Rede de Colaboração
Diretório de grupos de pesquisa

Shirley Vasconcelos Komninakis

Possui doutorado em Ciências (Fisiopatologia Experimental) pela Universidade de São Paulo (2003). Atualmente é pesquisadora associada da Universidade Federal de São Paulo. Tem experiência na área de Bioquímica, com ênfase em Biologia Molecular, atuando principalmente nos seguintes temas: Estudo de resistência genotípica a antivirais utilizados no tratamento anti HIV-1, Hepatites B e C, desenvolvimento de técnicas moleculares utilizando o Real Time PCR para ajudar no gerenciamento do tratamento.
(Texto informado pelo autor)

Última atualização do currículo em 02/12/2011
Endereço para acessar este CV:
http://lattes.cnpq.br/6529080329230878
Dados pessoais
NomeShirley Vasconcelos Komninakis
Nome em citações bibliográficasKOMNINAKIS, S. V.;Komninakis, Shirley
SexoFeminino
Endereço profissionalUniversidade Federal de São Paulo, Departamento de Medicina, Disciplina de Doenças Infecciosas e Parasitárias.
Laboratório de Retrovirolgoia - Rua Pedro de Toledo, 781 - 16º andar
Vila Clementino
04039-032 - Sao Paulo, SP - Brasil
Telefone: (11) 50844262 Ramal: 4 Fax: (11) 55712130
URL da Homepage: http://www.infectoepm.com.br

Formação acadêmica/Titulação
2004 - 2008Pós-Doutorado .
Universidade Federal de São Paulo, UNIFESP, Brasil.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo ,FAPESP ,Brasil .
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.
2000 - 2003Doutorado em Ciências (Fisiopatologia Experimental) .
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: Métodos sorológicos e moleculares para a identificação de varinates do vírus da imunodeficiência humana tipo 1 (HIV-1) do subtipo B presentes em São Paulo, Brasil, Ano de Obtenção: 2003.
Orientador: Jorge Simão do Rosário Casseb.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo ,FAPESP ,Brasil .
Palavras-chave: HIV-1; gp 120 do HIV-1; Região V3; Sorotipagem; RFLP; Seqüenciamento do gene env.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Imunologia.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica.
1998 - 1999Especialização em Fisiopatologia Experimental . (Carga Horária: 3800h).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: Avaliação de anticorpos para a alça v3 do envelope do vírus da imunodeficiência humana tipo 1 (HIV-1)..
Orientador: Alberto Jose da Silva Duarte.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo ,FAPESP ,Brasil .
1992 - 1995Graduação em Ciências Biológicas .
Universidade Presbiteriana Mackenzie, MACKENZIE, Brasil.
Título: Caracterização da região 5 dos agrupamentos de genes da trans-sialidase de trypanosoma cruzi..
Orientador: Sergio Schenkman.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo ,FAPESP ,Brasil .

Atuação profissional
Universidade Federal de São Paulo, UNIFESP, Brasil.
Vínculo institucional
2008 - Atual Vínculo: Pesquisadora Associada, Enquadramento Funcional: Pesquisadora Associada, Carga horária: 20
Outras informações Orientadora Credenciada do Programa de Pós-Graduação em Infectologia
Vínculo institucional
2004 - 2008 Vínculo: Bolsista recém-doutor, Enquadramento Funcional: Pós-doutoranda, Carga horária: 16
Outras informações Pós - doutoranda
Atividades
08/2009 - AtualAtividades de Participação em Projeto, Departamento de Medicina, Disciplina de Doenças Infecciosas e Parasitárias.
Projetos de pesquisa
ANÁLISE DO GENE DA INTEGRASE DO VÍRUS DA IMUNODEFICIENCIA HUMANA TIPO 1 (HIV-1) EM INDIVÍDUOS EM FALHA AO HAART E SEM TRATAMENTO COM RALTEGRAVIR
Avaliação da presença de resistência primária aos antirretrovirais Raltegravir, Darunavir, Beverimat e Etravirina em indivíduos infectados pelo Vírus da Imunodeficiência Humana tipo 1 (HIV-1) e em falha ao HAART
2/2003 - AtualAtividades de Participação em Projeto, Departamento de Medicina, Disciplina de Doenças Infecciosas e Parasitárias.
Projetos de pesquisa
Monitorização da carga proviral do HIV-1 em pacientes recebendo terapia antiretroviral combinada e associação com a progressão da doença.
Análise molecular da gp41 do Virus da Imunodeficiencia Humana tipo 1 (HIV-1) em indivíduos em falha terapêutica aos antiretrovirais
2008 - 2009Atividades de Participação em Projeto, Departamento de Medicina, .
Projetos de pesquisa
Desenvolvimento de quantificação do Vírus da Hepatite B (HBV) por meio da PCR em tempo real
2006 - 2006Atividades de Participação em Projeto, Departamento de Medicina, .
Projetos de pesquisa
Sexagem fetal
Fundação de Hematologia e Hemoterapia do Amazonas, HEMOAM, Brasil.
Vínculo institucional
2004 - Atual Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Pesquisadora Colaboradora
Outras informações Participação como colaboradora no desenvolvimento de projetos de pesquisa da Fundação de Hematologia e Hemoterapia do Amazonas - HEMOAM. O projeto "Características sorológicas e moleculares de vírus da hepatite B em indivíduos com infecção única ou com infecção dupla por vírus da hepatite Delta na Amazônia Ocidental" com suporte FAPESP, foi realizado culminando em título de pós doutorado para a pesquisadora Dagmar Kiesslich. Foi enviado e aceito um manuscrito para a revista Journal Infectious Diseases que será publicado este ano de 2009. Além disso, foi aprovado projeto com suporte CNPq para aplicação da técnica de carga viral do HDV em indivíduos do interior de Manaus. Minha participação está em assessorar o desenvolvimento e aplicação de técnicas de Real Time PCR.
Atividades
06/2004 - AtualAtividades de Participação em Projeto, Fundação de Hematologia e Hemoterapia do Amazonas, .
Projetos de pesquisa
Características sorológicas e moleculares de vírus da hepatite B em indivíduos com infecção única ou com infecção dupla por vírus da hepatite Delta na Amazônia Ocidental
Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da USP, HCFMUSP, Brasil.
Vínculo institucional
1997 - 2003 Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Pós-graduanda, Carga horária: 40
Outras informações Pós-graduanda
Atividades
1/1999 - 12/2003Estágios , Laboratório de Alergia e Imunologia 56, .
Estágio realizado
Pós-graduanda (Mestrado).
1/1999 - 12/2003Atividades de Participação em Projeto, Laboratório de Alergia e Imunologia 56, .
Projetos de pesquisa
Metodos sorologicos e moleculares para identificação de variantes do virus da imunodeficiencia humana do tipo 1 (HIV-1) do subtipo B presente em São Paulo, Brasil.
Fundação Lusíada, UNILUS, Brasil.
Atividades
02/2008 - 12/2010Pesquisa e desenvolvimento , Laboratório de Pesquisa, .
Linhas de pesquisa
Biologia Molecular
Estudo da presença de mutações aos antivirais em indivíduos HBV/HIV-1 positivos
Estudo da presença de mutantes de escape vacinal em indivíduos HBV em tratamento com antivirais
Diversidade Viral
Estudo das mutações de resistência primária e secundária para os antirretrovirais em amostras de São Paulo e Santos
Técnicas avançadas de biologia molecular aplicadas ao monitoramento de doenças infecciosas
02/2008 - 12/2010Ensino, Medicina, Nível: Graduação.
Disciplinas ministradas
Biologia Molecular e Celular
Embriologia Clínica
Parasitologia
02/2008 - 12/2010Ensino, Mestrado em Clínica Médica, Nível: Pós-Graduação.
Disciplinas ministradas
Biologia Molecular
02/2008 - 12/2010Atividades de Participação em Projeto, Laboratório de Pesquisa, .
Projetos de pesquisa
AVALIAÇÃO DA PRESENÇA DE MUTAÇÕES DE RESISTÊNCIA PRIMÁRIA E SECUNDÁRIA PARA OS ANTIVIRAIS LAMIVUDINA, ADEFOVIR E ENTECAVIR EM INDIVÍDUOS CO-INFECTADOS HBV/HIV
02/2008 - 12/2010Atividades de Participação em Projeto, Laboratório de Pesquisa, .
Projetos de pesquisa
Estudo da possível contribuição do resultado do teste de genotipagem dos genes da transcriptase reversa e protease do Vírus da Imunodeficiência Humana tipo 1 (HIV-1) para crianças da cidade de Santos

Linhas de Pesquisa
1. Biologia Molecular
Objetivos: Desenvolvimento e estabelecimento de técnicas de biologia molecular para o treinamento de estudantes de graduação e pós-graduação..
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia / Subárea: Virologia.
Palavras-chave: SEQUENCIAMENTO GÊNICO; PCR qualitativo; PCR quantitativo; Genotipagem do HIV-1; Genotipagem do HBV.
2. Estudo da presença de mutações aos antivirais em indivíduos HBV/HIV-1 positivos
Objetivos: Desenvolvimento e estabelecimento de técnicas de biologia molecular para serem aplicadas no estudo do Vírus da Hepatite B (HBV), tendo como objetivos o estudo da presença de mutações de resistência primária em indivíduos sob diferentes tratamentos antivirais, genotipagem e mutantes vacinais..
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia / Subárea: Virologia.
Palavras-chave: Hepatitis B; mutacoes primarias; genotipagem; Resistência aos antivirais; Escape vacinal.
3. Estudo da presença de mutantes de escape vacinal em indivíduos HBV em tratamento com antivirais
Objetivos: Verificar a influência de mutações de resistência causadas pelo antiviral Lamivudina no HBsAg que poderiam levar ao escape vacinal..
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia / Subárea: Virologia.
Palavras-chave: HBV; HBsAg; genotipagem; Escape vacinal; MUTAÇÕES DE RESISTÊNCIA.
4. Diversidade Viral
Objetivos: O estudo dos subtipos e genótipos circulantes pode trazer importantes informações sobre a diversidade genética viral que circula em nosso meio. No Brasil circulam os subtipos B, C, F e formas recombinantes circulantes B/F e B/C do HIV-1. No Brasil, 50% do subtipo B é representada por uma variante viral distinta da Européia e Norte Americana. Os subtipos do HIV-1 podem apresentar em diferentes respostas aos antirretrovirais, como é o caso do subtipo F. Os genótipos A, D e F do HBV circulam nas diferentes regiões do Brasil e estão implicados na resposta ao tratamento. Os genótipos da Hepatite Delta (HDV) juntamente com os do HBV podem ser determinantes de maior replicação viral e piora da clinica do paciente. A avaliação da presença de mutações e polimorfismos nos genes da genes da transcriptase reversa, protease e integrase do HIV-1 e na transcriptase reversa do HBV, são determinantes de resposta ou falha a terapia. Alem disso, o estudo de mutações no HBsAg do HBV pode nos indicar a eficácia da vacina. Estas abordagens ajudam no entendimento da epidemiologia molecular e no gerenciamento do tratamento. .
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia / Subárea: Virologia.
Palavras-chave: Biologia Molecular; Genotipagem do HBV; HBV; Subtipos; Escape vacinal; HBsAg.
5. Estudo das mutações de resistência primária e secundária para os antirretrovirais em amostras de São Paulo e Santos
Objetivos: O objetivo do projeto é genotipar e subtipar amostras de indivíduos HIV-1 positivos em falha aos antirretrovirais dos serviços de atendimento da Baixada Santista (Serviços de Atendimento Especializado-SAE) e amostras de São Paulo (repositório do Laboratório de Retrovirologia da UNIFESP). O desenvolvimento de projetos nesta área visa o estudo detalhado das mutações de resistência para os antirretrovirais que alvejam os genes da transcriptase reversa, protease e integrase do HIV-1. Estes estudos ajudam no melhor conhecimento da epidemiologia molecular e no gerenciamento do tratamento..
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia / Subárea: Virologia.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.
Palavras-chave: Genotipagem do HIV-1; Resistência secundária; Resposta ao tratamento.
6. Técnicas avançadas de biologia molecular aplicadas ao monitoramento de doenças infecciosas
Objetivos: O desenvolvimento de técnicas moleculares para o monitoramento de infecções virais é de extrema importância para um melhor gerenciamento dos tratamentos atuais. A industria farmacêutica tem produzido vários medicamentos que atuam em diferentes passos dos ciclos virais. No Brasil temos, para os indivíduos HIV-1 positivos cerca de 16 antirretrovirais aprovados e em uso e, para o HBV, associado ao interferon, dois antivirais. Ao longo da terapia, ocorre a emergência de variantes virais de resistência, como também, indivíduos infectados podem transmitir estes vírus e impedir a resposta inicial ao tratamento. Desta forma, os projetos visam desenvolver técnicas, tais como, a Reação em Cadeia da Polimerase (PCR), Sequenciamento gênico e Real Time PCR com o objetivo de monitorar resposta a terapia, emergência de variantes virais de resistência, estudo de genótipos e subtipos e resistência viral a novos medicamentos..
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.
Palavras-chave: HIV-1; Hepatitis B; Hepatite D; HGV/GBV-C; MUTAÇÕES DE RESISTÊNCIA; novos tratamentos.

Projetos de Pesquisa
2010 - AtualAvaliação da presença de resistência primária aos antirretrovirais Raltegravir, Darunavir, Beverimat e Etravirina em indivíduos infectados pelo Vírus da Imunodeficiência Humana tipo 1 (HIV-1) e em falha ao HAART
Descrição: Desde 1996, a Terapia Antirretroviral Altamente Ativa (HAART) reduziu a mortalidade e morbidade do HIV-1. Por outro lado, tivemos a emergência de populações virais resistentes, como consequência da pressão seletiva dos medicamentos causada pela falta de adesão ao tratamento, da farmocinética dependente da genética do hospedeiro, tecidos santuários, entre outros. A pesquisa de novas drogas direcionadas a diferentes alvos do ciclo viral é essencial, por serem utilizadas em terapia de resgate para indivíduos em falha ao HAART. Juntamente a isso, temos a presença de mutações primárias a determinados antirretrovirais (ARVs) mesmo sem o indivíduo tê-los recebido, como conseqüência de sua transmissão. O Brasil possui um programa de distribuição gratuita de antivirais e a cidade de São Paulo foi à precursora. Apesar do monitoramento das mutações de resistência a diferentes ARVs não temos dados suficientes com relação a transmissão de resistência primária e polimorfismos das drogas usadas no tratamento de resgate. Este fato, pode interferir na resposta ao tratamento. Atualmente, temos classes de drogas que estão sendo largamente utilizadas para o resgate de indivíduos em falha ao HAART, entre elas o inibidor de integrase Raltegravir e o inibidor de protease Darunavir. Alem desses, temos o inibidor de maturação Beverimat e o ITRNN de segunda geração Etravirina, que ainda não foram aprovados para o uso em nosso meio, mas que serão cruciais no tratamento de resgate por possuírem uma ação eficaz contra todas as variantes virais resistentes aos outros ARV utilizados atualmente. Logo, o principal objetivo deste estudo é avaliar a ocorrência de resistência primária e/ou polimorfismos que poderiam impedir ou diminuir a susceptibilidade aos ARVs Raltegravir, Darunavir, Beverimat e Etravirina no resgate de pacientes multifalidos das cidades de São Paulo e Santos..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico ( 1) .
Integrantes: Ricardo Sobhie Diaz - Integrante / Marcos Montani Caseiro - Integrante / Nathalia Mantovani Pena - Integrante / Shirley Vasconcelos Komninakis - Coordenador.
Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Fundação Lusíada - Cooperação / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa..
2009 - 2011ANÁLISE DO GENE DA INTEGRASE DO VÍRUS DA IMUNODEFICIENCIA HUMANA TIPO 1 (HIV-1) EM INDIVÍDUOS EM FALHA AO HAART E SEM TRATAMENTO COM RALTEGRAVIR
Descrição: o objetivo principal deste estudo é padronizar um teste para avaliação da presença de resistência ao anti-retroviral Raltegravir e avaliar a presença de mutações de resistência primária em indivíduos em falha ao HAART que são elegíveis para receberem o Raltegravir.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico ( 1) .
Integrantes: Ricardo Sobhie Diaz - Integrante / Dercy Jose de Sa-Filho - Integrante / Marcos Montani Caseiro - Integrante / Nathalia Mantovani Pena - Integrante / Shirley Vasconcelos Komninakis - Coordenador.
Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / Fundação Lusíada - Cooperação..
2008 - 2010AVALIAÇÃO DA PRESENÇA DE MUTAÇÕES DE RESISTÊNCIA PRIMÁRIA E SECUNDÁRIA PARA OS ANTIVIRAIS LAMIVUDINA, ADEFOVIR E ENTECAVIR EM INDIVÍDUOS CO-INFECTADOS HBV/HIV
Descrição: O projeto tem por objetivo estudar os diferentes perfis de mutação primária para os antivirais mais utilizados no tratamento de indivíduos co-infectados pelo HIV e HBV em amostras das cidades de Santos e São Paulo. Outro aspecto a ser abordado é o conhecimento dos genótipos circulantes e a influência das mutações sobre a região do envelope do vírus causando resistência a vacina utilizada para o HBV. O maior objetivo deste trabalho é iniciar na pesquisa científica alunos da Graduação do Curso de Biomedicina na UNILUS..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação ( 5) .
Integrantes: Ricardo Sobhie Diaz - Integrante / Dercy Jose de Sa-Filho - Integrante / Marcos Montani Caseiro - Integrante / Paulo Roberto Abrão Ferreira - Integrante / Janayna Thayna Rabelato - Integrante / Maíra Cícero - Integrante / Carla Silveira Pires de Almeida - Integrante / Luiz Claudio Santana - Integrante / Henrique dos Reis Barbosa da Silva - Integrante / Nathalia Mantovani Pena - Integrante / Shirley Vasconcelos Komninakis - Coordenador.
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2008 - 2009Desenvolvimento de quantificação do Vírus da Hepatite B (HBV) por meio da PCR em tempo real
Descrição: Este projeto visa o desenvolvimento de teste de quantificação do HBV utilizando a PCR em tempo real que possui alta eficiência, reprodutibilidade, sensibilidade e especificidade. Este teste é atualmente o mais importante para o monitoramento da resposta ao tratamento com antivirais..
Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento.
Alunos envolvidos: Graduação ( 0) / Especialização ( 0) / Mestrado acadêmico ( 2) / Mestrado profissionalizante ( 0) / Doutorado ( 0) .
Integrantes: Ricardo Sobhie Diaz - Integrante / Paulo Roberto Abrão Ferreira - Integrante / Rafael Gonçalves Azevedo - Integrante / Eliane Pereira do Carmo - Integrante / Shirley Vasconcelos Komninakis - Coordenador.
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2008 - 2009Estudo da possível contribuição do resultado do teste de genotipagem dos genes da transcriptase reversa e protease do Vírus da Imunodeficiência Humana tipo 1 (HIV-1) para crianças da cidade de Santos
Descrição: Este projeto é um levantamento de dados para tentar correlacionar mutações de resistência, teste de genotipagem, mudança de conduta de tratamento e benefício alcançado e visulaizado pelos dados de carga viral do HIV-1, contagem de linfócitos T CD4+. O projeto tem por objetivo trazer informações importantes para melhorar o gerenciamento do tratamento de crianças com idade inferior a 14 anos..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação ( 0) / Especialização ( 0) / Mestrado acadêmico ( 1) / Mestrado profissionalizante ( 0) / Doutorado ( 0) .
Integrantes: Dercy Jose de Sa-Filho - Integrante / Marcos Montani Caseiro - Integrante / MARIA LUZINETE SABINO DA SILVA - Integrante / Shirley Vasconcelos Komninakis - Coordenador.
Número de orientações: 1.
2006 - 2006Sexagem fetal
Descrição: Desenvolvimento de um teste de quantificação do cromossomo Y no plasma materno, por meioda PCR em tempo real. Este teste tem por objetivo a determinação do sexo fetal..
Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento.
Integrantes: Ricardo Sobhie Diaz - Integrante / Shirley Vasconcelos Komninakis - Coordenador.
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2004 - 2008Monitorização da carga proviral do HIV-1 em pacientes recebendo terapia antiretroviral combinada e associação com a progressão da doença.
Descrição: Desenvolvimento de método de quantificação do DNA proviral do HIV-1 por meio do Real Time PCR. A quantificação do DNA proviral do HIV-1 é importante para o estudo da dinâmica da semeadura do reservatório viral, enquanto a carga viral plasmática representa o vírus produzido naquele momento..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação ( 0) / Especialização ( 0) / Mestrado acadêmico ( 0) / Mestrado profissionalizante ( 0) / Doutorado ( 0) .
Integrantes: Jorge Simão do Rosario Casseb - Integrante / Ricardo Sobhie Diaz - Integrante / Alberto Jose da Silva Duarte - Integrante / Maria Cecilia Araripe Sucupira - Integrante / Luiz Mario Ramos Janini - Integrante / Shirley Vasconcelos Komninakis - Coordenador.
Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Número de produções C, T & A: 3.
2004 - 2007Análise molecular da gp41 do Virus da Imunodeficiencia Humana tipo 1 (HIV-1) em indivíduos em falha terapêutica aos antiretrovirais
Descrição: A gp41 é uma glicoproteína transmembrana do HIV-1 que, juntamente com a gp120, é responsável pelo evento de aproximação e fusão das membranas viral e da célula hospedeira. O sequenciamento das duas regiões da gp41 responsáveis pelo evento de fusão, a HR1 e HR2, mostrou a ocorrência de mutações que conferem resistência primária a uma nova classe de drogas em pacientes não tratados. Essas drogas consistem em peptídeos sintéticos derivados da região carboxiterminal da gp41 (peptídeos C) e podem ser potentes inibidores de entrada do HIV-1 na célula hospedeira. O T20, o primeiro dessa classe de drogas a ser aprovado, demostrou atividade antiretroviral, de acordo com 24 semanas de dois estudos multinacionais (TORO 1 e TORO2) realizados na Europa, Austrália e América no tratamento experimental de pacientes adultos. Esse estudo pretende analisar mudanças nos códons das regiões HR1 e HR2 da gp41 que poderiam determinar uma possível resistência primária em pacientes que estejam em falha no tratamento com os antiretrovirais atuais e que seriam possíveis candidatos ao uso do T20. .
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação ( 1) / Especialização ( 0) / Mestrado acadêmico ( 0) / Mestrado profissionalizante ( 0) / Doutorado ( 0) .
Integrantes: Jorge Simão do Rosario Casseb - Integrante / Ricardo Sobhie Diaz - Integrante / Carla Cristina Teixeira - Integrante / Maria Cecilia Araripe Sucupira - Integrante / Luiz Mario Ramos Janini - Integrante / Shirley Vasconcelos Komninakis - Coordenador.
Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.
Número de produções C, T & A: 5 / Número de orientações: 1.
2003 - 2008Características sorológicas e moleculares de vírus da hepatite B em indivíduos com infecção única ou com infecção dupla por vírus da hepatite Delta na Amazônia Ocidental
Descrição: Valor: R$ 58.560,00 Numero do Projeto: 03/13770 - 7 A Amazônia Ocidental caracteriza-se por uma elevada prevalência de infecção por vírus das hepatites B e Delta (HBV e HDV), estando a infecção dupla associada a uma maior morbi-mortalidade. De modo a contribuir para a história natural destas infecções, estabeleceu-se um protocolo de estudo com o objetivo de comparar as características sorológicas e moleculares de indivíduos com infecção única por HBV com indivíduos com infecção adicional por HDV. O estudo terá um delineamento do tipo caso-controle, e os grupos para estudo serão selecionados entre portadores crônicos de HBV no Hemocentro do Amazonas e Ambulatório da Universidade do Amazonas. Amostras de soro dos participantes serão submetidas à identificação dos marcadores sorológicos HBeAg/Anti-HBe e anti-Delta, detecção e quantificação de HBV DNA e HDV RNA, genotipagem de ambos os vírus, frequência de mutações na região pre-core e promotora do core do HBV, análise bioquímica e contagem de plaquetas. Casos e controles serão comparados quanto a estas características..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Integrantes: Ricardo Sobhie Diaz - Coordenador / Dagmar Kiesslich - Integrante / Myuki Alfaia Esashika Crispim - Integrante / Carlos Santos - Integrante / Shirley Vasconcelos Komninakis - Integrante.
Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado do Amazonas - Auxílio financeiro..
1999 - 2003Metodos sorologicos e moleculares para identificação de variantes do virus da imunodeficiencia humana do tipo 1 (HIV-1) do subtipo B presente em São Paulo, Brasil.
Descrição: Comparar métodos sorológicos e moleculares para ajudar em estudos epidemiológicos do HIV-1..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação ( 0) / Especialização ( 0) / Mestrado acadêmico ( 0) / Mestrado profissionalizante ( 0) / Doutorado ( 1) .
Integrantes: Jorge Simão do Rosario Casseb - Integrante / Alberto Jose da Silva Duarte - Integrante / Shirley Vasconcelos Komninakis - Coordenador.
Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Número de produções C, T & A: 15.

Áreas de atuação
1. Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.
2. Grande área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia / Subárea: Virologia.
3. Grande área: Ciências Biológicas / Área: Farmacologia / Subárea: Farmacologia Bioquímica e Molecular.
4. Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.
5. Grande área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia / Subárea: Biologia e Fisiologia dos Microorganismos.
6. Grande área: Ciências Biológicas / Área: Imunologia / Subárea: Imunologia Aplicada.

Idiomas
Inglês Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.
Espanhol Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.


Produção em C,T & A
Produção bibliográfica
Citações
Web of Science
  
null
Artigos completos publicados em periódicos
1. TEIXEIRA, D. ; MUNERATO, P. ; KOMNINAKIS, S. V. ; FUSUMA, E. E. ; JANINI, L. M. R. ; Sucupira, M. C. A. ; DIAZ, R. S. . The Detection of in Vivo and in Vitro HIV Type 1 B/F Profiles in Brazil Using a Real-Time PCR Assay for Five HIV Type 1 Genomic Regions. AIDS Research and Human Retroviruses, v. 26, p. 981-990, 2010.
2. TEIXEIRA, C. C. ; SA-FILHO, D. J. ; Maia, W. T. A. ; JANINI, L. M. R. ; DIAZ, R. S. ; KOMNINAKIS, S. V. . High Polymorphism Rates in the HR1 and HR2 gp41 and Presence of Primary Resistance-Related Mutations in HIV Type 1 Circulating in Brazil: Possible Impact on Enfuvirtide Efficacy. AIDS Research and Human Retroviruses, v. 26, p. 307-311, 2010.
3.   KIESSLICH, D. ; CRISPIM, M. A. E. ; SANTOS, C. ; FERREIRA, F. L. ; FRAIJI, N. A. ; KOMNINAKIS, S. V. ; DIAZ, R. S. . Influence of hepatitis B virus (HBV) genotype on the clinical course of disease in patients coinfected with HBV and hepatitis delta virus.. The Journal of Infectious Diseases, v. 199, p. 1608-1611, 2009.
4.   SALOMAO, R. ; BRUNIALTI, M. K. C. ; GOMES, N. E. ; MENDES, M. E. ; DIAZ, R. S. ; KOMNINAKIS, S. V. ; MACHADO, F. R. ; Silva, I. D. C. G. ; RIGATO JUNIOR, O. . Toll-like receptor pathway signaling is differently regulated in neutrophils and peripheral mononuclear cells of patients with sepsis, severe sepsis, and septic shock. Critical Care Medicine, v. 37, p. 132-139, 2009.
5. SA-FILHO, D. J. ; SOUZA, T. A. ; GOLEGA, A. A. C. ; DIAZ, R. S. ; Caseiro, M. M. ; ZETEHAKU, A. C. ; LINS-FILHO, A. ; Tobara, J. ; NAHON, N. C. ; SANTOS, N. ; Komninakis, Shirley . Long-Term HIV-1 Suppression in the Brazilian Public Health System. AIDS patient care and STDs, v. 23, p. 313-314, 2009.
6. SA-FILHO, D. J. ; AMBAR, R. F. ; DUARTE, N. B. ; MATIAS, R. B. R. ; CANDIDO, V. S. ; THOME, M. S. ; KOMNINAKIS, S. V. ; GAGLIANI, L. H. ; Caseiro, M. M. . HIV Type 1 Diversity from Newly Diagnosed Patients in Santos Metropolitan Area/Brazil. AIDS Research and Human Retroviruses, v. 25, p. 925-929, 2009.
7.   KOMNINAKIS, S. V. ; FUKUMORI, L. M. I. ; Alcalde R. ; Santos, M. A. C. G. ; Diniz, L. A. ; Brito, A. ; SANABANI, S. S. ; Duarte, A. J. S. ; Casseb, J. S. R. . Techniques to identify the Brazilian HIV-1 variant of subtype B. Brazilian Journal of Medical and Biological Research (Impresso), v. 40, p. 301-304, 2007.
8. Brito, A. ; KOMNINAKIS, S. V. ; Novoa, P. C. R. ; OLIVEIRA, R. M. ; FONSECA, L. A. M. ; Duarte, A. J. S. ; Casseb, J. S. R. . Women infected with Human Immunodeficiency Virus type 1 Brazilian variant, subtype B (B-GWGR motif) show a slower progression to AIDS as compared with patients infected with subtype B (B-GPGR motif).. Clinical Infectious Diseases, v. 11, p. 1476-1481, 2006.
9. Casseb, J. S. R. ; Montanheiro, P. A. ; KOMNINAKIS, S. V. ; Brito, A. ; Duarte, A. J. S. . Human immunodeficiency virus type 1 Brazilian subtype B variant showed an increasing avidity of the anti-V3 antibodies over time compared to the subtype B US/European strain in São Paulo, Brazil. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz (Impresso), Rio de Janeiro, v. 99, n. 1, p. 69-71, 2004.
10. Casseb, J. S. R. ; KOMNINAKIS, S. V. ; Diniz, L. A. ; Brigido L. F. M. ; Rodrigues, R. ; ARAUJO, F. ; Veiga, A. P. R. ; Almeida, A. ; FLANNERY, B. ; HENDRY, R. M. ; Duarte, A. J. S. . HIV disease progression: is the Brazilian variant subtype B' (GWGR motif) less pathogenic than US/European subtype B (GPGR)?. International Journal of Infectious Diseases, v. 6, p. 164-169, 2002.
Capítulos de livros publicados
1.   KOMNINAKIS, S. V. . Noções básicas de biologia molecular. In: Anete Sevciovic Grumach. (Org.). Alergia e imunologia na infância e na adolescência. 2 ed. São Paulo: Atheneu, 2009, v. 01, p. 21-36.
Textos em jornais de notícias/revistas
1. KOMNINAKIS, S. V. ; AZEVEDO, R. G. . Tratamento anti-HIV: Novas estratégias. Tendências em HIV-AIDS, São Paulo, p. 20 - 23, 07 jul. 2008.
2. KOMNINAKIS, S. V. ; Maia, W. T. A. ; TEIXEIRA, C. C. . DNA proviral em indivíduos infectados pelo HIV-1. Tendências em HIV. AIDS/Disciplina de Infectologia-UNIFESP, Tendências em HIV. AIDS, p. 11 - 14, 30 ago. 2006.
3. KOMNINAKIS, S. V. . Reação em Cadeia pela Polimerase em Tempo Real. Tendências em HIV-AIDS, São Paulo, p. 5 - 10.
Trabalhos completos publicados em anais de congressos
1. SOARES, C. M. P. M. ; VERGARA, T. R. C. ; Sucupira, M. C. A. ; ALVES, C. R. B. ; URBAEZ-BRITO, J. D. ; Caseiro, M. M. ; Correa, C. M. ; SUFFERT, T. A. ; PEREIRA, F. R. ; KOMNINAKIS, S. V. ; DIAZ, R. S. . Prevalence of Transmitted HIV-1 Antiretroviral Resistance among Patients Initiating ART in Brazil: A Surveillance Using Dried Blood Spots. In: 18th Conference on Retroviruses and Opportunistic Infections (CROI 2011), 2011, Boston, M, 27/02-02/03. Abstracts of 18th Conference on Retroviruses and Opportunistic Infections (CROI 2011), 2011. v. 18. p. 624-624.
2. Pena, N. M. ; AZEVEDO, R. G. ; CASTRO, D. F. ; DIAZ, R. S. ; KOMNINAKIS, S. V. . High levels of polymorphisms related to raltegravir resistance among raltegravir-naïve individuals in Brazil. In: Tenth International Congress on Drug Therapy in HIV Infection, 2010, 7-11 November 2010 Glasgow, UK. Journal of the International AIDS Society. London - UK : International AIDS Society, 2010. v. 13. p. 135-135.
3. SILVA, M. L. S. ; Carmo E. P. ; CASTRO, D. F. ; BARBOSA, F. K. ; DIAZ, R. S. ; KOMNINAKIS, S. V. . Benefit of genotyping after virologic failure among HIV-1 infected children. In: VIII Simpósio Brasileiro de Pesquisa em HIV/AIDS - SIMPAIDS, 2009, Rio de Janeiro - RJ - 28/06-01. Livro de Resumos do VIII Simpósio Brasileiro de Pesquisa em HIV/AIDS - SIMPAIDS, 2009. v. 8. p. 7-7.
4. SOARES, C. M. P. M. ; VERGARA, T. R. C. ; Caseiro, M. M. ; PEREIRA, F. R. ; ALVES, C. R. B. ; KOMNINAKIS, S. V. ; DIAZ, R. S. . Dried blood spots (DBS): A powerfull toll for HIV-1 genomic sequencing. In: VIII Simpósio Brasileiro de Pesquisa em HIV/AIDS - SIMPAIDS, 2009, Rio de Janeiro - RJ - 28/06-01. Livro de Resumos do VIII Simpósio Brasileiro de Pesquisa em HIV/AIDS - SIMPAIDS, 2009. v. 8. p. 63-63.
5. TEIXEIRA, D. ; MUNERATO, P. ; KOMNINAKIS, S. V. ; FUSUMA, E. E. ; Sucupira, M. C. A. ; DIAZ, R. S. . Development of real time PCR to detect POL and ENV regions from HIV-1 subtypes B and F and screening of B/F recombinant strains. In: VIII Simpósio Brasileiro de Pesquisa em HIV/AIDS - SIMPAIDS, 2009, Rio de Janeiro - RJ - 28/06-01. Livro de Resumos do VIII Simpósio Brasileiro de Pesquisa em HIV/AIDS - SIMPAIDS, 2009. v. 8. p. 117-117.
6. AZEVEDO, R. G. ; TENORE, S. B. ; Carmo E. P. ; OLIVEROS, M. P. R. ; PACHI, C. G. F. ; SOARES, C. M. P. M. ; DIAZ, R. S. ; KOMNINAKIS, S. V. . gp41 HR1 and HR2 evolution among individuals receiving enfuvirtide containing regimens and virologic success in Brazil. In: 5th IAS Conference on HIV Pathogenesis, Treatment and Prevention, 2009, Cape Town - 19-22/07. Abstracts of 5th IAS Conference on HIV Pathogenesis, Treatment and Prevention, 2009. v. 5. p. CDA069-CDA069.
7. TEIXEIRA, D. ; MUNERATO, P. ; KOMNINAKIS, S. V. ; FUSUMA, E. E. ; Sucupira, M. C. A. ; DIAZ, R. S. . Development of real time PCR targeting protease to discriminate HIV-1 from subtypes B and F. In: 5th IAS Conference on HIV Pathogenesis, Treatment and Prevention, 2009, Cape Town - 19-22/07. Abstracts of 5th IAS Conference on HIV Pathogenesis, Treatment and Prevention, 2009. v. 5. p. CDA058-CDA058.
8. MATIAS, R. B. R. ; AMBAR, R. F. ; DUARTE, N. B. ; CANDIDO, V. S. ; GAGLIANI, L. H. ; Komninakis, Shirley ; Caseiro, M. M. ; SA-FILHO, D. J. . K103N mutation in HIV-1RT gene is emerging in Santos/Brazil epidemic. In: 5th IAS Conference on HIV Pathogenesis, Treatment and Prevention, 2009, Cape Town - 19-22/07. Abstracts of 5th IAS Conference on HIV Pathogenesis, Treatment and Prevention, 2009. v. 5. p. CDA070-CDA070.
9. CORREIA, A. P. ; COSTA, E. P. ; RANGEL-SANTOS, A. C. ; KOMNINAKIS, S. V. ; CONSTANTINO-SILVA, R. N. ; Duarte, A. J. S. ; GRUMACH, A. S. . Mutations in the C1 esterase inihibitor gene in a brazilian family leading to type I and II of hereditary angioedema. In: II Simpósio Internacional de Imunodeficiências Primárias - II SIDEP, 2009, São Paulo - SP. Revista do Instituto de Medicina Tropical de São Paulo. São Paulo : Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, 2009. v. 51. p. 55-55.
10. BRUNIALTI, M. K. C. ; GOMES, N. E. ; MENDES, M. E. ; FERNANDES, M. L. ; DIAZ, R. S. ; KOMNINAKIS, S. V. ; MACHADO, F. R. ; Silva, I. D. C. G. ; SALOMAO, R. . Toll-like receptor pathway signaling is differently regulated in neutrophils and peripheral mononuclear cells of patients with sepsis, severe sepsis and septic shock. In: XXIII Reunião Anual da FeSBE - Federação de Sociedades de Biologia Experimental, 2008, 20-23/08 - Águas de Lindóia. Abstracts da XXIII Reunião Anual da FeSBE - Federação de Sociedades de Biologia Experimental, 2008. v. 23. p. 23022-23022.
11. TEIXEIRA, C. C. ; SA-FILHO, D. J. ; Maia, W. T. A. ; KOMNINAKIS, S. V. ; DIAZ, R. S. . High rates of natural polymorphisms in the gp41 HR1 and HR2 of T20 naïve Brazilian patients and possible repercussion for the use of this drug. In: AIDS 2008 - XVII International AIDS Conference, 2008, 3-8/08 - Mexico City. Abstracts of AIDS 2008 - XVII International AIDS Conference, 2008. v. 17. p. 35-35.
12. MATIAS, R. B. R. ; GUATELLI, K. C. P. ; AMBAR, R. F. ; DUARTE, N. B. ; GAGLIANI, L. H. ; KOMNINAKIS, S. V. ; CANDIDO, V. S. ; Caseiro, M. M. ; SA-FILHO, D. J. . HIV-1 pol gene diversity and antiretroviral drug resistance mutations in Itanhaém city, Brazil. In: 9th International Congress on Drug Therapy in HIV Infection, 2008, Glasgow - UK - 9-13/11. 9th International Congress on Drug Therapy in HIV Infection, 2008. v. 11. p. P196-P196.
13. ZETEHAKU, A. C. ; LINS-FILHO, A. ; RABELATO, J. T. ; Tobara, J. ; NAHON, N. C. ; SANTOS, N. ; MATIAS, R. B. R. ; COMPARINI, R. G. ; AMBAR, R. F. ; GAGLIANI, L. H. ; KOMNINAKIS, S. V. ; DIAZ, R. S. ; GOLEGA, A. A. C. ; Caseiro, M. M. ; SA-FILHO, D. J. . Analysis of viral load, CD4+ and CD8+ T-cell from HIV-1 infected patients enrolled in the AIDS programs from the city of Santos, Brazil. In: 9th International Congress on Drug Therapy in HIV Infection, 2008, Glasgow - UK. 9 - 13/11. Journal of the International AIDS Societ, 2008. v. 11. p. P209-P209.
14. KOMNINAKIS, S. V. ; SANTOS, C. ; SA-FILHO, D. J. ; TEIXEIRA, C. C. ; Maia, W. T. A. ; DIAZ, R. S. . Human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) proviral load in patients in Structured Treatment Interruption. In: 14th International Symposium on HIV-1 & Emerging Infectious Diseases, 2006, Toulon. 14th International Symposium on HIV-1 & Emerging Infectious Diseases, 2006.
15. TEIXEIRA, C. C. ; Maia, W. T. A. ; SA-FILHO, D. J. ; Zanoni M ; DIAZ, R. S. ; KOMNINAKIS, S. V. . Mutações e polimorfismos na gp41 do HIV-1 de pacientes recebendo HAART não submetidos previamente ao T20.. In: VI Congresso Brasileiro de Prevenção das DST e Aids, 2006, Belo Horizonte - MG-04-07/11. Livro de Resumos do Congresso, 2006. v. 6. p. 5-5.
16. TEIXEIRA, C. C. ; Maia, W. T. A. ; SA-FILHO, D. J. ; Zanoni M ; DIAZ, R. S. ; KOMNINAKIS, S. V. . Mutations and polymorphisms in the GP41 of the HIV-1 from T20 naïve patients receiving HAART.. In: 7th Annual Symposium on Antiviral Drug Resistance: Targets and Mechanisms, 2006, Chantilly -Virginia - 12-15/11. Book and Abstract of 7th Annual Symposium on Antiviral Drug Resistance: Targets and Mechanisms, 2006. v. 7. p. 80-80.
17. KOMNINAKIS, S. V. ; FUKUMORI, L. M. I. ; Alcalde R. ; Santos, M. A. C. G. ; Brito, A. ; Duarte, A. J. S. ; Casseb, J. S. R. . Serological and Molecular Techniques for Identification of the HIV-1 subtype B, B"-GWGR variant. In: AIDS 2004 - The XV International AIDS Conference, 2004, 11-16/07 - Bagkok. Abstracts da AIDS 2004 - The XV International AIDS Conference, 2004. v. 15. p. 10500-10500.
18. Brito, A. ; KOMNINAKIS, S. V. ; Novoa, P. C. R. ; Duarte, A. J. S. ; Casseb, J. S. R. . HIV-1 subtypes B serotypes may have different clinical outcome in Brazil.. In: XV National Meeting of Virology, 2004, Florianópolis, SC. Virus Reviews and Research, 2004. v. 09. p. S159-S159.
19. Brito, A. ; KOMNINAKIS, S. V. ; Novoa, P. C. R. ; Duarte, A. J. S. ; Casseb, J. S. R. . HIV-1 subtype B serotypes may have may have different clinical outcome in Brazil.. In: XXIX Meeting of the Brazilian Society of Immunology, 2004, Ouro Preto - MG. Abstracts of XXIX Meeting of the Brazilian Society of Immunology, 2004. v. 29. p. 113-113.
20. KOMNINAKIS, S. V. ; FUKUMORI, L. M. I. ; Alcalde R. ; Santos, M. A. C. G. ; Brito, A. ; Duarte, A. J. S. ; Casseb, J. S. R. . Serological and molecular techniques for identification of the HIV-1 subtype b brazilian variant, B-GWGR, in São Paulo City, Brazil. In: V Simpósio Brasileiro de Pesquisa em HIV/AIDS, 2003, Rio de Janeiro - RJ. Abstracts do V Simpósio Brasileiro de Pesquisa em HIV/AIDS, 2003. v. 5. p. 10-10.
21. Casseb, J. S. R. ; KOMNINAKIS, S. V. ; Diniz, L. A. ; Brigido L. F. M. ; Rodrigues, R. ; ARAUJO, F. ; Veiga, A. P. R. ; Almeida, A. ; HENDRY, R. M. ; Duarte, A. J. S. . HIV disease Progression: Is the Brazilian variant subtype B'(GWGR motif) less pathogenic than US/European subtype B (GPGR) in São Paulo, Brazil?.. In: 8th Annual HIV Dynamics and Evolution Meeting, 2001, Paris, França. The International Journal of Infectious Diseases, 2001. v. 5. p. S5-S5.
22. Casseb, J. S. R. ; KOMNINAKIS, S. V. ; Diniz, L. A. ; Brigido L. F. M. ; Rodrigues, R. ; ARAUJO, F. ; Veiga, A. P. R. ; Almeida, A. ; HENDRY, R. M. ; Duarte, A. J. S. . HIV disease progression: Is the Brazilian variant subtype B '(GWGR motif) less pathogenic than US/European subtype B (GPGR)?.. In: IV Simpósio de Pesquisa Básica em AIDS, 2001, Costa do Sauípe - Bahia. The Brazilian journal of infectious diseases. Salvador : Contexto, 2001. v. 5. p. S3-S3.
23. Veiga, A. P. R. ; KOMNINAKIS, S. V. ; ORII, N. M. ; Stellin, R. ; Casseb, J. S. R. ; Duarte, A. J. S. . Avaliação da subpopulação de células T CD4 virgem e de memória e da resposta anticórpica específica após vacinação contra hepatite B em pacientes infectados pelo HIV.. In: XII Congresso Brasileiro de Infectologia, 2001, Rio de Janeiro - RJ. The Brazilian Journal of Infectious Diseases. Salvador : Contexto, 2001. v. 5. p. S129-S129.
Resumos publicados em anais de congressos
1. RABELATO, J. T. ; CICERO, M. ; SILVEIRA, C. S. P. ; SANTANA, L. C. ; SILVA, H. R. B. ; Pena, N. M. ; Carmo E. P. ; AZEVEDO, R. G. ; SA-FILHO, D. J. ; DIAZ, R. S. ; Caseiro, M. M. ; KOMNINAKIS, S. V. . Profile of the functionals integrase domains in patients receiving Raltegravir in Itanhaém City, São Paulo - Brazil.. In: XIV Congresso Panamericano de Infectologia - II Congresso da Sociedade Ibero-Americana de Infectologia - SIAI, 2009, Campos do Jordão. XIV Congresso Panamericano de Infectologia, 2009.
2. AMBAR, R. F. ; DUARTE, N. B. ; THOME, M. ; MATIAS, R. B. R. ; KOMNINAKIS, S. V. ; GAGLIANI, L. H. ; Caseiro, M. M. ; SA-FILHO, D. J. . HIV-1 pol gene diversity drug resistance mutations in drug naïve patientes from Santos metropolitan area, Brazil. In: XVII International AIDS Conference, 2008, Mexico. XVII International AIDS Conference, 2008.
3. KOMNINAKIS, S. V. ; SANTOS, C. ; TEIXEIRA, C. C. ; Maia, W. T. A. ; Zanoni M ; SA-FILHO, D. J. ; DIAZ, R. S. . Human Immunodeficiency Virus Type 1 proviral load in Structured Treatment Interruption. In: XIX National Meeting og Virology, 2008, Caxambu - MInas Gerais. Virus - Reviewa and Research - Journal of the Brazilian Society for Virology, 2008. v. 13. p. 219-219.
4.   KOMNINAKIS, S. V. ; SANTOS, C. ; TEIXEIRA, C. C. ; Maia, W. T. A. ; Zanoni M ; SA-FILHO, D. J. ; DIAZ, R. S. . Real Time PCR: a Powerful Tool to Quantify HIV-1 Proviral Load. In: VII Simposio de Pesquisa em AIDS - SIMPAIDS 2007, 2007, Itapema. VII Simposio de Pesquisa em AIDS - SIMPAIDS 2007, 2007.
5. TEIXEIRA, C. C. ; SA-FILHO, D. J. ; Maia, W. T. A. ; DIAZ, R. S. ; KOMNINAKIS, S. V. . High Rates of Natural Polymorphisms in the gp41 HR1 and HR2 of T20 Naïve Brazilian Patients and Possible Repercussion for the Use of this Drug. In: VII Simpósio de Pesquisa em AIDS - SIMPAIDS 2007, 2007, Itapema. VII Simpósio de Pesquisa em AIDS - SIMPAIDS, 2007.
6. KOMNINAKIS, S. V. ; TEIXEIRA, C. C. ; Maia, W. T. A. ; Zanoni M ; SA-FILHO, D. J. ; DIAZ, R. S. . Human Immunodeficiency Virus type 1 (HIV-1) Proviral Load in Structured Treatment Interruption (STI). In: VII Simpósio de Pesquisa em AIDS - SIMPAIDS 2007, 2007, Itapema. VII Simpósio de Pesquisa em AIDS - SIMPAIDS, 2007.
7. TEIXEIRA, D. ; JANINI, L. M. R. ; MUNERATO, P. ; Sucupira, M. C. A. ; KOMNINAKIS, S. V. ; DIAZ, R. S. . Development of Real Time PCR to Detect and Quantify HIV-1 B/F Recombinant Strains. In: VII Simpósio de Pesquisa em AIDS - SIMPAIDS 2007, 2007, Itapema. VII Simpósio de Pesquisa em AIDS - SIMPAIDS, 2007.
8. KIESSLICH, D. ; FERREIRA, F. L. ; FELGA, G. E. G. ; CRISPIM, M. A. E. ; KOMNINAKIS, S. V. ; SANTOS, C. ; DIAZ, R. S. . COMPARAÇÃO CLÍNICA SOROLÓGICA E MOLECULAR ENTRE PACIENTES COM INFECÇÃO ÚNICA PELO VÍRUS HEPATITE B E COM INFECÇAO DUPLA PELO VÍRUS HEPATITE DELTA (VHD). In: XIX CONGRESSO BRASILEIRO DE HEPATOLOGIA, 2007, OURO PRETO. . GASTRENTEROLOGIA ENDOSCOPIA DIGESTIVA, 2007. v. 26. p. 97-97.
9. TEIXEIRA, C. C. ; Maia, W. T. A. ; SA-FILHO, D. J. ; Zanoni M ; DIAZ, R. S. ; KOMNINAKIS, S. V. . Mutations and polymorphisms in the gp41 of the HIV-1 from T20 naïve patients receiving HAART.. In: XVI International AIDS Conference, 2006, Toronto. XVI International AIDS Conference, 2006.
10. TEIXEIRA, C. C. ; Maia, W. T. A. ; SA-FILHO, D. J. ; Zanoni M ; DIAZ, R. S. ; KOMNINAKIS, S. V. . Mutations and polymorphisms in the gp41 of the HIV-1 from T20 naïve patients receiving HAART.. In: 14th International Symposium on HIV & Emerging Infectious Disesases, 2006, Toulon. 14th International Symposium on HIV & Emerging Infectious Disesases.
11. KIESSLICH, D. ; CRISPIM, M. A. E. ; CAMPELLO, S. ; CAVALCANTE, F. O. ; KOMNINAKIS, S. V. ; SANTOS, C. ; DIAZ, R. S. . Correlação entre níveis séricos de DNA do vírus da hepatite B (VHB) e antigenemina entre doadores de sangue do Hemocentro do Amazonas -Manaus. In: 29th - Congresso da Sociedade Brasileira de Hematologia e Hemoterapia, 2006, Pernambuco. Revista da Sociedade Brasileira de Hematologia e Hemoterapia, 2006. v. 11. p. 145-145.
12. KOMNINAKIS, S. V. ; SANTOS, C. ; TEIXEIRA, C. C. ; Maia, W. T. A. ; Zanoni M ; SA-FILHO, D. J. ; DIAZ, R. S. . Human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) proviral load in strutured. In: : XVII Encontro Nacional de Virologia, 2006, Campos do Jordão. Virus - Reviews & Research., 2006. v. 11. p. 80-80.
13. TEIXEIRA, C. C. ; Maia, W. T. A. ; SA-FILHO, D. J. ; Zanoni M ; DIAZ, R. S. ; KOMNINAKIS, S. V. . Mutations and polymorphisms in the gp41 of the HIV-1 from T20 naive patients receiving HAART. In: XVII Encontro Nacional de Virologia, 2006, Campos do Jordão. . Virus - Reviews & Research, 2006. v. 11. p. 80-80.
14. Brito, A. ; KOMNINAKIS, S. V. ; Novoa, P. C. R. ; OLIVEIRA, R. M. ; FONSECA, L. A. M. ; Duarte, A. J. S. ; Casseb, J. S. R. . Women with HIV-1 brazilian subtype B variant (B+GWGR motif) showed lower risk of death compared to women or men with the subtype B US/European strain.. In: VI Simpósio Brasileiro de Pesquisa em HIV/AIDS, 2005, Ouro Preto - MG. Abstracts of VI Simpósio Brasileiro de Pesquisa em HIV/AIDS, 2005. v. 6. p. 28-28.
15. Brito, A. ; KOMNINAKIS, S. V. ; Duarte, A. J. S. ; Casseb, J. S. R. . HIV serotypes co-circulating and its clinical outcome in a clinical setting in São Paulo city. In: V Simpósio Brasileiro de Pesquisa em HIV/AIDS, 2003, Rio de Janeiro. V Simpósio Brasileiro de Pesquisa em HIV/AIDS. Rio de Janeiro : Departamento de Multimeios/FIOCRUZ, 2003.
16. KOMNINAKIS, S. V. ; FUKUMORI, L. M. I. ; Alcalde R. ; Santos, M. A. C. G. ; Duarte, A. J. S. ; Casseb, J. S. R. . Prevalence of codon which codificate the tryptophan in the V3 loop region of the envelope of the HIV-1 in São Paulo city. In: V Simpósio Brasileiro de Pesquisa Básica em HIV/AIDS, 2003, Rio de Janeiro. V Simpósio Brasileiro de Pesquisa Básica em HIV/AIDS. Rio de Janeiro : Departamento de Multimeios/FIOCRUZ, 2003. p. 47-47.
17. KOMNINAKIS, S. V. ; FUKUMORI, L. M. I. ; Alcalde R. ; Santos, M. A. C. G. ; Brito, A. ; Duarte, A. J. S. ; Casseb, J. S. R. . Serological and molecular techniques for identification of the HIV-1 subtype B Brazilian variant, B. In: V Simpósio Brasileiro de Pesquisa em HIV/AIDS, 2003, Rio de Janeiro. V Simpósio Brasileiro de Pesquisa em HIV/AIDS. Rio de Janeiro : Departamento de Multimeios/FIOCRUZ, 2003. p. 48-48.
18. Veiga, A. P. R. ; KOMNINAKIS, S. V. ; ORII, N. M. ; Stellin, R. ; Casseb, J. S. R. . Humoral response to hepatitis B vaccination and its relationship with T CD4+ cell subsets in HIV-1 infected subjects. In: 14th AIDS International Conference, 2002, Barcelona. International AIDS Conference, 2002.
19. KOMNINAKIS, S. V. ; FUKUMORI, L. M. I. ; Montanheiro, P. A. ; Duarte, A. J. S. ; Casseb, J. S. R. . Comparison between anti-V3 serology and RFLP for identification of the brazilian variant of subtype B. In: 14th AIDS International Conference, 2002, Barcelona. International AIDS Conference, 2002.
20. Casseb, J. S. R. ; Costa, L. ; Diniz, L. A. ; PENALVA-DE-OLIVEIRA, A. C. ; Novoa, P. C. R. ; KOMNINAKIS, S. V. ; Montanheiro, P. A. ; DIAZ, R. S. ; Diggs, J. ; Duarte, A. J. S. . Molecular characterization of HTLV-II infections in Intravenous Drugs Users (IDU) from São Paulo, Brazil. In: 8th International HTLV Conference, 2002, Dublin. International HTLV Conference, 2002.
21. KOMNINAKIS, S. V. ; Montanheiro, P. A. ; Casseb, J. S. R. . Algorithm for HIV-1 serotyping using an modified V3 EIA in São Paulo. In: 1st IAS Conference on HIV Pathogenesisand treatment, 2001, Buenos Aires. International AIDS Society, 2001. p. 191-196.
22. Montanheiro, P. A. ; KOMNINAKIS, S. V. ; Duarte, A. J. S. ; Casseb, J. S. R. . Longitudinal evaluation of highly avidity anti-V3 antibodies (HAAV3) for the subtype B (GPGR motif) and the brazilian variant B. In: 1st IAS Conference on HIV pathogenesis and treatment, 2001, Buenos Aires. International AIDS Society, 2001. p. 196-196.
23. KOMNINAKIS, S. V. ; FUKUMORI, L. M. I. ; Duarte, A. J. S. ; Casseb, J. S. R. . Comparação entre sorologia anti-V3 e enzimas de restrição (Fok 1) para identificar variantes do subtipo B do HIV-1 no Brasil. In: IV Simpósio Brasileiro de Pesquisa em AIDS, 2001, Costa do Sauípe. The Brazilian Journal if Infectious Diseases, 2001. v. 5. p. S1-S1.
24. Montanheiro, P. A. ; KOMNINAKIS, S. V. ; Duarte, A. J. S. ; Casseb, J. S. R. . Highty avidity antibdies (HAAV3) for the subtype B (motif GPGR) and the brazilian variant B.. In: IV Simpósio Brasileiro de Pesquisa em AIDS, 2001, Costa do Sauípe. The Brazilian Journal of Infectious Disease, 2001. v. 5. p. S2-S2.
25. Montanheiro, P. A. ; KOMNINAKIS, S. V. ; Duarte, A. J. S. ; Casseb, J. S. R. . Highty avidity antibdies (HAAV3) for the subtype B (motif GPGR) and the brazilian variant B.. In: IV Simpósio Brasileiro de Pesquisa em AIDS, 2001, Costa do Sauípe. The Brazilian Journal of Infectious Disease, 2001. v. 5. p. S2-S2.
26. Casseb, J. S. R. ; KOMNINAKIS, S. V. ; Brigido L. F. M. ; Rodrigues, R. ; ARAUJO, F. ; Veiga, A. P. R. ; Almeida, A. ; Benard, G. ; HENDRY, R. M. ; Duarte, A. J. S. . HIV disease progression: Is the brazilian variant subtype B` (GWGR motif) less pathogenic than US/European B (GPGR)?. In: IV Simpósio Brasileiro de Pesquisa em AIDS, 2001, Costa do Sauípe. The Brazilian Journal of Infectious Diseases, 2001. v. 5.
27. ARAUJO, F. ; Casseb, J. S. R. ; KOMNINAKIS, S. V. ; Duarte, A. J. S. . Detection of HIV-1 in vitro induction of antibody production (IVIAP) in two individuals whom had repeated sexual exposure to HIV, but remained seronegative. In: IV Simpósio Brasileiro de Pesquisa em AIDS, 2001, Costa do Sauípe. The Brazilian Journal of Infectious Diseases, 2001. v. 5. p. S26-S26.
28. KOMNINAKIS, S. V. ; Montanheiro, P. A. ; Duarte, A. J. S. ; Casseb, J. S. R. . V3 reactivity among-infected subjects from São Paulo city. In: XXV Meeting of the Brazilian Society of Immunology, 2000, Florianópolis. International Meeting on Immunoregulation: Insights for therapeutic Intervention. Florianópolis : Editora da Universidade do Vale do Itajaí, 2000. p. 198-198.
29. KOMNINAKIS, S. V. ; Montanheiro, P. A. ; Duarte, A. J. S. ; Casseb, J. S. R. . Analysis of the seroreactivity in individuals users of drugs and of different sexual risks for V3 of HIV-1 in the city of São Paulo. In: I Fórum e II Conferência de Cooperação Técnica Horizontal da América Latina e do Caribe em HIV/Aids e DST, 2000, Rio de Janeiro. Fórum 2000, 2000. v. 1. p. 202-202.
30. KOMNINAKIS, S. V. ; Duarte, A. J. S. ; Casseb, J. S. R. . Comparison between two appoaches (EIA-solid phase an liquid phase) to distinguish the brazilian variant of subtype B of HIV-1. In: 10º Encontro Nacional de Virologia/2º Encontro de Virologia do Mercosul, 1999, Curitiba. Virus Reviews & Research- Journal of Brazilian Society for Virology, 1999. v. 4. p. 119-119.
31. KOMNINAKIS, S. V. ; Casseb, J. S. R. ; Duarte, A. J. S. . Identificação da variante do subtipo B (GWGR) pelo uso de peptídeos sintéticos representativos da alça da região V3 do HIV-1. In: XXXV Congresso da Sociedade Brasileira de Medicina Tropical, 1999, Guarapari. Revista da Sociedade Brasileira de Medicina Tropical, 1999. v. 32. p. 91-91.
32. KOMNINAKIS, S. V. ; Diniz, L. A. ; Duarte, A. J. S. ; Casseb, J. S. R. . Pattern of seroreactivity anti V3: comparison between two EIAS (liquid and solid phase) using synthetic peptides. In: III Simpósio de Pesquisa Básica em HIV/AIDS, 1999, Ilha de Comandatuba. Revista do Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, 1999. v. 41. p. S20-S20.
33. Veiga, A. P. R. ; KOMNINAKIS, S. V. ; Marao, V. ; Casseb, J. S. R. ; Duarte, A. J. S. . Antibodies anti-Hepatitis B levels after immunization with recombinant DNA HBV vaccine in HIV/AIDS patients. In: III Simpósio Brasileiro de Pesquisa Básica em HIV/AIDS, 1999, Ilha de Comandatuba. Revis do Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, 1999. v. 41. p. S38-S38.
34. Casseb, J. S. R. ; HONG, M. A. ; SALOMAO, R. ; Maia, W. T. A. ; KOMNINAKIS, S. V. ; Duarte, A. J. S. . In vitro induced antibody production (IVIAP) by peripheral blood mononuclear cells (PBMC) in brazilian HIV-1-infected subjects. In: 8th International Society for Infectious Diseases, 1998, Boston. International Society for Infectious Disease, 1998. p. 12-12.
35. KOMNINAKIS, S. V. ; HONG, M. A. ; Casseb, J. S. R. ; Duarte, A. J. S. . Avaliação preliminar da sororeatividade para a região V3 do HIV-1 em indivíduos usuários de drogas endovenosas. In: XXVI Congresso Brasileiro de Alergia e Imunopatologia, 1998, Belo Horizonte. Revista Brasileira de Alergia e Imunopatologia, 1998. v. 21. p. 162-162.
36. Freitas Junior, L. H. G. ; Egima, C. M. ; KOMNINAKIS, S. V. ; Schenkman, S. . A highly repeated DNA sequence is present dowstream of group of trans-sialidase genes. In: XXII Annual Meeting on Basic Research in Chaga's Disease, 1995, Caxambu - MG. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz, 1995. v. 90. p. 112-112.
Apresentações de Trabalho
1. KOMNINAKIS, S. V. . Aspectos laboratoriais da resistência do HBV. 2008. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

Bancas
Participação em bancas examinadoras
Dissertações
1. DIAZ, R. S.; SABINO, E. C.; LEWI, D. S.; KOMNINAKIS, S. V.. Participação em banca de Paula Tuma. Prognóstico Clínico de Pacientes Co-infectados com os Vírus da Hepatite Delta e B com e sem Infecção pelo HIV: na Era da Terapia Antiretroviral de Alta Atividade (HAART) a Infecção pelo HIV Ainda Piora o Desfecho Clínico dos Pacientes?. 2009. Dissertação (Mestrado em Infectologia) - Universidade Federal de São Paulo.
2. GRANATO, C. F. H.; Sucupira, M. C. A.; KOMNINAKIS, S. V.. Participação em banca de Mariana Leão Lima. Análise de correlação entre eventos de hipermutação e carga viral em pacientes infectados pelo Vírus da Imunodeficiência Humana tipo 1 (HIV-1). 2008. Dissertação (Mestrado em Infectologia) - Universidade Federal de São Paulo.
Teses de doutorado
1. DIAZ, R. S.; ETZEL, A.; LEWI, D. S.; KOMNINAKIS, S. V.; Casseb, J. S. R.. Participação em banca de Luiz Henrique Gagliani. Estudo da resistência genotípica primária aos antiretrovirais nos pacientes diagnosticados pelo Vírus da Imunodeficiência Humana (HIV-1) no municícipo de Santos - SP. 2009. Tese (Doutorado em Infectologia) - Universidade Federal de São Paulo.
2. JANINI, L. M. R.; DIAZ, R. S.; Sucupira, M. C. A.; SA-FILHO, D. J.; KOMNINAKIS, S. V.. Participação em banca de Elizabeth Cavalieri. Análise de tropismo do vírus da Imunodeficiência Humana tipo 1 (HIV-1) através de genotipagem da região V3 do envelope viral. 2009. Tese (Doutorado em Infectologia) - Universidade Federal de São Paulo.
3. CASTELO FILHO, A.; DIAZ, R. S.; MENDONCA, J. S.; GRANATO, C. F. H.; KOMNINAKIS, S. V.. Participação em banca de Ricardo da Silva de Souza. Avaliação da epidemia do HIV subtipo C no sul do Brasil. 2008. Tese (Doutorado em Infectologia) - Universidade Federal de São Paulo.
4. DIAZ, R. S.; MARTINS, A. M. C. R. P. F.; SABINO, E. C.; PINHO, J. R. R.; PETRELLA, S. M. C. N.; JANINI, L. M. R.; KOMNINAKIS, S. V.. Participação em banca de Marcia Helena Braga Catroxo. Pesquisa do Vírus Tt (Torque Teno Vírus) em Primatas Não Humanos e em Frangos de Corte (Gallus G. Domesticus), Pela Técnica de Reação em Cadeia Pela Polimerase (Pcr) e Caracterização do Genoma Viral. 2008. Tese (Doutorado em Infectologia) - Universidade Federal de São Paulo.
Trabalhos de Conclusão de Curso de graduação
1. KOMNINAKIS, S. V.; Sucupira, M. C. A.; Mota, G. R.. Participação em banca de Michelle Camargo. Diversidade Genetica do HIV-1 em individuos com infeccao recente. 2005. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biomedicina) - Universidade de Santo Amaro.
2. KOMNINAKIS, S. V.; Casseb, J. S. R.; Vigarruk V. Participação em banca de Adriana de Brito. Avaliação de anticorpos anti-V3: Seu papel na patogênese da infecção pelo HIV-1 nos pacientes com o motivo B-GPGR na cidade de São Paulo. 2004. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biomedicina) - Universidade Metodista de São Paulo.

Eventos
Participação em eventos
1. Tenth International Congress on Drug Therapy in HIV Infection.High levels of polymorphisms related to raltegravir resistance among raltegravir-naïve individuals in Brazil. 2010. (Congresso).
2. 5th IAS Conference on HIV Pathogenesis, Treatment and Prevention.gp41 HR1 and HR2 evolution among individuals receiving enfuvirtide containing regimens and virologic success in Brazil. 2009. (Congresso).
3. VIII Simpósio Brasileiro de Pesquisa em HIV/AIDS - SIMPAIDS.Benefit of genotyping after virologic failure among HIV-1 infected children. 2009. (Simpósio).
4. IV FÓRUM BRASILEIRO DE AIDS - II FÓRUM BRASILEIRO DE HEPATITES VIRAIS. 2008. (Congresso).
5. 9th International Congress on Drug Therapy in HIV Infection.HIV-1 pol gene diversity and antiretroviral drug resistance mutations in Itanhaém city, Brazil. 2008. (Congresso).
6. XIX National Meeting of Virology.Human Immunodeficiency Vírus Type 1 (HIV-1) proviral load in structured treatment interruption.. 2008. (Encontro).
7. Sociedade em Biologia celular (SPBCel).Carga proviral do HIV-1 em pacientes em falha terapêutica e submetidos a interrupção estruturada de tratamento (STI).. 2007. (Seminário).
8. Seminários em Patologia Tropical.Real Time PCR: Princípios e Aplicações. 2005. (Seminário).
9. IV BIOMIX.Biologia Molecular Aplicada ao Diagnóstico e a Pesquisa do HIV-1. 2004. (Encontro).

Orientações
Orientações em andamento
Dissertação de mestrado
1. Luiz Claudio Santana da Silva. Análise da presença de mutações de resistência primária aos antirretroviral Beverimat em pacientes infectados pelo HIV-1 em falha ao HAART. Início: 2011. Dissertação (Mestrado em Infectologia) - Universidade Federal de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Orientador).
2. Maira Cícero Ferreira. Análise da resposta ao tratamentode resgate com Darunavir em pacientes infectados pelo HIV-1 em falha terapêutica ao HAART que apresentam proteases virais B e não-Bs.. Início: 2011. Dissertação (Mestrado em Infectologia) - Universidade Federal de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. (Orientador).
3. Nathalia Mantovani Pena. Análise do gene da integrase do vírus da imunodeficiencia humana tipo 1 (HIV-1) em indivíduos em falha ao HAART e sem tratamento com raltegravir. Início: 2010. Dissertação (Mestrado em Infectologia) - Universidade Federal de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. (Orientador).
4. Eliane Pereira do Carmo Delduque. Desenvolvimento de técnica da Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) em Tempo Real para quantificação do DNA do Vírus da Hepatite B (VHB). Início: 2009. Dissertação (Mestrado em Infectologia) - Universidade Federal de São Paulo. (Orientador).
5. Michelle Zanoni. Analise de expressão gênica em pacientes infectados pelo HIV-1. Início: 2009. Dissertação (Mestrado em Infectologia) - Universidade Federal de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. (Co-orientador).
6. Marcos Ricardo Menegazzo. Estudo de polimorf ismos no gene TGF alpha relacionados ao ocorrência de Fissuras Labio Palatina (FMP) em crianças da Baixada Santista.. Início: 2009. Dissertação (Mestrado em Clínica Médica) - Centro Universitário Lusíada. (Orientador).
Tese de doutorado
1. Rafael Gonçalves de Azevedo. Análise da expressão gênica da IL28B e possível associação com progressão da doença em pacientes HCV positivos.. Início: 2010. Tese (Doutorado em Infectologia) - Universidade Federal de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. (Orientador).
2. Celina Maria Pereira de Moraes Soares. PREVALÊNCIA DE RESISTÊNCIA PRIMÁRIA DO HIV-1 AOS ANTI-RETROVIRAIS NO BRASIL. Início: 2007. Tese (Doutorado em Infectologia) - Universidade Federal de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Co-orientador).
Supervisões e orientações concluídas
Dissertação de mestrado
1. Maria Luzinete Sabino da Silva. Estudo da possível contribuição do resultado do teste de genotipagem dos genes da transcriptase reversa e protease do Vírus da Imunodeficiência Humana tipo 1 (HIV-1) para crianças da cidade de Santos. 2010. Dissertação (Mestrado em Mestrado em Clínica Médica) - Fundação Lusíada, . Orientador: Shirley Vasconcelos Komninakis.
2. Daniela Teixeira. Otimização de técnica de detecção de subtipos B e F de HIV-1 e seus recombinantes por reação em cadeia pela polimerase (PCR) em tempo real para as regiões pol (protease) e env (V3). 2009. Dissertação (Mestrado em Infectologia) - Universidade Federal de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Co-Orientador: Shirley Vasconcelos Komninakis.
3. Rafael Gonçalves de Azevedo. Genotipagem da gp41 do Vírus da Imunodeficiência Humana tipo 1 (HIV-1) em indivíduos respondedores e não respondedores ao inibidor de fusão T20.. 2009. Dissertação (Mestrado em Infectologia) - Universidade Federal de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Shirley Vasconcelos Komninakis.
4. Viviane Kelly Alves. Desenvolvimento de técnicas para avaliação da carga viral do vírus HGV/GBV-C em pacientes co-infectados pelo HIV-1 e determinação de sua relevância clínica. 2008. Dissertação (Mestrado em Infectologia) - Universidade Federal de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Co-Orientador: Shirley Vasconcelos Komninakis.
5. Erika Etsuko Fusuma. Avaliação clonal das vias mutacionais para resistência aos anti-retrovirais. 2007. Dissertação (Mestrado em Infectologia) - Universidade Federal de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Co-Orientador: Shirley Vasconcelos Komninakis.
Trabalho de conclusão de curso de graduação
1. Carla Cristina Teixeira. Análise molecular da gp41 do Virus da Imunodeficiencia Humana tipo 1 (HIV-1) em indivíduos em falha terapêutica aos antiretrovirais.. 2006. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Biologia) - Universidade Metodista de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Shirley Vasconcelos Komninakis.
2. Adriana de Brito. Avaliação de anticorpos anti-V3: Seu papel na patogênese da infecção pelo HIV-1 nos pacientes com o motivo B-GPGR na cidade de São Paulo. 2004. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Biomedicina) - Universidade Metodista de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Shirley Vasconcelos Komninakis.
Iniciação Científica
1. Maira Cicero Ferreira. CORRELAÇÃO ENTRE A PRESENÇA DE MUTAÇÕES DE RESISTÊNCIA PRIMÁRIA AO ANTIVIRAL 3TC (LAMIVUDINA) E MODIFICAÇÕES NO GENE S DO VÍRUS DA HEPATITE B EM INDIVÍDUOS CO-INFECTADOS HBV/HIV. 2010. Iniciação Científica. (Graduando em Biomedicina) - Fundação Lusíada. Orientador: Shirley Vasconcelos Komninakis.
2. Luiz Claudio Santana da Silva. ESTUDO DA DISTRIBUIÇÃO DOS GENÓTIPOS DO VÍRUS DA HEPATITE B NA BAIXADA SANTISTA. 2010. Iniciação Científica. (Graduando em Biomedicina) - Fundação Lusíada. Orientador: Shirley Vasconcelos Komninakis.
3. Carla Silveira Pires de Almeida. AVALIAÇÃO DA PRESENÇA DE MUTAÇÕES DE RESISTÊNCIA PRIMÁRIA AO ANTIVIRAL ENTECAVIR EM INDIVÍDUOS CO INFECTADOS PELO HBV/HIV. 2009. Iniciação Científica. (Graduando em Biomedicina) - Fundação Lusíada. Orientador: Shirley Vasconcelos Komninakis.
4. Henrique dos Reis Barbosa da Silva. AVALIAÇÃO DA PRESENÇA DE MUTAÇÕES DE RESISTÊNCIA PRIMÁRIA AO ANTIVIRAL ADEFOVIR EM INDIVÍDUOS CO INFECTADOS PELO HBV/HIV. 2009. Iniciação Científica. (Graduando em Biomedicina) - Fundação Lusíada. Orientador: Shirley Vasconcelos Komninakis.
5. Nathalia Mantovani Pena. AVALIAÇÃO DA PRESENÇA DE MUTAÇÕES DE RESISTÊNCIA PRIMÁRIA AO ANTIVIRAL LAMIVUDINA EM INDIVÍDUOS CO- INFECTADOS PELO HBV/HIV. 2009. Iniciação Científica. (Graduando em Biomedicina) - Fundação Lusíada, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Shirley Vasconcelos Komninakis.
6. Janayna Thainá Rabelato. Estudo da ocorrência de mutações primárias de resistência ao Raltegravir no gene da integrase DO HIV-1. 2009. Iniciação Científica. (Graduando em Medicina) - Fundação Lusíada. Orientador: Shirley Vasconcelos Komninakis.
7. Michelle Zanoni. Avaliação da presença de aminoácidos carregados positivamente nas posições 11 e/ou 25 da região V3 do HIV-1 de pacientes em falha terapêutica. 2005. Iniciação Científica. (Graduando em Biomedicina) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Shirley Vasconcelos Komninakis.
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