Elcio de Souza Leal

Possui graduação em Medicina Veterinária pela Universidade Federal do Paraná (1994), mestrado em Medicina Veterinária (Virologia) pela Universidade Federal do Rio Grande do Sul/Centro de Biotecnologia de Porto Alegre (1998) e doutorado em Biotecnologia pela Universidade de São Paulo (2004). Pesquisador associado da University Of Tokyo (Laboratory of Biometry and Bioinformatics Graduate School of Agriculture and Life Sciences) e da Universidade Federal de São Paulo (Laboratório de retrovirologia). Atualmente é professor adjunto na Universidade Federal do Pará, onde ministra aulas de evolução e de genética. Tem experiência na área de Microbiologia, com ênfase em Evolução viral, atuando principalmente nos seguintes temas: Evolução do HIV-1, Genética de populações, Métodos Bayesianos, Biologia estrutural, Bioinformática.
(Texto informado pelo autor)

Última atualização do currículo em 07/11/2011
Endereço para acessar este CV:
http://lattes.cnpq.br/1158983666415285

Dados pessoais
NomeElcio de Souza Leal
Nome em citações bibliográficasLEAL, Elcio de Souza;Leal, Élcio
SexoMasculino
Endereço profissionalUniversidade Federal do Pará, Faculdade de Biotecnologia, Instituto de Ciências Biológicas.
Rua Augusto Corrêa, 01
Guamá
04039-032 - Belem, PA - Brasil
URL da Homepage: http://www.unifesp.br/dmed/dipa/retro

Formação acadêmica/Titulação
2004            Pós-Doutorado .
Universidade Federal de São Paulo, UNIFESP, Brasil.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo ,FAPESP ,Brasil .
2007 - 2008Pós-Doutorado .
University of Tokyo, UT, Japão.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo ,FAPESP ,Brasil .
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: evolucao molecular.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.
2000 - 2004Doutorado em Biotecnologia .
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: SUBSTITUIÇÃO ALÉLICA E PARÂMETROS POPULACIONAIS DO VÍRUS DA IMUNODEFICIÊNCIA HUMANA, TIPO 1 (HIV-1), Ano de Obtenção: 2004.
Orientador: PAOLO MARINHO DE ANDRADE ZANOTTO.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo ,FAPESP ,Brasil .
Palavras-chave: HIV, positive selection, drug resistance.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.
1996 - 1998Mestrado em Medicina Veterinaria .
Universidade Federal do Rio Grande do Sul, UFRGS, Brasil.
Título: DETECÇÃO DO VÍRUS DA IMUNODEFICIÊNCIA FELINA (FIV) EM FELINOS SELVAGENS PERTENCENTES `A REGIÃO NEOTROPICAL, ATRAVES DA TÉCNICA DE PCR, Ano de Obtenção: 1998.
Orientador: ANA PAULA RAVAZZOLO.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior ,CAPES ,Brasil .
1989 - 1994Graduação em Medicina Veterinaria .
Universidade Federal do Paraná, UFPR, Brasil.

Atuação profissional
Universidade Federal do Pará, UFPA, Brasil.
Vínculo institucional
2009 - Atual Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Adjunto, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
University of Tokyo, UT, Japão.
Vínculo institucional
2005 - Atual Vínculo: Pesquisador Associado, Enquadramento Funcional: Pesquisador Associado, Carga horária: 0
Atividades
9/2005 - AtualAtividades de Participação em Projeto, School of Agriculture and Life Sciences, Statistic.
Projetos de pesquisa
On the limit of the procedures to estimate times and rates and estimation of the origin of the placental mammals and adaptation of the innate immune system
Universidade Federal de São Paulo, UNIFESP, Brasil.
Vínculo institucional
2004 - 2009 Vínculo: Bolsista recém-doutor, Enquadramento Funcional: Outro, Carga horária: 40
Atividades
2006 - AtualAtividades de Participação em Projeto, Departamento de Medicina, .
Projetos de pesquisa
Imunidade inata à infecção pelo Vírus da Imunodeficiência Humana, tipo 1 (HIV-1) mediada pelo gene APOBEC3G: Influência dos polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) da APOBEC3G na dinâmica populacional da infecção pelo HIV-1.
2006 - AtualAtividades de Participação em Projeto, Departamento de Medicina, Disciplina de Doenças Infecciosas e Parasitárias.
Projetos de pesquisa
Estudo da Geração da Diversidade Genética do HIV-1 em ciclo de infecção único durante o cultivo celular
2005 - AtualAtividades de Participação em Projeto, Departamento de Medicina, .
Projetos de pesquisa
Análise da diversidade genética no gene nef e pol do Vírus da Imunodeficiência Humana, tipo 1 (HIV-1) em crianças e em adultos recém infectados.
9/2004 - AtualEnsino, Infectologia, Nível: Pós-Graduação.
Disciplinas ministradas
Evoluçao Viral
Bioinformatica
02/2004 - AtualPesquisa e desenvolvimento , Departamento de Medicina, Disciplina de Doenças Infecciosas e Parasitárias.
Linhas de pesquisa
Evolução Molecular
2004 - AtualAtividades de Participação em Projeto, Departamento de Medicina, .
Projetos de pesquisa
Dinâmica Evolutiva do Vírus da Imunodeficiência Humana, tipo 1 (HIV-1) em populações sob tratamento anti-retroviral

Linhas de Pesquisa
1. Evolução Molecular
Objetivos: The massive quantity of DNA sequences that has been made available in the last decade provided a valuable opportunity to researchers to explore the population genetics and the evolutionary diversification of viruses. My research interest is centered in the evolutionary mechanisms that shape viral diversity during adaptation to novel environments (new hosts, population, cell types etc ) and its consequences to the pathogenesis. I also explore the pattern and rate of adaptive mutations in viruses subjected to drug therapy. To achieve this I have been analyzing empirical molecular data using population genetic, phylogenetic (mainly Bayesian), and computational methods. I also have been involved in the development of genealogy-based methods aimed to detect DNA recombination. .
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética.
Palavras-chave: Bayesian statistics; coalescent; Evolucao Viral; evolution; gene expression; HIV.

Projetos de Pesquisa
2006 - 2009Estudo da Geração da Diversidade Genética do HIV-1 em ciclo de infecção único durante o cultivo celular
Descrição: O HIV-1possui importante diversidade genética. As populações virais correspondem a uma distribuição de mutantes denominada "quasispecies". A redução de variabilidade e tamanho dessas populações, como as que acontecem durante a transmissão do HIV-1, colocam em risco a sua sobrevivência. A diversidade genética do HIV-1 pode ser influenciada pelo estágio de ativação em que as células alvo se encontram no momento da infecção. Um aumento brusco dessa diversidade pode fazer parte de uma estratégia do vírus em recuperar a diversidade genética perdida na população durante os eventos de transmissão. Para uma melhor elucidação das mudanças da diversidade ocorridas nas populações do HIV-1 após sua propagação de curta duração em cultivo celular, PBMCs serão submetidas a estímulos por diferentes mitógenos e infectadas por partículas do HIV-1 capazes de realizarem apenas um ciclo de infecção. As mutações acumuladas em um evento único de transcrição viral serão analisadas e comparadas com a seqüência do genoma do HIV-1 presente no inóculo original.. .
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Integrantes: Ricardo Sobhie Diaz - Integrante / Luiz Mario Ramos Janini - Coordenador / Wagner Tadeu Alkmim Maia - Integrante / Elcio de Souza Leal - Integrante.
Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro..
2006 - AtualImunidade inata à infecção pelo Vírus da Imunodeficiência Humana, tipo 1 (HIV-1) mediada pelo gene APOBEC3G: Influência dos polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) da APOBEC3G na dinâmica populacional da infecção pelo HIV-1.
Descrição: O gene APOBEC3G induz a deaminação das citidinas em uridinas (C?U) presentes na fita negativa do HIV-1, assim ocasionando substituições de guanosinas por adenosinas (G?A) na fita de polaridade positiva do DNA viral. Esse mecanismo é conhecido como hipermutação e por conseqüência disso ocorre o surgimento de códons de terminação, perda de fase de leitura dos genes virais resultando na perda da integridade da formação genética do HIV-1. O HIV-1 contrapõe a hipermutação pela degradação das proteínas da APOBEC3G, isso é feito pelas proteínas Vif do HIV-1 que induzem a ubiquitinação das proteínas da APOBEC3G assim possibilitando a degradação desta pelo complexo proteossomal celular. Porém, eventos de infecção recorrentes impingiram a fixação de variantes alélicas nos genes da família da APOBEC3G, caracterizado pelo grande número de polimorfismos de nucleotídeos únicos (SNPs). No entanto, diversos outros aspectos desse processo de co-evolução, como a influência desses SNPs na disseminação do HIV-1, nos nível de hipermutação e mesmo na diversificação de genes viras, precisam ser mais explorados. Em razão disso, propomos um estudo mais amplo visando determinar a correlação entre SNPs presentes na APOBEC3G com a dinâmica do HIV-1 na população (i.e. padrão de disseminação filogeográfico da epidemia), e as características clínicas dos indivíduos infectados (i.e. carga viral, níveis de linfócitos e resposta ao tratamento anti-retroviral)..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Integrantes: Ricardo Sobhie Diaz - Integrante / Luiz Mario Ramos Janini - Coordenador / Elcio de Souza Leal - Integrante.
Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro..
2005 - 2009Análise da diversidade genética no gene nef e pol do Vírus da Imunodeficiência Humana, tipo 1 (HIV-1) em crianças e em adultos recém infectados.
Descrição: A caracterização dos processos evolutivos que ocorrem nos genes do HIV-1 durante a infecção de crianças demandam estudos mais amplos. O estudo desses processos traz benefícios ao entendimento da pressão seletiva imposta aos genes virais por um sistema imunológico ainda em desenvolvimento. Neste trabalho propomos um estudo comparativo da dinâmica evolutiva do HIV-1 entre crianças (entre 0 e 3 anos de idade) infectadas pelas mães (transmissão materno-infantil) e adultos recém infectados. Analisaremos a diversidade genética (distância par-a-par e theta) e as taxas de substituições sinônimas e não-sinônimas no gene nef do HIV-1. Com isso, analisaremos a pressão seletiva no gene nef de forma comparativa entre crianças e adultos recém infectados.. .
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico ( 1) .
Integrantes: Ricardo Sobhie Diaz - Integrante / Camila Florido - Integrante / Luiz Mario Ramos Janini - Coordenador / Elcio de Souza Leal - Integrante.
Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro..
2005 - 2008On the limit of the procedures to estimate times and rates and estimation of the origin of the placental mammals and adaptation of the innate immune system
Descrição: Nao disponivel.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Integrantes: Hirohisa Kishino - Coordenador / Elcio de Souza Leal - Integrante.
Financiador(es): University of Tokyo - Auxílio financeiro..
2004 - 2009Dinâmica Evolutiva do Vírus da Imunodeficiência Humana, tipo 1 (HIV-1) em populações sob tratamento anti-retroviral
Descrição: Em um estudo prévio constatamos que o padrão de fixação alélica no HIV-1 é fortemente influenciado pelo uso de antiretrovirais, ou seja a fixação de mutações associadas com resistência antiretroviral é distinta entre populações de pacientes virgens de tratamento e pacientes tratados. Além disso, outros estudos proporcionaram evidências que a dinâmica de crescimento populacional do HIV-1 pode estar sendo afetada pelo uso de antiretrovirais. Contudo a relevância desses achados precisa ser explorada em mais detalhes. Neste trabalho propomos ampliar as análises da dinâmica evolutiva do HIV-1 em diferentes populações de pacientes sob tratamento. Abordaremos a influência de fatores clínicos (i.e. carga viral, níveis de células linfóides e esquema de tratamento) e fatores inerentes aos vírus (i.e. subtipos e padrão de mutações) no processo de aquisição de resistência aos antiretrovirais. Faremos, ainda, uma análise acerca do padrão de crescimento populacional de acordo com a distribuição geográfica de diferentes subtipos (e.g. subtipo C na região sul, recombinantes BF) do HIV-1. Essas análises serão feitas em seqüências do gene protease (pr) e parte do gene da transcriptase reversa (rt) de pacientes infectados pelo HIV-1 provenientes de varias regiões do Brasil e que estão sob tratamento antiretroviral..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Integrantes: Ricardo Sobhie Diaz - Integrante / Luiz Mario Ramos Janini - Integrante / Elcio de Souza Leal - Coordenador.
Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa..

Revisor de periódico
2006 - Atual Periódico: Virology
2007 - Atual Periódico: Infection, Genetics and Evolution

Áreas de atuação
1. Grande área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia / Subárea: Biologia e Fisiologia dos Microorganismos / Especialidade: Virologia.
2. Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.
3. Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética.
4. Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral.
5. Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: evolucao molecular.
6. Grande área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia / Subárea: Bioinformatica.

Idiomas
Inglês Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Espanhol Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.


Produção em C,T & A
Produção bibliográfica
Artigos completos publicados em periódicos
1. Watanabe, Aripuana ; Carraro E. ; Candeias, JM ; Leal, Élcio ; Granato C. ; Bellei N. . Viral etiology among the elderly presenting acute respiratory infection during the influenza season.. Revista da Sociedade Brasileira de Medicina Tropical (Impresso), v. 44, p. 18-21, 2011.
2. Moreira LP ; Kamikawa J. ; Watanabe A. ; Carraro E. ; Leal, Élcio ; Granato C. ; Bellei N. . FREQUENCY OF HUMAN RHINOVIRUS SPECIES IN OUTPATIENT CHILDREN WITH ACUTE RESPIRATORY INFECTIONS AT PRIMARY CARE LEVEL IN BRAZIL.. Journal of Pediatric Infectious Diseases, v. 1, p. 1-3, 2011.
3. Bizinoto, Maria Clara ; Leal, Élcio ; DIAZ, Ricardo Sobhie ; Janini, Luiz Mário . Loci Polymorphisms of the APOBEC3G Gene in HIV Type 1-Infected Brazilians. AIDS Research and Human Retroviruses, v. 27, p. 137-141, 2011.
4. LEAL, Elcio de Souza ; Villanova, Fabiola E. . Diversity of HIV-1 Subtype B: Implications to the Origin of BF Recombinants. Plos One, v. 5, p. e11833, 2010.
5. Watanabe, Aripuana ; Carraro, Emerson ; Kamikawa, Janete ; Leal, Élcio ; Granato, Celso ; Bellei, Nancy . Rhinovirus species and their clinical presentation among different risk groups of non-hospitalized patients. Journal of Medical Virology (Print), v. 82, p. 2110-2115, 2010.
6. CAVALIERI, Elizabeth ; FLORIDO, Camila ; LEAL, Elcio de Souza ; MACHADO, Daisy Maria ; CAMARGO, M. ; DIAZ, Ricardo Sobhie ; JANINI, Luiz Mario Ramos . Intrahost and interhost variability of the HIV type 1 nef gene in Brazilian children. AIDS Research and Human Retroviruses, v. 25, p. 1129-1140, 2009.
7. Villanova, F.E. ; Andrade, Enrico ; LEAL, Elcio de Souza ; Andrade PM ; Borra, Ricardo C ; Troncone, Lanfranco RP ; Leandro Magalhães ; Leite, Katia RM ; Paranhos, Mario ; Claro, Joaquim ; Srougi, Miguel . Erection induced by Tx2-6 toxin of Phoneutria nigriventer spider: expression profile of genes in the nitric oxide pathway of penile tissue of mice.. Toxicon (Oxford), v. 54, p. 793-801, 2009.
8.   MARTINS, L. O. ; LEAL, Elcio de Souza ; KISHINO, H. . Phylogenetic detection of recombination with a Bayesian prior on the distance between trees.. Plos One, v. 3, p. e2651, 2008.
9.   LEAL, Elcio de Souza ; Wilson Pereira Silva ; Maria Cecilia A. Sucupira ; JANINI, Luiz Mario Ramos ; DIAZ, Ricardo Sobhie . Molecular and structural characterization of HIV-1 subtype B Brazilian isolates with GWGR tetramer at the tip of the V3-loop.. Virology, v. 381, p. 222-229, 2008.
10. DIAZ, Ricardo Sobhie ; LEAL, Elcio de Souza ; Sabri Sanabani ; Maria Cecilia A. Sucupira ; Amílcar Tanuri ; Ester C. Sabino ; JANINI, Luiz Mario Ramos . Selective regimes and evolutionary rates of HIV-1 subtype B V3 variants in the Brazilian epidemic.. Virology, v. 381, p. 184-193, 2008.
11. LEAL, Elcio de Souza ; MARTINS, L. O. ; JANINI, Luiz Mario Ramos ; DIAZ, Ricardo Sobhie . Evolutionary Dynamics of HIV-1 BF and CB Recombinants and Its Parental Counterparts in South America Authors. Retrovirology: Research and Treatment, v. 1, p. 11-14, 2008.
12.   LEAL, Elcio de Souza ; PEREIRA, C A D ; DURIGON, e L . Selective regimen shift and demographic growth increase associated with the emergence of high-fitness variants of canine parvovirus.. Infection, Genetics and Evolution, v. 7, p. 399-409, 2007.
13.   LEAL, Elcio de Souza ; JANINI, Luiz Mario Ramos ; DIAZ, Ricardo Sobhie . Selective pressures of human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) during pediatric infection. Infection, Genetics and Evolution, v. 7, p. 694-707, 2007.
14. Wilson Pereira Silva ; Domingos E.M. Santos ; LEAL, Elcio de Souza ; Adriana Brunstein ; Maria Cecilia A. Sucupira ; Ester C. Sabino ; DIAZ, Ricardo Sobhie . Reactivation of ancestral strains of HIV-1 in the gp120 V3 env region in patients failing antiretroviral therapy and subjected to structured treatment interruption.. Virology, v. 354, p. 35-47, 2007.
15. Villanova, F.E. ; Gomes MT ; LEAL, Elcio de Souza ; Castro RA, ; Girão MJ ; Nishimura E ; Baracat EC ; Silva ID ; CASTELO FILHO, Adauto . Estrogen receptor alpha polymorphism and susceptibility to uterine leiomyoma2. Steroids (Stoneham), v. 71, p. 960-965, 2006.
16.   LEAL, Elcio de Souza ; HOLMES, Edward C ; ZANOTTO, Paolo Marinho de Andrade . Distinct Patterns of Natural Selection in the Reverse Transcriptase Gene of HIV-1 in the Presence and Absence of Antiretroviral Therapy.. Virology, elsevier, v. 325, p. 181-191, 2004.
17. LEAL, Elcio de Souza ; TUMILASCI, Vanessa F ; LUQUE, P. M. A., ; WOLFF, Josè Luiz Caldas . Sequence analysis of a 5.1 Kbp region of the Spodoptera frugiperda nucleopolyhedrovirus genome that comprises a functional ecdysteroid UDP-glucosyltransferase (egt) gene.. Virus Genes, kluwer pub, v. 27, p. 137-144, 2003.
18. LEAL, Elcio de Souza ; WOLFF, Josè Luiz Caldas ; Moraes, R. H. P ; Kitajima, E ; ZANOTTO, Paolo Marinho de Andrade . Identification and characterization of a baculovirus from Lonomia obliqua (Lepidoptera-Saturniidae).. Journal of Invertebrate Pathology, elsevier, v. 79, p. 137-145, 2002.
19. LEAL, Elcio de Souza ; ZANOTTO, P. M. A., . Viral diseases and human evolution. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro - Brasil, v. 95, n. Suppl 1, p. 193-2000, 2000.
Capítulos de livros publicados
1. Villanova, F.E. ; Leal, Élcio . Microarranjos de DNA (microarrays. In: Carvalho, Ricci & Affonso. (Org.). Guia de Práticas em Biologia Molecula. 1 ed. Sao Paulo: Yendeis, 2010, v. 10, p. 145-160.
Textos em jornais de notícias/revistas
1. LEAL, Elcio de Souza . HIV Voluntary universal testing and treatment. Nature (proceedings 14 November 2009), Reino Unido, p. 1 - 2, 14 nov. 2009.
2. Eduardo Geraque ; LEAL, Elcio de Souza . Folha on line. Folha de Sao Paulo, 22 set. 2007.
3. LEAL, Elcio de Souza . Destaques do 12Th Intern Bioinformatics worwhop on virus evol & mol epidemiology. Tendências em HIV.AIDS, p. 25 - 26, 01 abr. 2006.
4. LEAL, Elcio de Souza ; JANINI, Luiz Mario Ramos . Interação vírus hospedeiro e a evolução do HIV. Tendências em HIV.AIDS, Sao Paulo, p. 15 - 22, 01 mar. 2006.
Trabalhos completos publicados em anais de congressos
1. MARTINS, L. O. ; LEAL, Elcio de Souza . Independent evolutionary origin of BF recombinants of HIV-1 with identical mosaic structure. In: 15th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB), 2007, Vienna. Independent evolutionary origin of BF recombinants of HIV-1 with identical mosaic structure, 2007.
2. FLORIDO, Camila ; CAMARGO, M. ; DIAZ, Ricardo Sobhie ; JANINI, Luiz Mario Ramos ; LEAL, Elcio de Souza . Selective pressures in nef gene of HIV-1: a comparative analysis between children and adults. In: 4Th IAS Conference on HIV pathogenesis, treatment and prevention, 2007, Sydney. 4Th IAS Conference on HIV pathogenesis, treatment and prevention, 2007.
3. LEAL, Elcio de Souza ; Maria Cecilia A. Sucupira ; JANINI, Luiz Mario Ramos ; Wilson Pereira Silva ; Domingos E.M. Santos ; DIAZ, Ricardo Sobhie . Evolutionary constraints on the V3 loop of HIV-1 associated with coreceptor usage. In: 4Th IAS Conference on HIV pathogenesis, treatment and prevention, 2007, Sydney. 4Th IAS Conference on HIV pathogenesis, treatment and prevention., 2007.
4. MARTINS, L. O. ; LEAL, Elcio de Souza ; KISHINO, H. . HIV-1 intersubtype recombination in South America. In: The 7th Annual Meeting of the Society of Evolutionary Studies, 2007, Touhoku. The 7th Annual Meeting of the Society of Evolutionary Studies, 2007.
5. LEAL, Elcio de Souza ; JANINI, Luiz Mario Ramos ; DIAZ, Ricardo Sobhie . Demographic growth of the human immunodeficiency virus type 1 in South America: implications for the BF recombinant epidemics. In: AIDS 2006 - XVI International AIDS Conference, 2006, Toronto. Demographic growth of the human immunodeficiency virus type 1 in South America: implications for the BF recombinant epidemics, 2006.
6. LEAL, Elcio de Souza . Scarcity of positive selected codons on the human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) during pediatric infection. In: 12Th International Bio Informatics Workshop on Vírus Evolution and Molecular Epidemiology, 2006, Athens. 12Th International Bio Informatics Workshop on Vírus Evolution and Molecular Epidemiology, 2006.
7. PEREIRA, C A D ; LEAL, Elcio de Souza ; DURIGON, e L . Genetic Diversity of Canine Parvovirus. In: Xth International Congress of Mycology XIIth international Congress of Virology, 2002, Paris, July, 27 to August 1, 2002.
8. LEAL, Elcio de Souza ; LEWI, Jose Eduardo ; MACHADO, Daisy Maria ; SUMITA, L ; SÁ FILHO, Dercy Jose de ; PANNUTI, Claudio Sergio ; SEGURADO, Aluisio Augusto ; ZANOTTO, P M A ; CASTELO FILHO, Adauto ; DIAZ, Ricardo Sobhie . Mutations associated with drug resistance in a population of drug naive HIV-1 infected individuals. In: XIII International AIDS conference, 2000, Durban, 2000.
9. LEAL, Elcio de Souza ; SÁ FILHO, Dercy Jose de ; MACHADO, Daisy Maria ; SUMITA, L ; CASTELO FILHO, Adauto ; DIAZ, Ricardo Sobhie ; PANNUTI, C S ; LEVI, J e ; SEGURADO, A A ; ZANOTTO, P M A . Mutations associated with drug resistance in a population of drug naive HIV-1 infected individuals. In: III Simposio de pesquisa básica em HIV/AIDS, 1999, Comandatuba - BA, 1999.
Resumos publicados em anais de congressos
1. LEAL, Elcio de Souza ; DIAZ, Ricardo Sobhie ; L.M., J. . Selective pressures on nef gene of Human Immunodeficiency Virus type 1 (HIV-1): A Comparative Analysis between Children and Adults.. In: 3th IAS Conference on HIV pathogenesis and treatment., 2005, Rio de Janeiro. http://www.iasociety.org/index.asp, 2005.
2. LEAL, Elcio de Souza . Phylogenetic analysis of Human Immunodeficiency Virus type 1 (HIV-1) B/F recombinants from Brazil and Argentina. In: 3th IAS Conference on HIV pathogenesis and treatment., 2005, Rio de Janeiro. http://www.iasociety.org/index.asp, 2005.
3. LEAL, Elcio de Souza ; PEREIRA, C A D ; DURIGON, e L . Evolutionary Aspects of Canine Parvovirus population: Darwinian Selection and Adaptation. In: XIth International Congress of Bacteriology & Applied Microbiology,XIth International Congress of Mycology, XIIIth International Congress of Virology, 2005, San Franscisco. IUMS 2005 Microbes in a changing world. Washington : American Society for microbiology, 2005. p. 186-186.
4. LEAL, Elcio de Souza . Population dynamics of canine parvovirus epidemic in Brazil: Patterns of local adaptation. In: 11th Internationalworshop on virus evolution and molecular epidemiology, 2005, Petropolis RJ. Infection, Genetics and EvolutionJournal of Molecular Epidemiology and Evolutionary Genetics of Infectious Diseases (MEEGID). Amesterdam : Elsevier inc., 2005.
5. LEAL, Elcio de Souza ; MARTINS, L. O. ; KISHINO, H. . HIV-1 Intersubtype Recombination in South America. In: Society of Evolutionary Studies, 7th Annual meeting in Sendai, 2005, Sendai. 7th Annual meeting in Sendai, 2005.
Artigos aceitos para publicação
1. Bizinoto M.C. ; YABE, S. ; MARTINS, L. O. ; Leal, Élcio ; KISHINO, H. ; JANINI, Luiz Mario Ramos ; DIAZ, Ricardo Sobhie . Epistasis in codon pairs of the HIV-1 vif gene correlate with CD4+ T cell count. Plos One, 2012.
2. Leal, Élcio ; Villanova, F.E. ; Cui, S. . Recombination, point mutations and positive selection in the evolution of porcine parvovirus strains refractory to autologous vaccines. Infection, Genetics and Evolution (Print), 2012.
Apresentações de Trabalho
1. LEAL, Elcio de Souza . Adaptive evolution of the V3-loop of HIV-1. 2011. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
2. Bizinoto M.C. ; Leal, Élcio ; Leão M. ; Morais E ; JANINI, Luiz Mario Ramos . Association of APOBEC3G polymorphisms and hypermutation levels with AIDS prograssion among Brazilian Individuals. 2010. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
3. Leal, Élcio ; YABE, S. ; KISHINO, H. ; Bizinoto M.C. ; MARTINS, L. O. ; Leão M. ; Morais E ; DIAZ, Ricardo Sobhie ; JANINI, Luiz Mario Ramos . Epistatic effect and positive selection in the HIV-1 vif gene are linked with APOBEC3G/F neutralization activity. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
Produção técnica
Softwares sem registro de patente
1. MARTINS, L. O. ; LEAL, Elcio de Souza ; KISHINO, H. . biomc2. 2007.
2. LEAL, Elcio de Souza ; SOUZA, Robson Francisco de . VGDNvalid: script de análise de cromatogramas,validação e organização de seqüências feito para o projeto Rede de Diversidade Genética Viral (RDGN). 2000.

Eventos
Participação em eventos
1. 16Th HIV Dynamics & Evolution (Pembroke College-Oxford University).HIV-1 SUBTYPE B IN BRAZIL: THE TWO FACES OF THE SAME COIN. 2009. (Encontro).
2. 15th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB).Independent evolutionary origin of BF recombinants of HIV-1 with identical mosaic structure. 2007. (Congresso).
3. New Zealand's Phylogenetic Meeting.Bayesian recombination detection based on distance between trees. 2007. (Encontro).
4. The 2007 Japanese Joint Statistical Meeting, Kobe University.Bayesian recombination detection based on distances between trees. 2007. (Encontro).
5. AIDS 2006 - XVI International AIDS Conference.Demographic growth of the human immunodeficiency virus type 1 in South America: implications for the BF recombinant epidemics. 2006. (Congresso).
6. The annual meeting of the Society of.Distance between trees and Bayesain inference of viral recombination. 2006. (Encontro).
Organização de eventos
1. KISHINO, H. ; Yang, Z ; Leal, Élcio . Perspectives on molecular evolution. 2011. (Outro).

Orientações
Orientações em andamento
Dissertação de mestrado
1. Joao Batista dos Santos Araujo. Identificacao de RNAs do virus da dengue em mosquitos por pirosequenciamento. Início: 2011. Dissertação (Mestrado em BIOTECNOLOGIA) - Universidade Federal do Pará. (Orientador).
2. Erika Etsuko Fusuma. AVALIAÇÃO CLONAL DAS VIAS MUTACIONAIS PARA RESISTÊNCIA AOS ANTI-RETROVIRAIS. Início: 2008. Dissertação (Mestrado em Infectologia) - Universidade Federal de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. (Co-orientador).
Tese de doutorado
1. Elizabeth Cavalieri. Avaliação da dinâmica evolutiva dos genes gag, pol, nef e env do Vírus da Imunodeficiência Humana, tipo 1 (HIV-1): Estudo comparativo entre crianças e adultos recém infectados.. Início: 2005. Tese (Doutorado em Infectologia) - Universidade Federal de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. (Co-orientador).
Supervisões e orientações concluídas
Dissertação de mestrado
1. Maria Clara de Souza bizinoto. Imunidade inata à infecção pelo Vírus da Imunodeficiência Humana, tipo 1 (HIV-1) mediada pelo gene APOBEC3G: Influência dos polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) da APOBEC3G na dinâmica populacional da infecção pelo HIV-1. 2011. Dissertação (Mestrado em Microbiologia e Imunologia) - Universidade Federal de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Co-Orientador: Elcio de Souza Leal.
2. Camila Florido. Análise da diversidade genética no gene nef do Vírus da Imunodeficiência Humana, Tipo 1 (HIV-1) em crianças e em adultos recém infectados.. 2007. Dissertação (Mestrado em Mestrado / Doutorado) - Universidade Federal de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Co-Orientador: Elcio de Souza Leal.

Outras informações relevantes
Membro (desde 2008) da International Society for Computational Biology (ISCB)
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