Rodrigo Villares Portugal

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  • Última atualização do currículo em 03/01/2019


Bacharel e mestre em Física Computacional com doutorado em Física Biomolecular pelo Instituto de Física de São Carlos-USP, tendo um estágio de doutorado feito no Imperial College London (Inglaterra). Pós-doutoramento em crio microscopia eletrônica aplicada a biologia estrutural (Crio Microscopia Eletrônica de Partículas Isoladas - Single Particle Cryo-EM) no Imperial College London entre 2006 e 2008, com um estágio em desenvolvimento de software para Análise de Partículas Isoladas na empresa Image Science (Alemanha). Em 2010, foi contratado como pesquisador pelo Laboratório Nacional de Luz Sincrotron (LNLS/CNPEM) para implantar a linha de pesquisa em Crio-Microscopia Eletrônica e Análise de Partículas Isoladas. Atualmente é pesquisador do Laboratório Nacional de Nanotecnologia (LNNano/CNPEM) atuando nessa mesma área de pesquisa. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Rodrigo Villares Portugal
Nome em citações bibliográficas
PORTUGAL, R. V.;Portugal, Rodrigo V.;Portugal, Rodrigo Villares;VILLARES PORTUGAL, RODRIGO;Rodrigo Vilares Portugal;Portugal, Rodrigo Vilares

Endereço


Endereço Profissional
Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Laboratório Nacional de Nanotecnologia.
Rua Giuseppe Máximo Scolfaro, 10.000
Pólo II de Alta Tecnologia
13083970 - Campinas, SP - Brasil - Caixa-postal: 6192
Telefone: (19) 35183121
URL da Homepage: lnnano.cnpem.br


Formação acadêmica/titulação


2001 - 2006
Doutorado em Física.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: Estudos de complexos macromoleculares por crio-microscopia eletrônica e tecnicas biofísicas, Ano de obtenção: 2006.
Orientador: Igor Polikarpov.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
Palavras-chave: Crio-microscopia eletrônica; Fluorescência; Receptores Nucleares; Termodinâmica de proteínas.
Grande área: Ciências Biológicas
Setores de atividade: Produtos e Processos Biotecnológicos.
1993 - 1998
Mestrado em Física.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: Interface gráfica para um sistema de imagens por Ressonância Magnética,Ano de Obtenção: 1998.
Orientador: Horacio Carlos Panepucci.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
Palavras-chave: Interface com o usuário; Ressonância Magnética.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Física Geral / Especialidade: Instrumentação Específica de Uso Geral em Física.
Setores de atividade: Desenvolvimento de Produtos Tecnológicos Voltados Para A Saúde Humana; Desenvolvimento de Programas (Software).
1989 - 1993
Graduação em Bacharelado em Física.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Orientador: Jose Pedro Donoso Gonzales.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.


Pós-doutorado


2006 - 2008
Pós-Doutorado.
Imperial College of Science, Technology and Medicine, ICSTM, Inglaterra.
Bolsista do(a): Cyttron Consortium, CYTTRON, Holanda.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Química de Macromoléculas / Especialidade: Proteínas.


Atuação Profissional



Universidade Nova de Lisboa, UNL, Portugal.
Vínculo institucional

2019 - Atual
Vínculo: , Enquadramento Funcional:


Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, CNPEM, Brasil.
Vínculo institucional

2010 - Atual
Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Pesquisador, Carga horária: 40

Atividades

06/2016 - Atual
Conselhos, Comissões e Consultoria, Laboratório Nacional de Nanotecnologia, .

Cargo ou função
Membro Titular do Comitê de Tecnologia de Informação e Comunicação (CTIC) do CNPEM.
08/2011 - Atual
Pesquisa e desenvolvimento , Laboratório Nacional de Nanotecnologia, .

08/2013 - 08/2017
Conselhos, Comissões e Consultoria, Laboratório Nacional de Nanotecnologia, .

Cargo ou função
Membro do Conselho de Administração do CNPEM.
10/2015 - 06/2016
Conselhos, Comissões e Consultoria, Laboratório Nacional de Nanotecnologia, .

Cargo ou função
Membro efetivo do Grupo Trabalho de Estruturação Comitê de TIC do CNPEM.
02/2013 - 09/2013
Conselhos, Comissões e Consultoria, Laboratório Nacional de Nanotecnologia, .

Cargo ou função
Representante do LNNano no Grupo de Trabalho de Programação e Avaliação do Planejamento Estratégico do CNPEM.
04/2012 - 08/2013
Conselhos, Comissões e Consultoria, Laboratório Nacional de Nanotecnologia, .

Cargo ou função
Representante do LNNano no Grupo Executivo do Planejamento Estratégico do CNPEM.
05/2012 - 12/2012
Conselhos, Comissões e Consultoria, Laboratório Nacional de Nanotecnologia, .

Cargo ou função
Representante do LNNano no Grupo de Trabalho de Programação e Orçamentação do Planejamento Estratégico do CNPEM.
02/2012 - 07/2012
Conselhos, Comissões e Consultoria, Laboratório Nacional de Nanotecnologia, .

Cargo ou função
Membro do Grupo de Trabalho "Portal de Serviços - Usuário Externo" do CNPEM.
07/2011 - 06/2012
Conselhos, Comissões e Consultoria, Laboratório Nacional de Nanotecnologia, .

Cargo ou função
Membro do Comitê de TI do CNPEM.
07/2010 - 07/2011
Pesquisa e desenvolvimento , Laboratório Nacional Luz Síncrotron, .


Instituto de Física de São Carlos, IFSC/USP, Brasil.
Vínculo institucional

1998 - 2001
Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Bolsista, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações
Desenvolvimento e manutenção de software para o sistema de imagens por ressonância magnética, ToRM 05, desenvolvido e implantado na Santa Casa de Misericórdia de São Carlos pelo Grupo de Ressonância Magnético do IFSC-USP.



Linhas de pesquisa


1.
Classificação de heterogeneidade conformacional em dados de crio-microscopia eletrônica

Objetivo: Desenvolvimento de métodos para classificação conformacional de complexos macromoleculares em dados de crio-microscopia eletrônica..
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Sistemas de Computação / Especialidade: Software Básico.
Palavras-chave: Análise de Partículas Isoladas; Crio-microscopia eletrônica.
2.
Estudos estruturais de hemocianinas

Objetivo: Estudos estruturais de hemocianinas para investigação das bases estruturais da cooperatividade..
Grande área: Ciências Biológicas
Palavras-chave: Hemocianina; Crio-microscopia eletrônica; Análise de Partículas Isoladas.
3.
Visualização de dados hiperdimensionais

Objetivo: Desenvolvimento de software para visualização de dados hiperdimensionais obtidos por análise estatística multivariada em dados de crio-microscopia eletrônica de partículas isoladas..
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Sistemas de Computação / Especialidade: Software Básico.
Palavras-chave: Análise de Partículas Isoladas; Crio-microscopia eletrônica; Visualização de Dados.
4.
Crio microscopia eletrônica de partículas isoladas

Objetivo: Estudos estruturais de complexos macromoleculares..
Grande área: Ciências Biológicas
Palavras-chave: Análise de Partículas Isoladas; Crio-microscopia eletrônica; Biologia Molecular Estrutural.


Projetos de pesquisa


2019 - Atual
Um Mundo ? uma Saúde: abordagens integrativas em Biologia Estrutural e crio-Microscopia
Descrição: Esta rede temática integra 11 grupos provenientes de vários países (Brasil, Venezuela, Argentina, Uruguai, Costa Rica, Portugal e Espanha) que utilizam como ferramenta principal a biologia estrutural integrativa para desenvolverem investigação na área da Saúde. A Biologia Estrutural, através da Cristalografia aliada à Ressonância Magnética Nuclear e Criomicroscopia Eletrônica, revela a estrutura tridimensional das macromoléculas biológicas e a sua organização a nível atômico, possibilitando a compreensão do seu funcionamento, mecanismo de ação e interação com outros parceiros/ligantes..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2017 - Atual
EMU: Aquisição de microscópio eletrônico de transmissão para criomicroscopia eletrônica de partículas isoladas - estabelecimento de uma instalação aberta de criomicroscopia eletrônica no CNPEM
Descrição: O Microscópio Eletrônico de Transmissão (MET), desde a sua invenção na década de 1930, vem desempenhando um papel fundamental na visualização dos processos da vida. Muitas técnicas de preparação de espécimes foram desenvolvidas para visualizar amostras biológicas, incluindo Microscopia Eletrônica Criogênica ou Criomicroscopia Eletrônica ("crio-ME"), que é tipicamente utilizada para elucidar a estrutura de complexos macromoleculares imersos em gelo vítreo. O congelamento rápido de amostras biológicas hidratadas preserva-as em estado próximo ao nativo em "gelo vítreo", protegendo a amostra contra o dano estrutural causado pela recristalização do meio e também contra o dano de radiação ocasionado pelo feixe de elétrons. O objetivo deste projeto é instalar um microscópio eletrônico criogênico de 300kV de alto desempenho no Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais (CNPEM) - Centro Brasileiro de Pesquisa em Energia e Materiais -, criando uma instalação avançada de crio-ME para servir o Brasil e toda a América Latina. A instalação oferecerá a infraestrutura e experiência necessárias em: microscopia eletrônica para biologia estrutural; caracterização de amostras imersas em gelo vítreo; e tomografia de elétrons. O CNPEM é uma organização sem fins lucrativos ligada ao Ministério da Ciência e Tecnologia, composta por quatro laboratórios nacionais dedicados à pesquisa e manutenção de instalações de acesso aberto em: biociências; bioetanol; nanotecnologia; bem como um sincrotron. A instalação de microscopia eletrônica está em operação há 17 anos, apoiando centenas de projetos de pesquisa e treinando com sucesso uma geração inteira de microscopistas eletrônicos. O microscópio eletrônico solicitado neste projeto incorporará vários desenvolvimentos tecnológicos de ponta, destinados a aumentar a qualidade e a taxa de aquisição dos dados. Isso inclui: porta-amostras integrados estáveis; coleta automática de dados 24/7; filtros de energia; "phase-plates" e modernos detectores direto de elétrons. O CNPEM tem uma história de colaboração em microscopia eletrônica com grupos de pesquisa do Brasil - muitos deles do Estado de São Paulo - e de outros países da América Latina. Este ambiente colaborativo constitui a base para estabelecer uma instalação de crio-ME que abrigará o novo microscópio. A operação de uma instalação de crio-ME de classe mundial terá um impacto significativo na pesquisa em biologia estrutural do Estado de São Paulo. Os casos científicos apresentados em apoio a este projeto variam de grandes complexos a pequenas proteínas, incluindo proteínas de membrana. A participação ativa da comunidade científica para tornar bem-sucedida esta instalação de crio-ME mostra que esta é uma iniciativa oportuna e que o Brasil e a América Latina devem participar da "revolução de resolução" da crio-ME que a Biologia Estrutural vem atualmente experimentando..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2017 - Atual
Estrutura e função de sistemas de secreção bacterianas
Descrição: Bactérias possuem complexos multiproteicos grandes (multi-mega Dalton) que transportam proteínas efetoras através de membranas bacterianas para o meio extracelular ou diretamente dentro de outras células. Esses sistemas também medeiam a transferência horizontal de material genético (conjugação) entre células bacterianas e formas homólogas especializadas desses sistemas evoluíram para pili e flagelos bacterianos. Portanto, os sistemas de secreção macromolecular são determinantes importantes para a adaptação bacteriana, competição e sobrevivência em diversos nichos ambientais. No decurso do projeto temático anterior, demonstramos a importância do pili tipo IV (T4P) na motilidade twitching e na formação de biofilmes em Xanthomonas citri e caracterizamos os principais reguladores da biogênese do T4P. Também mostramos que o sistema de secreção de Xanthomonas citri tipo IV (T4SS) fornece a essas células a capacidade de matar outras espécies bacterianas Gram-negativas de maneira dependente do contato. Esta foi a primeira demonstração do envolvimento de um T4SS em matança bacteriana e aponta para esta classe especial de T4SS como um determinante importante para a sobrevivência de Xanthomonas durante encontros competitivos com outras espécies bacterianas no meio ambiente. Neste projeto, propomos seguir várias linhas de pesquisa sobre a estrutura molecular, função molecular e relevância fisiológica dessas nano-máquinas complexas em Xanthomonas citri, bem como em outros membros da família Xanthomonadaceae. Especificamente, seguiremos duas linhas gerais de investigação. Projeto 1: estudos sobre os sistemas de secreção do tipo IV de Xanthomonadaceae. Nós planejamos i) determinar a estrutura dos componentes individuais do T4SS de X. citri, bem como os sub-complexos principais e o complexo inteiro; ii) realizar estudos estruturais e enzimológicos sobre as toxinas segregadas por este sistema, bem como seus inibidores cognatos; iii) estudar a base molecular do reconhecimento de toxinas pelo aparelho do T4SS; iv) estudar a localização celular e a regulação da expressão do T4SS, e v) ampliam nossos estudos do sistema X. citri aos T4SS homólogos encontrados em outras espécies bacterianas, incluindo Stenotrophomonas, Lysobacter e em algumas espécies das ordens de Betaproteobactérias Burkholderiales e Neisseriales. Projeto 2: estudos sobre o pilus tipo IV (T4P) em Xanthomonas citri. Planejamos investigar i) como a atividade ATPase de PilB é regulada pelos componentes PilZ, FimX e c-diGMP e outros componentes da membrana interna (plataforma); ii) as estruturas dos complexos PilB-PilZ e PilB-PilZ-FimX; iii) os papéis das pilinas menores conservadas nas espécies Xanthomonadaceae; iv) o papel da PilU, a terceira e mal compreendida ATPase; v) como os sinais ambientais específicos controlam as funções dependentes de T4P nas espécies Xanthomonas; vi) como o T4P contribui para a competitividade de Xanthomonas em interações antagônicas com outras espécies bacterianas, e vii) a estrutura do pilus extracelular (polímero das subunidades PilA). Nestes estudos empregaremos métodos de Biologia Estrutural (cristalografia, ressonância magnética nuclear, criomicroscopia eletrônica, SAXS, simulações moleculares) a produção e caracterização de nocautes gênicos, microscopia de fluorescência, enzimologia, estudos de expressão gênica e bioinformática. O projeto inclui o treinamento de estudantes de graduação, pós-graduação, pós-doutores e colaborações com pesquisadores de outras instituições brasileiros e estrangeiros..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2015 - Atual
Septinas: estudos comparativos visando correlacionar estrutura e função
Descrição: A presente proposta foca aspectos estruturais e funcionais da família das septinas utilizando uma abordagem integrada composta por uma série de técnicas biofísicas e celulares. Embora descritos pela primeira vez em levedura a cerca de 40 anos atrás, onde são essenciais para completar o ciclo celular, septinas ainda são consideradas um componente do citoesqueleto neglegenciado em termos da sua bioquímica e fisiologia. Por exemplo, sabe-se pouco ainda sobre os fatores que controlam a formação de um heterofilamento de septinas e como isto está relacionado com a ligação e hidrólise de GTP e a associação com membranas celulares. Além disto, das dezenas de hetero-filamentos de septinas teoricamente possíveis, apenas uma única estrutura cristalográfica foi reportada até os dias de hoje e, mesmo assim, a baixa resolução. Sabe-se menos ainda sobre o papel de septinas em organismos inferiores. A presente proposta de pesquisa está divida em três sub-projetos que abordam respectivamente aspectos da estrutura, função e relação evolucionária de septinas de diferentes organismos, incluindo o homem, um helminto, um cefalocordado e uma alga. Em termos estruturais procuraremos visualizar diretamente filamentos e protofilamentos usando microscopia eletrônica e resolver estruturas cristalográficas por difração de raios-X e RMN de septinas individuais e seus heterocomplexos, além dos seus domínios isolados na presença de ligantes, tais como GTP, GDP e Mg2+. Os resultados serão complementados por estudos funcionais visando identificar por exemplo, parceiros das septinas em algas verdes e os mecanismos de parálise de Schistosoma mansoni induzido pela inibição de septinas in vivo..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2012 - 2015
CRYO-EM: visualizing biological macromolecules in different conformational states
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (2) .
Integrantes: Rodrigo Villares Portugal - Integrante / Marin van Heel - Integrante / Sandra Marta Gomes Dias - Integrante / Otávio Henrique Thiemann - Integrante / Jefferson Bettini - Integrante / Alexandre Cassago - Integrante / André L B Ambrósio - Integrante / Fernando Galembeck - Coordenador / Pedro Ismael da Silva Jr - Integrante.Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Cooperação.
Número de produções C, T & A: 1 / Número de orientações: 1


Projetos de extensão


2016 - 2016
The 7th Brazil School for Single Particle Cryo-EM
Situação: Concluído; Natureza: Extensão.
2014 - 2014
The 6th Brazil School for Single Particle Cryo-EM
Situação: Concluído; Natureza: Extensão.
Alunos envolvidos: Doutorado: (31) .
Integrantes: Rodrigo Villares Portugal - Coordenador / Marin van Heel - Integrante / Michael Schatz - Integrante / Nikolaus Grigorieff - Integrante / Carlos Alberto Goncalves Silva Jared - Integrante.Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.


Revisor de projeto de fomento


2013 - Atual
Agência de fomento: Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.
2.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Química de Macromoléculas/Especialidade: Proteínas.
3.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Sistemas de Computação/Especialidade: Software Básico.


Idiomas


Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Espanhol
Compreende RazoavelmenteLê Razoavelmente.


Prêmios e títulos


2015
SBBq Award - Best poster, 44th SBBq and 23rd IUBMB, SBBq - IUBMB.
2014
Poster Award - Biological aplications, Microscopy Society of America (MSA) and the Microanalysis Society (MAS).
2013
Melhor Trabalho na área de Células e Tecidos Biológicos, Sociedade Brasileira de Microscopia e Microanálise.
2012
Menção Honrosa em trabalho na II Jornada de Nanotecnologia da UFRJ, UFRJ.


Produções



Produção bibliográfica
Artigos completos publicados em periódicos

1.
E', ISMAIL2018E', ISMAIL ; OK, MERYEM TYRRASCH ; PUENTES-MARTINEZ, XIMENA E. ; DE TOLEDO, MARCELO AUGUSTO SZYMANSKI ; DE PINHO FAVARO, MARIANNA TEIXEIRA ; CAVALCANTI, LEIDE PASSOS ; CASSAGO, ALEXANDRE ; Portugal, Rodrigo Villares ; AZZONI, ADRIANO RODRIGUES ; DE LA TORRE, LUCIMARA GAZIOLA . Evaluation of siRNA and cationic liposomes complexes as a model for in vitro siRNA delivery to cancer cells. COLLOIDS AND SURFACES A-PHYSICOCHEMICAL AND ENGINEERING ASPECTS, v. 555, p. 280-289, 2018.

2.
BECHER, TIAGO B.2018BECHER, TIAGO B. ; MENDONÇA, MONIQUE C. P. ; DE FARIAS, MARCELO A. ; Portugal, Rodrigo V. ; DE JESUS, MARCELO B. ; ORNELAS, CATIA . Soft Nanohydrogels Based on Laponite Nanodiscs: A Versatile Drug Delivery Platform for Theranostics and Drug Cocktails. ACS Applied Materials & Interfaces, v. 10, p. 21891-21900, 2018.

3.
WOOD, IRENE2018WOOD, IRENE ; ALBANO, JUAN M. R. ; FILHO, PEDRO L. O. ; COUTO, VERONICA MUNIZ ; DE FARIAS, MARCELO A. ; Portugal, Rodrigo V. ; DE PAULA, ENEIDA ; OLIVEIRA, CRISTIANO L. P. ; PICKHOLZ, MONICA . A sumatriptan coarse-grained model to explore different environments: interplay with experimental techniques. EUROPEAN BIOPHYSICS JOURNAL WITH BIOPHYSICS LETTERS, v. 47, p. 561-571, 2018.

4.
KARPEL, RICHARD L.2018KARPEL, RICHARD L. ; DA SILVA LIBERATO, MICHELLE ; CAMPEIRO, JOANA D. ; BERGEON, LORNA ; SZYCHOWSKI, BRIAN ; BUTLER, ANDREW ; MARINO, GIOVANNI ; CUSIC, JOELLE F. ; DE OLIVEIRA, LILIAN CAROLINE GONÇALVES ; OLIVEIRA, EDUARDO B. ; de Farias, M. A. ; PORTUGAL, R. V. ; ALVES, WENDEL ANDRADE ; DANIEL, MARIE-CHRISTINE ; HAYASHI, MIRIAN A.F. . Design and characterization of crotamine-functionalized gold nanoparticles. COLLOIDS AND SURFACES B-BIOINTERFACES, v. 163, p. 1-8, 2018.

5.
DONIDA, BRUNA2018DONIDA, BRUNA ; TAUFFNER, BÁRBARA ; RAABE, MARCO ; IMMICH, MAIRA F. ; DE FARIAS, MARCELO A. ; DE SÁ COUTINHO, DIEGO ; ZAFFARI MACHADO, ANDRYELE ; GUS KESSLER, REJANE ; Portugal, Rodrigo V. ; BERNARDI, ANDRESSA ; FROZZA, RUDIMAR ; MOURA, DINARA J. ; POLETTO, FERNANDA ; REGLA VARGAS, CARMEN . Monoolein-based nanoparticles for drug delivery to the central nervous system: A platform for Lysosomal Storage Disorder treatment. EUROPEAN JOURNAL OF PHARMACEUTICS AND BIOPHARMACEUTICS, v. 133, p. 96-103, 2018.

6.
LOIOLA, LÍVIA M. D.2018LOIOLA, LÍVIA M. D. ; DE FARIAS, MARCELO A. ; Portugal, Rodrigo V. ; FELISBERTI, MARIA I. . Amphiphilic polylactide-poly(ethylene oxide)-poly(propylene oxide) block copolymers: Self-assembly behavior and cell affinity. JOURNAL OF POLYMER SCIENCE PART A-POLYMER CHEMISTRY, v. 56, p. 2203-2213, 2018.

7.
SGRO, GERMÁN G.2018SGRO, GERMÁN G. ; COSTA, TIAGO R. D. ; CENENS, WILLIAM ; SOUZA, DIORGE P. ; CASSAGO, ALEXANDRE ; COUTINHO DE OLIVEIRA, LUCIANA ; SALINAS, ROBERTO K. ; Portugal, Rodrigo V. ; FARAH, CHUCK S. ; WAKSMAN, GABRIEL . Cryo-EM structure of the bacteria-killing type IV secretion system core complex from Xanthomonas citri. Nature Microbiology, v. 3, p. 1429-1440, 2018.

8.
CAIMI, AYELEN TATIANA2018CAIMI, AYELEN TATIANA ; ALTUBE, MARIA JULIA ; DE FARIAS, MARCELO ALEXANDRE ; Portugal, Rodrigo Villares ; PEREZ, ANA PAULA ; ROMERO, EDER LILIA ; MORILLA, MARIA JOSE . Novel imiquimod nanovesicles for topical vaccination. COLLOIDS AND SURFACES B-BIOINTERFACES, v. 174, p. 536-543, 2018.

9.
PARRA, FEDERICO LEONEL2018PARRA, FEDERICO LEONEL ; CAIMI, AYELEN TATIANA ; ALTUBE, MARIA JULIA ; CARGNELUTTI, DIEGO ESTEBAN ; VERMEULEN, MÓNICA ELBA ; DE FARIAS, MARCELO ALEXANDRE ; Portugal, Rodrigo Villares ; MORILLA, MARIA JOSE ; ROMERO, EDER LILIA . Make It Simple: (SR-A1+TLR7) Macrophage Targeted NANOarchaeosomes. FRONTIERS IN BIOENGINEERING AND BIOTECHNOLOGY, v. 6, p. 163, 2018.

10.
PASCOAL, CAMILA CRISTINA2017PASCOAL, CAMILA CRISTINA ; ISLAM, ZEYAUL ; ADAMOSKI, DOUGLAS ; FERREIRA, IGOR MONTEZE ; RIGHETTO, RICARDO DIOGO ; BETTINI, JEFFERSON ; Portugal, Rodrigo Villares ; YUE, WYATT W. ; GONZALEZ, ANA ; DIAS, SANDRA MARTHA GOMES ; AMBROSIO, ANDRE LUIS BERTELI . The origin and evolution of human glutaminases and their atypical C-terminal ankyrin repeats. JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, v. 292, p. jbc.M117.787291, 2017.

11.
HIGA, LETICIA HERMINIA2017HIGA, LETICIA HERMINIA ; JEREZ, HORACIO EMANUEL ; DE FARIAS, MARCELO ALEXANDRE ; Portugal, Rodrigo Villares ; ROMERO, EDER LILIA ; MORILLA, MARIA JOSE . Ultra-small solid archaeolipid nanoparticles for active targeting to macrophages of the inflamed mucosa. Nanomedicine, v. 12, p. 1165-1175, 2017.

12.
CAIMI, AYELEN TATIANA2017CAIMI, AYELEN TATIANA ; PARRA, FEDERICO ; DE FARIAS, MARCELO ALEXANDRE ; Portugal, Rodrigo Villares ; PEREZ, ANA PAULA ; ROMERO, EDER LILIA ; MORILLA, MARIA JOSE . Topical vaccination with super-stable ready to use nanovesicles. COLLOIDS AND SURFACES B-BIOINTERFACES, v. 152, p. 114-123, 2017.

13.
AFANASYEV, P.2017 AFANASYEV, P. ; LINNEMAYR, C. ; RAVELLI, R. ; MATADEEN, R. ; DE CARLO, S. ; ALEWIJNSE, B. ; Rodrigo Vilares Portugal ; PANNU, N. S. ; SCHATZ, M. ; van HEEL, M. . Single-particle cryo-EM using alignment by classification (ABC): the structure of haemoglobin. IUCrJ, v. 4, p. 678-694, 2017.

14.
FRANQUI, LIDIANE SILVA2017FRANQUI, LIDIANE SILVA ; BORGES, ANTÔNIO CARLOS ; FARIAS, MARCELO ALEXANDRE DE ; Portugal, Rodrigo Villares ; LEME, ADRIANA FRANCO PAES ; COLUCI, VITOR RAFAEL ; MARTINEZ, DIEGO STEFANI TEODORO . Studying the fetal bovine serum protein corona associated with single and multilayer graphene oxide nanomaterials. TOXICOLOGY LETTERS, v. 280, p. S181, 2017.

15.
ALTUBE, M. J.2016ALTUBE, M. J. ; SELZER, S. ; DE FARIAS, M. A. ; PORTUGAL, R. V. ; MORILLA, M. J. ; ROMERO, E. L. . Surviving nebulization-induced stress: dexamethasone in pH-sensitive archaeosomes. Nanomedicine, v. 11, p. 2103-2117, 2016.

16.
HEEL, MARIN VAN2016 HEEL, MARIN VAN ; Portugal, Rodrigo V. ; SCHATZ, MICHAEL . Multivariate Statistical Analysis of Large Datasets: Single Particle Electron Microscopy. OPEN JOURNAL OF STATISTICS, v. 06, p. 701-739, 2016.

17.
GASPERINI, ANTONIO AUGUSTO MALFATTI2015GASPERINI, ANTONIO AUGUSTO MALFATTI ; MARTINEZ, XIMENA ELIZABETH PUENTES ; BALBINO, TIAGO ALBERTINI ; RIGOLETTO, THAIS DE PAULA ; CORRÊA, GABRIELA DE SÁ CAVALCANTI ; CASSAGO, ALEXANDRE ; Portugal, Rodrigo Villares ; DE LA TORRE, LUCIMARA GAZIOLA ; CAVALCANTI, LEIDE P. . Association between cationic liposomes and low molecular weight hyaluronic acid. Langmuir, v. 31, p. 3308-3317, 2015.

18.
AFANASYEV, P.2015 AFANASYEV, P. ; RAVELLI, R. ; MATADEEN, R. ; DE CARLO, S. ; DUINEN, G. V. ; ALLEWIJNSE, B. ; PETERS, P. ; ABRAHAMS, J. ; PORTUGAL, R. V. ; SCHATZ, M. ; VAN HEEL, MARIN . A posteriori correction of camera characteristics from large image data sets. Scientific Reports, v. 5, p. 10317, 2015.

19.
DOMINGUES, MARIANE NORONHA2015DOMINGUES, MARIANE NORONHA ; SFORÇA, MAURICIO LUIS ; SOPRANO, ADRIANA SANTOS ; LEE, JACK ; DE SOUZA, TATIANA DE ARRUDA CAMPOS BRASIL ; CASSAGO, ALEXANDRE ; Portugal, Rodrigo Villares ; DE MATTOS ZERI, ANA CAROLINA ; MURAKAMI, MARIO TYAGO ; SADANANDOM, ARI ; DE OLIVEIRA, PAULO SERGIO LOPES ; BENEDETTI, CELSO EDUARDO . Structure and mechanism of dimer-monomer transition of a plant poly(A)-binding protein upon RNA interaction: insights into its poly(A) tail assembly. Journal of Molecular Biology, p. 2491-2506, 2015.

20.
DE SOUZA, MARCOS MICHEL2014DE SOUZA, MARCOS MICHEL ; MANZINE, L. R. ; SILVA, M. V. G. ; BETTINI, J. ; PORTUGAL, R. V. ; CRUZ, A. K. ; ARRUDA, E. ; THIEMANN, O. H. . An improved purification procedure for Leishmania RNA virus (LRV). Brazilian Journal of Microbiology (Impresso), v. 45, p. 695-698, 2014.

21.
SERRÃO, VITOR HUGO BALASCO2014SERRÃO, VITOR HUGO BALASCO ; REGINA MANZINE, LÍVIA ; E SILVA, IVAN ROSA ; CASSAGO, ALEXANDRE ; BETTINI, JEFFERSON ; VILLARES PORTUGAL, RODRIGO ; VAN HEEL, MARIN ; HENRIQUE THIEMANN, OTAVIO . Investigation of Escherichia coli Selenocysteine Synthase (SelA) Complex Formation Using Cryo-Electron Microscopy (Cryo-EM). Microscopy and Microanalysis (Print), v. 20, p. 1282-1283, 2014.

22.
MANZINE, LIVIA REGINA2013MANZINE, LIVIA REGINA ; SERRÃO, VITOR HUGO BALASCO ; LIMA, LUIS MAURÍCIO TRAMBAIOLI DA ROCHA E ; DE SOUZA, MARCOS MICHEL ; BETTINI, JEFFERSON ; Portugal, Rodrigo Villares ; VAN HEEL, MARIN ; THIEMANN, OTAVIO HENRIQUE . Assembly stoichiometry of bacterial selenocysteine synthase and SelC (tRNAsec). FEBS LETTERS, v. 587, p. 906-911, 2013.

23.
BLASIOS, V.2013BLASIOS, V. ; BISSON-FILHO, A. W. ; CASTELLEN, P. ; NOGUEIRA, M. L. C. ; BETTINI, J. ; PORTUGAL, R. V. ; ZERI, A. C. M. ; GUEIROS-FILHO, F. J. . Genetic and Biochemical Characterization of the MinC-FtsZ Interaction in Bacillus subtilis. Plos One, v. 8, p. e60690, 2013.

24.
BARSOTTINI, M. R. O.2013BARSOTTINI, M. R. O. ; OLIVEIRA, J. F. ; ADAMOSKI, D. ; TEIXEIRA, P. J. P. L. ; PRADO, P. F. V. ; TIEZZI, H. O. ; SFORCA, M. L. ; CASSAGO, A. ; PORTUGAL, R. V. ; OLIVEIRA, P. S. L. ; ZERI, A. C. M. ; DIAS, S. M. G. ; PEREIRA, G. A. G. ; AMBROSIO, A. L. B. . Functional diversification of cerato-platanins in Moniliophthora perniciosa as seen by differential expression and protein function specialization. Molecular Plant-Microbe Interactions, v. 26, p. 1281-1293, 2013.

25.
FERREIRA, A. P. S.2013 FERREIRA, A. P. S. ; CASSAGO, A. ; GONCALVES, K. D. A. ; DIAS, M. M. ; ADAMOSKI, D. ; ASCENCAO, C. F. R. ; HONORATO, R. V. ; DE OLIVEIRA, J. F. ; FERREIRA, I. M. ; FORNEZARI, C. ; BETTINI, J. ; OLIVEIRA, P. S. L. ; PAES LEME, A. F. ; PORTUGAL, R. V. ; AMBROSIO, A. L. B. ; DIAS, S. M. G. . Active Glutaminase C Self-assembles into a Supratetrameric Oligomer That Can Be Disrupted by an Allosteric Inhibitor. The Journal of Biological Chemistry (Print), v. 288, p. 28009-28020, 2013.

26.
MARTI'NEZ, LEANDRO2010MARTI'NEZ, LEANDRO ; Souza, Paulo C. T. ; Garcia, Wanius ; Batista, Fernanda A. H. ; Portugal, Rodrigo V. ; Nascimento, Alessandro S. ; Nakahira, Marcel ; Lima, Luis M. T. R. ; Polikarpov, Igor ; Skaf, Munir S. . On the Denaturation Mechanisms of the Ligand Binding Domain of Thyroid Hormone Receptors. The Journal of Physical Chemistry. B (1997 : Online), v. 114, p. 1529-1540, 2010.

27.
Garcia, Wanius2008Garcia, Wanius ; FIGUEIRA, ANA CAROLINA M. ; DE OLIVEIRA NETO, MARIO ; DE GUZZI, CAROLINA A. ; BUZZÁ, HILDE H. ; Portugal, Rodrigo V. ; CALGARO, MARCOS R. ; Polikarpov, Igor . Probing conformational changes in orphan nuclear receptor: The NGFI-B intermediate is a partially unfolded dimer. Biophysical Chemistry (Print), v. 137, p. 81-87, 2008.

28.
CALGARO, M. R.2007CALGARO, M. R. ; Neto, M. d. O. ; FIGUEIRA, A. C. M. ; Santos, M. A.M. ; PORTUGAL, R. V. ; Guzzi, C. A. ; SAIDEMBERG, D. M. ; BLEICHER, L. ; VERNAL, J. ; FERNANDEZ, P. ; TERENZI, H. ; PALMA, M. S. ; POLIKARPOV, I. . Orphan nuclear receptor NGFI-B forms dimers with nonclassical interface. Protein Science (Print), v. 16, p. 1762-1772, 2007.

29.
GRIMM, E. D.2006GRIMM, E. D. ; PORTUGAL, R. V. ; OLIVEIRA NETO, M. ; MARTINS, N. H. ; POLIKARPOV, I. ; ZAHA, A. ; FERREIRA, H. B. . Structural Analysis of an Echinococcus granulosus Actin-Fragmenting Protein by Small-Angle X-Ray Scattering Studies and Molecular Modeling. Biophysical Journal (Print), v. 90, p. 3216-3223, 2006.

30.
SANTOS, MARIA A.M.2005SANTOS, MARIA A.M. ; SANTOS, SILVIA M. ; MATOZO, HUITA C. ; Portugal, Rodrigo V. ; IULIANO, RODOLFO ; FUSCO, ALFREDO ; Polikarpov, Igor . Expression, purification, and characterization of rat protein tyrosine phosphatase η catalytic domain. Protein Expression and Purification (Print), v. 41, p. 113-120, 2005.

31.
RAZZERA, G.2004RAZZERA, G. ; VERNAL, J. ; PORTUGAL, R. V. ; CALGARO, M. R. ; FERNANDEZ, P. ; ZAKIN, M. M. ; POLIKARPOV, I. ; TERENZI, H. . Expression, purification, and initial structural characterization of rat orphan nuclear receptor NOR-1 LBD domain. Protein Expression and Purification (Print), v. 37, p. 433-449, 2004.

32.
NUNES, F. M.2004NUNES, F. M. ; APARÍCIO, R. ; SANTOS, M. A. M. ; PORTUGAL, R. V. ; DIAS, S. M. G. ; NEVES, F. A. R. ; SIMEONI, L. A. ; BAXTER, J. D. ; WEBB, P. ; POLIKARPOV, I. . Crystallization and preliminary X-ray diffraction studies of isoform alpha 1 of the human thyroid hormone receptor ligand-binding domain. Acta Crystallographica. Section D, Biological Crystallography, v. 60, p. 1867-1870, 2004.

Capítulos de livros publicados
1.
Fioramonte, Mariana ; Gozzo, Fabio Cezar ; de Oliveira, Cristiano Luis Pinto ; Portugal, Rodrigo V. ; VAN HEEL, MARIN . Advance Techniques in Biophysics. In: Gauri Misra. (Org.). Introduction to Biomolecular Structure and Biophysics. 1ed.: Springer Singapore, 2017, v. , p. 245-274.

2.
van HEEL, M. ; PORTUGAL, R. V. ; ROHOU, A. ; LINNEMAYR, C. ; BEBEACUA, C. ; SCHMIDT, R. ; GRANT, T. ; SCHATZ, M. . Four-Dimensional Cryo Electron Microscopy at Quasi Atomic Resolution: IMAGIC 4D. In: Michael Rossmann; Eddy Arnold; Daniel Himmel. (Org.). International Tables for Crystallography: Crystallography of Biological Macromolecules. 2ed.Hoboken, NJ: John Wiley & Sons Ltd, 2012, v. F, p. 624-628.

Resumos expandidos publicados em anais de congressos
1.
BETTINI, JEFFERSON ; Portugal, Rodrigo Villares . Infrastructure for Negative Staining Transmission Electron Microscopy for Studying Biological Macromolecules at LNNano/CNPEM. In: XXIV Congresso da Sociedade Brasileira de Microscopia e Microanálise, 2013, Caxambu. Congresso da Sociedade Brasileira de Microscopia e Microanálise, 2013.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
FERREIRA, A. P. S. ; CASSAGO, A. ; GONCALVES, K. A. ; HONORATO, R. V. ; DIAS, M. M. ; FERREIRA, I. M. ; OLIVEIRA, J. F. ; FORNEZARI, C. ; LEME, A. F. P. ; BETTINI, JEFFERSON ; OLIVEIRA, P. S. L. ; PORTUGAL, R. V. ; AMBROSIO, A. L. B. ; DIAS, S. M. G. . Glutaminase C fiber-like superstructure is essential for protein activation and can be disrupted by an allosteric inhibitor. In: Keystone Symposia - Tumor Metabolism, 2013, Keystone, Colorado USA. Keystone Symposia - Tumor Metabolism, 2013.

2.
SERRAO, V. H. B. ; MANZINE, LIVIA REGINA ; BETTINI, JEFFERSON ; PORTUGAL, R. V. ; VAN HEEL, MARIN ; THIEMANN, O. H. . The macromolecular complex from Escherichia coli: Selenocysteine Synthase and its interactions with specific tRNAsec. In: 23a RAU - Reunião Anual de Usuários do LNLS/CNPEM, 2013, Campinas. Resumos de Trabalhos Científicos, 2013. p. 5-5.

3.
SERRAO, V. H. B. ; MANZINE, L. R. ; SILVA, I. R. E. ; CASSAGO, A. ; BETTINI, J. ; PORTUGAL, R. V. ; van HEEL, M. ; THIEMANN, O. H. . Preliminary studies of selenocysteine synthase (SelA) and its binary complex with tRNAsec using cryo-electron microscopy. In: XXIV Congresso da Sociedade Brasileira de Microscopia e Microanálise, 2013, Caxambu. XXIV Congresso da Sociedade Brasileira de Microscopia e Microanálise, 2013.

4.
CASSAGO, A. ; FERREIRA, A. P. S. ; OLIVEIRA, J. F. ; FERREIRA, I. M. ; BETTINI, J. ; AMBROSIO, A. L. B. ; DIAS, S. M. G. ; PORTUGAL, R. V. . Correlation between the Fiber-Like Supra-Tetrameric Assembly of Glutaminases and the Activation Levels of the Isozymes Investigated by Transmission Electron Microscopy. In: XXIV Congresso da Sociedade Brasileira de Microscopia e Microanálise, 2013, Caxambu. XXIV Congresso da Sociedade Brasileira de Microscopia e Microanálise, 2013.

5.
COHEN, D. ; GRANT, T. ; PORTUGAL, R. V. ; TOSIN, T. ; ALEWIJNSE, B. ; DUINEN, G. V. ; SCHATZ, M. ; van HEEL, M. . Automatic CTF correction for large data sets vitreous-ice embedded biological specimens. In: Gordon Research Conference - Three Dimensional Electron Microscopy, 2012, Les Diablerets, Switzerland. From Molecules to Systems - Visualizing Biological Complexity, 2012.

6.
LIMA, L. H. F. ; PORTUGAL, R. V. ; Skaf, Munir S. ; POLIKARPOV, I. . Modelagem molecular e estudos biofísicos da interação de receptores nucleares a elementos responsivos de DNA. In: XIII Workshop da Pós-Graduação em Física, 2009, São Carlos - SP. Caderno de Resumos. São Carlos - SP: Instituto de Física de São Carlos - USP, 2009.

7.
LIMA, L. H. F. ; PORTUGAL, R. V. ; FIGUEIRA, A. C. M. ; Lima, Luis M. T. R. ; Skaf, Munir S. ; POLIKARPOV, I. . Biophysical studies of the retinoid x receptor interaction with differents DNA hormone responsive elements. In: XXXVIII Annual Meeting of the Brazilian Biochemistry and Molecular Biology Society, 2009, Águas de Lindóia - SP. Program and Index. São Paulo - SP: Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2009.

8.
LIMA, L. H. F. ; PORTUGAL, R. V. ; FIGUEIRA, A. C. M. ; POLIKARPOV, I. . Interaction of retinoid X nuclear receptor with differentes DNA hormone responsive elements. In: XXXVII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2008, Águas de Lindóia - SP. Program and Index, 2008. v. N-104. p. 103.

9.
PORTUGAL, R. V.; RIZZI, L. G. ; SANTOS, M. A. M. ; Lima, Luis M. T. R. ; POLIKARPOV, I. . Determination of RXR Recognition Specificity of Cognate DNA Sequences in Solution Using Fluorescence Anisotropy. In: XXXV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2006, Águas de Lindóia - SP. Programa e Índices, 2006. v. N-93. p. 94.

10.
OLIVEIRA NETO, M. ; BALLESTERO, M. R. M. ; FIGUEIRA, A. C. M. ; PORTUGAL, R. V. ; SANTOS, M. A. M. ; CRAIEVICH, A. F. ; POLIKARPOV, I. . SAXS studies in nuclear receptors. In: XXXV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2006, Águas de Lindóia - SP. Programa e Índices, 2006. v. N-93. p. 92.

11.
MATOZO, H. C. ; SANTOS, S. M. ; SANTOS, M. A. M. ; PORTUGAL, R. V. ; IULIANO, R. ; FUSCO, A. ; POLIKARPOV, I. . Expression, purification and characterization of rat protein tyrosine phosphatase eta catalytic domain. In: XXXIV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2005, Águas de Lindóia. Programa e Índices, 2005. p. N-51.

12.
PORTUGAL, R. V.; POLIKARPOV, I. . Estudos termodinâmicos da interação do receptor de ácido retinóico 9-cis (RXR) com os elementos responsivos DR1, DR4 e PAL. In: IX Workshop da Pós-Graduação no Instituto de Física de São Carlos - USP, 2005, São Carlos - SP. Caderno de Resumos, 2005. p. 129.

13.
PORTUGAL, R. V.; POLIKARPOV, I. ; OLIVA, G. . Pressure-induced dissociation of retinoic acid X nuclear receptor dimers in the presence of ligand and reponsive element. In: VIII Workshop da Pós-Graduação no Instituto de Física de São Carlos - USP, 2004, São Carlos - SP. Caderno de Resumos. São Carlos - SP: Instituto de Física de São Carlos - USP, 2004. p. 116-116.

14.
RAZZERA, G. ; VERNAL, J. ; PORTUGAL, R. V. ; CALGARO, M. R. ; ZAKIN, M. M. ; POLIKARPOV, I. ; TERENZI, H. . Purification and initial structural characterization of rat orphan nuclear receptor NOR-1 LBD domain. In: II International Workshop on Spectroscopy for Biology - IWSB, 2004, Rio de Janeiro - RJ. Program and Abstracts, 2004.

15.
PORTUGAL, R. V.; MOREAU, V. H. ; GONZALEZ, A. D. F. ; SANTOS, M. A. M. ; POLIKARPOV, I. . Pressure-induced dissociation of RXR dimers in solution. In: II International Workshop on Spectroscopy for Biology - IWSB, 2004, Rio de Janeiro - RJ. Program and Abstracts, 2004.

16.
NUNES, F. M. ; APARÍCIO, R. ; SANTOS, M. A. M. ; PORTUGAL, R. V. ; DIAS, S. M. G. ; NEVES, F. A. R. ; SIMEONI, L. A. ; WEBB, P. ; POLIKARPOV, I. . Preliminary X-ray diffraction studies of the isoform alpha1 of the human thyroid hormone receptor ligand binding domain alpha 1. In: XXVIII Reunião Anual Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2004, Caxambu - MG. Programa e Resumos, 2004.

17.
RAZZERA, G. ; VERNAL, J. ; PORTUGAL, R. V. ; CALGARO, M. R. ; ZAKIN, M. M. ; POLIKARPOV, I. ; TERENZI, H. . Purification and initial structural characterization of rat orphan nuclear receptor NOR-1 LBD domain. In: XXVIII Reunião Anual Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2004, Caxambu - MG. Programa e Resumos, 2004.

18.
PORTUGAL, R. V.; SANTOS, M. A. M. ; MOREAU, V. H. ; GONZALEZ, A. D. F. ; DIAS, S. M. G. ; POLIKARPOV, I. . Pressure-induced dissociation of retinoic acid X nuclear receptor dimers in the presence of ligand and responsive element. In: 3rd International Conference on High Pressure Bioscience and Biotechnology ? HPBB, 2004, Rio de Janeiro - RJ. Abstracts, 2004.

19.
PORTUGAL, R. V.; GONZALEZ, A. D. F. ; MOREAU, V. H. ; OLIVA, G. ; POLIKARPOV, I. . Biophysical studies of human nuclear receptors for thyroid hormone (TR) and retinoic acid X (RXR). In: XXXII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2003, Caxambu - MG. Programa e Resumos. São Paulo - SP: Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2003. v. resN24. p. 172-172.

20.
PORTUGAL, R. V.; GONZALEZ, A. D. F. ; MOREAU, V. H. ; NUNES, F. M. ; SANTOS, M. A. M. ; MATOZO, H. C. ; POLIKARPOV, I. . Biophysical studies of thyroid hormone (TR) and retinoic acid X (RXR) human nuclear receptors. In: XXVIII Congresso da Sociedade Brasileira de Biofisica/V IberoAmerican Congress of Biophysics, 2003, Rio de Janeiro. Abstracts, 2003. v. res73. p. 101-101.

21.
PORTUGAL, R. V.; PANEPUCCI, H. C. . Desenvolvimento de interface gráfica com o usuário para um tomógrafo por ressonância magnética. In: III Fórum Nacional de Ciência e Tecnologia em Saúde, 1996, Campos do Jordão. III Fórum Nacional de Ciência e Tecnologia em Saúde, 1996.

22.
PORTUGAL, R. V.; PANEPUCCI, H. C. . Ferramenta web para avaliação clínica de imagens de tomografia por ressonância magnética. In: III Fórum Nacional de Ciência e Tecnologia em Saúde, 1996, Campos do Jordão, 1996.

23.
PORTUGAL, R. V.; FREIRE, H. J. P. ; MARTINS, M. J. ; VIDOTO, E. L. G. ; PANEPUCCI, H. C. . Desenvolvimento de um tomógrafo de RMN de 0,5 tesla. In: XIX Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 1996, Águas de Lindóia. Anais do XIX Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 1996.

24.
PORTUGAL, R. V.; PANEPUCCI, H. C. . Desenvolvimento de interface gráfica com o usuário para um tomógrafo de ressonância magnética nuclear. In: 2o Simpósio Interno da Pós-Graduação do IFSC, 1995, São Carlos, 1995.

25.
DONOSO, J. P. ; CAVALCANTE, M. G. ; FRARE, P. ; MAGON, C. ; BONAGAMBA, T. J. ; MATOSO, L. H. ; PORTUGAL, R. V. ; NASCIMENTO, O. R. ; PANEPUCCI, H. C. . Magnetic Resonance Characterization of PEO and PPO Lithium Salt Polymer electrolytes. Humidity Sensors. In: 2nd Ibero-American Polymer Symposium, 1994, Gramado, 1994.

26.
PORTUGAL, R. V.; CAVALCANTE, M. G. ; VIDOTO, E. L. G. ; DONOSO, J. P. . Sensores de umidade de complexos poliméricos sólidos. In: XV Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 1992, Caxambu, 1992.

27.
PORTUGAL, R. V.; CAVALCANTE, M. G. ; VIDOTO, E. L. G. ; DONOSO, J. P. . Análise do sensor de umidade à base de P(OE)6LiClO4 em função da freqüência, umidade e tempo de exposição. In: X Congresso de Iniciação Científica e Tecnológica em Engenharia - CICTE, 1991, São Carlos, 1991.

28.
CAVALCANTE, M. G. ; PORTUGAL, R. V. ; CRUZ, R. A. ; VIDOTO, E. L. G. ; DONOSO, J. P. . Desenvolvimento de sensores de umidade com complexos poliméricos sólidos. In: I Congresso Brasileiro de Polímeros, 1991. Congresso Brasileiro de Polímeros, 1991.

29.
PORTUGAL, R. V.; CRUZ, R. A. ; CAVALCANTE, M. G. ; VIDOTO, E. L. G. ; DONOSO, J. P. . Desenvolvimento de sensores de umidade com complexos poliméricos. In: IX Congresso de Iniciação Científica e Tecnológica em Engenharia - CICTE, 1990, São Carlos, 1990.

Apresentações de Trabalho
1.
FLOREZ, A. ; CASSAGO, A. ; PORTUGAL, R. V. ; GUERRA, D. G. . P69-ANÁLISIS ESTRUCTURAL DEL COMPLEJO DE INICIACIÓN DE LA TRANSCRIPCIÓN DE ESCHERICHIA COLI UTILIZANDO MICROSCOPÍA ELECTRÓNICA DE TRANSMISIÓN (TEM). 2016. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

2.
FLOREZ, A. ; CASSAGO, ALEXANDRE ; PORTUGAL, R. V. ; GUERRA, D. G. . ANÁLISIS DEL COMPLEJO DE INICIACIÓN DEL PROMOTOR λPR-σ POLIMERASA DE Escherichia coli UTILIZANDO MICROSCOPÍA ELECTRÓNICA DE TRANSMISIÓN (TEM). 2016. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

3.
RICILUCA, K. C. T. ; AFANASYEV, P. ; CASSAGO, A. ; van HEEL, M. ; SILVA JR, P. I. ; PORTUGAL, R. V. . Structural Analysis of Spider Hemocyanin by Cryogenic Electron Microscopy (?cryoEM?). 2015. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

4.
Portugal, Rodrigo Villares. A cryo-electron microscopy facility for single particle analysis at the National Center for Energy and Materials Research. 2014. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

5.
Portugal, Rodrigo Villares. Using single particle cryo-electron microscopy for structural study of macromolecular complexes. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

6.
BETTINI, J. ; PORTUGAL, R. V. . MIcroscopia eletrônica de transmissão aplicada à biologia molecular estrutural. 2012. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

7.
SASSI, L. M. ; PORTUGAL, R. V. . Estudo do uso de séries de imagens de microscopia eletrônica de transmissão para análise de partícula única. 2012. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

8.
SERRAO, V. H. B. ; MANZINE, L. R. ; BETTINI, J. ; PORTUGAL, R. V. ; van HEEL, M. ; THIEMANN, O. H. . Structural determination of selenocysteine synthase complex (SelA) of Escherichia coli. 2012. (Apresentação de Trabalho/Outra).

9.
CASSAGO, A. ; FERREIRA, I. M. ; FERREIRA, A. P. S. ; BETTINI, J. ; PORTUGAL, R. V. ; DIAS, S. M. G. ; AMBROSIO, A. L. B. . Estudos estruturais das glutaminases por microscopia eletrônica. 2012. (Apresentação de Trabalho/Outra).

10.
PORTUGAL, R. V.. Microscopia Eletrônica de Transmissão Aplicada à Biologia Molecular Estrutural. 2012. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

11.
PORTUGAL, R. V.; SCHATZ, M. ; SCHMIDT, R. ; van HEEL, M. . Parallel multivariate statistical analysis of huge data sets. 2008. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

12.
GRANT, T. ; IWEMA, R. B. ; ROHOU, A. ; PORTUGAL, R. V. ; SCHMIDT, R. ; SCHATZ, M. ; van HEEL, M. . Correlation functions and similarity criteria in Single-Particle Cryo-EM. 2007. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

13.
PORTUGAL, R. V.; PANEPUCCI, H. C. . Avaliação Clínica de Imagens na Web In: Reunião do Grupo de Trabalho em Saúde. 1996. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

Outras produções bibliográficas
1.
van HEEL, M. ; PORTUGAL, R. V. ; SCHATZ, M. . Multivariate Statistical Analysis in Single Particle (Cryo) Electron Microscopy. 3D-EM Network of Excellence - Editors: A. Verkley and E. Orlova, 2009 (Capítulo em Livro Eletrônico).


Produção técnica
Programas de computador sem registro
1.
PORTUGAL, R. V.; NACCARATO, K. P. ; MARTINS, M. J. ; VIDOTO, E. L. G. ; PANEPUCCI, H. C. . ToRM GUI. 1998.

Demais trabalhos
1.
PORTUGAL, R. V.. Física B. 2004 (Monitoria) .

2.
PORTUGAL, R. V.. Física I. 2003 (Monitoria) .

3.
PORTUGAL, R. V.. Laboratório de Programação de Alto Desempenho. 1995 (Monitoria) .

4.
PORTUGAL, R. V.. Laboratório de Física II. 1994 (Monitoria) .

5.
PORTUGAL, R. V.. Laboratório de Física I. 1994 (Monitoria) .



Bancas



Participação em bancas de trabalhos de conclusão
Mestrado
1.
Martinez, Leandro; Garrat, R. C.; Portugal, Rodrigo V.. Participação em banca de Mariana Raquel Bunoro Batista. Mobilidade da hélice 12 de receptores nucleares: comparação entre simulações de dinâmica molecular e experimentos de anisotropia de fluorescência. 2013 - UNIVERSIDADE DE SAO PAULO - CAMPUS DE SAO CARLOS - INSTITUTO DE FISICA.

2.
THIEMANN, O. H.; PORTUGAL, R. V.; ITRI, R.. Participação em banca de Ivan Rosa e Silva. Estudos Biofísicos da Selenofosfato Sintase de Escherichia coli e investigação de seu papel na via de biosíntese de Selenocisteínas. 2012 - UNIVERSIDADE DE SAO PAULO - CAMPUS DE SAO CARLOS - INSTITUTO DE FISICA.

3.
MARINS, M.; PORTUGAL, R. V.; COSTA, M. C. R.. Participação em banca de Marco Antônio Mansur Biagi. AGIL - Sistema de apoio ao gerenciamento e análise de dados em laboratórios de pesquisa: aplicação na análise molecular de hemoparasitas. 2009. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de Ribeirão Preto.

Teses de doutorado
1.
ALVES, W. A.; LANFREDI, A. J. C.; MARTINHO, H. S.; PORTUGAL, R. V.; PETRI, D. F. S.. Participação em banca de Michelle da Silva Liberato. Matrizes poliméricas funcionais preparadas por eletrofiação: estudos das propriedades estruturais e processos de biodegradação. 2015. Tese (Doutorado em Nanociências e Materiais Avançados) - Universidade Federal do ABC.

2.
Garrat, R. C.; HAIDUKE, R. L. A.; PORTUGAL, R. V.; PINTO, R. A.; MASCARENHAS, Y. P.. Participação em banca de José Fernando Ruggiero Bachega. Estrutura cristalográfica da hemoglobina gigante de Glossoscolex paulistus, um complexo de 3,6 mega Daltons. 2013. Tese (Doutorado em Doutorado em Fisica Aplicada) - Universidade de São Paulo.

3.
PORTUGAL, R. V.; SANTIAGO, P. S.; OLIVEIRA, C. L. P.; CANDURI, F.; TABAK, M.. Participação em banca de Francisco Adriano de Oliveira Carvalho. Estudo da estabilidade oligomérica da hemoglobina extracelular gigante de Glossoscolex paulistus (HbGp) na presença de agentes caotrópicos e caracterização das subunidades. 2013. Tese (Doutorado em Química (Físico-Química) - IQSC/USP) - Universidade de São Paulo.

Qualificações de Doutorado
1.
MANTOVANI, G. L.; LANFREDI, A. J. C.; SANTOS, D. J.; PORTUGAL, R. V.. Participação em banca de Michelle da Silva Liberato. Matrizes poliméricas funcionais preparadas por eletrofiação: estudos das propriedades estruturais e processos de biodegradação. 2014. Exame de qualificação (Doutorando em Nanociências e Materiais Avançados) - Universidade Federal do ABC.

2.
Portugal, Rodrigo V.; Garrat, R. C.; Borges, J. C.. Participação em banca de Ana Eliza Zeraik. Caracterização Biofísica e Estudos Funcionais das Septinas de Schistosoma mansoni. 2011. Exame de qualificação (Doutorando em Curso de Pós-Graduação em Física Aplicada - Opção Biomolecular) - Universidade de São Paulo.



Participação em bancas de comissões julgadoras
Outras participações
1.
PORTUGAL, R. V.. Banca avaliadora de Iniciação Científica na II SIFSC. 2012. UNIVERSIDADE DE SAO PAULO - CAMPUS DE SAO CARLOS - INSTITUTO DE FISICA.

2.
PORTUGAL, R. V.. Banca avaliadora de Mestrado na II SIFSC. 2012. UNIVERSIDADE DE SAO PAULO - CAMPUS DE SAO CARLOS - INSTITUTO DE FISICA.



Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
Latin American Summit Meeting on Biological Crystallography and Complementary Methods. A cryo-electron microscopy facility for single particle analysis at the National Center for Energy and Materials Research. 2014. (Congresso).

2.
30a Semana da Física.Estudos estruturais de complexos macromoleculares por microscopia eletrônica de transmissão e análise de partícula única. 2013. (Outra).

3.
XXIV Congresso da Sociedade Brasileira de Microscopia e Microanálise. Infrastructure for Negative Staining Transmission Electron Microscopy for Studying Biological Macromolecules at LNNano/CNPEM. 2013. (Congresso).

4.
XXIV Congresso da Sociedade Brasileira de Microscopia e Microanálise. Using single particle cryo-electron microscopy for structural study of macromolecular complexes. 2013. (Congresso).

5.
22a RAU Reunião Anual de Usuários do LNLS/CNPEM.Microscopia Eletrônica de transmissão aplicada à biologia molecular estrutural. 2012. (Encontro).

6.
Ciclo de Minioficinas do LNNano.Applications of Transmission Electron Microscopy for Structural Molecular Biolgy at LNNano. 2012. (Oficina).

7.
II Jornada de Nanotecnologia.Estudos estruturais de complexos macromoleculares por microscopia eletrônica de transmissão. 2012. (Outra).

8.
ICXOM21 - 21st International Congress on X-Ray Optics and Microanalysis. 2011. (Congresso).

9.
4th 3D-EM Network of Excellence Annual Metting. Parallel multivariate statistical analysis of huge data sets. 2008. (Congresso).

10.
3rd 3D-EM Network of Excellence Annual Metting. Correlation functions and similarity criteria in Single-Particle Cryo-EM. 2007. (Congresso).

11.
Gordon Research Conference - Three Dimensional Electron Microscopy - Visualizing Biological Processes With 3DEM. 2007. (Congresso).

12.
Workshop on Classification and Alignment of Diffraction Patterns from Randomly Oriented Molecules in Single-Molecule Imaging Experiments. 2007. (Outra).

13.
XXXV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. Determination of RXR Recognition Specificity of Cognate DNA Sequences in Solution Using Fluorescence Anisotropy. 2006. (Congresso).

14.
IX Workshop da Pós-Graduação no Instituto de Física de São Carlos - USP.Estudos termodinâmicos da interação do receptor de ácido retinóico 9-cis (RXR) com os elementos responsivos DR1, DR4 e PAL. 2005. (Oficina).

15.
3rd International Conference on High Pressure Bioscience and Biotechnology ? HPBB. Pressure-induced dissociation of retinoic acid X nuclear receptor dimers in the presence of ligand and responsive element. 2004. (Congresso).

16.
II International Workshop on Spectroscopy for Biology - IWSB. Pressure-induced dissociation of RXR dimers in solution. 2004. (Congresso).

17.
I Mostra de Ciência e Tecnologia em Políticas Públicas Municipais.ToRM05. 2004. (Outra).

18.
VIII Workshop da Pós-Graduação no Instituto de Física de São Carlos - USP.Pressure-induced dissociation of retinoic acid X nuclear receptor dimers in the presence of ligand and reponsive element. 2004. (Encontro).

19.
7a. Conferência Endeavor Anprotec. 2003. (Outra).

20.
XVI Reunião da Sociedade Brasileira de Cristalografia. 2003. (Outra).

21.
XXVIII Congresso da Sociedade Brasileira de Biofisica/V IberoAmerican Congress of Biophysics. Biophysical studies of thyroid hormone (TR) and retinoic acid X (RXR) human nuclear receptors. 2003. (Congresso).

22.
XXXII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. Biophysical studies of human nuclear receptors for thyroid hormone (TR) and retinoic acid X (RXR). 2003. (Congresso).

23.
Inter-American Workshop on the Use of Synchrotron Radiantion: Applications to Macromolecules and Biological Systems. 2002. (Simpósio).

24.
Workshop de Pós-Graduação em Física do Instituto de Física de São Carlos.Estudos Termodinâmicos e Estruturais de Heterodímeros dos Receptores Nucleares de Ácido Retinóico X (RXR) e de Hormônio Tiroideano (TR). 2002. (Outra).

25.
International Workshop on Spectroscopy for Biology. 2001. (Simpósio).

26.
Seminário de Cultura e Extensão 2001 USP: Diálogo com a sociedade.ToRM05 - Tomógrafo de Ressonância Magnética da Santa Casa de São Carlos. 2001. (Simpósio).

27.
VII Congresso Internacional sobre Tecnologias Inteligentes e Redes Globais - Inet 2001. 2001. (Congresso).

28.
V Congresso Internacional sobre Tecnologias Inteligentes e Redes Globais - Inet 99. 1999. (Congresso).

29.
A Telemedicina no Brasil, o Futuro é Hoje. 1998. (Simpósio).

30.
Jornadas Científicas InCor 97 - Módulo Informática. 1997. (Outra).

31.
III Fórum Nacional de Ciência e Tecnologia em Saúde. Desenvolvimento de interface gráfica com o usuário para um tomógrafo por ressonância magnética. 1996. (Congresso).

32.
Reunião do Grupo de Trabalho em Saúde - Comitê Gestor Internet Brasil - COMDEX Internet Brasil 96.Avaliação Clínica de Imagens na Web. 1996. (Encontro).

33.
XIX Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. Desenvolvimento de um tomógrafo de RMN de 0,5 tesla. 1996. (Congresso).

34.
2o Simpósio Interno da Pós-Graduação do IFSC.Desenvolvimento de interface gráfica com o usuário para um tomógrafo de ressonância magnética nuclear. 1995. (Simpósio).

35.
X Congresso de Iniciação Científica e Tecnológica em Engenharia - CICTE. Análise do sensor de umidade à base de P(OE)6LiClO4 em função da freqüência, umidade e tempo de exposição. 1991. (Congresso).

36.
IX Congresso de Iniciação Científica e Tecnológica em Engenharia - CICTE. Desenvolvimento de sensores de umidade com complexos poliméricos. 1990. (Congresso).


Organização de eventos, congressos, exposições e feiras
1.
PORTUGAL, R. V.; van HEEL, M. ; SCHATZ, M. . The 7th Brazil School for Single Particle Cryo-EM. 2016. (Outro).

2.
PORTUGAL, R. V.; VAN HEEL, MARIN ; Grigorieff, N. ; SCHATZ, M. ; JARED, C. A. G. S. . The 6th Brazil School for Single Particle Cryo-EM. 2014. (Outro).

3.
ZAGONEL, L. F. ; PORTUGAL, R. V. ; BETTINI, J. ; MONTORO, L. ; MAGNANI, M. ; INOKI, C. K. ; ARAUJO, S. R. ; LONDONO, A. R. . IV Curso Teórico-Prático de Microscopia Eletrônica de Transmissão. 2012. (Outro).

4.
van HEEL, M. ; PORTUGAL, R. V. . The Fifth Brazil School for Single Particle Cryo EM. 2012. (Outro).

5.
van HEEL, M. ; PORTUGAL, R. V. ; MARTIN, A. ; OLIVEIRA, A. C. ; SCHATZ, M. . The Fourth Brazil School for Single Particle Cryo Electron Microscopy. 2010. (Outro).

6.
van HEEL, M. ; SCHATZ, M. ; PORTUGAL, R. V. ; POLIKARPOV, I. ; GOMES, A. M. O. ; SILVA, J. L. . The Third Brazil School for Single Particle Cryo Electron Microscopy. 2008. (Outro).

7.
van HEEL, M. ; SCHATZ, M. ; POLIKARPOV, I. ; PORTUGAL, R. V. . The Second Brazil School for Single Particle Cryo Electron Microscopy. 2006. (Outro).

8.
van HEEL, M. ; SCHATZ, M. ; POLIKARPOV, I. ; PORTUGAL, R. V. . Santa Rita School for Single Particle Cryo-EM. 2005. (Outro).



Orientações



Orientações e supervisões em andamento
Supervisão de pós-doutorado
1.
Katie Cristina Takeuti Riciluca. Início: 2017. Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior.


Orientações e supervisões concluídas
Dissertação de mestrado
1.
Alfredo Jose Florez Ariza. Structural analysis of DNA wrapping in bacterial transcription initiation complex by transmission electron microscopy and single particle analysis. 2018. Dissertação (Mestrado em Fisica (Sc)) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Rodrigo Villares Portugal.

2.
Ricardo Diogo Righetto. Validation of Structural Heterogeneity in Cryo-EM Datasets by Cluster Ensembles. 2014. Dissertação (Mestrado em Engenharia Elétrica) - Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Coorientador: Rodrigo Villares Portugal.

Tese de doutorado
1.
Vitor Hugo Balasco Serrão. Caracteriização das iinterações macromollecullares das proteíínas envollviidas na sííntese de sellenociisteíínas em Escheriichiia colli. 2012. Tese (Doutorado em Doutorado em Fisica Aplicada) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Coorientador: Rodrigo Villares Portugal.

Supervisão de pós-doutorado
1.
Carolina Aparecida de Guzzi Cassago. 2017. Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Rodrigo Villares Portugal.

2.
Marcelo Alexandre de Farias. 2016. Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Financiadora de Estudos e Projetos. Rodrigo Villares Portugal.

3.
Marcelo Alexandre de Farias. 2015. Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, . Rodrigo Villares Portugal.

4.
Antônio Carlos Borges. 2015. Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, . Rodrigo Villares Portugal.

5.
Alexandre Cassago. 2013. Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Rodrigo Villares Portugal.

Trabalho de conclusão de curso de graduação
1.
Rohan Saldanha. Cryo electron microscopy of the prokaryotic Selenocysteine Synthase macromolecular complex. 2008. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Mres in Structural and Molecular Biology) - Imperial College of Science, Technology and Medicine. Orientador: Rodrigo Villares Portugal.

Iniciação científica
1.
Otávio Berenguel. Desenvolvimento de Substratos para Grades de Criomicroscopia Eletrônica. 2018. Iniciação Científica - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rodrigo Villares Portugal.

2.
Marcos Felipe Gomes Monteiro. Identificação de variabilidade conformacional em complexos macromoleculares por análise estatística de imagens. 2015. Iniciação Científica - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rodrigo Villares Portugal.

3.
Murilo Henrique Martinez Moreira. Estudo de macromoléculas por crio-microscopia eletrônica de partículas isoladas. 2014. Iniciação Científica - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rodrigo Villares Portugal.

4.
Marcos Felipe Gomes Monteiro. Desenvolvimento de software para classificação rápida de imagens de crio-microscopia eletrônica de partícula única. 2012. Iniciação Científica - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Rodrigo Villares Portugal.

Orientações de outra natureza
1.
Deborah Cezar Mendonça. Microscopia Eletrônica de Septinas. 2016. Orientação de outra natureza - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais. Orientador: Rodrigo Villares Portugal.

2.
Rafael Raiser. Análise estrutural de complexos macromoleculares por criomicroscopia eletrônica de partículas isoladas. 2016. Orientação de outra natureza. (Engenharia Física) - Universidade Estadual de Campinas. Orientador: Rodrigo Villares Portugal.

3.
Daniela Cristina Serdar. Análise estrutural de complexos macromoleculares por criomicroscopia eletrônica de partículas isoladas. 2016. Orientação de outra natureza. (Processos Químicos) - Faculdade de Tecnologia de Campinas. Orientador: Rodrigo Villares Portugal.

4.
Henrique Tinti de Andrade. Desenvolvimento de métodos de classificação de imagens de partículas de crio microscopia eletrônica. 2015. Orientação de outra natureza - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais. Orientador: Rodrigo Villares Portugal.

5.
Luiz Roberto Belatini Junior. Desenvolvimento de aplicativo para visualização de dados de classificação de partículas de crio microscopia eletrônica. 2014. Orientação de outra natureza - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais. Orientador: Rodrigo Villares Portugal.

6.
Vinicius Mattos dos Santos. Desenvolvimento de software para visualização de resultados de análise de componentes principais em imagens de criomicroscopia eletrônica. 2014. Orientação de outra natureza - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais. Orientador: Rodrigo Villares Portugal.

7.
Nicolás Diego Bruna Rivera. Estudio estructural de Hemocianinas mediante Crio Microscopia Electrónica de Partículas Aisladas. 2014. Orientação de outra natureza - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais. Orientador: Rodrigo Villares Portugal.

8.
Rafael Martins Alves. Estudo do uso de transformadas invariantes à rotação e translação aplicadas a imagens de crio-microscopia eletrônica. 2013. Orientação de outra natureza - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais. Orientador: Rodrigo Villares Portugal.

9.
Carlos Augusto Silva. Desenvolvimento de software para visualização e análise de dados estatísticos. 2013. Orientação de outra natureza - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais. Orientador: Rodrigo Villares Portugal.

10.
Lucas Muraro Sassi. Estudo do Uso de Série de Imagens de Microscopia Eletrônica de Transmissão para Análise de Partícula Única. 2012. Orientação de outra natureza - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais. Orientador: Rodrigo Villares Portugal.

11.
Alexandre Ruggieri Serante. Estudo estrutural de hemocianinas através da técnica de Microscopia Eletrônica de Partícula Única. 2011. Orientação de outra natureza - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais. Orientador: Rodrigo Villares Portugal.




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