MARCIO ROBERTO ; CONTIGIANI, MARTA S. . First isolation of Bunyamwera virus (Bunyaviridae family) from horses with neurological disease and an abortion in Argentina. The Veterinary Journal (London, England. 1997), v. 1, p. 1, 2015.

20.
LEMOS, POLIANA DA SILVA2015LEMOS, POLIANA DA SILVA ; MONTEIRO, HAMILTON ANTÔNIO DE OLIVEIRA ; CASTRO, FRANCISCO CORRÊA ; LIMA, CLAYTON PEREIRA SILVA DE ; SILVA, DAISY ELAINE ANDRADE DA ; VASCONCELOS, JANAÍNA MOTA DE ; OLIVEIRA, LAYANNA FREITAS DE ; SILVA, SANDRO PATROCA DA ; Cardoso, Jedson Ferreira ; VIANEZ JÚNIOR, JOÃO LÍDIO DA SILVA GONÇALVES ; NUNES, MÁRCIO ROBERTO TEIXEIRA . Characterization of mitochondrial genome of Haemagogus janthinomys (Diptera: Culicidae). Mitochondrial DNA, v. 1, p. 1-2, 2015.

21.
NUNES, MARCIO ROBERTO TEIXEIRA2015NUNES, MARCIO ROBERTO TEIXEIRA ; FARIA, NUNO RODRIGUES ; DE VASCONCELOS, JANAINA MOTA ; GOLDING, NICK ; KRAEMER, MORITZ UG ; DE OLIVEIRA, LAYANNA FREITAS ; AZEVEDO, RAIMUNDA DO SOCORRO DA SILVA ; DA SILVA, DAISY ELAINE ANDRADE ; DA SILVA, ELIANA VIEIRA PINTO ; DA SILVA, SANDRO PATROCA ; CARVALHO, VALÉRIA LIMA ; COELHO, GIOVANINI EVELIM ; CRUZ, ANA CECÍLIA RIBEIRO ; RODRIGUES, SUELI GUERREIRO ; DA SILVA GONÇALVES VIANEZ, JOAO LÍDIO ; NUNES, BRUNO TARDELLI DINIZ ; Cardoso, Jedson Ferreira ; TESH, ROBERT B ; HAY, SIMON I ; PYBUS, OLIVER G ; DA COSTA VASCONCELOS, PEDRO FERNANDO . Emergence and potential for spread of Chikungunya virus in Brazil. BMC Medicine, v. 13, p. 102, 2015.

22.
NUNES, MÁRCIO R. T.2015NUNES, MÁRCIO R. T. ; SILVA, SANDRO P. ; CARVALHO, VALÉRIA L. ; VASCONCELOS, JANAINA M. ; DA SILVA, DAISY E. A. ; OLIVEIRA, LAYANNA F. ; NUNES NETO, JOAQUIM P. ; RODRIGUES, SUELI G. ; AZEVEDO, RAIMUNDA S. S. ; MONTEIRO, HAMILTON A. O. ; CARDOSO, Jedson F. ; GUZMAN, HILDA ; TESH, ROBERT ; VASCONCELOS, PEDRO F. C. ; VIANEZ-JÚNIOR, JOÃO L. S. G. ; MARTINS, LÍVIA C. . Emergence of New Insect-Restrictive Viruses in the Amazon Region. Genome Announcements, v. 3, p. e00131-15, 2015.

23.
COSTA, GISELLE CALASANS DE SOUZA2015COSTA, GISELLE CALASANS DE SOUZA ; NUNES, MARCIO ; JESUS, JAQUELINE GOES ; NOVAES, THIAGO ; Cardoso, Jedson Ferreira ; SOUSA, EDIVALDO ; SANTOS, EDSON DE SOUZA ; GALVÃO-CASTRO, BERNARDO ; ZANETTE, DALILA LUCIOLA ; GONÇALVES, MARILDA DE SOUSA ; ALCANTARA, LUIZ CARLOS . Amino and Carboxyl-terminal CCR5 mutations in Brazilian HIV-1 infected women and homology model of p.L55Q CCR5 mutant. AIDS Research and Human Retroviruses, v. 00, p. 150331070418001, 2015.

24.
LIMA, A. R. J.2014LIMA, A. R. J. ; SIQUEIRA, A. S. ; DOS SANTOS, B. G. S. ; DA SILVA, F. D. F. ; INADA, D. T. ; INADA, D. T. ; CARDOSO, J. F. ; LIMA, C. P. ; VIANEZ-JUNIOR, J. L. S. G. ; NUNES, M. R. T. ; GONCALVES, E. C. . Draft Genome Sequence of Rhodobacter sp. Strain CACIA 14H1, a Heterotrophic Bacterium Obtained from a Nonaxenic Culture of a Cyanobium Species. Genome Announcements, v. 2, p. e01116-13-e01116-13, 2014.

25.
LIMA, A. R. J.2014LIMA, A. R. J. ; SIQUEIRA, A. S. ; DOS SANTOS, B. G. S. ; DA SILVA, F. D. F. ; LIMA, C. P. ; CARDOSO, J. F. ; VIANEZ-JUNIOR, J. L. S. G. ; NUNES, M. R. T. ; GONCALVES, E. C. . Draft Genome Sequence of Blastomonas sp. Strain CACIA 14H2, a Heterotrophic Bacterium Associated with Cyanobacteria. Genome Announcements, v. 2, p. e01200-13-e01200-13, 2014.

26.
LIMA, A. R. J.2014LIMA, A. R. J. ; SIQUEIRA, A. S. ; DOS SANTOS, B. G. S. ; DA SILVA, F. D. F. ; LIMA, C. P. ; CARDOSO, J. F. ; VIANEZ JUNIOR, J. L. D. S. G. ; DALL'AGNOL, L. T. ; MCCULLOCH, J. A. ; NUNES, M. R. T. ; GONCALVES, E. C. . Draft Genome Sequence of the Brazilian Cyanobium sp. Strain CACIAM 14. Genome Announcements, v. 2, p. e00669-14-e00669-14, 2014.

27.
SILVA, S. P.2014SILVA, S. P. ; DILCHER, M. ; WEBER, F. ; HUFERT, F. T. ; WEIDMANN, M. ; CARDOSO, J. F. ; CARVALHO, V. L. ; CHIANG, J. O. ; MARTINS, L. C. ; LIMA, C. P. S. ; DA SILVA, D. E. A. ; VIANEZ-JUNIOR, J. L. S. G. ; POPOV, V. L. ; TRAVASSOS DA ROSA, A. P. A. ; TESH, R. B. ; VASCONCELOS, P. F. C. ; NUNES, M. R. T. . Genetic and biological characterization of selected Changuinola viruses (Reoviridae, Orbivirus) from Brazil. Journal of General Virology (Print), v. 1, p. 35-39, 2014.

28.
WANZELLER, A. L. M.2014WANZELLER, A. L. M. ; MARTINS, L. C. ; DINIZ JUNIOR, J. A. P. ; DE ALMEIDA MEDEIROS, D. B. ; CARDOSO, J. F. ; DA SILVA, D. E. A. ; DE OLIVEIRA, L. F. ; DE VASCONCELOS, J. M. ; NUNES, M. R. T. ; VIANEZ JUNIOR, J. L. D. S. G. ; VASCONCELOS, P. F. C. . Xiburema Virus, a Hitherto Undescribed Virus within the Family Rhabdoviridae Isolated in the Brazilian Amazon Region. Genome Announcements, v. 2, p. e00454-14-e00454-14, 2014.

29.
MEDEIROS, D. B. D. A.2014MEDEIROS, D. B. D. A. ; DINIZ JUNIOR, J. A. P. ; CARDOSO, J. F. ; SILVA, S. P. ; DA SILVA, D. E. A. ; DE OLIVEIRA, L. F. ; E VASCONCELOS, J. M. ; CHIANG, J. O. ; DIAS, A. A. ; NUNES, M. R. T. ; VIANEZ JUNIOR, J. L. D. S. G. ; VASCONCELOS, P. F. C. . Nearly Complete Genome Sequence of Curionopolis Virus, a Culicoides-Related Rhabdovirus Isolated in the Brazilian Amazon Region. Genome Announcements, v. 2, p. e01158-14-e01158-14, 2014.

30.
RODRIGUES, D. S. G.2014RODRIGUES, D. S. G. ; MEDEIROS, D. B. D. A. ; RODRIGUES, S. G. ; MARTINS, L. C. ; DE LIMA, C. P. S. ; DE OLIVEIRA, L. F. ; DE VASCONCELOS, J. M. ; DA SILVA, D. E. ; CARDOSO, J. F. ; DA SILVA, S. P. ; VIANEZ-JUNIOR, J. L. D. S. G. ; NUNES, M. R. T. ; VASCONCELOS, P. F. D. C. . Pacui Virus, Rio Preto da Eva Virus, and Tapirape Virus, Three Distinct Viruses within the Family Bunyaviridae. Genome Announcements, v. 2, p. e00923-14-e00923-14, 2014.

31.
NUNES, M. R. T.2014NUNES, M. R. T. ; CHIANG, J. O. ; DE LIMA, C. P. S. ; MARTINS, L. C. ; ARAGAO DIAS, A. ; CARDOSO, J. F. ; SILVA, S. P. ; DA SILVA, D. E. A. ; OLIVEIRA, L. F. ; VASCONCELOS, J. M. ; FERREIRA, J. P. C. ; TRAVASSOS DA ROSA, A. P. A. ; GUZMAN, H. ; TESH, R. B. ; VASCONCELOS, P. F. C. . New Genome Sequences of Gamboa Viruses (Family Bunyaviridae, Genus Orthobunyavirus) Isolated in Panama and Argentina. Genome Announcements, v. 2, p. e00940-14-e00940-14, 2014.

32.
Garza, Daniel Rios2012Garza, Daniel Rios ; Thompson, Cristiane C. ; Loureiro, Edvaldo Carlos Brito ; Dutilh, Bas E. ; Inada, Davi Toshio ; Junior, Edivaldo Costa Sousa ; Cardoso, Jedson Ferreira ; Nunes, Márcio Roberto T. ; de Lima, Clayton Pereira Silva ; Silvestre, Rodrigo Vellasco Duarte ; Nunes, Keley Nascimento Barbosa ; Santos, Elisabeth C. O. ; Edwards, Robert A. ; Vicente, Ana Carolina P. ; de Sá Morais, Lena Lillian Canto . Genome-Wide Study of the Defective Sucrose Fermenter Strain of Vibrio cholerae from the Latin American Cholera Epidemic. Plos One, v. 7, p. e37283, 2012.

33.
CASSEB, S.M.M.2012CASSEB, S.M.M. ; CARDOSO, J.F. ; RAMOS, R. ; CARNEIRO, A. ; NUNES, M. ; VASCONCELOS, P.F.C. ; SILVA, A. . Optimization of dengue virus genome assembling using GSFLX 454 pyrosequencing data: evaluation of assembling strategies. Genetics and Molecular Research, v. 11, p. 3688-3695, 2012.

34.
NUNES, M. R. T.2012NUNES, M. R. T. ; PALACIOS, G. ; CARDOSO, J. F. ; MARTINS, L. C. ; SOUSA JUNIOR, E. C. ; LIMA, C. P. S. ; MEDEIROS, D. B. A. ; SAVJI, N. ; DESAI, A. ; RODRIGUES, S. G. ; CARVALHO, V. L. ; LIPKIN, W. I. ; VASCONCELOS, P.F.C. . Genomic and phylogenetic characterization of Brazilian Yellow Fever virus strains. Journal of Virology (Print), v. 86, p. 13263-13271, 2012.

35.
NUNES, M. R. T.2012 NUNES, M. R. T. ; FARIA, N. R. ; VASCONCELOS, H. B. ; MEDEIROS, D. B. A. ; LIMA, C. P. S. ; CARVALHO, V. L. ; SILVA, E. V. P. ; CARDOSO, J. F. ; SOUSA JUNIOR, E. C. ; NUNES, K. N. B. ; RODRIGUES, S. G. ; ABECASIS, A. B. ; SUCHARD, M. A. ; LEMEY, P. ; VASCONCELOS, P. F. C. . Phylogeography of Dengue Virus Serotype 4, Brazil, 2010-2011. Emerging Infectious Diseases (Print), v. 18, p. 1858-1864, 2012.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
OLIVEIRA, RLS ; NASCIMENTO, SB ; PINHEIRO, SS ; SOUSA JUNIOR, EC ; CARDOSO, J. F. ; SILVA, FR ; LAMEIRA, JS ; NUNES, MRT . Prediction of three-dimensional strucuture of a segment of glycoprotein G1 of the Bunyamwera virus by molecular modeling. In: XVI - Simpósio Brasileiro de Química Teórica, 2011, Ouro Preto - MG. Livro de Resumos do 16° Simpósio Brasileiro de Química Teórica, 20 a 23 de novembro de 2011. Belo Horizonte: Editora UFOP, 2011. Ouro Preto: UFOP, 2011. v. 512. p. 370-370.

Apresentações de Trabalho
1.
PEREIRA, P. S. ; LIMA, C. P. S. ; SILVA, S. P. ; CARDOSO, J. F. ; OLIVEIRA, R. S. ; LERY, L. M. ; NUNES, M. R. T. ; VIANEZ JUNIOR, J. L. D. S. G. ; ASENSI, M. ; CARVALHO-ASSEF, A. . DRAFT GENOME OF KPC-2-PRODUCING KLEBSIELLA PNEUMONIAE BELONGING TO ST437 FROM BRAZIL. 2015. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

2.
SILVA, D. F. L. ; MORAES, M. ; SAGICA, F. ; SILVA, S. P. ; CARDOSO, J. F. ; FRANCA, L. ; SOUSA, R. C. . PESQUISA DE MUTAÇÕES EM REGIÕES CONSERVADAS NO GENE UL97 DO CMV PODEM CONFERIR RESISTÊNCIA ANTIVIRAL AO GANCICLOVIR EM PACIENTES IMUNODEPRIMIDOS, BELÉM-PA. 2015. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

3.
VASCONCELOS, JANAÍNA MOTA DE ; CARDOSO, J.F. ; NUNES, M. R. T. ; FARIA, NUNO RODRIGUES ; MEDEIROS, D. B. A. ; SILVA, S. P. ; LIMA, C. P. S. ; DA SILVA, D. E. A. ; OLIVEIRA, LAYANNA FREITAS DE ; CARVALHO, VALÉRIA LIMA ; FERREIRA, J. P. C. ; RODRIGUES, S. G. ; TRAVASSOS DA ROSA, A. P. A. ; COELHO, T. C. O. ; COELHO, I. P. L. ; BAELE, G. ; PYBUS, O. ; LEMEY, P. ; VIANEZ JUNIOR, J. L. D. S. G. ; TESH, R. B. ; VASCONCELOS, P. F. C. . Phylogeography and evolution of Yellow Fever Virus in the Americas. 2014. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

4.
OLIVEIRA, LAYANNA FREITAS DE ; VASCONCELOS, JANAÍNA MOTA DE ; SILVA, S. P. ; DA SILVA, D. E. A. ; AZEVEDO, RAIMUNDA DO SOCORRO DA SILVA ; CARDOSO, J.F. ; VIANEZ JUNIOR, J. L. D. S. G. ; LIMA, A. F. ; ROSA, J. F. S. T. ; TESH, R. B. ; NUNES, M. R. T. . Genomic and Phylogenetic characterization of Madre de Dios strain Alazuale and Iquitos virus, two reassortant Orthobunyavirus associated with disease. 2014. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

5.
RODRIGUES, D. S. G. ; NUNES, M. R. T. ; CARDOSO, J. F. ; SOUSA JUNIOR, EC ; RODRIGUES, S. G. ; VASCONCELOS, P. F. C. . Caracterização molecular e filogeografia de cepas do Virus da Encefalite de St. Louis isoladas no estado do Pará, Brasil. 2012. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

6.
SOUSA JUNIOR, E. C. ; CARDOSO, J. F. ; VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. ; OLIVEIRA, R. L. S. ; INADA, D. T. ; LIMA, C. P. S. ; FRANCO, E. C. S. ; SILVA, F. R. ; LAMEIRA, Jeronimo ; NUNES, K. N. B. ; NUNES, M. R. T. ; VASCONCELOS, P. F. C. . Sequencing and Modeling of the Envelope Protein of a Yellow Fever Virus Strain (BEAR378600) Isolated in the Brazilian Amazon. 2012. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

7.
DA SILVA, D. E. A. ; INADA, D. T. ; VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. ; CARDOSO, J. F. ; LIMA, C. P. S. ; SOUSA JUNIOR, E. C. ; NUNES, K. N. B. ; NUNES, M. R. T. ; VASCONCELOS, P. F. C. . Full-Length Genome Determination of Bimiti Virus Using the Pyrosequencing Method. 2012. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

8.
PINHEIRO, S. S. ; NASCIMENTO, S. B. ; MIRANDA, R. ; SILVA, R. C. ; OLIVEIRA, R. L. S. ; ALENCAR, N. ; LIMA, A. H. ; CARDOSO, J. F. ; LAMEIRA, Jeronimo . Theorical Study of the Molecular Mechanism of the O-GIcNac Transferase Human: A Starting Point for Inhiibitor Desing. 2012. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

9.
NASCIMENTO, S. B. ; PINHEIRO, S. S. ; MIRANDA, R. ; MORAIS, G. ; ABRACADO, E. ; CARDOSO, J. F. ; LAMEIRA, Jeronimo ; ALVES, C. N. ; OLIVEIRA, R. L. S. . Molecular Modeling Study of Mur A Enzyme of the Mycobacterium Tuberculosisoel. 2012. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

10.
VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. ; CARVALHO, V. L. ; LIMA, C. P. S. ; DA SILVA, D. E. A. ; NUNES, M. R. T. ; CARDOSO, J. F. . A Simple Genome Assembly Strategy for New Viruses (Orthobunyavirus) Using Mixed Pyrosequencing Data. 2012. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

11.
CARDOSO, J. F.; NUNES, M. R. T. ; SOUSA JUNIOR, E. C. ; INADA, D. T. ; OLIVEIRA, R. L. S. ; NASCIMENTO, S. B. ; PINHEIRO, S. S. ; LAMEIRA, Jeronimo ; VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. . Molecular Modeling and Docking Study of Dengue Virus 4 NS2B/NS3 Protein Using Peptidic Inhibitors. 2012. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

12.
OLIVEIRA, R. S. ; PEREZ-CHAPARRO, P. J. ; BARATA, R. R. ; LIMA, C. P. S. ; CARDOSO, J. F. ; RAIOL, P. R. ; VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. ; ROGEZ, H. L. ; GONCALVES, E. C. ; SANTOS, A. S. ; NUNES, M. R. T. ; MCCULLOCH, J. A. . Pirossequenciamento do DNA Total Obtido do Microcosmo da Microbiota Endofítica de Frutos de Elaeis Guineensis Jacq, Revela Rica Fonte de Biocatalizadores. 2012. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

13.
CARDOSO, J. F.; SOUSA JUNIOR, EC ; INADA, D. T. ; SILVA, FR ; OLIVEIRA, RLS ; NUNES, M. R. T. ; SILVA, A. L. C. . MOLECULAR MODELING OF DENGUE VÍRUS 4 NS3 PROTEIN. 2011. (Apresentação de Trabalho/Outra).

14.
GARZA, D. R. ; CARDOSO, J. F. ; SA, L. L. C. . Molecular Evolution of an Environmental Vibrio cholerae O1 from the Amazon. 2011. (Apresentação de Trabalho/Outra).

15.
SOUSA JUNIOR, EC ; CARDOSO, J. F. ; INADA, D. T. ; OLIVEIRA, RLS ; SILVA, FR ; VASCONCELOS, P. F. C. ; NUNES, MRT ; SILVA, J. L. . Molecular Modeling and Docking of Yellow Fever Virus NS2B-NS3 Protein. 2011. (Apresentação de Trabalho/Outra).

16.
OLIVEIRA, RLS ; SOUSA JUNIOR, EC ; SILVA, FR ; CARDOSO, J. F. ; INADA, D. T. ; NUNES, MRT ; LAMEIRA, Jeronimo . MOLECULAR MODELING OF THE BUNYAMWERA ORTHOBUNYAVIRUS GC GLYCOPROTEIN. 2011. (Apresentação de Trabalho/Outra).

17.
INADA, D. T. ; SOUSA JUNIOR, EC ; CARDOSO, J. F. ; SILVA, FR ; OLIVEIRA, RLS ; NUNES, MRT . GENOMICS ANNOTATION OF VIRAL STRAINS DENV4 (DENGUE VIRUS TYPE 4) COMING FROM PIROSEQUENCING. 2011. (Apresentação de Trabalho/Outra).

18.
SILVA, FR ; SOUSA JUNIOR, EC ; CARDOSO, J. F. ; OLIVEIRA, RLS ; INADA, D. T. ; NUNES, MRT ; LAMEIRA, Jeronimo . MOLECULAR MODELING OF THE VIRUS OROPOUCHE GC GLYCOPROTEIN. 2011. (Apresentação de Trabalho/Outra).


Produção técnica
Redes sociais, websites e blogs
1.
CARDOSO, J. F.. Jedson Cardoso. 2007; Tema: http://www.jedsoncardoso.eti.br. (Site).


Demais tipos de produção técnica
1.
CARDOSO, J. F.. III Curso de Verão do PPGV: Virus, Vetores e Viroses. 2016. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

2.
CARDOSO, J.F.. II Simpósio de Virologia: Infecções Virais na Atualidade. 2016. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

3.
CARDOSO, J. F.. III International Bioinformatics Workshop on Biology/Molecular Epidemiology and Virus Evolution. 2015. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

4.
CARDOSO, J. F.. Introdução ao Linux e Introdução às Análises Filogenéticas e Filogeograficas. 2014. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

5.
CARDOSO, J. F.. Curso Básico de Internet e E-mail(Outlook). 2006. (Curso de curta duração ministrado/Outra).



Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
Ecology and evolution of Infectious Diseases ? Module one. 2016. (Seminário).

2.
Rabies in the Americas International Meeting. 2016. (Encontro).

3.
Webinar in Paradigms in Human and Animal Rabies Prevention & Control. 2016. (Encontro).

4.
8th Internacional Conference of the Brazilian Association for Bionformatics and Computational Biology - X-Meeting. Molecular Modeling and Docking Study of Dengue Virus 4 NS2B/NS3 Protein Using Peptidic Inhibitors. 2012. (Congresso).

5.
IV Simpósio de Simulação Computacional e Avaliação Biológica de Biomoléculas na Amazônia. 2012. (Simpósio).

6.
IV Simpósio Internacional de Arbovirologia e Febres Hemorrágicas. 2011. (Simpósio).

7.
I Workshop Internacional em Bioinformática.MOLECULAR MODELING OF DENGUE VÍRUS 4 NS3 PROTEIN. 2011. (Oficina).

8.
VII Curso de Verão em Bioinformática "Fundamentos de bioinformática aplicada à análise de microarrays"."Fundamentos de bioinformática aplicada à análise de microarrays". 2011. (Oficina).

9.
III Simpósio de Simulação Computacional e Avaliação Biológica de Biomoléculas na Amazônia. 2010. (Simpósio).

10.
Bioinformática ?Next-Gen?: Montagem e Anotação de Genomas Bacterianos Completos.Guia Básico de Sobrevivência no Linux. 2009. (Oficina).

11.
Palestra: Gestão Empresarial no Mundo Globalizado, CH: 06h.. 2007. (Outra).

12.
IV Forum Paraense de Software Livre. 2005. (Simpósio).

13.
III Amazonet - Congresso Amazônico de Conectividade. 1998. (Congresso).

14.
II Amazonet - Congresso Amazônico de Conectividade. 1997. (Congresso).


Organização de eventos, congressos, exposições e feiras
1.
CARDOSO, J. F.. IV Simpósio de Simulação Computacional e Avaliação Biológica de Biomoléculas na Amazônia. 2012. (Outro).

2.
CARDOSO, J. F.. VIII Seminário Interno do PIBIC / IEC. 2003. (Outro).

3.
CARDOSO, J. F.. I Jornada de Doenças Endêmicas no Nordeste do Pará. 2002. (Congresso).

4.
CARDOSO, J. F.. VII Seminário Interno do PIBIC / IEC. 2002. (Outro).

5.
CARDOSO, J. F.. VI Seminário Interno do PIBIC / IEC. 2001. (Outro).

6.
CARDOSO, J. F.. IV Seminário Interno do PIBIC / IEC. 1999. (Outro).

7.
CARDOSO, J. F.. III Seminário Interno do PIBIC / IEC. 1998. (Outro).



Educação e Popularização de C & T



Redes sociais, websites e blogs
1.
CARDOSO, J. F.. Jedson Cardoso. 2007; Tema: http://www.jedsoncardoso.eti.br. (Site).




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