Rede de Colaboração
Diretório de grupos de pesquisa |
Luciano Vieira de Araújo
possui
graduação
em Ciência da Computação
pela
Universidade Federal de Goiás
(1992)
, mestrado
em Ciências da Computação
pela
Universidade de São Paulo
(2002)
e doutorado
em Bioinformática
pela
Universidade de São Paulo
(2008)
. Atualmente é Professor Doutor - Adjunto
da
Escola de Artes, Ciências e Humanidades - USP. Tem experiência
na área de
Ciência da Computação.
Atuando principalmente nos seguintes temas:
Bioinformática, Banco de dados, HIV, genotipagem, Álgebra de Processos e análise de dados.
Última
atualização do currículo em 26/12/2011
Endereço para acessar este CV: http://lattes.cnpq.br/2459050725301964 |
Dados pessoais
| Nome | Luciano Vieira de Araújo |
| Nome em citações bibliográficas | ARAUJO, L. V.;Araújo, Luciano V.;de Araújo, Luciano Vieira;Araújo, Luciano V |
| Sexo | Masculino |
| Endereço profissional | Universidade de São Paulo, EACH - Escola de Artes, Ciências e Humanidades. Rua Arlindo Béttio, 1000, Predio A1, Sala 34 Ermelino Matarazzo 03828-000 - Sao Paulo, SP - Brasil |
Formação acadêmica/Titulação
| 2003 - 2008 | Doutorado em Bioinformática
.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil. Título: Sistema colaborativo para armazenamento e análise de dados de HIV, Ano de Obtenção: 2008. Orientador:  João Eduardo Ferreira.
Palavras-chave: Bioinformática; Banco de dados; HIV; genotipagem; Álgebra de Processos; análise de dados. Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Sistemas de Computação. Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Sistemas de Computação / Especialidade: Banco de Dados. Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Bioinformática / Especialidade: Bioinformática. Setores de atividade: Saúde e Serviços Sociais; Administração Pública, Defesa e Seguridade Social; Educação. |
| 1999 - 2002 | Mestrado em Ciências da Computação
.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil. Título: CCICLO: Componente para cruzamento e integração de objetos classificados, Ano de Obtenção: 2002. Orientador: João Eduardo Ferreira.
Palavras-chave: Banco de dados; Data mining; análise de dados; Cache semântico; Estrutura de dados. Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação. Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Sistemas de Computação / Especialidade: Banco de Dados. Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Sistemas de Computação / Especialidade: Arquitetura de Sistemas de Computação. Setores de atividade: Educação; Administração Pública, Defesa e Seguridade Social; Saúde e Serviços Sociais. |
| 1989 - 1992 | Graduação em Ciência da Computação
.
Universidade Federal de Goiás, UFG, Brasil. Título: Uma comparação entre a análise estruturada e a análise orientada a objetos. Orientador: Eduardo Virgílio. |
Formação complementar
| 2005 - 2005 | Extensão universitária em Operador de Mercado Financeiro. (Carga
horária: 186h). Faculdade FIA de Administração e Negócios. |
Atuação profissional
| Los Alamos National Laboratory, LANL, Estados Unidos. |
| Vínculo institucional |
| 2003 - 2003 | Vínculo: Outro (especifique), Enquadramento Funcional: Pesquisador, Carga horária: 40 |
| Atividades |
| 2003 - 2003 | Atividades de Participação em Projeto, HIV Databases - T10, . |
|
Projetos de pesquisa Reserch for development of HIV Bioinformatics tools. |
| Ministério da Saúde, MS, Brasil. |
| Vínculo institucional |
| 2002 - 2006 | Vínculo: Outro (especifique), Enquadramento Funcional: Pesquisador, Carga horária: 20 |
| Atividades |
| 2002 - 2006 | Atividades de Participação em Projeto, Programa Nacional de DST/AIDS, . |
|
Projetos de pesquisa Desenvolvimento de ambiente informatizado para análise determinística de dados epidemiológicos e de resistência genotípica do HIV-1 |
| Instituto Israelita de Ensino e Pesquisa Albert Einstein, IIEPAE, Brasil. |
| Vínculo institucional |
| 2002 - 2004 | Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Modelagem de Data Warehouse, Carga horária: 15 |
| Atividades |
| 2002 - 2004 | Atividades de Participação em Projeto, IIEPAE, . |
|
Projetos de pesquisa Data Warehouse para análise de dados do banco de sangue do Hospital Israelita Albert Einstein |
| Universidade de São Paulo, USP, Brasil. |
| Vínculo institucional |
| 1999 - 2005 | Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Pesquisador/Desenvolvedor, Carga horária: 20 |
| Atividades |
| 2010 - Atual | Atividades de Participação em Projeto, EACH - Escola de Artes, Ciências e Humanidades, . |
|
Projetos de pesquisa Ferramentas para criação e análise de indicadores dos dados clínicos e moleculares de pacientes HIV para gestão e tomada de decisão do DN-DST-Aids |
| 2005 - Atual | Atividades de Participação em Projeto, CEGH - Centro de Estudos do Genoma Humano, . |
|
Projetos de pesquisa Sistema de controle de exames genéticos para o Centro de Estudos de Genoma Humano - CEGH |
| 2008 - 2009 | Atividades de Participação em Projeto, Fundação Faculdade de Medicina/Fundação Pró Sangue Hemocentro de São Paulo, . |
|
Projetos de pesquisa Atualização, Capacitação Técnica e Automatização do Algoritmo Brasileiro |
| 1999 - 2005 | Atividades de Participação em Projeto, Instituto de Matemática e Estatística, . |
|
Projetos de pesquisa Cooperation for Analysis of Gene Expression-CAGE |
| Escola de Artes, Ciências e Humanidades - USP, EACH - USP, Brasil. |
| Vínculo institucional |
| 2009 - Atual | Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Doutor - Adjunto, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva. |
| Fundação Pró-Sangue Hemocentro de São Paulo, FPS/HSP, Brasil. |
| Vínculo institucional |
| 2008 - 2009 | Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Especialista em Bioinformática, Carga horária: 40 |
| Atividades |
| 06/2008 - 01/2009 | Pesquisa e desenvolvimento , Departamento de Biologia Molecular Divisao de Sorologia, . |
|
Linhas de pesquisa Bioinformática Data mining |
| Faculdades Associadas de São Paulo, FASP, Brasil. |
| Vínculo institucional |
| 2006 - 2008 | Vínculo: Celetista formal, Enquadramento Funcional: Professor - Ensino Superior, Carga horária: 20 |
| Atividades |
| 08/2006 - 04/2008 | Ensino, Ciência da Computação, Nível: Graduação. |
| Disciplinas ministradas Linguagem SQL Prática de Banco de Dados Modelagem de Banco de Dados |
| Instituto de Matemática e Estatística - USP, IME-USP, Brasil. |
| Vínculo institucional |
| 2000 - 2005 | Vínculo: Celetista formal, Enquadramento Funcional: Analista de Sistemas, Carga horária: 40 |
| Atividades |
| 08/2000 - 01/2005 | Pesquisa e desenvolvimento . |
|
Linhas de pesquisa Banco de Dados Data warehouse |
| IBPI - Instituto Brasileiro de Pesquisa em Informática, IBPI, Brasil. |
| Vínculo institucional |
| 2001 - 2004 | Vínculo: Autonomo, Enquadramento Funcional: Professor, Carga horária: 20 |
| Atividades |
| 02/2001 - 06/2004 | Ensino, Sistema de Informação, Nível: Pós-Graduação. |
| Disciplinas ministradas Data warehouse Linguagem SQL Modelagem de banco de dados Técnicas modernas de banco de dados |
| Borah Informática, BORAH, Brasil. |
| Vínculo institucional |
| 2000 - 2000 | Vínculo: Autonomo, Enquadramento Funcional: Analista de Sistemas, Carga horária: 20 |
| Special Computer Services, SCS, Brasil. |
| Vínculo institucional |
| 1996 - 1999 | Vínculo: Autonomo, Enquadramento Funcional: Analista de Sistemas, Carga horária: 40 |
| Núcleo Informática, NÚCLEO, Brasil. |
| Vínculo institucional |
| 1994 - 1996 | Vínculo: Autonomo, Enquadramento Funcional: Analista de Sistemas, Carga horária: 40 |
| Instituto Presbiteriano de Educação, IPE, Brasil. |
| Vínculo institucional |
| 1995 - 1999 | Vínculo: Celetista formal, Enquadramento Funcional: Professor, Carga horária: 20 |
| Vínculo institucional |
| 1989 - 1990 | Vínculo: Celetista formal, Enquadramento Funcional: Professor, Carga horária: 20 |
| Grupo Jorlan S. A., JORLAN, Brasil. |
| Vínculo institucional |
| 1991 - 1994 | Vínculo: Celetista formal, Enquadramento Funcional: Analista de Sistemas, Carga horária: 44 |
Linhas de Pesquisa
| 1. | Banco de Dados |
| Objetivos: Estudos sobre procedência de dados (Data Provenance) para análise e propagação de dados de bancos de dados públicos.. Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação. Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Sistemas de Computação / Especialidade: Banco de Dados. Palavras-chave: Banco de dados; Data Provenance. |
| 2. | Data warehouse |
| Objetivos: Uso de Data warehouse para análise de dados sobre HIV. Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Bioinformática. Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Sistemas de Computação / Especialidade: Banco de Dados. Palavras-chave: AIDS; HIV; Bioinformatics; Data warehouse; Banco de dados. |
| 3. | Bioinformática |
| Objetivos: Estudos sobre HIV, em especial, resistência à drogas. |
| 4. | Data mining |
| Objetivos: Avaliação da relação entre mutações e níveis de resistência à drogas. Palavras-chave: Bioinformatics; HIV; AIDS; Drug Resistance. |
Projetos de Pesquisa
| 2010 - Atual | Ferramentas para criação e análise de indicadores dos dados clínicos e moleculares de pacientes HIV para gestão e tomada de decisão do DN-DST-Aids |
| Descrição: Projeto busca o desenvolvimento de indicadores criação e análise de indicadores dos dados clínicos e moleculares de pacientes HIV para gestão e tomada de decisão do PN-DST-Aids. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação ( 2) / Doutorado ( 1) . Integrantes: João Eduardo Ferreira - Integrante / Ester Cerdeira Sabino - Integrante / Luciano Vieira de Araújo - Coordenador. Financiador(es): Ministério da Saúde - Auxílio financeiro.. |
| 2008 - 2009 | Atualização, Capacitação Técnica e Automatização do Algoritmo Brasileiro |
| Descrição: O Programa Nacional de DST/AIDS (PNDST/AIDS) assiste a mais de 130.000 portadores de AIDS com consultas médicas, realização de exames e distribuição de medicamentos. Porém, muitos pacientes adquirem vírus resistentes à determinadas drogas usadas no tratamento, o que implica em falha de resposta à terapêutica e agravamento do quadro clínico. Para atender tais pacientes, o PNDST/AIDS criou a rede nacional de genotipagem (RENAGENO) que oferece testes de genotipagem aos pacientes em falha terapêutica, para que através da informação do nível de resistência do HIV, o médico ajuste a terapêutica desses pacientes. A cada ano são realizados 15.000 exames de genotipagem nos 14 laboratórios espalhados pelo Brasil.
O exame de genotipagem, através de um software para análise das mutações encontradas no HIV, avalia nível de resistência do vírus às drogas usadas no tratamento. O crescente número de drogas usadas no tratamento e de mutações associadas à resistência às drogas torna a tarefa de inferência de resistência muito complexa e demanda uma abordagem computacional avançada e que permita constante atualização.
Esse projeto visa adaptar o HIVdag, software para geração automática do software para análise de resistência às drogas usadas no tratamento de AIDS, apra a geração automática dos Algoritmo Brasileiro de Genotipagem. O HIVdag apresenta uma inovadora abordagem matemática que permite gerenciar a complexidade tanto das relações entre mutações e níveis de resistência quanto do desenvolvimento e da atualização do software.
Além disso, o HIVdag permite a comparação entre diferentes algoritmos de genotipagem e a avaliação imediata do impacto no tratamento dos pacientes da descoberta de novas mutações relacionadas a resistência. A velocidade e precisão dessa avaliação são de extrema importância para definições de estratégias para o tratamento dos pacientes e para compra e distribuição de medicamentos.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico ( 2) Doutorado ( 1) . Integrantes: Luciano Vieira de Araújo - Coordenador. Financiador(es): Ministério da Saúde - Auxílio financeiro.. |
| 2005 - 2007 | Sistema de controle de exames genéticos para o Centro de Estudos de Genoma Humano - CEGH |
| Descrição: Desenvolvimento de um sistema computacional para controle de exames genéticos oferecidos pelo Centro de Estudos do Genoma Humano. Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. Alunos envolvidos: Especialização ( 2) Doutorado ( 1) . Integrantes: Luciano Vieira de Araújo - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.. |
| 2003 - 2003 | Reserch for development of HIV Bioinformatics tools. |
| Descrição: A cooperação entre o Programa Nacional de DST/AIDS do Ministério da Saúde do Brasil, Laboratório de Banco de Dados do IME-USP e o Los Alamos National Laboratory - University of California foi formada para viabilizar pesquisas junto ao LANL em Los Alamos - New Mexico - EUA para o desenvolvimento de ferramentas de bioinformática que permitesse a avaliação, em larga escala, de seqüência do HIV. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado ( 1) . Integrantes: Luciano Vieira de Araújo - Coordenador. Financiador(es): Los Alamos National Laboratory - Cooperação / Ministério da Saúde - Auxílio financeiro. Número de produções C, T & A: 2. |
| 2002 - 2006 | Desenvolvimento de ambiente informatizado para análise determinística de dados epidemiológicos e de resistência genotípica do HIV-1 |
| Descrição: Este projeto pretende implementar um banco de dados através da integração de bancos do Programa de DST-AIDS já existentes (SICLOM, SISCEL e RENAGENO) de modo a viabilizar os elementos analíticos para cruzamento de informações vinculadas aos aspectos clínicos, epidemiológicos e de genotipagem dos pacientes com HIV positivo. Pretende-se também adequar ferramentas de bioinformática que permitam analisar sequências do HIV, gerando laudos de genotipagem e subtipagem. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Especialização ( 2) / Mestrado acadêmico ( 2) Doutorado ( 1) . Integrantes: João Eduardo Ferreira - Coordenador / Luciano Vieira de Araújo - Integrante. Financiador(es): Ministério da Saúde - Auxílio financeiro.. |
| 2002 - 2004 | Data Warehouse para análise de dados do banco de sangue do Hospital Israelita Albert Einstein |
| Descrição: Data Warehouse para análise de dados do banco de sangue do Hospital Israelita Albert Einstein. Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. Alunos envolvidos: Especialização ( 2) / Mestrado acadêmico ( 2) . Integrantes: João Eduardo Ferreira - Coordenador / Luciano Vieira de Araújo - Integrante. Financiador(es): Instituto Israelita de Ensino e Pesquisa Albert Einstein - Auxílio financeiro.. |
| 1999 - 2005 | Cooperation for Analysis of Gene Expression-CAGE |
| Descrição: Cooperação entre professores dos departamentos de Bioquímica e Ciência da Computação da USP para o desenvolvimento de tecnologia para a análise de expressão gênica em diversos contextos biológicos. O projeto contempla a montagem de um laboratório de microarrays na Bioquímica e um laboratório de bioinformática na Computação, que permitam o desenvolvimento de todo processo de análise de expressão gênica por microarrays, desde a preparação bioquímica dos experimentos e aquisição dos dados, até a análise quantitativa desses dados.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico ( 2) . Integrantes: João Eduardo Ferreira - Integrante / Hugo Aguirre Armelin - Coordenador / Luciano Vieira de Araújo - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.. |
Áreas de atuação
| 1. | Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação. |
| 2. | Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Bioinformática. |
| 3. | Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Sistemas de Computação /
Especialidade: Banco de Dados. |
Idiomas
| Inglês | Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem. |
| Espanhol | Compreende Bem, Fala Pouco, Lê Bem, Escreve Pouco. |
Prêmios e títulos
| 2009 | Menção Honrosa - Prêmio de Incentivo em Ciência e Tecnologia para o SUS com o trabalho - HIVSetSubtype: Software for Subtype classification of HIV1 sequences., SUS - Ministério da Saúde. |
| 2006 | Menção Honrosa - Prêmio de Incentivo em Ciência e Tecnologia para o SUS com o trabalho Sistemas cooperativos para estudos do HIV/AIDS no Brasil, SUS - Ministério da Saúde. |
Produção em C,T & A
| Produção bibliográfica |
| Artigos completos publicados em periódicos |
| 1. | TEIXEIRA, F. O. ; FALÇÃO, A. E. J. ; SOUSA, F.S. ; HUMMEL, A. D. ; COSTA, T. M. ; MANCINI, F. ; ARAUJO, L. V. ; PISA, I. T. . Similarity-based scoring method for classification of Health Informatics content. Journal of Health Informatics , v. 3, p. 35-42, 2011. |
| 2. |   Araújo, Luciano V ; Malkowski, Simon ; Braghetto, Kelly R ; Passos-Bueno, Maria R ; Zatz, Mayana ; Pu, Calton ; Ferreira, João E . A rigorous approach to facilitate and guarantee the correctness of the genetic testing management in human genome information systems. BMC Genomics, v. 12, p. S13-8, 2011. |
| 3. | Mancini, Felipe ; Sousa, Fernando Sequeira ; Teixeira, Fábio Oliveira ; Falcão, Alex Esteves Jacoud ; Hummel, Anderson Diniz ; da Costa, Thiago Martini ; Calado, Pável Pereira ; de Araújo, Luciano Vieira ; Pisa, Ivan Torres . Use of Medical Subject Headings (MeSH) in Portuguese for categorizing web-based healthcare content. Journal of Biomedical Informatics, v. 44, p. 299-309, 2010. |
| 4. | Barreto, Claudia C. ; Nishyia, Anna ; ARAUJO, L. V. ; Ferreira, Jo??o E. ; Busch, Michael P. ; Sabino, Ester C. . Trends in Antiretroviral Drug Resistance and Clade Distributions Among HIV-1--Infected Blood Donors in Sao Paulo, Brazil. Journal of Acquired Immune Deficiency Syndromes, v. 41, p. 388-341, 2006. |
| 5. | ARAUJO, L. V. ; SOARES, M. A. ; OLIVEIRA, S. M. ; CHEQUER, P. ; TANURI, A. ; SABINO, E. C. ; FERREIRA, J. E. . DBCollHIV: A Database System for Collaborative HIV analysis in Brazil. Genetics and Molecular Research, v. 3, p. 203-215, 2006. |
| Trabalhos completos publicados em anais de congressos |
| 1. | CANTÃO, M. E. ; ARAUJO, L. V. ; LEMOS, E. G. M. ; FERREIRA, J. E. . Algebraic approach to optimal clone selection applied in metagenomic projects. In: ISB-International Symposium on Biocomputing, 2010, Calicut, Índia.
Proceedings of the International Symposium on Biocomputing. New York, NY, USA :
ACM, 2010. v. 1. p. 1-6. |
| 2. | ARAUJO, L. V. ; SANABANI, S. S. ; SABINO, E. C. ; FERREIRA, J. E. . HIVSetSubtype: Software for Subtype classification of HIV1 sequences. In: The 24th Annual ACM Symposium on Applied Computing, 2009, Honolulu, Hawaii.
Proceedings of The 24th Annual ACM Symposium on Applied Computing. New York, USA :
Association of Computer Machinery, 2009. v. 1. p. 811-815. |
| 3. | CANTÃO, M. E. ; ARAUJO, L. V. ; LEMOS, E. G. M. ; FERREIRA, J. E. . Optimal Clone Identifier based on Dynamic Rules and Process Algebra. In: International Conference on Bioinformatics, Computational Biology, Genomics and Chemoinformatics, 2009, Orlando, FL. International Conference on Bioinformatics, Computational Biology, Genomics and Chemoinformatics, 2009. |
| 4. | ARAUJO, L. V. ; SABINO, E. C. ; FERREIRA, J. E. . HIV drug resistance analysis tool based on process algebra. In: 23rd Annual ACM Symposium on Applied Computing- SAC-ACM, 2008, Fortaleza.
23rd Annual ACM Symposium on Applied Computing- SAC-ACM. New York, NY :
ACM, 2008. v. 2. p. 1358-1363. |
| 5. | ARAUJO, L. V. ; FERREIRA, J. E. . Cache Semântico para Computação Sem Fio Baseado na Abstração de Composição dos Dados. In: I Workshop SIDAM, 2000, São Paulo. I Workshop SIDAM, 2000. |
| Resumos publicados em anais de congressos |
| 1. | TEIXEIRA, F. O. ; HUMMEL, A. D. ; DOMENICO, E. B. L. ; ARAUJO, L. V. ; PISA, I. T. . Statistical approach for categorizing content in Medical Informatics, Computer Science and Health Domains. In: AMIA 2011 Annual Symposium on Biomedical and Health informatics, 2011, Washington - EUA. AMIA 2011 Annual Symposium on Biomedical and Health informatics, 2011. |
| 2. | PEREIRA, A. A. ; ARAUJO, L. V. ; FERREIRA, J. E. ; SUCUPIRA, M. C. A. ; FERNANDES, J. C. C. ; SOUSA, D. F. C. ; INOCENCIO, L. A. ; SABINO, E. C. ; DIAZ, R. S. . HIV-1 antiretroviral resistance mutations in subtypes B, C and F: results of the Brazilian Genotype Laboratory Network (RENAGENO).. In: XVIII International HIV Drug Resistance Workshop, 2009, Fort Myers. XVIII International HIV Drug Resistance Workshop, 2009. v. 14. p. A170-A170. |
| 3. | ARAUJO, L. V. ; SANABANI, S. S. ; SABINO, E. C. ; FERREIRA, J. E. . Evaluation of Brazilian web based program for classification of HIV-1. In: 14th. International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB), 2006, Fortaleza. 14th. International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB). La Jolla, California : International society for computational biology, 2006. |
| 4. | BASSICHETTO, K. C. ; BARBOSA, A. S. ; ABBATE, M. C. ; FERREIRA, J. E. ; ARAUJO, L. V. ; KON, R. . Improving the surveillance system of the STI/AIDS specialized services in the city of Sao Paulo, Brazil. In: XV International AIDS Conference, 2004, BangKok, Thailand. XV International AIDS Conference. Geneva, Switzerland : ejias - eJournal of International AIDS Society, 2004. |
| 5. | BRINDEIRO, R. M. ; DIAZ, R. S. ; SABINO, E. C. ; ARAUJO, L. V. ; LEVY, J. E. ; TANURI, A. ; OLIVEIRA, S. M. ; DANTAS, M. C. ; LIMA, J. N. ; GRANDEIRO, A. . Implementation of the quality control programme(QC) for HIV-1 resistance genotyping testing network - RENAGENO of Brazilian STD/AIDS programme. In: XV International AIDS Conference, 2004, BangKok, Thailand. XV International AIDS Conference. Geneva, Switzerland : ejias - eJournal of International AIDS Society, 2004. |
| 6. | GONCALVES, B. M. T. ; ARAUJO, L. V. ; SABINO, E. C. ; FERREIRA, J. E. . Data Warehouse Development for the Brazilian STD/AIDS Programme. In: XV International AIDS Conference, 2004, BangKok, Thailand. XV International AIDS Conference. Geneva, Switzerland : ejias - eJournal of International AIDS Society, 2004. |
| 7. | ARAUJO, L. V. ; DIAZ, R. S. ; BRINDEIRO, R. M. ; TANURI, A. ; OLIVEIRA, S. M. ; DANTAS, M. C. ; LIMA, J. N. ; VILELA, W. ; SABINO, E. C. ; FERREIRA, J. E. . Bioinformatic tools for HIV-1 sequences analyses developed for the Brazilian STD/AIDS programmer network for genotype testing. In: XV International AIDS Conference, 2004, BangKok, Thailand. XV International AIDS Conference. Geneva, Switzerland : ejias - eJournal of International AIDS Society, 2004. |
| 8. | KLEINE NETO, W. ; SANABANI, S. S. ; JAMAL, L. ; ARAUJO, L. V. ; SABINO, E. C. . Prevalence and risk factors of human T-Cell lymphotropic viruses type I/II (HTLV-1/2) in a cohort of patients with human immunodeficiency. In: V Simposio Brasileiro de Pesquisa em HIV/AIDS, 2003, Rio de Janeiro. V Simposio Brasileiro de Pesquisa em HIV/AIDS. Rio de Janeiro : FIOCRUZ, 2003. |
| 9. | SABINO, E. C. ; ARAUJO, L. V. ; FERREIRA, J. E. . Multidimensional data analysis for HIV drug resistence. In: International Conference on Bioinformatcs and Computational Biology- Icobicobi, 2003, Ribeirão Preto, SP. International Conference on Bioinformatcs and Computational Biology- Icobicobi. São Paulo, SP : Icobicobi, 2003. |
| Artigos aceitos para publicação |
| 1. | FERREIRA, J. E. ; ARAUJO, L. V. ; BRAGHETTO, K. R. ; Italiano, I. C. ; OIKAWA, M. K. ; TAKECIAN, P. L. . Long Lived Transaction Processing for Business Processes and Scientific Workflows. JOURNAL OF INFORMATION AND DATA MANAGEMENT, 2012. |
| Apresentações de Trabalho |
| 1. | ARAUJO, L. V. ; SANABANI, S. S. ; Sabino, Ester C. ; FERREIRA, J. E. . HIVSetSubtype: Software for Subtype classification of HIV1 sequences. 2009. (Apresentação de Trabalho/Congresso). |
| 2. | ARAUJO, L. V. ; SABINO, E. C. ; FERREIRA, J. E. . HIV drug resistance analysis tool based on process algebra. 2008. (Apresentação de Trabalho/Simpósio). |
| 3. | ARAUJO, L. V. ; SANABANI, S. S. ; SABINO, E. C. ; FERREIRA, J. E. . Evaluation of Brazilian web based program for classification of HIV-1 sequences. 2006. (Apresentação de Trabalho/Congresso). |
| 4. | ARAUJO, L. V. ; SOARES, M. A. ; OLIVEIRA, S. M. ; CHEQUER, P. ; TANURI, A. ; Sabino, Ester C. ; FERREIRA, J. E. . DBCollHIV: A Database System for Collaborative HIV analysis in Brazil. 2005. (Apresentação de Trabalho/Congresso). |
| Produção técnica |
| Softwares sem registro de patente |
| 1. | ARAUJO, L. V. ; SABINO, E. C. ; FERREIRA, J. E. . HIVdag - HIV Drug resistance Analysis Generator. 2007. |
| 2. | ARAUJO, L. V. . Sistema para randomização e acompanhamento de pacientes em protocolo de pesquisa de pneumologia e terapia intensiva. 2007. |
| 3. | ARAUJO, L. V. ; FERREIRA, J. E. . Gerenciamento de exames genéticos. 2006. |
| 4. | ARAUJO, L. V. ; SABINO, E. C. ; FERREIRA, J. E. . DBCollHIV - Database system for collaborative HIV analysis. 2005. |
| 5. | ARAUJO, L. V. ; SABINO, E. C. ; FERREIRA, J. E. . HIVSetSubtype - Software para Subtipagem do HIV. 2004. |
| 6. | ARAUJO, L. V. ; SABINO, E. C. ; FERREIRA, J. E. . PCR Contamination - Software para identificação de contaminação em PCR. 2003. |
| Demais tipos de produção técnica |
| 1. | ARAUJO, L. V. ; OIKAWA, M. K. ; FERREIRA, J. E. . Introduction to Databases - III Latin American Course on Bioinformatics for Tropical Disease Research. 2004. (Curso de curta duração ministrado/Extensão). |
| 2. | ARAUJO, L. V. ; OIKAWA, M. K. ; FERREIRA, J. E. . Introduction to Databases - II Latin American Course on Bioinformatics for Tropical Disease Research. 2003. (Curso de curta duração ministrado/Extensão). |
| 3. | ARAUJO, L. V. ; OIKAWA, M. K. ; FERREIRA, J. E. . Introduction to Databases - I Latin American Course on Bioinformatics for Tropical Disease Research. 2002. (Curso de curta duração ministrado/Extensão). |
Bancas
| Participação em bancas examinadoras |
| Dissertações |
| 1. | ARAUJO, L. V.; SCHOR, P.; PISA, I. T.; Felipe, J. C.. Participação em banca de Fernando Sequeira Sousa. Análise comparativa de métodos de recuperação de informação para categorização de conteúdos web relacionados à saúde. 2011. Dissertação (Mestrado em Gestão e Informática em Saúde) - Universidade Federal de São Paulo. |
| Teses de doutorado |
| 1. | MATIOLI, S. R.; FERNANDES, F. M. C.; LAURETTO, M. S.; ROMANO, C. M.; ARAUJO, L. V.. Participação em banca de ARTUR TRANCOSO LOPO DE QUEIRÓZ. SELEÇÃO NATURAL NO VÍRUS DA HEPATITE C: INFLUÊNCIA DO SISTEMA IMUNE NA RESPOSTA AO TRATAMENTO. 2010. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo. |
| Qualificações de doutorado |
| 1. | ARAUJO, L. V.; GUALANDRO, S. F. M.; SILVA, G. T.. Participação em banca de Fernanda Nascimento Almeida. Procedência de Dados em Sistemas de Informação para Hemoterapia. 2010. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade de São Paulo. |
| Trabalhos de Conclusão de Curso de graduação |
| 1. | VAZ, J. C.; ARAUJO, L. V.; COELHO, F. S.. Participação em banca de Stephanie Lili Shahini. Limites e possibilidads do uso das tecnologias de Business Inteligence na Gestão Pública.. 2011. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Gestão de Políticas Públicas) - Escola de Artes, Ciências e Humanidades - USP. |
| 2. | Italiano, I. C.; ARAUJO, L. V.; Martins, David C.. Participação em banca de Caue Rodergas Alvarez. Utilização de Indicadores para o Gerenciamento de um Ambiente de Data Warehouse. 2010. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em MAtemática Aplicada) - Instituto de Matemática e Estatística - USP. |
| 3. | ARAUJO, L. V.; LIMA, A. M.. Participação em banca de Marcos Markoto Chida. Web Services Semântico - uma implementação sob a ferramenta OWLS-XPLAN. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Sistemas de Informação - EACH) - Universidade de São Paulo. |
| 4. | ARAUJO, L. V.; LIMA, A. M.. Participação em banca de Mário Amaral Gonçalves. Elaboração do plano de arquitetura do sistema de controle de despesas. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Sistemas de Informação - EACH) - Universidade de São Paulo. |
| 5. | ARAUJO, L. V.; LIMA, A. M.. Participação em banca de Mariana Vidal Olivia. PBXIP: Um novo conceito de telefonia. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Sistemas de Informação - EACH) - Universidade de São Paulo. |
| Participação em bancas de comissões julgadoras |
| Concurso público |
| 1. | ARAUJO, L. V.; SANTOS, Oscar Fernando Pavão dos; PISA, I. T.; WAINER, J.; SCHOR, P.; SOUZA, W. L.. Concurso Público para provimento no cargo de Prof. Adjunto - Informática em Saúde. 2010. Universidade Federal de São Paulo. |
| 2. | OIKAWA, M. K.; Italiano, I. C.; ARAUJO, L. V.. Concurso poara provimento da vaga para professor efetivo da UFSCar - Campus Sorocaba, classe Assistente, sub-área Banco de Dados.. 2010. Universidade Federal de São Carlos. |
Eventos
| Participação em eventos |
| 1. | The 24th Annual ACM Symposium on Applied Computing.HIVSetSubtype: Software for subtype classification of HIV-1 sequences. 2009. (Congresso). |
| 2. | IV Curso Avançado de Patogênese do HIV.DBCollHIV: A Database System for Collaborative HIV analysis in Brazil. 2009. (Congresso). |
| 3. | 23th ACM Symposium on applied computing.HIV drug resistance analysis tool based on process algebra. 2008. (Simpósio). |
| 4. | 14th Annual International Conference on intelligent systems for molecular biology.Evaluation of Brazilian web based program for classification of HIV-1 sequences. 2006. (Congresso). |
| 5. | X-Meeting.DBCollHIV: Database System for collaborative HIV analysis in Brazil. 2005. (Congresso). |
| 6. | International Conference on Bioinformatcs and Computational Biology- Icobicobi.Multidimensional data analysis for HIV drug resistence. 2003. (Congresso). |
| 7. | V Simpósio Brasileiro de Pesquisas em HIV/AIDS. 2003. (Simpósio). |
| 8. | Seminário de Data Warehouse and Business Intelligence. 2002. (Seminário). |
| 9. | XVI Simpósio Brasileiro de Banco de Dados. 2001. (Seminário). |
| 10. | Seminário de Data warehouse. 2001. (Seminário). |
| 11. | 9 Simpósio Internacional de Iniciação Científica da USP.Sistema para cruzamento de Dados Clínico-genéticos da rede de diversidade de vírus. 2001. (Simpósio). |
| Organização de eventos |
| 1. | ARAUJO, L. V. . Session chair - Track on Computer Applications in Health Care. 2009. (Congresso). |
Orientações
| Orientações em andamento |
| Tese de doutorado |
| 1. | Anderson Alvarenga Pereira. Definição de Indicadores para avaliação da correlação entre mutações do HIV e a resistência às drogas usadas no tratamento do paciente.. Início: 2010. Tese (Doutorado em Infectologia) - Universidade Federal de São Paulo. (Co-orientador). |
| Iniciação científica |
| 1. | Eduarda Grehnanin Arduini. Software de processamento de imagens para criação de indicadores para prevenção de úlcera de pressão em pacientes acamados.. Início: 2011. Iniciação científica (Graduando em Sistemas de Informação) - Escola de Artes, Ciências e Humanidades - USP, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. (Orientador). |
| 2. | Elton Aparecido da Silva. Indicadores de qualidade para o gerenciamento de ambiente de Data Warehouse.. Início: 2011. Iniciação científica (Graduando em Sistemas de Informação) - Escola de Artes, Ciências e Humanidades - USP, Universidade de São Paulo - Programa Ensinar Com Pesquisa. (Orientador). |
| Supervisões e orientações concluídas |
| Dissertação de mestrado |
| 1. | Fabio Oliveira Teixeira. Classificação e Indexação de Artigos Científicos Internacionais de Informática em Saúde. 2011. Dissertação (Mestrado em Pós-Graduação em Gestão e Informática em Saúde) - Universidade Federal de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Co-Orientador: Luciano Vieira de Araújo. |
| Trabalho de conclusão de curso de graduação |
| 1. | André Makoto Joko. Algoritmos Implementados em Assembly de Estruturas de Campos Empregados em Memória de Dados de Microcontrolador. 2011. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Sistemas de Informação) - Escola de Artes, Ciências e Humanidades - USP. Orientador: Luciano Vieira de Araújo. |
| 2. | Joyce Paulineli dos Santos. Solução de Software Dinâmico para apoiar pesquisa e tomada de decisão no contexto de pesquisas clínicas. 2011. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Sistemas de Informação) - Escola de Artes, Ciências e Humanidades - USP. Orientador: Luciano Vieira de Araújo. |
| 3. | Ronaldo José de Souza Paiva Junior. Desenvolvimento de um modelo de Proveniência de Dados aplicado à E-Science. 2011. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Sistemas de Informação) - Escola de Artes, Ciências e Humanidades - USP. Orientador: Luciano Vieira de Araújo. |
| 4. | Felipe Dias de Souza. Sistema de Informação para Gestão de Ideias Inovadoras. 2011. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Sistemas de Informação) - Escola de Artes, Ciências e Humanidades - USP. Orientador: Luciano Vieira de Araújo. |
| 5. | Lucas Pietro Nogueira. Desenvolvimento de Software para colaboração em projetos acadêmicos. 2011. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Sistemas de Informação) - Escola de Artes, Ciências e Humanidades - USP. Orientador: Luciano Vieira de Araújo. |
| 6. | Elton Yukio Kitadani Odaguil. O uso das técnicas de mineração de dados para apoiar a modelagem multidimensional. 2011. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Sistemas de Informação) - Escola de Artes, Ciências e Humanidades - USP. Orientador: Luciano Vieira de Araújo. |
| 7. | Rodrigo Suemi Kamiya. Aplicação de Indexação de Texto em Sistemas Legados. 2010. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Sistemas de Informação) - Escola de Artes, Ciências e Humanidades - USP. Orientador: Luciano Vieira de Araújo. |
| 8. | Gabriel Homsi Pedroso. Desenvolvimento de Sistema para Avaliação da Qualidade de Projetos de Banco de Dado. 2010. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Sistemas de Informação) - Escola de Artes, Ciências e Humanidades - USP. Orientador: Luciano Vieira de Araújo. |
| 9. | Winicius dos Santos Silva. ESTUDO SOBRE A PERSISTÊNCIA DE OBJETOS EM MEMÓRIA. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Sistemas de Informação) - Escola de Artes, Ciências e Humanidades - USP. Orientador: Luciano Vieira de Araújo. |
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