Paulo de Paiva Rosa Amaral

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  • Última atualização do currículo em 28/08/2017


Possui graduação em Ciências Biológicas pela Universidade de Brasília (2003), mestrado em Bioquímica pela Universidade de São Paulo (2006) e doutorado em Genética Molecular pela University of Queensland, Australia (2011). Atualmente atua como pesquisador associado no Gurdon Institute, University of Cambridge, UK. Tem experiência na área de Bioquímica, com ênfase em Biologia Molecular, atuando principalmente no estudo da regulação da estrutura da cromatina e expressão gênica em eucariotos por RNAs não-codificadores de proteínas (ncRNAs). (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Paulo de Paiva Rosa Amaral
Nome em citações bibliográficas
AMARAL, P. P. R.;Amaral, P. P.;Amaral, Paulo P.;Amaral, Paulo P;AMARAL, PAULO P.

Endereço


Endereço Profissional
University of Cambridge.
The Gurdon Institute, Tennis Court Road
CB2 1QN - Cambridge, - Grã-Bretanha
Telefone: (44) 0122333408
Fax: (44) 122333408
URL da Homepage: http://www.gurdon.cam.ac.uk/~kouzarideslab/index.html


Formação acadêmica/titulação


2007 - 2011
Doutorado em Molecular Genetics.
The University of Queensland, UQ, Austrália.
Título: Expression and chromatin association of noncoding RNAs, Ano de obtenção: 2011.
Orientador: John S Mattick.
Bolsista do(a): Australian Government, International Postgraduate Research Scholarship, IPRS, Austrália.
2004 - 2006
Mestrado em Bioquímica.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: Estudo da Biossíntese e Regulação de RNAs Não-Codificadores Intrônicos em Células Humanas (http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/46/46131/tde-03012007-000256/),Ano de Obtenção: 2006.
Orientador: Aline Maria da Silva.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
Palavras-chave: RNA Polimerase II; RNA não-codificador; transcrição; Receptor de Andrógeno; Íntron.
2000 - 2003
Graduação em Ciências Biológicas.
Universidade de Brasília, UnB, Brasil.


Pós-doutorado


2011
Pós-Doutorado.
Gurdon Institute, University of Cambridge, UCAM, Inglaterra.
Bolsista do(a): Royal Society and Corpus Christi College Fellowships, RS, Grã-Bretanha.


Formação Complementar


2006 - 2006
Accessing the Human Genome Sequence. (Carga horária: 20h).
The Wellcome Trust Sanger Institute / Cold Spring Harbor joint course, CSH, Brasil.
2006 - 2006
Applications in Next Generation Sequencing.
Cold Spring Harbor Laboratory, CSHL, Estados Unidos.
2005 - 2005
Extensão universitária em Proteção Radiológica. (Carga horária: 45h).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
2004 - 2004
I Curso de Verão de Biologia Celular e Molecular.
Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto - USP, FMRP-USP, Brasil.
2004 - 2004
Avanços em Oncologia.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
2004 - 2004
Curso de Verão de Genética.
Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto - USP, FMRP-USP, Brasil.
2003 - 2003
Biotecnologia de Líquens. (Carga horária: 6h).
Sociedade Brasileira para o Progresso da Ciência - São Paulo, SBPC, Brasil.
2002 - 2002
Molecular and Cell Biology of RNA Virus Infections.
Sociedade Brasileira de Virologia, SBV, Brasil.
2002 - 2002
Genoma e Bioinformática. (Carga horária: 3h).
Universidade de Brasília, UnB, Brasil.


Atuação Profissional



University of Cambridge, CAM, Inglaterra.
Vínculo institucional

2011 - Atual
Vínculo: Research Associate, Enquadramento Funcional: Post-doctoral researcher, Regime: Dedicação exclusiva.

Vínculo institucional

2010 - 2010
Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Estudante de doutorado visitante, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações
Laboratório do Prof. Tony Kouzarides no Gurdon Institute


The University of Queensland, UQ, Austrália.
Vínculo institucional

2007 - 2011
Vínculo: Estudante, Enquadramento Funcional: Doutorando, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações
Institute for Molecular Bioscience, Genomics & Computational Biology


Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Vínculo institucional

2004 - 2006
Vínculo: Estudante, Enquadramento Funcional: Estudante de mestrado, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações
Departamento de Bioquímica, Instituto de Química


Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária, EMBRAPA, Brasil.
Vínculo institucional

2003 - 2004
Vínculo: Bolsista ITI, Enquadramento Funcional: Bolsista, Carga horária: 36
Outras informações
Bolsa de Iniciação Tecnológica Industrial (ITI) concedida pelo CNPq junto ao projeto "Análise da Estrutura Primária do Genoma A de Musa acuminata?

Vínculo institucional

2002 - 2003
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Bolsista, Carga horária: 16
Outras informações
Bolsa concedida pelo CNPq, programa PIBIC-UnB, sob orientação do Dr. Manoel Teixeira Souza Jr.

Atividades

8/2003 - 1/2004
Pesquisa e desenvolvimento , Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, .
7/2002 - 1/2004
Estágios , Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, .

Estágio realizado
Virologia.
7/2002 - 8/2003
Pesquisa e desenvolvimento , Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, .

Universidade de Brasília, UnB, Brasil.
Vínculo institucional

2000 - 2003
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Estagiário, Carga horária: 12
Outras informações
Estágio em Virologia Vegetal sob a orientação do prof. Renato de Oliveira Resende.

Vínculo institucional

2001 - 2002
Vínculo: Bolsista de IC (PIBIC-CNPq), Enquadramento Funcional: Bolsista, Carga horária: 12
Outras informações
Bolsa de iniciação científica. Agência financiadora: CNPq, programa: Pibic-UnB, duração: 12 meses.

Atividades

7/2000 - 7/2003
Estágios , Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Biologia Celular.

Estágio realizado
Estágio na área de Virologia Vegetal, sob a orientação do Dr. Renato O. Resende e co-orientação do Dr. Tatsuya Nagata no Laboratório de Microscopia Eletrônica..


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.


Idiomas


Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.


Produções



Produção bibliográfica
Artigos completos publicados em periódicos

1.
LI, MENG AMY2017LI, MENG AMY ; Amaral, Paulo P ; CHEUNG, PRISCILLA ; BERGMANN, JAN H ; KINOSHITA, MASAKI ; KALKAN, TÜZER ; RALSER, MERYEM ; ROBSON, SAM ; MEYENN, FERDINAND VON ; PARAMOR, MAIKE ; YANG, FENGTANG ; CHEN, CAIFU ; NICHOLS, JENNIFER ; SPECTOR, DAVID L ; KOUZARIDES, TONY ; HE, LIN ; SMITH, AUSTIN . A lncRNA fine tunes the dynamics of a cell state transition involving , and DNA methylation. eLife, v. 6, p. e23468, 2017.

2.
BELL, CHARLES C.2016BELL, CHARLES C. ; Amaral, Paulo P. ; KALSBEEK, ANTON ; MAGOR, GRAHAM W. ; GILLINDER, KEVIN R. ; TANGERMANN, PIERRE ; DI LISIO, LORENA ; CHEETHAM, SETH W. ; GRUHL, FRANZISKA ; FRITH, JESSICA ; TALLACK, MICHAEL R. ; RU, KE-LIN ; CRAWFORD, JOANNA ; Mattick, John S. ; Dinger, Marcel E. ; PERKINS, ANDREW C. . The Evx1/Evx1as gene locus regulates anterior-posterior patterning during gastrulation. Scientific Reports, v. 6, p. 26657, 2016.

3.
AMARAL, PAULO P.2014AMARAL, PAULO P.; BANNISTER, ANDREW J. . Re-Place Your BETs: The Dynamics of Super Enhancers. Molecular Cell, v. 56, p. 187-189, 2014.

4.
Amaral, P. P.2013Amaral, P. P.; Dinger, M. E. ; Mattick, J. S. . Non-coding RNAs in homeostasis, disease and stress responses: an evolutionary perspective. BRIEF FUNCT GENOMICS, v. 12, p. 254-278, 2013.

5.
CASTELO-BRANCO, GONÇALO2013CASTELO-BRANCO, GONÇALO ; Amaral, Paulo P ; ENGSTRÖM, PÄR G ; ROBSON, SAMUEL C ; MARQUES, SUELI C ; BERTONE, PAUL ; KOUZARIDES, TONY . The non-coding snRNA 7SK controls transcriptional termination, poising and bidirectionality in embryonic stem cells. GenomeBiology.com (London. Print), v. 14, p. r98, 2013.

6.
Gascoigne, D. K.2012Gascoigne, D. K. ; CHEETHAM, S. W. ; CATTENOZ, P. B. ; Clark, M. B. ; Amaral, P. P. ; TAFT, R. J. ; WILHELM, D. ; Dinger, M. E. ; Mattick, J. S. . Pinstripe: a suite of programs for integrating transcriptomic and proteomic datasets identifies novel proteins and improves differentiation of protein-coding and non-coding genes. Bioinformatics (Oxford. Print), v. 28, p. 3042-3050, 2012.

7.
Clark, Michael B.2011Clark, Michael B. ; Amaral, Paulo P. ; Schlesinger, Felix J. ; Dinger, Marcel E. ; Taft, Ryan J. ; Rinn, John L. ; Ponting, Chris P. ; Stadler, Peter F. ; Morris, Kevin V. ; Morillon, Antonin ; Rozowsky, Joel S. ; Gerstein, Mark B. ; Wahlestedt, Claes ; Hayashizaki, Yoshihide ; Carninci, Piero ; Gingeras, Thomas R. ; Mattick, John S. . The Reality of Pervasive Transcription. PLoS Biology (Online), v. 9, p. e1000625, 2011.

8.
Amaral, P. P.2010Amaral, P. P.; Clark, M. B. ; Gascoigne, D. K. ; Dinger, M. E. ; Mattick, J. S. . lncRNAdb: a reference database for long noncoding RNAs. Nucleic Acids Research, v. 39, p. D146-D151, 2010.

9.
Mattick, John S.2009Mattick, John S. ; Amaral, Paulo P. ; Dinger, Marcel E. ; Mercer, Tim R. ; Mehler, Mark F. . RNA regulation of epigenetic processes. BioEssays (Cambridge), v. 31, p. 51-59, 2009.

10.
Amaral, P. P.2009Amaral, P. P.; Neyt, C. ; Wilkins, S. J. ; Askarian-Amiri, M. E. ; Sunkin, S. M. ; Perkins, A. C. ; Mattick, J. S. . Complex architecture and regulated expression of the Sox2ot locus during vertebrate development. RNA. Ribonucleic Acid, p. 00-00, 2009.

11.
Dinger, M. E.2009Dinger, M. E. ; Amaral, P. P. ; Mercer, T. R. ; Mattick, J. S. . Pervasive transcription of the eukaryotic genome: functional indices and conceptual implications. Briefings in functional genomics & proteomics, p. Advance Access, 2009.

12.
AMARAL, P. P. R.;Amaral, P. P.;Amaral, Paulo P.;Amaral, Paulo P;AMARAL, PAULO P.2008AMARAL, P. P. R.; Dinger, M. E. ; Mercer, T. R. ; Mattick, J. S. . The Eukaryotic Genome as an RNA Machine. Science, v. 319, p. 1787-1789, 2008.

13.
Dinger, M. E.2008 Dinger, M. E. ; Amaral, P. P. ; Mercer, T. R. ; Pang, K. C. ; Bruce, S. J. ; Gardiner, B. B. ; Askarian-Amiri, M. E. ; Ru, K. ; Solda, G. ; Simons, C. ; Sunkin, S. M. ; Crowe, M. L. ; Grimmond, S. M. ; Perkins, A. C. ; Mattick, J. S. . Long noncoding RNAs in mouse embryonic stem cell pluripotency and differentiation. Genome Research, v. 18, p. 1433-1445, 2008.

14.
Amaral, Paulo P.2008 Amaral, Paulo P.; Mattick, John S. . Noncoding RNA in development. Mammalian Genome, v. 19, p. 454-492, 2008.

15.
SUNWOO, H.2008SUNWOO, H. ; Dinger, M. E. ; WILUSZ, J. E. ; Amaral, P. P. ; Mattick, J. S. ; SPECTOR, D. L. . MEN  /  nuclear-retained non-coding RNAs are up-regulated upon muscle differentiation and are essential components of paraspeckles. Genome Research, v. 19, p. 347-359, 2008.

16.
Louro, Rodrigo2007Louro, Rodrigo ; Nakaya, Helder I ; Amaral, Paulo P ; Festa, Fernanda ; Sogayar, Mari C ; da Silva, Aline M ; Verjovski-Almeida, Sergio ; Reis, Eduardo M . Androgen responsive intronic non-coding RNAs. BMC BIOLOGY, v. 5, p. 4, 2007.

17.
Nakaya, Helder I2007 Nakaya, Helder I ; Amaral, Paulo P ; Louro, Rodrigo ; Lopes, André ; Fachel, Angela A ; Moreira, Yuri B ; El-Jundi, Tarik A ; da Silva, Aline M ; Reis, Eduardo M ; Verjovski-Almeida, Sergio . Genome mapping and expression analyses of human intronic noncoding RNAs reveal tissue-specific patterns and enrichment in genes related to regulation of transcription. GenomeBiology.com (London. Print), v. 8, p. R43, 2007.

18.
AMARAL, P. P. R.;Amaral, P. P.;Amaral, Paulo P.;Amaral, Paulo P;AMARAL, PAULO P.2006AMARAL, P. P. R.; ALVES, P. C. M. ; MARTINS, N. F. ; SILVA., F. R. ; CAPDEVILLE, G. ; Souza Jr., M.T. . Isolation and Characterization of a Resistance Gene Analog (RGA) from Caricacea Dumort Family. Revista Brasileira de Fruticultura, v. 28, p. 458-462, 2006.

19.
AMARAL, P. P. R.;Amaral, P. P.;Amaral, Paulo P.;Amaral, Paulo P;AMARAL, PAULO P.2006AMARAL, P. P. R.; Resende, R.O. ; Souza Jr., M.T. . Papaya lethal yellowing virus (PLYV) infects Vasconcellea cauliflora (Jacq.) A. DC.. Fitopatologia Brasileira, v. 31, p. 517, 2006.

20.
AMARAL, P. P. R.;Amaral, P. P.;Amaral, Paulo P.;Amaral, Paulo P;AMARAL, PAULO P.2006AMARAL, P. P. R.; NAKAYA, H. I. . DNA não-codificador: o lixo que vale ouro?. Ciência Hoje, v. 38, p. 36-42, 2006.

21.
AMARAL, P. P. R.;Amaral, P. P.;Amaral, Paulo P.;Amaral, Paulo P;AMARAL, PAULO P.2006AMARAL, P. P. R.; VERJOVSKI-ALMEIDA, S. . Decifrando o Silencio. Ciência Hoje, v. 39, p. 14-15, 2006.

Livros publicados/organizados ou edições
1.
Amaral, P. P.; CASTELO-BRANCO, G. . Ciências genômicas: fundamentos e aplicações (Leandro Marcio Moreira, organizador). 1. ed. Sociedade Brasileira de Genética (SBG) e Editora Cubo, 2015. 413p .

Textos em jornais de notícias/revistas
1.
Amaral, Paulo P. Celebrating Francis Crick and the 60th Anniversary of DNA Structure. FEBS News (a magazine of the Federation of European Biochemical Societies), p. 10 - 13, 17 maio 2013.

Trabalhos completos publicados em anais de congressos
1.
AMARAL, P. P. R.; GOYA, A. . A Gravitação e a Dilatação do Tempo. In: Iniciação Científica 2° Grau - Centro de Atividades Culturais, 1998, Brasília. Iniciação Científica 2° Grau - o despertar para a ciência - 7ª edição, 1998. p. 17-23.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
Amaral, P. P.; LEONARDI, T. ; VIRE, E. ; HAN, N. ; Gascoigne, D. K. ; Mattick, J. S. ; KOUZARIDES, T. . Positionally conserved long noncoding RNAs as regulators of developmental genes. In: Keystone Conference, Long Noncoding RNAs: Marching toward Mechanism, 2014, Santa Fe. Keystone Conference, Long Noncoding RNAs: Marching toward Mechanism, 2014.

2.
KALSBEEK, A. M. ; Amaral, P. P. ; Perkins, A. C. ; Dinger, M. E. ; Mattick, J. S. . Characterizing the role of the Evx1-as long non-coding RNA in stem cell development.. In: 32nd Lorne Genome Conference, 2011, Lorne. 32nd Lorne Genome Conference, 2011.

3.
Amaral, P. P.; Clark, M. B. ; Gascoigne, D. K. ; Dinger, M. E. ; Mattick, J. S. . Long non-coding RNA database (lncRNAdb): a curated repository for long regulatory RNAs. In: EMBO/EMBL Symposium: Non-Coding Genome, 2010, Heidelberg. EMBO/EMBL Symposium: Non-Coding Genome.

4.
Amaral, P. P.; TAFT, R. J. ; CROFT, L. ; Mattick, J.S. . The RNA Hypothesis for Regulatory Evolution in Complex Organisms. In: Evolution - The Experience, 2009, Melbourne. Evolution - The Experience Conference 2009. p. 49.

5.
Dinger, M. E. ; Mercer, T.R. ; Amaral, P. P. ; Pang, K.C. ; Sunkin, S.M. ; Perkins, A.C. ; Mattick, J.S. . Long Noncoding RNAs: Insights into Functions. In: 3rd Marie Curie-Genome Architecture in Relation to Disease Meeting (MC-GARD), 2009, Edinburgh. CELLULAR ONCOLOGY. AMSTERDAM, NETHERLANDS: IOS PRESS, 2009. v. 31. p. 97-98.

6.
Amaral, P. P.; Dinger, M. E. ; Mercer, T.R. ; Pang, K.C. ; Askarian-Amiri, M. ; Bruce, S.J. ; Wilkins, S.J. ; Neyt, C. ; Sunkin, S.M. ; Perkins, A.C. ; Mattick, J.S. . Characterization of Long Noncoding RNAs in Mouse Embryonic Stem Cell Differentiation and Vertebrate Development. In: XX international Congress of Genetics, 2008, Berlin. Genetics - Understanding Living Systems, XX international Congress of Genetics, July 12-17, 2008, 2008. p. 319.

7.
Amaral, P. P.; Dinger, M. E. ; Mercer, T.R. ; Bruce, S.J. ; Askarian-Amiri, M. ; Wilkins, S.J. ; Neyt, C. ; Solda, G. ; Sunkin, S.M. ; Perkins, A.C. ; Mattick, J.S. . Characterization of Long Noncoding RNAs Associated with Developmental Genes in Vertebrates. In: Lorne Genome Conference, 2008, Lorne. The 29th Lorne Genome Conference, 17th - 21st February 2008, 2008.

8.
LOURO, R. ; AMARAL, P. P. R. ; NAKAYA, H. I. ; FESTA, F. ; SOGAYAR, M. C. ; REIS, E. M. ; SILVA, A. M. ; VERJOVSKI-ALMEIDA, S. . Androgen-responsive transcription of intronic non-coding RNAs in a human prostate cancer cell line.. In: 71st Cold Spring Harbor Symposium: Regulatory RNAs, 2006, Cold Spring Harbor. LXXI Cold Spring Harbor Symposium on Quantitative Biology - Regulatory RNAs. Cold Spring Harbor, New York: Cold Spring Harbor Laboratory, 2006. p. 132.

9.
NAKAYA, H. I. ; LOURO, R. ; LOPES, A. ; EL-JUNDI, T. ; AMARAL, P. P. R. ; FACHEL, A. ; SILVA, A. M. ; REIS, E. M. ; VERJOVSKI-ALMEIDA, S. . Global analysis of antisense transcription in intronic regions of the human genome. In: 71st Cold Spring Harbor Laboratory Symposium: Regulatory RNAs, 2006, Cold Spring Harbor. LXXI Cold Spring Harbor Laboratory Symposium on Quantitative Biology - Regulatory RNAs. Cold Spring Harbor, New York: Cold Spring Harbor Laboratory, 2006. p. 153.

10.
AMARAL, P. P. R.; NAKAYA, H. I. ; LOURO, R. ; REIS, E. M. ; SILVA, A. M. ; VERJOVSKI-ALMEIDA, S. . RNA Pol II-Independent Transcription of Noncoding RNAs in Human Cells.. In: 35ª Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Bilogia Molecular, 2006, Águas de Lindóia. 35ª Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular (SBBq), 2006.

11.
NAKAYA, H. I. ; LOURO, R. ; FESTA, F. ; AMARAL, P. P. R. ; EL JUNDI, T.A. ; SOGAYAR, M. C. ; SILVA, A. M. ; REIS, E. M. ; VERJOVSKI-ALMEIDA, S. . Identification of Intronic Non-Coding RNAs Regulated by Androgen in a Prostate Cancer Cell Line Using Intronic cDNA-Microarrays. In: 34a. Reunião Anual da SBBq, 2005, Águas de Lindóia, SP. 34a. Reunião Anual da SBBq, 2005.

12.
LOURO, R. ; NAKAYA, H. I. ; AMARAL, P. P. R. ; FESTA, F. ; SOGAYAR, M. C. ; SILVA, A. M. ; REIS, E. M. ; VERJOVSKI-ALMEIDA, S. . CHARACTERIZATION OF INTRONIC NON-CODING TRANSCRIPTS REGULATED BY ANDROGEN IN A PROSTATE CANCER CELL LINE BY STRAND-SPECIFIC REAL-TIME PCR. In: 34a. Reunião Anual da SBBq, 2005, Águas de Lindóia, SP. 34a. Reunião Anual da SBBq, 2005.

13.
SILVA, J. C. ; MARACAJA-COUTINHO, V. ; NAKAYA, H. I. ; LOURO, R. ; AMARAL, P. P. R. ; REIS, E. M. ; VERJOVSKI-ALMEIDA, S. . Molecular Characterization of Intronic Transcripts Regulated by Androgen in Prostate Cancer Cell Line. In: 34a. Reunião Anual da SBBq, 2005, Águas de Lindóia, SP. 34a. Reunião Anual da SBBq, 2005.

14.
AMARAL, P. P. R.; NAKAYA, H. I. ; LOURO, R. ; FESTA, F. ; SOGAYAR, M. C. ; REIS, E. M. ; SILVA, A. M. ; VERJOVSKI-ALMEIDA, S. . Binding of Androgen Receptor to Potential Promoter Sequences that Drive Antisense Intronic RNA Transcription. In: 51º Congresso da Sociedade Brasileira de Genética, 2005, Águas de Lindóia. 51º Congresso da Sociedade Brasileira de Genética, 2005.

15.
AMARAL, P. P. R.; Silva, A.M.R ; Kitajima, E.W. ; Resende, R.O. . Caracterização Molecular do Vírus do Amarelo Letal do Mamoeiro, um Possível Sobemovirus Infectando o Mamoeiro no Brasil. 2003. 10ª Jornada Nacional de Iniciação Científica, 55ª Reunião Anual da SBPC. In: 10ª Jornada Nacional de Iniciação Científica, 55ª Reunião Anual da SBPC, 2003, Recife/PE. 55ª Reunião Anual da SBPC, 2003.

16.
Souza Jr., M.T. ; AMARAL, P. P. R. ; ALVES, P. C. M. ; MARTINS, N. F. ; SILVA., F. R. . Search for resistance gene analogs (RGAs) in the genome of Carica spp. 2003. 49ª Reunião Anual da Sociedade Interamericana de Horticultura Tropical. In: 49ª Reunião Anual da Sociedade Interamericana de Horticultura Tropical, 2003, Fortaleza. 49ª Reunião Anual da Sociedade Interamericana de Horticultura Tropical, 2003.

17.
AMARAL, P. P. R.; ALVES, P. C. M. ; Souza Jr., M.T. . Response of a cp transgenic papaya and a Carica cauliflora population to the challenge by three virus infecting papaya in Brazil. 2003. XXXVI Congresso Brasileiro de Fitopatologia. In: XXXVI Congresso Brasileiro de Fitopatologia, 2003, Uberlândia. Fitopatologia Brasileira, 2003. v. 28. p. S228-S228.

18.
AMARAL, P. P. R.. Seqüenciamento e organização genômica do vírus do amarelo letal do mamoeiro (PLYV). 2002. 8° Congresso de Iniciação Científica da Universidade de Brasília. In: 8° Congresso de Iniciação científica da Universidade de Brasília, 2002, Brasília. 8° Congresso de Iniciação científica da Universidade de Brasília, 2002.

19.
Silva, A.M.R ; AMARAL, P. P. R. ; Kitajima, E.W. ; Resende, R.O. . Papaya Lethal Yellowing Virus, a possible sobemovius infecting papaya in Brazil. 2002. XII International Congress of Virology. Paris, França.. In: XII International Congress of Virology, 2002, Paris. The World of Microbes - XII International Congress of Virology, 2002. p. 196-196.

20.
AMARAL, P. P. R.; Silva, A.M.R ; Kitajima, E.W. ; Resende, R.O. . Papaya Lethal Yellowing Virus, a possible sobemovirus infecting Papaya in Brazil. 2002. XIII National Meting of Virology. Águas de Lindóia, SP, Brasil.. In: XIII National Meeting of Virology, 2002, Águas de Lindóia. Virus: Reviews & Research, 2002. v. 07. p. 154.

21.
AMARAL, P. P. R.; Resende, R.O. ; NAGATA, T. . Biological and genomic characteristics of a potyvirus isolated from Tropaeolum majus in Brazil. 2001. XII Encontro Nacional de Virologia/ 4º Encontro de Virologia do Mercosul. Caldas Novas, Brasil.. In: XII Encontro Nacional de Virologia/ 4º Encontro de Virologia do Mercosul, 2001, Caldas Novas. XII Encontro Nacional de Virologia/ 4º Encontro de Virologia do Mercosul, 2001.

Apresentações de Trabalho
1.
Amaral, P. P.. Long noncoding RNAs as regulators of developmental genes in differentiating and cancer cells. 2014. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

2.
Amaral, P. P.. Explorando a ?matéria escura? do genoma: RNAs não-codificadores de proteínas no desenvolvimento de vertebrados. 2010. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

3.
Amaral, P. P.; Dinger, M. E. ; Mercer, T.R. ; TAFT, R. J. ; Mattick, J.S. . The RNA Hypothesis For Regulatory Evolution In Complex Organisms. 2009. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

4.
Amaral, P. P.. Noncoding RNAs and associated developmental genes: functional relationships and evolutionary implications. 2009. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

5.
Amaral, P. P.. Regulação por RNA. 2006. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

6.
Amaral, P. P.. DNA lixo?. 2006. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

7.
Amaral, P. P.. DNA Não-codificante: Fonte de Complexidade. 2006. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).


Demais tipos de produção técnica
1.
Amaral, P. P.; CASTELO-BRANCO, GONÇALO ; HINAS, A. . Second Doctoral Course on 'Regulatory RNAs in Development, Disease and Evolution'. 2014. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

2.
Amaral, P. P.; CASTELO-BRANCO, GONÇALO ; HINAS, A. . First Doctoral Course and International Symposium on 'Regulatory RNAs in Development, Disease and Evolution'. 2013. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

3.
AMARAL, P. P. R.; ZAINI, P. . Técnicas de Estudo da Expressão Gênica, 1º Curso de Bioquímica e Biologia Molecular do Departamento de Biquímica, IQ-USP. 2006. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).



Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
Global Young Scientists Summit.Advancing Science, Creating Technologies for a Better World. 2013. (Outra).

2.
Chromatin: Structure & Function. 2011. (Congresso).

3.
Thirteenth Annual Meeting of the RNA Society. 2008. (Encontro).

4.
71st Cold Spring Harbor Laboratory Symposium: Regulatory RNAs.Androgen-responsive transcription of intronic non-coding RNAs in a human prostate cancer cell line. 2006. (Simpósio).

5.
. 50º Congresso Brasileiro de Genética. 2004. (Congresso).

6.
.V Simpósio Brasileiro sobre Bananicultura e I Workshop do Genoma Musa. 2003. (Simpósio).

7.
55ª Reunião Anual da SBPC.55ª Reunião Anual da SBPC. 2003. (Outra).

8.
XXXVI Congresso Brasileiro de Fitopatologia - Manejo Integrado de Doenças de Plantas. XXXVI Congresso Brasileiro de Fitopatologia. 2003. (Congresso).

9.
. XIII National Meeting of Virology. 2002. (Congresso).

10.
5° Seminário Brasileiro de Tecnologia Enzimática.5° Seminário Brasileiro de Tecnologia Enzimática. 2002. (Seminário).

11.
VIII Encontro Internacional Sobre Paracoccidioidomicose. VIII Encontro Internacional Sobre Paracoccidioidomicose. 2002. (Congresso).

12.
. XII National Meeting of Virology/ 4th Mercosul Meeting of Virology. 2001. (Congresso).


Organização de eventos, congressos, exposições e feiras
1.
STEMPOR, P. ; Amaral, P. P. . First Gurdon Institute Postdoc Association (GIPA) ?Building an Organism Symposium". 2014. (Congresso).

2.
Amaral, P. P.; CASTELO-BRANCO, GONÇALO ; HINAS, A. . Regulatory RNAs in Development, Disease and Evolution. 2013. (Congresso).

3.
Amaral, P. P.; CUBS, .. ; ABEP, .. . 5th Conference of the Association of Brazilian Postgraduate Students in the United Kingdom. 2012. (Outro).

4.
AMARAL, P. P. R.. 1º Curso de Bioquímica e Biologia Molecular do Departamento de Biquímica, IQ-USP. 2006. (Outro).



Educação e Popularização de C & T



Livros e capítulos
1.
Amaral, P. P.; CASTELO-BRANCO, G. . Ciências genômicas: fundamentos e aplicações (Leandro Marcio Moreira, organizador). 1. ed. Sociedade Brasileira de Genética (SBG) e Editora Cubo, 2015. 413p .


Apresentações de Trabalho
1.
Amaral, P. P.. Long noncoding RNAs as regulators of developmental genes in differentiating and cancer cells. 2014. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).


Cursos de curta duração ministrados
1.
Amaral, P. P.; CASTELO-BRANCO, GONÇALO ; HINAS, A. . First Doctoral Course and International Symposium on 'Regulatory RNAs in Development, Disease and Evolution'. 2013. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

2.
Amaral, P. P.; CASTELO-BRANCO, GONÇALO ; HINAS, A. . Second Doctoral Course on 'Regulatory RNAs in Development, Disease and Evolution'. 2014. (Curso de curta duração ministrado/Outra).


Organização de eventos, congressos, exposições e feiras
1.
Amaral, P. P.; CASTELO-BRANCO, GONÇALO ; HINAS, A. . Regulatory RNAs in Development, Disease and Evolution. 2013. (Congresso).



Outras informações relevantes


2005 - Bolsista do Programa de Aperfeiçoamento de Ensino (PAE), Instituto de Química, Universidade de São Paulo - estágio como monitor na disciplina Bioquímica e Biologia Molecular do Gene (QBQ0217 e QBQ0317).



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