Raphael de Souza Mattos

Possui bacharelado e licenciatura em Ciências Biológicas pela Pontifícia Universidade Católica de Campinas (2006) e Mestrado em Genética e Biologia Molecular da Universidade Estadual de Campinas. Participa de projetos financiados por FAPESP, CNPq e FINEP, dentre os quais se encontra o INCT do Bioetanol. Atualmente é doutorando e bioinformata bolsista DTI trabalhando no Laboratório de Bioinformática e Biologia de Sistemas do CBMEG/UNICAMP. Durante o doutorado desenvolve projeto relacionado a regulação da expressão de microRNAs, redes de regulação gênica, biologia de sistemas e biologia sintética. Tem experiência anterior nas áreas de Ecologia, com ênfase em Ecologia de Ecossistemas e de Morfologia (Biologia Celular e Histologia).
(Texto informado pelo autor)

Última atualização do currículo em 14/08/2011
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Dados pessoais
NomeRaphael de Souza Mattos
Nome em citações bibliográficasMATTOS, R. S.
SexoMasculino
Endereço profissionalUniversidade Estadual de Campinas, Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética.
Av. Cândido Rondon, 400
Barão geraldo
13083-875 - Campinas, SP - Brasil - Caixa-Postal: 6010
Telefone: (19) 35211133

Formação acadêmica/Titulação
2011            Doutorado em andamento em Genética e Biologia Molecular .
Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.
Título: Papel dos miRNAs na estrutura e dinâmica de redes de regulação gênica em plantas., Orientador: Renato Vicentini dos Santos.
Palavras-chave: miRNA; biologia sintética; biologia de sistemas; motivos de rede; redes de regulação gênica.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Bioinformática.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Vegetal.
Setores de atividade: Pesquisa e desenvolvimento científico.
2008 - 2011Mestrado em Genética e Biologia Molecular .
Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.
Título: Análise do microtranscritoma em variedades de cana (Saccharum spp.) submetidas a estresse hídrico., Ano de Obtenção: 2011.
Orientador: Marcelo Menossi Teixeira.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo ,FAPESP ,Brasil .
Palavras-chave: Saccharum; miRNA; expressão gênica; cana-de-açúcar; estresse hídrico; seca.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Vegetal.
Setores de atividade: Pesquisa e desenvolvimento científico.
2003 - 2006Graduação em Ciências Biológicas .
Pontifícia Universidade Católica de Campinas, PUC Campinas, Brasil.
Título: HISTOLOGIA DA LINHA LATERAL DE Iheringichthys labrosus (PIMELODIDAE, SILURIFORMES) NO RESERVATÓRIO DE JAGUARI/SABESP, SÃO PAULO..
Orientador: Drª Luciane Kern Junqueira.

Formação complementar
2007 - 2007 Curso de Curta Duração.
Sociedade Brasileira de Ictiologia.
2003 - 2003 Curso de Curta Duração.
Pontifícia Universidade Católica de Campinas, PUC Campinas, Brasil.
2003 - 2003 Curso de Curta Duração.
Pontifícia Universidade Católica de Campinas, PUC Campinas, Brasil.

Atuação profissional
Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.
Vínculo institucional
2010 - Atual Vínculo: Bolsista DTI, Enquadramento Funcional: Bioinformata, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Vínculo institucional
2008 - 2010 Vínculo: Aluno de Mestrado, Enquadramento Funcional: nenhum, Carga horária: 40
Vínculo institucional
2007 - 2007 Vínculo: Estágio, Enquadramento Funcional: Bolsista Treinamento Técnico (FAPESP), Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações Laboratório de Genômica Funcional - DGE
Vínculo institucional
2005 - 2006 Vínculo: Estágio, Enquadramento Funcional: Estagiário, Carga horária: 20
Outras informações Departamento de Histologia e Embriologia.
Vínculo institucional
2004 - 2004 Vínculo: Estágio, Enquadramento Funcional: Estagiário, Carga horária: 0
Outras informações Laboratório de Supraestrutura Cromatínica e Biopolímeros, Departamento de Biologia Celular
Atividades
08/2010 - AtualPesquisa e desenvolvimento , Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética, .
Linhas de pesquisa
Modelagem de redes de regulação gênica
miRNAs em redes de regulação gênica
2009 - 2011Atividades de Participação em Projeto, Instituto de Biologia, Departamento de Genética e Evolução.
Projetos de pesquisa
Análise dos mecanismos de tolerância à seca em cana-de-açúcar através do uso da análise transcritômica e metabolômica
2009 - 2011Atividades de Participação em Projeto, Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética, .
Projetos de pesquisa
Desenvolvimento radicular vegetal: controles genéticos, epigenéticos e respostas ambientais
2008 - 2011Atividades de Participação em Projeto, Instituto de Biologia, Departamento de Genética e Evolução.
Projetos de pesquisa
Análise do microtranscritoma em variedades de cana (Saccharum spp.) submetidas a estresse hídrico.
2007 - 2011Atividades de Participação em Projeto, Instituto de Biologia, Departamento de Genética e Evolução.
Projetos de pesquisa
Fisiologia, biologia molecular e biotecnologia da tolerância à seca em cana-de-açúcar.
05/2007 - 10/2007Estágios , Instituto de Biologia, Departamento de Genética e Evolução.
Estágio realizado
Treinamento Técnico (FAPESP).
12/2005 - 02/2006Estágios , Instituto de Biologia, Departamento de Histologia e Embriologia.
Estágio realizado
Histologia.
1/2004 - 7/2004Atividades de Participação em Projeto, Instituto de Biologia, Departamento de Biologia Celular.
Projetos de pesquisa
Extensibilidade da cromatina e caracterização bioquímica da histona H1 de espermatozóides de Apis mellifera
Pontifícia Universidade Católica de Campinas, PUC Campinas, Brasil.
Vínculo institucional
2003 - 2006 Vínculo: Aluno, Enquadramento Funcional: Outro, Carga horária: 0
Atividades
8/2006 - 12/2006Outras atividades técnico-científicas , Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Biologia.
Atividade realizada
Monitoria em Biologia de Vertebrados.
7/2005 - 12/2006Estágios , Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Biologia.
Estágio realizado
Iniciação Científica.
7/2005 - 12/2006Atividades de Participação em Projeto, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Biologia.
Projetos de pesquisa
Histologia da Linha Lateral de Iheringichthys Labrosus (Pimelodidae, Siluriformes) no Reservatório de Jaguari/SABESP, São Paulo.
10/2005 - 05/2006Outras atividades técnico-científicas , Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Biologia.
Atividade realizada
Bolsista do Programa de Ensino Tutorial - Biologia.
8/2005 - 12/2005Outras atividades técnico-científicas , Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Ciências Morfológicas.
Atividade realizada
Monitoria em Histologia.
8/2004 - 12/2004Outras atividades técnico-científicas , Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Ciências Morfológicas.
Atividade realizada
Monitoria em Histologia.

Linhas de Pesquisa
1. Modelagem de redes de regulação gênica
2. miRNAs em redes de regulação gênica

Projetos de Pesquisa
2010 - 2012Desenvolvimento radicular vegetal: controles genéticos, epigenéticos e respostas ambientais
Descrição: Entre as condições adversas do meio ambiente que limitam o cultivo e a produtividade das culturas agrícolas, os estresses abióticos como o estresse hídrico e os estresses induzidos por alumínio e ferro em solos ácidos, assim como os estresses bióticos causados por patógenos, são considerados um dos principais fatores de restrição à agricultura brasileira, contribuindo para reducções consideráveis na produtividade agrícola. Por outro lado, plantas são capazes de estabelecer interações benéficas com microorganismos, e conseguir vantagens adaptativas importantes do ponto de vista de crescimento e tolerância a estresses. Em comum, todos estes processos atuam principalmente no sistema radicular das plantas. Nesse contexto, a arquitetura do sistema radicular é crucial para a produtividade dos cultivos e a aquisição de recursos do solo (nutrientes e água). projeto se propõe a integrar diversos grupos de pesquisa do país que vem trabalhando em linhas de pesquisa envolvendo o tema do projeto, e nas áreas de fisiologia vegetal, transcriptoma, epigenética, proteômica , bioinformática e genômica funcional, com o objetivo geral comum de estudar os controles do desenvolvimento radicular em algumas espécies de importância econômica para diferentes regiões agrícolas do país (cana-de-açúcar, café, arroz e feijão-de-corda) e obter ferramentas biotecnológicas para futuro uso na agricultura..
Situação: Em andamento; Natureza: Extensão.
Integrantes: Renato Vicentini - Integrante / Paulo Cavalcanti Gomes Ferreira - Integrante / Adriana Silva Hemerly - Coordenador / Raphael de Souza Mattos - Integrante.
Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro..
2009 - 2011Análise dos mecanismos de tolerância à seca em cana-de-açúcar através do uso da análise transcritômica e metabolômica
Descrição: O projeto visa a identificação de miRNAs e proteínas associados à resposta a seca em plantas de cana-de-açúcar cultivadas em casa de vegetação. Projeto realizado em colaboração com a UFMG..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico ( 2) .
Integrantes: Marcelo Menossi Teixeira - Coordenador / Thaís Helena Ferreira - Integrante / Marcelo Ehlers Loureiro - Integrante / Raphael de Souza Mattos - Integrante.
Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro..
2008 - 2011Análise do microtranscritoma em variedades de cana (Saccharum spp.) submetidas a estresse hídrico.
Descrição: Visa estudar os padrões de expressão de microRNAs de cana-de-açúcar na resposta ao estresse hídrico. Para tanto, o projeto uso intensivo de bioinformática e ferramentas como microarranjo de DNA e qRT-PCR..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico ( 1) .
Integrantes: Marcelo Menossi Teixeira - Coordenador / Raphael de Souza Mattos - Integrante.
Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa..
2007 - 2010Fisiologia, biologia molecular e biotecnologia da tolerância à seca em cana-de-açúcar.
Descrição: Ampla caracterização da resposta da cana-de-açúcar ao estresse hídrico em campo. As abordagens fisiológica, proteômica e genômica (transcritoma e microtranscritoma) são utilizadas de forma integrada para produzir um perfil abrangente a tolerância à seca. O projeto é conduzido por uma rede de colaboração com 6 Universidades, na qual o papel do laboratório da UNICAMP é o trabalho com bioinformatica e genética de microRNAs..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico ( 1) .
Integrantes: Marcelo Menossi Teixeira - Coordenador / Raphael de Souza Mattos - Integrante.
Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro..
2005 - 2006Histologia da Linha Lateral de Iheringichthys Labrosus (Pimelodidae, Siluriformes) no Reservatório de Jaguari/SABESP, São Paulo.
Descrição: Análise histológica do canal subcutâneo da Linha Lateral do peixe dulcícola Iheringichthys Labrosus (mandi), no Reservatório de Jaguari, pertencente ao Sitema Cantareira, da SABESP..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação ( 1) / Especialização ( 0) / Mestrado acadêmico ( 0) / Mestrado profissionalizante ( 0) / Doutorado ( 0) .
Integrantes: Luiza Ishikawa Ferreira - Integrante / Raphael de Souza Mattos - Coordenador.
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2004 - 2004Extensibilidade da cromatina e caracterização bioquímica da histona H1 de espermatozóides de Apis mellifera
Descrição: Estudo da Exetenibilidade cromatínica em espermatozóides de Apis mellifera.
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação ( 1) / Doutorado ( 1) .
Integrantes: Alberto da Silva Moraes - Integrante / Maria Luiza Silveria Mello - Integrante / José Chaud Netto - Integrante / Raphael de Souza Mattos - Coordenador.
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Áreas de atuação
1. Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Bioinformática.
2. Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Vegetal.
3. Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.
4. Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.
5. Grande área: Ciências Biológicas / Área: Morfologia / Subárea: Citologia e Biologia Celular.
6. Grande área: Ciências Biológicas / Área: Ecologia / Subárea: Ecologia de Ecossistemas.

Idiomas
Português Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Inglês Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Francês Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente, Escreve Razoavelmente.


Produção em C,T & A
Produção bibliográfica
Artigos completos publicados em periódicos
1.   MATTOS, R. S. ; MORAES, A. S. ; CHAUD NETTO, José ; MELLO, M. L. S. . Extended chromatin fibers in spermatozoa of Apis mellifera (HYMENOPTERA, APOIDEA). Brazilian Journal of Morphological Sciences, v. 23, p. 363-368, 2006.
Resumos publicados em anais de congressos
1.   MATTOS, R. S. ; FERREIRA, Luiza Ishikawa ; JUNQUEIRA, L. K. . Histologia da Linha Lateral de Iheringichthys labrosus (Pimelodidae, Siluriformes) no Reservatório de Jaguari/SABESP, São Paulo.. In: XVII Encontro Brasileiro de Ictiologia, 2007, Itajaí. Resumos do XVII Encontro Brasileiro de Ictiologia. Itajaí : EBI, 2007. v. 1. p. 53-53.
2.   MATTOS, R. S. ; MORAES, A. S. ; MELLO, M. L. S. ; CHAUD NETTO, J. . Chromatin Extensibility in Spermatozoa of the Honey Bee. In: XII Congresso da Sociedade Brasileira de Biologica Celular e IX Congresso da Sociedade Ibero-Americana de Biologia Celular, 2004, Campinas. Anais do XII Congresso da Sociedade Brasileira de Biologica Celular e IX Congresso da Sociedade Ibero-Americana de Biologia Celular. Campinas : SBBC, 2004.

Eventos
Participação em eventos
1. III Simpósio Brasileiro de Genética Molecular de Plantas.Identificatioin and Analysis of miRNAs associated to Drought Stress in Sugarcane Plants. 2011. (Simpósio).
2. 1º Encontro de Pesquisadores do Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia do Bioetanol.. 2010. (Encontro).
3. II Simpósio Brasileiro de Biologia Molecular de Plantas. 2009. (Simpósio).
4. Simpósio Brasileiro sobre Ecofisiologia, Maturação, e Maturadores em Cana-de-açúcar.. 2008. (Simpósio).
5. XVII Encontro Brasileiro de Ictiologia.Histologia de Linha Lateral de Iheringichthys labrosus (Pimelodidae, Siluriformes) no Reservatório de Jaguari/SABESP, São Paulo.. 2007. (Encontro).
6. Primeiro Encontro Estadual de Grupos PET de São Paulo.. 2006. (Encontro).
7. XII Congresso Brasileiro de Biologia Celular e IX Congresso Ibero-Americano de Biologia Celular.XII Congresso Brasileiro de Biologia Celular e IX Congresso Ibero-Americano de Biologia Celular. 2004. (Congresso).
8. XXXIII Semana de Estudos da Faculdade de Ciências Biológica. PUC-Campinas. 2004. (Outra).
9. XXXII Semana de Estudos Biológicos. PUC-Campinas. 2003. (Outra).
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