Artur Luiz da Costa da Silva

Bolsista de Produtividade em Pesquisa do CNPq - Nível 1C

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  • Última atualização do currículo em 01/11/2018


ARTUR LUIZ DA COSTA DA SILVA Biólogo, licenciado pleno com mestrado e doutorado em Ciências Biológicas (Genética e Biologia Molecular) pela Universidade Federal do Pará. Professor titular da UFPA. Atua no ensino de graduação e pós-graduação da UFPA e UFMG. Presidente do conselho da Fundação de Amparo e Desenvolvimento da Pesquisa (FADESP). Editor associado da BMC Microbiology. Foi Coordenador do Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular no quadriênio 2013/17. Vice-Coordenador dos Programas de Pós-Graduação em Biotecnologia (CAPES 5) e do de Genética (CAPES 6), ambos da UFPA. Chefe do Laboratório de Genômica e Bioinformática da UFPA. Chefe do Laboratório de Engenharia Biológica do PCT-Guamá. Membro afiliado da Academia Brasileira de Ciências 2007-2012. Presidente do Conselho de Administração da Organização Social Bio Tec-Amazônia (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Artur Luiz da Costa da Silva
Nome em citações bibliográficas
SILVA, A.;SILVA, A;Silva, Artur;Costa da Silva, Artur Luiz;Silva, A.L.C.;Silva,;Silva, Artur da Costa da;Artur Silva;Silva;Silva A;DA COSTA DA SILVA, ARTUR;Artur LC da Silva;da Silva AL;DA SILVA, A. L. D. C.;DA COSTA DA SILVA, ARTUR LUIZ;Silva, A.L.;Artur Luiz da Costa Silva;SILVA, ARTUR LUIZ DA COSTA;DA SILVA, ARTUR LUIZ;da silva AL;SILVA, ARTUR L. C.;Artur L. da Costa da Silva;da Costa da Silva, Artur L.;SILVA, ARTUR LUIZ DA COSTA DA

Endereço


Endereço Profissional
Universidade Federal do Pará, Centro de Ciências Biológicas, Departamento de Genética.
Campus do Guamá - Laboratório de Polimorfismo de DNA
Guamá
66075900 - Belém, PA - Brasil - Caixa-postal: 8607
Telefone: (91) 32018426
Fax: (91) 31837931
URL da Homepage: www.lpdna.ufpa.br


Formação acadêmica/titulação


1996 - 2000
Doutorado em Ciências Biológicas.
Universidade Federal do Pará, UFPA, Brasil.
com período sanduíche em Georg-August-Universität Göttingen (Orientador: Bertram Brenig).
Título: Construção e Análise de uma Biblioteca Genômica Contendo 1,6 Genoma Equivalente do Búfalo de Pântano (Bubalus bubalis, Linnaeus), Ano de obtenção: 2000.
Orientador: Profa Dra. Maria Paula Cruz Schneider.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
Palavras-chave: Genômica; Búfalo; Biblioteca Genômicas.
Grande área: Ciências Biológicas
Setores de atividade: Produtos e Processos Biotecnológicos; Produção Animal, Inclusive Serviços Veterinários.
1995 - 1996
Mestrado em Ciências Biológicas.
Universidade Federal do Pará, UFPA, Brasil.
Título: Evidências da Variação Nucleotídica Ancestral no Gene Citocromo Oxidase II em Aotus (Cebidae, Primates),Ano de Obtenção: 1996.
Orientador: Profa Dra. Maria Paula Cruz Schneider.
Palavras-chave: Primates; DNA; PCR; CO II.
Grande área: Ciências Biológicas
1989 - 1994
Graduação em Licenciatura Plena em Ciências Biológicas.
Universidade Federal do Pará, UFPA, Brasil.
1986 - 1988
Curso técnico/profissionalizante em Habilitação Básica Em Patologia Clínica.
Centro de Ensino Técnico do Estado do Pará, CETEP, Brasil.




Formação Complementar


2017 - 2017
Curso intermediário de fotografia. (Carga horária: 3h).
Canon College, CANON, Brasil.
2017 - 2017
Técnicas de aprimoramento para iniciantes. (Carga horária: 3h).
Canon College, CANON, Brasil.
2017 - 2017
Introdução a fotografia. (Carga horária: 3h).
Canon College, CANON, Brasil.
2016 - 2016
Photoshop básico para fotógrafos. (Carga horária: 10h).
Edukar Educação e Formação Profissional, EDUKAR, Brasil.
2016 - 2016
PORQUE HOJE É SÁBADO! FOTOGRAFIA DE NU - Diálogos e Prática. (Carga horária: 16h).
StudioDez, STUDIODEZ, Brasil.
2015 - 2015
Lightroom avançado para fotógrafos. (Carga horária: 9h).
Edukar Educação e Formação Profissional, EDUKAR, Brasil.
2015 - 2015
Flash Dedicado, versão 2013. (Carga horária: 10h).
Edukar Educação e Formação Profissional, EDUKAR, Brasil.
2015 - 2015
Workshop de Composição. (Carga horária: 15h).
Clarté foto e cinema, CLARTÉ, Brasil.
2014 - 2014
Curso de fotografia básico. (Carga horária: 26h).
Clarté foto e cinema, CLARTÉ, Brasil.
2009 - 2009
SOLiD system customer training. (Carga horária: 80h).
Applied Biosystems, AB, Estados Unidos.
2008 - 2008
Stable Isotope Probing: A short course. (Carga horária: 40h).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
2008 - 2008
Microbial Genomics and Metagenomics. (Carga horária: 40h).
Joint Genome Institute, JGI, Estados Unidos.
2006 - 2006
Comparative Microbial Genomics And Taxonomy. (Carga horária: 40h).
Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.
2004 - 2004
Introdução à técnica RNA interference. (Carga horária: 80h).
Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.
2004 - 2004
Curso Operacional do 7500 Real Time Pcr Systems. (Carga horária: 40h).
Applied Biosystems, AP, Brasil.
2002 - 2002
Identificação Humana. (Carga horária: 32h).
Applied Biosystems, AP, Brasil.
1999 - 1999
Bioinformatics: from QTL to sequence. (Carga horária: 30h).
Technische Universität München, TUM, Alemanha.
1998 - 1998
Deustsch als Frendsprache. (Carga horária: 394h).
Goethe Institut, GO, Alemanha.


Atuação Profissional



Universidade Federal do Pará, UFPA, Brasil.
Vínculo institucional

2016 - Atual
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Membro da câmara de pesquisa do ICB

Vínculo institucional

2016 - Atual
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Membro da Congregação do ICB, Carga horária: 1

Vínculo institucional

2016 - Atual
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor titular, Carga horária: 40

Vínculo institucional

2016 - Atual
Vínculo: , Enquadramento Funcional: Professor titular, Carga horária: 1
Outras informações
Membro titular do Comité Consultivo do projeto de Extensão Industrial Exportadora (PEIEX) - Núcleo Belém - PCT Guamá. Representante da UFPA. Portaria da Reitoria # 4952/2016

Vínculo institucional

2015 - Atual
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Chefe de lab. Genômica e Bioinformática, Carga horária: 10
Outras informações
Portaria 010 2015 do ICB UFPA

Vínculo institucional

2015 - Atual
Vínculo: , Enquadramento Funcional: Chefe de Laboratório de Engenharia Biológica, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações
Chefe do Laboratório de Engenharia Biológica - Parque de Ciência e Tecnologia do Guamá. Governo do Estado do Pará

Vínculo institucional

2016 - 2017
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Coordenador Pos-Graduação Genética
Outras informações
Reconduzido a coordenação do PPGBM 2016-2017

Vínculo institucional

1997 - 2016
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor magistério superior - associado IV, Regime: Dedicação exclusiva.

Vínculo institucional

2013 - 2015
Vínculo: , Enquadramento Funcional: Coordenador Pos-Graduação Genética, Carga horária: 20
Outras informações
Coordenador do Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular da UFPA Portaria DOU 5117 2013

Vínculo institucional

2013 - 2015
Vínculo: , Enquadramento Funcional: Membro câmara de pesquisa do ICB, Carga horária: 1

Vínculo institucional

2013 - 2015
Vínculo: , Enquadramento Funcional: Membro da Congregação do ICB, Carga horária: 1

Vínculo institucional

1995 - 1997
Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Professor substituto, Carga horária: 40

Vínculo institucional

1990 - 1995
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Bolsista de Iniciação Científica, Carga horária: 20

Atividades

04/2016 - Atual
Ensino, Programa de pós-graduação em engenharia de barragem e gestão ambiental, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Biotecnologia ambiental
01/2014 - Atual
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Ciências Biológicas, .

Cargo ou função
Membro da Congregação.
12/2013 - Atual
Direção e administração, Programa de Pós-graduação em Genética e Biologia Molecular, .

Cargo ou função
Coordenador do Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular.
12/2010 - Atual
Ensino, Biotecnologia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Engenharia genética
10/2002 - Atual
Conselhos, Comissões e Consultoria, Reitoria, Pró-reitoria de pesquisa e pós-graduação.

Cargo ou função
Membro da Comissão Interna de Biossegurança.
03/2000 - Atual
Ensino, Genética e Biologia Molecular, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Engenharia genética
8/2006 - 12/2010
Ensino, Engenharia Química, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Engenharia genética
10/2004 - 12/2010
Ensino, Doenças Tropicais, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Diagnóstico molecular
1/2004 - 12/2010
Ensino, Odontologia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Genética
01/2007 - 12/2009
Direção e administração, Programa de Pós-graduação em Genética e Biologia Molecular, .

Cargo ou função
Vice coordenador do Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular.
01/2007 - 01/2009
Conselhos, Comissões e Consultoria, Reitoria, Pró-reitoria de pesquisa e pós-graduação.

Cargo ou função
membro do comitê assessor de pesquisa da UFPA como representante do Instituto de Ciências Biológicas.
12/2004 - 12/2006
Direção e administração, Programa de Pós-graduação em Genética e Biologia Molecular, .

Cargo ou função
Vice coordenador do programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular - Portaria da Reitoria 3820/2004.
05/2003 - 06/2004
Conselhos, Comissões e Consultoria, Reitoria, Pró-reitoria de pesquisa e pós-graduação.

Cargo ou função
Membro da comissão de seleção alunos PIBIC/UFPA/CNPq.
06/2003 - 06/2003
Conselhos, Comissões e Consultoria, Departamento de Genética, .

Cargo ou função
Membro de comissão de inquérito administrativo. Portaria #2 Departamento de Genética.
05/1997 - 05/2000
Ensino, Ciências Biológicas, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Biometria

Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.
Vínculo institucional

2011 - Atual
Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Professor colaborador Pos em Bioinformatica, Carga horária: 5
Outras informações
Professor colaborador do Programa de Pós-Graduação em Bioinformática


Agência de Inovação Tecnológica da UFPA, INOVAUFPA, Brasil.
Vínculo institucional

2009 - 2015
Vínculo: , Enquadramento Funcional: Membro titular do conselho, Carga horária: 10, Regime: Dedicação exclusiva.


Fundação de Amparo e Desenvolvimento da Pesquisa do Pará, FADESP, Brasil.
Vínculo institucional

2017 - Atual
Vínculo: , Enquadramento Funcional: Membro titular do Conselho Diretor, Carga horária: 1
Outras informações
Membro Conselho diretor no biênio 2017-2019

Vínculo institucional

2017 - Atual
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Presidente do Conselho Diretor da Fundação, Carga horária: 2

Vínculo institucional

2009 - 2013
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Membro titular do Conselho Diretor, Carga horária: 1


Fundação de Ciência e Tecnologia Guamá, FCTG, Brasil.
Vínculo institucional

2013 - 2017
Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Membro titular do conselho curador, Carga horária: 2

Vínculo institucional

2009 - 2013
Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Membro titular do conselho curador, Carga horária: 2


Secretaria de Estado de Desenvolvimento, Ciência e Tecnologia, SEDECT, Brasil.
Vínculo institucional

2007 - 2008
Vínculo: Membro de Comitê, Enquadramento Funcional: Membro de comitê
Outras informações
Membro do comitê do programa PIBIC Jr (CNPq-SEDECT)

Atividades

03/2007 - Atual
Conselhos, Comissões e Consultoria, Diretoria de Ciência e Tecnologia, .

Cargo ou função
Membro de comitê.

Universitat Göttingen, UNI-GOTTINGEN, Alemanha.
Vínculo institucional

1998 - 2004
Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Pesquisador colaborador, Carga horária: 40
Outras informações
Estágio de doutoramento sanduiche

Atividades

4/1998 - 9/1999
Estágios , Tierartzliches Institut, .

Estágio realizado
Doutorado sandwich.

Wayne State University, W.S.U., Estados Unidos.
Vínculo institucional

1994 - 1994
Vínculo: Outro, Enquadramento Funcional: Visita Científica, Carga horária: 40

Atividades

3/1994 - 6/1994
Estágios , Wayne State University, .

Estágio realizado
Clonagem e sequenciamento de DNA.

American Society for Microbiology, ASM, Estados Unidos.
Vínculo institucional

2012 - Atual
Vínculo: Membro estrangeiro, Enquadramento Funcional: Membro, Carga horária: 1


Sociedade Brasileira de Microbiologia, SBM, Brasil.
Vínculo institucional

2009 - 2013
Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Coord. de área de Genética e Bioinformática, Carga horária: 1
Outras informações
2009-2011 Coordenador da área de Genética e Bioinformática 2012-2014 Coordenador da área de Genética e Bioinformática


Institut National de la Recherche Agronomique, INRA, França.
Vínculo institucional

2018 - 2018
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Estágio Sênior no Exterior, Carga horária: 40
Outras informações
Bolsista CNPq de Estágio Sênior no Exterior INRA STLO, Rennes, France.


Organização Social Bio Tec-Amazônia, BIO TEC-AMAZÔNIA, Brasil.
Vínculo institucional

2018 - Atual
Vínculo: Membro do Conselho, Enquadramento Funcional: Presidente do Conselho de Administração, Carga horária: 10

Vínculo institucional

2016 - 2018
Vínculo: Membro do Conselho Fiscal, Enquadramento Funcional: Membro Titular do Conselho Fiscal, Carga horária: 2



Projetos de pesquisa


2015 - Atual
Análise dos mecanismos relacionados aos efeitos anti-inflamatórios de bactérias probióticas no tratamento de doenças intestinais humanas e em mamute animal
Descrição: Projeto CAPES/COFECUB (849/15) - Cooperação Internacional.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2015 - Atual
Identificação de Proteínas Efetoras do Sistema de Secreção Tipo VII de Corynebacterium pseudotuberculosis sob condições de estresse biologicamente relevantes e avaliação dos seus papéis nos mecanismos de interação com o hospedeiro
Descrição: A linfadenite caseosa é uma enfermidade crônica causada por bactérias Gram-positivas, intracelulares facultativas, da espécie Corynebacterium pseudotuberculosis, que acomete pequenos ruminantes. Essa bactéria pode infectar tanto animais de importância econômica (por ex. caprinos, ovinos, bovinos e equinos) quanto animais silvestres e o homem. A patologia é caracterizada pela presença de granulomas nos linfonodos viscerais e superficiais, ocasionando grandes perdas econômicas decorrente da condenação de carcaças, pele e reprodutividade reduzida. No Brasil, estimativas demonstram que a maior parte dos rebanhos esteja infectada, fato esse que é agravado pela inexistência de métodos profiláticos satisfatórios para o controle da LC. Ainda há um conhecimento restrito sobre os determinantes moleculares de virulência de C. pseudotuberculosis, bem como sobre o controle da sua expressão gênica. Sabe-se que durante o processo infeccioso, essa bactéria é exposta a uma gama de diferentes ambientes, desde o ponto de entrada no hospedeiro, passando pelo sistema linfático, até a replicação intracelular dentro de macrófagos e o estabelecimento de lesões. Dessa forma, a resposta bacteriana aos estresses intracelulares representa um importante fator atuante nesse processo. Muitas proteínas secretadas por agentes patogênicos são liberadas ou "injetadas" às células hospedeiras para modificar a fisiologia celular e promover a colonização com o auxílio de proteínas efetoras e toxinas. Uma maquinaria de secreção específica das bactérias Gram-positivas é o sistema do tipo VII (T7SS), que tem sido amplamente descrito em M. tuberculosis por ser constituído de três proteínas essenciais para a virulência desta bactéria. Há relatos da presença desse sistema nas corinebactérias, mas não tem sido estudado profundamente até o momento. Nesse contexto, o objetivo deste projeto é identificar e avaliar as proteínas efetoras (PEs) do T7SS de C. pseudotuberculosis, levando em consideração as condições do ambiente intracelular. Para isso, iremos submeter a bactéria à condições de estresse e identificar as proteínas diferencialmente expressas. Paralelamente, serão geradas linhagens mutantes para PEs do T7SS para avaliar a viabilidade dos macrófagos infectados com essas linhagens. Finalmente, iremos avaliar a persistência da enfermidade em camundongos após a infecção com as linhagens mutantes, assim como a produção de citocinas. Esperamos que através desse projeto novas PEs importantes para a virulência de C. pseudotuberculosis sejam identificadas sob condições de estresse, e assim possamos avançar nossos estudos na busca por métodos mais eficazes para controlar as doenças causadas por esse patógeno..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Doutorado: (1) .
Integrantes: Artur Luiz da Costa da Silva - Coordenador / Vasco - Integrante / Núbia Seyffert - Integrante.Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.
2015 - Atual
ARTEMan:Transferência de resistência a antibióticos entre o Ambiente e o Homem
Descrição: Projeto de cooperação internacional FCT CAPES Edital CAPES-FCT 039/2014. Universidade de Aveiro Profa. Dra. Isabel da Silva Henriques Resumo: A resistência a antibióticos foi eleita pela Organização Mundial de Saúde (OMS) como uma das maiores ameaças do século para a Saúde Humana. Um relatório publicado pela OMS em Abril de 2014 antevê uma era pós-antibióticos onde pequenas infecções irão matar novamente (1). Também de acordo com o centro Europeu de Controle e Prevenção de Doenças, os níveis de resistência a antibióticos na Europa são elevados e continuam a aumentar (2). Todos os anos mais de 25.000 cidadãos europeus morrem como consequência de infeções multiresistentes (2). Os custos estimados são de mais de 1.5 biliões de euros por ano (2). Por estas razões, é crucial tomar medidas que revertam a disseminação de resistência a antibióticos. Existem poucos antibióticos ainda eficazes contra estirpes multiresistentes, como é o caso dos carbapenemos. Estes são a escolha principal para o tratamento de infeções graves quando as outras opções terapêuticas se revelam ineficazes. De modo a evitar a disseminação de resistência, o uso de carbapenemos tem sido restrito em vários países, incluindo Portugal e Brasil (1-3). Apesar disso, os níveis de resistência a carbapenemos têm vindo a aumentar e novos mecanismos de resistência foram identificados (1, 2), constituindo um grave problema à escala mundial. O mecanismo mais comum de resistência a carbapenemos é a produção de carbapenemases, enzimas que hidrolisam e inativam estes compostos (4). Estudos recentes confirmaram que o Ambiente tem um papel central como reservatório de resistência a antibióticos e também na disseminação dessa resistência (4, 5). Bactérias resistentes a antibióticos e genes de resistência são liberados em sistemas aquáticos, facilitando a dispersão de características de multiresistência (4). Os sistemas aquáticos poluídos apresentam níveis mais elevados de contaminação com bactérias que transportam genes de resistência frequentemente associados a elementos genéticos móveis e que constituem ameaças sérias em meios hospitalares (5, 6). Apesar da enorme relevância desta temática em termos de saúde pública, o reservatório ambiental de resistência a carbapenemos tem sido pouco explorado. Alguns estudos descreveram carbapenemases em isolados de meios aquáticos (7, 8), algumas das quais clinicamente relevantes (9). Por outro lado, a origem putativa de algumas carbapenemases foi atribuída a bactérias ubíquas em ambientes aquáticos (10). A resistência a carbapenemos pode ser transferida do Ambiente para bactérias associadas ao Homem, incluindo patógenos humanos. No entanto, as vias que permitem esta difusão são ainda desconhecidas. É assim de extrema importância identificar e caracterizar os microorganismos que medeiam a transferência de resistência entre os dois ambientes. Escherichia coli faz parte da microflora intestinal do Homem e de outros animais de sangue quente. Apesar de se tratar de um microrganismo comensal, algumas estirpes são patogênicas para o Homem (11). Recentemente foi demonstrado que a E. coli pode persistir e proliferar em meios aquáticos (12). A resistência a carbapenemos em estirpes de E. coli tem aumentado nos últimos anos (2). As razões apresentadas fundamentam a hipótese que E. coli será um mediador chave de transferência de resistência a carbapenemos entre o Homem e o Ambiente..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2014 - Atual
REDE DE COOPERAÇÃO ACADÊMICA EM GENÔMICA FUNCIONAL E BIOLOGIA DE SISTEMAS DE MICRORGANISMOS
Descrição: Objetivo Geral Estabelecer uma rede de intercâmbio e formação de recursos humanos especializados em Genômica Funcional e Biologia de Sistemas de Microrganismos, através do fortalecimento e ampliação de colaborações científicas já existentes entre grupos das regiões Norte, Nordeste e Sudeste do Brasil, com ênfase especial na mitigação de desigualdades inter-regionais e na consolidação de programas de Pós-Graduação em áreas estratégicas. Objetivos Específicos - Implementar um plano de intercâmbio de estudantes de iniciação científica, mestrado e doutorado entre a UFPA, a UFMG e a UFBA. - Realizar missões de docência e pesquisa junto aos programas de pós-graduação em Genética e Biologia Molecular da UFPA (CAPES 6), Bioinformática da UFMG (CAPES 6) e Biotecnologia da UFBA (CAPES 4). - Organizar cursos avançados de formação de estudantes em metodologias e ferramentas de bioinformática essenciais para o desenvolvimento de projetos envolvendo análise genômica estrutural e funcional e biologia de sistemas de microrganismos. - Oferecer acesso para os estudantes dos programas de PG participantes da rede de cooperação aos equipamentos e tecnologias de vanguarda já implementadas em alguns dos grupos de pesquisa. - Treinar equipe multidisciplinar de estudantes para atuação na área emergente de Biologia de Sistemas de Microrganismos. - Qualificar recursos humanos através de estágios de pós-doutoramento. - Implementar e consolidar áreas de investigação de fronteira do conhecimento nas diferentes IES participantes da rede de cooperação. EDITAL N° 071/2013 - PROGRAMA NACIONAL DE COOPERAÇÃO ACADÊMICA - PROCAD.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (9) Doutorado: (5) .
Integrantes: Artur Luiz da Costa da Silva - Coordenador / Sidney Batista dos Santos - Integrante / Pacheco, Luis G. C. - Integrante / Vasco Ariston de Carvalho Azevedo - Integrante / Adriana Ribeiro Carneiro - Integrante / Andrea Kely Campos Ribeiro dos Santos - Integrante / Rommel Ramos - Integrante.Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.
2014 - Atual
O genoma do búfalo do Marajó
Descrição: Recentes avanços na biologia molecular tem levado a uma rápida obtenção de genomas completos de animais domésticos. Em relação a genômica aplicada a pecuária foram identificadas regiões gênicas ligadas a produção e qualidade do leite e queijo, a incidência de doenças hereditárias, resistência e susceptibilidade a verminose, maciez e marmoreio da carne, ganho de peso, entre outras. A tendência é um aumento na geração de novas informações sobre regiões gênicas e genes que possam influenciar na produção, saúde e qualidade das populações de animais criadas para alimentação humana. Estas informações tiveram um grande impacto no delineamento de novas opções tecnológicas para os sistemas produtivos, destacando-se as associadas ao melhoramento genético. Os programas de melhoramento genético animal estão baseados na correta identificação de animais superiores, que serão os progenitores das futuras gerações. Técnicas reprodutivas, tais como inseminação artificial e transferência de embriões, vêm sendo utilizadas pelos pesquisadores para aumentar o número de progênies de animais geneticamente superiores. Em 2008 o Governo do Pará implanta sua Rede Genoma consolidando a competência em Genômica e Bioinformática na Região Amazônica. Esta ação governamental visa a oferta de serviços biotecnológicos que atendam à demanda da sociedade paraense e da região. Atividades de pesquisa e ensino desenvolvidas na Rede Genoma Pará permitiram a criação de um núcleo atuante em Genômica e Bioinformática no Brasil, que hoje conta com 51 projetos de sequenciamento de micro-organismos no NCBI, fazendo deste programa de pesquisa o maior colaborador latino americano junto ao NCBI. Um outro feito que merece destaque foi a recente publicação do primeiro genoma de um ameríndio realizado integralmente na UFPA..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) .
Integrantes: Artur Luiz da Costa da Silva - Coordenador / Maria Silvanira Barbosa - Integrante / Soraya Silva Andrade - Integrante / Vasco Ariston de Carvalho Azevedo - Integrante / Adriana Ribeiro Carneiro - Integrante / Rommel Thiago Juca Ramos - Integrante.Financiador(es): Fundação Amazônia Paraense de Amparo à Pesquisa - Auxílio financeiro.
2014 - Atual
Estudo do interatoma e exossoma em Corynebacterium pseudotuberculosis para pesquisa de novos alvos terapêuticos

Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Rommel Thiago Juca Ramos em 06/08/2015.
Descrição: Micro-organismos do gênero Corynebacterium são classificados no grupo CMNR, do qual também fazem parte os gêneros Mycobacterium, Nocardia e Rhodococcus. Este compreende um dos grupos mais importantes do domínio bactéria, pois contém espécies de interesse médico, veterinário e biotecnológico (Khamis et al., 2004; Dorella et al., 2006). Dentre estas espécies podemos destacar o patógeno de animais Corynebacterium pseudotuberculosis, que é o agente etiológico da linfadenite caseosa (CLA caseous lymphadenitis), uma doença que acomete principalmente ovinos e caprinos ao redor de todo o mundo (Dorella et al., 2006). Mundialmente, o Agronegócio vem sofrendo perdas consideráveis em decorrência da infecção provocada pela bactéria patogênica C. pseudotuberculosis em seus diferentes hospedeiros. Esta bactéria foi inicialmente identificada como micro- organismo causador da linfadenite caseosa em caprinos e ovinos, porém também já foi isolada de outras espécies, como camelídeos, bovinos, bubalinos, equinos causando linfangite ulcerativa e até em humanos (Yeruham et al., 2004; Williamson, 2001; Selim, 2001), e ainda não existem soluções para combater eficientemente as doenças provocadas por este micro-organismo. O Brasil tornou-se referência na análise molecular desta espécie, e até junho de 2013, 15 linhagens de C. pseudotuberculosis foram isoladas e tiveram seus genomas sequenciados e analisados, revelando importantes características da espécie e agregando novos conhecimentos a cerca da problemática econômica e biológica da C. pseudotuberculosis (Soares et al., 2013). A linfadenite caseosa, caracteriza-se pela formação de abscessos contendo pus de coloração amarelo esverdeado e consistência viscosa. Pode ocorrer sob duas formas clínicas, uma superficial que acomete os linfonodos palpáveis (LC externa), e outra forma visceral que acomete os linfonodos internos (LC visceral) e órgãos como pulmão, rim, fígado (Dorella et al., 2006). O tratamento é feito principalmente pelo uso de antibióticos, porém apresenta um custo elevado e é pouco eficaz, uma vez que as drogas não penetram na cápsula dos abscessos. Por isso a importância de se desenvolver uma vacina potente, segura e realmente protetora. Algumas vacinas já vêm sendo pesquisadas, inclusive de DNA, mas o resultado ainda não é satisfatório (Dorella et al., 2006; Baird & Fontaine, 2007). O diagnóstico da linfadenite caseosa é principalmente clínico. Observa-se no animal acometido, a formação de grandes caroços, geralmente na cabeça, mandíbula e pescoço. Por ser contagiosa, a doença propaga-se nos rebanhos principalmente pelo contato direto entre animais. Em alguns casos, a infecção produz poucos sintomas evidentes, permanecendo indetectável até que um exame post-mortem seja realizado. Assim, o diagnóstico clínico tardio é um dos principais problemas (Alves & Pinheiro, 2000). Quando se verifica a lesão nodular (o caroço), o animal já pode estar francamente comprometido, com perda de peso e do rendimento da produção de carne e/ou leite. Neste caso a única solução, para evitar a propagação, é o descarte de animais acometidos, inclusive a carcaça, não havendo sequer o aproveitamento do couro (Veschi, 2005). O tamanho e a severidade da lesão dependem do número inicial de microrganismo que penetraram no tecido do hospedeiro, da velocidade de multiplicação do microrganismo e da susceptibilidade do hospedeiro em se defender da bactéria, entretanto isso parece ter pouca relação com a duração da infecção. A patogenia tem início quando bactérias penetram no organismo, se multiplicam e são fagocitadas. A sobrevivência intracelular em fagócitos é o principal fator para a disseminação e a eventual formação dos abscessos, que é mediado pelos fatores de virulência (Jolly, 1966)..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2013 - Atual
Rede de cooperação acadêmica para o estudo e desenvolvimento de ferramentas para a genômica estrutural e funcional
Descrição: OBJETIVOS Fortalecer e ampliar o intercâmbio acadêmico entre os programas inter-unidades de Pós-Graduação em Bioinformática da UFMG (CAPES 6) e da USP (5), o de Biotecnologia da UFPA (CAPES 5) e o de Bioinformática da UFPR (CAPES 3) com a criação de uma rede voltada a aumentar a formação de recursos humanos em Biologia Computacional, em resposta à presente chamada. OBJETIVOS ESPECÍFICOS: i) Formar de recursos humanos em nível de iniciação científica, mestrado e doutorado; ii) Qualificar de pessoal através de estágios de pós-doutoramento; iii) Publicar em revistas indexadas entre os docentes e discentes; iv) Transferir tecnologias, protocolos e desenvolver pipelines; v) Democratizar de competências; vi) Mitigar das desigualdades intra-regionais; vii) Implantar de áreas de investigação de fronteira do conhecimento. viii) Estabelecer interação com o ensino médio para fomentar o interesse científico e atrair novos talentos; ix) Produzir conhecimento e inovação tecnológica na área de Bioinformática, Biologia Computacional e Biologia de Sistemas; x) Fortalecer e ampliar a área de anotação estrutural e funcional de genomas.nos Programas de pós-graduação envolvidos. xi) Apoiar a implantação de um Programa de Pós-graduação em Bioinformática na Amazônia. CAPES Edital nº 51/2013 BIOLOGIA COMPUTACIONAL.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2013 - Atual
Avaliação do Potencial de Biorremediação da Amazônia Atlântica pela Indústria de Petróleo
Descrição: Apesar de o Brasil ser um dos lideres mundiais em investimentos na área de energias renováveis, este ainda tem uma tradição e atual domínio de sua matriz energética por combustíveis fósseis, predominantemente o petróleo (Sachs 2005; Goldemberg & Lucon 2007). Inclusive, a expansão recente na rede de infraestrutura brasileira é em grande parte resultado dos investimentos no setor energético, essencialmente a exploração de petróleo e gás natural na costa brasileira, tal como realizado no projeto Pré-sal, na Bacia de Santos. Fator que contribuiu para o crescimento expressivo do país, bem como o desenvolvimento econômico e social. Aliado a esse desenvolvimento, houvera um aumento significativo da população e consequentemente um aumento na demanda de energia. Desta forma, para suprir essa demanda, umas das medidas necessárias é a busca por novas áreas de exploração de petróleo, a exemplo da Bacia Pará-Maranhão (Tolmasquim 2012). A importância do petróleo para o cotidiano da população e da indústria nacional e mundial como destacada acima, também traz consigo um grande risco ao meio ambiente. Risco o qual está associado a derramamentos e vazamentos acidentais durante os processos de exploração, produção, refinamento e principalmente transporte e armazenamento deste produto e seus derivados. Grandes desastres ambientes, tal como o do navio Exxon Valdez e da plataforma Deepwater Horizon, deterioram o ecossistema local e por isso atraem a atenção para estudos de comunidades em áreas contaminadas ou de possível contaminação por petróleo (Leahy & Colwell 1990; Das & Chandran 2011; Atlas & Hazen 2011). O petróleo é constituído, predominantemente por hidrocarbonetos, que podem chegar a 97% de sua composição e, em menor quantidade, de derivados orgânicos sulfurados, nitrogenados, oxigenados e organo-metálicos (Atlas, 1981; Atlas, 1995; Mair & Schicktanz, 1936; Posthuma, 1977; Santos et al, 2010). Devido à predominância dos hidrocarbonetos no petróleo, esses são os compostos mais utilizados como indicadores deste tipo de poluição, e podem ser divididos em quatro classes: os saturados, os aromáticos, asfaltenos (fenóis, ácidos graxos, cetonas, ésteres e porfirinas), e as resinas (piridinas, quinolinas, carbazóis, sulfóxidos e amidas) (Colwell 1977). A biodegradação por microrganismos representa um dos primeiros mecanismos de remoção de petróleo e hidrocarbonetos do ambiente, além de ser o método mais barato de biorremediação (Leahy & Colwell 1990), porém é um processo complexo que depende da natureza e da quantidade de hidrocarbonetos presentes. A suscetibilidade dos hidrocarbonetos do petróleo a degradação microbiana é ordenada da seguinte forma: alcanos lineares > alcanos ramificados > pequenos aromáticos > alkanos cíclicos. Os Hidrocarbonetos Policíclicos Aromáticos (HPAs) merecem atenção especial por serem de difícil degradação e um dos mais tóxicos ao homem. A biodegradação destes hidrocarbonetos do petróleo já foi reportada em diversos trabalhos, e mais de 79 gêneros bacterianos já foram identificados como capazes de realizar a degradação (Head et al. 2006). 6 A biodegradação microbiana de hidrocarbonetos do petróleo envolve um ataque oxidativo inicial intracelular dos poluentes orgânicos catalisada por oxigenases e peroxidases. Vias de degradação periféricas convertem poluentes orgânicos em intermediários do metabolismo central, por exemplo, o ciclo de ácido tricarboxilico. A biossíntese de biomassa celular ocorre a partir dos precursores metabólitos centrais, por exemplo, acetil-CoA, succinato e piruvato. Açúcares necessários para várias biossínteses são sintetizados através da gliconeogênese (Das & Chandran, 2011)..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2013 - Atual
Análise Pangenômica de Corinebactérias Patogênicas Emergentes
Descrição: O número de espécies do gênero Corynebacterium identificadas como causadoras de infecções oportunistas e infecções nosocomiais em humanos vem crescendo bastante atualmente e a importância das corinebactérias para os microbiologistas clínicos e profissionais da saúde aumentou muito nos últimos anos. As espécies patogênicas deste gênero incluem as bactérias potencialmente produtoras de toxina diftérica, principalmente Corynebacterium diphtheriae, e as Corynebacterium spp. não diftéricas. Estas últimas podem ser encontradas naturalmente na mucosa e na microbiota normal da pele, mas o aumento dramático no número de indivíduos susceptíveis na atualidade, incluindo Página 1 de 13pacientes recebendo terapia imunossupressora, vem contribuindo para a identificação cada vez mais freqüente de espécies patogênicas emergentes. Em estudos recentes no Brasil, corinebactérias nãodiftéricas do complexo XSMA (Corynebacterium xerosis, Corynebacterium striatum, Corynebacterium minutissimum e Corynebacterium amycolatum) foram relatadas como importantes agentes causadores de infecções em pacientes com câncer. Estas bactérias têm sido isoladas de diversas fontes, incluindo ferimentos cirúrgicos, trato urinário, trato respiratório, tumores ulcerados e cateteres venosos. As espécies mais comumente isoladas são C. amycolatum e C. minutissimum. Tem sido relatado também um aumento na incidência de outra corinebactéria patogênica emergente, a C. pseudodiphtheriticum. Esta espécie também foi identificada como causadora de um surto de infecções respiratórias recentes em crianças com fibrose cística, na França. Embora estas espécies emergentes sejam geralmente de baixa virulência, as infecções que elas causam podem ser muito severas ou até mesmo fatais quando a terapia antimicrobiana efetiva não é iniciada precocemente, principalmente porque alguns isolados já apresentam resistência múltipla a antibióticos. No entanto, não é incomum encontrar trabalhos relatando identificações ambíguas e até mesmo incorretas destas bactérias pelos métodos mais amplamente utilizados, que se baseiam principalmente em testes bioquímicos, como o sistema API (Rapid) Coryne?. Ainda assim, a empresa líder mundial no fornecimento de kits semi-automatizados para identificação bioquímica de corinebactérias, a empresa bioMérieux, registrou no último ano um aumento significativo nas suas vendas para países do bloco de mercados emergentes, incluindo o Brasil. Atualmente, o auxílio de métodos moleculares baseados no seqüenciamento de genes tem contribuído para avanço no diagnóstico rápido. Dessa forma, justifica-se a realização de um estudo mais detalhado do metabolismo de diferentes isolados destas bactérias emergentes. Neste contexto, o principal objetivo deste projeto é combinar métodos de genômica estrutural e funcional numa estratégia sistêmica para entender a variabilidade bioquímica normalmente observada entre diferentes isolados de corinebactérias patogênicas emergentes, além de identificar novos determinantes moleculares de virulência para um conhecimento mais aprofundado da patogênese bacteriana, e também a seleção de candidatos para o desenvolvimento de medidas profiláticas eficientes contra as enfermidades causadas por C. pseudotuberculosis. Será utilizado um método de seqüenciamento de nova geração de vanguarda que, combinados com estratégias bioinformáticas já disponíveis, permitirá que a montagem e anotação dos genomas sejam feitas em tempo recorde. Espera-se que os resultados gerados neste trabalho contribuam significativamente para a identificação rápida e segura destas corinebactérias no futuro próximo, além melhorar nossa compreensão em escala genômica acerca dessas novas espécies patogênicas do gênero..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (2) .
Integrantes: Artur Luiz da Costa da Silva - Coordenador / Maria Silvanira Barbosa - Integrante / Soraya Silva Andrade - Integrante / Vasco Ariston de Carvalho Azevedo - Integrante / Adriana Ribeiro Carneiro - Integrante / Rafael A. Barauna - Integrante / Diego Assis das Graças - Integrante / Rommel Ramos - Integrante.Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
2012 - 2014
GENÉTICA APLICADA AO MONITORAMENTO E CONSERVAÇÃO DA ICTIOFAUNA

Projeto certificado pela empresa Leme Engenharia em 21/09/2012.
Descrição: PBA UHE BELO MONTE.
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
2012 - Atual
NEAR: Ambientes naturais como reservatórios de resistência a antibióticos de último recurso
Descrição: A resistência bacteriana a antibióticos foi recentemente considerada pela Organização Mundial da Saúde como uma das três maiores ameaças deste século em termos de saúde pública, aumentando consideravelmente a mortalidade associada a doenças infecciosas. A utilização de antibióticos de último recurso, como carbapenemos, tem sido restringida para prevenir a disseminação da sua resistência. Em ambientes naturais esta dispersão está certamente no início, o que constitui uma oportunidade para estudar e compreender o processo de disseminação e de evolução dos genes de resistência a carbapenemos. Os objetivos do projeto são: (i) caracterizar o reservatório de genes que codificam para carbapenemases num sistema aquático; (ii) integrar dados de abundância, diversidade de genes e dados ambientais para elucidar vias de disseminação e evolução destes genes; (iii) avaliar o potencial da resistência a carbapenemos como indicador de disseminação de resistência e de risco para a saúde humana....
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (1) .
Integrantes: Artur Luiz da Costa da Silva - Coordenador / Adriana Ribeiro Carneiro - Integrante / Rafael A. Barauna - Integrante / Diego Assis das Graças - Integrante / Rommel Ramos - Integrante / Isabel da Silva Henriques - Integrante.Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.
2011 - 2014
Emissões de gases de efeito estufa em reservatórios de centrais hidrelétricas
Descrição: Objetivos Investigar o papel dos microorganismos presente em reservatórios hidrelétricos na produção e consumo de metano. Específicos: Isolar, cultivar e caracterizar morfológica e geneticamente arquéias metanogênicas nos reservatórios objeto de estudo. Isolar, cultivar e caracterizar morfológica e geneticamente bactérias metanotróficas nos reservatórios objeto de estudo Correlacionar os componentes microbianos com parâmetros físico-químicos dos lagos: Temperatura, profundidade, pH, redox, condutividade, oxigênio, turbidez, amônia, nitrato, cloretos, metano, oxigênio, nitrogênio, hidrogênio, monóxido e dióxido de carbono. Medir a expressão do gene mcrA, envolvido na metanogênese Medir a expressão do gene pmoA, envolvido na metanotrofia Gerar uma estimativa do balanço de produção/consumo de metano nos reservatórios.
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (2) .
Integrantes: Artur Luiz da Costa da Silva - Coordenador / Vivian Helena Pellizari - Integrante.Financiador(es): Centrais Elétricas do Norte do Brasil - Auxílio financeiro.
2010 - 2013
Núcleo Amazônico de Excelência em Genômica de Microorganismos
Descrição: Investimentos na formação de recursos humanos e na implantação de infra-estrutura fizeram do Pará um estado referência na genética. O início da genômica na Amazônia remota aos trabalhos pioneiros dos grupos da Genética Animal e da Genética Humana. No primeiro momento fazendo uso de sequenciamento manual, posteriormente automatizado, construção de bibliotecas genômicas de grandes fragmentos, e em 2000 a UFPA integra a BRgene e em 2005 a Rede Nacional de Proteômica. O grupo paraense organiza-se, realiza parcerias e fazendo uso da moderna Plataforma de Sequenciamento do Laboratório de Engenharia Biológica do PCT-Guamá, estabelece a Rede Paraense de Genômica e Proteômica, concluindo em maio de 2009, o primeiro sequenciamento de próxima geração na América Latina. Foram decodificadas naquele momento duas linhagens de Corynebacterium pseudotuberculosis, isoladas de cavalo e camelo. Os primeiros organismos do Pangenoma de Coryne são montados, anotados e curados em prazo recorde de 21 dias. A associação do grupo do Pará com pesquisadores da Rede Genoma Minas foi decisiva para o sucesso alcançado até o momento. A consolidação e ampliação desta parceria, com foco na genômica de microrganismos, formação em alto nível de recursos humanos e geração de publicações de impacto internacional é objeto de interesse deste projeto. Nossa meta é a consolidação de um núcleo referência internacional no aproveitamento biotecnológico de genomas de microrganismos na Amazônia brasileira..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (2) .
Integrantes: Artur Luiz da Costa da Silva - Coordenador / Maria Silvanira Barbosa - Integrante / Soraya Silva Andrade - Integrante / Maria Paula C Schneider - Integrante / Vasco Ariston de Carvalho Azevedo - Integrante / Rommel Ramos - Integrante / Adriana - Integrante.Financiador(es): Fundação Amazônia Paraense de Amparo à Pesquisa - Auxílio financeiro.
2004 - 2004
Isolamento e caracterização genômica do gene da miostatina em búfalos de pântano
Descrição: Isolamento e carcaterização genômica do gene da miostatina em Búfalos de pântano. CAPES/DAAD.
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) .
Integrantes: Artur Luiz da Costa da Silva - Coordenador.Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.


Membro de corpo editorial


2014 - Atual
Periódico: Frontiers in Bioscience (Print)
2013 - Atual
Periódico: BMC Microbiology (Online)
2012 - Atual
Periódico: Integrative Omics and Molecular Biology
2011 - 2012
Periódico: Advances in Integrative Omics and Applied Biotechnology


Revisor de periódico


2009 - Atual
Periódico: ISME Journal
2009 - Atual
Periódico: Molecular Biology and Evolution
2009 - Atual
Periódico: International Journal of Primatology
2011 - Atual
Periódico: Veterinary Pathology
2012 - Atual
Periódico: Anais da Academia Brasileira de Ciências (Impresso)
2015 - Atual
Periódico: Bioinformatics and Biology Insights
2015 - Atual
Periódico: Bioinformatics and Biology Insights
2015 - Atual
Periódico: Gene Regulation and Systems Biology


Revisor de projeto de fomento


2015 - Atual
Agência de fomento: Instituto Antártico Chileno


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.
2.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Animal.


Idiomas


Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Alemão
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Espanhol
Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.
Francês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.


Prêmios e títulos


2015
Melhor foto - 1o Spotter Day Val de Cans, infraero Aeroportos.
2015
Honra ao merito - 1o Spotter Day Val de Cans, Infraero Aeroportos.
2009
Comenda Gaspar Viana, Estado do Pará - Câmara Municipal de Belém. Decreto legislativo 243 18/11/2009.
2008
Voto de aplauso - Requerimento No. 452 de 2008 - Senador Arthur Virgílio, Senado Federal.
2007
Membro afiliado da Academia Brasileira de Ciências, Academia Brasileira de Ciências.


Produções



Produção bibliográfica
Citações

Web of Science
Total de trabalhos:163
Total de citações:1586
Fator H:17
Silva, Artur  Data: 19/01/2018

SCOPUS
Total de trabalhos:123
Total de citações:1226
Silva, Artur L C Da; Silva, Artur Luiz Da Costa Da  Data: 08/10/2015

Outras
Total de trabalhos:163
Total de citações:1525
Artur Silva  Data: 18/08/2015

Artigos completos publicados em periódicos

1.
ESLABÃO, MARCUS REDÜ2018ESLABÃO, MARCUS REDÜ ; KREMER, FREDERICO SCHMITT ; RAMOS, ROMMEL THIAGO JUCA ; SILVA, ARTUR LUIZ DA COSTA DA ; AZEVEDO, Vasco Ariston de Carvalho ; PINTO, LUCIANO DA SILVA ; SILVA, ÉVERTON FAGONDE DA ; DELLAGOSTIN, ODIR ANTÔNIO . Genome of Leptospira borgpetersenii strain 4E, a highly virulent isolate obtained from Mus musculus in southern Brazil. MEMORIAS DO INSTITUTO OSWALDO CRUZ, v. 113, p. 137-141, 2018.

2.
ARAUJO, FABRICIO ALMEIDA2018ARAUJO, FABRICIO ALMEIDA ; Barh, Debmalya ; Silva, Artur ; GUIMARÃES, LUIS ; RAMOS, ROMMEL THIAGO JUCA . GO FEAT: a rapid web-based functional annotation tool for genomic and transcriptomic data. Scientific Reports, v. 8, p. 1794, 2018.

3.
HASSAN, SYED S.2018HASSAN, SYED S. ; JAMAL, SYED B. ; RADUSKY, LEANDRO G. ; Tiwari, Sandeep ; ULLAH, ASAD ; ALI, JAVED ; DE CARVALHO, PAULO V. S. D. ; SHAMS, RIDA ; KHAN, SABIR ; FIGUEIREDO, HENRIQUE C. P. ; Barh, Debmalya ; GHOSH, PREETAM ; Silva, Artur ; Baumbach, Jan ; RÖTTGER, RICHARD ; TURJANSKI, ADRIÁN G. ; AZEVEDO, VASCO A. C. . The Druggable Pocketome of Corynebacterium diphtheriae: A New Approach for in silico Putative Druggable Targets. Frontiers in Genetics, v. 9, p. NA, 2018.

4.
DIAS, LARISSA M2018DIAS, LARISSA M ; FOLADOR, ADRIANA R C ; OLIVEIRA, AMANDA M ; RAMOS, ROMMEL T J ; Silva, Artur ; BARAÚNA, RAFAEL A . Genomic Architecture of the Two Cold-Adapted Genera Exiguobacterium and Psychrobacter: Evidence of Functional Reduction in the Exiguobacterium antarcticum B7 Genome. Genome Biology and Evolution, v. 10, p. 731-741, 2018.

5.
SANTOS, ANDRÉ S.2018SANTOS, ANDRÉ S. ; RAMOS, ROMMEL T. ; Silva, Artur ; Hirata, Raphael ; Mattos-Guaraldi, Ana L. ; Meyer, Roberto ; AZEVEDO, VASCO ; FELICORI, LIZA ; Pacheco, Luis G. C. . Searching whole genome sequences for biochemical identification features of emerging and reemerging pathogenic Corynebacterium species. FUNCTIONAL & INTEGRATIVE GENOMICS, v. NE, p. NE, 2018.

6.
DA COSTA, WANA LAILAN OLIVEIRA2018DA COSTA, WANA LAILAN OLIVEIRA ; ARAÚJO, CARLOS LEONARDO DE ARAGÃO ; DIAS, LARISSA MARANHÃO ; PEREIRA, LINO CÉSAR DE SOUSA ; ALVES, JORIANNE THYESKA CASTRO ; ARAÚJO, FABRÍCIO ALMEIDA ; FOLADOR, EDSON LUIZ ; HENRIQUES, ISABEL ; SILVA, A. ; CARNEIRO, A. R. . Functional annotation of hypothetical proteins from the Exiguobacterium antarcticum strain B7 reveals proteins involved in adaptation to extreme environments, including high arsenic resistance. PLoS One, v. 13, p. e0198965, 2018.

7.
VERAS, ALLAN2018VERAS, ALLAN ; ARAUJO, FABRICIO ; PINHEIRO, KENNY ; Guimarães, Luis ; Azevedo, Vasco ; Soares, Siomar ; SILVA, A. ; Ramos, R. T. J. . Pan4Draft: A Computational Tool to Improve the Accuracy of Pan-Genomic Analysis Using Draft Genomes. Scientific Reports, v. 8, p. 9670, 2018.

8.
MOURA, FÁBIO GOMES2018MOURA, FÁBIO GOMES ; GRAÇAS, Diego Assis das ; Santos, Agenor Valadares ; SILVA, ARTUR LUIZ DA COSTA DA ; ROGEZ, HERVÉ . Dynamics and diversity of the bacterial community during the spontaneous decay of açai ( Euterpe oleracea ) fruits. BRAZILIAN JOURNAL OF MICROBIOLOGY, v. NE, p. NE, 2018.

9.
GOMIDE, ANNE CYBELLE PINTO2018GOMIDE, ANNE CYBELLE PINTO ; IBRAIM, IZABELA COIMBRA ; ALVES, JORIANNE T.C. ; DE SÁ, PABLO GOMES ; DE OLIVEIRA SILVA, YURI RAFAEL ; SANTANA, MARIANA PASSOS ; Silva, Wanderson Marques ; FOLADOR, EDSON LUIZ ; MARIANO, DIEGO C.B. ; DE PAULA CASTRO, THIAGO LUIZ ; Barbosa, Silvanira ; Dorella, Fernanda Alves ; CARVALHO, ALEX F. ; PEREIRA, FELIPE L. ; LEAL, CARLOS A.G. ; FIGUEIREDO, HENRIQUE C.P. ; AZEVEDO, V. ; SILVA, A. ; FOLADOR, ADRIANA RIBEIRO CARNEIRO . Transcriptome analysis of Corynebacterium pseudotuberculosis biovar Equi in two conditions of the environmental stress. GENE, v. 1, p. 1010100, 2018.

10.
BARAÚNA, R. A.2017BARAÚNA, R. A. ; Ramos, Rommel T. J. ; VERAS, ADONNEY A. O. ; PINHEIRO, KENNY C. ; BENEVIDES, LEANDRO J. ; VIANA, MARCUS V. C. ; GUIMARÃES, LUÍS C. ; EDMAN, JUDY M. ; SPIER, SHARON J. ; AZEVEDO, VASCO ; SILVA, A. . Assessing the Genotypic Differences between Strains of Corynebacterium pseudotuberculosis biovar equi through Comparative Genomics. Plos One, v. 12, p. e0170676, 2017.

11.
BARAÚNA, R. A.2017BARAÚNA, R. A. ; Ramos, Rommel T. J. ; VERAS, ADONNEY A. O. ; DE SÁ, PABLO H. C. G. ; GUIMARÃES, LUÍS C. ; DAS GRAÇAS, DIEGO A. ; CARNEIRO, ADRIANA R. ; EDMAN, JUDY M. ; SPIER, SHARON J. ; AZEVEDO, VASCO ; SILVA, A. . Genomic analysis of four strains of Corynebacterium pseudotuberculosis bv. Equi isolated from horses showing distinct signs of infection. Standards in Genomic Sciences, v. 12, p. 16, 2017.

12.
Baraúna, Rafael2017Baraúna, Rafael ; FREITAS, DHARA ; PINHEIRO, JULIANA ; FOLADOR, ADRIANA ; Silva, Artur . A Proteomic Perspective on the Bacterial Adaptation to Cold: Integrating OMICs Data of the Psychrotrophic Bacterium Exiguobacterium antarcticum B7. Proteomes, v. 5, p. 9, 2017.

13.
SILVA, WANDERSON M.2017SILVA, WANDERSON M. ; Dorella, Fernanda A. ; Soares, Siomar C. ; SOUZA, GUSTAVO H. M. F. ; Castro, Thiago L. P. ; SEYFFERT, Núbia ; FIGUEIREDO, HENRIQUE ; MIYOSHI, Anderson ; LE LOIR, YVES ; Silva, Artur ; AZEVEDO, VASCO . A shift in the virulence potential of Corynebacterium pseudotuberculosis biovar ovis after passage in a murine host demonstrated through comparative proteomics. BMC Microbiology (Online), v. 17, p. 55, 2017.

14.
MARQUES, JOANA MONTEZANO2017MARQUES, JOANA MONTEZANO ; DE MOURA, VITÓRIA ALMEIDA GONÇALVES ; LIMA, ALYNE CRISTINA SODRÉ ; PAIXÃO, CARLA THAIS MOREIRA ; LOBATO, AMÁLIA RAIANA FONSECA ; ALVES, JORIANNE THYESKA CASTRO ; GUARALDI, ANA LUIZA DE MATTOS ; FOLADOR, ADRIANA RIBEIRO CARNEIRO ; Ramos, Rommel T. J. ; Silva, Artur . Draft Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis Strain PA06 Isolated from a Subauricular Abscess in an Ovine Host. Genome Announcements, v. 5, p. e00083-17, 2017.

15.
VIANA, MARCUS VINICIUS CANÁRIO2017VIANA, MARCUS VINICIUS CANÁRIO ; FIGUEIREDO, HENRIQUE ; Ramos, Rommel ; GUIMARÃES, LUIS CARLOS ; PEREIRA, FELIPE LUIZ ; DORELLA, FERNANDA ALVES ; SELIM, SALAH ABDEL KARIM ; SALAHELDEAN, MOHAMMAD ; Silva, Artur ; WATTAM, ALICE R. ; AZEVEDO, VASCO . Comparative genomic analysis between Corynebacterium pseudotuberculosis strains isolated from buffalo. PLoS One, v. 12, p. e0176347, 2017.

16.
LIMA, ALYNE CRISTINA SODRÉ2017LIMA, ALYNE CRISTINA SODRÉ ; DE MOURA, VITÓRIA ALMEIDA GONÇALVES ; PINHEIRO, KENNY DA COSTA ; PAIXÃO, CARLA THAIS MOREIRA ; DA COSTA, WANA LAILAN OLIVEIRA ; FOLADOR, ADRIANA RIBEIRO CARNEIRO ; GUARALDI, ANA LUIZA DE MATTOS ; Ramos, Rommel T. J. ; Silva, Artur ; MARQUES, JOANA MONTEZANO . Draft Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis Strain PA05 Isolated from an Ovine Host in Pará State, Brazil. GENOME ANNOUNCEMENTS, v. 5, p. e00082-17, 2017.

17.
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SILVA, WANDERSON M.2017SILVA, WANDERSON M. ; FOLADOR, EDSON L. ; Soares, Siomar C. ; SOUZA, GUSTAVO H. M. F. ; Santos, Agenor V. ; SOUSA, CASSIANA S. ; FIGUEIREDO, HENRIQUE ; MIYOSHI, Anderson ; LE LOIR, YVES ; Silva, Artur ; AZEVEDO, VASCO . Label-free quantitative proteomics of Corynebacterium pseudotuberculosis isolates reveals differences between Biovars ovis and equi strains. BMC GENOMICS, v. 18, p. 451, 2017.

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MOREIRA, EDITH C. O.2017MOREIRA, EDITH C. O. ; Pinheiro, Daniel G. ; GORDO, SHEILA M. C. ; RODRIGUES, SIMONE M. ; PESSOA, ELAINE ; SCHALLER, HUBERT ; DE LEMOS, ORIEL F. ; Silva, Artur ; SCHNEIDER, HORACIO ; Silva, Wilson A. ; Sampaio, Iracilda ; Darnet, Sylvain . Transcriptional profiling by RNA sequencing of black pepper (Piper nigrum L.) roots infected by Fusarium solani f. sp. piperis. ACTA PHYSIOLOGIAE PLANTARUM, v. 39, p. NE, 2017.

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Barh, Debmalya2017Barh, Debmalya ; GARCÍA-SOLANO, MARÍA ; Tiwari, Sandeep ; BHATTACHARYA, ANTARIPA ; Jain, Neha ; TORRES-MORENO, DANIEL ; FERRI, BELÉN ; Silva, Artur ; AZEVEDO, VASCO ; GHOSH, PREETAM ; BLUM, KENNETH ; CONESA-ZAMORA, PABLO ; PERRY, GEORGE . BARHL1 Is Downregulated in Alzheimer?s Disease and May Regulate Cognitive Functions through ESR1 and Multiple Pathways. Genes, v. 8, p. 245, 2017.

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GOMES DE SÁ, PABLO2017GOMES DE SÁ, PABLO ; VERAS, ADONNEY ; FONTANA, CARLA SUERTEGARAY ; ALEIXO, Alexandre ; BURLAMAQUI, Tibério ; MELLO, CLAUDIO VIANNA ; DE VASCONCELOS, ANA TEREZA RIBEIRO ; PROSDOCIMI, FRANCISCO ; Ramos, Rommel ; SCHNEIDER, MARIA ; Silva, Artur . The assembly and annotation of the complete Rufous-bellied thrush mitochondrial genome. Mitochondrial DNA Part A, v. 28, p. 231-232, 2017.

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JAMAL, SYED BABAR2017JAMAL, SYED BABAR ; HASSAN, SYED SHAH ; Tiwari, Sandeep ; VIANA, MARCUS V. ; BENEVIDES, LEANDRO DE JESUS ; ULLAH, ASAD ; TURJANSKI, ADRIÁN G. ; Barh, Debmalya ; GHOSH, PREETAM ; COSTA, DANIELA ARRUDA ; Silva, Artur ; RÖTTGER, RICHARD ; Baumbach, Jan ; AZEVEDO, VASCO A. C. . An integrative in-silico approach for therapeutic target identification in the human pathogen Corynebacterium diphtheriae. PLoS One, v. 12, p. e0186401, 2017.

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SANTOS, CAROLINA S.2017SANTOS, CAROLINA S. ; RAMOS, JULIANA N. ; VIEIRA, VERONICA V. ; PINHEIRO, CARINA S. ; MEYER, ROBERTO ; ALCANTARA-NEVES, NEUZA M. ; RAMOS, ROMMEL T. ; SILVA, A. ; Hirata, Raphael ; FELICORI, LIZA ; DE ALEGRÍA PUIG, CARLOS RUIZ ; NAVAS, JESÚS ; Azevedo, Vasco ; MATTOS-GUARALDI, A.L. ; PACHECO, LUIS G.C. . Efficient differentiation of Corynebacterium striatum , Corynebacterium amycolatum and Corynebacterium xerosis clinical isolates by multiplex PCR using novel species-specific primers. JOURNAL OF MICROBIOLOGICAL METHODS, v. 142, p. 33-35, 2017.

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GOMIDE, ANNE CYBELLE PINTO2017GOMIDE, ANNE CYBELLE PINTO ; DE SÁ, PABLO GOMES ; CAVALCANTE, ANA LIDIA QUEIROZ ; DE JESUS SOUSA, THIAGO ; GOMES, LUCAS GABRIEL RODRIGUES ; RAMOS, ROMMEL THIAGO JUCA ; Azevedo, Vasco ; Silva, Artur ; FOLADOR, ADRIANA RIBEIRO CARNEIRO . Heat shock stress: Profile of differential expression in Corynebacterium pseudotuberculosis biovar Equi. GENE, v. 645, p. 124-130, 2017.

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ALVES, JORIANNE T. C.2016ALVES, JORIANNE T. C. ; VERAS, ADONNEY A. O. ; CAVALCANTE, ANA LÍDIA Q. ; DE SÁ, PABLO H. C. G. ; DIAS, LARISSA M. ; Guimarães, Luis C. ; MORAIS, EZEQUIEL ; SILVA, ANDRÉ G. M. ; Azevedo, Vasco ; Ramos, Rommel T. J. ; Silva, Artur ; Carneiro, Adriana R. . Complete Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis Strain PA01, Isolated from Sheep in Pará, Brazil. Genome Announcements, v. 4, p. e01664-15, 2016.

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GOMES, JAQUELINE CONCEIÇÃO MEIRELES2016GOMES, JAQUELINE CONCEIÇÃO MEIRELES ; DE AZEVEDO, JULIANA SIMÃO NINA ; DE OLIVEIRA VERAS, ADONNEY ALLAN ; ALVES, JORIANNE THYESKA CASTRO ; HENRIQUES, ISABEL ; CORREIA, ANTÓNIO ; DA COSTA DA SILVA, ARTUR LUIZ ; Carneiro, Adriana Ribeiro . Draft genome sequence of Psychrobacter sp. ENNN9_III, a strain isolated from water in a polluted temperate estuarine system (Ria de Aveiro, Portugal). Genomics Data, v. 1, p. ON LINE, 2016.

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GUIMARÃES, LUIS CARLOS2016GUIMARÃES, LUIS CARLOS ; LOPES, Thiago ; Ramos, Rommel Thiago Jucá ; Carneiro, Adriana Ribeiro ; CAVALCANTE, ANA LÍDIA QUEIROZ ; BARRETO, DIEGO ; DE SÁ, PABLO CARACCIOLO GOMES ; VERAS, ADONNEY ALLAN OLIVEIRA ; Rocha, Flávia Souza ; BAGANO, PRISCILLA ; PEREIRA, FELIPE LUIZ ; DORELLA, FERNANDA ALVES ; LEAL, CARLOS AUGUSTO ; CARVALHO, ALEX FIORINI ; BIZET, CHANTAL ; Guiso, Nicole ; BADELL, EDGAR ; FIGUEIREDO, HENRIQUE CÉSAR PEREIRA ; Azevedo, Vasco ; Silva, Artur . Draft Genome Sequences of Two Pathogenic Corynebacterial Species Isolated from Cows. Journal of Genomics, v. 4, p. 7-9, 2016.

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ARAÚJO, CARLOS LEONARDO DE A.2016ARAÚJO, CARLOS LEONARDO DE A. ; DIAS, LARISSA M. ; VERAS, ADONNEY A. O. ; ALVES, JORIANNE T. C. ; CAVALCANTE, ANA LÍDIA Q. ; DOWSON, CHRISTOPHER G. ; Azevedo, Vasco ; Ramos, Rommel T. J. ; Silva, Artur ; Carneiro, Adriana R. . Whole-Genome Sequence of 262 Biovar Isolated from Cow Milk. Genome Announcements, v. 4, p. e00176-16, 2016.

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LEÃO, TIAGO2016LEÃO, TIAGO ; GUIMARÃES, PEDRO IVO ; DE MELO, ALINE GRASIELLE COSTA ; Ramos, Rommel Thiago Jucá ; LEÃO, PEDRO NUNO ; Silva, Artur ; FIORE, MARLI FATIMA ; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz . Draft Genome Sequence of the N -Fixing Cyanobacterium CENA21, Isolated from the Brazilian Amazon Floodplain. Genome Announcements, v. 4, p. e00189-16, 2016.

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Guimarães, Luis C.2016Guimarães, Luis C. ; VIANA, MARCUS V. C. ; BENEVIDES, LEANDRO J. ; MARIANO, DIEGO C. B. ; VERAS, ADOONEY A. O. ; SÁ, PABLO H. C. ; ROCHA, FLÁVIA S. ; VILAS BOAS, PRISCILLA C. B. ; Soares, Siomar C. ; BARBOSA, MARIA S. ; Guiso, Nicole ; BADELL, EDGAR ; Carneiro, Adriana R. ; Azevedo, Vasco ; Ramos, Rommel T. J. ; Silva, Artur . Draft Genome Sequence of Toxigenic Strain 04-7514, Isolated from a Dog in France. Genome Announcements, v. 4, p. e00172-16, 2016.

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Guimarães, Luis C.2016Guimarães, Luis C. ; VIANA, MARCUS V. C. ; BENEVIDES, LEANDRO J. ; MARIANO, DIEGO C. B. ; VERAS, ADOONEY A. O. ; SÁ, PABLO H. C. ; ROCHA, FLÁVIA S. ; VILAS BOAS, PRISCILLA C. B. ; Soares, Siomar C. ; BARBOSA, MARIA S. ; Guiso, Nicole ; BADELL, EDGAR ; Carneiro, Adriana R. ; Azevedo, Vasco ; Ramos, Rommel T. J. ; Silva, Artur . Draft Genome Sequence of Strain 04-3911, Isolated from Humans. Genome Announcements, v. 4, p. e00171-16, 2016.

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SANTOS, LEONARDO N.2016SANTOS, LEONARDO N. ; SILVA, EDUARDO S. ; SANTOS, ANDRÉ S. ; DE SÁ, PABLO H. ; RAMOS, ROMMEL T. ; Silva, Artur ; COOPER, PHILIP J. ; BARRETO, MAURÍCIO L. ; LOUREIRO, SEBASTIÃO ; PINHEIRO, CARINA S. ; ALCANTARA-NEVES, NEUZA M. ; PACHECO, LUIS G.C. . De novo assembly and characterization of the Trichuris trichiura adult worm transcriptome using Ion Torrent sequencing. Acta Tropica, v. NE, p. NE, 2016.

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ALMEIDA, SINTIA2016ALMEIDA, SINTIA ; Tiwari, Sandeep ; MARIANO, DIEGO ; SOUZA, FLÁVIA ; JAMAL, SYED BABAR ; Coimbra, Nilson ; RAITTZ, ROBERTO TADEU ; DORELLA, FERNANDA ALVES ; CARVALHO, ALEX FIORINE DE ; PEREIRA, FELIPE LUIZ ; SOARES, SIOMAR DE CASTRO ; LEAL, CARLOS AUGUSTO GOMES ; Barh, Debmalya ; GHOSH, PREETAM ; FIGUEIREDO, HENRIQUE ; MOURA-COSTA, LÍLIA FERREIRA ; PORTELA, RICARDO WAGNER ; Meyer, Roberto ; Silva, Artur ; Azevedo, Vasco . The genome anatomy of Corynebacterium pseudotuberculosis VD57 a highly virulent strain causing Caseous lymphadenitis. Standards in Genomic Sciences, v. 11, p. NE, 2016.

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MARIANO, DIEGO CÉSAR BATISTA2016MARIANO, DIEGO CÉSAR BATISTA ; SOUSA, THIAGO DE JESUS ; PEREIRA, FELIPE LUIZ ; ABURJAILE, FLÁVIA ; Barh, Debmalya ; ROCHA, FLÁVIA ; Pinto, Anne Cybelle ; HASSAN, SYED SHAH ; SARAIVA, TESSÁLIA DINIZ LUERCE ; DORELLA, FERNANDA ALVES ; DE CARVALHO, ALEX FIORINI ; LEAL, CARLOS AUGUSTO GOMES ; FIGUEIREDO, HENRIQUE CÉSAR PEREIRA ; Silva, Artur ; Ramos, Rommel Thiago Jucá ; Azevedo, Vasco Ariston Carvalho . Whole-genome optical mapping reveals a mis-assembly between two rRNA operons of Corynebacterium pseudotuberculosis strain 1002. BMC Genomics, v. 17, p. NE, 2016.

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MARIANO, DIEGO C. B.2016MARIANO, DIEGO C. B. ; PEREIRA, FELIPE L. ; AGUIAR, EDGAR L. ; OLIVEIRA, LETÍCIA C. ; BENEVIDES, LEANDRO ; GUIMARÃES, LUÍS C. ; FOLADOR, EDSON L. ; SOUSA, THIAGO J. ; GHOSH, PREETAM ; Barh, Debmalya ; FIGUEIREDO, HENRIQUE C. P. ; SILVA, A. ; Ramos, R. T. J. ; AZEVEDO, VASCO A. C. . SIMBA: a web tool for managing bacterial genome assembly generated by Ion PGM sequencing technology. BMC Bioinformatics, v. 17, p. 65-72, 2016.

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Ali, Amjad2015Ali, Amjad ; NAZ, ANAM ; Soares, Siomar C ; BAKHTIAR, MARRIAM ; Tiwari, Sandeep ; HASSAN, SYED S ; HANAN, FAZAL ; Ramos, Rommel ; PEREIRA, ULISSES ; Barh, Debmalya ; FIGUEIREDO, HENRIQUE CÉSAR PEREIRA ; USSERY, DAVID W. ; MIYOSHI, Anderson ; Silva, Artur ; Azevedo, Vasco . Pan-Genome Analysis of Human Gastric Pathogen H. pylori : Comparative Genomics and Pathogenomics Approaches to Identify Regions Associated with Pathogenicity and Prediction of Potential Core Therapeutic Targets. BIOMED RES INT, v. 2015, p. 1-17, 2015.

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DE OLIVEIRA VERAS, ADONNEY ALLAN2015DE OLIVEIRA VERAS, ADONNEY ALLAN ; DA SILVA, MIRIAM LOPES ; GOMES, JAQUELINE CONCEIÇÃO MEIRELES ; DIAS, LARISSA MARANHÃO ; DE SÁ, PABLO CARACCIOLO GOMES ; ALVES, JORIANNE THYESKA CASTRO ; CASTRO, WENDEL ; MIRANDA, FÁBIO ; KAZUO, EHILTON ; MARINHO, DIOGO ; RODRIGUES, MATEUS ; FREIRE, MATHEUS ; ZAHLOUTH, RAMIRO ; RENAN, WENDEL ; LOPES, THIAGO SOUZA ; MATTÉ, MARIA HELENA ; DA SILVA MAYER, CINTIA CAROLINA ; DE ALMEIDA VASCONCELOS BARBONI, SUZI ; MATTÉ, GLAVUR ROGÉRIO ; Carneiro, Adriana Ribeiro ; Silva, Artur ; Ramos, Rommel Thiago Jucá . Draft Genome Sequences of Vibrio fluvialis Strains 560 and 539, Isolated from Environmental Samples. Genome Announcements, v. 3, p. e01344-14, 2015.

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BENEVIDES, LEANDRO DE JESUS2015BENEVIDES, LEANDRO DE JESUS ; VIANA, MARCUS VINICIUS CANÁRIO ; MARIANO, DIEGO CÉSAR BATISTA ; ROCHA, FLÁVIA DE SOUZA ; BAGANO, PRISCILLA CAROLINNE ; FOLADOR, EDSON LUIZ ; PEREIRA, FELIPE LUIZ ; DORELLA, FERNANDA ALVES ; LEAL, CARLOS AUGUSTO GOMES ; CARVALHO, ALEX FIORINI ; SOARES, SIOMAR DE CASTRO ; Carneiro, Adriana ; Ramos, Rommel ; BADELL-OCANDO, EDGAR ; Guiso, Nicole ; Silva, Artur ; FIGUEIREDO, HENRIQUE ; Azevedo, Vasco ; GUIMARÃES, LUIS CARLOS . Genome Sequence of Corynebacterium ulcerans Strain FRC11. Genome Announcements, v. 3, p. e00112-15, 2015.

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DE SÁ, PABLO H.C.G.2015DE SÁ, PABLO H.C.G. ; VERAS, ADONNEY A.O. ; Carneiro, Adriana R. ; PINHEIRO, KENNY C. ; Pinto, Anne C. ; Soares, Siomar C. ; Schneider, Maria P.C. ; Azevedo, Vasco ; Silva, Artur ; RAMOS, ROMMEL T.J. . The impact of quality filter for RNA-Seq. Gene (Amsterdam), v. 563, p. 165-171, 2015.

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FOLADOR, E. L.2015FOLADOR, E. L. ; OLIVEIRA JUNIOR, A. F. ; Tiwari, S. ; JAMAL, S. B. ; FERREIRA, Rafaela. S. ; Barh, Debmalya ; GHOSH, P. ; SILVA, A ; AZEVEDO, Vasco Ariston de . In Silico Protein-Protein Interactions: Avoiding Data and Method Biases Over Sensitivity and Specificity. Current Protein and Peptide Science, v. 16, p. 689-700, 2015.

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CARLOS GUIMARAES, LUIS2015CARLOS GUIMARAES, LUIS ; BENEVIDES DE JESUS, LEANDRO ; VINICIUS CANARIO VIANA, MARCUS ; Silva, Artur ; THIAGO JUCA RAMOS, ROMMEL ; de Castro Soares, Siomar ; Azevedo, Vasco . Inside of the Pan-Genome - Methods and Software Overview. Current Genomics, v. 16, p. 1-1, 2015.

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Abreu, Vinicius A. C.2015Abreu, Vinicius A. C. ; ALMEIDA, SINTIA ; Tiwari, Sandeep ; HASSAN, SYED SHAH ; MARIANO, DIEGO ; Silva, Artur ; Baumbach, Jan ; Azevedo, Vasco ; RÖTTGER, RICHARD . CMRegNet-An interspecies reference database for corynebacterial and mycobacterial regulatory networks. BMC Genomics, v. 16, p. NE, 2015.

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RADUSKY, LEANDRO G2015RADUSKY, LEANDRO G ; HASSAN, SYED ; LANZAROTTI, ESTEBAN ; Tiwari, Sandeep ; JAMAL, SYED ; ALI, JAVED ; Ali, Amjad ; FERREIRA, RAFAELA ; Barh, Debmalya ; Silva, Artur ; TURJANSKI, ADRIÁN G ; AZEVEDO, VASCO AC . An integrated structural proteomics approach along the druggable genome of Corynebacterium pseudotuberculosis species for putative druggable targets. BMC Genomics, v. 16, p. S9, 2015.

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GUIMARÃES, LUIS2015GUIMARÃES, LUIS ; SOARES, SIOMAR ; Trost, Eva ; BLOM, JOCHEN ; Ramos, Rommel ; Silva, Artur ; Barh, Debmalya ; Azevedo, Vasco . Genome informatics and vaccine targets in Corynebacterium urealyticum using two whole genomes, comparative genomics, and reverse vaccinology. BMC Genomics, v. 16, p. S7, 2015.

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NALLURI, JOSEPH J2015NALLURI, JOSEPH J ; KAMAPANTULA, BHANU K ; Barh, Debmalya ; Jain, Neha ; BHATTACHARYA, ANTARIPA ; DE ALMEIDA, SINTIA ; JUCA RAMOS, ROMMEL ; Silva, Artur ; Azevedo, Vasco ; GHOSH, PREETAM . DISMIRA: Prioritization of disease candidates in miRNA-disease associations based on maximum weighted matching inference model and motif-based analysis. BMC Genomics, v. 16, p. S12, 2015.

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Baraúna, Rafael A.2015Baraúna, Rafael A. ; Santos, Agenor V. ; Graças, Diego A. ; SANTOS, DANIEL M. ; GHILARDI JÚNIOR, RUBENS ; PIMENTA, ADRIANO M. C. ; CAREPO, MARTA S. P. ; Schneider, Maria P.C. ; Silva, Artur . Exposure to an extremely low-frequency electromagnetic field only slightly modifies the proteome of Chromobacterium violaceum ATCC 12472. Genetics and Molecular Biology (online version), v. 38, p. 227-230, 2015.

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ASSUMPCAO, PAULO2015ASSUMPCAO, PAULO ; Darnet, Sylvain ; MOREIRA, FABIANO ; HAMOY, IGOR ; Burbano, Rommel ; KHAYAT, ANDRÉ ; CRUZ, ALINE ; MAGALHÃES, LEANDRO ; Silva, Artur ; Santos, Sidney ; DEMACHKI, SAMIA ; Assumpção, Monica ; Assumpção, Paulo ; Ribeiro-dos-Santos, Ândrea . High-Throughput Sequencing of miRNAs Reveals a Tissue Signature in Gastric Cancer and Suggests Novel Potential Biomarkers. Bioinformatics and Biology Insights, v. NE, p. 1, 2015.

67.
Pacheco, Luis G. C.2015Pacheco, Luis G. C. ; Mattos-Guaraldi, Ana L. ; SANTOS, CAROLINA S. ; VERAS, ADONNEY A. O. ; Guimarães, Luis C. ; ABREU, VINÍCIUS ; PEREIRA, FELIPE L. ; Soares, Siomar C. ; Dorella, Fernanda A. ; CARVALHO, ALEX F. ; LEAL, CARLOS G. ; FIGUEIREDO, HENRIQUE C. P. ; RAMOS, JULIANA N. ; VIEIRA, VERONICA V. ; FARFOUR, ERIC ; Guiso, Nicole ; Hirata, Raphael ; Azevedo, Vasco ; Silva, Artur ; Ramos, Rommel T. J. . Draft Genome Sequences of Two Species of -Difficult-to-Identify- Human-Pathogenic Corynebacteria: Implications for Better Identification Tests. Journal of Genomics, v. 3, p. 82-84, 2015.

68.
Assumpção, M.B.2015Assumpção, M.B. ; MOREIRA, F. C. ; HAMOY, I. G. ; MAGALHAES, L. ; VIDAL, A. ; PEREIRA, A. ; BURBANO, R. ; KHAYAT, A. S. ; SILVA, A. ; SANTOS, Sidney ; DEMACHKI, S. ; SANTOS, A. K. C. R. ou Ribeiro-dos-Santos, A.K.C. ; Assumpção, Paulo . High-Throughput miRNA Sequencing Reveals a Field Effect in Gastric Cancer and Suggests an Epigenetic Network Mechanism. Bioinformatics and Biology Insights, v. 9, p. 111-117, 2015.

69.
Barh, Debmalya2015Barh, Debmalya ; KAMAPANTULA, BHANU ; Jain, Neha ; NALLURI, JOSEPH ; BHATTACHARYA, ANTARIPA ; JUNEJA, LUCKY ; BARVE, NEHA ; Tiwari, Sandeep ; MIYOSHI, Anderson ; Azevedo, Vasco ; BLUM, KENNETH ; Kumar, Anil ; Silva, Artur ; GHOSH, PREETAM . miRegulome: a knowledge-base of miRNA regulomics and analysis. Scientific Reports, v. 5, p. 12832, 2015.

70.
SOUSA, THIAGO JESUS2015SOUSA, THIAGO JESUS ; MARIANO, DIEGO ; PARISE, DOGLAS ; PARISE, MARIANA ; VIANA, MARCUS VINICIUS CANÁRIO ; GUIMARÃES, LUIS CARLOS ; BENEVIDES, LEANDRO JESUS ; ROCHA, FLÁVIA ; BAGANO, PRISCILLA ; Ramos, Rommel ; SILVA, A. ; FIGUEIREDO, HENRIQUE ; ALMEIDA, SINTIA ; AZEVEDO, V. . Complete Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis Strain 12C. Genome Announcements, v. 3, p. e00759-15, 2015.

71.
MARIANO, DIEGO CB2015MARIANO, DIEGO CB ; PEREIRA, FELIPE L ; GHOSH, PREETAM ; Barh, Debmalya ; FIGUEIREDO, HENRIQUE CP ; SILVA, A. ; Ramos, Rommel TJ ; AZEVEDO, V. . MapRepeat: an approach for effective assembly of repetitive regions in prokaryotic genomes. Bioinformation (Online) (Chennai), v. 11, p. 276-279, 2015.

72.
Mattos-Guaraldi, Ana L.2015Mattos-Guaraldi, Ana L. ; Guimarães, Luis C. ; SANTOS, CAROLINA S. ; VERAS, ADONNEY A. O. ; Carneiro, Adriana R. ; Soares, Siomar C. ; RAMOS, JULIANA N. ; SOUZA, CASSIUS ; VIEIRA, VERONICA V. ; Hirata, Raphael ; Azevedo, Vasco ; Pacheco, Luis G. C. ; Silva, Artur ; Ramos, Rommel T. J. . Draft Genome Sequence of Corynebacterium striatum 1961 BR-RJ/09, a Multidrug-Susceptible Strain Isolated from the Urine of a Hospitalized 37-Year-Old Female Patient. Genome Announcements, v. 3, p. e00869-15, 2015.

73.
GUIMARÃES, PEDRO IVO2015GUIMARÃES, PEDRO IVO ; LEÃO, TIAGO FERREIRA ; DE MELO, ALINE GRASIELLE COSTA ; Ramos, Rommel Thiago Jucá ; Silva, Artur ; FIORE, MARLI FATIMA ; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz . Draft Genome Sequence of the Picocyanobacterium Synechococcus sp. Strain GFB01, Isolated from a Freshwater Lagoon in the Brazilian Amazon. Genome Announcements, v. 3, p. e00876-15, 2015.

74.
Soares, Siomar C.2015Soares, Siomar C. ; GEYIK, HAKAN ; RAMOS, ROMMEL T.J. ; DE SÁ, PABLO H.C.G. ; BARBOSA, EUDES G.V. ; Baumbach, Jan ; FIGUEIREDO, HENRIQUE C.P. ; MIYOSHI, Anderson ; Tauch, Andreas ; Silva, Artur ; Azevedo, Vasco . GIPSy: genomic island prediction software. Journal of Biotechnology, v. NE, p. NE, 2015.

75.
DE SÁ, PABLO H.C.G.2015DE SÁ, PABLO H.C.G. ; VERAS, ADONNEY A.O. ; Carneiro, Adriana R. ; BARÚNA, RAFAEL A. ; GUIMARÃES, LUÍS C. ; PINHEIRO, KENNY C. ; Pinto, Anne C. ; Soares, Siomar C. ; Schneider, Maria P.C. ; Azevedo, Vasco ; Silva, Artur ; RAMOS, ROMMEL T.J. . Corynebacterium pseudotuberculosis RNA-seq data from abiotic stresses. Data in Brief, v. NA, p. NA, 2015.

76.
CAVALCANTE, ANA LÍDIA Q.2015CAVALCANTE, ANA LÍDIA Q. ; DIAS, LARISSA M. ; ALVES, JORIANNE T. C. ; VERAS, ADONNEY A. O. ; Guimarães, Luis C. ; ROCHA, FLÁVIA S. ; GALA-GARCÍA, ALFONSO ; RETAMAL, PATRICIO ; Ramos, Rommel T. J. ; Azevedo, Vasco ; Silva, Artur ; Carneiro, Adriana R. . Complete Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis Strain E19, Isolated from a Horse in Chile. Genome Announcements, v. 3, p. e01385-15, 2015.

77.
VIEGAS, A.2015VIEGAS, A. ; SILVA, A. ; DARNET, Sylvain . HCRA: a hybrid colour-space read-additive method for de novo transcriptomic assembly integrating Illumina and SOLiD datasets. PLANT OMICS, v. 8, p. 581-586, 2015.

78.
Pinto, A.C2014Pinto, A.C ; SÁ, P. H. C. G. ; RAMOS, R. T. J ; BARBOSA, Maria Silvanira Ribeiro ; DALL'AGNOL, H ; Carneiro, Adriana Ribeiro ; SILVA, W. M. ; ROCHA, F. S. ; SANTANA, M. P. ; CASTRO, T. L. P. ; Miyoshi, A ; SCHINEIDER, Maria Paula Cruz ; Artur Silva ; AZEVEDO, V . Differential transcriptional profile of Corynebacterium pseudotuberculosis in response to abiotic stresses. BMC Genomics, v. 15, p. 14, 2014.

79.
SILVA, A. D. S. D. S.2014SILVA, A. D. S. D. S. ; BARAUNA, R. A. ; DE SA, P. C. G. ; DAS GRACAS, D. A. ; CARNEIRO, A. R. ; THOUVENIN, M. ; AZEVEDO, V. ; BADELL, E. ; GUISO, N. ; DA SILVA, A. L. D. C. ; RAMOS, R. T. J. . Draft Genome Sequence of Corynebacterium ulcerans FRC58, Isolated from the Bronchitic Aspiration of a Patient in France. Genome Announcements, v. 2, p. e01132-13-e01132-13, 2014.

80.
PYLRO, VICTOR SATLER2014PYLRO, VICTOR SATLER ; ROESCH, LUIZ FERNANDO WURDIG ; ORTEGA, JOSÉ MIGUEL ; AMARAL, ALEXANDRE MORAIS ; TÓTOLA, MARCOS ROGÉRIO ; HIRSCH, PENNY RUTH ; ROSADO, ALEXANDRE SOARES ; GÓES-NETO, ARISTÓTELES ; DA COSTA DA SILVA, ARTUR LUIZ ; ROSA, CARLOS AUGUSTO ; MORAIS, DANIEL KUMAZAWA ; ANDREOTE, FERNANDO DINI ; DUARTE, GABRIELA FROIS ; MELO, ITAMAR SOARES ; SELDIN, LUCY ; LAMBAIS, MÁRCIO RODRIGUES ; HUNGRIA, MARIANGELA ; PEIXOTO, RAQUEL SILVA ; KRUGER, RICARDO HENRIQUE ; TSAI, SIU MUI ; Azevedo, Vasco . Brazilian Microbiome Project: Revealing the Unexplored Microbial Diversity-Challenges and Prospects. Microbial Ecology, v. 67, p. 237-241, 2014.

81.
KODAMA, C.S.2014KODAMA, C.S. ; Cuadros-Orellana, S. ; BANDEIRA, C.H.M.M. ; GRAÇAS, D.A. ; SANTOS, A.S. ; SILVA, A. . Use of PCR-DHPLC with fluorescence detection for the characterization of the bacterial diversity during cassava (Manihot esculenta crantz) fermentation. Genetics and Molecular Research, v. 13, p. 1304-1313, 2014.

82.
RIBEIRO, DAYANA2014RIBEIRO, DAYANA ; ROCHA, FLÁVIA DE ; LEITE, KÁTIA MORAIS ; SOARES, SIOMAR DE ; Silva, Artur ; PORTELA, RICARDO WAGNER ; Meyer, Roberto ; Miyoshi, Anderson ; OLIVEIRA, SÉRGIO COSTA ; Azevedo, Vasco ; DORELLA, FERNANDA ALVES . An iron-acquisition-deficient mutant of Corynebacterium pseudotuberculosis efficiently protects mice against challenge. Veterinary Research, v. 45, p. 28, 2014.

83.
MOREIRA, FABIANO CORDEIRO2014MOREIRA, FABIANO CORDEIRO ; Assumpção, Monica ; HAMOY, IGOR G. ; Darnet, Sylvain ; Burbano, Rommel ; KHAYAT, ANDRÉ ; GONÇALVES, ANDRÉ NICOLAU ; Alencar, Dayse O. ; CRUZ, ALINE ; MAGALHÃES, LEANDRO ; ARAÚJO JR., WILSON ; Silva, Artur ; Santos, Sidney ; DEMACHKI, SAMIA ; Assumpção, Paulo ; Ribeiro-dos-Santos, Ândrea . MiRNA Expression Profile for the Human Gastric Antrum Region Using Ultra-Deep Sequencing. Plos One, v. 9, p. e92300, 2014.

84.
Moraes, Pablo M. R. O.2014Moraes, Pablo M. R. O. ; Seyffert, Nubia ; SILVA, WANDERSON M. ; Castro, Thiago L. P. ; SILVA, RENATA F. ; LIMA, DANIELLE D. ; Hirata, Raphael ; Silva, Artur ; MIYOSHI, Anderson ; Azevedo, Vasco . Characterization of the Opp Peptide Transporter of Corynebacterium pseudotuberculosis and Its Role in Virulence and Pathogenicity. BioMed Research International, v. 2014, p. 1-7, 2014.

85.
SOUZA, BIANCA MENDES2014SOUZA, BIANCA MENDES ; CASTRO, THIAGO LUIZ DE PAULA ; CARVALHO, RODRIGO DIAS DE OLIVEIRA ; Seyffert, Nubia ; Silva, Artur ; MIYOSHI, Anderson ; Azevedo, Vasco . σECF factors of gram-positive bacteria: A focus on Bacillus subtilis and the CMNR group. Virulence (Print), v. 5, p. 1, 2014.

86.
RIBEIRO DOS SANTOS2014RIBEIRO DOS SANTOS ; HAMOY, IGOR ; RIBEIRO-DOS-SANTOS, ANDRÉ ; ALVAREZ, LUIZ ; Barbosa, Silvanira ; Silva, Artur ; Santos, Sidney ; GUSMÃO, LEONOR ; Ribeiro-dos-Santos, Ândrea . A Protocol for mtGenome Analysis on Large Sample Numbers. Bioinformatics and Biology Insights, v. 8, p. 127, 2014.

87.
CARVALHO, DAIANE M.2014CARVALHO, DAIANE M. ; DE SÁ, PABLO H. ; Castro, Thiago L. P. ; CARVALHO, RODRIGO D. ; Pinto, Anne ; GIL, DANILO J. P. ; BAGANO, PRISCILLA ; BASTOS, BRUNO ; COSTA, LILIA F. M. ; Meyer, Roberto ; Silva, Artur ; Azevedo, Vasco ; Ramos, Rommel T. J. ; Pacheco, Luis G. C. . Reference genes for RT-qPCR studies in Corynebacterium pseudotuberculosis identified through analysis of RNA-seq data. Antonie van Leeuwenhoek (Gedrukt), v. NA, p. NA, 2014.

88.
GOMES, SAMARA TATIELLE MONTEIRO2014GOMES, SAMARA TATIELLE MONTEIRO ; IMBIRIBA, LUCIANA ; BURBANO, ROMMEL RODRIGUÉZ ; SILVA, ARTUR LUIZ DA COSTA ; FEITOSA, ROSIMAR NERIS MARTINS ; CAYRES-VALLINOTO, IZAURA MARIA VIEIRA ; ISHAK, MARLUÍSA DE OLIVEIRA GUIMARÃES ; ISHAK, RICARDO ; VALLINOTO, Antonio Carlos Rosário . Lack of evidence for human infection with Xenotropic murine leukemia virus-related virus in the Brazilian Amazon basin. Revista da Sociedade Brasileira de Medicina Tropical (Impresso), v. 47, p. 302-306, 2014.

89.
CASTRO, W. D. O.2014CASTRO, W. D. O. ; TORRES-BALLESTEROS, A. M. ; NAKAYAMA, C. R. ; MELO, I. S. ; pellizari, V. H. ; SILVA, A. ; RAMOS, R. T. J. . Draft Genome Sequence of Haloferax sp. Strain ATB1, Isolated from a Semi-Arid Region in the Brazilian Caatinga. Genome Announcements, v. 2, p. e00812-14-e00812-14, 2014.

90.
FALCÃO, ALINE SEMBLANO CARREIRA2014FALCÃO, ALINE SEMBLANO CARREIRA ; KATAOKA, MARIA SUELI DA SILVA ; RIBEIRO, NÉLSON ANTONIO BAILÃO ; DINIZ, JOSÉ ANTONIO PICANÇO ; ALVES, SÉRGIO MELO ; RIBEIRO, ANDRÉ L. RIBEIRO ; SIQUEIRA, ADRIANE SOUSA DE ; DA SILVA, ARTUR LUIZ ; Ramos, Rommel Thiago Jucá ; FREITAS, VANESSA M. ; JAEGER, RUY G. ; PINHEIRO, JOÃO J. V. . A Novel Cell Line Derived from Pleomorphic Adenoma Expresses MMP2, MMP9, TIMP1, TIMP2, and Shows Numeric Chromosomal Anomalies. Plos One, v. 9, p. e105231, 2014.

91.
FOLADOR, EDSON LUIZ2014FOLADOR, EDSON LUIZ ; HASSAN, SYED SHAH ; LEMKE, NEY ; Barh, Debmalya ; Silva, Artur ; FERREIRA, RAFAELA SALGADO ; Azevedo, Vasco . An improved interolog mapping-based computational prediction of protein-protein interactions with increased network coverage. Integrative Biology: a new journal of quantitative biosciences from nano to macro, v. NE, p. NE, 2014.

92.
Tiwari, Sandeep2014Tiwari, Sandeep ; DA COSTA, MARCÍLIA PINHEIRO ; ALMEIDA, SINTIA ; HASSAN, SYED SHAH ; JAMAL, SYED BABAR ; OLIVEIRA, ALBERTO ; FOLADOR, EDSON LUIZ ; Rocha, Flavia ; DE ABREU, VINÍCIUS AUGUSTO CARVALHO ; Dorella, Fernanda ; HIRATA, RAFAEL ; DE OLIVEIRA, DIANA MAGALHAES ; DA SILVA TEIXEIRA, MARIA FÁTIMA ; Silva, Artur ; Barh, Debmalya ; Azevedo, Vasco . C. pseudotuberculosis Phop confers virulence and may be targeted by natural compounds. Integrative Biology: a new journal of quantitative biosciences from nano to macro, v. NE, p. NE, 2014.

93.
Seyffert, Nubia2014Seyffert, Nubia ; SILVA, RENATA FARIA ; JARDIN, JULIEN ; Silva, Wanderson Marques ; DE PAULA CASTRO, THIAGO LUIZ ; TARTAGLIA, NATAYME ROCHA ; DE OLIVEIRA SANTANA, KARINA TALITA ; PORTELA, RICARDO WAGNER ; Silva, Artur ; MIYOSHI, Anderson ; LE LOIR, YVES ; Azevedo, Vasco . Serological proteome analysis of Corynebacterium pseudotuberculosis isolated from different hosts reveals novel candidates for prophylactics to control caseous lymphadenitis. Veterinary Microbiology (Amsterdam. Print), v. NE, p. NE, 2014.

94.
BARBOSA, E. G. V.2014BARBOSA, E. G. V. ; ABURJAILE, F. F. ; RAMOS, R. T. J. ; CARNEIRO, A. R. ; Le Loir, Y. ; Baumbach, Jan ; Miyoshi, A. ; SILVA, A. ; AZEVEDO, V. . Value of a newly sequenced bacterial genome. World Journal of Biological Chemistry, v. 5, p. 161-168, 2014.

95.
GRAÇAS, Diego Assis das2014GRAÇAS, Diego Assis das ; Ramos, Rommel Thiago Jucá ; SÁ, PABLO GOMES ; Baraúna, Rafael Azevedo ; GHILARDI JR., RUBENS ; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz ; Silva, Artur . Semiconductor Sequencing Reveals the Diversity of Bacterial Communities in an Amazonian Reservoir. Aquatic Science and Technology, v. 3, p. 18, 2014.

96.
OLIVEIRA, L. C.2014OLIVEIRA, L. C. SARAIVA, T. D. L. SOARES, S. C. RAMOS, R. T. J. SA, P. H. C. G. CARNEIRO, A. R. MIRANDA, F. FREIRE, M. RENAN, W. JUNIOR, A. F. O. SANTOS, A. R. PINTO, A. C. SOUZA, B. M. CASTRO, C. P. Diniz, C. A. A. ROCHA, C. S. MARIANO, D. C. B. DE AGUIAR, E. L. FOLADOR, E. L. Barbosa, E. G. V. Aburjaile, F. F. GONCALVES, L. A. GUIMARAES, L. C. AZEVEDO, M. AGRESTI, P. C. M. , et al.SILVA, R. F. Tiwari, S. ALMEIDA, S. S. Hassan, S. S. PEREIRA, V. B. ABREU, V. A. C. Pereira, U. P. Dorella, F. A. CARVALHO, A. F. PEREIRA, F. L. LEAL, C. A. G. FIGUEIREDO, H. C. P. SILVA, A. MIYOSHI, A. AZEVEDO, V. ; Genome Sequence of Lactococcus lactis subsp. lactis NCDO 2118, a GABA-Producing Strain. Genome Announcements, v. 2, p. e00980-14-e00980-14, 2014.

97.
DE SA, P. C. G.2014DE SA, P. C. G. ; DA SILVA, M. L. ; CARNEIRO, A. R. ; GOMES, J. C. M. ; DIAS, L. M. ; ALVES, J. T. C. ; DE OLIVEIRA VERAS, A. A. ; BARAUNA, R. A. ; DAS GRACAS, D. A. ; MATTE, M. H. ; SATO, M. I. Z. ; HACHICH, E. M. ; MATTE, G. R. ; RAMOS, R. T. J. ; SILVA, A. . Draft Genome Sequence of Non-O1 and Non-O139 Vibrio cholerae Strain VCC19. Genome Announcements, v. 2, p. e01094-14-e01094-14, 2014.

98.
BARAUNA, R. A.2014BARAUNA, R. A. ; GUIMARAES, L. C. ; VERAS, A. A. O. ; DE SA, P. H. C. G. ; GRACAS, D. A. ; PINHEIRO, K. C. ; SILVA, A. S. S. ; FOLADOR, E. L. ; BENEVIDES, L. J. ; VIANA, M. V. C. ; CARNEIRO, A. R. ; Schneider, M. P. C. ; SPIER, S. J. ; EDMAN, J. M. ; RAMOS, R. T. J. ; AZEVEDO, V. ; SILVA, A. . Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis MB20 bv. equi Isolated from a Pectoral Abscess of an Oldenburg Horse in California. Genome Announcements, v. 2, p. e00977-14-e00977-14, 2014.

99.
DALL'AGNOL, HIVANA PMB2014DALL'AGNOL, HIVANA PMB ; BARAÚNA, RAFAEL A ; DE SÁ, PABLO HCG ; Ramos, Rommel TJ ; NÓBREGA, FELIPE ; NUNES, CATARINA IP ; DAS GRAÇAS, DIEGO A ; Carneiro, Adriana R ; SANTOS, DANIEL M ; Pimenta, Adriano MC ; CAREPO, MARTA SP ; Azevedo, Vasco ; PELLIZARI, VIVIAN H ; Schneider, Maria PC ; Silva, Artur . Omics profiles used to evaluate the gene expression of Exiguobacterium antarcticum B7 during cold adaptation. BMC Genomics, v. 15, p. 986, 2014.

100.
Silva, Wanderson M2014Silva, Wanderson M ; CARVALHO, RODRIGO D ; Soares, Siomar C ; BASTOS, ISABELA FS ; FOLADOR, EDSON L ; SOUZA, GUSTAVO HMF ; LE LOIR, YVES ; Miyoshi, Anderson ; Silva, Artur ; Azevedo, Vasco . Label-free proteomic analysis to confirm the predicted proteome of Corynebacterium pseudotuberculosis under nitrosative stress mediated by nitric oxide. BMC Genomics, v. 15, p. 1065, 2014.

101.
VERAS, A. A. O.2014VERAS, A. A. O. ; Gomes de Sa, P. H. C. ; PINHEIRO, K. C. ; DAS GRAÇAS, DIEGO A ; Rafael Baraúna ; Schneider, MPC. ; AZEVEDO, V. ; RAMOS, R. T. J. ; SILVA, A. . Efficiency of Corynebacterium pseudotuberculosis Cp31 Genome Assembly with the Hi-Q Enzyme on an Ion Torrent PGM Sequencing Platform. Journal of Proteomics & Bioinformatics, v. 7, p. 374-378, 2014.

102.
Hassan, S. S.2014Hassan, S. S. ; Tiwari, S. ; GUIMARAES, L. C. ; JAMAL, H ; FOLADOR, EDSON L ; SHARMA, N. ; SOARES, S. C. ; DE ALMEIDA, S. S. ; ALI, A. ; POVOA, F. ; ABREU, V. A. C. ; Jain, N. ; BHATTACHARYA, ANTARIPA ; JUNEJA, LUCKY ; MIYOSHI, A ; SILVA, A. ; Barh, D. ; TURJANSKI, A. ; AZEVEDO, V. ; FERREIRA, Rafaela. S. . Proteome scale comparative modeling for conserved drug and vaccine targets identification in Corynebacterium pseudotuberculosis. BMC Genomics, v. 15, p. 10-11, 2014.

103.
VIANA, M. V. C.2014VIANA, M. V. C. ; DE JESUS BENEVIDES, L. ; BATISTA MARIANO, D. C. ; DE SOUZA ROCHA, F. ; BAGANO VILAS BOAS, P. C. ; FOLADOR, E. L. ; PEREIRA, F. L. ; ALVES DORELLA, F. ; GOMES LEAL, C. A. ; FIORINI DE CARVALHO, A. ; SILVA, A. ; de Castro Soares, S. ; PEREIRA FIGUEIREDO, H. C. ; Azevedo, V. ; Guimaraes, L. C. . Genome Sequence of Corynebacterium ulcerans Strain 210932. Genome Announcements, v. 2, p. e01233-14-e01233-14, 2014.

104.
Ciprandi, A.2013Ciprandi, A. ; SILVA, W. M. ; Santos,Agenor V. ; Pimenta, Adriano MC ; CAREPO, Marta S P ; SCHNEIDER, M. P. C. ; AZEVEDO, V. ; SILVA, A. . Chromobacterium violaceum: Important Insights for Virulence and Biotechnological Potential by Exoproteomic Studies. Current Microbiology, v. 66, p. NE, 2013.

105.
Soares, Siomar C.2013 Soares, Siomar C. ; Silva, Artur ; Trost, Eva ; BLOM, JOCHEN ; Ramos, Rommel ; Carneiro, Adriana ; Ali, Amjad ; Santos, Anderson R. ; Pinto, Anne C. ; DINIZ, CARLOS ; BARBOSA, EUDES G. V. ; Dorella, Fernanda A. ; ABURJAILE, FLÁVIA ; ROCHA, FLÁVIA S. ; NASCIMENTO, KARINA K. F. ; GUIMARÃES, LUÍS C. ; ALMEIDA, SINTIA ; HASSAN, SYED S. ; Bakhtiar, Syeda M. ; PEREIRA, ULISSES P. ; Abreu, Vinicius A. C. ; Schneider, Maria P. C. ; MIYOSHI, Anderson ; Tauch, Andreas ; Azevedo, Vasco . The Pan-Genome of the Animal Pathogen Corynebacterium pseudotuberculosis Reveals Differences in Genome Plasticity between the Biovar ovis and equi Strains. Plos One, v. 8, p. e53818, 2013.

106.
Castro, Thiago L. P.2013Castro, Thiago L. P. ; Seyffert, Nubia ; Ramos, Rommel T. J. ; Barbosa, Silvanira ; CARVALHO, RODRIGO D. O. ; Pinto, Anne Cybelle ; Carneiro, Adriana Ribeiro ; Silva, Wanderson Marques ; Pacheco, Luis G. C. ; DOWNSON, CHRISTOPHER ; Schneider, Maria P. C. ; MIYOSHI, Anderson ; Azevedo, Vasco ; Silva, Artur . Ion Torrent-based transcriptional assessment of a Corynebacterium pseudotuberculosis equi strain reveals denaturing high-performance liquid chromatography a promising rRNA depletion method. Microbial Biotechnology (Online), v. n/a, p. n/a-n/a, 2013.

107.
MOREIRA-NUNES, CAROLINE FA2013MOREIRA-NUNES, CAROLINE FA ; AZEVEDO, TEREZA CB ; BELTRÃO, ANA CS ; FRANCÊS, LARISSA TVM ; SOUSA, RODRIGO GMA ; SILVA, ISRAEL T ; Silva, Artur ; Silva, Wilson A ; LEMOS, JOSÉ AR . Differentially expressed genes responsible for insensitivity of CD34+ cells to kinase inhibitors in patients with chronic myeloid leukemia. BMC Proceedings, v. 7, p. O1, 2013.

108.
LEÃO, SYLVIA CARDOSO2013LEÃO, SYLVIA CARDOSO ; MATSUMOTO, CRISTIANNE KAYOKO ; Carneiro, Adriana ; RAMOS, ROMMEL THIAGO ; NOGUEIRA, CHRISTIANE LOURENÇO ; JUNIOR, JAMES DALTRO LIMA ; LIMA, KARLA VALÉRIA ; LOPES, Maria Luiza ; SCHNEIDER, HORACIO ; AZEVEDO, VASCO ARISTON ; DA COSTA DA SILVA, ARTUR . The Detection and Sequencing of a Broad-Host-Range Conjugative IncP-1β Plasmid in an Epidemic Strain of Mycobacterium abscessus subsp. bolletii. Plos One, v. 8, p. e60746, 2013.

109.
ALVAREZ, M. C.2013ALVAREZ, M. C. ; SANTOS, J. C. ; MANIEZZO, N. ; LADEIRA, M. S. ; Silva, A.L.C. ; SCALETSKY, I. C. ; PEDRAZZOLI JR, J. ; RIBEIRO, M. L. . MGMT and MLH1 methylation in Helicobacter pylori-infected children and adults. World Journal of Gastroenterology, v. 1, p. 1, 2013.

110.
ALI, A.2013ALI, A. ; SOARES, S. C. ; Barbosa, Eudes ; SANTOS, A. R. ; BARH, D. ; BAKHTIAR, S. M. ; HASSAN, S. S. ; USSERY, D. W. ; SILVA, A. ; Miyoshi, Anderson ; AZEVEDO, V. . Microbial Comparative Genomics: An Overview of Tools and Insights Into The Genus Corynebacterium. Journal of Bacteriology & Parasitology, v. 4, p. 2-16, 2013.

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SILVA, W. M.2013SILVA, W. M. ; Silva A ; AZEVEDO, V. . Identification of 11 new exoproteins in Corynebacterium pseudotuberculosis by comparative analysis of the exoproteome. Microbial Pathogenesis, v. 1, p. 1, 2013.

112.
Barh, Debmalya2013Barh, Debmalya Gupta, Krishnakant Jain, Neha KHATRI, G. LEON-SICAIROS, N. CANIZALEZ-ROMAN, A. Tiwari, S. VERMA, A. RAHANGDALE, S. Hassan, Syed S. SANTOS, A. R. ALI, A. Guimarães, Luis C. RAMOS, R. T. J. DEVARAPALLI, P. BARVE, N. Bakhtiar, Syeda M. KUMAVATH, R. Ghosh, P. MIYOSHI, A. SILVA, A. Anil Kumar Misra, Amarendra Narayan BLUM, K. Baumbach, J. , et al.AZEVEDO, V. Azevedo, Vasco ; Conserved host?pathogen PPIs? Globally conserved inter-species bacterial PPIs based conserved host-pathogen interactome derived novel target in C. pseudotuberculosis, C. diphtheriae, M. tuberculosis, C. ulcerans, Y. pestis, and E. coli targeted by Piper betel compounds. INTEGR BIOL-UK, v. 1, p. 01-15-15, 2013.

113.
SILVA, WANDERSON M.2013SILVA, WANDERSON M. ; SEYFFERT, Núbia ; Ciprandi, Alessandra ; Santos, Agenor V. ; Castro, Thiago L. P. ; Pacheco, Luis G. C. ; Barh, Debmalya ; LE LOIR, YVES ; PIMENTA, ADRIANO M. C. ; MIYOSHI, Anderson ; Silva, Artur ; Azevedo, Vasco . Differential Exoproteome Analysis of Two Corynebacterium pseudotuberculosis Biovar Ovis Strains Isolated from Goat (1002) and Sheep (C231). Current Microbiology, v. 1, p. 1, 2013.

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ASSIS DAS GRACAS, D.2013ASSIS DAS GRACAS, D. ; THIAGO JUCA RAMOS, R. ; VIEIRA ARAUJO, A. C. ; ZAHLOUTH, R. ; RIBEIRO CARNEIRO, A. ; SOUZA LOPES, T. ; AZEVEDO BARAUNA, R. ; AZEVEDO, V. ; CRUZ SCHNEIDER, M. P. ; pellizari, V. H. ; SILVA, A. . Complete Genome of a Methanosarcina mazei Strain Isolated from Sediment Samples from an Amazonian Flooded Area. Genome Announcements, v. 1, p. e00271-13-e00271-13, 2013.

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Kierstein, G2004Kierstein, G ; Costa da Silva, Artur Luiz . Analysis of mitochondrial D-loop region casts new light on domestic water buffalo (Bubalus bubalis) phylogeny. Molecular Phylogenetics and Evolution (Print), v. 30, p. 308-324, 2004.

211.
CAREPO, M. S. P.2004CAREPO, M. S. P. ; AZEVEDO, J. S. N. ; PORTO, J. I. ; Sousa, Alexandra R. B. ; Batista, Jaqueline S. ; SILVA, A. ; SCHNEIDER, M. P. C. . Identification of Chromobacterium violaceum genes with potential biotechnological application in environmental detoxification. Genetics and Molecular Research, v. 3, n.1, p. 181-194, 2004.

212.
VALLINOTO, M.2004VALLINOTO, M. ; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz ; SILVA, A. ; IANNUZZI, Leopoldo ; BRENIG, Bertram . Molecular cloning and analysis of the swamp and river buffalo leptin gene. Animal Genetics (Print), v. 35, p. 462-463, 2004.

213.
SCHNEIDER, I.2004SCHNEIDER, I. ; Schneider, Igor ; SCHNEIDER, Horacio ; SILVA, A. ; Schneider, Maria Paula . The prion protein and New World primate phylogeny. Genetics and Molecular Biology (Impresso), v. 27, n.4, p. 505, 2004.

214.
GONCALVES, E. C.2004GONCALVES, E. C. ; SILVA, A. ; BARBOSA, M. S. R. ; SCHNEIDER, M. P. C. . Isolation and characterization of microsatellite loci in Amazonian red-handed howlers Alouatta belzebul (Primates, Plathyrrini). Molecular Ecology Notes, v. 4, n.3, p. 406-408, 2004.

215.
2003 Costa da Silva, Artur Luiz . The complete genome sequence of Chromobacterium violaceum reveals remarkable and exploitable bacterial adaptability. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, EUA, v. 100, n.20, p. 11660-11665, 2003.

216.
KIERSTEIN, Gerold2003KIERSTEIN, Gerold ; IANNUZZI, Leopoldo ; SILVA, A. ; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz ; BAUMGARTNER, B G ; BRENIG, Bertram . Assignment of solute carrier family 26 (sulfate transporter), member 2 (SLC26a2) to river buffalo (Bubalus bubalis, 2n = 50) chromosome 9q26 (BBU9q26) by fluorescence in situ hybridization and R-banding. Cytogenetic and Genome Research (Printed ed.), v. 103, p. 1-2, 2003.

217.
Dierkes, B2000Dierkes, B ; Kriegesmann, B ; SILVA, A ; Schneider, M P ; Brenig, B . Identification of a MaeI RFLP in the insulin-like growth factor-1 (IGF1) gene of swamp buffaloes (Bubalus b. bubalis kerebau). Animal Genetics (Print), v. 31, n.1, p. 70-71, 2000.

218.
Dierkes, B1999Dierkes, B ; Kriegesmann, B ; SILVA, A ; Schneider, Mp ; Brenig, B . Characterisation of a GA transition polymorphism within an Eco130I site of intron 3 of the insulin-like growth factor-1 (IGF1) gene of swamp buffaloes (Bubalus b. bubalis kerebau). Animal Genetics (Print), v. 30, n.1, p. 405-405, 1999.

219.
BAKER, A.1999BAKER, A. ; GONZALES, P. ; PIERSMA, T. ; MINTON, C. ; WILSON, J. ; SITTERS, H. ; GRAHAM, D. ; JESSOP, R. ; COLLINS, P. ; GOEIJ, P. ; PECK, M. ; LINI, R. ; BALA, L. ; PAGNONI, G. ; VILA, A. ; BREMER, E. ; BASTIDA, R. ; IENO, E. ; BLANCO, D. ; LIMA, S. ; NASCIMENTO, I. ; SCHERER, S. ; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz ; SILVA, A. ; RODRIGUES, A . Northbound Migration of Red Knots Calidris canutus rufa in Argentina and Brazil: Report on Results Obtained by International Expedition in March-April 1997. Wader Study Group. Bulletin, v. 88, p. 64-75, 1999.

220.
Franca, J.G.1997Franca, J.G. ; do-Nascimento, J.L.M. ; Picanço-Diniz, C.W. ; Quaresma, J.A.S. ; Silva, A.L.C. . NADPH-diaphorase activity in area 17 of the squirrel monkey visual cortex: neuropil pattern, cell morphology and laminar distribution. Brazilian Journal of Medical and Biological Research (Impresso), v. 30, p. 1093-1105, 1997.

Livros publicados/organizados ou edições
1.
RAMOS, R. T. J ; Silva, Artur . Montagem de Genomas Bacterianos. 1. ed. Saarbrücken: AV Akademikerverlag GmbH & Co, 2012. v. 1. 72p .

2.
DAMAZIO, J. M. ; SILVA, M. N. ; MEDEIROS, A. M. ; MACEIRA, M. E. P. ; SANTOS, M. A. ; SANTOS, E. O. ; DIAS, N. L. ; GOBBI, M. ; CUNHA, C. ; ABE, D. S. ; GALLI, C. ; STECH, J. L. ; ALVALA, P. ; ROLAND, F. ; SILVA, A. . Diretrizes para Análises Quantitativas de Emissões Líquidas de Gases de Efeito Estufa em Reservatórios. 1. ed. Rio de Janeiro: MME, 2012. v. 1. 95p .

3.
DAMAZIO, J. M. ; SILVA, M. N. ; MEDEIROS, A. M. ; PAZ, L. R. L. ; MACEIRA, M. E. P. ; SANTOS, M. A. ; SANTOS, E. O. ; DIAS, N. L. ; GOBBI, M. ; CUNHA, C. ; ABE, D. S. ; GALLI, C. ; STECH, J. L. ; ALVALA, P. ; ROLAND, F. ; Silva, Artur . Estado da Arte em Ciclo do Carbono em Reservatórios. 1. ed. Rio de Janeiro: MME, 2012. v. 1. 237p .

4.
AZEVEDO, V. (Org.) ; SCHNEIDER, M. P. C. (Org.) ; Silva, Artur (Org.) ; A. Miyoshi (Org.) ; BOREM, A. (Org.) ; ADRIANA, Carneiro (Org.) ; AR Santos (Org.) ; AMADIO, A. (Org.) ; MELO, H. V. F. (Org.) ; Ortega, J.M. (Org.) ; Cerdeira, Louise T. (Org.) ; BARBOSA, Maria Silvanira Ribeiro (Org.) ; GUEDES, R. L. M. (Org.) ; OLIVEIRA, R. S. (Org.) ; RAMOS, R. T. J. (Org.) ; ALMEIDA, S. S. (Org.) ; Abreu, Vinicius A. C. (Org.) ; D'Afonseca, Vivian (Org.) . Manual prático-teórico: Sequenciamento, montagem e anotação de genomas bacterianos. 2. ed. Belo Horizonte: Universidade Federal de Viçosa, 2011. v. 800. 160p .

Capítulos de livros publicados
1.
Baraúna, Rafael A. ; Graças, Diego A. ; Alves, Joriane T. C. ; CAVALCANTE, ANA LÍDIA Q. ; Silva, Artur . Gel-Based Approaches in Genomic and Proteomic Sciences. In: Dr. Vijay Kumar Thakur; Dr. Manju Kumari Thakur. (Org.). Gels Horizons: From Science to Smart Materials. 1ed.Singapore: Springer Singapore, 2018, v. , p. 185-195.

2.
BRAGA, M. B. ; VERAS, A. ; Gomes de Sa, P. H. C. ; GRAÇAS, Diego Assis das ; BARAUNA, R. A. ; ALVES, JORIANNE THYESKA CASTRO ; PINHEIRO, K. C. ; AZEVEDO, Vasco Ariston de ; SCHNEIDER, M. P. C. ; Ramos, Rommel T. J. ; SILVA, A. . Omics Technologies Applied to Prokaryotes. In: KEVIN V. URBANO. (Org.). ADVANCES IN GENETICS RESEARCH. 1ed.Nova Iorque: Nova Science Publishers, 2016, v. 1, p. 201-226.

3.
OLIVEIRA, ALBERTO ; BENEVIDES, LEANDRO DE JESUS ; MARIANO, D. C. B. ; AGUIAR, E. ; SOUSA, T. ; SILVA, A ; Azevedo, Vasco . Bioinformatics. In: Zahoorullah S MD. (Org.). A Textbook of Biotechnology. 1ed.Texas: SM Group, 2015, v. 1, p. 1-119.

4.
ABURJAILE, F. F. ; SANTANA, M. P. ; VIANA, M. V. C. ; SILVA, W. M. ; FOLADOR, EDSON L ; Silva, Artur ; Azevedo, Vasco . Genomics. In: Zahoorullah S MD. (Org.). A Textbook of Biotechnology. 1ed.Texas: SM Online Publishers LLC, 2015, v. 1, p. 20-40.

5.
Tiwari, S. ; JAMAL, S. B. ; CARVALHO, P. V. S. D. ; HASSAN, S. S. ; Silva, Artur ; Azevedo, Vasco . Industrial Microbiology & Biotechnology. In: Zahoorullah S MD. (Org.). A Textbook of Biotechnology. 1ed.Texas: SM Online Publishers LLC, 2015, v. 1, p. 21-35.

6.
AGRESTI, P. M. ; CARMO, F. L. R. ; CARVALHO, R. D. O. ; AZEVEDO, M. S. P. ; SILVA, A ; AZEVEDO, Vasco Ariston de . DNA Technology, Genes and Genetic Engineering. In: Zahoorullah S MD. (Org.). A Textbook of Biotechnology. 1ed.Texas: SM Online Publishers LLC, 2015, v. 1, p. 36-49.

7.
RAMOS, R. T. J. ; VERAS, ADONNEY A. O. ; Carneiro, A. R. ; GRAÇAS, DIEGO A ; ALMEIDA E SILVA, A. ; FRANCO FILHO, L. C. ; RODRIGUES, MATEUS ; Gomes de Sa, P. H. C. ; BARAÚNA, R. A ; Leao, T. ; Silva, Artur . Anotação de Genoma: Fundamentos e Aplicações das Análises in Silico. Biotecnologia Aplicada a Saúde Fundamentos e Aplicações. 1ed.São Paulo: Blucher, 2015, v. 3, p. 717-755.

8.
Graças, Diego A. ; Baraúna, Rafael A. ; FRANCO FILHO, L. C. ; LEAO, T. F. ; Gomes de Sa, P. H. C. ; VERAS, A. A. O. ; Carneiro, Adriana R ; MEIRELES, J. ; PINHEIRO, K. C. ; Silva, Artur ; RAMOS, R. T. J . The Use of Ion Torrent PGM for Bacterial Diversity Analyses: The Study Case of Five Brazilian Hydroelectric Reservoirs. In: Camilla Benedetti. (Org.). Metagenomics: Methods, Applications and Perspectives. 1ed.New York: Nova Science Publishers, Inc, 2014, v. 1, p. 1-15.

9.
Silva, Artur; Ramos, Rommel ; Carneiro, Adriana ; ALMEIDA, SINTIA ; De Abreu, Vinicius ; Santos, Anderson ; SOARES, SIOMAR ; Pinto, Anne ; GUIMARÃES, LUIS ; Barbosa, Eudes ; Schneider, Paula ; MIYOSHI, Anderson . Next-generation sequencing and assembly of bacterial genomes. In: Debmalya Barh , Vasudeo Zambare and Vasco Azevedo. (Org.). Omics: aplications in Biomedical, Agricultural, and Environmental Sciences. 1ed.Boca Raton: CRC Press, 2013, v. 1, p. 1-696.

10.
SOARES, S. C. ; Ramos, Rommel T. J. ; SILVA, W. M. ; Mattos-Guaraldi, A.L. ; Miyoshi, A ; Silva, A.L.C. ; AZEVEDO, V . Corynebacterium pathogenic species in next-generation genomic era: the use of EDGAR and PIPS software and the importance of pathogenicity islands identification in pan-genomic analyses of pathogenic species. In: A. Méndez-Vilas. (Org.). Microbial pathogens and strategies for combating them: science, technology and education. 1ed.Badajoz: FORMATEX RESEARCH CENTER, 2013, v. 3, p. 1584-1599.

11.
AZEVEDO, V. ; Abreu, Vinicius A. C. ; ALMEIDA, S. S. ; Santos, Anderson ; de Castro Soares, Siomar ; AC Pinto ; Magalhães, A. ; Barbosa, E. ; RAMOS, R. T. J. ; Cerdeira, Louise T. ; ADRIANA, Carneiro ; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz ; Silva, Artur ; A. Miyoshi . Whole Genome Annotation: In Silico Analysis. In: Mahmood A. Mahdavi. (Org.). Bioinformatics - Trends and Methodologies. Croacia: InTech - Open Access Publisher, 2011, v. , p. 679-704.

12.
Saia, FT ; Araujo, AC ; A. C. Nunes ; Nakayama, C R ; A. M. A. Nascimento ; GRACAS, D. A. ; CHAPARRO, J. P. ; Andreote, F ; Taketani, R ; Piza, F ; Silva, Artur ; pellizari, V. H. ; Soares, I ; Vazoller, RF . Archaea Diversity in Brazilian Aquatic Ecosystems. In: Sakura Y. Katō. (Org.). Archaea: Structure, Habitats and Ecological Significance. Nova Iorque: Nova Science Publishers, Inc., 2010, v. , p. -.

13.
GONÇALVES, Evonnildo Costa ; FERRARI, Stephen Francis ; MEDEIROS, Diogo Lavareda ; SILVA, A ; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz . Long-term variation in the genetic diversity of red-handed howlers, Alouatta belzebul (Primates: Platyrrhini) from eastern Brazilian Amazonia. In: Stephen Francis Ferrari e José Rímoli. (Org.). A Primatologia no Brasil. Aracaju: Sociedade Brasileira de Primatologia, 2009, v. , p. -.

14.
GONÇALVES, Evonnildo ; FERRARI, Stephen Francis ; COUTINHO, Paulo e G ; MENEZES, E. V. ; Silva, Artur ; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz . Limited dispersed and genetic structure of Silvery Marmosets (Mico argentatus) in the fragmented landscape of Central Amazonia. In: Susan Ford, Leila Porter, Lesa Davis. (Org.). The Smallest Anthropoids: the Marmoset/Callimico Radiation. New York: Springer, 2009, v. , p. 205-220.

15.
GONÇALVES, Evonnildo ; FERRARI, Stephen Francis ; SILVA, A. ; COUTINHO, Paulo e G ; MENEZES, Elytania Veiga de ; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz . Effects of habitat fragmentation on the genetic variability of Silvery Marmosets, Mico argentatus. In: Laura K. Marsh. (Org.). Primates in Fragments: Ecology and Conservation. Nova York: Plenum Press, 2003, v. 01, p. 17-27.

Trabalhos completos publicados em anais de congressos
1.
LIMA, Silenene Maria Araújo de ; MONTEIRO, André Walsh ; ELIAS, Carol Fuzeti ; SILVA, A. . Caracterização morfofuncional e molecular do gene envolvido com o ganho de peso em búfalos da Amazônia. In: II Workshop tecnológio da Agropecuária, 2005, Belém. II Workshop tecnológico da Pecuária. Belém: Secretária de Estado de Ciência e Tecnologia, 2005.

2.
SILVA, A.; GONÇALVES, Evonnildo Costa ; CARNEIRO, Thomaz Xavier ; REIS, Sávio ; BARBOSA, Maria Silvanira ; PEREIRA, Maria Do Socorro ; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz . Diversidade genética e controle genealógico em rebanhos bovinos, eqüinos e bubalinos. In: II workshop tecnológio da Agropecuária, 2005, Belém. II Workshop Tecnológico da Agropecuária. Belém: Secretaria de Estado de Ciência, Tecnologia e Meio Ambiente, 2005.

3.
INGLÊZ, Ana Paula Daltoé ; GONÇALVES, Evonnildo Costa ; SARAIVA, Patrícia ; GUIMARÃES, Maria de Nazaré Klautau ; SILVA, A. ; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz ; OLIVEIRA, Silviene Fabiane . Variable microsatellite markers for the Black Howler Monkey (Alouatta caraya): A test of four heterologous loci developed for Alouatta belzebul. In: 19th Annual Meeting of the Society for Conservation Biology, 2005, Brasília. Abstracts Book, 2005. v. 1. p. 23-25.

4.
SILVA, A.; CAREPO, Marta ; AZEVEDO, Juliana Nina ; SAMPAIO, Vanderson de Souza ; GONÇALVES, Evonnildo Costa ; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz . The mitochondrial genome of white-throated capuchin. In: 20th International Primatology Society Congress, 2004, Turin. Folia Primatologica. Basel: Karger Publishers, 2004. v. 75. p. 169-169.

5.
SCHNEIDER, Maria Paula Cruz ; SILVA, A. ; FERRARI, Stephen Francis ; GONÇALVES, Evonnildo . Evolutionary genetics of natural populations of neotropical primates. In: 20th International Primatology Society Congress, 2004, Turin. Folia Primatologica. Basel: Karger Publishers, 2004. v. 75. p. 166-166.

6.
SILVA, A.; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz ; GONÇALVES, Evonnildo ; KREMPLER, Andrea ; BRENIG, Bertram . Construction and analysis of a genomic library of the water buffalo (Bubalus bubalis L.), 2N=48. In: XXII World Buiatrics Congress, 2002, Hannover. Annals of XXII World Buiatrics Congress, 2002.

7.
SILVA, A.; SCHNEIDER, Igor ; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz . Genome research on Brazilian Buffaloes. In: 1st Buffalo Symposium of Americas, 2002, Belém. Proccedings of the 1st Buffalo Symposium of Americas, 2002.

Resumos expandidos publicados em anais de congressos
1.
SCHNEIDER, Maria Paula Cruz ; SILVA, A. ; GONÇALVES, Evonnildo Costa ; BRENIG, Bertram ; SILVA JUNIOR, Wilson Araujo da . Comparative profiles of gene expression of Bubalus bubalis and Bos taurus. In: 30th International Conference on Animal Genetics, 2006, Porto Seguro. Proceedings of the 30th International Conference on Animal Genetics. London: International Society for Animal Genetics, 2006.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
Marinho, D. ; ROCHA, Rafael Silva ; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz ; SILVA, A. . In Silico analysis of Shine-Dalgarno sequences in the bacterial and archaean domains. In: The Third Annual Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2007, São Paulo. Genetics and Molecular Research. Ribeirão Preto: Ribeirão Preto foundation for research, 2007. v. 4.

2.
SOUZA, Ricardo Lopes ; SANTANA, P. P. B. ; ROCHA, Rafael Silva ; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz ; SILVA, A. . Análise de seüências parciais e modelagem computacional de duas celulases bacterianas obtidas por PCR independente de cultivo. In: 53 Congresso Brasileiro de Genética, 2007, Águas de Lindóia. ANAIS 53 CONGRESSO BRASILEIRO DE GENETICA. Ribeirão Preto: Zepellini, 2007.

3.
DALLAGNOL, L. T. ; GHILARDI JUNIOR, R. ; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz ; SILVA, A. . Análise estrutural da região V3 de seqüências 16S rDNA de Prochlorococcus sp. do Lago da UHE-Tucurui, Pará. In: 53 Congresso Brasileiro de Genética, 2007, Águas de Lindóia. ANAIS 53 CONGRESSO BRASILEIRO DE GENETICA. Ribeirão Preto: Zeppelini, 2007.

4.
Baraúna, RA ; BARBOSA, Maria Silvanira Ribeiro ; ANDRADE, S. S. ; GHILARDI JUNIOR, R. ; SILVA, A. ; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz . Diversidade bacteriana do Reservatório da UHE-Tucurui, Pará. In: 53 Congresso Brasileiro de Genética, 2007, Águas de Lindóia. ANAIS 53 CONGRESSO BRASILEIRO DE GENETICA. Ribeirão Preto: Zeppelini, 2007.

5.
GRACAS, D. A. ; MIRANDA, P. R. O. ; BARBOSA, Maria Silvanira Ribeiro ; ANDRADE, S. S. ; GHILARDI JUNIOR, R. ; SILVA, A. ; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz . Diversidade de arquéias do reservatório da Hidrelétrica de Tucurui, Pará. In: 53 Congresso Brasileiro de Genética, 2007, Águas de Lindóia. ANAIS 53 CONGRESSO BRASILEIRO DE GENETICA. Ribeirão Preto: Zeppelini, 2007.

6.
SILVA, A.; Almeida, S. ; CORVELO, Tereza Cristina de Oliveira ; LOIOLA, R. ; MIRANDA, P. R. O. . Identificação da diversidade bacteriana na placa dental de indivíduos de uma comunidade escolar em Belém-PA. In: 53 Congresso Brasileiro de Genética, 2007, Águas de Lindóia. ANAIS 53 CONGRESSO BRASILEIRO DE GENETICA. Ribeirão Preto: Zeppelini, 2007.

7.
ROCHA, Rafael Silva ; CAREPO, Marta Sofia Peixe ; GONÇALVES, Evonnildo Costa ; SILVA, A. ; ALVES, Cláudio Nahum ; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz . Homology modeling of Chromobacterium violaceum and Thiobacillus ferrooxidans atypical ArsR proteins. In: 14th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology, 2006, Fortaleza. 14th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology. Manchester - UK: International Society for Computational Biology, 2006. v. 1. p. 45-46.

8.
SOUZA, Ricardo Lopes ; ROCHA, Rafael Silva ; AZEVEDO, Juliana Nina ; CAREPO, Marta Sofia Peixe ; GONÇALVES, Evonnildo Costa ; SILVA, A. ; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz . Modelagem molecular da proteína arsenato redutase (Arsc) de Chromobacterium violaceum. In: 2o Encontro de Genética do Norte, 2006, Belém. 2o EGENOR. Belém: Sociedade Brasileira de Genética, 2006.

9.
ROCHA, Rafael Silva ; CAREPO, Marta Sofia Peixe ; GONÇALVES, Evonnildo Costa ; SILVA, A. ; ALVES, Cláudio Nahum ; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz . Possível sítio de ligação ao metal na proteína ArsR de Chromobacterium violaceum. In: 2o Encontro de Genética do Norte, 2006, Belém. 2o Egenor, 2006.

10.
AZEVEDO, Juliana Nina ; ROCHA, Rafael Silva ; CAREPO, Marta Sofia Peixe ; SOUZA, Ricardo Lopes ; GONÇALVES, Evonnildo Costa ; SILVA, A. ; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz . Demonstração in vivo da dependência de co-fatores da enzima arsenato redutase em Chromobacterium violaceum. In: 2o Encontro de Genética do Norte, 2006, Belém. 2o Engenor. Belém: Sociedade Brasileira de Genética, 2006.

11.
ALMEIDA, Diogo ; SILVA, A. . Aplicativo WEB para seleção de seqüências na montagem de contigs. In: 2o Encontro de Genética do Norte, 2006, Belém. 2o Engenor. Belém: Sociedade Brasileira de Genética, 2006.

12.
CARNEIRO, Thomaz Xavier ; GONÇALVES, Evonnildo Costa ; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz ; SILVA, A. . Genetic diversity in Nellore, a Zebu cattle breed, using ten ISAG/FAO recommended DNA microssatellites. In: 30th International Conference on Animal Genetics, 2006, Porto Seguro. Proceedings of the 30th International Conference on Animal Genetics. London: International Society for Animal Genetics, 2006.

13.
BURLAMAQUI, Tibério Cesar Tortola ; ALEIXO, Alexandre Padovan ; SILVA, A. ; GONÇALVES, Evonnildo Costa ; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz . Análise preliminar do status taxonômico da mãe-de-taoca-paraense, Phlegopsis nigromaculata paraensis (Aves, Thamnophilidae). In: XXXXXII Congresso Brasileiro de Genética, 2006, Foz do Iguaçu. Anais do 52 Congresso Brasileiro de Genética. Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2006.

14.
SOUZA, Ricardo Lopes ; ROCHA, Rafael Silva ; AZEVEDO, Juliana Nina ; CAREPO, Marta Sofia Peixe ; GONÇALVES, Evonnildo Costa ; SILVA, A. ; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz . Clonagem e expressão da proteína arsenato redutase de Chromobacterium violaceum. In: XXXXXII Congresso Brasileiro de Genética, 2006, Foz do Iguaçu. Anais do 52 Congresso Brasieliro de Genética. Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2006.

15.
MIRANDA, Leonardo de Sousa ; HASS, Adriani ; SILVA, A. ; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz ; GONÇALVES, Evonnildo Costa . Diversidade genética do Bacurau-de-rabo-branco, Caprimulgus candicans, no Brasil. In: XXXXXII Congresso Brasileiro de Genética, 2006, Foz do Iguaçu. Resumos do 52 Congresso nacional de Genética. Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2006.

16.
AZEVEDO, Juliana Nina ; CAREPO, Marta Sofia Peixe ; ROCHA, Rafael Silva ; SOUZA, Ricardo Lopes ; GONÇALVES, Evonnildo Costa ; SILVA, A. ; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz . Expressão gênica do operon do arsênio em Chromobacterium violaceum. In: XXXXXII Congresso Brasileiro de Genética, 2006, Foz do Iguaçu. Anais do 52 Congresso Nacional de Genética. Ribeirão Preto: Sociedade Brasielira de Genética, 2006.

17.
DAMASCENO, C A ; BRASIL, I C ; RAMOS, F L P ; ARAÚJO, e C ; OLIVEIRA, M S ; SILVA, A. ; LOBO, M N ; CORVELO, T C O . Uso da Reação em Cadeia da Polimerase para detectar Treponema pallidum subspécie pallidum em amostras de sangue total de um grupo de puérperas e seus recém-nascidos soropositivos ao Veneral Disease Research Laboratories (VDRL).. In: XXXXXII Congresso Brasileiro de Genética, 2006, Foz do Iguaçu. resumos do 52 Congresso Brasileiro de Genética. Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2006.

18.
GUEDES, R I C ; SILVA, A. ; SARQUIS, M I M ; SANTOS, Alberdan Silva ; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz . Investigação Química macromolecular: Análise da Subunidade Ribossomal 18S para caracterização genômica de Aspergillus flavus. In: 46 Congresso Brasileiro de Química, 2006, Salvador. Anais do 46 Congresso Brasileiro de Química. Rio de janeiro: Associação Brasileira de Química, 2006.

19.
SCHNEIDER, Maria Paula Cruz ; BERDUGO, Jesus ; GONÇALVES, Evonnildo Costa ; BARBOSA, Maria Silvanira Ribeiro ; SILVA, A. . Diversidade genética comparativa entre búfalos (Bubalus bubalis) brasileiros e colombianos: Uma inferência a partir de marcadores genéticos heterólogos. In: XXXXXII Congresso Brasileiro de Genética, 2006, Foz do Iguaçu. Anais do 52 Congresso Brasileiro de Genética. Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2006.

20.
BURLAMAQUI, Tibério ; ALEIXO, Alexandre ; HENRIQUES, Magali ; SILVA, A. ; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz ; GONÇALVES, Evonnildo Costa . Análise do status taxonômico do Arapaçu-da-taoca maranhense, Dendrocincla merula Badia (Aves, Passeriformes). In: 51 Congresso Brasileiro de Genética, 2005, Águas de Lindóia. Genetics and Molecular Biology, 2005. v. 28.

21.
BASTOS, Heitor ; GONÇALVES, Evonnildo Costa ; SILVA, A. ; FERRARI, Stephen Francis ; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz . Diferentes performances no uso de marcadores microssatélites específicos e heterólogos: um estudo de caso. In: 51 Congresso Brasileiro de Genética, 2005, Águas de Lindóia. Genetics and Molecular Biology. Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2005. v. 28.

22.
REIS, Sávio ; GONÇALVES, Evonnildo Costa ; SILVA, A. ; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz . Variabilidade e diferenciação genética em cavalos (Raças Marajoára e Puruca) inferidas por marcadores microssatélites. In: 51 Congresso Brasileiro de Genética, 2005, Águas de Lindóia. Genetics and Molecular Biology. Ribeirao Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2005. v. 28.

23.
ROCHA, Rafael Silva ; CAREPO, Marta Sofia Peixe ; BARBOSA, Maria Silvanira Ribeiro ; GONÇALVES, Evonnildo Costa ; SILVA, A. ; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz . Comparação das seqüências do gene da proteína ArsR reguladora do operon de resistência ao arsênio em diferentes linhagens de Chromobacterium violaceum. In: 51 Congresso Brasileiro de Genética, 2005, Águas de Lindóia. Genetics and Molecular Biology. Ribeirao Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2005. v. 28.

24.
SOUZA, Ricardo ; CAREPO, Marta Sofia Peixe ; ROCHA, Rafael Silva ; BARBOSA, Maria Silvanira Ribeiro ; GONÇALVES, Evonnildo Costa ; SILVA, A. ; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz . Comparação das seqüências do gene para Arsenato Redutase (ARSC) em diferentes linhagens de Chromobacterium violaceum. In: 51 Congresso Brasileiro de Genética, 2005, águas de Lindóia. Genetics and Molecular Biology. Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2005. v. 28.

25.
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AMORIM, A. K. J. ; MARTIN, K. ; DINIZ, C. W. P. ; SILVA, A. . Estudo das Projecoes Intrínsecas da Area 17 do Cebus Apella Usando Tripla Marcacao: Biocitina, Citocromo Oxidase e Nadph-Diaforase. In: VII Reunião Anual das Federações de Biologia Experimental, 1992, Caxambu - MG, 1992.

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AMORIM, A. K. J. ; CAMPOS, L. T. ; FARO, L. R. F. ; FRANCA, J. G. ; MARTIN, K. ; DINIZ, C. W. P. ; QUARESMA, J. A. S. ; SILVA, A. . Dupla Marcação de Citocromo Oxidase e Nadph-Diaforase Revela Dois Sistemas de Blobs Independentes em V 1 em Primatas do Novo Mundo. In: VII Reunião Anual das Federações de Biologia Experimental, 1992, Caxambu, 1992.

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Apresentações de Trabalho
1.
Artur Silva. A revolução ômica. 2013. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

2.
Artur Silva. De Sanger a NGS. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

3.
SILVA, A. Genômica de procariotos: onde estamos e quais nossos desafios. 2012. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

4.
SILVA, A. O pangenoma de Corynebacterium pseudotuberculosis. 2012. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

5.
SILVA, A.. A revolução dos OMAS - Metagenoma. 2006. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

6.
SILVA, A.. O Genoma das Águas. 2006. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

7.
SILVA, A.; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz . Avanços recentes em Genética e Biologia Molecular - Introdução à técnica de interferência de RNA.. 2005. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

8.
SILVA, A.. Redes Genômicas e Proteômicas na Amazônia (A Genética no Pará: da genômica a proteômica). 2005. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).


Produção técnica
Assessoria e consultoria
1.
Artur Silva. Consultor ad hoc Fundação de Apoio à Pesquisa do DF - FAPDF. 2014.

Programas de computador sem registro
1.
MARIANO, D. C. B. ; PEREIRA, F. L. ; GHOSH, P. ; Barh, D. ; FIGUEIREDO, H. C. P. ; SILVA, A ; Ramos, R. T. J. ; Azevedo, Vasco . MapRepeat: an approach for effective assembly of repetitive regions in prokaryotic genomes. 2015.

2.
RAMOS, R. T. J. ; AZEVEDO, V. ; Artur Silva . Simplifier. 2011.

3.
Pinto, A.C ; RAMOS, R. T. J ; Carneiro, A. R. ; AZEVEDO, V. ; Artur Silva . CoreStimulon. 2011.

4.
RAMOS, R. T. J. ; AZEVEDO, V. ; Silva, Artur . Quality Assessment. 2009.

Trabalhos técnicos
1.
SILVA, A.. Utilização da tecnologia do DNA recombinante no manejo sustentável da atividade exploratória da pesca da lagosta na costa paraense. 2003.

Entrevistas, mesas redondas, programas e comentários na mídia
1.
Ramos, Rommel T. J. ; Silva A . Laboratório de Genômica. 2014.


Demais tipos de produção técnica
1.
Costa da Silva, Artur Luiz. Aplicações e impacto do sequenciamento de nova geração. 2010. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

2.
AZEVEDO, Vasco Ariston de ; Costa da Silva, Artur Luiz ; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz . Plataforma de sequenciamento de nova geração "NGS-Solid": Sequenciamento, montagem e anotação de um genoma bacteriano. 2010. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

3.
Astolfi-Filho, S ; SILVA, A. . Rede da Amazônia Legal de Pesquisas genômicas. 2006. (Relatório de pesquisa).


Produção artística/cultural
Artes Visuais
1.
Artur Silva. Belém em exposição: O Círio de Nazaré. 2016. Fotografia.

2.
Artur Silva. 1o Spotter Day Infraero Aeroportos Val de Cans. 2015. Fotografia.



Patentes e registros



Programa de computador
1.
RAMOS, R. T. J. ; Carneiro, Adriana Ribeiro ; SÁ, P. H. C. G. ; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz ; AZEVEDO, V. ; SILVA, A . G4ALL. 2016.
Patente: Programa de Computador. Número do registro: BR512016000356-1, data de registro: 06/09/2016, título: "G4ALL" , Instituição de registro: INPI - Instituto Nacional da Propriedade Industrial.

2.
VERAS, A. A. O. ; SÁ, P. H. C. G ; ZEVEDO, V. ; SILVA, A ; RAMOS, R. T. J. . AUTO ASSEMBLY D. 2016.
Patente: Programa de Computador. Número do registro: BR512016000358-8, data de registro: 06/09/2016, título: "AUTO ASSEMBLY D" , Instituição de registro: INPI - Instituto Nacional da Propriedade Industrial.



Bancas



Participação em bancas de trabalhos de conclusão
Mestrado
1.
Carneiro, A. R.; Ramos, R. T. J.; Baraúna, R. A.; SILVA, A. Participação em banca de Jorianne Thyeska CAstro Alves. Perfil de expressão diferencial de Corynebacterium pseudotuberculosis linhagem 258 submetida a condição de estresse ácido in vitro. 2015. Dissertação (Mestrado em BIOTECNOLOGIA) - Universidade Federal do Pará.

2.
Artur Silva; RAMOS, R. T. J.; Carneiro, Adriana Ribeiro. Participação em banca de Luciano Chaves Franco Filho. Analise pangenomica do Gênero Desulfovibrio. 2014. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

3.
SILVA, A; Carneiro,Adriana R; RAMOS, R. T. J.; BARAUNA, R. A.. Participação em banca de Andréia do Socorro de Souza e Silva. Análise estrutural e comparativa da bactérias Corynebacteriumulcerans linhagem FRc58. 2014. Dissertação (Mestrado em BIOTECNOLOGIA) - Universidade Federal do Pará.

4.
REGINA, C.; Santos, Agenor V; SILVA, G. B.; SILVA, A. Participação em banca de Aline Medeiros Lima. Isolamento e carcaterização de genes de cistatinas expressos durante a interação Piper nigrum e Fusarium solani F. sp. piperis. 2012. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

5.
ABELEM, A. J.; CERQUEIRA, E. C.; SILVA, A.. Participação em banca de Jakeline Machado Lima. Algoritmo de escalonamento de grades computacionais para minimizar o processamento centralizado na montagem de genomas bacterianos obtidos por sequenciamento de DNA de nova geraçãoi. 2012. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Federal do Pará.

6.
GONÇALVES, Evonnildo Costa; ANSELMO, N. P.; SILVA, A; VIEIRA, J. M. S.. Participação em banca de Fábio Daniel Florêncio da Silva. Diversidade molecular de cianobactérias do reservatório da Usina Hidrelétrica de Tucurui. 2012. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

7.
SILVA, A; DARNET, S. H.; SILVA, Jeronimo Lameira. Participação em banca de Silvana de souza Pinheiro. Estudos de docking e dinâmica molecular da enzima O-GlcNac transferase humana (hOGT). 2012. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

8.
AZEVEDO, Vasco Ariston de; A. Miyoshi; MACHADO, C. R.; Ortega, J.M.; Costa da Silva, Artur Luiz. Participação em banca de Caroline Pereira Domingueti. Análise do papel do fator sigma C na resposta de Corynebacterium pseudotuberculosis a diferentes condições de estresse ambiental. 2011. Dissertação (Mestrado em Genética) - Universidade Federal de Minas Gerais.

9.
SANTOS, Sidney Emanuel Batista dos; SANTOS, Ândrea Kely Ribeiro dos; SENA, Leonardo; SILVA, A. Participação em banca de Natalle do Socorro da Costa Freitas. Dsenvolvimento de um painel com 33 marcadores INDEL ligados ao cromossoma X, para responder questões ligadas a antropologia biológica e genética forense. 2010. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

10.
Foresti E; SILVA, M. B. V.; SILVA, A.. Participação em banca de Fabiana Mestrinelli. Isolamento e caracterização de microorganismo envolvido na desnitrificação autrófica pela oxidação do sulfeto em reator vertical de leito fixo. 2010. Dissertação (Mestrado em Engenharia Hidráulica e Saneamento) - Universidade de São Paulo.

11.
SINISTERRA, R. D.; E. Kalapothakis; Silva, Artur. Participação em banca de Isabela Cristinba Ferreira Drummond. Avaliação da atividade de patenteamento em biotecnologia. 2009. Dissertação (Mestrado em Genética) - Universidade Federal de Minas Gerais.

12.
V. F. M. H. Lima; S. R. C. Marchesin; SILVA, A.. Participação em banca de Larissa Paola Rodrigues Venâncio. Isolamento e caracterização de microssatélites em Búfalo de Rio (Bubalus bubalis) a partir da construção de bibliotecas genômicas parciais. 2008. Dissertação (Mestrado em Biociências) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

13.
C. R. B. Domingos; M. M. Itoyama; SILVA, A.. Participação em banca de Vanderlei Antônio Pelai. Mapeamento genômico RH do braço curto do cromossomo 4 do Búfalo de Rio. 2008. Dissertação (Mestrado em Biociências) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

14.
AZEVEDO, Vasco Ariston de; A. Miyoshi; SILVA, A.; G. C. Oliveira. Participação em banca de Vivian da Fonseca da Silva. Construção de uma biblioteca genômica de Corynebacterium pesudotuberculosis e sua caracterização através de Genomic Survey Sequence (GSS). 2008. Dissertação (Mestrado em Genética) - Universidade Federal de Minas Gerais.

15.
SILVA, A.; MACHADO, Luiz Fernando Almeida; VALLINOTO, Antônio Carlos Rosário; ISHAKE, Ricardo. Participação em banca de Anna Elizabeth Martins Alves. Avaliação do polimorfismo na região promotora do gene MBL2 (lectina ligante de manose) em associação à infecção pelo vírus linfotrópico de células tumorais (HTLV). 2007. Dissertação (Mestrado em Biologia de Agentes Infecciosos e Parasitários) - Universidade Federal do Pará.

16.
SILVA, A.; NAGAMASHI, Cleusa. Participação em banca de Susana Suely Rodrigues Milhomen. Estudos cromossômicos em espécies do gênero Gymnotus (Gymnotidae - Gymnotiformes). 2007. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

17.
SILVA, A.; CORVELO, Tereza Cristina de Oliveira; ISHIKAWA, Edna Aoba; MARTINS, Luisa Caricio. Participação em banca de Hivana Patrícia Melo Barbosa. Infecção pela bactéria Helicobacter pylori e o polimorfismo do gene do fator de necrose tumoral alfa. 2006. Dissertação (Mestrado em Pós Graduação Em Patologia das Doenças Tropicais) - Universidade Federal do Pará.

18.
VALLINOTO, Antonio Carlos Rosário; SILVA, A.; MACHADO, Luiz Fernando Almeida; CUNHA, M. G.. Participação em banca de Renato Fernandes Pinheiro da Silva. Avaliação do polimorfismo no exon 1 do gene da lectina ligadora de manose (MBL2) em pacientes infectados pelo vírus da hepatite C (VHC) na Amazônia Brasileira. 2006. Dissertação (Mestrado em Biologia de Agentes Infecciosos e Parasitários) - Universidade Federal do Pará.

19.
SILVA, A.; L C L Silveira. Participação em banca de Ana Flávia Endres Nunes. Doença neurológica associada ao vírus linfotrópico de células T humanas do tipo 1 - HTLV-1: Achados clínicos e virológicos. 2006. Dissertação (Mestrado em Doenças Tropicais) - Universidade Federal do Pará.

20.
SILVA, A.; A Y N Pinto. Participação em banca de Glaécia Aparecida do Nascimento Pereira. metabolismo redox em pacientes infectados com Plasmodium vivax. 2006. Dissertação (Mestrado em Doenças Tropicais) - Universidade Federal do Pará.

21.
HARADA, Maria Lucia; SILVA, A.; VALLINOTO, Antônio Carlos Rosário; VASCONCELOS, Pedro Fernando da Costa. Participação em banca de Darleise de Souza Oliveira. Genotipagem do vírus da Hepatite C (Vhc) circulante da população de Belém. 2005. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

22.
SCHNEIDER, Horacio; SILVA, A.; TAGLIARO, Claudia Helena; VALLINOTO, Marcelo. Participação em banca de Nadir Pereira Carmona. Filogenia molecular de arraias da costa norte brasileira. 2005. Dissertação (Mestrado em Biologia Ambiental) - Universidade Federal do Pará.

23.
SILVA, A.; VALLINOTO, Antonio Carlos Rosário; GUERREIRO, João Farias; SANTOS, Eduardo José Melo dos. Participação em banca de Fabíola Brasil Barbosa. Susceptibilidade a artrite reumatóide investigada por microssatélites no complexo principal de histocompatibilidade. 2004. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

24.
SILVA, A.; SENA, Leonardo; SANTOS, Eduardo José Melo dos; GONÇALVES, Evonnildo Costa. Participação em banca de Mauro André Damasceno de Melo. Variabilidade e diferenciação genética em três populações naturais de macacos da noite (Aotus infulatus). 2004. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

25.
HARADA, Maria Lúcia; SILVA, A.; SILVA JUNIOR, Jose de Souza e; TAGLIARO, Claudia Helena. Participação em banca de Luiz Marcelo de Lima Pinheiro. Relações filogenéticas entre populações de Saimiri sciureus (Cebidae: Primates): Uma abordagem moelcular usando a região controle do DNA mitocondrial. 2003. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Pará.

26.
SILVA, A.; SANTOS, Sidney Emanuel Batista dos; SANTOS, Eduardo José Melo dos. Participação em banca de Teresinha de Jesus Brabo Ferreira. Análise da variabilidade do cromossomo Y na população de Belém-PA. 2003 - Universidade Federal do Pará.

27.
SILVA, A.; SANTOS, Eduardo Melo dos; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz; TAGLIARO, Claudia Helena. Participação em banca de Elytania Veiga de Menezes. Análise da variabilidade genética em bovinos da raça Simental utilizando como ferramentas loci mini e microssatélites. 2003. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

28.
SILVA, A.; SANTOS, Eduardo Melo dos; MARCONDES, Luis; SANTOS, Sidney Emanuel Batista dos. Participação em banca de Ednaldo da Silva Filho. Diversidade e relações genéticas de seis raças de cavalos. 2003. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

29.
CORVELO, Tereza Cristina de Oliveira; SILVA, A.; MARTINS, Luisa Caricio; SANTOS, Ândrea Kely Ribeiro dos. Participação em banca de Juciclayton Tavares de Souza. Caracterização das cepas BabA2, Cag A e Vac A da Helicobacter pylori em pacientes com patologias gástricas de Belém-Pará e sua relação com os sistemas de grupos sanguíneos ABH e Lewis. 2003. Dissertação (Mestrado em Biologia de Agentes Infecciosos e Parasitários) - Universidade Federal do Pará.

Teses de doutorado
1.
Fiore, M. F.; ANDREOTE, FERNANDO DINI; SILVA, A; GROSS, J.. Participação em banca de Danillo Oliveira de Alvarenga. Análise genômica e funcional da Cianobacteria Nostoc sp CENA67 e caracterização da sua comunidade bacteriana associada. 2015. Tese (Doutorado em Energia Nuclear na Agricultura (Esalq)) - Universidade de São Paulo.

2.
SILVA, A; Santos, A. V.; SOUZA, C. E.; NAZARENO, J.. Participação em banca de Fabio Gomes Moura. Biodiversidade bacteriana durante a fermentação espontânea de frutos de açaí (Euterpe oleracea). 2015. Tese (Doutorado em BIOTECNOLOGIA) - Universidade Federal do Pará.

3.
SCHNEIDER, Horacio; SAMPAIO, I.; Silva A; RAMOS, R. T. J.; DARNET, Sylvain. Participação em banca de Carlos Murilo Tenorio Maciel. Transcriptomas do Macrobrachium amazonicum desenvolvido no sequenciador Ion Torrent. 2015. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

4.
SANTOS, Alberdan Silva; Silva, Artur; MIRANDA, E. A.; ROCHA FILHO, G. N.; NASCIMENTO, J. L. M.. Participação em banca de Nelson Rosa Ferreira. Produção de glucanases fúngicas com potencial catalítico de descontrução da celulose. 2012. Tese (Doutorado em Química) - Universidade Federal do Pará.

5.
SILVA, A.; SCHNEIDER, M. P. C.; CORREIA, A. C. M.; CUNHA, M. A. S. D. A.; HENRIQUES, I. S.; ALVES, A. J. C. P.. Participação em banca de JULIANA SIMÃO NINA DE AZEVEDO. Phylogenetic and functional diversity of estuarine bacterioneuston. 2012. Tese (Doutorado em Biologia) - Universidade de Aveiro.

6.
SCHNEIDER, HORACIO; Artur Silva; SANTOS, A. K. C. R. ou Ribeiro-dos-Santos, A.K.C.; De Lemos, Oriel F; CUNHA, E. F. M.. Participação em banca de Sheila Maysa da cunha Gordo. Análise dos transcritos de raiz de pimenta-do-reino (Piper nigrum) utilizando sequenciamento de nova geração (NGS) - SOLiD System 3 plus. 2012. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

7.
SAMPAIO, I.; SANTOS, A. K. C. R. ou Ribeiro-dos-Santos, A.K.C.; De Lemos, Oriel F; Artur Silva; RODRIGUES, S. M.. Participação em banca de Edith Cibelle de Oliveira Moreira. Análise da expressão diferencial do transcriptoma de rais de Piper nigrum L. em resposta a infecção por Fusarium solani F. SP. Piperis. 2012. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

8.
SANTOS, Sidney Emanuel Batista dos; Vêncio, RZN; SENA, Leonardo; SANTOS, Ândrea Kely Ribeiro dos; Silva, Artur. Participação em banca de Elzemar Martins Ribeiro Rodrigues. Investigação de 12-X-STRs na população brasileira: Aplicações em genética forense e no estabelecimento de vínculo genético. 2011. Tese (Doutorado em Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

9.
AZEVEDO, V.; A. Miyoshi; Costa da Silva, Artur Luiz; CAMPOS, A. C. F. A.; A. C. Nunes; PRUDENCIO, C. R.. Participação em banca de Sintia Silva de almeida. Identificação e caracterização de peptídeos bioativos através de phage display usando genoma completo de Corynebacterium pseudotuberculosis. 2011. Tese (Doutorado em Genética) - Universidade Federal de Minas Gerais.

10.
Marques, J. T.; Bruña-Romero, O.; Probst, C. M.; Costa da Silva, Artur Luiz. Participação em banca de Anne Cybelle Pinto. Análise em larga escala da expressão diferencial de Corynebacterium pseudotuberculosis em resposta a estrresses abióticos. 2011. Tese (Doutorado em Programa de Pós-Graduação em Microbiologia) - Universidade Federal de Minas Gerais.

11.
pellizari, V. H.; RIVERA, I. N. G.; VICENTE, E. J.; Nakayama, C R; SILVA, A.. Participação em banca de Ana Carolina Vieira Araujo. Diversidade molecular de arqueias em sedimentos de rios da Amazônia e caracterização de espécies metanogênicas cultivadas. 2010. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.

12.
SILVA, M. B. V.; ZAIAT, M.; GARCIA, M. L.; SILVA, A; OLIVEIRA, R. A.. Participação em banca de Daniele Vital Vich. Comunidade microbiana de reator anaeróbio em batelada com metilamina como fonte de carbono. 2010. Tese (Doutorado em Engenharia Hidráulica e Saneamento) - Universidade de São Paulo.

13.
AC Vicente; Silva, Artur; ABR Vieira; ECB Loureiro. Participação em banca de Lilian Canto de Sá. Diversidade genética de isolados ambientais de Vibrio cholerae da Amazônia brasileira. 2009. Tese (Doutorado em Biologia de Agentes Infecciosos e Parasitários) - Universidade Federal do Pará.

14.
REGITANO, L. C. A.; Versute, E.M.; M. R. V. Amarante; SILVA, A.; BICUDO, H. E. M. C.. Participação em banca de Melissa Nunes Miziara. Construção de um mapa RH do cromossomo 1 do Búfalo de Rio (BBU1) e análise comparativa com os genomas bovino, humano e de outros mamíferos. 2008. Tese (Doutorado em Pós-graduação em Ciências Biológicas - Genética) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

15.
A. M. A. Nascimento; E. Chartone; L. C. S. Mendonça; SILVA, A.; A. C. Nunes; E. Kalapothakis. Participação em banca de Dulcecleide Bezerra de Freitas. Prospecção de bactérias em rejeitos de uma indústria de aço. 2008. Tese (Doutorado em Genética) - Universidade Federal de Minas Gerais.

16.
SCHNEIDER, Maria Paula Cruz; SILVA, A.; FERRARI, Stephen Francis; SCHENEIDER, H.; BARTEN, Ronaldo. Participação em banca de Antonio Augusto Ferreira Rodrigues. Estratégias migratórias de Calidris pusilla (Aves: Scolopacidae) na costa norte da América do Sul. 2001 - Universidade Federal do Pará.

Qualificações de Doutorado
1.
SERROR, P.; FRANCOIS, P.; AZEVEDO, V; GUEDON, E.; SILVA, A.. Participação em banca de Natayame Rocha Tartaglia. Implication of extracellular vesicles (EVs) secreted by Staphylococcus aureus in the pathogenesis. 2017. Exame de qualificação (Doutorando em Genetica) - Institut National de la Recherche Agronomique.

2.
SERROR, P.; FRANCOIS, P.; SILVA, A. Participação em banca de Elma Lima Leite. Involvement of the « inflammasomes » in Staphylococcus aureus infection. 2017. Exame de qualificação (Doutorando em Genetica) - Institut National de la Recherche Agronomique.

3.
SILVA, A; DARNET, Sylvain; ROGEZ, H.; LAUTI, E.. Participação em banca de Gisele Teixeira da Silva. Diversidade genômica de açaizeiros: uma abordagem de genotipagem por sequenciamento. 2016.

4.
DARNET, Sylvain; SILVA, A; ROGEZ, H.; LAUTI, E.. Participação em banca de Elaine Cristina pessoa dos Santos. Sequenciamento de novo e análise transcriptômica de frutos do açaí roxo e branco. 2015. Exame de qualificação (Doutorando em BIOTECNOLOGIA) - Universidade Federal do Pará.

5.
SCHNEIDER, Horacio; DARNET, Sylvain; Sampaio, Iracilda; Artur Silva. Participação em banca de Murilo Maciel. Prospecção de genes de bibliotecas do Macrobrachium amazonicum obtidos em sistema multiplex no Sequenciador Ion Torrent. 2014. Exame de qualificação (Doutorando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

6.
SCHNEIDER, Horacio; DARNET, Sylvain; SAMPAIO, I.; Artur Silva. Participação em banca de Carlos Murilo Tenório Maciel. Prospecção de genes de bibliotecas do Macrobrachium amazonicum obtidos em sistema multiplex no sequenciador Ion Torrent. 2014. Exame de qualificação (Doutorando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

7.
Artur Silva; Ribeiro-dos-Santos, Ândrea; Santos,Agenor V.. Participação em banca de Diego Assis das Graças. Micro-organismos em reservatórios hidrelétricos: diversidade genética e genômica. 2013. Exame de qualificação (Doutorando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

8.
Artur Silva; ADRIANA, Carneiro; SCHNEIDER, M. P. C.; RAMOS, R. T. J.. Participação em banca de Diogo Marinho de Almeida. Métodos computacionais para biologia de sistemas: alinhamento e simulação de redes biológicas. 2013. Exame de qualificação (Doutorando em BIOTECNOLOGIA) - Universidade Federal do Pará.

9.
Artur Silva; SCHNEIDER, M. P. C.; XAVIER, L. P.; VARANI, A. M.. Participação em banca de Regiane Silva Kawasaki Frânces. Reconstrução e modelagem de vias metabólicas em escala genômica da bactéria psicotrófica Exiguobacterium antarticum linhagem B7. 2013. Exame de qualificação (Doutorando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

10.
ISHAKE, Ricardo; Alves, Cláudio N.; Silva, Artur. Participação em banca de Rogério Valois Laurentino. Investigação de polimorfismos no gene MDR-1 em portadores do vírus da imunodeficiência human tipo 1 (HIV-1) em Belém, Pará. 2012. Exame de qualificação (Doutorando em Biologia de Agentes Infecciosos e Parasitários) - Universidade Federal do Pará.

11.
Silva, Artur; A. Miyoshi; Tarazona Santos, E; Brunialti Godard, A L. Participação em banca de Vivian D´afonseca da Silva. Genômica comparativa e pangenômica de diferentes linhagens de Corynebacterium pseudotuberculosis. 2010. Exame de qualificação (Doutorando em Genética) - Universidade Federal de Minas Gerais.

12.
Silva, Artur; FERREIRA, P. C. P.. Participação em banca de Anne Cybelle Pinto. Caracterização do transcriptoma de Corynebacterium pseudotuberculosis para investigar a sua regulação, patogenia e fisiologia em diferentes condições de estresse. 2010. Exame de qualificação (Doutorando em Genética) - Universidade Federal de Minas Gerais.

13.
CORVELO, Cristina Tereza; Pereira, W L A; Cruz E M; SILVA, A. Participação em banca de Délia Cristina Figueira Aguiar. Expressão imunohostoquímica dos antígenos de grupos sanguíneos ABH em primatas não-humanos do Novo Mundo na Região Amazônica e a infecção pela bactéria Helicobacter pylori. 2009. Exame de qualificação (Doutorando em Biologia de Agentes Infecciosos e Parasitários) - Universidade Federal do Pará.

14.
SILVA, J. A. G.; SILVA, A.; Queiroz, H. L.; SAMPAIO, I.; VALLINOTO, Marcelo. Participação em banca de Juliana Araripe Gomes da Silva. Avaliação genética de populações de pirarucus (Arapaima gigas) da Reserva Mamirauá como subsídio para o plano de manejo. 2007. Exame de qualificação (Doutorando em Zoologia) - Universidade Federal do Pará.

15.
GUERREIRO, João Farias; SILVA, A.; SANTOS, Ândrea Kely Ribeiro dos; Santana. Participação em banca de Carlos Augusto Lima Barros. Estudo de polimorfismo de genes ligados a resposta imune e suas correlações com a citocinemia em pacientes adultos com infecção malárica por Plamodium falciparum e Plasmodium vivax do Município de Marabá - Pará. 2006. Exame de qualificação (Doutorando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

16.
SCHNEIDER, Maria Paula Cruz; SILVA, A.; FERRARI, Stephen Francis. Participação em banca de Antonio Augusto Ferreira Rodrigues. Estratégias migratórias de Calidris pusilla (Aves: Scolopacidae) na costa norte da América do Sul: Proposta de rotas. 2001 - Universidade Federal do Pará.

Qualificações de Mestrado
1.
Schneider, P.N.; SCHNEIDER, M. P. C.; Artur Silva. Participação em banca de Luiz Fabrício Angioletti Soares. Caracterização dos núcleos do canto em aves oscines brasileiras. 2014. Exame de qualificação (Mestrando em BIOTECNOLOGIA) - Universidade Federal do Pará.

2.
DARNET, Sylvain; RAMOS, R. T. J.; Artur Silva. Participação em banca de Adriano Marques Viegas. Montagem de novo híbrida de transcriptoma de plantas não modelo. 2014. Exame de qualificação (Mestrando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

3.
ADRIANA, Carneiro; RAMOS, R. T. J.; Silva, Artur. Participação em banca de Jaqueline Conceição Meireles Gomes. montagem e análise comparativa do genoma da bacteria psicotrófica Psychrobacter SP ENN9_III. 2014. Exame de qualificação (Mestrando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

4.
Artur Silva; Ramos, Rommel T. J.; DARNET, Sylvain. Participação em banca de Wendel de Oliveira Castro. Draft da montagem de novo de Haloferax volcanii. 2013. Exame de qualificação (Mestrando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

5.
SILVA, A.; MCCULLOCH, J. A.; SILVA, Jeronimo Lameira. Participação em banca de Maíse Gomes Queiroz. Estudo e caracterização dos elementos genéticos móveis que conferem resistência as carbapenemas em Klebisiella pneumoniae. 2012. Exame de qualificação (Mestrando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

Monografias de cursos de aperfeiçoamento/especialização
1.
SCHNEIDER, Horacio; SILVA, A.; SAMPAIO, I.. Participação em banca de Albino Luciano Portela de Souza. Variabilidade genética e filogenia de primatas do gênero Alouatta. 2006. Monografia (Aperfeiçoamento/Especialização em Especialização em genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

2.
SAMPAIO, I.; SILVA, A.; SCHENEIDER, H.. Participação em banca de Cícero Lucianaldo Soares de Oliveira Costa. Identificação molecular de escorpiões da região do Médio Amazonas. 2006. Monografia (Aperfeiçoamento/Especialização em Especialização em genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

3.
SAMPAIO, I.; SILVA, A.; SCHNEIDER, Horacio. Participação em banca de Lúcio Antonio Ferreira de Castro. Comparação da variabilidade genética de populações naturais e artificiais (cultivo) de tamabaqui (Colossoma). 2006. Monografia (Aperfeiçoamento/Especialização em Especialização em genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

4.
SAMPAIO, I.; SILVA, A.; SCHNEIDER, Horacio. Participação em banca de Markus Sócrates Ricardo M. C. da Gama. Estrutura genética de populações de curimatãs (Prochilodus) de diferentes pontos do rio Tapajós. 2006. Monografia (Aperfeiçoamento/Especialização em Especialização em genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

5.
SAMPAIO, I.; SILVA, A.; SCHNEIDER, Horacio. Participação em banca de Adriane Xavier Hager. Mapeamento de populações de moluscos exóticos na área do Médio Amazonas. 2006. Monografia (Aperfeiçoamento/Especialização em Especialização em genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

6.
SAMPAIO, I.; SILVA, A.; SCHENEIDER, H.. Participação em banca de Carmen Elinor Lobato Coimbra. Identificação molecular de arraias do rio Tapajós. 2006. Monografia (Aperfeiçoamento/Especialização em Especialização em genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

Trabalhos de conclusão de curso de graduação
1.
SCHNEIDER, M. P. C.; Artur Silva; Fiore, M. F.. Participação em banca de PEDRO IVO GUIMARAES BRAGA DA SILVA.GENOMA DA CIANOBACTÉRIA SYNECHOCOCCUS SP. R8. 2014. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biotecnologia) - Universidade Federal do Pará.

2.
SCHINEIDER, Maria Paula Cruz; Silva, Artur; Fiore, M. F.. Participação em banca de TIAGO FERREIRA LEAO.MINERAÇÃO DE CLUSTERS GÊNICOS DE PRODUTOS NATURAIS NO GENOMA DE NOSTOC SP. DA AMAZÔNIA. 2014. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biotecnologia) - Universidade Federal do Pará.

3.
SILVA, A. O. A.; SCHNEIDER, Horacio; SILVA, A.. Participação em banca de Thomaz Xavier Carneiro.Diversidade genética e eficiência de DNA microssatélites para o controle genealógico da raça Nelore. 2007. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Pará.

4.
SILVA, A.; CORVELO, Tereza Cristina de Oliveira. Participação em banca de Igor Brasil Costa.Perfil epidemiológico e diagnóstico molecular do Treponema pallidum subespécie pallidum em gestações com morte fetal ou perinatal. 2007. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biomedicina) - Universidade Federal do Pará.

5.
SILVA, A.; CORVELO, Tereza Cristina de Oliveira; AGUIAR, Délia Cristina Figueira. Participação em banca de Gyselle de Cássia Bastos de Matos.Expressão dos antígenos de grupos sanguíneos ABO em primatas do Novo Mundo da Região Amazônica. 2007. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Pará.

6.
SANTOS, Alberdan Silva; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz; SILVA, A.. Participação em banca de Nader Santos Margalho.O uso de bases de dados como instrumento para a pesquisa de processos microbiológicos. 2007. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Pará.

7.
Ribeiro HFL; VALLE, William Gomes; SILVA, A.. Participação em banca de Bruno Luis Filgueiras Rodrigues.Análise genômica estrutural do gene da miostatina em gado nelore (Bos indicus). 2007. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Medicina Veterinária) - Universidade Federal Rural da Amazônia.

8.
SILVA, A.; CORVELO, Tereza Cristina de Oliveira; MARTINS, Luisa Caricio. Participação em banca de Mayara de Oliveira e Silva.Perfil soroepidemiológico da sífilis em casos de aborto em mulheres atendidas na Fundação Santa Casa de Misericórdia do Pará (F.S.C.M. - PA).. 2006. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biomedicina) - Universidade Federal do Pará.

9.
CORVELO, Tereza Cristina de Oliveira; AGUIAR, Délia Cristina Figueira; SILVA, A.. Participação em banca de Felipe Bonfim Freitas.Caracterização epidemiológica e a infecção pela H. pylori em pacientes com úlcera péptica de Belém-PA. 2005. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Licenciatura Plena em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Pará.

10.
SILVA, A.; NASCIMENTO, José Luiz Martins Do; GONÇALVES, Evonnildo Costa. Participação em banca de Juliana Simão Nina de Azevedo.Identificação de genes da Chromobacterium violaceum com potencial biotecnológico na aplicação da detoxificação ambiental. 2004. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Pará.

11.
SILVA, A.; HARADA, Maria Lúcia; SANTOS, Sidney Emanuel Batista dos. Participação em banca de Vanderson de Souza Sampaio.Aplicação da bioinformática na anotação de genomas. 2002. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado Em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Pará.

12.
SILVA, A.; HARADA, Maria Lúcia; SANTOS, Eduardo José Melo dos. Participação em banca de Mauro André Damasceno de Melo.Organização e estrutura do genoma mitocondrial dos grandes macacos. 2002. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Licenciatura Plena em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Pará.

13.
SILVA, A.; HAMEL, Arno Holf; SANTOS, Sidney Emanuel Batista dos. Participação em banca de Adonis Melo Lima.Montagem e anotação de sequencias nucleotídicas usando como modelo o gene da leptina (b. bubalis). 2002. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Licenciatura Plena em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Pará.

14.
SILVA, A.; ISHAKE, Ricardo; HARADA, Maria Lúcia. Participação em banca de Igor Schneider.Sequenciamento do gene da proteína pron celular (PRPC) em primatas neotropicais. 2002. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Licenciatura Plena em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Pará.

Outros tipos
1.
CORVELO, Tereza Cristina de Oliveira; SILVA, A.; MARTINS, Luisa Caricio. Participação em banca de Hivana Patrícia Melo Barbosa. Infecção pela bactéria Helicobacter pylori e o polimorfismo do gene do fator de necrose tumoral alfa. 2005. Outra participação, Universidade Federal do Pará.

2.
SILVA, A.; CORVELO, Tereza Cristina de Oliveira. Participação em banca de Jucyclaiton Tavares de Souza. Caracterização das cepas BabA2 e CagA da Helicobacter pylori em pacientes com patologias gástricas de Belém-Pará e sua correlaçao com o sistema de grupos sanguíneos Lewis. 2005. Outra participação, Universidade Federal do Pará.



Participação em bancas de comissões julgadoras
Concurso público
1.
MALM, O.; ALVIANO, C. S.; PESSOA JUNIOR, A.; Artur Silva; OLIVARES, F. L.. Concurso público para professor adjunto de ecologia microbiana. 2014. Universidade Federal do Rio de Janeiro.

2.
MALM, O.; Artur Silva; PEDROSA, F. O.. Concurso público para professor auxiliar em microbiologia ambiental. 2013. Universidade Federal do Rio de Janeiro.

3.
Garratt, R; Oliveira, Sergio C; Silva, Artur; Santoro, M.M.. Concurso público para professor adjunto de bioinformática. 2011. Universidade Federal de Minas Gerais.

4.
Rodrigues, L R R; Silva, Artur; LIMA, M. M. C.. Concurso público para professor adjunto de genética. 2010. Universidade Federal do Oeste do Pará.

5.
Silva, Artur; NASCIMENTO, J. L. M.; QUARESMA, J. A. S.. Concurso público para porfessor adjunto de vacinas e imunologia. 2010. Universidade Federal do Pará.

6.
Silva, Artur; GONÇALVES, Evonnildo Costa; Lameira, Jerônimo. Concurso público para professor adjunto de proteômica e enzimologia. 2010. Universidade Federal do Pará.

7.
AZEVEDO, Vasco Ariston de; pellizari, V. H.; SILVA, A. Concurso público para professor adjunto de microbiologia. 2009. Universidade Federal do Pará.

8.
NASCIMENTO, José Luiz Martins Do; DARNET, S. H.; SILVA, A. Concurso público para professor adjunto de engenharia genética. 2009. Universidade Federal do Pará.

9.
NASCIMENTO, J. L. M.; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz; SILVA, A. Concurso público para professor adjunto de biotecnologia. 2009. Universidade Federal do Pará.

10.
ISHAKE, Ricardo; Guimarães Ishak; pellizari, V. H.; SILVA, A.. Concurso público para professor adjunto de microbiologia. 2008. Universidade Federal do Pará.

11.
SILVA, A.; PIECKZARKA, Julio Cesar; LIMA, M. M. C.. Concurso Público para professor substituto da disciplina Genética. 2007. Departamento de Genética.

12.
SILVA, A.; GUERREIRO, João Farias; SANTOS, Ândrea Kely Ribeiro dos; SCHNEIDER, Horacio. Membro da banca da comissão avaliadora do exame de seleção do Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular. 2005. Universidade Federal do Pará.

13.
SILVA, A.; GUERREIRO, João Farias; SANTOS, Ândrea Kely Ribeiro dos. Membro da banca da comissão avaliadora do exame de seleção do Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular-Programa Institucional de Qualificação Docente. 2005. Universidade Federal do Pará.

14.
HAMEL, Arno Holf; SILVA, A.; CONTI, Fátima. Concurso Público para professor substituto da materia análise e interpretação de dados - Biometria. Curso de Ciências Biológicas. 2005. Universidade Federal do Pará.

15.
SILVA, A.. Concurso público Processo Seletivo Seriado (vestibular) 2004 - Membro da banca examinadora de Biologia. 2004. Universidade Federal do Pará.

16.
SILVA, A.; BERG, Ana Virginia Vam Der; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz. Concurso público para professor adjunto do curso de medicina - genética. 2004. Universidade do Estado do Pará.

17.
SILVA, A.; SANTOS, Sidney Emanuel Batista dos; GUERREIRO, João Farias; SANTOS, Eduardo José Melo dos; SCHNEIDER, Horacio. Membro da banca da comissão avaliadora do exame de seleção do Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular. 2004. Universidade Federal do Pará.

18.
SILVA, A.; CORVELO, Cristina Tereza; CABRAL, Isabel Rosa. Concurso público para professor substituto da materia Genética. Curso de Ciências Biológicas. 2003. Universidade Federal do Pará.

19.
SILVA, A.; HAMEL, Arno Rolf; CONTI, Fátima. Concurso Público para professor substituto da materia análise e interpretação de dados - Biometria. Curso de Ciências Biológicas. 2003. Universidade Federal do Pará.

20.
SILVA, A.; GUERREIRO, João Farias; PIECKZARKA, Julio Cesar; SANTOS, Sidney Emanuel Batista dos. Membro da banca da comissão avaliadora do exame de seleção do Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular. 2003. Universidade Federal do Pará.

21.
SILVA, A.; BARBOSA, Diomedes; TAMEN, Imke; ELLER, Maria Luiza Peltz. Concurso público para professor adjunto da materia Imunologia Veterinária. Curso de Medicina Veterinária. 2002. Universidade Federal do Pará.

22.
SILVA, A.; BARBOSA, Diomedes; TAMEN, Imke. Concurso público para professor assistente de imunologia veterinária. Curso de Medicina Veterinária. 2002. Universidade Federal do Pará.

Outras participações
1.
Burbano, Rommel; OLIVEIRA, E.; Costa da Silva, Artur Luiz. Membro da banca da comissão avaliadora do exame de seleção do Programa de Pós-Graduçaõ em Genética e Biologia Molecular. 2012. Universidade Federal do Pará.

2.
SILVA, A; SILVA JUNIOR, Wilson Araujo da; NOUSHMEHR, H.. Comissão julgadora dos prêmios: painel iniciação científica e pós-graduação na área de Genômica. 2012. Sociedade Brasileira de Genética.

3.
SILVA JUNIOR, Wilson Araujo da; SILVA, A; NOUSHMEHR, H.. Comissão julgadora do prêmico de pós-graduação - apresentação oral. 2012. Sociedade Brasileira de Genética.

4.
Costa da Silva, Artur Luiz; Lameira, Jerônimo; ALVES, Cláudio Nahum. Membro da banca da comissão avaliadora do exame de seleção do Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular - Bioinformática. 2011. Universidade Federal do Pará.

5.
NAGAMASHI, Cleusa; DARNET, S. H.; SANTOS, Ândrea Kely Ribeiro dos; SILVA, A. Membro da banca da comissão avaliadora do exame de seleção do Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular. 2010. Universidade Federal do Pará.

6.
Silva, Artur. Seminário de avaliação final dsa pesquisas apoiadas pelo programa pesquisa para o SUS. 2010. Secretaria de Ciência, Tecnologia e Educação do Estado do Pará.

7.
Leite, J.P.G; SILVA, A.. Avaliação PIBIC CNPq Instituto Evandro Chagas. 2007. Instituto Evandro Chagas.

8.
SILVA, A.; CAREPO, Marta Sofia Peixe; GONÇALVES, Evonnildo Costa; SILVA JÚNIOR, José de Souza e. Programa de Pós-graduação em Genética e Biologia Molecular - Membro da Banca de Seleção - Mestrado. 2005. Universidade Federal do Pará.

9.
SILVA, A.; SANTOS, Sidney Emanuel Batista dos; SCHNEIDER, Horacio. Programa de Pós-graduação em Genética e Biologia Molecular - Membro da Banca de Seleção - Mestrado. 2004. Universidade Federal do Pará.

10.
SILVA, A.; NAGAMASHI, Cleusa; HARADA, Maria Lúcia; SANTOS, Sidney Batista dos. Programa de Pós-graduação em Genética e Biologia Molecular - Membro da Banca de Seleção - Mestrado. 2003. Universidade Federal do Pará.

11.
SILVA, A.; PIECKZARKA, Julio; HARADA, Maria Lúcia; SANTOS, Eduardo Melo dos. Programa de Pós-graduação em Genética e Biologia Molecular - Membro da Banca de Seleção - Mestrado. 2002. Universidade Federal do Pará.



Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
4th Annual world DNA and genome day. The pangenome of Corynebacterium pseudotuberculosis. 2013. (Congresso).

2.
5th Next Generation Sequencing Congress & Single Cell Analysis Congress. NA. 2013. (Congresso).

3.
Ion World 2013.NA. 2013. (Encontro).

4.
I simpósio de genômica funcional e biologia sistêmica de microorganismos.Plataformas de nova geração para análise genômica bacteriana. 2013. (Simpósio).

5.
Marine Molecular Ecology.NA. 2013. (Encontro).

6.
CBAB.De Sanger a SOLiD. Estrategias de Secuenciamiento Automático de DNA de Última Generación (Principales Tecnologías NGS). Procesamiento de datos para plataformas NGS. 2012. (Seminário).

7.
Seminários do Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuária.O pangenoma de Corynebacterium pseudotuberculosis. 2012. (Seminário).

8.
III Seminários Avançados em Tecnologia de Microarrays e Next Generati on Sequencing -.Utilização da plataforma SOLiD na reconstrução do pangenoma de Corynebacterium pseudotuberculosis. 2011. (Seminário).

9.
Next generation sequencing experience.Versatilidade da plataforma SOLiD: A experiência da Rede Paraense de Genômica e Proteômica. 2011. (Encontro).

10.
56 Congresso Barsileiro de Genética. Avaliação de paines - Genética de microorganismos. 2010. (Congresso).

11.
56 Congresso Brasileiro de Genética. A próxima geração de tecnologias de sequenciamento: qual é o futuro da genômica?. 2010. (Congresso).

12.
Semana do biomédico 2010.Desafios e perspectivas da Rede Paraense de Genômica e Proteômica. 2010. (Seminário).

13.
XX Seminário Nacional de Parques Tecnológicos e Incubadoras de Empresas & XVIII Workshop Anprotec.Ciência da vida x MPEs inovadoras: tendências, oportunidades e desafios. 2010. (Seminário).

14.
25 Congresso Brasileiro de Microbiologia. Avaliação de resumos. 2009. (Congresso).

15.
25 Congresso Brasileiro de Microbiologia. Contribuição do sequenciamento de nova geração para a pangenômica. 2009. (Congresso).

16.
Aula inaugural do Núcleo de Pós-Graduação do ICB UFMG.Genômica: a próxima geração. 2009. (Outra).

17.
XI Congresso Brasileiro de Biomedicina. Metagenômica: uma nova estratégia para exploração biotecnológica do universo microbiano. 2008. (Congresso).

18.
XI Congresso Brasileiro de Biomedicina. Biotecnologia e biodiversidade. 2008. (Congresso).

19.
XI Congresso Brasileiro de Biomedicina. Aplicação da tecnologia de cromatrografia líquida na análise do DNA: Desvendando a diversidade bacteriana. 2008. (Congresso).

20.
II seminário de atualização em Medicina Veterinária e Zootecnia.Controle genealógico através do exame do DNA em Nelore. 2007. (Seminário).

21.
2o Enontro de Genética do Norte.2o Encontro de Genética do Norte. 2006. (Encontro).

22.
3o Festival das Águas.3o Festival das Águas. 2006. (Seminário).

23.
Conferências e Seminários do Centro Nacional de Biotecnologia.Bacterial and archeal diversity of Tucurui Lake, Brazilian Amazon. 2006. (Seminário).

24.
II Seminário Ronaldo de Araújo.Professor Tutor. 2006. (Seminário).

25.
Sexta Técnica.Verticalização da produção pecuária do Estado através da tecnologia genômica. 2006. (Seminário).

26.
3a Conferência Regional de Ciência, Tecnologia e Inovação.Conferência Regional de Ciência Tecnologia e Inovação. 2005. (Encontro).

27.
II Workshop Tecnológico da Pecuária.II Workshop Tecnológico da Pecuária. 2005. (Oficina).

28.
Reunião Regional da Federação de Sociedades de Biologia Experimental. Conferencista da 1a Reunião Regional da FESBE: Introdução à técnica de interferência de RNA. 2005. (Congresso).

29.
Workshop de Pesquisa e Desenvolvimento Tecnológico.Workshop de Pesquisa e Desenvolvimento Tecnológico. 2005. (Encontro).

30.
Workshop internacional sobre microbiologia ambiental. 2005. (Oficina).

31.
Esforço de Conservação da Biodiversidade Brasileira: Encontro de Coordenadores dos Subprojetos Apoiados pelo PROBIO.Encontro de Coordenadores dos Subprojetos Apoiados pelo PROBIO. 2004. (Encontro).

32.
III Semana de Biomedicina.Palestrante na III Semana de Biomedicina. 2004. (Encontro).

33.
Reuinião Regional da SBPC. A célula silenciosa: a tecnologia de interferência do RNA. 2004. (Congresso).

34.
Semana Nacional de Ciência e Tecnologia.1a Semana Nacional de Ciência e Tecnologia. 2004. (Encontro).

35.
Fórum de Bionegócios na América do Sul. 2003. (Oficina).

36.
10 Congresso Brasileiro de Primatologia. Palestrante no 10 Congresso Brasileiro de Primatologia. 2002. (Congresso).

37.
16 Encontro de genética do nordeste.Aplicações da genética molecular em bovinos com o tema Construção de bibliotecas genômicas e seu uso no desenvolvimento de marcadores microssatélites em búfalos.. 2002. (Encontro).

38.
48 Congresso Nacional de Genética. 48o Congresso Brasileiro de Genética. 2002. (Congresso).

39.
48 Congresso Nacional de Genética. 2002. (Congresso).

40.
Encontro de Genética do Nordeste.16o Encontro de Genética do Nordeste. 2002. (Encontro).

41.
Seminário de apresentação de resultados dos projetos de pesquisa dirigida.Seminário de Apresentação de Resultados dos Projetos de Pesquisa Dirigida - PPD/Edital 01/98. 2002. (Seminário).

42.
Seminário de Apresentação de Resultados dos Projetos de Pesquisa Dirigida.Seminário de apresentação de resultados dos projetos de pesquisa dirigida - PPD/Edital 01/98. 2002. (Seminário).

43.
The B.I.G. Conference. 2001. (Congresso).

44.
1o workshop as Ciências Biológicas na UFPA.Análise genômica em búfalos da Amazônia. 1999. (Oficina).


Organização de eventos, congressos, exposições e feiras
1.
SILVA, A. 26 Congresso Brasileiro de Microbiologia. 2011. (Congresso).

2.
Silva, Artur; Vasconcelos AT ; Rosado AS ; Kruger RH . Metagenômica ambiental e a nova geração de sequenciadores: avanços e desafios. 2009. (Congresso).

3.
SILVA, A.; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz . Avanços Recentes en Genética e Biologia Molecular. 2005. (Congresso).

4.
SILVA, A.. 1st Buffalo Symposium fo Americas. 2002. (Congresso).

5.
SILVA, A.. Genética Molecular Microbiana. 2002. (Congresso).



Orientações



Orientações e supervisões em andamento
Dissertação de mestrado
1.
Thayana Almeida Walsh. Isolamento e caracterização genômica de micro-organismos nas galerias da UHE Tucurui. Início: 2016. Dissertação (Mestrado profissional em Programa de pós-graduação em engenharia de barragens e gestão ambiental) - Universidade Federal do Pará. (Orientador).

Tese de doutorado
1.
Alyne Cristina Sodré Lima. Comparação genômica entre linhagens de Corynebacterium pseudotuberculosis e Corynebacterium diphtheria. Início: 2015. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. (Orientador).

2.
JOAO MARIA DO AMARAL JUNIOR. Produção entérica de metano em bubalinos alimentados com torta de palmiste. Início: 2014. Tese (Doutorado em Ciência Animal) - Universidade Federal do Pará. (Coorientador).

3.
Marcus de Barros Braga. Detecção e Eliminação de Redundância em Contigs no Processo de Montagem de Genomas de Procariotos. Início: 2014. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará. (Orientador).

Iniciação científica
1.
Sávio de Souza costa. Definir o pipeline de enriquecimento de anotação do genoma do búfalo. Início: 2015. Iniciação científica (Graduando em Biotecnologia) - Universidade Federal do Pará, Fundação Amazônia Paraense de Amparo à Pesquisa. (Orientador).

2.
Amália Raiana Fonseca Lobato. Padronização da predição e curadoria dos genes do genoma do Búfalo do Marajó através de diferentes ferramentas de bioinformática. Início: 2015. Iniciação científica (Graduando em Biomedicina) - Universidade Federal do Pará, Fundação Amazônia Paraense de Amparo à Pesquisa. (Orientador).

Orientações de outra natureza
1.
Marta Cristina Oliveira Martins Tacão. Resistance to last-resort antibiotics in natural environments. Início: 2017. Orientação de outra natureza. Universidade de Aveiro. Fundação de Ciência e Tecnologia. (Orientador).


Orientações e supervisões concluídas
Dissertação de mestrado
1.
Luciano Chaves Franco Filho. Análise Pan-Genômica do gênero Desulfovibrio. 2012. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará, . Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

2.
Adonney Allan de Oliveira Veras. AutoassemblyD Software para submissão e gerenciamento de montagem de genomas de modelos XML. 2012. Dissertação (Mestrado em BIOTECNOLOGIA) - Universidade Federal do Pará, . Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

3.
Andreia do Socorro de Sousa Silva. Genoma da Corynebacterium Ulcerans FRC58. 2012. Dissertação (Mestrado em BIOTECNOLOGIA) - Universidade Federal do Pará, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

4.
Pablo Henrique Caracciolo Gomes de Sá. FunSys: programa para análises funcionais de transcriptoma e proteoma de procariotos. 2010. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará, . Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

5.
Thiago Souza Lopes. O genoma da Corynebacterium pseudotuberculosis linhagem 267. 2010. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

6.
Diego Assis das Graças. Ocorrência de Arqueias metanogênicas no reservatório da Usina Hidrelétrica de Tucurui. 2009. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

7.
Rommel Thiago Jucá Ramos. Desenvolvimento de um suite de aplicativos computacionais para suporte aa montagem de genomas bacterianos a partir de leituras curtas. 2008. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

8.
Samir Mansour Moraes Casseb. Montagem de genomas do vírus dengue tipo 4 utilizando dados de pirosequenciamento. 2008. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará, . Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

9.
Louise Teixeira Cerdeira. Montagem ab initio de um genoma procarioto utilizando sequencias curtas de uma biblioteca pareada: Caso de estudo Corynebacterium pseudotuberculosis, linhagem I 19. 2008. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará, Funbdação de Amparo a Pesquisa do Estado do Pará. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

10.
Rafael Azevedo Baraúna. Proteômica comparativa da Chromobacterium violaceum linhagem ATCC 12472 durante o processo de metabolização do cianato. 2008. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará, Funbdação de Amparo a Pesquisa do Estado do Pará. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

11.
Larissa Paola Rodrigues Venâncio. Isolamento e caracterização de microssatélites em Búfalos de Rio (bubalus bubalis) a partir da construção de bibliotecas genômicas parciais com hibridização seletiva. 2008. Dissertação (Mestrado em Biociências) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Coorientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

12.
Adonis de Melo Lima. Modelagem por homologia da proteína metil coenzima M redutase da Methanosarcina mazei isolada do reservatório da UHE Tucuruí - PA. 2008. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará, . Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

13.
Maria do Socorro da Silva Mota. Validação e padronização da tecnologia de cromatografia liquida desnaturante de alta performance na análise de 13 locos do genoma humano usadas em estudos de vínclulo genético. 2007. 0 f. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará, . Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

14.
Leonardo Teixeira Dall'agnol. Diversidade de populações de Synechoccocus sp. no reservaorio da hidrelétrica de Tucurui, Amazônia Oriental Brasileira. 2007. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

15.
Ricardo Lopes Souza. Diversidade de duas famílias de genes bacterianos relacionados a reciclagem de biomassa no reservatório da Hidrelétrica de Tucuruí. 2006. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

16.
Vanderson de Souza Sampaio. O genoma mitocondrial de Cebus capucinus (Cebidae, Primates). 2005. 60 f. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará, . Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

17.
Helio Longoni Plautz Junior. Relações evolutivas em Aotus Illiger 1811 (Platyrrhini, Cebidae) baseadas em sequencias de DNa mitocondrial. 2005. 96 f. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

18.
Vanessa de Souza Guimarães. Detecção da helicobacter pylori através da técnica de reação em cadeia da polimerase em amostras fecais de crianças da cidade de Belém - Pará. 2005. 0 f. Dissertação (Mestrado em Pós Graduação Em Patologia das Doenças Tropicais) - Universidade Federal do Pará, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

19.
Mauro Andre Damasceno de Melo. Variabiliadde e diferenciação genética em três populações naturais de Macacos da Noite (Aotus infulatus). 2004. 0 f. Dissertação - Universidade Federal do Pará, . Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

20.
Ednaldo da Silva Filho. Diversidade e relações genéticas de seis raças de cavalos. 2003. 50 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Pará, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

21.
Elytania Veiga de Menezes. Análise da variabilidade genética em bovinos da raça Simental utilizando como ferramentas loci mini e microssatélites. 2003. 70 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Pará, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

Tese de doutorado
1.
Eziquiel de Morais. ÓLEO DE PALMA E DESTILADO DA DESODORIZAÇÃO DO ÓLEO DE PALMA (DDOP) NA MITIGAÇÃO DA PRODUÇÃO DE METANO EM OVINOS. 2014. Tese (Doutorado em Ciência Animal) - Universidade Federal do Pará, . Coorientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

2.
Syed Babar Jamal Bacha. Sequenciamento, montagem e anotação do genomas de Corynebacterium emergentes. 2013. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

3.
Diogo Marinho. Analysis of massive multi-omics data sets in the context of huge biological networks. 2012. Tese (Doutorado em BIOTECNOLOGIA) - Universidade Federal do Pará, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

4.
Pablo Henrique Caracciolo Gomes de Sá. Montagem do genoma do Sabiá-laranjeira (Turdus rufiventris): a ave símbolo do Brasil. 2012. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

5.
Rommel Thiago Jucá Ramos. Pipeline para obtenção de genomas bacterianos por sequenciamento semicondutor. 2011. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

6.
Rafael Azevedo Barauna. Proteoma diferencial e caracterização da proteína reguladora da síntese de ácidos graxos em Exiguobacterium antarticum B7. 2011. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

7.
Danillo Oliveira de Alvarenga. Análise genômica e funcional da cianobactéria Nostoc sp. CENA67 e caracterização da sua comunidade microbiana associada. 2011. Tese (Doutorado em Energia Nuclear na Agricultura (Esalq)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Coorientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

8.
Diego Assis das Graças. Micro-organismos no reservatório da Usina Hidrelétrica de Tucuruí: Diversidade genética e genômica. 2011. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

9.
Hivana Patrícia Melo Barbosa. Análise transcriptômica da expressão diferencial térmica de Exiguobacterium antarcticum linhagem B7. 2008. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

10.
Adriana Ribeiro Carneiro. Genômica e transcriptômica estrutural da bactéria psicrotrófica Exiguobacterium antarticum linhagem B7. 2008. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

11.
RENÉ RIBEIRO DA SILVA. DETECÇÃO E CARACTERIZAÇÃO MOLECULAR DE ROTAVÍRUS, PICOBIRNAVÍRUS E REOVÍRUS EM AVES DE CORTE CRIADAS EM GRANJAS NA MESOREGIÃO METROPOLITANA DE BELÉM, PARÁ, BRASIL. 2008. Tese (Doutorado em Doenças Tropicais) - Universidade Federal do Pará, . Coorientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

12.
Alessandra Ciprandi. Análise proteômica da resposta ao arsênio e do exoproteoma de Chromobacterium violaceum. 2007. Tese (Doutorado em Doenças Tropicais) - Universidade Federal do Pará, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

Supervisão de pós-doutorado
1.
Flavia Figueira Aburjaile. 2016. Universidade Federal do Pará, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Artur Luiz da Costa da Silva.

2.
Diego Assis das Graças. 2014. Universidade Federal do Pará, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Artur Luiz da Costa da Silva.

3.
Rafael Azevedo Barauna. 2014. Universidade Federal do Pará, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Artur Luiz da Costa da Silva.

4.
Adriana Ribeiro Carneiro. 2012. Universidade Federal do Pará, . Artur Luiz da Costa da Silva.

5.
Sintia Silva Almeida. 2011. Universidade Federal do Pará, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Artur Luiz da Costa da Silva.

6.
Anne Cybelle Pinto. Pangenoma de Corynebacterium pseudotuberculosis. 2011. Universidade Federal do Pará, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Artur Luiz da Costa da Silva.

Trabalho de conclusão de curso de graduação
1.
PAULO ROBERTO DE OLIVEIRA MIRANDA. ANÁLISE DA DIVERSIDADE DE PROCARIOTOS NO RESERVATÓRIO DA USINA HIDRELÉTRICA DE TUCURUÍ. 2015. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Engenharia da Computação) - Universidade Federal do Pará. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

2.
Luciano Chaves Franco Filho. Caracterização do mecanismo de reparo de DNA do gênero Exiguobacterium. 2011. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Bacharelado Em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Pará, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

3.
Amanda Gabrielle Nunes Mello. Análise da diversidade microbiana endofítica durante o processo de fermentação da mandioca (manihot esculenta). 2008. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Bacharelado em Ciências Farmaceuticas) - Universidade Federal do Pará. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

4.
Cíntia Sayaka Kodama. Análise da diversidade microbiana endofítica durante o processo de fermentação da mandioca (manihot esculenta). 2008. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Bacharelado em Ciências Farmaceuticas) - Universidade Federal do Pará. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

5.
Diego Assis das Graças. Análise da diversidade de Arquéias presentes no reservatório da Usina Hidrelétrica de Tucurui-PA. 2008. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Bacharelado em Ciências Farmaceuticas) - Universidade Federal do Pará. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

6.
Rafael Azevedo Baraúna. Análise proteômica da resistência de Chromobacterium violaceum ao arsênio. 2008. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Bacharelado em Ciências Farmaceuticas) - Universidade Federal do Pará. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

7.
Thomaz Xavier Carneiro. Diversidade genética e eficiência de DNA microssatélites para o controle genealógico da raça Nelore. 2007. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Bacharelado Em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Pará. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

8.
Juliana Nina Azevedo. Identificação de genes da Chromobacterium violaceum com potencial biotecnológico na aplicação da detoxificação ambiental. 2004. 29 f. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Bacharelado Em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Pará, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

9.
Andre Luiz Viard Walsh Monteiros. Delimitação dos núcleos talâmicos em búfalos d'água, Bubalus bubalis (Co-orientador). 2003. 50 f. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Bacharelado Em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Pará. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

10.
Helio Longoni Plautz Junior. Relações evolutivas em Aotus (Platyrrhini, Cebidae) baseadas em seqüências de DNA nuclear e mitocondrial. 2003. 67 f. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Bacharelado Em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Pará. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

11.
Adonis de Melo Lima. Montagem e anotação de seqüências nucleotídicas usando como modelo o gene da leptina (B. bubalis). 2002. 50 f. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Bacharelado Em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Pará. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

12.
Igor Schneider. Sequenciamento do gene da proteína prion celular (PRPC) em primatas neotropicais. 2002. 50 f. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Licenciatura Plena em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Pará. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

13.
Mauro Andre Damasceno de Melo. Organização e estrutura do genoma mitocondrial dos grandes macacos. 2002. 50 f. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Licenciatura Plena em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Pará. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

14.
Adonis de Melo Lima. Aplicação da bioinformática na anotação de genomas. 2002. 50 f. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Licenciatura Plena em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Pará. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

15.
Elytania veiga menezes. Variabilidade Genética nos Loci DNA Microssatélite INRA 005, 023 e 063 em Bovinos das Raças Simenthal e Nelore do Brasil. 2000. 0 f. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Bacharelado Em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Pará. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

16.
Ednaldo da Silva Filho. Variabilidade Genética dos Loci DNA Microssatélite em Cavalos das Raças Brasiliero de Hipismo, Marajoara e Puruca. 2000. 50 f. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Bacharelado Em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Pará. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

Iniciação científica
1.
Marcos Damrley Galvao da Luz. Análise pangenômica em Corynebacterium pseudiotuberculosis. 2014. Iniciação Científica. (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Pará, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

2.
David Batista Maués. análise filogenômica em Corynebacterium. 2014. Iniciação Científica. (Graduando em Biotecnologia) - Universidade Federal do Pará, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

3.
Yan Patrick de Moraes Pantoja. Ilhas de patogenicidade no genoma de Corynebacterium pseudotuberculosis. 2014. Iniciação Científica. (Graduando em Engenharia da Computação) - Faculdade Estácio de Belém, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

4.
Walbert Silva. O papel dos microorganismos na produção e consumo de metano em reservatórios hidrelétricos brasileiros. 2012. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado em Sistemas de Informação) - Universidade Federal do Pará. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

5.
Fabio Malcher Miranda. apoio as atividades da Rede Paraense de Genômica e Proteômica & PRONEX Núcleo Amazônico de Excelência em Genômica de Microorganismos. 2012. Iniciação Científica. (Graduando em Ciência da Computação) - Universidade Federal do Pará, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

6.
Alex Ranieri Jerônimo Lima. Anotação funcional do genoma da Exiguobacterium antarticum. 2010. Iniciação Científica. (Graduando em Biomedicina) - Universidade Federal do Pará, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

7.
Nilson Antônio da Rocha Coimbra. Análise, curadoria e mineração do banco de dados da Rede Paraense de Genômica e Porteômica. 2010. Iniciação Científica. (Graduando em Engenharia da Computação) - Faculdade Estácio de Belém, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

8.
Luciano Chaves Franco Filho. Uso de display diferencial na identificação de vias metabólicas sensíveis ao estresse térmico em Corynebacterium psudotuberculosis. 2010. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado Em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Pará, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

9.
Rafael Ribeiro Barata. Análise da expressão do gene ntcA no metagenoma do lago de Tucurui, Pará. 2009. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado Em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Pará, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

10.
Luis Claudio Batista Luz. Investigação do potencial de biomineração da Chromobacterium violaceum através da análise proteômica. 2009. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado em Ciências Farmaceuticas) - Universidade Federal do Pará, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

11.
Cintia Sayaka Kodama. Diversidade bacteriana endofítica em mandioca. 2008. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado em Ciências Farmaceuticas) - Universidade Federal do Pará. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

12.
Paulo Roberto de Oliveira Miranda. Aplicativo computacional para análise da diversidade e diversidade de componentes de metagenomas. 2007. Iniciação Científica. (Graduando em Engenharia de Computação) - Universidade Federal do Pará, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

13.
Priscila Di Paula Bessa Santana. Modelagem Comparativa de proteínas McrA em arquéias do reservatório da Usina Hidroelétrica de Tucuruí. 2007. Iniciação Científica. (Graduando em Biomedicina) - Universidade Federal do Pará, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

14.
Amanda Mello. Análise do perfil e da diversidade de populações microbianas por desnaturação em cromatografia liquida de alta performance (DHPLC). 2007. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado em Ciências Farmaceuticas) - Universidade Federal do Pará, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

15.
Priscila di Paula Bessa Santana. Proteoma do músculo esquelético do búfalo. 2006. Iniciação Científica. (Graduando em Biomedicina) - Universidade Federal do Pará, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

16.
Joyce Mendes de Arruda Câmara. Estrutura genômica da miostatina em gado europeu. 2005. 0 f. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado Em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Pará, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

17.
Thomaz Xavier Carneiro. Análise de variabilidade genética em gado Nelore através de marcadores moleculares DNA microssatélites. 2005. 0 f. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado Em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Pará, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

18.
Carinne de Nazaré Monteiro Costa. Análise de código de barras (Barcoding) utilizando etiquetas de DNA da porção 5'do gene mitocondrial COI em aves Neotropicais. 2005. 0 f. Iniciação Científica. (Graduando em Licenciatura Plena Em Ciências Biológicas) - Centro Universitário do Estado do Pará, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

19.
Thomaz Xavier Carneiro. Aplicação e validação do painel de microssatélites da Sociedade Internacional de Genética Animal na identificação de perfis genéticos do rebanho bovino brasileiro. 2005. 0 f. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado Em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Pará, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

20.
Helio Longoni Plautz Junior. Variabilidade genética em Macacos da Noite através de DNA microssatélites. 2004. 0 f. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado Em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Pará, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

21.
Gisele Bastos Rolim. Variabilidade genética em Lagostas vermelhas (Panulirus argus). 2004. 0 f. Iniciação Científica. (Graduando em Licenciatura Plena em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Pará, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

22.
Bruno Luis Filgueiras Rodrigues. Análise genômica estrutural do Gene da Miostatina em Gado Nelore. 2004. 0 f. Iniciação Científica. (Graduando em Medicina Veterinária) - Universidade Federal Rural da Amazônia, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

23.
Diogo Santos Lavareda Medeiros. Análise da variabilidade genética de populações naturais de Eudocimus ruber (Aves: Ciconiiformes) através da técnica de RAPD (Random Amplified Polimorphic DNA). 2002. 0 f. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado Em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Pará, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

24.
Ana Paula Freitas. Caracterização molecular do ORF do gene priônico celular em primatas do Novo Mundo. 2001. 0 f. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado Em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Pará. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

25.
Igor Schneider. Isolamento do gene codificador da proteína priônica celular (PRPC) a partir de uma biblioteca contendo um genoma equivalente do Búfalo de Pântano (Bubalus bubalis, Linnaeus) (2N=48).. 2001. 0 f. Iniciação Científica. (Graduando em Licenciatura Plena em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Pará. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

26.
Adonis de Melo Lima. Implantação dos Aplicativos para Análise Genômica de ambiente Unix. 2001. 0 f. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado Em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Pará, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

27.
Vanderson de Souza Sampaio. Implantação dos Aplicativos para Análise Genômica de ambiente Microsoft Windows NT. 2001. 0 f. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado Em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Pará. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

28.
Helio Longoni Plautz Junior. Filogenia molecular dos Macacos da Noite com base na região controladora do genoma mitocondrial. 2001. 0 f. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado Em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Pará. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

29.
Juliana Nina Azevedo. Sequenciamento do genoma mitocondrial do Cebus apella. 2001. 0 f. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado Em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Pará, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

30.
Igor Schneider. Variabilidade Genética no Receptor do Gene do Hormônio do Crescimento em Bovídeos Nelore e Murrah. 2000. 0 f. Iniciação Científica. (Graduando em Licenciatura Plena em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Pará, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

31.
Moises Batista da Silva. Variabilidade Genética no Locus DNA Microssatélites C2165 em Cães das Raças Fila e Terrier Brasileiro. 2000. 0 f. Iniciação Científica. (Graduando em Licenciatura Plena em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Pará. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

32.
Breno Eduardo da Silva Barros. Variabilidade Genética em Lagostas Vermelhas da Costa Norte Brasileira. 2000. 0 f. Iniciação Científica. (Graduando em Bacharelado Em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Pará, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

Orientações de outra natureza
1.
Núbia Seyffert. CAPES BJT - Identificação de Proteínas Efetoras do Sistema de Secreção Tipo VII de Corynebacterium pseudotuberculosis sob condições de estresse biologicamente relevantes e avaliação dos seus papéis nos mecanismos de interação com o hospedeiro. 2014. Orientação de outra natureza - Universidade Federal do Pará, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.

2.
Adonis de Melo Lima. Montagem e estruturação da unidade de bioinformática do Laboratório de Polimorfismo de DNA. 2004. 0 f. Orientação de outra natureza - Universidade Federal do Pará. Orientador: Artur Luiz da Costa da Silva.



Inovação



Programa de computador registrado
1.
RAMOS, R. T. J. ; Carneiro, Adriana Ribeiro ; SÁ, P. H. C. G. ; SCHNEIDER, Maria Paula Cruz ; AZEVEDO, V. ; SILVA, A . G4ALL. 2016.
Patente: Programa de Computador. Número do registro: BR512016000356-1, data de registro: 06/09/2016, título: "G4ALL" , Instituição de registro: INPI - Instituto Nacional da Propriedade Industrial.

2.
VERAS, A. A. O. ; SÁ, P. H. C. G ; ZEVEDO, V. ; SILVA, A ; RAMOS, R. T. J. . AUTO ASSEMBLY D. 2016.
Patente: Programa de Computador. Número do registro: BR512016000358-8, data de registro: 06/09/2016, título: "AUTO ASSEMBLY D" , Instituição de registro: INPI - Instituto Nacional da Propriedade Industrial.


Programa de computador sem registro
1.
MARIANO, D. C. B. ; PEREIRA, F. L. ; GHOSH, P. ; Barh, D. ; FIGUEIREDO, H. C. P. ; SILVA, A ; Ramos, R. T. J. ; Azevedo, Vasco . MapRepeat: an approach for effective assembly of repetitive regions in prokaryotic genomes. 2015.

2.
RAMOS, R. T. J. ; AZEVEDO, V. ; Artur Silva . Simplifier. 2011.

3.
Pinto, A.C ; RAMOS, R. T. J ; Carneiro, A. R. ; AZEVEDO, V. ; Artur Silva . CoreStimulon. 2011.

4.
RAMOS, R. T. J. ; AZEVEDO, V. ; Silva, Artur . Quality Assessment. 2009.



Educação e Popularização de C & T



Apresentações de Trabalho
1.
SILVA, A. Genômica de procariotos: onde estamos e quais nossos desafios. 2012. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

2.
SILVA, A. O pangenoma de Corynebacterium pseudotuberculosis. 2012. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).


Entrevistas, mesas redondas, programas e comentários na mídia
1.
Ramos, Rommel T. J. ; Silva A . Laboratório de Genômica. 2014.




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