Marlon Dias Mariano dos Santos

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  • Última atualização do currículo em 05/10/2018


Possui graduação em Engenharia de Bioprocessos e Biotecnologia pela Universidade Positivo (2017). Atualmente é mestrando do Laboratório de Proteômica Computacional e Estrutural do Instituto Carlos Chagas, Fiocruz, Paraná. Atua na área de desenvolvimento de métodos experimentais e computacionais aplicados para espectrometria de massas e análise de dados de proteômicos. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Marlon Dias Mariano dos Santos
Nome em citações bibliográficas
SANTOS, M. D. M.;DOS SANTOS, MARLON D.M.;SANTOS, MARLON D M;SANTOS, MARLON D. M.;SANTOS, MARLON DIAS MARIANO;SANTOS, MARLON D.M.


Formação acadêmica/titulação


2018
Mestrado em andamento em Biociências e Biotecnologia.
Instituto Carlos Chagas, Fiocruz, ICC, Brasil. Orientador: Paulo Costa Carvalho.
Coorientador: Juliana de Saldanha da Gama Fischer.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.
2013 - 2017
Graduação em Engenharia de Bioprocessos e Biotecnologia.
Universidade Positivo, POSITIVO, Brasil.
2011 - 2013
Curso técnico/profissionalizante em Técnico em Biotecnologia.
SENAI - Departamento Regional do Paraná, SENAI/DR/PR, Brasil.
2006 - 2007
Curso técnico/profissionalizante em Técnico em Computação Linux.
Centro Tecnológico de Ensino Digital do Paraná, CETEC-PR, Brasil.




Formação Complementar


2018 - 2018
International Course on Bioinformatics Analysis of RNA-Seq Data. (Carga horária: 40h).
Instituto Oswaldo Cruz, Fiocruz, IOC, Brasil.
2017 - 2017
Nivelamento em Biologia Celular e Molecular. (Carga horária: 12h).
Instituto Carlos Chagas, Fiocruz, ICC, Brasil.
2017 - 2017
C3BI-Workshop- Bioinformatics of protein-protein interactions for wet lab. (Carga horária: 31h).
Institut Pasteur, PASTEUR, França.
2016 - 2016
Advanced Mass Spectrometry-Based Proteomics for PTMS Analysis. (Carga horária: 6h).
Brazilian Society for Mass Spectrometry, BRMASS, Brasil.
2016 - 2016
Proteome Analysis by Mass Spectrometry. (Carga horária: 40h).
Instituto Pasteur de Montevideo, PASTEUR, Uruguai.
2016 - 2016
Human Genome Tour 2016: from NGS Technologies to Evolutionary and Medical G. (Carga horária: 108h).
Instituto Pasteur de Montevideo, PASTEUR, Uruguai.
2015 - 2015
Puricação de Proteínas por Cromatograa. (Carga horária: 30h).
Instituto Carlos Chagas, Fiocruz, ICC, Brasil.
2015 - 2015
GE DAY. (Carga horária: 8h).
Instituto de Tecnologia do Paraná, TECPAR, Brasil.
2015 - 2015
Instrumentação e procedimentos visando a segurança de barragens.
Instituto de Engenharia do Paraná, IEP, Brasil.
2015 - 2015
Obras Marítimas e portuárias.
Instituto de Engenharia do Paraná, IEP, Brasil.
2014 - 2014
Nivelamento em Biologia Molecular. (Carga horária: 15h).
Instituto Carlos Chagas, Fiocruz, ICC, Brasil.
2014 - 2014
Controle de Qualidade Analítica de Água e Esgoto. (Carga horária: 32h).
SENAI - Departamento Regional do Paraná, SENAI/DR/PR, Brasil.
2013 - 2013
Redação Científica. (Carga horária: 9h).
Instituto de Tecnologia do Paraná, TECPAR, Brasil.
2011 - 2013
Técnico em Biotecnologia. (Carga horária: 1440h).
SENAI - Departamento Regional do Paraná, SENAI/DR/PR, Brasil.
2012 - 2012
Palestra técnica da empresa AmBev.
SENAI - Departamento Regional do Paraná, SENAI/DR/PR, Brasil.
2012 - 2012
Linux básico e noções de redes de computadores. (Carga horária: 16h).
Universidade Positivo, POSITIVO, Brasil.
2006 - 2007
Técnico em computação Linux. (Carga horária: 240h).
Centro Tecnológico de Ensino Digital do Paraná, CETEC-PR, Brasil.


Atuação Profissional



Instituto Leônidas e Maria Deane, ILMD, Brasil.
Vínculo institucional

2017 - Atual
Vínculo: , Enquadramento Funcional:


SENAI - Departamento Regional do Paraná, SENAI/DR/PR, Brasil.
Vínculo institucional

2014 - 2015
Vínculo: Estagiário, Enquadramento Funcional: Estagiário, Carga horária: 30


Instituto Carlos Chagas, Fiocruz, ICC, Brasil.
Vínculo institucional

2018 - Atual
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Mestrando, Carga horária: 40

Vínculo institucional

2013 - 2017
Vínculo: Aluno, Enquadramento Funcional: Iniciação Cientifica, Carga horária: 20



Projetos de pesquisa


2016 - Atual
Avaliação molecular de tumores cerebrais.
Descrição: Devida a alta capacidade de progressão dos tumores cerebrais e ao elevado índice de mortalidade dos pacientes, a pesquisa por marcadores moleculares provenientes de tecido tumoral cerebral torna-se de fundamental relevância. Esses marcadores poderão constituir-se de alvos moleculares para o desenvolvimento de novas drogas e poderão auxiliar na escolha de um tratamento individualizado e mais eficaz para cada tipo de tumor cerebral.Um dos objetivos da proteômica é caracterizar estados de um ?sistema biológico? através de alterações no perfil de expressão proteica. O reconhecimento de um padrão diferencial possibilitará melhor compreensão de diversos fenômenos que podem levar ao desenvolvimento da doença. O objetivo deste projeto é obter um melhor entendimento, ao nível molecular, dos tumores cerebrais através de perfis quantitativos de proteínas fornecidos por espectrometria de massas.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) .
Integrantes: Marlon Dias Mariano dos Santos - Integrante / Paulo Costa Carvalho - Integrante / Nilson Ivo T Zanchin - Integrante / FISCHER, JULIANA DE S. DA G. - Coordenador / AQUINO, PRISCILA F - Integrante / Maria da Gloria da Costa Carvalho - Integrante / Luis Alencar Biurrum - Integrante.
2013 - Atual
Desenvolvimento de métodos computacionais aplicados para espectrometria de massas.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.


Projetos de desenvolvimento


2018 - Atual
Rumo ao diagnóstico universal por espectrometria de massas e inteligência artificial utilizando sepse como modelo

Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Juliana de Saldanha da Gama Fischer Carvalho em 04/10/2018.
Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento.
2018 - Atual
Avaliação Molecular de Tumores Cerebrais

Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Juliana de Saldanha da Gama Fischer Carvalho em 04/10/2018.
Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento.
2018 - Atual
Identificação e função de miRNAs envolvido no processo de diferenciação de células-tronco derivadas de tecido adiposo humano
Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento.
2017 - Atual
Avaliação das características epidemiológicas e moleculares de mulheres tratadas com lesões precursoras do câncer de colo de útero no Amazonas
Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento.
2016 - 2018
Algoritmo para caracterização de homodímeros proteicos analisados por espectrometria de massas
Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento.


Revisor de periódico


2016 - Atual
Periódico: Journal of Proteomics (Print)


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica.
2.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.
3.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Bioinformatica.


Idiomas


Português
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.


Prêmios e títulos


2017
Melhor trabalho de conclusão de curso de Engenharia de Bioprocessos e Biotecnologia, Universidade Positivo.
2014
Menção honrosa, 2nd Proteomics Meeting of the Brazilian Proteomics Society jointly with the 2nd Pan American HUPO M.


Produções



Produção bibliográfica
Artigos completos publicados em periódicos

1.
SHIGUNOV, PATRÍCIA2018SHIGUNOV, PATRÍCIA ; BALVEDI, LUCAS TITTON ; SANTOS, MARLON DIAS MARIANO ; HERAI, ROBERTO H. ; DE AGUIAR, ALESSANDRA MELO ; DALLAGIOVANNA, BRUNO . Crosstalk between Hedgehog pathway and energy pathways in human adipose-derived stem cells: A deep sequencing analysis of polysome-associated RNA. Scientific Reports, v. 8, p. X, 2018.

2.
WIPPEL, HELISA HELENA2018WIPPEL, HELISA HELENA ; INOUE, ALEXANDRE HARUO ; VIDAL, NEWTON MEDEIROS ; COSTA, JIMENA FERREIRA DA ; MARCON, BRUNA HILZENDEGER ; ROMAGNOLI, BRUNO ACCIOLY ALVES ; SANTOS, MARLON DIAS MARIANO ; CARVALHO, PAULO COSTA ; GOLDENBERG, SAMUEL ; ALVES, LYSANGELA RONALTE . Assessing the partners of RBP9-mRNP complex in Trypanosoma cruzi using shotgun proteomics and RNA-seq. RNA Biology, v. X, p. X, 2018.

3.
SANTOS, M. D. M.2018SANTOS, M. D. M.; WIPPEL, HELISA HELENA ; CLASEN, MILAN AVILA ; KURT, LOUISE ULRICH ; NOGUEIRA, F. C. S. ; CARVALHO, CARLOS EDUARDO ; MCCORMICK, THAÍS MESSIAS ; NETO, GUILHERME PINTO BRAVO ; ALVES, LYSANGELA RONALTE ; CARVALHO, M. G. C. ; CARVALHO, PAULO C ; Fischer, JSG . Comparing intestinal versus diffuse gastric cancer using a PEFF-oriented proteomic pipeline. Journal of Proteomics, v. 171, p. 63-72, 2018.

4.
SILVA, ANDRÉ R.F.2017SILVA, ANDRÉ R.F. ; LIMA, DIOGO B. ; LEYVA, ALEJANDRO ; DURAN, ROSARIO ; BATTHYANY, CARLOS ; AQUINO, PRISCILA F. ; LEAL, JULIANA C. ; RODRIGUEZ, JIMMY E. ; DOMONT, GILBERTO B. ; SANTOS, MARLON D.M. ; CHAMOT-ROOKE, JULIA ; BARBOSA, VALMIR C. ; CARVALHO, PAULO C. . DiagnoProt: a tool for discovery of new molecules by mass spectrometry. BIOINFORMATICS, v. 33, p. 1883-1885, 2017.

5.
GARCIA, CARLOS H.S.2017GARCIA, CARLOS H.S. ; DEPOIX, DELPHINE ; QUEIROZ, RAYNER M.L. ; SOUZA, JAQUES M.F. ; FONTES, WAGNER ; DE SOUSA, MARCELO V. ; SANTOS, MARLON D.M. ; CARVALHO, PAULO C. ; GRELLIER, PHILIPPE ; CHARNEAU, SÉBASTIEN . Dynamic molecular events associated to Plasmodium berghei gametogenesis through proteomic approach. Journal of Proteomics, v. x, p. x, 2017.

6.
2CARVALHO, PAULO C2016 CARVALHO, PAULO C ; LIMA, DIOGO B ; LEPREVOST, FELIPE V ; SANTOS, M. D. M. ; FISCHER, JULIANA S G ; AQUINO, PRISCILA F ; MORESCO, JAMES J ; YATES, JOHN R ; BARBOSA, V. C. . Integrated analysis of shotgun proteomic data with PatternLab for proteomics 4.0. Nature protocols, v. 11, p. 102-117, 2016.

7.
2FISCHER, JULIANA DE S. DA G.2015FISCHER, JULIANA DE S. DA G. ; DOS SANTOS, MARLON D.M. ; MARCHINI, FABRICIO K. ; BARBOSA, VALMIR C. ; CARVALHO, PAULO C. ; ZANCHIN, NILSON I.T. . A scoring model for phosphopeptide site localization and its impact on the question of whether to use MSA. Journal of Proteomics (Print), v. 129, p. 42-50, 2015.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
WIPPEL, HELISA HELENA ; SANTOS, M. D. M. ; CLASEN, MILAN AVILA ; KURT, LOUISE ULRICH ; NOGUEIRA, FABIO CESAR SOUSA ; CARVALHO, CARLOS EDUARDO ; MCCORMICK, THAÍS MESSIAS ; NETO, GUILHERME PINTO BRAVO ; ALVES, LYSANGELA RONALTE ; CARVALHO, M. G. C. ; Carvalho, PC ; Fischer, JSG . Quantitative proteomic analysis of intestinal and diffuse types of gastric cancer using a new PEFF-oriented pipeline within PatternLab for proteomics.. In: American Society for Mass Spectrometry (ASMS), 2018, San Diego. American Society for Mass Spectrometry (ASMS), 2018.

2.
SANTOS, M. D. M.; LIMA, DIOGO B ; SILVA, ANDRÉ R. F. ; KURT, LOUISE ULRICH ; CLASEN, MILAN AVILA ; PINTO, A. F. M. ; MORESCO, JAMES J ; YATES, JOHN R ; AQUINO, PRISCILA F ; BARBOSA, VALMIR C ; Fischer, JSG ; CARVALHO, PAULO C . Analyzing isotopically labeled peptides with PatternLab for Proteomics 4.2. In: 4th BrProt Meeting, 7th BrMass CONFERENCE ON MASS SPECTROMETRY, 2018. 4th BrProt Meeting, 7th BrMass CONFERENCE ON MASS SPECTROMETRY.

3.
SANTOS, R. ; NOGUEIRA, FABIO CESAR SOUSA ; FARIAS, A. R. B. ; SANTOS, M. D. M. ; NASCIMENTO, J. R. S. ; WIPPEL, HELISA HELENA ; SOUZA, T. A. C. B. ; ELEUTHERIO, E. C. A. ; CARVALHO, PAULO C. . Structural characterization of the trehalose synthesis complex using mass spectrometry. In: 4th BrProt Meeting, 7th BrMass CONFERENCE ON MASS SPECTROMETRY, 2018. 4th BrProt Meeting, 7th BrMass CONFERENCE ON MASS SPECTROMETRY.

4.
KURT, LOUISE ULRICH ; CLASEN, MILAN AVILA ; SANTOS, M. D. M. ; LYRA, E. S. B. ; LIMA, DIOGO B ; GOZZO, F. C. ; CARVALHO, PAULO C . An approach for characterizing protein conformers by using cross-linking mass spectrometry and pattern recognition. In: 4th BrProt Meeting, 7th BrMass CONFERENCE ON MASS SPECTROMETRY, 2018. 4th BrProt Meeting, 7th BrMass CONFERENCE ON MASS SPECTROMETRY, 2018.

5.
SANTOS, M. D. M.; LIMA, DIOGO B ; NOGUEIRA, F. C. S. ; PINTO, A. F. M. ; MORESCO, JAMES J ; YATES, JOHN R ; BARBOSA, V. C. ; Carvalho, PC . Differential proteomics using stable isotope dimethyl labeling and PatternLab for Proteomics. In: Sao Paulo School of Advanced Science on Mass Spectrometry-based Proteomics, 2017, São Paulo. Differential proteomics using stable isotope dimethyl labeling and PatternLab for Proteomics, 2017.

6.
RIBEIRO, B. S. P. ; CHAGAS, V. L. A. ; Fischer, JSG ; SANTOS, M. D. M. ; SILVA, M. S. M. E. ; DA GLORIA DA COSTA CARVALHO, MARIA . Epigenetic and gene polymorphism of solid pseudopapillary tumor of pancreas. In: XI Simpósio de Oncobiologia, 2017, Rio de Janeiro. Epigenetic and gene polymorphism of solid pseudopapillary tumor of pancreas, 2017.

7.
CHAGAS, V. L. A. ; Fischer, JSG ; SANTOS, M. D. M. ; RIBEIRO, B. S. P. ; SILVA, M. S. M. E. ; CARVALHO, M. G. C. . Intratumoral heterogeneity of pseudopapillary tumor of pancreas. In: XI Simpósio de Oncobiologia, 2017, Rio de Janeiro. Intratumoral heterogeneity of pseudopapillary tumor of pancreas, 2017.

8.
SANTOS, M. D. M.; LIMA, DIOGO B ; LEPREVOST, FELIPE V ; FISCHER, JULIANA S G ; AQUINO, PRISCILA F ; MORESCO, JAMES J ; YATES, JOHN R ; BARBOSA, VALMIR C ; CARVALHO, PAULO C. . Analyzing isobarically label peptides with patternlab for proteomics 4.0. In: 1st IBERO-American, 6th BrMASS Conference on Mass Spectrometry and 13th UppCon, 2016, Rio de Janeiro, Brazil. Analyzing isobarically label peptides with patternlab for proteomics 4.0, 2016.

9.
SANTOS, MARLON D M; LIMA, DIOGO B ; LEPREVOST, FELIPE V ; FISCHER, JULIANA S G ; AQUINO, PRISCILA F ; MORESCO, JAMES J ; YATES, JOHN R ; BARBOSA, VALMIR C. ; CARVALHO, PAULO C. . Shotgun proteomic analysis of isobarically labeled peptides with PatternLab for Proteomics 4.0.. In: 21.ª Semana da Engenharia do Instituto de Engenharia do Paraná., 2015, Curitiba, Paraná, Brazil. Shotgun proteomic analysis of isobarically labeled peptides with PatternLab for Proteomics 4.0., 2015.

10.
SANTOS, MARLON D M; Fischer, JSG ; LEPREVOST, F. V. ; BARBOSA, V. C. ; Carvalho, PC . An algorithm for generating a representative protein sequence database to facilitate proteomic analysis of unsequenced organisms. In: 2nd Proteomics Meeting of the Brazilian Proteomics Society jointly with the 2nd Pan American HUPO Meeting, 2014, Búzios, Rio de Janeiro, Brazil. An algorithm for generating a representative protein sequence database to facilitate proteomic analysis of unsequenced organisms, 2014.

11.
Fischer, JSG ; SANTOS, M. D. M. ; MARCHINI, F. K. ; BARBOSA, V. C. ; Carvalho, PC ; ZANCHIN, N. I. T. . To MSA or not to MSA: that is the question !. In: 2nd Proteomics Meeting of the Brazilian Proteomics Society jointly with the 2nd Pan American HUPO Meeting, 2014, Búzios, Rio de Janeiro State. To MSA or not to MSA: that is the question !, 2014.



Bancas




Participação em bancas de comissões julgadoras
Outras participações
1.
SANTOS, MARLON D M. PROJETO DE INDÚSTRIA PRODUTORA DE QUEIJO MUSSARELA SEM LACTOSE. 2014. SENAI - Departamento Regional do Paraná.

2.
SANTOS, MARLON D M. PRODUÇÃO DE BIOETANOL A PARTIR DA CASCA DE EUCALIPTO PROVENIENTE DA INDÚSTRIA DE PAPEL E CELULOSE. 2014. SENAI - Departamento Regional do Paraná.

3.
SANTOS, MARLON D M. PRODUÇÃO DE CERVEJA AROMATIZADA COM COFFEA ARABICA LINNAEUS. 2014. SENAI - Departamento Regional do Paraná.

4.
SANTOS, MARLON D M. APLICAÇÃO DE BROMELINA E TRICLOSAN NA PRODUÇÃO DE UM COSMÉTICO BIOTECNOLÓGICO. 2014. SENAI - Departamento Regional do Paraná.

5.
SANTOS, MARLON D M. PRODUÇÃO DE UM BIOCOSMÉTICO A PARTIR DA TORTA DE FILTRO DA CANA DE AÇÚCAR E EXOPOLISSACARÍDEO DO KEFIR. 2014. SENAI - Departamento Regional do Paraná.

6.
SANTOS, MARLON D M. MICROPROPAGAÇÃO DE PLANTAS COM BIOLUMINESCÊNCIA. 2014. SENAI - Departamento Regional do Paraná.

7.
SANTOS, MARLON D M. PROCESSO PRODUTIVO DE BIOFERTILIZANTES A PARTIR DE MICROALGAS DA ESPÉCIE CHLORELLA. 2014. SENAI - Departamento Regional do Paraná.



Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
47 th Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology (SBBq). 47 th Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology (SBBq). 2018. (Congresso).

2.
Analyzing isotopically labeled peptides with PatternLab for Proteomics 4.2. Analyzing isotopically labeled peptides with PatternLab for Proteomics 4.2. 2018. (Congresso).

3.
25ª Reunião Anual de Iniciação Científica realizada pela Vice-Presidência de Pesquisa e Coleções Biológicas - VPPCB/Fundação Oswaldo Cruz - Fiocruz.Algoritimo para proteômica quantitativa de peptideos isotopicamente marcados. 2017. (Outra).

4.
Sao Paulo School of Advanced Science on Mass Spectrometry-based Proteomics.Differential proteomics using stable isotope dimethyl labeling and PatternLab for Proteomics. 2017. (Outra).

5.
Sao Paulo School of Advanced Science on Mass Spectrometry-based Proteomics.Differential proteomics using stable isotope dimethyl labeling and PatternLab for Proteomics. 2017. (Outra).

6.
1st IBERO-American, 6th BrMASS Conference on Mass Spectrometry and 13th UppCon. Analyzing isobarically label peptides with patternlab for proteomics 4.0. 2016. (Congresso).

7.
24ª Reunião Anual de Iniciação Científica realizada pela Vice-Presidência de Pesquisa e Laboratórios de Referência - VPPLR/Fundação Oswaldo Cruz - Fiocruz.ALGORITMO PARA ANÁLISE PROTEÔMICA DE PEPTÍDEOS MARCADOS COM ISÓBAROS E ANALISADOS POR ESPECTROMETRIA DE MASSAS. 2016. (Outra).

8.
21ª Semana da Engenharia do Instituto de Engenharia do Paraná.Shotgun proteomic analysis of isobarically labeled peptides with PatternLab for Proteomics 4.0. 2015. (Outra).

9.
23ª Reunião Anual de Iniciação Científica realizada pela Vice-Presidência de Pesquisa e Laboratórios de Referência - VPPLR/Fundação Oswaldo Cruz - Fiocruz.Heurística para análise proteomica de organismos sem genoma sequenciado. 2015. (Outra).

10.
2nd Proteomics Meeting of the Brazilian Proteomics Society jointly with the 2nd Pan American HUPO Meeting. An algorithm for generating a representative protein sequence database to facilitate proteomic analysis of unsequenced organisms. 2014. (Congresso).

11.
2nd Proteomics Meeting of the Brazilian Proteomics Society jointly with the 2nd Pan American HUPO Meeting.. To MSA or not to MSA: that is the question !. 2014. (Congresso).


Organização de eventos, congressos, exposições e feiras
1.
WIPPEL, HELISA HELENA ; SANTOS, M. D. M. ; KURT, LOUISE ULRICH ; CLASEN, MILAN AVILA ; SILVA, ANDRÉ R. F. ; SOUZA, T. A. C. B. ; Carvalho, PC . Determinação estrutural e quantificação por espectrometria de massas. 2017. (Outro).



Outras informações relevantes


Membro da Sociedade Brasileira de Proteômica - BrProt;
Membro da Sociedade Brasileira de Espectrometria de Massa - BrMass.



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