Genivaldo Gueiros Zacarias Silva

  • Endereço para acessar este CV: http://lattes.cnpq.br/8016670904372526
  • Última atualização do currículo em 13/05/2014


É graduado no curso de Computação pela Universidade Federal Rural de Pernambuco . Tem experiência na área de bioinformática trabalhando com bioinformática com foco em (meta)genomica e analise de dados biológicos . Foi aluno de Graduação Sanduíche na San Diego State University (SDSU) no departamento de Ciência da Computação trabalhando com bioinformática por um período de 6 meses no ano de 2013. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Genivaldo Gueiros Zacarias Silva
Nome em citações bibliográficas
SILVA, G. G. Z.;G. G. Z,SILVA ';Genivaldo G. Z. Silva

Endereço


Endereço Profissional
Universidade Federal do Rio de Janeiro.
Laboratório de Microbiologia
Cidade Universitária
21941901 - Rio de Janeiro, RJ - Brasil
Telefone: (21) 25626567
URL da Homepage: http://microbiologia.biologia.ufrj.br/


Formação acadêmica/titulação


2011 - 2011
Graduação em Graduação Sanduíche em Ciência da Computação.
San Diego State University, SDSU, Estados Unidos.
Orientador: Rob Edwards.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior.
2007 - 2011
Graduação em Licenciatura em Computação..
Universidade Federal Rural de Pernambuco, UFRPE, Brasil.
Orientador: Valdir de Queiroz Balbino.
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior.
2006 - 2009
Curso técnico/profissionalizante.
Técnico em informática modalidade EAD // Unibratec.
Bolsista do(a): Secretaria de Ciência, Tecnologia e Meio Ambiente de Pernambuco.




Formação Complementar


2010
Extensão universitária em Inglês.
Minds English School.
2012 - 2012
Intensive English for Communication (IEC). (Carga horária: 1035h).
San Diego State University, SDSU, Estados Unidos.
2011 - 2011
Extensão universitária em 6th Comparative Microbial Genomics & Taxonomy. (Carga horária: 40h).
Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.


Atuação Profissional



San Diego State University, SDSU, Estados Unidos.
Vínculo institucional

2012 - 2013
Vínculo: Graduate Assistant, Enquadramento Funcional: Graduate Assistant, Carga horária: 20, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações
Bioinformatician http://tinyurl.com/3henkzz

Vínculo institucional

2012 - 2012
Vínculo: Research Assistant III, Enquadramento Funcional: Research Assistant III, Carga horária: 20
Outras informações
Bioinformatician http://tinyurl.com/3henkzz

Vínculo institucional

2012 - 2012
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Teaching assistant (TA), Carga horária: 8
Outras informações
CS 503 Sec 1 SCI DATABASE TECHNIQUES CS 596 COMPUTATIONAL GENOMICS

Vínculo institucional

2011 - 2011
Vínculo: Estagio Especial, Enquadramento Funcional: Aluno Internacional, Carga horária: 30, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações
Research: 1 # Sand Fly ,Leishmania chagasi and Coral Reef Database || 2 #Genome sequence of the ethanol tolerant Lactobacillus vini || 3 # Scaffold_builder mais informaçoes:http://tinyurl.com/3henkzz


Universidade Federal Rural de Pernambuco, UFRPE, Brasil.
Vínculo institucional

2009 - 2013
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Desenvolvedor de software, Carga horária: 20
Outras informações
Bolsa vinculada ao Programa de Gerenciamento de Rebanhos Leiteiros do Nordeste (Progene) com o objetivo de informatizar o projeto através da criação de aplicações para a Intranet .

Vínculo institucional

2010 - 2011
Vínculo: Monitoria, Enquadramento Funcional: Monitoria, Carga horária: 12
Outras informações
Monitoria aplicada a Licenciatura em Computação ( Introdução a Programação) e Bacharelado em Ciências da Computação ( Programação I )

Vínculo institucional

2010 - 2010
Vínculo: Monitoria, Enquadramento Funcional: Monitoria em Banco de Dados, Carga horária: 12


Universidade Federal de Pernambuco, UFPE, Brasil.
Vínculo institucional

2010 - 2012
Vínculo: Bolsista PIBIC, Enquadramento Funcional: Bolsista PIBIC, Carga horária: 20
Outras informações
Bolsista PIBIC no Laboratório de Bioinformática e Biologia Evolutiva (LABBE)

Vínculo institucional

2009 - 2010
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Suporte em TI, Carga horária: 20
Outras informações
Bolsa ligada a :::PROEXT::: Pro Reitoria de Extensão da UFPE

Vínculo institucional

2008 - 2009
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Suporte em TI, Carga horária: 20
Outras informações
Bolsa vinculada ao NTI



Projetos de pesquisa


2006 - 2011
Xiscanoé - Modelos Computacionais para Simulação do Processo de Expansão da Esquistossomose na Área Litorânea de Pernambuco
Descrição: O processo de reprodução e urbanização da esquistossomose em Pernambuco é assunto em pauta entre pesquisadores da área. O objetivo desses pesquisadores é mapear e caracterizar criadouros e focos de vetores da esquistossomose, identificando novos sítios de transmissão ativa da parasitose. E ainda, correlacionar os determinantes biológicos da doença com o contexto ambiental da sua ocorrência. Assim, é notável a carência de um modelo matemático computacional para auxiliar a composição de cenários e o estudo do processo de expansão da doença. Este projeto visa prover modelos matemático-computacionais como efetiva ferramenta de auxílio na prevenção e controle de esquistossomose no estado de Pernambuco. Para determinar de forma precisa as variáveis mais relevantes no modelo serão capturadas imagens de satélite que revelam o aspecto de migração e contaminação temporal-geográfico das populações envolvidas, e comparadas com os dados epidemiológicos da doença, fornecidos pela CPqAM/FIOCRUZ. O processo de modelagem envolverá técnicas de programação linear estocástica e autômatos celulares. Pretende-se viabilizar os melhores modelos como ferramentas de trabalho para os pesquisadores, possibilitando a geração de cenários para que sejam tomadas ações estratégicas de combate e prevenção da doença, se tornando extremamente relevante para a comunidade científica, para o estado e para a sociedade. A sociedade será beneficiada, já que o nível de controle da doença será melhorado e, consequentemente, do serviço prestado pelos órgãos púbicos à população afetada. O estado poderá otimizar a distribuição de seus recursos financeiros e humanos no monitoramento, controle e combate da doença. Por fim, espera-se que os modelos propostos contribuam para o estado-da-arte em epidemiologia e matemática computacional, beneficiando a comunidade científica...
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (5) .
Integrantes: Genivaldo Gueiros Zacarias Silva - Integrante / Constança Clara Gayoso Simões Barbosa - Integrante / Jones Oliveira de Albuquerque - Coordenador / Hernande Pereira da Silva - Integrante / Laélia Pumilla Botêlho Campos dos Santos - Integrante / Marco Antônio Andrade de Souza - Integrante / Paulo Sergio Silva Rodrigues - Integrante / Reinaldo Souza dos Santos - Integrante / Silvana Bocanegra - Integrante / Tiago Alessandro Espinola Ferreira - Integrante / Wilson Rosa de Oliveira Junior - Integrante / André Caetano Alves Firmo - Integrante / Dalton Francisco de Araújo - Integrante / Danielle Nathália Gomes da Silva - Integrante / Elaine Cristina de Assis - Integrante / Natália Flora de Lima - Integrante / Vitor Alexandre Kessler de Almeida - Integrante / Caio Vinicius Xavier dos Santos e Silva - Integrante.


Áreas de atuação


1.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Bioinformática.
2.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Matemática da Computação/Especialidade: Modelos Analíticos e de Simulação.
3.
Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação/Especialidade: Engenharia de Software.


Idiomas


Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Espanhol
Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente.


Produções



Produção bibliográfica
Artigos completos publicados em periódicos

1.
Garcia GD2013Garcia GD ; GREGORACCI, G. B. ; Eidy de O. Santos ; Pedro M. Meirelles ; SILVA, G. G. Z. ; Robert A. Edwards ; Tomoo Sawabe ; Kazuyoshi Gotoh ; Shota Nakamura ; MOURA, R. L. ; Fabiano L. Thompson . Metagenomic Analysis of Healthy and White Plague-Affected Mussismilia braziliensis Corals. Microbial Ecology, v. xx, p. http://link.spr, 2013.

2.
Cristiane C.Thompson2013Cristiane C.Thompson ; G. G. Z,SILVA ' ; VIEIRA, N. M. ; Robert A. Edwards ; Ana Carolina Paulo Vicente ; Fabiano L. Thompson . Genomic Taxonomy of the Genus Prochlorococcus.. Microbial Ecology, v. 10, p. http://link.spr, 2013.

3.
G. G. Z,SILVA '2013G. G. Z,SILVA '; Bas E. Dutilh ; T. David Matthews ; Keri Elkins ; SCHMIEDER, R. ; Elizabeth A. Dinsdale ; Robert A. Edwards . Combining de novo and reference-guided assembly with scaffold_builder.. Source Code for Biology and Medicine, v. 2013, p. 23, 2013.

4.
Trindade-Silva, Amaro E2012Trindade-Silva, Amaro E ; Rua, C. ; Bruno GN Andrade ; Ana Carolina Paulo Vicente ; SILVA, G. G. Z. ; Berlinck, Roberto G. S. ; Fabiano L. Thompson . Polyketide synthase gene diversity within the endemic sponge Arenosclera brasiliensis microbiome. Applied and Environmental Microbiology (Print), v. 79, p. http://aem.asm, 2012.

5.
OLIVEIRA, L. S.2012OLIVEIRA, L. S. ; GREGORACCI, G. B. ; SILVA, G. G. Z. ; SALGADO, L. T. ; A FILHO, G. ; ALVES-FERREIRA, M. A. ; PEREIRA, R. C. ; Fabiano L. Thompson . Transcriptomic analysis of the red seaweed Laurencia dendroidea (Florideophyceae, Rhodophyta) and its microbiome. BMC Genomics, v. 17, p. biomedcentral, 2012.

6.
Brígida Thaís Luckwu de Lucena2012Brígida Thaís Luckwu de Lucena ; SILVA, G. G. Z. ; Billy Manoel dos Santos ; Graciela M. Dias ; Gilda Rose S. Amaral ; Ana Paula B. Moreira ; Marcos Antônio de Morais Júnior ; Bas E. Dutilh ; Robert A. Edwards ; V.Q.Balbino ; Cristiane C.Thompson ; Fabiano L. Thompson . Genome sequence of the ethanol tolerant Lactobacillus vini strains LMG23202T and JP7.8.9. Journal of Bacteriology (Print), v. 194, p. http://jb.asm.o, 2012.

7.
Trindade-Silva, Amaro E2012Trindade-Silva, Amaro E ; Rua, C. ; SILVA, G. G. Z. ; Bas E. Dutilh ; Ana Paula B. Moreira ; Robert A. Edwards ; Hajdu E ; Lobo-Hajdu G ; VASCONCELOS, A. T. ; Berlinck, Roberto G. S. ; Fabiano L. Thompson . Taxonomic and functional microbial signatures of the endemic marine sponge Arenosclera brasiliensis.. Plos One, v. 7, p. plosone.com, 2012.

8.
Noriko Cassman2012Noriko Cassman ; PRIETO-DAVO, A. ; WALSH, K. ; SILVA, G. G. Z. ; ANGLY, F. ; AKHTER, S. ; BAROTT, K. ; BUSCH, J. ; Tracey McDole ; HAGGERTY, J. M. ; WILLNER, D. ; ALARCON, G. ; ULLOA, O. ; DELONG, E. F. ; Bas E. Dutilh ; ROHWER, F. ; Elizabeth A. Dinsdale . Oxygen minimum zones harbor novel viral communities with low diversity. Environmental Microbiology (Print), v. 14, p. onlinelibrary, 2012.

Trabalhos completos publicados em anais de congressos
1.
ALBUQUERQUE, J. O. ; SILVA, G. G. Z. ; RAMOS,Ronaldo ; BOCANEGRA, Silvana ; FERREIRA, T. A. E ; FERRER, S. ; CODINA, D. L. ; SOUZA, M. A. A ; SANTOS, R. S ; BARBOSA, C. C. G. S . Modeling a Real Data Cellular Automaton to Analyze the Schistosomiasis Expansion Process along the coastline of Brasil. In: European Meetings on Cybernetics and Systems Research, 2012, Vienna. EMCSR Fourth International Symposium on Agent-Based Modeling and Simulation, 2012.

2.
SILVA, G. G. Z.; SILVA, C. V. X. S. ; RAMOS,Ronaldo ; ALBUQUERQUE, J. O. ; BOCANEGRA, Silvana ; AMARISTA, M. ; BARBOSA, C. S. . Simulação computacional do processo de expansão da Esquistossomose na área litorânea de Pernambuco usando Autômatos celulares com base de dados reais. In: IX Encontro Regional de Matemática Aplicada e Computacional, 2009, João Pessoa. IX Encontro Regional de Matemática Aplicada e Computacional, 2009.

Resumos expandidos publicados em anais de congressos
1.
SILVA, G. G. Z.; S.M.O.Medeiros ; R.C.A Gomes ; M.A.O.Santos ; M.V.A.Batista ; W.CUNHA ; T.L.D.LIMA ; FERREIRA, T. A. E ; V.Q.Balbino . SandFly Database: Development of an integrated platform of biological and molecular data of SandFlies ( Diptera: Psychodidae) of medical and veterinary importance. In: Entomol 4, 2010, Recife. Anais do IV Workshop de Genética e Biologia Molecular de Insetos Vetores de Doenças Tropicais, 2010. p. 120-121., 2010.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
Lins Marinho, L.A ; G. G. Z,SILVA ; M.A.O.Santos ; V.Q.Balbino ; Kido, E.A ; Pimentel Cassilhas, A.P ; Andrade, P.P. ; Medeiros, P.L ; Silva, E.C . In silico analysis of the most expressed 14 contigs in a Leishmania chagasi cDNA library from the Northeast Genome Program. In: I LUSO-BRAZILIAN CONGRESS OF THE EXPERIMENTAL PATHOLOGY (XI International Symposium on Experimental Techniques), 2011, Recife. XI International Symposium on Experimental Techniques), 2011.

2.
G. G. Z,SILVA; S.M.O.Medeiros ; R.C.A Gomes ; M.A.O.Santos ; M.V.A.Batista ; Gomes, L ; Lima,T L D ; FERREIRA, T. A. E ; V.Q.Balbino . Sandfly database: in silico exploitation of est data to Explore expression patterns in sandfly species. In: x-meeting - 6th international conference of the brazilian association for bioinformatics and computational biology, 2010, Ouro Preto. x-meeting - Abstracts book, 2010.

Apresentações de Trabalho
1.
G. G. Z,SILVA; Bas E. Dutilh ; T. David Matthews ; Keri Elkins ; Elizabeth A. Dinsdale ; Robert A. Edwards . Scaffold-builder for Combining De Novo and Reference-guided Assembly. 2012. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).


Produção técnica
Programas de computador sem registro
1.
G. G. Z,SILVA; Bas E. Dutilh ; T. David Matthews ; Keri Elkins ; Anca M. Segall ; Elizabeth A. Dinsdale ; Robert A. Edwards . Scaffold_builder. 2011.

2.
SILVA, G. G. Z.; LEITE FILHO,P.F. ; MEDEIROS, A. B. . RSQL - Sistema de apoio ao ensino de banco de dados. 2010.

3.
SILVA, G. G. Z.; R.C.A Gomes . Pro2Ger Programa de gerenciamento da Progene. 2010.

4.
SILVA, G. G. Z.; LEITE FILHO,P.F. ; SILVA, R. A. . Memory Start. 2009.


Demais tipos de produção técnica
1.
SILVA, G. G. Z.. Serviços Online - Internet. 2008. (Curso de curta duração ministrado/Outra).



Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
Applied Computational Science and Engineering Student Support (A.FOCUS - A Model to Identify Organisms Present in Metagenomes Based on Codon Usage. 2013. (Encontro).

2.
Student Research Symposium.FOCUS - A Model to Identify Organisms Present in Metagenomes Based on Codon Usage. 2013. (Simpósio).

3.
10th Rocky Mountain Bioinformatics Conference. Scaffold-builder for Combining De Novo and Reference-guided Assembly. 2012. (Congresso).

4.
San Diego Microbiology Group All Day Meeting. 2011. (Encontro).

5.
ACM International Collegiate Programming Contest (XIV Maratona de Programação).Membro da Equipe SeGuRança. 2010. (Outra).

6.
Entomol 4.SandFly Database: Development of an integrated platform of biological and molecular data of SandFlies ( Diptera: Psychodidae) of medical and veterinary importance. 2010. (Outra).

7.
I Semana de computação - Secomp. 2010. (Outra).

8.
ACM International Collegiate Programming Contest (XIV Maratona de Programação).Participante da equipe R3G. 2009. (Outra).

9.
IX Encontro Regional de Matemática Aplicada e Computacional ( ERMAC).Simulação computacional do processo de expansão da Esquistossomose na área litorânea de Pernambuco usando Autômatos celulares com base de dados reais. 2009. (Encontro).

10.
II Encontro de Software Livre. 2008. (Encontro).

11.
Jornada de Educação Digital. 2008. (Seminário).



Orientações



Orientações e supervisões concluídas
Orientações de outra natureza
1.
David Chien. High School Student - Python Programming for Bioinformatics || software to pre-processing sequence. 2012. Orientação de outra natureza - Polytechnic School in Pasadena, CA. Orientador: Genivaldo Gueiros Zacarias Silva.



Outras informações relevantes


Membro da International Society for Computational Biology (ISCB).



Página gerada pelo Sistema Currículo Lattes em 17/11/2018 às 3:14:17