Rodrigo Antonio Faccioli

  • Endereço para acessar este CV: http://lattes.cnpq.br/1025157978990218
  • Última atualização do currículo em 22/01/2018


A sua carreira acadêmica iniciou em 2001 no Centro Universitário Barão de Mauá onde graduou em Ciência da Computação no ano de 2004. Na Universidade de São Paulo iniciou em 2005, onde concluiu o seu Mestrado em 2007, seu Doutorado em 2012 e o seu Pós-doutorado em Computação em 2014. Desde 2005 trabalha na área de Biologia Computacional e Biofísica molecular. A sua linha de pesquisa é o emprego da Ciência da Computação em Cloud Computing no desenvolvimento de algoritmos, pipelines e análises dos dados em larga escala principalmente nos temas: docking molecular, triagem virtual (do inglês, Virtual Screening), dinâmica molecular e predição da estrutura terciária de proteínas. Participou em projetos nacionais e internacionais. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Rodrigo Antonio Faccioli
Nome em citações bibliográficas
FACCIOLI, R. A.;Faccioli, Rodrigo Antonio;FACCIOLI, RODRIGO A.


Formação acadêmica/titulação


2008 - 2012
Doutorado em Engenharia Elétrica.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: Implementação de um Framework de Computação Evolutiva Multi-Objetivo para Predição Ab Initio da Estrutura Terciária de Proteínas, Ano de obtenção: 2012.
Orientador: Ivan Nunes da Silva.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
2005 - 2007
Mestrado em Engenharia de Produção.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: Algoritmo Híbrido Mult-Objetivo para Predição de Estruturas Terciárias de Proteínas,Ano de Obtenção: 2007.
Orientador: Prof. Dr. Ivan Nunes da Silva.
Palavras-chave: Algoritmo Evolutivo; Logica Fuzzy; Multi-Objective; Protein Folding; Bioinformática.
2001 - 2004
Graduação em Ciência da Computação.
Centro Universitário Barão de Mauá - Jardim Paulista, CBM, Brasil.
Título: Ultilização de Técnicas de Computação Distribuídas Para Busca de Dados e Imagens Médicas.
Orientador: Prof Paulo Eduardo Ambrósio.
1997 - 1998
Curso técnico/profissionalizante em Eletrotécnica.
Centro Estadual de Educação Tecnológica Paula Souza, CEETEPS, Brasil.


Pós-doutorado


2015
Pós-Doutorado.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
2013 - 2014
Pós-Doutorado.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.


Formação Complementar


2015 - 2015
Desafios do professor universitario: relacionamento professor-aluno. (Carga horária: 3h).
Centro Universitário Barão de Mauá - Jardim Paulista, CBM, Brasil.
2015 - 2015
Treinamento no Portal do professor - plataforma Blackboard. (Carga horária: 3h).
Centro Universitário Barão de Mauá - Jardim Paulista, CBM, Brasil.
2015 - 2015
Pratical Docking. (Carga horária: 5h).
Universidade Federal do ABC, UFABC, Brasil.
2009 - 2009
III Curso de Inverno de Bioinformática. (Carga horária: 35h).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
2007 - 2007
3º Curso de Verão em Bioinformática. (Carga horária: 75h).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
2004 - 2004
Delphi 8 ASP.NET ESSENTIALS. (Carga horária: 40h).
Universidade Paulista, UNIP, Brasil.
2004 - 2004
Oracle 9i. (Carga horária: 20h).
Centro Universitário Barão de Mauá - Jardim Paulista, CBM, Brasil.
2003 - 2003
FreeBSD. (Carga horária: 40h).
Centro Universitário Barão de Mauá - Jardim Paulista, CBM, Brasil.
2003 - 2003
Java. (Carga horária: 20h).
Centro Universitário Barão de Mauá - Jardim Paulista, CBM, Brasil.
2001 - 2001
Linux Básico. (Carga horária: 40h).
Faculdade SENAC de Ciências Exatas e Tecnologia, SENAC, Brasil.


Atuação Profissional



MI4U Tecnologia da Informação LTDA, MI4U, Brasil.
Vínculo institucional

2015 - Atual
Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: CEO, Carga horária: 40


Centro Universitário Barão de Mauá - Jardim Paulista, CBM, Brasil.
Vínculo institucional

2011 - Atual
Vínculo: professor, Enquadramento Funcional: professor, Carga horária: 4


Faculdade Barretos, FB, Brasil.
Vínculo institucional

2014 - Atual
Vínculo: , Enquadramento Funcional: Professor Titular I, Carga horária: 12


Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Vínculo institucional

2008 - 2012
Vínculo: Livre, Enquadramento Funcional: Aluno de Doutoado, Carga horária: 40

Vínculo institucional

2005 - 2007
Vínculo: Pós-Graduação, Enquadramento Funcional: Aluno de Mestrado, Carga horária: 20

Atividades

03/2005 - 04/2007
Pesquisa e desenvolvimento , Escola de Engenharia de São Carlos, .


Verdartis Desenvolvimento Biotecnológico, VERDARTIS, Brasil.
Vínculo institucional

2007 - 2008
Vínculo: Bolsista TT4, Enquadramento Funcional: Bolsista FAPESP, Carga horária: 40
Outras informações
Eu trabalhei no projeto AbEVO. Em linhas gerais, a finalidade deste projeto era realizar dinâmica molecular usando o Gromacs. Minha contribuição, em suma, foi o desenvolvimento do software para integrar com o Gromacs os outros programas que eram utilizados neste projeto.


Centro Universitário Unifafibe, UNIFAFIBE, Brasil.
Vínculo institucional

2010 - 2011
Vínculo: professor, Enquadramento Funcional: professor, Carga horária: 4


Excelerator Consultoria e Serviços, 3WT, Brasil.
Vínculo institucional

2006 - 2007
Vínculo: Bolsista TT3 e TT4, Enquadramento Funcional: Atividades de Participação em Projeto, Carga horária: 40
Outras informações
Bolsista FAPESP: TT3 de Ago/2006 até Dez/2006. De Jan/2007 a Abr/2007 bolsista TT-4.


Destinform Sistemas, DEST, Brasil.
Vínculo institucional

2000 - 2005
Vínculo: Funcionário, Enquadramento Funcional: Desenvolvedor, Carga horária: 44

Atividades

10/2000 - 10/2005
Pesquisa e desenvolvimento , Destinform Sistemas, .


Ferton, FER, Brasil.
Vínculo institucional

2000 - 2000
Vínculo: Estágio, Enquadramento Funcional: Estagiário, Carga horária: 40

Atividades

03/2000 - 07/2000
Estágios .

Estágio realizado
Automaçao Industrial.


Linhas de pesquisa


1.
Metodologias de desenvolvimento de Software
2.
Bioinformática Estrutural
3.
Algoritmos Evolutivos
4.
Dinâmica Molecular
5.
Folding de Proteínas
6.
Sistemas Inteligentes em Bioinformática Estrutural


Projetos de desenvolvimento


2014 - Atual
Drug Design
Descrição: Projeto para o desenvolvimento colaborativo na área de drug design, principalmente no drug discovery. O projeto permite a execução de triagem virtual utilizando os softwares AutoDock Vina and MGLTools-1.5.6. Permite a execução da triagem virtual tanto do alvo biológico (receptor) obtido experimentalmente como também obitido por modelagem molecular por meio de simulação de dinâmica molecular..
Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento.
2013 - Atual
Koala Server

Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Alexandre Cláudio Botazzo Delbem em 14/08/2013.
Descrição: A finalidade deste projeto é possibilitar a predição da estrutura terciária de proteínas sendo um serviço web. Neste projeto algumas técnicas de predições principalmente empregando os algoritmos evolutivos serão disponibilizadas na web utilizando a plataforma Galaxy. Atualmente o link desse serviço: http://200.144.255.35:8084/.
Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento.
2010 - Atual
ProtPred-Gromacs

Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Alexandre Cláudio Botazzo Delbem em 14/08/2013.
Descrição: Este projeto tem a finalidade de integrar algoritmos evolutivos e o Gromacs na predição da estrutura terciária de proteínas. Este projeto não somente permite a predição Ab Initio da estrutura terciária de proteínas, mas também, analisar as predições afim de aperfeiçoa-la..
Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento.
2006 - 2007
Projeto apoiado pelo PIPE - FAPESP, para desenvolvimento de um sistema de monitoramento de frotas de veículos.
Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento.


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação.
2.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica.
3.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: BIOINFORMÁTICA.
4.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Teoria da Computação/Especialidade: Análise de Algoritmos e Complexidade de Computação.


Idiomas


Inglês
Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Bem.


Prêmios e títulos


2007
Diploma de Honra ao Mérito, por ser o primeiro egresso do Curso de Ciência da Computação a obter o grau de Mestre em Ciências., Centro Universitário Barão de Mauá.


Produções



Produção bibliográfica
Artigos completos publicados em periódicos

1.
KHOURY, GEORGE A.2014 KHOURY, GEORGE A. LIWO, ADAM KHATIB, FIRAS ZHOU, HONGYI CHOPRA, GAURAV BACARDIT, JAUME BORTOT, LEANDRO O. FACCIOLI, RODRIGO A. DENG, XIN HE, YI KRUPA, PAWEL LI, JILONG MOZOLEWSKA, MAGDALENA A. SIERADZAN, ADAM K. SMADBECK, JAMES WIRECKI, TOMASZ COOPER, SETH FLATTEN, JEFF XU, KEFAN BAKER, DAVID CHENG, JIANLIN DELBEM, ALEXANDRE C. B. FLOUDAS, CHRISTODOULOS A. KEASAR, CHEN LEVITT, MICHAEL , et al.POPOVI', ZORAN SCHERAGA, HAROLD A. SKOLNICK, JEFFREY CRIVELLI, SILVIA N. PLAYERS, FOLDIT ; WeFold: A Coopetition for Protein Structure Prediction. Proteins (Print), v. 1, p. n/a-n/a, 2014.

2.
FACCIOLI, R. A.2014 FACCIOLI, R. A.; BORTOT, L. O. ; DELBEM, A. C. B. . Multi-Objective Evolutionary Algorithm NSGA-II for Protein Structure Prediction using Structural and Energetic Properties. International Journal of Natural Computing Research, v. 4, p. 43-53, 2014.

Capítulos de livros publicados
1.
LIMA, T. W. ; CALIRI, A. ; BARROSO, F. L. ; TINOS, R. ; TRAVIESO, G. ; I. N. SILVA, ; SOUZA, P. S. L. ; MARQUES, E. ; DELBEM, A. C. B. ; BONATTO, V. ; FACCIOLI, R. A. ; Christiane Regina Soares Brasil ; GABRIEL, P. H. R. ; Tragante do Ó ; BONETTI, D. R. F. . Some Modeling Issues for Protein Structure Prediction Using Evolutionary Algorithms. In: Wellington Pinheiro dos Santos. (Org.). Evolutionary Computation. 1ed.: InTech, 2009, v. , p. 153-178.

Textos em jornais de notícias/revistas
1.
FACCIOLI, R. A.. Trabalhando com TFrame. Active Delphi, Active Delphi, , v. 4, p. 14 - 15, 01 jun. 2004.

Trabalhos completos publicados em anais de congressos
1.
FACCIOLI, R. A.; I. N. SILVA, ; BORTOT, L. O. ; DELBEM, A. C. B. . A Mono-Objective Evolutionary Algorithm for Protein Structure Prediction in Structural and Energetic Contexts. In: Evolutionary Computation (CEC), 2012 IEEE Congress on, 2012, Brisbane, QLD. WCCI 2012 IEEE World Congress on Computational Intelligence, 2012. p. 2206-2212.

2.
FACCIOLI, R. A.; I. N. SILVA, ; DELBEM, A. C. B. ; Brancini, G. ; CALIRI, A. . ProtPred-Gromacs: Evolutionay Algorithm with Gromacs for Protein Structure Prediction. In: BIOMAT 2011 International Symposium on Mathematical and Computational Biology, 2011, Chile. BIOMAT 2011 International Symposium on Mathematical and Computational Biology, 2011.

3.
LIMA, T. W. ; GABRIEL, P. H. R. ; DELBEM, A. C. B. ; FACCIOLI, R. A. ; I. N. SILVA, . Evolutionary Algorithm to Ab initio Protein Structure Prediction with Hydrophobic Interactions. In: IEEE Congress on Evolutionary Computation, 2007, Cingapura. CEC 2007, 2007. p. 612-619.

4.
GABRIEL, P. H. R. ; LIMA, T. W. ; DELBEM, A. C. B. ; FACCIOLI, R. A. ; I. N. SILVA, . PURE AB INITIO EVOLUTIONARY APPROACH TO PROTEIN STRUCTURE PREDICTION. In: International Symposium on Mathematical and Computation Biology (Biomat), 2007, Buzios-RJ. Biomat 2007, 2007.

5.
FACCIOLI, R. A.; LIMA, T. W. ; GABRIEL, P. H. R. ; I. N. SILVA, ; DELBEM, A. C. B. ; Christiane Regina Soares Brasil . ProtPred: An approach to Protein Structure Prediction with Hydrophobic Interactions. In: 6 International Congress of Pharmaceutical Sciences, 2007, Ribeirão Preto-SP. Innovative strategies for the development of drus, medicines, diagnostics and therapeutics, 2007. p. 78-78.

6.
LIMA, T. W. ; FACCIOLI, R. A. ; DELBEM, A. C. B. ; I. N. SILVA, . Multi-Objective Evolutionary Approach to Protein Tertiary Structure Prediction. In: 5th Brazilian Conference on Dynamics, Control and Their Applications, 2006, Guaratinguetá/sp. Proceedings of the 5th Brazilian Conference on Dynamics, Control and Their Applications, 2006.

7.
FACCIOLI, R. A.; I. N. SILVA, ; LIMA, T. W. ; DELBEM, A. C. B. ; GABRIEL, P. H. R. . Multi-Objective Evolutionary Approach to Ab Initio Protein Tertiary Structure Prediction. In: International Symposium on Mathematical and Computational Biology, 2006, Manaus. Proceedings of the International Symposium on Mathematical and Computational Biology, 2006. p. 269-286.

8.
ALVES, M. B. ; FACCIOLI, R. A. ; GONZAGA, A. . Human Face Detection Using Genetic Algorithm. In: I Workshop de Visão Computacional, 2005, Piracicaba-SP. WVC'2005 I Workshop de Visão Computacional, 2005. p. 88-91.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
BISCASSI, L. ; FACCIOLI, RODRIGO A. ; DELBEM, ALEXANDRE C. B. . DevOps cloud-computing environment to perform virtual screening. In: X-Meeting 2016 - 12th International Conference of the Brazilian Association of Bioinformatics and Computational Biology (AB3C), 2016, Belo Horizonte. X-Meeting 2016, 2016.

2.
L. E. Soares ; DEFELICIBUS, A. ; FACCIOLI, R. A. . Desenvolvendo uma interface web para um minimizador de energia de proteínas globulares. In: III ESCOLA BRASILEIRA DE MODELAGEM MOLECULAR, 2015, Santo André. III ESCOLA BRASILEIRA DE MODELAGEM MOLECULAR, 2015.

3.
BISCASSI, L. ; FACCIOLI, R. A. ; AMBROSIO, P. E. . Implementação de virtual screening em cloud computing utilizando autodock vina e galaxy. In: Encontro Nacional de Modelagem Computacional 2015, 2015, Salvador, Bahia. XVIII Encontro Nacional de Modelagem Computacional, 2015.

4.
DEFELICIBUS, A. ; FACCIOLI, R. A. ; DELBEM, A. C. B. . Koala: a web-based platform for protein structure evaluation and analysis. In: X-Meeting 2015 - 11th International Conference of th AB3C + Brazilian Symposium of Bioinformatics, 2015, São Paulo, SP. X-Meeting 2015, 2015.

5.
L. E. Soares ; DEFELICIBUS, A. ; FACCIOLI, R. A. . Web interface to apply energy minimization of globular proteins in cloud environment. In: X-Meeting 2015 - 11th International Conference of th AB3C + Brazilian Symposium of Bioinformatics, 2015, São Paulo, SP. X-Meeting 2015, 2015.

6.
FACCIOLI, R. A.; António Gaspar-Cunha ; DEFELICIBUS, A. ; BORTOT, L. O. ; DELBEM, ALEXANDRE C. B. . Reduced Pareto Set Genetic Algorithm: Application to Protein Structure Prediction. In: 5th International Conference on Metaheuristics and Nature Inspired, 2014, Marrakech. 5th International Conference on Metaheuristics and Nature Inspired, 2014.

7.
FACCIOLI, R. A.; BORTOT, L. O. ; DELBEM, A. C. B. . Application of Molecular Dynamics for Generating Models and Ranked by Dominance Criteria. In: CRITICAL ASSESSMENT OF TECHNIQUES FOR PROTEIN STRUCTURE PREDICTION (CASP), 2014, Riviera Maya, Mexico. Eleventh meeting, 2014. p. 13-14.

8.
FACCIOLI, R. A.; BORTOT, L. O. ; DELBEM, A. C. B. ; WeFold community . Application of Dominance Criteria for Ranking Models. In: CRITICAL ASSESSMENT OF TECHNIQUES FOR PROTEIN STRUCTURE PREDICTION (CASP), 2014, Riviera Maya, Mexico. Eleventh meeting, 2014. p. 237-238.

9.
BORTOT, L. O. ; FACCIOLI, R. A. ; DELBEM, A. C. B. . WeFold community . Application of Replica Exchange Molecular Dynamics with Implicit Solvation for Refinement of Collaboratively Generated and Ranked Models. In: CASP10 Meeting, 2012, Gaeta. CASP10 Meeting Abstracts, 2012.

10.
SOARES, M. P. M. ; BARCHUK, A. R. ; SIMOES, A. C. ; FACCIOLI, R. A. ; SIMOES, Z. L. P. ; BITONDI, M. M. G. . Global analysis of cuticle protein genes during the pupal-to-adult molt in Apis mellifera. In: Honey Bee Genomics & Biology Meeting, 2011, Cold Spring Harbor. Abstracts of papers presented at the Honey Bee Genomics & Biology Meeting, 2011. p. 49-49.

11.
BOMTORIN, A. D. ; BARCHUK, A. R. ; CRISTINO, A. S. ; SOARES, M. P. M. ; FACCIOLI, R. A. ; BITONDI, M. M. G. ; SIMOES, Z. L. P. . Nutritionally-driven differential expression of UBX gene is associated to leg diphenism in Apis mellifera castes. In: XVI Congress of the International Union for the study of social insects, 2010, Odense. XVI Congress of the International Union for the study of social insects, 2010. p. 187-187.

12.
SOARES, M. P. M. ; BARCHUK, A. R. ; FACCIOLI, R. A. ; BOMTORIN, A. D. ; SIMOES, Z. L. P. ; BITONDI, M. M. G. . The expression of different set of genes characterizes the pupal and adult cuticle development in Apis mellifera. In: International Union for the Study of Social Insects (IUSSI), 2010, Copenhagen. Abstracts for the XVI Congress of the International Union for the Study of Social Insects, 2010. p. 227-227.

13.
FACCIOLI, R. A.; CALIRI, A. ; I. N. SILVA, . Algoritmo Evolutivo para Predição de Estrutura Terciária de Proteínas com heurística para a população iniciall. In: XV SBQT, 2009, Poços de Caldas. SBQT, 2009.

14.
Soares, Michelle Prioli Miranda ; Barchuk, Angel Roberto ; Cristino, Alexandre dos Santos ; FACCIOLI, R. A. ; Bomtorin, Ana Durvalina ; Simoes, Zila Luz Paulino ; Bitondi, Marcia Maria Gentile . 07-P011 Differential expression of cuticle protein genes during metamorphosis of the honeybee, Apis mellifera. In: 16th International Society of Developmental Biologists Congress, 2009, 2009, Edinburgh. 16th International Society of Developmental Biologists Congress. v. 126. p. s139-s140.

15.
Bomtorin, Ana Durvalina ; Moda, Livia ; Laure, Marcela A.F.B. ; Cristino, Alexandre S. ; Soares, Michelle P.M. ; FACCIOLI, R. A. ; BITONDI, M. M. G. ; SIMOES, Z. L. P. . 07-P001 Differential hind leg development in Apis mellifera castes. In: 16th International Society of Developmental Biologists Congress, 2009, Edinburgh. Mechanisms of Development. p. 137-137.

16.
CALIXTO, T. M. ; FACCIOLI, R. A. ; BARROSO, F. L. . PROMETHEUS: A WEBSERVER FOR ESTIMATING ELECTROSTATIC AND COMPLEXATION PROPERTIES OF BIOMOLECULES. In: X-Meeting, 2009, Angra dos Reis. 5 International conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2009.

17.
LIMA, T. W. ; FACCIOLI, R. A. ; GABRIEL, P. H. R. ; DELBEM, A. C. B. ; I. N. SILVA, . Evolutionary Approach to Protein Structure Prediction with Hydrophobic Interactions. In: Genetic and Evolutionary Computation Conference (GECCO), 2007, Londres. GECCO '07: Proceedings of the 9th annual conference on Genetic and evolutionary computation. New York, NY, USA: ACM Press, 2007. p. 425-425.

Apresentações de Trabalho
1.
FACCIOLI, RODRIGO A.; BORTOT, L. O. ; CALIRI, A. . Desenvolvimento de um Software para encontrar Potenciais Inibidores da Protease do Virus da Dengue. 2015. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

2.
FACCIOLI, R. A.. Simulações em Dinâmica Molecular e Apresentação de Algoritmos empregados em Problemas de Otimização com Dinâmica Molecular. 2014. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

3.
FACCIOLI, R. A.. Ambiente de Predição Híbrida da Estrutura Terciária de Proteínas entre Dinâmica Molecular e Algoritmos Evolutivos. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

4.
FACCIOLI, R. A.; TICONA, W. ; BORTOT, L. O. ; I. N. SILVA, ; DELBEM, A. C. B. . Predição da Estrutura Terciária de Proteínas por Meio de Algortimos Evolutivos, GROMACS e ParadisEO. 2012. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

Outras produções bibliográficas
1.
FACCIOLI, R. A.; MORAES, Matheus Eduardo de . UTILIZAÇÃO DE TÉCNICAS DE COMPUTAÇÃO DISTRIBUÍDA PARA BUSCA DE DADOS E IMAGENS MÉDICAS 2004 (Trabalho de Conclusão de Curso).


Produção técnica
Programas de computador sem registro
1.
CALIXTO, T. M. ; FACCIOLI, R. A. ; BARROSO, F. L. . PROMETHEUS: A WEBSERVER FOR ESTIMATING ELECTROSTATIC AND COMPLEXATION PROPERTIES OF BIOMOLECULES. 2009.

2.
FACCIOLI, R. A.; SISTEMAS, Destinform . Desenvolvimento de Sistema ERP (Enterprise Resource Planning). 2005.



Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
III Escola Brasileira de Modelagem Molecular. 2015. (Encontro).

2.
Terceiro Simpósio ?Molecular Simulation". 2011. (Simpósio).

3.
IV Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biologicos. 2008. (Seminário).

4.
School of Advanced Topics on Molecular Modeling - David van der Spoel & Gerrit Groenhoff. 2008. (Oficina).

5.
6th INTERNACIONAL CONGRESS OF PHARMACEUTICAL SCIENCES. ProdPred: An approach to protein structure prediction with hidrophobic interactions. 2007. (Congresso).

6.
III Seminário Sobre Rotas Tecnológicas da Biotecnologia no Brasil. 2007. (Seminário).

7.
I Workshop em Bioinformática Estrutural. 2007. (Seminário).

8.
VII Semana de Tecnologia.Predição de estrutura terciária de proteínas, o problema desafiador para a Biologia Computacional. 2007. (Simpósio).

9.
Brazilian Conference on Dynamics, Control and Their Applications. Brazilian Conference on Dynamics, Control and Their Applications. 2006. (Congresso).

10.
I Escola de Física Computacional Moderna. 2006. (Simpósio).

11.
I Workshop de Visão Computacional. 2005. (Seminário).

12.
IV Semana de Tecnologia. 2004. (Outra).

13.
III Semana de Tecnologia. 2003. (Outra).



Orientações



Orientações e supervisões em andamento
Dissertação de mestrado
1.
Léo Biscassi. Identificação de Potencial Ligantes em Virtual Screening por meio de técnicas de Clustering. Início: 2015. Dissertação (Mestrado profissional em Modelagem Computacional em Ciência e Tecnologia) - Universidade Estadual de Santa Cruz. (Coorientador).

2.
Michelle Duarte Marciano. Investigação de um protocolo de predição ab initio da estrutura terciária da proteína por meio de algoritmos evolutivos multi-objetivo. Início: 2014. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Goiás, Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Goiás. (Coorientador).

3.
Alexandre Barbosa de Almeida. Estudo comparativo de Monte Carlo entre os critérios de Dominância de Pareto e Metrópolis na predição ab initio da estrutura terciária da proteína. Início: 2014. Dissertação (Mestrado em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Goiás, Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Goiás. (Coorientador).


Orientações e supervisões concluídas
Trabalho de conclusão de curso de graduação
1.
Alexandre Defelicibus. Implementação da interface web de execução do Framework 2PG na Plataforma Galaxy. 2012. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciência da Computação) - Centro Universitário Barão de Mauá - Jardim Paulista. Orientador: Rodrigo Antonio Faccioli.

2.
Alfredo Guilherme da Silva Souza. Implementação de uma interface web para Simulação de Dinâmica Molecular no GROMACS utilizando a plataforma GALAXY. 2012. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciência da Computação) - Centro Universitário Barão de Mauá - Jardim Paulista. Orientador: Rodrigo Antonio Faccioli.

3.
André Luiz da Silva. Método computacional para identificação de Genes submetidos à Impriting no Genoma Humano. 2012. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciência da Computação) - Centro Universitário Barão de Mauá - Jardim Paulista. Orientador: Rodrigo Antonio Faccioli.

4.
Gilson José da Silva Leite. Validação de Proteínas no campo de força Charmm27. 2012. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciência da Computação) - Centro Universitário Barão de Mauá - Jardim Paulista. Orientador: Rodrigo Antonio Faccioli.



Inovação



Projeto de desenvolvimento tecnológico


Educação e Popularização de C & T



Apresentações de Trabalho
1.
FACCIOLI, R. A.. Simulações em Dinâmica Molecular e Apresentação de Algoritmos empregados em Problemas de Otimização com Dinâmica Molecular. 2014. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).



Outras informações relevantes


Conhecimento em Ferramentas Computacionais e Linguagens de programação:
Linguagem Programação: C (Avançado), C++ (Intermediário) , Python (Avançado), Java (Avançado), Delphi (Avançado)
Banco de Dados: PostgreSQL (Intermediário), SQLite(Basico), SQLServer (Intermediário), Firebird (Intermediário), Oracle 10g (Básico).
Sistemas Operacionais: Linux (Avançado), Windows (Avançado), FreeBSD (Básico) e Android (Intermediário)
Outos: GIT (intermediário), SVN (Básico), Make (Básico), cMake (Básico), Matlab (Intermediário), Scilab (Intermediário), GROMACS (Intermediário), Latex (Intermediário) e BioPython (Intermediário).



Página gerada pelo Sistema Currículo Lattes em 16/12/2018 às 16:27:20