Atila Iamarino

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  • Última atualização do currículo em 28/06/2016


Biologo bacharelado (2006) e doutor em microbiologia (2012) pela Universidade de São Paulo. Pós-doutorando pela Universidade de São Paulo e pela Yale University. Atualmente é pós-doutorando da Universidade de São Paulo. Tem experiência na área de Microbiologia, com ênfase em Genética Molecular e de Microorganismos, atuando principalmente em evolução molecular. Faz comunicação de ciência no ScienceBlogs Brasil e no canal Nerdologia. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Atila Iamarino
Nome em citações bibliográficas
IAMARINO, A.;Iamarino, Atila

Endereço


Endereço Profissional
Universidade de São Paulo, Instituto de Ciências Biomédicas, Departamento de Microbiologia.
Avenida Professor Lineu Prestes, 1374 - Laboratório 215
Cidade Universitária
05508-000 - Sao Paulo, SP - Brasil
Telefone: (11) 30918453


Formação acadêmica/titulação


2006 - 2012
Doutorado em Ciências Biológicas (Microbiologia).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: Análise e Caracterização Molecular, Estrutural e Populacional de Proteases de HIV-1 do Estado de São Paulo, Ano de obtenção: 2012.
Orientador: Paolo Marinho de Andrade Zanotto.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
Palavras-chave: drug resistance; hiv; enzyme; aspartyl protease.
Grande área: Ciências Biológicas
2002 - 2006
Graduação em Ciências Biológicas Integral.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.


Pós-doutorado


2014 - 2015
Pós-Doutorado.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
Grande área: Ciências Biológicas
2013 - 2014
Pós-Doutorado.
Yale University, YALE, Estados Unidos.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
Grande área: Ciências Biológicas
2012 - 2013
Pós-Doutorado.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia / Subárea: Virologia.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.


Atuação Profissional



Yale University, YALE, Estados Unidos.
Vínculo institucional

2013 - 2014
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pós-doutorando


Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Vínculo institucional

2014 - 2015
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pós-Doutorando, Regime: Dedicação exclusiva.

Vínculo institucional

2012 - 2013
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pós-Doutorando

Vínculo institucional

2006 - 2012
Vínculo: Doutorado Direto, Enquadramento Funcional: Aluno

Atividades

03/2015 - Atual
Ensino, Ciências Biológicas (Microbiologia), Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
ICB5721-2 Organização Digital para Escrita Científica
01/2015 - 01/2015
Ensino,

Disciplinas ministradas
Curso de Difusão Cultural Internet no ensino de Ciências e Biologia
03/2013 - 04/2013
Ensino, Ciências Biológicas (Microbiologia), Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
ICB5721-1 - Organização Digital para Escrita Científica


Projetos de pesquisa


2013 - Atual
Genomic evolution of large DNA viruses of insects

Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Paolo Marinho de Andrade Zanotto em 15/05/2014.
Descrição: Large DNA viruses evolve by recombination and by a succession of gene gain and loss events, mostly from cellular host genomes. These processes allow them to undergo necessary adaptive changes. As a consequence, their genome is composed of a common replicative core that holds their evolutionary relationship, around which satellite genes that code mainly for host relationship are accreted. This work aims to compare the genomes of large DNA viruses that infect insects, entomopoxviruses, iridoviruses, ascoviruses, baculoviruses, and nudiviruses; and search for convergent events of independent parallel gene acquisition that may inform about host interaction. These genes will be compared in order to search for evolutionary relation, gene flux, origin, diversification, epistatic interactions and selective pressure after horizontal transfer. While doing so, it will be possible to infer a genomic network that reconstructs events of gene acquisition and modification that could demonstrate how organisms vary their complexity thorough time..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2012 - Atual
Evolução e filodinâmica dos recombinantes BF de HIV-1 da América do Sul

Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Paolo Marinho de Andrade Zanotto em 29/11/2012.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2006 - 2012
Análise e Caracterização Molecular, Estrutural e Populacional de Proteases de HIV-1 do Estado de São Paulo
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Doutorado: (1) .
Integrantes: Atila Iamarino - Integrante / Paolo Marinho de Andrade Zanotto - Coordenador.


Revisor de periódico


2015 - 2015
Periódico: Genetics and Molecular Biology (Impresso)
2015 - 2015
Periódico: BMC Evolutionary Biology (Online)
2015 - Atual
Periódico: PLoS Neglected Tropical Diseases (Online)
2015 - Atual
Periódico: Journal of Molecular Evolution


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.
2.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral.


Idiomas


Espanhol
Compreende Razoavelmente, Fala Pouco, Lê Bem, Escreve Pouco.
Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.


Produções



Produção bibliográfica
Artigos completos publicados em periódicos

1.
ZHAO, ZI-MING2016ZHAO, ZI-MING ; ZHAO, BIXIAO ; BAI, YALAI ; Iamarino, Atila ; GAFFNEY, STEPHEN G. ; SCHLESSINGER, JOSEPH ; LIFTON, RICHARD P. ; RIMM, DAVID L. ; TOWNSEND, JEFFREY P. . Early and multiple origins of metastatic lineages within primary tumors. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, v. 113, p. 2140-2145, 2016.

2.
FREIRE, CAIO C. M.2015 FREIRE, CAIO C. M. ; Iamarino, Atila ; SOUMARÉ ; FAYE, OUSMANE ; SALL, AMADOU ALPHA ; Zanotto, Paolo M. de A. . Reassortment and distinct evolutionary dynamics of Rift Valley Fever virus genomic segments. Scientific Reports, v. 5, p. 11353, 2015.

3.
FAYE, OUMAR2014FAYE, OUMAR ; FREIRE, CAIO C. M. ; Iamarino, Atila ; FAYE, OUSMANE ; DE OLIVEIRA, JULIANA VELASCO C. ; DIALLO, MAWLOUTH ; ZANOTTO, PAOLO M. A. ; SALL, AMADOU ALPHA . Molecular Evolution of Zika Virus during Its Emergence in the 20th Century. PLoS Neglected Tropical Diseases (Online), v. 8, p. e2636, 2014.

4.
SCARPINO, S. V.2014 SCARPINO, S. V. ; IAMARINO, A. ; WELLS, C. ; YAMIN, D. ; NDEFFO-MBAH, M. ; WENZEL, N. S. ; FOX, S. J. ; NYENSWAH, T. ; ALTICE, F. L. ; GALVANI, A. P. ; MEYERS, L. A. ; TOWNSEND, J. P. . Epidemiological and viral genomic sequence analysis of the 2014 Ebola outbreak reveals clustered transmission. Clinical Infectious Diseases, p. 000, 2014.

5.
DELATORRE, EDSON2013DELATORRE, EDSON ; Couto-Fernandez, José C. ; GUIMARÃES, MONICK LINDENMAYER ; VAZ CARDOSO, LUDIMILA PAULA ; DE ALCANTARA, KEILA CORREIA ; MARTINS DE ARAÚJO STEFANI, MARIANE ; ROMERO, HECTOR ; FREIRE, CAIO C. M. ; Iamarino, Atila ; DE A ZANOTTO, PAOLO M. ; Morgado, Mariza G. ; Bello, Gonzalo . Tracing the Origin and Northward Dissemination Dynamics of HIV-1 Subtype C in Brazil. Plos One, v. 8, p. e74072, 2013.

6.
DE CASTRO OLIVEIRA, JULIANA VELASCO2013DE CASTRO OLIVEIRA, JULIANA VELASCO ; DE BRITO, ANDERSON FERNANDES ; Braconi, Carla Torres ; DE MELO FREIRE, CAIO CÉSAR ; Iamarino, Atila ; DE ANDRADE ZANOTTO, PAOLO MARINHO . Modularity and evolutionary constraints in a baculovirus gene regulatory network. BMC Systems Biology, v. 7, p. 87, 2013.

7.
Iamarino, Atila2012 Iamarino, Atila; de Melo, Fernando Lucas ; Braconi, Carla Torres ; Zanotto, Paolo Marinho de Andrade . BF Integrase Genes of HIV-1 Circulating in São Paulo, Brazil, with a Recurrent Recombination Region. Plos One, v. 7, p. e34324, 2012.

8.
FAUSTO, SIBELE2012 FAUSTO, SIBELE ; MACHADO, FABIO A. ; BENTO, LUIZ FERNANDO J. ; Iamarino, Atila ; NAHAS, TATIANA R. ; MUNGER, DAVID S. . Research Blogging: Indexing and Registering the Change in Science 2.0. Plos One, v. 7, p. e50109, 2012.

9.
Bello, Gonzalo2012Bello, Gonzalo ; Zanotto, Paolo M. de A. ; Iamarino, Atila ; Gräf, Tiago ; Pinto, Aguinaldo R. ; Couto-Fernandez, José C. ; Morgado, Mariza G. . Phylogeographic Analysis of HIV-1 Subtype C Dissemination in Southern Brazil. Plos One, v. 7, p. e35649, 2012.

10.
Romano, Camila Malta2010Romano, Camila Malta ; de Carvalho-Mello, Isabel M. V. Guedes ; Jamal, Leda F. ; de Melo, Fernando Lucas ; Iamarino, Atila ; Motoki, Marco ; Pinho, João Renato Rebello ; Holmes, Edward C. ; Zanotto, Paolo Marinho de Andrade ; VGDN Network . Social Networks Shape the Transmission Dynamics of Hepatitis C Virus. Plos One, v. 5, p. e11170, 2010.

11.
Castro Oliveira, Juliana Velasco2008Castro Oliveira, Juliana Velasco ; Melo, Fernando Lucas ; Romano, Camila Malta ; IAMARINO, A. ; Rizzi, Thais Sampaio ; Yeda, Fernanda Peres ; Hársi, Charlotte Marianna ; Wolff, José Luiz Caldas ; Andrade Zanotto, Paolo Marinho . Structural and phylogenetic relationship of ORF 31 from the Anticarsia gemmatalis MNPV to poly (ADP-ribose) polymerases (PARP). Virus Genes, v. 37, p. 177-184, 2008.

Textos em jornais de notícias/revistas
1.
Iamarino, Atila. Aprendendo a piar. Revista Galileu.

Resumos expandidos publicados em anais de congressos
1.
Iamarino, Atila; de Melo, Fernando Lucas ; CORSINI, M. A. ; Zanotto, Paolo Marinho de Andrade . A Comparison of Methods for Predicting HIV-1 Coreceptor Usage with Sequences for Brazilian Samples. In: XVII Encontro Nacional de Virologia, 2006, Campos de Jordão, SP. Virus Reviews & Research. São Paulo: Brazilian Society for Virology, 2006. v. 11. p. 184-184.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
Sibele Fausto ; BENTO, L. F. J. ; Iamarino, Atila ; NAHAS, T. R. . Peer-reviewed science from blogs: an option to the Brazilian growing interest in science?. In: 13th Conference of the International Society for Scientometrics and Informetrics, 2011, Durban. Proceedings of the 13th Conference of the International Society for Scientometrics and Informetrics. Durban: Leiden University, 2011. v. 2. p. 975-977.

Apresentações de Trabalho
1.
Iamarino, Atila. Divulgação Científica e Novas Mídias. 2012. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

2.
Iamarino, Atila. Filogenia e Evolução. 2012. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

3.
Iamarino, Atila. Filogenia e Evolução.. 2011. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

4.
Iamarino, Atila. Antivirais podem evitar grandes epidemias?. 2010. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

5.
Iamarino, Atila. Filogenia e Evolução.. 2010. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

6.
Iamarino, Atila; CORSINI, M. A. ; ZANOTTO, P. M. A. . Detection of recurrent series of allelic substitutions under selection: IOP. 2008. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

7.
IAMARINO, A.. Interação parasita e hospedeiro: quando o parasita assume o controle. 2007. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

8.
IAMARINO, A.. State of Art: Antiretroviral drug resistance. 2006. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

9.
IAMARINO, A.; CORSINI, M. A. ; MELO, F. L. ; ZANOTTO, P. M. A. . A comparison on Methods of Predicting HIV-1 Coreceptor Usage with Sequences for Brazilian Samples. 2006. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

10.
IAMARINO, A.; TERRA, W. R. ; GENTA, F.A. ; FERREIRA, C. . Purification and Partial Characterization of Two Salivary Amylases from Periplaneta americana Midguts. 2004. (Apresentação de Trabalho/Congresso).


Produção técnica
Redes sociais, websites e blogs
1.
Iamarino, Atila. Nerdologia. 2013; Tema: Divulgação científica e cultura pop. (Rede social).

2.
Iamarino, Atila; NAHAS, T. R. ; Luiz Bento . Research Blogging. 2010; Tema: Agregador de Posts sobre publicações científicas. (Site).

3.
Iamarino, Atila. ScienceBlogs Brasil. 2008; Tema: DIvulgação Científica. (Site).

4.
Iamarino, Atila. Rainha Vermelha. 2007; Tema: Biologia, Evolução. (Blog).


Demais tipos de produção técnica
1.
Iamarino, Atila; de Melo, Fernando Lucas . Métodos de análise em evolução viral: Teoria e Prática. 2010. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

2.
Iamarino, Atila; BIREME/OPAS/OMS . Influenza A (H1N1). 2009. (Desenvolvimento de material didático ou instrucional - Infográficos).



Bancas



Participação em bancas de trabalhos de conclusão
Mestrado
1.
Iamarino, Atila. Participação em banca de Viviam Milanez Massolini. Avaliação de polimorfismos genéticos na progressão da infecção de pacientes monoinfectados e coinfectados com os Vírus da Imunodeficiência Humana (HIV) e Vírus da Hepatite C (VHC). 2015. Dissertação (Mestrado em Fisiopatologia em Clínica Médica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.




Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
EuroScience Open Forum 2014. The future of science communication. 2014. (Feira).

2.
Divulgação Científica para além dos Muros da Universidade.Divulgação Científica para além dos Muros da Universidade. 2011. (Encontro).

3.
27ª Semana da Química - Origens.Antivirais podem evitar grandes epidemias?. 2010. (Outra).

4.
Curso de Verão.Filogenia e Evolução.. 2010. (Oficina).

5.
II Encontro de Weblogs Científicos em Língua Portuguesa - II EWCLiPo..ScienceBlogs Brasil. 2009. (Encontro).

6.
54º Congresso Brasileiro de Genética. Detection of recurrent series of allelic substitutions under selection: IOP. 2008. (Congresso).

7.
I Encontro de Weblogs Científicos em Língua Portuguesa - I EWCLiPo..Blogs de Ciência. 2008. (Encontro).

8.
XII Semana da Bio.XII Semana da Bio. 2008. (Encontro).

9.
XVII Encontro Nacional de Virologia.A Comparison of Methods for Predicting HIV-1 Coreceptor Usage with Sequences for Brazilian Samples. 2006. (Encontro).



Educação e Popularização de C & T



Apresentações de Trabalho
1.
Iamarino, Atila. Divulgação Científica e Novas Mídias. 2012. (Apresentação de Trabalho/Seminário).


Redes sociais, websites e blogs
1.
Iamarino, Atila. Rainha Vermelha. 2007; Tema: Biologia, Evolução. (Blog).

2.
Iamarino, Atila. ScienceBlogs Brasil. 2008; Tema: DIvulgação Científica. (Site).

3.
Iamarino, Atila. Nerdologia. 2013; Tema: Divulgação científica e cultura pop. (Rede social).




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