Nelson Peixoto Kotowski Filho

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  • Última atualização do currículo em 08/10/2018


Doutor formado pelo Curso de Pós-Graduação em Biologia Computacional e Sistemas do Instituto Oswaldo Cruz - IOC/FIOCRUZ. Possui mestrado em Engenharia de Sistemas e Computação (2008) - Banco de Dados - realizado no programa PESC da COPPE/UFRJ e é graduado em INFORMÁTICA pela Universidade do Estado do Rio de Janeiro (2003). Atualmente é Tecnologista em Saúde Pública na Fundação Oswaldo Cruz - FIOCRUZ. Tem experiência na área de Bioinformática e Ciência da Computação, com ênfase em Genômica Comparativa, Computação em Nuvem, Banco de Dados e Infra-estrutura. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Nelson Peixoto Kotowski Filho
Nome em citações bibliográficas
KOTOWSKI, NELSON;Kotowski, Nelson

Endereço


Endereço Profissional
Fundação Oswaldo Cruz, Diretoria de Administração.
Avenida Brasil, 4365
Manguinhos
21040-360 - Rio de Janeiro, RJ - Brasil
URL da Homepage: http://www.fiocruz.br


Formação acadêmica/titulação


2011 - 2015
Doutorado em Biologia Computacional e Sistemas.
Fundação Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, Brasil.
com período sanduíche em Universitat Politècnica de València (Orientador: Ignacio Blanquer-Espert).
Título: Genômica Comparativa em Ambiente Computacional Distribuído: Aplicabilidade e Potencial no Estudo de Homologia entre Protozoários, Ano de obtenção: 2015.
Orientador: Alberto Martín Rivera Dávila.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
Palavras-chave: nuvem; cloud computing; ortólogos.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Sistemas de Computação / Especialidade: Biologia Computacional.
Setores de atividade: Atividades de atenção à saúde humana; Atividades dos serviços de tecnologia da informação.
2005 - 2008
Mestrado em Banco de Dados/Eng. de Sist. e Comp..
COPPE/UFRJ, COPPE, Brasil.
Título: Processamento Paralelo de Consultas de Apoio à Decisão em Grids,Ano de Obtenção: 2008.
Orientador: Marta Lima de Queirós Mattoso.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
Palavras-chave: Data Grid; processamento paralelo de consultas.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra
Setores de atividade: Atividades de Banco de Dados.
2004 - 2005
Especialização em Administração Econômico-Financeira. (Carga Horária: 392h).
Fundação de Apoio ao Cefet, FUNCEFET/RJ, Brasil.
Título: Balanced Scorecard - Histórico, Evolução e Tendências.
Orientador: Fernando Antônio Araújo Longhi.
1999 - 2003
Graduação em INFORMÁTICA.
Universidade do Estado do Rio de Janeiro, UERJ, Brasil.
Título: Contribuição ao Estudo da Logística Integrada para Intermediação de Carga Rodoviária.
Orientador: Alexandre Rojas.
Bolsista do(a): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ, FAPERJ, Brasil.




Formação Complementar


2017 - 2017
Foresight: métodos e aplicações em ciência, tecnologia e inovação. (Carga horária: 56h).
Fundação Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, Brasil.
2004 - 2005
MBA em Adminstração Econômico Financeira. (Carga Horária: 392h).
Fundação de Apoio ao Cefet, FUNCEFET/RJ, Brasil.
Título: Balanced Scorecard - Histórico, Evolução e Tendências.
Orientador: Fernando Antônio Araújo Longhi.
Palavras-chave: Balanced Scorecard.
Grande área: Ciências Sociais Aplicadas


Atuação Profissional



Fundação Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, Brasil.
Vínculo institucional

2008 - Atual
Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Tecnologista em Saúde Pública, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Vínculo institucional

2018 - 2018
Vínculo: Professor Visitante, Enquadramento Funcional: Professor Convidado, Carga horária: 50
Outras informações
Professor convidado de 13 de Março a 29 de Junho de 2018, na Disciplina de Algoritmos e Programação do Programa de Pós-Graduação em Biologia Computacional e Sistemas do Instituto Oswaldo Cruz (IOC/FIOCRUZ). Carga horária total -> 50 horas.

Atividades

06/2018 - Atual
Pesquisa e desenvolvimento , Instituto Oswaldo Cruz, .

03/2018 - 08/2018
Ensino, Biologia Computacional e Sistemas, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Algoritmos e Programação
05/2017 - 06/2018
Direção e administração, Diretoria de Administração, .

Cargo ou função
Chefe do Departamento de Gestão da Informação Administrativa e Assessoria - DEGIAS.
04/2014 - 05/2017
Direção e administração, Diretoria de Administração, .

Cargo ou função
Tecnologista em Saúde Pública.
07/2010 - 03/2014
Direção e administração, Presidência da Fiocruz, Vice-Presidência de Gestão e Desenvolvimento Institucional.

Cargo ou função
Gestor da Equipe de Business Intelligence.
09/2009 - 07/2010
Direção e administração, Diretoria de Administração, .

Cargo ou função
Chefe da Área de Redes e Banco de Dados - FG1.
07/2009 - 09/2009
Conselhos, Comissões e Consultoria, Diretoria de Administração, .

Cargo ou função
Membro de equipe autorizada em portaria interna para formulação de diretrizes visando a criação uma área de coordenação de atividades de T.I. no âmbito da Fiocruz.

Universitat Politècnica de València, UPV, Espanha.
Vínculo institucional

2014 - 2014
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Aluno Doutorado Sanduíche, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações
Bolsa concedida pela CAPES, programa PDSE


Coppetec Computação, CC*, Brasil.
Vínculo institucional

2006 - 2008
Vínculo: Analista de Sistemas, Enquadramento Funcional: Coordenador de Laboratório, Carga horária: 20

Vínculo institucional

2005 - 2006
Vínculo: Analista de Sistemas, Enquadramento Funcional: Analista de Sistemas, Carga horária: 20
Outras informações
Fundação COPPETEC

Atividades

06/2005 - 06/2008
Conselhos, Comissões e Consultoria, Fundação COPPETEC, .

Cargo ou função
Analista de Sistemas.

Universidade do Estado do Rio de Janeiro, UERJ, Brasil.
Vínculo institucional

2000 - 2001
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Desenvolvedor de Sistemas, Carga horária: 20
Outras informações
Bolsista da Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesq. do Estado do Rio de Janeiro. Alocado no Projeto SIMPUL.


Intelig Telecom, INTELIG, Brasil.
Vínculo institucional

2003 - 2005
Vínculo: Funcionário, Enquadramento Funcional: Analista de Suporte Técnico, Carga horária: 40

Vínculo institucional

2001 - 2003
Vínculo: Estagiário, Enquadramento Funcional: Estagiário em Informática - Redes e BD, Carga horária: 20

Atividades

01/2003 - 03/2005
Serviços técnicos especializados , Intelig Telecom, .

Serviço realizado
Analista de Suporte Técnico.


Linhas de pesquisa


1.
Genômica Comparativa
2.
Biologia Computacional
3.
Computação Distribuída
4.
Computação de Alto Desempenho


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Sistemas de Computação/Especialidade: Biologia Computacional.
2.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação.
3.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Computação Distribuída.
4.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Banco de Dados.
5.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Genômica Comparativa.


Idiomas


Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Espanhol
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.
Francês
Compreende Razoavelmente, Fala Pouco, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.
Português
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.


Produções



Produção bibliográfica
Artigos completos publicados em periódicos

1.
CARRIÓN, ABEL2017 CARRIÓN, ABEL ; CABALLER, MIGUEL ; BLANQUER, IGNACIO ; Kotowski, Nelson ; JARDIM, Rodrigo ; DÁVILA, ALBERTO MARTIN RIVERA . Managing workflows on top of a cloud computing orchestrator for using heterogeneous environments on e-Science. International Journal of Web and Grid Services (Online), v. 13, p. 375-402, 2017.

2.
Kotowski, Nelson2015 Kotowski, Nelson ; JARDIM, Rodrigo ; DÁVILA, ALBERTO M. R. . Improved orthologous databases to ease protozoan targets inference. Parasites & Vectors, v. 8, p. 1-12, 2015.

3.
Kotowski, Nelson2008 Kotowski, Nelson ; Lima, Alexandre A. B. ; PACITTI, ESTHER ; VALDURIEZ, PATRICK ; MATTOSO, MARTA . Parallel query processing for OLAP in grids. Concurrency and Computation. Practice & Experience, v. 20, p. 2039-2048, 2008.

4.
RUBERG, N.2006 RUBERG, N. ; KOTOWSKI, NELSON ; MATTOS, A. ; MATOS, L. ; MACHADO, M. ; OLIVEIRA, D. ; MONCLAR, R. ; FERRAZ, C. ; SANCHOTENE, T. ; BRAGANHOLO, V. . Experiencing Data Grids. Lecture Notes in Computer Science, v. 4395, p. 707-718, 2006.

Trabalhos completos publicados em anais de congressos
1.
CARRION, A. ; CABALLER, M. ; BLANQUER, I. ; Kotowski, Nelson ; DAVILA, A. M. R. . A Multi-Platform Workflow Management System optimized for Cloud Computing Platforms. In: PDPTA'15, 2015, Las Vegas. The 21st International Conference on Parallel and Distributed Processing Techniques and Applications, 2015. p. 424-430.

2.
CARRION, A. ; Kotowski, Nelson ; CABALLER, M. ; BLANQUER, I. ; JARDIM, Rodrigo ; DAVILA, A. M. R. . Design and implementation of a Generic and Multi-Platform Workflow System. In: 8th Iberian Grid Infrastructure Conference, 2014, Aveiro, Portugal. 8th Iberian Grid Infrastructure Conference Proceedings. València: Editorial Universitat Politècnica de València, 2014. v. 1. p. 77-88.

3.
KOTOWSKI, NELSON; LIMA, ALEXANDRE ; PACITTI, ESTHER ; VALDURIEZ, PATRICK ; MATTOSO, MARTA . OLAP Query Processing in Grids. In: 3rd VLDB Workshop on Data Manangement in Grids, 2007, Viena. 3rd VLDB Workshop on Data Management in Grids, 2007.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
Kotowski, Nelson ; JARDIM, Rodrigo ; CUADRAT, R. R. C. ; TSCHOEKE, D. A. ; DAVILA, A. M. R. . Towards a distributed/parallel comparative genomics workflow: Elastic- OrthoSearch. In: Brazilian Symposium on Bioinformatics and International Conference of the AB3C, 2013, Recife. Abstact Book, 2013. p. 151-151.

2.
KOTOWSKI, NELSON; SAPIRA, D. ; MARTINS, Isa ; WEDEMANN, R. ; SIQUEIRA, H. ; MAEDA, T. ; CHAUVET, P. . Avaliação de Estadiamento de Neoplasias Pulmonares. In: 10A. Semana de Iniciação Científica, 2001, Rio de Janeiro. Livro de Resumos da 10A. Semana de Iniciação Científica, 2001. p. 261-262.

3.
MARTINS, Isa ; WEDEMANN, R. ; SIQUEIRA, H. ; MAEDA, T. ; CHAUVET, P. ; KOTOWSKI, NELSON . Estadiamento do Cancer do Pulmão por Computador. In: VIII Congresso de Pneumologia e Tisiologia do Estado do Rio de Janeiro, 2001, Rio de Janeiro. Anais do VIII Congresso de Pneumologia e Tisiologia do Estado do Rio de Janeiro. Rio de Janeiro : Sociedade de Pneumologia e Tisiologia do Estado do Rio de Janeiro, 2001. v. 1. p. 14-14.

Apresentações de Trabalho
1.
Kotowski, Nelson ; JARDIM, Rodrigo ; CUADRAT, R. R. C. ; TSCHOEKE, D. A. ; DAVILA, A. M. R. . Towards a distributed/parallel comparative genomics workflow: Elastic-OrthoSearch. 2013. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

2.
KOTOWSKI, NELSON ; JARDIM, Rodrigo ; CUADRAT, R. R. C. ; TSCHOEKE, D. A. ; DAVILA, A. M. R. . Towards a distributed/parallel comparative genomics workflow: Elastic-OrthoSearch. 2013. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).


Produção técnica
Programas de computador sem registro
1.
KOTOWSKI, NELSON; SIQUEIRA, H. ; MAEDA, T. ; CHAUVET, P. ; MARTINS, Isa ; WEDEMANN, R. . ENEP - Estadiamento de Neoplasias Pulmonares. 2001.


Demais tipos de produção técnica
1.
DÁVILA, ALBERTO M. R. ; JARDIM, Rodrigo ; KOTOWSKI, NELSON ; ANDRADE, B. G. . Análise de dados genômicos utilizando computação de alto desempenho. 2018. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

2.
DÁVILA, ALBERTO M. R. ; JARDIM, Rodrigo ; KOTOWSKI, NELSON ; ANDRADE, B. G. . Análise de Dados Genômicos utilizando Computação de Alto Desempenho. 2017. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

3.
DÁVILA, ALBERTO M. R. ; JARDIM, Rodrigo ; KOTOWSKI, NELSON ; ANDRADE, B. G. . Análise de Dados Genômicos utilizando Computação de Alto Desempenho. 2017. (Curso de curta duração ministrado/Outra).



Bancas



Participação em bancas de trabalhos de conclusão
Teses de doutorado
1.
MAIA, J. M.; GOLDENBERG, S.; BORDIGNON, J.; SILVEIRA, G. F.; KOTOWSKI, NELSON. Participação em banca de Carlos Eduardo de Andrade Lima da Rocha. Desenvolvimento de Sistema de Informação para Apoio à Gestão de Projetos em sintonia com o Marco Legal da Ciência, Tecnologia e Inovação. 2018. Tese (Doutorado em Engenharia Elétrica e Informática Industrial) - Universidade Tecnológica Federal do Paraná.

Monografias de cursos de aperfeiçoamento/especialização
1.
ROMAR, M. G.; KOTOWSKI, NELSON. Participação em banca de Saulo José da Silva. O processo de execução do orçamento na Fundação Oswaldo Cruz: considerações sobre o rateio de despesas entre as Unidades nos contratos de serviços continuados. 2017. Monografia (Aperfeiçoamento/Especialização em Saude Publica) - Fundação Oswaldo Cruz.




Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
How to apply for ERC Grants?. 2018. (Oficina).

2.
USF Social Marketing Conference. 2016. (Congresso).

3.
HIMSS 2014. 2014. (Exposição).

4.
Brazilian Symposium on Bioinformatics.Towards a distributed/parallel comparative genomics workflow: Elastic-OrthoSearch. 2013. (Simpósio).

5.
Curso Microsoft 2276.Curso Microsoft 2276. 2010. (Outra).

6.
Disciplina de Políticas Públicas em Saúde II. 2009. (Outra).

7.
Disciplina de Políticas Públicas em Saúde no Brasil I. 2009. (Outra).

8.
Curso de Gerência de Projetos para Não-Especialistas.Curso de Gerência de Projetos para Não-Especialistas. 2008. (Outra).

9.
Curso Wireless - Fiocruz.Curso Wireless - Fiocruz. 2008. (Outra).

10.
Seminário 20 anos SUS: desafios para a informação e comunicação em saúde. 2008. (Seminário).

11.
Simpósio Saúde 200 Anos Brasil-Portugal. 2008. (Simpósio).

12.
3rd VLDB Workshop on Data Manangement in Grids.OLAP Query Processing in Grids. 2007. (Seminário).

13.
Escola de Grids - XXVII Congresso da SBC.Escola de Grids. 2007. (Outra).

14.
XXVII Congresso da SBC. 2007. (Congresso).

15.
10A. Semana de Iniciação Científica.ENeP - Estadiamento de Neoplasias Pulmonares. 2001. (Seminário).



Orientações



Orientações e supervisões concluídas
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização
1.
Carlos Henrique da Silva Athayde. Iniciativas para reduzir a incidência de juros e multas nos processos de contratos de serviços continuados sob a gestão da Coordenação-Geral de Administração.. 2017. Monografia. (Aperfeiçoamento/Especialização em Saude Publica) - Fundação Oswaldo Cruz. Orientador: Nelson Peixoto Kotowski Filho.



Educação e Popularização de C & T



Cursos de curta duração ministrados
1.
DÁVILA, ALBERTO M. R. ; JARDIM, Rodrigo ; KOTOWSKI, NELSON ; ANDRADE, B. G. . Análise de Dados Genômicos utilizando Computação de Alto Desempenho. 2017. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

2.
DÁVILA, ALBERTO M. R. ; JARDIM, Rodrigo ; KOTOWSKI, NELSON ; ANDRADE, B. G. . Análise de dados genômicos utilizando computação de alto desempenho. 2018. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

3.
DÁVILA, ALBERTO M. R. ; JARDIM, Rodrigo ; KOTOWSKI, NELSON ; ANDRADE, B. G. . Análise de Dados Genômicos utilizando Computação de Alto Desempenho. 2017. (Curso de curta duração ministrado/Outra).




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