Rodrigo Felipe de Oliveira Pena

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  • Última atualização do currículo em 07/12/2018


Doutorando em Física Aplicada à Medicina e Biologia pela Universidade de São Paulo. Bacharel em Física Médica. Tem experiência na área de Engenharia Biomédica, com ênfase em Modelagem de Sistemas Biológicos. Atualmente recebe bolsa de doutorado da FAPESP e possui projeto de pesquisa junto ao SisNe (Laboratório de Sistemas Neurais) da USP-RP com o título Mecanismos de Propagação de Atividade Epileptiforme em um Modelo Cortical de Grande Porte. Membro do grupo recém formado NeuroMat que visa desenvolver ferramentas matemáticas para análise do cérebro que é apoiado pelo projeto temático FAPESP 2013/07699-0. Também participante do projeto temático FAPESP 2011/50151-0 denominado Fenômenos Dinâmicos em Redes Complexas: Fundamentos e Aplicações pelo qual realizou estágio no exterior na Universidade de Humboldt, Berlim. (Texto informado pelo autor)


Identificação


Nome
Rodrigo Felipe de Oliveira Pena
Nome em citações bibliográficas
PENA, R. F. O.;PENA, RODRIGO FO;PENA, RF;RODRIGO, PENA;PENA, RODRIGO F. O.;PENA, RODRIGO FELIPE DE OLIVEIRA

Endereço


Endereço Profissional
Universidade de São Paulo, Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto.
Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto - USP
Vila Monte Alegre
14040901 - Ribeirão Preto, SP - Brasil
Telefone: (16) 36023859
URL da Homepage: http://www.ffclrp.usp.br/


Formação acadêmica/titulação


2014 - 2018
Doutorado em Física Aplicada à Medicina e Biologia.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
com período sanduíche em Humboldt-Universität Zu Berlin (Orientador: Benjamin Lindner e Michael A. Zaks).
Título: Mecanismos de propagação de atividade epileptiforme em um modelo cortical de grande porte, Ano de obtenção: 2018.
Orientador: Antônio Carlos Roque da Silva Filho.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
2009 - 2013
Graduação em Física Médica.
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
com período sanduíche em Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne (Orientador: Christian Gaumier).
Orientador: Antônio Carlos Roque da Silva Filho.
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
2005 - 2007
Curso técnico/profissionalizante.
Centro Universitário Adventista de São Paulo, UNASP, Brasil.




Formação Complementar


2018 - 2018
LASCON 2018 - VII Latin American School on Computational Neuroscience. (Carga horária: 205h).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
2017 - 2017
Python for Data Science and Machine Learning Bootcamp. (Carga horária: 21h).
Udemy, UDEMY, Estados Unidos.
2016 - 2016
Extensão universitária em Winterschool Dynamical phenomena in complex networks at Leucorea Wittenberg. (Carga horária: 20h).
Humboldt-Universität Zu Berlin, HUB, Alemanha.
2016 - 2016
Otimização de Código e Introdução à Programação de GPUs com CUDA. (Carga horária: 8h).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
2016 - 2016
I NeuroMat Course on Parallel and GPU Programming for Neuroscience. (Carga horária: 15h).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
2014 - 2014
Modelando Plasticidade Sináptica. (Carga horária: 3h).
Sociedade Brasileira de Neurociências e Comportamento, SBNeC, Brasil.
2014 - 2014
Clusters Linux. (Carga horária: 8h).
Centro de Informática de Ribeirão Preto - Universidade de São Paulo, CIRP-USP, Brasil.
2013 - 2013
Processamento de Sinais e Imagens Médicas. (Carga horária: 3h).
XVIII Congresso Brasileiro de Física Médica, CBFM, Brasil.
2013 - 2013
Dynamical Phenomena in Complex Networks. (Carga horária: 54h).
Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
2013 - 2013
Introdução à Neurociência Computacional. (Carga horária: 3h).
Sociedade Brasileira de Neurociências e Comportamento, SBNeC, Brasil.


Atuação Profissional



Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne, EPFL, Suiça.
Vínculo institucional

2012 - 2013
Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Estágio Científico


Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.
Vínculo institucional

2011 - 2012
Vínculo: Estudante de graduação, Enquadramento Funcional: Estudante de graduação, Regime: Dedicação exclusiva.


Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
Vínculo institucional

2017 - 2017
Vínculo: Estagiário, Enquadramento Funcional: Estagiário, Carga horária: 8
Outras informações
Programa de Aperfeiçoamento de Ensino - PAE - Departamento de Física - Física II - Ondas, Fluidos e Termodinâmica

Vínculo institucional

2015 - 2015
Vínculo: Livre, Enquadramento Funcional: Estagiário, Carga horária: 6
Outras informações
Programa de Aperfeiçoamento de Ensino - PAE - Departamento de Física - Física Computacional (5910154)

Vínculo institucional

2011 - 2011
Vínculo: Monitor, Enquadramento Funcional: Monitor, Carga horária: 20
Outras informações
Monitor voluntário no curso de Biofísica II durante o segundo semestre de 2011, no Departamento de Física, Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo.

Vínculo institucional

2010 - 2010
Vínculo: Outro (especifique) Bolsista, Enquadramento Funcional: Estagiário, Carga horária: 20

Vínculo institucional

2010 - 2010
Vínculo: Monitor, Enquadramento Funcional: Monitor, Carga horária: 20
Outras informações
Monitor voluntário no curso de Física I durante o segundo semestre de 2011, no Departamento de Física, Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo.


Centro Universitário Adventista de São Paulo, UNASP, Brasil.
Vínculo institucional

2006 - 2007
Vínculo: Estágio, Enquadramento Funcional: Estagiário, Carga horária: 10



Projetos de pesquisa


2012 - 2013
Modeling disease propagation using graph theory
Descrição: Various practical applications, such as bioengineering problems, require the detection of some basic graph structures within big complex graphs. The goal of the project is to implement various graph recognition algorithms and to evaluate their performances on several case studies such as neural networks, disease propagation, social networks. Using framework ATAG it will be implemented a discrete-time simulator for disease propagation over various types of population networks, this discrete-time simulator will be able to be used in neural networks..
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) .
Integrantes: Rodrigo Felipe de Oliveira Pena - Integrante / Christian Gaumier - Coordenador.Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.
2011 - Atual
Construção, Caracterização e Simulação de um Modelo de Rede Neural Cortical
Descrição: O objetivo deste projeto é construir um modelo genérico do córtex cerebral que contenha algumas características da sua organização estrutural e das propriedades dinâmicas intrínsecas dos seus neurônios. Em particular, a rede terá estrutura hierárquica e modular e os seus neurônios pertencerão a cinco classes eletrofisiológicas distintas. A estrutura topológica do modelo será caracterizada usando-se medidas de redes complexas. O modelo será simulado em computador para se estudar o efeito combinado da sua característica estrutural com a sua característica de ser composto por neurônios dinamicamente distintos sobre os possíveis padrões de atividade auto-sustentada exibidos por ele..
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
Alunos envolvidos: Graduação: (1) .
Integrantes: Rodrigo Felipe de Oliveira Pena - Integrante / Antonio Carlos Roque da Silva Filho - Coordenador.Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.


Outros Projetos


2010 - 2010
Estruturação e Implementação do Núcleo de Avaliação de Tecnologias em Saúde do HCRP-USP
Descrição: Atividades foram realizar a integração de diferentes bancos de dados institucionais sobre a aquisição de equipamentos médico-hospitalares, confrontação e correção de inconsistências e busca de evidências clínicas para a realização de pareceres técnico-científicos..
Situação: Concluído; Natureza: Outra.
Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (1) .
Integrantes: Rodrigo Felipe de Oliveira Pena - Integrante / Lauro Wichert Ana - Coordenador.Financiador(es): Fundação de Apoio ao Ensino, Pesquisa e Assistência do HCFMRP - Bolsa.


Áreas de atuação


1.
Grande área: Engenharias / Área: Engenharia Biomédica / Subárea: Bioengenharia/Especialidade: Modelagem de Sistemas Biológicos.


Idiomas


Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Espanhol
Compreende Pouco, Fala Pouco, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.
Francês
Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente, Escreve Razoavelmente.


Prêmios e títulos


2018
Vencedor do melhor projeto apresentado em LASCON 2018 - VII Latin American School on Computational Neuroscience, Universidade de São Paulo.
2014
Vencedor 2º lugar - Melhor Apresentação - Apresentação sobre o intercâmbio cultural, GCARI-RP.
2014
Prêmio Professor John Roderick Cameron - Aluno de graduação em Física Médica com o melhor desempenho acadêmico ao longo do curso, Universidade de São Paulo - USP.
2013
Melhor Pôster, XVIII Congresso Brasileiro de Física Médica.


Produções



Produção bibliográfica
Citações

Web of Science
Total de trabalhos:15
Total de citações:7
Fator H:2

Outras
Total de trabalhos:16
Total de citações:18
Rodrigo F. O. Pena (Google Scholar)  Data: 22/03/2018

Artigos completos publicados em periódicos

1.
LIMA, VINICIUS2019LIMA, VINICIUS ; PENA, R. F. O. ; CEBALLOS, C. C. ; SHIMOURA, R. ; ROQUE A.C. . Aplicações da teoria da informação à neurociência. Revista Brasileira de Ensino de Física (São Paulo), v. 41, p. e20180197, 2019.

2.
CEBALLOS, CESAR C.2018CEBALLOS, CESAR C. ; PENA, R. F. O. ; ROQUE A.C. ; LEÃO, RICARDO M. . Non-Decaying postsynaptics potentials and delayed spikes in hippocampal pyramidal neurons generated by a zero slope conductance created by the persistent Na + current. Channels, v. 12, p. 81-88, 2018.

3.
PENA, R. F. O.;PENA, RODRIGO FO;PENA, RF;RODRIGO, PENA;PENA, RODRIGO F. O.;PENA, RODRIGO FELIPE DE OLIVEIRA2018PENA, R. F. O.; VELLMER, SEBASTIAN ; BERNARDI, DAVIDE ; ROQUE A.C. ; LINDNER, BENJAMIN . Self-Consistent Scheme for Spike-Train Power Spectra in Heterogeneous Sparse Networks. Frontiers in Computational Neuroscience, v. 12, p. 9, 2018.

4.
PENA, R. F. O.;PENA, RODRIGO FO;PENA, RF;RODRIGO, PENA;PENA, RODRIGO F. O.;PENA, RODRIGO FELIPE DE OLIVEIRA2018 PENA, R. F. O.; CEBALLOS, CESAR C. ; LIMA, VINICIUS ; ROQUE A.C. . Interplay of activation kinetics and the derivative conductance determines resonance properties of neurons. PHYSICAL REVIEW E, v. 97, p. 042408, 2018.

5.
SHIMOURA, R.2018SHIMOURA, R. ; KAMIJI, N. L. ; PENA, RODRIGO F. O. ; LIMA, VINICIUS ; CEBALLOS, C. C. ; ROMARO, C. ; ROQUE A.C. . [Re] The cell-type specific cortical microcircuit: relating structure and activity in a full-scale spiking network model. The ReScience Journal, v. 4, p. 785-806, 2018.

6.
PENA, R. F. O.;PENA, RODRIGO FO;PENA, RF;RODRIGO, PENA;PENA, RODRIGO F. O.;PENA, RODRIGO FELIPE DE OLIVEIRA2018 PENA, R. F. O.; ZAKS, MICHAEL A. ; ROQUE A.C. . Dynamics of spontaneous activity in random networks with multiple neuron subtypes and synaptic noise. Journal of Computational Neuroscience, v. 45, p. 1-28, 2018.

7.
CUNHA, ALEXANDRA OLIMPIO SIQUEIRA2018CUNHA, ALEXANDRA OLIMPIO SIQUEIRA ; CEBALLOS, CESAR CELIS ; DE DEUS, JÚNIA LARA ; PENA, RODRIGO FELIPE DE OLIVEIRA ; DE OLIVEIRA, JOSÉ ANTONIO CORTES ; ROQUE, ANTONIO CARLOS ; GARCIA-CAIRASCO, NORBERTO ; LEÃO, RICARDO MAURÍCIO . Intrinsic and synaptic properties of hippocampal CA1 pyramidal neurons of the Wistar Audiogenic Rat (WAR) strain, a genetic model of epilepsy. Scientific Reports, v. 8, p. 10412, 2018.

8.
RUBCHINSKY, LEONID L.2017RUBCHINSKY, LEONID L. AHN, SUNGWOO KLIJN, WOUTER CUMMING, BEN YATES, STUART KARAKASIS, VASILEIOS PEYSER, ALEXANDER WOODMAN, MARMADUKE DIAZ-PIER, SANDRA DERAEVE, JAMES VASSENA, ELIANA ALEXANDER, WILLIAM BEEMAN, DAVID KUDELA, PAWEL BOATMAN-REICH, DANA ANDERSON, WILLIAM S. LUQUE, NICETO R. NAVEROS, FRANCISCO CARRILLO, RICHARD R. ROS, EDUARDO ARLEO, ANGELO HUTH, JACOB ICHINOSE, KOKI PARK, JIHOON KAWAI, YUJI , et al.SUZUKI, JUNICHI MORI, HIROKI ASADA, MINORU OPRISAN, SORINEL A. DAVE, AUSTIN I. BABAIE, TAHEREH ROBINSON, PETER TABAS, ALEJANDRO ANDERMANN, MARTIN RUPP, ANDRÉ BALAGUER-BALLESTER, EMILI LINDÉN, HENRIK CHRISTENSEN, RASMUS K. NAKAMURA, MARI BARKAT, TANIA R. TOSI, ZACH BEGGS, JOHN LONARDONI, DAVIDE BOI, FABIO DI MARCO, STEFANO MACCIONE, ALESSANDRO BERDONDINI, LUCA J'DRZEJEWSKA-SZMEK, JOANNA DORMAN, DANIEL B. BLACKWELL, KIM T. BAUERMEISTER, CHRISTOPH KEREN, HANNA BRAUN, JOCHEN DORNAS, JOÃO V. MAVRITSAKI, EIRINI ALDROVANDI, SILVIO BRIDGER, EMMA LIM, SUKBIN BRUNEL, NICOLAS BUCHIN, ANATOLY KERR, CLIFFORD CHARLES CHIZHOV, ANTON HUBERFELD, GILLES MILES, RICHARD GUTKIN, BORIS SPENCER, MARTIN J. MEFFIN, HAMISH GRAYDEN, DAVID B. BURKITT, ANTHONY N. DAVEY, CATHERINE E. TAO, LIANGYU TIRUVADI, VINEET ALI, REHMAN MAYBERG, HELEN BUTERA, ROBERT GUNAY, CENGIZ LAMB, DAMON CALABRESE, RONALD L. DOLOC-MIHU, ANCA LÓPEZ-MADRONA, VÍCTOR J. MATIAS, FERNANDA S. PEREDA, ERNESTO MIRASSO, CLAUDIO R. CANALS, SANTIAGO GEMINIANI, ALICE PEDROCCHI, ALESSANDRA D?ANGELO, EGIDIO CASELLATO, CLAUDIA CHAUHAN, ANKUR SOMAN, KARTHIK SRINIVASA CHAKRAVARTHY, V. MUDDAPU, VIGNAYANANDAM R. CHUANG, CHAO-CHUN CHEN, NAN-YOW BAYATI, MEHDI MELCHIOR, JAN WISKOTT, LAURENZ AZIZI, AMIR HOSSEIN DIBA, KAMRAN CHENG, SEN SMIRNOVA, ELENA Y. YAKIMOVA, ELENA G. CHIZHOV, ANTON V. CHEN, NAN-YOW SHIH, CHI-TIN FLORESCU, DORIAN COCA, DANIEL COURTIOL, JULIE JIRSA, VIKTOR K. COVOLAN, ROBERTO J. M. TELE'CZUK, BARTOSZ KEMPTER, RICHARD CURIO, GABRIEL DESTEXHE, ALAIN PARKER, JESSICA KLISHKO, ALEXANDER N. PRILUTSKY, BORIS I. CYMBALYUK, GENNADY FRANKE, FELIX HIERLEMANN, ANDREAS DA SILVEIRA, RAVA AZEREDO CASALI, STEFANO MASOLI, STEFANO RIZZA, MARTINA RIZZA, MARTINA FRANCESCA MASOLI, STEFANO SUN, YINMING WONG, WILLY FARZAN, FARANAK BLUMBERGER, DANIEL M. DASKALAKIS, ZAFIRIS J. POPOVYCH, SVITLANA VISWANATHAN, SHIVAKUMAR ROSJAT, NILS GREFKES, CHRISTIAN DAUN, SILVIA GENTILETTI, DAMIANO SUFFCZYNSKI, PIOTR GNATKOVSKI, VADYM DE CURTIS, MARCO LEE, HYEONSU PAIK, SE-BUM CHOI, WOOCHUL JANG, JAESON PARK, YOUNGJIN SONG, JUN HO SONG, MIN PALLARÉS, VICENTE GILSON, MATTHIEU KÜHN, SIMONE INSABATO, ANDREA DECO, GUSTAVO GLOMB, KATHARINA PONCE-ALVAREZ, ADRIÁN RITTER, PETRA GILSON, MATTHIEU CAMPO, ADRIA TAUSTE THIELE, ALEXANDER DEEBA, FARAH ROBINSON, P. A. VAN ALBADA, SACHA J. ROWLEY, ANDREW HOPKINS, MICHAEL SCHMIDT, MAXIMILIAN STOKES, ALAN B. LESTER, DAVID R. FURBER, STEVE DIESMANN, MARKUS BARRI, ALESSANDRO WIECHERT, MARTIN T. DIGREGORIO, DAVID A. DIMITROV, ALEXANDER G. VICH, CATALINA BERG, RUNE W. GUILLAMON, ANTONI DITLEVSEN, SUSANNE CAZÉ, ROMAIN D. GIRARD, BENOÎT DONCIEUX, STÉPHANE DOYON, NICOLAS BOAHEN, FRANK DESROSIERS, PATRICK LAURENCE, EDWARD DOYON, NICOLAS DUBÉ, LOUIS J. ELEONORA, RUSSO DURSTEWITZ, DANIEL SCHMIDT, DOMINIK MÄKI-MARTTUNEN, TUOMO KRULL, FLORIAN BETTELLA, FRANCESCO METZNER, CHRISTOPH DEVOR, ANNA DJUROVIC, SRDJAN DALE, ANDERS M. ANDREASSEN, OLE A. EINEVOLL, GAUTE T. NÆSS, SOLVEIG NESS, TORBJØRN V. HALNES, GEIR HALGREN, ERIC HALNES, GEIR MÄKI-MARTTUNEN, TUOMO PETTERSEN, KLAS H. ANDREASSEN, OLE A. SÆTRA, MARTE J. HAGEN, ESPEN SCHIFFER, ALINA GRZYMISCH, AXEL PERSIKE, MALTE ERNST, UDO HARNACK, DANIEL ERNST, UDO A. TOMEN, NERGIS ZUCCA, STEFANO PASQUALE, VALENTINA PICA, GIUSEPPE MOLANO-MAZÓN, MANUEL CHIAPPALONE, MICHELA PANZERI, STEFANO FELLIN, TOMMASO OIE, KELVIN S. BOOTHE, DAVID L. CRONE, JOSHUA C. YU, ALFRED B. FELTON, MELVIN A. ZULFIQAR, ISMA MOEREL, MICHELLE DE WEERD, PETER FORMISANO, ELIA BOOTHE, DAVID L. CRONE, JOSHUA C. FELTON, MELVIN A. OIE, KELVIN FRANASZCZUK, PIOTR DIGGELMANN, ROLAND FISCELLA, MICHELE HIERLEMANN, ANDREAS FRANKE, FELIX GUARINO, DOMENICO ANTOLÍK, JAN DAVISON, ANDREW P. FRÈGNAC, YVES ETIENNE, BENJAMIN XAVIER FROHLICH, FLAVIO LEFEBVRE, JÉRÉMIE MARCOS, ENCARNI MATTIA, MAURIZIO GENOVESIO, ALDO FEDOROV, LEONID A. DIJKSTRA, TJEERD M.H. STING, LOUISA HOCK, HOWARD GIESE, MARTIN A. BUHRY, LAURE LANGLET, CLÉMENT GIOVANNINI, FRANCESCO VERBIST, CHRISTOPHE SALVADÉ, STEFANO GIUGLIANO, MICHELE HENDERSON, JAMES A. WERNECKE, HENDRIK SÁNDOR, BULCSÚ GROS, CLAUDIUS VOGES, NICOLE DABROVSKA, PAULINA RIEHLE, ALEXA BROCHIER, THOMAS GRÜN, SONJA GU, YIFAN GONG, PULIN DUMONT, GRÉGORY NOVIKOV, NIKITA A. GUTKIN, BORIS S. TEWATIA, PARUL ERIKSSON, OLIVIA KRAMER, ANDREI SANTOS, JOAO JAUHIAINEN, ALEXANDRA KOTALESKI, JEANETTE H. BELI', JOVANA J. KUMAR, ARVIND KOTALESKI, JEANETTE HELLGREN SHIMONO, MASANORI HATANO, NAOMICHI AHMAD, SUBUTAI CUI, YUWEI HAWKINS, JEFF SENK, JOHANNA KORVASOVÁ, KAROLÍNA TETZLAFF, TOM HELIAS, MORITZ KÜHN, TOBIAS DENKER, MICHAEL MANA, PIERGIANLUCA GRÜN, SONJA DAHMEN, DAVID SCHUECKER, JANNIS GOEDEKE, SVEN KEUP, CHRISTIAN GOEDEKE, SVEN HEUER, KATJA BAKKER, REMBRANDT TIESINGA, PAUL TORO, ROBERTO QIN, WEI HADJINICOLAOU, ALEX GRAYDEN, DAVID B. IBBOTSON, MICHAEL R. KAMENEVA, TATIANA LYTTON, WILLIAM W. MULUGETA, LEALEM DRACH, ANDREW MYERS, JERRY G. HORNER, MARC VADIGEPALLI, RAJANIKANTH MORRISON, TINA WALTON, MARLEI STEELE, MARTIN ANTHONY HUNT, C. TAM, NICOLADIE AMADUCCI, RODRIGO MUÑIZ, CARLOS REYES-SÁNCHEZ, MANUEL RODRÍGUEZ, FRANCISCO B. VARONA, PABLO CRONIN, JOSEPH T. HENNIG, MATTHIAS H. IAVARONE, ELISABETTA YI, JANE SHI, YING ZANDT, BAS-JAN VAN GEIT, WERNER RÖSSERT, CHRISTIAN MARKRAM, HENRY HILL, SEAN O?REILLY, CHRISTIAN IAVARONE, ELISABETTA SHI, YING PERIN, RODRIGO LU, HUANXIANG ZANDT, BAS-JAN BRYSON, ALEXANDER RÖSSERT, CHRISTIAN HADRAVA, MICHAL HLINKA, JAROSLAV HOSAKA, RYOSUKE OLENIK, MARK HOUGHTON, CONOR IANNELLA, NICOLANGELO LAUNEY, THOMAS KAMENEVA, TATIANA KOTSAKIDIS, REBECCA MEFFIN, HAMISH SORIANO, JAYMAR KUBO, TAKATOMI INOUE, TAKAO KIDA, HIROYUKI YAMAKAWA, TOSHITAKA SUZUKI, MICHIYASU IKEDA, KAZUSHI ABBASI, SAMIRA HUDSON, AMBER E. HECK, DETLEF H. JAEGER, DIETER LEE, JOEL ABBASI, SAMIRA JANU?ONIS, SKIRMANTAS SAGGIO, MARIA LUISA SPIEGLER, ANDREAS STACEY, WILLIAM C. BERNARD, CHRISTOPHE LILLO, DAVIDE BERNARD, CHRISTOPHE PETKOSKI, SPASE SPIEGLER, ANDREAS DRAKESMITH, MARK JONES, DEREK K. ZADEH, ALI SADEGH KAMBHAMPATI, CHANDRA KARBOWSKI, JAN KAYA, ZEYNEP GOKCEN LAKRETZ, YAIR TREVES, ALESSANDRO LI, LILY W. LIZIER, JOSEPH KERR, CLIFF C. MASQUELIER, TIMOTHÉE KHERADPISHEH, SAEED REZA KIM, HOJEONG KIM, CHANG SUB MARAKSHINA, JULIA A. VARTANOV, ALEXANDER V. NEKLYUDOVA, ANASTASIA A. KOZLOVSKIY, STANISLAV A. KISELNIKOV, ANDREY A. TANIGUCHI, KANAKO KITANO, KATSUNORI SCHMITT, OLIVER LESSMANN, FELIX SCHWANKE, SEBASTIAN EIPERT, PETER MEINHARDT, JENNIFER BEIER, JULIA KADIR, KANAR KARNITZKI, ADRIAN SELLNER, LINDA KLÜNKER, ANN-CHRISTIN KUCH, LENA RUß, FRAUKE JENSSEN, JÖRG WREE, ANDREAS SANZ-LEON, PAULA KNOCK, STUART A. CHIEN, SHIH-CHENG MAESS, BURKHARD KNÖSCHE, THOMAS R. COHEN, CHARLES C. POPOVIC, MARKO A. KLOOSTER, JAN KOLE, MAARTEN H.P. ROBERTS, ERIK A. KOPELL, NANCY J. KEPPLE, DANIEL GIAFFAR, HAMZA RINBERG, DIMA KOULAKOV, ALEX FORLIM, CAROLINE GARCIA KLOCK, LEONIE BÄCHLE, JOHANNA STOLL, LAURA GIEMSA, PATRICK FUCHS, MARIE SCHOOFS, NIKOLA MONTAG, CHRISTIANE GALLINAT, JÜRGEN LEE, RAY X. STEPHENS, GREG J. KUHN, BERND TAUFFER, LUIZ ISOPE, PHILIPPE INOUE, KATSUMA OHMURA, YOSHIYUKI YONEKURA, SHOGO KUNIYOSHI, YASUO JANG, HYUN JAE KWAG, JEEHYUN DE KAMPS, MARC LAI, YI MING DOS SANTOS, FILIPA LAM, K. P. ANDRAS, PETER IMPERATORE, JULIA HELMS, JESSICA TOMPA, TAMAS LAVIN, ANTONIETA INKPEN, FELICITY H. ASHBY, MICHAEL C. LEPORA, NATHAN F. SHIFMAN, AARON R. LEWIS, JOHN E. ZHANG, ZHONG FENG, YEQIAN TETZLAFF, CHRISTIAN KULVICIUS, TOMAS LI, YINYUN PENA, RODRIGO F. O. BERNARDI, DAVIDE ROQUE, ANTONIO C. LINDNER, BENJAMIN BERNARDI, DAVIDE VELLMER, SEBASTIAN SAUDARGIENE, AUSRA MANINEN, TIINA HAVELA, RIIKKA LINNE, MARJA-LEENA POWANWE, ARTHUR LONGTIN, ANDRE NAVEROS, FRANCISCO GARRIDO, JESÚS A. GRAHAM, JOE W. DURA-BERNAL, SALVADOR ANGULO, SERGIO L. NEYMOTIN, SAMUEL A. ANTIC, SRDJAN D. ; 26th Annual Computational Neuroscience Meeting (CNS*2017): Part 2. BMC NEUROSCIENCE, v. 18, p. 59-P149, 2017.

9.
TOMOV, PETAR2016TOMOV, PETAR ; PENA, RODRIGO F. O. ; ROQUE, ANTONIO C. ; ZAKS, MICHAEL A. . Mechanisms of Self-Sustained Oscillatory States in Hierarchical Modular Networks with Mixtures of Electrophysiological Cell Types. Frontiers in Computational Neuroscience, v. 10, p. 23, 2016.

10.
PENA, R. F. O.;PENA, RODRIGO FO;PENA, RF;RODRIGO, PENA;PENA, RODRIGO F. O.;PENA, RODRIGO FELIPE DE OLIVEIRA2015PENA, R. F. O.; SHIMOURA, RENAN O ; ROQUE A.C. . A cortical multi-layered model and the properties of its internally-generated activity. BMC Neuroscience (Online), v. 16, p. P209, 2015.

11.
SHIMOURA, RENAN O2015SHIMOURA, RENAN O ; PENA, R. F. O. ; ROQUE A.C. . Effect of synaptic plasticity on functional connectivity and global activity of a neocortical network model. BMC Neuroscience (Online), v. 16, p. P210, 2015.

12.
2PETAR, TOMOV2014PETAR, TOMOV ; RODRIGO, PENA ; MICHAEL, ZAKS ; ANTONIO, ROQUE . Self-sustained activity in cortical network models. Frontiers in Neuroinformatics, v. 8, p. 120, 2014.

13.
TOMOV, PETAR2014TOMOV, PETAR ; PENA, RODRIGO F. O. ; ZAKS, MICHAEL A. ; ROQUE, ANTONIO C. . Sustained oscillations, irregular firing, and chaotic dynamics in hierarchical modular networks with mixtures of electrophysiological cell types. Frontiers in Computational Neuroscience, v. 8, p. 103, 2014.

14.
3VIEIRA, DIOGO PC2013VIEIRA, DIOGO PC ; PENA, RODRIGO FO ; ROQUE, ANTONIO C . Self-sustained activity in neural networks: influence of network topology and cell types. BMC Neuroscience (Online), v. 14, p. P411, 2013.

Textos em jornais de notícias/revistas
1.
PENA, R. F. O.; SHIMOURA, R. ; CEBALLOS, C. C. ; ROQUE A.C. . UM SIMULADOR DE UM MODELO COMPUTACIONAL CORTICAL EM MULTI-CAMADAS. REVISTA DE INFORMÁTICA BIOMÉDICA, Online, p. n.1, 30 set. 2015.

2.
PENA, R. F. O.; VIEIRA, D. P. C ; ROQUE A.C. . AUTO-SUSTENTABILIDADE EM UM MODELO DE REDE NEURAL: INFLUÊNCIA DA TOPOLOGIA DA REDE E DO TIPO DE CÉLULA. REVISTA DE INFORMÁTICA BIOMÉDICA, Online, p. 37 - 43, 28 abr. 2015.

Resumos publicados em anais de congressos
1.
LIMA, V. ; GHADERI, P. ; ROSTAMI, S. ; PENA, R. F. O. ; SHIMOURA, R. ; ROQUE A.C. . Biophysical model of acetylcholine modulation in visual cortex. In: 5th BRAINN Congress, 2018, Campinas. Biophysical model of acetylcholine modulation in visual cortex, 2018.

2.
SIQUEIRA, A. ; CEBALLOS, CESAR CELIS ; DEUS, J. L. ; PENA, RODRIGO FO ; OLIVEIRA, J. A. ; ROQUE A.C. ; GARCIA-CAIRASCO, N. ; LEÃ . Intrinsic and synaptic properties of hippocampal CA1 pyramidal neurons of the Wistar Audiogenic Rat (WAR) strain, a genetic model of epilepsy. In: 11th FENS Forum of Neuroscience, 2018, Berlin. 11th FENS Forum of Neuroscience, 2018.

3.
PENA, RF; ROQUE A.C. ; ZAKS, MICHAEL A. . Lifetime of self-sustained activity in random networks of two-dimensional integrate-and-fire neurons: role of input strength. In: Bernstein Conference 2018, 2018, Berlin. Lifetime of self-sustained activity in random networks of two-dimensional integrate-and-fire neurons: role of input strength, 2018.

4.
PENA, R. F. O.; ZAKS, MICHAEL A. ; ROQUE A.C. . Spontaneous activity patterns in networks of two-dimensional integrate and fire neurons with synaptic noise. In: Bernstein Conference 2018, 2018, Berlin. Spontaneous activity patterns in networks of two-dimensional integrate and fire neurons with synaptic noise, 2018.

5.
PENA, RODRIGO FO; LIMA, V. ; CEBALLOS, C. C. ; ROQUE A.C. . On the subthreshold resonance properties of neurons. In: CNS*2018, 2018, Seattle. P27 On the subthreshold resonance properties of neurons, 2018. v. 19. p. 64.

6.
SHIMOURA, R. ; KAMIJI, N. L. ; PENA, RODRIGO FO ; CORDEIRO, V. L. ; ROQUE, ANTONIO C . Effects of spike frequency adaptation on dynamics of a multi-layered cortical network with heterogeneous neuron types. In: CNS*2018, 2018, Seattle. P29 Effects of spike frequency adaptation on dynamics of a multi-layered cortical network with heterogeneous neuron types, 2018. v. 19. p. 64.

7.
LIMA, V. ; GHADERI, P. ; ROSTAMI, S. ; PENA, RODRIGO FO ; SHIMOURA, R. ; ROQUE A.C. ; SAFARI, M. S. . Acetylcholine modulation in a biophysical model of cortical neuron. In: CNS*2018, 2018, Seattle. P158 Acetylcholine modulation in a biophysical model of cortical neuron, 2018. v. 19. p. 64.

8.
KAMIJI, N. L. ; CORDEIRO, V. L. ; SHIMOURA, RENAN O ; PENA, RODRIGO F. O. ; ROMARO, C. ; ROQUE A.C. . A stochastic version of the Potjans-Diesmann cortical microcircuit model. In: XL Reunião Anual da SBNeC, 2017, Araraquara. Resumos da XL Reunião Anual da SBNeC, 2017.

9.
PENA, R. F. O.; ROQUE A.C. ; ZAKS, MICHAEL A. . Synaptic noise facilitates transitions from sleep-like state to awake-like state. In: XL Reunião Anual da SBNeC, 2017, Araraquara. Resumos da XL Reunião Anual da SBNeC, 2017.

10.
CEBALLOS, C. C. ; PENA, R. F. O. ; LEAO, R. ; ROQUE A.C. . Antagonistic effects of the persistent sodium and the hyperpolarization-activated currents on the membrane time constant. In: XL Reunião Anual da SBNeC, 2017, Araraquara. Resumos da XL Reunião Anual da SBNeC, 2017.

11.
OLIVEIRA, J. P. N. ; PENA, R. F. O. ; ROQUE A.C. . Avalanches neuronais em um modelo de rede cortical hierárquica e modular. In: XL Reunião Anual da SBNeC, 2017, Araraquara. Resumos da XL Reunião Anual da SBNeC, 2017.

12.
PENA, RF; ZAKS, MICHAEL A. ; ROQUE A.C. . Noise-enhanced transition from synchronized to desynchronized states in a cortical network model. In: Society for Neuroscience (SfN), 2017, Washington. Noise-enhanced transition from synchronized to desynchronized states in a cortical network model, 2017.

13.
KAMIJI, N. L. ; SHIMOURA, RENAN O ; PENA, R. F. O. ; CORDEIRO, V. L. ; ROMARO, C. ; CEBALLOS, C. C. ; ROQUE A.C. . A cortical microcircuit model with heterogeneous excitatory and inhibitory neurons. In: Society for Neuroscience (SfN), 2017, Washington. A cortical microcircuit model with heterogeneous excitatory and inhibitory neurons, 2017.

14.
ROQUE A.C. ; KAMIJI, N. L. ; CORDEIRO, V. L. ; CEBALLOS, C. C. ; SHIMOURA, R. ; PENA, RODRIGO F. O. ; ROMARO, C. . A stochastic cortical microcircuit model. In: Society for Neuroscience, 2017, Washington. A stochastic cortical microcircuit model, 2017.

15.
PENA, R. F. O.; TOMOV, PETAR ; ROQUE A.C. ; ZAKS, MICHAEL A. . Breakdown and resumption of oscillatory self-sustained activity in hierarchical modular networks. In: 10th FENS - Forum of Neuroscience, 2016, Copenhagen. Breakdown and resumption of oscillatory self-sustained activity in hierarchical modular networks, 2016.

16.
PENA, R. F. O.; BERNARDI, D. ; ROQUE A.C. ; LINDNER, B. . Self-consistency in the second-order correlation statistics: from network to a single-neuron scheme. In: Perspectives in Nonlinear Dynamics, 2016, Berlin. Self-consistency in the second-order correlation statistics: from network to a single-neuron scheme, 2016.

17.
PENA, R. F. O.; TOMOV, PETAR ; ROQUE A.C. ; MICHAEL, ZAKS . Up-down states in a neural network model and their relation with the individual neurons. In: Perspectives in Nonlinear Dynamics, 2016, Berlin. Up-down states in a neural network model and their relation with the individual neurons, 2016.

18.
PENA, R. F. O.; TOMOV, PETAR ; ZAKS, MICHAEL A. ; ROQUE A.C. . Self-sustained Activity Lifetime in a Cortical Network Model. In: IBRO - 9th World Congress International Brain Research Organization, 2015, Rio de Janeiro. Anais do 9th World Congress International Brain Research Organization, 2015.

19.
SHIMOURA, R. ; PENA, R. F. O. ; ROQUE A.C. . Dynamics of a Cortical Multi-layered Model with Cells of Different Electrophysiological Classes. In: IBRO - 9th World Congress International Brain Research Organization, 2015, Rio de Janeiro. Anais do 9th World Congress International Brain Research Organization, 2015.

20.
PENA, RODRIGO F. O.; ROQUE A.C. . Um modelo computacional bio-inspirado para estudo da dinâmica cortical. In: XXXVIII Reunião Anual da SBNeC - Sociedade Brasileira de Neurociências e Comportamento, 2014, Búzios - RJ. Resumos da XXXVIII Reunião Anual da SBNeC - Sociedade Brasileira de Neurociências e Comportamento. São Paulo-SP, 2014. v. 1. p. 42-42.

21.
PENA, R. F. O.; VIEIRA, D. P. C ; ROQUE A.C. . Auto-Sustentabilidade em um Modelo Neural Cortical: Influência da Estrutura e do tipo de Célula. In: XVIII Congresso Brasileiro de Física Médica, 2013, São Pedro-SP. Anais do XVIII Congresso Brasileiro de Física Médica.. São Paulo: Rev. Bras. Fis. Méd., 2013., 2013. v. 1. p. 67-67.

22.
PENA, R. F. O.; VIEIRA, D. P. C ; ROQUE A.C. . Efeito da topologia e composição neuronal de um modelo computacional do córtex sobre a atividade auto-sustentada dos neurônios. In: XXXVII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Neurociências e Comportamento - SBNeC, 2013, Belo Horizonte. Resumos da XXXVII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Neurociências e Comportamento - SBNeC 2013. São Paulo-SP: Editora da SBNeC, 2013. v. único. p. 60-60.

23.
PENA, R. F. O.; GAUMIER, C. . Modelando Propagação de Doenças Usando Teoria dos Grafos. In: XVIII Congresso Brasileiro de Física Médica, 2013, São Pedro-SP. Anais do XVIII Congresso Brasileiro de Física Médica.. São Paulo: Rev. Bras. Fis. Méd., 2013., 2013. v. 1.

24.
TOMOV, P. ; ROQUE A.C. ; PENA, R. F. O. ; ZACKS, M. . Modelling of self-sustained activity in neural networks. In: Dynamics Days Berlin-Brandenburg, 2013, TU Berlin. Modelling of self-sustained activity in neural networks, 2013. v. 1. p. 10-10.

25.
VIEIRA, D. P. C ; PENA, R. F. O. ; ROQUE A.C. . A study of spontaneous activity in modular neural networks made of neurons of different intrinsic dynamics. In: XXXIII Dynamics Days Europe Conference., 2013, Madrid. P59, 2013.

Artigos aceitos para publicação
1.
AMORIM, MATEUS R. ; PENA, RODRIGO F. O. ; SOUZA, GEORGE M. P. R. ; BONAGAMBA, LENI G. H. ; ROQUE, ANTÔNIO C. ; MACHADO, BENEDITO H. . Firing properties of ventral medullary respiratory neurons in sino-aortic denervated rats. EXPERIMENTAL PHYSIOLOGY, 2018.

Apresentações de Trabalho
1.
PENA, R. F. O.; LIMA, V. ; CEBALLOS, C. C. ; ROQUE A.C. . Multiple resonance peaks generated by active ionic currents in neurons. 2018. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

2.
PENA, RODRIGO F. O.. A neurociência computacional como ferramenta para o estudo do cérebro. 2018. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

3.
PENA, R. F. O.; ZAKS, MICHAEL A. ; ROQUE A.C. . Activity patterns in networks of excitatory and inhibitory spiking neurons with synaptic noise. 2018. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

4.
PENA, R. F. O.. Neurociência Computacional para alunos do Colégio Técnico da Unicamp em Campinas. 2017. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

5.
PENA, R. F. O.; PETAR, TOMOV ; ROQUE A.C. ; ZAKS, MICHAEL A. . Mechanisms of oscillatory self-sustained activity in a cortical model. 2016. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

6.
PENA, R. F. O.. Apresentação sobre o NeuroMat: Centro de Pesquisa, Inovação e Difusão em Neuromatemática. 2016. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

7.
PENA, RODRIGO F. O.. Mechanisms of self-sustained sleep-like and awake-like activity states in a heterogeneous spiking network model. 2016. (Apresentação de Trabalho/Outra).

8.
PENA, R. F. O.; ROQUE A.C. . A cortical microcircuit model to study structure-activity relationships. 2015. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

9.
PENA, R. F. O.. Apresentação de Pôster de Intercâmbio - Grupo Coordenador das Atividades de Relações Internacionais do Campus de Ribeirão Preto da USP ? GCARI-RP. 2014. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

10.
ROQUE A.C. ; MICHAEL, ZAKS ; PENA, R. F. O. . A cortical multi-layered computational model and its dynamical properties. 2014. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

11.
PENA, R. F. O.; TOMOV, P. ; ROQUE A.C. . Padrões coletivos de atividade em um modelo de rede cortical modular composto por neurônios de diferentes classes eletrofisiológicas. 2013. (Apresentação de Trabalho/Outra).

12.
PENA, R. F. O.; ROQUE A.C. ; VIEIRA, D. P. C . Construção e Análise de um Modelo Modular e Hierárquico para o Córtex Cerebral. 2011. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

Outras produções bibliográficas
1.
BORGES, F. S. ; PROTACHEVICZ, P. R. ; PENA, RODRIGO F. O. ; LAMEU, E. L. ; MATIAS, F. S. ; HIGA, G. S. V. ; KIHARA, A. H. ; ANTONOPOULOS, C. G. ; IAROSZ, K. C. ; PASQUALE, R. ; ANTONIO, ROQUE ; BATISTA, A. M. ; JI, P. . Self-sustained activity in balanced networks with low firing-rate. Ithaca: Cornell University Library, 2018 (Preprint - arXiv).

2.
LIMA, V. ; PENA, R. F. O. ; CEBALLOS, C. C. ; SHIMOURA, R. ; ROQUE A.C. . Asymmetry in the subthreshold resonance properties of neurons generated by high amplitude currents. Ithaca: Cornell University Library, 2018 (Preprint - arXiv).


Produção técnica
Programas de computador sem registro
1.
SHIMOURA, R. ; KAMIJI, N. L. ; PENA, RODRIGO FO ; LIMA, VINICIUS ; CEBALLOS, CESAR C. ; ROMARO, C. ; ROQUE A.C. . A full-scale cortical microcircuit spiking network model. 2018.

Entrevistas, mesas redondas, programas e comentários na mídia
1.
PENA, RODRIGO FO. 'Differences between stochastic and deterministic spiking neural network models' during workshop 'Mathematical and Simulation Modeling in Neuroscience'. 2018. (Programa de rádio ou TV/Mesa redonda).


Demais tipos de produção técnica
1.
PENA, RODRIGO F. O.. Introdução à Neurociência Computacional. 2018. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

2.
PENA, RODRIGO F. O.. 2o Curso Prático de Modelagem Computacional em Neurociência - PratiCoNeuro II. 2018. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

3.
PENA, R. F. O.. Introduction to Neuro-Mathematics. 2017. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

4.
PENA, R. F. O.. 1o Curso Prático de Modelagem Computacional em Neurociência - PratiCoNeuro. 2017. (Curso de curta duração ministrado/Outra).



Bancas




Participação em bancas de comissões julgadoras
Outras participações
1.
PENA, R. F. O.. Avaliador na 1a Etapa do 22o Simpósio Internacional de Iniciação Científica e Tecnológica da USP - SIICUSP. 2014. Universidade de São Paulo.



Eventos



Participação em eventos, congressos, exposições e feiras
1.
XLI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Neurociências e Comportamento. Cinética de ativação e condutância derivativa determinam propriedades de ressonância em um modelo com corrente Ih. 2018. (Congresso).

2.
Brain Dynamics on Multiple Scales - Paradigms, their Relations, and Integrated Approaches.Synaptic noise facilitates transitions from sleep-like state to awake-like state. 2017. (Oficina).

3.
O lado escuro do universo: matéria escura e energia escura. 2017. (Seminário).

4.
Workshop Random Structures in the Brain. 2017. (Oficina).

5.
XVI Semana de Física Médica.Synaptic Noise Induces Intermittent Oscillatory-Quiescent State Transitions in a Spiking Network Model. 2017. (Simpósio).

6.
10th FENS Forum of Neuroscience. Breakdown and resumption of oscillatory self-sustained activity in hierarchical modular networks. 2016. (Congresso).

7.
2nd International Conference on Mathematical NeuroScience. Mechanisms of oscillatory self-sustained activity in a cortical model. 2016. (Congresso).

8.
4 Workshop HPC - USP. 2016. (Simpósio).

9.
IV Workshop and School on Dynamics, Transport and Control in Complex Networks.Palestra selecionada - Auto consistência de estatísticas de segunda ordem em um modelo de neurônio único. 2016. (Outra).

10.
Perspectives on Nonlinear Dynamics. Self-consistency in the second-order correlation statistics: from network to a single-neuron scheme. 2016. (Congresso).

11.
Second NeuroMat Workshop: New Frontiers in NeuroMathematics.A stochastic model for neural nets, and the title was Too much noise to sleep: Noise- induced transition from sleep to awake-like state in a spiking network model. 2016. (Oficina).

12.
XV Semana de Física Médica e 1 ̊ Simpósio de Física Médica.Self-consistent determination of the second-order correlation statistics in a single-neuron scheme. 2016. (Simpósio).

13.
1st NeuroMat Young Researchers Workshop.A cortical microcircuit model to study structure-activity relationships. 2015. (Seminário).

14.
Escrita de Artigos Científicos de Alto Impacto: estrutura e linguagem. 2015. (Simpósio).

15.
IBRO - 9th IBRO World Congress on Neuroscience. SELF-SUSTAINED ACTIVITY LIFETIME IN A CORTICAL NETWORK MODEL. 2015. (Congresso).

16.
Workshop Stochastic Modeling of Neural Nets and Spike Sorting.Implementation of a large-scale cortical model using the stochastic neural model of Galves and Locherbach. 2015. (Oficina).

17.
2°. Workshop de High Performance Computing. 2014. (Oficina).

18.
Empreendedorismo no Ambiente Acadêmico. 2014. (Seminário).

19.
I International Workshop on Synaptic Plasticity - IWSYP'14I International Workshop on Synaptic Plasticity - IWSYP'14.Effect of synaptic plasticity on functional connectivity and global activity of a cortical network model; Renan O. Shimoura, Rodrigo F. O. Pena, and Antonio C. Roque. 2014. (Outra).

20.
Neurociências e Complexidade: Conceitos, Desafios e Perspectivas. 2014. (Simpósio).

21.
XIII Semana da Física Médica.Apresentação do Trabalho de Doutorado durante avaliação FAMB. 2014. (Encontro).

22.
A origem e evolução dos buracos negros. 2013. (Seminário).

23.
Ciclo de Palestras - "Neurociência - Histórico e Aspectos Gerais". 2013. (Seminário).

24.
I Dia Internacional da Física Médica. 2013. (Encontro).

25.
II Semana Nacional do Cérebro - Cérebro e música e a música do cérebro. 2013. (Seminário).

26.
II Semana Nacional do Cérebro - Controvérsias e convergências em Neurociência e Arte. 2013. (Seminário).

27.
Sistemas complexos: aleatoriedade, emergência e universalidade. 2013. (Simpósio).

28.
XII Semana da Física Médica. 2013. (Oficina).

29.
XI Semana da Informática Biomédica.Auto-sustentabilidade em um Modelo Neural Cortical: Influência da topologia da rede e do tipo de célula. 2013. (Simpósio).

30.
XVIII Congresso Brasileiro de Física Médica. Modelando Propagação de Doenças Usando Teoria dos Grafos. 2013. (Congresso).

31.
XVIII Congresso Brasileiro de Física Médica. Auto-Sustentabilidade em um Modelo Neural Cortical: Influência da Estrutura e do tipo de Célula. 2013. (Congresso).

32.
XXXVII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Neurociências e Comportamento. EFEITO DA TOPOLOGIA E COMPOSIÇÃO NEURONAL DE UM MODELO COMPUTACIONAL DO CÓRTEX SOBRE A ATIVIDADE AUTO-SUSTENTADA DOS NEURÔNIOS. 2013. (Congresso).

33.
International Conference on Artificial Neural Networks - ICANN 2012. 2012. (Congresso).

34.
19° Simpósio Internacional de Iniciação Científica da USP (SIICUSP).Construção e Análise de um Modelo Modular e Hierárquico para o Córtex Cerebral. 2011. (Simpósio).

35.
X Semana da Física Médica. 2011. (Oficina).

36.
IX Semana da Física Médica. 2010. (Oficina).

37.
Mesa Redonda Avaliação de Tecnologias em Saúde e Oficina de Parecer Técnico Científica. 2010. (Oficina).

38.
VIII Semana da Física Médica. 2009. (Oficina).


Organização de eventos, congressos, exposições e feiras
1.
PENA, RODRIGO FO. 2o Curso Prático de Modelagem Computacional em Neurociência - PratiCoNeuro II. 2018. (Outro).

2.
ROQUE A.C. ; PENA, R. F. O. . Resonance in neurons and neural networks: theoretical and experimental approaches. 2018. (Concerto).

3.
PENA, RODRIGO F. O.. 1o Curso Prático de Modelagem Computacional em Neurociência - PratiCoNeuro. 2017. (Outro).

4.
PINTO, THIAGO. M. ; ROQUE A.C. ; ARRUDA, D. ; CEBALLOS, C. C. ; PENA, RODRIGO F. O. ; SHIMOURA, R. ; FREITAS, J. . I International Workshop on Synaptic Plasticity. 2014. (Outro).

5.
MACAU, E. ; ROQUE A.C. ; TEJADA, J. ; PENA, R. F. O. ; SHIMOURA, R. ; ARANTES, R. ; FREITAS, J. ; ARRUDA, D. . II Workshop and School on Dynamics, Transport and Control in Complex Networks - ComplexNet. 2013. (Outro).



Inovação



Programa de computador sem registro
1.
SHIMOURA, R. ; KAMIJI, N. L. ; PENA, RODRIGO FO ; LIMA, VINICIUS ; CEBALLOS, CESAR C. ; ROMARO, C. ; ROQUE A.C. . A full-scale cortical microcircuit spiking network model. 2018.



Educação e Popularização de C & T



Artigos
Artigos completos publicados em periódicos
1.
LIMA, VINICIUS2019LIMA, VINICIUS ; PENA, R. F. O. ; CEBALLOS, C. C. ; SHIMOURA, R. ; ROQUE A.C. . Aplicações da teoria da informação à neurociência. Revista Brasileira de Ensino de Física (São Paulo), v. 41, p. e20180197, 2019.

Artigos aceitos para publicação
1.
AMORIM, MATEUS R. ; PENA, RODRIGO F. O. ; SOUZA, GEORGE M. P. R. ; BONAGAMBA, LENI G. H. ; ROQUE, ANTÔNIO C. ; MACHADO, BENEDITO H. . Firing properties of ventral medullary respiratory neurons in sino-aortic denervated rats. EXPERIMENTAL PHYSIOLOGY, 2018.


Apresentações de Trabalho
1.
PENA, R. F. O.. Apresentação de Pôster de Intercâmbio - Grupo Coordenador das Atividades de Relações Internacionais do Campus de Ribeirão Preto da USP ? GCARI-RP. 2014. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

2.
PENA, R. F. O.. Neurociência Computacional para alunos do Colégio Técnico da Unicamp em Campinas. 2017. (Apresentação de Trabalho/Seminário).


Cursos de curta duração ministrados
1.
PENA, RODRIGO F. O.. Introdução à Neurociência Computacional. 2018. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

2.
PENA, R. F. O.. Introduction to Neuro-Mathematics. 2017. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

3.
PENA, R. F. O.. 1o Curso Prático de Modelagem Computacional em Neurociência - PratiCoNeuro. 2017. (Curso de curta duração ministrado/Outra).


Organização de eventos, congressos, exposições e feiras
1.
ROQUE A.C. ; PENA, R. F. O. . Resonance in neurons and neural networks: theoretical and experimental approaches. 2018. (Concerto).



Outras informações relevantes


Membro da Sociedade Brasileira de Neurociências e Comportamento (SBNeC).
Membro da Society for Neuroscience (SfN).
Membro da Organization for Computational Neuroscience (OCNS).



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