Fabio Marcio Squina

Bolsista de Produtividade em Pesquisa do CNPq - Nível 2

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  • Última atualização do currículo em 23/11/2018


Possui graduação em Farmácia e Bioquímica pela Faculdade de Ciências Farmacêuticas da Universidade de São Paulo (1998), Mestrado em Ciência de Alimentos pela Faculdade de Engenharia de Alimentos da UNICAMP (2001) e Doutorado em Biologia Celular e Molecular pela Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da USP (2005). Realizou dois pós-doutorados, primeiro (2005 - 2007) no Departamento de Bioquímica da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, em seguida (2007-2008) no Departamento de Microbiology and Molecular Genetics da Oklahoma State University. Durante o período de 2008 a 2016, foi pesquisador líder no Laboratório Nacional de Ciência e Tecnologia do Bioetanol (CTBE/ CNPEM), implantou os Laboratórios de Microbiologia e Biologia Molecular do CTBE em 2011, bem como o Laboratório de Sequenciamento de Ácidos Nucleicos em Larga Escala (NGS) em 2013. Desde 2010 é professor (orientador) de pós-graduação no Instituto de Biologia da UNICAMP. Atualmente é professor adjunto na Universidade de Sorocaba (UNISO) no Programa de Processos Tecnológicos e Ambientais. Coordenou vários projetos financiados pelo CNPq e FAPESP. Coordenou projeto FINEP de Inovação Industrial envolvendo dezenas de profissionais multinacionais. Atualmente é coordenador de Projeto Temático da FAPESP, É revisor frequente de projetos de fomento CNPq e FAPESP. Participou como palestrante e na organização de eventos científicos internacionais e nacionais em sua área. Tem experiência na área de Biologia Molecular e Bioquímica, com ênfase em Enzimologia e Genética de Microrganismos. Seus interesses científicos combinam biologia sintética, ciências ômicas e abordagens de high-throughput screening visando o desenvolvimento de enzimas e soluções biotecnológicas para a conversão de biomassa lignocelulósica em bioprodutos. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Fabio Marcio Squina
Nome em citações bibliográficas
SQUINA F. M.;Squina, Fabio Marcio;Squina, Fabio M.;Squina, Fábio M.;SQUINA, FÁBIO MARCIO;SQUINA, F M;SQUINA, F. M.;SQUINA, F.M.;Squina, Fabio M;Squina, F;Squina, F.;Squina, FM;SQUINA, FM;SQUINA, FM.;SQUINA, FABIO MÁRCIO;SQUINA, FABIO;SQUINA, FÁBIO M.;SQUINA, FÁBIO MÁRCIO;M. SQUINA, FABIO;SQUINA, FÁBIO;The CAZypedia Consortium

Endereço


Endereço Profissional
Universidade de Sorocaba, Reitoria, Pró-Reitoria de Pós-Graduação e Pesquisa.
Rodovia Raposo Tavares - km 92,5
Cidade Universitária
18023000 - Sorocaba, SP - Brasil
Telefone: (19) 993454517
URL da Homepage: http://pta.uniso.br/


Formação acadêmica/titulação


2001 - 2005
Doutorado em Biologia Celular e Molecular.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: Produção sistemática de reagentes para mutagênese sítio-específica em Leishmania ssp. A ruptura de genes localizados na extremidade de cromossomos, Ano de obtenção: 2005.
Orientador: Prof. Dr. Luiz Ricardo Orsini Tosi.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Parasitologia / Subárea: Protozoologia de Parasitos.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Morfologia / Subárea: Biologia Celular.
1999 - 2001
Mestrado em Ciência de Alimentos.
Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.
Título: Estudos com Carotenóides de Leveduras do Gênero Rhodotorula: Desenvolvimento de Método Analítico, Influência de Inibidores e Cultivo em meio Alternativo a Basa de Caldo de Cana-de-Açúcar,Ano de Obtenção: 2001.
Orientador: Profa. Dra. Adriana Zerlotti Mercadante.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica.
1997 - 1998
Especialização em Análises Clínicas e Toxicológicas.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: Especialização em Análises Clínicas e Toxicológicas.
1994 - 1998
Graduação em Farmácia Bioquímica.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Título: Seleção de compostos oriundos de plantas com capacidade de alterar o crescimento apical e/ou ramificação de Neurospora crassa.
Orientador: Profa. Dra. Suraia Said.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.


Pós-doutorado


2007 - 2008
Pós-Doutorado.
Oklahoma State University, OSU, Estados Unidos.
Bolsista do(a): U. S. Department of Energy, DOE, Estados Unidos.
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Enzimologia.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica.
2005 - 2007
Pós-Doutorado.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.


Formação Complementar


2015 - 2015
Microbial Genomics and Metagenomics. (Carga horária: 40h).
DOE Joint Genome Institute, JGI, Estados Unidos.
2014 - 2014
Hiseq 2500 System, cBot and Truseq stranded RNA. (Carga horária: 20h).
Illumina, ILLUMINA, Brasil.
2014 - 2014
MiSeq System and Nextera Library Prep.. (Carga horária: 20h).
Illumina, ILLUMINA, Brasil.
2012 - 2012
Microbial Genomics and Metagenomics. (Carga horária: 40h).
DOE Joint Genome Institute, JGI, Estados Unidos.
2012 - 2012
São Paulo School of Advance Science on e-Science f. (Carga horária: 40h).
Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, CNPEM, Brasil.
2006 - 2006
Elaboração de Plano de Negócios. (Carga horária: 16h).
Incubadora de Empresas de Base Tecnológica, SUPERA, Brasil.


Atuação Profissional



Universidade de Sorocaba, UNISO, Brasil.
Vínculo institucional

2017 - Atual
Vínculo: , Enquadramento Funcional: Professor Adjunto, Carga horária: 40
Outras informações
Docente Permanente do Programa de Pós Graduação em Processos Tecnológicos e Ambientais

Atividades

03/2018 - Atual
Conselhos, Comissões e Consultoria, Reitoria, Centro de Ciências Biológicas e da Saúde.

Cargo ou função
Membro do Núcleo Docente Estruturante (NDE) do curso de Farmácia.
02/2018 - Atual
Ensino, Biomedicina, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Microbiologia
02/2018 - Atual
Ensino, Farmácia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Bioquímica Metabólica
08/2017 - Atual
Ensino, Processos Tecnológicos e Ambientais, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Estudo dirigido em Processos Tecnológicos
03/2017 - Atual
Pesquisa e desenvolvimento , Reitoria, Pró-Reitoria de Pós-Graduação e Pesquisa.

08/2017 - 12/2017
Ensino, Agronomia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Biologia Celular Aplicada

Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.
Vínculo institucional

2017 - Atual
Vínculo: Pesquisador Colaborador, Enquadramento Funcional: Pesquisador Colaborador DEPRO / FEQ, Carga horária: 2

Vínculo institucional

2017 - Atual
Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Orientação em Pós-graduação, Carga horária: 1
Outras informações
Professor Colaborador do Programa de Pós-graduação em Biociências e Tecnologia de Produtos Bioativos

Vínculo institucional

2017 - Atual
Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Orientação em Pós-graduação, Carga horária: 1
Outras informações
Professor Colaborador do Programa de Pós-graduação em Biologia Funcional e Molecular

Vínculo institucional

2011 - 2017
Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Orientação em Pós-graduaçao
Outras informações
Professor Permanente do Programa de Pós-graduação em Biociências e Tecnologia de Produtos Bioativos

Vínculo institucional

2010 - 2017
Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Orientação em Pós-graduaçao
Outras informações
Professor Permanente do Programa de Pós-graduação em Biologia Funcional e Molecular

Vínculo institucional

1999 - 2001
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Mestrando, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

03/2013 - Atual
Ensino, BIOCIÊNCIAS E TECNOLOGIA DE PRODUTOS BIOATIVOS, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
PD037 ? Enzimologia: Cinética Enzimática e Desenvolvimento de Novos Fármacos
03/2013 - Atual
Ensino, Biologia Funcional e Molecular, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
NB-325 Tópicos em Enzimologia e Biotecnologia
10/2010 - 10/2010
Ensino, Odontologia, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Ministrou a palestra: Aplicação de Ferramentas ômicas para prospecção de enzimas biotecnológicas
06/2010 - 06/2010
Ensino, Biologia Celular e Estrutural, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Ministrou a palestra: Desenvolvimento de Enzimas Envolvidas na Produção de Biocombustíveis
07/2009 - 07/2009
Ensino, Biologia Funcional e Molecular, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Ministrou a palestra: Desenvolvimento de Enzimas Envolvidas na Produção de Biocombustíveis
03/1999 - 02/2001
Pesquisa e desenvolvimento , Faculdade de Engenharia de Alimentos, .

08/2000 - 12/2000
Ensino, Faculdade de Engenharia de Alimentos, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Programa PAE; Microbiologia de Alimentos;
06/1999 - 12/2000
Ensino, Faculdade de Engenharia de Alimentos, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Programa PAE; Química dos componentes dos alimentos

Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, CNPEM, Brasil.
Vínculo institucional

2008 - 2016
Vínculo: Celetista formal, Enquadramento Funcional: Pesquisador Lider, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

01/2015 - 12/2016
Direção e administração, Laboratório Nacional de Ciência e Tecnologia do Bioetanol, .

Cargo ou função
Pesquisador Lider Instalação Aberta: Laboratório de Alto Desempenho em Sequenciamento e Robótica.
10/2014 - 12/2016
Direção e administração, Laboratório Nacional de Ciência e Tecnologia do Bioetanol, .

Cargo ou função
Coordenador do Laboratório de Biotecnologia Molecular (LBM/ CTBE).
9/2008 - 12/2016
Pesquisa e desenvolvimento , Laboratório Nacional de Ciência e Tecnologia do Bioetanol, .

01/2011 - 12/2015
Conselhos, Comissões e Consultoria, Laboratório Nacional de Ciência e Tecnologia do Bioetanol, .

Cargo ou função
Membro Comissão Interna de Biossegurança;.
02/2014 - 12/2014
Direção e administração, Laboratório Nacional de Ciência e Tecnologia do Bioetanol, .

Cargo ou função
Coordenador de Instalação de Sequenciamento de Alto Desempenho.
03/2012 - 12/2014
Direção e administração, Laboratório Nacional de Ciência e Tecnologia do Bioetanol, .

Cargo ou função
Coordenador da Instalação de High-throughput screening.
01/2011 - 12/2014
Conselhos, Comissões e Consultoria, Laboratório Nacional de Ciência e Tecnologia do Bioetanol, .

Cargo ou função
Comissão de Insumos e Rejeitos químicos.
03/2010 - 12/2010
Conselhos, Comissões e Consultoria, Laboratório Nacional de Ciência e Tecnologia do Bioetanol, .

Cargo ou função
Presidente Comissão Interna de Biossegurança.

Oklahoma State University, OSU, Estados Unidos.
Vínculo institucional

2007 - 2008
Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Post Doctoral Fellow, Regime: Dedicação exclusiva.


Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Vínculo institucional

2005 - 2007
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pos-Doutor, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações
Pós-doutorado no Departamento de Bioquímica e Imunologia da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto.

Vínculo institucional

2001 - 2005
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Doutorando, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações
Doutorando em Biologia Celular e Molecular na Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto

Vínculo institucional

1997 - 1998
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Bolsista de Iniciação Científica FAPESP, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações
Estágio de Iniciação Científica na Disciplina de Enzimologia Industrial. Faculdade de Ciência Farmacêuticas de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo.

Vínculo institucional

1994 - 1998
Vínculo: aluno de graduação, Enquadramento Funcional: Graduando, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações
Graduação em Farmácia Bioquímica. Faculdade de Ciência Farmacêuticas de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo.

Vínculo institucional

1997 - 1997
Vínculo: voluntário, Enquadramento Funcional: Estagiário, Carga horária: 40
Outras informações
Estágio de Iniciação em Farmácia de Dispensação e Manipulação. Farmácia Ensino da da Faculdade de Ciência Farmacêuticas de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo.

Atividades

09/2013 - 09/2013
Ensino, Bioquímica, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Ministrou a palestra: Development of Omics-based Approaches for Biocatalist Discovery in Lignocellulose-to-Bioproduct applicatios, junto a Disciplina de Seminários Gerais do Departamento de Bioquímica, programa de pós-graduação do Instituto de Química
10/2012 - 10/2012
Ensino, Bioquímica, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Ministrou a palestra: Estratégias MetaProteoGenômicas para Prospecção de Enzimas com Aplicação Biotecnológica, junto a disciplina de Seminários de Bioquímica II do Departamento de Bioquimica e Imunologia da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto
10/2009 - 10/2009
Ensino, Biotecnologia, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Ministrou a palestra: Desenvolvimento de uma Biblioteca de Enzimas Envolvidas na Conversão da Biomassa Vegetal, junto a disciplina de seminários em Biotecnologia do programa de pós-graduação interunidades da USP
10/2005 - 05/2007
Pesquisa e desenvolvimento , Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, .

06/2006 - 06/2006
Ensino, Genética de Fungos, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Palestra Proferida: A construção de bibliotecas subtrativas de cDNA para análise da expressâo diferencial da genes. Colaboração na disciplina do Programa de Genética da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto
10/2005 - 10/2005
Ensino, Tópicos em Bioquímica Contemporânea, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Palestra Proferida: Interferindo em Processos Biológicos; A Produção de Organismos Mutantes. Colaboração na disciplina do Programa de Bioquímica da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto
03/2004 - 03/2004
Ensino, Técnicas Básicas de Imunologia, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Palestra ministrada: O Papel de Mutantes como Ferramenta no Estudo de Processos Biológicos. Colaboração na disciplina do Programa de pós-graduação em Imunologia da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto
02/2003 - 05/2003
Ensino, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Nível: Graduação

Disciplinas ministradas
Genética Molecular e Tecnologia de DNA Recombinante; (Programa PAE)
03/2002 - 11/2002
Ensino, Tópicos Avançados em Microbiologia e Parasitologia, Nível: Pós-Graduação

Disciplinas ministradas
Palestra Proferida: Custos e Benefícios de Altas Taxas de Mutação em Bactérias em Disciplina de Seminários do Programa de Biologia Celular e Molecular. Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto
Palestra Proferida: Organismos Modelos como Ferramenta para o Estudo de Doenças Genéticas Humanas. Colaboração na Disciplina de Seminários do Programa de Biologia Celular e Molecular. Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto
01/1997 - 09/1998
Pesquisa e desenvolvimento , Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto, Departamento de Ciências Farmacêuticas.


Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, HCFM-USP, Brasil.
Vínculo institucional

1998 - 1998
Vínculo: Voluntário, Enquadramento Funcional: Estagiário Laboratório Clínico, Carga horária: 40

Atividades

07/1998 - 12/1998
Estágios , Laboratórios de Análises Clínicas, .

Estágio realizado
Estágio Curricular em Laboratório Clínico.

(FAPESP) Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo.
Vínculo institucional

2013 - Atual
Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Membro de comitê assessor do programa PIPE
Outras informações
Grupo de pesquisadores reunidos em períodos esporádicos para avaliação conjunta de projetos de inovação tecnológica propostos por empresas do setor privado

Vínculo institucional

2009 - Atual
Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Revisor de projeto de fomento
Outras informações
Revisor frequente de projetos de pesquisa e de solicações de bolsas



Linhas de pesquisa


1.
Produção de compostos químicos de alto valor por microrganismos

Objetivo: Produção de produtos químicos de alto valor partir de microrganismos a partir de substratos agrículas de baixo custo como bagaço da cana de açúcar ou hidrolisados lignocelulósicos..
2.
Regulação da Expressão Gênica em Microrganismos

Objetivo: Caracterização das vias metabólicas ou processos celulares que permitem aos fungos e microrganismos extremófilos sobreviverem em condições adversas. Controle da expressão de genes que codificam proteínas de resposta ao estresse e codições de cultivo..
Grande área: Ciências Biológicas
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Bioquímica dos Microorganismos.
Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.
3.
Crescimento apical e/ou a ramificação de N.crassa

Objetivo: Seleção de compostos oriundos de plantas com capacidade de alterar o crescimento apical e/ou a ramificação de N.crassa.
Grande área: Ciências Biológicas
4.
Estratégias Meta-Proteo-Genômicas para Prospecção de Enzimas com Aplicação Biotecnológica

Objetivo: Nos anos nosso grupo vem realizado abordagens ?ômicas? e de high-throughput screening com o objetivo de desenvolver de uma coleção de enzimas com aplicação biotecnológica. Estas estratégias incluem mineração em banco de dados de genomas de microrganismos, sequenciamento de metagenomas, screenings em bibliotecas mategenômicas, bem como, análises proteômicas de cupim e de fungos filamentosos. Neste sentido, identificamos milhares de enzimas e conseguimos ?colecionar? pelo menos 50 atividades enzimáticas derivadas fungos filamentosos, bactérias hipertermofílicas, metagenoma de solo e cupim, bem como genes sintetizados artificialmente. Entre estas atividades enzimáticas, incluem beta-glucosidases (GH1 e GH3), celulases (GH5, GH7, GH9, GH12), lichenases (GH16), mananases (GH5), laminarases (GH17), xilanases (GH10, GH11), xiloglucanases (GH12 e GH74), arabinofuranosidases (GH 51 e 54), arabinanases (GH 43), junto com atividades auxiliares como cellobiose dehydrogenase (AA3), monooxigenases líticas polissacarídeos (AA9) e feruloil esterases (CE1). A utilidade desta coleção de enzimas não se restringe ao desenvolvimento de coquetéis enzimáticos para produção de biocombustíveis. Esta coleção também está impulsionando o desenvolvimento de rotas biotecnológicas para produtos de interesse biotecnológicos, como a produção de compostos nutracêuticos, ingredientes para nutrição animal ou cosméticos. Além disso, estudos correlacionando estrutura e função de enzimas, têm fornecido subsídios para o melhor conhecimento da especificidade e modo de operação de enzimas, bem como a ultra estrutura de material lignocelulósico..
5.
Desenvolvimento de Sistemas de Expressão de Proteínas Recombinantes em Fungos Filamentosos

Objetivo: Nosso objetivo é desenvolver e consolidar a utilização de fungos filamentosos como plataforma para expressão e secreção heteróloga de proteínas recombinantes. Comparando-se com outros sistemas disponíveis para expressão de proteínas heterólogas, em culturas líquidas, os fungos filamentosos apresentam ótima performance, alto rendimento e uma opção pouco onerosa, com relação aos requerimentos nutricionais. Este apelo pelos fungos filamentosos como plataforma para expressão de proteínas recombinantes, também é baseada em sua habilidade natural em secretar grandes quantidades de proteínas para o meio de cultivo. Neste sentido, estamos desenvolver uma coleção de linhagens aptas a super-expressar diversas atividades enzimáticas envolvidas na degradação de polissacarídeos da parede celular de plantas. Além de estudar as propriedades funcionais das atividades enzimáticas, com amplas aplicações biotecnológicas que incluem estratégias para produção de bioetanol, também pretendemos fazer usos de estratégias de biologia molecular para desenvolver linhagens super-expressando concomitantemente duas ou mais atividades enzimáticas sinérgicas, visando sua aplicação em rotas biotecnológicas para biorefinarias de biomassa lignocelulósica...
6.
Regulação da Expressão Gênica em Microrganismos
7.
Produção de compostos químicos de alto valor por microrganismos
8.
Estratégias Meta-Proteo-Genômicas para Prospecção de Enzimas com Aplicação Biotecnológica


Projetos de pesquisa


2018 - Atual
CNPQ Produtividade 3: Desenvolvimento de microrganismo para conversão de biomassa lignocelulósica em ácido ferúlico
Descrição: As tecnologias alternativas para geração de energia e compostos químicos, em substituição aos combustíveis fósseis (fontes esgotáveis), são promissoras para o desenvolvimento econômico e mitigação de impactos ambientais relacionados ao aquecimento global. Neste sentido, a utilização da biomassa lignocelulósica apresenta-se em vantagem, este material é constituído de celulose e hemicelulose que podem ser utilizadas para a fermentação de microrganismos e produção de etanol, além da lignina, que pode ser convertida em compostos químicos de alto valor agregado. Este trabalho visa o melhoramento genético de microrganismos lignolíticos visando o desenvolvimento de um processo de conversão de material lignocelulósico em ácido ferúlico. Este composto é precursor de compostos químicos utilizados na indústria, como por exemplo o L-DOPA (L-3,4-dihydroxyphenylalanine) e o álcool coniferílico. O trabalho de pesquisa contempla o estudos "omicos" de sistema enzimáticos e as vias de conversão de lignina de microrganismos, que servirão de base para silenciamento e superexpressão de genes utilizando o sistema CRISPR/Cas9..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2017 - Atual
Temático FAPESP 2: Lignin valorization in cellulosic ethanol plants: biocatalytic conversion via ferulic acid to high value chemicals
Descrição: Lignin can be obtained as a by-product of cellulosic ethanol production, and is a potential source of renewable chemicals. Efficient valorisation of lignin is a major unsolved problem in the development of sustainable biorefineries. The proposal brings together expertise in cellulosic ethanol production and in biocatalyst discovery, with expertise in biocatalytic lignin valorisation and biocatalysis for high value chemicals production. The overall aim is to generate new methods for lignin valorisation via intermediate ferulic acid, which has been generated from lignin via bacterial fermentation in previous work. The project will involve the following work packages: 1) Integration between lignin valorization and cellulosic bioethanol production; 2) conversion of lignin to ferulic acid from lignin using synthetic biology; 3) enzymatic conversion of ferulic acid into pharmaceutical L-Dopa; 4) biocatalytic generation of high value fragrance chemicals (coniferyl acetate, isoeugenol) from ferulic acid (supported by cosmetics manufacturer Natura Brasil); 5) bioprocess intensification and scale-up of chemicals production from renewable feedstocks; 6) technical and sustainability impact assessment. Technology developed in the project could be applied to major plant feedstocks used in Brazil (sugarcane) or the UK (wheat)..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2015 - 2018
CNPq Universal 2: Desenvolvimento de um modelo enzimático para desconstrução da parede celular de bagaço de cana de açúcar
Descrição: Este estudo propõe desenvolver um modelo enzimático de desconstrução da parede celular de cana de açúcar em altas temperaturas, visa um melhor entendimento da atuação das enzimas na degradação da biomassa, mapeando sua acessibilidade e definindo quais as enzimas essências e secundárias para esta bioconversão. Este modelo enzimático de desconstrução da parede celular de cana de açúcar pretende responder quais as enzimas necessárias para a degradação da biomassa e servirá não apenas para a biomassa da cana de açúcar, mas também servirá como ponto de partida para estudos de demais substratos lignocelulósicos. Atualmente, frente à grande quantidade de biomassa lignocelulósica disponível para conversão em bioetanol, destaca-se o bagaço de cana, que é um resíduo gerado a partir da produção de etanol de 1ª geração. Para ampliarmos a produção de etanol utilizando esta biomassa, faz-se necessário estabelecer protocolos que agrupem dois pontos de vista importantes: (1) uma mistura enzimática eficiente para degradação de biomassa, sendo os produtos de hidrólise muito bem estudados; e (2) a combinação de hidrólise multi-enzimática e pré-tratamento desta biomassa. Neste contexto, o desenvolvimento de misturas enzimáticas para desestruturação da biomassa de cana de açúcar ganha crescente destaque, bem como, o conhecimento de quais são as enzimas principais e secundárias que atuam sobre a parede celular e suas respectivas proporções tornam-se essenciais. Reduzir os níveis de enzimas não-essenciais e aumentar a proporções relativas das enzimas prioritárias são, portanto, uma potencial estratégia para aumentar as atividades específicas e, assim, diminuir o custo da bioconversão da biomassa vegetal. Pois o que ainda torna o bioetanol de 2ª geração um produto não viável economicamente, é o custo gerado pela aquisição das enzimas necessárias para a degradação da biomassa lignocelulósica. Neste sentido, fazendo o uso de uma coleção de enzimas envolvidas na biodegradação da biomassa, expressas em sistema heterólogo de expressão, pretendemos desenvolver um modelo enzimático para desconstrução da parede celular de cana de açúcar em altas temperaturas, definindo quais as enzimas essências e secundárias para esta bioconversão. Também pretendemos realizar estudos do perfil glicômico das frações da parede celular da biomassa submetida a ação enzimática, para melhor compreender a ação dessas enzimas na degradação da parece celular vegetal. Em face disto, acreditamos que este estudo apresenta um grande potencial para agregar conhecimento no campo do aproveitamento de recursos renováveis, bem como, quanto à geração de inovação tecnológica e de patentes nesta área do conhecimento. Uma vez que, atingindo os objetivos proposto neste projeto, o CTBE oferece possibilidades para ampliação de escala, com o uso de fermentadores e planta piloto..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Doutorado: (2) .
Integrantes: Fabio Marcio Squina - Coordenador / Rolf A. Prade - Integrante / Thiago A Gonçalves - Integrante / Douglas A A Paixão - Integrante / GOLDBECK, ROSANA - Integrante.
2015 - 2018
CNPQ Produtividade 2: Desenvolvimento de um modelo enzimático para desconstrução da parede celular de bagaço de cana de açúcar
Descrição: A biodegradação dos materiais lignocelulósicos tem sido objeto de muitos estudos, pois, além de corresponder a uma etapa fundamental do ciclo do carbono na natureza, apresenta um enorme potencial biotecnológico em diversas áreas, como a produção de biocombustíveis. A conversão de biomassa lignocelulósica em combustíveis renováveis, como o bioetanol, tem sido considerada uma tecnologia promissora para a substituição dos combustíveis fósseis e ampliação da produção de etanol mundial. Um passo essencial na conversão da biomassa lignocelulósica em etanol ou em outros produtos de biorefinaria é a despolimerização de polissacarídeos por via enzimática. No entanto, o alto custo das enzimas necessárias para degradação da parede celular vegetal dificulta a produção do etanol lignocelulósico de forma economicamente viável. Uma abordagem para reduzir o custo das enzimas está no melhoramento de suas atividades específicas, ou seja, aumentar a quantidade de açúcar fermentecível liberada por unidade de proteína. Atualmente, um importante foco de pesquisas é voltado na otimização das enzimas empregadas na biodegradação do material lignocelulósico. Neste contexto, o desenvolvimento de misturas enzimáticas para desestruturação da biomassa de cana de açúcar ganha crescente destaque, bem como, o conhecimento de quais são as enzimas principais e secundárias que atuam sobre a parede celular, além de suas respectivas proporções, tornam-se essenciais. Hoje em dia contamos com muita informação na literatura a respeito de celulases e xilanases, no entanto, pouco se sabe sobre o envolvimento das demais enzimas assessórias necessárias na degradação da biomassa lignocelulósica, bem como a interação das enzimas ligno-hemicelulolíticas com o substrato. Uma potencial estratégia para diminuir o custo da bioconversão da biomassa vegetal é a redução dos níveis de enzimas não-essenciais e o aumento das proporções relativa as enzimas prioritárias. Em face disto, fazendo o uso de uma coleção de enzimas pertencentes ao Laboratório Nacional de Ciência e Tecnologia do Bioteanol (CTBE), pretendemos desenvolver um modelo enzimático para desconstrução da parede celular de cana de açúcar (bagaço pré-tratado hidrotermicamente e colmo de cana de açúcar), visando um melhor entendimento da atuação das enzimas na degradação da biomassa, mapeando sua acessibilidade e definindo quais as enzimas essências e secundárias para esta bioconversão. Este modelo enzimático, bem como a nossa estratégia de desconstrução da parede celular de cana de açúcar, deverá não apenas ser útil para um tipo de biomassa, mas também será ponto de partida para estudos de demais substratos lignocelulósicos, como eucalipto, sorgo, gramíneas, etc. Outro foco, que também agrega inovação a este projeto, está voltado para a análise do perfil glicômico das frações geradas na degradação da parede celular de cana de açúcar. Os estudos de glicômica deverão ampliar entendimento do modo de atuação das enzimas envolvidas, e identificar atividades enzimáticas ausentes necessárias para a completa hidrólise do material lignocelulósico..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (2) .
Integrantes: Fabio Marcio Squina - Coordenador.
2015 - Atual
Temático FAPESP 1: Recalcitrância da biomassa de cana-de-açúcar: Fundamentos relacionados à formação da parede celular, ao pré-tratamento e à digestão enzimática, aplicados no desenvolvimento de novos modelos de biorrefinarias
Descrição: O presente projeto tem como objetivo gerar conhecimento integrado sobre as origens da recalcitrância da biomassa de cana-de-açúcar. Em função deste conhecimento pretende-se desenhar processos inovadores de conversão de biomassa dentro do conceito contemporâneo das biorrefinarias. A deposição de paredes celulares secundárias será avaliada em função do estágio de maturação das plantas com teores contrastantes de componentes. Serão avaliados o processo de lignificação e a de deposição de hemicelulose. A lignificação será ainda avaliada pelo nível de expressão de genes codificadores de enzimas envolvidas na biossíntese de monolignóis. A digestibilidade direta das amostras geradas será avaliada e avaliação dos dados gerados permitirá direcionar as etapas subsequentes de desenho de bioprocessos destinados à conversão da biomassa da cana em produtos de interesse tecnológico dentro do contexto contemporâneo das biorrefinarias. Está previsto que processos amenos de pré-tratamento baseados na ação deslignificante do sulfito alcalino ou na ação seletiva de ácidos diluídos sobre a hemicelulose possam gerar substratos aptos à bioconversão por xilanases para a preparação de oligossacarídeos e posteriormente por celulases para a produção de hidrolisados fermentescíveis. Estudos de secretômica de fungos degradadores de madeira permitirão buscar novas enzimas hidrolíticas para o tratamento dos substratos gerados. A avaliação econômica e ambiental de processos desenhados com as bases científicas geradas no projeto permitirá ainda verificar os benefícios obtidos com o emprego de plantas selecionadas por apresentar baixa recalcitrância e como a eficiência de cada pré-tratamento pode ser maximizada a partir do emprego destas plantas (AU).
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
2014 - 2016
FAPESP - Auxílio Regular: Integrated enzyme discovery and pathway optimisation for bagase valorisation
Descrição: Esta proposta de auxílio FAPPA permitirá o estabelecimento de esforços em colaboração entre pesquisadores do Estado de São Paulo (Centro Nacional de Pesquisa e Energia e Materiais e Instituto de Física de São Carlos da USP) e do Reino Unido (Universidade de Manchester e Warwick) para o desenvolvimento de um projeto de pesquisa na área de biotecnologia aplicada. Nesta proposta de pesquisa pretende-se combinar abordagens metagenômicas para descoberta de biocatalizadores, com princípios de biologia sintética, visando a valoração de materiais agrícolas de baixo custo, como a lignina de bagaço de cana-de- açúcar. Os objetivos desta proposta de pesquisa incluem: i) desenvolver abordagens metagenômicas para descoberta enzimas envolvidas na bioconversão de lignina, ii) avaliar a capacidade de peroxidases bacterianas para o tratamento de lignina de bagaço de cana, iii) integrar vias metabólicas de conversão da lignina em um hospedeiro chassi apropriado utilizando princípios de biologia sintética, iv) avaliar este sistema enzimático em regimes de fermentação em alta densidade, junto com estudos compreensivos de bioprocessos e a otimização do fluxo metabólico. Neste sentido, como resultado das atividades propostas neste projeto FAPPA, pretende-se apresentar uma prova de conceito de bioconversão e valorização da lignina. Além disso, este projeto deve alavancar pesquisas em cooperação entre grupos do Estado de São Paulo e Reino Unido..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Doutorado: (1) .
Integrantes: Fabio Marcio Squina - Coordenador.
2012 - 2014
CNPQ Produtividade: Desenvolvimento de uma Coleção de Enzimas Envolvidas na Bioconversão da Biomassa Lignocelulósica
Descrição: O foco central desta proposta de pesquisa é consolidar Aspergillus nidulans (linhagem A773) como um modelo rápido e estável para expressão e secreção heteróloga de proteínas recombinantes. Comparando-se com outros sistemas disponíveis para expressão de proteínas heterólogas, em culturas líquidas, os fungos filamentosos apresentam ótima performance, alto rendimento e uma opção pouco onerosa, com relação aos requerimentos nutricionais. Este apelo pelos fungos filamentosos como plataforma para expressão de proteínas recombinantes, também é baseada em sua habilidade natural em secretar grandes quantidades de proteínas para o meio de cultivo. Neste sentido, nosso objetivo é desenvolver uma coleção de linhagens aptas a super-expressar diversas atividades enzimáticas envolvidas na degradação de polissacarídeos da parede celular de plantas. Além de estudar as propriedades funcionais das atividades enzimáticas, com amplas aplicações biotecnológicas, que incluem estratégias para produção de bioetanol, também pretendemos fazer usos de estratégias de biologia molecular para desenvolver linhagens super-expressando concomitantemente duas ou mais atividades enzimáticas sinérgicas..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
2011 - 2013
CNPq Universal 1: O Estabelecimento de Aspergillus nidulans como modelo para Expressão Proteínas Recombinantes
Descrição: O aproveitamento de recursos renováveis trata-se de uma área estratégica do conhecimento. Atualmente estudos nesta linha se apresentam como uma grande oportunidade para inovação e desenvolvimento tecnológico para o nosso País, haja vista não somente a intensa pressão política, econômica e ambiental no sentido do desenvolvimento de tecnologias ?verdes? (limpas) e sustentáveis, com também as milhões de toneladas de resíduos ligninocelulósicos produzidas anualmente advindos de agroindústrias. Atualmente através da biotecnologia, podemos propor rotas tecnológicas para agregar valor a esses resíduos, que irão deixar de ser um problema ambiental para se tornarão matérias-primas para indústrias de alimentos, farmacêuticas e para produção biocombustíveis. Tradicionalmente o bagaço de cana é queimado nas usinas para produção de eletricidade, mas as usinas ainda possuem um excedente de pelo menos cerca de 10% da biomassa que não é utilizado. Desta maneira, fica evidente que o aproveitamento destes resíduos para a geração de produtos com maior valor agregado é uma necessidade nacional. A dificuldade em converter do bagaço de cana-de-açúcar e outros materiais lignocelulósicos em biocombustíveis, insumos químicos e outros compostos biologicamente ativos começa pela à morfologia da parede celular das plantas superiores. A parede celular é uma estrutura complexa composta por polissacarídeos, principalmente cellulose e hemicelulose, que correspondem a 70-75% de sua massa seca, além de proteínas, compostos fenólicos e sais minerais. Além disso, a bioconversão de material lignocelulósico demanda um grande número de atividades enzimáticas. Enquanto a hidrólise enzimática da celulose envolve a ação sinergística de pelo menos 3 enzimas, endoglucanase, exoglucanase ou celobiohidrolase, e b-glucosidase, o segundo componente em maior abundância na parede cellular de plantas, a hemicelulose, demanda um número muito maior de enzimas. As hemiceluloses são classificadas de acordo com o açúcar.
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) .
Integrantes: Fabio Marcio Squina - Coordenador.Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
2010 - 2011
FAPESP Auxílio Pesquisa Professor Visitante: Biologia de Sistemas das Interações Microbianas na Decomposição do Bagaço de cana
Descrição: O foco deste projeto é esmiuçar a metamicrobiota de solo envolvida na degradação da biomassa de cana de açúcar, com o objetivo de este conhecimento dos sistemas biológicos de metamicrobiota para o desenvolvimento de coquetéis enzimáticos para degradação da biomassa vegetal..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
2009 - 2014
FAPESP Programa Jovens Pesquisadores em Centros Emergentes: Library Generation For Biomass-Conversion Enzymes From Soil Metagenome
Descrição: The gradual shift from petroleum to renewable biomass resources is generally seen as an important contribution to the development of a sustainable industrial society and the effective management of green house emissions. Lignocellulosic materials, such as agricultural and forestry residues, are an abundant and low-cost source of stored energy in the biosphere. Nowadays, biomass conversion into feedstock sugars has moved towards the forefront of the biofuel industry. However, the saccharification of plant biomass is a complicated and lengthy process, mainly due to the inherent recalcitrance and the complex heterogeneity of the polymers comprising plant cell walls. Lignocellulosic biomass must go through an intensive pretreatment step, after which enzymes are used to break down the polysaccharides biomass into simple sugar suitable for fermentation and ethanol production. Likewise, enzymatic conversion of cellulose and hemicellulose into simple sugar is also a demanding task, where a consortium of enzymes is needed for complete saccharification of these polysaccharides. Aiming at the entire exploitation of the plant cell wall polysaccharides, as an environmentally renewable energy source, an extensive repertoire of hydrolytic enzymes would play a major role for biofuel production. The objective of this proposal is the generation of a toolkit of lignocellulolytic enzymes with a wide range of biotechnological applications, including their use as players for the development of strategies for second generation ethanol production. The prospection of these enzymes will be done from soil metagenome, which contemplates a pioneering strategy towards the prospection of biomass conversion enzymes from microorganisms not conventionally cultivable. Additionally, this study may intensively contribute to the development of the field of bioenergy by improving techniques in rapid detection of hydrolysis using capillary electrophoresis and implementing heterologous gene expression in f.
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Mestrado acadêmico: (4) / Doutorado: (5) .
Integrantes: Fabio Marcio Squina - Coordenador.Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
2007 - 2008
Pos-Doutorado 2: Gene Library Generation for Biomass-Conversion Enzymes
Descrição: Enzymatic degradation of biomass is a complicated and lengthy process, taking a multitude of microbes and enzymes years to accomplish in the natural environment. As biomass conversion to feedstock sugars continues to move towards the fore-front of the biofuels industry, an overriding barrier is the inherent recalcitrance of biomass. Much of this resistance to degradation is intrinsic to the complex heterogeneity in the polymers comprising plant cell walls. The objective of this project is to provide cloned genes for heterologous expression system, such as bacteria, yeast, and filamentous fungi, of variety of enzyme activities needed to hydrolyzed native and variably pretreated biomass..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
2005 - 2007
Pos-Doutorado 1: Regulação da expressão gênica no fungo Neurospora crassa em resposta ao nível de fosfato e ao pH ambiente sob controle do gene nuc-1
Descrição: O controle da expressão gênica em resposta ao estresse celular é essencial para adaptabilidade e sobrevivência de qualquer organismo. Apesar do progresso no entendimento dos mecanismos adaptativos em fungos, desencadeados por alterações na concentração de fosfato e no pH ambiente, estes processos ainda não foram completamente esclarecidos. Assim, este projeto tem como objetivo o entendimento de alguns aspectos da regulação da expressão gênica em N. crassa, envolvidos no sistema de controle dos níveis de fosfato inorgânico (Pi) e do pH, a partir da identificação de genes diferencialmente expressos. Como estratégia, serão criadas bibliotecas subtrativas de cDNA utilizando a linhagem selvagem e o mutante RIP (repeat-induced point mutantion) do gene nuc-1. A avaliação do nível de expressão de genes na linhagem selvagem em diferentes condições de cultivo, como por exemplo em pH ácido ou alcalino e em concentrações de fosfato limitante ou suficiente, permitirá a caracterização das vias metabólicas envolvidas neste sistema adaptativo sob controle do gene nuc-1. Facilitado pelo projeto genoma (http://www.fgsc.net), estes experimentos, além de ampliar o nosso conhecimento dos processos ativados ou reprimidos nestes circuitos regulatórios, apresentarão novos alvos para nocaute gênico e posterior análise funcional dos mutantes, que pode ser feita, por exemplo, através da analise estrutural de enzimas secretadas ou pela avaliação da expressão de proteínas de choque térmico.
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
2001 - 2005
Doutorado: Nocaute sistemático de genes em Leishmania spp: utilização do sistema mariner Mos1 de transposição in vitro
Descrição: O recente seqüenciamento do genoma de vários organismos vem deslocando o enfoque da pesquisa genômica para estudos de função e localização celular de genes desconhecidos. As estratégias tradicionais que permitem entender a função e a correlação entre genes, utilizando a informação contida na seqüência genômica, são limitadas e laboriosas. A proposta deste projeto foi utilizar do sistema mariner Mos1 de transposição in vitro, como fonte de reagentes para uma estratégia de nocaute gênico sistemático do genoma de Leishmania major. Tais reagentes são fragmentos lineares de DNA que contêm uma marca de seleção flanqueada pelas regiões 5?e 3? de genes do parasita. Por recombinação homóloga no genoma, estes fragmentos irão mediar a obtenção de mutantes, que são ferramentas valiosas na dissecção genética que qualquer organismo..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Doutorado: (1) .
Integrantes: Fabio Marcio Squina - Integrante / Luiz Ricardo Orsini Tosi - Coordenador.Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Número de produções C, T & A: 29
1999 - 2001
Mestrado: Produção de Carotenóides por Linhagens de Levedura
Descrição: Os carotenóides compõem um grupo de pigmentos naturais amplamente distribuídos na natureza com grande diversidade de estruturas e funções. O interesse pelos carotenóides tem aumentado consideravelmente nos últimos anos pela evidência dos seus já conhecidos benefícios à saúde humana, por suas propriedades antimutagênicas, anticarcinogênicas e também atividade imunomodulatória. O fato de muitos animais com importância econômica conterem carotenóides e os requererem como nutrientes, faz destes pigmentos industrialmente importantes como componentes de rações para aves e para peixes e crustáceos. As principais fontes industriais de carotenóides são a síntese química e a extração a partir de plantas. Porém, são poucos os carotenóides que possuem métodos economicamente eficientes de produção e existe uma potencial demanda para carotenóides como licopeno, luteína, zeaxantina, cantaxantina, astaxantina, rodoxantina e toruleno. Os processos biotecnológicos apresentam-se como uma alternativa em potencial para obtenção destes pigmentos, sendo que, este tipo de fonte natural pode suprir uma proporção significativa dos pigmentos usados industrialmente como corantes ou como nutrientes. O objetivo deste projeto será determinar a composição de carotenóides de diferentes linhagens de Rhodotorula e avaliar a influência de diversos parâmetros de cultivo visando um aumento na produção desses pigmentos ..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) .
Integrantes: Fabio Marcio Squina - Integrante / Adriana Z. Mercadante - Coordenador.Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.
Número de produções C, T & A: 8
1997 - 1998
Iniciação Científica: Seleção de compostos oriundos de plantas com capacidade de alterar o crescimento apical e/ou a ramificação de Neurospora crassa
Descrição: Os fungos crescem pela ponta de sua estrutura vegetativa dominante, as hifas. Este processo é característico do Reino Fungi, mas os mecanismos que o regulam são pouco conhecidos apesar de sua grande importância. Diversas funções estão correlacionadas ao crescimento apical, como: a secreção de substâncias e absorção de nutrientes, a morfogênese, o reconhecimento do meio externo, a reprodução e o crescimento da hifa. Uma classe de substâncias de grande interesse neste estudo são os compostos fenólicos de origem vegetal, tal como o ácido cinâmico, ácido caféico, ácido ferúlico e o álcool coniferil. Todos estes compostos na planta tem uma origem biossintética comum através da via do ácido chiquímico. Este projeto tem por objetivo estudar aspectos do crescimento apical e da ramificação do fungo filamentoso Neurospora crassa, visando um melhor entendimento deste processo, o que permitiria o desenvolvimento de estratégias mais eficazes para controlar o crescimento de fungos quando indesejáveis, como no caso de fitopatogenicidades. Neste projeto, compostos considerados inibidores do crescimento, como os composto fenólicos de origem vegetal ou outros, foram testados quanto sua capacidade de alterar a morfologia e ou inibir germinação e crescimento vegetativo de Neurospora crassa, quando suplementados ao meio de cultivo. Os objetivos deste projeto foram: 1) Investigar as alterações morfológicas e o crescimento que o ácido cinâmico, ácido caféico, ácido ferúlico e o álcool coniferil induzem se usadas separadamente ou juntas. 2) Tentar isolar mutantes resistentes aos compostos em estudo. 3) Investigar o efeito destes compostos sobre a morfologia e o crescimento de mutantes morfológicos de N. crassa como ipa. cot-1, scr e crisp.
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) .
Integrantes: Fabio Marcio Squina - Integrante / Suraia Said - Coordenador.Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.
Número de produções C, T & A: 3


Projetos de desenvolvimento


2013 - 2017
ENCOMENDA TRANSVERSAL DE PROJETO DE PESQUISA PAISS : Desenvolvimento de plataforma tecnológica multifuncional visando obtenção de energia e nutrientes da biomassa vegetal
Descrição: ENCOMENDA TRANSVERSAL DE PROJETO DE PESQUISA - PAISS, envolvendo a participação de mais 20 profissionais do CTBE e da Elly Lilly, incluido pesquisadores e técnicos de desenvolvimento especializado e pessoal administrativo. http://www.jusbrasil.com.br/diarios/58963474/dou-secao-3-11-09-2013-pg-13.
Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento.


Revisor de periódico


2009 - 2013
Periódico: Brazilian Journal of Microbiology (Impresso)
2010 - 2011
Periódico: Enzyme and Microbial Technology
2010 - Atual
Periódico: Biochimica et Biophysica Acta. Proteins and Proteomics
2012 - 2012
Periódico: Journal of the Brazilian Chemical Society (Impresso)
2012 - 2012
Periódico: African Journal of Biotechnology
2012 - 2012
Periódico: Antonie Van Leeuwenhoek (Dordrecht. Online)
2012 - 2012
Periódico: Protein and Peptide Letters
2013 - 2013
Periódico: International Biodeterioration & Biodegradation
2013 - 2013
Periódico: Journal of Molecular Catalysis. B, Enzymatic (Print)
2013 - 2013
Periódico: BMC Biotechnology (Online)
2012 - Atual
Periódico: BioEnergy Research
2011 - 2014
Periódico: Process Biochemistry (1991)
2013 - Atual
Periódico: Journal of Molecular Catalysis. B, Enzymatic (Print)
2013 - 2014
Periódico: Journal of Proteome Research (Online)
2013 - Atual
Periódico: Plos One
2013 - 2013
Periódico: Journal of the American Chemical Society
2014 - Atual
Periódico: Bioresource Technology
2013 - 2013
Periódico: Critical Reviews in Microbiology
2011 - 2013
Periódico: Process Biochemistry (1991)
2012 - Atual
Periódico: BMC Genomics
2014 - 2014
Periódico: Molecules (Basel. Online)
2014 - 2014
Periódico: Journal of Industrial Microbiology & Biotechnology
2014 - Atual
Periódico: Fungal Genetics and Biology (Print)
2015 - Atual
Periódico: Applied and Environmental Microbiology (Print)
2015 - Atual
Periódico: Food Chemistry
2015 - Atual
Periódico: Naturwissenschaften
2015 - Atual
Periódico: International Journal of Biological Macromolecules
2013 - Atual
Periódico: Biotechnology for Biofuels
2017 - Atual
Periódico: BBA General Subjects


Revisor de projeto de fomento


2009 - Atual
Agência de fomento: Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Enzimologia.
2.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.
3.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.
4.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica.
5.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Morfologia / Subárea: Biologia Celular.


Idiomas


Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Francês
Compreende RazoavelmenteLê Pouco.
Espanhol
Compreende RazoavelmenteLê Pouco.


Prêmios e títulos


2016
Prêmio Prêmio Professor Arikerne Sucupira para o aluno Robson Tramontina de melhor trabalho VI Encontro da Escola Brasileira de Química Verde, Associação Brasileira de Química.
2016
Menção Honrosa - Melhor Trabalho apresentado no Encontro de Biociências da UNICAMP., ograma de Pós graduação em Biociências e tecnologia de produtos bioativos (BTPB-IB-UNICAMP).
2016
Seleção para apresentação oral de trabalho do Doutorando João Paulo Franco Cairo no 36th Symposium on Biotechnology for Fuels and Chemicals, Society for Industrial Microbiology and Biotechnology - USA.
2016
Seleção para apresentação oral de trabalho da Doutoranda Lívia B. Brenelli de Paivano 36th Symposium on Biotechnology for Fuels and Chemicals, ociety for Industrial Microbiology and Biotechnology - USA..
2014
Seleção para apresentação oral de trabalho do Doutorando João Paulo Franco Cairo no 34th Symposium on Biotechnology for Fuels and Chemicals, Society for Industrial Microbiology and Biotechnology.
2014
Melhor Tese de Doutorado 2014 para a aluna Thabata Maria Alvarez do Programa de Pós-Graduacao de Biologia Funcional e Molecular, Instituto de Biologia da UNICAMP.
2014
Seleção para apresentação oral de trabalho e subsídio financeiro para participação da Doutoranda Lívia B. Brenelli de Paiva no 2nd Brazil-Danish Workshop for Biorefineries, University of Copenhegen - Denmark.
2014
Seleção para apresentação oral de trabalho e subsídio financeiro para participação do Doutorando João Paulo Franco Cairo no 2nd Brazil-Danish Workshop for Biorefineries, University of Copenhegen - Denmark.
2013
Seleção para apresentação oral de trabalho do pós doutorando André Damásio na Gordon Conference on Cellulosomes, Cellulases & Other Carbohydrate Modifying Enzymes., Gordon Conference.
2012
Premio Auxílio-viagem para a Doutoranda Thabata Maria Alvarez participar do14th International Symposium on Microbial Ecology, Copenhagen na Dinamarca, International Society for Microbial Ecology.
2012
Seleção para apresentação oral de trabalho do Doutorando João Paulo Franco Cairo no 14th International Symposium on Microbial Ecology, ISME14., International Society for Microbial Ecology.
2011
Prêmio Pós-Graduação para Thabata Maria Alvarez de melhor trabalho Workshop do programa de Biologia Funcional e Molecular (BFM), Biologia Funcional e Molecular (BFM)- UNICAMP.
2004
Prêmio ZIGMAN BRENER, Sociedade Brasileira de Protozoologia.
2004
Selecionado pelo comitê científico do TriTryp Genomes Meeting com o prêmio de subsídio financeiro para participação no TRITRYP Genomes Meeting 2004 em Seattle EUA, Seattle Biomedical Research Institute.


Produções



Produção bibliográfica
Citações

Web of Science
Total de trabalhos:115
Total de citações:1088
Fator H:20
Squina, Fabio M  Data: 10/09/2018

SCOPUS
Total de trabalhos:102
Total de citações:1110
Squina, Fabio M. Squina, => h Index: 20 (Author ID: 6506059403)  Data: 25/05/2018

Outras
Total de trabalhos:136
Total de citações:1669
Fabio Squina - Google Scholar; h-index:25 ; i10-index:58 (https://scholar.google.com.br/citations?user=0ZC_17wAAAAJ&hl=pt-BR)  Data: 10/09/2018

Artigos completos publicados em periódicos

1.
BRENELLI, LÍVIA2018BRENELLI, LÍVIA ; Squina, Fabio M. ; FELBY, CLAUS ; CANNELLA, DAVID . Laccase-derived lignin compounds boost cellulose oxidative enzymes AA9. Biotechnology for Biofuels, v. 11, p. 10, 2018.

2.
DE SOUZA, WAGNER R.2018DE SOUZA, WAGNER R. MARTINS, POLYANA K. FREEMAN, JACKIE PELLNY, TILL K. MICHAELSON, LOUISE V. SAMPAIO, BRUNO L. VINECKY, FELIPE RIBEIRO, ANA P. DA CUNHA, BARBARA A. D. B. KOBAYASHI, ADILSON K. DE OLIVEIRA, PATRICIA A. CAMPANHA, RAQUEL B. PACHECO, THÁLYTA F. MARTARELLO, DANIELLY C. I. MARCHIOSI, ROGÉRIO FERRARESE-FILHO, OSVALDO DOS SANTOS, WANDERLEY D. Tramontina, Robson Squina, Fabio M. CENTENO, DANILO C. GASPAR, MARÍLIA BRAGA, MARCIA R. TINÉ, MARCO A. S. RALPH, JOHN MITCHELL, ROWAN A. C. , et al.MOLINARI, HUGO B. C. ; Suppression of a single BAHD gene in Setaria viridis causes large, stable decreases in cell wall feruloylation and increases biomass digestibility. NEW PHYTOLOGIST, v. X, p. X, 2018.

3.
MAINARDI, PEDRO H.2018MAINARDI, PEDRO H. ; FEITOSA, VALKER A. ; BRENELLI DE PAIVA, LIVIA B. ; BONUGLI-SANTOS, RAFAELLA C. ; Squina, Fabio M. ; PESSOA, ADALBERTO ; SETTE, LARA D. . Laccase production in bioreactor scale under saline condition by the marine-derived basidiomycete Peniophora sp. CBMAI 1063. Fungal Biology, v. X, p. X, 2018.

4.
GRANJA-TRAVEZ, ROMMEL SANTIAGO2018GRANJA-TRAVEZ, ROMMEL SANTIAGO ; WILKINSON, RACHAEL C. ; FELIX PERSINOTI, GABRIELA ; Squina, Fabio M. ; FÜLÖP, VILMOS ; BUGG, TIMOTHY D.H. . Structural and Functional Characterisation of Multi-copper Oxidase CueO from Lignin-Degrading Bacterium Ochrobactrum sp. Reveal its Activity towards Lignin Model Compounds and Lignosulfonate. FEBS Journal, v. X, p. X, 2018.

5.
MORAES, E. C.2018MORAES, E. C. ; Alvarez, Thabata Maria ; PERSINOTI, GABRIELA FELIX ; TOMAZETTO, G. ; BRENELLI, L.B. ; PAIXÃO, D. A. A. ; EMATSU, G. C. ; ARICETTI, J. A. ; CALDANA, C. ; DIXON, N. ; BUGG, T. D. H. ; SQUINA, FÁBIO MÁRCIO . Lignolytic-consortium omics analyses reveal novel genomes and pathways involved in lignin modification and valorization. Biotechnology for Biofuels, v. 11, p. 1, 2018.

6.
PERSINOTI, GABRIELA F.2018PERSINOTI, GABRIELA F. ; PAIXÃO, DOUGLAS A. A. ; BUGG, TIMOTHY D. H. ; Squina, Fabio M. . Genome Sequence of , a Lignin-Degrading Bacterium Isolated from Municipal Solid Waste Soil. GENOME ANNOUNCEMENTS, v. 6, p. e00353-18, 2018.

7.
DA SILVA MENEZES, BRUNA2018DA SILVA MENEZES, BRUNA ; ROSSI, DANIELE MISTURINI ; SQUINA, FABIO ; AYUB, MARCO ANTÔNIO ZÁCHIA . Comparative production of xylanase and the liberation of xylooligosaccharides from lignocellulosic biomass by BLf1 and recombinant XynC A773. INTERNATIONAL JOURNAL OF FOOD SCIENCE AND TECHNOLOGY, v. X, p. X, 2018.

8.
SCHNEIDER, WILLIAN DANIEL HAHN2018SCHNEIDER, WILLIAN DANIEL HAHN ; GONÇALVES, THIAGO AUGUSTO ; UCHIMA, CRISTIANE AKEMI ; REIS, LAÍSA DOS ; FONTANA, ROSELEI CLAUDETE ; Squina, Fabio Marcio ; DILLON, ALDO JOSÉ PINHEIRO ; CAMASSOLA, MARLI . Comparison of the production of enzymes to cell wall hydrolysis using different carbon sources by Penicillium echinulatum strains and its hydrolysis potential for lignocelullosic biomass. PROCESS BIOCHEMISTRY, v. 66, p. 162-170, 2018.

9.
DA SILVA MENEZES, BRUNA2018DA SILVA MENEZES, BRUNA ; ROSSI, DANIELE MISTURINI ; SQUINA, FABIO ; AYUB, MARCO ANTÔNIO ZÁCHIA . Xylooligosaccharides production by fungi cultivations in rice husk and their application as substrate for lactic acid bacteria growth. Bioresource Technology Reports, v. 2, p. 100-106, 2018.

10.
PEREIRA, GABRIELA FEIX2018PEREIRA, GABRIELA FEIX ; DE BASTIANI, DANIELA ; GABARDO, SABRINA ; SQUINA, FABIO ; AYUB, MARCO ANTÔNIO ZÁCHIA . Solid-state cultivation of recombinant Aspergillus nidulans to co-produce xylanase, arabinofuranosidase, and xylooligosaccharides from soybean fibre. BIOCATALYSIS AND AGRICULTURAL BIOTECHNOLOGY, v. X, p. X-X, 2018.

11.
The CAZypedia Consortium2018The CAZypedia Consortium. Ten years of CAZypedia: a living encyclopedia of carbohydrate-active enzymes. GLYCOBIOLOGY, v. 28, p. 3-8, 2018.

12.
DE MELO, RICARDO RODRIGUES2018DE MELO, RICARDO RODRIGUES ; TOMAZETTO, GEIZECLER ; PERSINOTI, GABRIELA FELIX ; SATO, HÉLIA HARUMI ; Ruller, Roberto ; Squina, Fabio Marcio . Unraveling the cellulolytic and hemicellulolytic potential of two novel Streptomyces strains. ANNALS OF MICROBIOLOGY, v. X, p. X-X, 2018.

13.
MOREIRA, EDIMAR A.2018MOREIRA, EDIMAR A. ; Alvarez, Thabata M. ; PERSINOTI, GABRIELA F. ; PAIXÃO, DOUGLAS ANTONIO ALVAREDO ; MENEZES, LETÍCIA R. ; CAIRO, JOÃO P. FRANCO ; Squina, Fabio Marcio ; COSTA-LEONARDO, ANA M. ; CARRIJO, TIAGO ; ARAB, ALBERTO . Microbial Communities of the Gut and Nest of the Humus- and Litter-Feeding Termite Procornitermes araujoi (Syntermitinae). CURRENT MICROBIOLOGY, v. X, p. X, 2018.

14.
FUESS, LUCAS TADEU2017FUESS, LUCAS TADEU ; KIYUNA, LUMA SAYURI MAZINE ; FERRAZ, ANTÔNIO DJALMA NUNES ; PERSINOTI, GABRIELA FELIX ; Squina, Fabio Marcio ; GARCIA, MARCELO LOUREIRO ; ZAIAT, MARCELO . Thermophilic two-phase anaerobic digestion using an innovative fixed-bed reactor for enhanced organic matter removal and bioenergy recovery from sugarcane vinasse. Applied Energy, v. 189, p. 480-491, 2017.

15.
Tramontina, Robson2017Tramontina, Robson ; FRANCO CAIRO, JOÃO PAULO L. ; LIBERATO, MARCELO V. ; MANDELLI, FERNANDA ; SOUSA, AMANDA ; SANTOS, SAMANTHA ; RABELO, SARITA CÂNDIDA ; CAMPOS, BRUNA ; IENCZAK, JACIANE ; Ruller, Roberto ; DAMÁSIO, ANDRÉ R. L. ; Squina, Fabio Marcio . The Coptotermes gestroi aldo-keto reductase: a multipurpose enzyme for biorefinery applications. Biotechnology for Biofuels, v. 10, p. 4, 2017.

16.
Segato, Fernando2017Segato, Fernando ; DIAS, BRUNO ; BERTO, GABRIELA L. ; DE OLIVEIRA, DYONI M. ; DE SOUZA, FLÁVIO H.M. ; DA SILVA, MATHEUS AUGUSTO R.N. ; CITADINI, ANA PAULA ; Murakami, Mario T. ; Damásio, André R.L. ; SQUINA, FÁBIO MÁRCIO ; Polikarpov, Igor . Cloning, heterologous expression and biochemical characterization of a non-specific endoglucanase family 12 from Aspergillus terreus NIH2624. Biochimica et Biophysica Acta. Proteins and Proteomics, v. X, p. X, 2017.

17.
MELO, RICARDO RODRIGUES DE2017MELO, RICARDO RODRIGUES DE ; PERSINOTI, GABRIELA FELIX ; PAIXÃO, DOUGLAS ANTONIO ALVAREDO ; SQUINA, FÁBIO MÁRCIO ; Ruller, Roberto ; SATO, HELIA HARUMI . Draft genome sequence of Streptomyces sp. strain F1, a potential source for glycoside hydrolases isolated from Brazilian soil. Brazilian Journal of Microbiology (Impresso), v. X, p. X-X, 2017.

18.
DE VRIES, RONALD P.2017DE VRIES, RONALD P. RILEY, ROBERT WIEBENGA, AD AGUILAR-OSORIO, GUILLERMO AMILLIS, SOTIRIS UCHIMA, CRISTIANE AKEMI ANDERLUH, GREGOR ASADOLLAHI, MOJTABA ASKIN, MARION BARRY, KERRIE BATTAGLIA, EVY BAYRAM, ÖZGÜR BENOCCI, TIZIANO BRAUS-STROMEYER, SUSANNA A. CALDANA, CAMILA CÁNOVAS, DAVID CERQUEIRA, GUSTAVO C. CHEN, FUSHENG CHEN, WANPING CHOI, CINDY CLUM, ALICIA DOS SANTOS, RENATO AUGUSTO CORRÊA DAMÁSIO, ANDRÉ RICARDO DE LIMA DIALLINAS, GEORGE EMRI, TAMÁS , et al.FEKETE, ERZSÉBET FLIPPHI, MICHEL FREYBERG, SUSANNE GALLO, ANTONIA GOURNAS, CHRISTOS HABGOOD, ROB HAINAUT, MATTHIEU HARISPE, MARÍA LAURA HENRISSAT, BERNARD HILDÉN, KRISTIINA S. HOPE, RYAN HOSSAIN, ABEER KARABIKA, EUGENIA KARAFFA, LEVENTE KARÁNYI, ZSOLT KRA?EVEC, NADA KUO, ALAN KUSCH, HARALD LABUTTI, KURT LAGENDIJK, ELLEN L. LAPIDUS, ALLA LEVASSEUR, ANTHONY LINDQUIST, ERIKA LIPZEN, ANNA LOGRIECO, ANTONIO F. MACCABE, ANDREW MÄKELÄ, MIIA R. MALAVAZI, IRAN MELIN, PETTER MEYER, VERA MIELNICHUK, NATALIA MISKEI, MÁRTON MOLNÁR, ÁKOS P. MULÉ, GIUSEPPINA NGAN, CHEW YEE OREJAS, MARGARITA OROSZ, ERZSÉBET OUEDRAOGO, JEAN PAUL OVERKAMP, KARIN M. PARK, HEE-SOO PERRONE, GIANCARLO PIUMI, FRANCOIS PUNT, PETER J. RAM, ARTHUR F. J. RAMÓN, ANA RAUSCHER, STEFAN RECORD, ERIC RIAÑO-PACHÓN, DIEGO MAURICIO ROBERT, VINCENT RÖHRIG, JULIAN Ruller, Roberto SALAMOV, ASAF SALIH, NADHIRA S. SAMSON, ROB A. SÁNDOR, ERZSÉBET SANGUINETTI, MANUEL SCHÜTZE, TABEA SEPč SHELEST, EKATERINA SHERLOCK, GAVIN SOPHIANOPOULOU, VICKY Squina, Fabio M. SUN, HUI SUSCA, ANTONIA TODD, RICHARD B. TSANG, ADRIAN UNKLES, SHIELA E. VAN DE WIELE, NATHALIE VAN ROSSEN-UFFINK, DIANA OLIVEIRA, JULIANA VELASCO DE CASTRO VESTH, TAMMI C. VISSER, JAAP YU, JAE-HYUK ZHOU, MIAOMIAO ANDERSEN, MIKAEL R. ARCHER, DAVID B. BAKER, SCOTT E. BENOIT, ISABELLE BRAKHAGE, AXEL A. BRAUS, GERHARD H. FISCHER, REINHARD FRISVAD, JENS C. GOLDMAN, GUSTAVO H. HOUBRAKEN, JOS OAKLEY, BERL PÓCSI, ISTVÁN SCAZZOCCHIO, CLAUDIO SEIBOTH, BERNHARD VANKUYK, PATRICIA A. WORTMAN, JENNIFER DYER, PAUL S. GRIGORIEV, IGOR V. ; Comparative genomics reveals high biological diversity and specific adaptations in the industrially and medically important fungal genus Aspergillus. GENOME BIOLOGY, v. 18, p. X, 2017.

19.
PIMENTEL, AGNES C.2017PIMENTEL, AGNES C. ; EMATSU, GABRIELA C.G. ; LIBERATO, MARCELO V. ; PAIXÃO, DOUGLAS A.A. ; CAIRO, JOÃO PAULO L.FRANCO ; MANDELLI, FERNANDA ; Tramontina, Robson ; GANDIN, CÉSAR A. ; NETO, MARIO DE OLIVEIRA ; Squina, Fabio M. ; Alvarez, Thabata M. . BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL PROPERTIES OF A METAGENOME-DERIVED GH5 ENDOGLUCANASE DISPLAYING AN UNCONVENTIONAL DOMAIN ARCHITECTURE. International Journal of Biological Macromolecules, v. x, p. x-x, 2017.

20.
ARAÚJO, JUSCEMÁCIA N.2017ARAÚJO, JUSCEMÁCIA N. ; TOFANELLO, ARYANE ; DA SILVA, VIVIAM M. ; SATO, JULIANA A.P. ; Squina, Fabio M. ; NANTES, ISELI L. ; GARCIA, WANIUS . Photobiosynthesis of stable and functional silver/silver chloride nanoparticles with hydrolytic activity using hyperthermophilic β-glucosidases with industrial potential. INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOLOGICAL MACROMOLECULES, v. 102, p. 84-91, 2017.

21.
MANDELLI, F.2017MANDELLI, F. ; COUGER, M. B. ; PAIXÃO, D. A. A. ; MACHADO, C. B. ; CARNIELLI, C. M. ; ARICETTI, J. A. ; POLIKARPOV, I. ; Prade, R. ; CALDANA, C. ; Paes Leme, A. F. ; MERCADANTE, A. Z. ; RIAÑO-PACHÓN, D. M. ; Squina, Fabio Marcio . Thermal adaptation strategies of the extremophile bacterium Thermus filiformis based on multi-omics analysis. EXTREMOPHILES, v. X, p. X, 2017.

22.
DA SILVA, VIVIAM M.2017DA SILVA, VIVIAM M. ; SATO, JULIANA A. P. ; ARAUJO, JUSCEMÁCIA N. ; Squina, Fabio M. ; MUNIZ, JOÃO R. C. ; RISKE, KARIN A. ; GARCIA, WANIUS . Systematic studies of the interactions between a model polyphenol compound and microbial β-glucosidases. PLoS One, v. 12, p. e0181629, 2017.

23.
CONTESINI, FABIANO JARES2017CONTESINI, FABIANO JARES ; LIBERATO, MARCELO VIZONÁ ; RUBIO, MARCELO VENTURA ; CALZADO, FELIPE ; ZUBIETA, MARIANE PALUDETTI ; PACHÓN, DIEGO MAURICIO RIAÑO ; Squina, Fabio Marcio ; BRACHT, FABRICIO ; SKAF, MUNIR S. ; DAMÁSIO, ANDRÉ RICARDO . Structural and functional characterization of a highly secreted α-L-arabinofuranosidase (GH62) from Aspergillus nidulans grown on sugarcane bagasse. BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-PROTEINS AND PROTEOMICS, v. X, p. X, 2017.

24.
DAMASIO, A.2017DAMASIO, A. ; Ventura Rubio, Marcelo ; GONÇALVES, T. A. ; PERSINOTI, GABRIELA F. ; Segato, Fernando ; Prade, R. ; CONTESINI, FABIANO JARES ; SOUSA, AMANDA ; BUCKERIDGE, MARCOS ; SQUINA, F M . Xyloglucan breakdown by endo-xyloglucanase family 74 from Aspergillus fumigatus. APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY, v. 111, p. 2893, 2017.

25.
MENEZES, LETÍCIA2017MENEZES, LETÍCIA ; Alvarez, Thabata Maria ; PERSINOTI, GABRIELA FÉLIX ; FRANCO, JOÃO PAULO ; SQUINA, FÁBIO ; MOREIRA, EDIMAR AGNALDO ; ALVAREDO PAIXÃO, DOUGLAS ANTONIO ; Costa-Leonardo, Ana Maria ; DA SILVA, VINÍCIUS XAVIER ; CLERICI, MARIA TERESA PEDROSA SILVA ; ARAB, ALBERTO . Food Storage by the Savanna Termite Cornitermes cumulans (Syntermitinae): a Strategy to Improve Hemicellulose Digestibility?. MICROBIAL ECOLOGY (ONLINE), v. X, p. X, 2017.

26.
BRENELLI, LÍVIA BEATRIZ2016BRENELLI, LÍVIA BEATRIZ ; MANDELLI, FERNANDA ; MERCADANTE, ADRIANA ZERLOTTI ; ROCHA, GEORGE JACKSON DE MORAES ; ROCCO, SILVANA APARECIDA ; CRAIEVICH, ALDO FELIX ; GONÇALVES, ADILSON ROBERTO ; CENTENO, DANILO DA CRUZ ; de Oliveira Neto, Mario ; Squina, Fabio Marcio . Acidification treatment of lignin from sugarcane bagasse results in fractions of reduced polydispersity and high free-radical scavenging capacity. Industrial Crops and Products (Print), v. 83, p. 94-103, 2016.

27.
SOUZA, THAÍS V.2016SOUZA, THAÍS V. ; ARAUJO, JUSCEMÁCIA N. ; DA SILVA, VIVIAM M. ; LIBERATO, MARCELO V. ; PIMENTEL, AGNES C. ; Alvarez, Thabata M. ; Squina, Fabio M. ; GARCIA, WANIUS . Chemical stability of a cold-active cellulase with high tolerance toward surfactants and chaotropic agent. Biotechnology Reports, v. 9, p. 1-8, 2016.

28.
DA SILVA, VIVIAM M.2016DA SILVA, VIVIAM M. ; DE SOUZA, ANDERSON S. ; NEGRÃO, DJANIRA ; Polikarpov, Igor ; Squina, Fabio M. ; de Oliveira Neto, Mario ; MUNIZ, JOÃO R.C. ; GARCIA, WANIUS . Non-productive adsorption of bacterial β-glucosidases on lignins is electrostatically modulated and depends on the presence of fibronection type III-like domain. Enzyme and Microbial Technology, v. X, p. X, 2016.

29.
HOFFMAM, ZAIRA B.2016HOFFMAM, ZAIRA B. ; ZANPHORLIN, LETÍCIA M. ; Cota, Junio ; DIOGO, JOSÉ A. ; ALMEIDA, GABRIELA B. ; Damásio, André R.L. ; SQUINA, FABIO ; Murakami, Mario T. ; Ruller, Roberto . Xylan-specific carbohydrate-binding module belonging to family 6 enhances the catalytic performance of a GH11 endo-xylanase. New Biotechnology (Print), v. X, p. X, 2016.

30.
SCHNEIDER, WILLIAN DANIEL HAHN2016SCHNEIDER, WILLIAN DANIEL HAHN ; GONÇALVES, THIAGO AUGUSTO ; UCHIMA, CRISTIANE AKEMI ; COUGER, MATTHEW BRIAN ; PRADE, ROLF ; Squina, Fabio Marcio ; DILLON, ALDO JOSÉ PINHEIRO ; CAMASSOLA, MARLI . Penicillium echinulatum secretome analysis reveals the fungi potential for degradation of lignocellulosic biomass. Biotechnology for Biofuels, v. 9, p. 66, 2016.

31.
VALADARES, FERNANDA2016VALADARES, FERNANDA ; Gonçalves, Thiago A. ; GONÇALVES, DAYELLE S. P. O. ; Segato, Fernando ; ROMANEL, ELISSON ; MILAGRES, ADRIANE M. F. ; Squina, Fabio M. ; FERRAZ, ANDRÉ . Exploring glycoside hydrolases and accessory proteins from wood decay fungi to enhance sugarcane bagasse saccharification. Biotechnology for Biofuels, v. 9, p. 110, 2016.

32.
GOLDBECK, ROSANA2016GOLDBECK, ROSANA ; Gonçalves, Thiago A. ; Damásio, André R.L. ; BRENELLI, LÍVIA B. ; WOLF, LÚCIA D. ; PAIXÃO, DOUGLAS A.A. ; ROCHA, GEORGE J.M. ; Squina, Fabio M. . Effect of hemicellulolytic enzymes to improve sugarcane bagasse saccharification and xylooligosaccharides production. Journal of Molecular Catalysis. B, Enzymatic (Print), v. X, p. X, 2016.

33.
CALZADO, FELIPE2016CALZADO, FELIPE ; PRATES, ERICA T. ; Gonçalves, Thiago A. ; RUBIO, MARCELO V. ; ZUBIETA, MARIANE P. ; Squina, Fabio M. ; SKAF, MUNIR S. ; DAMÁSIO, ANDRÉ R. L. . Molecular basis of substrate recognition and specificity revealed in family 12 glycoside hydrolases. Biotechnology and Bioengineering (Print), v. X, p. X, 2016.

34.
SALAZAR, MARCELA MENDES2016SALAZAR, MARCELA MENDES ; GRANDIS, ADRIANA ; PATTATHIL, SIVAKUMAR ; NETO, JORGE LEPIKSON ; CAMARGO, EDUARDO LEAL OLIVEIRA ; ALVES, ANA ; RODRIGUES, JOSÉ CARLOS ; SQUINA, FABIO ; CAIRO, JOÃO PAULO FRANCO ; Buckeridge, Marcos S. ; HAHN, MICHAEL G. ; PEREIRA, GONÇALO AMARANTE GUIMARÃES . Eucalyptus Cell Wall Architecture: Clues for Lignocellulosic Biomass Deconstruction. BioEnergy Research, v. X, p. X, 2016.

35.
SANTOS, SAMANTHA CHRISTINE2016SANTOS, SAMANTHA CHRISTINE ; SOUSA, AMANDA SILVA DE ; DIONÍSIO, SUZANE RODRIGUES ; Tramontina, Robson ; Ruller, Roberto ; SQUINA, FABIO MÁRCIO ; ROSSELL, CARLOS EDUARDO VAZ ; COSTA, ALINE CARVALHO DA ; IENCZAK, JACIANE LUTZ . Bioethanol production by recycled Scheffersomyces stipitis in sequential batch fermentations with high cell density using xylose and glucose mixture. Bioresource Technology, v. X, p. X, 2016.

36.
RUBIO, MARCELO VENTURA2016RUBIO, MARCELO VENTURA ; ZUBIETA, MARIANE PALUDETTI ; FRANCO CAIRO, JOÃO PAULO LOURENÇO ; CALZADO, FELIPE ; PAES LEME, ADRIANA FRANCO ; Squina, Fabio Marcio ; Prade, Rolf Alexander ; DE LIMA DAMÁSIO, ANDRÉ RICARDO . Mapping N-linked glycosylation of carbohydrate-active enzymes in the secretome of Aspergillus nidulans grown on lignocellulose. Biotechnology for Biofuels, v. 9, p. 168, 2016.

37.
DE CASTRO, PATRÍCIA ALVES2016DE CASTRO, PATRÍCIA ALVES ; DOS REIS, THAILA FERNANDA ; DOLAN, STEPHEN K. ; MANFIOLLI, ADRIANA OLIVEIRA ; BROWN, NEIL ANDREW ; JONES, GARY W. ; DOYLE, SEAN ; RIAÑO-PACHÓN, DIEGO M. ; SQUINA, FÁBIO MÁRCIO ; CALDANA, CAMILA ; SINGH, ASHUTOSH ; DEL POETA, MAURIZIO ; HAGIWARA, DAISUKE ; SILVA-ROCHA, RAFAEL ; GOLDMAN, GUSTAVO H. . The SchA kinase modulates SakA MAP kinase activity and it is essential for virulence. Molecular Microbiology (Print), v. X, p. X-X, 2016.

38.
CAMPOS, BRUNA MEDEIA2016CAMPOS, BRUNA MEDEIA ; LIBERATO, MARCELO VIZONA ; Alvarez, Thabata Maria ; ZANPHORLIN, LETICIA MARIA ; EMATSU, GABRIELA CRISTINA ; BARUD, HERNANE ; Polikarpov, Igor ; Ruller, Roberto ; GILBERT, HARRY J. ; ZERI, ANA CAROLINA DE MATTOS ; Squina, Fabio Marcio . A novel carbohydrate-binding module from sugar cane soil metagenome featuring unique structural and carbohydrate affinity properties. The Journal of Biological Chemistry (Print), v. X, p. jbc.M116.744383-X, 2016.

39.
MANDELLI, F.2016MANDELLI, F. ; GONÇALVES, T. A. ; GANDIN, C. A. ; OLIVEIRA, A. C. P. ; OLIVEIRA NETO, M. ; SQUINA, F. M. . Characterization and Low-Resolution Structure of an Extremely Thermostable Esterase of Potential Biotechnological Interest from Pyrococcus furiosus. Molecular Biotechnology, v. X, p. X, 2016.

40.
FRANCO CAIRO, JOÃO P. L.2016FRANCO CAIRO, JOÃO P. L. ; CARAZZOLLE, MARCELO F. ; LEONARDO, FLÁVIA C. ; MOFATTO, LUCIANA S. ; BRENELLI, LÍVIA B. ; Gonçalves, Thiago A. ; UCHIMA, CRISTIANE A. ; DOMINGUES, ROMÊNIA R. ; Alvarez, Thabata M. ; Tramontina, Robson ; VIDAL, RAMON O. ; COSTA, FERNANDO F. ; COSTA-LEONARDO, ANA M. ; PAES LEME, ADRIANA F. ; PEREIRA, GONÇALO A. G. ; Squina, Fabio M. . Expanding the Knowledge on Lignocellulolytic and Redox Enzymes of Worker and Soldier Castes from the Lower Termite Coptotermes gestroi. Frontiers in Microbiology (Online), v. 7, p. 1-21, 2016.

41.
1 LABORATORY OF PLANT BIOCHEMISTRY, STATE UNIVERSITY OF MARINGÁ, MARINGÁ, PR, BRAZIL20161 LABORATORY OF PLANT BIOCHEMISTRY, STATE UNIVERSITY OF MARINGÁ, MARINGÁ, PR, BRAZIL ; M. DE OLIVEIRA, DYONI ; HUGO SALVADOR, VICTOR ; R. MOTA, THATIANE ; FINGER-TEIXEIRA, ALINE ; F. DE ALMEIDA, RODRIGO ; A. A. PAIXÃO, DOUGLAS ; P. DE SOUZA, AMANDA ; S. BUCKERIDGE, MARCOS ; MARCHIOSI, ROGÉRIO ; FERRARESE-FILHO, OSVALDO ; M. SQUINA, FABIO ; D. DOS SANTOS, WANDERLEY . Feruloyl esterase from Aspergillus clavatus improves xylan hydrolysis of sugarcane bagasse. AIMS Bioengineering, v. 4, p. 1-11, 2016.

42.
COTA, J.2015COTA, J. ; CORREA, T. L. ; DAMASIO, A. ; DIOGO, J. A. ; HOFFMAM, Z. B. ; GARCIA, WANIUS ; OLIVEIRA, L. C. ; PRADE, R. A. ; Squina, Fabio Marcio . Comparative analysis of three hyperthermophilic GH1 and GH3 family members with industrial potential. New Biotechnology (Print), v. 32, p. 13-20, 2015.

43.
DE OLIVEIRA, LEANDRO C.2015DE OLIVEIRA, LEANDRO C. ; DA SILVA, VIVIAM M. ; COLUSSI, FRANCIELI ; CABRAL, ALINE D. ; de Oliveira Neto, Mario ; Squina, Fabio M. ; GARCIA, WANIUS . Conformational Changes in a Hyperthermostable Glycoside Hydrolase: Enzymatic Activity Is a Consequence of the Loop Dynamics and Protonation Balance. Plos One, v. 10, p. e0118225, 2015.

44.
DIOGO, JOSÉ A.2015DIOGO, JOSÉ A. ; HOFFMAM, ZAIRA B. ; ZANPHORLIN, LETÍCIA M. ; Cota, Junio ; MACHADO, CARLA B. ; WOLF, LÚCIA D. ; SQUINA, FABIO ; Damásio, André R.L. ; Murakami, Mario T. ; Ruller, Roberto . Development of a chimeric hemicellulase to enhance the xylose production and thermotolerance. Enzyme and Microbial Technology, v. 69, p. 31-37, 2015.

45.
ROBL, DIOGO2015ROBL, DIOGO ; DOS SANTOS COSTA, PATRÍCIA ; BÜCHLI, FERNANDA ; DA SILVA LIMA, DEISE JULIANA ; DA SILVA DELABONA, PRISCILA ; Squina, Fabio Marcio ; PIMENTEL, IDA CHAPAVAL ; PADILLA, GABRIEL ; DA CRUZ PRADELLA, JOSÉ GERALDO . Enhancing of sugar cane bagasse hydrolysis by Annulohypoxylon stygium glycohydrolases. Bioresource Technology, v. 177, p. 247-254, 2015.

46.
MANDELLI, F.2015MANDELLI, F. ; RAMIRES, B. O. ; BRIAN COUGER, M. ; PAIXAO, DOUGLAS ANTONIO ALVAREDO ; CAMILO, C. M. ; POLIKARPOV, I. ; Prade, R. ; RIANO-PACHON, D. M. ; SQUINA, FÁBIO MARCIO . Draft Genome Sequence of the Thermophile ATCC 43280, Producer of Carotenoid-(Di)glucoside-Branched Fatty Acid (Di)esters and Source of Hyperthermostable Enzymes of Biotechnological Interest. Genome Announcements, v. 3, p. e00475-15, 2015.

47.
BORIN, GUSTAVO PAGOTTO2015BORIN, GUSTAVO PAGOTTO ; SANCHEZ, CAMILA CRISTINA ; DE SOUZA, AMANDA PEREIRA ; DE SANTANA, ELIANE SILVA ; DE SOUZA, ALINE TIEPPO ; LEME, ADRIANA FRANCO PAES ; Squina, Fabio Marcio ; BUCKERIDGE, MARCOS ; GOLDMAN, GUSTAVO HENRIQUE ; OLIVEIRA, JULIANA VELASCO DE CASTRO . Comparative Secretome Analysis of Trichoderma reesei and Aspergillus niger during Growth on Sugarcane Biomass. Plos One, v. 10, p. e0129275, 2015.

48.
MACHADO, CARLA BOTELHO2015MACHADO, CARLA BOTELHO ; CITADINI, ANA PAULA ; GOLDBECK, ROSANA ; DE LIMA, EVANDRO ANTÔNIO ; FIGUEIREDO, FERNANDA LOPES ; DA SILVA, TONY MÁRCIO ; Hoffmam, Zaira Bruna ; DE SOUSA, AMANDA SILVA ; SQUINA, FÁBIO MÁRCIO ; DE LOURDES TEIXEIRA DE MORAES POLIZ, MARIA ; Ruller, Roberto ; WARD, RICHARD JOHN . Increased biomass saccharification by supplementation of a commercial enzyme cocktail with endo-arabinanase from Bacillus licheniformis. Biotechnology Letters, v. 37, p. 1455-1462, 2015.

49.
PELLEGRINI, VANESSA O. A.2015PELLEGRINI, VANESSA O. A. ; SERPA, VIVIANE ISABEL ; GODOY, ANDRE S. ; CAMILO, CESAR M. ; BERNARDES, AMANDA ; REZENDE, CAMILA A. ; JUNIOR, NEI PEREIRA ; FRANCO CAIRO, JOÃO PAULO L. ; Squina, Fabio M. ; Polikarpov, Igor . Recombinant Trichoderma harzianum endoglucanase I (Cel7B) is a highly acidic and promiscuous carbohydrate-active enzyme. Applied Microbiology and Biotechnology, v. 99, p. 9591-9604, 2015.

50.
Alvarez, Thabata Maria2015Alvarez, Thabata Maria ; LIBERATO, MARCELO VIZONÁ ; CAIRO, JOÃO PAULO L. FRANCO ; PAIXÃO, DOUGLAS A. A. ; CAMPOS, BRUNA M. ; FERREIRA, MARCEL R. ; ALMEIDA, RODRIGO F. ; PEREIRA, ISABELA O. ; BERNARDES, AMANDA ; EMATSU, GABRIELA C. G. ; CHINAGLIA, MARIANA ; Polikarpov, Igor ; de Oliveira Neto, Mario ; Squina, Fabio Marcio . A Novel Member of GH16 Family Derived from Sugarcane Soil Metagenome. Applied Biochemistry and Biotechnology (Online), v. 177, p. 304-317, 2015.

51.
ROBL, DIOGO2015ROBL, DIOGO ; DA SILVA DELABONA, PRISCILA ; DOS SANTOS COSTA, PATRÍCIA ; DA SILVA LIMA, DEISE JULIANA ; RABELO, SARITA CANDIDA ; PIMENTEL, IDA CHAPAVAL ; BÜCHLI, FERNANDA ; Squina, Fabio Marcio ; PADILLA, GABRIEL ; DA CRUZ PRADELLA, JOSÉ GERALDO . Xylanase production by endophytic Aspergillus niger using pentose-rich hydrothermal liquor from sugarcane bagasse. Biocatalysis and Biotransformation (Print), v. 33, p. 1-13, 2015.

52.
COLUSSI, FRANCIELI2015COLUSSI, FRANCIELI ; DA SILVA, VIVIAM M. ; MILLER, IAN ; Cota, Junio ; DE OLIVEIRA, LEANDRO C. ; DE OLIVEIRA NETO, MÁRIO ; SQUINA, FÁBIO M. ; GARCIA, WANIUS . Oligomeric state and structural stability of two hyperthermophilic β-glucosidases from Thermotoga petrophila. Amino Acids (Wien. Internet), v. 47, p. 937-948, 2015.

53.
CAMPOS, B. M.2015CAMPOS, B. M. ; LIBERATO, MARCELO VIZONA ; POLIKARPOV, I. ; ZERI, A. C. M. ; Squina, Fabio Marcio . Cloning, purification, crystallization and preliminary X-ray studies of a carbohydrate-binding module from family 64 (StX). Acta Crystallographica. Section F, v. 71, p. 311-314, 2015.

54.
MANDELLI, FERNANDA2014MANDELLI, FERNANDA ; BRENELLI, L.B. ; ALMEIDA, RODRIGO FERREIRA ; GOLDBECK, ROSANA ; WOLF, L. D. ; Hoffmam, Zaira ; Ruller, R. ; ROCHA, G. J. M. ; Mercadante, Adriana Z. ; SQUINA, FÁBIO MARCIO . Simultaneous production of xylooligosaccharides and antioxidant compounds from sugarcane bagasse via enzymatic hydrolysis. Industrial Crops and Products (Print), v. 52, p. 770-775, 2014.

55.
DA SILVA, VIVIAM M.2014DA SILVA, VIVIAM M. ; COLUSSI, FRANCIELI ; de Oliveira Neto, Mario ; BRAZ, ANTONIO S. K. ; Squina, Fabio M. ; OLIVEIRA, CRISTIANO L. P. ; GARCIA, WANIUS . Modular Hyperthermostable Bacterial Endo-β-1,4-Mannanase: Molecular Shape, Flexibility and Temperature-Dependent Conformational Changes. Plos One, v. 9, p. e92996, 2014.

56.
RIBEIRO, LILIANE FC2014RIBEIRO, LILIANE FC ; DE LUCAS, ROSYMAR C ; VITCOSQUE, GABRIELA L ; RIBEIRO, LUCAS F ; WARD, RICHARD J ; RUBIO, MARCELO V ; DAMÁSIO, ANDRE RL ; Squina, Fabio M ; GREGORY, REBECCA C ; WALTON, PAUL H ; JORGE, JOÃO A ; Prade, Rolf A ; BUCKERIDGE, MARCOS S ; POLIZELI, MARIA DE . A novel thermostable xylanase GH10 from Malbranchea pulchella expressed in Aspergillus nidulans with potential applications in biotechnology. Biotechnology for Biofuels, v. 7, p. 115, 2014.

57.
Segato, Fernando2014 Segato, Fernando ; Damásio, André R. de Lima ; Squina, Fabio Marcio ; PRADE, R. A. . Genomics Review of Holocellulose Deconstruction by Aspergilli. Microbiology and Molecular Biology Reviews, v. 78, p. 588-613, 2014.

58.
LEPIKSON-NETO, JORGE2014LEPIKSON-NETO, JORGE ; NASCIMENTO, LEANDRO C ; SALAZAR, MARCELA M ; CAMARGO, EDUARDO ; CAIRO, JOÃO ; TEIXEIRA, PAULO J ; MARQUES, WESLEY L ; Squina, Fabio M ; MIECZKOWSKI, PIOTR ; DECKMANN, ANA C ; PEREIRA, GONÇALO . Flavonoid supplementation affects the expression of genes involved in cell wall formation and lignification metabolism and increases sugar content and saccharification in the fast-growing eucalyptus hybrid E. urophylla x E. grandis. BMC Plant Biology (Online), v. 14, p. 301, 2014.

59.
CAMPOS, B. M.2014CAMPOS, B. M. ; ALVAREZ, T. M. ; LIBERATO, M. V. ; Polikarpov, Igor ; GILBERT, H. J. ; ZERI, A. C. M. ; Squina, Fabio Marcio . Cloning, purification, crystallization and preliminary X-ray studies of a carbohydrate-binding module (CBM_E1) derived from sugarcane soil metagenome. Acta Crystallographica. Section F, v. 70, p. 1232, 2014.

60.
Damásio, André R.L.2014Damásio, André R.L. ; RUBIO, MARCELO V. ; OLIVEIRA, LEANDRO C. ; Segato, Fernando ; DIAS, BRUNO A. ; Citadini, Ana P. ; PAIXÃO, DOUGLAS A. ; Squina, Fabio M. . Understanding the function of conserved variations in the catalytic loops of fungal glycoside hydrolase family 12. Biotechnology and Bioengineering (Print), v. 111, p. 1494-1505, 2014.

61.
SANTOS, C. R.2014SANTOS, C. R. ; POLO, C. C. ; COSTA, M. C. M. F. ; NASCIMENTO, A. F. Z. ; MEZA, A. N. ; COTA, J. ; HOFFMAM, Z. B. ; HONORATO, R. V. ; OLIVEIRA, P. S. L. ; GOLDMAN, G. H. ; GILBERT, H. J. ; PRADE, R. A. ; Ruller, R. ; SQUINA, F. M. ; WONG, D. W. S. ; MURAKAMI, M. T. . Mechanistic strategies for catalysis adopted by evolutionary distinct family 43 arabinanases. The Journal of Biological Chemistry (Print), v. 289, p. 7362-7373, 2014.

62.
BRIAN COUGER, M.2014BRIAN COUGER, M. ; PIPES, LENORE ; SQUINA, FABIO ; PRADE, ROLF ; SIEPEL, ADAM ; PALERMO, ROBERT ; KATZE, MICHAEL G. ; MASON, CHRISTOPHER E. ; BLOOD, PHILIP D. . Enabling large-scale next-generation sequence assembly with Blacklight. Concurrency and Computation, v. 26, p. n/a-n/a, 2014.

63.
GOLDBECK, ROSANA2014GOLDBECK, ROSANA ; DAMÁSIO, ANDRÉ R. L. ; Gonçalves, Thiago A. ; MACHADO, CARLA B. ; PAIXÃO, DOUGLAS A. A. ; WOLF, LÚCIA D. ; MANDELLI, FERNANDA ; ROCHA, GEORGE J. M. ; Ruller, Roberto ; Squina, Fabio M. . Development of hemicellulolytic enzyme mixtures for plant biomass deconstruction on target biotechnological applications. Applied Microbiology and Biotechnology, v. 98, p. 8513-8525, 2014.

64.
BORGES, THUANNY A.2014BORGES, THUANNY A. ; SOUZA, ALINE TIEPPO DE ; Squina, Fabio M. ; RIAÑO-PACHÓN, DIEGO MAURICIO ; SANTOS, RENATO AUGUSTO CORRÊA DOS ; MACHADO, EDNILDO ; OLIVEIRA, JULIANA VELASCO DE CASTRO ; Damásio, André R.L. ; GOLDMAN, GUSTAVO H. . Biochemical characterization of an endoxylanase from Pseudozyma brasiliensis sp. nov. strain GHG001 isolated from the intestinal tract of Chrysomelidae larvae associated to sugarcane roots. Process Biochemistry (1991), v. 49, p. 77-83, 2014.

65.
TEXTOR, LARISSA C.2013TEXTOR, LARISSA C. ; COLUSSI, FRANCIELI ; SILVEIRA, RODRIGO L. ; SERPA, VIVIANE ; DE MELLO, BRUNO L. ; MUNIZ, JOÃO RENATO C. ; Squina, Fabio M. ; PEREIRA, NEI ; SKAF, MUNIR S. ; Polikarpov, Igor . Joint X-ray crystallographic and molecular dynamics study of cellobiohydrolase I from : deciphering the structural features of cellobiohydrolase catalytic activity. The FEBS Journal (Print), v. 280, p. 56-69, 2013.

66.
DELABONA, PRISCILA DA SILVA2013DELABONA, PRISCILA DA SILVA ; Cota, Júnio ; Hoffmam, Zaira Bruna ; PAIXÃO, DOUGLAS ANTONIO ALVAREDO ; FARINAS, CRISTIANE SANCHEZ ; CAIRO, JOÃO PAULO LOURENÇO FRANCO ; LIMA, DEISE JULIANA ; SQUINA, FÁBIO MARCIO ; Ruller, Roberto ; PRADELLA, JOSÉ GERALDO DA CRUZ . Understanding the cellulolytic system of Trichoderma harzianum P49P11 and enhancing saccharification of pretreated sugarcane bagasse by supplementation with pectinase and α-l-arabinofuranosidase. Bioresource Technology, v. 131, p. 500-507, 2013.

67.
DAMÁSIO, ANDRÉ R. L.2013DAMÁSIO, ANDRÉ R. L. ; BRAGA, CLEITON MÁRCIO PINTO ; BRENELLI, LÍVIA B. ; CITADINI, ANA PAULA ; MANDELLI, FERNANDA ; Cota, Junio ; ALMEIDA, RODRIGO FERREIRA ; SALVADOR, VICTOR HUGO ; PAIXAO, DOUGLAS ANTONIO ALVAREDO ; Segato, Fernando ; MERCADANTE, ADRIANA ZERLOTTI ; NETO, MARIO ; SANTOS, WANDERLEY DANTAS ; Squina, Fabio M. . Biomass-to-bio-products application of feruloyl esterase from Aspergillus clavatus. Applied Microbiology and Biotechnology, v. 97, p. 6759-6767, 2013.

68.
Alvarez, Thabata M.2013Alvarez, Thabata M. ; GOLDBECK, ROSANA ; Santos, Camila Ramos dos ; PAIXÃO, DOUGLAS A. A. ; Gonçalves, Thiago A. ; FRANCO CAIRO, JOÃO PAULO L. ; ALMEIDA, RODRIGO FERREIRA ; DE OLIVEIRA PEREIRA, ISABELA ; JACKSON, GEORGE ; Cota, Junio ; BÜCHLI, FERNANDA ; CITADINI, ANA PAULA ; Ruller, Roberto ; POLO, CARLA CRISTINA ; de Oliveira Neto, Mario ; MURAKAMI, MÁRIO T. ; Squina, Fabio M. . Development and Biotechnological Application of a Novel Endoxylanase Family GH10 Identified from Sugarcane Soil Metagenome. Plos One, v. 8, p. e70014, 2013.

69.
Bragatto, Juliano2013Bragatto, Juliano ; Segato, Fernando ; SQUINA, FABIO MÁRCIO . Production of xylooligosaccharides (XOS) from delignified sugarcane bagasse by peroxide-HAc process using recombinant xylanase from Bacillus subtilis. Industrial Crops and Products (Print), v. 51, p. 123-129, 2013.

70.
PAIVA, LÍVIA BRENELLI DE2013PAIVA, LÍVIA BRENELLI DE ; GOLDBECK, ROSANA ; SANTOS, WANDERLEY DANTAS DOS ; Squina, Fabio Marcio . Ferulic acid and derivatives: molecules with potential application in the pharmaceutical field. Brazilian Journal of Pharmaceutical Sciences (Impresso), v. 49, p. 395-411, 2013.

71.
Alvarez, Thabata M.2013Alvarez, Thabata M. ; PAIVA, JOICE H. ; RUIZ, DIEGO M. ; CAIRO, JOÃO PAULO L. F. ; PEREIRA, ISABELA O. ; PAIXÃO, DOUGLAS A. A. ; DE ALMEIDA, RODRIGO F. ; TONOLI, CELISA C. C. ; Ruller, Roberto ; Santos, Camila R. ; Squina, Fabio M. ; Murakami, Mario T. . Structure and Function of a Novel Cellulase 5 from Sugarcane Soil Metagenome. Plos One, v. 8, p. e83635, 2013.

72.
Cota, Junio2013Cota, Junio ; OLIVEIRA, LEANDRO C. ; Damásio, André R.L. ; Citadini, Ana P. ; HOFFMAM, ZAIRA B. ; Alvarez, Thabata M. ; CODIMA, CARLA A. ; LEITE, VITOR B.P. ; PASTORE, GLAUCIA ; DE OLIVEIRA-NETO, MARIO ; Murakami, Mario T. ; Ruller, Roberto ; Squina, Fabio M. . Assembling a xylanase-lichenase chimera through all-atom molecular dynamics simulations. Biochimica et Biophysica Acta. Proteins and Proteomics, v. 1834, p. 1492-1500, 2013.

73.
SILVA, TONY MARCIO2013SILVA, TONY MARCIO ; DAMÁSIO, ANDRÉ RICARDO DE LIMA ; MALLER, ALEXANDRE ; MICHELIN, MICHELE ; Squina, Fabio M. ; JORGE, JOÃO ATÍLIO ; POLIZELI, MARIA DE LOURDES TEIXEIRA DE MORAES . Purification, partial characterization, and covalent immobilization-stabilization of an extracellular α-amylase from Aspergillus niveus. Folia Microbiologica (Prague), v. 58, p. 495-502, 2013.

74.
MANDELLI, F.2013MANDELLI, F. ; FRANCO CAIRO, J.P.L. ; CITADINI, A.P.S. ; BÜCHLI, F. ; Alvarez, T.M. ; OLIVEIRA, R.J. ; LEITE, V.B.P. ; PAES LEME, A.F. ; MERCADANTE, A.Z. ; SQUINA, F.M. . The characterization of a thermostable and cambialistic superoxide dismutase from Thermus filiformis. Letters in Applied Microbiology, v. 57, p. 40-46, 2013.

75.
PEREIRA, BEATRIZ MERCHEL PIOVESAN2013PEREIRA, BEATRIZ MERCHEL PIOVESAN ; Alvarez, Thabata Maria ; DA SILVA DELABONA, PRISCILA ; DILLON, ALDO JOSÉ PINHEIRO ; SQUINA, FABIO MÁRCIO ; DA CRUZ PRADELLA, JOSÉ GERALDO . Cellulase On-Site Production from Sugar Cane Bagasse Using Penicillium echinulatum. BioEnergy Research, v. 6, p. 1052-1062, 2013.

76.
HOFFMAM, ZAIRA B.2013HOFFMAM, ZAIRA B. ; OLIVEIRA, LEANDRO C. ; Cota, Junio ; Alvarez, Thabata M. ; DIOGO, JOSÉ A. ; OLIVEIRA NETO, MARIO ; CITADINI, ANA PAULA S. ; LEITE, VITOR B. P. ; Squina, Fabio M. ; Murakami, Mario T. ; Ruller, Roberto . Characterization of a Hexameric Exo-Acting GH51 α-l-Arabinofuranosidase from the Mesophilic Bacillus subtilis. Molecular Biotechnology, v. 55, p. 260-267, 2013.

77.
FRANCO CAIRO, JOÃO PAULO L.2013FRANCO CAIRO, JOÃO PAULO L. ; OLIVEIRA, LEANDRO C. ; UCHIMA, CRISTIANE A. ; Alvarez, Thabata M. ; CITADINI, ANA PAULA DA S. ; Cota, Júnio ; LEONARDO, FLÁVIA COSTA ; COSTA-LEONARDO, ANA M. ; CARAZZOLLE, MARCELO F. ; COSTA, FERNANDO F. ; PEREIRA, GONÇALO A.G. ; Squina, Fabio M. . Deciphering the synergism of endogenous glycoside hydrolase families 1 and 9 from Coptotermes gestroi. Insect Biochemistry and Molecular Biology, v. 43, p. 970-981, 2013.

78.
LIMA, M. A.2013LIMA, M. A. ; OLIVEIRA-NETO, M. ; KADOWAKI, M. A. S. ; ROSSETO, F. R. ; PRATES, E. T. ; SQUINA, F. M. ; LEME, A. F. P. ; SKAF, M. S. ; POLIKARPOV, I. . Aspergillus niger beta-glucosidase has a cellulase-like tadpole molecular shape: insights into GH3 beta-glucosidases structure and function. The Journal of Biological Chemistry (Print), v. 288, p. 32991-33005, 2013.

79.
Santos, Camila Ramos dos2012Santos, Camila Ramos dos ; Paiva, Joice Helena ; Meza, Andreia Navarro ; Cota, Junio ; Alvarez, Thabata Maria ; Ruller, Roberto ; Prade, Rolf Alexander ; Squina, Fabio Marcio ; Murakami, Mario Tyago . Molecular insights into substrate specificity and thermal stability of a bacterial GH5-CBM27 endo-1,4-ß-d-mannanase. Journal of Structural Biology (Print), v. 177, p. 469-476, 2012.

80.
Santos, Camila R.2012Santos, Camila  ; Paiva, Joice  ; Sforça, Maurício  ; Neves, Jorge  ; Navarro, Rodrigo  ; Cota, Júnio ; Akao, Patrícia  ; Hoffmam, Zaira  ; Meza, Andréia  ; Smetana, Juliana  ; Nogueira, Maria  ; Polikarpov, Igor ; Xavier Neto, José ; Squina, Fabio Marcio ; Ward, Richard  ; Ruller, Roberto ; Zeri, Ana  ; Murakami, Mário  . Dissecting structure function stability relationships of a thermostable GH5-CBM3 cellulase from 168. Biochemical Journal (London. 1984), v. 441, p. 95-104, 2012.

81.
Ribeiro, Daniela A.2012Ribeiro, Daniela A. ; Cota, Junio ; Alvarez, Thabata Maria ; BUCHLI, F. ; Bragatto, Juliano ; PEREIRA, B. M. ; PAULETTI, B. A. ; ROCHA, G. J. M. ; DILLON, A. ; PRADELLA, J. G. C. ; Paes Leme, A. F. ; Squina, Fabio M. . The Penicillium echinulatum Secretome on Sugar Cane Bagasse. Plos One, v. 7, p. e50571, 2012.

82.
Gonçalves, T.A.2012Gonçalves, T.A. ; Damásio, A.R.L. ; SEGATO, F. ; Alvarez, T.M. ; BRAGATTO, J. ; BRENELLI, L.B. ; CITADINI, A.P.S. ; Murakami, M.T. ; Ruller, R. ; PAES LEME, A.F. ; Prade, R.A. ; SQUINA, F.M. . Functional characterization and synergic action of fungal xylanase and arabinofuranosidase for production of xylooligosaccharides. Bioresource Technology, v. 119, p. 293-299, 2012.

83.
ARAGAO, A. Z. B.2012ARAGAO, A. Z. B. ; Nogueira, Maria  ; GRANATO, D. C. ; SIMABUCO, F. M. ; HONORATO, R. V. ; HOFFMAN, Z. ; YOKOO, S. ; LAURINDO, F. R. M. ; Zeri, Ana ; OLIVEIRA, P. S. L. ; Squina, Fabio M ; SHERMAN, N. E. ; Paes Leme, Adriana F . Identification of novel interaction between ADAM17 (a disintegrin and metalloprotease 17) and thioredoxin-1.. The Journal of Biological Chemistry (Print), v. 287, p. 43071, 2012.

84.
Bragatto, Juliano2012Bragatto, Juliano ; Segato, Fernando ; Cota, Junio ; Mello, Danilo B. ; Oliveira, Marcelo M. ; Buckeridge, Marcos S. ; Squina, Fabio M ; Driemeier, Carlos . Insights on How the Activity of an Endoglucanase Is Affected by Physical Properties of Insoluble Celluloses. Journal of Physical Chemistry. B, v. 116, p. 6128-6136, 2012.

85.
Segato, Fernando2012Segato, Fernando ; DAMASIO, ANDRÉ R L ; GONÇALVES, THIAGO ; Murakami, Mario T ; Squina, Fabio M ; POLIZELI, MARIADELOURDESTM ; MORT, ANDREW J ; Prade, Rolf A . Two structurally discrete GH7-cellobiohydrolases compete for the same cellulosic substrate fiber. BIOTECHNOL BIOFUELS, v. 5, p. 21, 2012.

86.
Segato, Fernando2012Segato, Fernando ; Damásio, André R. de Lima ; Gonçalves, T.A. ; de Lucas, Rosymar C. ; Squina, Fabio Marcio ; Decker, Stephen R. ; Prade, R. . High-yield secretion of multiple client proteins in Aspergillus. Enzyme and Microbial Technology, v. 15, p. 51, 2012.

87.
SQUINA F. M.2011SQUINA F. M.; Santos, Camila R. ; NAVARRO, A. ; Oldiges, D ; Leme A. P. ; Ruller, Roberto ; PRADE, R. A. ; MURAKAMI, M. T. . Functional and biophysical characterization of a hyperthermostable GH51 alpha-L-arabinofuranosidase from Thermotoga petrophila RKU-1. Biotechnology Letters, v. 33(1), p. 131-137, 2011.

88.
Cota, Junio2011Cota, Junio ; Alvarez, Thabata M. ; Citadini, Ana P. ; Santos, Camila Ramos ; de Oliveira Neto, Mario ; Oliveira, Renata R. ; Pastore, Glaucia M. ; Ruller, Roberto ; Prade, Rolf A. ; Murakami, Mario T. ; Squina, Fabio M. . Mode of operation and low-resolution structure of a multi-domain and hyperthermophilic endo-?-1,3-glucanase from Thermotoga petrophila. Biochemical and Biophysical Research Communications (Print), v. 406, p. 590-594, 2011.

89.
Damásio, André R. de Lima2011Damásio, André R. de Lima ; Silva, Tony M. ; Almeida, Fausto B. dos Reis ; SQUINA F. M. ; Ribeiro, Daniela A. ; Leme, Adriana F. Paes ; Segato, Fernando ; Prade, Rolf A. ; Jorge, João A. ; Terenzi, Hector F. ; Polizeli, Maria de Lourdes T.M. . Heterologous expression of an Aspergillus niveus xylanase GH11 in Aspergillus nidulans and its characterization and application. Process Biochemistry (1991), v. 46, p. 1236-1242, 2011.

90.
Franco Cairo, Joao Paulo L.2011 Franco Cairo, Joao Paulo L. ; Leonardo, Flavia C. ; Alvarez, Thabata M. ; Ribeiro, Daniela A. ; Buchli, Fernanda ; Costa-Leonardo, Ana Maria ; Carazzolle, Marcelo F ; Costa, Fernando F ; Paes Leme, Adriana F ; Pereira, Goncalo A. G. ; Squina, Fabio Marcio . Functional characterization and target discovery of Glycoside Hydrolases from Lower Termite Coptotermes gestroi Digestome. BIOTECHNOL BIOFUELS, v. 4, p. 50, 2011.

91.
WANG, H.2011WANG, H. ; LEE, D. ; Prade, R. ; PAPPAN, K. ; Squina, F. ; SEGATO, F. ; Mort, A. . High-Temperature Enzymatic Breakdown of Cellulose. Applied and Environmental Microbiology (Print), v. 77, p. 5199-5206, 2011.

92.
Souza, Tatiana A.C.B.2011Souza, Tatiana A.C.B. ; Santos, Camila R. ; Souza, Angelica R. ; Oldiges, Daiane P. ; Ruller, Roberto ; Prade, Rolf A. ; Squina, Fabio M. ; Murakami, Mario T. . Structure of a novel thermostable GH51 α-L-arabinofuranosidase from Thermotoga petrophila RKU-1. Protein Science (Print), v. 20, p. 1632-1637, 2011.

93.
Squina, Fabio M.2010Squina, Fabio M.; Leal, Juliana ; Cipriano, Vivian T. F. ; Martinez-Rossi, Nilce M. ; Rossi, Antonio . Transcription of the Neurospora crassa 70-kDa class heat shock protein genes is modulated in response to extracellular pH changes. Cell Stress & Chaperones (Print), v. 15, p. 225-231, 2010.

94.
Santos, Camila R.2010Santos, Camila R. ; SQUINA F. M. ; NAVARRO, A. ; RULER, R. ; Prade, Rolf A. ; Murakami, Mario Tyago . Cloning, expression, purification, crystallization and preliminary X-ray diffraction studies of the catalytic domain of a hyperthermostable endo-1,4-beta-D-mannanase from Thermotoga petrophila RKU-1. Acta Crystallographica. Section F, v. 1, p. 1078, 2010.

95.
Santos, Camila Ramos2010Santos, Camila Ramos ; Meza, Andreia Navarro ; Hoffmam, Zaira Bruna ; Silva, Junio Cota ; Alvarez, Thabata Maria ; Ruller, Roberto ; Giesel, Guilherme Menegon ; Verli, Hugo ; Squina, Fabio Marcio ; Prade, Rolf Alexander . Thermal-induced conformational changes in the product release area drive the enzymatic activity of xylanases 10B: Crystal structure, conformational stability and functional characterization of the xylanase 10B from Thermotoga petrophila RKU-1. Biochemical and Biophysical Research Communications (Print), v. 403, p. 214-219, 2010.

96.
Squina, Fabio M.2010Squina, Fabio M.; Santos, Camila R. ; Ribeiro, Daniela A. ; Cota, Júnio ; de Oliveira, Renata R. ; Ruller, Roberto ; Mort, Andrew ; Murakami, Mario T. ; Prade, Rolf A. . Substrate cleavage pattern, biophysical characterization and low-resolution structure of a novel hyperthermostable arabinanase from Thermotoga petrophila. Biochemical and Biophysical Research Communications (Print), v. 399, p. 505-511, 2010.

97.
SQUINA F. M.2009SQUINA F. M.; LEAL, J ; FREITAS, J ; SILVA, E ; ONO, C ; MARTINEZROSSI, N ; ROSSI, A . A splice variant of the Neurospora crassa hex-1 transcript, which encodes the major protein of the Woronin body, is modulated by extracellular phosphate and pH changes. FEBS Letters (Print), v. 583, p. 180-184, 2009.

98.
SQUINA F. M.;Squina, Fabio Marcio;Squina, Fabio M.;Squina, Fábio M.;SQUINA, FÁBIO MARCIO;SQUINA, F M;SQUINA, F. M.;SQUINA, F.M.;Squina, Fabio M;Squina, F;Squina, F.;Squina, FM;SQUINA, FM;SQUINA, FM.;SQUINA, FABIO MÁRCIO;SQUINA, FABIO;SQUINA, FÁBIO M.;SQUINA, FÁBIO MÁRCIO;M. SQUINA, FABIO;SQUINA, FÁBIO;The CAZypedia Consortium2009 SQUINA F. M.; Mort A. J. ; Decker S.R. ; PRADE, R. A. . Xylan Decomposition by Aspergillus clavatus Endo-Xylanase. Protein Expression and Purification, v. 68, p. 65-71, 2009.

99.
SQUINA F. M.;Squina, Fabio Marcio;Squina, Fabio M.;Squina, Fábio M.;SQUINA, FÁBIO MARCIO;SQUINA, F M;SQUINA, F. M.;SQUINA, F.M.;Squina, Fabio M;Squina, F;Squina, F.;Squina, FM;SQUINA, FM;SQUINA, FM.;SQUINA, FABIO MÁRCIO;SQUINA, FABIO;SQUINA, FÁBIO M.;SQUINA, FÁBIO MÁRCIO;M. SQUINA, FABIO;SQUINA, FÁBIO;The CAZypedia Consortium2009SQUINA F. M.; Prade, Rolf Alexander ; Wang, Hongliang ; Murakami, Mario Tyago . Expression, purification, crystallization and preliminary crystallographic analysis of an endo-1,5-α- L -arabinanase from hyperthermophilic Thermotoga petrophila. Acta Crystallographica. Section F, v. 65, p. 902-905, 2009.

100.
Silva, Emiliana M.2008Silva, Emiliana M. ; Freitas, Janaína S. ; Gras, Diana E. ; Squina, Fabio Marcio ; Leal, Juliana ; Silveira, Henrique C.S. ; Martinez-Rossi, Nilce M. ; Rossi, Antonio . Identification of genes differentially expressed in a strain of the mold carrying a loss-of-function mutation in the gene. Canadian Journal of Microbiology (Print), v. 54, p. 803-811, 2008.

101.
SQUINA F. M.;Squina, Fabio Marcio;Squina, Fabio M.;Squina, Fábio M.;SQUINA, FÁBIO MARCIO;SQUINA, F M;SQUINA, F. M.;SQUINA, F.M.;Squina, Fabio M;Squina, F;Squina, F.;Squina, FM;SQUINA, FM;SQUINA, FM.;SQUINA, FABIO MÁRCIO;SQUINA, FABIO;SQUINA, FÁBIO M.;SQUINA, FÁBIO MÁRCIO;M. SQUINA, FABIO;SQUINA, FÁBIO;The CAZypedia Consortium2007SQUINA F. M.; PEDROSA, A. L. ; NUNES, V. S. ; CRUZ, A. K. ; TOSI, L. R. O. . Shuttle mutagenesis and targeted disruption of a telomere-located essential gene of Leishmania. Parasitology (London. Print), v. 134, p. 511-522, 2007.

102.
DIAS, F. C.2007DIAS, F. C. ; RUIZ, J. C. ; LOPES, W. C. Z. ; SQUINA F. M. ; RENZI, A. ; CRUZ, A. K. ; TOSI, L. R. O. . Organization of H locus conserved repeats in Leishmania (Viannia) braziliensis correlates with lack of gene amplification and drug resistance.. Parasitology Research, v. 101, p. 667-676, 2007.

103.
Leal, Juliana2007Leal, Juliana ; Squina, Fabio Marcio ; Martinez-Rossi, Nilce M. ; Rossi, Antonio . The transcription of the gene for iso-orotate decarboxylase (IDCase), an enzyme of the thymidine salvage pathway, is downregulated in the mutant strain of Neurospora crassa grown under phosphate starvation. Canadian Journal of Microbiology (Print), v. 53, p. 1011-1015, 2007.

104.
SQUINA F. M.;Squina, Fabio Marcio;Squina, Fabio M.;Squina, Fábio M.;SQUINA, FÁBIO MARCIO;SQUINA, F M;SQUINA, F. M.;SQUINA, F.M.;Squina, Fabio M;Squina, F;Squina, F.;Squina, FM;SQUINA, FM;SQUINA, FM.;SQUINA, FABIO MÁRCIO;SQUINA, FABIO;SQUINA, FÁBIO M.;SQUINA, FÁBIO MÁRCIO;M. SQUINA, FABIO;SQUINA, FÁBIO;The CAZypedia Consortium2005SQUINA F. M.; MERCADANTE, A. Z. . Influence of nicotine and diphenylamine on the carotenoid composition of Rhodotorula glutinis and R. rubra. Journal of Food Biochemistry, Inglaterra, v. 29, n.5, p. 638-652, 2005.

105.
AUGUSTO, M. J.2004AUGUSTO, M. J. ; SQUINA F. M. ; MARCHINI, J. C. ; DIAS, F. C. ; TOSI, L. R. O. . Specificity of modified Drosophila mariner transposons in the identification of Leishmania genes. Experimental Parasitology, Inglaterra, v. 108, n.4, p. 109-113, 2004.

106.
Squina, Fabio Marcio2003Squina, Fabio Marcio; Mercadante, Adriana Z. . HPLC analysis of carotenoids from five Rhodotorula strains. Brazilian Journal of Pharmaceutical Sciences (Impresso), v. 39, p. 1, 2003.

107.
SQUINA F. M.;Squina, Fabio Marcio;Squina, Fabio M.;Squina, Fábio M.;SQUINA, FÁBIO MARCIO;SQUINA, F M;SQUINA, F. M.;SQUINA, F.M.;Squina, Fabio M;Squina, F;Squina, F.;Squina, FM;SQUINA, FM;SQUINA, FM.;SQUINA, FABIO MÁRCIO;SQUINA, FABIO;SQUINA, FÁBIO M.;SQUINA, FÁBIO MÁRCIO;M. SQUINA, FABIO;SQUINA, FÁBIO;The CAZypedia Consortium2002SQUINA F. M.; YAMASHITA, F. ; FERREIRA, J. L. ; MERCADANTE, A. Z. . Production of Carotenoids by Rhodotorula rubra e R. glutinis in culture medium supplemented with sugar cane juice. Food Biotechnology, New York, v. 16, n.3, p. 227-235, 2002.

Capítulos de livros publicados
1.
FERRAZ, ANTÔNIO DJALMA NUNES ; Damásio, André R. de Lima ; PAIXÃO, DOUGLAS A. ; ALVAREZ, T. M. ; SQUINA, FM . Applied Metagenomics for Biofuel Development and Environmental Sustainability. In: Marcos S. Buckeridge; Amanda P. De Souza. (Org.). Applied Metagenomics for Biofuel Development and Environmental Sustainability. 1ed.: , 2017, v. 1, p. 107-129.

2.
Ventura Rubio, Marcelo ; Tramontina, Robson ; GONÇALVES, THIAGO ; Uchima, Cristiane ; Segato, Fernando ; SQUINA, FABIO ; de Lima Damasio, André . Heterologous Expression of Carbohydrate-Active Enzymes in Filamentous Fungi. In: Roberto N. Silva. (Org.). Mycology: Current and Future Developments. 1ed.: BENTHAM SCIENCE PUBLISHERS, 2015, v. 1, p. 148-201.

3.
SOUZA-CORREA, J. A. ; B.PIMENTA, M. T. ; ROCHA, M. G. J. ; GOMEZ, E. O. ; SQUINA F. M. ; CURVELO, A. A. S. ; AMORIM, J. . Hydrothermal and Atmospheric Pressure Microplasma Pretreatment Processes of Sugarcane Bagasse. In: Plasmas for Environmental Issues. (Org.). Plasmas for Enviromental Issues. In: Elena Tatarova e Vasco Guerra. 2ed.: , 2010, v. 1, p. 1-9.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
Franco Cairo, J. P. L. ; CARAZZOLLE, MARCELO F. ; Leonardo, Flavia C. ; GONCALVES, T. A. ; BRENELLI, L. B. ; UCHIMA, CRISTIANE A. ; ALVAREZ, T. M. ; VIDAL, R. ; COSTA-LEONARDO, ANA M. ; LEME, A. F. P. ; COSTA, F. F. ; PEREIRA, G. A. G. ; Squina, Fabio Marcio . Metaproteogenomic approaches for target discovery of glycoside hydrolases and auxiliary activities in the digestome of lower termite Coptotermes gestroi. In: 62nd ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics, 2014, Baltimore - MD. Proceedings of 62nd ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics, 2014.

2.
GOLDBECK, ROSANA ; DAMASIO, A. ; PAIXAO, D. A. A. ; Ruller, R. ; Squina, Fabio Marcio . ESTUDO DA COMBINAÇÃO DE ENZIMAS HEMICELULOLÍTICAS NA DEGRADAÇÃO DE ARABINOXILANO. In: XIX Simpósio Nacional de Bioprocessos (SINAFERM), 2013, Foz do Iguaçu. Programação do XIX Simpósio Nacional de Bioprocessos (SINAFERM), 2013.

3.
ALVAREZ, T. M. ; BRIAN COUGER, M. ; PAIXAO, D. A. A. ; BUCHLI, F. ; Franco Cairo, J. P. L. ; LEME, A. F. P. ; PRADE, R. A. ; Squina, Fabio Marcio . Target Discovery of Biocatalysts For Biomass-to-Bioethanol Applications From Sugar Cane Field Soil Metagenome. In: Gordon Conference on Cellulosomes, Cellulases & Other Carbohydrate Modifying Enzymes,, 2013, Andover, NH. Proceedings of Gordon Conference on Cellulosomes, Cellulases & Other Carbohydrate Modifying Enzymes, 2013.

4.
CAIRO, JOÃO PAULO L. F. ; SILVA, J. C. ; ALVAREZ, T. M. ; CITADINI, A. P. ; Leonardo, Flavia C. ; UCHIMA, CRISTIANE A. ; VIDAL, R. ; CARAZZOLLE, MARCELO F. ; COSTA-LEONARDO, ANA M. ; COSTA, FERNANDO F. ; PEREIRA, G. A. G. ; Squina, Fabio Marcio . Deciphering the mode of operation and synergism of the main glycoside hydrolases (GH1 and GH9) secreted by the lower termite Coptotermes gestroi. In: Gordon Conference on Cellulosomes, Cellulases & Other Carbohydrate Modifying Enzymes,, 2013, Andover, NH. Proceedings of Gordon Conference on Cellulosomes, Cellulases & Other Carbohydrate Modifying Enzymes, 2103.

5.
Gonçalves, T.A. ; SEGATO, F. ; DAMASIO, A. ; LEITE, VITOR B. P. ; PRADE, R. A. ; Squina, Fabio Marcio . Operation Mode and Biotechnological Application of a Core set of Biomass Conversion Enzymes. In: XLI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2012, Foz do Iguaçu. Proceedings da XLI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2012.

6.
Franco Cairo, J. P. L. ; Leonardo, Flavia C. ; ALVAREZ, T. M. ; JUNIO, ; Ribeiro, Daniela A. ; Ruller, R. ; CARAZZOLLE, MARCELO F. ; COSTA-LEONARDO, ANA M. ; Leme, Adriana F. Paes ; COSTA, FERNANDO F. ; Pereira, Goncalo A. G. ; Squina, Fabio Marcio . Deciphering the microbial community and the lignocellulolytic digestome of lower termite Coptotermes gestroi. In: 4th International Symposium on Microbial Ecology, ISME14, 2012, Copenhagen. Annals of International Symposium on Microbial Ecology,, 2012.

7.
CAIRO, JOÃO PAULO L. F. ; SILVA, J. C. ; ALVAREZ, T. M. ; CITADINI, A. P. ; Leonardo, Flavia C. ; VIDAL, R. ; CARAZZOLLE, MARCELO F. ; COSTA-LEONARDO, ANA M. ; COSTA, FERNANDO F. ; PEREIRA, G. A. G. ; Squina, Fabio Marcio . Decifrando o modo de operação e efeito sinérgico de duas hidrolases glicolíticas secretadas pelo cupim inferior Coptotermes gestroi.. In: X Seminário Brasileiro de Tecnologia Enzimática - ENZITEC, 2012, 2012, Blumenau. Livro de Resumos do X Seminário Brasileiro de Tecnologia Enzimática - ENZITEC, 2012., 2012.

8.
DIAS, B. ; Segato, Fernando ; Damásio, André R. de Lima ; ALMEIDA, RODRIGO FERREIRA ; CITADINI, A. P. ; Squina, Fabio Marcio . Structural and functional analysis of a GH12 from Aspergillus terreus. In: 27th European Crystallographic Meeting, ECM 27, 2012, Bergen. Acta Cryst. (2012).,, 2012. v. A68. p. s177.

9.
CAIRO, J. P. L. F. ; LEONARDO, F. C. ; Alvarez, Thabata M. ; Cota, Junio ; Ribeiro, Daniela A. ; RULER, R. ; CARAZZOLLE, M. F. ; Paes Leme, A. F. ; PEREIRA, G. A. G. ; SQUINA F. M. . Digestome Characterization of Termite Coptotermes gestroi through metaproteogenomics. In: XL Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq,, 2011, Foz do Iguaçu. Livro de Resumos, 2011.

10.
CAIRO, J. P. L. F. ; Alvarez, Thabata M. ; AUGUSTO, M. J. ; LEONARDO, F. C. ; LEONARDO, A. M. C. ; PAIXAO, D. A. ; Ruller, Roberto ; CARAZZOLLE, M. F. ; PEREIRA, G. A. G. ; SQUINA F. M. . Coptotermes gestroi digestomic repertory involved in lignocellulosic bioconversion. In: 21st LNLS Annual Users Meeting, 2011, São Paulo. RESUMOS DE TRABALHOS, 2011.

11.
Alvarez, Thabata Maria ; PAIXAO, D. A. ; CAIRO, J. P. L. F. ; Ruller, Roberto ; SQUINA F. M. . Prospection of enzymes involved in degradation of lignocellulosic biomass from a metagenomic library derived from sugar cane plantation soil. In: 21st LNLS Annual Users Meeting, 2011, Campinas. Livro de resumos.

12.
Alvarez, Thabata M. ; PAIXAO, D. A. ; BUCHLI, F. ; CAIRO, J. P. L. F. ; RULER, R. ; Prade, Rolf Alexander ; Squina, Fabio M. . PROSPECTION OF GENES INVOLVED ON BIOMASS CONVERTION FROM SOIL METAGENOME THROUGH FUNCTION-BASED SCREENING. In: 26o. Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2011, Foz do Iguaçu. Livro de Resumos, 2011.

13.
Alvarez, Thabata Maria ; PAIXAO, D. A. ; CAIRO, J. P. L. F. ; Ruller, Roberto ; BUCHLI, F. ; Ribeiro, Daniela A. ; Leme A. P. ; PRADE, R. A. ; Squina, Fabio M. . TARGET DISCOVERY OF ENZYMES INVOLVED IN DEGRADATION OF LIGNOCELLULOSIC BIOMASS FROM SUGAR CANE SOIL METAGENOME. In: 1st Brazilian BioEnergy Science and Technology Conference, 2011, Campos do Jordão. Livro de Resumos, 2011.

14.
Alvarez, Thabata M. ; PAIXAO, D. A. ; CAIRO, J. P. L. F. ; Ribeiro, Daniela A. ; Ruller, Roberto ; BUCHLI, F. ; Leme, Adriana F. Paes ; PRADE, R. A. ; Squina, Fabio Marcio . Discovery of Biomass Conversion Enzymes from Sugar Cane Soil Metagenome. In: XL Annual Meeting of The Brazilian Biochemistry and Molecular Biology Society, 2011, Foz do Iguaçu. Livro de Resumos, 2011.

15.
Alvarez, Thabata M. ; PAIXAO, D. A. ; CAIRO, J. P. L. F. ; BUCHLI, F. ; Leme A. P. ; RULER, R. ; PRADE, R. A. ; SQUINA F. M. . Prospection of enzymes involved in degradation of lignocellulosic biomass from metagenome of Sugarcane Bagasse-Degrading-Soil. In: 1º Workshop BFM, 2011, Campinas. Livro de Resumos, 2011.

16.
HOFFMAM, Z. B. ; Cota, Junio ; Murakami, Mario Tyago ; Ruller, Roberto ; Squina, Fabio Marcio . Development of bifunctional glycosyl hydrolases chimeras by protein engineering applied in biomass hydrolysis process. In: Workshop da Pós em Biologia Funcional e Molecular, 2011, Campinas. Livro de Resumos, 2011.

17.
Ribeiro, Daniela A. ; PAUL, H. M. ; PEREIRA, B. M. P. ; PRADELLA, J. G. C. ; Ruller, Roberto ; Leme, Adriana F. Paes ; Squina, Fabio Marcio . Evaluation of Penicilium Echinulatum secretome through Shotgun Proteomics. In: 26th Fungal Genetics Conference at Asilomar, 2011, Pacific Grove. Abstracts, 2011.

18.
Ribeiro, Daniela A. ; PAUL, H. M. ; PEREIRA, B. M. P. ; PRADELLA, JOSÉ GERALDO DA CRUZ ; Ruller, R. ; LEME, A. F. P. ; Squina, Fabio Marcio . Evaluation of Penicilium Echinulatum secretome through Shotgun Proteomics.. In: 26th Fungal Genetics Conference at Asilomar, 2011, Asilomar - CA. Proceedings da 26th Fungal Genetics Conference at Asilomar, 2011.

19.
Ribeiro, Daniela A. ; Cota-Silva, Junio ; Testoni, F. M. ; RULER, R. ; Mort A. J. ; Murakami, Mario Tyago ; Prade, Rolf Alexander ; SQUINA F. M. . Biochemical Characterization of a Hyper Thermostable Arabinanase from Thermotoga petrophila. In: XXXIX Annual Meeting of The Brazilian Biochemistry and Molecular Biology Society, 2010, Foz do Iguaçu. XXXIX Annual Meeting of The Brazilian Biochemistry and Molecular Biology Society.

20.
CIPRIANO, V. T. ; Squina, Fabio M. ; ROSSI, A. . THE FUNCTIONING OF THE TRANSCRIPTION FACTOR PacC UNDER ACIDIC pH IN Aspergillusnidulans AND Neurospora crassa. In: XXXIX Annual Meeting of The Brazilian Biochemistry and Molecular Biology Society, 2010, Foz do Iguaçu. XXXIX Annual Meeting of The Brazilian Biochemistry and Molecular Biology Society, 2010.

21.
CAIRO, J. P. L. F. ; LEONARDO, F. C. ; Alvarez, Thabata M. ; Ribeiro, Daniela A. ; LEONARDO, A. M. C. ; CARAZZOLLE, M. F. ; PEREIRA, G. A. G. ; SQUINA F. M. . Insights of termite Coptotermes gestroi digestome toward the development of strategies for lignocellulosic bioethanol.. In: IX Seminário de Tecnologia Enzimática - ENZITEC, 2010, Rio de Janeiro. Livro de resumos, 2010.

22.
Cota, Junio ; CITADINI, A. P. ; de Oliveira, Renata R. ; Ruller, Roberto ; Murakami, Mario Tyago ; Pastore, Glaucia M. ; Squina, Fabio Marcio . Biochemical and Biophysical Characterization of a novel Hyper Thermostable Laminarinase from Thermotoga petrophila. In: IX Seminário Brasileiro de Tecnologia Enzimática, 2010, Rio de Janeiro. Livro de Resumos, 2010.

23.
Squina, Fabio M.; Ribeiro, Daniela A. ; MURAKAMI, M. T. ; PRADE, R. A. . Development of a Library for Biomass Conversion Enzymes. In: XVII Simpósio Nacional de Bioprocessos, 2009, Natal. XVII Simpósio Nacional de Bioprocessos, 2009.

24.
SQUINA F. M.; Prade, Rolf Alexander ; Murakami, Mario Tyago ; GOMEZ, E. O. ; PRADELLA, J. G. C. ; ROSSEL, C. E. V. . Development of a Library for Biomass-Conversion Enzymes. In: Sinaferm 2009, 2009, Natal. Livro de Resumos, 2009.

25.
SQUINA F. M.; LEAL, J. ; GRAS, D. E. ; FREITAS, J. S. ; SILVA, E. M. ; MARTINEZ-ROSSI, N. M. ; ROSSI, A. . New features over the expression of Neurospora crassa genes in response to extracellular phosphate levels and pH. In: Neurospora 2008, 2008, Asilomar. Abstracts Neurospora 2008, 2008.

26.
SILVA, E. M. ; FREITAS, J. S. ; GRAS, D. E. ; SILVEIRA, H. C. S. ; LEAL, J. ; SQUINA F. M. ; MARTINEZ-ROSSI, N. M. ; ROSSI, A. . Supression subtractive hybridization analyses identified gene up-regulated in the pala1 mutant strain of Aspergillus nidulans. In: XXXVI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2007, Salvador. Anais da XXXVI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2007.

27.
DIAS, F. C. ; RUIZ, J. C. ; SQUINA F. M. ; CRUZ, A. K. ; TOSI, L. R. O. . Conservation of repeated elements within non-coding sequences of Leishmania spp.. In: XXXVI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2007, Salvador. Anais do XXXVI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2007.

28.
FREITAS, J. S. ; SILVA, E. M. ; LEAL, J. ; SQUINA F. M. ; GRAS, D. E. ; SILVEIRA, H. C. S. ; MARTINEZ-ROSSI, N. M. ; ROSSI, A. . Suppression subtractive analyses revealed genes down-regulated in the palA1 mutante strain of Aspergillus nidulans grown in acid pH. In: XXXVI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2007, Salvador. Anais do XXXVI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2007.

29.
CIPRIANO, V. T. ; SQUINA F. M. ; ONO, C. J. ; ROSSI, A. . The transcription of heat shock proteins responds to ph and phosphate in Neurospora crassa. In: XXXVI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2007, Salvador. Anais da XXXVI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2007.

30.
SQUINA F. M.; LEAL, J. ; FREITAS, J. S. ; SILVA, E. M. ; SILVEIRA, H. C. S. ; GRAS, D. E. ; MARTINEZ-ROSSI, N. M. ; ROSSI, A. . Identification of new Neurospora crassa genes under regulation of the transcription factor nuc-1 in response to phosphate starvation. In: XXXVI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2007, Salvador. Anais da : XXXVI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2007.

31.
SILVA, E. M. ; FREITAS, J. S. ; GRAS, D. E. ; SQUINA F. M. ; LEAL, J. ; SILVEIRA, H. C. S. ; MARTINEZ-ROSSI, N. M. ; ROSSI, A. . Identification of genes up regulated in the palA1 mutant strain of Aspergillus nidulans. In: Fungal Genetics Conference, 2007, Asilomar, USA. Anais do XXII Fungal Genetics Conference, 2007.

32.
SQUINA F. M.; LEAL, J. ; MARTINEZ-ROSSI, N. M. ; ROSSI, A. . Identification of genes down regulated in the pregc mutant strain of N. crassa. In: XXIV Fungal Genetics Conference, 2007, Asilomar. Anais do XXII Fungal Genetics Conference, 2007.

33.
SILVA, E. M. ; FREITAS, J. S. ; GRAS, D. E. ; LEAL, J. ; SQUINA F. M. ; SILVEIRA, H. C. S. ; MARTINEZ-ROSSI, N. M. ; ROSSI, A. . Identification of genes displaying differential expression in the palA1 mutant strain of Aspergillus nidulans.. In: XI Congreso Argentino de Microbiologia, 2007, Cordoba. Revista Argentina de Microbiologia, 2007. v. 39. p. 20.

34.
GRAS, D. E. ; LEAL, J. ; SQUINA F. M. ; SILVEIRA, H. C. S. ; MARTINEZ-ROSSI, N. M. ; ROSSI, A. . Identification of new genes involved in metabolic responses to exogenous phosphate sensing in Neurospora crassa.. In: XI Congreso Argentino de Microbiologia, 2007, Cordoba. Revista Argentina de Microbiologia, 2007. v. 39. p. 19.

35.
SQUINA F. M.; ONO, C. J. ; LEAL, J. ; MARTINEZ-ROSSI, N. M. ; ROSSI, A. . O fator de transcrição NUC-1 silencia a expressão de genes que codificam proteínas de resposta ao choque térmico do tipo HSP70 em Neurospora crassa. In: LII Congresso Brasileiro de Genética, 2006, Foz do Iguaçu. Anais do LII Congresso Brasileiro de Genética, 2006. v. 1. p. 787.

36.
LEAL, J. ; SQUINA F. M. ; MARTINEZ-ROSSI, N. M. ; ROSSI, A. . A novel preg-controlled gene, involved in the thymidine salvage pathway, was revealed in neurospora crassa using DDRT-PCR. In: XXXV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2006, Águas de Lindóia. Anais do XXXV Annual Meeting of the Brazilian Society of Biochemistry and Molecular Biology, 2006. p. G - 53.

37.
SILVA, E. M. ; FREITAS, J. S. ; LEAL, J. ; SQUINA F. M. ; GRAS, D. E. ; SILVEIRA, H. C. S. ; SANCHES, P. R. ; MARTINEZ-ROSSI, N. M. ; ROSSI, A. . Identificação de genes diferencialmente expressos no mutante palA1 de Aspergillus nidulans através de uma biblioteca de subtração de cDNA. In: LII Congresso Brasileiro de Genética, 2006, Foz do Iguaçu. Anais do Congresso, 2006. p. 804.

38.
FREITAS, J. S. ; SILVA, E. M. ; LEAL, J. ; SQUINA F. M. ; GRAS, D. E. ; SILVEIRA, H. C. S. ; SANCHES, P. R. ; MARTINEZ-ROSSI, N. M. ; ROSSI, A. . Expressão diferencial de genes em Aspergillus nidulans em resposta ao pH ambiente. In: LII Congresso Brasileiro de Genética, 2006, Foz do Iguaçu. Anais do Congresso, 2006. p. 793.

39.
LEAL, J. ; SQUINA F. M. ; SILVA, E. M. ; FREITAS, J. S. ; GRAS, D. E. ; SILVEIRA, H. C. S. ; SANCHES, P. R. ; MARTINEZ-ROSSI, N. M. ; ROSSI, A. . Regulação da expressão gênica no fungo Neurospora crassa em resposta ao nível de fosfato sob controle do gene nuc-1. In: LII Congresso Brasileiro de Genética, 2006, Foz do Iguaçu. Anais do Congresso, 2006. p. 782.

40.
SIQUEIRA-NETO, J. L. ; SQUINA F. M. ; KATHER, L. ; LIRA, C. B. B. ; GIARDINI, M. A. ; CONTE, F. F. ; TOSI, L. R. O. ; KANO, M. I. N. . Leishmania Rpa-1 is a nuclear protein that associates with the G-rich single-stranded telomeric sequence. In: XXXIV Annual Meeting of the Brazilian Society of Biochemistry and Molecular Biology, 2005, Águas de Lindóia. Anais do XXXIV Annual Meeting of the Brazilian Society of Biochemistry and Molecular Biology, 2005.

41.
AUGUSTO, M. J. ; SQUINA F. M. ; TOSI, L. R. O. . Caracterização da função e atuação sinergistica dos genes do locus H de Leishmania major amplificados em resposta a pressão por drogas. In: III Sessão de Poster da Área de Biologia Celular e Molecular da FMRP-USP, 2005, Ribeirão Preto. Revista do Hospital das Clínicas e da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da USP, 2005. v. 38. p. 14.

42.
SQUINA F. M.; TOSI, L. R. O. . Produção sistemática de reagentes para integração gênica por transposição in vitro: Ruptura de genes na extremidade de telômeros de Leishmania. In: III Sessão de Poster da Área de Biologia Celular e Molecular da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo, 2005, Ribeirão Preto. Revista do Hospital das Clínicas e da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da USP, 2005. v. 38. p. 26.

43.
DIAS, F. C. ; RUIZ, J. C. ; SQUINA F. M. ; CRUZ, A. K. ; TOSI, L. R. O. . A Maintenance of inverted repeats within noncoding sequences of Leishmania (Viannia) braziliensis of H lucus. In: XXI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Protozoologia e XXXII Reunião Anual da Pesquisa Básica em Doença de Chagas, 2005, Caxambu. Proceedings of XXI Annual Meeting of the Brazilian Society of Protozoology, 2005. p. 111.

44.
DIAS, F. C. ; LOPES, W. C. Z. ; SQUINA F. M. ; TOSI, L. R. O. . Sintenia e amplificação gênica do locus H em Leishmania spp. In: III Sessão de Poster da Área de Biologia Celular e Molecular da FMRP-USP, 2005, Ribeirão Preto. Revista do Hospital das Clínicas e da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da USP, 2005. v. 38. p. 27.

45.
SQUINA F. M.; RUIZ, J. C. ; AUGUSTO, M. J. ; CRUZ, A. K. ; TOSI, L. R. O. . The systematic production of reagents for genome integration by shuttle mutagenesis: Disruption of genes at Leishmania telomeric ends. In: TriTryp Genomes Meeting, 2004, Seatlle. TriTryp Genomes Meeting 2004, 2004. p. 7.3.

46.
SIQUEIRA-NETO, J. L. ; FERNADES, M. F. ; SQUINA F. M. ; CONTE, F. F. ; GIARDINI, M. A. ; LIRA, C. B. B. ; TOSI, L. R. O. ; KANO, M. I. N. . Molecular characterization of the genes encoding two proteins that associate with the telomeric G-rich strand of Leishmania. In: XX Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Protozoologia e XXXI Reunião Anual da Pesquisa Básica em Doença de Chagas, 2004, Caxambu. Proceedings of XX Meeting of the Brazilian Society of Protozoology, 2004. p. 109.

47.
DIAS, F. C. ; LOPES, W. C. Z. ; SQUINA F. M. ; TOSI, L. R. O. . Gene synteny and amplification of the H locus in Leishmania ssp. In: XX Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Protozoologia e XXXI Reunião Anual da Pesquisa Básica em Doença de Chagas, 2004, Caxambu. Proceedings XX Meeting of the Brazilian Society of Protozoology, 2004. p. 91.

48.
SQUINA F. M.; AUGUSTO, M. J. ; RUIZ, J. C. ; TOSI, L. R. O. . In vitro shuttle mutagenesis and functional analysis in Leishmania; gene disruption and complementation of a telomere-located RNA polymerase III. In: XX Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Protozoologia e XXXI Reunião Anual da Pesquisa Básica em Doença de Chagas, 2004, Caxambu. Proceedings of XX Meeting of the Brazilian Society of Protozoology, 2004. p. 113.

49.
RENZI, A. ; DIAS, F. C. ; SQUINA F. M. ; TOSI, L. R. O. . Caracterização do gene da pteridina redutase-1 de Leishmania (Viannia) braziliensis. In: II Sessão de Poster da Área de Biologia Celular e Molecular da FMRP-USP, 2004, Ribeirão Preto. Revista do Hospital das Clínicas e da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da USP, 2004. v. 37. p. 37.

50.
SQUINA F. M.; TOSI, L. R. O. . The use of transposon technology for systematic gene disruption in Leishmania. In: II Sessão de Poster da Área de Biologia Celular e Molecular da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo, 2004, Ribeirão Preto. Revista do Hospital das Clínicas e da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da USP, 2004. v. 37. p. 43.

51.
SQUINA F. M.; PEDROSA, A. L. ; RENZI, A. ; CRUZ, A. K. ; TOSI, L. R. O. . Systematic production of reagents for gene inactivation in Leishmania. In: XIV Molecular Parasitology Meeting, 2003. Abstracts, 2003. p. 254B.

52.
SQUINA F. M.; PEDROSA, A. L. ; CRUZ, A. K. ; TOSI, L. R. O. . Systematic disruption of genes at Leishmania chromosome end. In: XIX Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Protozoologia e XXX Reunião Anual da Pesquisa Básica em Doença de Chagas, 2003, Caxambu. Revista do Instituto de Medicina Tropical de Sâo Paulo. Sâo Paulo, 2003. v. 45. p. 180.

53.
DIAS, F. C. ; SQUINA F. M. ; TOSI, L. R. O. . Characterization of the H locus of Leishmania (Viannia) braziliensis. In: XVIII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Protozoologia e XXIX Reunião Anual da Pesquisa Básica em Doença de Chagas, 2002, Caxambu. Revista do Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, 2002. v. 44. p. 77.

54.
SQUINA F. M.; PEDROSA, A. L. ; RENZI, A. ; CRUZ, A. K. ; TOSI, L. R. O. . The Use of Transposon for Systematic Disruption of Leishmania Genes. In: XVIII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Protozoologia e XXIX Reunião Anual da Pesquisa Básica em Doença de Chagas, 2002, Caxambu. Revista do Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, 2002. v. 44. p. 71.

55.
PEDROSA, A. L. ; SQUINA F. M. ; TOSI, L. R. O. ; CRUZ, A. K. . DNA Directed DNA Polimerase III Gene from Leishmania major and its Use as Probe to Evaluate Transcriptional Activity in Telomeric Regions. In: XVIII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Protozoologia e XXIX Reunião Anual da Pesquisa Básica em Doença de Chagas, 2002, Caxambu. Revista do Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, 2002. v. 44. p. 32.

56.
DIAS, F. C. ; SQUINA F. M. ; TOSI, L. R. O. . Caracterização do locus H de Leishmania (Viannia) braziliensis. In: I Sessão de Poster da Área de Biologia Celular e Molecular da FMRP-USP, 2002, Ribeirão Preto. Livro de Resumos, 2002. v. 1. p. 17.

57.
SQUINA F. M.; PEDROSA, A. L. ; AUGUSTO, M. J. ; RENZI, A. ; CRUZ, A. K. ; TOSI, L. R. O. . Nocaute Sistemático de Genes em Leishmania Utilizando Transposição in vitro. In: I Sessão de Poster da Área de Biologia Celular e Molecular da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo, 2002, Ribeirão Preto. Livro de Resumos, 2002. v. 1. p. 67.

58.
SQUINA F. M.; MERCADANTE, A. Z. ; FERREIRA, J. L. . Production of Carotenoids by Rhodotorula rubra and R. glutinis in Medium with Diluted Sugar-cane-juice. In: III Congresso Ibero Americano de Ingeniería de Alimentos, 2001, Valencia. Realción de Trabajos Presentados, 2001.

59.
SQUINA F. M.; MERCADANTE, A. Z. ; FERREIRA, J. L. . Influence of Nicotine and Diphenylamine on the Carotenoid Composition of Rhodotorula glutinis and R. rubra. In: III Congress of Pharmaceutical Sciences, 2001, Poços de Caldas. European Journal of Pharmaceutical Sciences, 2001. v. 13. p. 541.

60.
SQUINA F. M.; FERREIRA, J. L. ; MERCADANTE, A. Z. . Quantificação por CLAE dos principais carotenóides das Leveduras Rhodotorula lactosa, R. rubra. R. minuta e R. araucariae. In: XVII Congresso Brasileiro de Ciência e Tecnologia de Alimentos, 2000, Fortaleza. Livro de resumos, 2000. v. 3. p. 9.84.

61.
SQUINA F. M.; MERCADANTE, A. Z. . Desenvolvimento de Método para Determinação de Carotenóides em Leveduras do Gênero Rhodotorula. In: XVII Congresso Brasileiro de Ciência e Tecnologia de Alimentos, 2000, Fortaleza. Livro de Resumos. v. 1. p. 2.24.

62.
SQUINA F. M.; TOLEDO, J. S. ; SAID, S. . Effects of Natural Phenolic Compounds on the Growing and Morfology of Neurospora crassa. In: II Congress of Pharmaceutical Sciences, 1999, Ribeirão Preto. Bollettino Chimico Farmaceutico, 1999. v. 138. p. 138.

63.
TOLEDO, J. S. ; SQUINA F. M. ; SAID, S. . The Degradation of Cinnamic acid, a Potent Growth Inhibitor, by Neurospora crassa. In: II Congress of Pharmaceutical Sciences, 1999. Bollettino Chimico Farmaceutico, 1999. v. 138. p. 137.

Apresentações de Trabalho
1.
Squina, FM. Expanding the Knowledge of Auxiliary Mechanisms Based on Omics Approaches. III Escola de Biofísica Molecular, IBILCE - UNESP. 2017. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

2.
Squina, FM. Desenvolvimento de enzimas envolvidas na conversão de Biomassa Lignocelulósica. II Workbiotec - Workshop da pós graduação em Biotecnologia, IB - UNESP (Botucatu). 2016. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

3.
Squina, FM. Expanding the Knowledge of Auxiliary Mechanisms Based on Omics Mining of Natural Lignocellulolytic Systems. Workshop on Second Generation Bioethanol CNPEM - CTBE. 2016. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

4.
Squina, FM. Targeted Enzyme Discovery Based on Omics Mining of Natural Lignocellulolytic Systems. 67ª Reunião Anual da Sociedade Brasileira para o Progresso da Ciência. 2015. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

5.
SQUINA, F.M.. History of DNA sequencing development, with focus on new technologies. Workshop on Application of Next Generation Sequencing, CTBE - CNPEM. 2015. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

6.
Squina, Fabio Marcio. Desenvolvimento de Abordagens 'Omicas' para a Descoberta de Biocatalisadores para Conversão da Biomassa Vegetal. ENZITEC.. 2014. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

7.
Squina, FM. From Biomass-to-Bioproduct Application using Discovery-based Omics approaches. XXII Congreso Latinoamericano de Microbiología. 2014. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

8.
Squina, FM. Omics-based approaches for biocatalyst discovery in lignocellulose-to-bioproduct applications. 2nd Brazilian BioEnergy Science and Technology Conference. 2014. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

9.
Squina, FM. Estratégias Meta-prote-Genômicas para Prospecção de Enzimas com Aplicação Biotecnológica. 2014. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

10.
Squina, FM. From biomass-to-bioproduct application using discovery-based omics approaches. CNPEM-UK Meeting on Biocatalyst Discovery and Synthetic Biology. 2014. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

11.
Squina, Fabio Marcio. Development of omics-based approaches for biocatalyst discovery in lignocellulose-to-bioproduct applications. USP Conference on Synthetic Biology for Biomass and Biofuels Production. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

12.
Squina, Fabio Marcio. Omics approaches to biocatalysts discovery in biomass-­‐to-­‐bioproducts applicaons. Manchester - Brazil Industrial Biotechnology and Bioenergy Meeting. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

13.
Squina, Fabio Marcio. Metaproteogenomics Strategies for Enzyme Discovery in Biomass-to-Bioproducts aplications. XLII Reunião da Soc. Brasileira de Bioquímica. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

14.
Squina, Fabio Marcio. Chemicals and fuels from raw materials: disclosure by biotechnology. NWO-FAPESP-CNPq Joint Workshop. 2012. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

15.
Squina, Fabio Marcio. Library generation for biomass-conversion enzymes from soil metagenome. Workshop FAPESP/BIOEN de Pesquisa. 2012. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

16.
Squina, Fabio Marcio. Aplicação de Ferramentas 'Omicas' para prospecção de enzimas biotechnologicas e sua caracterização molecular. 9 SLACA - Simpósio Latino Americano de Ciência de Alimentos. 2011. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

17.
Squina, Fabio Marcio. Expressão Heteróloga de Celulases em Fungo Filamentoso. 26 Congresso Brasileiro de Microbiologia. 2011. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

18.
Squina, Fabio Marcio. The Lignocellulolytic Metagenome of Sugarcane Bagasse- Degrading Soil. 1st Brazilian Bioenergy Science and Technology Conference (BBEST). 2011. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

19.
SQUINA F. M.. Desenvolvimento de enzimas Envolvidas na produção de biocombustíveis. II 4BIOTEC. 2010. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

20.
Squina, Fabio Marcio. Evaluating filamentous fungi as biological system to produce recombinant enzymes and to assess modulation of gene expression in response to extracellular environment Workshop on Second Generation Bioethanol CTBE - CNPEM. 2010. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

21.
SQUINA, F.M.. Library generation for Biomass-Coversion enzymes from soil metagenome - UK - Brazil Frontier of Science Symposium. 2010. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

22.
Squina, Fabio Marcio. Abordagens Metagenômicas para busca de enzimas de interesse biotecnológico. Workshop do Programa de Pós-Graduação em Genética da FMRP - USP. 2010. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

23.
SQUINA F. M.; PRADE, R. A. . Gene library generation for biomass-conversion enzymes - Xth International Fungal Biology Conference. 2009. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

24.
SQUINA F. M.. Novos Rumos e Aplicaçações da Biologia Molecular. Congresso Aberto de Estudantes de Biologia IB - UNICAMP. 2009. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

25.
SQUINA F. M.; LEAL, J. ; GRAS, D. E. ; FREITAS, J. S. ; SILVA, E. M. ; MARTINEZ-ROSSI, N. M. ; ROSSI, A. . New features over the expression of Neurospora crassa genes in response to extracellular phosphate levels and pH. Neurospora 2008 - Asilomar Conference. 2008. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

26.
SQUINA F. M.; AUGUSTO, M. J. ; RUIZ, J. C. ; CRUZ, A. K. ; TOSI, L. R. O. . The systematic production of reagents for genome integration by shuttle mutagenesis: disruption of genes at Leishmania telomeric ends. TriTryp Genomes Meeting. 2004. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

27.
SQUINA F. M.; AUGUSTO, M. J. ; RUIZ, J. C. ; CRUZ, A. K. ; TOSI, L. R. O. . In vitro shuttle mutagenesis and functional analysis in Leishmania: gene disruption and complementation of a telomere-located RNA polymerase. XX Annual Meeting of the Brazilian Society of Protozoology. 2004. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).


Produção técnica
Trabalhos técnicos
1.
SQUINA, FM. Membro do Comitê da avaliação de pôsteres da XLlII Reunião anual da SBBq. 2014.

2.
Squina, F.. Membro do Comitê Local da 2nd Brazilian BioEnergy Science and Technology Conference. 2014.

3.
Squina, Fabio Marcio. Membro do Comitê da avaliação de pôsteres da XLlI Reunião anual da SBBq. 2013.

4.
Squina, Fabio Marcio. Membro do Comitê de Análise de Propostas apresentadas no Programa PIPE. 2013.

Entrevistas, mesas redondas, programas e comentários na mídia
1.
Squina, FM. SP Pesquisa - Etanol. 2015. (Programa de rádio ou TV/Entrevista).


Demais tipos de produção técnica
1.
SQUINA F. M.; SOUSA, J. F. ; RULER, R. ; VALENTE, V. ; PATUSSI, E. V. ; GRAMINHA, M. A. S. ; NASCIMENTO, A. A. C. ; ESPREAFICO, E. M. ; LARSON, M. L. P. ; MONESI, N. ; MARTINEZ-ROSSI, N. M. ; RODRIGUES, V. . Apostila de Tecnologia do DNA Recombinate. 2006. (Desenvolvimento de material didático ou instrucional - Revisão e atualização da Apostila de Tecnologia do DNA Recombinate).

2.
SQUINA F. M.; SOUSA, J. F. ; MODENA, J. L. P. ; TOLEDO, J. S. ; GODOY, L. M. F. ; RULER, R. ; IZIDORO, T. C. ; VALENTE, V. ; CRUZ, A. K. . Princípios e Aplicações das Principais Metodologias em Biologia Celular e Molecular. 2004. (Desenvolvimento de material didático ou instrucional - Apostila Didática).



Patentes e registros



Patente

A Confirmação do status de um pedido de patentes poderá ser solicitada à Diretoria de Patentes (DIRPA) por meio de uma Certidão de atos relativos aos processos
1.
 Squina, Fabio M.; PRADE, R. A. . New recombinant/isolated and purified heat stable endo-xylanase, laminarase, mannanase, arabinase, or arabinofuranosidase having specific amino acid sequence, is used in biofuel production method to hydrolyze hemicellulose. (WO/2012/0040410). Patente licenciada por EDENSPACE SYSTEM CORPORATION Virginia EUA. 2012, Estados Unidos.
Patente: Privilégio de Inovação. Número do registro: US2012040410-A1, título: "New recombinant/isolated and purified heat stable endo-xylanase, laminarase, mannanase, arabinase, or arabinofuranosidase having specific amino acid sequence, is used in biofuel production method to hydrolyze hemicellulose. (WO/2012/0040410). Patente licenciada por EDENSPACE SYSTEM CORPORATION Virginia EUA" , Instituição de registro: WIPO - World Intellectual Property Organization. Depósito: 16/02/2012

2.
 PRADELLA, J. G. C. ; DILLON, A. ; B.PIMENTA, M. T. ; ROCHA, G. J. M. ; Squina, Fabio M. ; DELABONA, P. S. ; Ruller, R. ; Ribeiro, Daniela A. ; FONTANA, R. C. . Producing cellulytic enzyme from filamentous fungus Penicillium echinulatum used in enzymatic hydrolysis of lignocellulosic biomass, involves adding carbon and nitrogen source in controlled way for modulating enzymes. 2012, Brasil.
Patente: Privilégio de Inovação. Número do registro: BR102013026715, título: "Producing cellulytic enzyme from filamentous fungus Penicillium echinulatum used in enzymatic hydrolysis of lignocellulosic biomass, involves adding carbon and nitrogen source in controlled way for modulating enzymes" , Instituição de registro: Pedido de Patente INPI. Depósito PCT: 19/10/2012; Depósito: 19/10/2012.

3.
 SQUINA F. M.; DAMASIO, A. ; CITADINI, A. P. ; BRAGA, C. ; PAIVA, L. B. B. ; Segato, Fernando ; Santos, W. D. . Producing phenolic compound, particularly ferulic acid and coumaric acid, involves utilizing enzyme system with feruloyl esterase property for treatment of bagasse from sugarcane to obtain second-generation ethanol. 2012, Brasil.
Patente: Privilégio de Inovação. Número do registro: BR102012001201, título: "Producing phenolic compound, particularly ferulic acid and coumaric acid, involves utilizing enzyme system with feruloyl esterase property for treatment of bagasse from sugarcane to obtain second-generation ethanol" , Instituição de registro: INPI - Instituto Nacional da Propriedade Industrial. Depósito: 18/01/2012; Pedido do Exame: 23/02/2012. Instituição(ões) financiadora(s): Associação Brasileira de Tecnologia de Luz Sincrotron.

4.
 PRADELLA, JOSÉ GERALDO DA CRUZ ; B.PIMENTA, M. T. ; Ruller, R. ; ROCHA, GEORGE J. M. ; SQUINA, FÁBIO MARCIO ; DELABONA, PRISCILA DA SILVA ; Ribeiro, Daniela A. ; DILLON, ALDO JOSÉ PINHEIRO ; CAMASSOLA, MARLI . Method for producing enzymes with Filamentary Penicillium Fungus Echinulatum for use in enzymatic reaction hydrolysis of lignocellulosic biomass, involves estimating growth and induction of enzymatic complex such that product is obtained. 2013, Brasil.
Patente: Privilégio de Inovação. Número do registro: BR102012026872, título: "Method for producing enzymes with Filamentary Penicillium Fungus Echinulatum for use in enzymatic reaction hydrolysis of lignocellulosic biomass, involves estimating growth and induction of enzymatic complex such that product is obtained" , Instituição de registro: INPI - Instituto Nacional da Propriedade Industrial. Depósito PCT: 08/01/2013; Depósito: 08/01/2013; Concessão: 24/04/2014.

5.
 Ribeiro, Daniela A. ; B.PIMENTA, M. T. ; CAMASSOLA, M. ; PRADELLA, JOSÉ GERALDO DA CRUZ ; DELABONA, PRISCILA DA SILVA ; ROCHA, G. J. M. ; REIS, L. ; ROSELEI, C. F. ; DILLON, ALDO JOSÉ PINHEIRO ; Ruller, R. ; SQUINA, FM . Producing enzymes used for enzymatic hydrolysis of lignocellulosic biomass such as agricultural residues such as straw, corn cobs, rice husk, wood waste, bagasse or sugarcane, involves preparing an inoculum with filamentous fungus. 2014, Brasil.
Patente: Privilégio de Inovação. Número do registro: WO2014059502-A1, título: "Producing enzymes used for enzymatic hydrolysis of lignocellulosic biomass such as agricultural residues such as straw, corn cobs, rice husk, wood waste, bagasse or sugarcane, involves preparing an inoculum with filamentous fungus" , Instituição de registro: WIPO - World Intellectual Property Organization. Depósito: 13/01/2014; Depósito PCT: 24/04/2014.

6.
 DIOGO, JOSÉ A. ; Hoffmam, Zaira ; PRADELLA, JOSÉ GERALDO DA CRUZ ; Ruller, R. ; Squina, Fabio Marcio . Bifunctional enzyme used for degrading lignocellulosic portions of biomass for obtaining xylose, has amino acids, and comprises xylosidase, linker and xylanase made of certain amino acids. 2015, Estados Unidos.
Patente: Privilégio de Inovação. Número do registro: WO2015006843-A2, título: "Bifunctional enzyme used for degrading lignocellulosic portions of biomass for obtaining xylose, has amino acids, and comprises xylosidase, linker and xylanase made of certain amino acids" , Instituição de registro: WIPO - World Intellectual Property Organization. Depósito: 22/01/2015

7.
 SQUINA, FÁBIO MARCIO; Franco Cairo, J. P. L. ; CARAZZOLLE, M. F. ; MANDELLI, F. ; PRADELLA, JOSÉ GERALDO DA CRUZ ; Alvarez, Thabata Maria ; Leonardo, Flavia C. ; COSTA, FERNANDO F. ; COSTA-LEONARDO, A. M. ; PEREIRA, G. A. G. ; BRENELLI, L.B. ; Gonçalves, T.A. ; ROBL, DIOGO . Lignocellulolytic enzyme composition used for recovery and conversion of lignocellulosic materials for production of second generation ethanol or other high added by-products, comprises superoxide dismutase and cellulases. 2015, Brasil.
Patente: Privilégio de Inovação. Número do registro: WO2017011885-A1, título: "Lignocellulolytic enzyme composition used for recovery and conversion of lignocellulosic materials for production of second generation ethanol or other high added by-products, comprises superoxide dismutase and cellulases" , Instituição de registro: WIPO - World Intellectual Property Organization. Depósito: 20/07/2015; Depósito PCT: 20/07/2015.

8.
 FARINAS, CRISTIANE SANCHEZ ; PAIXÃO, D. A. A. ; FRANCO CAIRO, JOÃO P. L. ; PRADELLA, JOSÉ GERALDO DA CRUZ ; DELABONA, PRISCILA DA SILVA ; Ruller, R. ; Hoffmam, Zaira ; SQUINA, FÁBIO MARCIO . Trichoderma harzianum enzymatic cocktail for hydrolysis of material lignocellulose, preferably pre-treated sugarcane bagasse, is supplemented with auxiliary enzymes which comprise pectinase and alpha-L-arabinufofanosanase. 2017, Brasil.
Patente: Privilégio de Inovação. Número do registro: BR102013029947, título: "Trichoderma harzianum enzymatic cocktail for hydrolysis of material lignocellulose, preferably pre-treated sugarcane bagasse, is supplemented with auxiliary enzymes which comprise pectinase and alpha-L-arabinufofanosanase" , Instituição de registro: INPI - Instituto Nacional da Propriedade Industrial. Depósito: 27/06/2017



Bancas



Participação em bancas de trabalhos de conclusão
Mestrado
1.
SQUINA F. M.. Participação em banca de Ana Paula Almeida dos Santos. Desenvolvimento de um método Analítico para Determinação da atividade de esterases usando material Lignocelulósico como substrato. 2014. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.

2.
SQUINA F. M.. Participação em banca de Maria Fernanda Benitiz Eriz. Atividade Hidrolítica de Extratos Enzimáticos obtidos a partir de Gloeophyllum trabeum associada a substratos celulósicos oxidados. 2014. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.

3.
SQUINA F. M.. Participação em banca de Dayelle Samila Pessoti de Oliveira Gonçalvez. Estudo sobre o modo de ação de enzimas hidrolíticas produzidas por fungos degradadores de madeira sobre substratos com elevado teor de lignina. 2013. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.

4.
SQUINA F. M.. Participação em banca de Bárbara Luiza Silva Santiago. Avaliação do tratamento alcalino do bagaço de malte e seu efeito sobre a bioconversão das fraçoes açucaradas em etanol. 2013. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.

5.
SQUINA F. M.. Participação em banca de Fernanda de Lima Valadares. Produção e uso de enzimas derivadas do fungo Pleurotus ostearus na hidrólise do bagaço de cana pré-tratado por processo quimiotermomecânico. 2013. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.

6.
SQUINA F. M.. Participação em banca de Gustavo Machado Alvarez de Lima. Estudos estruturais e moleculares da enzimas fosfopantetenil transferase de Xanthomonas albilineans: alvo molecular para o desenvolvimento de novos agroquímicos para a cultura de cana de açúcar. 2013. Dissertação (Mestrado em Ciências Física Aplicada) - Universidade de São Paulo.

7.
SQUINA F. M.. Participação em banca de Fernanda Craveiro Franco. Clonagem e expressão heteróloga do gene de uma xilanase de Thermoascus aurantiacus em Pichia pastoris. 2011. Dissertação (Mestrado em Microbiologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

8.
SQUINA F. M.. Participação em banca de Viviane Santos Miranda. Carotenóides de bactérias extremófilas: produção, caracterização e atividade antioxidante. 2010. Dissertação (Mestrado em Ciência de Alimentos) - Universidade Estadual de Campinas.

9.
SQUINA F. M.. Participação em banca de Fernanda Mandelli. Bactéria Termofílica Thermus Filiformis: Produção de Carotenóides e Avaliação da Capacidade Antioxidante. 2010. Dissertação (Mestrado em Ciência de Alimentos) - Universidade Estadual de Campinas.

Teses de doutorado
1.
SQUINA F. M.. Participação em banca de Omar Antônio Uyarte. Sistemas oxidativos biomiméticos aplicados à hidrólise enzimática de materiais lignocelulósicos. 2016. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.

2.
SQUINA F. M.. Participação em banca de Caio Vinicius dos Reis. Produção heteróloga, caracterização biofísica e estrutural de xilose isomerases visando potenciais aplicações na fermentação de pentoses. 2016. Tese (Doutorado em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Universidade de São Paulo.

3.
SQUINA F. M.. Participação em banca de Ivana Stankvic. Dinâmica Molecular de Celulases: Estudos de Reconhecimento de substrato e propriedades conformacionais. 2014. Tese (Doutorado em Instituto de Química) - Universidade Estadual de Campinas.

4.
SQUINA F. M.. Participação em banca de Isabelle Bezerra Cordeiro. Estudos Proteômicos revelam um novo papel da FAK na regulação do splicing do mRNA. 2014. Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

5.
SQUINA F. M.. Participação em banca de Jorge Lepikson Neto. Influência da suplementação por falonóides na formação da madeira em Eucalipto.. 2013. Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

6.
SQUINA F. M.. Participação em banca de Franciele Colussi. Caracterização Bioquímica, biofísica e estrutural da Celobiohidrolase I de Trichoderma harzianum envolvida na hidrólise da biomassa lignocelulósica. 2012. Tese (Doutorado em Ciências Física Aplicada) - Universidade de São Paulo.

7.
SQUINA F. M.. Participação em banca de Marcela Mendes Salazar. Caracterização do transcriptoma e parede celular de três espécies de Eucalyptus com importância industrial. 2012. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

8.
SQUINA F. M.. Participação em banca de Carla Botelho Machado. Estratégias Metagenômicas na bioprospecção de glicosil hidrolases para o uso na biorefinaria de biomassa. 2012. Tese (Doutorado em Ciencias - área Química) - Universidade de São Paulo.

9.
SQUINA F. M.. Participação em banca de Fernanda Barbosa Cupertino. Caracterização funcional de fatores de transcrição envolvidos na regulação do metabolismo do glicogênio em Neurospora crassa. 2011. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

10.
SQUINA F. M.. Participação em banca de Diane Téo de Moraes. Produção de Lipopeptídeo Surfactina a partir de uma cepa de Bacillus subtilis com operon Srfa sob controle do promotor Regulado Pgrac. 2010. Tese (Doutorado em Ciência de Alimentos) - Universidade Estadual de Campinas.

Qualificações de Doutorado
1.
SQUINA F. M.. Participação em banca de Bruno Luan Soares Paula de Mello. Identificação de novas enzimas com potencial na hidrólise de ligações glicosídicas. 2015. Exame de qualificação (Doutorando em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Universidade de São Paulo.

2.
SQUINA F. M.. Participação em banca de Camilia Aoyagui dos Santos. Bioconversão do Resíduo do Precessamento de Óleo de Palma visando a Produção de Vanilina Natural. 2014. Exame de qualificação (Doutorando em Ciência de Alimentos) - Universidade Estadual de Campinas.

3.
SQUINA F. M.. Participação em banca de Sulamita de Freitas Franco. Caracterização de taumatinas do fungo causador da Vassoura de bruxa, Moniliophthora perniciosa. 2013. Exame de qualificação (Doutorando em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

4.
SQUINA F. M.. Participação em banca de Marcelo Vizoná Liberato. Estrutura aberta do anel citoplasmático do canal de potássio de alta condutância ativado por calcio. 2012. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Física Aplicada) - Universidade de São Paulo.

5.
SQUINA F. M.. Participação em banca de Yuri de Abreo Mendonça. Caracterização de uma Hsp90 de Citrus sinensis potencialmente envolvida no processo infectivo do fitopatógeno Xanthomonas citri. 2011. Exame de qualificação (Doutorando em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Qualificações de Mestrado
1.
SQUINA F. M.. Participação em banca de Roberta Menegaldo Dal?Mas. Caractarização de novos fatores de transcrição de Trichoderma reesei relacionados com a degradação da biomassa lignocelulósic. 2016.

2.
SQUINA F. M.. Participação em banca de Gustavo Pagotto Borin. Estudos genômicos da expressão gênica global do fungo filamentoso Trichoderma reesei crescido em bagaço de cana-de-açúcar. 2014.



Participação em bancas de comissões julgadoras
Concurso público
1.
SQUINA F. M.. Cargo de Professor Doutor RDIDP junto ao Departamento de Biotecnologia, Escola de Engenharia de Lorena. 2013. Universidade de São Paulo.

2.
BADINO JUNIOR, A. J.; MITCHELL, D.; MILAGRES, A.; SQUINA F. M.; KILIKIAN, B. V.. Concurso para provimento de vaga de professor doutor na Engenharia Química USP. 2010. Universidade de São Paulo.



Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
III Escola de Biofísica Molecular: uma visão interdisciplinar do sistema biológico.Expanding the Knowledge of Auxiliary Mechanisms Based on Omics Approaches. 2017. (Simpósio).

2.
II Workbiotec - Workshop da pós graduação em Biotecnologia.Desenvolvimento de enzimas envolvidas na conversão de Biomassa Lignocelulósica. 2016. (Simpósio).

3.
67ª Reunião Anual da Sociedade Brasileira para o Progresso da Ciência. Targeted Enzyme Discovery Based on Omics Mining of Natural Lignocellulolytic Systems. 2015. (Congresso).

4.
2nd Brazilian BioEnergy Science and Tecnology Conference. Omics-based approaches for biocatalyst discovery in lignocellulose-to-bioproduct applications. 2014. (Congresso).

5.
62nd ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics. Metaproteogenomic approaches for target discovery of glycoside hydrolases and auxiliary activities in the digestome of lower termite Coptotermes gestroi. 2014. (Congresso).

6.
III Congresso Brasileiro de Recursos Genéticos. Estratégias Meta-prote-Genômicas para Prospecção de Enzimas com Aplicação Biotecnológica. 2014. (Congresso).

7.
XI Seminário Brasileiro de Tecnologia Enzimática (ENZITEC 2014).Desenvolvimento de Abordagens "Omicas" para a Descoberta de Biocatalisadores para Conversão da Biomassa Vegetal. 2014. (Seminário).

8.
XXII Congreso Latinoamericano de Microbiologia. From Biomass-to-Bioproduct Application using Discovery-based Omics approaches. 2014. (Congresso).

9.
Gordon Conference on Cellulosomes, Cellulases & Other Carbohydrate Modifying Enzymes. Metaproteogenomics Strategies for Enzyme Discovery in Biomass-to-Bioproducts aplications. 2013. (Congresso).

10.
Manchester?Brazil Industrial Biotechnology and Bioenergy meeting.Omics approaches to biocatalysts discovery in biomass-­to-­bioproducts applicaons. 2013. (Encontro).

11.
USP Conference on Synthetic Biology for Biomass and Biofuels Production.USP Conference on Synthetic Biology for Biomass and Biofuels Production. 2013. (Simpósio).

12.
XLII Annual Meeting of Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. Metaproteogenomics Strategies for Enzyme Discovery in Biomass-to-Bioproducts aplications. 2013. (Congresso).

13.
14th International Symposium on Microbial Ecology, ISME14,. Deciphering the microbial community and the lignocellulolytic digestome of lower termite Coptotermes gestroi.. 2012. (Congresso).

14.
NWO-FAPESP-CNPq Joint Workshop for developing research collaborations on the Bio-based Economy.Chemicals and fuels from raw materials: disclosure by biotechnology. 2012. (Encontro).

15.
Workshop BIOEN de Pesquisa.Library generation for biomass-conversion enzymes from soil metagenome. 2012. (Encontro).

16.
1st Brazilian BioEnergy Science and Technology Conference. The Lignocellulolytic Metagenome of Sugarcane Bagasse- Degrading Soil. 2011. (Congresso).

17.
26o. Congresso Brasileiro de Microbiologia. Expressão Heteróloga de Celulases em Fungo Filamentoso. 2011. (Congresso).

18.
26th Fungal Genetics Conference at Asilomar. Evaluation of Penicilium Echinulatum secretome through Shotgun Proteomics. 2011. (Congresso).

19.
9 SLACA - Simpósio Latino Americano de Ciência de Alimentos.Aplicação de Ferramentas "Omicas" para prospecção de enzimas biotechnologicas e sua caracterização molecular. 2011. (Simpósio).

20.
Workshop on Synthetic Biology and Robotics. 2011. (Encontro).

21.
XL Annual Meeting of The Brazilian Biochemistry and Molecular Biology Society. Discovery of Biomass Conversion Enzymes from Sugar Cane Soil Metagenome. 2011. (Congresso).

22.
20 Reunião Anual de Usuários do Laboratório Nacional de Luz Sincrotron.Development of a Lybrary for Biomass Conversio Enzymes. 2010. (Encontro).

23.
Bioen Research Workshop.Library generation for biomass-conversion enzymes from soil metagenome. 2010. (Oficina).

24.
BIOEN Workshop on Synthetic Biology. 2010. (Encontro).

25.
Encontro de Pesquisadores do Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia do Bioetanol. 2010. (Encontro).

26.
II 4 BIOTEC.Desenvolvimento de enzimas envolvidas na produção de biocombustíveis. 2010. (Simpósio).

27.
I Workshop do Programa de Pós-Graduação em Genética.Abordagens Metagenômicas para busca de enzimas de interesse biotecnológico. 2010. (Encontro).

28.
UK - Brazil Frontier of Science Symposium.Library generation for Biomass-Coversion enzymes from soil metagenome. 2010. (Simpósio).

29.
Congresso Aberto de Estudantes de Biologia. Novos Rumos e Aplicaçações da Biologia Molecular. 2009. (Congresso).

30.
Xth International Fungal Biology Conference. Gene library generation for biomass-conversion enzymes. 2009. (Congresso).

31.
XVII Simpósio Nacional de Bioprocessos. Development of a Library for Biomaas Conversion Enzymes. 2009. (Congresso).

32.
XXIV Fungal Genetics Conference. Identification of genes down regulated in the pregc mutant strain of N. crassa. 2007. (Congresso).

33.
Curso de Inverno da Bioquímica, Departamento de Bioquímica e Imunologia, na Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo.Palestra: Regulação da expressão gênica em resposta ao fosfato e ao pH em fungos filamentosos. 2006. (Outra).

34.
III Curso de Verão em Biologia Celular e Molecular da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo.Palestra: Organização do Genoma e Projetos Genoma. 2006. (Outra).

35.
LII Congresso Brasileiro de Genética. O fator de transcrição NUC-1 silencia a expressão de genes que codificam proteínas de resposta ao choque térmico do tipo HSP70 em Neurospora crassa. 2006. (Congresso).

36.
XXXV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. A novel preg-controlled gene, involved in the thymidine salvage pathway, was revealed in neurospora crassa using DDRT-PCR. 2006. (Congresso).

37.
II Curso de Verão em Biologia Celula da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo.Palestra: Organização do Genoma e Projetos Genoma. 2005. (Outra).

38.
III Sessão de Poster da Área de Biologia Celular e Molecular da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo.Produção sistemática de reagentes para integração gênica por transposição in vitro: Ruptura de genes na extremidade de telômeros de Leishmania. 2005. (Encontro).

39.
I Curso de Verão em Biologia Celular e Molecular da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo.Palestra: Organização do Genoma e Projetos Genoma. 2004. (Outra).

40.
II Sessão de Poster da Área de Biologia Celular e Molecular da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo.The use of transposon technology for systematic gene disruption in Leishmania. 2004. (Encontro).

41.
TriTryp Genomes Meeting. The systematic production of reagents for genome integration by shuttle mutagenesis: Disruption of genes at Leishmania telomeric ends. 2004. (Congresso).

42.
XX Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Protozoologia e XXXI Reunião Anual da Pesquisa Básica em Doença de Chagas. In vitro shuttle mutagenesis and functional analysis in Leishmania: gene disruption and complementation of a telomere-located RNA polymerase III. 2004. (Congresso).

43.
XIV Molecular Parasitology Meeting. Systematic production of reagents for gene inactivation in Leishmania. 2003. (Congresso).

44.
XIX Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Protozoologia e XXX Reunião Anual da Pesquisa Básica em Doença de Chagas. Systematic disruption of genes at Leishmania chromosome end. 2003. (Congresso).

45.
II Simpósio ?Leishmaniose Tegumentar Americana: Diagnóstico, Tratamento e Controle?. 2002. (Simpósio).

46.
I Sessão de Poster da Área de Biologia Celular e Molecular da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo.Nocaute Sistemático de Genes em Leishmania Utilizando Transposição in vitro. 2002. (Encontro).

47.
IV Workshop de Imunologia. 2002. (Oficina).

48.
VII Curso de Verão em Genética da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo.Aula teórico e prática: Utilização de Técnica de PCR para Tipagem de Leishmania ssp. 2002. (Outra).

49.
XVIII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Protozoologia e XXIX Reunião Anual da Pesquisa Básica em Doença de Chagas. The Use of Transposon for Systematic Disruption of Leishmania Genes. 2002. (Congresso).

50.
III Congress of Pharmaceutical Sciences. Influence of Nicotine and Diphenylamine on the Carotenoid Composition of Rhodotorula glutinis and R. rubra. 2001. (Congresso).

51.
II Congress of Pharmaceutical Sciences. Effects of Natural Phenolic Compounds on the Growing and Morfology of Neurospora crassa. 1999. (Congresso).

52.
III Simpósio Latino Americano de Ciência de Alimentos. 1999. (Simpósio).

53.
I Encontro Farmacêutico de Ribeirão Preto. 1998. (Encontro).

54.
X Simpósio regional de Análises Clínicas. 1998. (Simpósio).

55.
1 Simpósio de Integrado dos Örgãos Estaduais de Saúde e Meio Ambiente. 1997. (Simpósio).

56.
I Congress of Pharmaceutical Sciences. 1997. (Congresso).

57.
X Congresso Paulista de Farmacêuticos e II Seminário Internacional de Farmacêuticos. 1997. (Congresso).


Organização de eventos, congressos, exposições e feiras
1.
SQUINA F. M.. Second Generation Bioethanol 2016. 2016. (Congresso).

2.
SQUINA F. M.. I Workshop on Application of Next Generation Sequencing. 2015. (Outro).

3.
SQUINA F. M.. Second Generation Bioethanol 2014. 2014. (Congresso).

4.
SQUINA F. M.. 2nd Bioenergy Science and Technology Conference. 2014. (Congresso).

5.
SQUINA F. M.. CNPEM-UK Meeting on Biocatalyst Discovery and Synthetic Biology. 2014. (Outro).

6.
SQUINA F. M.. Second Generation Bioethanol: Enzymatic Hydrolysis 2013. 2013. (Congresso).

7.
SQUINA F. M.. Second Generation Bioethanol: Enzymatic Hydrolysis 2012. 2012. (Congresso).

8.
SQUINA F. M.. Second Generation Bioethanol: Enzymatic Hydrolysis 2011. 2011. (Congresso).

9.
SQUINA F. M.; TOLEDO, J. S. ; IZIDORO, T. C. ; SOUSA, J. F. ; VALENTE, V. ; RULER, R. . I Curso de Verão em Biologia Celular e Molecular. 2004. (Outro).

10.
SQUINA F. M.; TOLEDO, J. S. ; IZIDORO, T. C. ; SOUSA, J. F. ; VALENTE, V. ; RULER, R. . II Sessão de Pôster em Biologia Celular e Molecular. 2004. (Outro).

11.
SQUINA F. M.. III Simpósio Latino Americano de Ciência de Alimentos. 1999. (Congresso).



Orientações



Orientações e supervisões em andamento
Dissertação de mestrado
1.
Victoria Ramos Sodré de Castro. Development of E. coli-Rhodococcus CRISPR/Cas9 shuttle vector targeting ferulic acid accumulating Rhodococcus jostii RHA1 mutants. Início: 2017. Dissertação (Mestrado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. (Orientador).

Tese de doutorado
1.
Nathália Vilela. Desenvolvimento de uma levedura capaz de converter material lignocelulósico em ácido ferúlico... Início: 2017. Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. (Orientador).

2.
Robson Tramontina. NOVAS ESTRATÉGIAS INTEGRATIVAS ATRAVÉS DE UMA ALDOKETO REDUTASE DO CUPIM COPTOTERMES GESTROI PARA SACARIFICAÇÃO, DETOXIFICAÇÃO E FERMENTAÇÃO DE LIGNOCELULOSE VISANDO A PRODUÇÃO DE BIOETANOL. Início: 2016. Tese (Doutorado em BIOCIÊNCIAS E TECNOLOGIA DE PRODUTOS BIOATIVOS) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. (Orientador).

Supervisão de pós-doutorado
1.
Thiago Augusto Gonçalves. Início: 2017. Universidade de Sorocaba, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo.

2.
João Paulo Franco Cairo. Início: 2016. Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo.

3.
Geizecler Tomazetto. Início: 2016. Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo.

4.
Marcelo Vizoná Liberato. Início: 2014. Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais.


Orientações e supervisões concluídas
Dissertação de mestrado
1.
Agnes Cristina Pimentel. Influência de um domínio acessório nas características bioquímicas e estruturais da celulase CelE2. 2018. Dissertação (Mestrado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Fabio Marcio Squina.

2.
Ana Carolina Piva de Oliveira. Avaliação dos mecanismos de degradação da biomassa lignocelulósica pelo fungo basidiomiceto Laetiporus sulphureus. 2018. Dissertação (Mestrado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Fabio Marcio Squina.

3.
Robson Tramontina. Caracterização de enzimas auxiliares (redox) do cupim Coptotermes gestroi que atuam em conjunto com hidrolases glicolíticas. 2016. Dissertação (Mestrado em BIOCIÊNCIAS E TECNOLOGIA DE PRODUTOS BIOATIVOS) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Fabio Marcio Squina.

4.
Camila Cristina Sanchez. Estudos genômicos da expressão gênica global de Aspergillus niger crescido em bagaço e colmo de cana-de-açúcar. 2016. Dissertação (Mestrado em BIOCIÊNCIAS E TECNOLOGIA DE PRODUTOS BIOATIVOS) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Fabio Marcio Squina.

5.
FERNANDA BÜCHLI. Bioprospecção de Enzimas Envolvidas na Decomposição do Bagaço de Cana Através de Abordagens Metagenômicas e Metaproteômicas.. 2014. Dissertação (Mestrado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Fabio Marcio Squina.

6.
Livia Brenelli. Conversão Enzimática do Bagaço de Cana de Açúcar em Ácido Ferúlico e xilo-oligossacarídeos. 2013. Dissertação (Mestrado em BIOCIÊNCIAS E TECNOLOGIA DE PRODUTOS BIOATIVOS) - Universidade Estadual de Campinas, . Orientador: Fabio Marcio Squina.

7.
Zaira Bruna Hoffmam. ESTUDOS FUNCIONAIS DE HEMICELULASES MICROBIANAS COM POTENCIAL APLICAÇÃO BIOTECNOLÓGICA EM BIORREFINARIAS DE BIOMASSAS HEMICELULÓSICAS. 2013. Dissertação (Mestrado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Fabio Marcio Squina.

8.
João Paulo Cairo. Identificação e caracterização de genes e enzimas para hidrolases glicolíticas no cupim Coptotermes gestroi visando a aplicação na produção do bioetanol de segunda geração. 2012. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Coorientador: Fabio Marcio Squina.

Tese de doutorado
1.
Lívia Beatriz Brenelli de Paiva. Aplicação de abordagens químicas e biológicas para valorização da lignina. 2017. Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Fabio Marcio Squina.

2.
Thiago Augusto Golçalves. Caracterização de Proteínas Secretadas por Neurospora crassa em Resposta ao Cultivo em Material Lignocelulósico. 2017. Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Fabio Marcio Squina.

3.
Eduardo Cruz Moraes. Integrando a descoberta de enzimas e a otimização de vias metabólicas para valorização do bagaço. 2017. Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Fabio Marcio Squina.

4.
João Paulo Lourenço Franco Cairo. Investigação de vias de degradação de biomassa lignocelulósica no cupim Coptotermes gestroi complementares a hidrolases glicolíticas visando aplicação na produção de bioprodutos derivados de biomassa lignocelulósica. 2016. Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Fabio Marcio Squina.

5.
Fernanda Mandelli. Estudo da Capacidade Antioxidante de Carotenóides e de Carotenóides e de Proteínas da bactéria Hipertermofílica Thermus filiformes. 2014. Tese (Doutorado em Ciência de Alimentos) - Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Coorientador: Fabio Marcio Squina.

6.
Júnio Cota Silva. Estudos Funcionais e Estruturais de Hidrolases Bacterianas Visando Aplicações em Bioprocessos. 2013. Tese (Doutorado em Ciência de Alimentos) - Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Coorientador: Fabio Marcio Squina.

7.
Thabata Maria Alvarez. Desenvolvimento de uma Biblioteca De Enzimas a partir de Metagenoma de Solo. 2013. Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Fabio Marcio Squina.

8.
BRUNO AUGUSTO DIAS. CARACTERIZAÇÃO FUNCIONAL E ESTRUTURAL DE UMA β-GLUCANASE GH12 DE Aspergillus terreus. 2013. Tese (Doutorado em Microbiologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Coorientador: Fabio Marcio Squina.

Supervisão de pós-doutorado
1.
Cristiane Akemi Uchima. 2015. Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Fabio Marcio Squina.

2.
Thamy Lívia Ribeiro Corrêa. 2014. Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Fabio Marcio Squina.

3.
Fernanda Mandelli. 2014. Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Fabio Marcio Squina.

4.
André Ricardo de Lima Damásio. 2013. Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Fabio Marcio Squina.

5.
Rosana Goldbeck. 2013. Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Fabio Marcio Squina.

Iniciação científica
1.
Brenda Oliveira Ramires. Montagem e Anotação de Genomas de microorganismos de interesse biotecnológico. 2013. Iniciação Científica - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Fabio Marcio Squina.

2.
Isabela de Oliveira. Bioprospecção por Estratégias de Metagenômica de Enzimas Envolvidas na Conversão de Biomassa Vegetal. 2012. Iniciação Científica - Associação Brasileira de Tecnologia de Luz Sincrotron, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Fabio Marcio Squina.

3.
Flavio Pessanha. Caracterização Bioquimica e Biofísica de b-glucosidases hipertermofílicas. 2011. Iniciação Científica - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Fabio Marcio Squina.

4.
Thiago Augusto Gonçalves. PRODUÇÃO, PURIFICAÇÃO E CARACTERIZAÇÃO DE HEMICELULASES SUPEREXPRESSAS EM Aspergillus nidulans. 2011. Iniciação Científica - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Associação Brasileira de Tecnologia de Luz Sincrotron. Orientador: Fabio Marcio Squina.

5.
FERNANDA BÜCHLI. Bioprospecção de Enzimas Biotecnológicas através de Estratégias de Metagenômica. 2011. Iniciação Científica - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Associação Brasileira de Tecnologia de Luz Sincrotron. Orientador: Fabio Marcio Squina.

6.
Anna Paula Cruz Garcia. Desenvolvimento de um processo integrado de pré-tratamento e hidrólise enzimática do bagaço de cana de açúcar. 2011. Iniciação Científica - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Associação Brasileira de Tecnologia de Luz Sincrotron. Orientador: Fabio Marcio Squina.

7.
JOSE ALBERTO DIOGO. Clonagem, Expressão e Caracterização b-glucosidases hipertermofílicas. 2011. Iniciação Científica - Associação Brasileira de Tecnologia de Luz Sincrotron, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Fabio Marcio Squina.

8.
FABÍOLA MARIA TESTONI. EXPRESSÃO, PURIFICAÇÃO E CARACTERIZAÇÃO DEENDO-ARABINANASE DE Thermotoga petrophila. 2010. Iniciação Científica - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Associação Brasileira de Tecnologia de Luz Sincrotron. Orientador: Fabio Marcio Squina.

9.
Cleiton Pinto Braga. Expressão e Caracterização de Feruloil Esterases de Aspergillus clavatus. 2010. Iniciação Científica - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Orientador: Fabio Marcio Squina.

10.
Thabata Maria Alvarez. Library generation for biomass-conversion enzymes from soil metagenome. 2010. Iniciação Científica - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Associação Brasileira de Tecnologia de Luz Sincrotron. Orientador: Fabio Marcio Squina.



Inovação



Patente
1.
 Squina, Fabio M.; PRADE, R. A. . New recombinant/isolated and purified heat stable endo-xylanase, laminarase, mannanase, arabinase, or arabinofuranosidase having specific amino acid sequence, is used in biofuel production method to hydrolyze hemicellulose. (WO/2012/0040410). Patente licenciada por EDENSPACE SYSTEM CORPORATION Virginia EUA. 2012, Estados Unidos.
Patente: Privilégio de Inovação. Número do registro: US2012040410-A1, título: "New recombinant/isolated and purified heat stable endo-xylanase, laminarase, mannanase, arabinase, or arabinofuranosidase having specific amino acid sequence, is used in biofuel production method to hydrolyze hemicellulose. (WO/2012/0040410). Patente licenciada por EDENSPACE SYSTEM CORPORATION Virginia EUA" , Instituição de registro: WIPO - World Intellectual Property Organization. Depósito: 16/02/2012

2.
 PRADELLA, J. G. C. ; DILLON, A. ; B.PIMENTA, M. T. ; ROCHA, G. J. M. ; Squina, Fabio M. ; DELABONA, P. S. ; Ruller, R. ; Ribeiro, Daniela A. ; FONTANA, R. C. . Producing cellulytic enzyme from filamentous fungus Penicillium echinulatum used in enzymatic hydrolysis of lignocellulosic biomass, involves adding carbon and nitrogen source in controlled way for modulating enzymes. 2012, Brasil.
Patente: Privilégio de Inovação. Número do registro: BR102013026715, título: "Producing cellulytic enzyme from filamentous fungus Penicillium echinulatum used in enzymatic hydrolysis of lignocellulosic biomass, involves adding carbon and nitrogen source in controlled way for modulating enzymes" , Instituição de registro: Pedido de Patente INPI. Depósito PCT: 19/10/2012; Depósito: 19/10/2012.

3.
 PRADELLA, JOSÉ GERALDO DA CRUZ ; B.PIMENTA, M. T. ; Ruller, R. ; ROCHA, GEORGE J. M. ; SQUINA, FÁBIO MARCIO ; DELABONA, PRISCILA DA SILVA ; Ribeiro, Daniela A. ; DILLON, ALDO JOSÉ PINHEIRO ; CAMASSOLA, MARLI . Method for producing enzymes with Filamentary Penicillium Fungus Echinulatum for use in enzymatic reaction hydrolysis of lignocellulosic biomass, involves estimating growth and induction of enzymatic complex such that product is obtained. 2013, Brasil.
Patente: Privilégio de Inovação. Número do registro: BR102012026872, título: "Method for producing enzymes with Filamentary Penicillium Fungus Echinulatum for use in enzymatic reaction hydrolysis of lignocellulosic biomass, involves estimating growth and induction of enzymatic complex such that product is obtained" , Instituição de registro: INPI - Instituto Nacional da Propriedade Industrial. Depósito PCT: 08/01/2013; Depósito: 08/01/2013; Concessão: 24/04/2014.

4.
 Ribeiro, Daniela A. ; B.PIMENTA, M. T. ; CAMASSOLA, M. ; PRADELLA, JOSÉ GERALDO DA CRUZ ; DELABONA, PRISCILA DA SILVA ; ROCHA, G. J. M. ; REIS, L. ; ROSELEI, C. F. ; DILLON, ALDO JOSÉ PINHEIRO ; Ruller, R. ; SQUINA, FM . Producing enzymes used for enzymatic hydrolysis of lignocellulosic biomass such as agricultural residues such as straw, corn cobs, rice husk, wood waste, bagasse or sugarcane, involves preparing an inoculum with filamentous fungus. 2014, Brasil.
Patente: Privilégio de Inovação. Número do registro: WO2014059502-A1, título: "Producing enzymes used for enzymatic hydrolysis of lignocellulosic biomass such as agricultural residues such as straw, corn cobs, rice husk, wood waste, bagasse or sugarcane, involves preparing an inoculum with filamentous fungus" , Instituição de registro: WIPO - World Intellectual Property Organization. Depósito: 13/01/2014; Depósito PCT: 24/04/2014.

5.
 DIOGO, JOSÉ A. ; Hoffmam, Zaira ; PRADELLA, JOSÉ GERALDO DA CRUZ ; Ruller, R. ; Squina, Fabio Marcio . Bifunctional enzyme used for degrading lignocellulosic portions of biomass for obtaining xylose, has amino acids, and comprises xylosidase, linker and xylanase made of certain amino acids. 2015, Estados Unidos.
Patente: Privilégio de Inovação. Número do registro: WO2015006843-A2, título: "Bifunctional enzyme used for degrading lignocellulosic portions of biomass for obtaining xylose, has amino acids, and comprises xylosidase, linker and xylanase made of certain amino acids" , Instituição de registro: WIPO - World Intellectual Property Organization. Depósito: 22/01/2015

6.
 SQUINA, FÁBIO MARCIO; Franco Cairo, J. P. L. ; CARAZZOLLE, M. F. ; MANDELLI, F. ; PRADELLA, JOSÉ GERALDO DA CRUZ ; Alvarez, Thabata Maria ; Leonardo, Flavia C. ; COSTA, FERNANDO F. ; COSTA-LEONARDO, A. M. ; PEREIRA, G. A. G. ; BRENELLI, L.B. ; Gonçalves, T.A. ; ROBL, DIOGO . Lignocellulolytic enzyme composition used for recovery and conversion of lignocellulosic materials for production of second generation ethanol or other high added by-products, comprises superoxide dismutase and cellulases. 2015, Brasil.
Patente: Privilégio de Inovação. Número do registro: WO2017011885-A1, título: "Lignocellulolytic enzyme composition used for recovery and conversion of lignocellulosic materials for production of second generation ethanol or other high added by-products, comprises superoxide dismutase and cellulases" , Instituição de registro: WIPO - World Intellectual Property Organization. Depósito: 20/07/2015; Depósito PCT: 20/07/2015.

7.
 FARINAS, CRISTIANE SANCHEZ ; PAIXÃO, D. A. A. ; FRANCO CAIRO, JOÃO P. L. ; PRADELLA, JOSÉ GERALDO DA CRUZ ; DELABONA, PRISCILA DA SILVA ; Ruller, R. ; Hoffmam, Zaira ; SQUINA, FÁBIO MARCIO . Trichoderma harzianum enzymatic cocktail for hydrolysis of material lignocellulose, preferably pre-treated sugarcane bagasse, is supplemented with auxiliary enzymes which comprise pectinase and alpha-L-arabinufofanosanase. 2017, Brasil.
Patente: Privilégio de Inovação. Número do registro: BR102013029947, título: "Trichoderma harzianum enzymatic cocktail for hydrolysis of material lignocellulose, preferably pre-treated sugarcane bagasse, is supplemented with auxiliary enzymes which comprise pectinase and alpha-L-arabinufofanosanase" , Instituição de registro: INPI - Instituto Nacional da Propriedade Industrial. Depósito: 27/06/2017

8.
 SQUINA F. M.; DAMASIO, A. ; CITADINI, A. P. ; BRAGA, C. ; PAIVA, L. B. B. ; Segato, Fernando ; Santos, W. D. . Producing phenolic compound, particularly ferulic acid and coumaric acid, involves utilizing enzyme system with feruloyl esterase property for treatment of bagasse from sugarcane to obtain second-generation ethanol. 2012, Brasil.
Patente: Privilégio de Inovação. Número do registro: BR102012001201, título: "Producing phenolic compound, particularly ferulic acid and coumaric acid, involves utilizing enzyme system with feruloyl esterase property for treatment of bagasse from sugarcane to obtain second-generation ethanol" , Instituição de registro: INPI - Instituto Nacional da Propriedade Industrial. Depósito: 18/01/2012; Pedido do Exame: 23/02/2012. Instituição(ões) financiadora(s): Associação Brasileira de Tecnologia de Luz Sincrotron.


Projetos de pesquisa

Projeto de desenvolvimento tecnológico



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