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Rodrigo Antonio Faccioli

possui graduação em Ciência da Computação pelo Centro Universitário Barão de Mauá (2004). Concluiu o mestrado em Abril de 2007, na Universidade de São Paulo, sendo o título da dissertação Algoritmo Híbrido Mult-Objetivo para Predição de Estruturas Terciárias de Proteínas. Atualmente é aluno de doutorado na Universidade de São Paulo. Tem experiência na área de Ciência da Computação, com ênfase em Sistemas Inteligentes, atuando principalmente nos seguintes temas: Protein Structure Prediction, Protein-Protein Interactions, Evolutionary Algorithms, Fuzzy Logic, Structural Bioinformatics.
(Texto informado pelo autor)

Última atualização do currículo em 16/06/2011
Endereço para acessar este CV:
http://lattes.cnpq.br/1025157978990218
Dados pessoais
NomeRodrigo Antonio Faccioli
Nome em citações bibliográficasFACCIOLI, R. A.;Faccioli, Rodrigo Antonio
SexoMasculino
Endereço profissionalUniversidade de São Paulo, Escola de Engenharia de São Carlos, Departamento de Engenharia Elétrica.
Avenida Trabalhador São-carlense, 400
13566-590 - Sao Carlos, SP - Brasil
Telefone: (16) 33739366 Ramal: 229
URL da Homepage: http://laips.sel.eesc.usp.br

Formação acadêmica/Titulação
2008            Doutorado em andamento em Engenharia Elétrica .
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: Sistema Inteligente Para Predição de Estruturas de Proteínas Globulares, Orientador: Ivan Nunes da Silva.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior .
2005 - 2007Mestrado em Engenharia de Produção .
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: Algoritmo Híbrido Mult-Objetivo para Predição de Estruturas Terciárias de Proteínas, Ano de Obtenção: 2007.
Orientador: Prof. Dr. Ivan Nunes da Silva.
Palavras-chave: Algoritmo Evolutivo; Logica Fuzzy; Multi-Objective; Protein Folding; Bioinformática.
2001 - 2004Graduação em Ciência da Computação .
Organização Educacional Barão de Mauá, OEBM, Brasil.
Título: Ultilização de Técnicas de Computação Distribuídas Para Busca de Dados e Imagens Médicas.
Orientador: Prof Paulo Eduardo Ambrósio.
1997 - 1998Curso técnico/profissionalizante em Eletrotécnica .
Centro Estadual de Educação Tecnológica Paula Souza.

Formação complementar
2009 - 2009III Curso de Inverno de Bioinformática. (Carga horária: 35h).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
2007 - 20073º Curso de Verão em Bioinformática. (Carga horária: 75h).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
2004 - 2004Oracle 9i. (Carga horária: 20h).
Organização Educacional Barão de Mauá, OEBM, Brasil.
2004 - 2004Delphi 8 ASP.NET ESSENTIALS. (Carga horária: 40h).
Universidade Paulista.
2003 - 2003FreeBSD. (Carga horária: 40h).
Organização Educacional Barão de Mauá, OEBM, Brasil.
2003 - 2003Java. (Carga horária: 20h).
Organização Educacional Barão de Mauá, OEBM, Brasil.
2001 - 2001Linux Básico. (Carga horária: 40h).
Faculdade SENAC de Ciências Exatas e Tecnologia.

Atuação profissional
Verdartis Desenvolvimento Biotecnológico, VERDARTIS, Brasil.
Vínculo institucional
2007 - 2008 Vínculo: Bolsista TT4, Enquadramento Funcional: Bolsista FAPESP, Carga horária: 40
Outras informações Eu trabalhei no projeto AbEVO. Em linhas gerais, a finalidade deste projeto era realizar dinâmica molecular usando o Gromacs. Minha contribuição, em suma, foi o desenvolvimento do software para integrar com o Gromacs os outros programas que eram utilizados neste projeto.
Excelerator Consultoria e Serviços, 3WT, Brasil.
Vínculo institucional
2006 - 2007 Vínculo: Bolsista TT3 e TT4, Enquadramento Funcional: Atividades de Participação em Projeto, Carga horária: 40
Outras informações Bolsista FAPESP: TT3 de Ago/2006 até Dez/2006. De Jan/2007 a Abr/2007 bolsista TT-4.
Atividades
08/2006 - 04/2007Atividades de Participação em Projeto, SIGAME - Sistema de Informação Geográfica e Acompanhamento de Movimentação, .
Projetos de pesquisa
Projeto apoiado pelo PIPE - FAPESP, para desenvolvimento de um sistema de monitoramento de frotas de veículos.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Vínculo institucional
2005 - Atual Vínculo: Livre, Enquadramento Funcional: Aluno de Doutoado, Carga horária: 40
Atividades
03/2005 - 04/2007Pesquisa e desenvolvimento , Escola de Engenharia de São Carlos, .
Linhas de pesquisa
Bioinformática
Algoritmos Evolutivos
Lógica Fuzzy
Folding de Proteínas
Sistemas Inteligentes
Destinform Sistemas, DEST, Brasil.
Vínculo institucional
2000 - 2005 Vínculo: Funcionário, Enquadramento Funcional: Desenvolvedor, Carga horária: 44
Atividades
10/2000 - 10/2005Pesquisa e desenvolvimento .
Linhas de pesquisa
Desenvolvimento de Software
Metodologias de desenvolvimento de Software
Banco de Dados
Ferton, FER, Brasil.
Vínculo institucional
2000 - 2000 Vínculo: Estágio, Enquadramento Funcional: Estagiário, Carga horária: 40
Atividades
03/2000 - 07/2000Estágios .
Estágio realizado
Automaçao Industrial.

Linhas de Pesquisa
1. Desenvolvimento de Software
2. Metodologias de desenvolvimento de Software
3. Banco de Dados
4. Bioinformática
5. Algoritmos Evolutivos
6. Lógica Fuzzy
7. Folding de Proteínas
8. Sistemas Inteligentes

Projetos de Pesquisa
2006 - 2007Projeto apoiado pelo PIPE - FAPESP, para desenvolvimento de um sistema de monitoramento de frotas de veículos.
Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento.
Integrantes: Daniel Lucrédio - Integrante / Ricardo José Martines Ribeiro - Coordenador / Evandro Luis Ferreira Dugnani - Integrante / Vital Cruvinel Ferreira - Integrante / Karen Honda - Integrante / André Muezerie - Integrante / Wander Martins - Integrante / Rodrigo Antonio Faccioli - Integrante.
Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro..

Áreas de atuação
1. Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação / Especialidade: Sistemas de Informação.
2. Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação / Especialidade: Banco de Dados.
3. Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação / Especialidade: Engenharia de Software.
4. Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Teoria da Computação / Especialidade: Análise de Algoritmos e Complexidade de Computação.
5. Grande área: Engenharias / Área: Engenharia Elétrica / Subárea: Eletrônica Industrial, Sistemas e Controles Eletrônicos / Especialidade: Automação Eletrônica de Processos Elétricos e Industriais.
6. Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: BIOINFORMÁTICA.

Idiomas
Inglês Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Bem.

Prêmios e títulos
2007Diploma de Honra ao Mérito, por ser o primeiro egresso do Curso de Ciência da Computação a obter o grau de Mestre em Ciências., Centro Universitário Barão de Mauá.


Produção em C,T & A
Produção bibliográfica
Capítulos de livros publicados
1.   LIMA, T. W. ; CALIRI, A. ; BARROSO, F. L. ; TINOS, R. ; TRAVIESO, G. ; I. N. SILVA, ; SOUZA, P. S. L. ; MARQUES, E. ; DELBEM, A. C. B. ; BONATTO, V. ; FACCIOLI, R. A. ; Christiane Regina Soares Brasil ; GABRIEL, P. H. R. ; Tragante do Ó ; BONETTI, D. R. F. . Some Modeling Issues for Protein Structure Prediction Using Evolutionary Algorithms. In: Wellington Pinheiro dos Santos. (Org.). Evolutionary Computation. 1 ed. : InTech, 2009, v. , p. 153-178.
Textos em jornais de notícias/revistas
1. FACCIOLI, R. A. . Trabalhando com TFrame. Active Delphi, Active Delphi, v. 4, p. 14 - 15, 01 jun. 2004.
Trabalhos completos publicados em anais de congressos
1. LIMA, T. W. ; GABRIEL, P. H. R. ; DELBEM, A. C. B. ; FACCIOLI, R. A. ; I. N. SILVA, . Evolutionary Algorithm to Ab initio Protein Structure Prediction with Hydrophobic Interactions. In: IEEE Congress on Evolutionary Computation, 2007, Cingapura. CEC 2007, 2007. p. 612-619.
2. GABRIEL, P. H. R. ; LIMA, T. W. ; DELBEM, A. C. B. ; FACCIOLI, R. A. ; I. N. SILVA, . PURE AB INITIO EVOLUTIONARY APPROACH TO PROTEIN STRUCTURE PREDICTION. In: International Symposium on Mathematical and Computation Biology (Biomat), 2007, Buzios-RJ. Biomat 2007, 2007.
3. FACCIOLI, R. A. ; LIMA, T. W. ; GABRIEL, P. H. R. ; I. N. SILVA, ; DELBEM, A. C. B. ; Christiane Regina Soares Brasil . ProtPred: An approach to Protein Structure Prediction with Hydrophobic Interactions. In: 6 International Congress of Pharmaceutical Sciences, 2007, Ribeirão Preto-SP. Innovative strategies for the development of drus, medicines, diagnostics and therapeutics, 2007. p. 78-78.
4. LIMA, T. W. ; FACCIOLI, R. A. ; DELBEM, A. C. B. ; I. N. SILVA, . Multi-Objective Evolutionary Approach to Protein Tertiary Structure Prediction. In: 5th Brazilian Conference on Dynamics, Control and Their Applications, 2006, Guaratinguetá/sp. Proceedings of the 5th Brazilian Conference on Dynamics, Control and Their Applications, 2006.
5.   FACCIOLI, R. A. ; I. N. SILVA, ; LIMA, T. W. ; DELBEM, A. C. B. ; GABRIEL, P. H. R. . Multi-Objective Evolutionary Approach to Ab Initio Protein Tertiary Structure Prediction. In: International Symposium on Mathematical and Computational Biology, 2006, Manaus. Proceedings of the International Symposium on Mathematical and Computational Biology, 2006. p. 269-286.
6. ALVES, M. B. ; FACCIOLI, R. A. ; GONZAGA, A. . Human Face Detection Using Genetic Algorithm. In: I Workshop de Visão Computacional, 2005, Piracicaba-SP. WVC'2005 I Workshop de Visão Computacional, 2005. p. 88-91.
Resumos publicados em anais de congressos
1. SOARES, M. P. M. ; BARCHUK, A. R. ; SIMOES, A. C. ; FACCIOLI, R. A. ; SIMOES, Z. L. P. ; BITONDI, M. M. G. . Global analysis of cuticle protein genes during the pupal-to-adult molt in Apis mellifera. In: Honey Bee Genomics & Biology Meeting, 2011, Cold Spring Harbor. Abstracts of papers presented at the Honey Bee Genomics & Biology Meeting, 2011. p. 49-49.
2. BOMTORIN, A. D. ; BARCHUK, A. R. ; CRISTINO, A. S. ; SOARES, M. P. M. ; FACCIOLI, R. A. ; BITONDI, M. M. G. ; SIMOES, Z. L. P. . Nutritionally-driven differential expression of UBX gene is associated to leg diphenism in Apis mellifera castes. In: XVI Congress of the International Union for the study of social insects, 2010, Odense. XVI Congress of the International Union for the study of social insects, 2010. p. 187-187.
3. SOARES, M. P. M. ; BARCHUK, A. R. ; FACCIOLI, R. A. ; BOMTORIN, A. D. ; SIMOES, Z. L. P. ; BITONDI, M. M. G. . The expression of different set of genes characterizes the pupal and adult cuticle development in Apis mellifera. In: International Union for the Study of Social Insects (IUSSI), 2010, Copenhagen. Abstracts for the XVI Congress of the International Union for the Study of Social Insects, 2010. p. 227-227.
4.   FACCIOLI, R. A. ; CALIRI, A. ; I. N. SILVA, . Algoritmo Evolutivo para Predição de Estrutura Terciária de Proteínas com heurística para a população iniciall. In: XV SBQT, 2009, Poços de Caldas. SBQT, 2009.
5. Soares, Michelle Prioli Miranda ; Barchuk, Angel Roberto ; Cristino, Alexandre dos Santos ; FACCIOLI, R. A. ; Bomtorin, Ana Durvalina ; Simoes, Zila Luz Paulino ; Bitondi, Marcia Maria Gentile . 07-P011 Differential expression of cuticle protein genes during metamorphosis of the honeybee, Apis mellifera. In: 16th International Society of Developmental Biologists Congress, 2009, 2009, Edinburgh. 16th International Society of Developmental Biologists Congress. v. 126. p. s139-s140.
6. Bomtorin, Ana Durvalina ; Moda, Livia ; Laure, Marcela A.F.B. ; Cristino, Alexandre S. ; Soares, Michelle P.M. ; FACCIOLI, R. A. ; BITONDI, M. M. G. ; SIMOES, Z. L. P. . 07-P001 Differential hind leg development in Apis mellifera castes. In: 16th International Society of Developmental Biologists Congress, 2009, Edinburgh. Mechanisms of Development. p. 137-137.
7.   CALIXTO, T. M. ; FACCIOLI, R. A. ; BARROSO, F. L. . PROMETHEUS: A WEBSERVER FOR ESTIMATING ELECTROSTATIC AND COMPLEXATION PROPERTIES OF BIOMOLECULES. In: X-Meeting, 2009, Angra dos Reis. 5 International conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2009.
8.   LIMA, T. W. ; FACCIOLI, R. A. ; GABRIEL, P. H. R. ; DELBEM, A. C. B. ; I. N. SILVA, . Evolutionary Approach to Protein Structure Prediction with Hydrophobic Interactions. In: Genetic and Evolutionary Computation Conference (GECCO), 2007, Londres. GECCO '07: Proceedings of the 9th annual conference on Genetic and evolutionary computation. New York, NY, USA : ACM Press, 2007. p. 425-425.
Demais tipos de produção bibliográfica
1. FACCIOLI, R. A. ; MORAES, Matheus Eduardo de . UTILIZAÇÃO DE TÉCNICAS DE COMPUTAÇÃO DISTRIBUÍDA PARA BUSCA DE DADOS E IMAGENS MÉDICAS 2004 (Trabalho de Conclusão de Curso).
Produção técnica
Softwares sem registro de patente
1. CALIXTO, T. M. ; FACCIOLI, R. A. ; BARROSO, F. L. . PROMETHEUS: A WEBSERVER FOR ESTIMATING ELECTROSTATIC AND COMPLEXATION PROPERTIES OF BIOMOLECULES. 2009.
2. FACCIOLI, R. A. ; SISTEMAS, Destinform . Desenvolvimento de Sistema ERP (Enterprise Resource Planning). 2005.

Eventos
Participação em eventos
1. Terceiro Simpósio Molecular Simulation". 2011. (Simpósio).
2. IV Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biologicos. 2008. (Seminário).
3. School of Advanced Topics on Molecular Modeling - David van der Spoel & Gerrit Groenhoff. 2008. (Oficina).
4. 6th INTERNACIONAL CONGRESS OF PHARMACEUTICAL SCIENCES.ProdPred: An approach to protein structure prediction with hidrophobic interactions. 2007. (Congresso).
5. III Seminário Sobre Rotas Tecnológicas da Biotecnologia no Brasil. 2007. (Seminário).
6. I Workshop em Bioinformática Estrutural. 2007. (Seminário).
7. VII Semana de Tecnologia.Predição de estrutura terciária de proteínas, o problema desafiador para a Biologia Computacional. 2007. (Simpósio).
8. Brazilian Conference on Dynamics, Control and Their Applications.Brazilian Conference on Dynamics, Control and Their Applications. 2006. (Congresso).
9. I Escola de Física Computacional Moderna. 2006. (Simpósio).
10. I Workshop de Visão Computacional. 2005. (Seminário).
11. IV Semana de Tecnologia. 2004. (Outra).
12. III Semana de Tecnologia. 2003. (Outra).

Outras informações relevantes 
Conhecimento em Ferramentas Computacionais e Linguagens de programação:
Linguagem Programação: C (Avançado), C++ (Intermediário) , Python (Avançado),  Java (Intermediário), Delphi (Avançado)
Banco de Dados:  PostgreSQL (Intermediário), SQLite(Basico), SQLServer (Avançado), Firebird (Intermediário), Oracle 10g (Básico)
Sistemas Operacionais: Linux (Avançado), Windows (Avançado),  FreeBSD (Básico)
Outos:  GIT (intermediário), SVN (Básico), Make (Básico), cMake (Básico), Matlab (Intermediário), .Net (Básico), GROMACS (Intermediário) e Latex (Intermediário)..
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